View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0217_low_3 (Length: 337)

Name: NF0217_low_3
Description: NF0217
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0217_low_3
NF0217_low_3
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (5-317)||(21395789-21396101)
chr8 (5-317)||(21790282-21790594)
chr8 (5-317)||(21389259-21389571)
chr8 (117-317)||(21778697-21778897)
chr8 (104-317)||(16199551-16199765)
chr8 (104-317)||(31971257-31971471)
chr8 (104-317)||(45130903-45131117)
chr8 (114-317)||(21918915-21919121)
chr8 (112-317)||(18879150-18879352)
chr8 (104-317)||(20536208-20536424)
chr8 (104-317)||(22626736-22626951)
chr8 (104-316)||(28648949-28649164)
chr8 (104-317)||(18818314-18818530)
chr8 (104-317)||(21923833-21924049)
chr8 (104-317)||(22875065-22875281)
chr8 (104-320)||(6759255-6759472)
chr8 (129-317)||(16092272-16092463)
chr8 (245-317)||(5866323-5866395)
chr8 (104-317)||(7372778-7372986)
chr8 (104-317)||(23406379-23406597)
chr8 (245-317)||(17140916-17140988)
chr8 (245-317)||(21490995-21491067)
chr8 (245-317)||(6520368-6520440)
chr8 (245-317)||(38855300-38855372)
chr8 (245-317)||(23760893-23760962)
chr8 (5-126)||(17353744-17353865)
chr8 (200-298)||(21285616-21285716)
chr8 (245-313)||(26355747-26355815)
chr8 (104-316)||(23648554-23648769)
chr8 (245-317)||(17612159-17612231)
chr8 (246-301)||(17267044-17267099)
chr8 (267-317)||(21249384-21249434)
chr8 (267-317)||(21255222-21255272)
chr8 (245-298)||(983455-983508)
chr8 (106-181)||(25363047-25363123)
chr8 (246-301)||(17439557-17439612)
chr8 (246-301)||(24353036-24353091)
chr8 (246-301)||(37116363-37116418)
chr8 (244-301)||(19154935-19154992)
chr8 (249-298)||(21673723-21673772)
chr8 (245-301)||(20498578-20498634)
chr8 (204-314)||(14409495-14409606)
chr8 (204-314)||(20046246-20046357)
chr8 (264-314)||(1484402-1484452)
chr8 (264-314)||(4542485-4542535)
chr8 (264-314)||(5853404-5853454)
chr8 (264-314)||(19896265-19896315)
chr8 (264-314)||(20403227-20403277)
chr8 (264-314)||(22001753-22001803)
chr8 (264-314)||(26225359-26225409)
chr8 (249-310)||(13508138-13508199)
chr8 (5-126)||(19899286-19899407)
chr8 (264-320)||(19937118-19937174)
chr8 (204-298)||(16413367-16413462)
chr8 (248-310)||(13597669-13597731)
chr8 (264-298)||(15070574-15070608)
chr8 (264-314)||(15203343-15203393)
chr8 (264-298)||(26219733-26219767)
chr8 (264-314)||(41598188-41598238)
chr8 (264-298)||(45290807-45290841)
chr8 (264-301)||(19801493-19801530)
chr8 (246-302)||(22525573-22525628)
chr8 (271-314)||(4483281-4483324)
chr8 (264-314)||(25484380-25484430)
chr8 (80-169)||(16184877-16184965)
chr8 (254-302)||(22419471-22419519)
chr8 (80-179)||(23776717-23776816)
chr8 (249-301)||(28397566-28397617)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (112-317)||(7266-7471)
scaffold0106 (112-317)||(1289-1494)
scaffold0106 (264-314)||(15306-15356)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (112-317)||(16282-16487)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (104-317)||(17046487-17046700)
chr4 (104-317)||(14053207-14053422)
chr4 (99-317)||(12902757-12902978)
chr4 (99-317)||(7088877-7089098)
chr4 (104-315)||(22636437-22636650)
chr4 (104-317)||(44052829-44053045)
chr4 (80-313)||(15121685-15121917)
chr4 (99-310)||(23374259-23374473)
chr4 (104-314)||(16377428-16377639)
chr4 (105-312)||(14038653-14038863)
chr4 (112-317)||(16270149-16270356)
chr4 (136-317)||(7798774-7798958)
chr4 (148-317)||(6899891-6900062)
chr4 (104-317)||(16239875-16240090)
chr4 (245-317)||(15551817-15551889)
chr4 (236-317)||(3096293-3096373)
chr4 (245-317)||(39706337-39706409)
chr4 (104-317)||(7893703-7893916)
chr4 (236-317)||(52873408-52873488)
chr4 (200-301)||(13853-13956)
chr4 (245-313)||(12774011-12774079)
chr4 (245-298)||(12288259-12288312)
chr4 (245-298)||(52243245-52243298)
chr4 (200-314)||(14280316-14280431)
chr4 (245-313)||(8846360-8846428)
chr4 (104-191)||(3096772-3096859)
chr4 (264-315)||(22353835-22353886)
chr4 (200-314)||(54798756-54798872)
chr4 (252-298)||(43198611-43198657)
chr4 (236-314)||(44928965-44929042)
chr4 (244-301)||(46640504-46640561)
chr4 (248-300)||(6190479-6190531)
chr4 (264-320)||(19242693-19242749)
chr4 (204-314)||(18215325-18215436)
chr4 (246-301)||(53082202-53082257)
chr4 (264-314)||(12419-12469)
chr4 (264-314)||(1837621-1837671)
chr4 (264-314)||(7641294-7641344)
chr4 (264-314)||(12610950-12611000)
chr4 (264-314)||(15118464-15118514)
chr4 (116-181)||(17047989-17048055)
chr4 (264-314)||(18239531-18239581)
chr4 (264-314)||(23803377-23803427)
chr4 (264-314)||(44102214-44102264)
chr4 (264-314)||(44615288-44615338)
chr4 (264-314)||(44773199-44773249)
chr4 (264-314)||(50222451-50222501)
chr4 (264-314)||(51463980-51464030)
chr4 (264-314)||(52312510-52312560)
chr4 (200-298)||(8574871-8574969)
chr4 (5-126)||(13569703-13569824)
chr4 (264-317)||(15367690-15367743)
chr4 (264-317)||(15370018-15370071)
chr4 (264-317)||(15371202-15371255)
chr4 (264-317)||(15373483-15373536)
chr4 (264-317)||(15402703-15402756)
chr4 (264-317)||(16223532-16223585)
chr4 (235-316)||(19618257-19618336)
chr4 (264-314)||(3515007-3515057)
chr4 (264-298)||(15355437-15355471)
chr4 (5-126)||(23843669-23843790)
chr4 (5-179)||(15093911-15094085)
chr4 (266-301)||(21815699-21815734)
chr4 (264-298)||(14970819-14970853)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (112-317)||(20309108-20309313)
chr2 (104-317)||(38021-38235)
chr2 (99-317)||(23285865-23286082)
chr2 (99-317)||(23654286-23654507)
chr2 (80-317)||(23103278-23103516)
chr2 (5-313)||(40622015-40622327)
chr2 (104-317)||(22731139-22731355)
chr2 (99-314)||(298714-298933)
chr2 (104-317)||(22738085-22738300)
chr2 (104-317)||(23060513-23060728)
chr2 (104-317)||(23076442-23076658)
chr2 (80-317)||(23660023-23660262)
chr2 (104-317)||(22337115-22337331)
chr2 (245-317)||(23071998-23072070)
chr2 (245-313)||(7679589-7679657)
chr2 (241-317)||(8946657-8946732)
chr2 (5-125)||(23038227-23038347)
chr2 (204-314)||(22105412-22105524)
chr2 (245-312)||(28405981-28406048)
chr2 (244-301)||(22413186-22413243)
chr2 (264-317)||(23040257-23040310)
chr2 (244-301)||(23207293-23207350)
chr2 (200-301)||(7735-7838)
chr2 (245-317)||(19671830-19671902)
chr2 (5-182)||(22740767-22740945)
chr2 (245-313)||(25175854-25175922)
chr2 (245-316)||(22134256-22134326)
chr2 (246-301)||(25108903-25108958)
chr2 (204-316)||(32214972-32215085)
chr2 (162-314)||(45029863-45030016)
chr2 (5-182)||(22758522-22758700)
chr2 (246-301)||(20520243-20520298)
chr2 (246-301)||(23791289-23791344)
chr2 (204-314)||(26505379-26505490)
chr2 (204-314)||(26507857-26507968)
chr2 (264-314)||(571397-571447)
chr2 (264-314)||(6725995-6726045)
chr2 (264-314)||(18808943-18808993)
chr2 (264-314)||(23130862-23130912)
chr2 (264-314)||(23133329-23133379)
chr2 (264-314)||(23135590-23135640)
chr2 (264-314)||(23709644-23709694)
chr2 (264-314)||(23712125-23712175)
chr2 (264-314)||(28577099-28577149)
chr2 (264-314)||(34402634-34402684)
chr2 (264-314)||(38967374-38967424)
chr2 (264-314)||(39682313-39682363)
chr2 (245-298)||(18786952-18787005)
chr2 (245-298)||(23708668-23708721)
chr2 (248-300)||(32451981-32452033)
chr2 (264-312)||(43137301-43137349)
chr2 (264-311)||(21155172-21155219)
chr2 (246-301)||(23004764-23004819)
chr2 (255-314)||(24529633-24529691)
chr2 (264-311)||(24643062-24643109)
chr2 (246-301)||(24697657-24697712)
chr2 (264-298)||(24367790-24367824)
chr2 (264-314)||(32039610-32039660)
chr2 (246-302)||(23287378-23287433)
chr2 (264-314)||(24898307-24898358)
chr2 (264-314)||(24900790-24900841)
chr2 (264-314)||(24903267-24903318)
chr2 (264-314)||(24905744-24905795)
chr2 (264-314)||(24908219-24908270)
chr2 (247-302)||(26392397-26392451)
chr2 (5-167)||(22798933-22799094)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (112-317)||(51582-51787)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (112-317)||(27847746-27847951)
chr7 (104-315)||(40443393-40443605)
chr7 (104-317)||(12698831-12699048)
chr7 (99-317)||(16386147-16386369)
chr7 (104-317)||(9509189-9509405)
chr7 (104-317)||(10589039-10589254)
chr7 (80-313)||(17137945-17138177)
chr7 (105-314)||(18456319-18456530)
chr7 (99-317)||(26211995-26212217)
chr7 (80-313)||(12187019-12187251)
chr7 (104-314)||(3564269-3564482)
chr7 (245-317)||(16495402-16495474)
chr7 (104-317)||(38227481-38227696)
chr7 (245-317)||(28505347-28505419)
chr7 (245-317)||(34200786-34200858)
chr7 (245-317)||(11996076-11996148)
chr7 (204-317)||(13647325-13647440)
chr7 (245-317)||(67745-67817)
chr7 (198-317)||(16219717-16219835)
chr7 (245-313)||(44014182-44014250)
chr7 (245-317)||(47831807-47831879)
chr7 (245-317)||(15754936-15755008)
chr7 (200-298)||(2280121-2280221)
chr7 (245-313)||(811180-811248)
chr7 (245-313)||(18005650-18005718)
chr7 (5-182)||(18154643-18154821)
chr7 (249-317)||(22072913-22072981)
chr7 (168-314)||(16213684-16213831)
chr7 (200-314)||(48273392-48273508)
chr7 (241-298)||(12901342-12901399)
chr7 (246-301)||(20220238-20220293)
chr7 (244-298)||(1868043-1868097)
chr7 (245-295)||(12255842-12255892)
chr7 (204-314)||(24704688-24704796)
chr7 (244-301)||(15008547-15008604)
chr7 (264-317)||(18430709-18430762)
chr7 (244-301)||(48991196-48991253)
chr7 (5-169)||(24054618-24054781)
chr7 (200-298)||(16056347-16056446)
chr7 (204-314)||(24702238-24702349)
chr7 (204-314)||(44116509-44116620)
chr7 (264-314)||(456321-456371)
chr7 (264-314)||(3386333-3386383)
chr7 (264-314)||(11972496-11972546)
chr7 (264-314)||(13869346-13869396)
chr7 (264-314)||(14949234-14949284)
chr7 (264-314)||(15376825-15376875)
chr7 (264-314)||(16232520-16232570)
chr7 (264-314)||(16410059-16410109)
chr7 (264-314)||(17062027-17062077)
chr7 (264-314)||(18640272-18640322)
chr7 (264-314)||(20110556-20110606)
chr7 (264-314)||(20385235-20385285)
chr7 (264-314)||(21189707-21189757)
chr7 (264-314)||(32125491-32125541)
chr7 (264-314)||(41522917-41522967)
chr7 (264-314)||(41525379-41525429)
chr7 (5-126)||(9703458-9703579)
chr7 (264-313)||(11393399-11393448)
chr7 (246-298)||(14044765-14044817)
chr7 (246-298)||(14354795-14354847)
chr7 (5-182)||(19649291-19649469)
chr7 (255-314)||(13831373-13831431)
chr7 (204-298)||(24275187-24275282)
chr7 (248-302)||(9177718-9177772)
chr7 (264-298)||(15144105-15144139)
chr7 (236-298)||(18154882-18154943)
chr7 (264-314)||(27216860-27216910)
chr7 (245-317)||(19486793-19486865)
chr7 (246-289)||(14036282-14036325)
chr7 (246-289)||(14346312-14346355)
chr7 (246-301)||(18203828-18203882)
chr7 (264-298)||(38898489-38898523)
chr7 (5-114)||(11880456-11880565)
chr7 (264-313)||(19649557-19649606)
chr7 (264-316)||(2832509-2832561)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (112-317)||(965-1170)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (104-314)||(5036-5246)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (111-305)||(11185517-11185711)
chr6 (112-317)||(16920546-16920751)
chr6 (112-317)||(22831503-22831710)
chr6 (145-317)||(35245586-35245758)
chr6 (104-317)||(20638188-20638404)
chr6 (104-317)||(20360865-20361081)
chr6 (105-317)||(29060540-29060755)
chr6 (104-317)||(19303446-19303661)
chr6 (166-317)||(16496244-16496397)
chr6 (104-317)||(25629260-25629476)
chr6 (104-316)||(18409732-18409947)
chr6 (106-317)||(20593773-20593987)
chr6 (112-317)||(22780140-22780348)
chr6 (104-317)||(17287701-17287917)
chr6 (198-317)||(20076700-20076817)
chr6 (245-317)||(27333267-27333339)
chr6 (245-317)||(27394007-27394079)
chr6 (245-317)||(1561303-1561375)
chr6 (245-313)||(19652199-19652267)
chr6 (245-317)||(28496520-28496592)
chr6 (245-317)||(29808931-29809003)
chr6 (236-298)||(25644339-25644401)
chr6 (245-298)||(9098563-9098616)
chr6 (200-298)||(20109157-20109257)
chr6 (246-299)||(23076748-23076801)
chr6 (246-299)||(35008166-35008219)
chr6 (204-314)||(1595549-1595660)
chr6 (168-314)||(22782227-22782374)
chr6 (236-314)||(25656629-25656705)
chr6 (5-126)||(19863171-19863292)
chr6 (5-126)||(19873313-19873434)
chr6 (200-317)||(23019408-23019525)
chr6 (264-317)||(25714417-25714470)
chr6 (5-182)||(25641990-25642168)
chr6 (204-314)||(2291231-2291342)
chr6 (270-317)||(22080799-22080846)
chr6 (264-314)||(8055029-8055079)
chr6 (264-314)||(12742317-12742367)
chr6 (264-314)||(18334704-18334754)
chr6 (264-314)||(19005046-19005096)
chr6 (252-298)||(19668390-19668436)
chr6 (264-314)||(19859031-19859081)
chr6 (264-314)||(24422547-24422597)
chr6 (264-314)||(25754809-25754859)
chr6 (264-314)||(26924752-26924802)
chr6 (264-314)||(33861794-33861844)
chr6 (264-314)||(33864278-33864328)
chr6 (264-301)||(18456732-18456769)
chr6 (264-301)||(18461892-18461929)
chr6 (264-301)||(18821912-18821949)
chr6 (5-169)||(22438951-22439114)
chr6 (264-316)||(30676822-30676874)
chr6 (204-314)||(20556943-20557054)
chr6 (264-314)||(1541023-1541073)
chr6 (264-314)||(3852129-3852179)
chr6 (240-294)||(4185865-4185919)
chr6 (244-302)||(33443062-33443119)
chr6 (272-317)||(8227587-8227632)
chr6 (5-126)||(22432443-22432564)
chr6 (264-316)||(34963371-34963423)
chr6 (264-311)||(16448639-16448686)
chr6 (251-302)||(18177729-18177779)
chr6 (251-302)||(18204092-18204142)
chr6 (264-298)||(25688518-25688552)
chr6 (264-313)||(19862978-19863027)
chr6 (264-313)||(19873120-19873169)
chr6 (5-126)||(21739829-21739950)
chr6 (5-126)||(22334698-22334819)
chr6 (236-313)||(22432249-22432325)
chr6 (236-313)||(22438799-22438875)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (112-317)||(46995-47200)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (104-317)||(32067-32280)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (112-317)||(38801304-38801508)
chr1 (99-317)||(27250629-27250850)
chr1 (104-316)||(50210118-50210333)
chr1 (99-317)||(21026680-21026901)
chr1 (104-314)||(34509783-34509996)
chr1 (5-182)||(21714684-21714862)
chr1 (116-317)||(22532269-22532473)
chr1 (245-317)||(14295600-14295672)
chr1 (245-313)||(22921918-22921986)
chr1 (104-242)||(22354477-22354616)
chr1 (80-181)||(48603652-48603754)
chr1 (217-317)||(20847173-20847275)
chr1 (236-317)||(45574928-45575008)
chr1 (104-316)||(20135188-20135403)
chr1 (245-298)||(21754064-21754117)
chr1 (245-317)||(33681010-33681079)
chr1 (245-317)||(52928019-52928088)
chr1 (245-313)||(20248283-20248351)
chr1 (200-301)||(21896258-21896361)
chr1 (245-298)||(16758668-16758721)
chr1 (245-298)||(20918623-20918676)
chr1 (200-301)||(21861572-21861675)
chr1 (245-301)||(35261127-35261183)
chr1 (246-301)||(50614167-50614222)
chr1 (246-301)||(50621995-50622050)
chr1 (249-317)||(22237630-22237695)
chr1 (264-317)||(13212974-13213027)
chr1 (248-301)||(16368338-16368391)
chr1 (5-126)||(20091280-20091401)
chr1 (5-316)||(22468503-22468816)
chr1 (248-316)||(20454606-20454673)
chr1 (264-320)||(21342090-21342146)
chr1 (255-314)||(21707167-21707225)
chr1 (255-314)||(21711709-21711767)
chr1 (200-314)||(433012-433125)
chr1 (264-314)||(13988866-13988916)
chr1 (264-314)||(21346961-21347011)
chr1 (264-314)||(21923403-21923453)
chr1 (104-208)||(22356079-22356185)
chr1 (104-208)||(22357765-22357871)
chr1 (264-314)||(23593847-23593897)
chr1 (264-314)||(29298137-29298187)
chr1 (264-314)||(29776688-29776738)
chr1 (264-314)||(31612313-31612363)
chr1 (244-301)||(41050084-41050141)
chr1 (5-126)||(42865018-42865139)
chr1 (264-320)||(15860121-15860177)
chr1 (235-315)||(21840766-21840844)
chr1 (255-298)||(22123171-22123214)
chr1 (236-314)||(16275450-16275526)
chr1 (266-316)||(16361915-16361965)
chr1 (264-314)||(21475199-21475249)
chr1 (247-301)||(50686627-50686681)
chr1 (236-313)||(21714546-21714622)
chr1 (246-302)||(21533923-21533978)
chr1 (244-299)||(16093933-16093988)
chr1 (246-301)||(26064954-26065009)
chr1 (38-126)||(22831218-22831306)
chr1 (264-316)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (104-317)||(13497-13711)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (104-317)||(10331-10544)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (104-317)||(15370-15584)
scaffold0114 (80-313)||(7295-7527)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (5-316)||(174767-175079)
scaffold0021 (247-317)||(121766-121835)
scaffold0021 (104-225)||(124679-124801)
scaffold0021 (241-301)||(136414-136474)
scaffold0021 (241-301)||(145122-145182)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (112-317)||(4712-4919)
scaffold0358 (112-242)||(13-143)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (104-317)||(21292875-21293090)
chr5 (5-310)||(37723910-37724216)
chr5 (104-317)||(23390401-23390617)
chr5 (99-317)||(8286742-8286964)
chr5 (104-317)||(25421532-25421748)
chr5 (99-317)||(22075018-22075240)
chr5 (112-314)||(24529223-24529428)
chr5 (80-313)||(22032323-22032553)
chr5 (80-313)||(18769886-18770118)
chr5 (104-317)||(24493569-24493784)
chr5 (104-317)||(9077952-9078168)
chr5 (80-313)||(23572084-23572316)
chr5 (166-317)||(21729032-21729185)
chr5 (166-317)||(21808357-21808510)
chr5 (104-297)||(25431414-25431610)
chr5 (104-317)||(13025311-13025526)
chr5 (104-317)||(13095495-13095710)
chr5 (104-317)||(1096467-1096683)
chr5 (245-317)||(19660884-19660956)
chr5 (245-317)||(36314577-36314649)
chr5 (217-317)||(21997553-21997655)
chr5 (245-317)||(21329546-21329618)
chr5 (245-301)||(20026990-20027046)
chr5 (245-313)||(22959581-22959649)
chr5 (200-314)||(22412187-22412302)
chr5 (5-126)||(26704257-26704378)
chr5 (5-126)||(26973990-26974111)
chr5 (245-317)||(19668898-19668970)
chr5 (245-317)||(21502205-21502277)
chr5 (245-313)||(21565546-21565614)
chr5 (244-301)||(22178269-22178326)
chr5 (245-301)||(22144065-22144121)
chr5 (245-298)||(26012084-26012137)
chr5 (99-182)||(22107273-22107357)
chr5 (263-314)||(20909012-20909063)
chr5 (75-126)||(23501222-23501273)
chr5 (204-314)||(29329934-29330045)
chr5 (264-314)||(264880-264930)
chr5 (264-314)||(2154726-2154776)
chr5 (264-314)||(10733052-10733102)
chr5 (264-314)||(11581311-11581361)
chr5 (264-314)||(20918060-20918110)
chr5 (264-314)||(36154892-36154942)
chr5 (264-314)||(38619434-38619484)
chr5 (264-314)||(39245136-39245186)
chr5 (264-314)||(39363384-39363434)
chr5 (264-313)||(23064512-23064561)
chr5 (266-314)||(10775790-10775838)
chr5 (264-298)||(20902121-20902155)
chr5 (5-126)||(23201559-23201681)
chr5 (264-314)||(29345980-29346030)
chr5 (264-314)||(31061068-31061118)
chr5 (264-314)||(42245477-42245527)
chr5 (75-179)||(21873387-21873491)
chr5 (264-311)||(18319146-18319193)
chr5 (267-314)||(29348453-29348500)
chr5 (267-314)||(29350926-29350973)
chr5 (255-314)||(32027393-32027451)
chr5 (248-302)||(15796434-15796487)
chr5 (198-298)||(18418599-18418699)
chr5 (264-314)||(20806854-20806904)
chr5 (264-298)||(26704090-26704124)
chr5 (271-301)||(26740720-26740750)
chr5 (264-298)||(26973823-26973857)
chr5 (271-301)||(27989004-27989034)
chr5 (145-264)||(18356367-18356488)
chr5 (247-296)||(26732884-26732932)
chr5 (272-317)||(40725853-40725898)
chr5 (5-125)||(14079340-14079460)
chr5 (105-153)||(22412340-22412388)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (99-317)||(949-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (99-317)||(167879-168099)
scaffold0011 (104-317)||(51913-52129)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (104-317)||(20698341-20698556)
chr3 (104-317)||(13442274-13442490)
chr3 (99-317)||(12399209-12399430)
chr3 (104-317)||(17487856-17488072)
chr3 (104-317)||(14972854-14973070)
chr3 (104-317)||(17499338-17499554)
chr3 (112-317)||(18438534-18438742)
chr3 (104-317)||(26686887-26687103)
chr3 (104-317)||(43840932-43841148)
chr3 (80-313)||(856140-856372)
chr3 (104-317)||(23083266-23083482)
chr3 (104-298)||(14576738-14576934)
chr3 (105-314)||(24153115-24153326)
chr3 (104-317)||(25476290-25476506)
chr3 (245-317)||(13210376-13210448)
chr3 (104-314)||(40213626-40213838)
chr3 (104-317)||(11424668-11424880)
chr3 (80-181)||(14179570-14179672)
chr3 (245-313)||(49668125-49668193)
chr3 (245-301)||(52523778-52523834)
chr3 (112-298)||(42386429-42386619)
chr3 (245-313)||(9512924-9512992)
chr3 (245-313)||(9520899-9520967)
chr3 (245-313)||(12174308-12174376)
chr3 (249-313)||(16097332-16097396)
chr3 (245-317)||(15470927-15470996)
chr3 (204-317)||(43550529-43550644)
chr3 (245-298)||(32307696-32307749)
chr3 (204-314)||(17672626-17672737)
chr3 (104-298)||(14572608-14572804)
chr3 (252-314)||(28194693-28194755)
chr3 (245-314)||(27165250-27165319)
chr3 (245-317)||(14234487-14234559)
chr3 (245-313)||(16103784-16103852)
chr3 (246-301)||(22110402-22110457)
chr3 (246-301)||(43925974-43926029)
chr3 (244-313)||(37251216-37251283)
chr3 (5-126)||(17524959-17525080)
chr3 (200-314)||(36166598-36166712)
chr3 (245-314)||(53301600-53301669)
chr3 (245-317)||(24340772-24340844)
chr3 (204-314)||(9707658-9707769)
chr3 (204-314)||(29172634-29172745)
chr3 (264-314)||(6469246-6469296)
chr3 (264-314)||(7781459-7781509)
chr3 (264-314)||(8499518-8499568)
chr3 (264-314)||(10556985-10557035)
chr3 (264-314)||(15412429-15412479)
chr3 (264-314)||(15977515-15977565)
chr3 (264-314)||(17463178-17463228)
chr3 (264-314)||(17737236-17737286)
chr3 (264-314)||(28848723-28848773)
chr3 (264-314)||(34159326-34159376)
chr3 (264-314)||(45577950-45578000)
chr3 (264-314)||(45607019-45607069)
chr3 (204-301)||(53070704-53070802)
chr3 (264-314)||(55476491-55476541)
chr3 (264-314)||(55500942-55500992)
chr3 (248-301)||(606378-606431)
chr3 (244-300)||(12377938-12377994)
chr3 (264-312)||(16282923-16282971)
chr3 (264-312)||(41123892-41123940)
chr3 (264-315)||(13544024-13544075)
chr3 (204-298)||(50242838-50242933)
chr3 (264-314)||(8899094-8899144)
chr3 (264-314)||(10247835-10247885)
chr3 (264-314)||(12119837-12119887)
chr3 (264-298)||(12567576-12567610)
chr3 (264-314)||(16454393-16454443)
chr3 (264-298)||(21618465-21618499)
chr3 (264-298)||(38962003-38962037)
chr3 (264-314)||(44494809-44494859)
chr3 (80-125)||(14878388-14878433)
chr3 (245-298)||(23274706-23274759)
chr3 (106-181)||(16796685-16796761)
chr3 (245-317)||(37642314-37642386)
chr3 (264-314)||(13151902-13151953)
chr3 (264-314)||(13154367-13154418)
chr3 (264-314)||(17446767-17446816)
chr3 (245-298)||(1644723-1644775)
chr3 (264-313)||(15878119-15878168)
chr3 (246-302)||(13919344-13919399)
chr3 (264-316)||(14665398-14665450)
chr3 (264-316)||(14668554-14668606)
chr3 (5-169)||(23408581-23408744)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (5-301)||(26840-27135)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (112-317)||(1952-2160)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (112-317)||(4849-5057)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (104-317)||(13211-13427)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (104-317)||(1851-2067)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (104-317)||(3470-3686)
scaffold0292 (104-317)||(343-558)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (104-317)||(6026-6245)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (104-317)||(3056-3271)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (80-315)||(39479-39716)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (80-315)||(75096-75333)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (104-314)||(339855-340065)
scaffold0003 (264-314)||(158562-158612)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (104-298)||(24206-24405)
scaffold0042 (58-126)||(34770-34838)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (80-313)||(1881-2113)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (104-317)||(38761-38976)
scaffold0145 (112-317)||(32942-33149)
scaffold0145 (264-319)||(9744-9799)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (80-313)||(12763-12995)
scaffold0029 (204-297)||(11305-11399)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (99-317)||(20910-21132)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (116-316)||(3103-3306)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (104-316)||(17120-17337)
scaffold0056 (264-301)||(79396-79433)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (80-313)||(21688-21920)
scaffold0210 (80-313)||(29580-29812)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (104-310)||(25970-26179)
scaffold0122 (200-314)||(44709-44825)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (188-317)||(28414-28545)
scaffold0046 (245-317)||(11292-11364)
scaffold0046 (245-317)||(1997-2069)
scaffold0046 (261-317)||(4552-4608)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (245-317)||(1118-1190)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (104-317)||(8438-8650)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (240-317)||(34123-34200)
scaffold0175 (99-267)||(13141-13313)
scaffold0175 (264-317)||(273-326)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (104-317)||(25896-26111)
scaffold0026 (104-317)||(39858-40073)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (202-317)||(11447-11564)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (104-317)||(16505-16721)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (104-317)||(39913-40128)
scaffold0080 (244-301)||(19933-19990)
scaffold0080 (80-126)||(18538-18584)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (112-314)||(22886-23090)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (245-317)||(119875-119947)
scaffold0023 (245-313)||(100378-100446)
scaffold0023 (245-313)||(101503-101571)
scaffold0023 (246-313)||(40224-40291)
scaffold0023 (264-314)||(44454-44504)
scaffold0023 (264-314)||(94411-94461)
scaffold0023 (264-298)||(17552-17586)
scaffold0023 (75-126)||(38356-38407)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (112-257)||(6669-6818)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (104-317)||(4508-4723)
scaffold0228 (104-317)||(12090-12305)
scaffold0228 (104-317)||(22042-22257)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (142-317)||(32901-33077)
scaffold0120 (142-317)||(45928-46104)
scaffold0120 (236-317)||(16113-16193)
scaffold0120 (264-317)||(17397-17450)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (245-317)||(6611-6683)
scaffold0333 (245-317)||(13991-14063)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (245-317)||(15826-15898)
scaffold0020 (264-298)||(178913-178947)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (200-298)||(8485-8585)
scaffold0621 (245-317)||(6535-6607)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (245-317)||(1083-1155)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (5-182)||(36592-36770)
scaffold0131 (264-313)||(36454-36503)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (245-298)||(1101-1154)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (241-314)||(15664-15737)
scaffold0261 (5-126)||(1531-1652)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (245-301)||(1048-1104)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (245-313)||(2855-2923)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (245-317)||(6172-6244)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (245-313)||(2694-2762)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (245-313)||(19268-19336)
scaffold0102 (5-126)||(48267-48388)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (5-182)||(69930-70108)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (104-317)||(8479-8691)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (245-317)||(12942-13011)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (245-317)||(23932-24001)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (245-313)||(133-201)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (245-301)||(6828-6884)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (249-317)||(12766-12834)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (245-301)||(13144-13200)
scaffold0357 (246-301)||(2677-2732)
scaffold0357 (245-298)||(16149-16202)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (253-313)||(32102-32162)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (5-182)||(20117-20295)
scaffold0139 (244-294)||(38339-38389)
scaffold0139 (264-313)||(19980-20029)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (245-313)||(160688-160756)
scaffold0001 (264-314)||(85692-85742)
scaffold0001 (204-298)||(501100-501195)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (246-313)||(14747-14814)
[»] scaffold0555 (2 HSPs)
scaffold0555 (245-317)||(10590-10659)
scaffold0555 (5-126)||(773-894)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (80-296)||(4545-4763)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (245-298)||(5662-5715)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (241-298)||(8119-8176)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (5-126)||(8764-8885)
scaffold0101 (264-311)||(1393-1440)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (245-298)||(10546-10599)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (200-314)||(38704-38820)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (200-301)||(12584-12687)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (245-313)||(45841-45909)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (200-301)||(53551-53654)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (253-313)||(132662-132722)
scaffold0028 (245-298)||(62217-62270)
scaffold0028 (264-314)||(136680-136730)
scaffold0028 (264-314)||(139149-139199)
scaffold0028 (264-314)||(144087-144137)
scaffold0028 (264-314)||(134211-134261)
scaffold0028 (264-314)||(141618-141668)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (241-301)||(60761-60821)
scaffold0010 (245-298)||(129924-129977)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (246-301)||(129021-129075)
scaffold0022 (264-314)||(116430-116480)
scaffold0022 (248-301)||(78338-78391)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (251-301)||(13793-13843)
scaffold0420 (244-301)||(6332-6389)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (104-237)||(27912-28046)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (244-298)||(25125-25179)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (245-317)||(22719-22788)
scaffold0037 (264-314)||(82072-82122)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (5-126)||(1034-1155)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (248-301)||(566-619)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (245-298)||(27798-27851)
scaffold0165 (106-153)||(3648-3695)
scaffold0165 (106-153)||(7712-7759)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (9-126)||(18431-18548)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (245-298)||(32555-32608)
scaffold0034 (248-300)||(51936-51987)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (106-181)||(1052-1128)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (245-317)||(11464-11536)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (75-167)||(23995-24086)
scaffold0198 (264-313)||(23843-23892)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (245-317)||(38305-38377)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (204-301)||(20430-20527)
scaffold0031 (5-121)||(65600-65716)
scaffold0031 (263-317)||(128751-128805)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (204-298)||(4710-4805)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (250-317)||(4888-4954)
scaffold0395 (117-257)||(881-1021)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (204-314)||(16784-16895)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (264-314)||(13392-13442)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (264-314)||(20747-20797)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (264-314)||(37821-37871)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (264-301)||(11979-12016)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (245-313)||(28818-28887)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (5-126)||(18260-18381)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (244-301)||(2691-2748)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (244-301)||(267676-267733)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (235-315)||(10772-10850)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (104-242)||(3434-3574)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (253-317)||(18084-18148)
scaffold0247 (264-298)||(2241-2275)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (264-311)||(4300-4347)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (264-315)||(9241-9292)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (75-126)||(15546-15597)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (5-179)||(16156-16330)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (246-301)||(97021-97076)
scaffold0006 (246-301)||(106299-106354)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (264-314)||(106-156)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (264-314)||(13947-13997)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (264-298)||(29948-29982)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (264-314)||(40400-40450)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (268-314)||(161206-161252)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (5-126)||(14863-14984)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (266-314)||(4214-4262)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (245-301)||(8110-8166)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (264-316)||(12361-12413)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (270-314)||(12064-12108)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (199-264)||(15417-15483)
scaffold0107 (248-302)||(36195-36248)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (244-298)||(103679-103733)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (80-126)||(46609-46655)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (272-301)||(1874-1903)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (5-126)||(6294-6415)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 317
Target Start/End: Original strand, 21395789 - 21396101
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21395789 agcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 21395888  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395889 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 21395988  T
Q  205 ttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395989 ttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 21396088  T
Q  305 aagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||    
T  21396089 aagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 317
Target Start/End: Original strand, 21790282 - 21790594
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21790282 agcacgtccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 21790381  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790382 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 21790481  T
Q  205 ttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790482 ttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 21790581  T
Q  305 aagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||    
T  21790582 aagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 317
Target Start/End: Original strand, 21389259 - 21389571
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||   |||| |||||||||||||  ||||| ||||    
T  21389259 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccaatatatgaag 21389358  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389359 ttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 21389458  T
Q  205 ttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389459 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 21389558  T
Q  305 aagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||    
T  21389559 aagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 117 - 317
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  117 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  217 atttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 16199551 - 16199765
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16199551 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 16199650  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199651 gtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 16199750  T
Q  303 tgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||    
T  16199751 tgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31971471 - 31971257
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31971471 gttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 31971372  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31971371 gttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31971273  T
Q  302 ttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  31971272 ttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 45130903 - 45131117
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  45130903 gttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagat 45131002  T
Q  204 gttgatgaa-ttgaatttgatataattatgccatgttg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131003 gttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 45131101  T
Q  302 ttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  45131102 ttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 317
Target Start/End: Original strand, 21918915 - 21919121
Alignment:
Q  114 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatg-tttgtatacataagatgttgatgaa 212  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||| ||||    
T  21918915 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  213 ttgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 309  Q
    ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 21919113  T
Q  310 gatgatgt 317  Q
    ||||||||    
T  21919114 gatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Original strand, 18879150 - 18879352
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  18879150 taatctgtgaagctga-taagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 18879248  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 310  Q
    ||||| | ||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18879249 aattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T
Q  311 atgatgt 317  Q
    |||||||    
T  18879346 atgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20536424 - 20536208
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  20536424 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20536325  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20536324 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20536226  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  20536225 tgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22626951 - 22626736
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  22626951 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaaga 22626852  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626851 tgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22626753  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  22626752 gatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 316
Target Start/End: Original strand, 28648949 - 28649164
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||||  |||||    
T  28648949 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaaga 28649048  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28649049 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 28649147  T
Q  300 tgttgaagatgatgatg 316  Q
    || ||||||||||||||    
T  28649148 tgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 18818314 - 18818530
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  18818314 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 18818413  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    || || ||| ||  | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18818414 tgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18818512  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  18818513 tgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 21923833 - 21924049
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    |||| ||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  21923833 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 21923932  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| || ||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21923933 tgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21924031  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  21924032 tgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  202 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6759472 - 6759255
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||  |||  ||||||  | ||    
T  6759472 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgag 6759373  T
Q  202 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||    ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759372 atgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6759277  T
Q  299 atgttgaagatgatgatgtcca 320  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  6759276 ttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 317
Target Start/End: Original strand, 16092272 - 16092463
Alignment:
Q  129 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 227  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  16092272 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatta 16092371  T
Q  228 ttatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||| |||| ||||   ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16092372 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866395
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372778
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||       ||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    | || ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7372795  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  7372794 gatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406379
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  203 tgtt--gatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    || |  | ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23406399  T
Q  298 gatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23406398 gttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17140988 - 17140916
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17140988 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21490995
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6520440 - 6520368
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6520440 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 17353744 - 17353865
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||  || | || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17353744 agcacttgcagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 17353843  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17353844 ttaattgtaatctgtgaagctg 17353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  298 g 298  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23648769 - 23648554
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  23648769 gttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaga 23648670  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| || |||| |  |||||| |||||| |||||||||||   |  |||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  23648669 tgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23648571  T
Q  300 tgttgaagatgatgatg 316  Q
    || | |||||| |||||    
T  23648570 tgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612231
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  267 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  267 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Original strand, 25363047 - 25363123
Alignment:
Q  106 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 181  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25363047 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  249 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20498634 - 20498578
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20498634 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 14409495 - 14409606
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14409592  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  14409593 gattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 20046246 - 20046357
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20046246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20046343  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  20046344 gattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1484452 - 1484402
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484452 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 4542485 - 4542535
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542485 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 5853404 - 5853454
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853404 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19896315 - 19896265
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896315 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20403277 - 20403227
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403277 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22001803 - 22001753
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001803 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Original strand, 13508138 - 13508199
Alignment:
Q  249 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 310  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508138 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19899407 - 19899286
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||   |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  19899407 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatttaagaag 19899308  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  19899307 ttaactgcaatctgtgaagctg 19899286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 320
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413462
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 310
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597731
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 310  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070574
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 15203343 - 15203393
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203343 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26219767 - 26219733
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219767 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 26219733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41598238 - 41598188
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41598238 ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290841
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 301
Target Start/End: Original strand, 19801493 - 19801530
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801493 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4483324 - 4483281
Alignment:
Q  271 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483324 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16184965 - 16184877
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 169  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||| | ||| | |||||||||    
T  16184965 gtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg-atatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgttta 16184877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 302
Target Start/End: Original strand, 22419471 - 22419519
Alignment:
Q  254 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22419471 atgttgttgtatattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22419519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Original strand, 23776717 - 23776816
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattact 178  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||  || || |||||| |||||| ||||| ||  ||||||||| | |||||||||    
T  23776717 gtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagctg-ttatgaaatgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattact 23776815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397566
Alignment:
Q  249 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatg 28397566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 7266
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 7372  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7371 attgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 7272  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  7271 tgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1289
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1494 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 1395  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1394 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1295  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  1294 tgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15356
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16487 - 16282
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16487 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatga 16388  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16387 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 16288  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  16287 tgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17046700 - 17046487
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046700 gttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagat 17046601  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046600 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 17046501  T
Q  304 gaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||    
T  17046500 gaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 14053207 - 14053422
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag-a 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  14053207 gttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaa 14053306  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14053307 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatg 14053406  T
Q  302 ttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  14053407 ttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12902978 - 12902757
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||      
T  12902978 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 12902879  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902878 taagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12902780  T
Q  295 taagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  12902779 taagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7089098 - 7088877
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||      
T  7089098 aagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatg 7088999  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088998 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7088900  T
Q  295 taagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  7088899 taagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22636650 - 22636437
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  22636650 gttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22636552  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22636551 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22636453  T
Q  300 tgttgaagatgatgat 315  Q
    || |||||||||||||    
T  22636452 tgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44053045 - 44052829
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  44053045 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 44052946  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  44052945 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagt 44052847  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  44052846 tgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Original strand, 15121685 - 15121917
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15121685 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaggctga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattactt 15121783  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatg----ttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    ||||||||  ||||||||| || |  |||||||| |||    
T  15121784 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat--catgattattgttgtaatctgcctatgctgat-attgttattcaac 15121879  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  15121880 caagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 310
Target Start/End: Original strand, 23374259 - 23374473
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||      
T  23374259 aagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 23374358  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23374359 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttc 23374457  T
Q  295 taagatgttgaagatg 310  Q
    |||| |||||||||||    
T  23374458 taagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Original strand, 16377428 - 16377639
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  16377428 gttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 16377527  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16377528 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16377626  T
Q  302 ttgaagatgatga 314  Q
     ||||||| ||||    
T  16377627 atgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14038863 - 14038653
Alignment:
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||  | ||||    
T  14038863 ttaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagat 14038764  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14038763 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 14038665  T
Q  301 gttgaagatgat 312  Q
    | ||||||||||    
T  14038664 gatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Original strand, 16270149 - 16270356
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| |     
T  16270149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 16270248  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 308  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16270249 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 16270347  T
Q  309 tgatgatgt 317  Q
    |||||||||    
T  16270348 tgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  136 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcc 234  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| |    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  235 atgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  148 ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gt 244  Q
    |||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgt 6899963  T
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899962 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 16239875 - 16240090
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||| |||  |||||    
T  16239875 gttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaaga 16239974  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||| | || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |    
T  16239975 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagtt 16240073  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  16240074 gatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3096373 - 3096293
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096373 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7893916 - 7893703
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||   ||||||| |||  |||||| | | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  7893916 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 7893820  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7893819 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagt 7893721  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  7893720 tgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Original strand, 52873408 - 52873488
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52873408 tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13956
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13952  T
Q  298 gatg 301  Q
    ||||    
T  13953 gatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243298
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 296  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  297 agatgttgaagatgatga 314  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3096859 - 3096772
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 191  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096859 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22353886 - 22353835
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 296  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  297 agatgttgaagatgatga 314  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 298
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  252 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 314
Target Start/End: Original strand, 44928965 - 44929042
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44928965 tgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190479
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242693
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 18215325 - 18215436
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215325 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18215422  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  18215423 gattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 12419 - 12469
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12419 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 1837621 - 1837671
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837621 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 7641294 - 7641344
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641294 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12611000 - 12610950
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611000 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 15118464 - 15118514
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118464 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 181
Target Start/End: Original strand, 17047989 - 17048055
Alignment:
Q  116 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 181  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239581
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 23803377 - 23803427
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803377 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44615338 - 44615288
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615338 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 44773199 - 44773249
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44773199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 50222451 - 50222501
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222451 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 51463980 - 51464030
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463980 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52312560 - 52312510
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312560 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13569824 - 13569703
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||  |||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  13569824 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaag 13569725  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  13569724 ttaactgcaatctgtgaagctg 13569703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 316
Target Start/End: Original strand, 19618257 - 19618336
Alignment:
Q  235 atgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618257 atgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3515057 - 3515007
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515057 ttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355471
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23843790 - 23843669
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||   |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| || |||||| ||| ||||||||| |    
T  23843790 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtggtaatgtgacctatataagatg 23843691  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  23843690 ttaactgcaatctgtgaagctg 23843669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15094085 - 15093911
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    |||||||||| || |||||  |||| |||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   ||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  15094085 agcacttccaaaactgagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttggttagtaatgtgacctatataagaag 15093986  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 179  Q
    |||| || ||||| ||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  15093985 ttaactgcaatctctgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 15093911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 301
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  266 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970853
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20309313 - 20309108
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20309313 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 20309214  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309213 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 20309114  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  20309113 tgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 38021 - 38235
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38021 gttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 38120  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    | |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38121 gatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T
Q  302 ttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  38220 ttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23286082 - 23285865
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||      
T  23286082 aagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatt 23285983  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285982 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23285885  T
Q  298 gatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23285884 gttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Original strand, 23654286 - 23654507
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||  ||| |||      
T  23654286 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatt 23654385  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgt---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||   ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654386 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23654484  T
Q  295 taagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  23654485 taagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 317
Target Start/End: Original strand, 23103278 - 23103516
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattac 177  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||  | ||| ||| |||||||||||  ||||| ||    
T  23103278 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttggatttgatgtgatataatgtttaattgcatgac 23103376  T
Q  178 ttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaact 276  Q
    |||||  |||  || ||   | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23103377 ttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaact 23103475  T
Q  277 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103476 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 313
Target Start/End: Original strand, 40622015 - 40622327
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| ||| | |||| |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40622015 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgcatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 40622114  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtt-----tgtatacata 199  Q
    |||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||    
T  40622115 ttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacata 40622213  T
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    ||||||||||  ||||||||| || |  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |    
T  40622214 agatgttgatgaattgaa-ttgatataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatat 40622309  T
Q  296 aagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||| | |||||||||    
T  40622310 aagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 22731139 - 22731355
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  ||| |    
T  22731139 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaata 22731238  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22731239 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaact 22731337  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  22731338 tgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 314
Target Start/End: Original strand, 298714 - 298933
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||      
T  298714 aagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 298813  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298814 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 298913  T
Q  295 taagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  298914 taagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 22738085 - 22738300
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  22738085 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22738184  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||   |||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22738185 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22738282  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || | |||||||||||||    
T  22738283 tgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23060728 - 23060513
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||    
T  23060728 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaaga 23060630  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23060629 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23060531  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  23060530 tgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076442
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    | ||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23076460  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
     | |||||||||||||||    
T  23076459 ggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23660262 - 23660023
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattact 178  Q
    |||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||    
T  23660262 gtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 23660163  T
Q  179 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaact 276  Q
    |||   ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||  ||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  23660162 tgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaact 23660064  T
Q  277 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23660063 aagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22337331 - 22337115
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  22337331 gttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22337232  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||  ||| ||||||||| |||||| |||| |||| |   |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22337231 tgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22337133  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  22337132 tgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072070
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679589
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  241 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23038347 - 23038227
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| || |||||||   |||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  23038347 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaattgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaag 23038248  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagct 125  Q
    |||  || |||||||||||||    
T  23038247 ttatctgcaatctgtgaagct 23038227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22105524 - 22105412
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||| |   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105524 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22105426  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  22105425 gattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Original strand, 23040257 - 23040310
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040257 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  298 gatg 301  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671830
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 22740767 - 22740945
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22740767 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 22740866  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 182  Q
    |||| || ||||| ||||| ||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  22740867 ttaactgcaatctttgaagttg-ttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 22740945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 316
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215085
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T
Q  301 gttgaagatgatgatg 316  Q
    | | |||||| |||||    
T  32215070 gattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 314
Target Start/End: Original strand, 45029863 - 45030016
Alignment:
Q  162 aatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgtt 258  Q
    ||||| |||||||||||||||  || | || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||| ||  | ||||    
T  45029863 aatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgtt 45029961  T
Q  259 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029962 gttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 22758522 - 22758700
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  22758522 agcactttcagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaaa 22758621  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 182  Q
    |||| || ||||| ||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  22758622 ttaactgcaatctatgaagctg-ttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 22758700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26505490 - 26505379
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatg---ttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||   || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26505490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26505393  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  26505392 gattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26507968 - 26507857
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatg---ttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||   || ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26507968 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26507871  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  26507870 gattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 571447 - 571397
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  571447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6726045 - 6725995
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726045 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18808993 - 18808943
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18808993 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23130912 - 23130862
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23133379 - 23133329
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133379 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23135640 - 23135590
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135640 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 23709644 - 23709694
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709644 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 23712125 - 23712175
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712125 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 34402634 - 34402684
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402634 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39682363 - 39682313
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682363 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 23708668 - 23708721
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708668 atactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452033
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43137349 - 43137301
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137349 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 21155172 - 21155219
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 314
Target Start/End: Original strand, 24529633 - 24529691
Alignment:
Q  255 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529633 tgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 24643062 - 24643109
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643062 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24367824 - 24367790
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367824 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 32039610 - 32039660
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039610 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 24898307 - 24898358
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898307 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 24900790 - 24900841
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900790 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 24903267 - 24903318
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903267 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 24905744 - 24905795
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905744 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 24908219 - 24908270
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908219 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  247 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 22798933 - 22799094
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| | |||  |||| |||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   | || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22798933 agcacttccagaactaagtgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagaag 22799032  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt 167  Q
    |||| || ||| ||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  22799033 ttaactgcaatttgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgtt 22799094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51787 - 51582
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  51787 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatga 51688  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51687 attgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatga 51588  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  51587 tgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Original strand, 27847746 - 27847951
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847746 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 27847845  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27847846 attgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatga 27847945  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  27847946 tgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 104 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40443605 - 40443393
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40443605 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 40443506  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40443505 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgt 40443406  T
Q  303 tgaagatgatgat 315  Q
    |||||||||||||    
T  40443405 tgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12699048 - 12698831
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  12699048 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 12698949  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgt----tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698948 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12698850  T
Q  299 atgttgaagatgatgatgt 317  Q
     || |||||||||||||||    
T  12698849 ttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Original strand, 16386147 - 16386369
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||      
T  16386147 aagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatt 16386246  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    ||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386247 taagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16386346  T
Q  295 taagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16386347 taagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9509405 - 9509189
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  9509405 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 9509306  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9509305 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9509207  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  9509206 tgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10589254 - 10589039
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |   |||||    
T  10589254 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagat 10589155  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagtt 10589056  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    || ||||||||||||||    
T  10589055 gtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Original strand, 17137945 - 17138177
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17137945 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattactt 17138043  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||    ||||||||||  |||||||||||| |  |||||||| |||    
T  17138044 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaac 17138139  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17138140 caagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 314
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  302 ttgaagatgatga 314  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26212217 - 26211995
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| |||      
T  26212217 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 26212118  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26212117 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtc 26212019  T
Q  295 taagatgttgaag-atgatgatgt 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  26212018 taagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12187251 - 12187019
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12187251 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-taagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattactt 12187153  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatg-ttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||   |||||  |||||||||||| |  |||||||| |||    
T  12187152 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat--catgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaac 12187057  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  12187056 caagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Original strand, 3564269 - 3564482
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  3564269 gttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 3564368  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3564369 tgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 3564467  T
Q  300 tgttgaagatgatga 314  Q
    || ||||||||||||    
T  3564468 tgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495402
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38227696 - 38227481
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||| |   |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| | | | ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||    
T  38227696 gttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaaga 38227597  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38227596 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagta 38227498  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  38227497 gatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505419
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200786
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996148
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13647440 - 13647325
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| |||| |   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 13647342  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||| ||||||||||    
T  13647341 gttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 317
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 295  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  296 aagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15755008
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  298 g 298  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 18154643 - 18154821
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||  ||||||    ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18154643 agcacttccagaactgagtgcaagtgagggaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattaaagatggaccattgggtagtaatgagacctatataagaag 18154742  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 182  Q
    |||| || ||| ||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| | | |||||||||||  |||||||||||||    
T  18154743 ttaactgcaatatgtgaagctg-ttatgagatgttaatgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttgaa 18154821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  249 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16213831 - 16213684
Alignment:
Q  168 tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtt 264  Q
    |||||||||||||||  || | || |||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  16213831 tatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 16213733  T
Q  265 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213732 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 296  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  297 agatgttgaagatgatga 314  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  241 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 298
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24704796 - 24704688
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 303  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24704796 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T
Q  304 gaagatgatga 314  Q
     ||||||||||    
T  24704698 taagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18430762 - 18430709
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430762 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24054781 - 24054618
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| | | |||||| ||||| ||||  || | || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  24054781 agcacttccagaactgagtgaaagtgagaatattgcgatctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataaggag 24054682  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 169  Q
    |||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  24054681 ttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatatgatgttta 24054618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24702349 - 24702238
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24702349 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24702252  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  24702251 gattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116509
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  44116522 gattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 456371 - 456321
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456371 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3386383 - 3386333
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386383 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11972546 - 11972496
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972546 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 14949234 - 14949284
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949234 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 15376825 - 15376875
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376825 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16232570 - 16232520
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232570 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16410109 - 16410059
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16410109 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 17062027 - 17062077
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17062027 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18640322 - 18640272
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640322 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 20385235 - 20385285
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385235 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 21189707 - 21189757
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189707 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32125541 - 32125491
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41522967 - 41522917
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522967 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41525429 - 41525379
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525429 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9703579 - 9703458
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||  |||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  9703579 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaag 9703480  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  9703479 ttaactgcaatctgtgaagctg 9703458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Original strand, 11393399 - 11393448
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393399 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 19649291 - 19649469
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| |||||| |||||| || || |||||    
T  19649291 agcacttccagaaccgagtgtaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctaaattagaag 19649390  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 182  Q
    |||| || |||||||||||| |  ||||  |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  19649391 ttaactgcaatctgtgaagcag-ttaagtgatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 19649469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13831431 - 13831373
Alignment:
Q  255 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831431 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275187
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Original strand, 15144105 - 15144139
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144105 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 298
Target Start/End: Original strand, 18154882 - 18154943
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154882 tgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27216910 - 27216860
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216910 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 19486793 - 19486865
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486793 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203828
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaagatg 18203828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898523
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11880565 - 11880456
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||   |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||| ||| ||||||||| |    
T  11880565 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatatgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatg 11880466  T
Q  105 ttaattgtaa 114  Q
    |||| |||||    
T  11880465 ttaactgtaa 11880456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Original strand, 965 - 1170
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  965 taatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 1064  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1065 attgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1164  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  1165 tgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5246
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5036 gttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagat 5135  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 5235  T
Q  304 gaagatgatga 314  Q
    |||||||||||    
T  5236 gaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 111 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11185711 - 11185517
Alignment:
Q  111 gtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11185711 gtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Original strand, 16920546 - 16920751
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16920546 taatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 16920645  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16920646 atggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatga 16920745  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  16920746 tgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22831710 - 22831503
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat--aagatgttgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22831710 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 22831611  T
Q  210 gaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 309  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22831610 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagat 22831511  T
Q  310 gatgatgt 317  Q
    ||||||||    
T  22831510 gatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  145 tgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt 244  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 20638188 - 20638404
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||    
T  20638188 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaaga 20638287  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20638288 tgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 20638386  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  20638387 tgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 20360865 - 20361081
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  20360865 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20360964  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||   |||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20360965 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagt 20361063  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||| ||||||||||    
T  20361064 tgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29060755 - 29060540
Alignment:
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||| | ||||    
T  29060755 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagat 29060656  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  29060556 gatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 19303446 - 19303661
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  19303446 gttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgaga 19303545  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303546 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 19303644  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  19303645 gatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16496397 - 16496244
Alignment:
Q  166 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttg 262  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| ||    
T  16496397 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 16496298  T
Q  263 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496297 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 25629260 - 25629476
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  25629260 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 25629359  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||  ||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25629360 tgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25629458  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  25629459 tgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 316
Target Start/End: Original strand, 18409732 - 18409947
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||  || ||   | |||    
T  18409732 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgaga 18409831  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18409832 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagt 18409930  T
Q  300 tgttgaagatgatgatg 316  Q
    || ||||||||||||||    
T  18409931 tgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20593987 - 20593773
Alignment:
Q  106 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||||    
T  20593987 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatg 20593888  T
Q  205 ttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593887 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttg 20593789  T
Q  302 ttgaagatgatgatgt 317  Q
     |||||||||||||||    
T  20593788 atgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Original strand, 22780140 - 22780348
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||   |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  22780140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 22780239  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 307  Q
    | ||| | ||||||| |||||| ||   |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 22780338  T
Q  308 atgatgatgt 317  Q
    ||||||||||    
T  22780339 atgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 17287701 - 17287917
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||   ||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  17287701 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 17287800  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgt---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||| |||   |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17287801 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17287899  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || | |||||||||||||    
T  17287900 tgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20076817 - 20076700
Alignment:
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 295  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076817 taagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20076722  T
Q  296 aagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  20076721 aagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561303
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496592
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29809003
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25644401 - 25644339
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644401 tgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20109257 - 20109157
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||   |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20109257 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 20109158  T
Q  298 g 298  Q
    |    
T  20109157 g 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1595660 - 1595549
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1595660 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1595563  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  1595562 gattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22782374 - 22782227
Alignment:
Q  168 tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtt 264  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  22782374 tatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 22782276  T
Q  265 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22782275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25656705 - 25656629
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25656705 tgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19863292 - 19863171
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| |||| | |||||| |||||  |||  |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19863292 agcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcacatcatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 19863193  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  19863192 ttaactgcaatctgtgaagctg 19863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19873434 - 19873313
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| |||| | |||||| ||||| ||||  |||  || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19873434 agcacttccagaactgagtgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcgcatcattttattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 19873335  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  19873334 ttaactgcaatctgtgaagctg 19873313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  298 gatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25714470 - 25714417
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714470 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 25641990 - 25642168
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||  ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25641990 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgaactgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 25642089  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 182  Q
    |||| || ||||| ||||| ||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  25642090 ttaactgcaatctttgaagttg-ttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 25642168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 2291231 - 2291342
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2291231 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2291328  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  2291329 gattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 317
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  270 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8055079 - 8055029
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055079 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12742367 - 12742317
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742367 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 18334704 - 18334754
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334704 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19005096 - 19005046
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005096 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  252 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 19859031 - 19859081
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859031 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24422597 - 24422547
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422597 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25754859 - 25754809
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 26924752 - 26924802
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924752 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33861844 - 33861794
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861844 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33864328 - 33864278
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864328 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18456769 - 18456732
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456769 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18461929 - 18461892
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 301
Target Start/End: Original strand, 18821912 - 18821949
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22439114 - 22438951
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||| | | |||||| ||||| ||||  || | || |||||||   |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  22439114 agcacttccacaactgagtgcaagtgagaatattgcgatctgtgtcgcataattcgatttgagatggacccttgggtagtaatgagatctatataagaag 22439015  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 169  Q
    |||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  22439014 ttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatataaagttta 22438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 30676822 - 30676874
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676822 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 20556943 - 20557054
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20556943 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 20557040  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  20557041 gattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 1541023 - 1541073
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541023 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 3852129 - 3852179
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852129 ttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 4185865 - 4185919
Alignment:
Q  240 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185865 gttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 8227587 - 8227632
Alignment:
Q  272 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227587 taactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22432564 - 22432443
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| || | | |||||| |||||  |||  |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22432564 agcacttccagaactgagtgcaagttagtatattgcgatctgtgtctcattatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 22432465  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| |  ||||||||||||||    
T  22432464 ttaactacaatctgtgaagctg 22432443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34963423 - 34963371
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963423 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448686
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 302
Target Start/End: Original strand, 18177729 - 18177779
Alignment:
Q  251 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18177729 cctatgttgttgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18177779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 18204142 - 18204092
Alignment:
Q  251 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18204142 cctatgttgttgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18204092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25688552 - 25688518
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19873169 - 19873120
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873169 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 21739829 - 21739950
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| |   |||||| |||||  ||||  |||||| | |||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| || |    
T  21739829 agcacttccagaactgagtacaattgagaatgttgcgatctgtgtcacatgagttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatg 21739928  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  21739929 ttaattgcaatctgtgaagctg 21739950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 22334698 - 22334819
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || ||| |||   | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  22334698 agcacttccagaactgaatgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccctgggtagcaatgagacctatataagaag 22334797  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  22334798 ttaactgcaatctgtaaagctg 22334819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22432325 - 22432249
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||| || | || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432325 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22438875 - 22438799
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||| |||||||||| || | || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438875 tgttgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47200 - 46995
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47200 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatga 47101  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47100 attgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatga 47001  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  47000 tgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32280 - 32067
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32280 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagat 32181  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32180 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 32082  T
Q  303 tgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||    
T  32081 tgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Original strand, 38801304 - 38801508
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  38801304 taatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatga 38801403  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38801404 attgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatga 38801502  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  38801503 tgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Original strand, 27250629 - 27250850
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||      
T  27250629 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 27250728  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250729 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27250827  T
Q  295 taagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27250828 taagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 316
Target Start/End: Original strand, 50210118 - 50210333
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  50210118 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 50210217  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50210218 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 50210316  T
Q  300 tgttgaagatgatgatg 316  Q
    || ||||||||||||||    
T  50210317 tgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21026901 - 21026680
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||      
T  21026901 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 21026802  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| | |||| ||   ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026801 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21026703  T
Q  295 taagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  21026702 taagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34509996 - 34509783
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  ||||||  |||||    
T  34509996 gttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 34509897  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34509896 tgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 34509798  T
Q  300 tgttgaagatgatga 314  Q
    || ||||||||||||    
T  34509797 tgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21714862 - 21714684
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21714862 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 21714763  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 182  Q
    |||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21714762 ttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 21714684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532269
Alignment:
Q  116 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 214  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  || |||  |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  215 gaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    | | | ||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 22532275  T
Q  312 tgatgt 317  Q
    ||||||    
T  22532274 tgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295672
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Original strand, 22354477 - 22354616
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  22354477 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22354576  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt 242  Q
    ||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| ||||    
T  22354577 tgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 48603754 - 48603652
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattact 178  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  48603754 gtagtattgtgacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 48603655  T
Q  179 tga 181  Q
    |||    
T  48603654 tga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 317
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  217 atttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||   |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  314 atgt 317  Q
    ||||    
T  20847272 atgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Original strand, 45574928 - 45575008
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45574928 tgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20135403 - 20135188
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||    
T  20135403 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaaga 20135304  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgcc---atgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||||||| |  |||||| |||||| |   |||||||||||  ||||||||| || |  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  20135303 tgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 20135205  T
Q  300 tgttgaagatgatgatg 316  Q
    || | |||||| |||||    
T  20135204 tgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754064
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  298 gatg 301  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918623
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  298 gatg 301  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Original strand, 35261127 - 35261183
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261127 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22237695 - 22237630
Alignment:
Q  249 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22237695 tgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 20091280 - 20091401
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  20091280 agcacttccagaactgagtgcaaatgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaag 20091379  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  20091380 ttaactgcaatctgtgaagctg 20091401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 22468503 - 22468816
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||  | |||||| ||||| ||||  || | || |||||||   |||| |||||| |||||| | |  |||  |    
T  22468503 agcacttccagaactgagtgcaagtgagggtattgcgatatgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtattgagaccttttgaagttg 22468602  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
     ||||| |||||||||||||||  |||||| || || |||  ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||   ||  ||| |||  ||||||    
T  22468603 gtaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagat 22468701  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatg---ttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||||||| | ||||||| || ||| ||||   ||||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  22468702 gttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagtt 22468800  T
Q  301 gttgaagatgatgatg 316  Q
    | | |||||| |||||    
T  22468801 gattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 316
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21707225 - 21707167
Alignment:
Q  255 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707225 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21711767 - 21711709
Alignment:
Q  255 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711767 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 433125 - 433012
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgcc---atgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 296  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |   ||||| ||||||||||||| |||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  433125 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgccgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtcta 433030  T
Q  297 agatgttgaagatgatga 314  Q
    || || | ||||||||||    
T  433029 agttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13988916 - 13988866
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988916 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 21923403 - 21923453
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923403 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 22356079 - 22356185
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  22356079 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatg 22356178  T
Q  202 atgttga 208  Q
    |||||||    
T  22356179 atgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 22357765 - 22357871
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  || |    
T  22357765 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatg 22357864  T
Q  202 atgttga 208  Q
    |||||||    
T  22357865 atgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 23593847 - 23593897
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593847 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29298187 - 29298137
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29776738 - 29776688
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31612363 - 31612313
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612363 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 42865018 - 42865139
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||   |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||| ||| ||||||||| |    
T  42865018 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatg 42865117  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  42865118 ttaactgcaatctgtgaagctg 42865139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 320
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21840844 - 21840766
Alignment:
Q  235 atgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 315  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840844 atgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 298
Target Start/End: Original strand, 22123171 - 22123214
Alignment:
Q  255 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123171 tgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 314
Target Start/End: Original strand, 16275450 - 16275526
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16275450 tgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  266 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 21475199 - 21475249
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475199 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  247 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21714622 - 21714546
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714622 tgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 302
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533978
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 244 - 299
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 126
Target Start/End: Original strand, 22831218 - 22831306
Alignment:
Q  38 tgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||| | |||||  ||||  ||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  22831218 tgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctg 22831306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13711 - 13497
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13711 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 13612  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13611 gttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T
Q  302 ttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||| |||||||||    
T  13512 ttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10544
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10331 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagat 10430  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 303  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10431 gttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgtt 10530  T
Q  304 gaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||    
T  10531 gaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15584
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15370 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagat 15469  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15470 gttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15568  T
Q  302 ttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  15569 ttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7527 - 7295
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||| || || |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7527 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctatgaaactga-tatgagatgtttgcgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattactt 7429  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    ||||||||||  |||||||||||| |  |||||||| |||    
T  7428 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaac 7333  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7332 caagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 175079 - 174767
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||   |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  175079 agcacttccagaaccgagtccaagtgaggaaaatgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaag 174980  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    |||| || ||||||||||||| | || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || ||   | |||    
T  174979 ttaactgaaatctgtgaagct-attatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgaga 174881  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174880 tgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 174781  T
Q  303 tgaagatgatgatg 316  Q
    ||||| ||||||||    
T  174780 tgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  247 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 124801 - 124679
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |    
T  124801 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaa 124702  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatat 225  Q
     |||||||||||| | |||||||    
T  124701 cgttgatgaattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 301
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  241 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 301
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  241 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4919 - 4712
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4919 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 4820  T
Q  212 attgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 308  Q
    |||| | ||||| || ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4819 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4721  T
Q  309 tgatgatgt 317  Q
    |||||||||    
T  4720 tgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 13
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 211  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  143 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 44  T
Q  212 attgaatttgatataattatgccatgttgtt 242  Q
    |||| | ||||| || ||||| |||| ||||    
T  43 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 21292875 - 21293090
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  21292875 gttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagat 21292974  T
Q  204 gttgatgaa-ttgaat-ttgatataattatgccatgttg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||  || |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21292975 gttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 21293073  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||    
T  21293074 gttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37724216 - 37723910
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  37724216 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggagattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtattgagacctatataagaag 37724117  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    |||| || ||||||||||||||  |  || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || ||   | |||    
T  37724116 ttaactgcaatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgaga 37724018  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37724017 tgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgt 37723918  T
Q  303 tgaagatg 310  Q
    ||||||||    
T  37723917 tgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 23390401 - 23390617
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  23390401 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 23390500  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23390501 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23390599  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  23390600 tgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Original strand, 8286742 - 8286964
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||      
T  8286742 aagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatt 8286841  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt----gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 293  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286842 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8286940  T
Q  294 ctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  8286941 ctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25421748 - 25421532
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  25421748 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 25421649  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25421648 tgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25421550  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  25421549 tgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22075240 - 22075018
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| |||      
T  22075240 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 22075141  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075140 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtc 22075042  T
Q  295 taagatgttgaag-atgatgatgt 317  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  22075041 taagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24529428 - 24529223
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  ||||||  |||||||||| ||    
T  24529428 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 24529329  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 307  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24529328 acttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 24529230  T
Q  308 atgatga 314  Q
    |||||||    
T  24529229 atgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22032553 - 22032323
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22032553 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattactt 22032455  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatg-ttg-ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaacta 277  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||| |||||  |||||||||||| |  |||||||| ||| |    
T  22032454 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat--catgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaacca 22032359  T
Q  278 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    || ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  22032358 agttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Original strand, 18769886 - 18770118
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18769886 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattactt 18769984  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||    ||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  18769985 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgac 18770080  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  18770081 caagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24493784 - 24493569
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  24493784 gttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaaga 24493685  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24493684 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 24493586  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  24493585 gatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9078168 - 9077952
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  ||||||  | |||    
T  9078168 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgaga 9078069  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  9078068 tgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagt 9077970  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  9077969 tgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23572316 - 23572084
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||| || || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23572316 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagttga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattactt 23572218  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||    |||||||||   ||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  23572217 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat--catgattgttgttgtgatctgcctatgctgtt-attgttattgaac 23572122  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23572121 taagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatg 23572084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 317
Target Start/End: Original strand, 21729032 - 21729185
Alignment:
Q  166 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttg 262  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| ||    
T  21729032 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 21729131  T
Q  263 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729132 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 317
Target Start/End: Original strand, 21808357 - 21808510
Alignment:
Q  166 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttg 262  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| ||    
T  21808357 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 21808456  T
Q  263 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808457 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25431610 - 25431414
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| | |  |||||    
T  25431610 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaaga 25431511  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431510 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13025526 - 13025311
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||    
T  13025526 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaaga 13025427  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| | |||| |||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13025426 tgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagtt 13025328  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  13025327 gatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13095710 - 13095495
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||    
T  13095710 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaaga 13095611  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| | |||| |||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13095610 tgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagtt 13095512  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  13095511 gatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1096683 - 1096467
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||| || ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  1096683 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgaga 1096584  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||| |   ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1096583 tgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1096485  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||| ||||||    
T  1096484 tgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314577
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 317
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997655
Alignment:
Q  217 atttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  314 atgt 317  Q
    ||||    
T  21997652 atgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 21329546 - 21329618
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21329546 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Original strand, 20026990 - 20027046
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026990 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412187
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 22412204  T
Q  298 gatgttgaagatgatga 314  Q
    | || | ||||||||||    
T  22412203 gttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26704378 - 26704257
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||| || | |||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26704378 agcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaag 26704279  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  26704278 ttaactgcaatctgtgaagctg 26704257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26974111 - 26973990
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||| || | |||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26974111 agcacttccagaactgagtgcaagtaaggaaaatgtgatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaag 26974012  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  26974011 ttaactgcaatctgtgaagctg 26973990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21565614 - 21565546
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21565614 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22144121 - 22144065
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144121 atactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 26012084 - 26012137
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012084 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 182
Target Start/End: Original strand, 22107273 - 22107357
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaa 182  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22107273 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20909063 - 20909012
Alignment:
Q  263 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909063 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 23501222 - 23501273
Alignment:
Q  75 cttgcgtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23501222 cttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgcaatctgtgaagctg 23501273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29330045 - 29329934
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29330045 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29329948  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  29329947 gattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 264880 - 264930
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264880 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154776
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 10733052 - 10733102
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733052 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 11581311 - 11581361
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581311 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 20918060 - 20918110
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154942
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39245186 - 39245136
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245186 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39363434 - 39363384
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363434 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 314
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  266 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Original strand, 20902121 - 20902155
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23201681 - 23201559
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcg-tagtaatgagacttatataagaa 103  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||   |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  23201681 agcacttttagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagatggacccttggggtagtaatgagacctatagaagaa 23201582  T
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  23201581 gttaactgcaatctgtgaagctg 23201559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29346030 - 29345980
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346030 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061068
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 42245477 - 42245527
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245477 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21873491 - 21873387
Alignment:
Q  75 cttgcgtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgca 173  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  21873491 cttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgca 21873393  T
Q  174 ttactt 179  Q
    ||||||    
T  21873392 ttactt 21873387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319193
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29348500 - 29348453
Alignment:
Q  267 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29348500 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 267 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29350973 - 29350926
Alignment:
Q  267 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29350973 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32027451 - 32027393
Alignment:
Q  255 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027451 tgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18418699 - 18418599
Alignment:
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt-gtatactgcctatgttgttgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtct 295  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  18418699 taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtct 18418602  T
Q  296 aag 298  Q
    |||    
T  18418601 aag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704090
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 301
Target Start/End: Original strand, 26740720 - 26740750
Alignment:
Q  271 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740720 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973823
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 301
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  271 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  145 tgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt- 242  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||     
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  243 gtatactgcctatgttgttgtt 264  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  247 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 296  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40725898 - 40725853
Alignment:
Q  272 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725898 taactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 14079460 - 14079340
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    |||||||| |||| |||||  |||||||||   |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   | || ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  14079460 agcacttctagaactgagtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaag 14079361  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagct 125  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  14079360 ttaactgcaatctgtgaagct 14079340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412340
Alignment:
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 153  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatga 22412340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Original strand, 949 - 1169
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat 198  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |    
T  949 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 1048  T
Q  199 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatg---ttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 295  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 1147  T
Q  296 aagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  1148 aagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Original strand, 167879 - 168099
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacat 198  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |    
T  167879 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 167978  T
Q  199 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatg---ttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 295  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167979 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 168077  T
Q  296 aagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  168078 aagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 52129 - 51913
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  52129 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 52030  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52029 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 51931  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  51930 tgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 20698341 - 20698556
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  20698341 gttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagat 20698440  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| | ||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20698441 gttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20698539  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  20698540 gatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13442490 - 13442274
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  13442490 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13442391  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13442390 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 13442292  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  13442291 tgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12399430 - 12399209
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  | | |||| |||      
T  12399430 aagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatt 12399331  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399330 taagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12399232  T
Q  295 taagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  12399231 taagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17488072 - 17487856
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  17488072 gttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17487973  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17487972 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17487874  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  17487873 tgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14973070 - 14972854
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| || |||    
T  14973070 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgaga 14972971  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14972970 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14972872  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  14972871 tgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17499554 - 17499338
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  17499554 gttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17499455  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17499454 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17499356  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  17499355 tgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18438742 - 18438534
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  |||||| | ||||||||| ||    
T  18438742 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttg 18438643  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 307  Q
    | ||| ||||||||| |||||  |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  18438642 acttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 18438544  T
Q  308 atgatgatgt 317  Q
    ||||||||||    
T  18438543 atgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686887
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | |||  |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26686905  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  26686904 tgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43841148 - 43840932
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  43841148 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 43841049  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43841048 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 43840950  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43840949 tgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 856372 - 856140
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| | || || |||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  856372 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctta-tatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattactt 856274  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||    ||||||||||  |||||||||||| |  |||||||| |||    
T  856273 gaagattaattgtatacataagatgttgttgaattgaa-ttggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaac 856178  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856177 taagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 23083266 - 23083482
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||| |   ||| |||  |||||    
T  23083266 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaaga 23083365  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccat---gttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||   ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23083366 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23083464  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  23083465 tgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 298
Target Start/End: Original strand, 14576738 - 14576934
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  14576738 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 14576837  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttg--tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576838 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 314
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||  ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  302 ttgaagatgatga 314  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 25476290 - 25476506
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  25476290 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 25476389  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25476390 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagt 25476488  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  25476489 tgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210448
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Original strand, 40213626 - 40213838
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |  |||  ||||||  | |||    
T  40213626 gttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgaga 40213725  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  40213726 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 40213823  T
Q  300 tgttgaagatgatga 314  Q
    || | ||||||||||    
T  40213824 tgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 11424668 - 11424880
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  || |||  | |||    
T  11424668 gttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga 11424767  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||||||   |||   |||||||  ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11424768 tgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 11424863  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  11424864 gatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14179672 - 14179570
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattact 178  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14179672 gtagtattgtgacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 14179573  T
Q  179 tga 181  Q
    |||    
T  14179572 tga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42386619 - 42386429
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 209  Q
    |||||||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||  || |||  | |||||||| |    
T  42386619 taatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgtt 42386520  T
Q  210 gaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    || ||| |||||||||  ||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386519 gacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  249 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15470996 - 15470927
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15470996 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 317
Target Start/End: Original strand, 43550529 - 43550644
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |   ||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 43550627  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43550628 gttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672626
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  17672639 gattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14572804 - 14572608
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatg-cattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||  ||||| |||||| ||| |||||||||| |  ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||    
T  14572804 gttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaaga 14572705  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||| ||| |   | ||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572704 tgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  252 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27165319 - 27165250
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27165319 atactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14234559 - 14234487
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||    
T  14234559 atactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 313
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 17524959 - 17525080
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  17524959 agcacttccaaaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaag 17525058  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  17525059 ttaactgcaatctgtgaagctg 17525080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  298 gatgttgaagatgatga 314  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Original strand, 53301600 - 53301669
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301600 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 24340772 - 24340844
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340772 atactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 9707658 - 9707769
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707658 gttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9707755  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  9707756 gattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Original strand, 29172634 - 29172745
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172634 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29172731  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  29172732 gattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 6469246 - 6469296
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6469246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 7781459 - 7781509
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781459 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15977565 - 15977515
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17463228 - 17463178
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463228 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17737286 - 17737236
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 28848723 - 28848773
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848723 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34159376 - 34159326
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159376 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 45607019 - 45607069
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45607019 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 301
Target Start/End: Original strand, 53070704 - 53070802
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||   ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070704 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 53070801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55476541 - 55476491
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55500992 - 55500942
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55500992 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Original strand, 16282923 - 16282971
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282923 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13544075 - 13544024
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544075 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50242933 - 50242838
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242933 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8899144 - 8899094
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899144 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 10247835 - 10247885
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247835 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119887
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12567610 - 12567576
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567610 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 16454393 - 16454443
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454393 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21618499 - 21618465
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618499 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21618465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Original strand, 38962003 - 38962037
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962003 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 125
Target Start/End: Original strand, 14878388 - 14878433
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagct 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14878388 gtagtaatgtgacttatataagaagttaactgcaatctgtgaagct 14878433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274706
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16796761 - 16796685
Alignment:
Q  106 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttga 181  Q
    ||||| |||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16796761 taattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 37642314 - 37642386
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 13151902 - 13151953
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151902 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 13154367 - 13154418
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154367 ttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 17446767 - 17446816
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446767 ttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 1644723 - 1644775
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  1644723 atactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaag 1644775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Original strand, 15878119 - 15878168
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878119 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23408744 - 23408581
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| | |||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| |||||| ||  || ||| | |||||    
T  23408744 agcacttccagaacttagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgttacctattttagaag 23408645  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta 169  Q
    |||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23408644 ttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttta 23408581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 27135 - 26840
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||||||| | |||||| ||| | | || |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27135 agcatttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgaatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaag 27036  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 204  Q
    |||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27035 ttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 26937  T
Q  205 ttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||    ||||||||||  ||||||||| || |  |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  26936 ttgatgaattgaa-ttgatataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagat 26841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2160 - 1952
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||    
T  2160 taatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 2061  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 307  Q
    ||||| | ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2060 aattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 1962  T
Q  308 atgatgatgt 317  Q
    ||||||||||    
T  1961 atgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5057 - 4849
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||| |||||||||| ||    
T  5057 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttg 4958  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 307  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4957 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 4859  T
Q  308 atgatgatgt 317  Q
    ||||||||||    
T  4858 atgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13427 - 13211
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  13427 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13328  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13327 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13229  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  13228 tgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1851
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  2067 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 1968  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1967 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1869  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  1868 tgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3686 - 3470
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  3686 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 3587  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  3586 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 3488  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  3487 tgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 343
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | |||  |||||    
T  558 gttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaaga 459  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| ||  | ||||||| |||| | |||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  458 tgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 360  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | | |||||||||||||    
T  359 gataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 6026 - 6245
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  6026 gttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 6125  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || ||| |||| ||||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6126 tgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6225  T
Q  298 gatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    | || |||||||||||||||    
T  6226 gttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 3056 - 3271
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  3056 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 3155  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3156 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3254  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  3255 gatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39716 - 39479
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataa-gaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattac 177  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||    
T  39716 gtagtattgagactta-ataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 39618  T
Q  178 ttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    |||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39617 ttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaac 39519  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  39518 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 315
Target Start/End: Original strand, 75096 - 75333
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataa-gaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattac 177  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||    
T  75096 gtagtattgagactta-ataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 75194  T
Q  178 ttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    |||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  75195 ttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaac 75293  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  75294 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Original strand, 339855 - 340065
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  339855 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgaga 339954  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  339955 tgttgttgacttga-tttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 340051  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    |  |||||||||||    
T  340052 gacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 158562 - 158612
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158562 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 298
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24405
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  202 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgt----tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 126
Target Start/End: Original strand, 34770 - 34838
Alignment:
Q  58 ttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||||| |||||||   |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  34770 ttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 34838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2113 - 1881
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||   ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2113 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattactt 2015  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||    ||||||||||  |||||||||||| |  |||||||| |||    
T  2014 gaagaataattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaac 1919  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1918 caagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38976 - 38761
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  38976 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 38877  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  38876 tgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagtt 38778  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  38777 gatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33149 - 32942
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| |     
T  33149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 33050  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 308  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  33049 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 32951  T
Q  309 tgatgatgt 317  Q
    |||||||||    
T  32950 tgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9799 - 9744
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  9799 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12995 - 12763
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12995 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagct-aatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattactt 12897  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||    |||||||||   ||||||||| ||||  |||||||| |||    
T  12896 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat--catgattgttgttgtgatctgcctatgctgtt-attgttattgaac 12801  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  12800 taagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11305
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21132 - 20910
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||| |    
T  21132 aagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatata 21033  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |   ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  21032 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtc 20933  T
Q  295 taagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    
T  20932 taagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 316
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  116 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 214  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  215 gaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
      ||||||||| |||||  |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  312 tgatg 316  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 316
Target Start/End: Original strand, 17120 - 17337
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  17120 gttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 17219  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatg-----ttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||     || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17318  T
Q  298 gatgttgaagatgatgatg 316  Q
    | || ||||||||||||||    
T  17319 gttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 301
Target Start/End: Original strand, 79396 - 79433
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Original strand, 21688 - 21920
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  21688 gtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattactt 21786  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||    ||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||    
T  21787 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaac 21882  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  21883 caagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 313
Target Start/End: Original strand, 29580 - 29812
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattactt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  29580 gtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattactt 29678  T
Q  180 gaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca----tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||    ||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||    
T  29679 gaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaac 29774  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  29775 caagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 310
Target Start/End: Original strand, 25970 - 26179
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  25970 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 26069  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
     |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26070 cgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26168  T
Q  300 tgttgaagatg 310  Q
    || ||||||||    
T  26169 tgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 296  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  297 agatgttgaagatgatga 314  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28545 - 28414
Alignment:
Q  188 tttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 284  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28545 tttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgca 28447  T
Q  285 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28446 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11292
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1997
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 261 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  261 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1190
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8650
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    || || ||| ||| | ||||||| |||||| |||| |||| |  |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttg----ctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8633  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  8634 gatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34123
Alignment:
Q  240 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13141
Alignment:
Q  99 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 197  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  13313 aagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 13214  T
Q  198 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgt 267  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13213 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26111 - 25896
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  | |||    
T  26111 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 26012  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| |||||| |||| | ||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26011 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 25913  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | ||||||| |||||||    
T  25912 gatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40073 - 39858
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  | |||    
T  40073 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 39974  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| |||||| |||| | ||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  39973 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagtt 39875  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  39874 gatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  202 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  299 atgttgaagatgatgatgt 317  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Original strand, 16505 - 16721
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||| | |||    
T  16505 gttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 16604  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    || || ||| ||  ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16605 tgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 16703  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  16704 tgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40128 - 39913
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |   |||  |||||    
T  40128 gttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaaga 40029  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    ||||  |||  || ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  40028 tgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagtt 39930  T
Q  301 gttgaagatgatgatgt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  39929 gatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 126
Target Start/End: Original strand, 18538 - 18584
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18538 gtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23090 - 22886
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  23090 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 22991  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 307  Q
    | ||| ||||||||| |||||| ||   |||| ||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  22990 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 22893  T
Q  308 atgatga 314  Q
    |||||||    
T  22892 atgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 100446 - 100378
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  100446 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 313
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44504 - 44454
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44504 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 94461 - 94411
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94461 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Original strand, 17552 - 17586
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 38356 - 38407
Alignment:
Q  75 cttgcgtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38356 cttgggtagtaatgtgacctatataagaagttagttgcaatctgtgaagctg 38407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6669
Alignment:
Q  112 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 210  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||    
T  6818 taatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 6719  T
Q  211 aattgaatttgatataattatgccatgttg---ttgtatactgcctatgt 257  Q
    |||||   ||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  6718 aattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4723 - 4508
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  4723 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 4624  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||   |||| || |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4623 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 4526  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  4525 tgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12305 - 12090
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  12305 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 12206  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||   |||| || |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12205 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 12108  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  12107 tgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22257 - 22042
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  22257 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22158  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgcca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||   |||| || |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22157 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 22060  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  22059 tgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 317
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33077
Alignment:
Q  142 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg 240  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||    
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  241 tt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||  ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45928
Alignment:
Q  142 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttg 240  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||    
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  241 tt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||  ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16193 - 16113
Alignment:
Q  236 tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16193 tgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17450
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17397 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8485
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8585 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8486  T
Q  298 g 298  Q
    |    
T  8485 g 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36770 - 36592
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||| ||   |||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  36770 agcacttctagaactgagtgcaagtgaggaaaatacgatctgtgtcgcatgatttgtttagagaaggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaag 36671  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 182  Q
    |||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  36670 ttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 36592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15664
Alignment:
Q  241 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1652 - 1531
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  1652 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaag 1553  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || |||||  |||||||    
T  1552 ttaaatgcaatctacgaagctg 1531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1104 - 1048
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1104 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 2855 - 2923
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2855 atactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 48267 - 48388
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| || | | |||||| |||||  |||  |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  48267 agcacttccagaactgagtgcaagtaagaatattgcgatctgtgtcacataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 48366  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||| ||||||||||    
T  48367 ttaaatgcaatatgtgaagctg 48388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 70108 - 69930
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  70108 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 70009  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 182  Q
    |||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  70008 ttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8691 - 8479
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||| | |||||||||||||| |   ||| ||   |||||    
T  8691 gttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaaga 8596  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccat---gttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 299  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||| |||   ||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8595 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 8497  T
Q  300 tgttgaagatgatgatgt 317  Q
    || |||||||||||||||    
T  8496 tgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13011 - 12942
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  13011 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12766
Alignment:
Q  249 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13200 - 13144
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13200 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16202
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16149 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  253 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20295 - 20117
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  || ||||| ||||| |||| || | |||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20295 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggataatgtaatctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 20196  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaa 182  Q
    |||| || || |||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  20195 ttaactgcaacctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa 20117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160688
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 501195 - 501100
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501195 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 313
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 10590 - 10659
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  10590 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 894 - 773
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  894 agcacttccagaactgagtgtaaatgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtaatgagacctatttaagaag 795  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  794 ttaactgcaatctgtgaagctg 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4763 - 4545
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattact 178  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||| ||||  | | | |||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  4763 gtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattact 4665  T
Q  179 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaac 275  Q
    ||||| ||   || |||  |||||||||| ||||||  ||||||||| || ||  | || || |||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4664 tgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaac 4566  T
Q  276 taagctgcatgagtcggtcta 296  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  4565 taagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  241 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 8764 - 8885
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||  ||||| ||||  || | || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8764 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgacctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 8863  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  8864 ttaactgtaatctgtgaagctg 8885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10546
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10599 atactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaag 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 314
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  298 gatgttgaagatgatga 314  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  298 gatg 301  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 301
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53654
Alignment:
Q  200 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgttgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 297  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaa 53650  T
Q  298 gatg 301  Q
    ||||    
T  53651 gatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  253 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 136730 - 136680
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136730 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 139199 - 139149
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 144137 - 144087
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144137 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 134261 - 134211
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 141668 - 141618
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141668 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 301
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  241 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 129977 - 129924
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129977 atactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaag 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 116480 - 116430
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  116480 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 301
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  251 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28046 - 27912
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 202  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  28046 gttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 27947  T
Q  203 tgttgatgaattgaatttgatataattatgccatg 237  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  27946 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 22719 - 22788
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  22719 atactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 82122 - 82072
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82122 ttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 1034 - 1155
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || ||||||| | |||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  1034 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccttgggtagtaatatgacctatataagaag 1133  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || |||| |||||||||    
T  1134 ttaactgcaatcagtgaagctg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Original strand, 27798 - 27851
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27798 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3648
Alignment:
Q  106 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 153  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3695 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7712
Alignment:
Q  106 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 153  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  7759 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 18548 - 18431
Alignment:
Q  9 cttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaagttaa 108  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18548 cttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatatgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaa 18449  T
Q  109 ttgtaatctgtgaagctg 126  Q
     || ||||||||||||||    
T  18448 ctgcaatctgtgaagctg 18431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32608 - 32555
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51987
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 1052
Alignment:
Q  106 taattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 181  Q
    ||||| |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1128 taattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11464
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24086 - 23995
Alignment:
Q  75 cttgcgtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  24086 cttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt 23995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38377
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 301
Target Start/End: Original strand, 20430 - 20527
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20430 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Original strand, 65600 - 65716
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| | ||| ||||  |||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  65600 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatctttgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaag 65699  T
Q  105 ttaattgtaatctgtga 121  Q
    |||| || || ||||||    
T  65700 ttaactgcaacctgtga 65716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128751
Alignment:
Q  263 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4710
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 317
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  250 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 257
Target Start/End: Original strand, 881 - 1021
Alignment:
Q  117 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 215  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||| ||| |||  | |||| ||| ||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  216 aatttgatataattatgccatgttgttgtatactgcctatgt 257  Q
     ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  981 catt-gatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16784
Alignment:
Q  204 gttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 300  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16895 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  301 gttgaagatgatga 314  Q
    | | ||||||||||    
T  16797 gattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13442 - 13392
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13442 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20797 - 20747
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20797 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37871 - 37821
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37871 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12016 - 11979
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12016 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 313  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 18260 - 18381
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||  |||| || |||||||   | || ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  18260 agcacttccagaactgagtgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaag 18359  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| |  ||||||||||||||    
T  18360 ttaactacaatctgtgaagctg 18381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10850 - 10772
Alignment:
Q  235 atgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 315  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10850 atgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3574
Alignment:
Q  104 gttaattgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 201  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  202 atgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt 242  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 317
Target Start/End: Original strand, 18084 - 18148
Alignment:
Q  253 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 317  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18084 tatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2275
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4347 - 4300
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4347 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9292 - 9241
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 15546 - 15597
Alignment:
Q  75 cttgcgtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15546 cttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 15597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 16156 - 16330
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||    |||||| ||||| ||||  |||| || ||| |||   |||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  16156 agcacttccagaattgagtgcaagtgaggttgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtaatatgacctatataagaag 16255  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattactt 179  Q
    |||| || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16256 ttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 16330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  246 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 106
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  156 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13997 - 13947
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13997 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29982 - 29948
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29982 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40450 - 40400
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40450 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161252
Alignment:
Q  268 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14984 - 14863
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||| | ||| || ||||| ||||  |||| || |||||||  || || |||||||||| || |||| ||||||    
T  14984 agcacttccagaactgagtgccagtgaggatactgcaatctgtgtcgcataatttgattagagatggactcctgggtagtaatgaaacctatacaagaag 14885  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  14884 ttaactgcaatctgtgaagctg 14863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4214
Alignment:
Q  266 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Original strand, 8110 - 8166
Alignment:
Q  245 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8110 atactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 316
Target Start/End: Original strand, 12361 - 12413
Alignment:
Q  264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12361 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12108 - 12064
Alignment:
Q  270 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12108 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Original strand, 15417 - 15483
Alignment:
Q  199 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgccatgttgtt-gtatactgcctatgttgttgtt 264  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  15417 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36195
Alignment:
Q  248 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 302  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 36195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 298
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  244 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 298  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 126
Target Start/End: Original strand, 46609 - 46655
Alignment:
Q  80 gtagtaatgagacttatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46609 gtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 46655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 301
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  272 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 6415 - 6294
Alignment:
Q  5 agcacttccagaattgagtataagtgaggaaaatgcgatttgtgttgcatgttttgtttggagatggtttcttgcgtagtaatgagacttatataagaag 104  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||   |||||| ||||| ||||  |||| || ||||||| | | || ||||||| || || |||| ||||||    
T  6415 agcacttccagaactgtgtgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccctgggtagtaaagaaacctatacaagaag 6316  T
Q  105 ttaattgtaatctgtgaagctg 126  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  6315 ttaactgcaatctgtgaagctg 6294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1906 times since January 2019
Visitors: 2394