View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0235Ase25 (Length: 484)

Name: NF0235Ase25
Description: NF0235-1
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0235Ase25
NF0235Ase25
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (189-471)||(20054418-20054700)
chr1 (189-471)||(20054874-20055156)
chr1 (189-471)||(20055330-20055612)
chr1 (189-471)||(20055786-20056068)
chr1 (189-471)||(20056242-20056524)
chr1 (189-471)||(20057145-20057427)
chr1 (189-471)||(20845543-20845825)
chr1 (189-471)||(20057601-20057883)
chr1 (189-471)||(20053962-20054244)
chr1 (185-471)||(50002953-50003239)
chr1 (189-471)||(52250188-52250470)
chr1 (201-471)||(38340888-38341158)
chr1 (189-468)||(50002589-50002868)
chr1 (189-471)||(20056698-20056971)
chr1 (189-471)||(16451815-16452097)
chr1 (189-471)||(16460968-16461250)
chr1 (201-454)||(35759502-35759755)
chr1 (185-471)||(43057401-43057687)
chr1 (189-454)||(46693617-46693883)
chr1 (198-468)||(51372765-51373035)
chr1 (189-396)||(20060222-20060429)
chr1 (238-454)||(35760845-35761061)
chr1 (199-467)||(43056957-43057224)
chr1 (189-354)||(52250642-52250807)
chr1 (189-354)||(52250979-52251144)
chr1 (224-471)||(31822577-31822827)
chr1 (268-464)||(50002246-50002442)
chr1 (305-454)||(20061189-20061338)
chr1 (199-471)||(12883506-12883776)
chr1 (267-471)||(16907216-16907420)
chr1 (268-455)||(2634922-2635109)
chr1 (254-467)||(30872897-30873110)
chr1 (199-454)||(23180729-23180984)
chr1 (304-416)||(2328352-2328464)
chr1 (252-438)||(7548106-7548292)
chr1 (288-404)||(12728040-12728157)
chr1 (185-281)||(31822997-31823093)
chr1 (199-298)||(7547792-7547891)
chr1 (199-415)||(2634504-2634720)
chr1 (338-468)||(10820577-10820707)
chr1 (189-246)||(35759946-35760003)
chr1 (320-384)||(31823097-31823161)
chr1 (198-364)||(7229834-7230000)
chr1 (275-415)||(16410691-16410831)
chr1 (189-240)||(49996562-49996613)
chr1 (199-241)||(39582553-39582595)
chr1 (252-416)||(2739559-2739723)
chr1 (315-404)||(16440587-16440676)
chr1 (267-345)||(8278065-8278143)
chr1 (348-442)||(8278420-8278513)
chr1 (198-232)||(28181384-28181418)
chr1 (369-415)||(42317663-42317709)
chr1 (279-416)||(842905-843042)
chr1 (249-329)||(35009938-35010018)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (189-471)||(20850303-20850585)
chr6 (189-453)||(17027413-17027677)
chr6 (185-454)||(13492788-13493058)
chr6 (189-454)||(7911877-7912142)
chr6 (198-454)||(7912309-7912565)
chr6 (189-453)||(13191395-13191659)
chr6 (198-456)||(20896578-20896837)
chr6 (189-471)||(23986199-23986481)
chr6 (189-453)||(9352062-9352326)
chr6 (199-454)||(17731001-17731260)
chr6 (199-470)||(21311954-21312225)
chr6 (189-471)||(23776423-23776704)
chr6 (189-392)||(13492393-13492597)
chr6 (199-467)||(2890731-2890998)
chr6 (189-467)||(2681102-2681376)
chr6 (251-454)||(16519967-16520170)
chr6 (199-454)||(20126074-20126329)
chr6 (199-470)||(21311498-21311769)
chr6 (199-468)||(17850903-17851172)
chr6 (216-467)||(11062272-11062522)
chr6 (200-471)||(2720456-2720728)
chr6 (198-357)||(28780206-28780365)
chr6 (205-456)||(6330811-6331061)
chr6 (267-468)||(15929567-15929768)
chr6 (305-471)||(3652468-3652634)
chr6 (199-468)||(17851359-17851628)
chr6 (319-471)||(31821704-31821856)
chr6 (267-457)||(9440269-9440459)
chr6 (314-468)||(15929184-15929338)
chr6 (314-471)||(27334143-27334300)
chr6 (314-471)||(27394883-27395040)
chr6 (199-471)||(14771611-14771883)
chr6 (189-404)||(9440739-9440954)
chr6 (198-416)||(1991590-1991808)
chr6 (200-455)||(17205337-17205591)
chr6 (223-415)||(33774918-33775112)
chr6 (199-354)||(2891186-2891340)
chr6 (199-298)||(3652678-3652777)
chr6 (198-452)||(20735696-20735950)
chr6 (201-458)||(12194325-12194580)
chr6 (314-416)||(20732615-20732717)
chr6 (199-414)||(3884984-3885194)
chr6 (252-416)||(32292922-32293084)
chr6 (267-413)||(28065795-28065944)
chr6 (381-471)||(3652961-3653051)
chr6 (199-298)||(3653057-3653152)
chr6 (199-253)||(11062029-11062083)
chr6 (189-241)||(27334305-27334357)
chr6 (189-241)||(27395045-27395097)
chr6 (367-454)||(9440488-9440575)
chr6 (317-403)||(28583013-28583099)
chr6 (198-326)||(31415980-31416107)
chr6 (314-416)||(10964341-10964443)
chr6 (189-263)||(28583154-28583228)
chr6 (198-246)||(15929346-15929394)
chr6 (275-415)||(30729807-30729947)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (189-468)||(1205-1484)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (189-460)||(1933-2204)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (198-470)||(14813932-14814204)
chr3 (189-468)||(28561731-28562009)
chr3 (189-471)||(39653146-39653428)
chr3 (189-471)||(50347728-50348010)
chr3 (189-471)||(11179916-11180197)
chr3 (189-454)||(31284158-31284423)
chr3 (189-471)||(16811363-16811643)
chr3 (189-471)||(13149981-13150263)
chr3 (189-454)||(27187211-27187477)
chr3 (189-410)||(13150436-13150657)
chr3 (198-454)||(8067279-8067535)
chr3 (199-471)||(32227483-32227754)
chr3 (189-468)||(32227103-32227382)
chr3 (189-471)||(14820136-14820418)
chr3 (198-471)||(16810907-16811180)
chr3 (189-416)||(32386616-32386843)
chr3 (199-471)||(25230597-25230869)
chr3 (199-471)||(25238184-25238456)
chr3 (199-468)||(20885009-20885277)
chr3 (200-468)||(30529672-30529939)
chr3 (199-471)||(37045017-37045286)
chr3 (198-454)||(25248110-25248367)
chr3 (253-454)||(41472300-41472500)
chr3 (265-471)||(39640919-39641125)
chr3 (199-471)||(25802440-25802712)
chr3 (199-401)||(4067252-4067454)
chr3 (199-413)||(25238576-25238790)
chr3 (199-464)||(25230140-25230405)
chr3 (199-464)||(25237727-25237992)
chr3 (199-471)||(2911077-2911338)
chr3 (201-454)||(41473996-41474249)
chr3 (267-451)||(29224326-29224510)
chr3 (189-453)||(7477191-7477455)
chr3 (314-471)||(32796942-32797099)
chr3 (189-453)||(7493881-7494145)
chr3 (305-471)||(25239075-25239241)
chr3 (198-406)||(26309880-26310088)
chr3 (267-471)||(25802964-25803168)
chr3 (188-364)||(53150693-53150869)
chr3 (185-385)||(3899868-3900068)
chr3 (199-393)||(15392570-15392764)
chr3 (199-393)||(15405606-15405800)
chr3 (189-246)||(41473748-41473805)
chr3 (315-416)||(31103966-31104069)
chr3 (199-246)||(25239019-25239066)
chr3 (199-393)||(15388203-15388397)
chr3 (199-393)||(15417431-15417625)
chr3 (199-240)||(25230989-25231030)
chr3 (201-325)||(15377412-15377536)
chr3 (199-246)||(18318862-18318909)
chr3 (201-237)||(26436264-26436300)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (189-468)||(28495839-28496118)
chr7 (189-471)||(42515526-42515808)
chr7 (189-454)||(2941639-2941904)
chr7 (189-471)||(34405473-34405755)
chr7 (189-454)||(9124958-9125223)
chr7 (189-471)||(2193238-2193520)
chr7 (189-454)||(13125017-13125283)
chr7 (189-471)||(36422234-36422515)
chr7 (198-471)||(2189126-2189399)
chr7 (185-462)||(6718953-6719229)
chr7 (198-454)||(18833285-18833541)
chr7 (199-428)||(2465949-2466178)
chr7 (199-454)||(42515091-42515346)
chr7 (189-471)||(28495501-28495772)
chr7 (199-471)||(679799-680071)
chr7 (198-363)||(13122395-13122561)
chr7 (189-354)||(7646360-7646525)
chr7 (233-409)||(2465777-2465953)
chr7 (199-455)||(35474013-35474269)
chr7 (198-354)||(7646514-7646670)
chr7 (199-469)||(22529127-22529397)
chr7 (199-458)||(29038912-29039171)
chr7 (199-471)||(2611551-2611816)
chr7 (265-471)||(46425723-46425929)
chr7 (198-454)||(5406478-5406735)
chr7 (305-454)||(11517387-11517535)
chr7 (199-468)||(29357348-29357616)
chr7 (198-339)||(43776181-43776322)
chr7 (199-454)||(6747498-6747745)
chr7 (198-415)||(25182399-25182616)
chr7 (332-471)||(43233395-43233534)
chr7 (315-428)||(26421768-26421881)
chr7 (289-451)||(26421287-26421449)
chr7 (199-336)||(3305240-3305377)
chr7 (269-449)||(20966055-20966235)
chr7 (356-468)||(26957606-26957718)
chr7 (317-413)||(31743834-31743930)
chr7 (189-273)||(43233137-43233221)
chr7 (267-443)||(1628726-1628899)
chr7 (265-471)||(35527079-35527285)
chr7 (199-426)||(11372478-11372697)
chr7 (201-413)||(9623248-9623459)
chr7 (301-464)||(36015405-36015568)
chr7 (305-455)||(31406582-31406732)
chr7 (375-443)||(13124769-13124837)
chr7 (199-244)||(6747968-6748013)
chr7 (189-260)||(36422575-36422646)
chr7 (369-471)||(3305374-3305476)
chr7 (315-393)||(16192379-16192457)
chr7 (189-240)||(26419117-26419168)
chr7 (198-244)||(7461273-7461319)
chr7 (199-245)||(31743781-31743827)
chr7 (352-415)||(2490077-2490140)
chr7 (199-246)||(31406481-31406528)
chr7 (374-416)||(16811913-16811955)
chr7 (199-245)||(36015361-36015407)
chr7 (410-471)||(10430745-10430806)
chr7 (374-451)||(11372901-11372978)
chr7 (419-471)||(2463624-2463676)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (189-468)||(17445337-17445616)
chr5 (198-454)||(189067-189323)
chr5 (189-454)||(8641917-8642181)
chr5 (189-471)||(34371594-34371876)
chr5 (189-454)||(3886483-3886748)
chr5 (199-464)||(10927295-10927560)
chr5 (189-468)||(42788528-42788807)
chr5 (189-414)||(2474444-2474669)
chr5 (189-454)||(2473958-2474213)
chr5 (189-471)||(2193798-2194068)
chr5 (199-454)||(22556535-22556791)
chr5 (199-454)||(22556968-22557224)
chr5 (201-471)||(34372050-34372320)
chr5 (189-454)||(3886939-3887204)
chr5 (199-454)||(1821905-1822160)
chr5 (227-470)||(21886066-21886309)
chr5 (189-463)||(8391204-8391477)
chr5 (189-464)||(15512894-15513170)
chr5 (189-471)||(27646717-27646999)
chr5 (231-471)||(10926870-10927110)
chr5 (199-471)||(20039367-20039638)
chr5 (198-471)||(34867772-34868033)
chr5 (188-408)||(18750077-18750297)
chr5 (199-443)||(29679999-29680236)
chr5 (198-453)||(24182137-24182391)
chr5 (205-471)||(18304413-18304679)
chr5 (199-468)||(39146924-39147186)
chr5 (199-392)||(20858434-20858626)
chr5 (269-458)||(30719767-30719956)
chr5 (200-372)||(11757174-11757346)
chr5 (198-396)||(30684447-30684645)
chr5 (214-451)||(16370618-16370852)
chr5 (199-468)||(1880066-1880330)
chr5 (198-323)||(30720151-30720276)
chr5 (288-468)||(5066872-5067052)
chr5 (201-260)||(187751-187810)
chr5 (315-454)||(4658001-4658139)
chr5 (198-298)||(30684902-30685002)
chr5 (315-458)||(2058664-2058807)
chr5 (315-470)||(42429129-42429283)
chr5 (374-454)||(22975077-22975157)
chr5 (203-279)||(38063725-38063800)
chr5 (320-464)||(11160694-11160838)
chr5 (199-324)||(8366595-8366719)
chr5 (281-416)||(32574632-32574766)
chr5 (305-396)||(4673469-4673560)
chr5 (189-232)||(21883967-21884010)
chr5 (267-341)||(4102908-4102982)
chr5 (200-245)||(5066781-5066826)
chr5 (255-340)||(5785958-5786043)
chr5 (190-240)||(21041410-21041460)
chr5 (338-451)||(43356651-43356762)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (189-471)||(25337879-25338161)
chr2 (221-471)||(41754271-41754521)
chr2 (189-454)||(24818325-24818589)
chr2 (189-454)||(30966689-30966954)
chr2 (189-454)||(30966233-30966498)
chr2 (203-471)||(8256508-8256776)
chr2 (199-459)||(16379387-16379647)
chr2 (198-416)||(33771038-33771256)
chr2 (189-454)||(5399699-5399964)
chr2 (198-454)||(29259511-29259767)
chr2 (199-471)||(1912507-1912778)
chr2 (199-452)||(16378938-16379191)
chr2 (199-456)||(33174955-33175210)
chr2 (265-471)||(29804664-29804870)
chr2 (202-470)||(15619881-15620149)
chr2 (199-471)||(25433948-25434220)
chr2 (199-471)||(33174487-33174756)
chr2 (265-464)||(11388178-11388375)
chr2 (205-467)||(1707028-1707289)
chr2 (198-451)||(30963154-30963407)
chr2 (189-347)||(32377598-32377756)
chr2 (199-457)||(27882818-27883076)
chr2 (314-471)||(18098885-18099042)
chr2 (189-321)||(32377789-32377921)
chr2 (265-416)||(11394572-11394721)
chr2 (198-396)||(30961774-30961972)
chr2 (198-443)||(30963611-30963856)
chr2 (202-406)||(15639781-15639985)
chr2 (198-416)||(83054-83272)
chr2 (201-442)||(13190986-13191226)
chr2 (261-453)||(38898866-38899058)
chr2 (332-458)||(1953150-1953276)
chr2 (343-471)||(18447954-18448082)
chr2 (315-415)||(20502061-20502160)
chr2 (198-401)||(8073944-8074147)
chr2 (200-279)||(8181254-8181333)
chr2 (275-404)||(16542034-16542164)
chr2 (199-246)||(36924373-36924420)
chr2 (199-245)||(20502172-20502218)
chr2 (198-290)||(18875876-18875968)
chr2 (199-451)||(37552570-37552819)
chr2 (198-229)||(29804871-29804902)
chr2 (338-402)||(36924453-36924519)
chr2 (199-238)||(38898817-38898856)
chr2 (189-259)||(11389677-11389747)
chr2 (189-259)||(11406338-11406408)
chr2 (198-243)||(26865144-26865189)
chr2 (350-402)||(8181394-8181446)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (189-471)||(22548431-22548713)
chr8 (189-471)||(22026361-22026644)
chr8 (189-471)||(22548877-22549159)
chr8 (189-471)||(41658987-41659269)
chr8 (189-471)||(27022221-27022502)
chr8 (189-448)||(17103086-17103346)
chr8 (199-471)||(27925881-27926152)
chr8 (189-469)||(12827136-12827416)
chr8 (199-457)||(10844507-10844765)
chr8 (198-416)||(25147573-25147791)
chr8 (189-433)||(12100711-12100954)
chr8 (185-454)||(34308813-34309086)
chr8 (189-454)||(34308361-34308626)
chr8 (199-468)||(2044043-2044312)
chr8 (199-467)||(32292383-32292651)
chr8 (199-471)||(8080234-8080506)
chr8 (189-454)||(25147966-25148230)
chr8 (198-438)||(21316001-21316240)
chr8 (199-468)||(33852150-33852419)
chr8 (10-170)||(8446367-8446527)
chr8 (189-372)||(31283534-31283716)
chr8 (305-471)||(10844865-10845031)
chr8 (268-454)||(25144771-25144957)
chr8 (201-427)||(41912996-41913222)
chr8 (205-458)||(27819145-27819397)
chr8 (320-471)||(28375067-28375218)
chr8 (199-388)||(30527374-30527563)
chr8 (269-468)||(6464872-6465071)
chr8 (198-413)||(15818907-15819121)
chr8 (199-454)||(28453337-28453592)
chr8 (332-468)||(27021904-27022044)
chr8 (199-298)||(32292096-32292195)
chr8 (314-468)||(22840536-22840690)
chr8 (198-416)||(3744675-3744893)
chr8 (268-409)||(3745145-3745286)
chr8 (267-396)||(15567516-15567645)
chr8 (201-273)||(6463438-6463510)
chr8 (204-275)||(22705353-22705424)
chr8 (267-471)||(1296990-1297193)
chr8 (267-458)||(6466706-6466892)
chr8 (291-455)||(30334892-30335056)
chr8 (205-364)||(25307855-25308012)
chr8 (320-443)||(22705182-22705302)
chr8 (356-464)||(29971450-29971558)
chr8 (268-363)||(34687920-34688015)
chr8 (198-240)||(9251098-9251140)
chr8 (224-354)||(10729603-10729733)
chr8 (189-235)||(22840431-22840477)
chr8 (199-245)||(29117444-29117490)
chr8 (199-245)||(34688044-34688090)
chr8 (206-246)||(10729830-10729870)
chr8 (198-241)||(6466468-6466511)
chr8 (198-243)||(12119228-12119273)
chr8 (338-402)||(15568036-15568100)
chr8 (203-239)||(29971323-29971359)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (189-453)||(18966-19230)
scaffold0322 (389-454)||(18203-18268)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (189-468)||(2727-3006)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (221-471)||(12691907-12692157)
chr4 (198-453)||(49998636-49998891)
chr4 (198-454)||(35871627-35871882)
chr4 (199-454)||(44471211-44471466)
chr4 (189-437)||(7678498-7678746)
chr4 (189-471)||(24629312-24629591)
chr4 (198-471)||(4127774-4128048)
chr4 (189-454)||(23350159-23350424)
chr4 (199-471)||(1645635-1645907)
chr4 (199-456)||(50398424-50398681)
chr4 (199-415)||(44470761-44470976)
chr4 (199-471)||(23942675-23942947)
chr4 (189-463)||(4127294-4127587)
chr4 (199-471)||(23943128-23943396)
chr4 (199-456)||(50398880-50399136)
chr4 (199-471)||(3169188-3169460)
chr4 (260-471)||(21220278-21220489)
chr4 (263-471)||(24628927-24629138)
chr4 (218-387)||(50814730-50814899)
chr4 (203-468)||(9423748-9424013)
chr4 (200-454)||(14572041-14572291)
chr4 (185-468)||(14351780-14352063)
chr4 (199-464)||(21067271-21067536)
chr4 (199-456)||(51331169-51331424)
chr4 (200-455)||(31817740-31817994)
chr4 (198-464)||(1464136-1464401)
chr4 (262-471)||(29628617-29628825)
chr4 (198-471)||(8467698-8467957)
chr4 (189-454)||(13266085-13266350)
chr4 (198-458)||(27026499-27026757)
chr4 (199-458)||(27578795-27579054)
chr4 (199-427)||(21067760-21067985)
chr4 (267-471)||(4185696-4185901)
chr4 (189-451)||(17628513-17628775)
chr4 (198-412)||(27578342-27578556)
chr4 (288-464)||(53996090-53996266)
chr4 (198-310)||(40607074-40607186)
chr4 (305-458)||(27029273-27029425)
chr4 (274-450)||(15306052-15306234)
chr4 (305-454)||(14571713-14571862)
chr4 (291-454)||(31817376-31817539)
chr4 (199-341)||(27578172-27578314)
chr4 (189-278)||(15268049-15268138)
chr4 (213-454)||(17029329-17029570)
chr4 (201-413)||(13613786-13613997)
chr4 (189-325)||(14571564-14571700)
chr4 (272-471)||(17028856-17029055)
chr4 (199-271)||(7381449-7381521)
chr4 (269-448)||(33764865-33765044)
chr4 (214-393)||(20306063-20306241)
chr4 (270-392)||(23091468-23091590)
chr4 (276-438)||(43928927-43929088)
chr4 (189-258)||(35477855-35477924)
chr4 (315-443)||(4186177-4186305)
chr4 (206-414)||(41869957-41870165)
chr4 (367-471)||(53854861-53854965)
chr4 (199-258)||(4414273-4414332)
chr4 (356-470)||(17506367-17506482)
chr4 (199-325)||(53854733-53854859)
chr4 (252-337)||(11828424-11828509)
chr4 (267-416)||(24271505-24271653)
chr4 (205-415)||(42838661-42838874)
chr4 (339-468)||(17505916-17506045)
chr4 (225-298)||(26200205-26200278)
chr4 (198-279)||(31817023-31817104)
chr4 (338-425)||(23976244-23976331)
chr4 (198-244)||(52048562-52048608)
chr4 (199-244)||(33294778-33294823)
chr4 (277-389)||(34554493-34554605)
chr4 (199-236)||(53996016-53996053)
chr4 (198-246)||(5810041-5810089)
chr4 (382-470)||(10165937-10166025)
chr4 (338-450)||(17628971-17629083)
chr4 (315-415)||(44831035-44831135)
chr4 (319-415)||(53391925-53392021)
chr4 (199-237)||(2499388-2499426)
chr4 (389-471)||(20309594-20309675)
chr4 (189-230)||(13265859-13265900)
chr4 (338-443)||(45682213-45682318)
chr4 (330-378)||(39902470-39902518)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (189-454)||(107345-107610)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (189-454)||(10299-10563)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (199-471)||(4543-4814)
scaffold0333 (199-468)||(5001-5274)
scaffold0333 (199-255)||(5320-5377)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (189-471)||(154739-155021)
scaffold0002 (189-244)||(154511-154566)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (189-454)||(2092-2357)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (201-453)||(105720-105972)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (189-454)||(162559-162825)
scaffold0022 (198-354)||(163025-163181)
scaffold0022 (199-354)||(163170-163325)
scaffold0022 (199-456)||(69707-69964)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (202-468)||(17493-17759)
scaffold0047 (199-471)||(18027-18298)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (189-365)||(13415-13591)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (198-357)||(14593-14752)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (200-454)||(245085-245335)
scaffold0005 (305-454)||(245514-245663)
scaffold0005 (189-325)||(245676-245812)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (189-342)||(421-574)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (189-311)||(1583-1705)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (199-404)||(2154-2350)
scaffold0557 (406-464)||(739-797)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (341-466)||(23660-23785)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (326-454)||(4001-4129)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (338-454)||(142305-142421)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (213-409)||(14785-14981)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (199-449)||(26074-26322)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (199-393)||(44613-44807)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (204-325)||(7070-7190)
[»] scaffold0442 (2 HSPs)
scaffold0442 (419-464)||(2494-2539)
scaffold0442 (199-227)||(1-29)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (199-245)||(37205-37251)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (189-230)||(62989-63030)
[»] scaffold1126 (1 HSPs)
scaffold1126 (377-449)||(986-1058)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20054418 - 20054700
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20054418 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20054517  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20054518 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20054617  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20054618 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20054700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20054874 - 20055156
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20054874 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20054973  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20054974 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20055073  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20055074 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20055156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20055330 - 20055612
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20055330 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20055429  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20055430 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20055529  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20055530 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20055612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20055786 - 20056068
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20055786 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20055885  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20055886 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20055985  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20055986 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20056068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20056242 - 20056524
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20056242 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20056341  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20056342 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20056441  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20056442 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20056524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20057145 - 20057427
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20057145 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20057244  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20057245 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20057344  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20057345 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20057427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20845543 - 20845825
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20845543 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaatttc 20845642  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20845643 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaacaaacaattcttataag 20845742  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20845743 ccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20845825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20057601 - 20057883
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20057601 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20057700  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20057701 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20057800  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  20057801 ccttctttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcatttcggtgtgattcagttcctctagaagctg 20057883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20053962 - 20054244
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20053962 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccagaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20054061  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||| ||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20054062 tcctagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20054161  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20054162 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20054244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 185 - 471
Target Start/End: Original strand, 50002953 - 50003239
Alignment:
Q  185 tgctgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaa 284  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50002953 tgctgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccaaaaa 50003052  T
Q  285 ttgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattctta 384  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  50003053 ttgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttttggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattatta 50003152  T
Q  385 taagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50003153 taagtctccctttaaccatgcagtcctatacctgcatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctttagaagctg 50003239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 52250470 - 52250188
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  52250470 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccattccaaaattgc 52250371  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    | ||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  52250370 ttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 52250271  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  52250270 ccttccttcgaccatgtagtcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 52250188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 201 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 38341158 - 38340888
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38341158 aaaccaacacgagtcttttccgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagc 38341059  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38341058 acgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaatgaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaac 38340959  T
Q  401 catgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||| || || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  38340958 catgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccatctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 38340888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 189 - 468
Target Start/End: Original strand, 50002589 - 50002868
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  50002589 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggggaacttcccggtaggtcatccatcccaaaattgc 50002688  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||| ||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  50002689 tccaagtcaaacacgcttaactatggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 50002788  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  50002789 ccttccttcaaccatgcagtcccatgcctacacggcctcaggatctctctcattccgatgtgattcggctcctctagaag 50002868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 20056698 - 20056971
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20056698 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20056797  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  20056798 tccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctcataag 20056897  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||         ||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20056898 ccttccttcaaccctgcagtcccata---------cctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20056971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 16451815 - 16452097
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16451815 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcatcacgcgcacgcttattggaaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 16451914  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16451915 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 16452014  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    | |||||| ||||||| |||| | ||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16452015 ctttccttcaaccatgtagtcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctg 16452097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 16460968 - 16461250
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460968 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcatcacgcgcacgcttattggaaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 16461067  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16461068 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 16461167  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    | |||||| ||||||| |||| | ||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16461168 ctttccttcaaccatgtagtcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctg 16461250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 201 - 454
Target Start/End: Original strand, 35759502 - 35759755
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||      
T  35759502 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttcccggtaggtcaccaatcccaaaatagctccaagtcaagc 35759601  T
Q  301 acgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaa 399  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  35759602 acgtttaact-atgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaa 35759700  T
Q  400 ccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  35759701 ccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 35759755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 185 - 471
Target Start/End: Original strand, 43057401 - 43057687
Alignment:
Q  185 tgctgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaa 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||| |||| || |    
T  43057401 tgctgactgacaatacaaaccaacacaagtctttttagcgtgttttgttctcactcacatgcttaccgggaaacttcccagtaggtcaccgatccaaaga 43057500  T
Q  285 ttgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattctta 384  Q
       |||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||    
T  43057501 ccactccaagtcaatcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattctta 43057600  T
Q  385 taagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43057601 taagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctaaaagctg 43057687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 46693617 - 46693883
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46693617 gactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcataccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 46693716  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  46693717 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatgaaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataag 46693816  T
Q  389 ccttcctttaaccat-gcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||  ||| | ||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  46693817 ccttccttcaaccatcacagtcccatacatgcacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 46693883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 198 - 468
Target Start/End: Original strand, 51372765 - 51373035
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51372765 cacaaaccaacacgagtcttttcagcggattttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttcctgataggtcacccatcccaaaattgctcaaagtca 51372864  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||     
T  51372865 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaataagatgcatcttgtcgatataggtagtactaaacaattcttataagccttccttc 51372964  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||||||| |||||  ||||||| ||| | ||||||||    
T  51372965 aaccatacagtcacatacctgtatggcctcgggatccctctcattctagtgtgatttggtacgtctagaag 51373035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 189 - 396
Target Start/End: Original strand, 20060222 - 20060429
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20060222 gactgaccccacaaaccaacacgagtctttccatcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattga 20060321  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20060322 tccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 20060421  T
Q  389 ccttcctt 396  Q
    | ||||||    
T  20060422 ctttcctt 20060429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Original strand, 35760845 - 35761061
Alignment:
Q  238 ctcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccg 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||   ||||||| |||||||||||||||     
T  35760845 ctcgcacgcttaccgggaaacttcccgataggttacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactacggagttctcatggaatgagctacca 35760944  T
Q  338 aaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctc 437  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  35760945 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacggcctcaggatccctc 35761044  T
Q  438 ttattctgatgtgattc 454  Q
    | |||| ||||||||||    
T  35761045 tcattccgatgtgattc 35761061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 467
Target Start/End: Original strand, 43056957 - 43057224
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||| || |   ||| |||||||    
T  43056957 acaaaccaacacaagttttttcagtgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatccaaagaccactctaagtcaa 43057056  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |    
T  43057057 tcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttctaagccttccttca 43057156  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaa 467  Q
    |||||| |||| ||||||  || ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43057157 accatgtagtcacatacctacacggccttaggatccc-ctcattctgatgtgattcggttcctctagaa 43057224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 52250807 - 52250642
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52250807 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 52250708  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 354  Q
    | ||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52250707 ttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 52250642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 52251144 - 52250979
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52251144 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 52251045  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 354  Q
    | ||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52251044 ttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 52250979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 224 - 471
Target Start/End: Original strand, 31822577 - 31822827
Alignment:
Q  224 gtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaa---ctttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttct 320  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||   ||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||    
T  31822577 gtgttttgtcctcactcgcacgtctacagggaaataacttccgagtaggtcgtccatcccaaaattgttccaagtcaaaaacgcttaactgtggagttct 31822676  T
Q  321 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgca 420  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||  ||    
T  31822677 tttggattgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatatatgtagtaccaaataattcttataaatcttccttcaaccatgtagtctcatacctaca 31822776  T
Q  421 tggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31822777 cggcctcatgatccctctcattctgatgtgatttggttgctctagaagctg 31822827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 268 - 464
Target Start/End: Original strand, 50002246 - 50002442
Alignment:
Q  268 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggca 367  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  50002246 ggtcaccaatcccaaaattgctccaagtcaagcacactcaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgataaaggta 50002345  T
Q  368 gtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50002346 gtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatgcctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggttcctcta 50002442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 305 - 454
Target Start/End: Original strand, 20061189 - 20061338
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20061189 ttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatg 20061288  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20061289 cagtcccatacctgcacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattc 20061338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12883776 - 12883506
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||    || || ||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||| | || ||||||||    
T  12883776 acaaatcaacacgagt-ttttcagcatgttttgtccacaaaa-catgcttactgggaaacttcccagtaggtcatccatccaaaaactacttcaagtcaa 12883679  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    | ||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||| |    
T  12883678 acacacttaactgtggagtttttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtattccttca 12883579  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    | ||||||||| |||||| |||  |||||  ||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  12883578 atcatgcagtcccatacctgcacagcctcgggatccatctcattccggtgtgattcggttcgtctagaagctg 12883506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 267 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16907420 - 16907216
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||||| | |||||  | || |||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  16907420 aggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactatggagttcttgtagaatggaccactgaaaagaagatgtatcttgttgatataggt 16907321  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctaga 466  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||  | ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||   |||||    
T  16907320 agtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgcagtttcatacctgcacagtctcaaaatccctctcattttgatatgatttggtttgcctaga 16907221  T
Q  467 agctg 471  Q
    |||||    
T  16907220 agctg 16907216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 268 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2635109 - 2634922
Alignment:
Q  268 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggca 367  Q
    |||||| ||||| || ||| ||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  2635109 ggtcactcatccaaagattactccaagccaaacacgcttaactgtggagttcttattgaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggta 2635010  T
Q  368 gtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcg 455  Q
    ||||| |||||||||||| ||   ||||| |||||||||||| |||||| |||   ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  2635009 gtaccaaacaattcttatgagttatccttcaaccatgcagtcccatacctgcacaacctcatgatccctctcattccgatgtgattcg 2634922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 254 - 467
Target Start/End: Original strand, 30872897 - 30873110
Alignment:
Q  254 gaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatct 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || | | || ||||||||  | | |||| ||  |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  30872897 gaaacttttcagtaggtcacccatccaaagactactgcaagtcaagcatgcttaattgtggagttcttatagaatggactaccaaaaagaagatgcatct 30872996  T
Q  354 tattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    | |||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  30872997 tgttgatataggtagtatcaaacaattcttaaaagtcttccttcaaccatacagtctcatacctgcacggcctcagaatccctctcattccggtgtgatt 30873096  T
Q  454 cggttcctctagaa 467  Q
    |||||| |||||||    
T  30873097 cggttcgtctagaa 30873110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23180984 - 23180729
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |   |  ||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23180984 acaaaccaacattagtcttttcagcatgttttgtcgtcactcgcacattttttgaaaaactttccagaaggtaacccatcccaaaatttctccaagtcaa 23180885  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| ||  || ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| | |||||| |    
T  23180884 gcacgcttaattgtggaattcttatggaatgggctagcgaatagaagatacatcttgttgatataggtagtaccaagcaattcttataatcattccttca 23180785  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||| | |||| ||| ||  || ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  23180784 accacgtagtcccattcctacacggcttcaagatccctctcattccaatgtgattc 23180729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 304 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2328464 - 2328352
Alignment:
Q  304 tttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccat 403  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2328464 tttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccat 2328365  T
Q  404 gcagtctcatacc 416  Q
    |||||| ||||||    
T  2328364 gcagtcccatacc 2328352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7548292 - 7548106
Alignment:
Q  252 gggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcat 351  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  7548292 gggaaacttctcggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagtacgcttaattgtggagttcttatcaaatgggctaccaaaaagaatatgcat 7548193  T
Q  352 cttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctct 438  Q
    ||| |||||||||  | |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  7548192 cttgttgatatagttaataccaaacaatttttataagtcttcctttaatcatgtagtctcatacctacacggcctcatgatccctct 7548106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 288 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12728157 - 12728040
Alignment:
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagt-acctaacaattcttata 386  Q
    |||||||||||  | | |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12728157 ctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggcagtaaccaaacaattcttata 12728058  T
Q  387 agccttcctttaaccatg 404  Q
    || ||||||| |||||||    
T  12728057 agtcttccttcaaccatg 12728040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 281
Target Start/End: Original strand, 31822997 - 31823093
Alignment:
Q  185 tgctgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatccca 281  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  31822997 tgctgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaacttcccagtaggtcacccatccca 31823093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7547891 - 7547792
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  7547891 acaaatcaacacgagacttttcagtgtgttttgtccttactcgcacgcttatcgaaaaactttccggtaggtcacccatccaaacactactccaagtcaa 7547792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2634720 - 2634504
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||| ||||| || |   || |||||| || | | |||| |||||| || | | |||||||||||    
T  2634720 acaaacaaacaagagtcttttcagcgtgcttcatcctcattcgcatgctttttggaaaacttcccagaatgtcatccatccaaagactactccaagtcaa 2634621  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||||||||| |   ||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  2634620 gcacgtttaacagtgaagttcttattgaatagactatcgaaaagaagatgcatcttgtttgtatagctagtaccaaacaattcttgcaagccttccttta 2634521  T
Q  399 accatgcagtctcatac 415  Q
    | |||||| ||||||||    
T  2634520 atcatgcaatctcatac 2634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10820707 - 10820577
Alignment:
Q  338 aaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctc 437  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||  ||||   ||  ||||||  |||||||    
T  10820707 aaaaaaagatgtatcttattgatataggtagtaccaaacaattcttataaatcttccttcaaccatgtagtccaatacatacaccgcctcataatccctc 10820608  T
Q  438 ttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    | | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  10820607 tcactccgatgtgattcggttcatctagaag 10820577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Original strand, 35759946 - 35760003
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 246  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35759946 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcgctcgcacgc 35760003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Original strand, 31823097 - 31823161
Alignment:
Q  320 ttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattctta 384  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  31823097 ttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcattttattgatataggtagtaccaaataattctta 31823161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 364
Target Start/End: Original strand, 7229834 - 7230000
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| |  ||  |||||||     |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7229834 cacaaagcaacacgagttttttcagcatgttttatcctcactttcacgcttttcgaaaaactttatataaggtcaccaatcctaaaattgctccaagtca 7229933  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatag 364  Q
    || | | ||| ||   ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||||    
T  7229934 aacatgcttatctatggagttcttatgtaatgaactaccgaaatgaagatgcttcgtgttgatatag 7230000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Original strand, 16410691 - 16410831
Alignment:
Q  275 catcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtaccta 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    ||||||| | ||||  |||||| |||| |||||||||||| ||| ||| || ||||   |    
T  16410691 catcccaaacttgctccaagtcaaacatgtttaactttgaagttcttctagaataggctaccaaaaacaagatgcatcttgttggtattggtagtagtaa 16410790  T
Q  375 acaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatac 415  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||    
T  16410791 ataattcttataagctttccttcaacaatgcattcccatac 16410831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Original strand, 49996562 - 49996613
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 240  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49996562 gactgaccccacaaactaacaagagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 49996613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39582595 - 39582553
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 241  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39582595 acaaaccaaaacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcg 39582553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2739723 - 2739559
Alignment:
Q  252 gggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgca 350  Q
    |||||||||| | | |||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  |||||  |||| |||||||||||||   |||   |||||||||| ||    
T  2739723 gggaaacttttcagaaggtcatccatatcaaaattgctcaaagtcaaacacacttaacc-atgaagttcttatggaatagactataaaaaagaagataca 2739625  T
Q  351 tcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacc 416  Q
    | || |||||||| | ||| |  ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  2739624 tattgttgatatatgtagtgctaaacaattcttataagtctttccttaaccatacagtctcatacc 2739559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 404
Target Start/End: Original strand, 16440587 - 16440676
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| || |||| | |||| |||||||||| ||| ||| |||||||    
T  16440587 agttattatagaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttgttatcggtagtagcaaacagttcttataagtctttcttcaaccatg 16440676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 8278143 - 8278065
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaag 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||||  ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  8278143 aggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagtctttatgaaatggactaccaaaaagaag 8278065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8278513 - 8278420
Alignment:
Q  348 gcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttatt 442  Q
    |||||||||| | ||||| | |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |  | |||||||||||| ||||||||||    
T  8278513 gcatcttattaaaataggtaataccaaacaattgttacaagtcttcctttaacc-tgcagtctcgtgcttgtatggcctcaagaaccctcttatt 8278420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 232
Target Start/End: Original strand, 28181384 - 28181418
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28181384 cacaaaccaacacgagtcttttcagagtgttttgt 28181418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 42317709 - 42317663
Alignment:
Q  369 tacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatac 415  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  42317709 taccaaacaattcttataagcattcctttaaccgtgcaatctcatac 42317663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 842905 - 843042
Alignment:
Q  279 ccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaa 378  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||  | || ||| | ||||||| ||||||||| |||  || |  |||||| |||||    
T  842905 ccaaaattgttcaaagtcaagcacgttcaactgttgagttcttatgtgacgatctatcaaaaagaacatgcatcttgttggaatggatagtaccaaacaa 843004  T
Q  379 ttcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacc 416  Q
    |||||| | | ||||||| || ||||||| | ||||||    
T  843005 ttcttacacgacttccttcaatcatgcagacacatacc 843042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 329
Target Start/End: Original strand, 35009938 - 35010018
Alignment:
Q  249 accgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatg 329  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | | |||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  35009938 accgggaaaattctcggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatg 35010018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 20850585 - 20850303
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20850585 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 20850486  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  20850485 tccaagtcaagcacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacaaaacaattcttataag 20850386  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20850385 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcatgaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 20850303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 17027413 - 17027677
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17027413 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 17027512  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17027513 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 17027612  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  17027613 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatt 17027677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 185 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13493058 - 13492788
Alignment:
Q  185 tgctgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaa 283  Q
    |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13493058 tgctgactgaccctacaaatcaacacgagtcttttcagcatgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggtaactttccggtaggtcacccatcccaaa 13492959  T
Q  284 attgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattctt 383  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  13492958 attgctctaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattatt 13492859  T
Q  384 ataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||    
T  13492858 ataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacagcctcaggatccttctcattccgatatgattc 13492788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7912142 - 7911877
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7912142 gactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaatcttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 7912043  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  | |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7912042 tccaagtcaagcaagcataactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 7911943  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
      |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  7911942 ttttccttcaaccatgcagtcctatacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattc 7911877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 198 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7912565 - 7912309
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7912565 cacaaaccaacatgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgtacgcttaacgggaaacttcccagcaggtcacccattccaaaattgctccaagtca 7912466  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||     
T  7912465 agcacgtttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcatataagttttccttc 7912366  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  7912365 aaccatgcagtcccatacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattc 7912309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 13191395 - 13191659
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13191395 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtattttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccggttggtcacccatctcaaaattgc 13191494  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13191495 tccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 13191594  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | || | ||||||||| |||| |||||||||    
T  13191595 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctacatagtcttaggatccctctcattccgatgtgatt 13191659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 198 - 456
Target Start/End: Original strand, 20896578 - 20896837
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttg-tcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20896578 cacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgtttttctcctcactcgcacacttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagcc 20896677  T
Q  297 aaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctt 396  Q
    ||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20896678 aagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttcctt 20896777  T
Q  397 taaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcgg 456  Q
     ||||||| |||||||||||  || ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20896778 caaccatgtagtctcatacctacacggcctaaggatccctctcattccgatgtgattcgg 20896837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 23986199 - 23986481
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  23986199 gactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcagcgtgtcttctcctcactcgcacgctttccgtgaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgc 23986298  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||  |||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23986299 tccaagtcaagcacacttaactgtgaagttcttatggtttgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttcatataggtagtaccaaacaattcttataag 23986398  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||| |||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23986399 cctaccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctccggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctg 23986481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9352326 - 9352062
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9352326 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttccaggtaggtcacccatcccaaaattgc 9352227  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  9352226 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtaccaaacaaatattataag 9352127  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
     || ||||  |||||| |||||||||||  ||  |||||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  9352126 tctcccttcgaccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcatttcgatgtgatt 9352062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Original strand, 17731001 - 17731260
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17731001 acaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccgataaactttccggtaggtcacctatctcaaaattgctccaagtcaa 17731100  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgc----atcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcc 394  Q
      ||| |||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17731101 gcacgcttaaatgtggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatctatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttcc 17731200  T
Q  395 tttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  17731201 tttaaccatgcagtcccatacctgaacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 17731260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21312225 - 21311954
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||  || | |||||||||||||    
T  21312225 acaaaccaacaccagtcttttcaatgtgttttgtcttcacttacacacttaccgggaaacttcccggtaggtcactcatcataagactgctccaagtcaa 21312126  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||||||||||   || |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21312125 gcacgtttaactatggatttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacctaacaattcttataagccttccttca 21312026  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagct 470  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| || |||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  21312025 accatgcagtctcatacctgcacagcctcatgaaccctctcattctggtgtgattcagttcctttagaagct 21311954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23776704 - 23776423
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  23776704 gactgactccacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtcgtcactcgcacgtttactaggaaacttcccagtaggtcatccatcccaaaattgc 23776605  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    |||||||||| |||| |||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  23776604 tccaagtcaagtacgcttaa-tgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccagacgattcttataag 23776506  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     ||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||| ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  23776505 tcttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggatacctctcattccggcgtgattcagttcctctagaagctg 23776423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13492597 - 13492393
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt-cctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattg 287  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13492597 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttttcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattg 13492498  T
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    |||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  13492497 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaatatcaaacaattcttataa 13492398  T
Q  388 gcctt 392  Q
    |||||    
T  13492397 gcctt 13492393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 199 - 467
Target Start/End: Original strand, 2890731 - 2890998
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||| |  | |  | ||||||||    
T  2890731 acaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttctcagtaggtcacccatcctagtactatttcaagtcaa 2890830  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2890831 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctactgaaaagaagaagcatctttttgatataggtagtccctaacaattcttataaaccttccttca 2890930  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaa 467  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2890931 accatgcagtcccatacctgcacggcctcgggat-cctctcattctaatgtgattcgattcctctagaa 2890998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 467
Target Start/End: Original strand, 2681102 - 2681376
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||| || |||    ||||||||||||||||     
T  2681102 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttctcaacgtgttttgtcctcacttgcacgcttactaggaaacttcccagta----acccatcccaaaattgt 2681197  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||| | ||  ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  2681198 tccaaattaagcacgcttaattgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatgggtagtaccaaacaattcttataag 2681297  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaa 467  Q
     |||| || |||||||||||| || |||  || ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  2681298 tcttcattcaaccatgcagtcccaaacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaa 2681376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16520170 - 16519967
Alignment:
Q  251 cgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgca 350  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16520170 cgggaaacttcccggcaggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgca 16520071  T
Q  351 tcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtg 450  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||  |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  16520070 tcttgttgatataggtagtaccaaacaaatctcataagccttccttcgaccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtg 16519971  T
Q  451 attc 454  Q
    ||||    
T  16519970 attc 16519967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Original strand, 20126074 - 20126329
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||| ||||| | || | | |||||||||||    
T  20126074 acaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttctaggtaggtcgcccattcaaagactactccaagtcaa 20126173  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| ||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| |    
T  20126174 gcacgcttaattgtggaattcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaaccattcttataagccttccttca 20126273  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||| |||||||||||  ||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  20126274 accatgtagtctcatacctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgattc 20126329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21311769 - 21311498
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||||||  || | | ||| |||||||    
T  21311769 acaaaccaacacgagtccttacagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccggaaaacatcccggtaggtcacccatcataagactactcaaagtcaa 21311670  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  21311669 gcacgcttaactgcggagttcttatggaatgagcttccaaaaagaagatggatcttgtttatctaggtaataccaaacaattcttataaggcttccttca 21311570  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagct 470  Q
    ||||||||||| |||||  | | ||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21311569 accatgcagtcccatacttgtacggcctcatgaaccctctcattccgatgtgattcgttttctctagaagct 21311498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17851172 - 17850903
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||| || | | |||||||||||    
T  17851172 acaaaccaacacgagtcttttcgacttgttttgtcctaactcgcacgcgtactaggaaacttcccagtaggtctcccatccgaagactactccaagtcaa 17851073  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||  |||||| ||| ||| ||||    
T  17851072 gcacgcttaactgtggagttcttatagaatgggctaccagaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacatatcttatcagcattctttta 17850973  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    ||||||||||| |||||  ||| | ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  17850972 accatgcagtcccatacttgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaag 17850903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 11062522 - 11062272
Alignment:
Q  216 ttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |  || |||||||||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||  ||| |||||||  ||    
T  11062522 ttttcagcgtgttttgtcctcactcacgggtttatcgggaaactttccgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtgga 11062423  T
Q  316 gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatac 415  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  11062422 gttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacaaaacacttcttataagccttccttcaaccatgtagtttcatac 11062323  T
Q  416 ccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaa 467  Q
    |  ||  |||||| ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  11062322 ctacacagcctcaggat-cctctcatgtcgatgtgattcggttcctctagaa 11062272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 471
Target Start/End: Original strand, 2720456 - 2720728
Alignment:
Q  200 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaa 299  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||  || ||||||||||| || | | |||||||||||     
T  2720456 caaaccgacacgagtcttctcagcgtgttttgttctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccaatatgtcacccatccaaagactactccaagtcaag 2720555  T
Q  300 tacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctacc-gaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
     ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  2720556 cacacttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaaagatgtgtcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttca 2720655  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||   ||||||||| |||| | | ||||| ||||| |||||||||||    
T  2720656 accatgcagtctcatacctgcacgaccttgggatccctctcattccggtatgatttggttcgtctagaagctg 2720728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 198 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28780365 - 28780206
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28780365 cacaaaccaacacgagtcttttcaaaatgttttatcctcactcgcacacttaccagaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 28780266  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttatt 357  Q
    |  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28780265 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatcttatt 28780206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 205 - 456
Target Start/End: Original strand, 6330811 - 6331061
Alignment:
Q  205 caacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgt 304  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||  |||| ||||||||||| |||  || | | ||| |||||||  |||     
T  6330811 caacacgagtctttctcgcgtgttttgtcatcacttgcacgcttactgagaatttttc-ggtaggtcaccaatcataagaatactcaaagtcaagcacgc 6330909  T
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6330910 ttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatg 6331009  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcgg 456  Q
     |||||||||||  || ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  6331010 tagtctcatacctacacggcctcaggatccatctcattccgatgtgattcgg 6331061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 267 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15929768 - 15929567
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  15929768 aggtcacccatcccaaaattgcttcatgttaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttgttgatataggt 15929669  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctaga 466  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||   || ||| | | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15929668 agtaccaaataattcttataagccttcattcaaccatgtagtccaatacatacaaggcattaggatctctcttattctgatgtgattcgattcatctaga 15929569  T
Q  467 ag 468  Q
    ||    
T  15929568 ag 15929567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 305 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 3652634 - 3652468
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3652634 ttaactgtggagttcttatggaatgaactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcagacaattcttataagccttccttcaaccatg 3652535  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     |||| ||||||  ||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3652534 tagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctg 3652468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17851628 - 17851359
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||| |||| |||||| | ||||||||| |||| |||||||||  || || |||| | ||  ||| |||||||||| || | | |||||||||||    
T  17851628 acaaaccaatacgattctttttaccgtgttttgccctcgctcgcacgctaacgggaaaacctcccaatagatcacccatccgaagactactccaagtcaa 17851529  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| ||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  17851528 gcacgcttaattgtggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacatatcttataagccttctttta 17851429  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  17851428 accatgcagtcccatacttgcacggcctcgggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaag 17851359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 319 - 471
Target Start/End: Original strand, 31821704 - 31821856
Alignment:
Q  319 cttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccg 418  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||      
T  31821704 cttatggaatgagctaccaaaaaaaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaataattcttataagcattccttcaaccatgtagtctcataccta 31821803  T
Q  419 catggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31821804 catggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggtttctctagaagctg 31821856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 267 - 457
Target Start/End: Original strand, 9440269 - 9440459
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |     
T  9440269 aggtcacccatccaaaaattgctccaaatcaagcacacttaactgtgaagttcttatggagtgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgttgatataagt 9440368  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggt 457  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||| ||| | | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9440369 agtaccgaacaattcttataagctttcattcaaccatgcagttccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattcggt 9440459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 314 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15929338 - 15929184
Alignment:
Q  314 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||    
T  15929338 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttattgatataggcattaccaaacaattcttataagcttttcttcaaccttgtagtctcat 15929239  T
Q  414 acccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||   | ||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||    
T  15929238 acctaaacggcctcaggatccatcttattatgttgtgattcggttaatctagaag 15929184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 314 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27334300 - 27334143
Alignment:
Q  314 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  27334300 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagttccat 27334201  T
Q  414 acccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||| ||| | ||||| || ||||||  ||| | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  27334200 acctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattcagttcctctataagctg 27334143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 314 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27395040 - 27394883
Alignment:
Q  314 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  27395040 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagttccat 27394941  T
Q  414 acccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||| ||| | ||||| || ||||||  ||| | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  27394940 acctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattcagttcctctataagctg 27394883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 14771611 - 14771883
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||| || |||||| |  ||||||||| ||||| || | | ||||| ||| |    
T  14771611 acaaaccaacatgagtcttatcagcgtgttttgtcctcgctcgtacgtttactggtaaacttccgagtaggtcactcatccaaagactactccacgtcta 14771710  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||  |||||||  |||||||||||||||    |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  14771711 gcacacttaactgtggagttcttatggaatagattaccaaaaagaatatggatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttca 14771810  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||  ||||||||| |||| |  |||||||| ||| || ||||||||    
T  14771811 accatgcagtctcatacctacacggcttcgggatccctctcattccggcgtgattcgcttcatcaagaagctg 14771883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 404
Target Start/End: Original strand, 9440739 - 9440954
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||   |  |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  9440739 gactgaccccacaaaccagcacgagttttttcagcgtattttgtcatcacttgcacatttttcgggaaacttccaagaaggtcacccatcccaaaattgc 9440838  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    || |||||||| ||  |||||||   |||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| | | |||||| || ||||||||||||    
T  9440839 tcaaagtcaaacacacttaactgtgaagttcttatggtttgggctactgaaaagaaaatgcatcttgttgataaaagtagtaccaaagaattcttataag 9440938  T
Q  389 ccttcctttaaccatg 404  Q
    | |||||| |||||||    
T  9440939 cattccttcaaccatg 9440954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1991808 - 1991590
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| || || |  ||| ||||||| | | ||||||||||||| |||| | |||||| |||    
T  1991808 cacaaatcaacacgagttttttcagcgtactttgtcttcactcacatgcttttcggaaaacttttcagaaggtcacccatccaaaaactactccaaatca 1991709  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  | |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | | |||| |||||||||| ||||||||| |      
T  1991708 ataatgtttaactgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttagatatgtaataccaaacaattcttgtaagccttcttcc 1991609  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacc 416  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  1991608 aaccatgtagtctcatacc 1991590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17205591 - 17205337
Alignment:
Q  200 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaa 299  Q
    |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |  | |||  ||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||     
T  17205591 caaatcaacgcgagtcttttcggtgtgttttgttctcactcgcatgttttccgaaaaactttcataaaggtctcccatcccaaaattactccaaatcaag 17205492  T
Q  300 tacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaa 399  Q
     | |||||||    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||  |||| || ||    
T  17205491 catgtttaacaatggagttcttatggaatgggctacc-aaaacaagatgaatcttgttggtaaaggtagtaccaaacaattcttataattcttcattcaa 17205393  T
Q  400 ccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcg 455  Q
     |||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  17205392 tcatgcagtttcataccaccatggtctcaaaatccctctaattccgatgtgattcg 17205337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 415
Target Start/End: Original strand, 33774918 - 33775112
Alignment:
Q  223 cgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttctta 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||  | ||||||||||||||| || | | || ||||||||| ||  |||||||  |||||||||    
T  33774918 cgtgttttttcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttctcagtaggtcacccatccaaagactactgcaagtcaaacacacttaactgtggagttctta 33775017  T
Q  323 tggaatgagctaccgaaaagaagatgca--tcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatac 415  Q
    |||||||  ||| | |||||||||||||  |||| |||||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||    
T  33775018 tggaatggactatcaaaaagaagatgcatctcttgttgatataggtagcaccagacaattcttataatccttccttcaaccatgcggtcacatac 33775112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 354
Target Start/End: Original strand, 2891186 - 2891340
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    ||||||||||||||| || | | |||||| ||||    
T  2891186 acaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgg-aaacatcgtagtaggtcacccatccaaagactactccaaatcaa 2891284  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 354  Q
      || ||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  2891285 gcacatttaactgtggagtttttatggaatgggctaccaaaacaaagatgcatctt 2891340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3652777 - 3652678
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  3652777 acaaaccaacaagagtcttttcagctttttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaagcttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 3652678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 20735950 - 20735696
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| | ||| || | || |||||||| |  | |||| |||||||| ||   | ||||||| ||    
T  20735950 cacaaaccgacgcaagtctttttagcgtgttttgtcctcaattgcatgctttcctggaaacttccttgaaggttacccatccaaaggctactccaagcca 20735851  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||  ||||||   ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||      
T  20735850 accacacttaactatggagtttttatagaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtatcaaacaattcttataagccttcctac 20735751  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgat 452  Q
    || |||| |||| ||||||  ||  | |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20735750 aatcatgtagtcacatacctacacagtctcaagatccctctcattatgatgtgat 20735696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 12194580 - 12194325
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||  | | || ||||||||    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||     
T  12194580 aaaccaacatgagtcttttcagtgtgttttgtccaaactcacacgttttctggaaaactttctaaaaggtcatccatcctaaaattgctccatgtcaaac 12194481  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    | | |||||||  |||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||| |||||||||  ||| || || || | ||||||| ||| ||| ||     
T  12194480 atgcttaactgtggagttcttatggaatgaattataaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtgccaaaaaaat-ttataagtctttcttcaat 12194382  T
Q  401 catgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
    |||||||| ||||| | ||| || |||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||    
T  12194381 catgcagt-tcatatctgcacggtctcaggattcctctcattccaatgtgattcggtt 12194325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20732717 - 20732615
Alignment:
Q  314 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||    
T  20732717 gagtttttattgaatgggctaccgaaaagaatatgcatattattaatataggtagtaccaaataattcttataagccttcctacaaccatgtagtcacat 20732618  T
Q  414 acc 416  Q
    |||    
T  20732617 acc 20732615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 414
Target Start/End: Original strand, 3884984 - 3885194
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || || |   ||||| ||||| |  | |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3884984 acaaaccaacacaagtctttacatcgtgttttgtcctcactcacatgcttcttgggaa-ctttc-gaaatgtcacctatctcaaaattgctccaagtcaa 3885081  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||||| ||||    |||||||||||||| |||||||   || |||||| || || ||  |||| | |||||| |||||||||| ||||| |||||| |    
T  3885082 gcacgttcaactttgaagttcttatggaataagctacc---aaaaagatgtattttgttagtatatgtagtaccaaacaattcttttaagcattccttca 3885178  T
Q  399 accatgcagtctcata 414  Q
    || |||||||||||||    
T  3885179 actatgcagtctcata 3885194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 32293084 - 32292922
Alignment:
Q  252 gggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcat 351  Q
    |||||||||| ||  | |||| |||||  |||||||||| ||||||| | || ||||||   ||||||||||  |||| | |||  |||| |||||| ||    
T  32293084 gggaaacttttcgtaaagtcatccatcttaaaattgctcaaagtcaagttcgcttaactatggagttcttat--aatgtgttactaaaaacaagatgtat 32292987  T
Q  352 cttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacc 416  Q
     || ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32292986 tttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccatgcagtctcatacc 32292922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 413
Target Start/End: Original strand, 28065795 - 28065944
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaa---gatgcatcttattgatata 363  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| | | |||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||   |||||||||| |||||| |    
T  28065795 aggttacccatcacaaaactgctcaaagtcaaacatgcttaattgtggagttcttatggaataagctaccaaaaaaaaaaagatgcatcttgttgataga 28065894  T
Q  364 ggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    |  |||||| |||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||    
T  28065895 gatagtaccaaacaattcttataagctttcattcaatcatacagtctcat 28065944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 3653051 - 3652961
Alignment:
Q  381 cttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||  |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3653051 cttataagccttcgttcaaccatgcagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgagtcggttcatctagaagctg 3652961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3653152 - 3653057
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  3653152 acaaaccaatacgagtcttttcagcgtgttttgtc----ctcgcacgcttatcgggaaacttctcgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 3653057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11062083 - 11062029
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgg 253  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11062083 acaaaccaacacgagtttttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgg 11062029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27334357 - 27334305
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 241  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27334357 gactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 27334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27395097 - 27395045
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 241  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395097 gactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 27395045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 454
Target Start/End: Original strand, 9440488 - 9440575
Alignment:
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||| | | ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9440488 agtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccatgaagtcccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattc 9440575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28583099 - 28583013
Alignment:
Q  317 ttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccat 403  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||   ||| | || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  28583099 ttcttatggaatgaactaccggaaagatgatgcatcttgttgatatagatcgtatcaaataattcttataagccttcattcaaccat 28583013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 326
Target Start/End: Original strand, 31415980 - 31416107
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  || ||||||||||   || ||  ||||||||||| |  || ||||||    
T  31415980 cacaaaccaacacga-tcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgtttttcgagaaactttccataagatcgtccatcccaaaactaatctaagtca 31416078  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatgga 326  Q
    || ||| |||| ||  |||||||||||||    
T  31416079 aacacgcttaattgtggagttcttatgga 31416107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 10964443 - 10964341
Alignment:
Q  314 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||  || ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||| |||  ||||| |||||||||    
T  10964443 gagtttttatggattaagctaccaaaaagaatatttattttattgatatatgtagtaccaaacaattcttgtaagtctttcttctaccatacagtctcat 10964344  T
Q  414 acc 416  Q
    |||    
T  10964343 acc 10964341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28583228 - 28583154
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttcc 263  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| | | ||||||||||||    
T  28583228 gactgaccccacaaactaacatgagtcttttcagtatgttttgtccccactcacacgctttctgggaaactttcc 28583154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15929394 - 15929346
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 246  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15929394 cacaaatcaacacaagtctttttagcgtattttgtcctcactcacacgc 15929346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Original strand, 30729807 - 30729947
Alignment:
Q  275 catcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtaccta 374  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||    ||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||| | || ||||| | |||||| |    
T  30729807 catcccaaaattgctcaaattcaagaacgcttaactataaagttcttatagaattgactacccaaaagaagatcaatcatgtttatatacgtagtaccaa 30729906  T
Q  375 acaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatac 415  Q
    |||||| |||| || | ||||| |||||||| |||||||||    
T  30729907 acaatttttatgagtcctccttcaaccatgctgtctcatac 30729947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 189 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1484 - 1205
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1484 gactgacgccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 1385  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1384 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtaccaaacaattcttataag 1285  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1284 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattcggttcctctagaag 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 189 - 460
Target Start/End: Original strand, 1933 - 2204
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1933 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 2032  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2033 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 2132  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcc 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||| ||||||||||||||    
T  2133 ccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacggcctcaggaaccctttcattctggtgtgattcggttcc 2204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 198 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14814204 - 14813932
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14814204 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacgcttaccgggaaacctttcggtaggtcacccatcacaaaattgctccaagtca 14814105  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14814104 agcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggtagtaccaaacaattattataagccttccttt 14814005  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagct 470  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14814004 aaccatgcagtctcatacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagct 14813932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 189 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28562009 - 28561731
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  28562009 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttccccgtaggtcacc-atcccaaaattgc 28561911  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28561910 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 28561811  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||    
T  28561810 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaag 28561731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 39653428 - 39653146
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39653428 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 39653329  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  39653328 tccaagtcaagcacacttaactgtggagttctcatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatccaacaattcttataag 39653229  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  39653228 ctttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctg 39653146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 50348010 - 50347728
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  50348010 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttatcgggaaacttctcggtaggtcacccatcccaaaattgc 50347911  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  50347910 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 50347811  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  50347810 ccttccttcaaccaagtagtctcatacatacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctg 50347728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 11179916 - 11180197
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11179916 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacacttaccgggaaacatcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 11180015  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11180016 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 11180115  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  11180116 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccg-gctgattcggttcctctagaagctg 11180197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 31284158 - 31284423
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31284158 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcggcgtgttttgtccccactcgcacgcttgtcggaaaacttcccggcaggtcacccatcccaaaattgc 31284257  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31284258 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 31284357  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31284358 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacctcaagatccctctcattccgatgtgattc 31284423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16811643 - 16811363
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16811643 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgt--tttgtcctcactcgcatgcttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 16811546  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16811545 tccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgaaataggtagtacccaacaattcttataag 16811446  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| |||| || |||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16811445 ccttccttcaaccatggagtcccaaacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctg 16811363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 13149981 - 13150263
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13149981 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacacttaccgagaaacttcccggtaggtcacccattccaaaattgc 13150080  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  13150081 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtacccaacaattcttataag 13150180  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  13150181 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctg 13150263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 27187211 - 27187477
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattg 287  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27187211 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattg 27187310  T
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    ||| |||||||  ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27187311 ctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttagtgatataggtagtaccaaacaattcttataa 27187410  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  |||  |||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  27187411 gccttcatttaaccatgcagtcccatacatgcacagcctcaggatccctctcattccaatgtgattc 27187477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 410
Target Start/End: Original strand, 13150436 - 13150657
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13150436 gactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 13150535  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13150536 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 13150635  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtct 410  Q
    |||||||| ||||||| |||||    
T  13150636 ccttccttcaaccatgtagtct 13150657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 198 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8067535 - 8067279
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8067535 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 8067436  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||     
T  8067435 agcacgcttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcttataagccggccttc 8067336  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||||||| || |||||| ||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  8067335 aaccatgcaatcccatacctgcacggcctcagggtccctctcattccgatgtgattc 8067279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 32227754 - 32227483
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32227754 acaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttttcctcactcgcacacttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 32227655  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  32227654 gcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttca 32227555  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32227554 accatgtagtcccatacctacaaggcctc-agatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctg 32227483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 189 - 468
Target Start/End: Original strand, 32227103 - 32227382
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32227103 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttttcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 32227202  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32227203 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtacccaacaattcttataag 32227302  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||| | ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||    
T  32227303 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaag 32227382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 14820418 - 14820136
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14820418 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcatgcttaccgggaaactttccgataggtcacccatcccaaaattgt 14820319  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  14820318 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaataagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataag 14820219  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||  || || |||| || |||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  14820218 ccttcctttagccgtgcagccccatacctacacgggctcaggaaccctctcattgcggtgtgattcggttcctctagaagctg 14820136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 198 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16811180 - 16810907
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16811180 cacaaaccaacacgaatcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttacggggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctacaagtca 16811081  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||  |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |     
T  16811080 agcacacttaaatgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtagatatagttagtacgcaacaattcttataagccttccatc 16810981  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16810980 aaccatgcagtcccatatctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctg 16810907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 189 - 416
Target Start/End: Original strand, 32386616 - 32386843
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32386616 gactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcggacgcttaccaagaaactttccggtgggtcacccatcccaaaattgc 32386715  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32386716 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctactgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataag 32386815  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacc 416  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  32386816 ccttccttcaaccatacagtcccatacc 32386843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 25230597 - 25230869
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||  || | | |||||||||||    
T  25230597 acaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgatctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtagggcacccatcataagactactccaagtcaa 25230696  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  25230697 gcacgcttaattgttgagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaaccttccttca 25230796  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  25230797 accatgtagtctcatacctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatttggttcctctataagctg 25230869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 25238184 - 25238456
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||  || | | |||||||||||    
T  25238184 acaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgatctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtagggcacccatcataagactactccaagtcaa 25238283  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  25238284 gcacgcttaattgttgagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaaccttccttca 25238383  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  25238384 accatgtagtctcatacctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatttggttcctctataagctg 25238456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Original strand, 20885009 - 20885277
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  20885009 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctaacttgcacgcttaacgggaaatttcccggtaggtcacccatccaaatactactccaagtcaa 20885108  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  20885109 gcacgcttaattgtggagttcttatggaatgtgctactaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagtcttccttca 20885208  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||| |||| ||||||  || | ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  20885209 accatgtagtcacatacctacacgacctcaagatccctctcattgcgatgtgatt-ggttcctctagaag 20885277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30529939 - 30529672
Alignment:
Q  200 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaa 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | | |||||||||||     
T  30529939 caaaccaacacaagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttactgggaaactt-ccagtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaag 30529841  T
Q  300 tacgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
     ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| |    
T  30529840 cacgcttaact-atgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaaaattcttataagccttacttca 30529742  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||| |||||||||||  ||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30529741 accatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaag 30529672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 37045286 - 37045017
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |   |||||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  37045286 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttatcgggaatc---ccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 37045190  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  37045189 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatagggtaccaaaaagaagatgcaccttgttgatataggtattaccaaacaattcttataagcattccttca 37045090  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
      |||| |||| || |||  || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37045089 ttcatgtagtcccacacctacacggcctcaggatccctctcattcagatgtgattcggttcctctagaagctg 37045017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 198 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25248367 - 25248110
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtctttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtc 296  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||  || | | |||||||||    
T  25248367 cacaaatcaacacgagtctttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgtgaaacttcccggtaggtcatccatcataagactactccaagtc 25248268  T
Q  297 aaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctt 396  Q
    ||  ||| | ||| |  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  25248267 aagcacgctgaaccgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattcctt 25248168  T
Q  397 taaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |  |||||||| |||| ||||||||||    
T  25248167 taaccatgcagtcccatacctgcacggccttagaatccctctcattccgatgtgattc 25248110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41472500 - 41472300
Alignment:
Q  253 ggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatc 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41472500 ggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgtttcaagtcaagcacgtttaaccgtggagttcttatggaatgatctaccgaaaagaagatgcatc 41472401  T
Q  353 ttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgat 452  Q
    || |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  41472400 ttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttataag-cttccttcaaccatgcagtctcatacctgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgat 41472302  T
Q  453 tc 454  Q
    ||    
T  41472301 tc 41472300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 265 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 39641125 - 39640919
Alignment:
Q  265 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatag 364  Q
    |||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39641125 gtaggtcaccaatccaaagactgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttattgatatag 39641026  T
Q  365 gcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    | |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  39641025 gtagtaccaaacaactcttataagtcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatctctctcattctgatgtgattcgattcttcta 39640926  T
Q  465 gaagctg 471  Q
     ||||||    
T  39640925 aaagctg 39640919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 25802440 - 25802712
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |  || ||||||| |  | ||||||||| ||| || | | |||||||||||    
T  25802440 acaaaccaacacacgtcttttcagcgtgttttgaccttactcgcactcttttcgagaaacttcctagaaggtcacccgtcctaagactactccaagtcaa 25802539  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    | ||| |||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  25802540 acacgcttaactgtggatttcttatggaatgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaccattcttatcagccttccgtta 25802639  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||  ||| || |||| ||||||||||||||    
T  25802640 accatgcagtctcatacctacatggccacatgatccctctcattccaatgagactcggctcctctagaagctg 25802712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 401
Target Start/End: Original strand, 4067252 - 4067454
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||    
T  4067252 acaaaccaacactggtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccagaaaactttccggtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaa 4067351  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |    
T  4067352 gcacgcttaactgtggagttcttatgtaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataagtcttccttca 4067451  T
Q  399 acc 401  Q
    |||    
T  4067452 acc 4067454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 413
Target Start/End: Original strand, 25238576 - 25238790
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| ||| ||||||||| |||| || | | |||||||||||    
T  25238576 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccaaaaaacttcccgataggtcaccaatccaaagactactccaagtcaa 25238675  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  25238676 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgataaagatagtaccaaacaattcttataagtcttccttca 25238775  T
Q  399 accatgcagtctcat 413  Q
    |||||| ||||||||    
T  25238776 accatgtagtctcat 25238790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 464
Target Start/End: Original strand, 25230140 - 25230405
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | | |||||||||||||  || | | |||||||||||    
T  25230140 acaaaccaacactagtctttccaacgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccggaaaacttcctgataggtcacccatcataagactactccaagtcaa 25230239  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      |||  ||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  25230240 gcacgcataactgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaataattcttataagccttccttca 25230339  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    |||||| |||| ||||||  || | ||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  25230340 accatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatttggttcctcta 25230405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 464
Target Start/End: Original strand, 25237727 - 25237992
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | | |||||||||||||  || | | |||||||||||    
T  25237727 acaaaccaacactagtctttccaacgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccggaaaacttcctgataggtcacccatcataagactactccaagtcaa 25237826  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      |||  ||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  25237827 gcacgcataactgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaataattcttataagccttccttca 25237926  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    |||||| |||| ||||||  || | ||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  25237927 accatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatttggttcctcta 25237992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2911338 - 2911077
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||           |||||| ||||| || | | |||||||||||    
T  2911338 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaa-----------ggtcactcatccaaagactactccaagtcaa 2911250  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | || | ||||||| |||||| | ||| || |    
T  2911249 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttgatataggtaatatcaaacaatttttataaccattctttca 2911150  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||  ||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  2911149 accatgtggtcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattcaggtgtgattcggttcgtctagaagctg 2911077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 201 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 41474249 - 41473996
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    |||| |||| ||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  41474249 aaactaacatgagtcttttcaacatgttttgtattcacccgcacgattactgggaaactttctggtatgtcacccatcccaaaattgttccaagtcaagc 41474150  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    ||| || ||||  ||||| |||| |||||| | ||| ||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41474149 acgcttgactgtggagtttttatagaatgatccaccaaaaagaatatcaatcttgttgatataggaagtatcaaacaattcttataagtcttcctttaac 41474050  T
Q  401 catgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||| ||||| |||||| | | | ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  41474049 catccagtcacatacctgaacgacctcaagatccctctcatttcgatgtgattc 41473996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 267 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 29224510 - 29224326
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||   |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||     
T  29224510 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaattgtgaagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttagtataggt 29224411  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtga 451  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| || |||| | ||||||||||||    
T  29224410 agtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtctcatatctacatggcctcatgaaccctttcattctgatgtga 29224326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7477455 - 7477191
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||| || ||   |||||| |||||| || | | |    
T  7477455 gactgaccccacataccaacatgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgctttccgagaaatttcccataaggtcagccatcctaagactac 7477356  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    || |||||||  | | |||| ||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  7477355 tctaagtcaagcatgcttaaatgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgtatcttgttgatataagtagtaccaaaaaattcttataag 7477256  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | | | ||||||||| |||| |||||||||    
T  7477255 ccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgactttaggatccctctcattccgatgtgatt 7477191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 314 - 471
Target Start/End: Original strand, 32796942 - 32797099
Alignment:
Q  314 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||    
T  32796942 gagttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtagtttcat 32797041  T
Q  414 acccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||  ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||    
T  32797042 acctacatggtctcaggatccctcttatttcgatgtgattcggcttgtctagaagctg 32797099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7494145 - 7493881
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||| || |  | |||||| |||| | || |   |    
T  7494145 gactgaccccacataccaacatgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgctttacgggaaatttcctagaaggtcagccatgctaagacaac 7494046  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  | | |||| ||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  7494045 tccaagtcaagcatgcttaaatgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaaaaattcttataag 7493946  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | | | |||| |||| |||| |||||||||    
T  7493945 ccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgactttaggatctctctcattccgatgtgatt 7493881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 305 - 471
Target Start/End: Original strand, 25239075 - 25239241
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  25239075 ttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaaaattcttataagcgttccttcaaccata 25239174  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     |||| ||||||  || | |||||  |||||||| || | | ||||||||| |||||||||||||||    
T  25239175 tagtcccatacctacacgacctcagaatccctctcataccggtgtgattcgattcctctagaagctg 25239241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 406
Target Start/End: Original strand, 26309880 - 26310088
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||   || |||||| | | |  || |||||||||||||||||| |  ||||||    
T  26309880 cacaaaccaacatgagtcttttgagtgtattttgtcttcacttgcacgctatccaggaaacatcctgaaagatcacccatcccaaaattgttttaagtca 26309979  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| | |||| | || |||||||||||  | |||||     
T  26309980 aatacatttaactgtcgagttctaatggaatgagctaccataaagaagatgcatctttttggtatatgtagtaacaaaaaattcttataaatcgtccttc 26310079  T
Q  398 aaccatgca 406  Q
    |||||||||    
T  26310080 aaccatgca 26310088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 471
Target Start/End: Original strand, 25802964 - 25803168
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    ||||||||||||| || | |  ||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||     
T  25802964 aggtcacccatcctaagactagtccaagtcaagcacgcttaactacggagttcttatgaaatgggataccgaaaagaagatacatcttgtttttataggt 25803063  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctaga 466  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||||  || | | | | || ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  25803064 agtaccaaacaattcttacaagtcttacttcaaccatgcagtcccatacctacacgacattaggaaccctcttattccgatatgattcggttcatctaga 25803163  T
Q  467 agctg 471  Q
    |||||    
T  25803164 agctg 25803168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 364
Target Start/End: Original strand, 53150693 - 53150869
Alignment:
Q  188 tgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattg 287  Q
    ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |   |||||||||  |   |||||||||||||||||||||    
T  53150693 tgactgaccccacaaactaacatgagtcttttcaacatgttttgtcctcactcgcccgctttttgggaaacttctcataaggtcacccatcccaaaattg 53150792  T
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatag 364  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||   |||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  53150793 ctccaagttaagcacggttaactgtgaagttcttatgaaattggctaccgaaaaaaatatgcatcttgttaatatag 53150869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3900068 - 3899868
Alignment:
Q  185 tgctgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaa 284  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||| |   |||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  3900068 tgctgactgaccccacagatcaacacgagtcttttcaccttgttttgtccatactcacacgctttttgggaaactttccagaaggtcacccataccaaaa 3899969  T
Q  285 ttgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattctta 384  Q
    ||||||||||||||  | | || | ||  |||||||||||   || | |  |||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  3899968 ttgctccaagtcaagcatgctttattgtggagttcttatgatttgtgttgtcgaaaaaaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaacaattctta 3899869  T
Q  385 t 385  Q
    |    
T  3899868 t 3899868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15392764 - 15392570
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||| | |   || |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15392764 acaaaccaacacgagttctttcagcgtgctatgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtcaa 15392665  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttc 393  Q
      || |||||||   ||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||| ||| ||  || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  15392664 gcacatttaactttggagttctgatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagccttc 15392570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15405800 - 15405606
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||| | |   || |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15405800 acaaaccaacacgggttctttcagcgtgctttgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtcaa 15405701  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttc 393  Q
      || |||||||   ||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||| ||| ||  || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  15405700 gcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagccttc 15405606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41473805 - 41473748
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 246  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41473805 gactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 41473748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 416
Target Start/End: Original strand, 31103966 - 31104069
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgag--ctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctca 412  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  31103966 agttcttatggaatgagagctaccaaaaagaaaatgcatctagttggtatagatagtatcaaacaattcttataagtcttccttgaaccatgcaatctca 31104065  T
Q  413 tacc 416  Q
    ||||    
T  31104066 tacc 31104069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 246
Target Start/End: Original strand, 25239019 - 25239066
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25239019 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgc 25239066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15388397 - 15388203
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||| | |   || |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15388397 acaaaccaacacgagttctttcagcgtgctatgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtcaa 15388298  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttc 393  Q
      || |||||||   ||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||| ||| ||  || | |||  ||||||||||||||||||||    
T  15388297 gcacatttaactttggagttctgatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtactggtaatacgaaacaattcttataagccttc 15388203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15417625 - 15417431
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||| | |   || |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15417625 acaaaccaatacgggttctttcagcgtgctttgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtcaa 15417526  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttc 393  Q
      || |||||||   ||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||| ||| ||  || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  15417525 gcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagccttc 15417431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Original strand, 25230989 - 25231030
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25230989 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 25231030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15377536 - 15377412
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||| |||| | |   || |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  15377536 aaaccaacacgggttctttcaacgtgctttgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtcaagc 15377437  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatgg 325  Q
    || ||||||||  ||||||| ||||    
T  15377436 acatttaactgtggagttctaatgg 15377412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18318909 - 18318862
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 246  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18318909 acaaaccaacccgaatcttttcagcgtgttttgttctcactcgcacgc 18318862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26436300 - 26436264
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26436300 aaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgttctca 26436264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 189 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 28496118 - 28495839
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  28496118 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccaataggtcacccatcccaaaattgc 28496019  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  28496018 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacagttcttataag 28495919  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28495918 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaag 28495839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 42515808 - 42515526
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  42515808 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaatttccatgtaggtcacccatcccaaaattgc 42515709  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  42515708 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacacttcttataag 42515609  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42515608 ccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattcggttcgtctagaagctg 42515526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 2941639 - 2941904
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2941639 gactgaccgcacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttctcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 2941738  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  2941739 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttatcag 2941838  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2941839 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattc 2941904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 34405473 - 34405755
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34405473 gactgaccccacaaatcaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 34405572  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34405573 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcctgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 34405672  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34405673 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 34405755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 9125223 - 9124958
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9125223 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 9125124  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||| ||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9125123 tccgagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 9125024  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  9125023 ctttcctttaaccatacagtctcatacctgcacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattc 9124958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2193520 - 2193238
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2193520 gactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 2193421  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||| ||||  ||| |||||||  |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2193420 tccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcctatgaaatgagctaccgaatagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 2193321  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| || |||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2193320 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggtctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 2193238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 13125017 - 13125283
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattg 287  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13125017 gactgaccccacaaaccaacacgagtcctttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattg 13125116  T
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    |||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13125117 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataa 13125216  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  13125217 gccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcagggcctcaagatccctctcattccgatatgattc 13125283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 36422515 - 36422234
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36422515 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaa-ttgc 36422417  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36422416 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 36422317  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||| | ||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  36422316 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattcgattcctctagaagctg 36422234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 198 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2189399 - 2189126
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2189399 cacaaatcaacacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcactcatcccaaaattgctccaagtca 2189300  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  2189299 agcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtgccaaacaattcttataagccttctttc 2189200  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||||||| || ||| |||  |||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2189199 aaccatgcagtcccacacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 2189126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 462
Target Start/End: Original strand, 6718953 - 6719229
Alignment:
Q  185 tgctgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaa 284  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||||||     
T  6718953 tgctgactgaccccacaaaccaacacgattcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaagttcccgatatgtcacccatcccaaa- 6719051  T
Q  285 ttgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattctta 384  Q
    || |||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6719052 ttactccaagtcaagcacgcttaactctggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 6719151  T
Q  385 taagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctc 462  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||  ||  |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  6719152 taagcattccttcaaccatgtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccaatgtgattcggttcctc 6719229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 198 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 18833541 - 18833285
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18833541 cacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtca 18833442  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    || ||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||| |     
T  18833441 aacacgcttaactgtggagttcttatgtaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcatataagctttccctc 18833342  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||||||  |||||| | | ||||||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  18833341 aaccatgcagttccatacctgtacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgattc 18833285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 199 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2466178 - 2465949
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2466178 acaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcatgcttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatcccgaaattgctccaagtcaa 2466079  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  2466078 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcaacttgttgatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttca 2465979  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctca 428  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  2465978 accatgtagtcccatacctacatggcctca 2465949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 42515346 - 42515091
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| || | |||| ||||||||||| || | | |||||||||||    
T  42515346 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacccgcacgcttaccgaaaaagttcctggtatgtcacccatccaaagactactccaagtcaa 42515247  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  42515246 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttca 42515147  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  42515146 atcatgcagtctcatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 42515091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 28495501 - 28495772
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||           ||||||||||||||||||||||||||    
T  28495501 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgggttttgtcctcactcgcacgctttcc-----------cggtaggtcacccatcccaaaattgc 28495589  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  28495590 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctacctaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaaaactcaacaattcttataag 28495689  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     ||||||| ||||||| |||| ||||||  || | ||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  28495690 tcttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctcattccgatgggattcgattcctctagaagctg 28495772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 680071 - 679799
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  680071 acaaaccaacatgagtcttttcagcgtgtttttgttctcactcgcatgtttaccgcgaaacttcccggcaggtcacccatccaaagactactccaagtca 679972  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  679971 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtacc-aacaattcttataagccttccttc 679873  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    | ||||| | || ||||||  || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  679872 agccatgtactcccatacctacacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattcagttcctctagaagctg 679799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 198 - 363
Target Start/End: Original strand, 13122395 - 13122561
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13122395 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaaatc 13122494  T
Q  297 aaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatata 363  Q
    ||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13122495 aagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatata 13122561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 189 - 354
Target Start/End: Original strand, 7646360 - 7646525
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7646360 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 7646459  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 354  Q
    ||||||||||  ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7646460 tccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 7646525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2465953 - 2465777
Alignment:
Q  233 cctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagc 332  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2465953 cctcactcgcatgcttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagc 2465854  T
Q  333 taccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtc 409  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2465853 taccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccatgtagtc 2465777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 199 - 455
Target Start/End: Original strand, 35474013 - 35474269
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||| ||||||||||| || | | |||||||||||    
T  35474013 acaaaccaacacaagtcatttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaaaattcccggtacgtcacccatccaaagactactccaagtcaa 35474112  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  35474113 acacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtactaaacaattcttataagtctttcttca 35474212  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcg 455  Q
    |||||| |||||||||||  || | ||| | ||||||||| |||| | |||||||||    
T  35474213 accatgtagtctcatacctacacgacctaaggatccctctcattccggtgtgattcg 35474269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 198 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7646670 - 7646514
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7646670 cacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcggaaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 7646571  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 354  Q
    |  ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7646570 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagttaccgaaaacaagatgcatctt 7646514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 199 - 469
Target Start/End: Original strand, 22529127 - 22529397
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  22529127 acaaaccaacatgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcacacgcttaccgagaaacttctcagtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 22529226  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    | ||| |||||||   ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  22529227 acacgcttaactgtgaagttcttttgtaatgagttactgaaaagaagatgcatcttgtttatatagatagtaccaaacatttcttataagccttccttca 22529326  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagc 469  Q
    |||||| || | |||||   |||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  22529327 accatgtaggcccatacttacatgacctcaggatccctctcattcggatatgattcggttcgtctagaagc 22529397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 458
Target Start/End: Original strand, 29038912 - 29039171
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | | |||||||||||    
T  29038912 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcagtcacacgcttaccgggaaacttaccggtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaa 29039011  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| ||  ||||||||||||||||   || | |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | || |    
T  29039012 gcacgcttaaatgtagagttcttatggaatggattatcaaaaagaagatgcatgttgttgatataggtagtaccaaacaattcttgtaagcctccattca 29039111  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
    |||||| |||| |||| |  || ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  29039112 accatgtagtcacatatctacacggcctcaggatgcctctcattccgatgtgattcggtt 29039171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 2611551 - 2611816
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |  ||   |||||||||||||||||| || | | |||||||| ||    
T  2611551 acaaaccaacacgagtcttttcagagtgttttgtcctcactcgcacgctta----gttac---ccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtaaa 2611643  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| ||||||   |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  2611644 gcacgcttaactatggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgttatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttcc 2611743  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||  |||||||||||  |||| ||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2611744 accatatagtctcatacctacatgacctcaggacccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctg 2611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 265 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 46425929 - 46425723
Alignment:
Q  265 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatag 364  Q
    ||||||||||||||  || | | |||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46425929 gtaggtcacccatcataagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaataagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 46425830  T
Q  365 gcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||    
T  46425829 gtaataccaaacaattcttataagccttatttcaaccatgtagtcccatacctacatggtctcaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtcta 46425730  T
Q  465 gaagctg 471  Q
    |||||||    
T  46425729 gaagctg 46425723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 198 - 454
Target Start/End: Original strand, 5406478 - 5406735
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtac-cgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtc 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5406478 cacagaccaacacgagtgttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgttttttcggaaaactttccagaaagtcatccatcccaaaattgctcaaagtc 5406577  T
Q  297 aaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctt 396  Q
    ||  ||| |||||||  ||||||||||||  || || ||| |||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||    
T  5406578 aagcacgcttaactgtggagttcttatggtttgggcaaccaaaaataagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattcttataaatcttcctt 5406677  T
Q  397 taaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
     |||||||||||| |||||| ||| | | | | ||||||| | |||| ||||||||||    
T  5406678 caaccatgcagtcccataccggcacgactttaggatccctatcattccgatgtgattc 5406735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 305 - 454
Target Start/End: Original strand, 11517387 - 11517535
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11517387 ttaactgcggagttcttatggaatgagctaccgaaaagtagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttcc-ttcaccatg 11517485  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  11517486 cagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 11517535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Original strand, 29357348 - 29357616
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |  || | ||||| |||| |||||| |||||  || | | ||| |||||||    
T  29357348 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgcttttcgaggaacttaccggaaggtcatccatcttaagactactctaagtcaa 29357447  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    | ||| |||||||   |||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| | |||||| |    
T  29357448 acacggttaactgtgtagttcttatgaaacgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaacaattcttataaacattccttca 29357547  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | ||||  ||| ||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  29357548 accatgcagtcccatacctgcacgacctcgggatacctctcattc-ggtgtgattcagttcatctagaag 29357616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 198 - 339
Target Start/End: Original strand, 43776181 - 43776322
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43776181 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcattcgcacgcttactggaaaacttccccgcaggtcacccattccaaaattgctccaagtca 43776280  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaa 339  Q
    |  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43776281 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaa 43776322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Original strand, 6747498 - 6747745
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||        |||||| ||| |||||||||||||| || | | |   |||||||    
T  6747498 acaaaccaacacaagtcttttcaacttgttttgtcctcactcgcaagc--------aaacttcccgataggtcacccatccaaagactacgataagtcaa 6747589  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  6747590 gcacgcttaactgtggagtttttatggaataggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttca 6747689  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||| ||| |||||||  || ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  6747690 accatgtagtatcatacctacacggcctcaggatccctctcattccaatgtgattc 6747745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25182616 - 25182399
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||| |   | ||||||| || | |||||  |||||| || | | ||||||||||    
T  25182616 cacaacccaatacgagtttttttagcgtgttttgccctcactcgaacgctttttgagaaacttcccagaaggtcctccatccaaagactactccaagtca 25182517  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    || ||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  25182516 aacacacttaactgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaataagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttc 25182417  T
Q  398 aaccatgcagtctcatac 415  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25182416 aaccatgcagtctcatac 25182399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 43233534 - 43233395
Alignment:
Q  332 ctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaaga 431  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||| ||    
T  43233534 ctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagtcttcctttaaccatacagtcacatacctacacggcctcatga 43233435  T
Q  432 tccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  43233434 tccctctcatttcggtgtgattcggttcctctagaagctg 43233395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 428
Target Start/End: Original strand, 26421768 - 26421881
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcata 414  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26421768 agttcttatggaatgggctaccgaaaagaagattcatcttgttggtatagggagtacctaacaattcttatgagccttacttcaaccatgcagtctcata 26421867  T
Q  415 cccgcatggcctca 428  Q
    |  ||| |||||||    
T  26421868 catgcacggcctca 26421881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 289 - 451
Target Start/End: Original strand, 26421287 - 26421449
Alignment:
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||    
T  26421287 tccaattcaaacacgtttaactgtggagttcttatggaatggactaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtagtatcaagcaattcttataag 26421386  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtga 451  Q
     ||||||| |||||| | | | ||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  26421387 tcttccttcaaccatactgacccatacctacatggcctcaagaaccctatcattctgatgtga 26421449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 336
Target Start/End: Original strand, 3305240 - 3305377
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||| ||||    
T  3305240 acaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgttctcactcgcactcttaccaggaaactttccggtaggtcacccatccaaagactactccaaatcaa 3305339  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctacc 336  Q
      ||| |||||||   |||| ||||| |||||||||||    
T  3305340 gcacgcttaactgtgaagtttttatgtaatgagctacc 3305377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20966235 - 20966055
Alignment:
Q  269 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcag 368  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||   | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| |||||| |     
T  20966235 gtcacccatcccaaaattgatacaagtcatgcatgtttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaataatatacatcttgttggtataggtat 20966136  T
Q  369 tacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgt 449  Q
    |||  || |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  20966135 tacaaaataattcttataagtcatccttcaatcatgcagtctcatacctagatggcctcaagaccactctcattccgatgt 20966055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 356 - 468
Target Start/End: Original strand, 26957606 - 26957718
Alignment:
Q  356 ttgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcg 455  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||  ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26957606 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgtagttccatacctacacagcctcaagatccctctcattccgatgtgattcg 26957705  T
Q  456 gttcctctagaag 468  Q
    |||||||||||||    
T  26957706 gttcctctagaag 26957718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 413
Target Start/End: Original strand, 31743834 - 31743930
Alignment:
Q  317 ttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31743834 ttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagcaccaaaccattcttataagcattccttcaaccatgcagtctcat 31743930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43233221 - 43233137
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcac 273  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  43233221 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttctcggtaggtcac 43233137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 1628899 - 1628726
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||   |||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||| |      
T  1628899 aggtcacccatcccaaaattgctccaagccaaatacacttaactatggagttcttatggtatgggcttcaaaaaagaagatgcatcttgttgatatcgat 1628800  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattc 443  Q
    |||||| |||||   ||||||||||| ||| ||||||||| || |||| | ||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  1628799 agtaccaaacaa---ttataagcctttcttcaaccatgcaatcccatatctgcacggcttcaacatccctctcattc 1628726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 471
Target Start/End: Original strand, 35527079 - 35527285
Alignment:
Q  265 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatag 364  Q
    ||||||||||||| | || | | |||||||||||  | | |||||||  |||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35527079 gtaggtcacccatgcaaagactactccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcctatggaatggactactgaaaagaatatgcatcttgttgatatag 35527178  T
Q  365 gcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||   ||| | ||||  ||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  35527179 gtagcaccaaacaattcttataagccttctttcaaccaaccagtcccatatttgcacgacctcgggatccctctcatttcggtgtgattcggttcgtcta 35527278  T
Q  465 gaagctg 471  Q
    |||||||    
T  35527279 gaagctg 35527285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 199 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11372697 - 11372478
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |  | |||| ||||||  |||   ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  11372697 acaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcact-----gatttccggaaaacttctcgg---gtcactcatcccaaaattgctataagtcaa 11372606  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    |   | ||||||   ||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||| | ||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  11372605 acgtgcttaactttggagttcttatggtttgagctaccaaaaataacatgcatcatgttggtacaggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 11372506  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcct 426  Q
    ||||| || | |||||||  ||||||||    
T  11372505 accatacaatttcatacctacatggcct 11372478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9623459 - 9623248
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | || |  | | ||||||  | | | ||||||||||| || | |  |||||||||||     
T  9623459 aaaccaacatgagtctttacagcgtgctttgtcctcactcgaaggcttttcagaaaacttctcagaacgtcacccatccaaagactagtccaagtcaaac 9623360  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    ||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||   |||||  ||    
T  9623359 acgcttaactgtggagttcttatagaatgaactaccg-aaagaagatgcatcttgttgatataggtggtatcaaacaattcttataagtactccttctac 9623261  T
Q  401 catgcagtctcat 413  Q
    |||| ||||||||    
T  9623260 catggagtctcat 9623248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 464
Target Start/End: Original strand, 36015405 - 36015568
Alignment:
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  36015405 acgtttaactgtgaagttcttatggaatgggctatttaaaagaagaggcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttttaagctttccttcaac 36015504  T
Q  401 catgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    |||| ||||||||||  |||  ||||   ||||||||| |||| | ||||||| ||||| ||||    
T  36015505 catggagtctcatacttgcactgccttgggatccctctcattccggtgtgatttggttcgtcta 36015568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 455
Target Start/End: Original strand, 31406582 - 31406732
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||| ||||| | || || ||||||     
T  31406582 ttaactgtggagttcttatgaaacgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaacaccaaacaattctaataagtcatctttcaaccatt 31406681  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcg 455  Q
    ||||| || | | ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31406682 cagtcccagatctgcacggcttcaggatccctctcattttgatgtgattcg 31406732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 375 - 443
Target Start/End: Original strand, 13124769 - 13124837
Alignment:
Q  375 acaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattc 443  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13124769 acaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaagatccctctcattc 13124837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 244
Target Start/End: Original strand, 6747968 - 6748013
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747968 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 6748013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36422646 - 36422575
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactt 260  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  36422646 gactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacacttgccgggaaactt 36422575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 471
Target Start/End: Original strand, 3305374 - 3305476
Alignment:
Q  369 tacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||| |||||   || ||||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3305374 taccaaacaattctcataagccttcattcaaccatgtagtcccatacttacacggcctcaggatccccctcatttcgatgtgattcggttcctctagaag 3305473  T
Q  469 ctg 471  Q
    |||    
T  3305474 ctg 3305476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16192457 - 16192379
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttc 393  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||||||||||| |||||    
T  16192457 agttcttatggaatgggctaccaaaacgaagatgcatcttgttgatgtaggtaataccaaacaattcttataatccttc 16192379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Original strand, 26419117 - 26419168
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 240  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26419117 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacatgttttgtcctcactc 26419168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 244
Target Start/End: Original strand, 7461273 - 7461319
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7461273 cacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttatcttcactcgcac 7461319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 31743781 - 31743827
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  31743781 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgcgttgacctcactcgcacg 31743827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2490140 - 2490077
Alignment:
Q  352 cttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatac 415  Q
    |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||    
T  2490140 cttattgatataggtagtaacaaacacttcttataagcattccttcaatcatgcagtcacatac 2490077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 246
Target Start/End: Original strand, 31406481 - 31406528
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 246  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31406481 acaaaccaacacatgtcttttcagcatgttttgtcctcactcacacgc 31406528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 416
Target Start/End: Original strand, 16811913 - 16811955
Alignment:
Q  374 aacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacc 416  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  16811913 aacaattcttataagcattccttcaaccatgtagtctcatacc 16811955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 36015361 - 36015407
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 245  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36015361 acaaactaacacgagtctttttagcgtattttgtcctcactcacacg 36015407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10430806 - 10430745
Alignment:
Q  410 tcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  10430806 tcatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgatacggttcctctagaagctg 10430745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 11372978 - 11372901
Alignment:
Q  374 aacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtga 451  Q
    ||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||  |||||||| | || |||||| ||| ||||||||    
T  11372978 aacaattcttacaagtcttcattcaaccatgcaatctcatacctacatggccttaggaaccctctcattttgatgtga 11372901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 419 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2463676 - 2463624
Alignment:
Q  419 catggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||||| || |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  2463676 catggcctcaggaaccctctcattccggtgtgtttcggttcctctagaagctg 2463624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 189 - 468
Target Start/End: Original strand, 17445337 - 17445616
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17445337 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 17445436  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17445437 tccaagtcaagcacgcttaactgtggatttcttatggaatgagctaccgataagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 17445536  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| ||  || ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17445537 ccttccttcaaccatgtagtcccatgcctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattcggttcctctagaag 17445616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 198 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 189323 - 189067
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189323 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 189224  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  | | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  189223 agcatgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttc 189124  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  189123 aaccatgcagtcccatacatgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 189067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 8641917 - 8642181
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  8641917 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccg-taggtcacccatcttaaaattgc 8642015  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  8642016 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcttataag 8642115  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  8642116 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggccttaggatccctctcattctgatgtgattc 8642181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34371876 - 34371594
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34371876 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgc 34371777  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  34371776 tccaagtcaagcacgcttaactgtggtgttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttttaag 34371677  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    | |||||| |||||||||||| || ||| | | |||||   || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34371676 cattccttcaaccatgcagtcccacacctgtacggccttgggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 34371594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 3886483 - 3886748
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3886483 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatccaaaaattgc 3886582  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    |||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  3886583 tccacgtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcatataag 3886682  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    | ||||||  ||||||||||| |||||  | | | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3886683 cattccttctaccatgcagtcccatacttgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgattc 3886748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 199 - 464
Target Start/End: Original strand, 10927295 - 10927560
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||| || | | |||||||||||    
T  10927295 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcattcacacgcttaccgaaaaacttcccggtcggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 10927394  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10927395 gcacgtttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 10927494  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10927495 accatgtagtctcatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcggttcctcta 10927560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 189 - 468
Target Start/End: Original strand, 42788528 - 42788807
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  42788528 gactgactccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcaagcttaccgagaaacttcccggtaggtcacctatcccaaaattgc 42788627  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42788628 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttgtggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 42788727  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
     |||| || ||||||| |||| ||  ||  || ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42788728 tcttctttcaaccatgtagtcccaatcctacacggcctcaggatccctctcattccgttgtgattcggttcctctagaag 42788807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 189 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2474669 - 2474444
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2474669 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttttcctcactcgcatgcttaccgggaaactttccggtaggtcacccatctcaaaattgc 2474570  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  2474569 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttttaag 2474470  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcata 414  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||    
T  2474469 tcttccttcaaccatgcagtcccata 2474444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2474213 - 2473958
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  2474213 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga----------taggtcacccatcccaaaattgc 2474124  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2474123 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggcagtaccaaacaattcttataag 2474024  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || | | | ||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  2474023 ccttccttcaaccatgcagtctcatgcctgtacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattc 2473958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2194068 - 2193798
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2194068 gactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac------------acttaccggtaggtcacccatcccaaaattgc 2193981  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2193980 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 2193881  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2193880 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctg 2193798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 22556791 - 22556535
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtctttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556791 acaaaccaacacgagtcttttacagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcctggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 22556692  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
       ||| |||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  22556691 gccacgcttaactgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcatataagccttccttc 22556592  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  22556591 aaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgattc 22556535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 22557224 - 22556968
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtctttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22557224 acaaaccaacacgagtcttttacagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 22557125  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
       ||| |||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  22557124 ggcacgcttaactgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatattggtagtaccaaacaattcatataagccttccttc 22557025  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || | |||| |||| ||||||||||    
T  22557024 aaccatgcagtcccatacctgcacggcctcatgaactctctcattccgatgtgattc 22556968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 201 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34372320 - 34372050
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  34372320 aaaccaacacgagtattttcagcgtgttttttcctcactcgcacgcttatcggaaaacttcccggtaggtcaccaatcccaaaattgctccaagtcaagc 34372221  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||    
T  34372220 acgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttttaagcattccttcaac 34372121  T
Q  401 catgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||| |||| |||||  | | |||||   || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34372120 catgtagtcccatacttgtacggccttgggaaccctctcattctggtgtgattcggttcctctagaagctg 34372050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 3886939 - 3887204
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  3886939 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttgtcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccagtaggtcacccatccaaaaattgc 3887038  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  3887039 tccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattcatataag 3887138  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||    
T  3887139 tcttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcaggatcactctcattccgatgtgattc 3887204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1822160 - 1821905
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  1822160 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcattcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 1822061  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1822060 gcacgcttaaatgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 1821961  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||| |||| ||||| ||||    
T  1821960 accatgcagtctcatacctgcacgaccttaagatctctctcattccgatgtaattc 1821905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 227 - 470
Target Start/End: Original strand, 21886066 - 21886309
Alignment:
Q  227 ttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatgga 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||   |||||||||||||    
T  21886066 ttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactttggagttcttatgga 21886165  T
Q  327 atgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcct 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||   |||    
T  21886166 atgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacaacct 21886265  T
Q  427 caagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagct 470  Q
    || || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21886266 caggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagct 21886309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 8391204 - 8391477
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8391204 gactgaccccacaaatcaacacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttatcgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 8391303  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  8391304 tccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatacagg-agtaccaaacaattcttataag 8391402  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctct 463  Q
     ||||||| || |||| |||||||| ||  || |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  8391403 tcttccttcaatcatgtagtctcatgcctacacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattcggtttctct 8391477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 189 - 464
Target Start/End: Original strand, 15512894 - 15513170
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15512894 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtattttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcatccatcccaaaattgc 15512993  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    | ||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  15512994 ttcaagtcaagcacgtttaattgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgcatcttgttgatattggtagtacc-aacaattcttataag 15513092  T
Q  389 c--cttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    |   |||||| ||||||| |||| ||||||  ||  |||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15513093 catattccttcaaccatgtagtcccatacctacacagcctaatgatccctctcattccgatgtgattcggttcctcta 15513170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 27646717 - 27646999
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||| | || | | |    
T  27646717 gactgaccatacaaaccaacatgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgtttattgggaaacttcccggtaggtcacccatgcaaagactac 27646816  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    |||||| |||  ||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27646817 tccaagacaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgttataggtagtaccaaacaattcttataag 27646916  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||  || ||||  | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27646917 ccttccttcaaccatgtagccccatacctacacggccctaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctg 27646999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Original strand, 10926870 - 10927110
Alignment:
Q  231 gtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatga 330  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  10926870 gtcctcactcacacgcttaccaggaaacttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggaatgg 10926969  T
Q  331 gctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaag 430  Q
     ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  || | ||||| |    
T  10926970 actaccaaaaggaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcagg 10927069  T
Q  431 atccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10927070 atccctctcattctgatgtgattcggttcctctataagctg 10927110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 20039367 - 20039638
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| || | | ||| |||||||    
T  20039367 acaaaccaacatgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccaataggtcaccaatccaaagactactctaagtcaa 20039466  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||  |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20039467 gcacacttaactgtagagttcttatggaatgggctacc-aaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 20039565  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    || ||| ||||  |||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20039566 actatgtagtcctatacctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggtttgtctagaagctg 20039638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 198 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34868033 - 34867772
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||            |||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  34868033 cacaaatcaacacgagtctttttagcgtgttttgtccttacttgcacgcttaccggtaa------------gtcacctatcccaaaattgctcaaagtta 34867946  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  34867945 agcacgcttaactatggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttc 34867846  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  34867845 aaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcttctagaagctg 34867772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 188 - 408
Target Start/End: Original strand, 18750077 - 18750297
Alignment:
Q  188 tgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattg 287  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |    |||||| |  | ||||||||||||| |||||||    
T  18750077 tgactgaccccacaaaccaactcgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacactttctaaaaaacttcctagaaggtcacccatcctaaaattg 18750176  T
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    ||||||||||| |||| |||| |   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  18750177 ctccaagtcaagtacgattaattatggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatctttttggtataggtagtaccaaacaattgttataa 18750276  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagt 408  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  18750277 tccttccttcaaccatgcagt 18750297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 443
Target Start/End: Original strand, 29679999 - 29680236
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  29679999 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcatttgcacgcttatcgggaaacttctcggaaggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 29680098  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    | ||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||        |||||||||||||||| |    
T  29680099 acacgcttaactgtggagttcttatgtaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtattacc-------acttataagccttccttca 29680191  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattc 443  Q
    |||||| |||| ||||||  || |||||||||||| |||| ||||    
T  29680192 accatgtagtcccatacctacacggcctcaagatctctctcattc 29680236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 198 - 453
Target Start/End: Original strand, 24182137 - 24182391
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24182137 cacaaaccaacacgaatcttttcaacgtgttttatcctcactcgcacactttccgagaaactttttagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 24182236  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| ||||||| | |||| ||||||  || | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||| || ||||||||||||||||||||     
T  24182237 accacgcttaactgttaagttattatggtttggggtaccg-aaagaagatgcatcttgttggtatagatagtaccaaataattcttataagccttccttc 24182335  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    ||||||   |||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24182336 aaccatttcgtctcatacttgcacgttctcaagatccctctcattctaatgtgatt 24182391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 18304679 - 18304413
Alignment:
Q  205 caacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgt 304  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||   | | | |||||||  |   |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |     
T  18304679 caacacgagtttgttcagcgtgttttgtcctcactcgcacaatttctgtgaaacttctcaaaaggtcacccatcacaaaattgctccaagtcaaacatgc 18304580  T
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  ||||||| || | | | |||||    
T  18304579 ttaactgtggaattcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttatataagcttttcatcatccatg 18304480  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     |||| ||||||  || | ||||| ||||| ||| |||| | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  18304479 tagtcccatacctacacgacctcaggatccttctcattccgttgtgatttggttcgtctagaagctg 18304413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39147186 - 39146924
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||        || || ||||||||||||||  |  | | |||||||||||    
T  39147186 acaaaccaacatgagtctttctagcgttttttgtcctctctcgcacgcttact-------ttcccagtaggtcacccatcatacgactactccaagtcaa 39147094  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||| | ||||||||||||||| || |||| |    
T  39147093 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataagtagtatcaaacaattcttataagtctaccttca 39146994  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  39146993 accatgtagtcccatacctacacggcctcatgatccctctcatttcgatgtgattcagttcctctagaag 39146924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 392
Target Start/End: Original strand, 20858434 - 20858626
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |  | | |||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20858434 acaaatcaacacgagtattttcagcgtgttttgtcctcactagcatgcttttcagaaaacttcccagaaggtcacc-atcccaaagttgctccaagtcaa 20858532  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagcctt 392  Q
      |   ||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  20858533 gcaaccttaactatggagttcttatggaatgagctacagaaaagaagaagcatcttgttgatatagaaaataccaaacaattcttataagcctt 20858626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 458
Target Start/End: Original strand, 30719767 - 30719956
Alignment:
Q  269 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcag 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |  ||| |||| ||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||    
T  30719767 gtcacccgtcccaaaattgctccaagttgagcacgcttaattgtggagttcttatggtttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtttttataggtag 30719866  T
Q  369 tacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||| |||||  |||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30719867 taccaaacaattcatataagccttccttcaacaatgatgtcccatacttgcacaacctcaggatccctctcattctgatgtgattcggtt 30719956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 372
Target Start/End: Original strand, 11757174 - 11757346
Alignment:
Q  200 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaa 299  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||     
T  11757174 caaaccaacaagagtcttttaagcggatttcgtcctcactcacacgcttaccgaaaaatttcccggtaggtcacccatctcgaaattgctgtaagtcaag 11757273  T
Q  300 tacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacc 372  Q
     ||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||    
T  11757274 cacgcttaactgtggagttcttatggattgaactaccgaaaagaagatgcattttgttgatataagtagtacc 11757346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 396
Target Start/End: Original strand, 30684447 - 30684645
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||| ||| | ||||||||| ||  | ||||||||| |||||||||| |  || |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||      
T  30684447 cacaaatcaatatgagtctttttagtatattttgtccttactcgcacgcttttcgagaaacttttcagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagttg 30684546  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctt 396  Q
    |  ||| |||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  30684547 agcacgcttaactgtggagttcttatggtttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtttttatagatagtaccaaacaattcatataagcctccctt 30684645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 451
Target Start/End: Original strand, 16370618 - 16370852
Alignment:
Q  214 tcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgat 313  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |   | |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||      
T  16370618 tcttttcagtgtgttttttcctcattcgcacgctttatgagaaacttttcagaatgtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaacatgcttaactgcg 16370717  T
Q  314 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    | ||||| ||  |    |||||| |||||||||| | |||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||    
T  16370718 gggttctgatttag---gctaccaaaaagaagatacgtcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataagttttccttcaaccatgcagtcttat 16370814  T
Q  414 acccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtga 451  Q
    |||  |||||| ||| || |||||| |||  |||||||    
T  16370815 acctacatggcatcaggaaccctctcatttcgatgtga 16370852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1880330 - 1880066
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||| |  ||| |||| | |||| || ||| | |||| |||     
T  1880330 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccataaaacttcctagtaagtcatctatccaaatattacaccaactcat 1880231  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||| || || ||||||| |||||   ||||||||||     ||||||| |    
T  1880230 gcacgcttaactgtagagttcttgtggaatagactaccaaaaagaatatgcat-ttgttaatataggaagtactggacaattctta----acttccttca 1880136  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    ||||||||||| |||| | ||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  1880135 accatgcagtcacataactgcacggtctcgagatccctctcattctggtgtgatttggtttgtctagaag 1880066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 323
Target Start/End: Original strand, 30720151 - 30720276
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| || |||||  | | |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30720151 cacaaaccaacaggagtcttttcagcgtgttttgtcctcgctcgcacgcttttcggaaagctttcaagaaagtcatccatcccaaaattgttccaagtca 30720250  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttat 323  Q
    |  ||| |||||||  ||||||||||    
T  30720251 agcacgattaactgtagagttcttat 30720276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 468
Target Start/End: Original strand, 5066872 - 5067052
Alignment:
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||   ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  5066872 ctccaaggcaaacacgtttaattgtggagtttttatgaaatagactaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatatagataataccaaacaattcttataa 5066971  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |  ||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||  |||| |||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  5066972 gttttcctttaatcatacagtctcatacatgcacggcctcgggatctctctcattctggtgtgattcgatttgtctagaag 5067052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 187810 - 187751
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  187810 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaactt 187751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 454
Target Start/End: Original strand, 4658001 - 4658139
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcata 414  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||| | ||||| ||||||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  4658001 agttcttatggaatggactaccaaaaagaagatgcatgttgttgttataggtagtatcaaacaagtcttataa-tcttcgttcaaccatgaagtctcata 4658099  T
Q  415 cccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    || ||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4658100 cctgcacggtttcaagatccctcttatttcgatgtgattc 4658139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 298
Target Start/End: Original strand, 30684902 - 30685002
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  ||| ||||||||  | | |||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  30684902 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcgcttgcacgcttttcggaaaactttcaagaaagtcatccatctcaaaattgttccaagtca 30685001  T
Q  298 a 298  Q
    |    
T  30685002 a 30685002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 458
Target Start/End: Original strand, 2058664 - 2058807
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcata 414  Q
    ||||||||||||||| ||||   || ||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||    
T  2058664 agttcttatggaatgtgctatttaacagaatttgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcatataagtcttccttcaatcatccagtctcata 2058763  T
Q  415 cccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
     | ||||| | ||| |||| |||| | || ||||||||||||||    
T  2058764 gctgcatgacttcaggatctctctcaatccgatgtgattcggtt 2058807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 42429283 - 42429129
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcata 414  Q
    |||||||||| || | ||||| |||||||| |||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||   || ||||    
T  42429283 agttcttatgtaacgggctacggaaaagaatatgcatattgttgataaaggtagtaccaaacaattcttataagtcctccttcaaccatgtgttcacata 42429184  T
Q  415 cccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagct 470  Q
    ||  || || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  42429183 cctacacggtctcaggat-cctcttattccgatgtgattcggttcgtctaaaagct 42429129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 454
Target Start/End: Original strand, 22975077 - 22975157
Alignment:
Q  374 aacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  22975077 aacaattcttataagcttttcttcaaccatgcagtcacatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 22975157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Original strand, 38063725 - 38063800
Alignment:
Q  203 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcc 279  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  38063725 accaacacgagt-ttttcagcgtattttgtcctcattcgcacgcttaccggaaaacttcccagtaggtcacccatcc 38063800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 464
Target Start/End: Original strand, 11160694 - 11160838
Alignment:
Q  320 ttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgc 419  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||  |    
T  11160694 ttatggaatgaactacgtgaaagaatatgcatcttgttgacatagatagtaccaaacaattattataagccttccttcaactatgtagtgtcatacctac 11160793  T
Q  420 atggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    | | | ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||    
T  11160794 acgacttcatgatccctctcattccgatgcaattcggttcatcta 11160838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8366719 - 8366595
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||  || |||||| || ||||||||||||||| || | | || ||| ||||    
T  8366719 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcgtcactcac-cgcttattggaaaacttcccagtaggtcacccatccaaatactacttcaaatcaa 8366621  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatg 324  Q
    | ||| ||||||   |||||||||||    
T  8366620 acacgcttaactatagagttcttatg 8366595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 416
Target Start/End: Original strand, 32574632 - 32574766
Alignment:
Q  281 aaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaat 379  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||| |||| |  || |||||| |||  ||||||||| || ||  |||||| |||||| ||||||    
T  32574632 aaaattgctccaagtcaagcacgcttaact-atgaagttattatagtttgggctaccaaaagaaagatgcattttgtttgtataggtagtaccaaacaat 32574730  T
Q  380 tcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacc 416  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32574731 tcctataagcctt-ctttaaccgtgcagtctcatacc 32574766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 396
Target Start/End: Original strand, 4673469 - 4673560
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctt 396  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||   |||| || |||||||||||| |||||||    
T  4673469 ttaactgtggagttcttatggaatgaaataccaaaaagaatatgcatcttgttgatacaggtgctaccaaataattcttataagacttcctt 4673560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 232
Target Start/End: Original strand, 21883967 - 21884010
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt 232  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21883967 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt 21884010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4102982 - 4102908
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaa 341  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||||  || |||||||||||    
T  4102982 aggtcactcatctcaaaattgctccaagtcaagcacgtttaactgtgaagttcttatggtttgggctaccgaaaa 4102908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Original strand, 5066781 - 5066826
Alignment:
Q  200 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 245  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5066781 caaaccaacatgaatcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacg 5066826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5786043 - 5785958
Alignment:
Q  255 aaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaa 340  Q
    ||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  5786043 aaactttccagaagatcactcatcctaaaattgctccaagtcaaacacgcttaagcgtagagttcttatggaatgggctatcgaaa 5785958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 240
Target Start/End: Original strand, 21041410 - 21041460
Alignment:
Q  190 actgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 240  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21041410 actgaccacacacaccaactcgagtcttttcagcatgttttgtcctaactc 21041460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 451
Target Start/End: Original strand, 43356651 - 43356762
Alignment:
Q  338 aaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctc 437  Q
    |||||||||||||| || ||| | ||||  ||||| ||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||||||| |||||  |||| || |||||    
T  43356651 aaaagaagatgcatattgttggtttaggttgtaccaaacaattcttataagtcatcc-tcaatcatgcagtctcatacctgcatgatctcagga-ccctc 43356748  T
Q  438 ttattctgatgtga 451  Q
    | |||| |||||||    
T  43356749 tcattccgatgtga 43356762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 25337879 - 25338161
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25337879 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 25337978  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25337979 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 25338078  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  25338079 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctg 25338161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 221 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41754521 - 41754271
Alignment:
Q  221 agcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttct 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||    
T  41754521 agcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct 41754422  T
Q  321 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgca 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41754421 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgca 41754322  T
Q  421 tggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     |||||||||| |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  41754321 cggcctcaagaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctg 41754271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24818589 - 24818325
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24818589 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaacttcccggtaggtcacccatcc-aaaattgc 24818491  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  24818490 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcttataag 24818391  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  24818390 ccttccttgaaccatgcagtcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 24818325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 30966954 - 30966689
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30966954 gactgactccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 30966855  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||| ||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  30966854 tccaagttaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataat 30966755  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  30966754 ccttccttcaaccatgcagtcccatacatgtacggcctcaggatccctctcattccgatgcgattc 30966689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 30966498 - 30966233
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  30966498 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgg 30966399  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30966398 tccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 30966299  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  30966298 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgcgattc 30966233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 203 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 8256776 - 8256508
Alignment:
Q  203 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatac 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8256776 accaacatgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttatcggaaaacttcccagcaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcac 8256677  T
Q  303 gtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaacca 402  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8256676 gcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaacca 8256577  T
Q  403 tgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    || |||| ||||||  || ||| ||||||||||||| |||| |  |||||| | |||||||||||||||    
T  8256576 tgtagtcccatacctacaaggcttcaagatccctctcattccggcgtgatttgattcctctagaagctg 8256508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 199 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16379647 - 16379387
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  16379647 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacagtgaaacttcccggtaggtcacccatccaaagattactccaagtcaa 16379548  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    | ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |    
T  16379547 acacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcgtataagtcttccttca 16379448  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttc 459  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||  || |||||||||||    
T  16379447 accatgcagtcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattccaatttgattcggttc 16379387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 198 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 33771256 - 33771038
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33771256 cacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 33771157  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  | | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  33771156 agcatgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctttcttc 33771057  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacc 416  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  33771056 aaccctgcagtcccatacc 33771038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 5399699 - 5399964
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  5399699 gactgaccccacaaaccaacacaagtctttccagcgtgttttgttctcactcgcacgcttaccggaaaacttcctggtaggtcacccatcccaaaatttc 5399798  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5399799 tccaagtcaagcacgcttaact-atgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 5399897  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||| |||| |||||| || || |||||  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5399898 gcctcccttaaaccatacactcccatacttgcacgacctcaagatccctctcattccgatgtgattc 5399964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 198 - 454
Target Start/End: Original strand, 29259511 - 29259767
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29259511 cacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtca 29259610  T
Q  298 aatacgtttaactgatg-agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctt 396  Q
    |  ||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  29259611 agcacgcttaact-atgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattttaataagccttcctt 29259709  T
Q  397 taaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
     |||||||||||| |||||  | | || |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  29259710 caaccatgcagtcccatacttgtacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattc 29259767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1912778 - 1912507
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || | | |||||||||||    
T  1912778 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 1912679  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  || | || |    
T  1912678 tcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctacc-aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaatctactttca 1912580  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1912579 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctaaaagctg 1912507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 199 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16379191 - 16378938
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  16379191 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacccggaaacttcccgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 16379092  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||| |    
T  16379091 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcgtataagacttccttca 16378992  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgat 452  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||   |||||||| |||| | ||||||    
T  16378991 accatgcagtctcatacttgcacggcctcggaatccctctcattccggtgtgat 16378938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 199 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33175210 - 33174955
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||  || | | |||||||||||    
T  33175210 acaaactaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaat-ttcccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaa 33175112  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33175111 c-acgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 33175013  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcgg 456  Q
    |||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33175012 accatgtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgg 33174955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 265 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 29804870 - 29804664
Alignment:
Q  265 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatag 364  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29804870 gtaggtcaaacatcccaaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 29804771  T
Q  365 gcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  29804770 gtagtacccaacaattcttataagcctgccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctcta 29804671  T
Q  465 gaagctg 471  Q
    |||||||    
T  29804670 gaagctg 29804664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 202 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15620149 - 15619881
Alignment:
Q  202 aaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaata 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| || | | ||| |||||||  |    
T  15620149 aaccaacacgagtcttttcagcgagttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccagtaggtcacccatccaaagactactcaaagtcaagca 15620050  T
Q  302 cgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaacc 401  Q
    || |||| ||  ||||||||||||| || | | || ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||     
T  15620049 cgcttaattgtggagttcttatggattgggtttccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcttgccttcaact 15619950  T
Q  402 atgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagct 470  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  15619949 atgcagtctcatacttgcacggcatcgggatccctctcattctgatgtaattcggttcgtctataagct 15619881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 25433948 - 25434220
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |||||| || || |||||||||||| || |   |||||||||||    
T  25433948 acaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtccttactcacacgcttaccagaaaacttccctgttggtcacccatccaaagaccactccaagtcaa 25434047  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||| |||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  25434048 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccagaaaggagatgcatcttgttgataaaggttgtatcaaacaattcttataagccttccttca 25434147  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||    
T  25434148 accatgaagtcccataccagcacggcctcaggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtttagaagctg 25434220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 33174756 - 33174487
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||  || | | |||||||||||    
T  33174756 acaaacaaacacgggtctttctagcatgttttttcctaactcgcacgcttaccgggaat-ttcccggtatgtcacccatcataagactactccaagtcaa 33174658  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33174657 gcacgcttaactgcggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 33174558  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||  || |||| ||||||  || ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33174557 ac--tgtagtcccatacctacacggcatcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcgtctagaagctg 33174487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 11388375 - 11388178
Alignment:
Q  265 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatag 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11388375 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 11388276  T
Q  365 gcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    | |||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||  || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11388275 gtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcatcaggat-cctctcattccgatgtgattcggttcctcta 11388178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 205 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1707289 - 1707028
Alignment:
Q  205 caacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgt 304  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| || | | || ||||||||| ||      
T  1707289 caacgcgaatctttttagcgtgttttgtattcactcgcacgcttaccgggaaacttcctggtaggtcacccatccaaagactacttcaagtcaaacactc 1707190  T
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  1707189 ttaactgtggagttcttatgagatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaatcatg 1707090  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaa 467  Q
     |||||||||||  ||  | |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1707089 tagtctcatacctacacagtctcaggat-cctctcattccgatgtgattcggttcctctagaa 1707028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 198 - 451
Target Start/End: Original strand, 30963154 - 30963407
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30963154 cacaaaccaacacgagtcttttcaacgtattttatcctcactcgcacgctttccgagaaacttccaagaaggtcactcatcccaaaattgctccaagtca 30963253  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| ||||||| ||| ||||||||   || |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30963254 agcacgcttaactgttgaattcttatgatttgggctaccaaaaataagatgcatcttgttgatataggtagtacctaacaattcttataagccttccttc 30963353  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtga 451  Q
    || |||||| ||  ||||  |   ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30963354 aatcatgcattcatatacatgtgcggcttcatgatccctctcattctgatgtga 30963407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 347
Target Start/End: Original strand, 32377598 - 32377756
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32377598 gactgaccccacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaactttccggtaggtcacctatcccaaaattgc 32377697  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagat 347  Q
    ||||||||||  | | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32377698 tccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttttggaatgagctaccgaaaacaagat 32377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 457
Target Start/End: Original strand, 27882818 - 27883076
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||  ||||||  | |||||||||| |||| || | | |||||||||||    
T  27882818 acaaaccaacaagattcttttcagcgtgttttgtcctgacttgcacacttaccgaaaaacttctcagtaggtcacctatccaaagactactccaagtcaa 27882917  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    | ||| |||| ||  |||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  27882918 acacgcttaattgtggagttcttatggaacggcctacaaaaaagaagatgcatcttattgatatagataataccaaacaattcttataagcattccttca 27883017  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggt 457  Q
    || ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||    
T  27883018 acaatgcagtctcatacatgcacggcctcaggatccctctcatttcggtgtgattcggt 27883076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 314 - 471
Target Start/End: Original strand, 18098885 - 18099042
Alignment:
Q  314 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  18098885 gagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaaccatgtagtctcat 18098984  T
Q  414 acccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||  || ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18098985 acctacacggcctcaggattcctctcattccgatgtgattcggttcctctataagctg 18099042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 32377789 - 32377921
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  32377789 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccagtagatcacccatcccaaaattgc 32377888  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttctt 321  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  32377889 tccaagtcaaacacgcttaactgtggagttctt 32377921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 265 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11394721 - 11394572
Alignment:
Q  265 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatag 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11394721 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaat-agctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 11394623  T
Q  365 gcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacc 416  Q
    | |||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  11394622 gtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccatgtagtctcatacc 11394572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 396
Target Start/End: Original strand, 30961774 - 30961972
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | | ||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30961774 cacaaactaacacaagtcttttcactgtgttttgtcctcactcgcacgctttctgagaaactacccagaaggtcacccatcccaaaattgctctaagtca 30961873  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctt 396  Q
    |  |||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  30961874 agcacgtttaactgtggagttcttatggtttcggctaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtagtaccaatcaaatcttataagacttcctt 30961972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 443
Target Start/End: Original strand, 30963611 - 30963856
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||  |||||| |  | |||||||| ||||||||| | | ||||||||    
T  30963611 cacaaaccaaaacgagtcttttcactgtgttttgtcctcactcgcacggtttccgacaaacttcctagaaggtcacctatcccaaaactccgccaagtca 30963710  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| |||||||  ||||| ||||||  || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||  ||||||     
T  30963711 agcacgcttaactgtggagttattatggtttgggctaccagaaagaagatgcatcttgttgatataggtagaaccatacaattcttataagttttccttc 30963810  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattc 443  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  30963811 aaccatgcattctcttacctgcacggcttcatgatccctctcattc 30963856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15639985 - 15639781
Alignment:
Q  202 aaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaata 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||||| || | | |||||||||||  |    
T  15639985 aaccaacacgagtcttttctgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgagaaacttcccagtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagca 15639886  T
Q  302 cgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaacc 401  Q
    || |||| ||  |||||||| |||| || | | || ||||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||     
T  15639885 cgcttaattgtggagttcttgtggattgggtttccaaaaagaagatgtatgttgttgatataggtagtaccaaacaattcctataagcgtgccttcaact 15639786  T
Q  402 atgca 406  Q
    |||||    
T  15639785 atgca 15639781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 83272 - 83054
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | | |  ||| |  ||   |||||||  ||| |||||||| ||||| |||    
T  83272 cacaaaccaacataagtcttatcaacgtgttttgtcctcactcgcacactttctgaaaaattaccctaaaggtcacatatcacaaaattgttccaaatca 83173  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||     
T  83172 aacacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaagattcatcttgttggtataggtagtaccaaacgattcttataagcataccttc 83073  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacc 416  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  83072 aaccatgtagtctcatacc 83054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13191226 - 13190986
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |   | |||||||||| | |||||||| ||| ||||||| || ||||||||      
T  13191226 aaaccaacactagtctttttagcgtgttttgtccgcattcacacgctttttgagaaactttccagaaggtcacctatctcaaaatttcttcaagtcaagc 13191127  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    ||   |||||   ||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13191126 acacataactatggagttcttataaaatggactaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaacaattcttataagtcttccttgaac 13191027  T
Q  401 catgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttatt 442  Q
    |||||||||| ||| || |||  |||| ||||||||||||||    
T  13191026 catgcagtcttata-cctcataacctcgagatccctcttatt 13190986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 453
Target Start/End: Original strand, 38898866 - 38899058
Alignment:
Q  261 tccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgat 360  Q
    |||||||||||||| |||| || | | ||| |||||||  ||| |||||||  ||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  38898866 tccggtaggtcacctatccaaagactactctaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgtgttaccaaaaagaaaatgcatcttgttgat 38898965  T
Q  361 ataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||  || |||||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  38898966 ataggtagtaccaaacaattcttataagctctccttcaaccatgtagtctgatacctacacggcctcaagatcactctccttccgatgtgatt 38899058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 1953276 - 1953150
Alignment:
Q  332 ctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaaga 431  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||    
T  1953276 ctaccaaaaagaagatgcatctagttgatataggtagtaccaaacaattcttataggtcttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgacttcagga 1953177  T
Q  432 tccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1953176 tccctctcattccgatgtgattcggtt 1953150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 343 - 471
Target Start/End: Original strand, 18447954 - 18448082
Alignment:
Q  343 aagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttatt 442  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||| | |||    
T  18447954 aagatgcatcttgttgatacaagtagtaccaaacaattcttataagtcttacttcaaccatgtagtcacatacctacacggcctcaggatccctatcatt 18448053  T
Q  443 ctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18448054 ccgatgtgattcggttcctctaaaagctg 18448082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 315 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20502160 - 20502061
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcata 414  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20502160 agttcttatgaaatgggctaccaaaaa-aagaagcatcttgttgatatagaaagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccata 20502062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8074147 - 8073944
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||| || ||| | |  || ||||||||| || ||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  8074147 cacaaacaaacacaagttttttcatcgtgttttgttctcaatcacacacttttcgagaaactttctggaaggtcactcatcccaaaatttaaccaagtca 8074048  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  | | ||| ||   ||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||     
T  8074047 agaaggcttatctatggagttcttatgaaatgggctacaagaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagtctcccttc 8073948  T
Q  398 aacc 401  Q
    ||||    
T  8073947 aacc 8073944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 279
Target Start/End: Original strand, 8181254 - 8181333
Alignment:
Q  200 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||| || |||||||||||||||    
T  8181254 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacgtttatcggaaaacttcccagtaggtcacccatcc 8181333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16542164 - 16542034
Alignment:
Q  275 catcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagcta-ccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacct 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||||    |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||      
T  16542164 catcctaaaattgctccaagtcaaacacatttaactgtagagtttttatggaatgagctataaaaaaaaaagatacatcttgttgatataggtagtacaa 16542065  T
Q  374 aacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  16542064 aacaattattataagtcttccttcaaccatg 16542034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 246
Target Start/End: Original strand, 36924373 - 36924420
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36924373 acaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 36924420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20502218 - 20502172
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 245  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502218 acaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 20502172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 290
Target Start/End: Original strand, 18875876 - 18875968
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctc 290  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |  |  |||||||| | | || |||||||||||||||||||||    
T  18875876 cacaaaccaacacgtgtctttacagtgtgttttgtcctcactcgcacgattttcaagaaacttttcagaagatcacccatcccaaaattgctc 18875968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 37552819 - 37552570
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||| |  |  ||||||||||| | | ||||  ||| ||||| ||||| |  |||||||    
T  37552819 acaaaccaacacgggtattttaagcgtgttttttcctcaatcgcatgattttcgggaaacttttcagaaggtttcccgtcccagaattgattaaagtcaa 37552720  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      | | |||||||  || |||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||| | ||| |||| | |||||| ||||||||||||||| | || |||     
T  37552719 gcatgcttaactgtggaattcttacggaatgcgctgccaaaaagaaga-gcatcattttg-tatatgtagtaccaaacaattcttataagtc-tcgtttg 37552623  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtga 451  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||| ||  ||||| ||||| ||||||    
T  37552622 accatgcagtcccatacttgcatggtctcaggaatcctctcattctaatgtga 37552570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29804902 - 29804871
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29804902 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttt 29804871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 402
Target Start/End: Original strand, 36924453 - 36924519
Alignment:
Q  338 aaaagaagatgcatcttattgatatag--gcagtacctaacaattcttataagccttcctttaacca 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   | | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36924453 aaaagaagatgcatcttgttgatatataagtaataccaaacaattcttataagccttccttcaacca 36924519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 238
Target Start/End: Original strand, 38898817 - 38898856
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcac 238  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898817 acaaaccaacttgagtcttttcagcgtgttttgtcctcac 38898856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11389747 - 11389677
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaact 259  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||||    
T  11389747 gactgaccccacaaaccaacatgagttttttcagcatgttttattctcactcgcatgcttaccaggaaact 11389677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11406408 - 11406338
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaact 259  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| || |||| |||||||    
T  11406408 gactgaccccacaaaccaacatgagttttttcagcatgttttattctcactcgcatgcttaccaggaaact 11406338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 243
Target Start/End: Original strand, 26865144 - 26865189
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgca 243  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26865144 cacaaaccaacacggatcttttcagcatgctttgtcctcactcgca 26865189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 402
Target Start/End: Original strand, 8181394 - 8181446
Alignment:
Q  350 atcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaacca 402  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  8181394 atcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttaaaagtcttccttcaacca 8181446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 22548431 - 22548713
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22548431 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 22548530  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  22548531 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaa 22548630  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||| || |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  22548631 acttccttcaaccatgcagtcacatacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgattaggttcctctagaagctg 22548713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 22026644 - 22026361
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt-gtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattg 287  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22026644 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccgataggttacccatcccaatattg 22026545  T
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    |||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22026544 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 22026445  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22026444 gccttcattcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcacgaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 22026361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 22548877 - 22549159
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22548877 gactgaccccacaaaccaacacgagtctgttcagcgtgttttatcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 22548976  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22548977 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagtttttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 22549076  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||| |||  |||||| ||  ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22549077 tcttccttcaaccatgcagtcacatacctgcacagcctcaggaagcctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 22549159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 41658987 - 41659269
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41658987 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttacagggaaacttcccggtaggtcacctatcccaaaattgc 41659086  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  41659087 tccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatgtaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 41659186  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||| ||| | | ||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41659187 tcttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacatcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 41659269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 27022221 - 27022502
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27022221 gactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaa-aaactttccagtaggtcacccatcccaaaattgc 27022319  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27022320 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctgccgaaaataagatgcatgttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 27022419  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||| || ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27022420 ccttctttcaaccatgtagtcccatacctacatggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcggctcctctagaagctg 27022502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17103346 - 17103086
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtca-cccatcccaaaattg 287  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17103346 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcaacccatcccaaaattg 17103247  T
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    |||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17103246 ctccaagtcaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcagcttgttgatataggcagtaccaaacaattcttataa 17103147  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatg 448  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  17103146 gtcttccttcaaccatgcagtctcatacctgtacggcctcaggatctctctcattccgatg 17103086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27926152 - 27925881
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27926152 acaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtacctcacccatcccaaa-ttgctccaagtcaa 27926054  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  27926053 gcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataatccttccttca 27925954  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27925953 accatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 27925881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 469
Target Start/End: Original strand, 12827136 - 12827416
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12827136 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttaaaagtgttttaacctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 12827235  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12827236 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 12827335  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagc 469  Q
    |||||||| ||||| | |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  12827336 ccttccttcaaccaagtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgattcggttcttctagaagc 12827416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 199 - 457
Target Start/End: Original strand, 10844507 - 10844765
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10844507 acaaacaaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgcttcaagtcaa 10844606  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  10844607 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttca 10844706  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggt 457  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||| ||||||    
T  10844707 accatgcagtcccatacctgcaaggcctcaggaaccctctcattccggtgtggttcggt 10844765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 198 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25147791 - 25147573
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25147791 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtactcactcgcacgcttatcaggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 25147692  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||     
T  25147691 agcacgattaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagcaccaaacaattcttataagccttccttc 25147592  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacc 416  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25147591 aaccatgcagtctcatacc 25147573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 189 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12100954 - 12100711
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12100954 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacgaggaaacttcccggtaggtcacccatcc-aaaattgc 12100856  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  12100855 tccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggtagtaccaaacaaatcttataag 12100756  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatc 433  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||    
T  12100755 cttgccttcaaccatgcagtctcatacctgtacggcctcaggatc 12100711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 454
Target Start/End: Original strand, 34308813 - 34309086
Alignment:
Q  185 tgctgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaa 284  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34308813 tgctgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatctcaaaa 34308912  T
Q  285 ttgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattg----atataggcagtacctaacaatt 380  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    ||||||| |||||| |||| ||    
T  34308913 ttgctccaagccaagcacgcttaactgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatataggtagtaccaaacagtt 34309012  T
Q  381 cttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  34309013 cttataagccttccttcaaccatacagtctcatacttgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 34309086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 34308361 - 34308626
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34308361 gactgaccccacaaaccagcacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatctcaaaattgc 34308460  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    |||||| |||  ||| |||| ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  34308461 tccaagccaagcacgcttaagtgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacagttcttataag 34308560  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  | | ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  34308561 ccttccttcaaccatacagtctcatacttgtacggcctcaggatccctttcattccgatgtgattc 34308626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 2044312 - 2044043
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  2044312 acaaaccaatacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccattaggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 2044213  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  2044212 gcacgcttaactgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagccttccttca 2044113  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||| |||||||||||  ||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2044112 accatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattctgttcctctagaag 2044043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 32292651 - 32292383
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || | | |||||||||||    
T  32292651 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccggaaaacttcccggtagatcacccatccaaagactactccaagtcaa 32292552  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  32292551 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctagcaaaaagaagatgcaacttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagcattccttca 32292452  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaa 467  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  32292451 accatgcagtcccatacttgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaa 32292383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 8080234 - 8080506
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||| |||||||| || | | |||||||||||    
T  8080234 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcctagtaggttacccatccaaagactactccaagtcaa 8080333  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |    
T  8080334 gcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttatcagctttccttca 8080433  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| |||| ||||||  || ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8080434 accatgtagtcccatacctacacggcttcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctg 8080506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25148230 - 25147966
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25148230 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgacctcactcgcacgtttatcgg-aaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 25148132  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    || |||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  25148131 tcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtaagaccaaacaattcttataag 25148032  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| ||| |  ||||| ||||||  || | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  25148031 ccttccttcaacgacacagtcccatacctacacgacctcgggatccctctcattcttatgtgattc 25147966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 198 - 438
Target Start/End: Original strand, 21316001 - 21316240
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  21316001 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgg-aaacttcgcggtaggtcacccttaccaaaattactccaagtca 21316099  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||  |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||  || |||    
T  21316100 agcacacttaactgtggagttcttatgaaatgagctactgaaaagacgatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttttaagcgctcattt 21316199  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctct 438  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  21316200 aaccatacagtctcatacctgcacggccttaggatccctct 21316240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Original strand, 33852150 - 33852419
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  33852150 acaaatcaacatgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcatgaaactttccgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 33852249  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||| |    
T  33852250 gcacgcttaattgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatacatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagttttccttca 33852349  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || |||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  33852350 accatacagtctcatacctgcacggtctcgggatccctctcattctggtgtgattcagttcctcttgaag 33852419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 8446367 - 8446527
Alignment:
Q  10 aacaaactgaacaaaaatcactttcactttgatctacttccttcactgaaccaccaacattgaaacaattcttgtagattttatgaagagtcttgattat 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  8446367 aacaaactgaacaacaatcactttcactttgatctatttccttcattgagccaccaacatagaaataattcttgtagagtttatcaagagtcttaattat 8446466  T
Q  110 gttttcttgaaatgaataagccataagagcaacggttgtgaggaatttgaggatggttgtt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8446467 gttttcttgaaatgaataagctataagagcaactattgtgaggaatttgaggatggttgtt 8446527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Original strand, 31283534 - 31283716
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31283534 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgcgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccat-ccaaaattgc 31283632  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacc 372  Q
    || |||||||  ||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  31283633 tcaaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtacc 31283716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 305 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10845031 - 10844865
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10845031 ttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatg 10844932  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10844931 cagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 10844865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 268 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25144957 - 25144771
Alignment:
Q  268 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggca 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  25144957 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgctgatataggta 25144858  T
Q  368 gtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||| ||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  25144857 gtaccaaacaattcttataagcctgccttcaatcatgcaatcccatacctgcacgacctcgagatctctctcattctgatgtgattc 25144771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 201 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41913222 - 41912996
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||  ||||||||| ||||| || | | || ||||||||      
T  41913222 aaactaacacgagttttttcaacgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccaagaaactttctagtaggtcactcatccaaagactacttcaagtcaagc 41913123  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  41913122 acgcttaactgcggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagacgcatcttgttgatataggtagcaccaaacaattcttataagccttctttcaaa 41913023  T
Q  401 catgcagtctcatacccgcatggcctc 427  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41913022 catgcagtcccatacctgcatggcctc 41912996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 205 - 458
Target Start/End: Original strand, 27819145 - 27819397
Alignment:
Q  205 caacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgt 304  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||| | | || ||||||  | | ||||||||||||| || | | ||| |||||||| ||      
T  27819145 caacacgggtcttttcagtgtgctt-gtcctcactcacacgctttctggaaaacttatcagaaggtcacccatccaaatactactcaaagtcaaacacac 27819243  T
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27819244 ttaactgtggagtttttatggaatgagctattgaaaagaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaacaattcttattagccttccttcaaccatg 27819343  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
     ||||||||||  ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27819344 aagtctcatacttgcatgacttcatgatccctctcattctgatgtgattcggtt 27819397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 320 - 471
Target Start/End: Original strand, 28375067 - 28375218
Alignment:
Q  320 ttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgc 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  28375067 ttatggaaagagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatgtaggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaatcatgcagtctcatacctgc 28375166  T
Q  420 atggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    | ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  28375167 acggcctcaggatccctctcattatggtgtgattcgtttcgtctagaagctg 28375218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 388
Target Start/End: Original strand, 30527374 - 30527563
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||||||| || ||| ||| |||||||    
T  30527374 acaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttatcctcactcgcacgcttaccgggaagttttcaggtagatcacccatccaaagattactcaaagtcaa 30527473  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    | |   |||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||    
T  30527474 acaatcttaactgtggagttcttatgaaatgggctacccaaaagaagatgtatcttattgatgtaagtggtaccaaacaattcttataag 30527563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 269 - 468
Target Start/End: Original strand, 6464872 - 6465071
Alignment:
Q  269 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcag 368  Q
    ||||||||||| || | | |||||||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  6464872 gtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttgttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtag 6464971  T
Q  369 tacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  || ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||| || |||||||||    
T  6464972 taccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagttccatacctacacggcctcatgattcctctcattccaatgtgattcgattactctagaag 6465071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 413
Target Start/End: Original strand, 15818907 - 15819121
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||| || | ||||| ||||||| ||   | ||||||||||    
T  15818907 cacaaaccaacacaagtcttttcagtgtgctttgtcctcactcgcacacttttcgggaaacttcccagaaggtcgcccatccaaagcctactccaagtca 15819006  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||| || ||||| ||||||     
T  15819007 agcaaatttaactg-tgagttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcatgttgatatatgtagtaccaaacaatttttctaagcattccttc 15819105  T
Q  398 aaccatgcagtctcat 413  Q
    |||||||  |||||||    
T  15819106 aaccatgttgtctcat 15819121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 28453592 - 28453337
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||   |||||||| |  |||||||| |||||| || | | |||||||||||    
T  28453592 acaaacaaacacgactcttttcagcatgttttgtcctcactcgcagtcttattaggaaacttccgagtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaa 28453493  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||||  ||| || |    
T  28453492 gcacgcttaactgtagagttcttatggaatgggctaccataaagaagatgcatcttgttaatataggtagtataaaacaattcttataagttttctttca 28453393  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | ||||  ||||||||| |||| | ||||||||    
T  28453392 accatgaagtctcatacctgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattc 28453337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 468
Target Start/End: Original strand, 27021904 - 27022044
Alignment:
Q  332 ctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaaga 431  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||    
T  27021904 ctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcttatacctacatggcctcagga 27022003  T
Q  432 tccctcttattct----gatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    ||||||| ||||     |||||||||||| |||||||||||    
T  27022004 tccctctcattcattccgatgtgattcggctcctctagaag 27022044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32292195 - 32292096
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  32292195 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 32292096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 314 - 468
Target Start/End: Original strand, 22840536 - 22840690
Alignment:
Q  314 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||    
T  22840536 gagttcttatggaatgagctaacaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagtcttcattcgaccatgtagtctcat 22840635  T
Q  414 acccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||  ||  |||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  22840636 acctacaaagcctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttactctagaag 22840690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3744893 - 3744675
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactt-tccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||| | | | | ||||||| ||   ||| ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  3744893 cacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgttctcattaacacactttctgagaaacttctcaaatag-tcaccaatcccaaaattgctcaaagtt 3744795  T
Q  297 aaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctt 396  Q
    ||  | | |||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || ||| |||||| |||  | ||||||||||||||| |||||||    
T  3744794 aataaagcttaattgtagagttcttatgaaatgtgctaccaaaaagaaggtgcatattgttggtataggtagtgtcaaacaattcttataagtcttcctt 3744695  T
Q  397 taaccatgcagtctcatacc 416  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  3744694 caaccatgcagtcccatacc 3744675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3745286 - 3745145
Alignment:
Q  268 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggca 367  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |    
T  3745286 ggtcagccatcccaaaattgctctaagtcaagcacgcttgactgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatattgttggtataggta 3745187  T
Q  368 gtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtc 409  Q
    ||||  |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  3745186 gtactaaacagttcttataagttttccttcaaccatgtagtc 3745145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 396
Target Start/End: Original strand, 15567516 - 15567645
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    |||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| |     
T  15567516 aggtcatccattccaaaactactccaagtcaaacacgattaactgcggagttcttatgaaatgaactaccaaaaagaagatgtatcttgttggtatatgt 15567615  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctt 396  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||    
T  15567616 agtgtcaaacaattcttataagccttcctt 15567645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 273
Target Start/End: Original strand, 6463438 - 6463510
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||    
T  6463438 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaagttttctggtaggtcac 6463510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22705424 - 22705353
Alignment:
Q  204 ccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcaccc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  22705424 ccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactggcacgcttactggaaaacttcccggtaggtcaccc 22705353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1297193 - 1296990
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    ||||||| ||||| || ||| || ||||||||| ||  ||||||   ||||||||||  |||| | |||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||     
T  1297193 aggtcactcatccaaagattacttcaagtcaaacacacttaactatggagttcttatataatgggataccgaaaagaatataaatcttgttggtataggt 1297094  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctaga 466  Q
    |||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||  | |||||| | | |||||||||| |||| || ||||    
T  1297093 agtaccaaacaattcttataagttttacttcaaccatgcagtctcatacctgcatgatctcagaacccctctcactttgatgtgatttggttgct-taga 1296995  T
Q  467 agctg 471  Q
    |||||    
T  1296994 agctg 1296990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 6466892 - 6466706
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |    |||||||||| |||| ||||  |||||  ||||||||||| ||| ||||||     
T  6466892 aggtcacccataccaaaattgctccaagtcaagtacacttaaatttgtagttcttatgaaatg-gctat-gaaaa--agatgcatcttgttggtataggt 6466797  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||  | ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  6466796 agtaccaaacaatttttataagtct-cctttaaccatgcagttccatacccgcacagtctcagaatccctctcattctgatatgatttggtt 6466706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 455
Target Start/End: Original strand, 30334892 - 30335056
Alignment:
Q  291 caagtcaaatacgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagc 389  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| | ||||||| |||||||     
T  30334892 caagtcaaacacatttaact-atgaagttattatgaattgagctatcgaaaagaagatgtatcttgttggtataggtagtatcaaacaatttttataagt 30334990  T
Q  390 cttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcg 455  Q
    |||| || |||| ||||||| |||||| |||  | |||| ||||| ||| |||| |||||||||||    
T  30334991 cttctttcaaccttgcagtcgcatacctgcacagtctcaggatccatctaattccgatgtgattcg 30335056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25308012 - 25307855
Alignment:
Q  205 caacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgt 304  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||  ||| ||||||||||| || | | | |||||||||  | |     
T  25308012 caacacgagtcttttcagcgtactttgtcctcactcgcacgcttgccgaaaaactttcaagtacgtcacccatccaaagactacaccaagtcaagcaagc 25307913  T
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatag 364  Q
    |||||||  |||||||||  ||||| ||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  25307912 ttaactgtggagttcttacagaatgggctacc--aaaaaagatgtatcttgttgatatag 25307855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22705302 - 22705182
Alignment:
Q  320 ttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgc 419  Q
    |||||||||| | |||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||  |    
T  22705302 ttatggaatgggttaccaaaaaga---tgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataacccttccttcaatcatccagtcccatacctac 22705206  T
Q  420 atggcctcaagatccctcttattc 443  Q
    | ||| ||| ||||||||| ||||    
T  22705205 acggcttcaggatccctctcattc 22705182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 464
Target Start/End: Original strand, 29971450 - 29971558
Alignment:
Q  356 ttgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcg 455  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||     
T  29971450 ttgatatagatagtatcaaacaattcttataaatcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccttccaattctgatgtgattca 29971549  T
Q  456 gttcctcta 464  Q
    |||| ||||    
T  29971550 gttcgtcta 29971558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34688015 - 34687920
Alignment:
Q  268 ggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatata 363  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||| | || |||||||   || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34688015 ggtcatccataccataattgctccaagtcagacacatttaactatggaattcttatggaataacctaccaaaaagaagatgcatctttttggtata 34687920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9251140 - 9251098
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactc 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9251140 cacaaaccaacacaagttttttcagcgtgttttgtcctcactc 9251098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 354
Target Start/End: Original strand, 10729603 - 10729733
Alignment:
Q  224 gtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttat 323  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |  ||||||||||   ||||||  ||||||||||||||| |||| |||  ||  |||| ||  |||| |||||    
T  10729603 gtgttttgtcttcactcgcacgcttttcatgaaactttccataaggtcagtcatcccaaaattgcttcaagccaagcacccttaattgtggagtccttat 10729702  T
Q  324 ggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 354  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  10729703 ggaataggctaccaaaaagaagatgcatctt 10729733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Original strand, 22840431 - 22840477
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcct 235  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22840431 gactgaccatacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcct 22840477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29117490 - 29117444
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  29117490 acaaaccaacacgagtcttttcaggatgatttgtcctcactcgcacg 29117444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34688090 - 34688044
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34688090 acaaaccaacatgagtcttttcaacgtgttttgtcctcattcgcacg 34688044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10729870 - 10729830
Alignment:
Q  206 aacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10729870 aacacgagtcttttcagcgtgctttgtccacactcgcacgc 10729830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6466511 - 6466468
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 241  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6466511 cacaaaccaacacaagtctttttagcgtgctttgtcctcactcg 6466468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 243
Target Start/End: Original strand, 12119228 - 12119273
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgca 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  12119228 cacaaaccaacacgagtattttcaatgtgctttgtcctcactcgca 12119273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 402
Target Start/End: Original strand, 15568036 - 15568100
Alignment:
Q  338 aaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaacca 402  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  15568036 aaaaaaagatgcatcttgttgatataggtcataccaaacaattgttataagtcttccttcaacca 15568100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 239
Target Start/End: Original strand, 29971323 - 29971359
Alignment:
Q  203 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcact 239  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29971323 accaacacgagttttttcagcatgttttgtcctcact 29971359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19230 - 18966
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19230 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 19131  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19130 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 19031  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  19030 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatt 18966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 389 - 454
Target Start/End: Original strand, 18203 - 18268
Alignment:
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  18203 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgattc 18268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 189 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 3006 - 2727
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3006 gactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtctcccatcccaaaattgc 2907  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2906 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 2807  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  2806 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattcgattcctctagaag 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 221 - 471
Target Start/End: Original strand, 12691907 - 12692157
Alignment:
Q  221 agcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttct 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||    
T  12691907 agcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct 12692006  T
Q  321 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgca 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  12692007 tatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgca 12692106  T
Q  421 tggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
     ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12692107 cggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 12692157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 198 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 49998891 - 49998636
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998891 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 49998792  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  49998791 aacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttc 49998692  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    |||||||||||| ||| ||  ||  |||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  49998691 aaccatgcagtcccatgcctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgatt 49998636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 198 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 35871882 - 35871627
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35871882 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccgataggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 35871783  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  35871782 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaa-atgcatcttgttgatataggtggtaccaaacaattcatataagccttccttc 35871684  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||||| |||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  35871683 aaccatgaagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 35871627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 199 - 454
Target Start/End: Original strand, 44471211 - 44471466
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44471211 acaaaccaacacgagtctttccagcatgttttgtcctcactcgcccgcttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaaatcaa 44471310  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  44471311 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttca 44471410  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||| ||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  44471411 accatgtagtctcatacctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattc 44471466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 437
Target Start/End: Original strand, 7678498 - 7678746
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7678498 gactgaccccacaaacctacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 7678597  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7678598 tccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataag 7678697  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctc 437  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||  || ||||||||||||||||    
T  7678698 ccttccttcaaccatgtagccccatacctacaaggcctcaagatccctc 7678746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Original strand, 24629312 - 24629591
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24629312 gactgaccccacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggt---ttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 24629408  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24629409 tccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttatggaacgaggtaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 24629508  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24629509 cattcctttaaccatgcagtcccatacctacacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctg 24629591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 198 - 471
Target Start/End: Original strand, 4127774 - 4128048
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4127774 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccggaaaacttttcggtaggtcacccatcccaaaattgctctaagcca 4127873  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| ||||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4127874 agcacgcttaactctgaagttcttatggaattggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttc 4127973  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctc-tagaagctg 471  Q
    ||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  4127974 aaccatatagtctcatgcctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctcttagaagctg 4128048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 23350159 - 23350424
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  23350159 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcacacgcttacagagaaacttctcggtaggtcatccatcccaaaattgc 23350258  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23350259 tccaagtcaagcacgcttaact-atgaagttcttatggaaggagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggaagtaccaaacaattcttataa 23350357  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||| | | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  23350358 gccttccttcaaccatgcagtcccctacctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattc 23350424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 1645635 - 1645907
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| | |||||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  1645635 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttacaaagaaacttcctggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 1645734  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  1645735 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattcttataagtcttccttca 1645834  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| |||| ||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1645835 accatgtagtcccatacctacacggcctcaagattcctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctg 1645907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 456
Target Start/End: Original strand, 50398424 - 50398681
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  || | | |||||||||||    
T  50398424 acaaaccaacacgagtctttccagtgtattttgtcctcactcgcacgcttaccggtaaacttcccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaa 50398523  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  50398524 gcacgcttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 50398623  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcgg 456  Q
    |||||| ||||  |||||  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  50398624 accatgtagtcctatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgg 50398681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 415
Target Start/End: Original strand, 44470761 - 44470976
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44470761 acaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcaaccatcccaaaattgctccaagtcaa 44470860  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  44470861 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagtta-cgaacagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttca 44470959  T
Q  399 accatgcagtctcatac 415  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  44470960 accatacagtcacatac 44470976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 23942675 - 23942947
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||    
T  23942675 acaaaccaacacgggtcctttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttatttggaaactttccggtaggtcatccatccaaagactactccaagtcaa 23942774  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  23942775 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttca 23942874  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| |||  ||||||  || |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23942875 accatgtagttccatacctacacggccccaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctg 23942947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 4127294 - 4127587
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4127294 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccgatagctcacccatcccaaaattgc 4127393  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactg----------atg---------agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagt 369  Q
    |||||| |||  | | |||||||          |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4127394 tccaagccaatcatgcttaactgtggagttcttatggaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagt 4127493  T
Q  370 acctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctct 463  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4127494 accaaacaattcttataagtcttccttcaactatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctct 4127587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 23943128 - 23943396
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | | |||||||||||    
T  23943128 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggttggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 23943227  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | || ||||||| ||||||| |    
T  23943228 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaatattttttataagtcttccttca 23943327  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||   ||  ||||||  ||  |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23943328 accat---gtgacatacctaca-cgcctcaggatccctatcattttgatgtgattcggttcctctagaagctg 23943396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 456
Target Start/End: Original strand, 50398880 - 50399136
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |  |||||||||||||||||  || | | |||||||||||    
T  50398880 acaaaccaacacgagtctttccaacgtgttttgtcctcacttgcacgtttaccgggaat-tccccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaa 50398978  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
    | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  50398979 acacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcgtgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 50399078  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcgg 456  Q
    |||||| | |||||||||  || || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  50399079 accatgtaatctcatacctacacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattcgg 50399136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 3169460 - 3169188
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| || | | |||||||||||    
T  3169460 acaaaccaacacgagtattttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaagaaactttctggtaggtcactcatccaaagactactccaagtcaa 3169361  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| ||  ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |    
T  3169360 gcacgcttaagtgtggagttcttatggattgggttaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataagtcttccttca 3169261  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||| |||| ||||||  || ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3169260 accatgtagtcccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattcggttcctctataagctg 3169188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 260 - 471
Target Start/End: Original strand, 21220278 - 21220489
Alignment:
Q  260 ttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattga 359  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21220278 ttccagtaggtcacccgtcccaaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtgtagttcttatagaatgagttaccaaaaagaagatgcatcttgttga 21220377  T
Q  360 tataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttc 459  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21220378 tataggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaaccatatagtttcatacctacatggcctcatgatccctctcattctgatgtgattcggttc 21220477  T
Q  460 ctctagaagctg 471  Q
    ||||||||||||    
T  21220478 ctctagaagctg 21220489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 263 - 471
Target Start/End: Original strand, 24628927 - 24629138
Alignment:
Q  263 cggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatat 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24628927 cggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatat 24629026  T
Q  363 aggcagtacctaacaattcttataagcc---ttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttc 459  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| || |||||| |||| | |||||||||||||    
T  24629027 aggtagtaccaaacaattcttataagcctaattcctttaaccatgcagtcccatacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttc 24629126  T
Q  460 ctctagaagctg 471  Q
    ||| ||||||||    
T  24629127 ctcaagaagctg 24629138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 387
Target Start/End: Original strand, 50814730 - 50814899
Alignment:
Q  218 ttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||    
T  50814730 ttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaacttcccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagt 50814829  T
Q  318 tcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  50814830 tcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataa 50814899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 203 - 468
Target Start/End: Original strand, 9423748 - 9424013
Alignment:
Q  203 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatac 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||||||||| || | | |||||| ||||  ||    
T  9423748 accaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaacgggaaatttcccggtaggtcacccatcctaagactactccaattcaagcac 9423847  T
Q  303 gtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaacca 402  Q
      |||| ||   | ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  9423848 acttaattgtgaaattcttatggaatgggctactagaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattattataagccttctttcaacca 9423947  T
Q  403 tgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    ||||||| |||||  ||| | ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  9423948 tgcagtcccatacatgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaag 9424013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Original strand, 14572041 - 14572291
Alignment:
Q  200 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  14572041 caaaccaacacgagtcttttcaccgtgttttgtcctcactcacacgctttccgagaaacttcccagaaggtcacccatctcaaaattgctctaagtcaag 14572140  T
Q  300 tacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaa 399  Q
     ||| ||   ||  ||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  14572141 cacgctt---tgtggagttcttatggtttaggctaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctcccttcaa 14572236  T
Q  400 ccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  14572237 ccatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 14572291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14352063 - 14351780
Alignment:
Q  185 tgctgactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaa 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||| | |||||||| |||||| || |    
T  14352063 tgctgactgaccatacaaaccaacatgagtcttttcagcatattttgtcttcacttgcacgcttactggaaaactttgcagtaggtcatccatccaaaga 14351964  T
Q  285 ttgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattctta 384  Q
     | ||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || || |||||    
T  14351963 ctactcgaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaataggataccaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaaaaactctta 14351864  T
Q  385 taagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  14351863 caagccttccttcaaccatgcagactcatacatgcacgacctcaggatccctctcattctggtgtgattcggtttgtctagaag 14351780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 21067536 - 21067271
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||||    
T  21067536 acaaactaacacgagtcttttcagtgtgttttgtccccactcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtcacccctccaaagactactccaagtcaa 21067437  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||| ||  |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||| |||| || ||||||| |    
T  21067436 gcacgcttaattgtggagtacttttagaatgagctaccggaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaataattattattagtcttccttca 21067337  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||  ||||||||| |||| | ||||||||| ||| ||||    
T  21067336 accatgcagtctcatacatgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattcgattcgtcta 21067271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 456
Target Start/End: Original strand, 51331169 - 51331424
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| || ||  ||| || |||||||||||||||||  || | | |||||||||||    
T  51331169 acaaactaatacgagtcttt-cagtgtgttttgtcctcattcgcacgcttatcga-aaatttcccggtaggtcacccatcataagaatactccaagtcaa 51331266  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  51331267 gcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgtatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttca 51331366  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcgg 456  Q
    |||||| |||| ||||||  || ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  51331367 accatgtagtcccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattcgg 51331424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 455
Target Start/End: Original strand, 31817740 - 31817994
Alignment:
Q  200 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaa 299  Q
    |||||||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||| | ||| |||||||  | | ||||| ||||||| |||| | || ||||||||     
T  31817740 caaaccaacacgagtcatt-caacatgatttgtcctcactcgcacgctttccgcgaaacttcaccgaaggtcgcccatcctaaaactactacaagtcaag 31817838  T
Q  300 tacgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
     ||| |||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31817839 cacgcttaact-atgaagttcttatgaaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccgaacaattcttataagccttccttca 31817937  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcg 455  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  31817938 accatgcagtcccatacatgcatgacctcataatccctcttattccgatgtgattcg 31817994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 198 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 1464401 - 1464136
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  |   || ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1464401 cacaaatcaacacgagt-ttttcagcgtgttgtgtcctaactcgcacgttttttggaaaacttctcagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagtta 1464303  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| | || ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||     
T  1464302 agcacgctaaattgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagttttctttc 1464203  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    ||| ||| | |||||||||  || || | || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1464202 aactatgtattctcatacctacacggtcgcatgatccctctcattctgatgtgattcggttcgtcta 1464136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 471
Target Start/End: Original strand, 29628617 - 29628825
Alignment:
Q  262 ccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgata 361  Q
    |||||| ||||||||||| || | | |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | ||||  |||||| ||||||    
T  29628617 ccggtaagtcacccatccaaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaca-aagacacatcttgttgata 29628715  T
Q  362 taggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcct 461  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  29628716 taggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattcggttcct 29628815  T
Q  462 ctagaagctg 471  Q
    ||||||||||    
T  29628816 ctagaagctg 29628825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 198 - 471
Target Start/End: Original strand, 8467698 - 8467957
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||   ||||||||||     ||||||||||||||||    
T  8467698 cacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgctttccgagaaacttcccataaggtcaccca-----aaattgctccaagtca 8467792  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| |||||||  |||||||        | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  8467793 agcacgcttaactgtggagttct--------gggctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttc 8467884  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  8467885 aaccatgtagtctcatacctgcacagtctcaggatccctttcattctgatgtggttcggttgc-ctagaagctg 8467957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13266350 - 13266085
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| | |  ||| |||||| ||   ||||||||||||| |||||| |    
T  13266350 gactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcaacatgttttctcctcactcgcacacttttcggaaaacttcccaaaaggtcacccatcctaaaatttc 13266251  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    || |||||||  ||| |||||||  | |||||| ||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||    
T  13266250 tcaaagtcaagcacgcttaactgtggggttcttgtgatttgggctaccgaaaataagatgcatcttattgatatagggagtactaaaaaattattataag 13266151  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13266150 ccttccttcaaccatgcattcccatacctgcacggctttaagatccctctcattctaatgtgattc 13266085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27026757 - 27026499
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |   || |||||| |  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27026757 cacaaacaaacacgagtcttttcagcgtgttttttcctcagtcacacgctttttggtaaacttcctagaaggtcacccttcccaaaattgcttcaagtca 27026658  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| ||||||    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||     
T  27026657 agcacgcttaactacgtagttcttatggaatgggctaccaaaaa-aagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagccttccttc 27026559  T
Q  398 aaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
    || | || |||| |||||| |||  | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27026558 aatcgtgtagtcccatacctgcaccgtc-caatatccctctcattctgatgtgattcggtt 27026499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 458
Target Start/End: Original strand, 27578795 - 27579054
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  27578795 acaaatcaacacaagtcttttcagcatgatttgtcctcactcgcacgctttctgggaaacttcccagaaggtcacgcatcccaaaatcgctccaagttaa 27578894  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||   ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||  | |    
T  27578895 gcacgcttaactgtgtagttcttatggatagggctactgaaaagaagatgtgtctaattgatatatgtagtaccaaacaattcttataagtcttcagtca 27578994  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
    |||| | ||| |||||||  || | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27578995 accaagtagtgtcatacctacacgactttaagatccctcttattccgatgtgattcggtt 27579054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21067985 - 21067760
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| || | | || ||||||||    
T  21067985 acaaaccaacacgaattttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccggtaaacttcccggtaggtcacccatccaaagactacttcaagtcaa 21067886  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||   |||||||||||||||  |||||   || || ||| ||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  21067885 gcacgcttaactgtgaagttcttatggaatggactacc---aaaaaaatgtatcttgttgatataggtagcaccaaacaattcttataagtcttccttca 21067789  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctc 427  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  21067788 accatgcagtcccatacctgcacggcctc 21067760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 267 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 4185901 - 4185696
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |   |||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |     
T  4185901 aggtcacctatcccaaaattgctccaagtcaagcatacttaactgtagagttcttgtagaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgt 4185802  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtg-attcggttcctctag 465  Q
     ||| | ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  4185801 ggtatcaaacaattcttatatgtattcctttaaccatgccgtctcatacctgcatggcctcatgaaccctctcattttgatgtgaattcggttcacctag 4185702  T
Q  466 aagctg 471  Q
    ||||||    
T  4185701 aagctg 4185696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 189 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 17628775 - 17628513
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |   ||||| ||| |  | |||||||||||| |||||||||    
T  17628775 gactgactccacataccaacacaagtctttccagtgtgttttgtcctcactcacacgctttatgggaatcttcctagaaggtcacccatctcaaaattgc 17628676  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    |||||||||   ||| | |||||  || |||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17628675 tccaagtcaggcacgctcaactgtggaattcttatgggttgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataag 17628576  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtga 451  Q
    ||| |||| ||||||| | || | || | ||||||||||  |||| |||| | ||||||||||    
T  17628575 cctaccttcaaccatgaaatcacttatctgcatggcctcgggatctctctcactctgatgtga 17628513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 412
Target Start/End: Original strand, 27578342 - 27578556
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| || | ||||| | ||||||||||||| || ||||||    
T  27578342 cacaaaccatcacgagtcttttctgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttgtcggaaaacttcccagaaggtcgctcatcccaaaattgttcgaagtca 27578441  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttt 397  Q
    |  ||| ||||||   ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||| || || ||     
T  27578442 agcacgcttaactatggagttcttatggtttgggataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagcaccaaataattcttataaaccatcattc 27578541  T
Q  398 aaccatgcagtctca 412  Q
    |||||  ||||||||    
T  27578542 aaccacacagtctca 27578556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 464
Target Start/End: Original strand, 53996090 - 53996266
Alignment:
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    |||||||||||  ||  |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  53996090 ctccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataa 53996189  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    || |||||| ||||||| |||| |||| |  ||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  53996190 gcattccttcaaccatgtagtcccatatctacatagcctcaggatccttctcattccgatgtgattcggttcctcta 53996266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40607186 - 40607074
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  40607186 cacaaatcaacacgagttttttcagcgtattttgtcctcactcgaacgcttaccgataaactttccggtaggtcacccatcccaaatttgctccaaatca 40607087  T
Q  298 aatacgtttaact 310  Q
    || ||||||||||    
T  40607086 aacacgtttaact 40607074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27029425 - 27029273
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||| ||||||| || | ||    
T  27029425 ttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaataattcttataagtcttccttcaatcgtg 27029326  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggtt 458  Q
     |||||||| || |||||| | | | |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27029325 tagtctcattcctgcatggtcccga-atccctctcattctgatgtaattcggtt 27029273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 450
Target Start/End: Original strand, 15306052 - 15306234
Alignment:
Q  274 ccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacct 373  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||     
T  15306052 ccatcccaagattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtacca 15306151  T
Q  374 aa------caattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtg 450  Q
    ||      ||| ||||||||| |||| ||  |||||| |||| ||||||  ||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15306152 aaattgctcaaatcttataagtcttctttcgaccatgtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattctgatgtg 15306234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 454
Target Start/End: Original strand, 14571713 - 14571862
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  ||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  14571713 ttaactgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaaccatg 14571812  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
     |||| ||||||  || || |||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  14571813 aagtcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattc 14571862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 454
Target Start/End: Original strand, 31817376 - 31817539
Alignment:
Q  291 caagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagcc 390  Q
    ||||||||| ||| |||| ||  ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |     
T  31817376 caagtcaaacacgcttaattgtagagttcttaaggaatgggctgcggaaaagaagatgcattttgttggtataggtagtaccaaacaattattataaacg 31817475  T
Q  391 ttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  31817476 ttccttcaaccatgaagtctcatacatgcacgacctcatgatccctcttatttcgatgtgattc 31817539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 341
Target Start/End: Original strand, 27578172 - 27578314
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27578172 acaacccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgttttcagggaaacttcccataaggtcactcatcccaaaactgctccaagtcaa 27578271  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaa 341  Q
      ||| |||||||   ||||||||| |  || |||||||||||    
T  27578272 gcacgcttaactgtgaagttcttatagtttgggctaccgaaaa 27578314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 278
Target Start/End: Original strand, 15268049 - 15268138
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatc 278  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  15268049 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaaatttcccggtagctcacccatc 15268138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17029570 - 17029329
Alignment:
Q  213 gtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactga 312  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| | || ||| | | ||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||  |||||||     
T  17029570 gtctttttagcatgttttgtcgtcatttgcccgctttctgggaaacttcccagaaggtcacccaacccaaaaatgctccaagttaagcactcttaactgt 17029471  T
Q  313 tgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctca 412  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||  || ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||| ||| |||| || ||| |||||||| ||    
T  17029470 ggagttcttatggaataaggtaccaaaagtaatatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattattacaagtcttcattcaactatgcagtccca 17029371  T
Q  413 tacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||  ||| | |||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  17029370 tacttgcacgacctctagatccctctcattccgatgtaattc 17029329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 413
Target Start/End: Original strand, 13613786 - 13613997
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | || |  | | ||||||  | | | ||||||||||| || | |  |||||||||||     
T  13613786 aaaccaacatgagtctttacagcgtgctttgtcctcactcgaaggcttttcagaaaacttctcagaacgtcacccatccaaagactagtccaagtcaaac 13613885  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    ||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||   |||||  ||    
T  13613886 acgcttaactgtggagttcttatagaatgaactaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtggtatcaaacaattcttataagtactccttctac 13613984  T
Q  401 catgcagtctcat 413  Q
    |||| ||||||||    
T  13613985 catggagtctcat 13613997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 325
Target Start/End: Original strand, 14571564 - 14571700
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||| ||   || ||||||||| | |||||||    
T  14571564 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcacacactttccgagaaacttcccaaaagatcacccatctcgaaattgc 14571663  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatgg 325  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||    
T  14571664 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 14571700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 17029055 - 17028856
Alignment:
Q  272 acccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagta 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||| |||| ||||||||||||| |||||   |||| |||| ||||||| |||||||||| || |    
T  17029055 acccatcccgaaattgctccaagtcaagcactcttaact-atgaagttcttatggaataagctaggtaaaataagacgcatcttgttgatataggtagca 17028957  T
Q  371 cctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagct 470  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||| ||| |||||||| |||||  ||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||   |||||||||    
T  17028956 cctaacaattcttacaaatcctccttcaactatgcagtcccatacatgcaaggcttcaggatccctctcattccgatgtgattcagtttgcctagaagct 17028857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7381521 - 7381449
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtc 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  7381521 acaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttctcggtaggtc 7381449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33765044 - 33764865
Alignment:
Q  269 gtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcag 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||| ||   |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  33765044 gtcacccatcccaaaattgatccaaatcaagcacgcttaagtgtgaagttcttataaaatgagctacaaaaaagaagatgcatcttgttggtataggtag 33764945  T
Q  369 tacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatg 448  Q
     ||| ||||||||||| ||| |||| |  ||||||| ||||| |||| |||| || | || ||||||||  |||||||||    
T  33764944 caccaaacaattcttaaaagtcttcatccaaccatgtagtcttatacacgcacggtcccaggatccctcacattctgatg 33764865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 393
Target Start/End: Original strand, 20306063 - 20306241
Alignment:
Q  214 tcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccg--gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactg 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||| |    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||| |    
T  20306063 tcttttcagagtgttttgtcctcacttgcacgtttttcgggaaacttcctatagtagggcacccatctaaaaattgctccaagtcaagcacgcttaaccg 20306162  T
Q  312 atgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttc 393  Q
       |||||||||| |||| | |||| ||||||   |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20306163 tgtagttcttatgaaatgggataccaaaaaga---tgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagccttc 20306241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 270 - 392
Target Start/End: Original strand, 23091468 - 23091590
Alignment:
Q  270 tcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagt 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | | |||||||  ||||| |||| |||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||| | |||    
T  23091468 tcacccatcccaaaattgctacaagtcaagcatgcttaactgtggagtttttatagaataagctaccagaaagaagatgcatcttgttaatatatgtagt 23091567  T
Q  370 acctaacaattcttataagcctt 392  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||    
T  23091568 accaaacaatttttatacgcctt 23091590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 438
Target Start/End: Original strand, 43928927 - 43929088
Alignment:
Q  276 atcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaa 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||  || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||    
T  43928927 atcccaaaattgctcaaagtcaagcacgtttaattgtggatttcttatgaaataa-ctaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaa 43929025  T
Q  376 caattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctct 438  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||   ||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||    
T  43929026 caattcttgtaagctttccttcgaccaaatagtctcatacctgcacggcttcaggaaccctct 43929088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35477924 - 35477855
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaac 258  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  35477924 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctctctcgcacgtttaccgagaaac 35477855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4186305 - 4186177
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcata 414  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || || |||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  4186305 agttcttatgcaatgggctaccaaaaagaagatgaatcttgttcatgtaggtagtaccaaatcattcttataagcattcctttaaacatttagtctcata 4186206  T
Q  415 cccgcatggcctcaagatccctcttattc 443  Q
    |  ||||||||| | || |||||| ||||    
T  4186205 cgtgcatggccttacgaaccctctcattc 4186177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41870165 - 41869957
Alignment:
Q  206 aacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| |  ||  ||||||| | | |||||  ||||||||||||||||| | |||||| | |      
T  41870165 aacacgagtcttttcagcgtgttctgtcatcccttacacgcttttcgaaaaacttttcagaaggtcttccatcccaaaattgctctatgtcaaacatgca 41870066  T
Q  306 taactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgc 405  Q
    ||| ||   ||||||||||   || | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  41870065 taattgtgaagttcttatgatttgggttactgaaaagaagatgcgtcttgttgatataggtagtatcatacaattcttataagtcttccttcaatcatgc 41869966  T
Q  406 agtctcata 414  Q
    |||| ||||    
T  41869965 agtcccata 41869957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 471
Target Start/End: Original strand, 53854861 - 53854965
Alignment:
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctaga 466  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||  ||  || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |    
T  53854861 agtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatatagtctcatacctacactgcttcatgatccctctcattccgatgtgattcggttcgtctata 53854960  T
Q  467 agctg 471  Q
    |||||    
T  53854961 agctg 53854965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 258
Target Start/End: Original strand, 4414273 - 4414332
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaac 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  4414273 acaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctgactcgcacgcttaccaggaaac 4414332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 356 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17506482 - 17506367
Alignment:
Q  356 ttgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgt-gattc 454  Q
    |||||||||| |||||   |||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||     
T  17506482 ttgatataggtagtactatacaattcttataagtcttcttttaatcatgcactctcatacatgcatgacctcatgatccctctcattctgatgtagattt 17506383  T
Q  455 ggttcctctagaagct 470  Q
     |||| ||||||||||    
T  17506382 agttcgtctagaagct 17506367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 325
Target Start/End: Original strand, 53854733 - 53854859
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||| | || |||||| |    
T  53854733 acaaatcaacacgagtcttttcaacgtattttgtcatcactcgcacgtttaccggtaaactttttggtaggtcacacatccaaaaactacttcaagtcta 53854832  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatgg 325  Q
    | | | ||||||   ||||||||||||    
T  53854833 acatgcttaactatggagttcttatgg 53854859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 337
Target Start/End: Original strand, 11828424 - 11828509
Alignment:
Q  252 gggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccg 337  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  11828424 gggaaattttccagaaggtcacccatcccaaaaatgctccaagtaaagcacgcttaactgtggagttcttatggaaggagctaccg 11828509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 416
Target Start/End: Original strand, 24271505 - 24271653
Alignment:
Q  267 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggc 366  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || ||||  | |||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| ||  ||||||     
T  24271505 aggtcacgcatcccaaaattgttctaactcaagcatgtttatttgcagagttcttatggaatgggctacccaaaa-aatatgcatcttgttcgtataggt 24271603  T
Q  367 agtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacc 416  Q
    |||| | || |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24271604 agtatcaaataattcttatatgtcttactttaaccatgtagtctcatacc 24271653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 42838874 - 42838661
Alignment:
Q  205 caacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgt 304  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||  ||||  || |  | | ||||||||||   | |||||| |||| |||  |||| || |||||||| |||     
T  42838874 caacacaaatcttttcagcgtgttttgtctacacttacatgtcttctgggaaactttttagaaggtcatccattccattattgttctaagtcaaacacgc 42838775  T
Q  305 ttaactgatga--gttcttatggaatgagctaccgaaaa--gaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||    
T  42838774 ttaactg-tgaaagttcttatggaatgaactatcgaaaaagaaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaacaatttttatacgtcttccttgaac 42838676  T
Q  401 catgcagtctcatac 415  Q
     ||| ||||||||||    
T  42838675 tatgtagtctcatac 42838661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 17506045 - 17505916
Alignment:
Q  339 aaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctct 438  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| | ||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||||  |||| ||||  |||    
T  17506045 aaagaagatacatcttatccgtatagactgtactaaacaatttttataagacttcatttaaccatacagtctcatacgtgcatgatctcatgatctatct 17505946  T
Q  439 tattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  17505945 tattttgatgtggtttggttcgtctagaag 17505916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 26200205 - 26200278
Alignment:
Q  225 tgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  || |||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26200205 tgttttgtcctcactcacacgcttttcgtgaaacttcgctgaaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 26200278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 279
Target Start/End: Original strand, 31817023 - 31817104
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcc 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| || | | |||||||||||    
T  31817023 cacaaaccagcacgagtcttttcaacatgttttgtcctcactcgtacgctttctgggaaacttcccagaatgtcacccatcc 31817104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 425
Target Start/End: Original strand, 23976244 - 23976331
Alignment:
Q  338 aaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcc 425  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||| | ||||||  |||||||    
T  23976244 aaaagaagatgcatcttgttagtataggtagtaccaaacaattcttataactcttccttcaatcatgcagacccatacctacatggcc 23976331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 244
Target Start/End: Original strand, 52048562 - 52048608
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 244  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52048562 cacaaaccaacatgaatcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcac 52048608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 244
Target Start/End: Original strand, 33294778 - 33294823
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33294778 acaacccaacacgagtcttttcagcgtgttttgttctcacttgcac 33294823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34554605 - 34554493
Alignment:
Q  277 tcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactgatga-gttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaa 375  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||  || |||||| |||  | ||    
T  34554605 tcccaaaatttctctaagtcaaacatgtttaact-atgaagttcttatggaatggtctaccaaaaataaaatgcatcttgctggtataggtagtgtcaaa 34554507  T
Q  376 caattcttataagc 389  Q
    ||||||||||||||    
T  34554506 caattcttataagc 34554493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Original strand, 53996016 - 53996053
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53996016 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 53996053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5810089 - 5810041
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgc 246  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5810089 cacaaatcaacatgagtcttttcagcgtgttttatcctcactcacacgc 5810041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10166025 - 10165937
Alignment:
Q  382 ttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagct 470  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| |||||| |||  |||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  10166025 ttataagccttcattcaacaatgcagtcccatacctgcaatgcctcatgatctttctcattccgatgtgattcggttcgtctaaaagct 10165937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 17629083 - 17628971
Alignment:
Q  338 aaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctc 437  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||  ||  || |||||| || || |||||| ||| | ||| | |||||| |    
T  17629083 aaaagaagaggcatcttattagtataggtagtaccaaacaattcttataagtttttattcaaccatacattcacatacctgcacgaccttaggatcccac 17628984  T
Q  438 ttattctgatgtg 450  Q
    | |||||||||||    
T  17628983 tcattctgatgtg 17628971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 44831135 - 44831035
Alignment:
Q  315 agttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcata 414  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||  | |||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||| | |||||||    
T  44831135 agttcatatgaaatgggctaccgaaaagaatatacatcttgttagtttaggtagtaccaaacaatttttataagcttcccttcaaccatgtaatctcata 44831036  T
Q  415 c 415  Q
    |    
T  44831035 c 44831035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 53392021 - 53391925
Alignment:
Q  319 cttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatac 415  Q
    |||||||  ||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  53392021 cttatggtctgaactaccgaaaaaaatatgtatcttgttgatatagatggtatcaaacaatttttataagcatttcttcaaccatgcagtctcatac 53391925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 237
Target Start/End: Original strand, 2499388 - 2499426
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctca 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2499388 acaaaccaacacgcgtcttttcaacgtgttttgtcctca 2499426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 471
Target Start/End: Original strand, 20309594 - 20309675
Alignment:
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| |||  | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  20309594 ccttccttcaaccatgtagtcacatacctgcaaagtctcatgatccctctcattccgatgtgattcggtttc-ctagaagctg 20309675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13265900 - 13265859
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt 230  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13265900 gactgaccgcacaaactaacacgagtcttttcagcgtgtttt 13265859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 45682318 - 45682213
Alignment:
Q  338 aaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctc 437  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||  | |||| || ||||||||||| ||||| || || |||| |||| ||||   |||||||||||||||| |||    
T  45682318 aaaagaaaatgcatcttgttggtatagataataccaaataattcttataaaccttcattcaatcatgtagtcccatatatgcatggcctcaagatctctc 45682219  T
Q  438 ttattc 443  Q
    | ||||    
T  45682218 tcattc 45682213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 330 - 378
Target Start/End: Original strand, 39902470 - 39902518
Alignment:
Q  330 agctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaa 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  39902470 agctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaa 39902518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 107345 - 107610
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  107345 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtacgtcacccatcccaaaattgc 107444  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||||    
T  107445 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatattggtagtatcaaacaattcttataag 107544  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  107545 ccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattc 107610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10563 - 10299
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10563 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaacttcccggtaggtcacccatcc-aaaattgc 10465  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  10464 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcttataag 10365  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  10364 ccttccttgaaccatgcagtcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 10299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 4814 - 4543
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4814 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaa-ttgctccaagttaa 4716  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  4715 gcacacttaactgtggagttcttataaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttctaaaccttccttca 4616  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4615 accatgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccctctccttccgatgtgattcggttcctctagaagctg 4543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 199 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 5274 - 5001
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5274 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaatttccaggtaggtcacccatcccaaa-ttgctccaagttaa 5176  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttat-----aagccttc 393  Q
      ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |     || |||||    
T  5175 gcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttctcttttaaaccttc 5076  T
Q  394 ctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5075 cttcaaccatgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaag 5001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 5377 - 5320
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtg-ttttgtcctcactcgcacgcgtaccggga 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5377 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacacttaccggga 5320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 189 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 155021 - 154739
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  155021 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactagcacacttaccgagaaacttcccggtaggtcacccattccaaaattgc 154922  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  154921 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtacccaacaattcttataag 154822  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  154821 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctg 154739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 154566 - 154511
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 244  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154566 gactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcac 154511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 2092 - 2357
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2092 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 2191  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataag 388  Q
    ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2192 tccaagtcaagcacgcttaactattgagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 2291  T
Q  389 ccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  2292 ccttccttcaaccatgtagtcccatacctgcacggccttaggatccttctcattccgatgtgattc 2357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 105972 - 105720
Alignment:
Q  201 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  105972 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaacttctcggtaggtcacacatcccaaaattgctccaagtcaagc 105873  T
Q  301 acgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaac 400  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  105872 acgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaac 105773  T
Q  401 catgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgatt 453  Q
    | ||||||  |||||| | | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  105772 cctgcagttccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgatt 105720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 189 - 454
Target Start/End: Original strand, 162559 - 162825
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtctttt-cagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattg 287  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||    
T  162559 gactgaccccacaaaccaacacgagtctttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgcgaaacttccaggtaggtcactcatcccaaagttg 162658  T
Q  288 ctccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataa 387  Q
    |||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  162659 ctccaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataa 162758  T
Q  388 gccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    | ||||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  162759 gtcttccttcaaccatgcagtcacatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtaattc 162825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 198 - 354
Target Start/End: Original strand, 163025 - 163181
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163025 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgaacgcttaccgagaaacttcccgataggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 163124  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 354  Q
    |  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  163125 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 163181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 163325 - 163170
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163325 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttctcggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 163226  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 354  Q
      ||| |||||||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163225 gcacgcttaactgtggaattcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatctt 163170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 456
Target Start/End: Original strand, 69707 - 69964
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| | ||   |||||| || | ||||||||||||| || | | |||| ||||||    
T  69707 acaaaccaacacgagtctttttagcgtggtttgtcatcactcacacgctttcccataaacttccctgaaggtcacccatccaaagactactcctagtcaa 69806  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
       ||  ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |    
T  69807 gcccgcataactgtggagttcttatggaatgagctaatgaaaaaaagatgcatcatgttgatataggtagtaccaaacaattattataagcattccttca 69906  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcgg 456  Q
    || ||||||||||||||| |||| | || | ||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  69907 acgatgcagtctcatacctgcatagtcttaggatccctctcattatgatgtgaatcgg 69964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 202 - 468
Target Start/End: Original strand, 17493 - 17759
Alignment:
Q  202 aaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaata 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||| || | | |||||||||||  |    
T  17493 aaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaactttcgagtaggtcacccatccaaagagtactccaagtcaagca 17592  T
Q  302 cgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaacc 401  Q
    || |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17593 cgcttaactgtggagttcttatgaattgagctaccaaaaagaagatacatcctgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaacc 17692  T
Q  402 atgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaag 468  Q
    ||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17693 atgtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtcattcggttcctcaagaag 17759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 199 - 471
Target Start/End: Original strand, 18027 - 18298
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||  |||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  18027 acaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttgtgtcctcactcgcacgtttaccgaaaaactttccaataggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 18126  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  18127 gcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctacc-aaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagtcttccttca 18225  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctctagaagctg 471  Q
    || ||| |||| ||||||  || ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18226 actatgtagtcacatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctg 18298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 365
Target Start/End: Original strand, 13415 - 13591
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13415 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacaaagaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 13514  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatatagg 365  Q
    || |||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13515 tcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagg 13591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 198 - 357
Target Start/End: Original strand, 14593 - 14752
Alignment:
Q  198 cacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14593 cacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtca 14692  T
Q  298 aatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttatt 357  Q
    |  ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14693 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatcttatt 14752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 245335 - 245085
Alignment:
Q  200 caaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  245335 caaaccaacacgagtcttttcaccgtgttttgtcctcactcacacgctttccgagaaacttcccagaaggtcacccatctcaaaattgctctaagtcaag 245236  T
Q  300 tacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaa 399  Q
     ||| ||   ||  ||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  245235 cacgctt---tgtggagttcttatggtttaggctaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctcccttcaa 245140  T
Q  400 ccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  245139 ccatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattc 245085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 245663 - 245514
Alignment:
Q  305 ttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatg 404  Q
    |||||||  ||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  245663 ttaactgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaaccatg 245564  T
Q  405 cagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
     |||| ||||||  || || |||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  245563 aagtcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattc 245514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 245812 - 245676
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||| ||   || ||||||||| | |||||||    
T  245812 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcacacactttccgagaaacttcccaaaagatcacccatctcgaaattgc 245713  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatgg 325  Q
    ||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||    
T  245712 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 245676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 574 - 421
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  574 gactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 475  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaag 342  Q
    |||| |||||  ||| ||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  474 tccatgtcaagcacgcttaactatggagattttatggaatgagctaccgaaaag 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 311
Target Start/End: Original strand, 1583 - 1705
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgc 288  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1583 gactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgc 1682  T
Q  289 tccaagtcaaatacgtttaactg 311  Q
    ||||||||||  ||| |||||||    
T  1683 tccaagtcaagcacgcttaactg 1705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2350 - 2154
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |         |||||||||||||||  || | | ||||| |||||    
T  2350 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttctcctcactcgcacgcttaccgag---------ggtaggtcacccatcataagactactccatgtcaa 2260  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      | | |||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2259 gcatgcttaactgtggagttcttaaggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgtttatatagggagtaccaaacaattcttataagccttccttca 2160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 739
Alignment:
Q  406 agtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  797 agtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctcta 739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23785 - 23660
Alignment:
Q  341 agaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctctta 440  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||| |    
T  23785 agaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaagaaccctctca 23686  T
Q  441 ttctgatgtgattcggttcctctaga 466  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||    
T  23685 tttcggtgtgattcggttcctctaga 23660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 326 - 454
Target Start/End: Original strand, 4001 - 4129
Alignment:
Q  326 aatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcc 425  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||    
T  4001 aatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaacaatgcagtcccatacctgcacggcc 4100  T
Q  426 tcaagatccctcttattctgatgtgattc 454  Q
    ||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  4101 tcgggatccctctcattctggtgtgattc 4129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 338 - 454
Target Start/End: Original strand, 142305 - 142421
Alignment:
Q  338 aaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctc 437  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  142305 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattccttcaaccatgaagtcccatacctgcacggcctcaggatccctc 142404  T
Q  438 ttattctgatgtgattc 454  Q
    | |||| ||||||||||    
T  142405 tcattccgatgtgattc 142421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14981 - 14785
Alignment:
Q  213 gtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacgtttaactga 312  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |  ||| |||||| ||    |||||||||||| || |   |||||||||||| | | |||||||     
T  14981 gtctttttagcgtgttttgtcatcactcgcacgtttttcggaaaacttcccatatggtcacccatccaaagaccactccaagtcaaacatgcttaactgt 14882  T
Q  313 tgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttcctttaaccatgcagtc 409  Q
      |||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||    
T  14881 gaagttcttattcaatgaattaccgaaaagacgatgcatcttattgatataggtattaccaaacaattcttataagcattccttcaacactgcagtc 14785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26322 - 26074
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || |  || |||||||||    || |||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  26322 acaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttatgttctccctcgcaagcttttcgagaaactttctataagctcactcatcctaaaaatactccaagtcaa 26223  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttccttta 398  Q
      ||  |||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| || ||||  |||||||| |  |  |    
T  26222 gcacacttaactg--gagttcttataaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcatgttgatatatgtagtaccaaaaaatttgtataagccattatgca 26125  T
Q  399 accatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgt 449  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  26124 accatgaagtctcacacctgcacggccttaggatccctctctttctgatgt 26074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 393
Target Start/End: Original strand, 44613 - 44807
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 298  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||| | |   || |||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44613 acaaaccaatacgggttctttcagcgtgctttgtcctcacttgcacacttttaggaaaacttcccagaaggtcacccatcccaaaattgatccaagtcaa 44712  T
Q  299 atacgtttaactgatgagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggcagtacctaacaattcttataagccttc 393  Q
      || |||||||   ||||||| ||||     ||||| |||||||||  ||||||| ||| ||  || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  44713 gcacatttaactttggagttctaatggtcctggctactgaaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagccttc 44807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7190 - 7070
Alignment:
Q  204 ccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcgtaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaaatacg 303  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| || || |  |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |    
T  7190 ccaacacgagtcttttcaccttgttt-gtccccactcacatgcttttcgggaaactttccaaaaggtcacccataccaaaattgctccaagtcaagcatg 7092  T
Q  304 tttaactgatgagttcttatgg 325  Q
     |||||||  ||||||||||||    
T  7091 cttaactgtggagttcttatgg 7070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 2539 - 2494
Alignment:
Q  419 catggcctcaagatccctcttattctgatgtgattcggttcctcta 464  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2539 catggcctcaggatccctctcattctgatgtgattcggttcctcta 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29 - 1
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 37205 - 37251
Alignment:
Q  199 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37205 acaaaccaacacgaatcttttcagcgtgtttttccctcactcgcacg 37251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 230
Target Start/End: Original strand, 62989 - 63030
Alignment:
Q  189 gactgacaacacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttt 230  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  62989 gactgaccccacaaaccaatacgagtcttttcagcgtgtttt 63030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1126 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1126
Description:

Target: scaffold1126; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 377 - 449
Target Start/End: Original strand, 986 - 1058
Alignment:
Q  377 aattcttataagccttcctttaaccatgcagtctcatacccgcatggcctcaagatccctcttattctgatgt 449  Q
    |||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||  | ||||||| |||||| ||||||||||    
T  986 aattattataagtcttctttcaaccatgcagtctcatatctgcactgtctcaagaaccctctcattctgatgt 1058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1125 times since January 2019
Visitors: 2389