View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0243-INSERTION-4 (Length: 456)

Name: NF0243-INSERTION-4
Description: NF0243
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0243-INSERTION-4
NF0243-INSERTION-4
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (8-456)||(12130643-12131091)
chr2 (10-452)||(88295-88737)
chr2 (10-456)||(34695909-34696353)
chr2 (10-456)||(34718321-34718765)
chr2 (19-393)||(18345555-18345916)
chr2 (126-453)||(44017326-44017653)
chr2 (286-456)||(1417986-1418156)
chr2 (50-323)||(26198467-26198742)
chr2 (257-343)||(9709912-9709998)
chr2 (338-456)||(22845600-22845718)
chr2 (351-456)||(9710032-9710137)
chr2 (340-410)||(11292113-11292181)
chr2 (324-430)||(13109900-13110006)
chr2 (352-451)||(14827158-14827257)
chr2 (371-456)||(26198779-26198864)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (10-456)||(16731669-16732115)
chr7 (10-456)||(17709803-17710249)
chr7 (12-456)||(9328607-9329050)
chr7 (14-456)||(22288981-22289423)
chr7 (10-447)||(1581351-1581789)
chr7 (43-456)||(29200960-29201367)
chr7 (166-456)||(16098382-16098672)
chr7 (10-386)||(17877153-17877520)
chr7 (126-456)||(30493615-30493944)
chr7 (19-149)||(11745953-11746083)
chr7 (166-379)||(30824557-30824769)
chr7 (201-299)||(34578440-34578538)
chr7 (25-117)||(16098234-16098326)
chr7 (362-456)||(3601740-3601834)
chr7 (296-341)||(3601683-3601728)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (10-456)||(2064589-2065035)
chr4 (8-456)||(49951047-49951495)
chr4 (10-456)||(55734745-55735191)
chr4 (10-456)||(18442152-18442595)
chr4 (10-456)||(28537792-28538236)
chr4 (10-442)||(21321263-21321697)
chr4 (19-456)||(29655671-29656107)
chr4 (10-414)||(56065365-56065769)
chr4 (10-456)||(32577053-32577497)
chr4 (10-456)||(51259534-51259981)
chr4 (56-456)||(37245857-37246261)
chr4 (10-456)||(51734977-51735423)
chr4 (146-456)||(41835316-41835626)
chr4 (10-456)||(49119405-49119838)
chr4 (10-456)||(28425931-28426365)
chr4 (47-456)||(43840311-43840721)
chr4 (299-456)||(26422607-26422764)
chr4 (301-456)||(47226335-47226490)
chr4 (307-442)||(44936101-44936236)
chr4 (371-442)||(24989952-24990023)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (11-456)||(20204692-20205137)
chr5 (10-443)||(22767275-22767708)
chr5 (9-456)||(15988754-15989201)
chr5 (10-452)||(8387822-8388264)
chr5 (10-456)||(4267847-4268281)
chr5 (43-456)||(41940742-41941155)
chr5 (158-456)||(25730692-25730990)
chr5 (134-456)||(26597462-26597784)
chr5 (10-452)||(27532915-27533358)
chr5 (10-326)||(30222934-30223250)
chr5 (178-440)||(11375534-11375796)
chr5 (168-456)||(12660210-12660498)
chr5 (19-456)||(27292191-27292616)
chr5 (219-456)||(34652259-34652495)
chr5 (10-189)||(34653864-34654042)
chr5 (10-213)||(16074473-16074675)
chr5 (177-379)||(37448028-37448230)
chr5 (305-454)||(32632546-32632695)
chr5 (10-137)||(12660080-12660207)
chr5 (371-443)||(30222856-30222928)
chr5 (10-89)||(25730577-25730656)
chr5 (124-156)||(37447993-37448025)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (33-456)||(14679918-14680344)
chr6 (20-456)||(28106885-28107321)
chr6 (10-456)||(15605999-15606452)
chr6 (19-190)||(19364217-19364387)
chr6 (19-456)||(29368061-29368478)
chr6 (206-443)||(15053193-15053430)
chr6 (10-213)||(30802218-30802421)
chr6 (22-225)||(11731885-11732089)
chr6 (267-456)||(19690884-19691073)
chr6 (257-456)||(30801996-30802195)
chr6 (257-456)||(11731674-11731870)
chr6 (384-456)||(34104470-34104542)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (19-441)||(4394904-4395325)
chr1 (10-456)||(44527001-44527435)
chr1 (8-456)||(51113049-51113497)
chr1 (70-456)||(48949729-48950115)
chr1 (19-456)||(5609084-5609521)
chr1 (42-456)||(25682419-25682833)
chr1 (10-456)||(36733429-36733878)
chr1 (25-308)||(24538260-24538544)
chr1 (186-449)||(48166149-48166412)
chr1 (144-456)||(52109324-52109635)
chr1 (152-456)||(16816802-16817108)
chr1 (287-456)||(44602765-44602934)
chr1 (357-456)||(2885306-2885405)
chr1 (373-456)||(24538586-24538669)
chr1 (124-172)||(17507308-17507356)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (10-456)||(53496780-53497214)
chr3 (10-454)||(42340284-42340727)
chr3 (69-456)||(55199306-55199693)
chr3 (70-455)||(46007097-46007480)
chr3 (124-329)||(2615343-2615548)
chr3 (166-410)||(48227305-48227550)
chr3 (187-329)||(647343-647485)
chr3 (10-213)||(1070748-1070952)
chr3 (318-442)||(647182-647306)
chr3 (287-456)||(11020185-11020354)
chr3 (194-326)||(27941129-27941261)
chr3 (365-456)||(27608908-27608999)
chr3 (43-111)||(27747790-27747858)
chr3 (365-440)||(24176861-24176936)
chr3 (365-456)||(34497377-34497468)
chr3 (10-149)||(36310808-36310947)
chr3 (364-454)||(31341732-31341826)
chr3 (382-442)||(2615591-2615651)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (10-431)||(478086-478507)
chr8 (48-456)||(23853718-23854114)
chr8 (10-456)||(40588735-40589166)
chr8 (58-442)||(8451142-8451526)
chr8 (10-442)||(7126959-7127391)
chr8 (164-456)||(13414913-13415205)
chr8 (230-456)||(185596-185820)
chr8 (222-456)||(37712027-37712255)
chr8 (356-456)||(33642769-33642869)
chr8 (364-456)||(598242-598334)
chr8 (289-349)||(9496797-9496857)
chr8 (374-456)||(11870364-11870446)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (104-414)||(16-326)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (290-456)||(269-434)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12131091 - 12130643
Alignment:
Q  8 gaaatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12131091 gaaatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgt 12130992  T
Q  108 gcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12130991 gcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcaatttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgt 12130892  T
Q  208 aaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12130891 aaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggcaaattattcgggctcaaacgaaatgacagcgagcaaatatgatagtgttggagg 12130792  T
Q  308 gggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctct 407  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12130791 gggaggcagtagccttacttgaggctcttcactttgctgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctct 12130692  T
Q  408 atcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12130691 atcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgctattatttctagt 12130643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 10 - 452
Target Start/End: Original strand, 88295 - 88737
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |    
T  88295 aatgacgctcatcatagatcaacgagcattgggaggacgacactagatgcatgacaacaatggcaagatgttcataaacatccctcactaccggttgtac 88394  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    |||||| |   || ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  88395 aacacgagcataatagagtgcaaggcaacaacacagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccgtaa 88494  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  | ||||||  ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  88495 ccatattacaacttttgcatgttgtgttagagactctcgcgggcaatttattcgggctcaaatgaaatggcaatgggcaaatatgacagttttggagggg 88594  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  88595 gaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgttgatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctat 88694  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttc 452  Q
    | |||   |  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  88695 cgtctcaagatcatggtgattcagaattctatgctattgtttc 88737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34696353 - 34695909
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||    
T  34696353 aatgacgttcatcatacttcaacaagcattggaaggacaacactagatgcatggcaacaatggcaagaggttcatacacaaccatcaccattgccggtgc 34696254  T
Q  110 aacacgggaca-aacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgta 208  Q
    | ||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||    
T  34696253 atcacga-acataatagaatgcaaggtaacaactcagtttgggagaaactgcgcgagtcgtggttgaagtacaacgtggatgccacattccatgaccata 34696155  T
Q  209 accatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggaggg 308  Q
    | ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||  || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  34696154 agcatattacatcttttgcgtgttgcgttagagactcccgtgggcaatttattcgggctcaatcga--tggcagcgggcaaatatgacagttttggaggg 34696057  T
Q  309 ggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctcta 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||  ||    
T  34696056 ggaggcagtagccttactcaaggccattcactttgctgatgtcaatagatgggaacgggttgtcttcgagtccgactccgctactctagtgcaagcgtta 34695957  T
Q  409 tcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  34695956 tcgtctccgggtcatggtgattcagaattttatgctattgtttctagt 34695909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34718765 - 34718321
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||    
T  34718765 aatgacgttcatcatacttcaacaagcattggaaggacaacactagatgcatggcaacaatggcaagaggttcatacacaaccatcaccattgccggtgc 34718666  T
Q  110 aacacgggaca-aacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgta 208  Q
    | ||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||    
T  34718665 atcacga-acataatagaatgcaaggtaacaactcagtttgggagaaactgcgcgagtcgtggttgaagtacaacgtggatgccacattccatgaccata 34718567  T
Q  209 accatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggaggg 308  Q
    | ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||  || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  34718566 agcatattacatcttttgcgtgttgcgttagagactcccgtgggcaatttattcgggctcaatcga--tggcagcgggcaaatatgacagttttggaggg 34718469  T
Q  309 ggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctcta 408  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||||  ||    
T  34718468 ggaggcagtagccttactcaaggccattcactttgctgatgtcaatagatgggaacgggttgtcttcgagtccgactccgctactctagtgcaagcgtta 34718369  T
Q  409 tcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  34718368 tcgtctccgggtcatggtgattcagaattttatgctattgtttctagt 34718321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18345916 - 18345555
Alignment:
Q  19 catcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggga 118  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     
T  18345916 catcacacttcaacgagcattgcgaggacaacactaaatgcatggcagtaatggcaagaggttcataaacatcattcaccaccggttgtgcaacacgggc 18345817  T
Q  119 caaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattct 218  Q
      || ||||||||||            ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||      
T  18345816 agaatagagtgcaag------------tttggaagaaaccgaacgagacatggttgaagtgcaatgtggacgcaacgttccatgagcgtaaccatattac 18345729  T
Q  219 atcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagta 318  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  |||||||||||||  ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18345728 ttcttttgcgtgttgtgttagagacttccgtgggtaatttatttgaactcaaacgaaatggtaacggacaaatatgacagt-tttgagggggaggcagta 18345630  T
Q  319 gccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctact 393  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| ||||  || ||||||| || ||||||||||||    
T  18345629 gccttactcgaggcccttcactttgctgatgctaacagatgggatcgaattgtcttcgaatccgactcatctact 18345555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 44017653 - 44017326
Alignment:
Q  126 agtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatctttt 225  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||||| | || || |||||  ||| | | ||||| ||  ||||||     
T  44017653 agtgcaaggtaacagctaagttttgaagaagccgagcgagacatggttgaagtgcaatgcgaattccgcgttctgtgatcatgaccatcttacatctttc 44017554  T
Q  226 gggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttac 325  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||||    
T  44017553 gcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttattcgggctcaaataaaatgacaccgtgcaaatatgacagttttggagggggagacaacaaccttac 44017454  T
Q  326 tcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatgg 425  Q
    |||| ||  ||||| ||| | |||  || | |||  | |  ||| ||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  44017453 tcgatgccattcacgttgctaatgtgaacatatgagaccaagttgtcttcgagtctgactccgttactttagtgcaagctctatcgtctccgaaacatgg 44017354  T
Q  426 tgattcagaattctatgccattatttct 453  Q
    | ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  44017353 tcattaagaattatatgccattgtttct 44017326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 1418156 - 1417986
Alignment:
Q  286 gcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgact 385  Q
    ||||||||||| ||  || |||| ||| ||||||||||||||||||   ||   |||| ||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  1418156 gcaaatatgacggttatgaagggagagacagtagccttactcgaggtaatttgatttgctgatgcaaacagatgggactgggttgtcttcgagtctgact 1418057  T
Q  386 catctactctagtccaagctctatcatcttcgggac-atggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1418056 catctactctagttcaagctctattgtc-tctggactatggtgattcagaattctatgctattgtttctagt 1417986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 323
Target Start/End: Original strand, 26198467 - 26198742
Alignment:
Q  50 cactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggaca-aacagagtgcaaggtaacaactcagttt 148  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |     ||||||| || |||||||||||  ||| || ||| ||||| |||||| || ||||     
T  26198467 cactagatgcatgacatcaatgacaagaggttcataatcc----tcaccactgggtgtgcaacacga-acagaatagaatgcaaagtaacagcttagttc 26198561  T
Q  149 gggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatg------accgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagaga 242  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||       ||| ||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  26198562 gggagaaattgcacgagacgtggttgaagtgtattgtggatgtcgcgttccattttcattaccataatcatattgcatcttttgtgtgctgtgttagaga 26198661  T
Q  243 ctcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagcctt 323  Q
    |||  | ||| || ||||||| |||||||  |||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26198662 ctcatgtgggcaatttattcgagctcaaataaaatggtagcgaacaaatatgacagttttggagggggatgcagtagcctt 26198742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 343
Target Start/End: Original strand, 9709912 - 9709998
Alignment:
Q  257 ttattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttg 343  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  9709912 ttattcaggctcaaacgaaatggcaacgaacaaatatgacagttttggagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttg 9709998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 456
Target Start/End: Original strand, 22845600 - 22845718
Alignment:
Q  338 actttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaatt 437  Q
    |||||| |||||| || |||||| | |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||    
T  22845600 actttgctgatgcgaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccaactaatctactctagtgcaagctctatcgtctccagatcatggtgattcagaatt 22845699  T
Q  438 ctatgccattatttctagt 456  Q
    ||| || ||| ||||||||    
T  22845700 ctaggctattgtttctagt 22845718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 456
Target Start/End: Original strand, 9710032 - 9710137
Alignment:
Q  351 aaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatt 450  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||    
T  9710032 aaatagatgggaccgggttgtcttcgagtctgactttgatactctagtgcaagctctatcgtcagcgggacatggtaattcataattctatgcaattgtt 9710131  T
Q  451 tctagt 456  Q
    ||||||    
T  9710132 tctagt 9710137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11292181 - 11292113
Alignment:
Q  340 tttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11292181 tttgttgatgcaaatagatggaac--ggttgtctttgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatc 11292113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13110006 - 13109900
Alignment:
Q  324 actcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacat 423  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||| |  |||||| |   |||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||    
T  13110006 actcgaggcccttcacttagctgatgcgatcagatgggacatggttgtcttcgagtccgactcttctactctagtggaagctctatcgtcttcgggccat 13109907  T
Q  424 ggtgatt 430  Q
    |||||||    
T  13109906 ggtgatt 13109900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 451
Target Start/End: Original strand, 14827158 - 14827257
Alignment:
Q  352 aatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattattt 451  Q
    ||||||||  |||| ||| |||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  14827158 aatagatgagatcgagttgtctttgaatctgacttagctactctagtgcaagctctatcgtgtttgggtcatggtgattcgaaattctatgctattattt 14827257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 456
Target Start/End: Original strand, 26198779 - 26198864
Alignment:
Q  371 tcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||   || |||||||| |   |||||||||| ||| ||||||||    
T  26198779 tcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagctctatcgtctctaggtcatggtgaattgaaattctatgctattgtttctagt 26198864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Original strand, 16731669 - 16732115
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  16731669 aatgacgctcatcgtacttcaacgagcattgggaggacaacactagaagcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaacactcaccaccagttgtgc 16731768  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    |||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  16731769 aacacatgcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccatgaccgcaa 16731868  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  16731869 ccatattacatcttttgcatgttgtgttagagattcccgcgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagagggcaaatatgacagtattggagggg 16731968  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16731969 gaggcagtagccttactcgaggccattcactctgctgatgcgaacagatggaaccgagttgtcttcgagtccgactcgtctactctagtgcaagctctat 16732068  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  16732069 catctccgggccatggtgattcagaattctctgctattgtttctagt 16732115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Original strand, 17709803 - 17710249
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17709803 aatgacgctcatcgtacttcaacgagcattgggaggacaacactagaagcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaacactcaccaccagttgtgc 17709902  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    |||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  17709903 aacacatgcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccatgaccgcaa 17710002  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  17710003 ccatattacatcttttgcatgttgtgttagagattcccgcgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagagggcaaatatgacagtattggagggg 17710102  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17710103 gaggcagtagccttactcgaggccattcactctgctgatgcgaacagatggaaccgagttgtcttcgagtccgactcgtctactctagtgcaagctctat 17710202  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  17710203 catctccgggccatggtgattcagaattctctgctattgtttctagt 17710249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 9329050 - 9328607
Alignment:
Q  12 tgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||  ||||||||| || ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  9329050 tgacgctcatcatacttcaaaaggcattggaaggacaacattagatgcatggcagcaatggcaagatgttcataaacatccatcactactggttgtgcca 9328951  T
Q  112 cacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaacc 211  Q
    |||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9328950 cacggctagaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaacc 9328851  T
Q  212 atattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggaggggga 311  Q
    || ||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  9328850 atcttacatcatttgcgtgttgtgttagagattcccg-ggacaatttattcgagctcaaacgaaatggcaacgggaaaatatgactgttttggaggggga 9328752  T
Q  312 ggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatca 411  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||     
T  9328751 ggcagtagccttactcgctgctattcactttgctgatgtaaacagatgggaccgggttgtcttggagtctgactctgatactctagtgcaagctctatcg 9328652  T
Q  412 tcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  9328651 tcagcgggacatggtaattcagaattctatgcgtttgtttctagt 9328607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 456
Target Start/End: Original strand, 22288981 - 22289423
Alignment:
Q  14 acgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaaca 113  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  22288981 acgctcatcacacttcaacaagcattgggaggacaacactagatgcatggcagcaatgacaggaggttcataaacaaccctcatcatcggttgtgcaaca 22289080  T
Q  114 cgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccat 213  Q
    ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||    
T  22289081 cgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaagccgcgtgagacgtggtttaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacat 22289180  T
Q  214 attctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggagg 313  Q
    |||  |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22289181 attacatctttcgcgtgttgtgttagagattcccgtgggcaattcattcggactcagacgaaatggcaacgagcaaatatgacagttttggagggggagg 22289280  T
Q  314 cagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatc 413  Q
      || ||||||||||| ||  |||||||||  | ||  || | |||| | |||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  22289281 tggttgccttactcgatgccattcactttgccgttgggaacaaatgggaccgggctgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtc 22289380  T
Q  414 ttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22289381 tccgggccatggtgattcagaattttatgctattgtttctagt 22289423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 447
Target Start/End: Original strand, 1581351 - 1581789
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |    
T  1581351 aatgacgctcatcatacttcaacgagcattgcgagaacgacactagatgcttggcaacaatggcaagaggttcataaacatccctcaccatcggttgtac 1581450  T
Q  110 aacacgggacaaac-agagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgta 208  Q
    ||||||  |||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  1581451 aacacga-acaaagtatagtgcaacgtaacaactcagtttgggagaaactgagcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccata 1581549  T
Q  209 accatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttgga-gg 307  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||| | ||| || || ||    
T  1581550 accatattacatcttttgcgtgttgtgctagagactccagcggatagtttatccgggctcaaacgaaatggcagagggcaaatattatagtttttgaggg 1581649  T
Q  308 gggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctct 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||  |||||||| | || |||||  |||||||||| ||| | ||| ||||    
T  1581650 gggatgcagtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaacagatgagatcgggttctattggagtccaactcatctacactaatgcaaactct 1581749  T
Q  408 atcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccatt 447  Q
    ||| ||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  1581750 atcgtctccggaccatggtgattcgaaattctatgccatt 1581789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29201367 - 29200960
Alignment:
Q  43 aggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaact 142  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||   ||| | |||||||||||| | ||    
T  29201367 aggacaacactagatgcatgacagcaatgacaagaggttcataaacagccctcaccatcggttgtgcaacacggacaaaatacagtgcaaggtaatagct 29201268  T
Q  143 cagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagaga 242  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||        ||||||| |||||||||  |||||| |||||||    
T  29201267 cagtttgggagaaaccgcacgagacgtggttgaagtgcaatgttgatgccgctttccat--------ccatattatatcttttgcatgttgtattagaga 29201176  T
Q  243 ctc--ccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcact 340  Q
    |||    | ||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| || |   ||||| || |   ||||||    
T  29201175 ctcatgtgtggccagtttattcgggctcaaacgaaatgacagcggacaaatatgacagttttggagggggaggtagcatgtttacttgatgtcattcact 29201076  T
Q  341 ttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattcta 440  Q
    ||| |||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  29201075 ttgctgatgtgaacagatggaaacgggttgtcttcgagtctgactcagctactctagtgcaagctctatcgtctctgggccatggtgattcagaattcta 29200976  T
Q  441 tgccattatttctagt 456  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  29200975 tgctattgtttctagt 29200960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 456
Target Start/End: Original strand, 16098382 - 16098672
Alignment:
Q  166 acgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcggg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||   || || |||||||||    
T  16098382 acgtggttgaagtgcaatgtggacgcatcgttccatgaccgtaaccatattacttcttttgcgtgttgtgttagagactcccataggcaatttattcggg 16098481  T
Q  266 ctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcg 365  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| || | |||| | ||    
T  16098482 ctcaaacgaaatggaaacgaacaaatatgacaattttggagggagaggtagtagccttactagaggcccttcaatttgctgatgctaacaaatgggaccg 16098581  T
Q  366 ggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  16098582 ggttgtcttcgagtccgactcatctactctagtacaagctccatcgtctccgggccatggtgattcagaattctatgatattgtttctagt 16098672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 386
Target Start/End: Original strand, 17877153 - 17877520
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||         |||||| || ||| || ||||| ||     
T  17877153 aatgacactcatcatacttcaacgagcattgggaggacagcactagatgcatggcaacaatggca---------taaacagccttcatcaacggttttga 17877243  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||    
T  17877244 aacacgggcataatcgagtgcaaggtaacaactcaatttgggagaaaccgagcgagacgtggttgaaatgcaatgtggatgtcgcgttccatgattgtaa 17877343  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  || | ||| |||| | |||| ||||||||  ||| |  | ||||| |||||||||||||  || || | |||||||||||| |||||||||    
T  17877344 ccatattacatttgttgcgtgtggcgttatagactcccatgggaagttcattcgtgctcaaacgaaatcgcagcggggaaatatgacagtattggagggg 17877443  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactc 386  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||    |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17877444 gaggaagtagccttactcaaggcccttcactttacaaatgcgaacagatggaatcgggttgtcttcgagtctgactc 17877520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30493944 - 30493615
Alignment:
Q  126 agtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatctttt 225  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||||  ||  || ||||    
T  30493944 agtgcaagataacaacacagtttggaagaaatcgaacgaaacgtggttaaagtgcaatatggatgtcgcattccatgactgtaaccaacttacatatttt 30493845  T
Q  226 gggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttac 325  Q
    | ||||||||||||| | || |  ||| || ||| || ||||||||||||||| || |   ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30493844 gcgtgttgtgttagaaattctcatgggcaatttactcaggctcaaacgaaatggcagcagacaagtatgacagttttgga-ggggaggcagtagccttac 30493746  T
Q  326 tcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatgg 425  Q
    | || |   ||||||| | ||||   || |||||  | | |||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30493745 ttgatgtcgttcacttagctgatatgaacagatgagaccaggttgtcttcgagtccgactcaattactctagtgcaagctctatcgtcttcgggccatgg 30493646  T
Q  426 tgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  30493645 tgattcagaattttatgctattgtttatagt 30493615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11746083 - 11745953
Alignment:
Q  19 catcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggga 118  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||  ||| | ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  11746083 catcatacttcaacaaccattgggaggacggcaccagatgcatgacaataatggcaacaggtgcataaacaaccctcaccaccggttgtgcaacac-aga 11745985  T
Q  119 ca-aacagagtgcaaggtaacaactcagtttg 149  Q
    || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11745984 cagaatagagtgcaaagtaacaactcagtttg 11745953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 30824769 - 30824557
Alignment:
Q  166 acgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcggg 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| |||  ||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  30824769 acgtgattgaagtgcaatgtggatgctacatttcatgactgtagtcatattacatcttttgcatgttgtgttagagactgccgcgaataatttattcggg 30824670  T
Q  266 ct-caaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatc 364  Q
    ||  |||  ||| |||| ||   |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| || |||||| |||    
T  30824669 ctaaaaaaaaaaagacagcggataaatatgacagttttgaa--gggaggcagtagccttactcgaggcccttcacttttctaatgcgaacagatgggatc 30824572  T
Q  365 gggttatcttcgagt 379  Q
     |||| |||||||||    
T  30824571 aggttgtcttcgagt 30824557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34578538 - 34578440
Alignment:
Q  201 tgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagt 299  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||| || | ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34578538 tgaccgttaacatattacatcttttgcgtgttgtgttcgaaattcccgtgggcaatttattcgggctcagacgaaatgacaacgagcaaatatgacagt 34578440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 117
Target Start/End: Original strand, 16098234 - 16098326
Alignment:
Q  25 acttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggg 117  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16098234 acttcaatgaacattgggaggactgcactagatgcatggcatcaatggcaagaggttcctaaacatcattcaccaccggttgtgcaacacggg 16098326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 456
Target Start/End: Original strand, 3601740 - 3601834
Alignment:
Q  362 atcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  3601740 atcgggttgttttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctttatcgtctctggaccatggtgattcagaattttatgctattgtttctagt 3601834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 341
Target Start/End: Original strand, 3601683 - 3601728
Alignment:
Q  296 cagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactt 341  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3601683 cagttttggagggggaggtggtagccttactcgaggcccttcactt 3601728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Original strand, 2064589 - 2065035
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  2064589 aatgacgctcatcatacttcaatgagcattgggaggacatctttagatgcatgacaacaatggcaagaggttcgtaaacaaccttcaccatcggttgtgc 2064688  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2064689 aacacggacaaaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaactgagcgagtcgtggttgaagtgcaatgtggacgccacgttccatgaccgtaa 2064788  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  2064789 ccatattacatcctctgcgtgttgtgttagagactcccgcggataatttattcgggctcaaacaaaatgacagcgggcaaatatgacagtattgaagggg 2064888  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  || ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2064889 gaggcagtagccttactcgacgcccttcactttgctgatgagaacagatggagtcgggttgtctttgagtcggactcatctactctagcccaagctctat 2064988  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||| | || |||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||    
T  2064989 cgtctccaggtcatggtgattcgaaattatatgctattgtttctagt 2065035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 456
Target Start/End: Original strand, 49951047 - 49951495
Alignment:
Q  8 gaaatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgt 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  49951047 gaaatgacgctcatcatacttcaacgagcattgaaaggacaacactagaagcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaacgctcaccaccagttgt 49951146  T
Q  108 gcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgt 207  Q
    ||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||     
T  49951147 gcaacacaggcataatagagtgcaaggtaacaactcagttttggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcattccatgaccgc 49951246  T
Q  208 aaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagg 307  Q
    |||||||||  ||||||||  || ||||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  49951247 aaccatattacatcttttgcatgctgtgttagagattctcgcggccaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatatgacagtattggagg 49951346  T
Q  308 gggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctct 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |    
T  49951347 gggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaacagatggaaccgagttgtcttcgagtccgactcgtctactctagtgcaagcttt 49951446  T
Q  408 atcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  49951447 atcatcttcgggccgtggtgattcagaattctctgctattgtttctagt 49951495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Original strand, 55734745 - 55735191
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  55734745 aatgacgctcatcatacttcaatgagcattgggaggacaacactagatgtatggcaacaatggcaagatgttcataaacaaccatcatcatcggttgtgc 55734844  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    || || |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |  ||    
T  55734845 aatacagacaaaatagagtgcaaggtaacaactcggtttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgcgctccatgatctcaa 55734944  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  | | || || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  55734945 ccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactcccatgagcaatttgttcgggctcaaacgaaatggaagcgagcaaatatgacagtattggagggg 55735044  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  55735045 gaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgttgttgcgaacacatggaaccgggttattttcgagtccgattcatctactctagtgcaagctctat 55735144  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  55735145 cgtcttcggaccatggtgattcagaattctatgctattgtttctagt 55735191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18442595 - 18442152
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18442595 aatgacgctcatcatactttaatgagcattgggaggacaacactatatgcatggcaacaatggcaagatgttcataaacaacc-tcatcaccggttgtgc 18442497  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    || || |   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||    
T  18442496 aatacagacaaaatagagtgcaaggtaacaactctgtttgggagaaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgcggatgtcgcgttccatgaccgcaa 18442397  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||| |||||||||    
T  18442396 ccatattacaacttttgcgtgttgtgttagagactcccatgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggaagcgggaaaatatgacagtattggagggg 18442297  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| || |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||    
T  18442296 gaggcagtagccttactcgaggccctacactttgctgttgcgaacagatggaaccgggttattttcgagtgcgactcatcta--ctagtgcaagctatat 18442199  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18442198 cgtctttggcccatggtgattcagaattctatgctattgtttctagt 18442152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28538236 - 28537792
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| |    
T  28538236 aatgacgctcatcatacttcaacgagcatgggaaggacaacactagatgcatgtcaacaatggcaagaggttcataaacaccactcaccaccgattgtac 28538137  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  28538136 aacacgggcacagtagagtgcaaggtaacaattcagtttgggagaaaccgaacgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgatcgtaa 28538037  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| || || | |||||||| |  ||| ||||||    
T  28538036 ccatattacatattttgcgtgttgtgttagagactcccacgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggaaaatatgata--gtttgagggg 28537939  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||||| | ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28537938 gaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgttgatgcgaacagatgggaccgggttgtgttcaagtccgactcatctactttagtgcaagctctat 28537839  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | |||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  28537838 cgtctctgggccatggtgattcaaaattctatgctattgtttctagt 28537792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 442
Target Start/End: Original strand, 21321263 - 21321697
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |    
T  21321263 aatgacactcatcatacatcaacgagcattgggaggacagcactagatgcttggcagcaatggcaagatgttcataaacatccctcactaccggttgtac 21321362  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    |||||| |   || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  21321363 aacacgagcataatagagtgcaaggcaacaacacagtttgggagaaatcgagcgaaacgtggttgaagtgcaatgtggatgttgcgttccatgaccgtaa 21321462  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  | ||||||  |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21321463 ccatattacaacttttgcatgttgtattagagactctcgcgggaaatttattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgacagttttggagggg 21321562  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaa--gctct 407  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||||| || |||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||    
T  21321563 gagacaatagccttactcgaggcccttcacttttctgatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaattgctct 21321662  T
Q  408 atcatcttcgggacatggtgattcagaattctatg 442  Q
    ||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21321663 attgtctcagggtcatggtgattcagaattctatg 21321697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29656107 - 29655671
Alignment:
Q  19 catcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggga 118  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||     
T  29656107 catcatacttcaaaaagcattggaaggacaacactagatgcatggcagcaatggaaagaggttcataaacattcatcaccaccgggtgtgcaacatgggc 29656008  T
Q  119 caaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattct 218  Q
      || ||| |||||||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||      
T  29656007 ataatagaatgcaaggtaatatctcagtttggaagaaaccgagtgagacatggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgatcgtaaccctcttac 29655908  T
Q  219 atcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagta 318  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  29655907 atcttttgt-tgttgtgttagaggctcccgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggcaaatatgactgttttggagggagaggcagta 29655809  T
Q  319 gccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgg 418  Q
    ||||||||||| |   ||||||||| |||||  || |||||||| || ||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29655808 gccttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatggaaccgtgttgtcttcgagtctgactacgctactctagtgcaagctctatcatcttcgg 29655709  T
Q  419 gacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  29655708 gccatggtgattcagaattctatgttattgtttctagt 29655671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Original strand, 56065365 - 56065769
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  || || ||||||    
T  56065365 aatgacgctcatcacacttcaacaagcattgggaggacaacactagatgcatggcagcaatggcaggaggttcataaacaaccctcgtcatcgattgtgc 56065464  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |    
T  56065465 aacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaactgtgtgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgtttcatgaccgtca 56065564  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
     ||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  56065565 acatattacatctttcgcgtgttgttttagagactcccgtgggcaattcattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagttttggagggg 56065664  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| || ||  |||| |||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  56065665 gaggcagttgccttactcgatgccattcactttgctgttgggaatatatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctat 56065764  T
Q  410 catct 414  Q
    |||||    
T  56065765 catct 56065769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 32577497 - 32577053
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    ||||||||  ||||||||||||   ||||||  ||||||||| || ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||    
T  32577497 aatgacgcttatcatacttcaaaaggcattggaaggacaacattagatgcatggcggcaatggcaagaggttcataaacatccgtcactaccgtttgtgc 32577398  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    |||||||    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  32577397 aacacggccagaatatagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgag-gagacatggttgaagtgcaatgtggatgctgcgttccatgaccttaa 32577299  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  32577298 ccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagattcccg-gggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgactgttttggagggg 32577200  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||| | ||||||||||||  ||| || |||||| ||||| ||| | |||| |  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  32577199 gaggtactagccttactcgctgctatttactttgctgatgtaaacatatgggactgggttgtcttcgagtctgactctgctactctagtgcaagctcaat 32577100  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  32577099 cgtcagcgggacatggtgattcagaattctatgcgattgtttatagt 32577053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 51259981 - 51259534
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||| ||    
T  51259981 aatgacgctcatcacacttcaacaagcattgggaggacaacactagatgcatggcagcaatggcaggaggttcataaacaaccctcatcatcgattgcgc 51259882  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  51259881 aacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaaccgcgtgagacgtggttgaactgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtca 51259782  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttgga-ggg 308  Q
     ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  51259781 acatattacatctttcgtatgttgtgttagagactctcgtgggcaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgagcaaatatgacagttttggagggg 51259682  T
Q  309 ggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctcta 408  Q
    ||||||||| ||||||||||| |   ||||||||| || ||  |  || | | | | |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||    
T  51259681 ggaggcagttgccttactcgatgtcattcactttgctgttgggatcagttcggaccaggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgcta 51259582  T
Q  409 tcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  51259581 tcgtcttcgggccatggtgattcagaattttatgttattgtttctagt 51259534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 56 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 37246261 - 37245857
Alignment:
Q  56 atgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggta----acaactcagtttggg 151  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |     || || ||||||||||    |||||| ||||||||    
T  37246261 atgcatggcagcaatggcatgaggttcataaacatccctcactaccggttgtgcaacatgaccggaatagggtgcaaggtacgtaacaacttagtttggg 37246162  T
Q  152 agaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgg 251  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||  ||| | ||  |||||||||||||||||||| ||    
T  37246161 agaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaatcgtcttacatcctctgcatgttgtgttagagactcccgagg 37246062  T
Q  252 gtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgca 351  Q
    | || |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||      
T  37246061 gaaatttattcgggcacaaacgaaatggaaacgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgatgctattcactttgcttatgtg 37245962  T
Q  352 aatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattattt 451  Q
    || |||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37245961 aacagatgggaccgggttgtcttcgagtctgactctgctactttagtgcaagctctttcgtctctgggccatggtgattcagaattctatgctattgttt 37245862  T
Q  452 ctagt 456  Q
    |||||    
T  37245861 ctagt 37245857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 51735423 - 51734977
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcacc-accggttgtg 108  Q
    ||||| || |||||||||||||  |||||||  |||| ||||||| |||  |  || ||||||||||||||||||||||| || || || | || |||||    
T  51735423 aatgatgctcatcatacttcaacaagcattggaaggataacactagatgtctagcagcaatggcaagaggttcataaacatccctcccccatcgattgtg 51735324  T
Q  109 caacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgta 208  Q
    |||||  ||   || || |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||    
T  51735323 caacataggcagaatagggtgcaatgtaacatctcagtttgggcgaaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaacgtggatgccgcgttccatgattgta 51735224  T
Q  209 accatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggaggg 308  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||  |  || ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  51735223 accatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagacttccgttgacaatttattcgggcttaaacgaaatgacagcgtgcaaatatgacagttttggaggg 51735124  T
Q  309 ggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctcta 408  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||  ||||||| | | || ||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  51735123 ggaggcagtagccttactcgatgccattcactttgctgatgtgaatagatagga-cgagttgtcttcgagtcaggctcctctactctagtgcaagctcta 51735025  T
Q  409 tcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    || |||  ||  |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  51735024 tcgtctctggaccatggtgattcataattctatgatattgtttctagt 51734977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 41835626 - 41835316
Alignment:
Q  146 tttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactc 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  41835626 tttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccacgttccttgaacgtaaccatattacaacttttgcgtgttgtgttagagactc 41835527  T
Q  246 ccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgtt 345  Q
     ||| |  || |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||      
T  41835526 tcgcagacaatttattcgggctcaaacaaaatgacagctggcaaatatgacagttttggagggggatgcagtagccttactcgagacccttcattttgcg 41835427  T
Q  346 gatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgcca 445  Q
    |||||||| |||||| | |||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |    
T  41835426 gatgcaaacagatgggaccgggttgtcttcgagttcgattcatctactctagtgcaaacgctatcgtctccgggccatggtgattcggaatcctatgcta 41835327  T
Q  446 ttatttctagt 456  Q
    || ||||||||    
T  41835326 ttgtttctagt 41835316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49119838 - 49119405
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||  |||||||||||||    |||||  |||||| || || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  49119838 aatgacgttcatcatacttcaaaagtcattggaaggacagcattagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcactattggttgtgc 49119739  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
     ||||||    || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49119738 cacacggccagaatagagtgtaaggtaacaacccagtttgggataaaccaagcgagacatggctgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaa 49119639  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||| ||  |||||||| ||||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  49119638 ccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagattcc-------------ttcgggctcaaacgaaatggcaacaggcaaatatgactgttttggagggg 49119552  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||||||    
T  49119551 gaggcagtagccttactcgctgctattcactttgctgatgtaaacagatgggaccgggttgtcttcaagtctgactctgatactctagtgccagctctat 49119452  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||  ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  49119451 cgtcagcgggacatggtaatttagaattatatgcgattgtttctagt 49119405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Original strand, 28425931 - 28426365
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||  |||||||||||||    |||||  |||||| || || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  28425931 aatgacgttcatcatacttcaaaagtcattggaaggacagcattagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcactattggttgtgc 28426030  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactc-agtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgta 208  Q
     ||||||    || |||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28426031 cacacggccagaatagagtgtaaggtaacaaccccagtttgggataaaccaagcgagacatggctgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgta 28426130  T
Q  209 accatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggaggg 308  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||    
T  28426131 accatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagattcc-------------ttcgggctcaaacgaaatggcaacaggcaaatatgactgttttggaggg 28426217  T
Q  309 ggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctcta 408  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||    
T  28426218 ggaggcagtagccttactcgctgctattcactttgctgatgtaaacagatgggaccgggttgtcttcaagtctgactctgatactctagtgccagctcta 28426317  T
Q  409 tcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    || ||  ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28426318 tcgtcagcgggacatggtaatttagaattatatgcgattgtttctagt 28426365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 43840721 - 43840311
Alignment:
Q  47 caacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||| || ||||||||  |   || ||||||||||  ||||||| |||    
T  43840721 caacactagatgcatgacaacaatgacaagagattcataaaaagccctcaccaccgattatgcaacactagcataatagagtgcaagacaacaacttagt 43840622  T
Q  147 ttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcc 246  Q
    |||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  43840621 ttgggagagaccgcacgagacgtggttgaagttcaacgtggatgccgcgttctatgagcataaccatcttacatcttttgcgttttgtgttagagactcc 43840522  T
Q  247 cgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagcc-ttactcgaggctcttcactttgtt 345  Q
    || ||  || ||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| ||  ||||||||| |    
T  43840521 cgtggacaatttattcggggtcaaacgaaatggcagcggacaaatatgacagtgttggagggggagacaacaacctttactcgatgccattcactttgct 43840422  T
Q  346 gatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgcca 445  Q
    ||||  || | |||  | ||| || |||||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  43840421 gatgtgaacaaatgagaccggtttgtcttcgagttcgactcagctactctaatgcaagctctatcgtcttcggaccatggtgattcggaattctatgcta 43840322  T
Q  446 ttatttctagt 456  Q
    || ||||||||    
T  43840321 ttgtttctagt 43840311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 299 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26422764 - 26422607
Alignment:
Q  299 tgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagt 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  26422764 tgttggagagggaggcagtagccttactcgatgctatttactttgctgatgtaaacagatgggatcgggttgtcttcgagtctgactctgatactctagt 26422665  T
Q  399 ccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
     ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  26422664 gcaagctctatcgtcagcgggacatagtgattcagaattctatgcgattgtttttagt 26422607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 47226490 - 47226335
Alignment:
Q  301 ttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtcc 400  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||  |||| ||| | |||||||| |||||||||||| |||  |    
T  47226490 ttggagggggaggtaatagtcttactcgaggcttttcactttgctgatgcgaacagatgagatcgagttgtgttcgagtccgactcatctactttagagc 47226391  T
Q  401 aagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  47226390 aagctctatcgtcttcaggccatggtgattcagatttatatgctattgtttctagt 47226335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 307 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 44936236 - 44936101
Alignment:
Q  307 ggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctc 406  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||| | ||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||    
T  44936236 ggggaggcaatagccttactcgagatcctttactttgctaatgcaaacagatgaaattgggttgtgttcgagtccgactcatttactctagtgcaaactc 44936137  T
Q  407 tatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatg 442  Q
    |||| | |||||| || ||||||| |||||||||||    
T  44936136 tatcgttttcgggccacggtgatttagaattctatg 44936101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24990023 - 24989952
Alignment:
Q  371 tcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatg 442  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||  ||| || ||||||||| |||||||||    
T  24990023 tctttgagtctgactcagctactctagtgcaagctctaccgtctctgggccacggtgattcaaaattctatg 24989952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 456
Target Start/End: Original strand, 20204692 - 20205137
Alignment:
Q  11 atgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgca 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  20204692 atgacgctcatcatacttcaacgagcattgggaggacagcactagatgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaaccctcacccttggttgtgca 20204791  T
Q  111 acacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaac 210  Q
    ||||  |  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20204792 acacaagcaaaatagagtgtaaggtaataactcagtttgggagaaaccaaatgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccataac 20204891  T
Q  211 catattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggaggggg 310  Q
    ||||||  |||||||   | ||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20204892 catattacatcttttacattttgtgctagagactcccgcgggaaatttatccaggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgacagtattggaggggg 20204991  T
Q  311 aggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20204992 aggcagtagccttactcgaggccattcactttgttgttgcgaacagatggaaccgagttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatc 20205091  T
Q  411 atcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
     ||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  20205092 ctctccgggtcatggtgattcaaaattctatgctattgtttctagt 20205137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22767708 - 22767275
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||  | ||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  22767708 aatgacgctcatcatacttcaaaaggcattggaatgacaacattagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcactactggttgtgc 22767609  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
     ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22767608 cacacggccaaaatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgacagtaa 22767509  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
     ||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22767508 tcatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagattcccgggggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgactgttttggagggg 22767409  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  22767408 gaggcagtagccttactcgctgctattcactttgctgatgtaaacagatgggaccgggttgtcttcgagtttgactctgatactctagtgcaagctctat 22767309  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgc 443  Q
    | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22767308 cgtcagcgggacatggtaattcagaattctatgc 22767275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15989201 - 15988754
Alignment:
Q  9 aaatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtg 108  Q
    ||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15989201 aaatgacactcatcatacatcaacgagcattgggaggacggcattagatgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacaaccttcactagcggttgtg 15989102  T
Q  109 caacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgta 208  Q
    ||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |    
T  15989101 caacacgagcataatagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacgttgttgaagtgaaatatggatgtcgcgttccatgaccgca 15989002  T
Q  209 accatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggaggg 308  Q
    ||||||||  | |||||| ||||| ||| |||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||    
T  15989001 accatattacaacttttgcgtgttatgtcagagactttcgcgagcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcggacaaatatgacagttttggaggg 15988902  T
Q  309 ggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctcta 408  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||| || | |||| | |||||| ||||| |||| | |||| |||||||||| ||| |||||    
T  15988901 ggaggcagtaaccttactcgaggccctttactttgctgatgcgaacatatgggaccgggttgtcttcaagtccgtctcagctactctagtgcaatctcta 15988802  T
Q  409 tcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  15988801 tcgtcttcaggccatggtgattcggaattctatgttattgtttctagt 15988754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 452
Target Start/End: Original strand, 8387822 - 8388264
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| || || |||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  8387822 aatgacgctcaccacacttcaacaagcattgggaggaaaacactagatgcatggcagcaatgacaggaggttcataaacaaccctcatcatcgattgtgc 8387921  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  8387922 aacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtctgggagaaaccgcgtgagacgtggttgaagtacaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtta 8388021  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
      |||||  |||||| | |||||||||||||||||| || ||| || | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8388022 aaatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactctcgtgggcaattcattcaggctcaaacgaaatggcaacgaacaaatatgacagttttggagggg 8388121  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||  | ||  || |||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  8388122 gaggcagttgccttactcgatgccattcactttgcggttgggaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctat 8388221  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttc 452  Q
    | ||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  8388222 cgtctccaggccatggtgattcagaattttatgctattgtttc 8388264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Original strand, 4267847 - 4268281
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||    
T  4267847 aatgatgctcatcacacttcaacgaacattgggaggacagcactagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaaaatcgttcaccatcggttgtgc 4267946  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   || ||||||||||            ||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||| ||||| ||| |||| | |||  ||||    
T  4267947 aacacgggcagaatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaacgagtcatggttaaagtgcaacgtggacgccgcgtttcttgattgtaa 4268034  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||| ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  4268035 ccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgtgggcaatttattcaggctcaaacaaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggagggg 4268134  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4268135 gaggcagtagccttactagaggcccttcactttgctgatgctaacaggtgggaccgggttttcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctat 4268234  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  4268235 catctccgggccatggtgattcggaattctatgctattgtttctagt 4268281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 43 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 41941155 - 41940742
Alignment:
Q  43 aggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaact 142  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||     
T  41941155 aggacaacactagatacatgacaataatggcaagaggttcataaacaaccctcgccaccggttgtgcaacacgggcagaatagagtgcaaggtatcaacc 41941056  T
Q  143 cagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagaga 242  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  41941055 caatttgggagaaaccgagcgagatgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaactatcttacatcttttgtgtgtagtgttaaaga 41940956  T
Q  243 ctcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgag-caaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactt 341  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||   ||  |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | |   |||||||    
T  41940955 ctcccgtgggaaatttattcgagctcaaacgaaatgacatatagaaaaatatgacagttttggagggggagacaatagccttactcaatgtcattcactt 41940856  T
Q  342 tgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctat 441  Q
    || | |||  || |  ||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| |||  ||  ||| |||||||||||||||||    
T  41940855 tgctcatgtgaacaactgg-accgggttgtcttcgagtccgactcaactactctagtgcaaactctatcgtctctggaccattgtgattcagaattctat 41940757  T
Q  442 gccattatttctagt 456  Q
    || ||| ||||||||    
T  41940756 gctattgtttctagt 41940742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 158 - 456
Target Start/End: Original strand, 25730692 - 25730990
Alignment:
Q  158 cgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |  |||   |||||||||||||| ||| |||||| || |    
T  25730692 cgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggattccgcgttccatgaccgtaaccatattacaattttcacgtgttgtgttagagtctcacgcgggaaatt 25730791  T
Q  258 tattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaataga 357  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||    
T  25730792 tattcgagctcaaacgaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaacaga 25730891  T
Q  358 tggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||| |  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  25730892 tgggactgagttgtcttcgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatcgtctcagggtcatggtgattaagaattctatgttattgtttctagt 25730990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26597784 - 26597462
Alignment:
Q  134 gtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttg 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | | ||||||  |||||| | ||||||    
T  26597784 gtaacaacacagtttgggagaaatcgtgtaagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgatcatcaacatattacatctttcgcgtgttg 26597685  T
Q  234 tgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggct 333  Q
    ||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  26597684 tgttagagactcccgtggacaattcattcgggctcaaacgaaatggcaacgagcaaatatgacaattttggagggggaggcagttgccttactcgatgcc 26597585  T
Q  334 cttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcag 433  Q
     |||||||||  | ||  ||||||||  | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |    
T  26597584 attcactttgcagttgggaatagatgagaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcgg 26597485  T
Q  434 aattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||| ||||  ||| ||||||||    
T  26597484 aattttatgttattgtttctagt 26597462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 27533358 - 27532915
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27533358 aatgacgttcatcatacttcaacaagcattggaaagacaacactagatgcatggcaacaatgacaagaggttcataaacatccctcaccaccggttgtgc 27533259  T
Q  110 aacacgggaca-aacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgta 208  Q
    ||||| | ||| || | |||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  27533258 aacacag-acagaatatagtgcaaggtaatagtttagtttgggagaaatcgcgcgagacgcgactgaagtgtaatgtggatgtcgcgttccatgatcgta 27533160  T
Q  209 accatattctatcttttgg-gtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagg 307  Q
    ||||  ||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  | |  | |||||| ||||| |||||||    
T  27533159 accagtttacatctttttgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttattcgggctcaaacgaaatggtagcaggaaaatataacagttttggagg 27533060  T
Q  308 gggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctct 407  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |   ||||||||| |||||  ||||||||| | |||||| | |||||||| ||||   || || |||| ||  || |    
T  27533059 gggaggcaatagctttattcgatgtcattcactttgctgatgtgaatagatgggaccgggttgttttcgagtccgactttgcttctttagtgcagacttt 27532960  T
Q  408 atcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttc 452  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  27532959 atcgtctccgggtcatggtgattcagaattctttgctattgtttc 27532915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30223250 - 30222934
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||||||||||||  |  ||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  30223250 aatgacgctcatcatacttcaacaattattggaagaacaacactagatgcatgacaacaatgacaagaggttcataaacagccctcaccaacagttgtgc 30223151  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||  |||| | | ||||||||||| ||||    
T  30223150 aacacgggcagaatagagtgcaaggtaacaactctgtttgggagaaaccgtgcgagacgtggtcaaagtgcaacatggacgtcgcgttccatgactgtaa 30223051  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||| |  || | ||| ||| ||||||| |||||| ||    
T  30223050 ccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagacttccatgggcaatttattcgggctcaaacgaatttgcagcaagcgaatttgacagttttggagagg 30222951  T
Q  310 gaggcagtagccttact 326  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  30222950 gagacagtagctttact 30222934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 178 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11375796 - 11375534
Alignment:
Q  178 tgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaat 277  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  11375796 tgcaatgtggatgctgcgttccatgaacgtaaccatattacaacttttgcatgttgtgttagagactctcgcaggtgatttattcggactcaaacgaaat 11375697  T
Q  278 gacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcga 377  Q
    | || |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||| | |||||| |||| ||    
T  11375696 ggcagcgagtaaatatgacagttttggagggggagacagtagccttactcgaggcccttcattttgcggatgcaaatatatgggaccgggttgtctttga 11375597  T
Q  378 gtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattcta 440  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||    
T  11375596 gtctgattcatctattctagtgcaagctctatcgtctccggtccatggtgattcggaattcta 11375534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 168 - 456
Target Start/End: Original strand, 12660210 - 12660498
Alignment:
Q  168 gtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggct 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||  |  ||  || |||||||||||    
T  12660210 gtggttgaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagactttcatggacaatttattcgggct 12660309  T
Q  268 caaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcggg 367  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |   ||||||||| | |||  || | |||  | || |    
T  12660310 caaacgaaatggcagcgggcaaatatgacagtgttagagcgggaggcagtagtcttactcgatgtcattcactttgctaatgtgaacaaatgagaccgtg 12660409  T
Q  368 ttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  12660410 ttatcgtcgagtctgactcagctactctagtgcaagctctatcgtcttcgggccacggtgattcagaattctatgatattgtttctagt 12660498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 456
Target Start/End: Original strand, 27292191 - 27292616
Alignment:
Q  19 catcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggga 118  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||   |||||||||||| ||     
T  27292191 catcacacttcaatgagcatcgggaggacaggactagatgcatgtcaacaatggcaagaggttcataaacattgttcaccattagttgtgcaacacaggt 27292290  T
Q  119 caaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattct 218  Q
      || || |||||||            ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||      
T  27292291 agaatagcgtgcaag------------tttgggagaaaccgaacgagtcatggttgaagtgcaatgtggatgtcacgttccatgatagtaaccatattac 27292378  T
Q  219 atcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagta 318  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |  || ||| ||||||||||| ||    
T  27292379 atattttgcatgttgtgttagagactctcgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatattattgttttgaagggggaggcaata 27292478  T
Q  319 gccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgg 418  Q
    |||||||| || || |||||||||| |||||  || |||||| | |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| | |    
T  27292479 gccttactagatgcccttcactttgctgatgataacagatgggaccgggttgtcttcgagttcgactcatctgctctagtgcaaactctatcgtctccag 27292578  T
Q  419 gacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  27292579 gccatggtgatttggaattttatgctattgtttctagt 27292616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 219 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34652495 - 34652259
Alignment:
Q  219 atcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagta 318  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||    
T  34652495 atcttttgtgtgttgtgttagagactcccgtgggcaatttatccggtctcaaacaaaagg-cagcgagcaaatatgacagtgttgtaaggggagataata 34652397  T
Q  319 gccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgg 418  Q
     |||||||||| ||  |||||||||  ||||  || |||||| |||||||| |||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||| | |||  ||    
T  34652396 accttactcgatgccattcactttgccgatgtgaacagatgggatcgggttgtcttcgagcccgactcgactactctagtgcaagctctaccgtctctgg 34652297  T
Q  419 gacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  34652296 gccatggtgattcagaattatatgttattgtttctagt 34652259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34654042 - 34653864
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||||||||| |   |||||||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  34654042 aatgacgctcatcatactttatcaagcattggaaagacatcactagatgcatggcaacaatggcaaaagattcataaacaaccctcaacaccagttgtgc 34653943  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggat 189  Q
    |||||| |   || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34653942 aacacgtgcagaatagagtgc-aggcaacaactaagtttgggagaaaccgcacgagacgtggttgaagtgcaatgtggat 34653864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Original strand, 16074473 - 16074675
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||| | ||| |||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||  | | |||    
T  16074473 aatgacgttcatcatacttcaagaagcattg-gaggacagctctagatgcttggcaacaatgacaagagattcataaacaagcattaccactagctttgc 16074571  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    || | |||   || | || ||||  |||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16074572 aaaatgggcagaatatagggcaatataacaacttagtttaggagaaaccgtgcgagacgtggtcaaagtgcaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaa 16074671  T
Q  210 ccat 213  Q
    ||||    
T  16074672 ccat 16074675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 379
Target Start/End: Original strand, 37448028 - 37448230
Alignment:
Q  177 gtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaa 276  Q
    |||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||  ||| |||   ||||||||||||||||| || ||  ||  ||||||| ||||||| |||    
T  37448028 gtgcgatgtggatgtcgtgttccatgaccataaccatcttacatcgtttatatgttgtgttagagactctcgtggacaatgtattcggactcaaacaaaa 37448127  T
Q  277 tgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcg 376  Q
    || || || ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |   ||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||||||    
T  37448128 tggcagcgtgcaaacatgacagtgttgaaaggggaggcggtagccttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatggaaccgggttgtcttcg 37448227  T
Q  377 agt 379  Q
    |||    
T  37448228 agt 37448230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 454
Target Start/End: Original strand, 32632546 - 32632695
Alignment:
Q  305 agggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagc 404  Q
    |||||||| || || |||||||||||||  |||| |||  |||| | |||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  32632546 agggggagacaataaccttactcgaggcctttcattttactgatacgaatagattaaaccgggttgtctttgagtctgactcatctactttagtgtaagc 32632645  T
Q  405 tctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttcta 454  Q
    | |||| ||| || | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32632646 tttatcgtctccgagccatagtgattcagaattctatgacattgtttcta 32632695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 137
Target Start/End: Original strand, 12660080 - 12660207
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| || |||| ||  ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  12660080 aatgaagctcatcatacttcaagaagcattgggaggacaactctagatacatggcagtaatggcaagagattcataaacaggcattaccaccggttgtgc 12660179  T
Q  110 aacacgggaca-aacagagtgcaaggtaa 137  Q
    ||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  12660180 aaca-tggacataatagagtgcaaggtaa 12660207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 30222928 - 30222856
Alignment:
Q  371 tcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgc 443  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  30222928 tcttcgaatctgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtcttcgggtcacggtgattcggaattctatgc 30222856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 25730577 - 25730656
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaaca 89  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||||| || |||  || |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  25730577 aatgatgctcatcatacatcaacgagcattgggaagacggcattatatgcatggcagcaatgccaagaggttcataaaca 25730656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 156
Target Start/End: Original strand, 37447993 - 37448025
Alignment:
Q  124 agagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaa 156  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37447993 agagtgcaaggtaacagctcagtttgggagaaa 37448025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 33 - 456
Target Start/End: Original strand, 14679918 - 14680344
Alignment:
Q  33 gagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaa 132  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |   || |||||||||    
T  14679918 gagcattgagaggacaacactagatgcatggccacaatggaaagaggttcataaacaactctcaccactagttgtgcaacacgagcataatagagtgcaa 14680017  T
Q  133 ggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgtt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||  ||||    
T  14680018 ggtaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatgtggataccgcgttccatgaccgcaaccacattacatcttttgcatgtt 14680117  T
Q  233 gtgttagagactccc---gcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcga 329  Q
    |||||||||||||||   ||||| || |||||  |||||||| |||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680118 gtgttagagactcccgcggcgggcaatttattatggctcaaatgaaatggcagcgggaaaatatgacagtattggagggggaggcagtagccttactcga 14680217  T
Q  330 ggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgat 429  Q
    ||| ||||||| || ||||||||| |||||||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||   |||||||    
T  14680218 ggcccttcactctgctgatgcaaacagatggaaccgagttgtctttgattccgactcgtctactctattgcaagctctatcatctccgggcagtggtgat 14680317  T
Q  430 tcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||| |||||| ||| ||| ||||||||    
T  14680318 tcaaaattctctgctattgtttctagt 14680344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 456
Target Start/End: Original strand, 28106885 - 28107321
Alignment:
Q  20 atcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggac 119  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||  |      
T  28106885 atcatacttcaacaagcattggaaggacaatactagatgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacatctttcaccattggttgtgcaacacatgca 28106984  T
Q  120 aaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattcta 219  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||  |    
T  28106985 aaatagagtgcaaggtaacatctcagtttgggagaaaccaaacgagacgtggttgaagtgcaacgaggaagccacgttccatgatcgtaaccatcttaca 28107084  T
Q  220 tcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtag 319  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||| || ||  || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28107085 tctttcgtgtgttgtgttagagactcccgtggacaatttattcaggctcaaacgaaatggcagcggacagatatgacagttttggagggggaggcagtag 28107184  T
Q  320 ccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcggg 419  Q
    ||||||| || ||  |||||||||   ||   ||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  28107185 ccttacttgatgccattcactttgcaaatatgaatagatgggatcacgttgtcttcgagtctaactccgctactctagtgcaagctctatcgtctccggg 28107284  T
Q  420 acatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
     ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  28107285 ccatggtgattcagaattctatgttattgtttctagt 28107321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15606452 - 15605999
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||  |||||||||||||  || ||||  |||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  15606452 aatgacgatcatcatacttcaacaagtattggtaggacatcactagattcatggcaacaatggcaggaggttcataaacaacactcaccaccggctatgc 15606353  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaact-------cagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatg 202  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |    
T  15606352 aacacgggaaacatagagtgcaaggtaacaactaacaactcagtttgggagaaaccgcacgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgcatttcacg 15606253  T
Q  203 accgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgtt 302  Q
    | ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||    
T  15606252 atcgtaaccatattacatctttttcgtgttgtgttagagactcccatgggcaacttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggaaaacatgacagtttt 15606153  T
Q  303 ggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaa 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  || | |||| | |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| |||    
T  15606152 ggagggggaggcagtagccttactcgatgccattcactttgttgatgggaacaaatgggaccgggttgtcttcaagtccgactcagctactctagtgcaa 15606053  T
Q  403 gctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||| |||   || |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  15606052 gctctatcgtctctaggtcatggtgattcagaacactatgctattgtttctagt 15605999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19364387 - 19364217
Alignment:
Q  19 catcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggga 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |     
T  19364387 catcatacttcaacgagcattgggaggacaacactagatgcatgacaacaatggcgagaggttcataaacaaccctcaccaacgcatgtgcaacacgagc 19364288  T
Q  119 caaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatg 190  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19364287 aaaatcgagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaactgagcgaga-gtggttaaagtgcattgtggatg 19364217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29368478 - 29368061
Alignment:
Q  19 catcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggga 118  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  | |||||||| |||||| |     
T  29368478 catcatacctgaatgagcattgggaggacaacactagatgcatgacagcaatggcaagaggttcataaacatcattcattatcggttgtgtaacacgagc 29368379  T
Q  119 caaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattct 218  Q
      || |||||||||             ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||  |  | |||||||||||  |          
T  29368378 acaatagagtgcaaa------------tttgggagaaatcgaacgaaatgtggttgaagtgaaatgtggacgctgcagttcatgaccgtaataa------ 29368297  T
Q  219 atcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagta 318  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| || ||  || |||||||  |||||| |||||| || ||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29368296 atcttttgcgtgttgtgtttgagactctcgtggacaatttattcg--ctcaaaagaaatggcagcggataaatatgacagttttggagggggaggcaata 29368199  T
Q  319 gccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgg 418  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |    | | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||    
T  29368198 tccttactcgaggcccttcactttgctgatgctaatagatgggacctaactgttttcgagtccgactcatctactatagtgcaagctctatcgtctccgg 29368099  T
Q  419 gacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||| |||||||  |||||||||| |||  |||||||    
T  29368098 gtcatagtgattcgtaattctatgctattgcttctagt 29368061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15053430 - 15053193
Alignment:
Q  206 gtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttgga 305  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| | | ||  || |||||||||||||||| | |||||| || | |||||||| |||||||||    
T  15053430 gtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagacttcagtggacaatttattcgggctcaaacaagatgacagcgggtaaatatgatagtgttgga 15053331  T
Q  306 gggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagct 405  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||| | ||| ||| |  || | |||  |   |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |     
T  15053330 gggggaggcagtagccttactcgatgccattcgccttgctgacgtgaaaaaatgagacaaggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaaacg 15053231  T
Q  406 ctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgc 443  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15053230 ctatcgtcttcgggccatggtgattcggaattctatgc 15053193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30802421 - 30802218
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||||||||||||  || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| || |||||| ||||||||     
T  30802421 aatgacgctcatcatacttcaacaagtattggaaggacaacactagatgcatgacaacaatggtaagacattcataaacagccctcaccaacggttgtgg 30802322  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||| ||   || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||  ||||    
T  30802321 aacacaggcagaatagagtgcaaggtaccaactcagtttgggaaaaactaagcgagaggtagttaaagtgcattgtggatgccgcattcaatgaatgtaa 30802222  T
Q  210 ccat 213  Q
    ||||    
T  30802221 ccat 30802218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11732089 - 11731885
Alignment:
Q  22 catacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaat----ggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggg 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  | ||||    | |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||   | ||    
T  11732089 catacttcaatgagcattgggaggacaacaatagatgcatgggagcaattaatgacaagaggttcataaacaaccctcacca---gttgtgcattgcagg 11731993  T
Q  118 acaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattc 217  Q
    |  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||| ||||| |||||     
T  11731992 aagaatatagtgcaaggtaacaactcagcttgggagaaactgagcgagacgtggtggaagtgcaatgtagatgacgcattccatgactgtaacaatatta 11731893  T
Q  218 tatctttt 225  Q
     |||||||    
T  11731892 catctttt 11731885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19691073 - 19690884
Alignment:
Q  267 tcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgg 366  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||| |||| |   ||||||||| |||||  || |||||  | ||     
T  19691073 tcaaacgaaatgacaacggacaaatatgaccgttttggaaggggaggcaatagccttattcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatgtgaccga 19690974  T
Q  367 gttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||  | | ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  19690973 gttgtcttcgagtctgactcagctactttagtgcaagctctatcgtctctgagtcatggtgatttggaattctatgtcattgtttctagt 19690884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 30802195 - 30801996
Alignment:
Q  257 ttattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatag 356  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||  || ||||||  ||||  || |     
T  30802195 ttattcgggcttaaacaaaatggcagcgggcaaatatgacagttttggtgggggaggcagtagccttactagatgccatttactttgcagatgtgaaaaa 30802096  T
Q  357 atggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||| |   |||| |||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||| | | || | |||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||    
T  30802095 atgggactaggttgtcttcgagtccgattcagctactttagtgcaagctctatcgtttccgagccatggtgacttggaattctatgttattgtttctagt 30801996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11731870 - 11731674
Alignment:
Q  257 ttattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatag 356  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| |||||  || |     
T  11731870 ttatccgggctcaaacaaaatggcagcgggcaaatatgacagttttgga-ggggaggcagcagcct--ctcgagactcttcactttgctgatgagaacat 11731774  T
Q  357 atggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    || | | | |||| |||||||||| ||||| |  | | |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| ||| || |||||||| | | ||||||||    
T  11731773 ataggaacaggttgtcttcgagtccgactctttcaatatagtgcaagctctattgtctccgggccatggtggttcggagttctatgctactgtttctagt 11731674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 384 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34104542 - 34104470
Alignment:
Q  384 ctcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  34104542 ctcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccggaccatggtgattcagaattttatgctattgtttttagt 34104470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 441
Target Start/End: Original strand, 4394904 - 4395325
Alignment:
Q  19 catcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggga 118  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||  ||||||||  |     
T  4394904 catcatacatcaacgagcattgggaggacggcactagatgcatgacaacaatggcaagaggtttataaacatccctcgctaccggtaatgcaacacatgc 4395003  T
Q  119 caaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattct 218  Q
      |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||       
T  4395004 ataacagagtgcaagacaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacgtggctgaagtgcaatgtggaagccgcgttccatgaccgtaaccatatcac 4395103  T
Q  219 atcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagta 318  Q
    | ||||||  || |||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||    
T  4395104 aacttttgcatgctgtgttagagactctcgtgggcaatttatccgggctcaatcgaaatggcagcgggcaaatatgagagttttgaagggg-aggcacta 4395202  T
Q  319 gccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgg 418  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||   |    
T  4395203 gccttactcgaggcccttcactttgctgatgcgaatagatgggaccaggttatcttcgagtccaactcatctactctagtgcaagctctatcgtctcaag 4395302  T
Q  419 gacatggtgattcagaattctat 441  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  4395303 gtcatggtgattcagaattctat 4395325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Original strand, 44527001 - 44527435
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    | |||| |||||||||    
T  44527001 aatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggaggacaacactagatgcatggcaacaatggcaagaggttcataaaaatagtttaccatcggttgtgc 44527100  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   || ||||||||||            ||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  44527101 aacacgggcataatagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaccgagtcatggttaaagtgcaatgtggacgccgcgttccatgactgtaa 44527188  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  44527189 ccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactcttgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggg 44527288  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  44527289 gaggcagtagccttactagaggcccttcactttgctgatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactcttgtgcaagctctat 44527388  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  44527389 catctccgggccatggtgattcggaattctatgctattgtttctagt 44527435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 456
Target Start/End: Original strand, 51113049 - 51113497
Alignment:
Q  8 gaaatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgt 107  Q
    |||||||||  ||||| |||||||  ||||| | ||||||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||| || || ||||    
T  51113049 gaaatgacgttcatcacacttcaacaagcatcgggaggacagcactagatgcatggcagcaatggcaggaggttcataaacagccctcatcatcgattgt 51113148  T
Q  108 gcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgt 207  Q
    ||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  51113149 gcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaatcgtgtgagacgtggttaaagtgcaatgtggatgccgtgtttcatgaccgt 51113248  T
Q  208 aaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagg 307  Q
     | ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  51113249 caacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaattcattcggactcaaacgaaatggcaacgagcaaatataaccgttttggagg 51113348  T
Q  308 gggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctct 407  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||    
T  51113349 gggaggcagttgccttactcgatgtcattcactttgttgttgggaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgct 51113448  T
Q  408 atcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||| |||  ||| ||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||    
T  51113449 atcgtctctgggccatggtgattcggagttttatgctattgtttctagt 51113497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 70 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 48950115 - 48949729
Alignment:
Q  70 tggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgt 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | |||||||    
T  48950115 tggcaggaggttcataaacaaccctcatcatcgattgtgcaacacgggcagaatagagtgcaagctaacaactcagattgggagaaaccgcgtgagacgt 48950016  T
Q  170 ggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctca 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||  || || | |||||||||||    
T  48950015 ggttgaagtgcaatgtggatgccgcgtttcatgaccgtcaacatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactcccgttggcaattcattcgggctca 48949916  T
Q  270 aacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggtt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||  || |||||| | ||||||    
T  48949915 aacgaaatggcaacgagcaaatatgaaagttttggagggggaggcagttgccttactcgatgcgattcactttgttgttgggaacagatgggaccgggtt 48949816  T
Q  370 atcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
     |||||||||   ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  48949815 gtcttcgagttcaactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgctattgtttctagt 48949729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 456
Target Start/End: Original strand, 5609084 - 5609521
Alignment:
Q  19 catcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacggga 118  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||  ||| | ||||  | |||||| ||     
T  5609084 catcatacatcattgagcattgggaggacgacactagatgcatggtagcaatggcaagaggttcataaacggcctccactatcggtaatacaacacaggc 5609183  T
Q  119 caaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattct 218  Q
      || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||      
T  5609184 ataatagagtgcaaggcaacaactcagtttgggagaaaccgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgcgttccatgactgtaaccatattac 5609283  T
Q  219 atcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagta 318  Q
    | |||| | ||| |||| ||||||||| | || | || ||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  5609284 aactttcgcgtgctgtgctagagactcacacgagcaatttattcgggctcaaactctatgacagcggacaaatatgatagttttgaagggggaggcagta 5609383  T
Q  319 gccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgg 418  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || ||| || |||||  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||    
T  5609384 gccttactcgaggtccttcactttgatgttgcgaacagatgagatcgggttgtcttcgagttcgactcatctactctagtgcaaactctatcgtctcagg 5609483  T
Q  419 gacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5609484 gtcatggtgattcagaattctatgctattgtttctagt 5609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 456
Target Start/End: Original strand, 25682419 - 25682833
Alignment:
Q  42 gaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaac 141  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | | | ||| |||||||||| |||   || ||||||||||| || |||    
T  25682419 gaggacaactctagatgcatggcagcaatggcaagagattcataaacaacccttatcgccgattgtgcaacatgggtagaatagagtgcaaggcaagaac 25682518  T
Q  142 tcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagag 241  Q
    ||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25682519 tcaatttgggagaaaccgtgtgagacatggttgaagtgcaatgtggatgccgtgtttcatgaacgtaaccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagag 25682618  T
Q  242 actcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactt 341  Q
    ||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  25682619 actcccgtgggcaatttatctgggctcaaacgaaatggcaacgggcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgatgtcattcactt 25682718  T
Q  342 tgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctat 441  Q
    || | |||  || |||||| | |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  |||||| ||||||||||    
T  25682719 tgctaatgtgaacagatgggaccgggctgtcttcgagtttgactcagctactctagtacaagctctatcgtctccgggccacagtgatttagaattctat 25682818  T
Q  442 gccattatttctagt 456  Q
     | ||| ||||||||    
T  25682819 actattgtttctagt 25682833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Original strand, 36733429 - 36733878
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaacca-tcaccaccggttgtg 108  Q
    |||||||  |||||||||||||  | ||| |  |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  36733429 aatgacgttcatcatacttcaacaaacatcggaaggacaacactagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatcccctcactaccggttgtg 36733528  T
Q  109 caacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaat--gtggatgccccgttccatgaccg 206  Q
    ||||| ||   ||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||      
T  36733529 caacaaggccaaaatagaatgcaaggtaataactgagtttcggagaaaccgagcgagacatggttgaagtgcaatatgtggatgccgcgtttcatgacta 36733628  T
Q  207 taaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggag 306  Q
    ||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  36733629 taaccatcttacaccttttgtgtgttgtgttagagactctcgtggacaatttattcgggctcaaacaaaatgacaacgggtaaatatggcagttttggag 36733728  T
Q  307 ggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctc 406  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||| |||||  || | |||| | |||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||     
T  36733729 ggggaggcagtagtcttactcaatgttattcactttgctgatgtgaacaaatgggaccgggttgtcttcgagtctgactctataactctagtgcaagcta 36733828  T
Q  407 tatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  36733829 tatcgtctccgggccatgatgattcataattctatgttattgtttctagt 36733878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Original strand, 24538260 - 24538544
Alignment:
Q  25 acttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggtt-cataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaac 123  Q
    |||||||  |||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||  ||   ||     
T  24538260 acttcaacaagcattggaaggacatcattagatgcatgacaacaatggcaagaggtttcataaacatccctcaccaccagttgtgcaacataggcagaat 24538359  T
Q  124 agagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatctt 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||  |||||    
T  24538360 agagtgcaaggtaacatctcagtttgagagaaaccaagtgagacctggtcgaaatgcaatgtggatgccgcgttctataaccgtaaccaagttagatctt 24538459  T
Q  224 ttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggaggg 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || || |  ||||||| |||||| ||||||||    
T  24538460 ttgtgtgttgtgttagagactcccgtggataatttattcgggctcaaacgaattggcagcaggcaaatacgacagttttggaggg 24538544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 449
Target Start/End: Original strand, 48166149 - 48166412
Alignment:
Q  186 ggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacga 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| |||||| || |||    
T  48166149 ggatgccacgttccatgaccgtaaccatcttacatcttttgtgtgttgtgttagagactcccgtggtcaatttattcgggctcaaatgaaatggcagcga 48166248  T
Q  286 gcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgact 385  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |   ||||||||| | |||  |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  48166249 gcaaatatgacagttttggagtgggagacaatagccttactcgatgtcattcactttgcttatgtgaatatatgggatcgggttgtcttcgagtctgatt 48166348  T
Q  386 catctactctagtccaagctctatcatcttcgggac-atggtgattcagaattctatgccattat 449  Q
    || |||||||| | ||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  48166349 cagctactctattgcaagctctatagtctt-gggacgatggtgatacagaattctatgctattat 48166412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 456
Target Start/End: Original strand, 52109324 - 52109635
Alignment:
Q  144 agtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagac 243  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||| |    ||||||||||||||| ||| || |||||||||  |||||||||||||||    
T  52109324 agtttgggagaaaccgacaaagacgtggttgaagtgtaatgtggacgttgtgttccatgaccgtaatcatcttatatcttttgcatgttgtgttagagac 52109423  T
Q  244 tcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttg 343  Q
    ||| | ||  || |||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  52109424 tcctgtggacaatttattcaggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatatgatcattttggagggggatgcagtagccttactcgaggtccttcactttg 52109523  T
Q  344 ttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgc 443  Q
     |||||| || |||||| || ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||  ||||||||||| ||||||||||     
T  52109524 ctgatgctaacagatgggat-gggttgtctttgagtgtgattcatctactctagtacaagctctattgtctccggaccatggtgattcggaattctatgt 52109622  T
Q  444 cattatttctagt 456  Q
     ||| ||||||||    
T  52109623 tattgtttctagt 52109635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16817108 - 16816802
Alignment:
Q  152 agaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgg 251  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||| ||||     
T  16817108 agaaaccgagtgagatgtggttgaagtgcaatgcggacgccgcgttccatgtctgtaaccatattacatcttttgtgtattgttttagagactctcgcgt 16817009  T
Q  252 gtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgca 351  Q
    | || ||||||| |||||| | ||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  16817008 gcaatttattcgagctcaatcaaaatggcagtgggcaaatatgacaattttggagggg-aggcagtagccttactcgaggcccttcattttgctgatgca 16816910  T
Q  352 aatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatg---gtgattcagaattctatgccatta 448  Q
    || |||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| | ||| || | ||||   ||||||| |||||||| || |||     
T  16816909 aacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcgtctactctagttcaagttctaccgtctccgagccatggacgtgattcggaattctacgctattg 16816810  T
Q  449 tttctagt 456  Q
    ||||||||    
T  16816809 tttctagt 16816802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 287 - 456
Target Start/End: Original strand, 44602765 - 44602934
Alignment:
Q  287 caaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactc 386  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| |   ||||||||  |||||  || |||||  | ||||||  |||||||||| ||||    
T  44602765 caaatatgacaattttggagggggagacattagtcttactcgatgtcattcactttactgatgtgaacagatgagaccgggttgccttcgagtctaactc 44602864  T
Q  387 atctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
      |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  44602865 cgctactctagtgcaagctctatcatctccgggccatggtgattcaaaattctatgctattgtttctagt 44602934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 357 - 456
Target Start/End: Original strand, 2885306 - 2885405
Alignment:
Q  357 atggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| || || ||||| ||| ||||||||    
T  2885306 atggaatcgggttgtcttcgagtcagactcagctactctagtgcaagctctatcgtcttcgggctatggtgattcggagttatatgctattgtttctagt 2885405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 456
Target Start/End: Original strand, 24538586 - 24538669
Alignment:
Q  373 ttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24538586 ttcgagtctgactcttctactctagtgcaagatctatctgcttcgggtcatagtgattcagaattctacgctattatttctagt 24538669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 172
Target Start/End: Original strand, 17507308 - 17507356
Alignment:
Q  124 agagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggt 172  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17507308 agagtgcaaggtaatatctcagtttgggagaaaccgagcgagacatggt 17507356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Original strand, 53496780 - 53497214
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||    
T  53496780 aatgatgctcatcacacttcaacgagcattgggaggacaacactagatgcatggcagcaatgacaagaggttcataaaaatcgttcaccatcggttgtgc 53496879  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   |||||||||||||            ||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53496880 aacacgggcagaacagagtgcaag------------tttgggagaaaccgaccgagtcatggttaaagtgcaatgtggacgccgcgttccatgaccgtaa 53496967  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||| || ||||||    
T  53496968 ccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagactcttgtgggcaatttattcgggctcaaacaaaatgacagcggacaaatgtgacagtttttgagggg 53497067  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  53497068 gaggcagtagccttactagaggcccttcactttgctgatgctaacagatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcatctactcttgtgcaagctctat 53497167  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  53497168 cgtctccgggccatggtgattcggaattctatgctattgtttctagt 53497214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 42340727 - 42340284
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    ||||| || |||||||||| ||  |||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42340727 aatgatgcccatcatacttgaacaagcattggaaggacaacaatggatgcatgacaacaatggcaagagattcataaacagccctcaccaccggttgtgc 42340628  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    |||||| |   || |||||  |||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| | | ||    
T  42340627 aacacgtgcagaatagagtctaaggcaacaactcagtttgagagaaaccgtgcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgttg-gttctatgtcggcaa 42340529  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||    
T  42340528 ccatcttacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgtggacaatttattcgggctcaaacaaaatggcagcgggcagatatgacagtgttggagggg 42340429  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||| ||||| ||||||| |   |||||||||  ||||  || |||||| | || ||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  42340428 gaggcaatagccctactcgatgtcattcactttgcagatgtgaacagatgggaccgagttgtcttcgagtcagactcagctactttagtgcaagctctgt 42340329  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttcta 454  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42340328 cgtctccgggccatggtgattcagaattctatgctattgtttcta 42340284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 69 - 456
Target Start/End: Original strand, 55199306 - 55199693
Alignment:
Q  69 atggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacg 168  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| || || |||||||||||  |   || | |||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| |    
T  55199306 atggcaggaggttcataaacagccctcatcatcgattgtgcaacacatgcagaataaagtgcaagctaacaactcagtttgggagaaaccgcgtgagatg 55199405  T
Q  169 tggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctc 268  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  55199406 tggttgacgtgcaatgtggatgccacgtttcatgaccgtcaatatattacatctttcgcgtgttgtgttagagactcccgtgggcaattcattcgggctc 55199505  T
Q  269 aaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggt 368  Q
    ||||||||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| || ||| |||||| | |||||    
T  55199506 aaacgaaatgacagctgataaatatgacagttttggagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttgttgttggaaacagatgggaccgggt 55199605  T
Q  369 tatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  55199606 tgtcttcaagtccgactcagctactctggtgcaagcgctatcgtctacgggtcatggtgattcggaattttatgctattgtttctagt 55199693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 455
Target Start/End: Original strand, 46007097 - 46007480
Alignment:
Q  70 tggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgt 169  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||  ||| | |||||| | |||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  46007097 tggcaataggtttataaacagccctcaccaccggttgtgcagcacaggtaaaataaagtgcaggataacaactcagtttgggaaaaacaaagcgagacgt 46007196  T
Q  170 ggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtg-ttagagactcccgcgggtaaattattcgggctc 268  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||| || ||||||||| ||||| || |||||||||| || ||  || ||||||||||||    
T  46007197 ggttgaagtgcaatgtggatgccgtgttccattattgtaaccatcttatatcttttgcgtgttttgtttagagactctcgtggaaaatttattcgggctc 46007296  T
Q  269 aaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggt 368  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||| | ||  |||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||| |||   || ||||||   ||||     
T  46007297 aaacgaaatggcagcgggcaaatacgacaattttttagggggagacagtagccttacttgatgccattcactttgtcgatatgaacagatgg--gcggg- 46007393  T
Q  369 tatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctag 455  Q
    | |||||||||| || ||| |||||||||| ||| || |||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  46007394 tgtcttcgagtccgattcaactactctagtgcaaactatatcgtctccgggccatggcgattcggaattttatgctattgtttctag 46007480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 124 - 329
Target Start/End: Original strand, 2615343 - 2615548
Alignment:
Q  124 agagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatctt 223  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||||  || ||    
T  2615343 agagtgcaaagtaacggttcagtttgggagaaatcgtgcaagacgtggttgaaatgcaatgtggataccgcgtttcatgatcataaccatattacatttt 2615442  T
Q  224 ttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagcctt 323  Q
    ||| | |||||||||||| ||   | ||| || | ||||||||||||||||| || || || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2615443 ttgtgcgttgtgttagaggcttttgtgggcaattcattcgggctcaaacgaattggcagcgggcaaatatgatagttttggagggggaggcagtagcctt 2615542  T
Q  324 actcga 329  Q
    ||||||    
T  2615543 actcga 2615548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 410
Target Start/End: Original strand, 48227305 - 48227550
Alignment:
Q  166 acgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcggg 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  48227305 acgtggttgaagtacaatgtggatgccgcatttcattaccgtaaccatgttacatcttttgcgtgttgtgttagagactctcgcgggcaatttattcggg 48227404  T
Q  266 ctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgag-gctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatc 364  Q
    || ||||||||   ||  | | ||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||  ||| |||  || |    
T  48227405 cttaaacgaaacagcagtgggaaaacatgactgtattggagtgggatgcagtagccttactcgagaccccatcactttgctgatgtgaatggataaaacc 48227504  T
Q  365 gggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatc 410  Q
    | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48227505 gagttgtctttgagtccgactcatctactctagtgcaagctctatc 48227550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 647485 - 647343
Alignment:
Q  187 gatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgag 286  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |    || || || | ||||||||||||||||| || || |    
T  647485 gatgccgcgttccatgagcgtaaccatattacatcttttgcgtgttgtgttagagacttctctaggcaatttttccgggctcaaacgaaatggcagcggg 647386  T
Q  287 caaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcga 329  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  647385 ctaatatgacagttatggagggggaggcagcagccttactcga 647343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Original strand, 1070748 - 1070952
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaa-caaccatcaccaccggttgtg 108  Q
    |||||||| |||||||||||||  | |||||  |||||| ||||| |||| ||| | ||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  1070748 aatgacgctcatcatacttcaacaatcattggaaggacatcactagatgcctgatagcaatgacaagagaatcataaaacaactatcaccaccgcttgta 1070847  T
Q  109 caacacgggaca-aacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgt 207  Q
    |||||||| ||| || |||| ||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||   | |||||||| |||    
T  1070848 caacacgg-acataatagagagcaaggtaaaacctcagtttaggagaaaccgcgcgagacatggttgaactgcaatgtggatgttgccttccatgatcgt 1070946  T
Q  208 aaccat 213  Q
    ||||||    
T  1070947 aaccat 1070952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 647306 - 647182
Alignment:
Q  318 agccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcg 417  Q
    |||||||||||| |   ||||||||| |||||  || |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  647306 agccttactcgatgtcattcactttgctgatgtgaacagatgtgaccgagttatcttcgagtctgactcatctactctagtgcaagctctatcgtctccg 647207  T
Q  418 ggacatggtgattcagaattctatg 442  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  647206 ggccatggtgattcggaattctatg 647182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11020354 - 11020185
Alignment:
Q  287 caaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactc 386  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||||| ||| || |||||| |||||  || | ||||||  ||||| |||||||||||||||     
T  11020354 caaatatgacacttttggagggggagacatcagctttactcgatgctatttactttgctgatgggaacaaatggaactgggttgtcttcgagtctgactt 11020255  T
Q  387 atctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | |||||| |||  ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11020254 aactactccagtgtaaggtctatcgtctccgggccatggtgattcagaattctgtgctattgtttctagt 11020185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27941261 - 27941129
Alignment:
Q  194 cgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatat 293  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| || || ||  || |||||||| ||||||| ||||| || ||  |||||||    
T  27941261 cgtttcatgatcgtaaccatattatattttttgcgtgttgtattagagattctcgaggacaatttattcggactcaaacaaaatggcagcggacaaatat 27941162  T
Q  294 gacagtgttggagggggaggcagtagccttact 326  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27941161 gatagttttggagggggaggcagtagccttact 27941129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 365 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27608999 - 27608908
Alignment:
Q  365 gggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  27608999 gggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgctattgtttctagt 27608908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27747858 - 27747790
Alignment:
Q  43 aggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  27747858 aggacaacactagatgcatggcaacaatgacaagaggttcataaaaagcactcaccaccggttgtgcaa 27747790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 440
Target Start/End: Original strand, 24176861 - 24176936
Alignment:
Q  365 gggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattcta 440  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  24176861 gggttgtcttcgagtctgacacaactactctagtgcaagctctatcgtctctgggtcatggtgattcggaattcta 24176936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34497468 - 34497377
Alignment:
Q  365 gggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||    
T  34497468 gggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaagcgctatcgtctccgggccatggtgattcggaattttatgctattgttcctagt 34497377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 36310947 - 36310808
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||| |  ||||||  |||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||    
T  36310947 aatgacactcatcatacttcaacaagcatcggaaggacataactagatacattgcagcaatggcaagaggttcataaacaaccctcacaactgattgtgc 36310848  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttg 149  Q
    |||||||    || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  36310847 aacacggccataatagagtgcaaggtgacaattcagtttg 36310808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 364 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31341826 - 31341732
Alignment:
Q  364 cgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcat----cttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttcta 454  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |    || |||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  31341826 cgggttatcttcgaatctgactccactactctagtgcaagctctatcctacgtctccgggtcatggtgattcagaattttatactattgtttcta 31341732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 2615591 - 2615651
Alignment:
Q  382 gactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatg 442  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  2615591 gactcaactactctagtgcgagctctatcgtctttgtgccatggtgattcagaattctatg 2615651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 478507 - 478086
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  478507 aatgacgctcatcatacttcaacaagcattggaaggacggcactagatgcatggcagcaatggcaagaggttcataaacatccatcaccagtggttgtgc 478408  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||| ||  ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||    
T  478407 aacacaggcaaaatagagtccaaggtaacatctcaatttgggagaaaccaagcgagatgtggttgaagtgtaatgtggatgcaacgttccatgaccacaa 478308  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    |||| |   |||||||| ||||||||||||||| | ||  ||  || |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  478307 ccatctaacatcttttgtgtgttgtgttagagatttccatggtcaatttatccgggctcaaacaaaatggcaacgggcaaatatgacagttttggagggg 478208  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  478207 gaggcagtagccttactcgatgccattcactttgctaatgtgaatagatgggaccgggttatcttcgaatctgactctactactctagtgcaagctctat 478108  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattc 431  Q
    | ||| ||||  ||||||||||    
T  478107 cgtctccgggttatggtgattc 478086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 48 - 456
Target Start/End: Original strand, 23853718 - 23854114
Alignment:
Q  48 aacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtt 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||            ||    
T  23853718 aacactaaatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacattattcaccacaggttgtgcaacacaggcataatagagtgcaag------------tt 23853805  T
Q  148 tgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactccc 247  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23853806 tgggagaaaccgaacgagacgtggttgaagtgcgatgtggacgccgcgttccatgaccgtaactatattacatcttttgcgtgttatgttagagactccc 23853905  T
Q  248 gcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttga 347  Q
    | ||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  23853906 gtgggcaatttattcgggttcaaacgaaatgacagcggaaaaatatgacagttttggagggtgaggcagtagccttacttgaggccattcactttgttga 23854005  T
Q  348 tgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccatt 447  Q
    ||| || |||||  |  | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23854006 tgctaacagatgagactgagttgtcttcgagtccgactcatcaactctagtgcaagctctatcgtctccgggccatggtgattcagaattctatgctatt 23854105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 40589166 - 40588735
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40589166 aatgatgctcatcatacttcaacaagcattgggaggacgacactagatgcatggcaacaatggcaagaggttcataaacagccctcaccaccggttgtgc 40589067  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  40589066 aacacgggcataacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaaccgagtgagacgtggttgaagtgcaacgtggatgccgcgttccatgaacgtaa 40588967  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    ||||||   | ||||||  |||                || || || |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  40588966 ccatataacaacttttgcttgt---------------agcaggcaatttattcgggctcaaacgaaatggcagcgggcaaatataacagttttggagggg 40588882  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||  | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||    
T  40588881 gaggcagtagccgtactcgaggcccttcgttttgcggatgcaaacagatgagaccgggttgtctttgagtctgattcatctactctagtgtaaactctat 40588782  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    | ||  |||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  40588781 cgtccccgggccatgatgattctgaattctatgctattgtttatagt 40588735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 58 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8451526 - 8451142
Alignment:
Q  58 gcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaat 157  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |  ||| |||||||||||| | |  ||| |||||||||||     
T  8451526 gcatggcaacaatggcaagaggttcataaacagccatcaccacaggttgtgcaacaccagcaaaatagagtgcaaggtcatagttcaatttgggagaaac 8451427  T
Q  158 cgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaat 257  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  | ||  || |    
T  8451426 cgtgcgagacgtggttgaagtgtaatgtggatgccgcgttccatgaccgtaaccattttacatcttttggatgttgtgttagagactcttgtggacaatt 8451327  T
Q  258 tattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaataga 357  Q
    ||||||||||||||| ||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||||| | |||||  ||  ||    
T  8451326 tattcgggctcaaacaaaaaggaagcgggcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagctttactcgattccattcacttcgctgatgtgaacgga 8451227  T
Q  358 tggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatg 442  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||    
T  8451226 tgggaccgggttgtcttcgagtctgactcatctactttagtgcaagctttatcgtctccaggtcatggtgattcggaattttatg 8451142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 442
Target Start/End: Original strand, 7126959 - 7127391
Alignment:
Q  10 aatgacgcacatcatacttcaatgagcattgtgaggacaacactatatgcatgacaacaatggcaagaggttcataaacaaccatcaccaccggttgtgc 109  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||||||  |||||| | ||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  7126959 aatgacactcatcatacttcaacaagcattggaaggacagctctggatgcatggcagcaatggcatgaggttcataaacatccctcactaccggttgtgc 7127058  T
Q  110 aacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaa 209  Q
    ||||| |    || || | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7127059 aacacagccagaatagggggcaaggtaacaacttagtttgggagaagccgagcgagacatggttgaagtggaatgtggatgccgcgttccatgaacgtaa 7127158  T
Q  210 ccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggg 309  Q
    || | ||  ||| | ||  ||||||||||||||||| || ||| || ||||||| || |||| ||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  7127159 ccgtcttacatcctctgcatgttgtgttagagactctcgggggaaatttattcgtgcacaaatgaaatggaaacgggcaaatatgaaagttttggagggg 7127258  T
Q  310 gaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctat 409  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  || |||||| | ||||||  ||||||||||||||   ||||| |||| |||||||| |    
T  7127259 gaggtagtagccttactcgatgctattcactttgctgatgtgaacagatgggaccgggttgccttcgagtctgactatgctactttagtgcaagctcttt 7127358  T
Q  410 catcttcgggacatggtgattcagaattctatg 442  Q
    | ||| |||| |||||||||| || ||||||||    
T  7127359 cgtctccgggccatggtgatttagtattctatg 7127391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 456
Target Start/End: Original strand, 13414913 - 13415205
Alignment:
Q  164 agacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatgaccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||  | |||||| ||||| | |||||||||  |||||| || |||||||    
T  13414913 agacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgttccatgaacgtaaccatattacaacttttgtgtgtttttttagagactttcgcgggcaatttattcg 13415012  T
Q  264 ggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaat 363  Q
    ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||| |||||| ||    
T  13415013 ggctcaaacgaaatggcagcggacaaatatgacagttttggagggggaggcagtagccttactcgaggcccttccttttgcggatgcaaacagatgggat 13415112  T
Q  364 cgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    || ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||| | |||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  13415113 cgagttgtctttgagtccgattcttctactctagtgcaaggtatatcgtccccgggccatggtgattctgaattttatgctattgtttttagt 13415205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 185820 - 185596
Alignment:
Q  230 gttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcga 329  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| || ||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  185820 gttgtgtaagagactcc-gagggaaatttatctgggctcaaacgaaatggaaacgggcaaatatgacagttttggagggg-aggaagtagccttactcga 185723  T
Q  330 ggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgat 429  Q
      || |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||| || ||| |||  |||||||||    
T  185722 tactattcactttgttgatgtgaatagatggaaccgggttgtctacgagtctgactctgctactttagtgcaagctctttcgtctccggaccatggtgat 185623  T
Q  430 tcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  185622 tcagaattctatgctattgtttctagt 185596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 456
Target Start/End: Original strand, 37712027 - 37712255
Alignment:
Q  222 ttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttggagggggaggcagtagcc 321  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  | ||| || ||||| | ||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||     
T  37712027 ttttgcgtgttgtgttagaaactcgtgtgggcaatttatttgagctaaaacgaaatgacagcgggaaaatatgacagttttgaagggg-aggtagtagct 37712125  T
Q  322 ttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggac 421  Q
    ||| |    ||  |||||||||||||||  || |||||  ||| |||||||||| ||| |||| |  ||||||||||  |||||||||  ||||||| ||    
T  37712126 ttaat----gccattcactttgttgatgtgaacagatgagatcaggttatcttctagtttgaccctgctactctagtgtaagctctattgtcttcgg-ac 37712220  T
Q  422 atggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  37712221 atggtgattcagaatactatgctattgtttctagt 37712255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 33642869 - 33642769
Alignment:
Q  356 gatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctag 455  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  33642869 gatggaatcaggttgtcttcaagtccaactcatctactctaatgcaagctctgtcgtctccgggccatggtgattcagaattcaatgatattgtttctag 33642770  T
Q  456 t 456  Q
    |    
T  33642769 t 33642769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 598334 - 598242
Alignment:
Q  364 cgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||| ||||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||    
T  598334 cgggttgtcttcaagtcggacttagctactctagtgcaagctctatcgtcttcaggtcatggtgattcgaagttctatgctattgtttctagt 598242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 349
Target Start/End: Original strand, 9496797 - 9496857
Alignment:
Q  289 aatatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatg 349  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||    
T  9496797 aatatgacagttttggagggtgaggcagtagccttacttgatgacattcactttgttgatg 9496857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 456
Target Start/End: Original strand, 11870364 - 11870446
Alignment:
Q  374 tcgagtctgactcatctactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  |||  | | ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  11870364 tcgagtctgactcagctactcttgtgcaagctctattgtctcggagccatggtgattcggatttctatgctattgtttctagt 11870446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 104 - 414
Target Start/End: Original strand, 16 - 326
Alignment:
Q  104 ttgtgcaacacgggacaaacagagtgcaaggtaacaactcagtttgggagaaatcgagcgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgccccgttccatga 203  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||    
T  16 ttgtgcaacacgggcagaacagactgcaagctaacaactcagtttgggagaaactgtgtgagacgtggttgaagtgcaatgtggatgtcgtgtttcatga 115  T
Q  204 ccgtaaccatattctatcttttgggtgttgtgttagagactcccgcgggtaaattattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtgttg 303  Q
    |||| | ||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  116 ccgtcaacatatacnatctttcgcgtgttgttttagagactcccgtgggcaattcattcgggctcaaacgaaatgacaacgagcaaatatgacagtttgg 215  T
Q  304 gagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatctactctagtccaag 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| || ||  |||| |||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  216 gagggggaggcagttgccttactcgatgccattcactttgctgttgggaatatatgggaccgggttgtcttcgagtccgactcagctactctagtgcaag 315  T
Q  404 ctctatcatct 414  Q
    | |||||||||    
T  316 cgctatcatct 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 290 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 434 - 269
Alignment:
Q  290 atatgacagtgttggagggggaggcagtagccttactcgaggctcttcactttgttgatgcaaatagatggaatcgggttatcttcgagtctgactcatc 389  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||   |||| |||||||| ||||||||    
T  434 atatgacagttttggagggg-aggtagtagccttgttggaggccctttattttgctgatgcaaacaaatgggatccaattattttcgagtccgactcatc 336  T
Q  390 tactctagtccaagctctatcatcttcgggacatggtgattcagaattctatgccattatttctagt 456  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  335 tactctagtgcaagctctatcatctccaggtcatggtaattcagaattctatgctattgtttctagt 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 977 times since January 2019
Visitors: 2388