View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0245_low_7 (Length: 238)

Name: NF0245_low_7
Description: NF0245
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0245_low_7
NF0245_low_7
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (11-227)||(22072913-22073129)
chr7 (1-223)||(811028-811248)
chr7 (1-227)||(47831807-47832031)
chr7 (1-227)||(16219614-16219835)
chr7 (1-212)||(16056343-16056551)
chr7 (1-227)||(67745-67968)
chr7 (1-223)||(18005650-18005870)
chr7 (2-223)||(44014182-44014398)
chr7 (57-227)||(34200786-34200951)
chr7 (1-212)||(12901338-12901548)
chr7 (104-224)||(3564363-3564482)
chr7 (57-227)||(11995983-11996148)
chr7 (57-227)||(16495402-16495567)
chr7 (57-227)||(28505254-28505419)
chr7 (57-227)||(15754843-15755008)
chr7 (104-224)||(48273392-48273511)
chr7 (103-227)||(2280117-2280238)
chr7 (104-227)||(13647325-13647447)
chr7 (107-227)||(38227481-38227599)
chr7 (107-227)||(12698831-12698951)
chr7 (107-224)||(18456415-18456530)
chr7 (104-224)||(456321-456439)
chr7 (104-224)||(11972496-11972614)
chr7 (104-224)||(14949166-14949284)
chr7 (104-224)||(15376757-15376875)
chr7 (104-224)||(16232520-16232638)
chr7 (104-224)||(16410059-16410177)
chr7 (104-224)||(18640272-18640390)
chr7 (104-224)||(20385167-20385285)
chr7 (104-224)||(21189639-21189757)
chr7 (104-220)||(24275175-24275289)
chr7 (104-224)||(32125491-32125609)
chr7 (104-224)||(41522917-41523035)
chr7 (104-224)||(41525379-41525497)
chr7 (104-223)||(11393331-11393448)
chr7 (104-227)||(18430709-18430830)
chr7 (2-208)||(20220087-20220290)
chr7 (107-227)||(9509189-9509308)
chr7 (107-227)||(16386249-16386369)
chr7 (104-224)||(24702238-24702356)
chr7 (104-224)||(27216860-27216978)
chr7 (104-224)||(44116509-44116627)
chr7 (111-224)||(16213684-16213795)
chr7 (64-224)||(17061919-17062077)
chr7 (47-212)||(1867937-1868101)
chr7 (104-224)||(3386333-3386451)
chr7 (47-205)||(12255733-12255892)
chr7 (45-212)||(14044761-14044928)
chr7 (45-212)||(14354791-14354958)
chr7 (115-224)||(13869346-13869453)
chr7 (107-227)||(26211995-26212115)
chr7 (107-227)||(10589039-10589158)
chr7 (104-224)||(13831373-13831491)
chr7 (104-212)||(15144037-15144143)
chr7 (104-224)||(24704688-24704803)
chr7 (47-227)||(19486686-19486865)
chr7 (104-220)||(38898420-38898535)
chr7 (47-204)||(15008441-15008597)
chr7 (126-225)||(40443393-40443490)
chr7 (4-58)||(16324172-16324226)
chr7 (174-224)||(20110556-20110606)
chr7 (157-227)||(27847881-27847951)
chr7 (103-209)||(10063816-10063921)
chr7 (22-82)||(9389615-9389675)
chr7 (158-221)||(18154894-18154956)
chr7 (98-199)||(14036282-14036384)
chr7 (98-199)||(14346312-14346414)
chr7 (174-223)||(14932802-14932851)
chr7 (174-223)||(15356237-15356286)
chr7 (174-223)||(15360351-15360400)
chr7 (57-141)||(15113028-15113111)
chr7 (174-224)||(26356106-26356156)
chr7 (174-224)||(26358558-26358608)
chr7 (155-201)||(48991206-48991252)
chr7 (174-226)||(2832509-2832561)
chr7 (104-208)||(12756715-12756817)
chr7 (57-141)||(15116565-15116648)
chr7 (158-223)||(12187019-12187083)
chr7 (158-223)||(17138113-17138177)
chr7 (174-223)||(19649557-19649606)
chr7 (158-206)||(9177718-9177766)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (1-227)||(6520368-6520591)
chr8 (1-227)||(38855149-38855372)
chr8 (1-223)||(21285601-21285821)
chr8 (11-212)||(983312-983512)
chr8 (11-227)||(23760751-23760962)
chr8 (57-227)||(5866230-5866395)
chr8 (57-227)||(21490995-21491160)
chr8 (2-213)||(21673718-21673927)
chr8 (2-208)||(37116366-37116572)
chr8 (103-227)||(16092340-16092463)
chr8 (57-227)||(17140916-17141081)
chr8 (2-208)||(17266890-17267096)
chr8 (107-227)||(18818411-18818530)
chr8 (1-208)||(20498581-20498787)
chr8 (107-226)||(28649046-28649164)
chr8 (107-227)||(7372778-7372897)
chr8 (47-223)||(26355643-26355815)
chr8 (113-230)||(6759255-6759371)
chr8 (104-224)||(14409488-14409606)
chr8 (107-227)||(21919002-21919121)
chr8 (11-208)||(24353039-24353235)
chr8 (113-227)||(23406379-23406492)
chr8 (57-227)||(21249384-21249550)
chr8 (57-227)||(21255222-21255388)
chr8 (104-224)||(1484402-1484520)
chr8 (104-224)||(5853336-5853454)
chr8 (104-224)||(15203275-15203393)
chr8 (104-220)||(16413360-16413474)
chr8 (104-224)||(20403227-20403345)
chr8 (107-227)||(20536208-20536327)
chr8 (107-227)||(21923930-21924049)
chr8 (104-224)||(22001753-22001871)
chr8 (107-227)||(22626736-22626854)
chr8 (104-224)||(20046239-20046357)
chr8 (103-227)||(22875065-22875187)
chr8 (104-224)||(41598188-41598306)
chr8 (57-208)||(17439458-17439609)
chr8 (104-224)||(4483281-4483398)
chr8 (104-224)||(4542417-4542535)
chr8 (57-227)||(17612062-17612231)
chr8 (149-227)||(18879275-18879352)
chr8 (2-144)||(22364745-22364885)
chr8 (103-224)||(26219717-26219835)
chr8 (126-227)||(31971257-31971356)
chr8 (47-209)||(13508027-13508188)
chr8 (126-227)||(16199666-16199765)
chr8 (107-227)||(21395984-21396101)
chr8 (107-227)||(21790477-21790594)
chr8 (104-224)||(19896265-19896386)
chr8 (103-224)||(26225291-26225409)
chr8 (119-220)||(45290754-45290853)
chr8 (47-209)||(13597559-13597720)
chr8 (115-230)||(19937061-19937174)
chr8 (107-227)||(21389454-21389571)
chr8 (107-227)||(21778780-21778897)
chr8 (104-226)||(26223917-26224037)
chr8 (126-227)||(45131019-45131117)
chr8 (104-224)||(14823774-14823891)
chr8 (115-211)||(15070571-15070665)
chr8 (104-224)||(25484319-25484430)
chr8 (107-225)||(18678104-18678221)
chr8 (155-208)||(19154936-19154989)
chr8 (104-208)||(19801426-19801527)
chr8 (158-226)||(23648554-23648621)
chr8 (107-225)||(32121734-32121851)
chr8 (98-144)||(40492844-40492890)
chr8 (57-140)||(18862430-18862512)
chr8 (57-140)||(21383896-21383978)
chr8 (57-140)||(21387316-21387398)
chr8 (57-140)||(21411189-21411271)
chr8 (57-140)||(21805681-21805763)
chr8 (57-140)||(21827799-21827881)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-227)||(6020-6244)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (1-227)||(21329394-21329618)
chr5 (1-227)||(21502052-21502277)
chr5 (13-227)||(26011944-26012154)
chr5 (1-208)||(20026837-20027043)
chr5 (47-223)||(21565546-21565720)
chr5 (58-223)||(22959489-22959649)
chr5 (57-227)||(19660791-19660956)
chr5 (47-227)||(19668898-19669073)
chr5 (2-208)||(22178117-22178323)
chr5 (107-227)||(21729066-21729185)
chr5 (107-227)||(21808391-21808510)
chr5 (104-227)||(9077952-9078074)
chr5 (58-208)||(22144068-22144217)
chr5 (118-227)||(21997547-21997655)
chr5 (103-224)||(22412187-22412306)
chr5 (107-224)||(24529223-24529339)
chr5 (104-224)||(264812-264930)
chr5 (104-224)||(10732984-10733102)
chr5 (104-224)||(20909012-20909130)
chr5 (107-227)||(24493569-24493687)
chr5 (107-227)||(25421532-25421651)
chr5 (104-224)||(39363384-39363502)
chr5 (105-227)||(1096467-1096588)
chr5 (107-227)||(8286844-8286964)
chr5 (107-227)||(13025311-13025429)
chr5 (107-227)||(13095495-13095613)
chr5 (107-227)||(23390498-23390617)
chr5 (104-224)||(29329934-29330052)
chr5 (104-224)||(42245409-42245527)
chr5 (104-224)||(36154827-36154942)
chr5 (128-227)||(36314577-36314675)
chr5 (104-224)||(20902053-20902172)
chr5 (115-224)||(39245136-39245243)
chr5 (104-224)||(2154658-2154776)
chr5 (104-224)||(11581243-11581361)
chr5 (107-227)||(25431395-25431513)
chr5 (104-224)||(29345980-29346098)
chr5 (115-224)||(10775731-10775838)
chr5 (104-224)||(29348453-29348571)
chr5 (104-224)||(29350926-29351044)
chr5 (115-221)||(18319089-18319193)
chr5 (107-227)||(22075018-22075138)
chr5 (115-224)||(31061068-31061175)
chr5 (115-224)||(38619434-38619541)
chr5 (104-224)||(32027393-32027511)
chr5 (140-224)||(20918028-20918110)
chr5 (115-223)||(23064512-23064618)
chr5 (47-227)||(40725853-40726032)
chr5 (156-227)||(21293020-21293090)
chr5 (70-174)||(29448055-29448159)
chr5 (104-208)||(37723922-37724023)
chr5 (174-224)||(20806854-20806904)
chr5 (115-221)||(24067110-24067214)
chr5 (174-223)||(26704075-26704124)
chr5 (174-223)||(26973808-26973857)
chr5 (127-217)||(18418590-18418678)
chr5 (174-225)||(17517269-17517320)
chr5 (56-118)||(21741485-21741545)
chr5 (157-211)||(26732884-26732937)
chr5 (103-160)||(20766118-20766174)
chr5 (57-140)||(10753603-10753685)
chr5 (57-140)||(21871525-21871607)
chr5 (140-223)||(21873254-21873336)
chr5 (57-140)||(21875805-21875887)
chr5 (57-140)||(22120149-22120231)
chr5 (157-208)||(26740697-26740747)
chr5 (57-88)||(36314685-36314716)
chr5 (158-208)||(15796438-15796487)
chr5 (158-223)||(22032323-22032387)
chr5 (107-174)||(18356367-18356432)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (1-227)||(23019408-23019630)
chr6 (1-212)||(19668386-19668596)
chr6 (100-212)||(25644335-25644447)
chr6 (57-227)||(28496427-28496592)
chr6 (57-227)||(29808838-29809003)
chr6 (57-212)||(9098466-9098620)
chr6 (47-223)||(19652199-19652371)
chr6 (57-227)||(1561303-1561468)
chr6 (128-227)||(27333241-27333339)
chr6 (128-227)||(27393981-27394079)
chr6 (104-227)||(29060540-29060662)
chr6 (103-227)||(20109140-20109261)
chr6 (104-226)||(30676754-30676874)
chr6 (64-224)||(22782227-22782385)
chr6 (107-227)||(16496244-16496363)
chr6 (107-227)||(17287798-17287917)
chr6 (99-226)||(18409821-18409947)
chr6 (104-227)||(25629354-25629476)
chr6 (104-224)||(12742317-12742435)
chr6 (104-224)||(18334636-18334754)
chr6 (104-224)||(19005046-19005164)
chr6 (104-224)||(19858963-19859081)
chr6 (104-224)||(24422547-24422665)
chr6 (104-224)||(25656629-25656747)
chr6 (104-224)||(33861794-33861912)
chr6 (104-224)||(33864278-33864396)
chr6 (104-227)||(20593773-20593895)
chr6 (113-227)||(20076700-20076812)
chr6 (104-224)||(2291224-2291342)
chr6 (104-224)||(8055029-8055147)
chr6 (104-224)||(25754809-25754927)
chr6 (104-224)||(26924684-26924802)
chr6 (104-227)||(19303540-19303661)
chr6 (104-226)||(34963371-34963491)
chr6 (104-224)||(1540955-1541073)
chr6 (104-224)||(1595549-1595667)
chr6 (107-227)||(20360962-20361081)
chr6 (104-224)||(20556936-20557054)
chr6 (2-227)||(22080637-22080846)
chr6 (104-224)||(25688502-25688620)
chr6 (126-227)||(20638304-20638404)
chr6 (107-227)||(22780229-22780348)
chr6 (2-208)||(23076749-23076955)
chr6 (115-221)||(16448582-16448686)
chr6 (47-227)||(8227453-8227632)
chr6 (104-224)||(3852061-3852179)
chr6 (165-227)||(25714417-25714478)
chr6 (155-227)||(16920679-16920751)
chr6 (104-208)||(18456735-18456837)
chr6 (104-208)||(18461895-18461997)
chr6 (155-227)||(35245586-35245658)
chr6 (2-208)||(35008167-35008373)
chr6 (123-213)||(4185839-4185928)
chr6 (159-227)||(22831503-22831571)
chr6 (123-213)||(4186381-4186470)
chr6 (126-208)||(18821866-18821946)
chr6 (2-83)||(28103796-28103877)
chr6 (164-208)||(11185524-11185568)
chr6 (174-225)||(19848063-19848114)
chr6 (1-55)||(27333182-27333236)
chr6 (1-55)||(27393922-27393976)
chr6 (45-144)||(18696570-18696667)
chr6 (47-175)||(18706356-18706483)
chr6 (174-225)||(23992429-23992480)
chr6 (155-206)||(33443068-33443118)
chr6 (186-230)||(19008799-19008843)
chr6 (57-140)||(22949384-22949466)
chr6 (57-140)||(22953340-22953422)
chr6 (57-140)||(23871828-23871910)
chr6 (57-140)||(23875784-23875866)
chr6 (57-140)||(27325388-27325470)
chr6 (174-223)||(18907111-18907160)
chr6 (174-223)||(19862978-19863027)
chr6 (174-223)||(19873120-19873169)
chr6 (158-223)||(21766695-21766759)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-227)||(932-1155)
[»] chr4 (69 HSPs)
chr4 (1-227)||(39706186-39706409)
chr4 (1-212)||(12288106-12288316)
chr4 (1-208)||(13747-13953)
chr4 (57-227)||(15551817-15551982)
chr4 (47-212)||(52243136-52243302)
chr4 (2-208)||(53082049-53082254)
chr4 (103-224)||(54798752-54798872)
chr4 (107-227)||(7798774-7798893)
chr4 (107-227)||(52873369-52873488)
chr4 (47-212)||(43198495-43198661)
chr4 (70-223)||(12774011-12774160)
chr4 (103-224)||(14280316-14280435)
chr4 (104-224)||(16377522-16377639)
chr4 (2-208)||(46640353-46640558)
chr4 (107-227)||(7088877-7088996)
chr4 (107-227)||(12902757-12902876)
chr4 (104-224)||(18215318-18215436)
chr4 (104-224)||(44928923-44929042)
chr4 (104-224)||(12351-12469)
chr4 (107-227)||(7893703-7893822)
chr4 (104-224)||(15118396-15118514)
chr4 (104-224)||(44773131-44773249)
chr4 (104-224)||(52312510-52312628)
chr4 (104-230)||(19242693-19242817)
chr4 (104-226)||(19618216-19618336)
chr4 (104-224)||(1837553-1837671)
chr4 (104-224)||(3515007-3515125)
chr4 (107-227)||(16270238-16270356)
chr4 (104-224)||(18239463-18239581)
chr4 (104-224)||(44615288-44615406)
chr4 (104-224)||(50222383-50222501)
chr4 (104-224)||(51463912-51464030)
chr4 (47-223)||(8846360-8846550)
chr4 (104-222)||(14038653-14038770)
chr4 (134-227)||(3096293-3096385)
chr4 (111-224)||(23803316-23803427)
chr4 (107-227)||(6899891-6900009)
chr4 (107-227)||(16239972-16240090)
chr4 (107-227)||(44052829-44052948)
chr4 (57-189)||(16596686-16596813)
chr4 (107-225)||(22636437-22636554)
chr4 (103-224)||(8574867-8574985)
chr4 (115-220)||(15355380-15355483)
chr4 (107-220)||(23374361-23374473)
chr4 (104-224)||(44102214-44102332)
chr4 (104-226)||(14970751-14970871)
chr4 (155-227)||(17046487-17046559)
chr4 (126-208)||(6190481-6190563)
chr4 (22-118)||(15099457-15099551)
chr4 (22-118)||(15190424-15190518)
chr4 (165-224)||(7641286-7641344)
chr4 (165-224)||(12610950-12611008)
chr4 (126-227)||(14053323-14053422)
chr4 (115-227)||(15367690-15367800)
chr4 (115-227)||(15370018-15370128)
chr4 (115-227)||(15371202-15371312)
chr4 (115-227)||(15373483-15373593)
chr4 (115-227)||(15402703-15402813)
chr4 (115-227)||(16223532-16223642)
chr4 (104-208)||(21815629-21815731)
chr4 (100-146)||(15464926-15464972)
chr4 (115-221)||(20149832-20149936)
chr4 (104-225)||(22353835-22353955)
chr4 (57-140)||(630728-630810)
chr4 (57-140)||(3331970-3332052)
chr4 (57-140)||(13812763-13812845)
chr4 (57-140)||(14953915-14953997)
chr4 (57-140)||(25690146-25690228)
chr4 (174-226)||(20157527-20157579)
[»] chr3 (93 HSPs)
chr3 (1-227)||(14234487-14234713)
chr3 (1-227)||(15470927-15471147)
chr3 (1-223)||(16097332-16097552)
chr3 (46-223)||(12174204-12174376)
chr3 (57-227)||(13210283-13210448)
chr3 (47-223)||(16103784-16103957)
chr3 (107-227)||(18438534-18438653)
chr3 (1-208)||(37251064-37251270)
chr3 (103-224)||(27165250-27165370)
chr3 (105-227)||(14972854-14972975)
chr3 (2-208)||(22110249-22110454)
chr3 (47-208)||(52523669-52523831)
chr3 (107-227)||(12399209-12399328)
chr3 (116-224)||(53301562-53301669)
chr3 (70-213)||(32307691-32307830)
chr3 (103-209)||(42386428-42386533)
chr3 (107-227)||(23083363-23083482)
chr3 (104-224)||(29172627-29172745)
chr3 (104-227)||(25476384-25476506)
chr3 (107-224)||(24153211-24153326)
chr3 (103-224)||(36166598-36166716)
chr3 (104-224)||(6469178-6469296)
chr3 (104-224)||(9707651-9707769)
chr3 (104-224)||(17463178-17463296)
chr3 (104-224)||(17672626-17672744)
chr3 (107-227)||(20698437-20698556)
chr3 (107-227)||(26686887-26687006)
chr3 (104-224)||(28848655-28848773)
chr3 (104-224)||(34159326-34159444)
chr3 (104-224)||(45606951-45607069)
chr3 (104-224)||(55476491-55476609)
chr3 (109-224)||(55500942-55501055)
chr3 (126-227)||(11424781-11424880)
chr3 (104-224)||(7781391-7781509)
chr3 (104-224)||(8899094-8899212)
chr3 (107-227)||(13442274-13442393)
chr3 (104-224)||(16454325-16454443)
chr3 (107-227)||(17487856-17487975)
chr3 (107-227)||(17499338-17499457)
chr3 (104-224)||(38961935-38962053)
chr3 (123-223)||(49668094-49668193)
chr3 (64-208)||(43925977-43926121)
chr3 (104-224)||(13151834-13151953)
chr3 (104-224)||(13154299-13154418)
chr3 (104-225)||(13544024-13544143)
chr3 (123-223)||(9512924-9513023)
chr3 (123-223)||(9520899-9520998)
chr3 (104-224)||(10247767-10247885)
chr3 (104-220)||(12567564-12567678)
chr3 (104-224)||(15977515-15977633)
chr3 (104-224)||(17446699-17446816)
chr3 (104-224)||(40213720-40213838)
chr3 (64-227)||(43550482-43550644)
chr3 (107-227)||(43840932-43841051)
chr3 (107-213)||(14572603-14572707)
chr3 (104-222)||(16282855-16282971)
chr3 (162-224)||(28194693-28194755)
chr3 (115-224)||(12119780-12119887)
chr3 (115-224)||(15412429-15412536)
chr3 (103-224)||(21618449-21618567)
chr3 (47-227)||(24340665-24340844)
chr3 (104-222)||(41123892-41124005)
chr3 (104-224)||(50242822-50242940)
chr3 (103-209)||(23274705-23274810)
chr3 (115-224)||(8499518-8499625)
chr3 (47-227)||(37642207-37642386)
chr3 (103-224)||(10556985-10557105)
chr3 (123-224)||(44494809-44494908)
chr3 (104-208)||(53070697-53070799)
chr3 (165-224)||(17737236-17737294)
chr3 (107-213)||(14576835-14576939)
chr3 (174-224)||(45577950-45578000)
chr3 (22-118)||(1465329-1465423)
chr3 (99-208)||(12377940-12378050)
chr3 (47-165)||(2051141-2051260)
chr3 (47-227)||(22147467-22147646)
chr3 (104-208)||(606324-606428)
chr3 (70-213)||(1644642-1644780)
chr3 (174-225)||(46822267-46822318)
chr3 (47-117)||(49389573-49389642)
chr3 (174-225)||(12511059-12511110)
chr3 (158-223)||(856140-856204)
chr3 (158-223)||(23077530-23077594)
chr3 (2-67)||(43927291-43927356)
chr3 (174-226)||(14665398-14665450)
chr3 (174-226)||(14668554-14668606)
chr3 (57-140)||(14501207-14501290)
chr3 (57-140)||(19776007-19776089)
chr3 (57-140)||(37439421-37439503)
chr3 (156-206)||(13919350-13919399)
chr3 (174-223)||(15878119-15878168)
chr3 (175-223)||(26196500-26196548)
chr3 (174-226)||(30029841-30029893)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-227)||(12942-13163)
scaffold0138 (10-144)||(18143-18276)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-227)||(32538-32759)
scaffold0034 (126-208)||(51904-51985)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-212)||(10542-10751)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (2-227)||(6535-6758)
scaffold0621 (1-212)||(8481-8693)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-227)||(6611-6835)
scaffold0333 (1-227)||(13991-14215)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-227)||(12766-12990)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (1-223)||(22921766-22921986)
chr1 (1-208)||(21861466-21861672)
chr1 (11-208)||(21896162-21896358)
chr1 (47-227)||(33681010-33681185)
chr1 (47-227)||(22237630-22237805)
chr1 (57-211)||(20918620-20918769)
chr1 (104-226)||(50210212-50210333)
chr1 (57-227)||(14295507-14295672)
chr1 (47-223)||(20248283-20248454)
chr1 (107-224)||(34509783-34509899)
chr1 (2-208)||(50686630-50686836)
chr1 (1-208)||(16368183-16368388)
chr1 (70-213)||(21754059-21754198)
chr1 (2-208)||(41049933-41050138)
chr1 (47-208)||(35261023-35261180)
chr1 (64-227)||(45574846-45575008)
chr1 (20-208)||(50614031-50614219)
chr1 (20-208)||(50621859-50622047)
chr1 (104-224)||(13988866-13988984)
chr1 (104-224)||(21923335-21923453)
chr1 (104-224)||(23593779-23593897)
chr1 (47-212)||(52927925-52928076)
chr1 (48-212)||(16758664-16758828)
chr1 (105-224)||(31612313-31612430)
chr1 (104-225)||(21840766-21840885)
chr1 (104-224)||(21475131-21475249)
chr1 (107-227)||(27250731-27250850)
chr1 (104-224)||(29298137-29298254)
chr1 (104-224)||(433012-433128)
chr1 (112-224)||(22123119-22123230)
chr1 (107-227)||(22532269-22532388)
chr1 (104-224)||(29776688-29776806)
chr1 (124-227)||(20847173-20847275)
chr1 (107-227)||(21026680-21026799)
chr1 (104-226)||(16361915-16362035)
chr1 (64-224)||(21707167-21707325)
chr1 (64-224)||(21711709-21711867)
chr1 (115-227)||(13212917-13213027)
chr1 (158-226)||(20454606-20454673)
chr1 (115-230)||(15860064-15860177)
chr1 (115-230)||(21342090-21342203)
chr1 (115-224)||(16275419-16275526)
chr1 (115-224)||(21346961-21347068)
chr1 (151-227)||(38801433-38801508)
chr1 (57-208)||(16093836-16093987)
chr1 (107-226)||(22468698-22468816)
chr1 (1-118)||(35981585-35981700)
chr1 (22-118)||(49261448-49261542)
chr1 (57-174)||(22130863-22130975)
chr1 (22-119)||(20636956-20637051)
chr1 (115-221)||(40389157-40389261)
chr1 (174-223)||(21714546-21714595)
chr1 (107-226)||(20135188-20135306)
chr1 (57-206)||(26064959-26065107)
chr1 (10-223)||(21161720-21161928)
chr1 (57-151)||(51130639-51130729)
chr1 (174-226)||(24783160-24783212)
chr1 (57-140)||(1924914-1924996)
chr1 (57-140)||(20923928-20924010)
chr1 (104-141)||(12271639-12271676)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-213)||(5657-5867)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-223)||(19268-19488)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-223)||(100378-100598)
scaffold0023 (11-223)||(40081-40291)
scaffold0023 (104-224)||(94411-94529)
scaffold0023 (104-224)||(44454-44573)
scaffold0023 (104-220)||(17484-17598)
scaffold0023 (154-227)||(119875-119948)
scaffold0023 (150-223)||(101503-101576)
scaffold0023 (174-223)||(38547-38596)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (1-223)||(25175854-25176074)
chr2 (1-222)||(28405981-28406201)
chr2 (11-208)||(7639-7835)
chr2 (59-223)||(7679589-7679750)
chr2 (1-212)||(18786799-18787009)
chr2 (104-224)||(22105412-22105531)
chr2 (107-224)||(298816-298933)
chr2 (47-227)||(23708561-23708738)
chr2 (2-208)||(23207296-23207501)
chr2 (107-227)||(23060513-23060632)
chr2 (57-227)||(23071905-23072070)
chr2 (1-208)||(23791292-23791499)
chr2 (104-224)||(6725995-6726113)
chr2 (103-227)||(22337115-22337238)
chr2 (107-227)||(23076442-23076561)
chr2 (2-208)||(25108906-25109112)
chr2 (104-224)||(571397-571515)
chr2 (104-224)||(18808943-18809061)
chr2 (104-224)||(23130862-23130980)
chr2 (104-224)||(23133329-23133447)
chr2 (104-224)||(23135590-23135708)
chr2 (104-224)||(23709576-23709694)
chr2 (104-224)||(23712057-23712175)
chr2 (104-224)||(26505379-26505497)
chr2 (104-224)||(26507857-26507975)
chr2 (104-224)||(34402566-34402684)
chr2 (104-224)||(39682313-39682431)
chr2 (104-226)||(32214965-32215085)
chr2 (104-224)||(24367774-24367892)
chr2 (104-224)||(28577099-28577217)
chr2 (57-227)||(19671830-19671998)
chr2 (109-227)||(22731238-22731355)
chr2 (126-227)||(38136-38235)
chr2 (104-221)||(21155104-21155219)
chr2 (104-224)||(24898239-24898358)
chr2 (104-224)||(24900722-24900841)
chr2 (104-224)||(24903199-24903318)
chr2 (104-224)||(24905676-24905795)
chr2 (104-224)||(24908151-24908270)
chr2 (104-224)||(32039542-32039660)
chr2 (149-227)||(23285865-23285942)
chr2 (104-222)||(43137301-43137417)
chr2 (107-227)||(23660023-23660141)
chr2 (104-224)||(45029898-45030016)
chr2 (107-227)||(20309108-20309225)
chr2 (57-208)||(20520145-20520295)
chr2 (107-227)||(22738182-22738300)
chr2 (104-227)||(23103396-23103516)
chr2 (104-224)||(24529573-24529691)
chr2 (148-227)||(8946657-8946735)
chr2 (47-208)||(22413078-22413240)
chr2 (105-226)||(22134208-22134326)
chr2 (104-224)||(38967374-38967493)
chr2 (163-227)||(23040247-23040310)
chr2 (107-227)||(23654388-23654507)
chr2 (126-208)||(32451949-32452031)
chr2 (165-221)||(24643054-24643109)
chr2 (47-208)||(24697548-24697709)
chr2 (98-208)||(23004767-23004878)
chr2 (57-141)||(22459514-22459598)
chr2 (107-220)||(25616192-25616304)
chr2 (156-206)||(23287384-23287433)
chr2 (157-206)||(26392403-26392451)
chr2 (57-140)||(1283666-1283748)
chr2 (57-140)||(30344776-30344858)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-147)||(8094-8239)
scaffold0556 (1-213)||(6826-7033)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-223)||(2542-2762)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-223)||(1086-1306)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (47-212)||(10484-10647)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (14-212)||(7983-8180)
scaffold0218 (59-180)||(29238-29354)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (47-212)||(22613-22776)
scaffold0037 (104-224)||(82072-82190)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (47-223)||(45735-45909)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-213)||(129919-130129)
scaffold0010 (100-208)||(60710-60818)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (47-223)||(160688-160861)
scaffold0001 (104-220)||(501088-501202)
scaffold0001 (115-224)||(85635-85742)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (3-223)||(14596-14814)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (47-223)||(133-307)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-209)||(62216-62419)
scaffold0028 (104-224)||(136680-136798)
scaffold0028 (104-224)||(139149-139267)
scaffold0028 (104-224)||(144087-144205)
scaffold0028 (104-224)||(134211-134329)
scaffold0028 (104-224)||(141618-141736)
scaffold0028 (120-223)||(132662-132765)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (57-224)||(15664-15826)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (57-227)||(11292-11457)
scaffold0046 (57-227)||(1997-2162)
scaffold0046 (107-227)||(28414-28533)
scaffold0046 (171-227)||(4552-4608)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (2-208)||(128867-129072)
scaffold0022 (2-204)||(78345-78545)
scaffold0022 (103-224)||(116430-116548)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (104-226)||(3185-3306)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (10-208)||(6188-6386)
scaffold0420 (161-208)||(13793-13840)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-208)||(12587-12792)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-208)||(136264-136471)
scaffold0021 (1-208)||(144972-145179)
scaffold0021 (104-226)||(174767-174886)
scaffold0021 (157-227)||(121766-121835)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (57-227)||(1025-1190)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (2-204)||(38339-38541)
scaffold0139 (174-223)||(19980-20029)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (103-224)||(44705-44825)
scaffold0122 (104-220)||(26064-26179)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (103-224)||(38700-38820)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-223)||(2701-2923)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (103-227)||(3149-3271)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (100-212)||(27744-27855)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-208)||(53445-53651)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (91-227)||(15763-15898)
scaffold0020 (174-223)||(178898-178947)
scaffold0020 (1-36)||(15729-15764)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-212)||(103535-103737)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (2-208)||(19782-19987)
scaffold0080 (107-227)||(39913-40031)
scaffold0080 (57-140)||(48939-49021)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (104-226)||(17214-17337)
scaffold0056 (104-208)||(79328-79430)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (100-212)||(16095-16206)
scaffold0357 (102-208)||(13147-13252)
scaffold0357 (156-208)||(2680-2732)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (103-225)||(39479-39599)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (103-225)||(75213-75333)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (5-208)||(97024-97227)
scaffold0006 (5-208)||(106302-106505)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (103-208)||(1051-1155)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (1-169)||(2115-2281)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (107-227)||(4849-4968)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (57-227)||(34123-34288)
scaffold0175 (107-177)||(13141-13211)
scaffold0175 (174-227)||(273-326)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (107-227)||(51913-52032)
scaffold0011 (107-227)||(167980-168099)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (104-227)||(16113-16235)
scaffold0120 (107-227)||(32959-33077)
scaffold0120 (107-227)||(45928-46046)
scaffold0120 (165-227)||(17389-17450)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (57-212)||(25121-25275)
scaffold0123 (47-144)||(620-715)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (107-224)||(22886-23001)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (104-224)||(13392-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (104-224)||(20747-20865)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (107-227)||(13211-13330)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (104-224)||(37821-37939)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (104-224)||(158494-158612)
scaffold0003 (104-224)||(339949-340065)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (100-227)||(8479-8605)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (104-227)||(16599-16721)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (104-225)||(10772-10891)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (104-224)||(4694-4812)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (107-227)||(3470-3589)
scaffold0292 (107-227)||(343-461)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (104-224)||(13947-14065)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (107-227)||(32942-33060)
scaffold0145 (104-229)||(9744-9867)
scaffold0145 (107-227)||(38761-38879)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (104-224)||(16784-16902)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (107-227)||(1851-1970)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (107-227)||(8535-8650)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (123-227)||(23901-24001)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (104-226)||(11286-11406)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (3-177)||(54-228)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (47-227)||(11464-11643)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (47-227)||(38198-38377)
scaffold0124 (57-140)||(24605-24690)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (107-227)||(1050-1169)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (103-227)||(4508-4630)
scaffold0228 (103-227)||(12090-12212)
scaffold0228 (103-227)||(22042-22164)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (104-224)||(40400-40518)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (103-227)||(25896-26018)
scaffold0026 (103-227)||(39858-39980)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (107-227)||(6123-6245)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (120-223)||(32102-32205)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (104-226)||(12293-12413)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (107-227)||(10427-10544)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (115-224)||(4214-4321)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-206)||(7955-8161)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (104-225)||(9241-9360)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (104-224)||(29931-30050)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-208)||(267679-267872)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (135-227)||(4712-4803)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (107-209)||(24304-24406)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-208)||(569-774)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (157-227)||(1289-1359)
scaffold0106 (155-227)||(7266-7338)
scaffold0106 (158-224)||(15291-15356)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (104-221)||(4300-4415)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (124-227)||(16282-16382)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (47-227)||(17969-18148)
scaffold0247 (115-224)||(2184-2291)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (104-224)||(106-224)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (3-208)||(1696-1900)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (107-227)||(1952-2071)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (107-227)||(20910-21030)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (155-227)||(51582-51654)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (148-227)||(13497-13575)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (156-227)||(32067-32137)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (104-224)||(12064-12176)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (126-227)||(15485-15584)
scaffold0114 (158-223)||(7295-7359)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (104-224)||(161133-161252)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (107-206)||(4545-4643)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (150-223)||(28813-28887)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (115-221)||(1336-1440)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (157-227)||(46995-47065)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (126-227)||(11464-11564)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (155-227)||(1098-1170)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (104-208)||(20423-20524)
scaffold0031 (107-227)||(128751-128869)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (161-224)||(5183-5246)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (160-227)||(4888-4954)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (123-208)||(2694-2780)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (47-169)||(225465-225585)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (174-223)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (174-223)||(36454-36503)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (104-163)||(3529-3588)
scaffold0327 (173-223)||(289-339)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (165-208)||(11982-12024)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (174-223)||(29558-29607)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (57-151)||(2398-2488)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (57-140)||(6-88)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (103-145)||(27911-27953)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (156-206)||(206575-206624)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (158-223)||(1881-1945)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (174-223)||(159-208)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (158-223)||(10575-10639)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (174-223)||(21871-21920)
scaffold0210 (174-223)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (174-223)||(69794-69843)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22073129 - 22072913
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22073129 tgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagat 22073030  T
Q  111 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22073029 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagtt 22072930  T
Q  211 gattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  22072929 gattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 811028 - 811248
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  811028 tttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttga 811126  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  811127 tgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtc 811225  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  811226 ggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47832031 - 47831807
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  47832031 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatga-attatgtttga 47831933  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831932 tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 47831834  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  47831833 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 16219614 - 16219835
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16219614 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttga 16219712  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16219713 tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtc 16219811  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||   |||||||||||||    
T  16219812 ggtctaagttg---aagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16056551 - 16056343
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16056551 tttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttga 16056453  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16056452 tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg--tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtc 16056355  T
Q  201 ggtctaagttga 212  Q
    ||||||||||||    
T  16056354 ggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 67968 - 67745
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  67968 tttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttg 67871  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67870 at-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 67773  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  67772 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18005870 - 18005650
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  18005870 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-g 18005773  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005772 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttc-catactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 18005674  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  18005673 cggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44014398 - 44014182
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  44014398 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaatt-atgtt-ga 44014301  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    | |||||||||||| |   || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014300 tatttgagatgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 44014205  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  44014204 ggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34200951 - 34200786
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  34200951 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 34200857  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34200856 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12901548 - 12901338
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  12901548 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtatga 12901450  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || ||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12901449 tg-ttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagt 12901351  T
Q  200 cggtctaagttga 212  Q
    |||| ||||||||    
T  12901350 cggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564482
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  3564462 ctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 11995983 - 11996148
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11995983 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtttgatatttgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcat 11996077  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11996078 actgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495402
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 16495473  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16495472 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 28505254 - 28505419
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||   ||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  28505254 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtttgataattgag---ttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggttt-gcat 28505348  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28505349 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 15754843 - 15755008
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  15754843 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 15754937  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  15754938 actacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273392
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Original strand, 2280117 - 2280238
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2280117 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 2280215  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  2280216 tctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13647447 - 13647325
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647447 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 13647349  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| || | || ||||||||||    
T  13647348 ctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38227599 - 38227481
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227599 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 38227502  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  38227501 agtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12698951 - 12698831
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 205  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698951 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12698853  T
Q  206 aagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  12698852 aagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Original strand, 18456415 - 18456530
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456415 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18456512  T
Q  207 agttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18456513 agttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 456439 - 456321
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  456439 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 456342  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  456341 ctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11972614 - 11972496
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972614 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11972517  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11972516 ctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 14949166 - 14949284
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949166 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 14949263  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14949264 ctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 15376757 - 15376875
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376757 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15376854  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15376855 ctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16232638 - 16232520
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232638 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16232541  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16232540 ctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16410177 - 16410059
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410177 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16410080  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16410079 ctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18640390 - 18640272
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640390 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18640293  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18640292 ctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 20385167 - 20385285
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385167 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20385264  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20385265 ctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 21189639 - 21189757
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189639 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21189736  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21189737 ctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275175
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  204 ctaagttgattaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  24275191 ctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32125609 - 32125491
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125609 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 32125512  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32125511 ctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41523035 - 41522917
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523035 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 41522938  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41522937 ctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41525497 - 41525379
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525497 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 41525400  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41525399 ctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 223
Target Start/End: Original strand, 11393331 - 11393448
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393331 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11393428  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11393429 ctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18430830 - 18430709
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430830 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18430733  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18430732 ctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 20220087 - 20220290
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||    
T  20220087 ttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatga-attatatatgat 20220185  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  20220186 gtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagt 20220281  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  20220282 cggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9509308 - 9509189
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509308 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 9509210  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  9509209 agttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 16386249 - 16386369
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386249 agatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16386348  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  16386349 agttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24702356 - 24702238
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702356 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24702259  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24702258 ctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27216978 - 27216860
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27216978 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 27216881  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27216880 ctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44116627 - 44116509
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44116627 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggt 44116530  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44116529 ctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213684
Alignment:
Q  111 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 210  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T
Q  211 gattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||    
T  16213697 gattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062077
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 162  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||     
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtta-ataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgcta-ttttgtatactgct 17062016  T
Q  163 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062017 ga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 1867937 - 1868101
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 144  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||      
T  1867937 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgag 1868034  T
Q  145 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868035 ctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3386451 - 3386333
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386451 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 3386354  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3386353 ctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Original strand, 12255733 - 12255892
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| ||| || || | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  12255733 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaatt-atatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatga 12255831  T
Q  146 -tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 205  Q
     | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255832 attgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14044928 - 14044761
Alignment:
Q  45 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcat 143  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||     
T  14044928 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcag 14044831  T
Q  144 g--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    |  ||| ||||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044830 gagctg-ttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14354958 - 14354791
Alignment:
Q  45 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcat 143  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||     
T  14354958 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcag 14354861  T
Q  144 g--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    |  ||| ||||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354860 gagctg-ttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13869453 - 13869346
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 13869356  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  13869355 aagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26212115 - 26211995
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26212115 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtcta 26212017  T
Q  207 agttgattaag-atgatgatgt 227  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  26212016 agttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589039
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 10589060  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||   |||||||||||||    
T  10589059 agttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13831491 - 13831373
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831491 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13831394  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  13831393 ctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 212
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144143
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  204 ctaagttga 212  Q
    |||||||||    
T  15144135 ctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24704803 - 24704688
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || || |   |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704803 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt---tttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24704709  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24704708 ctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486865
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 19486784  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  19486785 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 220
Target Start/End: Original strand, 38898420 - 38898535
Alignment:
Q  104 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38898420 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 38898517  T
Q  203 tctaagttgattaagatg 220  Q
    | ||||||||||||||||    
T  38898518 tttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 204
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 144  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaatt-atatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaa 15008538  T
Q  145 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 204  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008539 ctg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40443490 - 40443393
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  40443490 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16324226 - 16324172
Alignment:
Q  4 atctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgcta 58  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324226 atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgcta 16324172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847951
Alignment:
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 209
Target Start/End: Original strand, 10063816 - 10063921
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||| ||||   || |||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  10063816 tttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcag 10063914  T
Q  203 tctaagt 209  Q
    |||||||    
T  10063915 tctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Original strand, 9389615 - 9389675
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacatt 82  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9389615 cagtaagcctggattgtatattctaatattgatgataatgttatataattgtatatacatt 9389675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 221
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154956
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14036384 - 14036282
Alignment:
Q  98 tgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 194  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14036384 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 14036287  T
Q  195 tgagt 199  Q
    |||||    
T  14036286 tgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14346414 - 14346312
Alignment:
Q  98 tgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 194  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14346414 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 14346317  T
Q  195 tgagt 199  Q
    |||||    
T  14346316 tgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932851
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356286
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360400
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15113111 - 15113028
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15113111 taatgtgatataattgtatatatattacttgagtt-atatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Original strand, 26356106 - 26356156
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26356106 ttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Original strand, 26358558 - 26358608
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26358558 ttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991206
Alignment:
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 12756715 - 12756817
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12756715 ttgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaactgctcgagtcggt 12756812  T
Q  204 ctaag 208  Q
    |||||    
T  12756813 ctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15116648 - 15116565
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 141  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||   ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  15116648 taatgtgatataattgtatatatattacttgagtt-atatgtgaatattgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12187083 - 12187019
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12187083 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Original strand, 17138113 - 17138177
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  17138113 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 206
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177766
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtcta 9177766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6520591 - 6520368
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  6520591 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatg-ttga 6520494  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520493 tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 6520395  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6520394 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 38855149 - 38855372
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  38855149 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttga 38855246  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    | |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855247 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 38855345  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38855346 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21285821 - 21285601
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  21285821 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatgaact-atgtttga 21285723  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21285722 tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtc 21285624  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  21285623 ggtctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Original strand, 983312 - 983512
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagat 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  983312 tgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgat 983409  T
Q  111 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983410 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttg-tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T
Q  209 ttga 212  Q
    ||||    
T  983509 ttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 23760751 - 23760962
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||    
T  23760751 tgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatatttgaga 23760848  T
Q  110 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 209  Q
    ||||||||| ||  |||  |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760849 tgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgattta-catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23760947  T
Q  210 tgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||   |||||||||||||    
T  23760948 tg---aagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 5866230 - 5866395
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  5866230 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 5866324  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5866325 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21491160 - 21490995
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  21491160 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatgg-tttgcat 21491066  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21491065 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21673927 - 21673718
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | || || || ||    
T  21673927 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaatt-atatt-ga 21673830  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    | |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21673829 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtc 21673731  T
Q  201 ggtctaagttgat 213  Q
    |||||||||||||    
T  21673730 ggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37116572 - 37116366
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||    
T  37116572 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgat 37116474  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37116473 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 37116375  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  37116374 cggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Original strand, 16092340 - 16092463
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16092340 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 16092438  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  16092439 tctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17141081 - 17140916
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||  ||||||    
T  17141081 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatgg-attgcat 17140987  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17140986 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 17266890 - 17267096
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||  |||| | ||||    
T  17266890 ttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaaga-attatatatgat 17266988  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    |||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17266989 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 17267088  T
Q  201 ggtctaag 208  Q
    ||||||||    
T  17267089 ggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 18818411 - 18818530
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818411 agatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18818509  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  18818510 agttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20498787 - 20498581
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg- 99  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||     
T  20498787 tttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttga-attatatatga 20498689  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  20498688 atgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagt 20498590  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  20498589 cggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Original strand, 28649046 - 28649164
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649046 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28649144  T
Q  207 agttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  28649145 agttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7372897 - 7372778
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372897 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7372799  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  7372798 agttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Original strand, 26355643 - 26355815
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || |    
T  26355643 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatg-gaatatgtt-gatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgat 26355739  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26355740 gattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759255
Alignment:
Q  113 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6759273  T
Q  213 ttaagatgatgatgtcca 230  Q
    | ||||||||||||||||    
T  6759272 tgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 14409488 - 14409606
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409488 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 14409585  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14409586 ctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 21919002 - 21919121
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919002 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21919100  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  21919101 agttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24353235 - 24353039
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||  | |  ||||||||||||    
T  24353235 tgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattg-tatacgatgtttgagat 24353137  T
Q  111 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353136 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406379
Alignment:
Q  113 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23406394  T
Q  213 ttaagatgatgatgt 227  Q
    | |||||||||||||    
T  23406393 tgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21249550 - 21249384
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||    
T  21249550 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat-gaattgcat 21249456  T
Q  157 actgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21249455 actgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21255388 - 21255222
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||    
T  21255388 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat-gaattgcat 21255294  T
Q  157 actgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21255293 actgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1484520 - 1484402
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484520 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 1484423  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1484422 ctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 5853336 - 5853454
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853336 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 5853433  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5853434 ctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 15203275 - 15203393
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15203275 ttgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgct 15203372  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15203373 ctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 220
Target Start/End: Original strand, 16413360 - 16413474
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16413457  T
Q  204 ctaagttgattaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  16413458 ctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20403345 - 20403227
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403345 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20403248  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20403247 ctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20536327 - 20536208
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536327 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20536229  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  20536228 agttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 21923930 - 21924049
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923930 agatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21924028  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  21924029 agttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22001871 - 22001753
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001871 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 22001774  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22001773 ctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22626854 - 22626736
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626854 agatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22626757  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22626756 agttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 20046239 - 20046357
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046239 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20046336  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20046337 ctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22875187 - 22875065
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  22875187 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcgg 22875090  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22875089 tctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41598306 - 41598188
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41598306 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggt 41598209  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41598208 ctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 17439458 - 17439609
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 154  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||      
T  17439458 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttat 17439555  T
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
     |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439556 gtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4483398 - 4483281
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483398 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggt 4483302  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4483301 ctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 4542417 - 4542535
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542417 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 4542514  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4542515 ctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 17612062 - 17612231
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 155  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||| || |||||||    
T  17612062 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgca 17612159  T
Q  156 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  17612160 tactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 18879275 - 18879352
Alignment:
Q  149 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18879275 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22364885 - 22364745
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||    
T  22364885 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgat 22364787  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 144  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  22364786 gtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatg 22364745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26219835 - 26219717
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||  ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26219835 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatacta-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 26219739  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  26219738 tctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971257
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 31971259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508188
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 13508125  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 209  Q
    || || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508126 tg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 227
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199765
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396101
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21396080  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || || | |||||||||||||    
T  21396081 agatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790594
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21790573  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || || | |||||||||||||    
T  21790574 agatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19896386 - 19896265
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttata---tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    |||||||| ||||| |||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19896386 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 19896289  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19896288 ggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Original strand, 26225291 - 26225409
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26225291 tttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactg-ttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 26225387  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26225388 tctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 220
Target Start/End: Original strand, 45290754 - 45290853
Alignment:
Q  119 cttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 218  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290754 cttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 45290851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 13597559 - 13597720
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||| ||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  13597559 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 13597657  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 209  Q
    || |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597658 tg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937174
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 19937158  T
Q  215 aagatgatgatgtcca 230  Q
    |||||||||| |||||    
T  19937159 aagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389571
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21389550  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || || | |||||||||||||    
T  21389551 agatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778897
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21778876  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || || | |||||||||||||    
T  21778877 agatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26224037 - 26223917
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| | | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  26224037 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctt-tattgctgtt-gttatttaattaagctgcatgggtcgat 26223940  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  26223939 ctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 227
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131117
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 45131115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14823891 - 14823774
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  14823891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgttg-ttgttatttaactttgctgcatgagt-ggt 14823795  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  14823794 ctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070571
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 211  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 25484319 - 25484430
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||         |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25484319 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta--------gctgtt-gttatttaactaagctgcacgagttggt 25484409  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25484410 ctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Original strand, 18678104 - 18678221
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18678104 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtcta 18678202  T
Q  207 agttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  18678203 agttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 208
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154989
Alignment:
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 19801426 - 19801527
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19801426 ttgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggt 19801522  T
Q  204 ctaag 208  Q
    |||||    
T  19801523 ctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23648621 - 23648554
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23648621 ctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32121851 - 32121734
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  32121851 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattcta 32121753  T
Q  207 agttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  32121752 agttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 144
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492890
Alignment:
Q  98 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 144  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 40492890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 18862430 - 18862512
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  18862430 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 18862512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383896
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21383896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21387398 - 21387316
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21387398 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21387316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21411271 - 21411189
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21411271 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21411189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 21805763 - 21805681
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21805763 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21805681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 21827799 - 21827881
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21827799 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21827881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 6020 - 6244
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6020 tttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttga 6118  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6119 tgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 6217  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6218 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21329394 - 21329618
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21329394 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttga 21329492  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329493 tgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 21329591  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21329592 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21502052 - 21502277
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21502052 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttg 21502150  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    |||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21502151 atgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattta-catactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 21502249  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502250 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 26011944 - 26012154
Alignment:
Q  13 ttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26011944 ttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgt 26012042  T
Q  113 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012043 tgttgattcacatttgatattgttatatcatg-ttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T
Q  213 ttaagatgatgatgt 227  Q
      |||||||||||||    
T  26012142 --aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 20026837 - 20027043
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20026837 tttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaatt-atgtttga 20026935  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 198  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026936 tgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactg-ttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 20027033  T
Q  199 tcggtctaag 208  Q
    ||||||||||    
T  20027034 tcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21565720 - 21565546
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  21565720 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 21565622  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21565621 gatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 58 - 223
Target Start/End: Original strand, 22959489 - 22959649
Alignment:
Q  58 aatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcata 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || ||||  |||||||||||||||| || ||| |||||    
T  22959489 aatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcata 22959583  T
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22959584 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 19660791 - 19660956
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||| ||| |||||  |||||||| | ||| |||||||    
T  19660791 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatgg-tttgcat 19660885  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19660886 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19669073 - 19668898
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| ||||||||||||||| | |    
T  19669073 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgat 19668978  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19668977 gattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 22178117 - 22178323
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||   ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||    
T  22178117 ttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgat 22178215  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  22178216 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagt 22178314  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  22178315 cggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 21729066 - 21729185
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729066 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21729164  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  21729165 agttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 21808391 - 21808510
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808391 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21808489  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  21808490 agttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077952
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  9077975 ctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22144217 - 22144068
Alignment:
Q  58 aatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22144217 aatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatg-ttgttttgcat 22144120  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144119 actacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 227
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  118 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 217  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21997645  T
Q  218 atgatgatgt 227  Q
    ||||||||||    
T  21997646 atgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22412306 - 22412187
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22412306 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcgg 22412209  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22412208 tctaagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529223
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  207 agttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  24529240 agttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 264812 - 264930
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  264812 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 264909  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  264910 ctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 10732984 - 10733102
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732984 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 10733081  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10733082 ctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20909130 - 20909012
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909130 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 20909033  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20909032 ctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24493687 - 24493569
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24493687 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtcta 24493590  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  24493589 agttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25421651 - 25421532
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421651 agatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25421553  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  25421552 agttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39363502 - 39363384
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363502 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 39363405  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39363404 ctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1096588 - 1096467
Alignment:
Q  105 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096588 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1096490  T
Q  205 taagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  1096489 taagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 8286844 - 8286964
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 205  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286844 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8286942  T
Q  206 aagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  8286943 aagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13025429 - 13025311
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13025429 agatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtcta 13025332  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  13025331 agttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13095613 - 13095495
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13095613 agatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtcta 13095516  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  13095515 agttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 23390498 - 23390617
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390498 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23390596  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23390597 agttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29330052 - 29329934
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330052 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29329955  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29329954 ctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 42245409 - 42245527
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42245409 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 42245506  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42245507 ctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 36154827 - 36154942
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154827 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 36154921  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36154922 ctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  128 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 20902053 - 20902172
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902053 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20902150  T
Q  204 ctaagttg-attaagatgatga 224  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  20902151 ctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39245243 - 39245136
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245243 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 39245146  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  39245145 aagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 2154658 - 2154776
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154658 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 2154755  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2154756 ctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 11581243 - 11581361
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581243 ttgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11581340  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11581341 ctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25431513 - 25431395
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25431513 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtcta 25431415  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    | || || |||||||||||||    
T  25431414 a-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29346098 - 29345980
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346098 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggt 29346001  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29346000 ctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Original strand, 10775731 - 10775838
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775731 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 10775828  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  10775829 aagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29348571 - 29348453
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348571 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggt 29348474  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29348473 ctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29351044 - 29350926
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29351044 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggt 29350947  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29350946 ctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 18319089 - 18319193
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18319089 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatt 18319186  T
Q  215 aagatga 221  Q
    |||||||    
T  18319187 aagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22075138 - 22075018
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22075138 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtcta 22075040  T
Q  207 agttgattaag-atgatgatgt 227  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  22075039 agttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31061068
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 31061078  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  31061077 aagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619434
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 38619444  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  38619443 aagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32027511 - 32027393
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  32027511 ttgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggt 32027414  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32027413 ctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 224
Target Start/End: Original strand, 20918028 - 20918110
Alignment:
Q  140 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918028 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064512
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 23064521  T
Q  215 aagatgatg 223  Q
    |||||||||    
T  23064520 aagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725853
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 40725934  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  40725933 tgcttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293090
Alignment:
Q  156 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448055
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgt 167  Q
    |||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaatt-acgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagct-gttttatatactgcctatgt 29448062  T
Q  168 tgctgtt 174  Q
    |||||||    
T  29448061 tgctgtt 29448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37724023 - 37723922
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||  | || ||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37724023 ttgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagt 37723927  T
Q  204 ctaag 208  Q
    |||||    
T  37723926 ctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24067214 - 24067110
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  24067214 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgatt 24067117  T
Q  215 aagatga 221  Q
    |||||||    
T  24067116 aagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704075
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973808
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  127 tgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 217  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgtt-gttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 225
Target Start/End: Original strand, 17517269 - 17517320
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17517269 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 118
Target Start/End: Original strand, 21741485 - 21741545
Alignment:
Q  56 ctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21741485 ctaatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 21741545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 211  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Original strand, 20766118 - 20766174
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  20766118 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10753685 - 10753603
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  10753685 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 10753603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 21871525 - 21871607
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21871525 taatgttatataattcgatatatattgcatgaatt-atgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21871607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21873336 - 21873254
Alignment:
Q  140 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21873336 tcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21873254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 21875805 - 21875887
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21875805 taatgttatataattcgatatatattgcatgaatt-atgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21875887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 22120149 - 22120231
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22120149 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgttcatttgtaattgttatat 22120231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 208
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 36314716 - 36314685
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatga 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314716 taatgttatataattgtatatacattacatga 36314685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796438
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaag 15796438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22032387 - 22032323
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  22032387 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18356432 - 18356367
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt 174  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  18356432 agatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--tttgtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23019630 - 23019408
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23019630 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttga 23019532  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  23019531 tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtc 23019433  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||    
T  23019432 ggtctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19668596 - 19668386
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | || |||    
T  19668596 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaatt-acgtatga 19668498  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 198  Q
    |||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19668497 tgtt-gtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgag 19668400  T
Q  199 tcggtctaagttga 212  Q
    ||||||||||||||    
T  19668399 tcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25644447 - 25644335
Alignment:
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25644447 atgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagt 25644348  T
Q  200 cggtctaagttga 212  Q
    |||||||||||||    
T  25644347 cggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 28496427 - 28496592
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  28496427 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 28496521  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28496522 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 29808838 - 29809003
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  29808838 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 29808932  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  29808933 actgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Original strand, 9098466 - 9098620
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggttttgca 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  9098466 taatgttatataattatatatacattacatgaatt-atgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgca 9098563  T
Q  156 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098564 tactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19652371 - 19652199
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |    
T  19652371 atgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatg-gattatgtt-gatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgat 19652275  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19652274 gattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1561468 - 1561303
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  1561468 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 1561374  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  1561373 actacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 227
Target Start/End: Original strand, 27333241 - 27333339
Alignment:
Q  128 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333241 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 128 - 227
Target Start/End: Original strand, 27393981 - 27394079
Alignment:
Q  128 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393981 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060540
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    
T  29060563 ctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20109261 - 20109140
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20109261 tttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 20109163  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  20109162 tctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 30676754 - 30676874
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676754 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 30676851  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  30676852 ctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782227
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 162  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||| ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||     
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaatt-atgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc- 22782288  T
Q  163 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782287 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16496363 - 16496244
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496363 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16496265  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  16496264 agttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 17287798 - 17287917
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287798 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17287896  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17287897 agttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 226
Target Start/End: Original strand, 18409821 - 18409947
Alignment:
Q  99 gatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 198  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18409821 gatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgag 18409919  T
Q  199 tcggtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409920 tcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629476
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggt 25629452  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  25629453 ctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12742435 - 12742317
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742435 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 12742338  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12742337 ctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 18334636 - 18334754
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334636 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18334733  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18334734 ctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19005164 - 19005046
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005164 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19005067  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19005066 ctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 19858963 - 19859081
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858963 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19859060  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19859061 ctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24422665 - 24422547
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422665 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24422568  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24422567 ctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25656747 - 25656629
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656747 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 25656650  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25656649 ctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33861912 - 33861794
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861912 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 33861815  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33861814 ctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33864396 - 33864278
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864396 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 33864299  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33864298 ctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593773
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  20593796 ctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076700
Alignment:
Q  113 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20076715  T
Q  213 ttaagatgatgatgt 227  Q
    | |||||||||||||    
T  20076714 tgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 2291224 - 2291342
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291224 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 2291321  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2291322 ctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8055147 - 8055029
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055147 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8055050  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8055049 ctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25754927 - 25754809
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754927 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 25754830  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25754829 ctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 26924684 - 26924802
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924684 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26924781  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26924782 ctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303661
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19303637  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| |||| |||||||||||||    
T  19303638 ctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34963491 - 34963371
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34963491 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 34963394  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  34963393 ctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 1540955 - 1541073
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1540955 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgat 1541052  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1541053 ctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1595667 - 1595549
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1595667 ttgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 1595570  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1595569 ctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 20360962 - 20361081
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20360962 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 20361060  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| || ||||||||||    
T  20361061 agttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 20556936 - 20557054
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  20556936 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 20557033  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20557034 ctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 22080637 - 22080846
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||   ||    
T  22080637 ttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatattaatt-atgac-ga 22080734  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgact-tacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||    
T  22080735 tgtttgagatgttgtt--ctgtgcattcgatattgttatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgtt-------------taactaagctgcatgagt 22080818  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22080819 cggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688502
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25688522 ctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 227
Target Start/End: Original strand, 20638304 - 20638404
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20638304 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 20638402  T
Q  226 gt 227  Q
    ||    
T  20638403 gt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 22780229 - 22780348
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22780229 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 22780327  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22780328 agttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23076955 - 23076749
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||    
T  23076955 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgat 23076857  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||| || ||||||||| |  || |||||||| |||||||  | |  |||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23076856 gtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 23076757  T
Q  201 ggtctaag 208  Q
    ||||||||    
T  23076756 ggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 16448582 - 16448686
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16448582 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatt 16448679  T
Q  215 aagatga 221  Q
    |||||||    
T  16448680 aagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227632
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 8227551  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  8227552 tg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 3852061 - 3852179
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3852061 ttgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggt 3852158  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3852159 ctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  165 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 16920679 - 16920751
Alignment:
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  16920679 atactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18456837 - 18456735
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456837 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18456740  T
Q  204 ctaag 208  Q
    |||||    
T  18456739 ctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18461997 - 18461895
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461997 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18461900  T
Q  204 ctaag 208  Q
    |||||    
T  18461899 ctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35245658 - 35245586
Alignment:
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35008373 - 35008167
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||    
T  35008373 ttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaatt-atatatgat 35008275  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||| || |||| |||| |  || |||||||| |||||||  | |  |||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35008274 gtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 35008175  T
Q  201 ggtctaag 208  Q
    ||||||||    
T  35008174 ggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 213
Target Start/End: Original strand, 4185839 - 4185928
Alignment:
Q  123 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185839 cattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831503
Alignment:
Q  159 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4186470 - 4186381
Alignment:
Q  123 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4186470 cattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4186381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821946
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103877
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacatta 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 28103877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185524
Alignment:
Q  164 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 225
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848114
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 27333182 - 27333236
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 55  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27333182 tttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttg 27333236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 27393922 - 27393976
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 55  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27393922 tttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttg 27393976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18696667 - 18696570
Alignment:
Q  45 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 144  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  18696667 taatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgttggagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 18696570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18706483 - 18706356
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||      
T  18706483 atgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttaagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaa 18706386  T
Q  145 ctggttttgcatactgcctatgttgctgttt 175  Q
    || |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  18706385 ct-gttttatatattgcctatgttgctgttt 18706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23992480 - 23992429
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23992480 ttgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33443118 - 33443068
Alignment:
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443118 atactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  186 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 230  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22949466 - 22949384
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22949466 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 22949384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22953422 - 22953340
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22953422 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 22953340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23871910 - 23871828
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  23871910 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 23871828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23875866 - 23875784
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  23875866 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 23875784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 27325388 - 27325470
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| | || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  27325388 taatgttatataattatatatatattgcattaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 27325470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18907160 - 18907111
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  18907160 ttgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19873169 - 19873120
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873169 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766695
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 932 - 1155
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  932 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgta-aatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttga 1029  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||  ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1030 tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatct-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1128  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1129 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 69)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 39706186 - 39706409
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  39706186 tttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtt-ga 39706283  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706284 tgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 39706382  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  39706383 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 12288106 - 12288316
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12288106 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtttga 12288204  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 198  Q
    || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288205 tg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 12288302  T
Q  199 tcggtctaagttga 212  Q
    ||||||||||||||    
T  12288303 tcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 13747 - 13953
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | |||    
T  13747 tttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atatatga 13845  T
Q  101 -tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
     | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13846 atatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 13944  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  13945 cggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15551982 - 15551817
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||    
T  15551982 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatgg-attgcat 15551888  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15551887 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 52243136 - 52243302
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| || | |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  52243136 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttg-gattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatga 52243234  T
Q  145 -ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243235 act-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 53082049 - 53082254
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||    
T  53082049 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgat 53082147  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||  || |||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  53082148 gtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 53082245  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  53082246 cggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Original strand, 54798752 - 54798872
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54798752 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcgg 54798850  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  54798851 tctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7798893 - 7798774
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798893 agatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7798795  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  7798794 agttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873488
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 52873467  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  52873468 agttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 43198495 - 43198661
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||     
T  43198495 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatga 43198593  T
Q  146 -tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
     | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198594 attgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12774160 - 12774011
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 169  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  12774160 ttgtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 12774065  T
Q  170 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12774064 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14280435 - 14280316
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14280435 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 14280338  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14280337 tctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377639
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16377618  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  16377619 ctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 46640353 - 46640558
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||    
T  46640353 ttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgat 46640451  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46640452 gtt-gagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 46640549  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  46640550 cggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088877
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12902876 - 12902757
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902876 agatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12902778  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  12902777 agttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 18215318 - 18215436
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215318 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18215415  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18215416 ctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 44928923 - 44929042
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928923 ttgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44929021  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44929022 ctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 12351 - 12469
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12351 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 12448  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12449 ctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7893822 - 7893703
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7893822 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtcta 7893724  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  7893723 agttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 15118396 - 15118514
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118396 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15118493  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15118494 ctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 44773131 - 44773249
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773131 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44773228  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44773229 ctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52312628 - 52312510
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312628 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 52312531  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52312530 ctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19242817 - 19242693
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242817 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19242720  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgtcca 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19242719 ctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 19618216 - 19618336
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618216 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19618313  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  19618314 ctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 1837553 - 1837671
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837553 ttgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 1837650  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  1837651 ctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3515125 - 3515007
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3515125 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggt 3515028  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3515027 ctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 16270238 - 16270356
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270238 agatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtcta 16270335  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  16270336 acttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 18239463 - 18239581
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239463 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18239560  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18239561 ctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44615406 - 44615288
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44615309  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44615308 ctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 50222383 - 50222501
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222383 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 50222480  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50222481 ctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 51463912 - 51464030
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463912 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 51464009  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  51464010 ctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8846550 - 8846360
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgtta--------- 137  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||             
T  8846550 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgat 8846452  T
Q  138 -------tatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
           | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  8846451 attgttatctcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038653
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  204 ctaagttgattaagatgat 222  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  14038671 ctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3096385 - 3096293
Alignment:
Q  134 gttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3096385 gttacatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 224
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803427
Alignment:
Q  111 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 210  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  211 gattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||    
T  23803414 gattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6900009 - 6899891
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6900009 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtcta 6899912  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  6899911 agttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 16239972 - 16240090
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16239972 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtcta 16240069  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16240070 agttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44052948 - 44052829
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  44052948 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggccta 44052850  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  44052849 agttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16596813 - 16596686
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  16596813 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 16596719  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 189  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596718 actacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22636554 - 22636437
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636554 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22636456  T
Q  207 agttgattaagatgatgat 225  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22636455 agttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Original strand, 8574867 - 8574985
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8574867 tttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 8574963  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  8574964 tctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 220
Target Start/End: Original strand, 15355380 - 15355483
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355380 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 15355477  T
Q  215 aagatg 220  Q
    ||||||    
T  15355478 aagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Original strand, 23374361 - 23374473
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23374361 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttcta 23374459  T
Q  207 agttgattaagatg 220  Q
    ||||| | ||||||    
T  23374460 agttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44102332 - 44102214
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102332 ttgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44102235  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44102234 ctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970871
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 14970848  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    
T  14970849 ctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046487
Alignment:
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15099551 - 15099457
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 118  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15099551 cagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 15099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15190518 - 15190424
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 118  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15190518 cagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 15190424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  165 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610950
Alignment:
Q  165 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 227
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053422
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15367800 - 15367690
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  15367800 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttg 15367703  T
Q  215 aagatgatgatgt 227  Q
    |||||| ||||||    
T  15367702 aagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15370018
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttg 15370031  T
Q  215 aagatgatgatgt 227  Q
    |||||| ||||||    
T  15370030 aagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15371312 - 15371202
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttg 15371215  T
Q  215 aagatgatgatgt 227  Q
    |||||| ||||||    
T  15371214 aagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15373593 - 15373483
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttg 15373496  T
Q  215 aagatgatgatgt 227  Q
    |||||| ||||||    
T  15373495 aagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15402813 - 15402703
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  15402813 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttg 15402716  T
Q  215 aagatgatgatgt 227  Q
    |||||| ||||||    
T  15402715 aagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16223642 - 16223532
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttg 16223545  T
Q  215 aagatgatgatgt 227  Q
    |||||| ||||||    
T  16223544 aagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 21815629 - 21815731
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||| |  | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21815629 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcacgagtcggt 21815726  T
Q  204 ctaag 208  Q
    |||||    
T  21815727 ctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 146
Target Start/End: Original strand, 15464926 - 15464972
Alignment:
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15464926 atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgct 15464972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20149936 - 20149832
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20149936 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgtcgctgtt-gttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgatt 20149839  T
Q  215 aagatga 221  Q
    |||||||    
T  20149838 aagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22353955 - 22353835
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| ||||| || |  | ||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22353955 ttgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggt 22353857  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    ||||| || | || ||||||||    
T  22353856 ctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 630728 - 630810
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  630728 taatgttatataattggatatatattgcatgcatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 630810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3332052 - 3331970
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  3332052 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacatgcatttgtaattgttatat 3331970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 13812763 - 13812845
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  13812763 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 13812845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 14953915 - 14953997
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  14953915 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 14953997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25690228 - 25690146
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  25690228 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 25690146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Original strand, 20157527 - 20157579
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20157527 ttgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 93)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14234713 - 14234487
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtt--tcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgttt 98  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14234713 tttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgttt 14234615  T
Q  99 gatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 198  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  14234614 gatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaa 14234516  T
Q  199 tcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14234515 tcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15471147 - 15470927
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15471147 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttga 15471050  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15471049 tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtc 15470951  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||   |||||||||||||    
T  15470950 ggtctaagttg---aagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16097552 - 16097332
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16097552 tttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttga 16097454  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097453 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 16097355  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  16097354 ggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 223
Target Start/End: Original strand, 12174204 - 12174376
Alignment:
Q  46 aatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||   || |||| |||||||||||||||||     
T  12174204 aatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatga 12174299  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12174300 tgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 13210283 - 13210448
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  13210283 taatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 13210377  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13210378 actgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16103957 - 16103784
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |    
T  16103957 atgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgat 16103860  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16103859 gattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438534
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  18438554 agttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 37251064 - 37251270
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||    
T  37251064 tttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atttatga 37251162  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 198  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  37251163 tgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgac 37251260  T
Q  199 tcggtctaag 208  Q
    ||||||||||    
T  37251261 tcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27165370 - 27165250
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165370 tttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 27165272  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27165271 tctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14972975 - 14972854
Alignment:
Q  105 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 204  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972975 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14972877  T
Q  205 taagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  14972876 taagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 22110249 - 22110454
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||  |||||| |||||| ||||||  ||||||||||  || | | ||||    
T  22110249 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatga-attctatatgat 22110347  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    | |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22110348 g-ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 22110445  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  22110446 cggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523831
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 52523767  T
Q  145 -ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523768 act-gttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12399328 - 12399209
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399328 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12399230  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  12399229 agttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 224
Target Start/End: Original strand, 53301562 - 53301669
Alignment:
Q  116 tgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  53301562 tgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatta 53301660  T
Q  216 agatgatga 224  Q
    |||||||||    
T  53301661 agatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32307830 - 32307691
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 169  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  32307830 ttgtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 32307735  T
Q  170 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307734 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42386533 - 42386428
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42386533 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagtcgg 42386435  T
Q  203 tctaagt 209  Q
    |||||||    
T  42386434 tctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 23083363 - 23083482
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083363 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23083461  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23083462 agttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 29172627 - 29172745
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172627 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29172724  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29172725 ctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476506
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  25476483 ctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Original strand, 24153211 - 24153326
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153211 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24153308  T
Q  207 agttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24153309 agttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36166716 - 36166598
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36166716 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 36166620  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36166619 tctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469296
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 6469275  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6469276 ctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 9707651 - 9707769
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707651 ttgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9707748  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9707749 ctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17463296 - 17463178
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463296 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17463199  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17463198 ctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17672744 - 17672626
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672744 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17672647  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17672646 ctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698556
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  20698536 agttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26687006 - 26686887
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687006 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26686908  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  26686907 agttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 28848655 - 28848773
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848655 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28848752  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28848753 ctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34159444 - 34159326
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159444 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 34159347  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34159346 ctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 45606951 - 45607069
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606951 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 45607048  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45607049 ctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 55476609 - 55476491
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476609 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 55476512  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  55476511 ctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  109 atgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  209 ttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 227
Target Start/End: Original strand, 11424781 - 11424880
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 11424878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 7781391 - 7781509
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781391 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 7781488  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7781489 ctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8899212 - 8899094
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899212 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8899115  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  8899114 ctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13442393 - 13442274
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442393 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13442295  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  13442294 agttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 16454325 - 16454443
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16454325 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 16454422  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16454423 ctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17487975 - 17487856
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487975 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17487877  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  17487876 agttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17499457 - 17499338
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499457 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17499359  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  17499358 agttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 38961935 - 38962053
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961935 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 38962032  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  38962033 ctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 49668094 - 49668193
Alignment:
Q  123 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  49668094 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 49668192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925977
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgc 161  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||||||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattg-tatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgc 43926024  T
Q  162 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926023 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 13151834 - 13151953
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13151834 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcgg 13151931  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13151932 tctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 13154299 - 13154418
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13154299 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcgg 13154396  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13154397 tctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13544143 - 13544024
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544143 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13544046  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  13544045 ctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9513023 - 9512924
Alignment:
Q  123 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  9513023 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 9512925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9520998 - 9520899
Alignment:
Q  123 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  9520998 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 9520900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 10247767 - 10247885
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247767 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggt 10247864  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10247865 ctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12567678 - 12567564
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567678 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 12567581  T
Q  204 ctaagttgattaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  12567580 ctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977515
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 17446699 - 17446816
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17446699 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc-gt 17446795  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17446796 ctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213838
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550644
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 162  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||     
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaatt-atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgca 43550580  T
Q  163 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  43550581 tatgttgctg-tcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43841051 - 43840932
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43841051 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggttta 43840953  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| ||||| |||||||    
T  43840952 agttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14572707 - 14572603
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572707 agatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14572610  T
Q  207 agttgat 213  Q
    |||||||    
T  14572609 agttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Original strand, 16282855 - 16282971
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282855 ttgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16282952  T
Q  204 ctaagttgattaagatgat 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16282953 ctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  162 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119887
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 12119877  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  12119878 aagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412429
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 15412439  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  15412438 aagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21618567 - 21618449
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21618567 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 21618471  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||| ||| |||||    
T  21618470 tctaagttgattgagaagatga 21618449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340844
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 24340763  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  24340764 tg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41124005 - 41123892
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124005 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 41123911  T
Q  204 ctaagttgattaagatgat 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41123910 ctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50242940 - 50242822
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242940 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 50242843  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  50242842 ctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23274810 - 23274705
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  23274810 tttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcag 23274712  T
Q  203 tctaagt 209  Q
    |||||||    
T  23274711 tctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499518
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 8499528  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  8499527 aagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642386
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 37642305  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  37642306 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10557105 - 10556985
Alignment:
Q  103 tttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 201  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10557105 tttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 10557008  T
Q  202 gtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10557007 gtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  123 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 222  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgat 44494811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 53070697 - 53070799
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070697 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 53070794  T
Q  204 ctaag 208  Q
    |||||    
T  53070795 ctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  165 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 213
Target Start/End: Original strand, 14576835 - 14576939
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| | ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14576835 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgttt-atactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtcta 14576932  T
Q  207 agttgat 213  Q
    |||||||    
T  14576933 agttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 224
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 1465329 - 1465423
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 118  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1465329 cagtaagcctggattgtttattctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 1465423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12378050 - 12377940
Alignment:
Q  99 gatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 196  Q
    ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  12378050 gatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagcta-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatg 12377952  T
Q  197 agtcggtctaag 208  Q
    ||||||||||||    
T  12377951 agtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 2051239  T
Q  145 -ctggttttgcatactgcctat 165  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  2051240 act-gttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147646
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 22147565  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  22147566 tg-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606428
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatg--tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 606420  T
Q  201 ggtctaag 208  Q
    ||| ||||    
T  606421 ggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 213
Target Start/End: Original strand, 1644642 - 1644780
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 169  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||    
T  1644642 ttgtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgattt-gcatactgcctatgttg 1644737  T
Q  170 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 213  Q
     |||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  1644738 ttgtt-gttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgat 1644780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46822318 - 46822267
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46822318 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Original strand, 49389573 - 49389642
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 117  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  49389573 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatga-attatgtttgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12511110 - 12511059
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  12511110 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856140
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctatt-gttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 43927356 - 43927291
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatat 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| ||||    
T  43927356 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14501290 - 14501207
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  14501290 taatgttatataattggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 14501207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19776089 - 19776007
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  19776089 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 19776007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 37439421 - 37439503
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  37439421 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 37439503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  156 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 15878119 - 15878168
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878119 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  175 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30029893 - 30029841
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  30029893 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatg 30029841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13163 - 12942
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  13163 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacga-attatgtttga 13065  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13064 tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgct-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtc 12966  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||   |||||||||||||    
T  12965 ggtctaagttg---aagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Original strand, 18143 - 18276
Alignment:
Q  10 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  18143 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgaga 18241  T
Q  110 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 144  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  18242 tgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatg 18276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32759 - 32538
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32759 tttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtttga 32661  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32660 tgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 32563  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  32562 ggtctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Original strand, 51904 - 51985
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||||| |||| || ||||  ||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51904 ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10751 - 10542
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  10751 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatga-attatgttcga 10653  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10652 tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtc 10554  T
Q  201 ggtctaagttga 212  Q
    ||||||||||||    
T  10553 ggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6758 - 6535
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  6758 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-ga 6661  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    | |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6660 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 6562  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  6561 ggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8693 - 8481
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataat--tgtatatacattacatgagtttatgttt 98  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||  | ||| |  | ||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||| ||| || || | |    
T  8693 tttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaatt-atatat 8595  T
Q  99 ga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 197  Q
    || | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8594 gaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 8496  T
Q  198 gtcggtctaagttga 212  Q
    |||||||||||||||    
T  8495 gtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6835 - 6611
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6835 tttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttga 6737  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||   ||| || | |||| |||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6736 tgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 6638  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6637 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14215 - 13991
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14215 tttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttga 14117  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||   ||| || | |||| |||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14116 tgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 14018  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  14017 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12990 - 12766
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12990 tttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttga 12892  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    |||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12891 tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtc 12793  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12792 ggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22921766 - 22921986
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |    
T  22921766 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattt-tgtt-g 22921863  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||| |||| | |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 21861466 - 21861672
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg- 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||     
T  21861466 tttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttga-attatatatga 21861564  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21861565 atgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagt 21861663  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  21861664 cggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Original strand, 21896162 - 21896358
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgaga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||    
T  21896162 tgttgttgtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatga-attatatatgaatgtttgaga 21896260  T
Q  110 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896261 tgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33681185 - 33681010
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  33681185 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgat 33681087  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33681086 gattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22237805 - 22237630
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  22237805 atgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 22237707  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22237706 gattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20918769 - 20918620
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  20918769 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 20918675  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918674 actgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210333
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  50210311 ctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295672
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 14295601  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  14295602 actacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20248454 - 20248283
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||   ||||||| || |||| ||||||||||||||||| |    
T  20248454 atgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 20248359  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20248358 gattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509783
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  207 agttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  34509800 agttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50686836 - 50686630
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||    
T  50686836 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgat 50686738  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  ||  ||||    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50686737 gtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaact-attttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagt 50686639  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  50686638 cggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 16368183 - 16368388
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||    ||    
T  16368183 tttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-ataaacga 16368281  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  | |||||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16368282 tgtt-gagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 16368379  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  16368380 cggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21754198 - 21754059
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 169  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  21754198 ttgtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 21754103  T
Q  170 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754102 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 41049933 - 41050138
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| |||  |||| | ||||    
T  41049933 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttga-attatatatgat 41050031  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  41050032 g-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-attttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagt 41050129  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  41050130 cggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Original strand, 35261023 - 35261180
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||    
T  35261023 atgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaatt-atgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgc 35261118  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261119 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45575008
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 162  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||  |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtta-ataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcc 45574944  T
Q  163 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  45574945 tatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 50614031 - 50614219
Alignment:
Q  20 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||    ||||||||||||||||||||     
T  50614031 ttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-ataaaagatgtttgagatgttgttgat 50614129  T
Q  120 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614130 ttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 50621859 - 50622047
Alignment:
Q  20 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||    ||||||||||||||||||||     
T  50621859 ttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-ataaaagatgtttgagatgttgttgat 50621957  T
Q  120 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621958 ttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13988984 - 13988866
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988984 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13988887  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13988886 ctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 21923335 - 21923453
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923335 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21923432  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21923433 ctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 23593779 - 23593897
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593779 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23593876  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23593877 ctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 52927925 - 52928076
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||            ||| ||||||||||||||||| |    
T  52927925 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgat 52928011  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928012 gattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16758828 - 16758664
Alignment:
Q  48 tgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--c 145  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | |||   ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||  |    
T  16758828 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaac 16758730  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758729 tggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31612430 - 31612313
Alignment:
Q  105 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612430 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 31612333  T
Q  205 taagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31612332 taagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840766
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  21840787 ctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 21475131 - 21475249
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21475131 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 21475228  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21475229 ctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 27250731 - 27250850
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250731 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 27250829  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  27250830 agttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29298254 - 29298137
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298254 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29298158  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29298157 ctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 433128 - 433012
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  433128 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggt 433033  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  433032 ctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 22123119 - 22123230
Alignment:
Q  112 ttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22123119 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtag 22123217  T
Q  212 attaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||    
T  22123218 attaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22532388 - 22532269
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  22532388 agatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtcta 22532290  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22532289 agttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29776806 - 29776688
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776806 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29776709  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29776708 ctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 227
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  124 atttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  224 atgt 227  Q
    ||||    
T  20847272 atgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21026799 - 21026680
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026799 agatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21026701  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | | |||||||||||    
T  21026700 agttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16362035 - 16361915
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362035 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16361938  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16361937 ctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21707325 - 21707167
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 162  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||       
T  21707325 atataattgtataggcattacatga-tttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat- 21707228  T
Q  163 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707227 tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21711867 - 21711709
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 162  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||       
T  21711867 atataattgtataggcattacatga-tttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat- 21711770  T
Q  163 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711769 tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Original strand, 13212917 - 13213027
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212917 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 13213014  T
Q  215 aagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||    
T  13213015 aagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860177
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 15860161  T
Q  215 aagatgatgatgtcca 230  Q
    |||||||||| |||||    
T  15860162 aagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21342203 - 21342090
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342203 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21342106  T
Q  215 aagatgatgatgtcca 230  Q
    |||||||||| |||||    
T  21342105 aagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Original strand, 16275419 - 16275526
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16275419 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatt 16275516  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  16275517 aagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21347068 - 21346961
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347068 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21346971  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  21346970 aagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 227
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801508
Alignment:
Q  151 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 16093836 - 16093987
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgtt-gacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttg 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||  ||| ||||     
T  16093836 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaatt-acctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgagctg-ttttc 16093932  T
Q  154 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
     ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Original strand, 22468698 - 22468816
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | || |||||||| | ||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22468698 agatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtcta 22468796  T
Q  207 agttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  22468797 agttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 35981585 - 35981700
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  35981585 tttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatga-attatg-ttga 35981682  T
Q  101 tgtttgagatgttgttga 118  Q
    | ||||||||||||||||    
T  35981683 tatttgagatgttgttga 35981700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 49261542 - 49261448
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 118  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49261542 cagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatat-aaattatg-ttgatatttgagatgttgttga 49261448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 174
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130975
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttggat 22130957  T
Q  157 actgcctatgttgctgtt 174  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130958 actgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20637051 - 20636956
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 119  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  20637051 cagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatga-attatgtttg-tatttgggatgttgttgac 20636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40389261 - 40389157
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  40389261 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgtcgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgatt 40389164  T
Q  215 aagatga 221  Q
    |||||||    
T  40389163 aagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20135306 - 20135188
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||| || | ||| |  ||||||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  20135306 agatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttgtttaactaagttgcatgagtcagtcta 20135208  T
Q  207 agttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  20135207 agttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26065107 - 26064959
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggttttgca 155  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| || || | |||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||  |  ||||       
T  26065107 taatgtgatatatttgtatatgtattacttgaatt-atatatgatctttgagatgttgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  156 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21161928 - 21161720
Alignment:
Q  10 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga 109  Q
    |||||| |||| |||| ||||| | |||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||||| |||| |   ||    
T  21161928 ctgttgatgttccagtgagcctaatttgtttaatccaatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatga-tttatgtt-gatgatat-ga 21161832  T
Q  110 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 209  Q
     |||| ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21161831 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagt 21161734  T
Q  210 tgattaagatgatg 223  Q
    |||| | |||||||    
T  21161733 tgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130639
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtctgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 51130639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 226
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 1924914 - 1924996
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  1924914 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 1924996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 20923928 - 20924010
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  20923928 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 20924010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12271676 - 12271639
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 141  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12271676 ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5867 - 5657
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  5867 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-g 5770  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttt-catactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  200 cggtctaagttgat 213  Q
    ||||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19488 - 19268
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  19488 tttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-g 19391  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 100598 - 100378
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||      
T  100598 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaatt-atgtta- 100501  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100500 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 100402  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  100401 cggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 223
Target Start/End: Original strand, 40081 - 40291
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||    
T  40081 tgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatatttgaga 40178  T
Q  110 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 209  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40179 tgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 40277  T
Q  210 tgattaagatgatg 223  Q
    |||| | |||||||    
T  40278 tgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 94529 - 94411
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  94529 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 94432  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  94431 ctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44573 - 44454
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44573 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 44476  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44475 tctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 220
Target Start/End: Original strand, 17484 - 17598
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17581  T
Q  204 ctaagttgattaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  17582 ctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119875
Alignment:
Q  154 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  150 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 38547 - 38596
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  38547 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25176074 - 25175854
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||| |    
T  25176074 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatgaatt-atgtt-g 25175977  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    | |||||||||||| | |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28406201 - 28405981
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |   |||    
T  28406201 tttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaag--ttg 28406104  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgat 222  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 208
Target Start/End: Original strand, 7639 - 7835
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgaga 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| | || ||||||||||    
T  7639 tgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttga-attatatatgaatgtttgaga 7737  T
Q  110 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7738 tgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679589
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatac 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaatt-atgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatac 7679654  T
Q  159 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7679653 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 18786799 - 18787009
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18786799 tttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatatagttgtatatacattacatgaatt-atgtttga 18786897  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 198  Q
    |||| | || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18786898 tgtt-gtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggttt-gcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgag 18786995  T
Q  199 tcggtctaagttga 212  Q
    ||||||||||||||    
T  18786996 tcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22105531 - 22105412
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105531 ttgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 22105433  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22105432 ctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Original strand, 298816 - 298933
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298816 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 298915  T
Q  207 agttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  298916 agttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708738
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || ||||| |||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||     
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgt 23708659  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23708660 tg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23207501 - 23207296
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | | ||    
T  23207501 ttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatttataat 23207403  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23207402 g-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 23207305  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  23207304 cggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23060632 - 23060513
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060632 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23060534  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23060533 agttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072070
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttatattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 23071999  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  23072000 actgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23791499 - 23791292
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | | |    
T  23791499 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatataa 23791401  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 198  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  23791400 tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgag 23791302  T
Q  199 tcggtctaag 208  Q
    ||||||||||    
T  23791301 tcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6726113 - 6725995
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726113 ttgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 6726016  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6726015 ctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22337238 - 22337115
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22337238 tttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 22337140  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  22337139 tctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23076561 - 23076442
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076561 agatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23076463  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  23076462 agtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25109112 - 25108906
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||    
T  25109112 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgat 25109014  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||  ||  ||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  25109013 gtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaact-attttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagt 25108915  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  25108914 cggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 571515 - 571397
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  571515 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 571418  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  571417 ctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18809061 - 18808943
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809061 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18808964  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18808963 ctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23130980 - 23130862
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130980 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23130883  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23130882 ctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23133447 - 23133329
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133447 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23133350  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23133349 ctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23135708 - 23135590
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135708 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23135611  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23135610 ctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 23709576 - 23709694
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709576 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23709673  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23709674 ctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 23712057 - 23712175
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712057 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23712154  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23712155 ctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26505497 - 26505379
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505497 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26505400  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26505399 ctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26507975 - 26507857
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507975 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26507878  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26507877 ctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 34402566 - 34402684
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402566 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 34402663  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34402664 ctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39682431 - 39682313
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682431 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 39682334  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39682333 ctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 32214965 - 32215085
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214965 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 32215062  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  32215063 ctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24367892 - 24367774
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367892 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24367795  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  24367794 ctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28577217 - 28577099
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577217 ttgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-tgcgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28577120  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28577119 ctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19671998 - 19671830
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | |||   ||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  19671998 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcat 19671901  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  19671900 actgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 22731238 - 22731355
Alignment:
Q  109 atgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22731238 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaac 22731336  T
Q  209 ttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  22731337 ttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 227
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38235
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgat 38233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Original strand, 21155104 - 21155219
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155104 ttgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21155201  T
Q  204 ctaagttgattaagatga 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21155202 ctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 24898239 - 24898358
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24898239 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24898336  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24898337 tctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 24900722 - 24900841
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24900722 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24900819  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24900820 tctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 24903199 - 24903318
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24903199 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24903296  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24903297 tctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 24905676 - 24905795
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24905676 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24905773  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24905774 tctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 24908151 - 24908270
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24908151 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24908248  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24908249 tctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 32039542 - 32039660
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32039542 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggt 32039639  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32039640 ctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23285942 - 23285865
Alignment:
Q  149 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23285942 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43137417 - 43137301
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137417 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 43137320  T
Q  204 ctaagttgattaagatgat 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43137319 ctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23660141 - 23660023
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  23660141 agatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtcta 23660044  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  23660043 agttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 45029898 - 45030016
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029898 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 45029995  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45029996 ctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309108
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20309129  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || || | |||||||||||||    
T  20309128 agatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 208
Target Start/End: Original strand, 20520145 - 20520295
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 154  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||||      
T  20520145 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactg-ttttat 20520241  T
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
     |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520242 gtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 22738182 - 22738300
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738182 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22738279  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22738280 agttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103516
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||  | || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 23103492  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| || | |||||||||||||    
T  23103493 ctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 24529573 - 24529691
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24529573 ttgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggt 24529670  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24529671 ctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8946735 - 8946657
Alignment:
Q  148 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8946735 gttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413240
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat--tgttatatcatg 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatg 22413175  T
Q  145 --ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
      ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413176 agctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Original strand, 22134208 - 22134326
Alignment:
Q  105 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 204  Q
    ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22134208 tgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtc 22134304  T
Q  205 taagttgattaagatgatgatg 226  Q
    || | |||| | ||||||||||    
T  22134305 tatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38967493 - 38967374
Alignment:
Q  104 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||  | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38967493 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgt-tgtgtcgatgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 38967396  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38967395 tctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 227
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  163 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 23654388 - 23654507
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| ||  |||| || ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654388 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23654486  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  23654487 agttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Original strand, 32451949 - 32452031
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451949 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  165 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Original strand, 24697548 - 24697709
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||      
T  24697548 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattg-tatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaa 24697646  T
Q  145 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    || ||||    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24697647 ct-gtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23004878 - 23004767
Alignment:
Q  98 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 195  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||   |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23004878 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaacta-ttttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 23004780  T
Q  196 gagtcggtctaag 208  Q
    |||||||| ||||    
T  23004779 gagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 141
Target Start/End: Original strand, 22459514 - 22459598
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| | |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  22459514 taatgtgatataattgtatatacattacttgagtt-atatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25616304 - 25616192
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25616304 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtcta 25616206  T
Q  207 agttgattaagatg 220  Q
    ||||||||||||||    
T  25616205 agttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  156 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 1283748 - 1283666
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  1283748 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 1283666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 30344776 - 30344858
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  30344776 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 30344858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8239 - 8094
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8239 tttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttga 8141  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8140 tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 8094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7033 - 6826
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7033 tttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttga 6935  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    | ||||||   ||||||| || ||||  |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6934 tatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtc 6839  T
Q  201 ggtctaagttgat 213  Q
    |||||||| ||||    
T  6838 ggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2542 - 2762
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  2542 tttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-g 2639  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2640 atatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgattta-catactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2738  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  2739 cggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 1086
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  1306 tttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaatt-atgtttga 1208  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    ||||||| |||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1207 tgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1109  T
Q  201 ggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  1108 ggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 10484 - 10647
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  10484 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 10582  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10583 gattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Original strand, 7983 - 8180
Alignment:
Q  14 tgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgtt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||    
T  7983 tgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatga-attatatatgatg-ttgtgatgtt 8080  T
Q  114 gttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 211  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8081 gttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactgg-tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 180
Target Start/End: Original strand, 29238 - 29354
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatac 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| | | |||| ||||    
T  29238 atgttatataattgtatatacagtacatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatag-tttgaatac 29332  T
Q  159 tgcctatgttgctgtttgttat 180  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  29333 tacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 22613 - 22776
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  22613 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 22711  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22712 gattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 82190 - 82072
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  82190 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggt 82093  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  82092 ctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Original strand, 45735 - 45909
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  45735 atgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaatt-atgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgat 45833  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45834 gattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 130129 - 129919
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  130129 tttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttga 130031  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  130030 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtc 129932  T
Q  201 ggtctaagttgat 213  Q
    |||||||||||||    
T  129931 ggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 60710 - 60818
Alignment:
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 197  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  60710 atgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 60807  T
Q  198 gtcggtctaag 208  Q
    |||||| ||||    
T  60808 gtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 160861 - 160688
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  160861 atgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgactt-atgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgat 160764  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  160763 gattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 501202 - 501088
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  501202 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 501105  T
Q  204 ctaagttgattaagatg 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  501104 ctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Original strand, 85635 - 85742
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  85635 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatt 85732  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  85733 aagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 14596 - 14814
Alignment:
Q  3 tatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||    
T  14596 tatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaatt-atgtt-gat 14693  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 201  Q
     |||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14694 atttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgatttt-cttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcg 14792  T
Q  202 gtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  14793 gtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 307 - 133
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 146  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |    
T  307 atgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat 209  T
Q  147 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  208 gattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 62419 - 62216
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgt-ataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  62419 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-g 62322  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    || |||||||||||||||   | |||| |||||| ||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  62321 atatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgttttt-catactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagt 62226  T
Q  200 cggtctaagt 209  Q
    |||| |||||    
T  62225 cggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 136798 - 136680
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  136798 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 136701  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  136700 ctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 139267 - 139149
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  139267 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 139170  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  139169 ctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 144205 - 144087
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  144205 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 144108  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  144107 ctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 134329 - 134211
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  134329 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 134232  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  134231 ctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 141736 - 141618
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  141736 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 141639  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  141638 ctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 132765 - 132662
Alignment:
Q  120 ttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 219  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  132765 ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 132666  T
Q  220 gatg 223  Q
    ||||    
T  132665 gatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15826 - 15664
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  15826 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgtat 15732  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15731 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11457 - 11292
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  11457 taatgttatataatagtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 11363  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11362 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 1997
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  2162 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 2068  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2067 actgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28414
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  28434 agttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  171 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 128867 - 129072
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | ||||    
T  128867 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatga-attatatatgat 128965  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  128966 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtc 129064  T
Q  201 ggtctaag 208  Q
    ||||||||    
T  129065 ggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 78545 - 78345
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||    
T  78545 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaacgat 78447  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  || |||||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  78446 g-ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaact-gttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 78350  T
Q  200 cggtc 204  Q
    |||||    
T  78349 cggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 116548 - 116430
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  116548 tttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 116452  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  116451 tctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3306
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  3284 ctaagttgatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 208
Target Start/End: Original strand, 6188 - 6386
Alignment:
Q  10 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  6188 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgaga 6286  T
Q  110 tgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 207  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6287 tgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagct-gttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaa 6385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 208
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  161 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12792 - 12587
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | | |    
T  12792 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaatt-atatataa 12695  T
Q  101 -tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
     | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  12694 gtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagt 12596  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  12595 cggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 136264 - 136471
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatct-aatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |    
T  136264 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtacg 136362  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 197  Q
    |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  136363 atg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatga 136460  T
Q  198 gtcggtctaag 208  Q
    |||||||||||    
T  136461 gtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 144972 - 145179
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatct-aatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  |    
T  144972 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtacg 145070  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 197  Q
    |||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  145071 atg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatga 145168  T
Q  198 gtcggtctaag 208  Q
    |||||||||||    
T  145169 gtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 174886 - 174767
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||  | || ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 174790  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||| || | ||| ||||||||    
T  174789 ctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1190
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 1119  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1120 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38541 - 38339
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||    |||||| |||||  ||||||| |||||||||| || || | ||||    
T  38541 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaatt-atatatgat 38443  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38442 gtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagt 38344  T
Q  200 cggtc 204  Q
    |||||    
T  38343 cggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Original strand, 44705 - 44825
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44705 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcag 44803  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44804 tctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 220
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  204 ctaagttgattaagatg 220  Q
    |||||||||| ||||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Original strand, 38700 - 38820
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38700 tttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtagg 38798  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38799 tctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2701 - 2923
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatg--tt 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||| || ||||   ||||||  ||    
T  2701 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtata--attgtatatatat-acat---tttatgaatt 2794  T
Q  98 ----tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 193  Q
        |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2795 aagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgc 2893  T
Q  194 atgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  2894 atgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Original strand, 3149 - 3271
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3149 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 3246  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  3247 tctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Original strand, 27744 - 27855
Alignment:
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27744 atgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagt 27842  T
Q  200 cggtctaagttga 212  Q
    |||||||||||||    
T  27843 cggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 53445 - 53651
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | |||    
T  53445 tttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atatatga 53543  T
Q  101 -tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
     | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  53544 atatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaat 53642  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    | |||||||    
T  53643 cagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 227
Target Start/End: Original strand, 15763 - 15898
Alignment:
Q  91 ttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 190  Q
    ||||||||||||| |  |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15763 ttatgtttgatgtatatgatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 15861  T
Q  191 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 15729 - 15764
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 36  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15729 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 103535 - 103737
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  103535 tttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagttgtatatacattacatga-attatgtatga 103633  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    |||      |||||||   || ||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  103634 tgt------tgttgtt---ttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagt 103724  T
Q  200 cggtctaagttga 212  Q
    |||||||||||||    
T  103725 cggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 208
Target Start/End: Original strand, 19782 - 19987
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || | ||||| ||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||    
T  19782 ttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgagtt-atttatgat 19880  T
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  19881 gct-gagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagt 19978  T
Q  200 cggtctaag 208  Q
    |||||||||    
T  19979 cggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40031 - 39913
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40031 agatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtcta 39934  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  39933 agttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 48939 - 49021
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  48939 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 49021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17337
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt--gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  202 gtctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  17313 gtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 79328 - 79430
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79328 ttgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 79425  T
Q  204 ctaag 208  Q
    |||||    
T  79426 ctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Original strand, 16095 - 16206
Alignment:
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16095 atgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagt 16193  T
Q  200 cggtctaagttga 212  Q
    |||||||||||||    
T  16194 cggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13252 - 13147
Alignment:
Q  102 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 201  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13252 gtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 13154  T
Q  202 gtctaag 208  Q
    |||||||    
T  13153 gtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  156 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39599 - 39479
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39599 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 39502  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  39501 tctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Original strand, 75213 - 75333
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  75213 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 75310  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    ||||||||||| |||| ||||||    
T  75311 tctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 97227 - 97024
Alignment:
Q  5 tctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  97227 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt 97129  T
Q  105 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||    
T  97128 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtggg 97030  T
Q  203 tctaag 208  Q
    ||||||    
T  97029 tctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 106505 - 106302
Alignment:
Q  5 tctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtt 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | |||||||    
T  106505 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt 106407  T
Q  105 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||    
T  106406 tgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtggg 106308  T
Q  203 tctaag 208  Q
    ||||||    
T  106307 tctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 103 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1051
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1155 tttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1057  T
Q  203 tctaag 208  Q
    ||||||    
T  1056 tctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 2115 - 2281
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |    
T  2115 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgct-g 2212  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 169  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  2213 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4849
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  4869 agttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34288 - 34123
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||  ||| ||    
T  34288 taatgttatataattgtatatatattacttga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-gttgtat 34194  T
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34193 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13211 - 13141
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgt 177  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13211 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52032 - 51913
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52032 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 51934  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  51933 agttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 167980 - 168099
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167980 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 168078  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  168079 agttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16113
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 32959 - 33077
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32959 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 33056  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  33057 agttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46046 - 45928
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46046 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 45949  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  45948 agttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  165 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25275 - 25121
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 154  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||  ||| ||||      
T  25275 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctg-ttttat 25179  T
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25178 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 620
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  715 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23001 - 22886
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23001 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22904  T
Q  207 agttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22903 agttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13510 - 13392
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13510 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13413  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13412 ctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20865 - 20747
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20865 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20768  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20767 ctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13330 - 13211
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13330 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 13232  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  13231 agttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37939 - 37821
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37939 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 37842  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37841 ctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 158494 - 158612
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  158494 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 158591  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  158592 ctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340065
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggt 340044  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  340045 ctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8605 - 8479
Alignment:
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  8605 atgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagt 8507  T
Q  200 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8506 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 227
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16721
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||    
T  16698 ctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10772
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  10793 ctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4812 - 4694
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4812 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 4715  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  4714 ctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3470
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3589 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtcta 3491  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  3490 agttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 461 - 343
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461 agatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgcta-ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 364  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  363 agtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14065 - 13947
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14065 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggt 13968  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13967 ctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33060 - 32942
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33060 agatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtcta 32963  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  32962 acttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9867 - 9744
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9867 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9770  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatgtcc 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9769 ctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38879 - 38761
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38879 agatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtcta 38782  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  38781 agttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16902 - 16784
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16902 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16805  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16804 ctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1970 - 1851
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1970 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1872  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  1871 agttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 8535 - 8650
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8535 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtcta 8629  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  8630 agttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Original strand, 23901 - 24001
Alignment:
Q  123 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgat 23996  T
Q  223 gatgt 227  Q
    |||||    
T  23997 gatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11406 - 11286
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 11309  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    |||| |||||||||||| |||||    
T  11308 ctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 228 - 54
Alignment:
Q  3 tatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || || | ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||    
T  228 tatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatg 130  T
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgt 177  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||  || |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  129 tttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgt 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11464
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 11545  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  11544 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38377
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 38296  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  38297 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 24605 - 24690
Alignment:
Q  57 taatgttatataattg--tatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  24605 taatgttatataattggatatatatattgcatgaaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 24690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 1050 - 1169
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1050 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1148  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  1149 agttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4630 - 4508
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4630 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcgg 4533  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  4532 tctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12212 - 12090
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12212 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcgg 12115  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  12114 tctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22164 - 22042
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22164 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcgg 22067  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  22066 tctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40518 - 40400
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40518 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggt 40421  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40420 ctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26018 - 25896
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26018 tttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgata-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcgg 25921  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||    
T  25920 tctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39980 - 39858
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  39980 tttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgata-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttgg 39883  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  39882 tctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 6123 - 6245
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 204  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6123 agatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6222  T
Q  205 taagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  6223 taagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32205 - 32102
Alignment:
Q  120 ttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  32205 ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 32106  T
Q  220 gatg 223  Q
    ||||    
T  32105 gatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 226
Target Start/End: Original strand, 12293 - 12413
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12293 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 12390  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  12391 ctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10544
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10427 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtcta 10523  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  10524 agttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4321 - 4214
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4321 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 4224  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    ||||||||||    
T  4223 aagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 7955 - 8161
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg- 99  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| || ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||| | ||     
T  7955 tttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttga-attatatatga 8053  T
Q  100 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 197  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||     
T  8054 atgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagct-gatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgc 8152  T
Q  198 gtcggtcta 206  Q
    |||||||||    
T  8153 gtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9241
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9263  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  9262 ctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30050 - 29931
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30050 ttgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29953  T
Q  204 ctaagtt-gattaagatgatga 224  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  29952 ctaagttcaattaagatgatga 29931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 267872 - 267679
Alignment:
Q  14 tgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgtt 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || | ||| ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| ||||| ||    
T  267872 tgttgtttcagtaagcctggatgatatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt-gagatatt 267775  T
Q  114 gttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267774 gttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4712
Alignment:
Q  135 ttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Original strand, 24304 - 24406
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 205  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304 agatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 24402  T
Q  206 aagt 209  Q
    ||||    
T  24403 aagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 774 - 569
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || || |   |||| | |||| | ||||||| |||||||||| || || | |||    
T  774 tttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattacatgaatt-atatatga 676  T
Q  101 tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 198  Q
    |||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  675 tgttgg-gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactg-ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 579  T
Q  199 tcggtctaag 208  Q
    ||||||||||    
T  578 tcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1289
Alignment:
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1359 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7338 - 7266
Alignment:
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  7338 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 224
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4300
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4415 ttgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 4318  T
Q  204 ctaagttgattaagatga 221  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4317 ctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16382 - 16282
Alignment:
Q  124 atttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16382 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16286  T
Q  224 atgt 227  Q
    ||||    
T  16285 atgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18148
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 18067  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || || |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  18068 tg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Original strand, 2184 - 2291
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2184 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgatt 2281  T
Q  215 aagatgatga 224  Q
    || |||||||    
T  2282 aaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 224 - 106
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  224 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 127  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  126 ctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 208
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1900
Alignment:
Q  3 tatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg 102  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||| | || || | |||||    
T  1696 tatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaatt-atatatgatg 1794  T
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 200  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||| ||||||||  |||| |||   |||||||||||||||||||    
T  1795 tt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-attttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtc 1892  T
Q  201 ggtctaag 208  Q
    ||||||||    
T  1893 ggtctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2071 - 1952
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2071 agatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 1973  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    || || | |||||||||||||    
T  1972 agatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20910
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||| | | |||||| ||||||    
T  20930 agtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51654 - 51582
Alignment:
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  51654 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13575 - 13497
Alignment:
Q  148 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13575 gttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32137 - 32067
Alignment:
Q  156 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32137 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12176 - 12064
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  12176 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgttt-------aactaagctgcatgagtcggt 12085  T
Q  204 ctaagttgattaagatgatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12084 ctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 227
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15584
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgat 15582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7359 - 7295
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  7359 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 224
Target Start/End: Original strand, 161133 - 161252
Alignment:
Q  104 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 202  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  161133 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcgg 161230  T
Q  203 tctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  161231 tctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4643 - 4545
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4643 agatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 223
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  150 tttgcatactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1440
Alignment:
Q  115 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 214  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1336 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 1433  T
Q  215 aagatga 221  Q
    |||||||    
T  1434 aagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46995
Alignment:
Q  157 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 227
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11564
Alignment:
Q  126 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 225  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagat 11562  T
Q  226 gt 227  Q
    ||    
T  11563 gt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1170
Alignment:
Q  155 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1098 atactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Original strand, 20423 - 20524
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 203  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20423 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20519  T
Q  204 ctaag 208  Q
    |||||    
T  20520 ctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 128869 - 128751
Alignment:
Q  107 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||   |  |   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  128869 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttt-tgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtcta 128772  T
Q  207 agttgattaagatgatgatgt 227  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  128771 atttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Original strand, 5183 - 5246
Alignment:
Q  161 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5183 cctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  160 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2780 - 2694
Alignment:
Q  123 catttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  2780 catttgatattgttatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgc 225488  T
Q  146 tggttttgcatactgcctatgttg 169  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  225487 t-gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 163
Target Start/End: Original strand, 3529 - 3588
Alignment:
Q  104 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcct 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  3529 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 339 - 289
Alignment:
Q  173 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  339 tttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  165 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29558
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 151
Target Start/End: Original strand, 2398 - 2488
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  2398 taatgttatataattgtatatacattaaatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 2488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 6
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 140  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  88 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27953 - 27911
Alignment:
Q  103 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  27953 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  156 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 206  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1881
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  1945 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 159
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  208 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  158 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 21871 - 21920
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  21871 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 29763 - 29812
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29763 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69794
Alignment:
Q  174 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69843 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2308 times since January 2019
Visitors: 2400