View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0253_low_32 (Length: 307)

Name: NF0253_low_32
Description: NF0253
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0253_low_32
NF0253_low_32
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (58-226)||(27679169-27679338)
chr5 (58-207)||(16737447-16737596)
chr5 (58-226)||(33991179-33991348)
chr5 (58-226)||(38598450-38598619)
chr5 (58-226)||(3386486-3386655)
chr5 (58-226)||(8374339-8374507)
chr5 (58-207)||(9008057-9008206)
chr5 (58-207)||(16069412-16069561)
chr5 (58-207)||(19358585-19358734)
chr5 (58-226)||(33491196-33491365)
chr5 (61-207)||(1579095-1579241)
chr5 (61-207)||(1605574-1605720)
chr5 (58-226)||(31883183-31883352)
chr5 (61-226)||(1165604-1165770)
chr5 (58-207)||(3921640-3921789)
chr5 (58-207)||(24105671-24105820)
chr5 (58-207)||(4120996-4121145)
chr5 (58-207)||(20992146-20992295)
chr5 (62-207)||(27420917-27421062)
chr5 (59-207)||(5203031-5203179)
chr5 (58-207)||(27025015-27025164)
chr5 (58-207)||(35782644-35782793)
chr5 (61-207)||(31410535-31410681)
chr5 (58-207)||(26602942-26603091)
chr5 (131-207)||(20992354-20992430)
chr5 (125-207)||(33284642-33284724)
chr5 (58-116)||(35420424-35420482)
chr5 (130-204)||(31638207-31638281)
chr5 (147-199)||(41818552-41818604)
chr5 (114-197)||(25634651-25634732)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (58-207)||(14422761-14422910)
chr8 (58-226)||(33278438-33278607)
chr8 (60-226)||(2042526-2042693)
chr8 (58-207)||(144452-144601)
chr8 (58-207)||(6144273-6144422)
chr8 (58-207)||(13110462-13110611)
chr8 (58-207)||(18594595-18594744)
chr8 (58-207)||(29938119-29938268)
chr8 (58-207)||(34998896-34999045)
chr8 (58-226)||(35118031-35118200)
chr8 (58-207)||(39206644-39206793)
chr8 (59-205)||(4035907-4036053)
chr8 (58-207)||(22260630-22260779)
chr8 (58-207)||(24113166-24113315)
chr8 (58-207)||(7774822-7774971)
chr8 (58-207)||(10836755-10836904)
chr8 (59-226)||(44804945-44805113)
chr8 (58-207)||(7791469-7791618)
chr8 (62-207)||(38167159-38167304)
chr8 (59-226)||(39218815-39218983)
chr8 (58-226)||(42571632-42571798)
chr8 (58-207)||(7812053-7812202)
chr8 (58-207)||(34679457-34679606)
chr8 (59-207)||(41575571-41575719)
chr8 (59-207)||(66180-66329)
chr8 (58-207)||(34842365-34842514)
chr8 (61-207)||(28639340-28639484)
chr8 (58-199)||(36491223-36491364)
chr8 (61-186)||(9807339-9807464)
chr8 (58-226)||(5320602-5320771)
chr8 (110-207)||(40117904-40118001)
chr8 (110-207)||(33287077-33287174)
chr8 (58-226)||(8021757-8021918)
chr8 (126-226)||(26783801-26783902)
chr8 (114-207)||(2322068-2322161)
chr8 (114-207)||(39220314-39220407)
chr8 (137-226)||(5005204-5005294)
chr8 (61-93)||(33287040-33287072)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (58-207)||(24792322-24792471)
chr7 (58-207)||(30181014-30181163)
chr7 (58-207)||(12101168-12101317)
chr7 (58-207)||(25748544-25748693)
chr7 (60-226)||(3511360-3511527)
chr7 (58-226)||(933322-933491)
chr7 (58-207)||(5280917-5281066)
chr7 (58-207)||(7164241-7164390)
chr7 (58-226)||(12097580-12097749)
chr7 (58-226)||(20346525-20346694)
chr7 (58-226)||(33359080-33359249)
chr7 (58-207)||(42204212-42204361)
chr7 (58-207)||(42964986-42965135)
chr7 (58-207)||(43067963-43068112)
chr7 (59-207)||(36890821-36890969)
chr7 (58-199)||(17753665-17753806)
chr7 (58-207)||(8630723-8630872)
chr7 (60-207)||(43156770-43156917)
chr7 (60-207)||(48865690-48865837)
chr7 (58-207)||(1803083-1803232)
chr7 (58-199)||(4477311-4477452)
chr7 (58-207)||(9452647-9452796)
chr7 (58-199)||(15655977-15656118)
chr7 (58-207)||(22649684-22649833)
chr7 (58-226)||(32041579-32041748)
chr7 (58-207)||(38866601-38866750)
chr7 (58-207)||(6394808-6394957)
chr7 (58-186)||(42673539-42673667)
chr7 (58-207)||(4347330-4347478)
chr7 (58-207)||(16894497-16894646)
chr7 (58-207)||(33846519-33846663)
chr7 (58-207)||(46891329-46891478)
chr7 (58-207)||(46134294-46134443)
chr7 (58-207)||(43021570-43021715)
chr7 (119-207)||(19828327-19828415)
chr7 (114-207)||(37005857-37005950)
chr7 (114-207)||(43405077-43405170)
chr7 (130-197)||(20163886-20163953)
chr7 (121-207)||(36849590-36849676)
chr7 (169-226)||(37705017-37705075)
chr7 (114-207)||(15655458-15655551)
chr7 (114-197)||(30075277-30075357)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (63-226)||(22956-23120)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (59-226)||(16052132-16052300)
chr1 (58-207)||(1168559-1168708)
chr1 (58-207)||(25897430-25897579)
chr1 (58-226)||(38829105-38829274)
chr1 (58-226)||(39260346-39260515)
chr1 (59-226)||(46761002-46761170)
chr1 (58-226)||(20089507-20089676)
chr1 (58-226)||(32671615-32671784)
chr1 (58-207)||(33510540-33510689)
chr1 (58-226)||(52753147-52753316)
chr1 (59-207)||(29078572-29078720)
chr1 (58-226)||(5215421-5215590)
chr1 (58-226)||(17591724-17591893)
chr1 (58-207)||(26663314-26663463)
chr1 (63-226)||(6765495-6765659)
chr1 (59-226)||(8079710-8079878)
chr1 (61-226)||(1170447-1170613)
chr1 (58-207)||(7145264-7145412)
chr1 (58-207)||(12682876-12683025)
chr1 (58-207)||(19715161-19715310)
chr1 (58-207)||(26580270-26580419)
chr1 (58-207)||(41928495-41928644)
chr1 (58-207)||(42370795-42370944)
chr1 (58-207)||(970524-970675)
chr1 (58-207)||(46409491-46409642)
chr1 (58-207)||(2347712-2347862)
chr1 (58-207)||(29288205-29288352)
chr1 (58-207)||(1940747-1940896)
chr1 (58-207)||(43905710-43905859)
chr1 (58-199)||(52696855-52696996)
chr1 (58-196)||(51359217-51359355)
chr1 (58-207)||(8120925-8121074)
chr1 (58-226)||(13996723-13996892)
chr1 (58-207)||(15203168-15203317)
chr1 (61-225)||(15717822-15717986)
chr1 (58-207)||(17587505-17587654)
chr1 (58-207)||(40092547-40092696)
chr1 (58-207)||(40149519-40149668)
chr1 (58-207)||(49146228-49146377)
chr1 (61-207)||(2473778-2473924)
chr1 (58-199)||(23498524-23498665)
chr1 (58-207)||(15554152-15554293)
chr1 (97-207)||(29695732-29695842)
chr1 (59-207)||(38171888-38172023)
chr1 (134-207)||(52086323-52086396)
chr1 (115-190)||(23322897-23322972)
chr1 (114-196)||(5217840-5217921)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (59-226)||(35198322-35198489)
chr6 (58-226)||(6086599-6086768)
chr6 (58-207)||(26704339-26704488)
chr6 (58-207)||(26946876-26947025)
chr6 (58-226)||(3347523-3347692)
chr6 (58-207)||(9459621-9459770)
chr6 (58-207)||(11167298-11167447)
chr6 (58-226)||(17261073-17261242)
chr6 (58-207)||(21893513-21893662)
chr6 (58-207)||(2837603-2837752)
chr6 (58-207)||(30691909-30692058)
chr6 (58-226)||(1153631-1153800)
chr6 (58-207)||(18613596-18613745)
chr6 (58-207)||(28199508-28199656)
chr6 (58-195)||(33464399-33464536)
chr6 (58-207)||(34887292-34887441)
chr6 (63-207)||(30698934-30699078)
chr6 (58-207)||(3955769-3955915)
chr6 (58-186)||(20726866-20726994)
chr6 (65-199)||(16307015-16307149)
chr6 (58-172)||(53001-53115)
chr6 (110-226)||(52874-52991)
chr6 (130-203)||(12835110-12835183)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (58-226)||(36741-36910)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (58-207)||(53717452-53717601)
chr4 (58-207)||(54189601-54189750)
chr4 (58-207)||(1756752-1756901)
chr4 (58-226)||(8591080-8591249)
chr4 (58-226)||(11639566-11639735)
chr4 (58-207)||(27488636-27488785)
chr4 (58-207)||(40428708-40428857)
chr4 (60-207)||(23776449-23776596)
chr4 (60-207)||(48909902-48910049)
chr4 (57-207)||(8932165-8932315)
chr4 (61-226)||(30423556-30423721)
chr4 (61-207)||(52139259-52139405)
chr4 (58-207)||(1617140-1617289)
chr4 (58-207)||(15241016-15241165)
chr4 (58-207)||(19913618-19913767)
chr4 (58-207)||(28032700-28032849)
chr4 (58-226)||(31969717-31969886)
chr4 (58-207)||(35490761-35490910)
chr4 (58-207)||(44379175-44379324)
chr4 (58-226)||(44784905-44785074)
chr4 (59-207)||(37968746-37968894)
chr4 (58-205)||(27536092-27536239)
chr4 (58-226)||(47632070-47632240)
chr4 (61-207)||(43289951-43290097)
chr4 (58-207)||(6611348-6611497)
chr4 (58-207)||(33703897-33704046)
chr4 (58-207)||(38055213-38055362)
chr4 (58-226)||(40680026-40680195)
chr4 (58-199)||(45424522-45424663)
chr4 (58-207)||(50353857-50354006)
chr4 (58-186)||(23269034-23269162)
chr4 (58-209)||(14987846-14987997)
chr4 (59-207)||(53353115-53353267)
chr4 (61-226)||(23704200-23704366)
chr4 (58-199)||(2481396-2481537)
chr4 (58-207)||(16700837-16700986)
chr4 (58-207)||(37464777-37464926)
chr4 (58-207)||(53875713-53875862)
chr4 (59-207)||(20877103-20877251)
chr4 (67-207)||(50055098-50055238)
chr4 (58-207)||(6688615-6688758)
chr4 (58-207)||(15669239-15669388)
chr4 (58-207)||(19164961-19165108)
chr4 (58-226)||(27583620-27583789)
chr4 (58-207)||(54412684-54412833)
chr4 (58-207)||(30171636-30171785)
chr4 (61-226)||(16703857-16704023)
chr4 (58-226)||(55344813-55344982)
chr4 (67-199)||(44375909-44376041)
chr4 (58-207)||(38071314-38071457)
chr4 (95-207)||(28360486-28360599)
chr4 (114-207)||(50053499-50053592)
chr4 (58-145)||(53408137-53408225)
chr4 (115-197)||(51780763-51780845)
chr4 (58-121)||(23261874-23261937)
chr4 (58-161)||(9595890-9595982)
chr4 (58-124)||(48748197-48748263)
chr4 (58-107)||(50055301-50055350)
chr4 (119-176)||(55344724-55344781)
chr4 (114-197)||(17493399-17493482)
chr4 (58-92)||(55344681-55344715)
chr4 (130-226)||(46257269-46257366)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (58-226)||(8042640-8042809)
chr3 (58-226)||(25999421-25999590)
chr3 (58-207)||(25494271-25494420)
chr3 (58-207)||(37698129-37698278)
chr3 (58-207)||(38856146-38856295)
chr3 (63-226)||(32244153-32244317)
chr3 (58-199)||(22174976-22175117)
chr3 (59-207)||(42307892-42308040)
chr3 (59-207)||(46452149-46452297)
chr3 (58-207)||(15520128-15520277)
chr3 (58-207)||(20842334-20842483)
chr3 (58-207)||(21581095-21581244)
chr3 (58-207)||(29445541-29445690)
chr3 (58-226)||(32359292-32359461)
chr3 (58-207)||(35226500-35226649)
chr3 (58-226)||(44609319-44609488)
chr3 (58-199)||(50528990-50529131)
chr3 (58-226)||(54870160-54870329)
chr3 (59-207)||(24835686-24835834)
chr3 (58-226)||(38933978-38934147)
chr3 (59-199)||(15520697-15520837)
chr3 (59-226)||(44688794-44688961)
chr3 (58-192)||(53028285-53028419)
chr3 (59-199)||(20699210-20699350)
chr3 (58-226)||(48924989-48925156)
chr3 (58-227)||(16354378-16354548)
chr3 (58-207)||(12117644-12117793)
chr3 (58-207)||(42104957-42105106)
chr3 (58-207)||(54534314-54534461)
chr3 (58-207)||(2895238-2895391)
chr3 (59-207)||(26122867-26123015)
chr3 (58-207)||(34700394-34700543)
chr3 (110-226)||(35643250-35643367)
chr3 (61-207)||(12915959-12916105)
chr3 (126-207)||(50529827-50529908)
chr3 (59-146)||(24366143-24366230)
chr3 (58-139)||(13696914-13696995)
chr3 (132-207)||(49128102-49128177)
chr3 (58-106)||(50528868-50528916)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (58-226)||(18806884-18807053)
chr2 (58-226)||(3873244-3873413)
chr2 (58-207)||(31517215-31517364)
chr2 (58-207)||(33906047-33906196)
chr2 (58-207)||(1482903-1483052)
chr2 (58-207)||(2178769-2178918)
chr2 (58-207)||(4016095-4016244)
chr2 (58-207)||(26323186-26323335)
chr2 (58-207)||(30270679-30270828)
chr2 (61-207)||(19383938-19384084)
chr2 (58-207)||(42937775-42937925)
chr2 (58-226)||(851033-851202)
chr2 (58-226)||(4232142-4232311)
chr2 (58-207)||(5733455-5733604)
chr2 (66-226)||(16066302-16066463)
chr2 (59-207)||(39635508-39635656)
chr2 (58-207)||(28329839-28329986)
chr2 (62-226)||(429852-430017)
chr2 (58-226)||(16588776-16588945)
chr2 (63-223)||(19901143-19901303)
chr2 (78-207)||(1108335-1108464)
chr2 (58-207)||(6174828-6174977)
chr2 (58-215)||(44947549-44947700)
chr2 (60-207)||(30420181-30420316)
chr2 (114-207)||(42446625-42446718)
chr2 (114-205)||(3585348-3585439)
chr2 (121-207)||(22101210-22101296)
chr2 (150-214)||(39463160-39463225)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (59-207)||(145246-145394)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (58-207)||(6-155)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (58-226)||(3746-3915)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (58-226)||(10274-10443)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (58-207)||(6-154)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (58-207)||(295-444)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 27679169 - 27679338
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679169 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 27679268  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  27679269 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 27679338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 16737447 - 16737596
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737447 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16737546  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16737547 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 16737596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33991348 - 33991179
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33991348 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 33991249  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  33991248 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 33991179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 38598450 - 38598619
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598450 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38598549  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac-ttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  38598550 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataa 38598619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 3386486 - 3386655
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386486 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3386585  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  3386586 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 3386655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 8374339 - 8374507
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374339 cagagagaatcgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8374437  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  8374438 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 8374507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 9008057 - 9008206
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008057 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 9008156  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9008157 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 9008206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16069561 - 16069412
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069561 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16069462  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16069461 atgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaa 16069412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19358734 - 19358585
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19358734 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagctt 19358635  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358634 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 19358585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 33491196 - 33491365
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33491196 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagctt 33491295  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  33491296 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 33491365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1579241 - 1579095
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579241 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1579142  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1579141 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 1579095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 1605574 - 1605720
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605574 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1605673  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1605674 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 1605720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31883352 - 31883183
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31883352 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 31883253  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatg-cttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  31883252 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataa 31883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Original strand, 1165604 - 1165770
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1165604 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 1165703  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  1165704 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 1165770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3921789 - 3921640
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921789 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3921690  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3921689 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 3921640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 24105671 - 24105820
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24105671 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 24105770  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24105771 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 24105820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4121145 - 4120996
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121145 cagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 4121046  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4121045 atgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaa 4120996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 20992146 - 20992295
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20992146 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagctt 20992245  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20992246 atgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 20992295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27421062 - 27420917
Alignment:
Q  62 gagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 161  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421062 gagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 27420963  T
Q  162 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27420962 aactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaa 27420917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5203179 - 5203031
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5203179 agagagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 5203080  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5203079 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 5203031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27025164 - 27025015
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27025164 cagagagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagctt 27025065  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  27025064 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaa 27025015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 35782644 - 35782793
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagc-cgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 156  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35782644 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgt-aagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagct 35782742  T
Q  157 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35782743 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 35782793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31410681 - 31410535
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  31410681 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttata 31410582  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  31410581 aaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaa 31410535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 26602942 - 26603091
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  || |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26602942 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagttt 26603041  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26603042 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 26603091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 207
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992430
Alignment:
Q  131 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 20992430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284724
Alignment:
Q  125 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaa 33284724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 116
Target Start/End: Original strand, 35420424 - 35420482
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaa 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  35420424 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638207
Alignment:
Q  130 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttta 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacactttta 31638207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 199
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818604
Alignment:
Q  147 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacac 41818604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634651
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 197  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaac 25634651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14422910 - 14422761
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422910 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 14422811  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14422810 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 14422761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33278607 - 33278438
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278607 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33278508  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatg-cttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  33278507 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataa 33278438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 226
Target Start/End: Original strand, 2042526 - 2042693
Alignment:
Q  60 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042526 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 2042625  T
Q  160 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  2042626 gaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 2042693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 144601 - 144452
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144601 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 144502  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  144501 atgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaa 144452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 6144273 - 6144422
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144273 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagctt 6144372  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6144373 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaa 6144422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13110611 - 13110462
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110611 cagagagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 13110512  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13110511 attaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 13110462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18594744 - 18594595
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18594744 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 18594645  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18594644 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 18594595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29938268 - 29938119
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938268 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 29938169  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29938168 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaa 29938119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 34998896 - 34999045
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34998896 cagagagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 34998995  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34998996 atgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 34999045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 35118031 - 35118200
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35118031 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 35118130  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  35118131 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataa 35118200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39206793 - 39206644
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39206793 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 39206694  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39206693 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 39206644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4036053 - 4035907
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036053 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 4035954  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4035953 tgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaa 4035907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 22260630 - 22260779
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260630 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22260729  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  22260730 atgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaa 22260779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 24113166 - 24113315
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24113166 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 24113265  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24113266 atgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 24113315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7774971 - 7774822
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7774971 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagctt 7774872  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7774871 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 7774822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 10836755 - 10836904
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10836755 cagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 10836854  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10836855 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 10836904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 44804945 - 44805113
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44804945 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 44805044  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  44805045 tgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataa 44805113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7791618 - 7791469
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7791618 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 7791519  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7791518 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 7791469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 207
Target Start/End: Original strand, 38167159 - 38167304
Alignment:
Q  62 gagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167159 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 38167258  T
Q  162 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38167259 aactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaa 38167304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39218983 - 39218815
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39218983 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 39218884  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  39218883 tgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 39218815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42571798 - 42571632
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  42571798 cagagagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagctt 42571701  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttt-aaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  42571700 atgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataa 42571632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7812202 - 7812053
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7812202 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 7812103  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7812102 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 7812053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 34679457 - 34679606
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34679457 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagctt 34679556  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  34679557 atgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaa 34679606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41575719 - 41575571
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41575719 agagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctta 41575620  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41575619 tgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 41575571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Original strand, 66180 - 66329
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaa-gggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  66180 agagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagctt 66279  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66280 atgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 66329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 34842365 - 34842514
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34842365 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 34842464  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34842465 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 34842514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28639484 - 28639340
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639484 agagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 28639387  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28639386 aaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaa 28639340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36491364 - 36491223
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  36491364 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagtt 36491265  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36491264 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacac 36491223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9807464 - 9807339
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9807464 agagaaacgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 9807365  T
Q  161 aaactatgataagctatttttattta 186  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  9807364 aagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5320771 - 5320602
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||    
T  5320771 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaactt 5320672  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac-acttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  5320671 atgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataa 5320602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 207
Target Start/End: Original strand, 40117904 - 40118001
Alignment:
Q  110 agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40117904 agggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 40118001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 207
Target Start/End: Original strand, 33287077 - 33287174
Alignment:
Q  110 agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33287077 agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 33287174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8021918 - 8021757
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8021918 cagagagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 8021827  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  8021826 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataa 8021757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783902
Alignment:
Q  126 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  225 aa 226  Q
    ||    
T  26783901 aa 26783902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322161
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaa 2322161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220314
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaa 39220314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005204
Alignment:
Q  137 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac-acttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataa 5005204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 93
Target Start/End: Original strand, 33287040 - 33287072
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataag 93  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33287040 agagaatcgaaggaggttacataaattcataag 33287072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 24792322 - 24792471
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792322 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 24792421  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24792422 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 24792471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 30181014 - 30181163
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181014 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 30181113  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30181114 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 30181163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 12101168 - 12101317
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101168 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 12101267  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12101268 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 12101317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25748693 - 25748544
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748693 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25748594  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25748593 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 25748544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3511527 - 3511360
Alignment:
Q  60 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511527 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 3511428  T
Q  160 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  3511427 gaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 3511360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 933491 - 933322
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933491 cagagagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 933392  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  933391 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 933322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5281066 - 5280917
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5281066 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 5280967  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5280966 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 5280917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7164390 - 7164241
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164390 cagatagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 7164291  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7164290 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 7164241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 12097580 - 12097749
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12097580 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagctt 12097679  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  12097680 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 12097749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20346694 - 20346525
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20346694 cagagagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 20346595  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  20346594 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 20346525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 33359080 - 33359249
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359080 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33359179  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  33359180 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataa 33359249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42204361 - 42204212
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204361 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42204262  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42204261 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaa 42204212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 42964986 - 42965135
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964986 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42965085  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42965086 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 42965135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 43067963 - 43068112
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43067963 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagctt 43068062  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43068063 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 43068112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Original strand, 36890821 - 36890969
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36890821 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaactta 36890920  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36890921 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 36890969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17753806 - 17753665
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753806 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 17753707  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17753706 atgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacac 17753665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8630872 - 8630723
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630872 cagagagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8630773  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8630772 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaa 8630723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43156917 - 43156770
Alignment:
Q  60 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  43156917 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttat 43156818  T
Q  160 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43156817 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 43156770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48865837 - 48865690
Alignment:
Q  60 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865837 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 48865738  T
Q  160 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48865737 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 48865690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1803232 - 1803083
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  1803232 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagctt 1803133  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1803132 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaa 1803083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 4477311 - 4477452
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4477311 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 4477410  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477411 atgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacac 4477452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9452796 - 9452647
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9452796 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagctt 9452697  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9452696 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaa 9452647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15656118 - 15655977
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656118 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 15656019  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15656018 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacac 15655977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 22649684 - 22649833
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649684 cagagaaaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22649783  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22649784 atgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 22649833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32041748 - 32041579
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32041748 cagagagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagctt 32041649  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatg-cttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  32041648 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataa 32041579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38866750 - 38866601
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38866750 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagctt 38866651  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38866650 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 38866601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6394957 - 6394808
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6394957 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 6394858  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6394857 atgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 6394808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42673667 - 42673539
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673667 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42673568  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttattta 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42673567 atgaaactatgataagctgtttttattta 42673539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4347478 - 4347330
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4347478 cagagagaatagaagggg-ttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 4347380  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4347379 atgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 4347330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 16894497 - 16894646
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894497 cagaaagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16894596  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  16894597 atgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaa 16894646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 33846519 - 33846663
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33846519 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagttt 33846613  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33846614 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 33846663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 46891329 - 46891478
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46891329 cagagacaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagctt 46891428  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46891429 ataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 46891478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 46134294 - 46134443
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  46134294 cagagagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagctt 46134393  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  46134394 atgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaa 46134443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 43021570 - 43021715
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    |   ||||||| ||||||||||||    
T  43021570 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttag----accgaaatatgccataagcagctt 43021665  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43021666 atgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaa 43021715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828327
Alignment:
Q  119 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaa 19828327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37005950
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaa 37005950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405077
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaa 43405077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163886
Alignment:
Q  130 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 197  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaac 20163886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849676
Alignment:
Q  121 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaa 36849676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37705017
Alignment:
Q  169 ataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 37705017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655551
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaa 15655551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075357
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 197  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctattttta-ttatttacccaaac 30075357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23120
Alignment:
Q  63 agaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  163 actatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 23120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16052300 - 16052132
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052300 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagctta 16052201  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  16052200 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataa 16052132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1168708 - 1168559
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168708 cagagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1168609  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1168608 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 1168559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25897579 - 25897430
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897579 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25897480  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25897479 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 25897430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38829274 - 38829105
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38829274 cagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagctt 38829175  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  38829174 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 38829105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 39260346 - 39260515
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39260346 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 39260445  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  39260446 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataa 39260515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46761170 - 46761002
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46761170 agagagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttta 46761071  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  46761070 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataa 46761002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20089676 - 20089507
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20089676 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 20089577  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  20089576 atgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataa 20089507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32671784 - 32671615
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32671784 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagctt 32671685  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  32671684 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataa 32671615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33510689 - 33510540
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510689 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33510590  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33510589 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 33510540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 52753147 - 52753316
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52753147 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagctt 52753246  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  52753247 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataa 52753316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29078720 - 29078572
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29078720 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctta 29078621  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29078620 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 29078572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5215590 - 5215421
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5215590 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 5215491  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5215490 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataa 5215421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17591893 - 17591724
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17591893 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 17591794  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  17591793 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataa 17591724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26663463 - 26663314
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663463 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagctt 26663364  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26663363 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 26663314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6765659 - 6765495
Alignment:
Q  63 agaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6765659 agaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaa 6765560  T
Q  163 actatgataagctatttttatttatttacccaaacactttt-aaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6765559 aatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataa 6765495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Original strand, 8079710 - 8079878
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8079710 agagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagctta 8079809  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  8079810 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 8079878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Original strand, 1170447 - 1170613
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1170447 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 1170546  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  1170547 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 1170613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7145412 - 7145264
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145412 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 7145313  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7145312 atgaaactatgataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaa 7145264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12683025 - 12682876
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12683025 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 12682926  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12682925 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 12682876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 19715161 - 19715310
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19715161 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 19715260  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19715261 atgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 19715310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 26580270 - 26580419
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580270 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26580369  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26580370 atgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaa 26580419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 41928495 - 41928644
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41928495 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 41928594  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41928595 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 41928644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 42370795 - 42370944
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42370795 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagctt 42370894  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42370895 atgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaa 42370944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 970524 - 970675
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  970524 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctt 970623  T
Q  158 atgaaac--tatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  970624 atgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 970675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46409642 - 46409491
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaa--gccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagc 155  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46409642 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagc 46409543  T
Q  156 ttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46409542 ttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 46409491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2347862 - 2347712
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttatt-aaaatatggcataagcagct 156  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2347862 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagct 2347763  T
Q  157 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2347762 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 2347712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29288352 - 29288205
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288352 cagagagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 29288255  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29288254 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 29288205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 1940747 - 1940896
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  1940747 cagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaactt 1940846  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1940847 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 1940896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43905859 - 43905710
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905859 cagagacaatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 43905760  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43905759 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 43905710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 52696996 - 52696855
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696996 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 52696897  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  52696896 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacac 52696855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 196
Target Start/End: Original strand, 51359217 - 51359355
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51359217 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcacctt 51359316  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51359317 atgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa 51359355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8121074 - 8120925
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8121074 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagctt 8120975  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8120974 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 8120925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 13996723 - 13996892
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13996723 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 13996822  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  13996823 atgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataa 13996892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15203317 - 15203168
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15203317 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagctt 15203218  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15203217 atgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaa 15203168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15717986 - 15717822
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15717986 agagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatg 15717887  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagata 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  15717886 aaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagata 15717822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 17587505 - 17587654
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587505 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 17587604  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17587605 atgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaa 17587654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40092696 - 40092547
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092696 cagagaaaatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 40092597  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40092596 atgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 40092547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40149668 - 40149519
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40149668 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 40149569  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40149568 ataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 40149519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 49146377 - 49146228
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49146377 cagagagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 49146278  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49146277 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 49146228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2473924 - 2473778
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2473924 agagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 2473825  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2473824 aaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 2473778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23498665 - 23498524
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  23498665 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaactt 23498566  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23498565 atgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacac 23498524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 15554152 - 15554293
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15554152 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagttt 15554251  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||        | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15554252 atgaa--------atgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 15554293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695732
Alignment:
Q  97 cttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaa 196  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  197 cacttttaaaa 207  Q
    ||| |||||||    
T  29695742 cacctttaaaa 29695732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38172023 - 38171888
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||    
T  38172023 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggc-------------acataagcagctta 38171937  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38171936 tgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaa 38171888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086323
Alignment:
Q  134 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaa 52086323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23322972
Alignment:
Q  115 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttattta 190  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgattta 23322972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217921
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaa 196  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaa 5217921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35198489 - 35198322
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35198489 agagagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 35198390  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35198389 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagcttatggaagtagataa 35198322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 6086599 - 6086768
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6086599 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 6086698  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  6086699 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataa 6086768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 26704339 - 26704488
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704339 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26704438  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26704439 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 26704488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 26946876 - 26947025
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26946876 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 26946975  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26946976 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 26947025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 3347523 - 3347692
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3347523 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 3347622  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  3347623 atgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 3347692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9459770 - 9459621
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459770 cagagagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 9459671  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9459670 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaa 9459621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11167447 - 11167298
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11167447 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 11167348  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11167347 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 11167298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 17261073 - 17261242
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17261073 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 17261172  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttta-aaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||    
T  17261173 atgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataa 17261242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21893662 - 21893513
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893662 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagctt 21893563  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21893562 atgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaa 21893513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2837752 - 2837603
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2837752 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctc 2837653  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2837652 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 2837603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30692058 - 30691909
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692058 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 30691959  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30691958 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 30691909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1153800 - 1153631
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153800 cagagagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1153701  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  1153700 atgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 1153631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18613745 - 18613596
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18613745 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 18613646  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18613645 atggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 18613596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 28199508 - 28199656
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  28199508 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcat 28199606  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28199607 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 28199656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33464536 - 33464399
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464536 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33464437  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaa 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33464436 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 34887292 - 34887441
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34887292 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagctt 34887391  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34887392 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 34887441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 207
Target Start/End: Original strand, 30698934 - 30699078
Alignment:
Q  63 agaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30698934 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaa 30699033  T
Q  163 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30699034 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 30699078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 3955769 - 3955915
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3955769 cagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagttt 3955865  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3955866 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 3955915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20726994 - 20726866
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726994 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 20726895  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttattta 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20726894 atgaaactatgataagttatttttattta 20726866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 199
Target Start/End: Original strand, 16307015 - 16307149
Alignment:
Q  65 aatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 164  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307015 aatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 16307114  T
Q  165 tatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16307115 tatgataagctgtttttatttatttatccaaacac 16307149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 53115 - 53001
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53115 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 53016  T
Q  158 atgaaactatgataa 172  Q
    |||||||||||||||    
T  53015 atgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52991 - 52874
Alignment:
Q  110 agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  52991 agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaat 52892  T
Q  209 gcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||  |||||||||    
T  52891 gcttatgttagtagataa 52874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12835183 - 12835110
Alignment:
Q  130 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttt 203  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||| || || ||||||||||||    
T  12835183 gcttattaaaatattgcttaagcagcttatgaaattagtataagttcttttgattaatgtatccaaacactttt 12835110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36910 - 36741
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36910 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 36811  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  36810 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataa 36741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 53717452 - 53717601
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53717452 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagctt 53717551  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53717552 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaa 53717601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 54189750 - 54189601
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189750 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 54189651  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54189650 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 54189601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 1756752 - 1756901
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756752 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1756851  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1756852 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 1756901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 8591080 - 8591249
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8591080 cagagagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagctt 8591179  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  8591180 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataa 8591249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 11639566 - 11639735
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639566 cagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 11639665  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac-ttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  11639666 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataa 11639735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 27488636 - 27488785
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488636 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 27488735  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27488736 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 27488785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 40428708 - 40428857
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40428708 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagctt 40428807  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428808 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 40428857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 207
Target Start/End: Original strand, 23776449 - 23776596
Alignment:
Q  60 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 159  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776449 gagagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 23776548  T
Q  160 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23776549 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 23776596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48910049 - 48909902
Alignment:
Q  60 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  48910049 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttat 48909950  T
Q  160 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  48909949 gaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 48909902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Original strand, 8932165 - 8932315
Alignment:
Q  57 gcagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagct 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8932165 gcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagct 8932264  T
Q  157 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8932265 tatgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaa 8932315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Original strand, 30423556 - 30423721
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30423556 agagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatg 30423654  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  30423655 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 30423721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52139405 - 52139259
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139405 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 52139306  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52139305 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 52139259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1617289 - 1617140
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1617289 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagctt 1617190  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1617189 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 1617140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 15241016 - 15241165
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15241016 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 15241115  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15241116 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 15241165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 19913618 - 19913767
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19913618 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 19913717  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  19913718 atgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaa 19913767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 28032700 - 28032849
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28032700 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 28032799  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28032800 atgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 28032849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31969886 - 31969717
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31969886 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 31969787  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  31969786 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataa 31969717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 35490761 - 35490910
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35490761 cagagagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 35490860  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35490861 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 35490910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 44379175 - 44379324
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  44379175 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaactt 44379274  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44379275 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 44379324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 44784905 - 44785074
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44784905 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 44785004  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttta-aaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  44785005 atgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataa 44785074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Original strand, 37968746 - 37968894
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37968746 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 37968845  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37968846 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 37968894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 27536092 - 27536239
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27536092 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 27536191  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaa 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27536192 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaa 27536239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47632240 - 47632070
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632240 cagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 47632141  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac--ttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| | |||||| |||||||||    
T  47632140 atgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataa 47632070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 43289951 - 43290097
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289951 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 43290050  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43290051 aaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaa 43290097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 6611348 - 6611497
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  6611348 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagctt 6611447  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6611448 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 6611497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33704046 - 33703897
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33704046 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 33703947  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33703946 atgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 33703897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38055362 - 38055213
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055362 cagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38055263  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38055262 atgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 38055213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 40680026 - 40680195
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40680026 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 40680125  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatg-cttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  40680126 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataa 40680195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 45424522 - 45424663
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424522 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 45424621  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45424622 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacac 45424663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50354006 - 50353857
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50354006 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagctt 50353907  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50353906 atgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 50353857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 186
Target Start/End: Original strand, 23269034 - 23269162
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23269034 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 23269133  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttattta 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269134 atgaaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14987997 - 14987846
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14987997 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 14987898  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14987897 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatg 14987846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 53353267 - 53353115
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcag 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  53353267 agagagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcag 53353168  T
Q  155 cttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53353167 cttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 53353115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Original strand, 23704200 - 23704366
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23704200 agagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 23704299  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  23704300 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataa 23704366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 2481396 - 2481537
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481396 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagctt 2481495  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2481496 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacac 2481537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16700986 - 16700837
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16700986 cagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 16700887  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16700886 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 16700837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37464926 - 37464777
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464926 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 37464827  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37464826 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 37464777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 53875862 - 53875713
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  53875862 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctt 53875763  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53875762 ataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 53875713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20877251 - 20877103
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20877251 agagagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 20877152  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20877151 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 20877103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 207
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055238
Alignment:
Q  67 tcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  167 tgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaa 50055238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 6688615 - 6688758
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  6688615 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca---- 6688710  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6688711 --gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 6688758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15669388 - 15669239
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15669388 cagagagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagctt 15669289  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15669288 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 15669239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 19164961 - 19165108
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19164961 cagagaaaaacgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccga-gggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagctt 19165058  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19165059 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 19165108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 27583620 - 27583789
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27583620 cagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 27583719  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  27583720 atgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataa 27583789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 54412833 - 54412684
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  54412833 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagctt 54412734  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  54412733 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 54412684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30171785 - 30171636
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30171785 cagagagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagctt 30171686  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  30171685 atgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaa 30171636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16704023 - 16703857
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16704023 agagaatcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16703924  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaac-acttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  16703923 aaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataa 16703857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 55344813 - 55344982
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||     
T  55344813 cagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactc 55344912  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  55344913 atgcaaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataa 55344982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44376041 - 44375909
Alignment:
Q  67 tcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44376041 tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaacta 44375942  T
Q  167 tgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  44375941 tgataaactatttttatttatttacccgaacac 44375909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 38071314 - 38071457
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071314 cagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38071407  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38071408 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 38071457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28360599 - 28360486
Alignment:
Q  95 tccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttaccc 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28360599 tccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttatttaccc 28360500  T
Q  194 aaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| |||||||    
T  28360499 aaacacctttaaaa 28360486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053499
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaa 50053499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 53408225 - 53408137
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagcc-gaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408225 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  115 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 121
Target Start/End: Original strand, 23261874 - 23261937
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctga 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23261874 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 161
Target Start/End: Original strand, 9595890 - 9595982
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||           || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9595890 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-----------gagagtttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 9595978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48748263 - 48748197
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaa 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  48748263 cagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 50055350 - 50055301
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagcc 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50055350 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  119 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493399
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac 197  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaac 17493399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 92
Target Start/End: Original strand, 55344681 - 55344715
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataa 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55344681 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Original strand, 46257269 - 46257366
Alignment:
Q  130 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttt-aaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||||| | |||||| || |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||    
T  46257269 gcttattaaactatagaataaacagcttatgaaattgtgataaactctttcaattgatttacccaaacaattttgtaaatgcttatgtcagtagataa 46257366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8042809 - 8042640
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042809 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8042710  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  8042709 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 8042640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25999590 - 25999421
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999590 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25999491  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  25999490 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 25999421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 25494271 - 25494420
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494271 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25494370  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25494371 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 25494420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 37698129 - 37698278
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37698129 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 37698228  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37698229 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 37698278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38856295 - 38856146
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856295 cagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38856196  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38856195 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 38856146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32244317 - 32244153
Alignment:
Q  63 agaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 162  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244317 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 32244218  T
Q  163 actatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  32244217 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 32244153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Original strand, 22174976 - 22175117
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174976 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22175075  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22175076 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacac 22175117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Original strand, 42307892 - 42308040
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307892 agagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 42307991  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42307992 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaa 42308040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Original strand, 46452149 - 46452297
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46452149 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactta 46452248  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46452249 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 46452297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 15520128 - 15520277
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15520128 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 15520227  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15520228 atgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 15520277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 20842334 - 20842483
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20842334 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagctt 20842433  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20842434 atgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 20842483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21581244 - 21581095
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581244 cagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 21581145  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21581144 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 21581095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29445690 - 29445541
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29445690 cagatagaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagctt 29445591  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29445590 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaa 29445541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32359461 - 32359292
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359461 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 32359362  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttta-aaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||    
T  32359361 atgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataa 32359292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35226649 - 35226500
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226649 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 35226550  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35226549 atgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaa 35226500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 44609319 - 44609488
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609319 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 44609418  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  44609419 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataa 44609488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50529131 - 50528990
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529131 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 50529032  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50529031 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacac 50528990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 54870160 - 54870329
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54870160 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 54870259  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  54870260 atgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataa 54870329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Original strand, 24835686 - 24835834
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24835686 agagataatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 24835785  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24835786 tgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 24835834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 38934147 - 38933978
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38934147 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagctt 38934048  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||    
T  38934047 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataa 38933978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15520837 - 15520697
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520837 agagagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 15520738  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15520737 tgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacac 15520697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44688961 - 44688794
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44688961 agagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatat-gcataagcagctta 44688863  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  44688862 tgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataa 44688794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53028419 - 53028285
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  53028419 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagttt 53028320  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacc 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028319 atgaaaatatgataagctatttttatttatttacc 53028285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20699350 - 20699210
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699350 agagagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 20699251  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20699250 tgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacac 20699210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 48924989 - 48925156
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48924989 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagctt 48925088  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  48925089 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac-ttttaaaaaagcttatggaagtagataa 48925156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16354548 - 16354378
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16354548 cagagataatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagctt 16354449  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatg-cttatgaaagtagataat 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||    
T  16354448 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataat 16354378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 12117644 - 12117793
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12117644 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaactt 12117743  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12117744 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 12117793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 42104957 - 42105106
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42104957 cagagggaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 42105056  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  42105057 atgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaa 42105106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 54534314 - 54534461
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54534314 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatt-gaatatggcataagcagctt 54534412  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54534413 at-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 54534461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2895391 - 2895238
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcata----agttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 153  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895391 cagagagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 2895292  T
Q  154 gcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2895291 gcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaa 2895238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26123015 - 26122867
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    |||||||||||||| |  |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26123015 agagagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctta 26122916  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26122915 tgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 26122867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34700543 - 34700394
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34700543 cagagataatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 34700444  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34700443 atgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaa 34700394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35643367 - 35643250
Alignment:
Q  110 agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaat 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||     
T  35643367 agggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaag 35643268  T
Q  209 gcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  35643267 gcttatggaagtagataa 35643250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12916105 - 12915959
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||  || || |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  12916105 agagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatg 12916006  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12916005 aaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaa 12915959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529908
Alignment:
Q  126 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 50529908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24366230 - 24366143
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 146  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366230 agagagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13696995 - 13696914
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 139  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696995 cagagagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128102
Alignment:
Q  132 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaa 49128102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 106
Target Start/End: Original strand, 50528868 - 50528916
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagc 106  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50528868 cagatagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 18806884 - 18807053
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18806884 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 18806983  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  18806984 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 18807053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 3873244 - 3873413
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873244 cagagagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3873343  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-cttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  3873344 atgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataa 3873413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 31517215 - 31517364
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31517215 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 31517314  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31517315 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 31517364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 33906047 - 33906196
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906047 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33906146  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33906147 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 33906196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 1482903 - 1483052
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1482903 cagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1483002  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1483003 atgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 1483052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 2178769 - 2178918
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178769 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 2178868  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2178869 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaa 2178918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4016244 - 4016095
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4016244 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 4016145  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4016144 atgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaa 4016095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 26323186 - 26323335
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323186 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26323285  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  26323286 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaa 26323335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 30270679 - 30270828
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30270679 cagagataatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 30270778  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  30270779 atgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaa 30270828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 19383938 - 19384084
Alignment:
Q  61 agagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19383938 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatg 19384037  T
Q  161 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19384038 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 19384084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42937925 - 42937775
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagct 156  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42937925 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagct 42937826  T
Q  157 tatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42937825 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 42937775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 851202 - 851033
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  851202 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 851103  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttt-aaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    || ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  851102 ataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataa 851033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 4232142 - 4232311
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4232142 cagagataatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagctt 4232241  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatg-cttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  4232242 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataa 4232311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5733604 - 5733455
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5733604 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 5733505  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5733504 atgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaa 5733455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 226
Target Start/End: Original strand, 16066302 - 16066463
Alignment:
Q  66 atcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066302 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 16066401  T
Q  166 atgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaatg-cttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  16066402 atgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataa 16066463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39635656 - 39635508
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39635656 agagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagctta 39635557  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39635556 tgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaa 39635508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 28329839 - 28329986
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28329839 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 28329936  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28329937 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 28329986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 430017 - 429852
Alignment:
Q  62 gagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 161  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  430017 gagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatga 429918  T
Q  162 aactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttt-aaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  429917 aattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataa 429852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Original strand, 16588776 - 16588945
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16588776 cagagataatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 16588875  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaac-acttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  16588876 atgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataa 16588945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 223
Target Start/End: Original strand, 19901143 - 19901303
Alignment:
Q  63 agaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 162  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19901143 agaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaa 19901242  T
Q  163 actatgataagctatttttatttatttacccaaacactttt-aaaatgcttatgaaagtaga 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  19901243 actatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtaga 19901303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108335
Alignment:
Q  78 tacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  178 ttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaa 1108335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 6174828 - 6174977
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  6174828 cagagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagctt 6174927  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6174928 atgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 6174977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 215
Target Start/End: Original strand, 44947549 - 44947700
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  44947549 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagctt 44947641  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttt-aaaatgcttatg 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44947642 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatg 44947700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 207
Target Start/End: Original strand, 30420181 - 30420316
Alignment:
Q  60 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 159  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420181 gagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaag------------ctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 30420268  T
Q  160 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30420269 gaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 30420316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 207
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446718
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaa 42446718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585348
Alignment:
Q  114 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaa 205  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaa 3585348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101296
Alignment:
Q  121 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||  |||| || |||||||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaa 22101296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39463225 - 39463160
Alignment:
Q  150 agcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttta-aaatgcttat 214  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39463225 agcagcttatgaaattgtgataagcactttccattgatttacccaaacacttttataaatgcttat 39463160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Original strand, 145246 - 145394
Alignment:
Q  59 agagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  145246 agagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 145345  T
Q  159 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  145346 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 145394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 6 - 155
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagctt 105  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  106 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3915 - 3746
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3915 cagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3816  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacac-ttttaaaatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  3815 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataa 3746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10443 - 10274
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10443 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagctt 10344  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaa-aatgcttatgaaagtagataa 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  10343 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataa 10274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 6 - 154
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  6 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcat 104  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  105 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 295 - 444
Alignment:
Q  58 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  295 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 394  T
Q  158 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  395 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 545 times since January 2019
Visitors: 2567