View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0278_high_1 (Length: 481)

Name: NF0278_high_1
Description: NF0278
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0278_high_1
NF0278_high_1
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (7-460)||(27104120-27104573)
chr7 (7-460)||(7827371-7827824)
chr7 (7-460)||(27173752-27174205)
chr7 (7-462)||(4443392-4443847)
chr7 (7-458)||(13459484-13459943)
chr7 (7-107)||(16575119-16575219)
chr7 (7-107)||(16590443-16590543)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (7-460)||(16378855-16379308)
chr6 (7-460)||(16646451-16646904)
chr6 (13-460)||(22364852-22365299)
chr6 (64-458)||(14149746-14150139)
chr6 (7-460)||(21412008-21412461)
chr6 (7-460)||(1660325-1660778)
chr6 (49-460)||(16103651-16104062)
chr6 (7-224)||(18421146-18421363)
chr6 (73-458)||(19982149-19982534)
chr6 (118-329)||(17786673-17786884)
chr6 (7-74)||(15007241-15007308)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (7-460)||(30150468-30150921)
chr3 (7-460)||(8270975-8271428)
chr3 (7-460)||(13963931-13964384)
chr3 (23-460)||(17201747-17202184)
chr3 (13-457)||(17321176-17321620)
chr3 (28-460)||(22149343-22149775)
chr3 (7-461)||(6149429-6149883)
chr3 (23-368)||(25768418-25768763)
chr3 (10-460)||(15943174-15943624)
chr3 (305-372)||(22259970-22260037)
chr3 (305-372)||(22268462-22268529)
chr3 (43-269)||(22260052-22260280)
chr3 (43-269)||(22268219-22268447)
chr3 (25-133)||(30084945-30085053)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (7-460)||(20827801-20828254)
chr1 (7-460)||(22128847-22129301)
chr1 (7-458)||(41214270-41214721)
chr1 (101-460)||(20928551-20928910)
chr1 (101-460)||(20528550-20528909)
chr1 (32-445)||(20172643-20173056)
chr1 (350-460)||(23312571-23312681)
chr1 (7-56)||(22840465-22840514)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (7-460)||(15289495-15289948)
chr4 (52-376)||(18272652-18272976)
chr4 (7-432)||(15000164-15000588)
chr4 (68-460)||(12339272-12339664)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (7-460)||(24584596-24585049)
chr5 (7-461)||(21828202-21828655)
chr5 (7-460)||(23509071-23509524)
chr5 (98-328)||(33313828-33314075)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (33-458)||(20242-20667)
scaffold0021 (33-458)||(29818-30243)
scaffold0021 (7-461)||(8667-9121)
scaffold0021 (163-460)||(91013-91310)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (7-460)||(4147-4599)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (7-461)||(25041-25494)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (7-458)||(25131574-25132026)
chr2 (10-461)||(22281217-22281668)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (7-460)||(5354-5806)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-458)||(35513-35963)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (23-460)||(21193348-21193785)
chr8 (7-460)||(21847117-21847570)
chr8 (7-460)||(20649135-20649588)
chr8 (177-437)||(16415656-16415916)
chr8 (13-71)||(22553262-22553320)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (7-460)||(3266-3719)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (29-460)||(97038-97467)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (7-462)||(3999-4454)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (7-460)||(26907-27360)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (117-367)||(2180-2430)
scaffold0193 (7-74)||(2438-2505)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (7-461)||(25689-26142)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (181-458)||(32389-32665)
scaffold0151 (7-140)||(32257-32391)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (7-460)||(12671-13124)
scaffold0467 (49-460)||(3-414)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (7-432)||(3250-3675)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (7-461)||(101-555)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (88-460)||(372-744)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (94-460)||(27287-27653)
scaffold0008 (163-460)||(130982-131282)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (64-460)||(4768-5163)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (177-460)||(12135-12418)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (10-460)||(6200-6653)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (101-461)||(8823-9175)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (251-460)||(16412-16621)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (281-460)||(24474-24653)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (163-435)||(7932-8204)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (313-460)||(77661-77808)
scaffold0011 (313-460)||(73280-73427)
scaffold0011 (349-461)||(182500-182612)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (356-460)||(35587-35691)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (70-458)||(77934-78322)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (7-213)||(3168-3374)
scaffold0302 (412-460)||(1722-1770)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (309-460)||(49170-49321)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 27104120 - 27104573
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27104120 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 27104219  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104220 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 27104319  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  27104320 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 27104419  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  27104420 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 27104519  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27104520 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27104573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 7827824 - 7827371
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7827824 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 7827725  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827724 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 7827625  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  7827624 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 7827525  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    |||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  7827524 aggttttgcccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 7827425  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7827424 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 7827371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27174205 - 27173752
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27174205 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatcgtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 27174106  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27174105 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 27174006  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  27174005 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 27173906  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  27173905 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 27173806  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27173805 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27173752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4443847 - 4443392
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||||||    
T  4443847 ggagctcagacatgggtgcagggcatggagaggatcttctatgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacctacatgcttgctgagg 4443748  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4443747 aggccgagtattggtggacgaatgctaagggaagacttgagatcggcagagaggttgggacttgggcaaggttcaagactaagtttttgaggaagtactt 4443648  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||     
T  4443647 tccagaggatttgaggaatagaaaggaagtggagttcttaaacttgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcg 4443548  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||| | ||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  4443547 aggttttatgcgtacattaatgttgaggatgcaatggtgtccaagtgtgtgaaatttgaaagtggacataggccggatatctatcagtatatgtgtgtta 4443448  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgtc 462  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4443447 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 4443392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 13459943 - 13459484
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtg--------actggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgct 98  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||| |||| || |  || ||||| ||||||||    
T  13459943 ggagctcagacattggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgctatggtgactggtgatgattagaaggtcaagttagctacccacatgct 13459844  T
Q  99 tgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgagg 198  Q
    || ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  13459843 tgttgaggaggctgagcattggttgacgaatgctaagggaagacttgagatcagtggagaggtagtgacttaggttaggttcaagactgagtttttgagg 13459744  T
Q  199 aagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgagg 298  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |  ||||||| |  ||||||||||    
T  13459743 aagtattttccagaggatttgaggagcaggaaggaagtggaattcttgaacttgaagcaagggagcttgtctgtcactaagtatgctgcaaagtttgagg 13459644  T
Q  299 aacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatat 398  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| |||| |    
T  13459643 aacttccgaggttttatccctacattaatgtcgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaacgtgggcttaagctggatatctatcagtatgt 13459544  T
Q  399 gtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  13459543 gtgtgtttaggatattagagacttcgatactttggtgcacaagtgtcgtatattcgatga 13459484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Original strand, 16575119 - 16575219
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| | | |||| ||||||||| |||| || | ||| |||||||  || ||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  16575119 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16575218  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  16575219 a 16575219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16590543 - 16590443
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| | | |||| ||||||||| |||| || | ||| |||||||  || ||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  16590543 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16590444  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  16590443 a 16590443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 16378855 - 16379308
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16378855 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 16378954  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378955 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 16379054  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  16379055 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 16379154  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  16379155 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 16379254  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16379255 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16379308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 16646451 - 16646904
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16646451 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagagaatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 16646550  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16646551 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggaggggttgtgacttggacaacgttcaagactgagtttttgaggaagtactt 16646650  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  16646651 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 16646750  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  16646751 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgtta 16646850  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16646851 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16646904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 460
Target Start/End: Original strand, 22364852 - 22365299
Alignment:
Q  13 cagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccg 112  Q
    ||||| ||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||  |||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22364852 cagacttgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacaagtgatgactagaaggtcaggttggttactcacatgcttgctgaggaggccg 22364951  T
Q  113 agtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccgga 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||| || || ||    
T  22364952 agtattggtggactaattctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagttgagttcttgaggaagtatttccctga 22365051  T
Q  213 agatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttt 312  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||| || ||| | || |||    
T  22365052 aggtttgaggaccaggaaggaagtagagttcttgaacttgtagcaagggagcatgtctgtagctgagtatacggcgaagtttgaagagctttcgagattt 22365151  T
Q  313 tgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggaga 412  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22365152 tttccatacatcaatgttgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgagcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 22365251  T
Q  413 tccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  22365252 tccgagattttgatactttggtgtataagtgtcgtatgtttgatgatg 22365299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 64 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14150139 - 14149746
Alignment:
Q  64 gatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttg 163  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14150139 gatgatcagaaggtcaggttggctactcacatgtttgttgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaaaacttgagattggtggagaggttg 14150040  T
Q  164 tgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggag 263  Q
    |||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14150039 tgacttgggctaagttcaagaccgagtttttgaggaagtactttctagaggatttgaggactaggaaggaggtggagttcttgaacttgaagcaagggag 14149940  T
Q  264 catgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagttt 363  Q
     ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  14149939 tatgtccgtggctgagtatgcggcgatgtttgaggagctgtcgaggttttgtccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtgtccaagtgtgtgaaattt 14149840  T
Q  364 gaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||   ||||||||||||||||||    
T  14149839 gaaagtgggcttaggctggatttctatctgtatatgtgtgttcaagagatccgagattttgatacctt-gtgcatcagtgtcgtatgtttgatga 14149746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 21412008 - 21412461
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21412008 ggagctcagacttgggtgcagggcatggagcggatatttcgtgctatggtgacgggagatgaccaaaaggccagattggcgactcatatgcttgctgagg 21412107  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| | |||||| || || || || |||||||| ||    
T  21412108 aggctgagtactggtggactaatgtcaaaggaagatttgagatgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagcagaattcttaaggaagtattt 21412207  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||| |     
T  21412208 ccctgaagatttgagaactaggaaggaggtggaatttctgaacctgaagcagggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcg 21412307  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21412308 aagttttgtccgtacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 21412407  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||    
T  21412408 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgttgcatgtttgttgatg 21412461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 1660325 - 1660778
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| | || ||||| ||| |||||||||    
T  1660325 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgtttgctgagg 1660424  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||| | || || || || ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  1660425 aagcagagtactggtggatcaatgccaagggcaggcttgagttgggcggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 1660524  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     |||||||| |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  1660525 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcg 1660624  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  1660625 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggtcatctatcagtacatgtgtgttc 1660724  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1660725 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 1660778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 49 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16104062 - 16103651
Alignment:
Q  49 gctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgaga 148  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | || |||||  ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  16104062 gctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatgtgcttgctgaggaagcggagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgaaa 16103963  T
Q  149 ttggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaa 248  Q
    | || || || || ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||| || |||||  ||||    
T  16103962 tgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagctgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggactaagaaggaggttgagtttctgaa 16103863  T
Q  249 cttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttcc 348  Q
     ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16103862 tttgaatcaaggaagcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttccaggttttttccctacatcaatgctgaagatgctatggtttcg 16103763  T
Q  349 aagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgta 448  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  16103762 aagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgcgtctaggagatccgagactttcatactttggtgcaaaagtgtcgta 16103663  T
Q  449 tgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||    
T  16103662 tgtttgatgatg 16103651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18421363 - 18421146
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| || ||  ||||||||||  | ||||| ||||| || ||| | || ||||| ||||||||| |||    
T  18421363 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgatctatggtgacgagggatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctaagg 18421264  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| | |||| ||| ||| || ||||||||||| ||    
T  18421263 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgttgtgacctgggctaagttccaggttgaattcttgaggaagtattt 18421164  T
Q  207 tccggaagatttgaggac 224  Q
     || ||||| ||||||||    
T  18421163 ccctgaagacttgaggac 18421146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 458
Target Start/End: Original strand, 19982149 - 19982534
Alignment:
Q  73 aaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggg 172  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| || | || ||||  |||||||||||| ||    ||||| | |||||||||  ||||||||| || ||| ||||||    
T  19982149 aaagttagattggctacacatatgtttcccgaagaggatgagtattggtgggctggatctaagaggagacttgaggctggtggagaagtcgtgtcttggg 19982248  T
Q  173 caaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgt 272  Q
     ||  ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||| ||||| |||||| |  | |||||||| | ||||||||  ||    
T  19982249 gaaaattcaagagtgaatttatgaggaagtactttccgaaagacttgaggaacaagaaagaagttgagttcatacagttgaagcaggagagcatgtatgt 19982348  T
Q  273 ggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgga 372  Q
     ||  ||||  ||   |||||| |||| ||  | ||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |     
T  19982349 tgcgtagtacacgactaagtttaaggagctatcaaggttttgttcgtatattaatgttgaggatgctatggtttcaaaatgtgagaagtttgagagtcgt 19982448  T
Q  373 cttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
     | ||||| || || |||| ||| ||  || |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  19982449 ttgaggcccgagatttatcagtacatacgttttcatgagatccgagatttttatactttggtacacaagtatcgtatgtttgatga 19982534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17786884 - 17786673
Alignment:
Q  118 tggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatt 217  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| | ||| | ||||||||  || || |||||||| || || || ||||| |    
T  17786884 tggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctaggctaagttcaaggtcgaattcttgaggaaatatttccctgaagact 17786785  T
Q  218 tgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtcc 317  Q
    ||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||    
T  17786784 tgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgaatatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttatcc 17786685  T
Q  318 gtacatcaatga 329  Q
     ||||| |||||    
T  17786684 ttacataaatga 17786673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 15007241 - 15007308
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaa 74  Q
    ||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15007241 ggagcgcagacatggggtcaaggcatggaaaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaa 15007308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 30150921 - 30150468
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30150921 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 30150822  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30150821 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 30150722  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  30150721 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 30150622  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  30150621 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 30150522  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30150521 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 30150468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 8270975 - 8271428
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8270975 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcaaaaggtgaggttggctactcgcatgcttgctgagg 8271074  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271075 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 8271174  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  8271175 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 8271274  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  8271275 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcaaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 8271374  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  8271375 aggagatccgagactttgatactttggtgaataagtgtcgtatgtttgatgatg 8271428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 13963931 - 13964384
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13963931 ggagctcagacatggttgcaaggcatggaaaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgttgagg 13964030  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13964031 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaaggttcaaagctgagtttttgaggaagtactt 13964130  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  13964131 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 13964230  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  13964231 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 13964330  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13964331 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 13964384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 17202184 - 17201747
Alignment:
Q  23 tgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtg 122  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17202184 tgcagggcatggagaggatatttcgtgctatggtgacgagtgatgaacagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattagtg 17202085  T
Q  123 gactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgagg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17202084 gactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagttcttgaggaagtattttcctgaagatttgagg 17201985  T
Q  223 actaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtaca 322  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| || |||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  17201984 accaggaaggaagtggagttcctgaacttgaagcaagggagcatgtccatagctgtgtatgtggcgaagtttgaggagcttttgaggttttgtccgtaca 17201885  T
Q  323 tcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactt 422  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  17201884 tcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtttaggagatcctagattt 17201785  T
Q  423 taatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17201784 tgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 17201747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 457
Target Start/End: Original strand, 17321176 - 17321620
Alignment:
Q  13 cagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccg 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||  |||||||||||| ||||||| |    
T  17321176 cagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctaaccacatgcttgctaaggaggctg 17321275  T
Q  113 agtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccgga 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17321276 agtattggtggacgaatgctaaggggagactcgagataggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggttgagtttttgaggaagtactttccaga 17321375  T
Q  213 agatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttt 312  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || ||| | ||||||    
T  17321376 ggatttgagaactagaaaggaagtggagttcttgaacttgcagtaagggagcatgtccgtggctgagtatgcagcaaagtttgaagagctttcgaggttt 17321475  T
Q  313 tgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggaga 412  Q
    |   ||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17321476 ttctcgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtccaagtgtgtgaaatttgaaagtggacttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 17321575  T
Q  413 tccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatg 457  Q
    | ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  17321576 ttcgagagtttgataccttggtgcataagtgtcgtatgtttgatg 17321620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Original strand, 22149343 - 22149775
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggacta 127  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22149343 ggcatagagaggatctttcatgcggtggtgactggcgatgaccagaaggttaggttggctactcatatgcttgctgaggaggcagagtattagtggacta 22149442  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactag 227  Q
    |||| || |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  22149443 atgccaaaggaagacttgagatggagggggaggtggtgacttgggcaaggttcaaggccgagttcttgaggaagtatttttcggaagatttgaggacaag 22149542  T
Q  228 gaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaat 327  Q
    |||||  || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  22149543 gaaggtggtagaattcttaaacttgaagcaaggaagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaagagtttgcaaggttttgtctgtacatcaat 22149642  T
Q  328 gatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaata 427  Q
    |  ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||| |||||| ||| |||||||| || |||||||| || ||| | |    
T  22149643 gtcgagaatgcaatggtgtccaagtgtgtgaagtttgagagtgggctttggctagatgtctatcagtacatgtgtgtgcaagagatccgtgattttgaca 22149742  T
Q  428 ctttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22149743 ctttggtgcacaagtgtcatatgtttgatgatg 22149775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Original strand, 6149429 - 6149883
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||||| || ||| |||| || |||||| |||| || || ||||||||||| || | ||| ||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||    
T  6149429 ggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacaggaggtgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgcttgctgagg 6149528  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| | ||| |||| ||| || ||||||||||| ||    
T  6149529 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggcgaagtttaaggttgaattcttgaggaagtattt 6149628  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     || ||||| |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  6149629 ccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcg 6149728  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  6149729 aggttttgcccctacatcaatgctgaggatgctatggttttgaagtatgtgaagtttgagagtgggcttaggccgaatatctatcagtacatgtgtgttc 6149828  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  6149829 aggagatccgagactttgatactttggtgcattagtgttgtatgtttgatgatgt 6149883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25768763 - 25768418
Alignment:
Q  23 tgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtg 122  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25768763 tgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacgagtgatgaccaaaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgaggaggccgaacattggtg 25768664  T
Q  123 gactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgagg 222  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  25768663 gactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtatttccctgaagatttgagg 25768564  T
Q  223 actaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtaca 322  Q
    || |||||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||| || || ||   |||||| |  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  25768563 accaggaaggaggttgagtttctgaacttgaaacaaggaagcatatctgtagctacgtatgcagaaaagtttgaggagctttcaaggttttgtccgtaca 25768464  T
Q  323 tcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaag 368  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25768463 tcaatgctgaagatgctatggtttcaaagtgtgtgaagtttcaaag 25768418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 460
Target Start/End: Original strand, 15943174 - 15943624
Alignment:
Q  10 gcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggagg 109  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||  ||| || || |||||||| || || ||||| || || || ||| |||| ||||| ||| |  ||||||| |    
T  15943174 gcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaag 15943273  T
Q  110 ccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttcc 209  Q
    | ||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||| | |  || || || ||||| ||||| | |||||||| ||| || || |||||||| || ||    
T  15943274 cggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaagtatttccc 15943373  T
Q  210 ggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctagg 309  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||  | |||||  ||||  | |||||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||    
T  15943374 ggaagacttgaggaccaagaatgagattgagtttctgaatctaaagcaaggaatcttgtcagtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgagg 15943473  T
Q  310 ttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcagg 409  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15943474 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgcgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcagg 15943573  T
Q  410 agatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15943574 agatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15943624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22260037 - 22259970
Alignment:
Q  305 ctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgga 372  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22260037 ctaggttttgtccttatatcaatgttgaagatgctatggtgtccaagtgtgttaagtttgagagtgga 22259970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 372
Target Start/End: Original strand, 22268462 - 22268529
Alignment:
Q  305 ctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgga 372  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22268462 ctaggttttgtccttatatcaatgttgaagatgctatggtgtccaagtgtgttaagtttgagagtgga 22268529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22260280 - 22260052
Alignment:
Q  43 tttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggct--actcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaag 140  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||    || |||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  22260280 tttcgtgctaaggttactagtgatgatcataaagtgaggttggagtcacgcacatgctagcggaggaggctgagtattggtgggataatgataagagaag 22260181  T
Q  141 acttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggag 240  Q
    | | ||| ||||||| || || ||  ||||||  || || ||||  || || ||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||  | |||||||||||||    
T  22260180 attagaggttggtggtgatgtggtatcttgggagagattaaaggaggaattcttgagaaagtattttccagccgatctgaggaacaagaaggaagtggag 22260081  T
Q  241 ttcttgaacttgaagcaagggagcatgtc 269  Q
    |||||  |  | |||||||||||||||||    
T  22260080 ttcttacagcttaagcaagggagcatgtc 22260052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 269
Target Start/End: Original strand, 22268219 - 22268447
Alignment:
Q  43 tttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggct--actcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaag 140  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||    || |||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||    
T  22268219 tttcgtgctaaggttactagtgatgatcataaagtgaggttggagtcacgcacatgctagcggaggaggctgagtattggtgggataatgataagagaag 22268318  T
Q  141 acttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggag 240  Q
    | | ||| ||||||| || || ||  ||||||  || || ||||  || || ||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||  | |||||||||||||    
T  22268319 attagaggttggtggtgatgtggtatcttgggagagattaaaggaggaattcttgagaaagtattttccagccgatctgaggaacaagaaggaagtggag 22268418  T
Q  241 ttcttgaacttgaagcaagggagcatgtc 269  Q
    |||||  |  | |||||||||||||||||    
T  22268419 ttcttacagcttaagcaagggagcatgtc 22268447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 30084945 - 30085053
Alignment:
Q  25 caaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtgga 124  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||| |||   || |||||||| |||||    || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||     
T  30084945 caaggtattgagaggattttccgtgctatggttactacggaggatcagaaggtgaggcaagccactcacatgcttgtggaggaggctgagtattggtggg 30085044  T
Q  125 ctaatgcta 133  Q
    | |||||||    
T  30085045 cgaatgcta 30085053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 20827801 - 20828254
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20827801 ggagctcaaacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 20827900  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20827901 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 20828000  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  20828001 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 20828100  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  20828101 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 20828200  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20828201 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 20828254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 22128847 - 22129301
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || || || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22128847 ggagctcagacgtgggtgcaaggcatggagaggatctttcgaactatggtgactagtgatgatcaaaaggtcaggttggctactcatatgattgctgagg 22128946  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaaga-cttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtact 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22128947 aggccgagtattggtggactaatgctaaggcaaaagcttgagattggtgaagaggttgtgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtact 22129046  T
Q  206 ttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgc 305  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22129047 ttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggttgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgc 22129146  T
Q  306 taggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgtt 405  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22129147 aaggttttgttcgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttcgaagtgtgtgaaatttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtt 22129246  T
Q  406 caggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22129247 taggagatcctagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 22129301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 458
Target Start/End: Original strand, 41214270 - 41214721
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  41214270 ggagctcagacataggtgcaaggaatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 41214369  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  41214370 aggctgagtattggtagacgaatgctaaggggagactcgagatcggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaagactgagtttttgaggaagtcctt 41214469  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||| || |||       
T  41214470 tcctgaggatttgaggactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgctgcgatgtttgaagagcttttg 41214569  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41214570 aggttttgtccgtatattaatgctgaagatgggatggtttcgaagtgtgtgaagttcgaaagtgggctcaggctggatatctatcagtatatgtgtgttc 41214669  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  41214670 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgcatgtttgatga 41214721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 20928910 - 20928551
Alignment:
Q  101 ctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaa 200  Q
    ||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |  || || ||||| ||||| | |||||||| ||| || || |||||    
T  20928910 ctgaggaagcagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagatgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaa 20928811  T
Q  201 gtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaa 300  Q
    ||| || || ||||| |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  ||||| |||| | |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20928810 gtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaagaaaggaatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaa 20928711  T
Q  301 cttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgt 400  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20928710 ctttcaaggttttgtccctacatcaatgctcaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgt 20928611  T
Q  401 gtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20928610 gtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 20928551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 101 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 20528909 - 20528550
Alignment:
Q  101 ctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaa 200  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |  || || ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||    
T  20528909 ctgaggaagcagagcactggtggactaatgccaaaggaaggcttgagatgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaa 20528810  T
Q  201 gtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaa 300  Q
    ||| || || ||||| |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  ||||| |||| | ||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20528809 gtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggacattgagtttctgaatctgaagtaaggaatcatgtctatagccgagtatgcggcgaagttcgaggaa 20528710  T
Q  301 cttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgt 400  Q
    ||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||| || |    
T  20528709 ctttcgaggttttttccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggagatctaccagtacatat 20528610  T
Q  401 gtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  20528609 gtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgaataagtatcgtatgtttgatgatg 20528550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 20173056 - 20172643
Alignment:
Q  32 tggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  20173056 tggagaggatctttcgtgctatggttaccgatgaggactagaaagttagattggctattcacatgcttgcacaggaggctgagtattggtggactagagc 20172957  T
Q  132 taagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaag 231  Q
    |||| |||||||||||   |||||||| || ||| ||||||  |  ||||||  ||||||| ||| ||||| |||| || |||| ||||||| || |||     
T  20172956 taagagaagacttgaggccggtggagaagtggtgtcttgggagaaattcaagagtgagtttctgaagaagtgcttttcgaaagacttgaggaataagaaa 20172857  T
Q  232 gaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatg 331  Q
    || |||||||||||| | |||||||| | || |||||| || || |||||||| |  |||||||||||  |  |  |||||||||| | |||||||  ||    
T  20172856 gaggtggagttcttgcagttgaagcaggagaacatgtctgttgcggagtatgccgccaagtttgaggagatatcctggttttgtcccttcatcaatattg 20172757  T
Q  332 aagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatacttt 431  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| || || || || ||  ||| ||| || ||  |||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  20172756 aggatgctatggtgtctaagtgtgtgaaggttgagagtggtctgagtcccgagattcatcagtacatctgctttcatgagatctgagattttgatacttt 20172657  T
Q  432 ggtgcacatgtgtc 445  Q
    | |||||| |||||    
T  20172656 gatgcacaagtgtc 20172643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 350 - 460
Target Start/End: Original strand, 23312571 - 23312681
Alignment:
Q  350 agtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtat 449  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  23312571 agtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcatgagatccgagattttgatactttggtgcataagtgtcgtat 23312670  T
Q  450 gtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||    
T  23312671 gtttgatgatg 23312681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 56
Target Start/End: Original strand, 22840465 - 22840514
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggt 56  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22840465 ggagctcaggcatggatgcagggcatggagcggatctttcgtgctatggt 22840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 15289495 - 15289948
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15289495 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 15289594  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15289595 aggctgagtattggcggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 15289694  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  15289695 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaatttgaagtaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 15289794  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15289795 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagaatgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 15289894  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15289895 aggagatctgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15289948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 52 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18272976 - 18272652
Alignment:
Q  52 atggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattg 151  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18272976 atggtgactagtgacgatcagaaggtcaggtttgctacccacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattg 18272877  T
Q  152 gtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaactt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18272876 gtggagaggttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagtttttgaggaagtattttccagaagatttaaggactaggaagaaagtggagttcttgaactt 18272777  T
Q  252 gaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaag 351  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||| || ||||||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||  |||||    
T  18272776 gaagcaagggagcatgtccatagctgagtatgcggcgacgtttgaggagctatcgaggttttgttcgtacattaatgctgaggatgcaatggtgcccaag 18272677  T
Q  352 tgtgtgaagtttgaaagtggactta 376  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18272676 tgtgtgaagtttgaaggtgggctta 18272652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15000588 - 15000164
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| || || |||||  |||| || ||| | || ||||| ||| | |||||||    
T  15000588 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgactagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 15000489  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| | || || || || ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  15000488 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggggggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagta-tt 15000390  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     |||||||| |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |     
T  15000389 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatacggcgaagtttgaggaactttcg 15000290  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15000289 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 15000190  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttg 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15000189 aggagatccgagactttgatactttg 15000164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 68 - 460
Target Start/End: Original strand, 12339272 - 12339664
Alignment:
Q  68 atcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgac 167  Q
    ||||||| || || ||||||||  ||||||||| |||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||   |||||||||||| ||||    
T  12339272 atcagaaggtcaggttggctacctacatgcttgttgaggaagctgagtaccggtggacgaatgctaaggggagacttaaggcaggtggagaggttatgac 12339371  T
Q  168 ttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatg 267  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||| | |||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||| | || | ||    
T  12339372 ttgggctaggctcaagagtgagtttgtaaggaagtattttccagagaatttgaggaccaagaaggaagtgaagttcttgaatctgaagcaggagaacttg 12339471  T
Q  268 tccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaa 367  Q
    || || |  || ||||| |  ||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  12339472 tctgttgtggaatatgcagctaagttcgagaaactttcgaggttttgtccttacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgaga 12339571  T
Q  368 gtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||  | ||||| || ||  |   |||||||||||||||||||||| | || ||  |||| |||||||  | || |||||||||||||||||    
T  12339572 gtggtttgaggccagagattcactagtatatgtgtgttcaggagatcagggatttcgataccttggtgcctaagtttcgtatgtttgatgatg 12339664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 24585049 - 24584596
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24585049 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcagatgcttgctgagg 24584950  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24584949 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaatgttcaaaactgagtttttgaggaagtactt 24584850  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||     
T  24584849 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttaaggagcttgca 24584750  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24584749 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagttggagagtgggcttaggtcggatatctatcagtacatgtgtgttc 24584650  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24584649 aggagatccgagagtttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 24584596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 21828655 - 21828202
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  21828655 ggagctcagacatggctgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 21828556  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  21828555 aagctgagttttggtggactaatgctaaggggagacttgaggtcggtggagaggttgtgacttgggctaggttcaagaccgagtttttgatgaaatactt 21828456  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||| |  ||||||||||| ||| |     
T  21828455 tcctgaggatttgaggactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagtaagggagtatgtctgtcgctgagtatgcagcaaagtttgaggagctttcg 21828356  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21828355 aggttttgtacgtacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagttcgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 21828256  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    |||||||  |||| ||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21828255 aggagattagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 21828202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 23509524 - 23509071
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||| |  ||||||    
T  23509524 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgagg 23509425  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||| || | || || || || ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  23509424 aagcagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttaagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 23509325  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     || ||||| |||||||| | |||||   | |||||  ||||  |||||||||| | |||||| || ||| || ||| ||||||||| |||||||||       
T  23509324 ccccgaagacttgaggaccaagaaggcgattgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtagccaagcatgtggtgaagttcgaggaacttttg 23509225  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23509224 aggttttgtccatacatcaatgctaaggatgctatgatttcgaagtgtgcgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 23509125  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  23509124 aggagatccgagactttgatactttgatgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 23509071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Original strand, 33313828 - 33314075
Alignment:
Q  98 ttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagac-----ttgagatt----ggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctga 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  33313828 ttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacaagacttgagattgattggtggagaggttgtgacttgggctaagttcaaagctga 33313927  T
Q  189 gtttttgaggaagtactttcc---ggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaag-----ggagcatgtccgtggccgagt 280  Q
    |||||||||||||||||||||   ||  ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||||| || || ||||    
T  33313928 gtttttgaggaagtactttccagagggggatctgaggactagaaaggaagcggagttcttgaacttgaagcaagggatcggagcatgtcagtagctgagt 33314027  T
Q  281 atgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatg 328  Q
    |||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  33314028 atgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccgtacattaatg 33314075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 33 - 458
Target Start/End: Original strand, 20242 - 20667
Alignment:
Q  33 ggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgct 132  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20242 ggagaggatcttctgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggttaggttggctacccacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgct 20341  T
Q  133 aagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaagg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20342 aagggaagacttgagattggtggataggtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaagg 20441  T
Q  233 aagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |    
T  20442 aagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaa 20541  T
Q  333 agatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttg 432  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20542 ggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttg 20641  T
Q  433 gtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  20642 gtgcataggtgtcatatgtttgatga 20667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 33 - 458
Target Start/End: Original strand, 29818 - 30243
Alignment:
Q  33 ggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgct 132  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29818 ggagaggatcttctgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggttaggttggctacccacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgct 29917  T
Q  133 aagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaagg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29918 aagggaagacttgagattggtggataggtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaagg 30017  T
Q  233 aagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |    
T  30018 aagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaa 30117  T
Q  333 agatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttg 432  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30118 ggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttg 30217  T
Q  433 gtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  30218 gtgcataggtgtcatatgtttgatga 30243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 8667
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||||| || ||| |||| |||| |||| |||| ||  ||||||||||||| || | ||||||||| || | | |||| ||||  ||||||| |||||    
T  9121 ggagcacaaacgtgggtgcagggcacggagcggatattcggtgctatggtgacgggaggtgatcagaaggtcaaactggcgactcgtatgcttgttgagg 9022  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | |  ||||||||||| || |||||| ||||||| || ||  | |||||||| ||||| | |||||| ||||| || |||| |||||| ||    
T  9021 aagctgagcactattggactaatgccaaaggaagaattgagatgggaggtaaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgaattcttgatgaagtattt 8922  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     || ||||| |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |     
T  8921 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 8822  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |    
T  8821 aggttttatccgtacatcaatgctaaagatgctatggtttcgaagtgtgtaaagtttgaaagtgggcttaggccgaatatttatcagtatttgtgtgtcc 8722  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  8721 aggagatccgagactttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 8667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 163 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 91310 - 91013
Alignment:
Q  163 gtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaaggga 262  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| || ||||    
T  91310 gtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacatggga 91211  T
Q  263 gcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtt 362  Q
     |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  91210 tcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctaagatttcgaagtatgtgaagtt 91111  T
Q  363 tgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||| ||||| |||||| || | |||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  91110 tgagagtgggcttaggacgaaaatctatcaataaatgtgtgttcaggagatcagagactttgaaactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 91013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 4147 - 4599
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||  ||||||||| | ||| |||    
T  4147 ggagctcagatatggttgcaaggcatggagaggatctttcatgctatggtgactagtgatgatcagaaggtaaggttggg-actcacatggtagctaagg 4245  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4246 aagcagagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggggaggttgtgacttggataaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 4345  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  4346 tccagaggatttgagaactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 4445  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  4446 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 4545  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4546 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Original strand, 25041 - 25494
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  25041 ggagctcagacatgggtgcaaggcatggggtggatcttccgtgctatgatgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactctaatgcttgccgagg 25140  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25141 aggccgagtattggtggaccaatgctaatggaagacttgagattggtggagaagtt-tgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtactt 25239  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |     
T  25240 tccagaggatttaaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgttcgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttccg 25339  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25340 aggttttgtccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgcgcgaagtttgaaagtgggattaggccggatgtctatcagtatatgtgtgttc 25439  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    | ||||| | ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25440 aagagattcaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 25494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 25132026 - 25131574
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||    
T  25132026 ggagctcagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttagctacccacatgcttgctgagg 25131927  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25131926 aggccgagtattggtggacaaatgctaaggggagactcgagatcggcggagaggttgtgacttgggcaaggttcaagactgagttttttaggaagtactt 25131827  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcg-gtgaagtttgaggaacttgc 305  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    ||||||||||| ||| |    
T  25131826 tcaagaggatttgaggactagaaaggaagtagagttcttaaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcgacaaaagtttgaggagctttc 25131727  T
Q  306 taggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgtt 405  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25131726 gaggttttgtccgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtcacagtgtgtgaaatttgaaagtggacttaggccggatatttatcagtatatgtgtgtt 25131627  T
Q  406 caggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25131626 caggagattcgagattttgataccttggtgcaaaagtgtcgtatgtttgatga 25131574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 22281668 - 22281217
Alignment:
Q  10 gcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggagg 109  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||| |  ||||||| |    
T  22281668 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgaggaag 22281569  T
Q  110 ccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttcc 209  Q
    | ||| | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || || || ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| || ||    
T  22281568 cagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttgagatgggaggtgatgtggtaacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 22281469  T
Q  210 ggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctagg 309  Q
    | |||| |||||||| | ||||||  | ||||| |||||  ||||| |||| | |||||| || | ||||||||| | |||||| ||||||||| | | |    
T  22281468 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttttgaatctgaagtaaggaatcatgtctgtagtcgagtatgcagcgaagttcgaggaactttcgaag 22281369  T
Q  310 ttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcagg 409  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  22281368 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatttatcagtacatgtttgttcagg 22281269  T
Q  410 agatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22281268 agatccgagacttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 22281217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 5354 - 5806
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  5354 ggagctcagacatggta-caaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 5452  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5453 aggctgagtattggtggacgaatgctaaggggagacttgaagtcggtggagaggtcgtgacttgggcaaggttcaaggttgagtttttgaggaaatactt 5552  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||| || ||| |     
T  5553 tccagaggatttgagaactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtcagtggctgagtatgcgccaaagtttgaagagctttcg 5652  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
     ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5653 tggttttgtccgtatattaatgttgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 5752  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||  |||| ||| |||  |||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  5753 aggagatttgagattttgatatcttggtgcataagcgtcgtatgtttgaagatg 5806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 458
Target Start/End: Original strand, 35513 - 35963
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  35513 ggagctcagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 35612  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  35613 aagctgagttttggtggactaatgctaaggggagacttgaggtcggtggagaggttgtgacttgggctaggttcaagaccgagtttttgacgaaatactt 35712  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||| |     
T  35713 tcctgaggatttgagtactagaaaggaagtggagttcttgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggctgagtatgcagcaaagtttgaggagctttcg 35812  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35813 aggttttgtccatacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttagcccggatatctatcagtatatgtgtgttc 35912  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    |||||||  |||| ||  || |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35913 aggagattagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatga 35963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 460
Target Start/End: Original strand, 21193348 - 21193785
Alignment:
Q  23 tgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtg 122  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21193348 tgcagggcatggagaggatattttgtgctatggtgacgagtgatgaccagaaggtcagattgacgactcatatgcttgctgaggaggccgaatattggtg 21193447  T
Q  123 gactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgagg 222  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21193448 gaccaatgccaagggaagacttgagattgttggggaagtcgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtatttccctgaagatttgagg 21193547  T
Q  223 actaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtaca 322  Q
    || |||||||| || | |||  ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||||| ||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  21193548 accaggaaggaggtagcgtttctgaacttgaagtaagggagcatctctgtagccgagtatgcggcgaagttcgagaagctttcgaggttttgtccgtaca 21193647  T
Q  323 tcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactt 422  Q
    ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21193648 tcattgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagattt 21193747  T
Q  423 taatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  21193748 tgatactttggtgcataagtgtcgtaagtttgatgatg 21193785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 21847117 - 21847570
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21847117 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccaagctatggttactggtgatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgctagctgagg 21847216  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |  || |  |||||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  21847217 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcagacttgagttggaaggtggtgttgtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 21847316  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     |||||||| |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  21847317 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggtgaagtttgaggagctttcg 21847416  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  21847417 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 21847516  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21847517 aggagattcgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 21847570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 20649135 - 20649588
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| || | ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  20649135 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcgggtttttcgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgcttgctgagg 20649234  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | | |||||||||||| || |||||||||||| | || || || |||||||| ||||| | |||||| | ||| || ||||||||||  ||    
T  20649235 aagcagagcacttgtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggtgatgttgtgacctgggcgaagttcaaagttgaattcttgaggaagtgttt 20649334  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     || ||||| |||||||| | |||||| || |||||  |||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |     
T  20649335 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatttaaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 20649434  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  20649435 aggttttgtccctacatcaatgttgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtaaatgtatgtac 20649534  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  20649535 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttaatgatg 20649588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 177 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16415916 - 16415656
Alignment:
Q  177 gttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggcc 276  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| ||| ||| |||||| || |||    
T  16415916 gttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaatggatcatgtctgtagcc 16415817  T
Q  277 gagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggactta 376  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16415816 gaatatgcggcgaagtttgaggaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggctta 16415717  T
Q  377 ggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgca 437  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16415716 ggccggatatctatcagtacatgtgtgtccaggggatccgagactttgatactttggtgca 16415656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22553320 - 22553262
Alignment:
Q  13 cagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatca 71  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||    
T  22553320 cagacatgggtgcaagacatggagaggatcttccgtgctatgatgactaatgatgatca 22553262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 3266 - 3719
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| || | |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  3266 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcggatattccatgctatggtgacgggagatgaccagaaggttagattggcgactcatatgcttactgagg 3365  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| |||| || |||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  3366 aagcggagcactggtggactaatgccaagggaagacttgatatgggaggtgaagttgtgacctgggaaaagttcaaagctgaattcttgaggaagtattt 3465  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     || ||||| |||||||| | |||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||| |     
T  3466 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctatagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 3565  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  3566 aggttttgtccctacatcaatgctgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgatagtgggcttaggccagatatctatcagtacatgtgtgtcc 3665  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3666 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 3719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 97467 - 97038
Alignment:
Q  29 gcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaa 128  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  97467 gcatggagcggatattccgtgctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgaggaagctgagcagtggtggactaa 97368  T
Q  129 tgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactagg 228  Q
    ||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||| | |    
T  97367 tgccaaaagaagacttgagtttggtgaagaagttgtgacctggacaaagttcaaagctgaattcttgaggaaatatttccctgaagacttgaggaccaag 97268  T
Q  229 aaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatg 328  Q
    ||||| || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  97267 aaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccgtacatcaatg 97168  T
Q  329 atgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatac 428  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  97167 ttgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtata--tgtgttcaggagatccgagactttgatac 97070  T
Q  429 tttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  97069 tttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 97038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4454 - 3999
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||    
T  4454 ggagctcagacatgggtgcaagccatggagagggtcttccgtgttatggttactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgttgagg 4355  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  4354 aggctgagtattggtggactaatgctaaggtgagacttgaggctagtggaaaggtcgtgacttgggctaggttcaagacagagtttttgaggaagtattt 4255  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||    ||| ||||| |||||| | |   ||||||  |  ||| |     
T  4254 tccggaggatttgaggaccaggaaggaagtagagttcttgaacttcaagcatgagaatcggtcagtggcagagtatactgcatagtttgtagtgctttcc 4155  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    |||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |    
T  4154 aggttttgcccgtacatcaatgcggaggatgttatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtaggcttaggctggatatgtatcagtatatttgtgtcc 4055  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgtc 462  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4054 aggagatcgaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 3999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27360 - 26907
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    |||| |||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  27360 ggaggacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagattagcgactcatatgctagctgagg 27261  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| | |||||||  ||| || |||||||| || ||    
T  27260 aagcagagtactggtggaccaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaagtttgaattcttgaggaattattt 27161  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     ||| |||| |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27160 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttct 27061  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  27060 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 26961  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  26960 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgttgatg 26907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2430 - 2180
Alignment:
Q  117 ttggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  2430 ttggtggactaatgctaagggaagacttgagaatggtggagaggttatgacttgggatcagttcaagactgagtttttgaggaagtactttctagaggat 2331  T
Q  217 ttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtc 316  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  2330 ttgaggactaggaagcaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggatttgtc 2231  T
Q  317 cgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaa 367  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2230 cgtacattaatgttgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaa 2180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 2505 - 2438
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaa 74  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2505 ggagctcagatatgggtgcaaggcatggagaggatctcccgtgctatggtgactagtgatgatcagaa 2438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 26142 - 25689
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||| | |||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | || ||||| ||||||| |||||    
T  26142 ggagcacagacttgggtgcagggtatggggtggattttccgagctatggtgacaggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgttgagg 26043  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||  | || ||||||||||| | |||||| | ||| || ||| ||||||| ||    
T  26042 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtaatgtggtgacttgggctaagttcaaagttgaattcttg-ggaagtattt 25944  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     || ||||| ||||| |||| |||||| || |||||  ||||  |||| ||||| |||||||  || ||||||||||||| ||||||| || | ||| |     
T  25943 ccctgaagacttgagaactaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtttgtagccgagtatgcggcgaagtttaagaagctttcg 25844  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25843 aggttttgtccttacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttg 25744  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25743 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 25689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 181 - 458
Target Start/End: Original strand, 32389 - 32665
Alignment:
Q  181 aaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagt 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32389 aaggatgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactcagaaagaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgttcgtggctgagt 32488  T
Q  281 atgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggcc 380  Q
    ||||||  || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||  || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32489 atgcggcaaaatttgaggagcttgcgaggttttgttcgtacattaatgttgaggatgtgat-gtgtccaagtgtgtgaattttgaaagtgggcttaggcc 32587  T
Q  381 ggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32588 ggatatctatcagtatatgtgtgtttaggagatccaagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatga 32665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 140
Target Start/End: Original strand, 32257 - 32391
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgc-ttgctgag 105  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  32257 ggagctcagacatgggtgcaaggcatgtagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatgagaagattaggttggctactcacatgcattgctgag 32356  T
Q  106 gaggccgagtattggtggactaatgctaagggaag 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32357 gaggccgagtattggtggactaatgctaagggaag 32391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 12671 - 13124
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |  | || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  12671 ggagcacagacttgggtctaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgagg 12770  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||  ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  12771 aagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 12870  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     || ||||| |||||||| | ||||||| | |||||  ||||  |||| ||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |     
T  12871 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctgaatctgaaacaaggaaacatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 12970  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  12971 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgttt 13070  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  13071 aggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcgtatgtttgatgatg 13124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 460
Target Start/End: Original strand, 3 - 414
Alignment:
Q  49 gctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgaga 148  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  3 gctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttgaga 102  T
Q  149 ttggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaa 248  Q
    | || || || || ||||  ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| | ||||||| | |||||  ||||    
T  103 tgggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctgaa 202  T
Q  249 cttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttcc 348  Q
      |||| ||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  203 tctgaaacaaggaaacatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcg 302  T
Q  349 aagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgta 448  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||    
T  303 aaatgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgtttaggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcgta 402  T
Q  449 tgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||    
T  403 tgtttgatgatg 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3675 - 3250
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||||| || ||| |||| || |||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| | || ||||| |||||||||||||    
T  3675 ggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctgagg 3576  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | | |||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| | |||||| ||| | || ||||||||||| ||    
T  3575 aagcagagaactagtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagcttaattattgaggaagtattt 3476  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     || ||||| |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |     
T  3475 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 3376  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  3375 aggttttgtccctacatcaatgctgaagatgatatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtatcc 3276  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttg 432  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||    
T  3275 aagagatccgagactttgagactttg 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 101
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||||| || ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| | || ||||| ||||| |||||||    
T  555 ggagcacatacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 456  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| | || ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||  | || ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  455 aagcagagcactgatggactaatgccaaaggaaggcttgagttgggaggttatgtggtgacgtgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 356  T
Q  207 tccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgct 306  Q
     ||| |||| |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| |     
T  355 cccgtaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 256  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||| | || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  255 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatggtatgatctcgaagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttc 156  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  155 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 460
Target Start/End: Original strand, 372 - 744
Alignment:
Q  88 actcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctg 187  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||| | |||||||| || || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||| | |||||||| ||    
T  372 actcatatgctagctgaagaagcagagcactggtggacaaacgccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctacgttcaaggttg 471  T
Q  188 agtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggt 287  Q
    | || ||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||  | |||||  | ||  |||||||||| | |||||| || |||||||||||||     
T  472 aattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctaaatctgaagcaaggaatcatgtcggtagccgagtatgcggc 571  T
Q  288 gaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatc 387  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  572 gaagttcgaggaactttcgaggttttgtctctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatc 671  T
Q  388 tatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  672 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27653 - 27287
Alignment:
Q  94 atgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttt 193  Q
    |||||||||||||| ||  || | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || | ||| ||||| | |||||| |   | || |    
T  27653 atgcttgctgaggaagcaaagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggggacctgggctaagttcaaagtcaaattct 27554  T
Q  194 tgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtt 293  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  27553 tgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtt 27454  T
Q  294 tgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcgg 393  Q
    |||||| ||| | ||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  27453 tgaggagctttcgaggttttgtccctatatcaatgctgaggatgctgtggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtggacttaggccggatatctatcaa 27354  T
Q  394 tatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27353 tacatgtgtgttcagtagatcctagacttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 163 - 460
Target Start/End: Original strand, 130982 - 131282
Alignment:
Q  163 gtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaaggga 262  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||||||||| |    
T  130982 gtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaa 131081  T
Q  263 gcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaa---cttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaa 359  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||   ||| | ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  131082 tcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcgaggttctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaa 131181  T
Q  360 gtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgat 459  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  131182 gtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaagagatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgat 131281  T
Q  460 g 460  Q
    |    
T  131282 g 131282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 64 - 460
Target Start/End: Original strand, 4768 - 5163
Alignment:
Q  64 gatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttg 163  Q
    ||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||| | | || ||||||||  || |||||  ||||||| || || || || |    
T  4768 gatgaccagaaggtcagactggcgactcaaatgcttgctgaggaagcagagcactagttgactaatgtcaaaggaagg-ttgagatgggaggtgatgtgg 4866  T
Q  164 tgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggag 263  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||| || | ||||||||| || || ||||| |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| |||||||     
T  4867 tgacctgggctaagttcaaggttgaattctagaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggat 4966  T
Q  264 catgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagttt 363  Q
    ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4967 catgtctttcgccgagtatgcggcgaagtttgaggaaccttcgaggttttgcccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagttt 5066  T
Q  364 gaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5067 gagagtgggcttagaccggatatctatcagtacatgtgtgtccaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 5163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 177 - 460
Target Start/End: Original strand, 12135 - 12418
Alignment:
Q  177 gttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggcc 276  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| | ||||||  | |||||  ||||  |||| ||||| | |||||| || |||    
T  12135 gttcaaggttgaattattgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaatcatgtctgtagcc 12234  T
Q  277 gagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggactta 376  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12235 gagtatgcggcgaagttcgagcaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggctta 12334  T
Q  377 ggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12335 ggccagatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 460
Target Start/End: Original strand, 6200 - 6653
Alignment:
Q  10 gcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggagg 109  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| | || ||||| ||| |  ||||||| |    
T  6200 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttgactgaggaag 6299  T
Q  110 ccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttcc 209  Q
    | ||| | | |||||| ||||| |||||||| |||||| | ||    || || ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| || ||    
T  6300 cagagcactagtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaaatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 6399  T
Q  210 ggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaa---cttgct 306  Q
     ||||| |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||   ||| |     
T  6400 tgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcg 6499  T
Q  307 aggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttc 406  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6500 aggttctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 6599  T
Q  407 aggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6600 aagagatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 6653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 101 - 461
Target Start/End: Original strand, 8823 - 9175
Alignment:
Q  101 ctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaa 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||  || || ||||||| |||| | || || || || ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||    
T  8823 ctgaggaggcagagcactggtggactagcgccaaaggaagacatgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaa 8922  T
Q  201 gtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaa 300  Q
    ||| || || ||||| |||||||| |  ||||| || |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||     
T  8923 gtatttccctgaagacttgaggaccaataaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggag 9022  T
Q  301 cttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgt 400  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  9023 ctgtctaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtggacttaggccggatatctatcaatacatgt 9122  T
Q  401 gtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||| |||||||| |||        ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9123 gtgttaaggagatctgag--------actttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 9175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16621 - 16412
Alignment:
Q  251 tgaagcaagggagcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaa 350  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  16621 tgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttcaggagctgtctaggttttgtccctacatcaatcttgaggatgctatggtttcgaa 16522  T
Q  351 gtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatg 450  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  16521 gcgtgtgaagtttgagagtggacttgggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaagagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatg 16422  T
Q  451 tttgatgatg 460  Q
    ||||||||||    
T  16421 tttgatgatg 16412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 281 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 24653 - 24474
Alignment:
Q  281 atgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggcc 380  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24653 atgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgcccctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggcc 24554  T
Q  381 ggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24553 ggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 24474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 163 - 435
Target Start/End: Original strand, 7932 - 8204
Alignment:
Q  163 gtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaaggga 262  Q
    ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| | | ||||||  || ||||  ||||  |||| |||||||    
T  7932 gtgacctgggctatgttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgagggccaagaaggagatgaagtttctgaatctgaaacaaggga 8031  T
Q  263 gcatgtccgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtt 362  Q
     |||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8032 tcatgtcggtagccgagtatgtggcgaagttcgaggaacttttgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtt 8131  T
Q  363 tgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtg 435  Q
    ||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  8132 tgagagtgcgcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatcccagactttgatattttggtg 8204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 313 - 460
Target Start/End: Original strand, 77661 - 77808
Alignment:
Q  313 tgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggaga 412  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  77661 tgtccctacttcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggaga 77760  T
Q  413 tccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  77761 tccgagactttgatactttggtgcacaaatgtcgtatgtttgatgatg 77808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 313 - 460
Target Start/End: Original strand, 73280 - 73427
Alignment:
Q  313 tgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggaga 412  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  73280 tgtccctacttcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggaga 73379  T
Q  413 tccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  73380 tccgagactttgatactttggtgcaaaaatgtcgtatgtttgatgatg 73427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 349 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 182612 - 182500
Alignment:
Q  349 aagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgta 448  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  182612 aagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgta 182513  T
Q  449 tgtttgatgatgt 461  Q
    |||||||||||||    
T  182512 tgtttgatgatgt 182500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 356 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 35691 - 35587
Alignment:
Q  356 tgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttga 455  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35691 tgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttga 35592  T
Q  456 tgatg 460  Q
    |||||    
T  35591 tgatg 35587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 78322 - 77934
Alignment:
Q  70 cagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgactt 169  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||  | |||| |||||||||||  ||||||||| || ||| |||    
T  78322 cagaaagttagattggctattcatatgcttgcagaggaggatgagtattggtgggctagagttaagagaagacttgaggctggtggagaagtggtgtctt 78223  T
Q  170 gggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccggaagatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtc 269  Q
     ||| |  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |  || || |||||||||||  |  |||| || | || ||||||    
T  78222 aggcgaaattcaagagtgagtttctgaggaagtactttccggatgacttgaggaacaacaaagaggtggagttcttacaggtgaaccaggagaacatgtc 78123  T
Q  270 cgtggccgagtatgcggtgaagtttgaggaacttgctaggttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagt 369  Q
     || || |||||| |    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||    
T  78122 tgttgcggagtataccactaagtttgaggagctatcaaggttttgtcgctacattaatgttgaggatgctatggtgtcgaaatgtgtgaagtttgagagt 78023  T
Q  370 ggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcaggagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||| | ||||| || || |||| |||||| ||  |||| |||||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  78022 ggattgaggcccgagatttatcagtatatctgctttcatgagatttgtgactttgatactttggtgcacaagtgtcgcctgtttgatga 77934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3374 - 3168
Alignment:
Q  7 ggagcacagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactggtgatgatcagaaagtgagattggctactcacatgcttgctgagg 106  Q
    ||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||| |  ||||||    
T  3374 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggttagactggcgactcatatgttgactgagg 3275  T
Q  107 aggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | || || || || ||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  3274 aagcagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 3175  T
Q  207 tccggaa 213  Q
     ||||||    
T  3174 cccggaa 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1770 - 1722
Alignment:
Q  412 atccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1770 atccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 49321 - 49170
Alignment:
Q  309 gttttgtccgtacatcaatgatgaagatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtggacttaggccggatatctatcggtatatgtgtgttcag 408  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | || || |||||||||||||| |||||  | ||||| || || ||||  || || ||| ||||     
T  49321 gttttgcccgtacattaatgttgaggatgctatgatatctaaatgtgtgaagtttgagagtggtttgaggcctgagatttatcaatacatctgttttcat 49222  T
Q  409 gagatccgagactttaatactttggtgcacatgtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  49221 gagatcagagattttgatactttggtgcacaagtgtcacatgtttaatgatg 49170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 771 times since January 2019
Visitors: 2568