View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0278_low_13 (Length: 304)

Name: NF0278_low_13
Description: NF0278
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0278_low_13
NF0278_low_13
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (1-272)||(6311228-6311502)
chr8 (1-246)||(7289834-7290081)
chr8 (2-273)||(36979310-36979582)
chr8 (2-273)||(33037700-33037970)
chr8 (1-246)||(25328187-25328433)
chr8 (2-273)||(18853059-18853332)
chr8 (2-273)||(18870453-18870726)
chr8 (2-273)||(30655574-30655851)
chr8 (2-273)||(4759967-4760240)
chr8 (2-273)||(10689034-10689307)
chr8 (1-244)||(39784734-39784978)
chr8 (50-273)||(1261847-1262073)
chr8 (1-244)||(35745322-35745566)
chr8 (35-194)||(10684224-10684388)
chr8 (50-271)||(31071124-31071349)
chr8 (50-152)||(26287879-26287985)
chr8 (50-152)||(26301136-26301242)
chr8 (50-152)||(26313130-26313236)
chr8 (72-155)||(26403240-26403327)
chr8 (72-153)||(4456028-4456113)
chr8 (37-153)||(7412305-7412426)
chr8 (72-155)||(23799587-23799674)
chr8 (198-273)||(26288020-26288094)
chr8 (198-273)||(26301277-26301351)
chr8 (198-273)||(26313271-26313345)
chr8 (72-153)||(19175766-19175851)
chr8 (72-152)||(4696609-4696693)
chr8 (75-155)||(6127224-6127308)
chr8 (74-133)||(9765852-9765914)
chr8 (72-152)||(19752407-19752491)
chr8 (72-155)||(5702493-5702580)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (1-273)||(31180145-31180418)
chr5 (1-246)||(43592209-43592456)
chr5 (1-246)||(27449744-27449991)
chr5 (1-246)||(27444900-27445147)
chr5 (1-246)||(43598654-43598901)
chr5 (1-246)||(43604146-43604393)
chr5 (1-246)||(43609638-43609885)
chr5 (1-246)||(1457070-1457316)
chr5 (1-273)||(30631337-30631610)
chr5 (1-246)||(15044617-15044862)
chr5 (5-244)||(28807485-28807724)
chr5 (1-244)||(37556533-37556778)
chr5 (1-244)||(37561355-37561600)
chr5 (33-273)||(24135809-24136052)
chr5 (33-273)||(38219360-38219602)
chr5 (33-265)||(38192135-38192369)
chr5 (50-273)||(35387640-35387866)
chr5 (1-244)||(2785306-2785550)
chr5 (2-194)||(31396953-31397146)
chr5 (35-244)||(33791278-33791491)
chr5 (2-194)||(31401810-31402003)
chr5 (39-189)||(33768145-33768299)
chr5 (72-153)||(9353344-9353429)
chr5 (72-153)||(36932362-36932447)
chr5 (72-155)||(10281751-10281838)
chr5 (72-272)||(15464532-15464735)
chr5 (72-155)||(19588746-19588833)
chr5 (73-155)||(11916982-11917068)
chr5 (72-153)||(14520230-14520315)
chr5 (72-155)||(3880299-3880386)
chr5 (72-155)||(17003970-17004057)
chr5 (75-153)||(12084187-12084269)
chr5 (72-152)||(28832259-28832343)
chr5 (72-152)||(42127423-42127507)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (1-273)||(28503756-28504021)
chr3 (1-246)||(22173103-22173349)
chr3 (2-273)||(7167176-7167449)
chr3 (5-273)||(8738955-8739224)
chr3 (5-273)||(9091193-9091462)
chr3 (5-273)||(2671478-2671747)
chr3 (113-273)||(28501589-28501750)
chr3 (12-273)||(40372688-40372949)
chr3 (33-273)||(8477324-8477569)
chr3 (5-234)||(18656366-18656598)
chr3 (72-272)||(26928484-26928687)
chr3 (57-194)||(8512202-8512342)
chr3 (57-194)||(8517082-8517222)
chr3 (72-246)||(2676995-2677171)
chr3 (72-243)||(2672842-2673015)
chr3 (50-272)||(32143299-32143524)
chr3 (35-194)||(32475446-32475608)
chr3 (50-271)||(1305927-1306150)
chr3 (35-194)||(32480304-32480466)
chr3 (1-246)||(24968038-24968284)
chr3 (72-272)||(27452958-27453161)
chr3 (72-153)||(8370488-8370573)
chr3 (72-153)||(27974954-27975039)
chr3 (72-152)||(27986449-27986533)
chr3 (72-155)||(18552883-18552970)
chr3 (73-155)||(36029094-36029180)
chr3 (72-153)||(16264350-16264435)
chr3 (72-153)||(21711223-21711308)
chr3 (75-155)||(1736305-1736389)
chr3 (72-152)||(33386669-33386753)
chr3 (72-155)||(3716002-3716089)
chr3 (72-155)||(30709790-30709877)
chr3 (72-155)||(40592782-40592869)
chr3 (72-118)||(10207935-10207981)
chr3 (72-155)||(48438214-48438301)
chr3 (72-153)||(6794715-6794800)
chr3 (72-155)||(40844652-40844738)
chr3 (72-152)||(1417493-1417577)
chr3 (72-152)||(39039995-39040079)
chr3 (72-155)||(25795781-25795868)
chr3 (72-155)||(26298988-26299075)
chr3 (72-155)||(47923906-47923993)
chr3 (72-152)||(3328359-3328443)
chr3 (72-152)||(37466291-37466375)
chr3 (72-155)||(24695164-24695251)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-246)||(22010605-22010851)
chr6 (1-246)||(11856902-11857151)
chr6 (1-246)||(14737485-14737731)
chr6 (1-246)||(14742345-14742590)
chr6 (1-246)||(28184435-28184681)
chr6 (1-246)||(28155479-28155725)
chr6 (73-273)||(5674661-5674865)
chr6 (1-244)||(6438430-6438674)
chr6 (1-244)||(6005348-6005592)
chr6 (1-246)||(16838675-16838921)
chr6 (72-246)||(33330353-33330529)
chr6 (72-246)||(33335850-33336026)
chr6 (72-153)||(5757490-5757575)
chr6 (72-150)||(21356036-21356118)
chr6 (198-268)||(22709137-22709207)
chr6 (72-153)||(31086485-31086570)
chr6 (72-155)||(5572251-5572338)
chr6 (72-154)||(4629954-4630040)
chr6 (72-154)||(10077176-10077262)
chr6 (72-155)||(22963700-22963786)
chr6 (72-155)||(23824607-23824693)
chr6 (62-109)||(5343471-5343519)
chr6 (50-152)||(22708996-22709102)
chr6 (72-155)||(31979513-31979600)
chr6 (72-152)||(5017482-5017566)
chr6 (72-133)||(31936587-31936651)
chr6 (84-155)||(21801354-21801429)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (1-246)||(12406262-12406508)
chr7 (1-246)||(12396842-12397088)
chr7 (2-273)||(20357439-20357711)
chr7 (2-273)||(2057892-2058171)
chr7 (1-246)||(24024235-24024482)
chr7 (1-246)||(31109492-31109738)
chr7 (5-158)||(4866665-4866819)
chr7 (1-244)||(19992242-19992487)
chr7 (50-273)||(1533335-1533563)
chr7 (33-273)||(21639770-21640012)
chr7 (1-244)||(21812149-21812394)
chr7 (33-273)||(21645968-21646210)
chr7 (35-194)||(24261283-24261447)
chr7 (72-271)||(18413641-18413840)
chr7 (35-194)||(24266162-24266326)
chr7 (35-194)||(16880034-16880197)
chr7 (35-194)||(16884890-16885053)
chr7 (72-271)||(18408764-18408964)
chr7 (72-155)||(29159803-29159890)
chr7 (73-154)||(21983285-21983370)
chr7 (72-155)||(46516320-46516407)
chr7 (72-155)||(49091661-49091748)
chr7 (72-149)||(47263678-47263757)
chr7 (72-155)||(55948-56034)
chr7 (73-154)||(21988909-21988992)
chr7 (72-153)||(44848696-44848781)
chr7 (72-152)||(9190021-9190105)
chr7 (72-152)||(20284089-20284173)
chr7 (72-153)||(2479337-2479421)
chr7 (72-155)||(2647706-2647793)
chr7 (72-155)||(33332460-33332547)
chr7 (72-152)||(2580390-2580474)
chr7 (72-153)||(35960816-35960901)
chr7 (72-152)||(9185178-9185262)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (1-246)||(9224315-9224561)
chr4 (1-246)||(51520387-51520634)
chr4 (1-246)||(9229102-9229348)
chr4 (2-273)||(24741873-24742145)
chr4 (2-246)||(45357205-45357450)
chr4 (2-246)||(45347725-45347971)
chr4 (1-189)||(56146677-56146866)
chr4 (2-273)||(29760574-29760845)
chr4 (5-246)||(3813959-3814199)
chr4 (1-244)||(18855656-18855900)
chr4 (5-234)||(5732596-5732828)
chr4 (50-273)||(28468431-28468647)
chr4 (50-272)||(31985529-31985752)
chr4 (72-155)||(10047379-10047466)
chr4 (72-155)||(16623303-16623390)
chr4 (72-155)||(39245994-39246081)
chr4 (72-153)||(5396683-5396768)
chr4 (72-153)||(36315241-36315326)
chr4 (72-153)||(36329450-36329535)
chr4 (72-155)||(38152449-38152536)
chr4 (77-155)||(6743425-6743507)
chr4 (73-154)||(5143260-5143345)
chr4 (72-152)||(5269204-5269288)
chr4 (72-155)||(3796529-3796616)
chr4 (73-154)||(5147678-5147763)
chr4 (73-153)||(3777550-3777634)
chr4 (76-155)||(16630690-16630773)
chr4 (72-155)||(24333809-24333896)
chr4 (72-154)||(54867184-54867269)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-246)||(34970-35216)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (2-273)||(11098819-11099091)
chr2 (1-215)||(44312563-44312778)
chr2 (1-246)||(39811897-39812142)
chr2 (2-273)||(14291421-14291693)
chr2 (2-273)||(9296293-9296565)
chr2 (1-246)||(32246715-32246964)
chr2 (50-271)||(3491729-3491952)
chr2 (1-244)||(19344351-19344596)
chr2 (1-244)||(19349209-19349454)
chr2 (33-273)||(25398457-25398699)
chr2 (33-273)||(25403595-25403837)
chr2 (110-273)||(25407663-25407826)
chr2 (50-152)||(40738822-40738926)
chr2 (72-155)||(21629944-21630030)
chr2 (72-155)||(8040060-8040147)
chr2 (75-155)||(13569331-13569415)
chr2 (72-153)||(28259189-28259274)
chr2 (72-156)||(20522220-20522308)
chr2 (72-155)||(10445454-10445541)
chr2 (72-155)||(17865203-17865290)
chr2 (72-155)||(34682344-34682431)
chr2 (73-155)||(34388859-34388945)
chr2 (72-155)||(14699018-14699104)
chr2 (72-155)||(31056044-31056131)
chr2 (72-155)||(33528631-33528718)
chr2 (200-272)||(40738963-40739035)
chr2 (73-155)||(10707262-10707348)
chr2 (75-155)||(8390160-8390244)
chr2 (72-150)||(42039684-42039766)
chr2 (72-155)||(16940219-16940306)
chr2 (72-155)||(17010884-17010971)
chr2 (72-155)||(39482931-39483018)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (2-273)||(24787256-24787528)
chr1 (5-246)||(41398176-41398412)
chr1 (5-246)||(41390521-41390757)
chr1 (1-246)||(25444998-25445245)
chr1 (1-244)||(39445429-39445673)
chr1 (1-244)||(1054923-1055167)
chr1 (1-244)||(44023785-44024028)
chr1 (33-273)||(24202662-24202904)
chr1 (36-273)||(19358736-19358975)
chr1 (36-273)||(19361325-19361564)
chr1 (36-273)||(19379965-19380204)
chr1 (55-194)||(43988424-43988566)
chr1 (72-155)||(47703946-47704033)
chr1 (198-273)||(19366201-19366276)
chr1 (72-153)||(26644909-26644994)
chr1 (72-155)||(9476261-9476348)
chr1 (72-155)||(19072928-19073015)
chr1 (72-155)||(19120818-19120905)
chr1 (72-155)||(13598398-13598485)
chr1 (72-155)||(16124526-16124613)
chr1 (72-155)||(27104382-27104469)
chr1 (72-155)||(29651811-29651898)
chr1 (72-153)||(3281708-3281793)
chr1 (72-153)||(37069770-37069855)
chr1 (72-155)||(775672-775759)
chr1 (72-152)||(47098837-47098921)
chr1 (37-153)||(21536581-21536702)
chr1 (72-153)||(13604635-13604720)
chr1 (174-246)||(25439805-25439877)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (1-246)||(9552-9794)
scaffold0355 (167-246)||(3757-3836)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (1-244)||(292-536)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (33-273)||(17845-18087)
scaffold0188 (50-273)||(23938-24164)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (35-194)||(14269-14433)
scaffold0197 (1-217)||(19102-19319)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-194)||(2211-2405)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-194)||(148916-149110)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (35-138)||(181980-182088)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (2-104)||(300-400)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (72-153)||(8431-8516)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (73-153)||(85684-85768)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (72-155)||(5683-5770)
scaffold0006 (72-155)||(2492-2579)
scaffold0006 (72-153)||(133292-133377)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (72-153)||(43973-44058)
scaffold0087 (37-153)||(36844-36965)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (72-155)||(10729-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (72-152)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (75-155)||(17266-17350)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 6311228 - 6311502
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311228 tagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 6311326  T
Q  101 gcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagacagacc 198  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  6311327 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagacaaacc 6311426  T
Q  199 ctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccct--agaagagaagtcactagaggaagcttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  6311427 ctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaaaagagaagtcactagaggaagcttt 6311502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7290081 - 7289834
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7290081 tagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 7289982  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  7289981 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 7289883  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7289882 cctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaacccta 7289834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 36979310 - 36979582
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979310 agcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 36979407  T
Q  102 cctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagac 197  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  36979408 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaac 36979506  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36979507 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 36979582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33037970 - 33037700
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037970 agcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaag-aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 33037873  T
Q  102 cctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagacc 198  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |||    
T  33037872 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaacc 33037774  T
Q  199 ctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33037773 ctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaacccta-aagagaagacactagaggaagcttta 33037700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25328433 - 25328187
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatat 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328433 tagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatat 25328335  T
Q  100 ggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acaga 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |    
T  25328334 ggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaa 25328237  T
Q  197 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25328236 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaacccta 25328187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18853332 - 18853059
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853332 agcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 18853235  T
Q  102 cctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acaga 196  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |    
T  18853234 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaa 18853136  T
Q  197 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18853135 ccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 18853059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18870726 - 18870453
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18870726 agcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcatccaatatgg 18870629  T
Q  102 cctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg-ttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-caga 196  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || |    
T  18870628 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagctt-acacaagaacaaa 18870530  T
Q  197 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18870529 ccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 18870453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 30655574 - 30655851
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaa----caccgagaagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655574 agcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaat 30655672  T
Q  98 atggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-c 193  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| |    
T  30655673 atggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaac 30655771  T
Q  194 agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30655772 aaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 30655851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4760240 - 4759967
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760240 agcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacatcaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 4760142  T
Q  102 cctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagac 197  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| ||  |    
T  4760141 cctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagc 4760043  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4760042 cctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 4759967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10689307 - 10689034
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10689307 agcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 10689210  T
Q  102 cctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  |    
T  10689209 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagc 10689111  T
Q  198 cctagattctaccc-tttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10689110 cctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 10689034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39784978 - 39784734
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39784978 tagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaata 39784880  T
Q  99 tggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  39784879 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaaca 39784783  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  39784782 aaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 39784734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1262073 - 1261847
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1262073 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 1261974  T
Q  146 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    |||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1261973 gttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 1261876  T
Q  245 tagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||    
T  1261875 taaaagagaagacactagaggaagcttta 1261847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 35745322 - 35745566
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35745322 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaat 35745417  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-a 192  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | |    
T  35745418 gtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaa 35745515  T
Q  193 cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  35745516 caaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 35745566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10684388 - 10684224
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10684388 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 10684289  T
Q  130 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10684288 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 10684224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31071349 - 31071124
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 144  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31071349 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 31071250  T
Q  145 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacc 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31071249 tgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaacc 31071152  T
Q  244 ctagaagagaagtcactagaggaagctt 271  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  31071151 ctaaaagagaagacacaagaggaagctt 31071124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Original strand, 26287879 - 26287985
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26287879 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26287978  T
Q  146 gttacaa 152  Q
    |||||||    
T  26287979 gttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Original strand, 26301136 - 26301242
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26301136 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26301235  T
Q  146 gttacaa 152  Q
    |||||||    
T  26301236 gttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Original strand, 26313130 - 26313236
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26313130 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26313229  T
Q  146 gttacaa 152  Q
    |||||||    
T  26313230 gttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403240
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456113
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 4456113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412426
Alignment:
Q  37 aagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcc 132  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  133 aatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgttacaaa 7412426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799587
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23799587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 26288020 - 26288094
Alignment:
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  26288020 cctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 26288094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 26301277 - 26301351
Alignment:
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  26301277 cctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 26301351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 26313271 - 26313345
Alignment:
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  26313271 cctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 26313345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175766
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 19175766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696609
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127308
Alignment:
Q  75 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6127308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  74 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatcca 133  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19752491 - 19752407
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19752491 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5702580 - 5702493
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5702580 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaag 5702493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 31180145 - 31180418
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180145 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatg 31180243  T
Q  101 gcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagacagacc 198  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  31180244 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagacaaacc 31180343  T
Q  199 ctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  31180344 ctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaagagaagacactagaggaagcttta 31180418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 43592209 - 43592456
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592209 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 43592308  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  43592309 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 43592407  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  43592408 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaacccta 43592456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 27449744 - 27449991
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27449744 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatata 27449843  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  27449844 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 27449942  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27449943 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaacccta 27449991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 27444900 - 27445147
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27444900 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcaggcaatata 27444999  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  27445000 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 27445098  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  27445099 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaacccta 27445147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 43598654 - 43598901
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43598654 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatg 43598753  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  43598754 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 43598852  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  43598853 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaacccta 43598901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 43604146 - 43604393
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43604146 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatg 43604245  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  43604246 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 43604344  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  43604345 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaacccta 43604393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 43609638 - 43609885
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43609638 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatg 43609737  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  43609738 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 43609836  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  43609837 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaacccta 43609885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1457316 - 1457070
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1457316 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatgtg 1457218  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  1457217 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 1457119  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1457118 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaacccta 1457070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 30631337 - 30631610
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    |||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30631337 tagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgactcagttcagccaatgtg 30631435  T
Q  101 gcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  30631436 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacatgaacaaac 30631535  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30631536 catagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaacccta-aagagaagtcactagaggaagcttta 30631610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 15044617 - 15044862
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044617 tagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatg 15044715  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| ||    
T  15044716 gcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaac 15044813  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  15044814 cctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 15044862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28807724 - 28807485
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggc 102  Q
    |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28807724 aaaaccactcaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggc 28807626  T
Q  103 ctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccc 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||    
T  28807625 ctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatgaacaaaccc 28807529  T
Q  200 tagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  28807528 taga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 28807485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37556778 - 37556533
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  37556778 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatg 37556680  T
Q  99 tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||| | |||    
T  37556679 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagta--tctagcttatcaagctttacacatgaaca 37556582  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  37556581 aaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 37556533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37561600 - 37561355
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  37561600 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatg 37561502  T
Q  99 tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||| | |||    
T  37561501 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagta--tctagcttatcaagctttacacatgaaca 37561404  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  37561403 aaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 37561355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 24135809 - 24136052
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  24135809 aaacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaa 24135908  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccac 227  Q
    | || || || |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24135909 tgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccac 24136006  T
Q  228 tctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24136007 tctcacaatgtgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 24136052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 38219360 - 38219602
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38219360 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 38219458  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccac 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  38219459 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccac 38219556  T
Q  228 tctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  38219557 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 38219602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 265
Target Start/End: Original strand, 38192135 - 38192369
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38192135 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 38192233  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccac 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  38192234 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccac 38192331  T
Q  228 tctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagagg 265  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  38192332 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagagg 38192369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Original strand, 35387640 - 35387866
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  35387640 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagt 35387739  T
Q  146 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    |||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| | |   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35387740 gttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 35387837  T
Q  245 tagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  35387838 taaaagagaagacactagaggaagtttta 35387866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 2785306 - 2785550
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2785306 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaat 2785401  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-a 192  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | ||||||||||| || | |    
T  2785402 gtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttactcatgaa 2785499  T
Q  193 cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  2785500 caaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 2785550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31397146 - 31396953
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca-aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatat 99  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31397146 agcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgt 31397050  T
Q  100 ggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31397049 ggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 31396953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 244
Target Start/End: Original strand, 33791278 - 33791491
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  33791278 acaagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaa 33791376  T
Q  130 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttcccca 226  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  33791377 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttccca 33791473  T
Q  227 ctctcacaagatgaaccc 244  Q
    | ||||||  ||||||||    
T  33791474 ccctcacactatgaaccc 33791491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31402003 - 31401810
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  31402003 agcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatg 31401908  T
Q  99 tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31401907 tggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 31401810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 33768145 - 33768299
Alignment:
Q  39 gataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcca 133  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  33768145 gataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatcca 33768243  T
Q  134 atatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 189  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  33768244 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacaca 33768299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353344
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 9353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932362
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36932362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281838
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10281838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464735
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 167  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-a 15464630  T
Q  168 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa-gatgaaccctagaagagaagtcactagagg 265  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| | |||    
T  15464631 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctcacaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaagg 15464728  T
Q  266 aagcttt 272  Q
    |||||||    
T  15464729 aagcttt 15464735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588833
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 19588833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916982
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 11916982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520315
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaa 14520315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 3880299 - 3880386
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3880299 aagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3880386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003970
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084187
Alignment:
Q  75 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 12084187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Original strand, 28832259 - 28832343
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  28832259 aagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42127507 - 42127423
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||    
T  42127507 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28504021 - 28503756
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28504021 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaaga----------aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 28503932  T
Q  101 gcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagac-agac 197  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||    
T  28503931 gcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaac 28503832  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28503831 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 28503756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22173349 - 22173103
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173349 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 22173251  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  22173250 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 22173152  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22173151 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaacccta 22173103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 7167176 - 7167449
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7167176 agcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 7167274  T
Q  102 cctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagac 197  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  7167275 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaac 7167373  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7167374 cctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 7167449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8739224 - 8738955
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739224 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 8739127  T
Q  105 aatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccct 200  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||    
T  8739126 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccct 8739028  T
Q  201 agattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8739027 agattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagcttta 8738955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9091462 - 9091193
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091462 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 9091365  T
Q  105 aatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccct 200  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||    
T  9091364 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccct 9091266  T
Q  201 agattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9091265 agattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagcttta 9091193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2671747 - 2671478
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671747 aaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 2671650  T
Q  105 aatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccct 200  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||| |  ||||| |||||||||| ||  ||||    
T  2671649 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagattgcaagc-ttacacaagaccaagccct 2671551  T
Q  201 agattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2671550 agattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 2671478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 113 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501589
Alignment:
Q  113 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  212 tttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 28501589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40372949 - 40372688
Alignment:
Q  12 cacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-- 109  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40372949 cacatagagataacaaagca-aaacaagataagcaagata-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 40372852  T
Q  110 gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  40372851 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattct 40372754  T
Q  208 accctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40372753 acccatatgtgtttccccactctcataatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 40372688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 8477324 - 8477569
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8477324 aaacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 8477422  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacaca--agacagaccctagattctaccctttggtgttt-cccc 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |||||  ||||| |||||||  | |||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8477423 tccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccc 8477521  T
Q  226 actctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8477522 actctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 8477569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 18656366 - 18656598
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatat 99  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| || |||| | ||||||||||    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656366 aaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatat 18656463  T
Q  100 ggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acaga 196  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |    
T  18656464 ggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcattcaagctttacacatgaacaaa 18656561  T
Q  197 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcaca 234  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18656562 ccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 18656598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26928687 - 26928484
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||       
T  26928687 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 26928588  T
Q  169 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaa 267  Q
     |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  26928587 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaa 26928489  T
Q  268 gcttt 272  Q
    |||||    
T  26928488 gcttt 26928484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 194
Target Start/End: Original strand, 8512202 - 8512342
Alignment:
Q  57 gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8512202 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 8512301  T
Q  154 ag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    || ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8512302 agagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 8512342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 194
Target Start/End: Original strand, 8517082 - 8517222
Alignment:
Q  57 gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8517082 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 8517181  T
Q  154 ag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    || ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8517182 agagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 8517222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 2677171 - 2676995
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |    
T  2677171 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--t 2677074  T
Q  169 ctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||    
T  2677073 ctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaacccta 2676995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2673015 - 2672842
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |    
T  2673015 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--t 2672918  T
Q  169 ctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacc 243  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  |||||||    
T  2672917 ctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaacc 2672842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 272
Target Start/End: Original strand, 32143299 - 32143524
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 144  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32143299 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 32143397  T
Q  145 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacc 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32143398 tgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaacc 32143495  T
Q  244 ctagaagagaagtcactagaggaagcttt 272  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  32143496 ctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 32143524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 32475446 - 32475608
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32475446 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 32475545  T
Q  130 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32475546 tccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 32475608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Original strand, 1305927 - 1306150
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  1305927 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagt 1306025  T
Q  146 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    |||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1306026 gttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccc 1306123  T
Q  245 tagaagagaagtcactagaggaagctt 271  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||    
T  1306124 taaaagagaagacacaagaggaagctt 1306150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 32480304 - 32480466
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32480304 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 32480403  T
Q  130 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32480404 tccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 32480466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 24968038 - 24968284
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24968038 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaat 24968133  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagcta-tcaagctttacacaag-a 192  Q
     |||| |||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| | |    
T  24968134 gtggcttaattttggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagctttacacatgaa 24968231  T
Q  193 cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    || |||| ||| |||||||||||||  || ||||  ||||||  ||||||||||    
T  24968232 caaacccgaga-tctaccctttggtactttcccatcctcacactatgaacccta 24968284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453161
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 167  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||      
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-a 27453056  T
Q  168 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagagga 266  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||    
T  27453057 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaaaagga 27453155  T
Q  267 agcttt 272  Q
    ||||||    
T  27453156 agcttt 27453161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370488
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8370488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974954
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 27974954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552883
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 18552883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029180
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagaga--gcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 36029180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264435
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 16264435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711308
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 21711308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736305
Alignment:
Q  75 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 1736305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3716002
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 3716002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709790
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaag 30709790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592782
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaag 40592782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 118
Target Start/End: Original strand, 10207935 - 10207981
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggagagag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10207935 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagag 10207981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 48438214 - 48438301
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48438214 aagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 48438301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6794800 - 6794715
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6794800 aagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 6794715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 40844652 - 40844738
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40844652 aagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 40844738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417493
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795868
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaag 25795868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 26298988 - 26299075
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  26298988 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 26299075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47923993 - 47923906
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  47923993 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaag 47923906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3328443 - 3328359
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttca-gccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||   |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||    
T  3328443 aagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Original strand, 37466291 - 37466375
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  37466291 aagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24695251 - 24695164
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  24695251 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaag 24695164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22010851 - 22010605
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010851 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 22010753  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  22010752 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 22010654  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22010653 cctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaacccta 22010605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 11856902 - 11857151
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaa---caccgagaagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856902 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaat 11857000  T
Q  98 atggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | |||    
T  11857001 atggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaaca 11857099  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11857100 aaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaacccta 11857151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14737731 - 14737485
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaa-gagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatat 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14737731 tagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgatccagttcagccaatat 14737633  T
Q  100 ggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acaga 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||| | | ||| |    
T  14737632 ggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacatatgaacaaa 14737535  T
Q  197 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  14737534 ccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 14737485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14742590 - 14742345
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742590 tagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 14742492  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
     |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||| | | ||| ||    
T  14742491 acctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacatatgaacaaac 14742394  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  14742393 cctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 14742345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 28184435 - 28184681
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatat 99  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184435 tagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatat 28184533  T
Q  100 ggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acaga 196  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||  |||||||||||||| | ||| |    
T  28184534 ggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaca--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaa 28184631  T
Q  197 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  28184632 ccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 28184681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28155725 - 28155479
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  28155725 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatg 28155627  T
Q  99 tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acag 195  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||     
T  28155626 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa--tttagctttcaagctttacacatgaacaa 28155529  T
Q  196 accctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  28155528 accctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 28155479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 73 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5674865 - 5674661
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |      
T  5674865 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 5674766  T
Q  170 tagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaa 267  Q
    |||||  ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5674765 tagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaa 5674667  T
Q  268 gcttta 273  Q
    ||||||    
T  5674666 gcttta 5674661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 6438430 - 6438674
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6438430 tagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaata 6438528  T
Q  99 tggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| | |||    
T  6438529 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttgtcaagctttacacatgaaca 6438625  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6438626 aaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 6438674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 6005348 - 6005592
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6005348 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaat 6005443  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-a 192  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | |    
T  6005444 gtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaa 6005541  T
Q  193 cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  6005542 caaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 6005592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16838675 - 16838921
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16838675 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaat 16838770  T
Q  98 atggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagcta-tcaagctttacacaag-a 192  Q
     |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| | |    
T  16838771 gtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagctttacacatgaa 16838868  T
Q  193 cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||    
T  16838869 caaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaacccta 16838921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33330529 - 33330353
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |    
T  33330529 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--t 33330432  T
Q  169 ctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||    
T  33330431 ctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaacccta 33330353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33336026 - 33335850
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |    
T  33336026 aagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--t 33335929  T
Q  169 ctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||    
T  33335928 ctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaacccta 33335850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757490
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 5757490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 150
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356118
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 150  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac 21356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 268
Target Start/End: Original strand, 22709137 - 22709207
Alignment:
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaag 268  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  22709137 cctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaag 22709207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086485
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5572338 - 5572251
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5572338 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5572251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10077262 - 10077176
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 154  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077262 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 22963700 - 22963786
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22963700 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 22963786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23824693 - 23824607
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23824693 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23824607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 109
Target Start/End: Original strand, 5343471 - 5343519
Alignment:
Q  62 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5343471 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 5343519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Original strand, 22708996 - 22709102
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 144  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22708996 aaaggaagaacaaacacaccaaaaa-attgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 22709094  T
Q  145 tgttacaa 152  Q
    ||||||||    
T  22709095 tgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979600
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaag 31979600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5017566 - 5017482
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017566 aagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 133
Target Start/End: Original strand, 31936587 - 31936651
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggaga--gagcagctctccaatcca 133  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31936587 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801354
Alignment:
Q  84 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagag--agcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaag 21801354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 12406262 - 12406508
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406262 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 12406360  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  12406361 gcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 12406459  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12406460 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaacccta 12406508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 12396842 - 12397088
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396842 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 12396940  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  | || ||||||||| | ||| ||    
T  12396941 gcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagcctttaatctttacacatgaacaaac 12397039  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12397040 cctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaacccta 12397088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20357711 - 20357439
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357711 agcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaataccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 20357614  T
Q  102 cctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagacc 198  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||||||||||||| |||  ||    
T  20357613 cctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgcc 20357514  T
Q  199 ctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20357513 ctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 20357439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 2057892 - 2058171
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaa----caagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057892 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaat 2057991  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-ac 193  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||    
T  2057992 atggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaac 2058090  T
Q  194 agaccctagattctaccc-tttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2058091 aagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 2058171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24024482 - 24024235
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaa-caccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24024482 tagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaata 24024384  T
Q  99 tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acag 195  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | |||     
T  24024383 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatgttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaa 24024286  T
Q  196 accctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24024285 accctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaacccta 24024235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31109738 - 31109492
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatat 99  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109738 tagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatat 31109640  T
Q  100 ggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acaga 196  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| |||| | ||| |    
T  31109639 ggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttgcacatgaacaaa 31109542  T
Q  197 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31109541 ccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaacccta 31109492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 4866665 - 4866819
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866665 aaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 4866763  T
Q  105 aatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 158  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866764 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 4866819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 19992242 - 19992487
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19992242 tagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaata 19992340  T
Q  99 tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  19992341 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaaca 19992438  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  19992439 aaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 19992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1533563 - 1533335
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1533563 aaagaaagaacaaacacaccaataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagt 1533464  T
Q  146 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacc 243  Q
    |||||||| |||| |||||| |  |||||  ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1533463 gttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactctcacaatatgaacc 1533365  T
Q  244 ctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1533364 ctaaaagagaagacactagaggaagcttta 1533335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 21639770 - 21640012
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21639770 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 21639868  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccac 227  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21639869 tccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccac 21639966  T
Q  228 tctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21639967 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 21640012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21812394 - 21812149
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  21812394 tagcaaaaccacacaaagagttaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatg 21812296  T
Q  99 tggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatc-aagctttacacaag-ac 193  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||  ||||||| | || |||||||||||| | ||    
T  21812295 tggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtg-aagtcttacaaaaggttccaaga--ctctagcttgtcaaagctttacacatgaac 21812199  T
Q  194 agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  21812198 aaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 21812149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 21645968 - 21646210
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  21645968 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaa 21646066  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccac 227  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21646067 tccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccac 21646164  T
Q  228 tctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  21646165 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagattta 21646210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24261447 - 24261283
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24261447 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 24261348  T
Q  130 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24261347 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 24261283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 271
Target Start/End: Original strand, 18413641 - 18413840
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctc 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||        
T  18413641 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaa 18413739  T
Q  170 tagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaag 268  Q
    ||| |  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  18413740 tagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag-gaagacacaagaggaag 18413837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24266326 - 24266162
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24266326 acaagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 24266227  T
Q  130 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24266226 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 24266162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 16880034 - 16880197
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16880034 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 16880133  T
Q  130 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16880134 tccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 16880197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 16884890 - 16885053
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16884890 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 16884989  T
Q  130 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16884990 tccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 16885053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 271
Target Start/End: Original strand, 18408764 - 18408964
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||       
T  18408764 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aa 18408862  T
Q  169 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaa 267  Q
     || ||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  18408863 ataacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag-gaagacacaagaggaa 18408960  T
Q  268 gctt 271  Q
    ||||    
T  18408961 gctt 18408964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159890
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29159890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516320
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 46516320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091748
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 49091748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 149
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 149  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56034
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55948 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 56034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848696
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 44848696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190021
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284173
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggggagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2647793 - 2647706
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2647793 aagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2647706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332460
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 33332460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Original strand, 2580390 - 2580474
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  2580390 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 2580474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 35960816 - 35960901
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960816 aagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9185262 - 9185178
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||  |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185262 aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9224561 - 9224315
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224561 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 9224463  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  9224462 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 9224364  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9224363 cctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaacccta 9224315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 51520387 - 51520634
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51520387 tagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttctgccaatatg 51520486  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  51520487 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 51520585  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  51520586 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaacccta 51520634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9229348 - 9229102
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9229348 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatg 9229250  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  9229249 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 9229151  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9229150 cctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaacccta 9229102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 24741873 - 24742145
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741873 agcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 24741970  T
Q  102 cctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagac 197  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||||| || ||    
T  24741971 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaac 24742069  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24742070 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 24742145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45357450 - 45357205
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357450 agcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 45357352  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| ||    
T  45357351 gcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaac 45357254  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  45357253 cctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 45357205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45347971 - 45347725
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347971 agcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 45347873  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  45347872 gcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-acctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 45347774  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  45347773 cctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 45347725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 56146866 - 56146677
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  56146866 tagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatg 56146767  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacaca 189  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  56146766 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacaca 56146677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 29760574 - 29760845
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29760574 agcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 29760671  T
Q  102 cctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag--acaga 196  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||   ||||| |||||||||  |||      
T  29760672 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctgcaagc-ttacacaagaaacaag 29760770  T
Q  197 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29760771 acctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccct--aagagaagacactagaggaagcttta 29760845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 3813959 - 3814199
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcc 103  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813959 aaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcc 3814056  T
Q  104 taatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccct 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||    
T  3814057 taatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccct 3814154  T
Q  201 agattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  3814155 aga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 3814199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 18855656 - 18855900
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18855656 tagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaata 18855754  T
Q  99 tggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  18855755 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaaca 18855851  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  18855852 aaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 18855900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 5732596 - 5732828
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatat 99  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| || |||| | ||||||||||    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732596 aaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatat 5732693  T
Q  100 ggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acaga 196  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |    
T  5732694 ggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaa 5732791  T
Q  197 ccctagattctaccctttggtgtttccccactctcaca 234  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5732792 ccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 5732828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28468647 - 28468431
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28468647 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 28468549  T
Q  146 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa-gacagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    |||||||      | || ||    ||| |  ||||| ||||||||  |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28468548 gttacaa------gaaaaaa----tagtttgcaagc-ttacacaataacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccc 28468460  T
Q  245 tagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  28468459 taaaagagaagacacaagaggaagcttta 28468431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31985752 - 31985529
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31985752 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 31985654  T
Q  146 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    |||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  31985653 gttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgttt-cccactctcacaatgtgaaccc 31985557  T
Q  245 tagaagagaagtcactagaggaagcttt 272  Q
    || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  31985556 taaaagagaagacacaaaaggaagcttt 31985529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047466
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10047466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16623390 - 16623303
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16623390 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16623303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246081
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 39246081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396683
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaa 5396683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36315326 - 36315241
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36315326 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36315241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36329535 - 36329450
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36329535 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36329450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152449
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  77 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 154  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269204
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796529
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3796529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 154
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 154  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777634
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 3777634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16630773 - 16630690
Alignment:
Q  76 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgg--gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16630773 ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16630690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 24333809 - 24333896
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333809 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Original strand, 54867184 - 54867269
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  54867184 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35216 - 34970
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35216 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatg 35118  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  35117 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 35019  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35018 cctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaacccta 34970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11099091 - 11098819
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11099091 agcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag-gaagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 11098994  T
Q  102 cctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagac 197  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  |||||  ||||||| |||||||| || ||    
T  11098993 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagctt-acacaagaacaaac 11098895  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11098894 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 11098819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44312778 - 44312563
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312778 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 44312680  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  44312679 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 44312581  T
Q  198 cctagattctaccctttg 215  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44312580 cctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 39812142 - 39811897
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39812142 tagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgaaccagttcagccaatatg 39812044  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  39812043 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 39811946  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  39811945 cctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 39811897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 14291421 - 14291693
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291421 agcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 14291518  T
Q  102 cctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  |    
T  14291519 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagc 14291617  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14291618 cctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 14291693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9296565 - 9296293
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296565 agcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 9296468  T
Q  102 cctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||| ||||| |||  |    
T  9296467 cctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttatacaagaacaagc 9296369  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9296368 cctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 9296293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 32246715 - 32246964
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagc---gataaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcagccaa 96  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  32246715 tagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaa 32246813  T
Q  97 tatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-ac 193  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||    
T  32246814 tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaac 32246911  T
Q  194 agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  32246912 aaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 32246964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Original strand, 3491729 - 3491952
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3491729 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 3491827  T
Q  146 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    |||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3491828 gttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 3491925  T
Q  245 tagaagagaagtcactagaggaagctt 271  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||    
T  3491926 taaaagagaagacacaagaggaagctt 3491952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 19344351 - 19344596
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19344351 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaat 19344447  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-a 192  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | |    
T  19344448 gtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaa 19344545  T
Q  193 cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  19344546 caaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 19344596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 19349209 - 19349454
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19349209 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaat 19349305  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-a 192  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||| | |    
T  19349306 gtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaa 19349403  T
Q  193 cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  19349404 caaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 19349454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 25398457 - 25398699
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25398457 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 25398555  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccac 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  25398556 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccac 25398653  T
Q  228 tctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  25398654 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 25398699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 25403595 - 25403837
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25403595 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 25403693  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccac 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  25403694 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccac 25403791  T
Q  228 tctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  25403792 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 25403837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 273
Target Start/End: Original strand, 25407663 - 25407826
Alignment:
Q  110 gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||||| |||||||| ||   ||||| ||||    
T  25407663 gggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa-tagcttgcaagctt-acacaagaacaagtcctagtttct 25407760  T
Q  208 accctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  25407761 acccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 25407826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 152
Target Start/End: Original strand, 40738822 - 40738926
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtg 146  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  40738822 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggggagagcagctctccaatccactatgatgaaagtg 40738920  T
Q  147 ttacaa 152  Q
    ||||||    
T  40738921 ttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630030
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg-agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 21630030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040147
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569415
Alignment:
Q  75 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13569415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259189
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 28259189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522308
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg 156  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagg 20522308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10445541 - 10445454
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  10445541 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaag 10445454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865290
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17865290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682344
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 34682344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388945
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 34388945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14699018
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaag 14699018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33528718 - 33528631
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33528718 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 33528631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 40738963 - 40739035
Alignment:
Q  200 tagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttt 272  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | || |||||||    
T  40738963 tagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaatagtaagcttt 40739035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707262
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10707262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390160
Alignment:
Q  75 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaag 8390160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039684
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctg--ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 150  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttac 42039684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16940306 - 16940219
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||| || ||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940306 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17010971 - 17010884
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggagagag--cagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||| || ||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010971 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 39482931 - 39483018
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  39482931 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaag 39483018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24787528 - 24787256
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787528 agcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 24787431  T
Q  102 cctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagacc 198  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| | |    
T  24787430 cctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatc 24787331  T
Q  199 ctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24787330 ctagattctaccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 24787256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 41398176 - 41398412
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41398176 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccaggtcagccaatatggcct 41398269  T
Q  105 aatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagacccta 201  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||    
T  41398270 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaacccta 41398367  T
Q  202 gattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  41398368 gattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 41398412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 41390521 - 41390757
Alignment:
Q  5 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41390521 aaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaacatcgagaagattgttgacccagatcagccaatatggcct 41390614  T
Q  105 aatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagacccta 201  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||    
T  41390615 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaacccta 41390712  T
Q  202 gattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  41390713 gattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 41390757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25445245 - 25444998
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25445245 tagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaata 25445147  T
Q  99 tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  25445146 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaaca 25445049  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25445048 aaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 25444998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 39445429 - 39445673
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39445429 tagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaata 39445527  T
Q  99 tggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  39445528 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaaca 39445624  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  39445625 aaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 39445673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1055167 - 1054923
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1055167 tagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaata 1055069  T
Q  99 tggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  1055068 tggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaaca 1054972  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1054971 aaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 1054923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44024028 - 44023785
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatat 99  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024028 tagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatat 44023930  T
Q  100 ggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acag 195  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| | |||     
T  44023929 ggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttgtcaagctttacacatgaacaa 44023833  T
Q  196 accctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  44023832 accctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 44023785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24202904 - 24202662
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24202904 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 24202806  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccac 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24202805 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccac 24202708  T
Q  228 tctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24202707 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 24202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358736
Alignment:
Q  36 caagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 132  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19358877  T
Q  133 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 230  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19358876 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19358779  T
Q  231 cacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19358778 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 19358736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361325
Alignment:
Q  36 caagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 132  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  133 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 230  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19361368  T
Q  231 cacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19361367 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 19361325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19379965
Alignment:
Q  36 caagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatcc 132  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  133 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 230  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19380008  T
Q  231 cacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19380007 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 19379965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 43988566 - 43988424
Alignment:
Q  55 aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttaca 151  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43988566 aagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttaca 43988467  T
Q  152 aaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    |||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43988466 aaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 43988424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703946
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19366276 - 19366201
Alignment:
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19366276 cctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 19366201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644909
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaa 26644909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476348
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073015
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19073015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120905
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19120905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598485
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16124613 - 16124526
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16124613 aagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16124526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27104469 - 27104382
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27104469 aagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 27104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 29651811 - 29651898
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651811 aagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281793
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaa 3281793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069855
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaa 37069855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775759
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098837
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21536702 - 21536581
Alignment:
Q  37 aagataagcgataaaaggaag-aacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctggg--agagagcagctctccaatc 131  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21536702 aagataagcgatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 21536604  T
Q  132 caatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    || ||| | ||||||||||||||    
T  21536603 cactataatgaaagtgttacaaa 21536581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604635
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 13604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25439877 - 25439805
Alignment:
Q  174 tatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25439877 tatcaagctttacacatgaacaaaccctagag-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 25439805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9794 - 9552
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9794 tagcaaaaccacacaa-gagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatg 9698  T
Q  101 gcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| ||    
T  9697 gcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaac 9600  T
Q  198 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9599 cctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 9552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3836 - 3757
Alignment:
Q  167 ctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaacccta 246  Q
    |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  3836 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 3757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 292 - 536
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaata 98  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  292 tagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaata 390  T
Q  99 tggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-aca 194  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  391 tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaaca 487  T
Q  195 gaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  488 aaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18087 - 17845
Alignment:
Q  33 aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18087 aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 17989  T
Q  130 tccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccac 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || ||||||||||||    
T  17988 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccac 17891  T
Q  228 tctcacaagatgaaccctagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  17890 tctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 17845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24164 - 23938
Alignment:
Q  50 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 145  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24164 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 24065  T
Q  146 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccc 244  Q
    |||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24064 gttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 23967  T
Q  245 tagaagagaagtcactagaggaagcttta 273  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  23966 taaaagagaagacacaagaggaagcttta 23938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14433 - 14269
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14433 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 14334  T
Q  130 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 194  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14333 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 14269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19319 - 19102
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19319 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccatt 19224  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac 193  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19223 gtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagac 19126  T
Q  194 -agaccctagattctaccctttggt 217  Q
     | |||||||| |||||||||||||    
T  19125 aaaaccctaga-tctaccctttggt 19102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2405 - 2211
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2405 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaat 2310  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac 193  Q
     |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2309 gtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagac 2212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 149110 - 148916
Alignment:
Q  1 tagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaat 97  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  149110 tagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaat 149015  T
Q  98 atggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac 193  Q
     |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  149014 gtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagac 148917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 182088 - 181980
Alignment:
Q  35 acaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  182088 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 181989  T
Q  130 tccaatatg 138  Q
    |||||||||    
T  181988 tccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 300
Alignment:
Q  2 agcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  400 agcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaa-gaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacctagttcagccaatatgg 303  T
Q  102 cct 104  Q
    |||    
T  302 cct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8431
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 153
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85768
Alignment:
Q  73 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaa 85768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5770
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 2492 - 2579
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2492 aagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133292
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 133292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43973
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 43973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 36965 - 36844
Alignment:
Q  37 aagataagcgataaaaggaag-aacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatct--gggagagagcagctctccaatc 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||| |    
T  36965 aagataagcaataaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacc 36867  T
Q  132 caatatga-gaaagtgttacaaa 153  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  36866 cactatgatgaaagtgttacaaa 36844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Original strand, 10729 - 10816
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  10729 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 10816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  72 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 152  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17350
Alignment:
Q  75 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctggg--agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 155  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaag 17350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1183 times since January 2019
Visitors: 2573