View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0278_low_15 (Length: 300)

Name: NF0278_low_15
Description: NF0278
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0278_low_15
NF0278_low_15
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (1-216)||(20309108-20309323)
chr2 (1-216)||(38019-38235)
chr2 (3-216)||(23285865-23286077)
chr2 (1-216)||(23654289-23654507)
chr2 (3-216)||(22731139-22731355)
chr2 (1-213)||(298717-298933)
chr2 (3-216)||(22738085-22738300)
chr2 (3-216)||(23076442-23076658)
chr2 (3-216)||(23060513-23060728)
chr2 (99-216)||(23103399-23103516)
chr2 (3-216)||(22337115-22337331)
chr2 (3-216)||(23660023-23660238)
chr2 (144-216)||(23071998-23072070)
chr2 (67-213)||(22105412-22105560)
chr2 (12-130)||(40622123-40622244)
chr2 (53-215)||(32214921-32215085)
chr2 (67-213)||(26505379-26505526)
chr2 (67-213)||(26507857-26508004)
chr2 (144-212)||(7679589-7679657)
chr2 (140-216)||(8946657-8946732)
chr2 (144-211)||(28405981-28406048)
chr2 (143-200)||(22413186-22413243)
chr2 (163-216)||(23040257-23040310)
chr2 (143-200)||(23207293-23207350)
chr2 (144-216)||(19671830-19671902)
chr2 (144-212)||(25175854-25175922)
chr2 (67-213)||(18808943-18809090)
chr2 (144-215)||(22134256-22134326)
chr2 (67-213)||(23130862-23131009)
chr2 (67-213)||(23133329-23133476)
chr2 (67-213)||(23135590-23135737)
chr2 (67-213)||(23709547-23709694)
chr2 (67-213)||(23712028-23712175)
chr2 (145-200)||(25108903-25108958)
chr2 (67-213)||(34402537-34402684)
chr2 (67-213)||(39682313-39682460)
chr2 (4-197)||(23708524-23708721)
chr2 (99-200)||(7735-7838)
chr2 (103-213)||(571397-571508)
chr2 (67-213)||(6725995-6726142)
chr2 (145-200)||(20520243-20520298)
chr2 (145-200)||(23791289-23791344)
chr2 (67-197)||(24367790-24367921)
chr2 (3-66)||(27753728-27753791)
chr2 (154-213)||(45029958-45030016)
chr2 (163-213)||(28577099-28577149)
chr2 (118-199)||(32451949-32452033)
chr2 (163-213)||(38967374-38967424)
chr2 (144-197)||(18786952-18787005)
chr2 (67-210)||(21155075-21155219)
chr2 (118-213)||(24529595-24529691)
chr2 (67-213)||(24898210-24898358)
chr2 (67-213)||(24900693-24900841)
chr2 (67-213)||(24903170-24903318)
chr2 (67-213)||(24905647-24905795)
chr2 (67-213)||(24908122-24908270)
chr2 (163-211)||(43137301-43137349)
chr2 (145-200)||(23004764-23004819)
chr2 (163-210)||(24643062-24643109)
chr2 (145-200)||(24697657-24697712)
chr2 (67-213)||(32039513-32039660)
chr2 (145-201)||(23287378-23287433)
chr2 (146-201)||(26392397-26392451)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-216)||(10329-10544)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-216)||(16282-16497)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (3-216)||(21389358-21389571)
chr8 (3-216)||(21395888-21396101)
chr8 (3-216)||(21790381-21790594)
chr8 (16-216)||(21778697-21778897)
chr8 (1-216)||(16199549-16199765)
chr8 (1-216)||(31971257-31971473)
chr8 (1-216)||(45130901-45131117)
chr8 (1-216)||(21918903-21919121)
chr8 (3-216)||(20536208-20536424)
chr8 (3-216)||(18879142-18879352)
chr8 (3-216)||(22626736-22626951)
chr8 (3-216)||(18818314-18818530)
chr8 (3-215)||(28648949-28649164)
chr8 (3-216)||(7372778-7372986)
chr8 (3-216)||(21923833-21924049)
chr8 (3-216)||(22875065-22875281)
chr8 (3-216)||(23406379-23406597)
chr8 (3-219)||(6759255-6759472)
chr8 (3-216)||(16092246-16092463)
chr8 (144-216)||(5866323-5866395)
chr8 (103-216)||(17140916-17141031)
chr8 (144-216)||(21490995-21491067)
chr8 (144-216)||(6520368-6520440)
chr8 (144-216)||(38855300-38855372)
chr8 (3-215)||(23648554-23648769)
chr8 (144-216)||(23760893-23760962)
chr8 (99-200)||(20498578-20498681)
chr8 (144-212)||(26355747-26355815)
chr8 (144-197)||(21285616-21285669)
chr8 (144-216)||(17612159-17612231)
chr8 (5-80)||(25363047-25363123)
chr8 (67-213)||(14409459-14409606)
chr8 (145-200)||(17267044-17267099)
chr8 (53-197)||(16413316-16413462)
chr8 (166-216)||(21249384-21249434)
chr8 (166-216)||(21255222-21255272)
chr8 (144-197)||(983455-983508)
chr8 (67-213)||(1484402-1484549)
chr8 (67-213)||(5853307-5853454)
chr8 (145-200)||(17439557-17439612)
chr8 (67-213)||(20403227-20403374)
chr8 (67-213)||(22001753-22001900)
chr8 (145-200)||(24353036-24353091)
chr8 (145-200)||(37116363-37116418)
chr8 (143-200)||(19154935-19154992)
chr8 (148-197)||(21673723-21673772)
chr8 (99-197)||(26219733-26219831)
chr8 (67-213)||(41598188-41598335)
chr8 (163-213)||(4542485-4542535)
chr8 (47-209)||(13508034-13508199)
chr8 (163-213)||(19896265-19896315)
chr8 (163-213)||(20046307-20046357)
chr8 (163-213)||(26225359-26225409)
chr8 (163-219)||(19937118-19937174)
chr8 (67-213)||(4483281-4483427)
chr8 (67-213)||(15203246-15203393)
chr8 (147-209)||(13597669-13597731)
chr8 (163-197)||(15070574-15070608)
chr8 (163-197)||(45290807-45290841)
chr8 (163-200)||(19801493-19801530)
chr8 (145-201)||(22525573-22525628)
chr8 (163-213)||(25484380-25484430)
chr8 (153-201)||(22419471-22419519)
chr8 (148-200)||(28397566-28397617)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-216)||(955-1170)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-216)||(7266-7481)
scaffold0106 (1-216)||(1289-1504)
scaffold0106 (163-213)||(15306-15356)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (9-216)||(46995-47202)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (1-216)||(17046487-17046702)
chr4 (1-216)||(14053205-14053422)
chr4 (1-216)||(12902757-12902975)
chr4 (1-216)||(7088877-7089095)
chr4 (3-214)||(22636437-22636650)
chr4 (3-216)||(44052829-44053045)
chr4 (1-209)||(23374262-23374473)
chr4 (7-216)||(16270145-16270356)
chr4 (3-213)||(16377428-16377639)
chr4 (3-216)||(7893703-7893916)
chr4 (3-216)||(16239875-16240090)
chr4 (35-216)||(7798774-7798958)
chr4 (4-211)||(14038653-14038863)
chr4 (139-216)||(15551817-15551894)
chr4 (47-216)||(6899891-6900062)
chr4 (1-90)||(3096772-3096861)
chr4 (140-216)||(3096293-3096368)
chr4 (144-216)||(39706337-39706409)
chr4 (97-216)||(52873367-52873488)
chr4 (44-130)||(15121749-15121834)
chr4 (144-212)||(12774011-12774079)
chr4 (47-200)||(13800-13956)
chr4 (144-197)||(12288259-12288312)
chr4 (144-197)||(52243245-52243298)
chr4 (67-213)||(18215289-18215436)
chr4 (67-213)||(44928894-44929042)
chr4 (99-213)||(54798756-54798872)
chr4 (53-213)||(23803265-23803427)
chr4 (144-212)||(8846360-8846428)
chr4 (5-80)||(17047979-17048055)
chr4 (53-219)||(19242693-19242861)
chr4 (67-213)||(12322-12469)
chr4 (99-213)||(14280316-14280431)
chr4 (67-213)||(15118367-15118514)
chr4 (163-214)||(22353835-22353886)
chr4 (67-213)||(44615288-44615435)
chr4 (67-213)||(52312510-52312657)
chr4 (53-213)||(3515007-3515169)
chr4 (118-199)||(6190479-6190563)
chr4 (151-197)||(43198611-43198657)
chr4 (53-213)||(51463868-51464030)
chr4 (143-200)||(46640504-46640561)
chr4 (47-213)||(1837503-1837671)
chr4 (53-215)||(19618172-19618336)
chr4 (67-213)||(18239434-18239581)
chr4 (67-213)||(44102214-44102361)
chr4 (103-213)||(44773138-44773249)
chr4 (67-213)||(50222354-50222501)
chr4 (145-200)||(53082202-53082257)
chr4 (163-213)||(7641294-7641344)
chr4 (163-213)||(12610950-12611000)
chr4 (163-216)||(15367690-15367743)
chr4 (163-216)||(15370018-15370071)
chr4 (163-216)||(15371202-15371255)
chr4 (163-216)||(15373483-15373536)
chr4 (163-216)||(15402703-15402756)
chr4 (163-216)||(16223532-16223585)
chr4 (163-197)||(8574935-8574969)
chr4 (163-197)||(15355437-15355471)
chr4 (44-163)||(43256106-43256227)
chr4 (165-200)||(21815699-21815734)
chr4 (163-197)||(14970819-14970853)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (1-214)||(40443393-40443607)
chr7 (4-216)||(27847739-27847951)
chr7 (3-216)||(12698831-12699048)
chr7 (3-216)||(9509189-9509405)
chr7 (1-216)||(16386150-16386369)
chr7 (1-216)||(10589039-10589256)
chr7 (1-216)||(26211995-26212214)
chr7 (4-213)||(18456319-18456530)
chr7 (3-216)||(38227481-38227696)
chr7 (3-213)||(3564269-3564482)
chr7 (144-216)||(16495402-16495474)
chr7 (67-216)||(13647325-13647476)
chr7 (144-216)||(28505347-28505419)
chr7 (144-216)||(34200786-34200858)
chr7 (144-216)||(11996076-11996148)
chr7 (144-216)||(67745-67817)
chr7 (12-212)||(12187019-12187218)
chr7 (97-216)||(16219717-16219835)
chr7 (144-212)||(44014182-44014250)
chr7 (144-216)||(47831807-47831879)
chr7 (12-118)||(17137978-17138083)
chr7 (99-197)||(2280121-2280221)
chr7 (144-216)||(15754936-15755008)
chr7 (47-213)||(16213684-16213852)
chr7 (99-213)||(48273392-48273508)
chr7 (103-213)||(17061966-17062077)
chr7 (144-212)||(811180-811248)
chr7 (144-212)||(18005650-18005718)
chr7 (148-216)||(22072913-22072981)
chr7 (67-213)||(24704688-24704832)
chr7 (140-197)||(12901342-12901399)
chr7 (67-213)||(456321-456468)
chr7 (67-213)||(11972496-11972643)
chr7 (67-213)||(14949137-14949284)
chr7 (67-213)||(15376728-15376875)
chr7 (67-213)||(16232520-16232667)
chr7 (67-213)||(18640272-18640419)
chr7 (145-200)||(20220238-20220293)
chr7 (67-213)||(20385138-20385285)
chr7 (67-213)||(21189610-21189757)
chr7 (67-197)||(24275187-24275318)
chr7 (67-213)||(32125491-32125638)
chr7 (67-213)||(41522917-41523064)
chr7 (67-213)||(41525379-41525526)
chr7 (143-197)||(1868043-1868097)
chr7 (67-212)||(11393302-11393448)
chr7 (144-194)||(12255842-12255892)
chr7 (67-216)||(18430709-18430859)
chr7 (143-200)||(15008547-15008604)
chr7 (143-200)||(48991196-48991253)
chr7 (103-213)||(16410059-16410170)
chr7 (67-213)||(24702238-24702385)
chr7 (67-213)||(27216860-27217007)
chr7 (163-213)||(3386333-3386383)
chr7 (163-213)||(13869346-13869396)
chr7 (163-213)||(20110556-20110606)
chr7 (145-197)||(14044765-14044817)
chr7 (145-197)||(14354795-14354847)
chr7 (154-213)||(13831373-13831431)
chr7 (99-197)||(16056347-16056446)
chr7 (103-213)||(44116509-44116620)
chr7 (147-201)||(9177718-9177772)
chr7 (163-197)||(15144105-15144139)
chr7 (144-216)||(19486793-19486865)
chr7 (99-197)||(38898423-38898523)
chr7 (145-188)||(14036282-14036325)
chr7 (145-188)||(14346312-14346355)
chr7 (145-200)||(18203828-18203882)
chr7 (163-197)||(18154909-18154943)
chr7 (163-212)||(19649557-19649606)
chr7 (163-215)||(2832509-2832561)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-216)||(51582-51797)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (1-216)||(16920536-16920751)
chr6 (44-216)||(35245586-35245758)
chr6 (1-216)||(22831503-22831720)
chr6 (11-204)||(11185517-11185710)
chr6 (1-216)||(20360863-20361081)
chr6 (3-216)||(20638188-20638404)
chr6 (4-216)||(29060540-29060755)
chr6 (3-216)||(19303446-19303661)
chr6 (66-216)||(16496244-16496396)
chr6 (3-216)||(22780132-22780348)
chr6 (3-216)||(25629260-25629476)
chr6 (5-216)||(20593773-20593987)
chr6 (3-216)||(17287701-17287917)
chr6 (3-215)||(18409732-18409947)
chr6 (52-216)||(20076700-20076863)
chr6 (144-216)||(27333267-27333339)
chr6 (144-216)||(27394007-27394079)
chr6 (144-216)||(1561303-1561375)
chr6 (144-212)||(19652199-19652267)
chr6 (144-216)||(28496520-28496592)
chr6 (144-216)||(29808931-29809003)
chr6 (116-213)||(25656629-25656727)
chr6 (53-213)||(25754809-25754971)
chr6 (144-197)||(9098563-9098616)
chr6 (145-198)||(23076748-23076801)
chr6 (144-197)||(25644339-25644392)
chr6 (145-198)||(35008166-35008219)
chr6 (53-215)||(30676710-30676874)
chr6 (67-213)||(12742317-12742464)
chr6 (67-213)||(18334607-18334754)
chr6 (67-213)||(19005046-19005193)
chr6 (67-213)||(19858934-19859081)
chr6 (103-213)||(22782227-22782338)
chr6 (67-213)||(24422547-24422694)
chr6 (67-213)||(33861794-33861941)
chr6 (67-213)||(33864278-33864425)
chr6 (144-197)||(20109157-20109210)
chr6 (163-216)||(25714417-25714470)
chr6 (53-215)||(34963371-34963535)
chr6 (103-213)||(1595549-1595660)
chr6 (67-213)||(2291195-2291342)
chr6 (67-213)||(8055029-8055176)
chr6 (169-216)||(22080799-22080846)
chr6 (67-213)||(26924655-26924802)
chr6 (67-200)||(18456732-18456866)
chr6 (67-200)||(18461892-18462026)
chr6 (151-197)||(19668390-19668436)
chr6 (44-163)||(27415887-27416008)
chr6 (163-200)||(18821912-18821949)
chr6 (144-216)||(23019408-23019478)
chr6 (67-213)||(1540926-1541073)
chr6 (163-213)||(3852129-3852179)
chr6 (163-213)||(20557004-20557054)
chr6 (143-201)||(33443062-33443119)
chr6 (144-193)||(4185870-4185919)
chr6 (171-216)||(8227587-8227632)
chr6 (118-197)||(25688518-25688598)
chr6 (163-210)||(16448639-16448686)
chr6 (150-201)||(18177729-18177779)
chr6 (150-201)||(18204092-18204142)
chr6 (163-212)||(19862978-19863027)
chr6 (163-212)||(19873120-19873169)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-216)||(32067-32282)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-216)||(15368-15584)
scaffold0114 (48-130)||(7378-7459)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-213)||(5034-5246)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-216)||(4712-4929)
scaffold0358 (1-138)||(16-153)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-216)||(13497-13713)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (1-216)||(21292873-21293090)
chr5 (3-216)||(23390401-23390617)
chr5 (3-216)||(8286747-8286964)
chr5 (3-216)||(25421532-25421748)
chr5 (1-216)||(22075018-22075237)
chr5 (3-216)||(24493569-24493784)
chr5 (3-213)||(24529223-24529436)
chr5 (3-216)||(13025311-13025526)
chr5 (3-216)||(13095495-13095710)
chr5 (99-209)||(37723910-37724020)
chr5 (3-216)||(9077952-9078168)
chr5 (52-216)||(21808343-21808510)
chr5 (66-216)||(21729033-21729185)
chr5 (3-196)||(25431414-25431610)
chr5 (3-216)||(1096467-1096683)
chr5 (144-216)||(19660884-19660956)
chr5 (144-216)||(36314577-36314649)
chr5 (116-216)||(21997553-21997655)
chr5 (144-216)||(21329546-21329618)
chr5 (12-212)||(22032323-22032520)
chr5 (100-200)||(20026942-20027046)
chr5 (4-213)||(22412187-22412388)
chr5 (12-118)||(18769919-18770024)
chr5 (44-118)||(23572178-23572252)
chr5 (1-81)||(22107276-22107357)
chr5 (144-212)||(22959581-22959649)
chr5 (144-216)||(19668898-19668970)
chr5 (144-216)||(21502205-21502277)
chr5 (144-212)||(21565546-21565614)
chr5 (143-200)||(22178269-22178326)
chr5 (144-200)||(22144065-22144121)
chr5 (67-213)||(264783-264930)
chr5 (67-213)||(10732955-10733102)
chr5 (67-213)||(20909012-20909159)
chr5 (67-213)||(39363384-39363531)
chr5 (67-213)||(36154798-36154942)
chr5 (44-163)||(18356367-18356488)
chr5 (144-197)||(26012084-26012137)
chr5 (67-213)||(29329934-29330081)
chr5 (67-213)||(32027393-32027540)
chr5 (67-213)||(42245380-42245527)
chr5 (163-213)||(2154726-2154776)
chr5 (163-213)||(11581311-11581361)
chr5 (163-213)||(20918060-20918110)
chr5 (163-213)||(38619434-38619484)
chr5 (163-213)||(39245136-39245186)
chr5 (4-197)||(18418599-18418793)
chr5 (163-212)||(23064512-23064561)
chr5 (165-213)||(10775790-10775838)
chr5 (118-197)||(20902075-20902155)
chr5 (67-213)||(29345980-29346127)
chr5 (44-163)||(20910745-20910866)
chr5 (163-213)||(31061068-31061118)
chr5 (163-210)||(18319146-18319193)
chr5 (166-213)||(29348453-29348500)
chr5 (166-213)||(29350926-29350973)
chr5 (147-201)||(15796434-15796487)
chr5 (163-213)||(20806854-20806904)
chr5 (163-197)||(26704090-26704124)
chr5 (170-200)||(26740720-26740750)
chr5 (163-197)||(26973823-26973857)
chr5 (170-200)||(27989004-27989034)
chr5 (146-195)||(26732884-26732932)
chr5 (171-216)||(40725853-40725898)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (4-216)||(38801297-38801508)
chr1 (1-216)||(27250632-27250850)
chr1 (1-216)||(21026680-21026898)
chr1 (3-215)||(50210118-50210333)
chr1 (3-213)||(34509783-34509996)
chr1 (3-138)||(22354477-22354613)
chr1 (15-216)||(22532269-22532473)
chr1 (116-216)||(20847173-20847275)
chr1 (144-216)||(14295600-14295672)
chr1 (144-212)||(22921918-22921986)
chr1 (3-215)||(20135188-20135403)
chr1 (103-216)||(45574893-45575008)
chr1 (3-80)||(48603652-48603730)
chr1 (144-197)||(21754064-21754117)
chr1 (99-200)||(21896258-21896361)
chr1 (5-215)||(22468604-22468816)
chr1 (144-216)||(33681010-33681079)
chr1 (144-216)||(52928019-52928088)
chr1 (144-212)||(20248283-20248351)
chr1 (99-200)||(21861572-21861675)
chr1 (3-107)||(22356079-22356185)
chr1 (3-107)||(22357765-22357871)
chr1 (53-213)||(23593735-23593897)
chr1 (144-197)||(16758668-16758721)
chr1 (144-197)||(20918623-20918676)
chr1 (144-200)||(35261127-35261183)
chr1 (67-213)||(13988866-13989013)
chr1 (67-213)||(21923306-21923453)
chr1 (67-213)||(29776688-29776835)
chr1 (67-213)||(31612313-31612460)
chr1 (145-200)||(50614167-50614222)
chr1 (145-200)||(50621995-50622050)
chr1 (67-213)||(433012-433157)
chr1 (116-197)||(22123131-22123214)
chr1 (148-216)||(22237630-22237695)
chr1 (163-216)||(13212974-13213027)
chr1 (147-200)||(16368338-16368391)
chr1 (147-215)||(20454606-20454673)
chr1 (163-219)||(21342090-21342146)
chr1 (67-213)||(21475102-21475249)
chr1 (154-213)||(21707167-21707225)
chr1 (154-213)||(21711709-21711767)
chr1 (53-214)||(21840766-21840929)
chr1 (163-213)||(21346961-21347011)
chr1 (163-213)||(29298137-29298187)
chr1 (143-200)||(41050084-41050141)
chr1 (163-219)||(15860121-15860177)
chr1 (118-213)||(16275430-16275526)
chr1 (165-215)||(16361915-16361965)
chr1 (44-136)||(33797601-33797694)
chr1 (146-200)||(50686627-50686681)
chr1 (163-212)||(21714546-21714595)
chr1 (145-201)||(21533923-21533978)
chr1 (143-198)||(16093933-16093988)
chr1 (145-200)||(26064954-26065009)
chr1 (163-215)||(24783160-24783212)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-216)||(952-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-216)||(167882-168099)
scaffold0011 (3-216)||(51913-52129)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (3-216)||(20698341-20698556)
chr3 (1-216)||(12399209-12399427)
chr3 (3-216)||(13442274-13442490)
chr3 (3-216)||(17487856-17488072)
chr3 (3-216)||(17499338-17499554)
chr3 (3-216)||(14972854-14973070)
chr3 (3-216)||(26686887-26687103)
chr3 (3-216)||(43840932-43841148)
chr3 (3-216)||(18438534-18438750)
chr3 (3-197)||(14576738-14576934)
chr3 (4-213)||(24153115-24153326)
chr3 (3-216)||(23083266-23083482)
chr3 (3-216)||(25476290-25476506)
chr3 (3-213)||(40213626-40213838)
chr3 (3-216)||(11424668-11424880)
chr3 (3-197)||(14572608-14572804)
chr3 (3-197)||(42386429-42386627)
chr3 (144-216)||(13210376-13210448)
chr3 (144-212)||(49668125-49668193)
chr3 (144-200)||(52523778-52523834)
chr3 (3-80)||(14179570-14179648)
chr3 (53-213)||(17672626-17672788)
chr3 (144-212)||(9512924-9512992)
chr3 (144-212)||(9520899-9520967)
chr3 (144-212)||(12174308-12174376)
chr3 (148-212)||(16097332-16097396)
chr3 (144-216)||(15470927-15470996)
chr3 (144-197)||(32307696-32307749)
chr3 (67-213)||(9707622-9707769)
chr3 (67-213)||(29172598-29172745)
chr3 (48-212)||(856140-856304)
chr3 (151-213)||(28194693-28194755)
chr3 (166-216)||(43550594-43550644)
chr3 (144-213)||(27165250-27165319)
chr3 (99-213)||(36166598-36166712)
chr3 (144-216)||(14234487-14234559)
chr3 (144-212)||(16103784-16103852)
chr3 (67-213)||(7781362-7781509)
chr3 (67-213)||(17463178-17463325)
chr3 (145-200)||(22110402-22110457)
chr3 (67-213)||(28848626-28848773)
chr3 (67-213)||(34159326-34159473)
chr3 (145-200)||(43925974-43926029)
chr3 (67-213)||(45606922-45607069)
chr3 (67-213)||(55476491-55476638)
chr3 (143-212)||(37251216-37251283)
chr3 (47-216)||(24340672-24340844)
chr3 (144-213)||(53301600-53301669)
chr3 (101-213)||(55500942-55501055)
chr3 (5-80)||(16796685-16796761)
chr3 (103-213)||(6469185-6469296)
chr3 (67-213)||(8899094-8899241)
chr3 (53-214)||(13544024-13544187)
chr3 (67-213)||(16454296-16454443)
chr3 (67-197)||(38961906-38962037)
chr3 (163-213)||(8499518-8499568)
chr3 (163-213)||(10556985-10557035)
chr3 (53-197)||(12567576-12567722)
chr3 (163-213)||(15412429-15412479)
chr3 (163-213)||(15977515-15977565)
chr3 (163-213)||(17737236-17737286)
chr3 (163-213)||(45577950-45578000)
chr3 (53-197)||(50242838-50242984)
chr3 (67-200)||(53070668-53070802)
chr3 (147-200)||(606378-606431)
chr3 (99-197)||(21618465-21618563)
chr3 (143-199)||(12377938-12377994)
chr3 (67-213)||(13151805-13151953)
chr3 (67-213)||(13154270-13154418)
chr3 (163-211)||(16282923-16282971)
chr3 (163-211)||(41123892-41123940)
chr3 (67-213)||(10247738-10247885)
chr3 (67-213)||(17446670-17446816)
chr3 (163-213)||(12119837-12119887)
chr3 (163-213)||(44494809-44494859)
chr3 (144-197)||(23274706-23274759)
chr3 (144-216)||(37642314-37642386)
chr3 (144-197)||(1644723-1644775)
chr3 (163-212)||(15878119-15878168)
chr3 (145-201)||(13919344-13919399)
chr3 (163-215)||(14665398-14665450)
chr3 (163-215)||(14668554-14668606)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (3-216)||(13211-13427)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (9-216)||(4849-5059)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (3-216)||(3470-3686)
scaffold0292 (3-216)||(343-558)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (3-216)||(1851-2067)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (3-216)||(6026-6245)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-216)||(1952-2170)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (3-197)||(24206-24405)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (3-216)||(38761-38976)
scaffold0145 (7-216)||(32942-33153)
scaffold0145 (163-218)||(9744-9799)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (99-215)||(174767-174883)
scaffold0021 (3-124)||(124679-124801)
scaffold0021 (146-216)||(121766-121835)
scaffold0021 (140-200)||(136414-136474)
scaffold0021 (140-200)||(145122-145182)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (3-214)||(39479-39692)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (3-214)||(75120-75333)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (3-216)||(3056-3271)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (3-216)||(20910-21127)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (3-216)||(25896-26111)
scaffold0026 (3-216)||(39858-40073)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (3-216)||(8438-8650)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (3-213)||(339855-340065)
scaffold0003 (67-213)||(158465-158612)
scaffold0003 (44-163)||(71353-71474)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (3-215)||(17120-17337)
scaffold0056 (163-200)||(79396-79433)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (3-209)||(25970-26179)
scaffold0122 (99-213)||(44709-44825)
scaffold0122 (3-64)||(33400-33461)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (15-215)||(3103-3306)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (3-213)||(22886-23098)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (3-216)||(16505-16721)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (3-216)||(39913-40128)
scaffold0080 (143-200)||(19933-19990)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (80-216)||(28414-28552)
scaffold0046 (144-216)||(11292-11364)
scaffold0046 (144-216)||(1997-2069)
scaffold0046 (160-216)||(4552-4608)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (144-216)||(1118-1190)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (3-216)||(4508-4723)
scaffold0228 (3-216)||(12090-12305)
scaffold0228 (3-216)||(22042-22257)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (12-130)||(26911-27027)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (140-216)||(34123-34199)
scaffold0175 (3-166)||(13141-13308)
scaffold0175 (163-216)||(273-326)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-156)||(6669-6828)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (101-216)||(11447-11564)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (44-216)||(32904-33077)
scaffold0120 (44-216)||(45928-46101)
scaffold0120 (8-216)||(16113-16323)
scaffold0120 (163-216)||(17397-17450)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (144-216)||(119875-119947)
scaffold0023 (144-212)||(100378-100446)
scaffold0023 (144-212)||(101503-101571)
scaffold0023 (67-213)||(44454-44602)
scaffold0023 (145-212)||(40224-40291)
scaffold0023 (67-213)||(94411-94558)
scaffold0023 (53-197)||(17440-17586)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (71-197)||(8485-8613)
scaffold0621 (144-216)||(6535-6607)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (144-216)||(6611-6683)
scaffold0333 (144-216)||(13991-14063)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (144-216)||(15826-15898)
scaffold0020 (163-197)||(178913-178947)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (3-216)||(8479-8691)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (3-195)||(4545-4739)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (99-200)||(1048-1151)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (144-216)||(1083-1155)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (48-118)||(1975-2045)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (12-118)||(21721-21826)
scaffold0210 (12-118)||(29613-29718)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (44-118)||(12857-12931)
scaffold0029 (53-196)||(11305-11450)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (144-197)||(1101-1154)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (140-213)||(15664-15737)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (100-216)||(12942-13057)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (144-212)||(2855-2923)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (99-200)||(13144-13247)
scaffold0357 (145-200)||(2677-2732)
scaffold0357 (144-197)||(16149-16202)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (144-216)||(6172-6244)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (144-212)||(2694-2762)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (144-212)||(19268-19336)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (3-137)||(27911-28046)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (144-216)||(23932-24001)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (144-212)||(133-201)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (144-200)||(6828-6884)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (5-80)||(1052-1128)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (148-216)||(12766-12834)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (99-200)||(12584-12687)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (152-212)||(32102-32162)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (144-212)||(160688-160756)
scaffold0001 (163-213)||(85692-85742)
scaffold0001 (53-197)||(501100-501246)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (145-212)||(14747-14814)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (144-216)||(10590-10659)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (3-138)||(3434-3571)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (144-197)||(5662-5715)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (140-197)||(8119-8176)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (144-197)||(10546-10599)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (144-212)||(45841-45909)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (152-212)||(132662-132722)
scaffold0028 (67-213)||(136680-136827)
scaffold0028 (67-213)||(139149-139296)
scaffold0028 (67-213)||(144087-144234)
scaffold0028 (144-197)||(62217-62270)
scaffold0028 (67-213)||(134211-134358)
scaffold0028 (67-213)||(141618-141765)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (140-200)||(60761-60821)
scaffold0010 (144-197)||(129924-129977)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (67-213)||(13392-13539)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (67-213)||(20747-20894)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (5-60)||(3640-3695)
scaffold0165 (5-60)||(7704-7759)
scaffold0165 (144-197)||(27798-27851)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (67-213)||(37821-37968)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (145-200)||(129021-129075)
scaffold0022 (99-213)||(116430-116544)
scaffold0022 (147-200)||(78338-78391)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (53-197)||(4710-4856)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (150-200)||(13793-13843)
scaffold0420 (143-200)||(6332-6389)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (143-197)||(25125-25179)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (44-163)||(15362-15483)
scaffold0107 (147-201)||(36195-36248)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (144-216)||(22719-22788)
scaffold0037 (53-213)||(82072-82234)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (147-200)||(566-619)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (47-200)||(53498-53654)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (144-213)||(38751-38820)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (144-197)||(32555-32608)
scaffold0034 (118-199)||(51904-51987)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (144-216)||(11464-11536)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (144-216)||(38305-38377)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (67-200)||(20394-20527)
scaffold0031 (52-216)||(128751-128917)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (53-214)||(10772-10935)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (149-216)||(4888-4954)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (67-213)||(13947-14094)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (163-213)||(16784-16834)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (143-193)||(38339-38389)
scaffold0139 (163-212)||(19980-20029)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (163-200)||(11979-12016)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (47-216)||(17976-18148)
scaffold0247 (163-197)||(2241-2275)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (144-212)||(28818-28887)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (143-200)||(2691-2748)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (143-200)||(267676-267733)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (3-59)||(10323-10379)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (163-210)||(4300-4347)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (163-214)||(9241-9292)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (145-200)||(97021-97076)
scaffold0006 (145-200)||(106299-106354)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (163-213)||(106-156)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (163-197)||(29948-29982)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (163-213)||(40400-40450)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (167-213)||(161206-161252)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (97-200)||(8059-8166)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (163-212)||(23843-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (163-212)||(36454-36503)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (165-213)||(4214-4262)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (163-215)||(12361-12413)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (169-213)||(12064-12108)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (163-210)||(1393-1440)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (143-197)||(103679-103733)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (171-200)||(1874-1903)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (163-212)||(69794-69843)
scaffold0004 (12-81)||(69930-70000)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (3-39)||(17892-17928)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20309323 - 20309108
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309323 aggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 20309224  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309223 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20309124  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  20309123 ttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 38019 - 38235
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38019 aggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 38118  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38119 atgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 38217  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38218 tgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23286077 - 23285865
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  23286077 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaaga 23285978  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23285977 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23285880  T
Q  202 tgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||    
T  23285879 tgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23654289 - 23654507
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||| |||  |||    
T  23654289 aggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaa 23654388  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct---attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654389 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23654487  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  23654488 gttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 22731139 - 22731355
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||| |    
T  22731139 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaata 22731238  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22731239 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaact 22731337  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  22731338 tgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 298717 - 298933
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||  |||    
T  298717 aggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 298816  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298817 gatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 298916  T
Q  197 gatgttgaagatgatga 213  Q
    | || | ||||||||||    
T  298917 gttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 22738085 - 22738300
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22738085 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22738184  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22738185 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22738282  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || | |||||||||||||    
T  22738283 tgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076442
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    | ||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23076460  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
     | |||||||||||||||    
T  23076459 ggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23060728 - 23060513
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||    
T  23060728 gttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaaga 23060630  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23060629 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23060531  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  23060530 tgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22337331 - 22337115
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  22337331 gttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22337232  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||| || |   |||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22337231 tgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22337133  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  22337132 tgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23660238 - 23660023
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||  ||| |||  |||||    
T  23660238 gttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaaga 23660139  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  23660138 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagtt 23660040  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  23660039 gatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072070
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22105560 - 22105412
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || |   ||||||||||||||| ||||    
T  22105560 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 22105461  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22105460 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622244
Alignment:
Q  12 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatt-----tgtatacataagatgttg 106  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgttg 40622221  T
Q  107 atgaattgaatttgatataattat 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  40622222 atgaattgaa-ttgatataattat 40622244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 215
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  32215021 gc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26505526 - 26505379
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  26505526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26505428  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26505427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26508004 - 26507857
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  26508004 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 26507906  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26507905 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679589
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  140 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Original strand, 23040257 - 23040310
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040257 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671830
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18809090 - 18808943
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  18809090 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18808992  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18808991 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23131009 - 23130862
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  23131009 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23130911  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23130910 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23133476 - 23133329
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  23133476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23133378  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23133377 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23135737 - 23135590
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  23135737 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23135639  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23135638 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 23709547 - 23709694
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  23709547 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23709645  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23709646 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 23712028 - 23712175
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  23712028 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 23712126  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23712127 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 34402537 - 34402684
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  34402537 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34402635  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34402636 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39682460 - 39682313
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  39682460 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39682362  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39682361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 23708524 - 23708721
Alignment:
Q  4 ttaattataatctgtgaagctgt-ataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| || || |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||| ||   | |||    
T  23708524 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgaga 23708623  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||  |||| ||||| | || |  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708624 tgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | || |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  197 gatg 200  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571397
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T
Q  200 gttgaagatgatga 213  Q
    | | ||||||||||    
T  571410 gattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6726142 - 6725995
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  6726142 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 6726044  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6726043 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24367921 - 24367790
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  24367921 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24367823  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367822 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 27753791 - 27753728
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat 66  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27753791 gttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgat 27753728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Original strand, 45029958 - 45030016
Alignment:
Q  154 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029958 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Original strand, 32451949 - 32452033
Alignment:
Q  118 ttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |   || |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451949 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 210
Target Start/End: Original strand, 21155075 - 21155219
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  21155075 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21155173  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155174 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 213
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  118 ttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 24898210 - 24898358
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  24898210 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24898308  T
Q  164 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24898309 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 24900693 - 24900841
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  24900693 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24900791  T
Q  164 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24900792 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 24903170 - 24903318
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  24903170 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24903268  T
Q  164 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24903269 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 24905647 - 24905795
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  24905647 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24905745  T
Q  164 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24905746 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 24908122 - 24908270
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  24908122 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24908220  T
Q  164 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24908221 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43137349 - 43137301
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137349 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 24643062 - 24643109
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643062 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 32039513 - 32039660
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||  ||||    
T  32039513 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt 32039611  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  32039612 -gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  146 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 10329 - 10544
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10329 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaag 10428  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10429 atgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 10528  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  10529 ttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16497 - 16282
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  16497 aggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataat 16398  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16298  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  16297 ttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 102  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21389557  T
Q  203 gaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||    
T  21389558 gaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21396087  T
Q  203 gaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||    
T  21396088 gaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21790580  T
Q  203 gaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||    
T  21790581 gaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  16 tgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattga 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  116 atttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  216 t 216  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16199549 - 16199765
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16199549 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 16199648  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199649 atgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16199748  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  16199749 gttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31971473 - 31971257
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971473 aggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 31971374  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31971373 atgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 31971275  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31971274 tgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 45130901 - 45131117
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45130901 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaag 45131000  T
Q  101 atgttgatgaa-ttgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131001 atgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 45131099  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45131100 tgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21918903 - 21919121
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaa-tatttgtatacataa 99  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  21918903 aggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaa 21919002  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919003 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21919101  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  21919102 gttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20536424 - 20536208
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  20536424 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 20536325  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20536324 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 20536226  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  20536225 tgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 18879142 - 18879352
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  18879142 gttaactataatctgtgaagctg-ataagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaag 18879239  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18879240 atgttgatgaattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18879336  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
     |||||||||||||||    
T  18879337 atgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22626951 - 22626736
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  22626951 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaaga 22626852  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626851 tgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22626753  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  22626752 gatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 18818314 - 18818530
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  18818314 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 18818413  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    || || ||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18818414 tgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 18818512  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  18818513 tgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 28648949 - 28649164
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||  |||||    
T  28648949 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaaga 28649048  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28649049 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 28649147  T
Q  199 tgttgaagatgatgatg 215  Q
    || ||||||||||||||    
T  28649148 tgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7372986 - 7372778
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||       ||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  7372986 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagat 7372894  T
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    | || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7372893 gatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7372795  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  7372794 gatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 21923833 - 21924049
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  | |||| | | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  21923833 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 21923932  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| || |||||||| | ||   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21923933 tgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21924031  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  21924032 tgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23406597 - 23406379
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23406597 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23406498  T
Q  102 tg--ttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||   || ||| ||| | ||||||| |||||||||   || | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406497 tgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23406399  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23406398 gttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6759472 - 6759255
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||  ||   ||||||  | ||    
T  6759472 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgag 6759373  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||    ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759372 atgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6759277  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgtcca 219  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  6759276 ttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 16092246 - 16092463
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||| || |||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||   ||||||  | ||    
T  16092246 gttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgag 16092345  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092346 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16092444  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     || |||||||||||||||    
T  16092445 ttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866395
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140916
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct--attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17140931 ttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21490995
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6520440 - 6520368
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6520440 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23648769 - 23648554
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  23648769 gttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaga 23648670  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| || |||| |  |||||| |||||||||   || | |||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  23648669 tgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23648571  T
Q  199 tgttgaagatgatgatg 215  Q
    || | |||||| |||||    
T  23648570 tgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgta--tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  197 gatg 200  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21285669 - 21285616
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21285669 atactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaag 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612231
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Original strand, 25363047 - 25363123
Alignment:
Q  5 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 80  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  25363047 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 14409459 - 14409606
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  14409459 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 14409557  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14409558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413462
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  166 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  166 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1484549 - 1484402
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  1484549 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1484451  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1484450 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 5853307 - 5853454
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  5853307 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 5853405  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5853406 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20403374 - 20403227
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  20403374 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20403276  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20403275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22001900 - 22001753
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  22001900 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 22001802  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  22001801 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  148 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41598335 - 41598188
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | | ||||| ||||    
T  41598335 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 41598237  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41598236 -gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 4542485 - 4542535
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542485 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 13508034 - 13508199
Alignment:
Q  47 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt-- 143  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| | | |||  || ||||| ||||| ||||| | ||||      
T  13508034 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgc 13508133  T
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 209  Q
    ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508134 atattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19896315 - 19896265
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896315 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 20046307 - 20046357
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20046307 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4483427 - 4483281
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  4483427 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 4483329  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4483328 -gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 15203246 - 15203393
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  15203246 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15203344  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  15203345 -gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597731
Alignment:
Q  147 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 209  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070574
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290841
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 200
Target Start/End: Original strand, 19801493 - 19801530
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801493 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 201
Target Start/End: Original strand, 22419471 - 22419519
Alignment:
Q  153 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22419471 atgttgttgtatattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22419519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397566
Alignment:
Q  148 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatg 28397566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 955 - 1170
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  955 aggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 1054  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055 atgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1154  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  1155 ttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7481 - 7266
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7481 aggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 7382  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7381 atgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 7282  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  7281 ttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1504 - 1289
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1504 aggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 1405  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1404 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1305  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  1304 ttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15356
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46995
Alignment:
Q  9 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgat 47103  T
Q  109 gaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 208  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47102 gaattgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagat 47003  T
Q  209 gatgatgt 216  Q
    ||||||||    
T  47002 gatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17046702 - 17046487
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17046702 aggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataag 17046603  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046602 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17046503  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  17046502 ttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 14053205 - 14053422
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14053205 aggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataag 14053304  T
Q  101 -atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14053305 aatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaaga 14053404  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14053405 tgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12902975 - 12902757
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  12902975 aggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaa 12902876  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902875 gatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12902777  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  12902776 gttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7089095 - 7088877
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  7089095 aggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaa 7088996  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088995 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7088897  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | || |||||||||||||||    
T  7088896 gttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22636650 - 22636437
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22636650 gttaattataatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22636552  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22636551 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22636453  T
Q  199 tgttgaagatgatgat 214  Q
    || |||||||||||||    
T  22636452 tgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44053045 - 44052829
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  44053045 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaag 44052947  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44052946 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaag 44052848  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     || |||||||||||||||    
T  44052847 ttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 23374262 - 23374473
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||    
T  23374262 aggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 23374361  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23374362 gatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaa 23374460  T
Q  197 gatgttgaagatg 209  Q
    | |||||||||||    
T  23374461 gttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  7 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  106 gatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 203  Q
    | | | ||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  204 aagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 16377428 - 16377639
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  16377428 gttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 16377527  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16377528 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16377626  T
Q  201 ttgaagatgatga 213  Q
     ||||||| ||||    
T  16377627 atgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7893916 - 7893703
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||   |||||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  7893916 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgat---tatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 7893820  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7893819 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagt 7893721  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  7893720 tgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 16239875 - 16240090
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||| ||| ||| |||  |||||    
T  16239875 gttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaaga 16239974  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |    
T  16239975 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagtt 16240073  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  16240074 gatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  35 tgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 133  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  134 atgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14038863 - 14038653
Alignment:
Q  4 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | ||||    
T  14038863 ttaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagat 14038764  T
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14038763 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 14038665  T
Q  200 gttgaagatgat 211  Q
    | ||||||||||    
T  14038664 gatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15551894 - 15551817
Alignment:
Q  139 attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551894 attgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  47 ttatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattg 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  |||   | |||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttg 6899964  T
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3096861 - 3096772
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttg 90  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3096861 aggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096293
Alignment:
Q  140 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 216
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  97 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 193  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  194 taagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 130
Target Start/End: Original strand, 15121749 - 15121834
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 130  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15121749 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Original strand, 13800 - 13956
Alignment:
Q  47 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt-- 143  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | || |      
T  13800 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 13899  T
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13900 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 12288259 - 12288312
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288259 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243298
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 18215289 - 18215436
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  18215289 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 18215387  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18215388 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 44928894 - 44929042
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||  ||| ||| |||||| || ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  44928894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt 44928993  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44928994 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 195  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  196 agatgttgaagatgatga 213  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Original strand, 17047979 - 17048055
Alignment:
Q  5 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 80  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17047979 taattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 219  Q
    |  | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 12322 - 12469
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  12322 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12420  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12421 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 195  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  196 agatgttgaagatgatga 213  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 15118367 - 15118514
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  15118367 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15118465  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15118466 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22353886 - 22353835
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44615435 - 44615288
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| ||||    
T  44615435 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 44615337  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44615336 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52312657 - 52312510
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  52312657 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 52312559  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  52312558 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||   |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190479
Alignment:
Q  118 ttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |   || |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  151 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  47 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---g 142  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||   |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 215
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||  || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 18239434 - 18239581
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | || || ||||    
T  18239434 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 18239532  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18239533 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44102361 - 44102214
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| | | |||| |||||    
T  44102361 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttattgtt 44102263  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102262 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773249
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T
Q  200 gttgaagatgatga 213  Q
    | | ||||||||||    
T  44773236 gattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 50222354 - 50222501
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||| ||  | ||||| ||||    
T  50222354 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt 50222452  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50222453 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 7641294 - 7641344
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641294 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12611000 - 12610950
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611000 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Original strand, 8574935 - 8574969
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574935 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8574969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355471
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256227
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt 141  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt 43256204  T
Q  142 -gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
     |||| |||||||||||| ||||    
T  43256205 ggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  165 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970853
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40443607 - 40443393
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40443607 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 40443508  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40443507 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagat 40443408  T
Q  200 gttgaagatgatgat 214  Q
    |||||||||||||||    
T  40443407 gttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 27847739 - 27847951
Alignment:
Q  4 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 103  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27847739 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatg 27847838  T
Q  104 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27847839 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttg 27847938  T
Q  204 aagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||    
T  27847939 aagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12699048 - 12698831
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  12699048 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 12698949  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat----tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698948 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12698850  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     || |||||||||||||||    
T  12698849 ttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9509405 - 9509189
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  9509405 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 9509306  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct---attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9509305 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 9509207  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  9509206 tgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16386150 - 16386369
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  | | |||| |||  |||    
T  16386150 aggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaa 16386249  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386250 gatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16386349  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  16386350 gttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10589256 - 10589039
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |   |||    
T  10589256 aggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaag 10589157  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||   || | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10589156 atgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 10589058  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  10589057 ttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26212214 - 26211995
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||    
T  26212214 aggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 26212115  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26212114 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaa 26212016  T
Q  197 gatgttgaag-atgatgatgt 216  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  26212015 gttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  4 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  201 ttgaagatgatga 213  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38227696 - 38227481
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||    
T  38227696 gttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaaga 38227597  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38227596 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagta 38227498  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  38227497 gatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 3564269 - 3564482
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  3564269 gttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 3564368  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3564369 tgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 3564467  T
Q  199 tgttgaagatgatga 213  Q
    || ||||||||||||    
T  3564468 tgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495402
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13647476 - 13647325
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || |   ||||||||||||||| ||||    
T  13647476 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt 13647377  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647376 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505419
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200786
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996148
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12187218 - 12187019
Alignment:
Q  12 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   | ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12187218 aatctgtgaagctg-ataagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 12187120  T
Q  112 ttgaatttgatataattatgtcatgct----attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 207  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||| |    ||||||  |||||||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  12187119 ttgaa-ttggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaaga 12187024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 216
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  97 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 194  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  195 aagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 17137978 - 17138083
Alignment:
Q  12 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 111  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17137978 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 17138076  T
Q  112 ttgaatt 118  Q
    |||||||    
T  17138077 ttgaatt 17138083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  197 g 197  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15755008
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  47 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---g 142  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 195  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  196 agatgttgaagatgatga 213  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062077
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T
Q  201 ttgaagatgatga 213  Q
     | ||||||||||    
T  17062065 attaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22072981 - 22072913
Alignment:
Q  148 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  22072981 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24704832 - 24704688
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgt 166  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||  | ||||| |||| ||    
T  24704832 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gt 24704735  T
Q  167 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24704734 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  140 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 456468 - 456321
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  456468 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 456370  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  456369 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11972643 - 11972496
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  11972643 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11972545  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11972544 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 14949137 - 14949284
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  14949137 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 14949235  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14949236 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 15376728 - 15376875
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  15376728 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 15376826  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15376827 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16232667 - 16232520
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  16232667 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16232569  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16232568 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18640419 - 18640272
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  18640419 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18640321  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18640320 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 20385138 - 20385285
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  20385138 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20385236  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20385237 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 21189610 - 21189757
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  21189610 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21189708  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21189709 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24275318 - 24275187
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  24275318 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 24275220  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275219 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32125638 - 32125491
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  32125638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 32125540  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32125539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41523064 - 41522917
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  41523064 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41522966  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41522965 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41525526 - 41525379
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  41525526 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 41525428  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41525427 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 212
Target Start/End: Original strand, 11393302 - 11393448
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  11393302 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 11393400  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11393401 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18430859 - 18430709
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | || |   ||||||  | ||||| ||||    
T  18430859 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt 18430761  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18430760 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410059
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T
Q  200 gttgaagatgatga 213  Q
    | | ||||||||||    
T  16410072 gattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24702385 - 24702238
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  24702385 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24702287  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24702286 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27217007 - 27216860
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  27217007 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 27216909  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  27216908 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3386383 - 3386333
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386383 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13831431 - 13831373
Alignment:
Q  154 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831431 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| | || | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116509
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  200 gttgaagatgatga 213  Q
    | | ||||||||||    
T  44116522 gattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  147 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Original strand, 15144105 - 15144139
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144105 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 19486793 - 19486865
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486793 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 38898423 - 38898523
Alignment:
Q  99 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 194  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| || |   ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38898423 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggttt 38898520  T
Q  195 aag 197  Q
    |||    
T  38898521 aag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203828
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaagatg 18203828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Original strand, 18154909 - 18154943
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154909 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51797 - 51582
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  51797 aggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataag 51698  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51697 atgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 51598  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||| ||||||||||    
T  51597 ttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16920536 - 16920751
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920536 aggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 16920635  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16920636 atgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatg 16920735  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  16920736 ttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22831720 - 22831503
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtataca--ta 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  22831720 aggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatcta 22831621  T
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22831620 agatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacta 22831521  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22831520 tgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11185710 - 11185517
Alignment:
Q  11 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  11185710 taatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatga 11185611  T
Q  111 attgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185610 attgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20360863 - 20361081
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  20360863 aggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaa 20360962  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20360963 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaa 20361061  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | || |||| ||||||||||    
T  20361062 gttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 20638188 - 20638404
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| |||   ||||    
T  20638188 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaaga 20638287  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||   || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20638288 tgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagt 20638386  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  20638387 tgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29060755 - 29060540
Alignment:
Q  4 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||| | ||||    
T  29060755 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagat 29060656  T
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  29060556 gatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 19303446 - 19303661
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  19303446 gttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgag 19303544  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303545 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 19303643  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  19303644 tgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16496396 - 16496244
Alignment:
Q  66 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgt 162  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||    
T  16496396 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 16496297  T
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16496296 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 22780132 - 22780348
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  22780132 gttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 22780231  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||| ||| ||   ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22780232 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 22780330  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  22780331 tgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 25629260 - 25629476
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  25629260 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 25629359  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||   ||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25629360 tgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25629458  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  25629459 tgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20593987 - 20593773
Alignment:
Q  5 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||    
T  20593987 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatg 20593888  T
Q  104 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593887 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttg 20593789  T
Q  201 ttgaagatgatgatgt 216  Q
     |||||||||||||||    
T  20593788 atgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 17287701 - 17287917
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  | |||||||| | ||| |||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  17287701 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 17287800  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |   |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17287801 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17287899  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || | |||||||||||||    
T  17287900 tgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 18409732 - 18409947
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||  ||   || ||   | |||    
T  18409732 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgaga 18409831  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18409832 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagt 18409930  T
Q  199 tgttgaagatgatgatg 215  Q
    || ||||||||||||||    
T  18409931 tgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  52 atgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatact 148  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| ||| ||   ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttact 20076767  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561303
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496592
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29809003
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25656727 - 25656629
Alignment:
Q  116 atttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  25656727 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25644392 - 25644339
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644392 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 215
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||   |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12742464 - 12742317
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  12742464 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 12742366  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12742365 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 18334607 - 18334754
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  18334607 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 18334705  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  18334706 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19005193 - 19005046
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  19005193 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19005095  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19005094 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 19858934 - 19859081
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  19858934 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 19859032  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19859033 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22782338 - 22782227
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22782241  T
Q  200 gttgaagatgatga 213  Q
    | | ||||||||||    
T  22782240 gattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24422694 - 24422547
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  24422694 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 24422596  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24422595 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33861941 - 33861794
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  33861941 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33861843  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33861842 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33864425 - 33864278
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  33864425 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 33864327  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33864326 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20109210 - 20109157
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109210 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25714470 - 25714417
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714470 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1595660 - 1595549
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1595660 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1595563  T
Q  200 gttgaagatgatga 213  Q
    | | ||||||||||    
T  1595562 gattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 2291195 - 2291342
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  2291195 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 2291293  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2291294 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8055176 - 8055029
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||   | ||||| ||||    
T  8055176 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt 8055078  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8055077 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 216
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  169 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 26924655 - 26924802
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||   | ||||| ||||    
T  26924655 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 26924753  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26924754 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18456866 - 18456732
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||   | ||||| ||||    
T  18456866 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18456768  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18462026 - 18461892
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||   | ||||| ||||    
T  18462026 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 18461928  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461927 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  151 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416008
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-at 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||  |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 27415985  T
Q  141 tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  27415986 tgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 200
Target Start/End: Original strand, 18821912 - 18821949
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23019478 - 23019408
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23019478 atactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 1540926 - 1541073
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  1540926 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 1541024  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  1541025 -gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 3852129 - 3852179
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852129 ttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 20557004 - 20557054
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  20557004 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 193
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185919
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 193  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 8227587 - 8227632
Alignment:
Q  171 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227587 taactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  118 ttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448686
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 201
Target Start/End: Original strand, 18177729 - 18177779
Alignment:
Q  150 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18177729 cctatgttgttgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18177779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18204142 - 18204092
Alignment:
Q  150 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18204142 cctatgttgttgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18204092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19873169 - 19873120
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873169 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32282 - 32067
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32282 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaag 32183  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32182 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32084  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  32083 gttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 15368 - 15584
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15368 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataag 15467  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15468 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15566  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15567 tgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7459 - 7378
Alignment:
Q  48 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 130  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7459 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 5034 - 5246
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5034 aggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataag 5133  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5134 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 5233  T
Q  201 ttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||    
T  5234 ttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4929 - 4712
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4929 aggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataag 4830  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    || ||||||||||| | ||||| || |||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4829 attttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4731  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     ||||||||||||||||||    
T  4730 ttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 153 - 16
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  153 aggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataag 54  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct 138  Q
    || ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||    
T  53 attttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgct 16  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13713 - 13497
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13713 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 13614  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13613 atgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 13515  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13514 tgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21292873 - 21293090
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21292873 aggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaag 21292972  T
Q  101 atgttgatgaa-ttgaat-ttgatataattatgtcatgct-attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21292973 atgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21293072 atgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 23390401 - 23390617
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  23390401 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 23390500  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23390501 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23390599  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  23390600 tgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 8286747 - 8286964
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||  ||  |||||    
T  8286747 gttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaaga 8286846  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt----gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286847 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8286945  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     || |||||||||||||||    
T  8286946 ttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25421748 - 25421532
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  25421748 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 25421649  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25421648 tgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25421550  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  25421549 tgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22075237 - 22075018
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||    
T  22075237 aggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 22075138  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||   || | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22075137 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaa 22075039  T
Q  197 gatgttgaag-atgatgatgt 216  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  22075038 gttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24493784 - 24493569
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  24493784 gttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaaga 24493685  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24493684 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 24493586  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  24493585 gatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24529436 - 24529223
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||    
T  24529436 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 24529337  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24529336 tgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24529238  T
Q  199 tgttgaagatgatga 213  Q
    || ||||||||||||    
T  24529237 tgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13025526 - 13025311
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  ||||    
T  13025526 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaag 13025428  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13025427 atgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagt 13025329  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  13025328 tgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13095710 - 13095495
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||  ||||    
T  13095710 gttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatg-ttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaag 13095612  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13095611 atgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagt 13095513  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  13095512 tgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37724020 - 37723910
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37724020 agatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaaga 37723921  T
Q  199 tgttgaagatg 209  Q
    |||||||||||    
T  37723920 tgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9078168 - 9077952
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  | |||    
T  9078168 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgaga 9078069  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  9078068 tgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagt 9077970  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  9077969 tgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  52 atgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatac 147  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    ||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  148 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 21729033 - 21729185
Alignment:
Q  66 ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgt 162  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||    
T  21729033 ttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgt 21729132  T
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21729133 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25431610 - 25431414
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| | |  |||||    
T  25431610 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaaga 25431511  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||   || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431510 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1096683 - 1096467
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  1096683 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgaga 1096584  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| |   || | ||| ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1096583 tgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1096485  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||| ||||||    
T  1096484 tgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314577
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 216
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997655
Alignment:
Q  116 atttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  213 atgt 216  Q
    ||||    
T  21997652 atgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 21329546 - 21329618
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21329546 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22032520 - 22032323
Alignment:
Q  12 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 111  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22032520 aatctgtgaagctg-atacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 22032422  T
Q  112 ttgaatttgatataattatgtcatgct--attgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 209  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||| |   |||||  |||||||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  22032421 ttgaa-ttggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatg 22032326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc----tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 195  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||     | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  196 agatg 200  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  4 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||      ||||    ||||||||  ||   ||||||  | |||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac-----ttat----tacttgaattatgaatgtatatttgagatg 22412298  T
Q  104 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  22412297 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 22412199  T
Q  202 tgaagatgatga 213  Q
    | ||||||||||    
T  22412198 ttaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 18769919 - 18770024
Alignment:
Q  12 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 111  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||  || ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18769919 aatctgtgaagctg-atatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 18770017  T
Q  112 ttgaatt 118  Q
    |||||||    
T  18770018 ttgaatt 18770024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 23572252 - 23572178
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatt 118  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572252 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 23572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 22107276 - 22107357
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat-gattatgcattacttgaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22107276 aggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 21502205 - 21502277
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21502205 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21565614 - 21565546
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  21565614 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22144121 - 22144065
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144121 atactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 264783 - 264930
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  264783 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 264881  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  264882 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 10732955 - 10733102
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  10732955 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 10733053  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10733054 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20909159 - 20909012
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| | ||    
T  20909159 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tt 20909062  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39363531 - 39363384
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  39363531 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 39363433  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39363432 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 36154798 - 36154942
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| || |||||    |    
T  36154798 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttg----t 36154892  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  36154893 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356367
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-att 141  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  142 gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  18356388 gtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 26012084 - 26012137
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012084 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29330081 - 29329934
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  29330081 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29329983  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29329982 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32027540 - 32027393
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||||||||    
T  32027540 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt 32027442  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32027441 -gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 42245380 - 42245527
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  42245380 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 42245478  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42245479 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154776
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 11581311 - 11581361
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  11581311 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 20918060 - 20918110
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39245186 - 39245136
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  39245186 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418599
Alignment:
Q  4 ttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| | |||    ||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||  |  ||| |||  |||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatat-taaga 18418695  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-gtatactgcctatgttgttgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  165 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  118 ttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29346127 - 29345980
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | || || ||||    
T  29346127 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt 29346029  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29346028 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910866
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-at 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 20910843  T
Q  141 tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||    
T  20910844 tgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061068
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319193
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29348500 - 29348453
Alignment:
Q  166 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29348500 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29350973 - 29350926
Alignment:
Q  166 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29350973 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  147 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704090
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 200
Target Start/End: Original strand, 26740720 - 26740750
Alignment:
Q  170 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740720 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973823
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 200
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  170 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 195
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  146 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 195  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40725898 - 40725853
Alignment:
Q  171 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725898 taactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 38801297 - 38801508
Alignment:
Q  4 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 103  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  38801297 ttaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatg 38801396  T
Q  104 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38801397 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttg 38801495  T
Q  204 aagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||    
T  38801496 aagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 27250632 - 27250850
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||  |||    
T  27250632 aggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaa 27250731  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250732 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27250830  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  27250831 gttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21026898 - 21026680
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||    
T  21026898 aggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 21026799  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||   | ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026798 gatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21026700  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  21026699 gttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 50210118 - 50210333
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  50210118 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 50210217  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||   || | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50210218 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 50210316  T
Q  199 tgttgaagatgatgatg 215  Q
    || ||||||||||||||    
T  50210317 tgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34509996 - 34509783
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||   ||||||  |||||    
T  34509996 gttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 34509897  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34509896 tgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 34509798  T
Q  199 tgttgaagatgatga 213  Q
    || ||||||||||||    
T  34509797 tgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Original strand, 22354477 - 22354613
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  22354477 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaaga 22354576  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct 138  Q
    ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  22354577 tgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgct 22354613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532269
Alignment:
Q  15 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 113  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   || |||  |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  114 gaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 210  Q
    | | | ||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 22532275  T
Q  211 tgatgt 216  Q
    ||||||    
T  22532274 tgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 216
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  116 atttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  213 atgt 216  Q
    ||||    
T  20847272 atgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295672
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20135403 - 20135188
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||    
T  20135403 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaaga 20135304  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtc---atgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||||||| |  |||||| ||||||||   ||| | |||||  ||||||||| || |  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  20135303 tgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 20135205  T
Q  199 tgttgaagatgatgatg 215  Q
    || | |||||| |||||    
T  20135204 tgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 216
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45575008
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| || |   ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 45574991  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||| ||||||||||    
T  45574992 gttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754064
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  197 gatg 200  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  5 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || || | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  104 ttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||| ||||||| | ||||||| || |||||||||| ||||   |  |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  201 ttgaagatgatgatg 215  Q
     | |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  197 gatg 200  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 22356079 - 22356185
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  22356079 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatg 22356178  T
Q  101 atgttga 107  Q
    |||||||    
T  22356179 atgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Original strand, 22357765 - 22357871
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttga-tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||  || |    
T  22357765 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatg 22357864  T
Q  101 atgttga 107  Q
    |||||||    
T  22357865 atgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918623
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 200
Target Start/End: Original strand, 35261127 - 35261183
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261127 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13989013 - 13988866
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  13989013 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13988915  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13988914 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 21923306 - 21923453
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  21923306 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21923404  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21923405 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29776835 - 29776688
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  29776835 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 29776737  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776736 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31612460 - 31612313
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||   | ||||| ||||    
T  31612460 tatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt 31612362  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  31612361 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 433157 - 433012
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc---atgctattgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||   ||| | ||||||||||||| |||||  |||    
T  433157 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgccgtt 433058  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  433057 ----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Original strand, 22123131 - 22123214
Alignment:
Q  116 atttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123131 atttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22237695 - 22237630
Alignment:
Q  148 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22237695 tgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  147 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 215
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  147 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 21475102 - 21475249
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  21475102 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 21475200  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  21475201 -gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21707225 - 21707167
Alignment:
Q  154 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707225 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21711767 - 21711709
Alignment:
Q  154 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711767 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 214  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29298187 - 29298137
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 213
Target Start/End: Original strand, 16275430 - 16275526
Alignment:
Q  118 ttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16275430 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  165 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797601
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatg 33797601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  146 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533978
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 952 - 1169
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  952 aggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaag 1051  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1052 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1150  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     ||||||||||||||||||    
T  1151 ttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 167882 - 168099
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||    
T  167882 aggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaag 167981  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167982 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 168080  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     ||||||||||||||||||    
T  168081 ttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 52129 - 51913
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  52129 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 52030  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52029 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 51931  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  51930 tgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 20698341 - 20698556
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20698341 gttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagat 20698440  T
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20698441 gttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20698539  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  20698540 gatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12399427 - 12399209
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatga-ttatgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| |||  |||    
T  12399427 aggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaa 12399328  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399327 gatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12399229  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  12399228 gttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13442490 - 13442274
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  13442490 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13442391  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13442390 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 13442292  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  13442291 tgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17488072 - 17487856
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  17488072 gttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17487973  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17487972 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17487874  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  17487873 tgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17499554 - 17499338
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  17499554 gttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 17499455  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17499454 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17499356  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  17499355 tgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14973070 - 14972854
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   |||||| || |||    
T  14973070 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgaga 14972971  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14972970 tgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 14972872  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  14972871 tgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26687103 - 26686887
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  26687103 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaaga 26687004  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26687003 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26686905  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  26686904 tgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43841148 - 43840932
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  43841148 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 43841049  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  43841048 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 43840950  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43840949 tgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18438750 - 18438534
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||   |||||| | ||||    
T  18438750 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaaga 18438651  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18438650 tgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 18438552  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  18438551 tgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 14576738 - 14576934
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  14576738 gttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 14576837  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattg--tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576838 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  4 ttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  201 ttgaagatgatga 213  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 23083266 - 23083482
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| | | ||| |||  |||||    
T  23083266 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaaga 23083365  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| || ||   ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23083366 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23083464  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  23083465 tgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 25476290 - 25476506
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat--gcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||   ||||||| | ||    
T  25476290 gttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatg-ttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgag 25476388  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25476389 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaag 25476487  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     || |||||||||||||||    
T  25476488 ttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 40213626 - 40213838
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |  ||   ||||||  | |||    
T  40213626 gttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgaga 40213725  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |   ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  40213726 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 40213823  T
Q  199 tgttgaagatgatga 213  Q
    || | ||||||||||    
T  40213824 tgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 11424668 - 11424880
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  | || |||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   || |||  | |||    
T  11424668 gttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga 11424767  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||||||   |||   |||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11424768 tgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 11424863  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  11424864 gatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14572804 - 14572608
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatg-cattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||  || || |||||||||||||||||| || |  ||||| |||||| ||| ||| |||  |||||    
T  14572804 gttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaaga 14572705  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||| ||| |   | ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572704 tgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42386627 - 42386429
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||   || |||  | ||    
T  42386627 gttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgag 42386528  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386527 atgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210448
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 200
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  148 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15470996 - 15470927
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15470996 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 9707622 - 9707769
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  9707622 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 9707720  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9707721 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 29172598 - 29172745
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  29172598 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 29172696  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29172697 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  48 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctattgtat 145  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | | || | |||||     
T  856304 tatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaa 856206  T
Q  146 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
     |||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856205 tctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  151 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Original strand, 43550594 - 43550644
Alignment:
Q  166 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43550594 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27165319 - 27165250
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27165319 atactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  197 gatgttgaagatgatga 213  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14234559 - 14234487
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||    
T  14234559 atactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 7781362 - 7781509
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  7781362 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 7781460  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7781461 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17463325 - 17463178
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  17463325 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17463227  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17463226 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 28848626 - 28848773
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  28848626 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 28848724  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28848725 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34159473 - 34159326
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  34159473 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 34159375  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  34159374 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 45606922 - 45607069
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  45606922 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 45607020  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45607021 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55476638 - 55476491
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  55476638 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 55476540  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  55476539 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 212
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Original strand, 24340672 - 24340844
Alignment:
Q  47 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt-- 143  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| | | |||  || ||||| ||||| ||||| | ||||      
T  24340672 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgc 24340771  T
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340772 atactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 213
Target Start/End: Original strand, 53301600 - 53301669
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301600 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  198 atgttgaagatgatga 213  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16796761 - 16796685
Alignment:
Q  5 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 80  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16796761 taattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469296
Alignment:
Q  103 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T
Q  200 gttgaagatgatga 213  Q
    | | ||||||||||    
T  6469283 gattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8899241 - 8899094
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  8899241 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 8899143  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  8899142 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 214  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 16454296 - 16454443
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  16454296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 16454394  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16454395 -gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 197
Target Start/End: Original strand, 38961906 - 38962037
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  38961906 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 38962004  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962005 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567576
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15977565 - 15977515
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17737286 - 17737236
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  17737286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242838
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
     | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Original strand, 53070668 - 53070802
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || | ||   ||||||||  ||||||| ||||    
T  53070668 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt 53070766  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070767 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53070802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  147 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 13151805 - 13151953
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  13151805 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13151903  T
Q  164 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13151904 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 13154270 - 13154418
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  13154270 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13154368  T
Q  164 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13154369 -gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 211
Target Start/End: Original strand, 16282923 - 16282971
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282923 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 10247738 - 10247885
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | || || ||||    
T  10247738 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt 10247836  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10247837 -gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 17446670 - 17446816
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  17446670 tatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 17446768  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  17446769 -gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119887
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274706
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 37642314 - 37642386
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 1644723 - 1644775
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  1644723 atactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaag 1644775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 15878119 - 15878168
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878119 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13427 - 13211
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  13427 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 13328  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13327 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13229  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  13228 tgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4849
Alignment:
Q  9 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttga 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  | |||||| |||| ||||||||||     
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgt 4960  T
Q  108 tgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 204  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttga 4861  T
Q  205 agatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||    
T  4860 agatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3686 - 3470
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  3686 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 3587  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  3586 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 3488  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  3487 tgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 343
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| | | |||  |||||    
T  558 gttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaaga 459  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||  | ||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  458 tgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtc 360  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | | |||||||||||||    
T  359 gataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2067 - 1851
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  2067 gttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 1968  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1967 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 1869  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  1868 tgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 6026 - 6245
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  6026 gttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 6125  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6126 tgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6225  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    | || |||||||||||||||    
T  6226 gttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2170 - 1952
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||  |||    
T  2170 aggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaa 2071  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2070 gatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1972  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1971 gatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 24206 - 24405
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatga-ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  24206 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 24305  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc----tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 atgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38976 - 38761
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  38976 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 38877  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  38876 tgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagtt 38778  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  38777 gatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  7 attataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgtt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  106 gatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 203  Q
    | | | ||| ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  204 aagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9799 - 9744
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  9799 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 174883 - 174767
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174883 agatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 174784  T
Q  199 tgttgaagatgatgatg 215  Q
    |||||||| ||||||||    
T  174783 tgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 124801 - 124679
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |    
T  124801 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaa 124702  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatat 124  Q
     |||||||||||| | |||||||    
T  124701 cgttgatgaattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  146 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 200
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  140 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 200
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  140 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39692 - 39479
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  39692 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 39593  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39592 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39494  T
Q  200 gttgaagatgatgat 214  Q
    | |||||| ||||||    
T  39493 gatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 75120 - 75333
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  75120 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 75219  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  75220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 75318  T
Q  200 gttgaagatgatgat 214  Q
    | |||||| ||||||    
T  75319 gatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 3056 - 3271
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  3056 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 3155  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3156 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3254  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  3255 gatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21127 - 20910
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  21127 gttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataaga 21028  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | || |   ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||     
T  21027 tgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
     |||||||||| ||||||    
T  20927 cgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26111 - 25896
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  26111 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 26012  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26011 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 25913  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | ||||||| |||||||    
T  25912 gatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40073 - 39858
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  | |||    
T  40073 gttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgaga 39974  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  39973 tgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagtt 39875  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  39874 gatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 8438 - 8650
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  8438 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 8537  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8538 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttg----ctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8633  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  8634 gatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 339855 - 340065
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  339855 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgaga 339954  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  339955 tgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 340051  T
Q  200 gttgaagatgatga 213  Q
    |  |||||||||||    
T  340052 gacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 158465 - 158612
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  158465 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 158563  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  158564 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71353
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-at 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||  |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtt 71376  T
Q  141 tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  71375 tgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 17120 - 17337
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat-gcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  17120 gttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 17219  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt-----gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||     ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17220 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17318  T
Q  197 gatgttgaagatgatgatg 215  Q
    | || ||||||||||||||    
T  17319 gttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 200
Target Start/End: Original strand, 79396 - 79433
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 25970 - 26179
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  25970 gttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 26069  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
     |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26070 cgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 26168  T
Q  199 tgttgaagatg 209  Q
    || ||||||||    
T  26169 tgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 195  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  196 agatgttgaagatgatga 213  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 33400 - 33461
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg 64  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  33400 gttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 33461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  15 ctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattat-gcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatt 113  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  114 gaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 210  Q
      ||||||||| ||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  211 tgatg 215  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23098 - 22886
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  23098 gttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 22999  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22998 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22901  T
Q  199 tgttgaagatgatga 213  Q
    || | ||||||||||    
T  22900 tgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 16505 - 16721
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||| | |||    
T  16505 gttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgaga 16604  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    || || ||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16605 tgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 16703  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  16704 tgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40128 - 39913
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| |   |||  |||||    
T  40128 gttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaaga 40029  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||  |||  || ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  40028 tgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagtt 39930  T
Q  200 gttgaagatgatgatgt 216  Q
    | |||||||||||||||    
T  39929 gatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 19933 - 19990
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19933 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  80 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaacta 176  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaacta 28454  T
Q  177 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28453 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11292
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1997
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  160 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1190
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4723 - 4508
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  4723 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 4624  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | || |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4623 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 4526  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  4525 tgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12305 - 12090
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  12305 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 12206  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | || |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12205 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 12108  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  12107 tgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22257 - 22042
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  22257 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 22158  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||   | || |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22157 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagt 22060  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  22059 tgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26911
Alignment:
Q  12 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 111  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 26929  T
Q  112 ttgaatttgatataattat 130  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  26928 ttgaa-ttgatataattat 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  140 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13308 - 13141
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  13308 gttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 13209  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tattgtatactgcctatgttgttgtttgt 166  Q
    || || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13208 tgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6828 - 6669
Alignment:
Q  1 aggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataa 99  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||| |||  |||    
T  6828 aggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaa 6729  T
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta---ttgtatactgcctatgt 156  Q
    ||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  6728 gatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 216
Target Start/End: Original strand, 32904 - 33077
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt- 141  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||     
T  32904 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 33002  T
Q  142 -gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33003 tgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46101 - 45928
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt- 141  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||| | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||     
T  46101 tgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 46003  T
Q  142 -gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46002 tgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  8 ttataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttg 106  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||| || |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||   ||   ||||||| | ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  107 atgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttg 203  Q
     ||  ||| ||||||||| || || || |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  204 aagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17450
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17397 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 100446 - 100378
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  100446 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44602 - 44454
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt----gtatactgcctatgttgttgt 162  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||  | ||||| |||    
T  44602 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgt 44504  T
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44503 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 212
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 94558 - 94411
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  94558 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 94460  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  94459 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17586
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    || | ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540 gc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8485
Alignment:
Q  71 cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc--tattgtatactgcctatgttgttgtttgtta 168  Q
    |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtta 8514  T
Q  169 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8691 - 8479
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||    ||||| | | |||||||||||||| | | ||| ||   |||||    
T  8691 gttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaaga 8596  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 198  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| || ||   ||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8595 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 8497  T
Q  199 tgttgaagatgatgatgt 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  8496 tgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4739 - 4545
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | | | |||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  || |||  |||||    
T  4739 gttaattataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaaga 4641  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtc---atgctattgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 195  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| || || ||    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4640 tgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  197 gatg 200  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1975
Alignment:
Q  48 tatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatt 118  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045 tatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 1975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21826
Alignment:
Q  12 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 111  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 21819  T
Q  112 ttgaatt 118  Q
    |||||||    
T  21820 ttgaatt 21826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29718
Alignment:
Q  12 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaa 111  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaa 29711  T
Q  112 ttgaatt 118  Q
    |||||||    
T  29712 ttgaatt 29718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12931 - 12857
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatt 118  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931 tgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 12857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11305
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11350 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15664
Alignment:
Q  140 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  100 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgcta--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  198 atgttgaagatgatgatgt 216  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 2855 - 2923
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2855 atactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  197 gatg 200  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16202
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16149 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 28046 - 27911
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataaga 101  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||   ||||||  | |||    
T  28046 gttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgaga 27947  T
Q  102 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc 137  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27946 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 1052
Alignment:
Q  5 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-attatgcattacttga 80  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1128 taattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12834 - 12766
Alignment:
Q  148 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt--atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  197 gatg 200  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  152 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160688
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501100
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 212
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 10590 - 10659
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  10590 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3571
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtat-aagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | ||    
T  3434 gttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgag 3533  T
Q  101 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct 138  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3534 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 3571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 197
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  140 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10546
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10599 atactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaag 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  152 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 136827 - 136680
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| ||||    
T  136827 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 136729  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  136728 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 139296 - 139149
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| ||||    
T  139296 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 139198  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  139197 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 144234 - 144087
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| ||||    
T  144234 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 144136  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  144135 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 134358 - 134211
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| ||||    
T  134358 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 134260  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  134259 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 141765 - 141618
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctat---tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||  | ||||| ||||    
T  141765 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt 141667  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  141666 -gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 200
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  140 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 129977 - 129924
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  129977 atactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaag 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13539 - 13392
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  13539 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13441  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13440 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20894 - 20747
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  20894 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 20796  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20795 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3640
Alignment:
Q  5 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 60  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3695 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7704
Alignment:
Q  5 taattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 60  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7759 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 27798 - 27851
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27798 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37821
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  37968 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 37870  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  37869 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  99 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 196  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  197 gatgttgaagatgatga 213  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  147 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4710
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    || | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  150 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15483
Alignment:
Q  44 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaat-atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct-at 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt 15460  T
Q  141 tgtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  15461 tgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36195
Alignment:
Q  147 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 201  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 36195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 22719 - 22788
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  22719 atactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     | | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  82134 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  147 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 200
Target Start/End: Original strand, 53498 - 53654
Alignment:
Q  47 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt-- 143  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| || |||  | |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | || |      
T  53498 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgc 53597  T
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53598 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 213
Target Start/End: Original strand, 38751 - 38820
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  38751 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32608 - 32555
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 199
Target Start/End: Original strand, 51904 - 51987
Alignment:
Q  118 ttgatataattatgtcatgctattgt---atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 199  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |   || |||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51904 ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11464
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 216
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38377
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Original strand, 20394 - 20527
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt--gtatactgcctatgttgttgttt 164  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||  | ||||| ||||     
T  20394 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt- 20491  T
Q  165 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  52 atgtgatataatgattatg--cattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgtatactg 149  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| || | |  |     
T  128917 atgtgatataatg-ttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt-ttttttt 128820  T
Q  150 cctatgttgttg--tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
      | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||    
T  128819 ttttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  53 tgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatact 148  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||   |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 214  Q
    || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  149 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14094 - 13947
Alignment:
Q  67 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctatt---gtatactgcctatgttgttgtt 163  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | ||||| ||||    
T  14094 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt 13996  T
Q  164 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13995 -gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16834 - 16784
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16834 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12016 - 11979
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12016 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Original strand, 17976 - 18148
Alignment:
Q  47 ttatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctattgt-- 143  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| || |||  | |||||||| | | |||  || ||||| ||||| ||||| | ||||      
T  17976 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgc 18075  T
Q  144 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 216  Q
    ||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18076 ataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2275
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  144 atactgcctatgttgttgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 10379 - 10323
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgata 59  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10379 gttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4347 - 4300
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4347 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9292 - 9241
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  145 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 106
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  156 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29982 - 29948
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29982 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40450 - 40400
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  40450 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161252
Alignment:
Q  167 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  97 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--cta--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 192  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||  ||   ||| |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  193 ctaagatg 200  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4214
Alignment:
Q  165 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 12361 - 12413
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| |||||    
T  12361 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12108 - 12064
Alignment:
Q  169 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12108 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  143 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 197  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 200
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  171 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69794
Alignment:
Q  163 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69843 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69930
Alignment:
Q  12 aatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgatta--tgcattacttgaa 81  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgt-tatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 69930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 39
Target Start/End: Original strand, 17892 - 17928
Alignment:
Q  3 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttg 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17892 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1095 times since January 2019
Visitors: 2571