View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0279_low_14 (Length: 355)

Name: NF0279_low_14
Description: NF0279
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0279_low_14
NF0279_low_14
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (169-332)||(26924639-26924802)
chr6 (169-332)||(18334591-18334754)
chr6 (170-332)||(3852017-3852179)
chr6 (170-332)||(8055029-8055191)
chr6 (170-332)||(12742317-12742479)
chr6 (170-332)||(19005046-19005208)
chr6 (170-332)||(19858919-19859081)
chr6 (170-332)||(22782227-22782389)
chr6 (170-332)||(24422547-24422709)
chr6 (170-332)||(25754809-25754971)
chr6 (170-332)||(33861794-33861956)
chr6 (170-332)||(33864278-33864440)
chr6 (169-332)||(2291179-2291342)
chr6 (170-334)||(30676710-30676874)
chr6 (170-334)||(34963371-34963535)
chr6 (170-332)||(1540911-1541073)
chr6 (170-316)||(18456735-18456881)
chr6 (170-332)||(25656629-25656791)
chr6 (170-329)||(16448526-16448686)
chr6 (170-332)||(20556894-20557054)
chr6 (170-332)||(1595549-1595711)
chr6 (170-332)||(25688502-25688664)
chr6 (180-316)||(18461895-18462031)
chr6 (170-334)||(18409782-18409947)
chr6 (190-335)||(17287771-17287917)
chr6 (170-335)||(25629310-25629476)
chr6 (173-335)||(29060540-29060703)
chr6 (210-335)||(20593773-20593899)
chr6 (210-335)||(19303536-19303661)
chr6 (170-335)||(20360915-20361081)
chr6 (207-335)||(16496244-16496373)
chr6 (230-335)||(20076700-20076805)
chr6 (170-320)||(25644335-25644487)
chr6 (230-335)||(20638298-20638404)
chr6 (274-335)||(25714417-25714478)
chr6 (170-316)||(18821801-18821946)
chr6 (190-335)||(22780202-22780348)
chr6 (274-335)||(27333277-27333339)
chr6 (274-335)||(27394017-27394079)
chr6 (179-335)||(20109140-20109295)
chr6 (170-333)||(19847949-19848114)
chr6 (288-335)||(22080799-22080846)
chr6 (282-335)||(1561303-1561356)
chr6 (282-335)||(28496539-28496592)
chr6 (282-335)||(29808950-29809003)
chr6 (274-320)||(9098573-9098620)
chr6 (282-335)||(16920698-16920751)
chr6 (282-331)||(19652199-19652248)
chr6 (282-335)||(35245586-35245639)
chr6 (170-226)||(8227466-8227522)
chr6 (277-333)||(23992429-23992485)
chr6 (274-320)||(19668386-19668433)
chr6 (282-316)||(11185524-11185558)
chr6 (274-335)||(22831503-22831565)
chr6 (294-338)||(19008799-19008843)
chr6 (214-335)||(23019408-23019528)
chr6 (274-314)||(33443068-33443108)
chr6 (277-331)||(18907111-18907165)
chr6 (277-331)||(19862978-19863032)
chr6 (277-331)||(19873120-19873174)
chr6 (290-335)||(8227587-8227632)
chr6 (274-331)||(21766695-21766752)
chr6 (274-321)||(4185880-4185928)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (170-332)||(14409444-14409606)
chr8 (170-332)||(41598188-41598350)
chr8 (169-332)||(22001753-22001916)
chr8 (170-332)||(1484402-1484564)
chr8 (170-332)||(5853292-5853454)
chr8 (170-332)||(20403227-20403389)
chr8 (170-328)||(16413316-16413474)
chr8 (169-332)||(4483281-4483443)
chr8 (170-332)||(15203231-15203393)
chr8 (170-332)||(20046195-20046357)
chr8 (169-332)||(4542372-4542535)
chr8 (170-332)||(19896265-19896430)
chr8 (170-332)||(14823774-14823935)
chr8 (169-328)||(45290693-45290853)
chr8 (170-332)||(25484275-25484430)
chr8 (170-334)||(26223917-26224081)
chr8 (173-319)||(15070571-15070718)
chr8 (170-335)||(16092297-16092463)
chr8 (170-316)||(19801382-19801527)
chr8 (170-338)||(19937005-19937174)
chr8 (170-338)||(6759255-6759421)
chr8 (190-335)||(7372778-7372924)
chr8 (170-335)||(18818364-18818530)
chr8 (210-334)||(28649039-28649164)
chr8 (189-332)||(26219717-26219859)
chr8 (170-335)||(20536208-20536374)
chr8 (207-335)||(21918992-21919121)
chr8 (223-335)||(23406379-23406492)
chr8 (189-332)||(26225267-26225409)
chr8 (190-335)||(21923903-21924049)
chr8 (170-335)||(22875065-22875230)
chr8 (170-335)||(22626736-22626901)
chr8 (256-335)||(18879272-18879352)
chr8 (239-335)||(31971257-31971353)
chr8 (274-335)||(6520368-6520430)
chr8 (274-335)||(38855310-38855372)
chr8 (239-335)||(45131022-45131117)
chr8 (170-317)||(13508040-13508188)
chr8 (170-317)||(13597572-13597720)
chr8 (274-335)||(17140916-17140978)
chr8 (274-335)||(21490995-21491057)
chr8 (170-335)||(17612065-17612231)
chr8 (274-335)||(5866333-5866395)
chr8 (274-335)||(16199703-16199765)
chr8 (285-335)||(21249384-21249434)
chr8 (285-335)||(21255222-21255272)
chr8 (282-331)||(21285601-21285650)
chr8 (282-335)||(21389518-21389571)
chr8 (282-335)||(21396048-21396101)
chr8 (282-335)||(21778844-21778897)
chr8 (282-335)||(21790541-21790594)
chr8 (170-219)||(24486044-24486093)
chr8 (277-333)||(18678165-18678221)
chr8 (170-316)||(20498581-20498728)
chr8 (274-334)||(23648554-23648614)
chr8 (274-335)||(23760903-23760962)
chr8 (274-320)||(983465-983512)
chr8 (282-331)||(26355766-26355815)
chr8 (277-333)||(32121734-32121790)
chr8 (282-321)||(21673718-21673757)
chr8 (170-209)||(32810054-32810093)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (170-332)||(3386333-3386495)
chr7 (172-332)||(16410059-16410219)
chr7 (169-332)||(14949121-14949284)
chr7 (170-332)||(456321-456483)
chr7 (170-332)||(11972496-11972658)
chr7 (170-332)||(15376713-15376875)
chr7 (170-332)||(16232520-16232682)
chr7 (170-332)||(18640272-18640434)
chr7 (170-332)||(20385123-20385285)
chr7 (170-332)||(21189595-21189757)
chr7 (170-332)||(32125491-32125653)
chr7 (170-332)||(41522917-41523079)
chr7 (170-332)||(41525379-41525541)
chr7 (170-331)||(11393287-11393448)
chr7 (170-332)||(24702238-24702400)
chr7 (170-332)||(27216860-27217022)
chr7 (169-335)||(18430709-18430875)
chr7 (170-332)||(44116509-44116671)
chr7 (170-332)||(16213684-16213846)
chr7 (183-328)||(24275175-24275320)
chr7 (170-332)||(24704688-24704847)
chr7 (173-332)||(13869346-13869506)
chr7 (170-335)||(13647325-13647491)
chr7 (170-332)||(17061915-17062077)
chr7 (170-332)||(20110556-20110708)
chr7 (206-332)||(13831373-13831499)
chr7 (169-328)||(38898375-38898535)
chr7 (170-316)||(12756671-12756817)
chr7 (213-332)||(48273392-48273512)
chr7 (170-332)||(26355983-26356156)
chr7 (170-332)||(26358435-26358608)
chr7 (210-332)||(3564359-3564482)
chr7 (170-335)||(12698831-12698998)
chr7 (170-332)||(18456368-18456530)
chr7 (207-335)||(38227481-38227609)
chr7 (230-335)||(9509189-9509295)
chr7 (170-335)||(2280074-2280238)
chr7 (190-320)||(15144013-15144143)
chr7 (221-335)||(10589039-10589154)
chr7 (274-335)||(67745-67807)
chr7 (207-335)||(26211995-26212125)
chr7 (282-335)||(47831807-47831860)
chr7 (214-335)||(22072913-22073036)
chr7 (274-335)||(28505357-28505419)
chr7 (274-335)||(34200786-34200848)
chr7 (282-335)||(16386316-16386369)
chr7 (274-331)||(18005650-18005708)
chr7 (282-331)||(811199-811248)
chr7 (282-335)||(15754955-15755008)
chr7 (282-335)||(16495402-16495455)
chr7 (282-331)||(44014182-44014231)
chr7 (170-237)||(15081949-15082017)
chr7 (274-329)||(18154901-18154956)
chr7 (170-313)||(12255746-12255892)
chr7 (230-331)||(14932749-14932851)
chr7 (230-331)||(15356184-15356286)
chr7 (230-331)||(15360298-15360400)
chr7 (282-335)||(11996095-11996148)
chr7 (170-243)||(15113036-15113108)
chr7 (239-333)||(40443393-40443487)
chr7 (282-335)||(16219785-16219835)
chr7 (285-335)||(27847901-27847951)
chr7 (277-334)||(2832504-2832561)
chr7 (170-243)||(15116573-15116645)
chr7 (170-226)||(19486699-19486755)
chr7 (289-320)||(1868070-1868101)
chr7 (289-320)||(14044761-14044792)
chr7 (289-320)||(14354791-14354822)
chr7 (274-320)||(16056343-16056390)
chr7 (277-331)||(19649552-19649606)
chr7 (274-331)||(12187019-12187076)
chr7 (274-331)||(17138120-17138177)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (170-332)||(18215274-18215436)
chr4 (170-332)||(12307-12469)
chr4 (170-332)||(15118352-15118514)
chr4 (170-332)||(52312510-52312672)
chr4 (169-332)||(44615288-44615451)
chr4 (169-332)||(50222338-50222501)
chr4 (170-332)||(23803265-23803427)
chr4 (170-332)||(44102214-44102376)
chr4 (170-332)||(44773087-44773249)
chr4 (170-332)||(51463868-51464030)
chr4 (170-338)||(19242693-19242861)
chr4 (169-332)||(18239418-18239581)
chr4 (170-332)||(1837509-1837671)
chr4 (170-332)||(3515007-3515169)
chr4 (170-334)||(19618172-19618336)
chr4 (170-334)||(14970707-14970871)
chr4 (170-328)||(15355324-15355483)
chr4 (170-332)||(44928879-44929042)
chr4 (170-332)||(12610950-12611105)
chr4 (172-316)||(21815587-21815731)
chr4 (170-332)||(7641192-7641344)
chr4 (170-335)||(15367690-15367856)
chr4 (170-335)||(15402703-15402869)
chr4 (170-335)||(15371202-15371368)
chr4 (170-335)||(15373483-15373649)
chr4 (170-335)||(16223532-16223698)
chr4 (170-329)||(20149832-20149992)
chr4 (214-332)||(14280316-14280434)
chr4 (170-335)||(15370018-15370183)
chr4 (189-332)||(54798728-54798872)
chr4 (170-335)||(7088877-7089043)
chr4 (190-335)||(7798774-7798920)
chr4 (170-330)||(14038653-14038814)
chr4 (223-335)||(52873375-52873488)
chr4 (170-332)||(16377478-16377639)
chr4 (170-335)||(7893703-7893869)
chr4 (170-335)||(12902757-12902923)
chr4 (170-333)||(22636437-22636601)
chr4 (189-332)||(8574843-8574985)
chr4 (170-335)||(16270191-16270356)
chr4 (172-335)||(16239927-16240090)
chr4 (250-335)||(3096293-3096379)
chr4 (170-335)||(44052829-44052995)
chr4 (170-333)||(22353835-22353999)
chr4 (170-335)||(6899891-6900056)
chr4 (282-335)||(39706356-39706409)
chr4 (170-316)||(13806-13953)
chr4 (207-328)||(23374351-23374473)
chr4 (170-320)||(52243149-52243302)
chr4 (274-335)||(15551817-15551879)
chr4 (170-320)||(43198508-43198661)
chr4 (274-331)||(12774011-12774069)
chr4 (274-335)||(17046487-17046549)
chr4 (274-320)||(12288269-12288316)
chr4 (274-331)||(8846360-8846418)
chr4 (282-335)||(14053369-14053422)
chr4 (172-261)||(15464888-15464977)
chr4 (277-334)||(20157522-20157579)
chr4 (288-316)||(6190481-6190509)
chr4 (274-314)||(17333298-17333338)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (170-332)||(29172583-29172745)
chr3 (169-332)||(34159326-34159489)
chr3 (169-332)||(55476491-55476654)
chr3 (170-332)||(9707607-9707769)
chr3 (170-332)||(17463178-17463340)
chr3 (170-332)||(45606907-45607069)
chr3 (169-332)||(16454280-16454443)
chr3 (169-332)||(28848610-28848773)
chr3 (170-332)||(6469134-6469296)
chr3 (170-332)||(7781347-7781509)
chr3 (170-332)||(8899094-8899256)
chr3 (170-332)||(38961891-38962053)
chr3 (169-332)||(13151789-13151953)
chr3 (169-332)||(13154254-13154418)
chr3 (170-330)||(16282811-16282971)
chr3 (170-332)||(10247723-10247885)
chr3 (170-332)||(50242822-50242984)
chr3 (170-333)||(13544024-13544187)
chr3 (170-328)||(12567564-12567722)
chr3 (170-332)||(17446655-17446816)
chr3 (170-332)||(17672626-17672788)
chr3 (170-330)||(41123892-41124049)
chr3 (173-332)||(15412429-15412589)
chr3 (170-332)||(8499518-8499681)
chr3 (170-332)||(12119724-12119887)
chr3 (201-332)||(15977515-15977646)
chr3 (170-316)||(53070653-53070799)
chr3 (170-335)||(43550478-43550644)
chr3 (221-332)||(55500942-55501053)
chr3 (170-335)||(14972854-14973020)
chr3 (189-332)||(36166598-36166740)
chr3 (214-335)||(25476384-25476506)
chr3 (170-332)||(40213676-40213838)
chr3 (170-335)||(17487856-17488022)
chr3 (170-335)||(17499338-17499504)
chr3 (229-332)||(10556985-10557088)
chr3 (221-335)||(18438534-18438649)
chr3 (189-332)||(21618449-21618591)
chr3 (233-332)||(44494809-44494908)
chr3 (230-335)||(20698450-20698556)
chr3 (207-332)||(24153201-24153326)
chr3 (207-335)||(12399209-12399338)
chr3 (207-335)||(23083353-23083482)
chr3 (170-317)||(42386428-42386576)
chr3 (170-335)||(13442274-13442440)
chr3 (170-335)||(26686887-26687053)
chr3 (170-335)||(43840932-43841098)
chr3 (234-332)||(17737236-17737337)
chr3 (170-332)||(27165250-27165413)
chr3 (170-321)||(14576788-14576939)
chr3 (239-335)||(11424784-11424880)
chr3 (170-332)||(53301505-53301669)
chr3 (239-321)||(14572603-14572685)
chr3 (170-335)||(24340678-24340844)
chr3 (279-332)||(45577947-45578000)
chr3 (274-332)||(28194693-28194752)
chr3 (170-316)||(52523682-52523831)
chr3 (274-335)||(14234487-14234549)
chr3 (282-335)||(13210395-13210448)
chr3 (274-331)||(12174318-12174376)
chr3 (282-331)||(16097332-16097381)
chr3 (170-317)||(23274705-23274853)
chr3 (274-335)||(15470927-15470986)
chr3 (274-321)||(32307691-32307739)
chr3 (277-333)||(46822267-46822323)
chr3 (274-331)||(16103784-16103842)
chr3 (274-331)||(49668135-49668193)
chr3 (170-243)||(2051154-2051227)
chr3 (277-333)||(12511059-12511115)
chr3 (274-334)||(14665398-14665458)
chr3 (170-226)||(22147480-22147536)
chr3 (170-226)||(37642220-37642276)
chr3 (274-331)||(9512924-9512982)
chr3 (274-331)||(9520899-9520957)
chr3 (170-216)||(17248241-17248287)
chr3 (274-331)||(856140-856197)
chr3 (277-334)||(14668554-14668611)
chr3 (274-331)||(23077537-23077594)
chr3 (274-314)||(13919350-13919390)
chr3 (277-331)||(15878114-15878168)
chr3 (277-334)||(30029841-30029898)
chr3 (283-331)||(26196500-26196548)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (169-332)||(39363384-39363547)
chr5 (170-332)||(264768-264930)
chr5 (171-332)||(10732941-10733102)
chr5 (169-332)||(20909012-20909175)
chr5 (169-332)||(42245364-42245527)
chr5 (170-332)||(29329934-29330096)
chr5 (170-332)||(29345980-29346142)
chr5 (170-332)||(36154783-36154942)
chr5 (170-332)||(29348453-29348615)
chr5 (170-332)||(29350926-29351088)
chr5 (170-332)||(39245136-39245298)
chr5 (170-332)||(11581199-11581361)
chr5 (170-332)||(32027393-32027555)
chr5 (170-329)||(18319033-18319193)
chr5 (170-332)||(20902008-20902172)
chr5 (170-332)||(2154613-2154776)
chr5 (173-331)||(23064512-23064671)
chr5 (170-332)||(31061068-31061231)
chr5 (170-332)||(10775675-10775838)
chr5 (174-332)||(38619434-38619593)
chr5 (170-332)||(20917952-20918110)
chr5 (170-329)||(24067110-24067270)
chr5 (170-335)||(1096467-1096633)
chr5 (229-335)||(21997548-21997655)
chr5 (170-335)||(9077952-9078118)
chr5 (170-335)||(23390451-23390617)
chr5 (170-335)||(25421532-25421698)
chr5 (210-332)||(24529223-24529346)
chr5 (207-335)||(21729056-21729185)
chr5 (207-335)||(21808381-21808510)
chr5 (230-335)||(8286857-8286964)
chr5 (170-335)||(24493569-24493734)
chr5 (189-332)||(22412187-22412330)
chr5 (170-335)||(25431395-25431560)
chr5 (207-335)||(13025311-13025439)
chr5 (207-335)||(13095495-13095623)
chr5 (170-316)||(22144068-22144215)
chr5 (274-335)||(21329556-21329618)
chr5 (207-335)||(22075018-22075148)
chr5 (273-332)||(20806845-20806904)
chr5 (274-335)||(19660894-19660956)
chr5 (289-335)||(21502231-21502277)
chr5 (274-335)||(21293029-21293090)
chr5 (274-331)||(22959591-22959649)
chr5 (274-335)||(36314577-36314639)
chr5 (282-331)||(21565546-21565595)
chr5 (277-331)||(26704075-26704129)
chr5 (277-331)||(26973808-26973862)
chr5 (282-335)||(19668898-19668951)
chr5 (277-333)||(17517264-17517320)
chr5 (170-226)||(40725963-40726019)
chr5 (274-316)||(20027000-20027043)
chr5 (289-335)||(26012110-26012154)
chr5 (274-316)||(26740705-26740747)
chr5 (239-325)||(18418590-18418676)
chr5 (274-319)||(26732892-26732937)
chr5 (189-261)||(20766094-20766166)
chr5 (274-316)||(37723922-37723965)
chr5 (274-331)||(22032323-22032380)
chr5 (271-331)||(23501412-23501472)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (169-332)||(23130862-23131025)
chr2 (169-332)||(23133329-23133492)
chr2 (169-332)||(26505379-26505542)
chr2 (169-332)||(26507857-26508020)
chr2 (169-332)||(34402521-34402684)
chr2 (170-332)||(18808943-18809105)
chr2 (170-332)||(23709532-23709694)
chr2 (170-332)||(23712013-23712175)
chr2 (170-332)||(39682313-39682475)
chr2 (169-332)||(23135590-23135753)
chr2 (170-332)||(571397-571559)
chr2 (170-332)||(6725995-6726157)
chr2 (170-332)||(24367774-24367936)
chr2 (169-332)||(24898194-24898358)
chr2 (169-332)||(24900677-24900841)
chr2 (169-332)||(24903154-24903318)
chr2 (169-332)||(24905631-24905795)
chr2 (169-332)||(24908106-24908270)
chr2 (170-334)||(32214921-32215085)
chr2 (170-330)||(43137301-43137461)
chr2 (170-329)||(21155060-21155219)
chr2 (170-332)||(28577099-28577261)
chr2 (170-332)||(32039498-32039660)
chr2 (170-332)||(22105412-22105575)
chr2 (170-332)||(45029854-45030016)
chr2 (170-332)||(24529528-24529691)
chr2 (170-332)||(38967374-38967537)
chr2 (170-335)||(22337115-22337281)
chr2 (170-335)||(23060513-23060679)
chr2 (170-335)||(23076442-23076608)
chr2 (254-329)||(24643034-24643109)
chr2 (230-335)||(22731249-22731355)
chr2 (239-335)||(38139-38235)
chr2 (170-335)||(22738135-22738300)
chr2 (255-335)||(23285865-23285946)
chr2 (170-247)||(24642856-24642933)
chr2 (207-332)||(298806-298933)
chr2 (274-335)||(23040249-23040310)
chr2 (170-335)||(19671830-19671995)
chr2 (170-335)||(23660023-23660188)
chr2 (230-335)||(23654401-23654507)
chr2 (274-335)||(8946657-8946718)
chr2 (170-335)||(23708574-23708738)
chr2 (274-331)||(7679589-7679647)
chr2 (207-335)||(23103389-23103516)
chr2 (282-335)||(20309108-20309161)
chr2 (170-316)||(7688-7835)
chr2 (274-334)||(22134266-22134326)
chr2 (284-335)||(23072019-23072070)
chr2 (282-320)||(18786971-18787009)
chr2 (214-330)||(28405981-28406099)
chr2 (277-328)||(25616192-25616243)
chr2 (274-331)||(25175854-25175912)
chr2 (274-314)||(23287384-23287424)
chr2 (274-314)||(26392403-26392443)
chr2 (170-209)||(22173829-22173868)
chr2 (170-237)||(22459517-22459584)
chr2 (207-316)||(32451920-32452031)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (170-332)||(20747-20909)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (170-332)||(16784-16946)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (170-332)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (170-332)||(94411-94573)
scaffold0023 (169-328)||(17439-17598)
scaffold0023 (173-332)||(44454-44614)
scaffold0023 (274-335)||(119875-119937)
scaffold0023 (274-331)||(100378-100436)
scaffold0023 (285-331)||(40245-40291)
scaffold0023 (282-331)||(101503-101552)
scaffold0023 (277-331)||(38542-38596)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (170-332)||(158450-158612)
scaffold0003 (214-332)||(339949-340065)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (170-332)||(13988866-13989028)
chr1 (170-332)||(21923291-21923453)
chr1 (170-333)||(21840766-21840929)
chr1 (170-332)||(21475087-21475249)
chr1 (170-332)||(23593735-23593897)
chr1 (170-332)||(31612313-31612475)
chr1 (170-332)||(29298137-29298298)
chr1 (170-332)||(29776688-29776850)
chr1 (170-332)||(21707167-21707329)
chr1 (170-332)||(21711709-21711871)
chr1 (170-334)||(16361915-16362079)
chr1 (170-335)||(13212861-13213027)
chr1 (170-332)||(21346961-21347124)
chr1 (170-332)||(22123067-22123230)
chr1 (170-338)||(21342090-21342259)
chr1 (170-335)||(45574842-45575008)
chr1 (170-332)||(433012-433172)
chr1 (170-338)||(15860008-15860177)
chr1 (170-329)||(40389157-40389317)
chr1 (170-332)||(16275363-16275526)
chr1 (214-334)||(50210212-50210333)
chr1 (210-332)||(34509783-34509906)
chr1 (170-335)||(27250684-27250850)
chr1 (170-335)||(22532269-22532435)
chr1 (274-334)||(20454613-20454673)
chr1 (249-335)||(20847188-20847275)
chr1 (207-335)||(21026680-21026809)
chr1 (207-334)||(22468688-22468816)
chr1 (170-316)||(21861525-21861672)
chr1 (170-316)||(21896211-21896358)
chr1 (277-331)||(21714546-21714600)
chr1 (170-320)||(16758664-16758816)
chr1 (282-321)||(21754059-21754098)
chr1 (274-335)||(14295610-14295672)
chr1 (170-316)||(35261036-35261180)
chr1 (282-320)||(52928038-52928076)
chr1 (277-334)||(20135188-20135245)
chr1 (282-319)||(20918620-20918657)
chr1 (282-331)||(22921937-22921986)
chr1 (274-335)||(33681010-33681069)
chr1 (282-335)||(22237630-22237680)
chr1 (274-335)||(38801447-38801508)
chr1 (282-331)||(20248283-20248332)
chr1 (277-334)||(24783155-24783212)
chr1 (170-243)||(12271647-12271719)
chr1 (274-331)||(42865273-42865330)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (170-333)||(10772-10935)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (169-332)||(13392-13555)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (169-332)||(136680-136843)
scaffold0028 (169-332)||(139149-139312)
scaffold0028 (169-332)||(144087-144250)
scaffold0028 (169-332)||(134211-134374)
scaffold0028 (169-332)||(141618-141781)
scaffold0028 (250-331)||(132662-132745)
scaffold0028 (274-317)||(62216-62260)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (170-332)||(13947-14109)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (170-332)||(82072-82234)
scaffold0037 (282-320)||(22738-22776)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (170-332)||(4694-4856)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (170-333)||(9241-9404)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (169-332)||(40400-40563)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (170-332)||(106-268)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (170-328)||(501088-501246)
scaffold0001 (170-332)||(85579-85742)
scaffold0001 (274-331)||(160688-160746)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (170-334)||(11286-11450)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (170-329)||(4300-4459)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (170-334)||(12249-12413)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (170-337)||(9744-9912)
scaffold0145 (170-335)||(32942-33107)
scaffold0145 (170-335)||(38761-38926)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (170-332)||(4214-4377)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (170-332)||(12064-12220)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (170-332)||(29931-30094)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (170-316)||(20379-20524)
scaffold0031 (170-335)||(128751-128916)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (170-329)||(1280-1440)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (170-316)||(79284-79430)
scaffold0056 (214-334)||(17214-17337)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (170-332)||(2128-2291)
scaffold0247 (170-335)||(17982-18148)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (170-332)||(161089-161252)
scaffold0007 (170-253)||(164590-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (170-332)||(22886-23048)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (189-332)||(44681-44825)
scaffold0122 (214-328)||(26064-26179)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (170-335)||(3106-3271)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (189-332)||(116430-116572)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (170-335)||(16555-16721)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (170-335)||(13211-13377)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (170-335)||(51913-52079)
scaffold0011 (170-335)||(167934-168099)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (170-335)||(4508-4673)
scaffold0228 (170-335)||(12090-12255)
scaffold0228 (170-335)||(22042-22207)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (170-335)||(1851-2017)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (214-334)||(3185-3306)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (170-333)||(39479-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (170-333)||(75170-75333)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (221-335)||(8479-8594)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (170-335)||(1004-1169)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (207-335)||(4849-4978)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (171-335)||(16113-16278)
scaffold0120 (207-335)||(32949-33077)
scaffold0120 (207-335)||(45928-46056)
scaffold0120 (273-335)||(17388-17450)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (170-335)||(6076-6245)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (221-335)||(28414-28529)
scaffold0046 (274-335)||(11292-11354)
scaffold0046 (282-335)||(1997-2050)
scaffold0046 (282-335)||(4552-4605)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (170-335)||(3470-3636)
scaffold0292 (170-335)||(343-508)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (170-335)||(25896-26061)
scaffold0026 (170-335)||(39858-40023)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (170-335)||(8488-8650)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (249-335)||(4712-4799)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (239-335)||(11467-11564)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (170-320)||(27704-27855)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (170-332)||(38657-38820)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (179-320)||(8481-8623)
scaffold0621 (274-335)||(6535-6597)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (282-335)||(1102-1155)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (282-335)||(6611-6664)
scaffold0333 (282-335)||(13991-14044)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (282-335)||(6191-6244)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (274-335)||(32067-32128)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (231-335)||(39913-40017)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (170-317)||(24257-24406)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (274-335)||(121766-121827)
scaffold0021 (190-334)||(174767-174910)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (282-335)||(15845-15898)
scaffold0020 (277-331)||(178898-178952)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (175-247)||(13093-13165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (185-335)||(1952-2103)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (170-269)||(3485-3584)
scaffold0327 (277-331)||(289-343)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (274-332)||(15298-15356)
scaffold0106 (274-335)||(1289-1351)
scaffold0106 (282-335)||(7266-7319)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (274-335)||(13497-13558)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (274-335)||(4893-4954)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (239-335)||(15488-15584)
scaffold0114 (274-331)||(7295-7352)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (256-316)||(11982-12042)
scaffold0503 (170-226)||(12039-12095)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (170-320)||(16055-16206)
scaffold0357 (170-316)||(13147-13295)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (274-332)||(15664-15723)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (282-331)||(1086-1135)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (279-335)||(273-329)
scaffold0175 (282-335)||(34123-34176)
scaffold0175 (170-269)||(13159-13258)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (170-316)||(53504-53651)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (170-335)||(11464-11630)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (170-335)||(38211-38377)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (277-331)||(23843-23897)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (274-331)||(19268-19326)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (282-331)||(2713-2762)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (282-335)||(1137-1190)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (282-331)||(36454-36503)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (282-331)||(45860-45909)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (239-335)||(10449-10544)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (170-261)||(225482-225572)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (282-332)||(5196-5246)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (285-335)||(16282-16332)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (274-335)||(51582-51644)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (274-331)||(14756-14814)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (282-331)||(2874-2923)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (282-335)||(12766-12819)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (282-335)||(46995-47048)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (170-316)||(12587-12733)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (274-321)||(5657-5705)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (283-331)||(28839-28887)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (274-335)||(23942-24001)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (274-321)||(129919-129967)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (274-316)||(1051-1094)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (274-320)||(10600-10647)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (289-335)||(32538-32582)
scaffold0034 (288-316)||(51957-51985)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (289-335)||(1124-1170)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (230-331)||(29558-29660)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (282-331)||(133-182)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (282-331)||(32102-32151)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (170-255)||(27911-27996)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (274-321)||(6826-6874)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (221-335)||(20910-21026)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (289-320)||(8149-8180)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (282-335)||(12942-12992)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (289-320)||(25121-25152)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (277-331)||(159-213)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (277-331)||(21866-21920)
scaffold0210 (277-331)||(29758-29812)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (282-320)||(10542-10580)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (280-314)||(4545-4579)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (277-331)||(69794-69848)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (274-331)||(1881-1938)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (274-331)||(10582-10639)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (282-331)||(19980-20029)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (274-314)||(206584-206624)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 26924639 - 26924802
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26924639 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 26924738  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924739 tattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 18334591 - 18334754
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18334591 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18334690  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334691 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852117 attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055091 tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742379 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005108 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859019 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782289 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422609 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754871 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861856 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864340 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 2291179 - 2291342
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2291179 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 2291278  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291279 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30676810 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34963435 gttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541073
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1541011 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18456881 - 18456735
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18456881 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18456782  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456781 attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656629
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656691 gctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16448626 tgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20556992 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1595611 gttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25688664 - 25688502
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25688664 tgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25688565  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25688564 gttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  180 ttgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgc 279  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgc 18461932  T
Q  280 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461931 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409947
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||||||   || || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 17287771 - 17287917
Alignment:
Q  190 attacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttat 288  Q
    ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17287771 attacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttat 17287870  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287871 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629476
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 173 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060540
Alignment:
Q  173 gatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac- 271  Q
    ||||||||  ||| || ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |     
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  272 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593773
Alignment:
Q  210 ataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 308  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  309 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303661
Alignment:
Q  210 ataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 308  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  309 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361081
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16496373 - 16496244
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496373 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 16496274  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16496273 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20076805 - 20076700
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20076805 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20076707  T
Q  329 atgatgt 335  Q
    |||||||    
T  20076706 atgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| || ||| ||||| ||||| |||  ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  270 ac-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
     | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638404
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T
Q  329 atgatgt 335  Q
    |||||||    
T  20638398 atgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| || | ||  ||||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgttg-atattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 22780202 - 22780348
Alignment:
Q  190 attacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttat 288  Q
    ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||| | | | ||||  |||||||||    
T  22780202 attacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttat 22780301  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22780302 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333339
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394079
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20109295 - 20109140
Alignment:
Q  179 attgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtt 277  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||  | ||| |||||| | ||||| | | ||||    
T  20109295 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgtttt-gcatactgcctatgtt 20109197  T
Q  278 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109196 gctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848114
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || || |||  ||||||  ||||| || ||||| ||| ||  |||||||  ||||  |    
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatc 19848048  T
Q  269 tac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
    | | | || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19848049 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 335
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 28496539 - 28496592
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28496539 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 29808950 - 29809003
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  29808950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 320
Target Start/End: Original strand, 9098573 - 9098620
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098573 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920751
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652199
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35245639 - 35245586
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  35245639 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 8227466 - 8227522
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  8227466 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtt 8227522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23992485 - 23992429
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23992485 tgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19668433 - 19668386
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668433 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831503
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  294 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 338  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019408
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||| |||||| | ||||| ||  |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  312 ctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||| |||  |||||||||||||    
T  23019429 ctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 314  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18907165 - 18907111
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  18907165 tgctattgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19863032 - 19862978
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863032 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19873174 - 19873120
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873174 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 335
Target Start/End: Original strand, 8227587 - 8227632
Alignment:
Q  290 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  8227587 taactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766695
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Original strand, 4185880 - 4185928
Alignment:
Q  274 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185880 tgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409544 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598250 actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22001916 - 22001753
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22001916 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 22001817  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001816 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484464 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853392 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403289 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 328
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413416 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4483443 - 4483281
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4483443 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 4483344  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483343 tgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203331 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046295 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 4542372 - 4542535
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||      
T  4542372 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatct 4542471  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattag---gtcatgctgtttttgtat 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  267 actactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896330 accgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14823835 gttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 169 - 328
Target Start/End: Original strand, 45290693 - 45290853
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtata 267  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45290693 ctgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata 45290792  T
Q  268 ctactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290793 ctgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25484374  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25484375 a-------gctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
     || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26223981 gctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15070718 - 15070571
Alignment:
Q  173 gatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 271  Q
    |||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15070718 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 15070619  T
Q  272 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070618 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092463
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 19801382 - 19801527
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19801382 tgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 19801480  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801481 gttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 19937005 - 19937174
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||| ||||| || |||  || |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19937005 tgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatac 19937104  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 338  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19937105 tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759255
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | |||| || ||||||  ||| ||||||||||   ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 338  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7372924 - 7372778
Alignment:
Q  190 attacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttat 288  Q
    ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  7372924 attacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 7372825  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7372824 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 18818364 - 18818530
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18818364 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18818463  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18818464 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 334
Target Start/End: Original strand, 28649039 - 28649164
Alignment:
Q  210 ataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 308  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28649039 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtc 28649138  T
Q  309 ggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28649139 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26219859 - 26219717
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 288  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  26219859 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttat 26219761  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536208
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 21918992 - 21919121
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918992 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21919091  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21919092 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406379
Alignment:
Q  223 tgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T
Q  322 taagatgatgatgt 335  Q
     |||||||||||||    
T  23406392 gaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Original strand, 26225267 - 26225409
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 288  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  26225267 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Original strand, 21923903 - 21924049
Alignment:
Q  190 attacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttat 288  Q
    ||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||| |||||| || ||||||| | |||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  21923903 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttat 21924002  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21924003 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875065
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22875132  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626736
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||||   ||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||  ||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22626803  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 335
Target Start/End: Original strand, 18879272 - 18879352
Alignment:
Q  256 tgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18879272 tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31971353 - 31971257
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31971353 atattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6520430 - 6520368
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520430 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 38855310 - 38855372
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855310 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Original strand, 45131022 - 45131117
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  45131022 atattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Original strand, 13508040 - 13508188
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||  ||||| || || || ||| |    
T  13508040 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatatt 13508138  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 317  Q
      || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508139 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Original strand, 13597572 - 13597720
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||| ||  |||||||||  ||||| || ||||| || ||    
T  13597572 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcattct 13597670  T
Q  270 ac-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 317  Q
     | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597671 gcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17140978 - 17140916
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17140978 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21491057 - 21490995
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21491057 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 17612065 - 17612231
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||  ||| | |   |||||||||  ||||| || ||||| |||||    
T  17612065 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatact 17612163  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  17612164 gcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 5866333 - 5866395
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5866333 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 16199703 - 16199765
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16199703 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  285 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  285 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21285650 - 21285601
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21285650 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 21389518 - 21389571
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21389518 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 21396048 - 21396101
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21396048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 21778844 - 21778897
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21778844 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 21790541 - 21790594
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21790541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 219
Target Start/End: Original strand, 24486044 - 24486093
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgaga 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24486044 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Original strand, 18678165 - 18678221
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18678165 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20498728 - 20498581
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||  |||||||  ||||  |||||    
T  20498728 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-attttacatact 20498630  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498629 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23648614 - 23648554
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23648614 tgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23760962
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 320
Target Start/End: Original strand, 983465 - 983512
Alignment:
Q  274 tgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983465 tgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355815
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32121790 - 32121734
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32121790 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21673757 - 21673718
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673757 ttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32810093 - 32810054
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtga 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32810093 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386395 attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 172 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  172 tgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt 16410120  T
Q  272 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410119 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 14949121 - 14949284
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14949121 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 14949220  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949221 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456383 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972558 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376813 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232582 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640334 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385223 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189695 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125553 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522979 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525441 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393387 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702300 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27216922 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 169 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18430875 - 18430709
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  18430875 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatac 18430776  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430775 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116571 gctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16213846 - 16213684
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16213846 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16213747  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213746 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 183 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275175
Alignment:
Q  183 tatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgt 282  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  283 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704750 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 173 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13869506 - 13869346
Alignment:
Q  173 gatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 271  Q
    |||||||||||||||| || | ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13869506 gatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 13869407  T
Q  272 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869406 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 17061915 - 17062077
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  17061915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgct-attttgtatact 17062013  T
Q  270 actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062014 gctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110556
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110610 --------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 206 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831373
Alignment:
Q  206 gtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 169 - 328
Target Start/End: Original strand, 38898375 - 38898535
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtata 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38898375 ctgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatata 38898474  T
Q  268 ctactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898475 ctgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756771 gttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273392
Alignment:
Q  213 attgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 311  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  312 ctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356156
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac- 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||     
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  269 ----------tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
              |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26356083 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358608
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac- 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||     
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  269 ----------tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
              |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26358535 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 332
Target Start/End: Original strand, 3564359 - 3564482
Alignment:
Q  210 ataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 308  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564359 ataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 3564458  T
Q  309 ggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  3564459 ggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698831
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgt-ttttgtatac 268  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  269 tac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456530
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 18456466  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38227609 - 38227481
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38227609 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 38227511  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38227510 gtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9509295 - 9509189
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9509295 ttgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 9509196  T
Q  329 atgatgt 335  Q
    |||||||    
T  9509195 atgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 2280074 - 2280238
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||||    
T  2280074 tgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgtttt-gcatact 2280172  T
Q  270 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280173 gcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 320
Target Start/End: Original strand, 15144013 - 15144143
Alignment:
Q  190 attacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatt 289  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |  || ||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||    
T  15144013 attacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatt 15144112  T
Q  290 taactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144113 taactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10589039
Alignment:
Q  221 gttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 319  Q
    |||||||  ||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T
Q  320 attaagatgatgatgt 335  Q
       |||||||||||||    
T  10589054 tcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 67807 - 67745
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67807 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26212125 - 26211995
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26212125 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatga 26212026  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaag-atgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  26212025 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831807
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072913
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 311  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||  |||||||| ||||| ||| | | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  312 ctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 28505357 - 28505419
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28505357 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34200848 - 34200786
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34200848 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 16386316 - 16386369
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16386316 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18005708 - 18005650
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18005708 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811248
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16495455 - 16495402
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16495455 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014182
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Original strand, 15081949 - 15082017
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattt 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  15081949 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcattt 15082017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 329
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154956
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 313
Target Start/End: Original strand, 12255746 - 12255892
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatg-ctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||  |||||  |   |||| ||||    
T  12255746 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgatttgcatac 12255845  T
Q  269 t-actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 313  Q
    | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255846 tgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Original strand, 14932749 - 14932851
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  |||| | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932749 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T
Q  329 atg 331  Q
    |||    
T  14932849 atg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Original strand, 15356184 - 15356286
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  |||| | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356184 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T
Q  329 atg 331  Q
    |||    
T  15356284 atg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Original strand, 15360298 - 15360400
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  |||| | || | || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360298 ttgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T
Q  329 atg 331  Q
    |||    
T  15360398 atg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996148
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15113108 - 15113036
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatatt 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  15113108 tgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatatt 15113036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40443487 - 40443393
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
    ||||||||| ||||||||||||  || |||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||    
T  40443487 atattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 16219785 - 16219835
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  16219785 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 335
Target Start/End: Original strand, 27847901 - 27847951
Alignment:
Q  285 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  27847901 ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 334
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832561
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15116645 - 15116573
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatatt 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| || |||||| || |||||    
T  15116645 tgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatatt 15116573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 19486699 - 19486755
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  19486699 tgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtt 19486755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 320
Target Start/End: Original strand, 1868070 - 1868101
Alignment:
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868070 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16056390 - 16056343
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056390 tgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 19649552 - 19649606
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649552 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12187076 - 12187019
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12187076 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 17138120 - 17138177
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  17138120 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215374 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12407 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118452 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312572 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44615451 - 44615288
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44615451 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatac 44615352  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615351 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 50222338 - 50222501
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  50222338 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataa 50222437  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222438 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803365 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44102376 - 44102214
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44102376 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44102277  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102276 actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773187 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463968 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 338  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19242761 gttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 18239418 - 18239581
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18239418 ctgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18239517  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239518 tgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 1837509 - 1837671
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1837509 tgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatact 1837608  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837609 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515069 gctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19618272 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14970807 gctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 170 - 328
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355424 tgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 44928879 - 44929042
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44928879 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 44928978  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928979 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611010 --tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 316
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  172 tgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagt 21815686  T
Q  272 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815687 tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||            
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-------- 7641283  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641284 --tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15367856 - 15367690
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15367856 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15367757  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15367756 tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15402869 - 15402703
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15402869 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15402770  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15402769 tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15371368 - 15371202
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15371368 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15371269  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15371268 tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15373649 - 15373483
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15373649 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15373550  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15373549 tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16223698 - 16223532
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16223698 tgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16223599  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  16223598 tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    |  ||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20149892 tgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280316
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 313  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  314 aagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14280334 aagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15370183 - 15370018
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15370183 tgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15370085  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15370084 tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Original strand, 54798728 - 54798872
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactact-gtgttgctgttgtta 287  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  54798728 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgtta 54798827  T
Q  288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798828 ttcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088877
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||| ||| |||| ||||||  | ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 190 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7798920 - 7798774
Alignment:
Q  190 attacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttat 288  Q
    ||||||| || ||||  |||||| || ||| |||| || |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  7798920 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 7798821  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7798820 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038653
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || |||   || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 330  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 335
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873488
Alignment:
Q  223 tgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    ||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  322 taagatgatgatgt 335  Q
     |||||||||||||    
T  52873475 gaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377639
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatact 16377575  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893703
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902757
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||| ||| |||| |||||| || ||| |||| ||  || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636437
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  270 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
      || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Original strand, 8574843 - 8574985
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 288  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||||  || ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  8574843 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttat 8574941  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8574942 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270356
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 16270289  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240090
Alignment:
Q  172 tgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 271  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc 16240025  T
Q  272 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  250 tcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052829
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||  | ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||| ||| |||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
      || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899891
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| |  ||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||| || |||||||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttgtatact 6899958  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706409
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 13806 - 13953
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||  ||||| || ||||| |||||    
T  13806 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 13904  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13905 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 328
Target Start/End: Original strand, 23374351 - 23374473
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374351 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 23374450  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    |||| ||||||||| | ||||||    
T  23374451 gtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 52243149 - 52243302
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatg--ctgtttttgtata 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||  |||||| |||||||  || ||||| ||||| |||  |||||  ||| ||| | |||    
T  52243149 tgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcata 52243247  T
Q  268 ctac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243248 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551817
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 43198508 - 43198661
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgt-ttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| || ||||||||| ||||  |||  |||||   | ||||| |||     
T  43198508 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatat 43198607  T
Q  269 ta-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198608 tgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12774069 - 12774011
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12774069 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046487
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 320
Target Start/End: Original strand, 12288269 - 12288316
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288269 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846360
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 14053369 - 14053422
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||    
T  14053369 ttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 261
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  172 tgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttt 261  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||  |||||||| ||||| |||  ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 334
Target Start/End: Original strand, 20157522 - 20157579
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20157522 tgctattgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6190509 - 6190481
Alignment:
Q  288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190509 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17333338 - 17333298
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 314  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333338 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172683 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34159489 - 34159326
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34159489 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 34159390  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159389 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 55476654 - 55476491
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55476654 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 55476555  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476554 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707707 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463240 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607007 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 16454280 - 16454443
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16454280 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16454379  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454380 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 28848610 - 28848773
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28848610 ctgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 28848709  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848710 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469234 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781447 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899156 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38961991 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 13151789 - 13151953
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13151789 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 13151888  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151889 tgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 13154254 - 13154418
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13154254 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 13154353  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154354 tgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 330  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282911 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247823 gttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50242884 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13544087 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567622 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17446755 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672688 gctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 330  Q
      |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123949 gttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15412589 - 15412429
Alignment:
Q  173 gatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 271  Q
    |||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15412589 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac 15412490  T
Q  272 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412489 tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8499681 - 8499518
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8499681 tgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 8499582  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499581 tactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 12119724 - 12119887
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12119724 tgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 12119823  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119824 tgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 201 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977515
Alignment:
Q  201 tatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  301 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070753 gttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550644
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 221 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500942
Alignment:
Q  221 gttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  321 ttaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||    
T  55500953 ttaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972854
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||   || |||  ||||| |||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36166740 - 36166598
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 288  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  36166740 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 214 - 335
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476506
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 312  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtc 25476483  T
Q  313 taagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  25476484 taagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213838
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||  |||||   || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487856
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  270 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499338
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  270 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556985
Alignment:
Q  229 cttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  329 atga 332  Q
    ||||    
T  10556988 atga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438534
Alignment:
Q  221 gttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 319  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  320 attaagatgatgatgt 335  Q
    || |||||||||||||    
T  18438549 atgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21618591 - 21618449
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 288  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  21618591 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttat 21618493  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21618492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattgagaagatga 21618449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  233 cattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Original strand, 20698450 - 20698556
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698450 ttgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20698549  T
Q  329 atgatgt 335  Q
    |||||||    
T  20698550 atgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 332
Target Start/End: Original strand, 24153201 - 24153326
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24153201 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatga 24153299  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24153300 gtcggtctaagttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12399338 - 12399209
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399338 tgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 12399239  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12399238 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 23083353 - 23083482
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23083353 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 23083452  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083453 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42386576 - 42386428
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||   |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42386576 tgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatact 42386477  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 317  Q
      || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386476 gcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442274
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26687053 - 26686887
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||   ||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26687053 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26686954  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26686953 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43841098 - 43840932
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43841098 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 43840999  T
Q  270 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  43840998 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  234 attttatattattaggtcatgctgtttttgta---tactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 330  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17737238  T
Q  331 ga 332  Q
    ||    
T  17737237 ga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27165413 - 27165250
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||  ||| || ||||||||| |||||  ||  ||||| |||||| | |||||    
T  27165413 tgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatact 27165315  T
Q  270 a-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165314 gtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 321
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  270 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
      || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Original strand, 11424784 - 11424880
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11424784 atattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 53301505 - 53301669
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgt-tgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||  |||  || ||||||||| ||||| |||  ||||| |||||| | ||||    
T  53301505 tgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatac 53301603  T
Q  269 ta-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  || |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301604 tgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 239 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14572685 - 14572603
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572685 atattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 24340678 - 24340844
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||  ||||| || || || |||||    
T  24340678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatact 24340776  T
Q  270 ac-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  24340777 gcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 279 - 332
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  279 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194693
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 52523682 - 52523831
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatg--ctgtttttgtata 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||  |||||||  ||||| |||  |||||  ||| ||||| |||    
T  52523682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactg-ttttgcata 52523780  T
Q  268 ct-actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    ||  || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523781 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14234549 - 14234487
Alignment:
Q  274 tgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14234549 tgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 13210395 - 13210448
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13210395 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 12174318 - 12174376
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12174318 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16097381 - 16097332
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16097381 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23274853 - 23274705
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||  ||||| || ||||| |||||    
T  23274853 tgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatact 23274755  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 317  Q
      || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274754 gcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15470986 - 15470927
Alignment:
Q  274 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  15470986 tgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32307739 - 32307691
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307739 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46822323 - 46822267
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46822323 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16103842 - 16103784
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16103842 tgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 49668135 - 49668193
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  49668135 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 243
Target Start/End: Original strand, 2051154 - 2051227
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatatt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  2051154 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 2051227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12511115 - 12511059
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  12511115 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665398
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 22147480 - 22147536
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  22147480 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtt 22147536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Original strand, 37642220 - 37642276
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  37642220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtt 37642276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9512982 - 9512924
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9512982 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9520957 - 9520899
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9520957 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 216
Target Start/End: Original strand, 17248241 - 17248287
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattg 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  17248241 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 856197 - 856140
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  856197 tgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668554
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077594
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 314  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 15878114 - 15878168
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878114 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30029898 - 30029841
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  30029898 tgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatg 30029841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 331
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  283 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39363547 - 39363384
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39363547 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 39363448  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363447 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264868 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 332
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  171 gtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatacta 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  271 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733041 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20909175 - 20909012
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20909175 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20909076  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909075 tgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 42245364 - 42245527
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42245364 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 42245463  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245464 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329996 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346042 gttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154883 gctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348515 gttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350988 gttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245136
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245198 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 11581199 - 11581361
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11581199 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 11581298  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581299 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027455 gttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18319133 tgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902172
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20902107  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatga 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20902108 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 2154712  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154713 tgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23064671 - 23064512
Alignment:
Q  173 gatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 271  Q
    |||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064671 gatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac 23064572  T
Q  272 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064571 tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31061231 - 31061068
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31061231 tgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 31061132  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061131 tactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775775 tgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 174 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38619593 - 38619434
Alignment:
Q  174 atataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactact 272  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619593 atataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactact 38619494  T
Q  273 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619493 gtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 20917952 - 20918110
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20917952 tgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatact 20918047  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918048 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24067170 tgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096467
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||   || |||  ||||| |||||||  |||||||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 335
Target Start/End: Original strand, 21997548 - 21997655
Alignment:
Q  229 cttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 327  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21997548 cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 21997647  T
Q  328 gatgatgt 335  Q
    ||||||||    
T  21997648 gatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077952
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| | ||||   || |||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390617
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  270 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421532
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529223
Alignment:
Q  210 ataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 308  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  309 ggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 21729056 - 21729185
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729056 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21729155  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21729156 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 21808381 - 21808510
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808381 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21808480  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21808481 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Original strand, 8286857 - 8286964
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgttttt-gtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 327  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8286857 ttgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 8286956  T
Q  328 gatgatgt 335  Q
    ||||||||    
T  8286957 gatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493569
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || || |||| || ||||  |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 24493636  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22412330 - 22412187
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgtta 287  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||| | | ||||    
T  22412330 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgtta 22412232  T
Q  288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412231 tttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431395
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||| | || ||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13025439 - 13025311
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13025439 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatga 13025341  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025340 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13095623 - 13095495
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13095623 tgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatga 13095525  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095524 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||  ||||| || ||||| |||  ||||| || ||||| |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 22144117  T
Q  270 a-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    | || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329618
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22075148 - 22075018
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||||||| |||||| || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22075148 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatga 22075049  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaag-atgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22075048 gtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 332
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806904
Alignment:
Q  273 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660956
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 335
Target Start/End: Original strand, 21502231 - 21502277
Alignment:
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502231 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 21293029 - 21293090
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  21293029 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 22959591 - 22959649
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22959591 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314577
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21565595 - 21565546
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21565595 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704075
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973808
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668898
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Original strand, 17517264 - 17517320
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17517264 tgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40726019 - 40725963
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  40726019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtt 40725963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 316
Target Start/End: Original strand, 20027000 - 20027043
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20027000 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 335
Target Start/End: Original strand, 26012110 - 26012154
Alignment:
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26012110 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 316
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18418676 - 18418590
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418676 atattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 319
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 319  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 261
Target Start/End: Original strand, 20766094 - 20766166
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttt 261  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20766094 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 20766166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37723965 - 37723922
Alignment:
Q  274 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723965 tgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22032380 - 22032323
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  22032380 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Original strand, 23501412 - 23501472
Alignment:
Q  271 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23501412 ctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23131025 - 23130862
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23131025 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 23130926  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130925 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23133492 - 23133329
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23133492 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 23133393  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133392 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26505542 - 26505379
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26505542 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatac 26505443  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505442 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26508020 - 26507857
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26508020 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatac 26507921  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507920 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 34402521 - 34402684
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34402521 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 34402620  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402621 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809005 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709632 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712113 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682375 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23135753 - 23135590
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23135753 ctgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 23135654  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135653 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571459 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726057 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24367836 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 24898194 - 24898358
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24898194 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24898293  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898294 tgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 24900677 - 24900841
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24900677 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24900776  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900777 tgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 24903154 - 24903318
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24903154 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24903253  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903254 tgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 24905631 - 24905795
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24905631 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24905730  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905731 tgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 24908106 - 24908270
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24908106 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24908205  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908206 tgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32215021 gctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137361 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155160 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577161 gttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32039598 gttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029954 gttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529628 tgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967437 tgttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337115
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060513
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  | |||| || ||| ||||||| |||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076442
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || |||  |||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  254 gctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Original strand, 22731249 - 22731355
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22731249 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatg 22731348  T
Q  329 atgatgt 335  Q
    |||||||    
T  22731349 atgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Original strand, 38139 - 38235
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38139 atattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738300
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     |    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 255 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23285946 - 23285865
Alignment:
Q  255 ctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23285946 ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 247
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattatta 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 332
Target Start/End: Original strand, 298806 - 298933
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatg 304  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  298806 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 298905  T
Q  305 agtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  298906 agtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040310
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19671995 - 19671830
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||  ||||| || ||||| |||||    
T  19671995 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatact 19671898  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  19671897 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660023
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| | ||||   |||||| || ||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 335
Target Start/End: Original strand, 23654401 - 23654507
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||| || | | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23654401 ttgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 23654500  T
Q  329 atgatgt 335  Q
    |||||||    
T  23654501 atgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8946718 - 8946657
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8946718 tgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 23708574 - 23708738
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||| || | ||  ||||| || ||||| |||  ||||| |||||| | |||||    
T  23708574 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 23708672  T
Q  270 ac-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23708673 gcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679589
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103516
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    ||||| ||||||| |||| ||  ||| |||| |||| || | ||||||||||||  ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatga 23103486  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||    
T  23103487 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20309161 - 20309108
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  20309161 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||  ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 334
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134326
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 335
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072070
Alignment:
Q  284 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 320
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405981
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 311  Q
    |||||| |||||||  |||||||  ||||| |||  ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  312 ctaagttgattaagatgat 330  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25616243 - 25616192
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25616243 tgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25175912 - 25175854
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  25175912 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 314  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 314  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 209
Target Start/End: Original strand, 22173829 - 22173868
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtga 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22173829 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Original strand, 22459517 - 22459584
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattt 237  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||||    
T  22459517 tgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcattt 22459584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 316
Target Start/End: Original strand, 32451920 - 32452031
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacg-ttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcat 303  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||| || || | | |||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  32451920 tgaataattgagatgattgttggcttgcattg-atattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcat 32452018  T
Q  304 gagtcggtctaag 316  Q
    |||||||||||||    
T  32452019 gagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20809 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16846 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37883 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94473 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 328
Target Start/End: Original strand, 17439 - 17598
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17439 ctgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 17538  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17539 tgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  173 gatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgttttt-gtatactac 271  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  272 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119875
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 100436 - 100378
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  100436 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 331
Target Start/End: Original strand, 40245 - 40291
Alignment:
Q  285 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  40245 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101503
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38596
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158550 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340065
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 312  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 340045  T
Q  313 taagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  340046 taagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988928 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923391 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21840829 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21475187 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593835 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612375 attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298199 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776750 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707167
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707229 attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711709
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711771 attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16361979 gttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213027
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212961 tgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21347124 - 21346961
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21347124 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21347025  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347024 tgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  270 actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22123167 gttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21342259 - 21342090
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21342259 tgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21342160  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 338  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342159 tgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 433172 - 433012
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  433172 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatact 433073  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433072 gcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 338
Target Start/End: Original strand, 15860008 - 15860177
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||| || |||  || |||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15860008 tgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatac 15860107  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 338  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15860108 tgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    |  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40389217 tgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275463 tgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210333
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 312  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 50210311  T
Q  313 taagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  50210312 taagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509783
Alignment:
Q  210 ataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 308  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  309 ggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250850
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||| ||| |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532269
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||||||   |||||| || ||| |||||||  ||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 334
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454673
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 335
Target Start/End: Original strand, 20847188 - 20847275
Alignment:
Q  249 gtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||| |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20847188 gtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21026809 - 21026680
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026809 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatga 21026710  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  21026709 gtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 334
Target Start/End: Original strand, 22468688 - 22468816
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||| || ||||||| | ||||||||||| |||||  || | | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22468688 tgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatga 22468787  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22468788 gtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 21861525 - 21861672
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||| |||||    
T  21861525 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatact 21861623  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861624 gcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 21896211 - 21896358
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||  |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  21896211 tgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgtatact 21896309  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896310 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714546
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16758816 - 16758664
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatg--ctgtttttgtata 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||| || |||||||  ||| |||| ||||| |||  |||||  ||| ||| | |||    
T  16758816 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcata 16758719  T
Q  268 ctac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    || | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758718 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21754098 - 21754059
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754098 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 14295610 - 14295672
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  14295610 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 35261036 - 35261180
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||  |||||| |||| |   |||||||| ||||| |||  |||||||||||| | |||||    
T  35261036 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatact 35261131  T
Q  270 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
     | | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261132 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 320
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20135245 - 20135188
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20135245 tgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20918657 - 20918620
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918657 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Original strand, 22921937 - 22921986
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  22921937 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33681069 - 33681010
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33681069 tgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22237680 - 22237630
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22237680 ttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 38801447 - 38801508
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  38801447 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248283
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 334
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783212
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12271719 - 12271647
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatatt 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||| ||||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  12271719 tgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatatt 12271647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 42865273 - 42865330
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  42865273 tgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10835 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13555 - 13392
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13555 ctgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 13456  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 136843 - 136680
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  136843 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatac 136744  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136743 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 139312 - 139149
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  139312 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatac 139213  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139212 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 144250 - 144087
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  144250 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatac 144151  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144150 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 134374 - 134211
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  134374 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatac 134275  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134274 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 141781 - 141618
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  141781 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatac 141682  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141681 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 132745 - 132662
Alignment:
Q  250 tcatgctgtttttgtatactactg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  132745 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 62260 - 62216
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 317  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62260 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14009 gttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82134 actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 320
Target Start/End: Original strand, 22738 - 22776
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4756 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9304 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40563 - 40400
Alignment:
Q  169 ctgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40563 ctgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatac 40464  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40463 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  168 attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501146 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 85579 - 85742
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85579 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 85678  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  85679 tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 160746 - 160688
Alignment:
Q  274 tgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  160746 tgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11350 gctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4359 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 334
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12349 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9744
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 9813  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcc 337  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9812 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32942
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33009  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38761
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 38828  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4277 tgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
     |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12120 gctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29931
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt-gattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29994 gttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaagatgatga 29931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 20477  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20478 gatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128751
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| |  ||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 329
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    |  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1380 tcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 79284 - 79430
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  79284 tgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatact 79383  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79384 gtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17337
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgttttt--gtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 310  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 17313  T
Q  311 tctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  17314 tctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 2128 - 2291
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2128 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 2227  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2228 tgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 17982 - 18148
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||  ||||| || || || ||| |    
T  17982 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataat 18080  T
Q  270 ac-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  18081 gcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161252
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  269 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  161189 tgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 253
Target Start/End: Original strand, 164590 - 164674
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgccttgcattttatattattaggtcat 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  164590 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22886
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  270 actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Original strand, 44681 - 44825
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgtta 287  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44681 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgtta 44780  T
Q  288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44781 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 328
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 312  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26163  T
Q  313 taagttgattaagatg 328  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26164 taagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3271
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 3204  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 116572 - 116430
Alignment:
Q  189 tattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttat 288  Q
    |||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  116572 tattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16721
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||   || ||| |||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  270 act-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13211
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52079 - 51913
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  52079 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 51980  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51979 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 167934 - 168099
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||| ||| |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  167934 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 168032  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  168033 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4508
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12090
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22042
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1851
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  270 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3306
Alignment:
Q  214 ttgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 312  Q
    |||||| |||||||  || ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 3284  T
Q  313 taagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  3285 taagttgatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39479
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 39544  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75333
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 75268  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 333  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8479
Alignment:
Q  221 gttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 319  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8594 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 8495  T
Q  320 attaagatgatgatgt 335  Q
    || |||||||||||||    
T  8494 atgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 1004 - 1169
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||| ||| |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1004 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 1102  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1103 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4978 - 4849
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4978 tgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatga 4879  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4878 gtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16113
Alignment:
Q  171 gtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatacta 270  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| | ||||   || ||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||     
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  271 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 32949 - 33077
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32949 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatga 33047  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33048 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 46056 - 45928
Alignment:
Q  207 tgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 305  Q
    |||||| || ||| |||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46056 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatga 45958  T
Q  306 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45957 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17450
Alignment:
Q  273 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6245
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  270 ac---tg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 221 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28414
Alignment:
Q  221 gttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 319  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  320 attaagatgatgatgt 335  Q
    || |||||||||||||    
T  28429 atgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11354 - 11292
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11354 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1997
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3470
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 343
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||   ||||| || ||| ||||||| ||| || || ||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatact 410  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25896
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  || ||| ||||||| || ||||  |||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatact 25963  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39858
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  || ||| ||||||| || ||||  |||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatact 39925  T
Q  270 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
     | | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8650
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8488 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atact 8586  T
Q  270 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8587 gcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4799 - 4712
Alignment:
Q  249 gtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4799 gtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Original strand, 11467 - 11564
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||    
T  11467 atattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 27704 - 27855
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||  || ||||| ||||| |||  |||||||| ||||| |||||    
T  27704 tgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatact 27802  T
Q  270 a-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    | || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27803 acctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 332
Target Start/End: Original strand, 38657 - 38820
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| | |||| ||||||  ||| || ||||||||| ||||| |||  ||||| |||||| | |||||    
T  38657 tgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 38755  T
Q  270 a-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
      || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38756 gtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8623 - 8481
Alignment:
Q  179 attgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtt 277  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||  |||||||||||| | ||||| | | ||||    
T  8623 attgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgtt 8525  T
Q  278 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8524 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6597 - 6535
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6597 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1155
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6611
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13991
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6244
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32128 - 32067
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  32128 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40017 - 39913
Alignment:
Q  231 tgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 329  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40017 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 39919  T
Q  330 tgatgt 335  Q
    ||||||    
T  39918 tgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgt-ttttgtatac 268  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  269 tac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 317  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121766
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 174910 - 174767
Alignment:
Q  190 attacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gtta 287  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||  ||| |||| |||| || | |||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||    
T  174910 attacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgtta 174814  T
Q  288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  174813 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15898
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178898
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 175 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13093
Alignment:
Q  175 tataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattatta 247  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 13093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1952
Alignment:
Q  185 tatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt 283  Q
    |||| ||||||| ||| || | |||||| || ||| |||||||  ||||| || |||| |||| |||||| || ||||||||||| | | ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  284 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3584
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 289
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  343 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15356
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1351 - 1289
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1351 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7266
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13558 - 13497
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13558 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4954
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Original strand, 15488 - 15584
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  15488 atattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7295
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  7352 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  256 tgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12095 - 12039
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgtt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12095 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 320
Target Start/End: Original strand, 16055 - 16206
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||  || ||||| ||||| |||  ||||| || ||||| |||||    
T  16055 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 16153  T
Q  270 a-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    | || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154 acctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13295 - 13147
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatac 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||   || ||| |||||||  |||||||| ||||| |||  |||||||| ||||| ||||    
T  13295 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatac 13197  T
Q  269 t-actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |  || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13196 tgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15723 - 15664
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1086
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  279 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34123
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13258 - 13159
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||| || ||||  |||||| || ||| | ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13258 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 53504 - 53651
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||  ||||| || ||||| |||||    
T  53504 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 53602  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
      || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53603 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11630 - 11464
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||  ||| | |   |||||||||  ||||| || ||||| |||||    
T  11630 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatact 11532  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  11531 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 335
Target Start/End: Original strand, 38211 - 38377
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||  ||| | |   |||||||||  ||||| || ||||| |||||    
T  38211 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatact 38309  T
Q  270 -actgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
      || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  38310 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23843
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19326 - 19268
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19326 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2762
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Original strand, 1137 - 1190
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1137 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Original strand, 45860 - 45909
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 335
Target Start/End: Original strand, 10449 - 10544
Alignment:
Q  239 atattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||| |||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10449 atattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 225572 - 225482
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttt 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  225572 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 332
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5246
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16332 - 16282
Alignment:
Q  285 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16332 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51644 - 51582
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  51644 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 14756 - 14814
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14756 tgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Original strand, 2874 - 2923
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  2874 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12766
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47048 - 46995
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47048 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12733 - 12587
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatact 269  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |||||| | | || |||||| |||| || ||||||||| ||||| |||  |||||||||||| | |||||    
T  12733 tgtgatataattgtatatacattactgaa-ttatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatact 12636  T
Q  270 ac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
     | | |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12635 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5705 - 5657
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5705 tgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 331
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28887
Alignment:
Q  283 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 335
Target Start/End: Original strand, 23942 - 24001
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23942 tgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 129967 - 129919
Alignment:
Q  274 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129967 tgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 1051
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1094 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 320
Target Start/End: Original strand, 10600 - 10647
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10600 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32582 - 32538
Alignment:
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32582 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 316
Target Start/End: Original strand, 51957 - 51985
Alignment:
Q  288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51957 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 335
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1170
Alignment:
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1124 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29558
Alignment:
Q  230 ttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 328  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  |||| | || | || ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T
Q  329 atg 331  Q
    |||    
T  29560 atg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 182 - 133
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  182 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 32151 - 32102
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  32151 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  170 tgtgatataattgtatatgtattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgccttgcattttatattattaggtcatgc 255  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6874 - 6826
Alignment:
Q  274 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 321  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6874 tgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21026 - 20910
Alignment:
Q  221 gttgttgccttgcattttatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 318  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||| |||||| |||||||| ||| | | | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  21026 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtc 20927  T
Q  319 gattaagatgatgatgt 335  Q
    | | |||||| ||||||    
T  20926 gttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 320
Target Start/End: Original strand, 8149 - 8180
Alignment:
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8149 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12992 - 12942
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 335  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  12992 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25152 - 25121
Alignment:
Q  289 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25152 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 159
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  213 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 21866 - 21920
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  21866 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Original strand, 29758 - 29812
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29758 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10580 - 10542
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 320  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10580 ttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4579 - 4545
Alignment:
Q  280 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4579 tgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 69848 - 69794
Alignment:
Q  277 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69848 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1938 - 1881
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  1938 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 331
Target Start/End: Original strand, 10582 - 10639
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10582 tgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 331  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Original strand, 206584 - 206624
Alignment:
Q  274 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 314  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206584 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University