View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0294_low_3 (Length: 382)

Name: NF0294_low_3
Description: NF0294
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0294_low_3
NF0294_low_3
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (21-377)||(23573606-23573962)
chr5 (21-372)||(23440089-23440440)
chr5 (21-370)||(18775641-18775990)
chr5 (56-369)||(20798659-20798972)
chr5 (21-377)||(21984471-21984827)
chr5 (21-377)||(23516405-23516761)
chr5 (21-377)||(22134532-22134888)
chr5 (21-369)||(25423053-25423401)
chr5 (21-377)||(14999905-15000261)
chr5 (21-377)||(22333053-22333409)
chr5 (21-377)||(27685566-27685922)
chr5 (21-377)||(37291662-37292018)
chr5 (21-377)||(40708644-40709000)
chr5 (21-377)||(27668656-27669012)
chr5 (21-377)||(34566358-34566714)
chr5 (21-377)||(16356366-16356722)
chr5 (21-377)||(19769824-19770180)
chr5 (21-377)||(27518271-27518627)
chr5 (21-377)||(27610218-27610574)
chr5 (21-377)||(41770706-41771062)
chr5 (25-377)||(26738871-26739223)
chr5 (21-377)||(29476239-29476595)
chr5 (46-377)||(22348314-22348643)
chr5 (21-367)||(23471093-23471439)
chr5 (21-364)||(20468275-20468618)
chr5 (21-262)||(20573385-20573626)
chr5 (21-235)||(21343666-21343880)
chr5 (100-370)||(21498209-21498479)
chr5 (58-329)||(21564180-21564451)
chr5 (39-364)||(24735790-24736115)
chr5 (39-364)||(24749733-24750058)
chr5 (39-364)||(21890938-21891263)
chr5 (48-364)||(23442472-23442788)
chr5 (39-317)||(24737011-24737289)
chr5 (39-355)||(22461816-22462132)
chr5 (39-329)||(28923982-28924272)
chr5 (39-357)||(20773624-20773942)
chr5 (21-372)||(21404700-21405035)
chr5 (39-329)||(28895156-28895446)
chr5 (18-364)||(22236099-22236445)
chr5 (36-357)||(37545682-37546004)
chr5 (36-357)||(14887177-14887498)
chr5 (233-377)||(21339452-21339596)
chr5 (21-357)||(23080275-23080611)
chr5 (36-283)||(21662300-21662546)
chr5 (36-322)||(24798618-24798904)
chr5 (21-357)||(20821299-20821635)
chr5 (36-357)||(20342143-20342464)
chr5 (57-283)||(21665761-21665986)
chr5 (21-322)||(22381045-22381346)
chr5 (36-322)||(25847936-25848222)
chr5 (21-322)||(22502525-22502826)
chr5 (57-364)||(17269512-17269819)
chr5 (180-357)||(11210880-11211057)
chr5 (180-343)||(24581216-24581379)
chr5 (180-343)||(27011089-27011252)
chr5 (257-357)||(23503525-23503625)
chr5 (180-343)||(21937388-21937551)
chr5 (36-109)||(21625397-21625470)
chr5 (231-349)||(25244546-25244664)
chr5 (231-349)||(25308698-25308816)
chr5 (288-322)||(21831964-21831998)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (21-377)||(12497799-12498155)
chr3 (21-370)||(14876729-14877078)
chr3 (21-377)||(17489401-17489757)
chr3 (21-377)||(16370964-16371320)
chr3 (21-370)||(16691711-16692060)
chr3 (21-377)||(16492404-16492760)
chr3 (21-377)||(16807149-16807505)
chr3 (21-377)||(9522270-9522626)
chr3 (21-377)||(10905761-10906117)
chr3 (21-369)||(15348476-15348824)
chr3 (21-377)||(10005151-10005507)
chr3 (21-371)||(48424998-48425348)
chr3 (39-377)||(53385241-53385579)
chr3 (28-377)||(26792622-26792971)
chr3 (21-377)||(13252241-13252597)
chr3 (21-377)||(15589615-15589971)
chr3 (21-377)||(16635324-16635680)
chr3 (21-377)||(43162648-43163004)
chr3 (21-377)||(15725157-15725512)
chr3 (21-377)||(20062277-20062633)
chr3 (21-377)||(6600298-6600654)
chr3 (21-377)||(15402733-15403089)
chr3 (21-377)||(16412505-16412861)
chr3 (21-377)||(5425153-5425508)
chr3 (21-377)||(15208442-15208798)
chr3 (21-377)||(15338820-15339176)
chr3 (21-377)||(16756808-16757164)
chr3 (48-377)||(15247725-15248054)
chr3 (39-329)||(15227228-15227518)
chr3 (57-364)||(15953193-15953500)
chr3 (48-322)||(13972387-13972661)
chr3 (21-364)||(13322877-13323220)
chr3 (21-364)||(14571409-14571752)
chr3 (48-322)||(14086261-14086535)
chr3 (213-377)||(15015967-15016131)
chr3 (34-357)||(10383543-10383866)
chr3 (21-364)||(18134571-18134914)
chr3 (36-357)||(47123520-47123841)
chr3 (39-349)||(10420285-10420595)
chr3 (87-322)||(12850546-12850781)
chr3 (21-363)||(11303999-11304341)
chr3 (57-364)||(8759307-8759614)
chr3 (57-364)||(13941621-13941928)
chr3 (57-364)||(41177119-41177426)
chr3 (21-311)||(11961312-11961602)
chr3 (39-356)||(12360775-12361092)
chr3 (36-322)||(16329926-16330212)
chr3 (39-364)||(44776826-44777151)
chr3 (196-357)||(18748401-18748562)
chr3 (180-343)||(8274656-8274819)
chr3 (57-329)||(16381190-16381459)
chr3 (156-322)||(16836777-16836943)
chr3 (39-165)||(31689047-31689173)
chr3 (180-357)||(16742946-16743123)
chr3 (258-343)||(17192892-17192977)
chr3 (39-163)||(31945051-31945175)
chr3 (180-357)||(15576470-15576647)
chr3 (258-343)||(6712666-6712751)
chr3 (219-343)||(13975302-13975426)
chr3 (18-74)||(320781-320836)
chr3 (234-343)||(267515-267624)
chr3 (330-367)||(14183145-14183182)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (21-370)||(30313578-30313927)
chr8 (21-370)||(16408479-16408828)
chr8 (21-377)||(15533378-15533734)
chr8 (21-377)||(19977965-19978321)
chr8 (21-377)||(22046372-22046727)
chr8 (21-377)||(32600142-32600498)
chr8 (21-377)||(21166964-21167320)
chr8 (21-370)||(22164625-22164974)
chr8 (21-377)||(21250940-21251295)
chr8 (21-370)||(22133475-22133824)
chr8 (21-377)||(21394292-21394648)
chr8 (21-377)||(21788785-21789141)
chr8 (21-377)||(23650039-23650395)
chr8 (21-330)||(22032030-22032339)
chr8 (21-377)||(17674450-17674806)
chr8 (21-377)||(19112688-19113044)
chr8 (21-377)||(21922162-21922518)
chr8 (21-377)||(20018177-20018533)
chr8 (21-377)||(22120601-22120957)
chr8 (21-377)||(19485297-19485653)
chr8 (21-377)||(22987199-22987555)
chr8 (21-262)||(15441179-15441420)
chr8 (21-296)||(23948887-23949162)
chr8 (36-364)||(20396565-20396893)
chr8 (168-377)||(22377880-22378089)
chr8 (168-377)||(22384055-22384264)
chr8 (58-364)||(21681910-21682216)
chr8 (57-329)||(20388133-20388405)
chr8 (39-364)||(20007866-20008191)
chr8 (39-322)||(20010382-20010665)
chr8 (21-322)||(19851409-19851710)
chr8 (21-322)||(19857445-19857746)
chr8 (39-364)||(21840433-21840758)
chr8 (21-322)||(1266237-1266538)
chr8 (36-357)||(6679124-6679445)
chr8 (39-364)||(23654943-23655268)
chr8 (21-364)||(21324849-21325193)
chr8 (36-322)||(804155-804441)
chr8 (36-322)||(14565155-14565441)
chr8 (39-357)||(22061880-22062198)
chr8 (21-358)||(31416920-31417257)
chr8 (36-357)||(6603671-6603992)
chr8 (57-364)||(31571282-31571589)
chr8 (261-360)||(23949158-23949257)
chr8 (36-322)||(29303908-29304194)
chr8 (21-295)||(16265127-16265401)
chr8 (299-377)||(18856853-18856931)
chr8 (216-346)||(21196960-21197090)
chr8 (36-298)||(28982370-28982632)
chr8 (36-298)||(28987590-28987852)
chr8 (21-322)||(12304756-12305057)
chr8 (178-322)||(22051018-22051162)
chr8 (180-343)||(16877556-16877719)
chr8 (180-357)||(20652780-20652957)
chr8 (326-377)||(22040162-22040213)
chr8 (196-343)||(22315364-22315511)
chr8 (36-233)||(27347239-27347436)
chr8 (180-343)||(21850798-21850961)
chr8 (180-343)||(22982593-22982756)
chr8 (183-366)||(24818054-24818237)
chr8 (189-370)||(19863223-19863404)
chr8 (189-370)||(19867860-19868041)
chr8 (256-343)||(22283229-22283316)
chr8 (21-53)||(22179309-22179341)
chr8 (281-343)||(23157472-23157534)
chr8 (231-349)||(25282339-25282457)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (21-377)||(16355169-16355525)
chr4 (21-377)||(16252169-16252525)
chr4 (21-370)||(18227177-18227526)
chr4 (21-377)||(12523608-12523964)
chr4 (21-377)||(14680499-14680855)
chr4 (54-367)||(15149740-15150053)
chr4 (21-377)||(7090365-7090720)
chr4 (21-377)||(23955679-23956035)
chr4 (21-377)||(12476532-12476888)
chr4 (21-377)||(18297137-18297493)
chr4 (21-377)||(19778517-19778873)
chr4 (21-377)||(8386344-8386700)
chr4 (21-377)||(14303702-14304057)
chr4 (21-377)||(27711268-27711624)
chr4 (21-364)||(14652240-14652583)
chr4 (21-377)||(29039128-29039484)
chr4 (21-370)||(40472972-40473321)
chr4 (21-377)||(14266623-14266979)
chr4 (21-370)||(14159424-14159773)
chr4 (21-377)||(14851090-14851446)
chr4 (21-377)||(8053347-8053703)
chr4 (21-286)||(15364318-15364583)
chr4 (39-364)||(15003361-15003686)
chr4 (21-210)||(14927150-14927339)
chr4 (224-377)||(16676427-16676580)
chr4 (21-364)||(15070345-15070688)
chr4 (36-357)||(3264798-3265119)
chr4 (36-357)||(11207235-11207556)
chr4 (39-364)||(16145862-16146187)
chr4 (233-370)||(1640156-1640293)
chr4 (21-322)||(1649316-1649617)
chr4 (36-357)||(29453541-29453862)
chr4 (220-328)||(15415059-15415167)
chr4 (39-364)||(15245874-15246199)
chr4 (21-108)||(18607823-18607910)
chr4 (36-322)||(20890930-20891215)
chr4 (36-355)||(33222865-33223184)
chr4 (21-357)||(44661870-44662206)
chr4 (57-364)||(51606178-51606485)
chr4 (180-357)||(27900477-27900654)
chr4 (180-364)||(15359087-15359271)
chr4 (180-343)||(16445230-16445393)
chr4 (256-343)||(13247812-13247899)
chr4 (180-343)||(15293175-15293338)
chr4 (156-366)||(9849473-9849683)
chr4 (213-343)||(55375376-55375506)
chr4 (196-357)||(12132413-12132574)
chr4 (39-131)||(15415209-15415301)
chr4 (178-322)||(16752682-16752826)
chr4 (180-343)||(14997407-14997570)
chr4 (57-268)||(42702871-42703082)
chr4 (258-343)||(9291004-9291089)
chr4 (76-207)||(18164343-18164474)
chr4 (249-367)||(8706078-8706196)
chr4 (279-364)||(15077825-15077910)
chr4 (272-372)||(18550049-18550151)
chr4 (258-343)||(12342881-12342966)
chr4 (281-357)||(16685446-16685522)
chr4 (21-92)||(15359326-15359397)
chr4 (21-53)||(15351934-15351966)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (21-377)||(14323-14679)
scaffold0044 (21-377)||(583-939)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (21-377)||(65369-65724)
scaffold0042 (21-229)||(39924-40132)
scaffold0042 (279-377)||(39806-39904)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (21-367)||(17319-17665)
chr7 (21-377)||(11553095-11553451)
chr7 (21-377)||(12687422-12687778)
chr7 (21-377)||(14954541-14954897)
chr7 (21-372)||(14037728-14038079)
chr7 (21-372)||(14347758-14348109)
chr7 (21-370)||(15154652-15155001)
chr7 (21-377)||(8707526-8707882)
chr7 (21-377)||(15161050-15161406)
chr7 (21-377)||(18551751-18552107)
chr7 (21-377)||(8198549-8198905)
chr7 (21-377)||(14332318-14332674)
chr7 (21-377)||(18177663-18178019)
chr7 (21-377)||(11237206-11237562)
chr7 (21-377)||(10870916-10871272)
chr7 (21-377)||(13685984-13686341)
chr7 (21-377)||(44791344-44791700)
chr7 (21-371)||(23516768-23517118)
chr7 (21-366)||(15203800-15204145)
chr7 (87-364)||(15624539-15624816)
chr7 (21-364)||(12206784-12207127)
chr7 (39-363)||(15102586-15102910)
chr7 (21-364)||(19147133-19147476)
chr7 (21-364)||(20746532-20746875)
chr7 (39-322)||(14264270-14264553)
chr7 (39-364)||(11388412-11388736)
chr7 (39-322)||(16072320-16072603)
chr7 (21-372)||(21661885-21662233)
chr7 (36-357)||(49152238-49152559)
chr7 (39-322)||(8212154-8212437)
chr7 (213-372)||(35964848-35965007)
chr7 (36-322)||(11306289-11306575)
chr7 (277-377)||(9596234-9596334)
chr7 (21-364)||(13665475-13665813)
chr7 (21-357)||(13021279-13021615)
chr7 (249-367)||(11772244-11772362)
chr7 (57-364)||(16950455-16950762)
chr7 (57-364)||(18053937-18054244)
chr7 (57-364)||(6413469-6413776)
chr7 (57-364)||(14286360-14286667)
chr7 (39-322)||(14129813-14130096)
chr7 (39-322)||(14433631-14433914)
chr7 (180-357)||(4440008-4440185)
chr7 (21-82)||(12254326-12254387)
chr7 (57-328)||(23199763-23200034)
chr7 (57-328)||(23505890-23506161)
chr7 (21-357)||(12455625-12455960)
chr7 (196-343)||(14936443-14936590)
chr7 (180-341)||(21674562-21674723)
chr7 (140-357)||(26118596-26118813)
chr7 (57-322)||(26288063-26288327)
chr7 (219-343)||(7824019-7824143)
chr7 (231-343)||(12368603-12368715)
chr7 (219-343)||(27107801-27107925)
chr7 (57-364)||(1391-1698)
chr7 (281-357)||(17923862-17923938)
chr7 (196-343)||(15364036-15364183)
chr7 (21-115)||(26118817-26118911)
chr7 (21-165)||(15479321-15479465)
chr7 (189-372)||(41144-41327)
chr7 (195-365)||(5764588-5764758)
chr7 (281-355)||(12193737-12193811)
chr7 (231-340)||(17145288-17145397)
chr7 (196-357)||(45146652-45146812)
chr7 (57-137)||(15340454-15340534)
chr7 (259-360)||(20466941-20467041)
chr7 (281-357)||(13378879-13378955)
chr7 (21-53)||(13634038-13634070)
chr7 (260-322)||(12456940-12457002)
chr7 (256-357)||(23641673-23641774)
chr7 (256-328)||(5432638-5432710)
chr7 (258-322)||(15340590-15340654)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (23-371)||(278823-279171)
scaffold0005 (21-377)||(308622-308978)
scaffold0005 (21-364)||(164709-165052)
scaffold0005 (39-364)||(260289-260614)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (21-377)||(22756987-22757343)
chr2 (21-377)||(24708006-24708362)
chr2 (21-377)||(21325790-21326146)
chr2 (21-377)||(24675052-24675408)
chr2 (21-377)||(23188571-23188927)
chr2 (21-377)||(16924823-16925179)
chr2 (21-377)||(16998563-16998919)
chr2 (21-377)||(24261933-24262289)
chr2 (21-377)||(16981715-16982071)
chr2 (21-377)||(17063280-17063636)
chr2 (21-377)||(24709596-24709952)
chr2 (27-369)||(21145562-21145904)
chr2 (21-377)||(9609699-9610055)
chr2 (45-377)||(23063664-23063996)
chr2 (21-377)||(24878519-24878875)
chr2 (21-377)||(27370832-27371188)
chr2 (21-372)||(22325385-22325736)
chr2 (21-377)||(10868413-10868769)
chr2 (21-377)||(27217579-27217935)
chr2 (21-377)||(44386093-44386449)
chr2 (21-332)||(23138600-23138911)
chr2 (21-332)||(23550390-23550701)
chr2 (21-285)||(27377087-27377351)
chr2 (21-377)||(17066941-17067294)
chr2 (120-372)||(24825811-24826063)
chr2 (21-329)||(23087013-23087321)
chr2 (21-363)||(30211455-30211797)
chr2 (41-367)||(45529100-45529420)
chr2 (48-322)||(27365658-27365932)
chr2 (36-357)||(31830236-31830557)
chr2 (21-357)||(11358418-11358754)
chr2 (21-364)||(23293521-23293864)
chr2 (39-364)||(23276357-23276682)
chr2 (21-198)||(41609047-41609224)
chr2 (36-322)||(20832563-20832849)
chr2 (36-357)||(1063329-1063650)
chr2 (57-364)||(27787340-27787647)
chr2 (21-118)||(24833356-24833453)
chr2 (281-342)||(27368391-27368452)
chr2 (57-364)||(12573952-12574259)
chr2 (21-298)||(24653908-24654185)
chr2 (180-343)||(12640477-12640640)
chr2 (213-357)||(25128402-25128546)
chr2 (180-343)||(22276001-22276164)
chr2 (180-343)||(24831745-24831908)
chr2 (196-343)||(22762127-22762274)
chr2 (21-64)||(23599834-23599877)
chr2 (282-357)||(23817597-23817672)
chr2 (57-209)||(24944966-24945118)
chr2 (21-65)||(45676685-45676729)
chr2 (258-357)||(24570212-24570311)
chr2 (271-343)||(14708900-14708972)
chr2 (42-82)||(17967577-17967617)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (21-377)||(17045071-17045427)
chr1 (21-377)||(19106314-19106670)
chr1 (21-377)||(16078708-16079045)
chr1 (21-377)||(20136725-20137081)
chr1 (21-377)||(20249797-20250153)
chr1 (21-377)||(21747482-21747837)
chr1 (21-377)||(33391085-33391441)
chr1 (21-370)||(50620307-50620656)
chr1 (21-377)||(21830250-21830606)
chr1 (39-377)||(16350655-16350993)
chr1 (21-377)||(51333549-51333905)
chr1 (21-377)||(21836897-21837253)
chr1 (21-377)||(41354525-41354881)
chr1 (21-364)||(19760935-19761278)
chr1 (44-377)||(16369267-16369600)
chr1 (21-247)||(50612602-50612828)
chr1 (39-364)||(19664945-19665270)
chr1 (21-175)||(21163227-21163381)
chr1 (57-349)||(20940147-20940439)
chr1 (21-364)||(19854261-19854604)
chr1 (21-355)||(20856839-20857173)
chr1 (21-322)||(20294359-20294660)
chr1 (36-322)||(37677041-37677328)
chr1 (21-322)||(31550292-31550593)
chr1 (39-357)||(22433192-22433510)
chr1 (153-364)||(41307904-41308115)
chr1 (156-322)||(11382676-11382842)
chr1 (87-364)||(20835957-20836237)
chr1 (36-322)||(20075170-20075456)
chr1 (57-311)||(20244183-20244437)
chr1 (36-232)||(20395194-20395390)
chr1 (219-343)||(20831482-20831606)
chr1 (180-343)||(46518827-46518990)
chr1 (36-115)||(24476942-24477021)
chr1 (180-357)||(20914316-20914493)
chr1 (281-346)||(22135645-22135710)
chr1 (256-348)||(20184364-20184456)
chr1 (281-349)||(21202371-21202439)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (23-370)||(12497824-12498171)
chr6 (23-370)||(12510730-12511077)
chr6 (21-377)||(19864483-19864839)
chr6 (23-370)||(12505153-12505500)
chr6 (21-377)||(16963496-16963852)
chr6 (21-377)||(25765419-25765774)
chr6 (21-377)||(5839348-5839704)
chr6 (21-315)||(21833172-21833466)
chr6 (21-371)||(22078823-22079173)
chr6 (21-377)||(16927769-16928125)
chr6 (21-377)||(25609990-25610346)
chr6 (27-377)||(1543213-1543563)
chr6 (21-377)||(23078265-23078621)
chr6 (21-377)||(24313297-24313653)
chr6 (21-377)||(16626846-16627202)
chr6 (21-377)||(29592049-29592405)
chr6 (21-370)||(27331569-27331918)
chr6 (21-370)||(27392309-27392658)
chr6 (21-377)||(18408072-18408428)
chr6 (21-377)||(28263326-28263682)
chr6 (21-377)||(28342075-28342431)
chr6 (21-377)||(27187232-27187588)
chr6 (21-377)||(27261652-27262008)
chr6 (21-377)||(2874932-2875288)
chr6 (21-377)||(25112348-25112704)
chr6 (21-377)||(28292501-28292857)
chr6 (21-377)||(22762584-22762940)
chr6 (21-245)||(17032358-17032582)
chr6 (47-377)||(18197676-18198006)
chr6 (21-322)||(21471397-21471698)
chr6 (21-158)||(22433793-22433930)
chr6 (39-316)||(25750623-25750900)
chr6 (21-357)||(15459132-15459468)
chr6 (48-322)||(14131363-14131637)
chr6 (57-322)||(25768023-25768288)
chr6 (58-364)||(22796774-22797080)
chr6 (21-322)||(19879094-19879395)
chr6 (39-322)||(18794504-18794787)
chr6 (48-322)||(21564316-21564590)
chr6 (21-322)||(34645770-34646071)
chr6 (21-322)||(11287782-11288083)
chr6 (21-357)||(10468998-10469334)
chr6 (283-377)||(22433927-22434021)
chr6 (21-322)||(11280689-11280990)
chr6 (231-331)||(11291818-11291918)
chr6 (21-357)||(24364208-24364544)
chr6 (140-364)||(18800857-18801081)
chr6 (104-364)||(17415365-17415625)
chr6 (39-357)||(8766297-8766615)
chr6 (57-364)||(27560759-27561066)
chr6 (168-329)||(1640715-1640876)
chr6 (179-303)||(25750900-25751024)
chr6 (141-364)||(14381609-14381832)
chr6 (180-357)||(25743236-25743413)
chr6 (180-343)||(16098005-16098168)
chr6 (180-343)||(23996203-23996366)
chr6 (219-343)||(16382536-16382660)
chr6 (21-136)||(1640595-1640710)
chr6 (256-343)||(18571682-18571769)
chr6 (231-346)||(25655489-25655604)
chr6 (57-364)||(28282955-28283262)
chr6 (39-136)||(18787702-18787799)
chr6 (180-357)||(18838057-18838234)
chr6 (219-343)||(1648947-1649071)
chr6 (219-357)||(16233203-16233341)
chr6 (180-357)||(15078513-15078690)
chr6 (258-343)||(21413101-21413186)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (21-377)||(5977-6333)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (21-377)||(4392-4748)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (21-377)||(8559-8915)
scaffold0109 (21-377)||(33560-33916)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (21-377)||(639-995)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (21-377)||(64018-64374)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (21-369)||(5986-6334)
scaffold0120 (57-364)||(1524-1831)
scaffold0120 (180-357)||(22816-22993)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (21-377)||(681-1036)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (21-377)||(127186-127542)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (21-377)||(5184-5540)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (21-377)||(6335-6691)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (21-377)||(219404-219760)
scaffold0012 (21-377)||(229006-229362)
scaffold0012 (180-343)||(33016-33179)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (27-377)||(43123-43473)
scaffold0028 (40-370)||(8467-8797)
scaffold0028 (224-358)||(13832-13966)
scaffold0028 (48-322)||(50556-50830)
scaffold0028 (213-343)||(106594-106724)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (21-372)||(32744-33095)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (21-371)||(1102-1452)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (21-377)||(810-1165)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (21-377)||(180180-180536)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (39-377)||(109798-110136)
scaffold0029 (21-322)||(112522-112823)
scaffold0029 (39-357)||(96009-96327)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (21-370)||(15456-15804)
scaffold0333 (235-370)||(15832-15967)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (21-369)||(14002-14350)
scaffold0106 (39-348)||(31391-31700)
scaffold0106 (273-377)||(17657-17761)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (21-370)||(7340-7689)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (21-377)||(9306-9662)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (21-377)||(6900-7258)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (21-377)||(377-733)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (21-355)||(3995-4329)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (21-320)||(26-325)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (21-355)||(16950-17284)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (21-367)||(16462-16808)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (21-355)||(3103-3437)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (21-372)||(448022-448373)
scaffold0001 (21-341)||(162076-162396)
scaffold0001 (57-364)||(90932-91239)
scaffold0001 (180-357)||(78636-78813)
scaffold0001 (147-209)||(175352-175414)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (21-367)||(26530-26876)
scaffold0011 (39-364)||(195703-196027)
scaffold0011 (21-322)||(148533-148834)
scaffold0011 (39-209)||(68595-68765)
scaffold0011 (180-343)||(121971-122134)
scaffold0011 (281-343)||(180147-180209)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (21-377)||(14840-15196)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (21-322)||(27930-28231)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (21-372)||(252-603)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (123-377)||(21932-22186)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (21-364)||(15079-15422)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (21-372)||(12969-13320)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (122-377)||(7854-8109)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (21-364)||(111984-112327)
scaffold0004 (36-322)||(203510-203796)
scaffold0004 (57-364)||(322703-323010)
scaffold0004 (36-357)||(385797-386118)
scaffold0004 (39-364)||(117549-117874)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (57-367)||(1-311)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (21-372)||(16408-16759)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (71-370)||(49506-49805)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (21-355)||(968-1301)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (21-364)||(116905-117248)
scaffold0037 (180-343)||(98137-98300)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (36-364)||(886-1214)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (21-364)||(25719-26062)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (21-243)||(16920-17142)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (21-367)||(5588-5933)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (21-367)||(25068-25414)
scaffold0234 (180-322)||(16213-16355)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (183-369)||(7522-7708)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (21-329)||(10774-11082)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (178-377)||(767-966)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (21-372)||(86496-86847)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (141-372)||(9053-9284)
scaffold0507 (21-133)||(6940-7052)
scaffold0507 (180-346)||(351-517)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (57-328)||(28805-29076)
scaffold0064 (57-328)||(40796-41067)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (57-364)||(3874-4181)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (57-364)||(47123-47430)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (21-357)||(10090-10426)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (48-364)||(26132-26448)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (21-364)||(27482-27825)
scaffold0139 (39-364)||(1149-1473)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (39-364)||(18537-18862)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (39-364)||(13901-14226)
scaffold0034 (93-357)||(4960-5224)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (39-322)||(18830-19113)
scaffold0090 (141-322)||(23094-23275)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (57-364)||(51863-52170)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (57-364)||(37201-37508)
scaffold0026 (153-358)||(38180-38385)
scaffold0026 (153-318)||(27383-27548)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (48-322)||(7078-7352)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (57-322)||(5956-6220)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (39-364)||(9779-10099)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (39-364)||(14067-14391)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (39-363)||(13362-13686)
scaffold0298 (39-363)||(17132-17456)
scaffold0298 (48-322)||(19973-20247)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (48-364)||(21671-21987)
scaffold0235 (256-343)||(26004-26091)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (102-322)||(58448-58668)
scaffold0058 (58-357)||(19120-19419)
scaffold0058 (21-94)||(59042-59115)
scaffold0058 (196-349)||(74038-74191)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (21-364)||(61-404)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (48-322)||(33719-33993)
scaffold0076 (219-343)||(40419-40543)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (39-363)||(10869-11193)
scaffold0124 (48-363)||(400-715)
scaffold0124 (180-343)||(7831-7994)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (39-357)||(6164-6483)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (39-358)||(3872-4191)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (57-364)||(5002-5309)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (39-329)||(172-462)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (48-322)||(1211-1485)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (39-364)||(27207-27531)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (39-364)||(42333-42658)
scaffold0010 (39-364)||(47399-47724)
scaffold0010 (87-118)||(2212-2243)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (68-364)||(4760-5056)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (39-358)||(14257-14576)
scaffold0203 (39-202)||(9039-9202)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (57-364)||(2750-3057)
scaffold0035 (219-370)||(13189-13340)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (72-222)||(4567-4717)
scaffold0023 (21-136)||(36974-37089)
scaffold0023 (258-377)||(4441-4560)
scaffold0023 (57-109)||(18993-19045)
scaffold0023 (273-328)||(58969-59024)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (39-364)||(49033-49358)
scaffold0053 (39-322)||(57859-58141)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (39-322)||(509-792)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (48-266)||(1167-1385)
scaffold0165 (21-82)||(26203-26264)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (39-357)||(49214-49532)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (39-357)||(61220-61538)
scaffold0067 (57-357)||(67608-67908)
scaffold0067 (39-357)||(52186-52504)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (39-364)||(39720-40045)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (21-322)||(25907-26208)
scaffold0113 (21-322)||(16639-16940)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (21-322)||(16755-17056)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (39-346)||(20103-20410)
scaffold0114 (39-357)||(43486-43804)
scaffold0114 (39-357)||(44498-44816)
scaffold0114 (39-209)||(36036-36206)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (279-377)||(3706-3804)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (22-322)||(38929-39229)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (57-357)||(248612-248912)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (23-118)||(6238-6333)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (21-357)||(26224-26560)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (57-364)||(12781-13088)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (180-358)||(1916-2094)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (213-357)||(1241-1385)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (309-377)||(12738-12806)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (57-207)||(2023-2173)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (39-268)||(4235-4464)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (57-364)||(7238-7543)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (196-357)||(14661-14822)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (57-237)||(13380-13560)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (21-357)||(42746-43082)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (189-364)||(1-176)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (180-343)||(46276-46439)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (156-322)||(5311-5477)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (21-82)||(7498-7559)
scaffold0101 (279-349)||(5467-5537)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (48-209)||(136109-136270)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (258-357)||(8898-8997)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (180-343)||(3281-3444)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (273-364)||(3355-3446)
scaffold0222 (39-136)||(3496-3593)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (196-357)||(1061-1222)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (180-357)||(393-570)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (256-357)||(8293-8394)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (234-343)||(23570-23679)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (180-357)||(13030-13207)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (257-357)||(43737-43837)
scaffold0132 (180-357)||(14779-14956)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (180-343)||(3896-4059)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (180-343)||(28287-28450)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (180-334)||(940-1094)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (48-136)||(45835-45923)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (281-357)||(71442-71518)
scaffold0021 (213-357)||(13406-13550)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (180-343)||(14758-14921)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (180-343)||(24002-24165)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (256-357)||(1431-1532)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (281-357)||(9210-9286)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (196-328)||(10493-10625)
scaffold0447 (196-328)||(5879-6011)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (231-343)||(3965-4077)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (39-126)||(9200-9287)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (256-343)||(26178-26265)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (39-115)||(886-962)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (196-328)||(8488-8620)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (231-343)||(10829-10941)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (291-346)||(14370-14425)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (281-343)||(18332-18394)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (256-346)||(820-910)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 23573606 - 23573962
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573606 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23573705  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23573706 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23573805  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573806 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23573905  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23573906 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 23573962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440440
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23440388  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23440389 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 23440440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 18775641 - 18775990
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775641 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 18775740  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||    
T  18775741 ccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagt 18775840  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18775841 cacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 18775940  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775941 attctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 18775990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 56 - 369
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798972
Alignment:
Q  56 aacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgat 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||| |||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  156 atctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 255  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 20798958  T
Q  356 ctgctgaacaatct 369  Q
    ||||||||||||||    
T  20798959 ctgctgaacaatct 20798972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21984827 - 21984471
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21984827 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatc 21984728  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |    
T  21984727 ccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaat 21984628  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21984627 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 21984528  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21984527 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 21984471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23516761
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23516704  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23516705 atcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctctggtcct 23516761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 22134532 - 22134888
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22134532 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22134631  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||  | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  22134632 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 22134731  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134732 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22134831  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22134832 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22134888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 369
Target Start/End: Original strand, 25423053 - 25423401
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25423053 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25423152  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||    
T  25423153 ccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagt 25423252  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423253 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 25423352  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  25423353 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 25423401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15000261 - 14999905
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15000261 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15000162  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15000161 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15000062  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000061 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14999962  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14999961 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 14999905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22333409 - 22333053
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22333409 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 22333310  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  22333309 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22333210  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22333209 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22333110  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22333109 attttctcttggatcatccggactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22333053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27685922 - 27685566
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27685922 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27685823  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  27685822 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 27685723  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685722 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 27685623  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27685622 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27685566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 37292018 - 37291662
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37292018 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 37291919  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  37291918 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 37291819  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37291818 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 37291719  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37291718 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 37291662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 40708644 - 40709000
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40708644 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 40708743  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  40708744 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 40708843  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40708844 cataggagtgactctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 40708943  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40708944 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 40709000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668656
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27668713  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27668712 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27668656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 34566358 - 34566714
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  34566358 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 34566457  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  34566458 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 34566557  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34566558 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 34566657  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34566658 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 34566714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 16356366 - 16356722
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  16356366 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 16356465  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  16356466 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 16356565  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16356566 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 16356665  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16356666 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16356722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770180
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | || ||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19770123  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19770124 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19770180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 27518271 - 27518627
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  27518271 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27518370  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27518371 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27518470  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27518471 cataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27518570  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27518571 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27518627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610574
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttc 27610517  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27610518 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27610574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 41770706 - 41771062
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  41770706 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 41770805  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  41770806 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41770905  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  41770906 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttc 41771005  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41771006 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 41771062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26739223 - 26738871
Alignment:
Q  25 catcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccac 124  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26739223 catctctttagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccac 26739124  T
Q  125 tcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcaca 224  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||    
T  26739123 tcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcaca 26739024  T
Q  225 ggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattt 324  Q
    |||||||| |||||||| |  || |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26739023 ggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatct 26738924  T
Q  325 tctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||    
T  26738923 tttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgtacaatttctggtcct 26738871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29476595 - 29476239
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  29476595 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 29476496  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||    
T  29476495 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgt 29476396  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  29476395 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttc 29476296  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29476295 attttctcttggatcatccgaactttttcagtagtctgttgaacaatctctggtcct 29476239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 46 - 377
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348643
Alignment:
Q  46 atggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaac 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  146 tctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacg 245  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  246 tggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactt 345  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactt 22348611  T
Q  346 tctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22348612 tctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 22348643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471439
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttc 23471392  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  23471393 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaat 23471439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468275
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| |||||||||  |  | | ||||||  |||||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttc 20468319  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20468318 atcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgctgaac 20468275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaa 262  Q
    ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21343880 - 21343666
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21343880 acatcgtctctttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 21343781  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||    
T  21343780 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagt 21343681  T
Q  221 cacaggagtgactct 235  Q
    |||||||||||||||    
T  21343680 cacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 100 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498209
Alignment:
Q  100 tcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  200 caaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 299  Q
    |||  |||||   ||||| |||||| |||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  300 tgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctc 21498209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564180
Alignment:
Q  58 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||  | | |||||| || |||||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  158 ctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 257  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 329  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctct 21564180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735790
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   |||| |    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24735816  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  24735815 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 24735790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749733
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   |||| |    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24749759  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  24749758 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 24749733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890938
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| |   |||||||||| ||| || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  21890963 ttgactttctctgtagtctgatgaac 21890938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442472
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||   || |||||  | ||||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || |||| |||||| | |||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  |||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 347  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttc 23442489  T
Q  348 tcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||    
T  23442488 tctgtagtctgatgaac 23442472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737011
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgct 317  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgct 24737011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 355
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462132
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||      
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||||||||| || ||||| || | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatc 22462115  T
Q  339 ttaactttctcagtagt 355  Q
    || |||||||| |||||    
T  22462116 ttgactttctctgtagt 22462132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28924272 - 28923982
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||      
T  28924272 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacag 28924173  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||||||||| || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||     
T  28924172 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 28924073  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 329  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28924072 aaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 28923982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 20773624 - 20773942
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||      
T  20773624 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacag 20773723  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||||||||| || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||||   || || |||| |||||| || ||||     
T  20773724 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcag 20773823  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || ||| | ||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20773824 aaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 20773923  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
    || |||||||| |||||||    
T  20773924 ttgactttctctgtagtct 20773942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Original strand, 21404700 - 21405035
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  21404700 acatcatctcttggaatcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaac 21404799  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||  |||||||| || |  ||||||   ||||| ||    
T  21404800 ccactctatacgcaactgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggt 21404899  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || |||||||                 ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||    
T  21404900 cacaagagtgactctaaaaaacacatgatctcctt----------------gttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttc 21404983  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || |||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21404984 atattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaacaatgtctg 21405035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28895446 - 28895156
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||       
T  28895446 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagag 28895347  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||||||||| || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||     
T  28895346 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 28895247  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 329  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28895246 aaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 28895156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236099
Alignment:
Q  18 tggacatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggta 117  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  118 atcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacacc 217  Q
    | || |||| ||| | |||  | ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  218 agtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgct 317  Q
     |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgct 22236146  T
Q  318 ttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    ||||| ||||||   | |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  22236145 ttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtctgatgaac 22236099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37546004 - 37545682
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  37546004 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 37545905  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  37545904 cagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 37545805  T
Q  236 ca-aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 334  Q
    || |||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||   ||    
T  37545804 cagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttat 37545705  T
Q  335 catcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || | | ||||||||||||||||    
T  37545704 caaccttactttctcagtagtct 37545682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14887498 - 14887177
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  14887498 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 14887399  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||| ||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  14887398 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 14887299  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  14887298 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 14887199  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  14887198 aacctgactttctcagtagtct 14887177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339452
Alignment:
Q  233 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 332  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  333 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 21339452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23080611 - 23080275
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  23080611 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaac 23080512  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||    
T  23080511 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgt 23080412  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||  ||  | || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23080411 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttc 23080312  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || || ||    |||||||| ||||||||||||||||    
T  23080311 atcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 23080275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21662546 - 21662300
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||    
T  21662546 atcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtca 21662447  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
       | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||    |||||  ||| ||||||||||||    
T  21662446 ttgttccaactctttccgatatctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactct 21662348  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgctt 283  Q
     | |||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21662347 tagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798618
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| |  ||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||| || || || || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcat 24798618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Original strand, 20821299 - 20821635
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  20821299 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 20821398  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | | || |||||||||  | ||||| ||||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  20821399 caattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 20821498  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20821499 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 20821598  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || ||||||   |||||| |||||||||| |||||||    
T  20821599 atcttctctctgatcatcctaactttctctgtagtct 20821635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Original strand, 20342143 - 20342464
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  20342143 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 20342242  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||||   ||||| |||| ||| ||||||||    
T  20342243 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactct 20342342  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  20342343 cagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 20342442  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  20342443 aacctgactttctcagtagtct 20342464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||    |||||  ||| |||||||||||| | |||||| || ||| ||||    
T  21665886 tctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgctt 283  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 22381045 - 22381346
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  22381045 acatcatctcttggaatcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22381144  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||| | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  22381145 caactctataagccaccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 22381244  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||  |||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22381245 catcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 22381344  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  22381345 at 22381346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 25847936 - 25848222
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||    
T  25847936 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgcca 25848035  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  | |||||||| || || |||||||| | |||||| ||| | |||||||||||  | || ||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||    
T  25848036 cagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 25848135  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    |||||| || || || || || |||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25848136 caaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 25848222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 22502525 - 22502826
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  22502525 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22502624  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | |||||||| || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| ||    
T  22502625 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 22502724  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  22502725 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttc 22502824  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  22502825 at 22502826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269512
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || |  || || || |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 17269520  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  17269519 tcctgaac 17269512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210880
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtct 11210880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581379
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || ||||||||| | || || | ||||||||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 24581379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011252
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 27011252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 357
Target Start/End: Original strand, 23503525 - 23503625
Alignment:
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  23503525 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtc 23503624  T
Q  357 t 357  Q
    |    
T  23503625 t 23503625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937388
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || ||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 21937388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Original strand, 21625397 - 21625470
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatg 109  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21625397 atcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25244664 - 25244546
Alignment:
Q  231 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 330  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||| ||| | ||| |    ||||||||| ||||  |    
T  25244664 actctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctcttgcctactgtcacgcgctttcatcttcttct 25244565  T
Q  331 gaatcatcttaactttctc 349  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  25244564 gaatcatcttaacattctc 25244546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25308816 - 25308698
Alignment:
Q  231 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 330  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||| ||| | ||| |    ||||||||| ||||  |    
T  25308816 actctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctcttgcctactgtcacgcgctttcatcttcttct 25308717  T
Q  331 gaatcatcttaactttctc 349  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  25308716 gaatcatcttaacattctc 25308698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831964
Alignment:
Q  288 tgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 21831964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498155
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12498098  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12498099 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 12498155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876729
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14876779  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14876778 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctc 14876729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 17489401 - 17489757
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17489401 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 17489500  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  17489501 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 17489600  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489601 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17489700  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17489701 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 17489757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 16370964 - 16371320
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16370964 acatcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16371063  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  16371064 ccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16371163  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371164 cacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16371263  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16371264 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16371320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 16691711 - 16692060
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691711 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16691810  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  16691811 ccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16691910  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16691911 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 16692010  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16692011 attttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaacaatctc 16692060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16492760 - 16492404
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16492760 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16492661  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||    
T  16492660 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagt 16492561  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492560 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16492461  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16492460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 16492404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16807149
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttc 16807206  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16807205 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16807149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 9522270 - 9522626
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9522270 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaac 9522369  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  9522370 ccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9522469  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9522470 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 9522569  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  9522570 atcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 9522626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 10905761 - 10906117
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10905761 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 10905860  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  10905861 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10905960  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10905961 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 10906060  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10906061 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10906117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15348824 - 15348476
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  15348824 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 15348725  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15348724 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15348625  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348624 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15348525  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15348524 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 15348476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 10005151 - 10005507
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10005151 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10005250  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  10005251 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10005350  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10005351 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 10005450  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10005451 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10005507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 371
Target Start/End: Original strand, 48424998 - 48425348
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  48424998 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 48425097  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  48425098 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 48425197  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48425198 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 48425297  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 371  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48425298 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctct 48425348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 53385579 - 53385241
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||     
T  53385579 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 53385480  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||  |||| |||||||| || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  53385479 tcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaa 53385380  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53385379 aaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 53385280  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53385279 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 53385241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792622
Alignment:
Q  28 cactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcg 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  128 atacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacagga 227  Q
     || |||| | | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  228 gtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 26792672  T
Q  328 cttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26792671 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 26792622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 13252241 - 13252597
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13252241 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 13252340  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  13252341 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 13252440  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13252441 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 13252540  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13252541 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 13252597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15589971 - 15589615
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  15589971 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 15589872  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15589871 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15589772  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15589771 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 15589672  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15589671 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15589615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 16635324 - 16635680
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  16635324 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 16635423  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  16635424 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 16635523  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16635524 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 16635623  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16635624 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16635680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 43162648 - 43163004
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  43162648 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 43162747  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  43162748 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 43162847  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43162848 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 43162947  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43162948 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 43163004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15725512 - 15725157
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15725512 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15725413  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||    
T  15725412 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 15725313  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15725312 cataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 15725213  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15725212 attttctcttggatcatccgaa-tttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 15725157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20062633 - 20062277
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  20062633 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 20062534  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||||    
T  20062533 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 20062434  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20062433 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 20062334  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20062333 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 20062277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6600654
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 6600597  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6600598 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 6600654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15403089 - 15402733
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15403089 acatcgtcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15402990  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||||    
T  15402989 ccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15402890  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402889 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15402790  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15402789 attttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15402733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16412861 - 16412505
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  16412861 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16412762  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16412761 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16412662  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16412661 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttc 16412562  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16412561 attttctcttggatcatctgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16412505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5425153
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5425308 cataggagtgactctc-aaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 5425210  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5425209 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 5425153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15208798
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||| |    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||   ||||||||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 15208741  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  15208742 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 15208798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 15338820 - 15339176
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15338820 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15338919  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || || ||| | |||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   || |||||    
T  15338920 ccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15339019  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339020 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15339119  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15339120 atttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctggtcct 15339176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756808
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | || ||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttc 16756865  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16756864 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16756808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 48 - 377
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15248054
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||| ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 347  Q
     ||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttc 15248024  T
Q  348 tcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  15248025 tcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 15248054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 329
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227518
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||| || |||||||| || | |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctct 15227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953193
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || |||||  | ||||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| | ||||| ||| || || ||||| ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 15953201  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  15953200 tgatgaac 15953193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972387
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    |||| || |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 13972387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13323220 - 13322877
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  13323220 acatcatctcttggaataacatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaac 13323121  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |  | ||| |||||  | ||||  || ||| |||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   || || ||    
T  13323120 caatcctatatgccactgttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgt 13323021  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13323020 cataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 13322921  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    ||  | |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  13322920 atcctttctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 13322877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571752
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| ||| |||||  | ||||| || || ||||||||||| | |||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttc 14571708  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  14571709 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtggtctgatgaac 14571752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086535
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| | ||| |||||  | || ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14086535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15016131 - 15015967
Alignment:
Q  213 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15016131 acaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgag 15016032  T
Q  313 acgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||| |||||   ||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||| ||||    
T  15016031 acgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcct 15015967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 10383543 - 10383866
Alignment:
Q  34 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||    
T  10383543 ggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgc 10383642  T
Q  134 caccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgact 233  Q
    |||  |||||||||| || || |||||||| | |||||| ||| | |||||||||||  | ||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||     
T  10383643 cactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgacc 10383742  T
Q  234 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaa 333  Q
    |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |    
T  10383743 ctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctctta 10383842  T
Q  334 tcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||| | | ||||||||||||||||    
T  10383843 tcaacctgactttctcagtagtct 10383866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18134914 - 18134571
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || |    
T  18134914 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 18134815  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||||||    
T  18134814 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagt 18134715  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||  | || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18134714 cataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 18134615  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || ||||||   ||||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  18134614 atcttctctccgatcattttgactttatctgtagtctgatgaac 18134571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Original strand, 47123520 - 47123841
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  47123520 atcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 47123619  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||    
T  47123620 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 47123719  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  47123720 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 47123819  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  47123820 aacctgactttctcagtagtct 47123841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10420595 - 10420285
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || | || |||||||||      
T  10420595 acatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 10420496  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | || |||||||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || ||||     
T  10420495 ttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 10420396  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  10420395 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 10420296  T
Q  339 ttaactttctc 349  Q
     | ||||||||    
T  10420295 ctgactttctc 10420285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850546
Alignment:
Q  87 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtca 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | |||||||| || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  187 acttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatc 286  Q
    ||||||| |||||||| |||||    | ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||  | ||||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  287 atgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12850581 atggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcat 12850546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11303999
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||    ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttc 11304042  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 363  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  11304041 atcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcctgatgaa 11303999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759307
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || | ||| || || |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 8759315  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  8759314 tcctgaac 8759307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941928
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || | ||| || || |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||  | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 13941920  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  13941921 tcctgaac 13941928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177426
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || | ||| || || |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||  | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 41177418  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  41177419 tcctgaac 41177426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11961602 - 11961312
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||      
T  11961602 acatcatctcttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaat 11961503  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | |||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| ||||||   ||||  ||    
T  11961502 caactctataagccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgt 11961403  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 311  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11961402 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 11961312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360775
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||  | || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | || ||||| ||||||   ||||  |||| || ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||    ||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 12360793  T
Q  339 ttaactttctcagtagtc 356  Q
    || |||||||| ||||||    
T  12360792 ttgactttctctgtagtc 12360775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329926
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  | |||||||| || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||| | | |||||||| ||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcat 16329926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 44776826 - 44777151
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||||     
T  44776826 acatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccg 44776925  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | || |  || || || |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||||| |     
T  44776926 ttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttag 44777025  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || ||||| ||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  44777026 aaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 44777125  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || ||||| || ||||||| ||||||    
T  44777126 ttgactttttctgtagtctcctgaac 44777151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 357
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748562
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||  | ||||| |||||||| || || ||  ||||||||||||  |  ||||| | |||||||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 18748562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274656
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 8274656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381190
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | ||||  || || || |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatc 16381260  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 329  Q
      ||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16381259 ccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactc---tgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 16381190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16836943 - 16836777
Alignment:
Q  156 atctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 255  Q
    |||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || |    
T  16836943 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccct 16836844  T
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  16836843 cctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcat 16836777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31689173 - 31689047
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || || |||| ||| |||||      
T  31689173 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgccactg 31689074  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatg 165  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31689073 ttccaaccctttctgatatctgatatg 31689047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742946
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  ||||| |||||| ||| || || |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 16742946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 17192892 - 17192977
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17192892 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 17192977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 163
Target Start/End: Original strand, 31945051 - 31945175
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||  ||| |||||      
T  31945051 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 31945150  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgata 163  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||    
T  31945151 ttccaaccctttctgatatctgata 31945175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576647
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 15576647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6712751 - 6712666
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6712751 tgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaac 6712666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13975426 - 13975302
Alignment:
Q  219 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || |    
T  13975426 gtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgcct 13975327  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  13975326 tcatcttctcctgaatcatcttaac 13975302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 320781 - 320836
Alignment:
Q  18 tggacatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgc 74  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  320781 tggacatcatctctttggatcacg-gagatggatccggagcatacttccgaagttgc 320836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 267624 - 267515
Alignment:
Q  234 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaa 333  Q
    ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||  || | || ||| ||| ||||||| || || | ||    
T  267624 ctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatctcctgcctaccctgagacactttcatgttttcctaaa 267525  T
Q  334 tcatcttaac 343  Q
    ||||||||||    
T  267524 tcatcttaac 267515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14183182 - 14183145
Alignment:
Q  330 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14183182 tgaatcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaat 14183145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30313927 - 30313578
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30313927 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 30313828  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  30313827 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 30313728  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30313727 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 30313628  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313627 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 30313578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16408828 - 16408479
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408828 acatcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16408729  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16408728 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16408629  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16408628 cacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 16408529  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408528 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 16408479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 15533378 - 15533734
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533378 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 15533477  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||     
T  15533478 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15533577  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15533578 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 15533677  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15533678 atcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 15533734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 19977965 - 19978321
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19977965 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 19978064  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  19978065 ccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 19978164  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978165 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19978264  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19978265 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 19978321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 22046372 - 22046727
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046372 acatcatcactttg-atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22046470  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  22046471 ctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22046570  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22046571 cactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttc 22046670  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22046671 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22046727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 32600142 - 32600498
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32600142 acatcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatc 32600241  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  32600242 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 32600341  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32600342 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 32600441  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32600442 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctactgaacaatctctggtcct 32600498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21166964
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21167021  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21167020 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 21166964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22164974 - 22164625
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164974 acatcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22164875  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  22164874 ccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22164775  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22164774 cacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22164675  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22164674 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22164625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 21250940 - 21251295
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21250940 acatcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21251039  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  21251040 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21251139  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21251140 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 21251239  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    | | |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21251240 a-tctctctttaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 21251295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22133824 - 22133475
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22133824 acatcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattc 22133725  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  22133724 cgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22133625  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22133624 cacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22133525  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22133524 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22133475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21394648 - 21394292
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21394648 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21394549  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  21394548 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21394449  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21394448 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21394349  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  21394348 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcct 21394292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21789141 - 21788785
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21789141 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21789042  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  21789041 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21788942  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21788941 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21788842  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  21788841 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcct 21788785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 23650039 - 23650395
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23650039 acattatcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23650138  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  23650139 caactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 23650238  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  23650239 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttt 23650338  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23650339 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 23650395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 330
Target Start/End: Original strand, 22032030 - 22032339
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22032030 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22032129  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  22032130 ctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22032229  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032230 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22032329  T
Q  321 attttctctt 330  Q
    ||||||||||    
T  22032330 attttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674450
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 17674507  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17674506 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17674450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 19112688 - 19113044
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19112688 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19112787  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||  | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  19112788 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19112887  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19112888 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19112987  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19112988 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaataatctctggtcct 19113044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21922518 - 21922162
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21922518 acatcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21922419  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||   ||||||||    
T  21922418 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagt 21922319  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21922318 cacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttc 21922219  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21922218 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 21922162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20018533 - 20018177
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  20018533 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 20018434  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  20018433 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 20018334  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20018333 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 20018234  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  20018233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 20018177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22120957 - 22120601
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  22120957 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 22120858  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||  ||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||    
T  22120857 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 22120758  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22120757 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22120658  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22120657 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatcct 22120601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19485297
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19485354  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  19485353 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcct 19485297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987555
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| ||   ||| ||||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 22987498  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||| | |||||||    
T  22987499 atcttctcttgaatcatattatctttctcaatagtttgttgaacaatttatgctcct 22987555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 15441179 - 15441420
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15441179 acatcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15441278  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
      || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||     
T  15441279 aaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15441378  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15441379 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949162
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396565
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |  ||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatc 20396594  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  20396593 aacttaaccttctcagtagtttgttgaac 20396565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 168 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377880
Alignment:
Q  168 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  268 gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaat 22377890  T
Q  368 ctctgctcct 377  Q
     |||| ||||    
T  22377889 ttctggtcct 22377880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 168 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384055
Alignment:
Q  168 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  268 gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaat 22384065  T
Q  368 ctctgctcct 377  Q
     |||| ||||    
T  22384064 ttctggtcct 22384055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21682216 - 21681910
Alignment:
Q  58 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||  | ||||| || || |||||    
T  21682216 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 21682117  T
Q  158 ctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 257  Q
    |||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||    
T  21682116 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 21682017  T
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  21682016 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 21681917  T
Q  358 gctgaac 364  Q
    | |||||    
T  21681916 gatgaac 21681910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 329
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388405
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||| | |||  | |||||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||| ||||| ||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||    ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 329  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctct 20388405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008191
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||| |||||      
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||||| |||||| ||  | ||||||| ||| || |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||   ||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20008165  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  20008166 tttaccttctccgtagtctgatgaac 20008191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010382
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || |||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| ||||  |||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 20010382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 19851409 - 19851710
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  19851409 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19851508  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||   || |||||  | ||||| || || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||| | ||    
T  19851509 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgt 19851608  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||  ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19851609 caacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 19851708  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  19851709 at 19851710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 19857445 - 19857746
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  19857445 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19857544  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||   || |||||  | ||||| || || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||| | ||    
T  19857545 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgt 19857644  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||  ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19857645 caacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 19857744  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  19857745 at 19857746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 21840433 - 21840758
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||  || |||||      
T  21840433 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 21840532  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| |   ||||| || | |||||| ||||| |     
T  21840533 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttag 21840632  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||   ||||||    
T  21840633 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatc 21840732  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  21840733 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 21840758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 1266237 - 1266538
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  1266237 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 1266336  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  1266337 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 1266436  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||  ||||| ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266437 catcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 1266536  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  1266537 at 1266538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Original strand, 6679124 - 6679445
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  6679124 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 6679223  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||  | ||||||||||||||    ||||| |||| ||||||||| ||    
T  6679224 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 6679323  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  6679324 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 6679423  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  6679424 aacctgactttctcagtagtct 6679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 23654943 - 23655268
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |  |||  ||||      
T  23654943 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatataccactg 23655042  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | | ||| || || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||     
T  23655043 ttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23655142  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||  || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  23655143 aaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 23655242  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  23655243 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 23655268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21325193 - 21324849
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaa-gatgcggtggtaat 119  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||     
T  21325193 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaa 21325094  T
Q  120 cccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccag 219  Q
    || |||| ||| |||||  | ||||| || |  ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |    
T  21325093 ccaactctatatgccactgttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccg 21324994  T
Q  220 tcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttt 319  Q
    ||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21324993 tcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgtttt 21324894  T
Q  320 cattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    ||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21324893 catcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 21324849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 804441 - 804155
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  804441 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 804342  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||| ||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  804341 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 804242  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  804241 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcat 804155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 14565155 - 14565441
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  14565155 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 14565254  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||||| |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  14565255 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 14565354  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  14565355 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcat 14565441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22062198 - 22061880
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  22062198 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 22062099  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||| ||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| ||   ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22062098 ttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 22061999  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |   ||||||    
T  22061998 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctgatcatc 22061899  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
    || |||||||| |||||||    
T  22061898 ttgactttctctgtagtct 22061880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31417257 - 31416920
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||      
T  31417257 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaag 31417158  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| ||||| || |||| ||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  31417157 caactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 31417058  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || | |||| ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31417057 cataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 31416958  T
Q  321 a--ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 358  Q
    |  ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  31416957 accttttccctt--atcatcttgactttctcagtagtctg 31416920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Original strand, 6603671 - 6603992
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  6603671 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 6603770  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||| ||| || || || ||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| ||    
T  6603771 ctgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 6603870  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  6603871 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 6603970  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  6603971 aacctgactttctcagtagtct 6603992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571282
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || | ||| || || |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| |  ||||| ||| |||||||||||||  | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 31571290  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  31571289 tcctgaac 31571282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 360
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949257
Alignment:
Q  261 aactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 360  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303908
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  | |||| ||| || || |||||||| | ||| || |   | |||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||| ||||  |||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcat 29303908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265127
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||| |   ||||| ||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 299 - 377
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18856931
Alignment:
Q  299 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18856931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21197090 - 21196960
Alignment:
Q  216 ccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 315  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||| || || ||| | |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||| | || | |||||| ||||    
T  21197090 ccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcctctgccaactctgagacg 21196991  T
Q  316 ctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21196990 ctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 21196960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 28982370 - 28982632
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  28982370 atcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 28982469  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||| ||| || || |||||||| |  ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||||  |||||||| ||    
T  28982470 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccct 28982569  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactctt 298  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  28982570 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 28987590 - 28987852
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  28987590 atcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 28987689  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||| ||| || || |||||||| |  ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||||  |||||||| ||    
T  28987690 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccct 28987789  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactctt 298  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  28987790 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 12304756 - 12305057
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  12304756 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 12304855  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  |  |||| || || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  12304856 caactctatatgccactgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgt 12304955  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| || | ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12304956 caaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 12305055  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  12305056 at 12305057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051162
Alignment:
Q  178 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcct 277  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| || || || || ||||||||||||||  | |||||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  278 gcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22051118 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 22051162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877556
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||   |||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16877556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652780
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| |||||| || | ||||||||||| || || || ||  |||||||||| | ||| || || |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtct 20652780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 377
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040213
Alignment:
Q  326 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22040213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315511
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||||||||    ||||| || |||||| | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 22315511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Original strand, 27347239 - 27347436
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||    
T  27347239 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgcca 27347338  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgact 233  Q
    |  | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||    
T  27347339 ctgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850798
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||    ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||| | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 21850798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982756
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||    |||||| ||||| || | ||||| |||||| | || || ||  | |||||||||| |||||| |  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaac 22982756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24818237 - 24818054
Alignment:
Q  183 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgct 282  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||  |  | ||||| |||||||| || ||| |  |||||||||||  ||||||||| | ||    
T  24818237 gtcaacttcctacacttcaaagcacgttcgacaccggtcacgaggttcactcttaaaaacacatgatcttcaacttgaaactcagtatctttccttctct 24818138  T
Q  283 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaa 366  Q
     |||||| |||||||| |  | |||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| || |  |||||||| |||||||    
T  24818137 catcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttatgtagtctgttgaacaa 24818054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863404
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcat 288  Q
    ||||| ||||||||||||||    || || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |    |||||| |  |||||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19863322  T
Q  289 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||| ||||| ||||||| || || || || || |||||||||||||||||    
T  19863323 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctc 19863404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19868041
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcat 288  Q
    ||||| ||||||||||||||    || || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |    |||||| |  |||||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19867959  T
Q  289 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||| ||||| ||||||| || || || || || |||||||||||||||||    
T  19867960 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctc 19868041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 343
Target Start/End: Original strand, 22283229 - 22283316
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  | |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  22283229 cttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataactcttctacctactctgagacactctcattttctcctgaatcatcttaac 22283316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 22179341 - 22179309
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22179341 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 22179309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23157534 - 23157472
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||||||| | | || | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23157534 cttatcatgataactcctctatctattctgagatgctttcatattctcttgaatcatcttaac 23157472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 349
Target Start/End: Original strand, 25282339 - 25282457
Alignment:
Q  231 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 330  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  || ||||| | ||||| |||||||||||| || | |||| | ||| || |||| |||||||    
T  25282339 actctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcgatgtccttcctcctcttattatgataactcttctgcctactccgagacactctcatcttctctt 25282438  T
Q  331 gaatcatcttaactttctc 349  Q
    |||| |||||||| |||||    
T  25282439 gaatgatcttaaccttctc 25282457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16355169
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttc 16355226  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16355225 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16252525 - 16252169
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16252525 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatc 16252426  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16252425 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16252326  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16252325 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttt 16252226  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16252225 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctctggtcct 16252169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18227526 - 18227177
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18227526 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatc 18227427  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  18227426 ccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18227327  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227326 cacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18227227  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18227226 attttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtcttctgaacaatctc 18227177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 12523608 - 12523964
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12523608 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 12523707  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  12523708 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12523807  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12523907  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12523908 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 12523964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 14680499 - 14680855
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680499 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14680598  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  14680599 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14680698  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680699 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 14680798  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14680799 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 14680855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 54 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149740
Alignment:
Q  54 ggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  154 atatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 253  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  254 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagta 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaata 15149754  T
Q  354 gtctgctgaacaat 367  Q
    ||||||||||||||    
T  15149753 gtctgctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 7090365 - 7090720
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7090365 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 7090464  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||    
T  7090465 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgagc-aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagt 7090563  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7090564 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttc 7090663  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7090664 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 7090720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 23955679 - 23956035
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  23955679 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 23955778  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23955779 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23955878  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955879 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23955978  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23955979 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 23956035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 12476532 - 12476888
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12476532 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 12476631  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  12476632 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 12476731  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12476732 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 12476831  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12476832 attttctcttggatcatctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 12476888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 18297137 - 18297493
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18297137 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 18297236  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  18297237 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 18297336  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18297337 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 18297436  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18297437 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18297493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778517
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19778574  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19778573 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19778517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 8386344 - 8386700
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8386344 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8386443  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  8386444 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8386543  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8386544 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 8386643  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8386644 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 8386700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14304057 - 14303702
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14304057 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14303958  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  14303957 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 14303859  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14303858 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 14303759  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14303758 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 14303702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 27711268 - 27711624
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  27711268 acatcgtcactttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27711367  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  27711368 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27711467  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27711468 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27711567  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27711568 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27711624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652583
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14652539  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14652540 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 14652583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29039484 - 29039128
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  29039484 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 29039385  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  29039384 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 29039285  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29039284 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 29039185  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29039184 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 29039128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 40472972 - 40473321
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  40472972 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 40473071  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||| | | |||||||||||| ||||||||||   |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  40473072 ccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 40473171  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40473172 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 40473271  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40473272 attttctcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 40473321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266623
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14266680  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||   ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14266679 attttctctcagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 14266623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159773
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||  ||||| |||||||  ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 14159723  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  14159724 atcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctc 14159773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14851090
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14851147  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||| ||||    
T  14851146 atcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttctggtcct 14851090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8053703 - 8053347
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  8053703 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 8053604  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| || || |||| | | ||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  8053603 ccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8053504  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053503 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8053404  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8053403 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 8053347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Original strand, 15364318 - 15364583
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15364318 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15364417  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15364418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15364517  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatc 286  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  15364518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003361
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||   ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15003387  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  15003386 ttgactttctccgtagtctgatgaac 15003361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14927339 - 14927150
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14927339 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14927240  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtt 210  Q
    ||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14927239 ccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgtt 14927150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 224 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676427
Alignment:
Q  224 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  324 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16676427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 15070345 - 15070688
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15070345 acatcatctcttggaatcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15070444  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| |  || |||||  | |||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  ||||    ||||| ||    
T  15070445 ccaccctgtatgccactgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgt 15070544  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15070545 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 15070644  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15070645 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 15070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3265119 - 3264798
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  3265119 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 3265020  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  3265019 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 3264920  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  3264919 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 3264820  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  3264819 aacctgactttctcagtagtct 3264798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11207556 - 11207235
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  11207556 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 11207457  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||    
T  11207456 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 11207357  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  11207356 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 11207257  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  11207256 aacctgactttctcagtagtct 11207235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146187
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    |||| |    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcacc 16146161  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  16146162 ttgactttctccgtagtctgatgaac 16146187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640156
Alignment:
Q  233 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 332  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttga 1640194  T
Q  333 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1640193 atcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 1640156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1649617 - 1649316
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  1649617 acatcatcccttggaattacatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacc 1649518  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||  || || ||||||||||| | |||||| ||  | | |||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||    
T  1649517 caactctatatgccacagttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgt 1649418  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||| | ||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1649417 cataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttc 1649318  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  1649317 at 1649316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29453862 - 29453541
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  29453862 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 29453763  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| ||    
T  29453762 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 29453663  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  29453662 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 29453563  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  29453562 aaccttactttctcagtagtct 29453541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15415167 - 15415059
Alignment:
Q  220 tcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttt 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15415167 tcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttt 15415068  T
Q  320 cattttctc 328  Q
    ||| |||||    
T  15415067 catcttctc 15415059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 15245874 - 15246199
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| || | |||||  || |||||      
T  15245874 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgccactg 15245973  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || | ||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| ||| || |||||||     
T  15245974 ttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcag 15246073  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || ||||| || ||||||||||   | ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  15246074 aaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15246173  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||  |||||||| |||||    
T  15246174 tttaccttcttcgtagtctgatgaac 15246199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18607910 - 18607823
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagat 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18607910 acatcttcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891215
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||  | ||| ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaa-cccatcctatatgcca 20891028  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  | ||||| || || || |||||||| |||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 20891215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 355
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223184
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  | |||||||| |  || |||||||| | |||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    |||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 33223164  T
Q  336 atcttaactttctcagtagt 355  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  33223165 aacttgactttctcagtagt 33223184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 44662206 - 44661870
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  44662206 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 44662107  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | |||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  |||||    ||||| ||    
T  44662106 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgt 44662007  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44662006 caaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 44661907  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  44661906 atcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 44661870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606178
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || | ||| || || |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||  | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 51606186  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  51606185 tcctgaac 51606178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Original strand, 27900477 - 27900654
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||  |||| |||||| || |||| ||| || || || || || ||||||||||| |||||||| |    
T  27900477 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctac 27900576  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  27900577 gcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 27900654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15359271 - 15359087
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||  ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || |    
T  15359271 ggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 15359172  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15359171 gcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagtctgatgaac 15359087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445230
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || |||||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16445230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 343
Target Start/End: Original strand, 13247812 - 13247899
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13247812 cttgaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 13247899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293175
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || ||| |||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 15293175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9849683 - 9849473
Alignment:
Q  156 atctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 255  Q
    |||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||| |||||  |    |||||||||||||  || |||||      
T  9849683 atctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccga 9849584  T
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    ||||||| |||| ||| |||||  | ||||||||| ||||||| |  | ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||    
T  9849583 cttgaaattcaatatccttcctctgtttatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttctccatagt 9849484  T
Q  356 ctgctgaacaa 366  Q
    |||||||||||    
T  9849483 ctgctgaacaa 9849473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 55375506 - 55375376
Alignment:
Q  213 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 312  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  55375506 acaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgag 55375407  T
Q  313 acgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  55375406 acgctttcatcttctactgaatcatcttaac 55375376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132413
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| || | || ||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||| || | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 12132413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415209
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatac 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||| ||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactctatac 15415209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 322
Target Start/End: Original strand, 16752682 - 16752826
Alignment:
Q  178 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcct 277  Q
    ||||||| |||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||||||  | || ||    
T  16752682 tcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttct 16752781  T
Q  278 gcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16752782 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 16752826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997570
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaac 14997570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703082
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || | ||| || || |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||  | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 42703070  T
Q  257 ttgaaactcaag 268  Q
    ||||||||||||    
T  42703071 ttgaaactcaag 42703082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 9291004 - 9291089
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9291004 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 9291089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164343
Alignment:
Q  76 acacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaa 175  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  176 tctcggagtcaacttctttgacttcaaagcac 207  Q
      | ||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcac 18164343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 367
Target Start/End: Original strand, 8706078 - 8706196
Alignment:
Q  249 tctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttct 348  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||   || | ||||||||| |    
T  8706078 tctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaacttttt 8706177  T
Q  349 cagtagtctgctgaacaat 367  Q
    |  ||||||| ||||||||    
T  8706178 ctatagtctggtgaacaat 8706196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 364
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15077910
Alignment:
Q  279 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 15077910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18550151 - 18550049
Alignment:
Q  272 tttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat--tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 369  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||||  | ||||| ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||    
T  18550151 tttccttcgcttatcatgatagctcttttgtctattttgtgatgctttcattctctctctcgaatcattttgactttttctgtcgtctgctgaacaatct 18550052  T
Q  370 ctg 372  Q
    |||    
T  18550051 ctg 18550049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12342966 - 12342881
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||| || | |||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  12342966 tgaaactcaatattcttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaac 12342881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 357
Target Start/End: Original strand, 16685446 - 16685522
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||||||||||||| | || || | |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  16685446 cttatcatgataaattttctgcctactctgagacgctctcatcttctcctgaatcatcttaactttcttcgtagtct 16685522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15359397 - 15359326
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatca 92  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15359397 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15351966 - 15351934
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15351966 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14679
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14323 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14422  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  14423 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 14522  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14523 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14622  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14623 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 14679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 583 - 939
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  583 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 682  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||| | || |||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  683 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 782  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  783 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 882  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  883 attttctcttggatcatctgaactttcttactagtctgctgaacaatctctggtcct 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 65369 - 65724
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  65369 acatcatcactt-ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 65467  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||    
T  65468 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagt 65567  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65568 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 65667  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  65668 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 65724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39924
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  221 cacaggagt 229  Q
    |||||||||    
T  39932 cacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 279 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39904 - 39806
Alignment:
Q  279 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39904 cgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 39806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17665 - 17319
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17665 acatcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17566  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  17565 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17466  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17465 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 17366  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17365 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 17319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11553451 - 11553095
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11553451 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 11553352  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  11553351 ccactcgataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 11553252  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11553251 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 11553152  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11553151 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 11553095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 12687422 - 12687778
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12687422 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 12687521  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  12687522 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12687621  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687622 cataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12687721  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  12687722 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttggacaatctctggtcct 12687778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 14954541 - 14954897
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14954541 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14954640  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
     ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  14954641 tcactcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14954740  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954741 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14954840  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14954841 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctggacaatctctggtcct 14954897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Original strand, 14037728 - 14038079
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14037728 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14037827  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    ||||||||    
T  14037828 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14037927  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14037928 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14038027  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  14038028 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctg 14038079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Original strand, 14347758 - 14348109
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14347758 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14347857  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    ||||||||    
T  14347858 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14347957  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14347958 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14348057  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  14348058 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctg 14348109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15155001 - 15154652
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15155001 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaac 15154902  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15154901 ccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15154802  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  15154801 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttc 15154702  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15154701 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15154652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 8707526 - 8707882
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8707526 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8707625  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  8707626 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8707725  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707726 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8707825  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  8707826 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 8707882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15161406 - 15161050
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15161406 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15161307  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15161306 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15161207  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161206 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15161107  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15161106 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15161050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18552107 - 18551751
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  18552107 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 18552008  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  18552007 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 18551908  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551907 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18551808  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18551807 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18551751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 8198549 - 8198905
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8198549 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8198648  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  8198649 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8198748  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8198749 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 8198848  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8198849 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 8198905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 14332318 - 14332674
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14332318 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 14332417  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  14332418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 14332517  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14332617  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14332618 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 14332674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 18177663 - 18178019
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18177663 acatcgtcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 18177762  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18177763 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagt 18177862  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18177863 tataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 18177962  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18177963 attttctctcgaatcatctaaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18178019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11237562 - 11237206
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11237562 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 11237463  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  11237462 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 11237363  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11237362 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 11237263  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11237262 attctctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 11237206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871272
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 10871215  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10871216 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10871272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 13685984 - 13686341
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaa-catcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaat 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||  |||||     
T  13685984 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaa 13686083  T
Q  120 cccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccag 219  Q
    |||||||| || |||||| | |||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  13686084 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 13686183  T
Q  220 tcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttt 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13686184 tcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgcttt 13686283  T
Q  320 cattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13686284 cattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 13686341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44791700 - 44791344
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  44791700 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 44791601  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  44791600 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44791501  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44791500 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 44791401  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44791400 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 44791344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516768
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttc 23516819  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 371  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23516818 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctct 23516768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 366
Target Start/End: Original strand, 15203800 - 15204145
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15203800 acatcatctctttcgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15203899  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||| | ||| | |||| |||||| |  ||||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    ||||||||    
T  15203900 ccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagt 15203999  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204000 cacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15204099  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaa 366  Q
    || || || || |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15204100 atcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagtttgctgaacaa 15204145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 87 - 364
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624816
Alignment:
Q  87 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  187 acttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatc 286  Q
    | ||| |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  287 atgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||| || |||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaac 15624816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12207127 - 12206784
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  12207127 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 12207028  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| ||| |||||  |  ||||||| || |||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||    ||||| ||    
T  12207027 ccactctatatgccactgttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgt 12206928  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12206927 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12206828  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||  ||||  || || || || ||||||||||||||    
T  12206827 atcttctcttttatcaatttgaccttttctgtagtctgctgaac 12206784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15102910 - 15102586
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  15102910 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15102811  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15102810 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaa 15102711  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||    
T  15102710 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatc 15102611  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaa 363  Q
    || |||||||| |||||||| ||||    
T  15102610 ttgactttctctgtagtctgatgaa 15102586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 19147133 - 19147476
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| || |    
T  19147133 acatcatctcttagaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19147232  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
     |||||  || |||||  | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  19147233 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 19147332  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19147333 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 19147432  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  19147433 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 19147476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 20746532 - 20746875
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| || |    
T  20746532 acatcatctcttagaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 20746631  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
     |||||  || |||||  | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  20746632 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 20746731  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20746732 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 20746831  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  20746832 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 20746875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14264553 - 14264270
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  14264553 acatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 14264454  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| ||||||||||||||     
T  14264453 ttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcag 14264354  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14264353 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14264270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388412
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   |||| |    
T  11388536 gaacacatgatctcc-tcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 11388438  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  11388437 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 11388412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072320
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    | |||||      
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 16072320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Original strand, 21661885 - 21662233
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  21661885 acatcatctcttggaatcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaac 21661984  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||   |||||| |||   |||||||||| ||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |  |||||||| || |  || |||   ||||| ||    
T  21661985 ccacgttatacgcaaccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggt 21662084  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
     | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21662085 aagaggggtgactctcaaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttc 21662181  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || |||  ||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  21662182 atcttttctctaatcaacttaacattttcattagtctgttgaacaatgtctg 21662233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Original strand, 49152238 - 49152559
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  49152238 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 49152337  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  49152338 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 49152437  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  49152438 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 49152537  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  49152538 aacctgactttctcagtagtct 49152559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212154
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || |||||      
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    |||||||||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 8212154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35965007 - 35964848
Alignment:
Q  213 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35965007 acactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgcg 35964908  T
Q  313 acgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    |||| ||||| || |||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  35964907 acgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctg 35964848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11306575 - 11306289
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  11306575 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11306476  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  11306475 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 11306376  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11306375 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11306289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 377
Target Start/End: Original strand, 9596234 - 9596334
Alignment:
Q  277 tgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcc 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  9596234 tgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcc 9596333  T
Q  377 t 377  Q
    |    
T  9596334 t 9596334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 13665475 - 13665813
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  13665475 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 13665574  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| ||||| || |||||||| |      | ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||    ||||| ||    
T  13665575 caactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgt 13665669  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13665670 cataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 13665769  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  13665770 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtttgatgaac 13665813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Original strand, 13021279 - 13021615
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  13021279 acatcatctcttggaatcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 13021378  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || || |||||||| | |||||||||  | |||||| ||||| | |||||||| |||||||| || || ||    
T  13021379 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgt 13021478  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || ||||||||||| ||  | ||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13021479 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 13021578  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || || ||    |||||||| || |||||||||||||    
T  13021579 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtct 13021615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 249 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11772362 - 11772244
Alignment:
Q  249 tctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttct 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  11772362 tctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttct 11772263  T
Q  349 cagtagtctgctgaacaat 367  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  11772262 cagtagtttgttgaacaat 11772244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950455
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || || |||| ||| |||||  | ||||| ||||| || |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
     ||||||||| |  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||    |||||||| |||||||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtc 16950463  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  16950462 tgatgaac 16950455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053937
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || | ||| || || |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| |  ||||| ||  |||||||||||||  | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 18053945  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  18053944 tcctgaac 18053937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 6413469 - 6413776
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| || || || |    
T  6413469 acatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaa 6413568  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||  |||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || |||| |||||| || || || ||    
T  6413569 tctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctc 6413668  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
     ||||||||||   | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    |||||||| |||||||||||||||    
T  6413669 ctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtc 6413768  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  6413769 tgatgaac 6413776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286360
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||  || |  || |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    |||||||   |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| |   ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  257 ttgaaactcaa-gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
     |||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||    |||||||| || |||||||| ||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtcttt-ctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgt 14286369  T
Q  356 ctgctgaac 364  Q
    ||| |||||    
T  14286368 ctgatgaac 14286360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Original strand, 14129813 - 14130096
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||| |     
T  14129813 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcg 14129912  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||  || ||  | |||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||  ||||  ||||| ||||| ||    
T  14129913 ttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaa 14130012  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14130013 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 14130096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Original strand, 14433631 - 14433914
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||| |     
T  14433631 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcg 14433730  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||  || ||  | |||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||  ||||  ||||| ||||| ||    
T  14433731 ttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaa 14433830  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14433831 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 14433914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440185
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||   |||||||||| |||  | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 4440185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12254387 - 12254326
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12254387 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199763
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| | || | | || |  || || || |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 328  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505890
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| | || | | || |  || || || |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 328  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23505890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Original strand, 12455625 - 12455960
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  12455625 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaac 12455723  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | | || ||| |||||  | | |||||| || || ||||||||   |||||| ||  | ||| |||||||| | |||||||| |||| |   ||||| ||    
T  12455724 caattctataagccactgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgt 12455823  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||| ||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12455824 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 12455923  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || || ||    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  12455924 atcttttcccttatcaccttgactttctcagtagtct 12455960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936590
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||||||||    |||||||||||| || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 14936590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674562
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||   | |||| ||||| |  | |||||||||||||| || || ||  ||||||| ||||  || ||||| |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctta 341  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21674623 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatctta 21674562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26118813 - 26118596
Alignment:
Q  140 accaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaa 239  Q
    ||||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | ||||||| ||||||    ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  26118813 accaactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaga 26118714  T
Q  240 aacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat--tttctcttgaatcat 337  Q
    || || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||     
T  26118713 aaaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctctt--atcaa 26118616  T
Q  338 cttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  26118615 cctgactttctcagtagtct 26118596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288063
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | | ||| ||||| || |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || |||   ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctc 26288128  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| || ||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26288127 ctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcat 26288063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Original strand, 7824019 - 7824143
Alignment:
Q  219 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  7824019 gtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgcct 7824118  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  7824119 tcatcttctcctgaatcatcttaac 7824143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12368715 - 12368603
Alignment:
Q  231 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 330  Q
    ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  12368715 actctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctctt 12368616  T
Q  331 gaatcatcttaac 343  Q
    | |||||||||||    
T  12368615 ggatcatcttaac 12368603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27107925 - 27107801
Alignment:
Q  219 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  27107925 gtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgcct 27107826  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  27107825 tcatcttctcctgaatcatcttaac 27107801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1391
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||   | ||||| |||||  | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    |||||||   |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| || ||| ||| ||| ||| || || || || ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
     |||||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||    |||||||| || ||||||||||||    
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtc 1399  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  1398 tgatgaac 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 357
Target Start/End: Original strand, 17923862 - 17923938
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17923862 cttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 17923938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364183
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||||||||    ||||| |||||| || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 15364183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26118911 - 26118817
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgg 115  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  26118911 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgg 26118817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15479465 - 15479321
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15479465 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15479366  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatg 165  Q
    | | || |||||||||  | |||||||| || || ||||||||||    
T  15479365 caattctatacgccacagttccaactctctcagagatctgatatg 15479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41144
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcat 288  Q
    ||||| |||||||||||||||   || || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |  | ||| || || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  289 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    |||| ||||| |||| | | || || |||||||||| |||  ||||| | || || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctg 41144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 365
Target Start/End: Original strand, 5764588 - 5764758
Alignment:
Q  195 gacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataac 294  Q
    |||||||||||||| |  || ||  |||| ||||||||||| |||||||| || || | | ||||||| || |  |  ||||| |||||| |||||||||    
T  5764588 gacttcaaagcacgatcaacgcccatcactggagtgactctaaaaaacacatgatcccgtacttgaaattccaattacttccttcgcttaccatgataac 5764687  T
Q  295 tcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaaca 365  Q
    |||| || |   | ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5764688 tcttctgcctgatttgcgatgccttcatcctctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgttgaaca 5764758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 355
Target Start/End: Original strand, 12193737 - 12193811
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    |||| ||||||||||||| || | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12193737 cttaacatgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagt 12193811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17145397 - 17145288
Alignment:
Q  231 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 330  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||| || ||||    
T  17145397 actcttaaaaacacatgagctccaacttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagaagctttcatattttctt 17145298  T
Q  331 gaatcatctt 340  Q
    ||||||||||    
T  17145297 gaatcatctt 17145288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 357
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146812
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| || || | | |||||||||||| || || ||  |||||||| |||  || ||||| | ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||| | |  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  45146751 cttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtct 45146812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 137
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340534
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacc 137  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacc 15340534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 360
Target Start/End: Original strand, 20466941 - 20467041
Alignment:
Q  259 gaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 358  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || | |||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||| |||| || || ||||||||    
T  20466941 gaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataactattctgcctactctgagattctttcatcttctcctgaatcatcataacctt-tctgtagtctg 20467039  T
Q  359 ct 360  Q
    ||    
T  20467040 ct 20467041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 357
Target Start/End: Original strand, 13378879 - 13378955
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  13378879 cttatcataataacgcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 13378955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13634070 - 13634038
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13634070 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 13634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 322
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457002
Alignment:
Q  260 aaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    |||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 12457002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 357
Target Start/End: Original strand, 23641673 - 23641774
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||  |||||    
T  23641673 cttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataagtcttctgcttattctgagacgctttcatcttatcctgaatcatctgaactttcttcgtagt 23641772  T
Q  356 ct 357  Q
    ||    
T  23641773 ct 23641774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5432710 - 5432638
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 328  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| || | ||| || |||||| |||| |||||    
T  5432710 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactttgagacgctctcatcttctc 5432638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Original strand, 15340590 - 15340654
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15340590 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcat 15340654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278823
Alignment:
Q  23 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 122  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  123 actcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtca 222  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  223 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 278872  T
Q  323 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278871 tttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 278823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 308622 - 308978
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  308622 acatcgtcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 308721  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  308722 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 308821  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  308822 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 308921  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  308922 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 308978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164709
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 164753  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  164752 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 164709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 260289 - 260614
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| || |  |||| ||| ||||||     
T  260289 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgccaccg 260388  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | | ||  || || || |||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || || |||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  260389 ttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaa 260488  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||    
T  260489 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 260588  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || |||||||| ||||| |||||    
T  260589 ttgaccttctcagtcgtctgatgaac 260614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22756987
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22757044  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  22757043 atcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatctctggtcct 22756987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24708362 - 24708006
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708362 acatcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 24708263  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  24708262 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24708163  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24708162 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttc 24708063  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24708062 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctggtcct 24708006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325790
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21325847  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  21325846 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcct 21325790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 24675052 - 24675408
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24675052 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 24675151  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  24675152 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24675251  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24675252 cacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 24675351  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24675352 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 24675408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 23188571 - 23188927
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188571 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23188670  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
     |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23188671 tcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23188770  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188771 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23188870  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23188871 attttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 23188927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 16924823 - 16925179
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16924823 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16924922  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16924923 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16925022  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16925023 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 16925122  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16925123 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16925179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 16998563 - 16998919
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16998563 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16998662  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16998663 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16998762  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16998763 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 16998862  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16998863 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16998919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 24261933 - 24262289
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  24261933 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 24262032  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||| |||||   |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  24262033 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24262132  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262133 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24262232  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24262233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24262289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 16981715 - 16982071
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16981715 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16981814  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16981815 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16981914  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16981915 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 16982014  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16982015 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16982071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 17063280 - 17063636
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17063280 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17063379  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  17063380 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17063479  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17063480 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 17063579  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17063580 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17063636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 24709596 - 24709952
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||| ||||| |    
T  24709596 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaac 24709695  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  24709696 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24709795  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709796 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24709895  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24709896 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24709952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145562
Alignment:
Q  27 tcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 126  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  127 gatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacagg 226  Q
    |||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||   | |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  227 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 21145605  T
Q  327 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21145604 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctggacaatct 21145562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 9609699 - 9610055
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  9609699 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 9609798  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  9609799 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 9609898  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9609899 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 9609998  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9609999 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 9610055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 45 - 377
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063996
Alignment:
Q  45 gatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaa 144  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  145 ctctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacac 244  Q
    ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  245 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaact 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacc 23063963  T
Q  345 ttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||    
T  23063964 ttctcggtagtttgttcaacaatctctggtcct 23063996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24878875 - 24878519
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24878875 acatcgtcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 24878776  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||| | || |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  24878775 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 24878676  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878675 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24878576  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24878575 attttctcttgaatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24878519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 27370832 - 27371188
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| |||||      
T  27370832 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaat 27370931  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  27370932 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagt 27371031  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27371032 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 27371131  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27371132 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27371188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22325736 - 22325385
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  22325736 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 22325637  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||    
T  22325636 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22325537  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22325536 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22325437  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22325436 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 22325385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 10868413 - 10868769
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10868413 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 10868512  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||  | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  10868513 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10868612  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  10868613 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttc 10868712  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10868713 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10868769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 27217579 - 27217935
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27217579 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27217678  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  27217679 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 27217778  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27217779 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27217878  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27217879 attttctcttgtatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctggtcct 27217935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44386093
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 44386150  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44386149 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 44386093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 332
Target Start/End: Original strand, 23138600 - 23138911
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23138600 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23138699  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  23138700 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23138799  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138800 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23138899  T
Q  321 attttctcttga 332  Q
    || || ||||||    
T  23138900 atcttttcttga 23138911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 332
Target Start/End: Original strand, 23550390 - 23550701
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23550390 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23550489  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  23550490 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23550589  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550590 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23550689  T
Q  321 attttctcttga 332  Q
    || || ||||||    
T  23550690 atcttttcttga 23550701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27377351 - 27377087
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377351 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 27377252  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  27377251 caacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 27377152  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27377151 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcccgcgcttat 27377087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 17066941 - 17067294
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  17066941 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaag-tgcgacacatgaaaaacgt-gtgc-aattcgaaagatgcggcggtaaac 17067037  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||||  | |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  17067038 ccactcgtaaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17067137  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17067138 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 17067237  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17067238 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17067294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 120 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24826063 - 24825811
Alignment:
Q  120 cccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccag 219  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||    
T  24826063 cccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccag 24825964  T
Q  220 tcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttt 319  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24825963 tcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgcttt 24825864  T
Q  320 cattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24825863 catcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctg 24825811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087321
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
     ||||| |||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||    ||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || || | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 23087312  T
Q  321 attttctct 329  Q
    || ||||||    
T  23087313 atcttctct 23087321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30211797 - 30211455
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  30211797 acatcatctcttggaatcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaac 30211698  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||  |||||| |||   |||||| ||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||  |||||||| || |  || |||   ||||| ||    
T  30211697 ccactttatacgcaaccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggt 30211598  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30211597 cacatgggtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttc 30211498  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 363  Q
    || || |||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  30211497 atcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaa 30211455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 367
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529420
Alignment:
Q  41 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacctta 140  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |     
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  141 ccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  241 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctt 340  Q
    |||| |||      |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||  ||||| |||    
T  45529300 acacatgg------tcttcaaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaactt 45529393  T
Q  341 aactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  45529394 aaccttcttagtagtctgttgaacaat 45529420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365658
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    |||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 27365658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Original strand, 31830236 - 31830557
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  31830236 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 31830335  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||    
T  31830336 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 31830435  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  31830436 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 31830535  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  31830536 aacctgactttctcagtagtct 31830557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11358754 - 11358418
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  11358754 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11358655  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  |||||||| | || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||    ||||| ||    
T  11358654 caactctatatgccactgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgt 11358555  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11358554 caaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 11358455  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  11358454 atcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 11358418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 23293521 - 23293864
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||  ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || |    
T  23293521 acatcatatctttgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaac 23293620  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  23293621 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 23293720  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23293721 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttc 23293820  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || |||   |||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  23293821 atcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctgatgaac 23293864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 23276357 - 23276682
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  23276357 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23276456  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || |||||||||||||| | |||||| ||  | |||||| ||||  | |||||||| ||||||   |||||  ||| |||||| | |||||     
T  23276457 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcag 23276556  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  23276557 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 23276656  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
     | |||||||| |||||||| |||||    
T  23276657 atgactttctccgtagtctgatgaac 23276682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgact 198  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||| | |||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 20832563 - 20832849
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  20832563 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20832662  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| ||    
T  20832663 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20832762  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  20832763 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcat 20832849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Original strand, 1063329 - 1063650
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||| ||| ||||    
T  1063329 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgcca 1063428  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||| ||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| ||    ||||| |||| ||||||||| ||    
T  1063429 cagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 1063528  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||   |||    
T  1063529 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatc 1063628  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  1063629 aaccttactttctcagtagtct 1063650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787647
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || | ||| || || |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||  | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||| || ||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtc 27787639  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  27787640 tcctgaac 27787647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24833453 - 24833356
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 118  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24833453 acatcatctcttcgaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaa 24833356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 281 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574259
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | ||||  || || || |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  || || || || | ||| || || || || ||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctc 12574151  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  12574152 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 12574251  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  12574252 tcctgaac 12574259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 24653908 - 24654185
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  24653908 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24654007  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | |||||  |  | || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| ||   ||||| ||    
T  24654008 caactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgt 24654107  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactctt 298  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24654108 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640477
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||   |||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 12640477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 357
Target Start/End: Original strand, 25128402 - 25128546
Alignment:
Q  213 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 312  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| |  | ||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  25128402 acaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactcttctgtctactctgag 25128501  T
Q  313 acgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25128502 atgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 25128546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276164
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||    ||||| ||||||||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 22276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831745
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||| | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaac 24831745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22762274 - 22762127
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||| || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||    
T  22762274 acttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataact 22762175  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    ||| |  | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22762174 cttcttcctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaac 22762127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 23599834 - 23599877
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599834 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23817672 - 23817597
Alignment:
Q  282 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23817672 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggatcatcttaactttttccgtagtct 23817597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945118
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| || |  || |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 209  Q
    ||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgt 24945118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 45676729 - 45676685
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttc 65  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676729 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24570311 - 24570212
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| | || |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  24570311 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtct 24570212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Original strand, 14708900 - 14708972
Alignment:
Q  271 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||| ||||  || |||||||||||    
T  14708900 ctttcctccgcttatcatgataactcttctgtctactccacgatgctttcatcttcttctggatcatcttaac 14708972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967577
Alignment:
Q  42 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatg 17967577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17045427 - 17045071
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045427 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17045328  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||    
T  17045327 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggt 17045228  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045227 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17045128  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17045127 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 17045071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 19106314 - 19106670
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19106314 acatcgtcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 19106413  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  19106414 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagt 19106513  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106514 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19106613  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19106614 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19106670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16079045 - 16078708
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16079045 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16078946  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  16078945 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16078846  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078845 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc-------------------ttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16078765  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16078764 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16078708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 20136725 - 20137081
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20136725 acatcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaac 20136824  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  20136825 caacacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 20136924  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20136925 cacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 20137024  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20137025 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 20137081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 20249797 - 20250153
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20249797 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 20249896  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||    
T  20249897 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagt 20249996  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249997 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 20250096  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  20250097 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacgatctctggtcct 20250153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 21747482 - 21747837
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21747482 acatcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 21747581  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  21747582 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 21747681  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747682 cacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatcttt-ctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21747780  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21747781 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 21747837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33391441 - 33391085
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  33391441 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 33391342  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  33391341 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 33391242  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391241 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 33391142  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33391141 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 33391085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50620656 - 50620307
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50620656 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50620557  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  50620556 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50620457  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50620456 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 50620357  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  50620356 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacaatctc 50620307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 21830250 - 21830606
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21830250 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 21830349  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  21830350 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21830449  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830450 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21830549  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21830550 attttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 21830606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 39 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16350993 - 16350655
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||     
T  16350993 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16350894  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16350893 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16350794  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16350793 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 16350694  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  16350693 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 16350655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 51333905 - 51333549
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  51333905 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 51333806  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  51333805 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 51333706  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51333705 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 51333606  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51333605 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 51333549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 21836897 - 21837253
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  21836897 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 21836996  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  21836997 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21837096  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21837097 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttc 21837196  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21837197 attttctcttggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 21837253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354525
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 41354582  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  41354581 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcct 41354525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19760935
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 19760979  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19760978 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaac 19760935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 377
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369600
Alignment:
Q  44 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttacca 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| | |||    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  144 actctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaaca 243  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  244 cgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    | || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttac 16369566  T
Q  344 tttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
     || ||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  16369567 cttttcaatagtttgttgaacaatctctggtcct 16369600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 50612828 - 50612602
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50612828 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50612729  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  50612728 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50612629  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50612628 cacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664945
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   || || |||| |||||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19664971  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  19664970 ttgactttctctgtagtctgatgaac 19664945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163381
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaa 175  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940147
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| || || ||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 349  Q
     |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||||||| ||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 20940147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 19854261 - 19854604
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  19854261 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaac 19854360  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || || ||||||||   |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || ||    ||||| ||    
T  19854361 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgt 19854460  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19854461 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttc 19854560  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19854561 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 19854604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20857173 - 20856839
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  20857173 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 20857074  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| |||||||||  | ||||||||||| || ||||| || | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  20857073 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 20856974  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20856973 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttc 20856874  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    || |||||   ||||||||| |||||||| |||||    
T  20856873 atcttctccctaatcatcttgactttctccgtagt 20856839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 20294359 - 20294660
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  20294359 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 20294458  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  |||||||||| || || |||||||||| |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||||   ||||| ||    
T  20294459 caactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 20294558  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20294559 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 20294658  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  20294659 at 20294660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Original strand, 37677041 - 37677328
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||    
T  37677041 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 37677140  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  |||||||||| || || |||||||| | |||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  37677141 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 37677240  T
Q  236 caa-aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||| ||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37677241 caagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 37677328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31550593 - 31550292
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  31550593 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31550494  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||  || |||||  |||||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| ||    ||||| ||    
T  31550493 caactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgt 31550394  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  31550393 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttc 31550294  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  31550293 at 31550292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22433510 - 22433192
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  22433510 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 22433411  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    |  |||| || || || |||||||| ||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22433410 ttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22433311  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
     ||||| || || || || |||||||||||    || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  22433310 gaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 22433211  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||| || |||||||    
T  22433210 ttaactttttctgtagtct 22433192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 364
Target Start/End: Original strand, 41307904 - 41308115
Alignment:
Q  153 gatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctc 252  Q
    ||||||||||| | |||||||||  | ||||||||||| || |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || |||| |||||| |||||||    
T  41307904 gatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctc 41308003  T
Q  253 cttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagt 352  Q
    | ||||||||||||||    || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   || || || |||||||| ||    
T  41308004 cctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattttgactttctccgt 41308103  T
Q  353 agtctgctgaac 364  Q
    |||||| |||||    
T  41308104 agtctgatgaac 41308115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 322
Target Start/End: Original strand, 11382676 - 11382842
Alignment:
Q  156 atctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 255  Q
    |||||||| | |||||||||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||||| ||| || || || || |    
T  11382676 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccct 11382775  T
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11382776 cctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11382842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20835957
Alignment:
Q  87 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtca 186  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | |||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  187 acttcttt---gacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgctt 283  Q
    |||||||    ||||| || | ||||   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || || | ||||| |||  | ||||  |||||    
T  20836137 acttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgctt 20836038  T
Q  284 atcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  20836037 gtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 20835957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075170
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  | || ||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     | ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcat 20075170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 311
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244437
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| || || || |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||||| ||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||| ||   ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 311  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20395390 - 20395194
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||    
T  20395390 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20395291  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgac 232  Q
    |  | |||||||| || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||| ||| | ||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||    
T  20395290 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20831606 - 20831482
Alignment:
Q  219 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  20831606 gtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgcct 20831507  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  20831506 tcatcttctcctgaatcatcttaac 20831482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518990
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||  || || ||||| ||||||||||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaac 46518990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 115
Target Start/End: Original strand, 24476942 - 24477021
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgg 115  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  24476942 atcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtgg 24477021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914493
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
      |||| |||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  20914416 atttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 20914493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22135710 - 22135645
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 346  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22135710 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaatcatcttaacttt 22135645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 348
Target Start/End: Original strand, 20184364 - 20184456
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttct 348  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| || | |||||| ||| ||  ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  20184364 cttgaaactcaatatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatcatcttcactttct 20184456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21202439 - 21202371
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 349  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21202439 cttatcatgataactcttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 21202371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 370
Target Start/End: Original strand, 12497824 - 12498171
Alignment:
Q  23 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497824 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12497923  T
Q  123 actcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtca 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||    
T  12497924 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12498023  T
Q  223 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498024 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12498123  T
Q  323 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12498124 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12498171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12511077 - 12510730
Alignment:
Q  23 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511077 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12510978  T
Q  123 actcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtca 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||    
T  12510977 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12510878  T
Q  223 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510877 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12510778  T
Q  323 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12510777 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12510730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19864839
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19864782  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19864783 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctctggtcct 19864839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 370
Target Start/End: Original strand, 12505153 - 12505500
Alignment:
Q  23 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12505153 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccc 12505252  T
Q  123 actcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtca 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||    
T  12505253 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12505352  T
Q  223 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505353 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12505452  T
Q  323 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12505453 attctcttgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaacaatctc 12505500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963496
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | || |||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16963553  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16963552 atcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 16963496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765419
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25765574 caca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 25765476  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25765475 attttctcttgaatcatctttactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 25765419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5839348
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 5839405  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5839404 attttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 5839348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21833466 - 21833172
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833466 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21833367  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  21833366 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagt 21833267  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833266 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22079173 - 22078823
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22079173 acatcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22079074  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |    
T  22079073 ccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaat 22078974  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22078973 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 22078874  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 371  Q
    || || ||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  22078873 atcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatctct 22078823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927769
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |  |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttc 16927826  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16927825 atcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 16927769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25610346 - 25609990
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  25610346 acatcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25610247  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  25610246 caacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggt 25610147  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25610146 cacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 25610047  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25610046 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 25609990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543213
Alignment:
Q  27 tcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 126  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  127 gatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacagg 226  Q
    | || |||||| | |||||||||||| ||||||||||   |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  227 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttc 1543264  T
Q  327 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1543263 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 1543213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 23078265 - 23078621
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23078265 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23078364  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||    
T  23078365 ccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagt 23078464  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23078465 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttc 23078564  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  23078565 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 23078621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24313653 - 24313297
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24313653 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 24313554  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  24313553 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24313454  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24313453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 24313354  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24313353 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24313297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16627202 - 16626846
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16627202 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 16627103  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16627102 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16627003  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627002 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16626903  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16626902 attttctcttggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctggtcct 16626846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29592405 - 29592049
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  29592405 acatcgtcgctttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 29592306  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  29592305 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 29592206  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29592205 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 29592106  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29592105 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 29592049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27331918 - 27331569
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27331918 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27331819  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||||    
T  27331818 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27331719  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27331718 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27331619  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  27331618 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27331569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27392658 - 27392309
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27392658 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27392559  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||   ||||||||    
T  27392558 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27392459  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27392458 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27392359  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  27392358 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27392309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18408428 - 18408072
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18408428 acatcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 18408329  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  18408328 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18408229  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18408228 cacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttc 18408129  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  18408128 atcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 18408072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28263326
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28263383  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28263382 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28263326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28342075
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28342132  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28342131 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28342075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187588
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27187531  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27187532 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27187588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261652
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27261709  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27261708 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27261652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2875288 - 2874932
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  2875288 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 2875189  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||  | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||    
T  2875188 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 2875089  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2875088 cataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 2874989  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2874988 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 2874932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 25112348 - 25112704
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25112348 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 25112447  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | || ||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  25112448 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 25112547  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25112548 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgcttta 25112647  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  25112648 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacgatcgctggtcct 25112704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292501
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28292558  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28292557 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28292501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22762940 - 22762584
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22762940 acatcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22762841  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  22762840 ccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 22762741  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||  |||||    
T  22762740 cacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttc 22762641  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||| ||||    
T  22762640 atcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcct 22762584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 17032358 - 17032582
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17032358 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17032457  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  17032458 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagt 17032557  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacg 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  17032558 cataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197676
Alignment:
Q  47 tggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaact 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |   || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  147 ctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgt 246  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||  |||||| |||||||| ||| ||| || |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  247 ggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 346  Q
    | | ||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || ||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttacctt 18197707  T
Q  347 ctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  18197706 ctcagtagtctgttaaacaatcgctggtcct 18197676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 21471397 - 21471698
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21471397 acatcatctcttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21471496  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||  || |||||  | |||||||| || |||||||| || | | |||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||   || || ||    
T  21471497 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgt 21471596  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21471597 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 21471696  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  21471697 at 21471698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433930
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatc 158  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 22433930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 316
Target Start/End: Original strand, 25750623 - 25750900
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  25750623 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 25750722  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||| || |||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||||||     
T  25750723 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcag 25750822  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 316  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25750823 aaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Original strand, 15459132 - 15459468
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15459132 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15459231  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| |||||||||  | ||||||||||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  15459232 ccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 15459331  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15459332 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 15459431  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || ||||||  ||||||| | |||||||| |||||||    
T  15459432 atcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtct 15459468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131363
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||| |||||  | |||||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || ||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14131363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768288
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | |||||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    |||| || | |||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 25768288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22797080 - 22796774
Alignment:
Q  58 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||  | ||||| || || |||||    
T  22797080 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 22796981  T
Q  158 ctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 257  Q
     |||||   |||||||||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||    
T  22796980 atgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 22796881  T
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||    ||||||||||| ||||| |||||||    
T  22796880 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtct 22796781  T
Q  358 gctgaac 364  Q
    | |||||    
T  22796780 gatgaac 22796774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 19879094 - 19879395
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  19879094 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaac 19879193  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| | ||| |||||  | |||||||| || |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||||    ||||| |     
T  19879194 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgc 19879293  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19879294 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttc 19879393  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  19879394 at 19879395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794787
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||      
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || |  |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 18794787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564316
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| || || || ||||||| |||||||||  | ||||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcat 21564316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34646071 - 34645770
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || || |||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34646071 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacgtacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 34645972  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | | || |||||||||  | |||||||| || |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||| || || || |||||    ||||| ||    
T  34645971 caattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgt 34645872  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34645871 cataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 34645772  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  34645771 at 34645770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11288083 - 11287782
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || | |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  11288083 acatcatctcttggaataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaac 11287984  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| | ||| |||||  | |||||||| || |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||| || || || |||||    ||||| ||    
T  11287983 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 11287884  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11287883 cataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 11287784  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  11287783 at 11287782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10469334 - 10468998
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  10469334 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaac 10469235  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  10469234 caactctatatgccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgt 10469135  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10469134 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 10469035  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  10469034 atcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 10468998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 283 - 377
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22434021
Alignment:
Q  283 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22434021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11280990 - 11280689
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || | |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  11280990 acatcatctcttggaataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaac 11280891  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| | ||| |||||  | |||||||| || |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||| ||   ||||| ||    
T  11280890 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgt 11280791  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||| |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11280790 cataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 11280691  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  11280690 at 11280689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 231 - 331
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  231 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  331 g 331  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Original strand, 24364208 - 24364544
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  24364208 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24364307  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  |||||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  |||||    ||||| ||    
T  24364308 caactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgt 24364407  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24364408 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 24364507  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  24364508 atcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 24364544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 364
Target Start/End: Original strand, 18800857 - 18801081
Alignment:
Q  140 accaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaa 239  Q
    |||||| || || ||||||||||||| |||||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  18800857 accaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcaga 18800956  T
Q  240 aacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 339  Q
    || || || || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  18800957 aatacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatct 18801056  T
Q  340 taactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    | |||||||| |||||||| |||||    
T  18801057 tgactttctccgtagtctgatgaac 18801081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 364
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415625
Alignment:
Q  104 aagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaa 203  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| |||||  | ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  204 gcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
    ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || |||||  |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  304 gactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    |||||| |||||||||||| || ||    |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 17415625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766297
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   || |  |||| || ||| || ||||     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||   ||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatc 8766316  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
    || |||||||| |||||||    
T  8766315 ttgactttctctgtagtct 8766297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560759
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | ||||  || || || |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||| || ||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtc 27560767  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  27560766 tcctgaac 27560759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 329
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640876
Alignment:
Q  168 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa 267  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||    ||||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  268 gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 329  Q
    | || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 1640876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 303
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751024
Alignment:
Q  179 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctg 278  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  279 cgcttatcatgataactcttttgtc 303  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14381832 - 14381609
Alignment:
Q  141 ccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 240  Q
    ||||| || |||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || |||| ||    
T  14381832 ccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaa 14381733  T
Q  241 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctt 340  Q
    | || || || || || |||||||||||  | || || ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||   ||||||||    
T  14381732 atacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctt 14381633  T
Q  341 aactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
     |||||||| |||||||| |||||    
T  14381632 gactttctctgtagtctgatgaac 14381609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743236
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| |||||| || |  | ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25743313 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 25743236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098168
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaac 16098168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996366
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || |||| |||| | || || ||||||||||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 23996366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16382660 - 16382536
Alignment:
Q  219 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  16382660 gtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgcct 16382561  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  16382560 tcatcttctcctgaatcatcttaac 16382536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Original strand, 1640595 - 1640710
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  1640595 acatcatctcttggaataacatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaat 1640694  T
Q  121 ccactcgatacgccac 136  Q
    |||||| ||| |||||    
T  1640695 ccactctatatgccac 1640710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 343
Target Start/End: Original strand, 18571682 - 18571769
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18571682 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaac 18571769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 346
Target Start/End: Original strand, 25655489 - 25655604
Alignment:
Q  231 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 330  Q
    |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  25655489 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctctt 25655588  T
Q  331 gaatcatcttaacttt 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  25655589 gaatcatcttaacttt 25655604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28283262 - 28282955
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| |||||| | || |  || || || |    
T  28283262 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 28283163  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| |  ||||| ||  |||||||||||||  | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  28283162 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 28283063  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  28283062 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 28282963  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    | ||||||    
T  28282962 tcctgaac 28282955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 136
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787799
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccac 136  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| ||| |||||    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgccac 18787799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18838057
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| |    ||||| ||||||||| | || | ||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  18838134 tcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 18838057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1649071 - 1648947
Alignment:
Q  219 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |    
T  1649071 gtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgcct 1648972  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||| || || ||||||||||||||    
T  1648971 tcatcttttcctgaatcatcttaac 1648947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 357
Target Start/End: Original strand, 16233203 - 16233341
Alignment:
Q  219 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |    
T  16233203 gtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgcct 16233302  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||| || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16233303 tcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtct 16233341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15078690 - 15078513
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||||||||| ||| | | ||||||||| || || || ||  | |||||||| | ||| || ||      
T  15078690 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctct 15078591  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtct 15078513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21413186 - 21413101
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||| ||| || || | ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  21413186 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaac 21413101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6333
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6276  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6277 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctctggtcct 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4392
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4748 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 4649  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  4648 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 4549  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4548 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 4449  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4448 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcct 4392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8915
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8559 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 8658  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  8659 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 8758  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8759 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 8858  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8859 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcct 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33560
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 33617  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33616 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcct 33560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 639 - 995
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  639 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagc 738  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  739 caacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 838  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  839 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 938  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  939 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 64018
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 64075  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  64074 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctggtcct 64018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 369
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6334
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5986 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 6085  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  6086 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 6185  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6186 cacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttc 6285  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  6286 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 6334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1524
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| ||||| ||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | || ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||  ||| || || ||| |  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||||  |||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtc 1532  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  1531 tgatgaac 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Original strand, 22816 - 22993
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||     ||||| |||||| || | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 22993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 681
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036 acatcaccactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 937  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  936 ccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 837  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  836 cacacgagggactctc-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 738  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  737 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 127542 - 127186
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  127542 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 127443  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  127442 ccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 127343  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  127342 cacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttc 127243  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  127242 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 127186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5540
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5184 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 5283  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||   ||||||||    
T  5284 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 5383  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5384 cacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 5483  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5484 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 5540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6691
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6335 acatcatcacctaggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 6434  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  6435 ccactcgatataccaccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 6534  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6634  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6635 atctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctctggtcct 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219404
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 219461  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||| ||||    
T  219460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcct 219404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 229006 - 229362
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  229006 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacc 229105  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  229106 ctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 229205  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
     | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229206 aataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 229305  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  229306 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 229362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33016
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||    ||||| ||||||||  | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 27 - 377
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43473
Alignment:
Q  27 tcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 126  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  127 gatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacagg 226  Q
      || |||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  227 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttc 43422  T
Q  327 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43423 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 43473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 40 - 370
Target Start/End: Original strand, 8467 - 8797
Alignment:
Q  40 catgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacctt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |    
T  8467 catgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccaccct 8566  T
Q  140 accaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaa 239  Q
     |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8567 tccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaa 8666  T
Q  240 aacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 339  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8667 aatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 8766  T
Q  340 taactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8767 gaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 224 - 358
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13966
Alignment:
Q  224 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  324 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 358  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttcttagtagtctg 13966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50556
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| | ||| |||||  | || ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 50556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 106724 - 106594
Alignment:
Q  213 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 312  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | ||||||||||||| |||| |||| |||||| |    
T  106724 acaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataaatcttatgtctactctgag 106625  T
Q  313 acgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  106624 atgctttcatcttctcctgaatcatcctaac 106594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32744
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33095 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 32996  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||    
T  32995 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagt 32896  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  32895 cacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttc 32796  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||    
T  32795 atcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttctg 32744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 21 - 371
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1452
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  1102 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 1201  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  1202 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagt 1301  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1302 cacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttc 1401  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 371  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1402 atcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctct 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 810
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||  ||||||| ||| || ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  965 cacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttcc 867  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  866 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 180180 - 180536
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  180180 acatcaacactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagc 180279  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  180280 caactcgatacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagt 180379  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180380 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 180479  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  180480 atcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctggtcct 180536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 39 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 110136 - 109798
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||     
T  110136 acatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 110037  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  110036 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 109937  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  109936 aaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatc 109837  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  109836 tgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 109798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 112522 - 112823
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  112522 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaac 112621  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||| | ||| |||||  | |||||||| || |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||| || || || |||||    ||||| ||    
T  112622 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgt 112721  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  112722 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttc 112821  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  112822 at 112823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 96327 - 96009
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || | || |||||||||      
T  96327 acatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 96228  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||||||||| || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || |||||    
T  96227 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaa 96128  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| |    
T  96127 aaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcacc 96028  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||| |||||||    
T  96027 ctaactttctccgtagtct 96009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15804
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  15456 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaac 15554  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  15555 ctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 15654  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655 cacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15754  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15755 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15967
Alignment:
Q  235 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 334  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  335 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 369
Target Start/End: Original strand, 14002 - 14350
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14002 acatcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14101  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  14102 tcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14201  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202 cacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14301  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  14302 atcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatct 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 348
Target Start/End: Original strand, 31391 - 31700
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  31391 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 31490  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||  || || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| || ||| |||||||     
T  31491 ttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcag 31590  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || | ||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  31591 aaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 31690  T
Q  339 ttaactttct 348  Q
    || |||||||    
T  31691 ttgactttct 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 273 - 377
Target Start/End: Original strand, 17657 - 17761
Alignment:
Q  273 ttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17657 ttcctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctg 17756  T
Q  373 ctcct 377  Q
     ||||    
T  17757 gtcct 17761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7689
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7340 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 7439  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  7440 ccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 7539  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7540 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 7639  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7640 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgttgaacagtctc 7689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9662
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9306 acatcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 9405  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  9406 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9505  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9506 cacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttc 9605  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| || | ||||||||||| ||||    
T  9606 atcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagtttgttaaacaatctctggtcct 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 6900 - 7258
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaga-tgcggtggtaat 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||     
T  6900 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaa 6999  T
Q  120 cccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccag 219  Q
    |||||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  7000 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 7099  T
Q  220 tcacaggagtgactctcaaaa-acacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7100 tcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 7199  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7200 tcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 7258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 377 - 733
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| || |||||  | |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 676  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  677 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4329
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 4294  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4295 atcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 26
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  325 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 226  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
     |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  225 tcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 126  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  125 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Original strand, 16950 - 17284
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16950 acatcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17049  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| | |    
T  17050 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaat 17149  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17150 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttc 17249  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    || || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17250 atcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagt 17284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16808 - 16462
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16808 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16709  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||   ||||||||    
T  16708 ccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagt 16609  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16608 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 16509  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16508 atcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaat 16462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3437
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3103 acatcatctcgttggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 3202  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||    
T  3203 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 3302  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3303 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 3402  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3403 atcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448373
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||  |||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttc 448321  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  448322 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 448373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 341
Target Start/End: Original strand, 162076 - 162396
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  162076 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 162175  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||   ||||||||    
T  162176 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagt 162275  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  162276 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 162375  T
Q  321 attttctcttgaatcatctta 341  Q
    | | | |||| ||||||||||    
T  162376 actctttcttaaatcatctta 162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90932
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || |||||  | ||||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||| ||||| || ||||||  | | |||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||  |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 90940  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  90939 tgatgaac 90932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78636
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || |||||| || | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||| || || ||||| ||||  ||||||||| |||| || || |||||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttctactgaatcatcataaccttttccgtagtct 78636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175414
Alignment:
Q  147 ctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 209  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgt 175414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26876 - 26530
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26876 acattatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaac 26777  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| |  |||  ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||   ||||||||    
T  26776 ccactcgatacgccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagt 26677  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26676 cacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 26577  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26576 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaat 26530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 196027 - 195703
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  196027 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 195928  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||  | || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || ||||     
T  195927 ttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 195828  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||   ||||||    
T  195827 aaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatc 195729  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  195728 ttgactttctctgtagtctgatgaac 195703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 148533 - 148834
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  148533 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 148632  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||  || |||||  | ||||| || ||  |||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  148633 ctactctgtatgccactgttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 148732  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || ||||  |||| |||  | || || || || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  148733 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttc 148832  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  148833 at 148834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 68765 - 68595
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  68765 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 68666  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 209  Q
    | ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  68665 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgt 68595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 121971
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaac 121971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 343
Target Start/End: Original strand, 180147 - 180209
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  180147 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaac 180209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15196
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||   ||||||||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttc 15139  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  15140 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 15196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28231
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 28229  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  28230 at 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 603 - 252
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  603 acatcgtctcttgggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 504  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  503 ccactcgatacgccaccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggt 404  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  403 tacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttc 304  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  303 atcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgtacaatttctg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22186
Alignment:
Q  123 actcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtca 222  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  223 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  323 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcct 22186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15079
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||   |||||| || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttc 15123  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  15122 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaac 15079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13320 - 12969
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||||||| |    
T  13320 acatcatctcttaggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaac 13221  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| |||||| ||| | || | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||||||    
T  13220 ccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagt 13121  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13120 cacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13021  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13020 atcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttgctgaagaatttctg 12969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 377
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8109
Alignment:
Q  122 cactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtc 221  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  222 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 321  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  322 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 8109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112327
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatc 112283  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||| |||||| |||||| |||| || |||||    
T  112284 atcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagtttgttgaac 112327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 203796 - 203510
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||    
T  203796 atcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 203697  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  | ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||     |||| |||||| ||||||||||    
T  203696 ctgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactct 203597  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  203596 tagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcat 203510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 322703 - 323010
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||   | ||||| || || ||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||||| |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtc 323002  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  323003 tgatgaac 323010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386118
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  | |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||     ||||| |||  ||||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa-gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 334  Q
    || ||| |  || ||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||   ||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtcttt-cttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttat 386095  T
Q  335 catcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  386096 catcttaaccttctccgtagtct 386118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 117549 - 117874
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  117549 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 117648  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || |||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||  |||| |||||| || ||||     
T  117649 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcag 117748  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||   ||||||    
T  117749 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatc 117848  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| ||||| || |||||    
T  117849 ttgactttctccgtagtatgatgaac 117874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 57 - 367
Target Start/End: Original strand, 1 - 311
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||||||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |  || ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtc 300  T
Q  357 tgctgaacaat 367  Q
    |||||||||||    
T  301 tgctgaacaat 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16408
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | ||  ||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||   |||||| |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||   |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttc 16460  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  16459 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 71 - 370
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49805
Alignment:
Q  71 ttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaacca 170  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  171 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 270  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   ||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  271 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Original strand, 968 - 1301
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  968 acatcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 1067  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  1068 ccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 1167  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||| ||||||||||| || || || ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1168 cacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttc 1267  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    | ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  1268 actttttctt-aatcgtcttaaccttctcagtagt 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 117248 - 116905
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  117248 acatcatcccttggaatcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaac 117149  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| | |    
T  117148 ccactcgatacgccaccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactatt 117049  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  117048 cacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 116949  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  116948 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaac 116905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98300
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || |||| |||| | || || ||||||||||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 98300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 364
Target Start/End: Original strand, 886 - 1214
Alignment:
Q  36 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgcca 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  136 ccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactct 235  Q
    |  | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  236 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 335  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || ||||| |||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatc 1185  T
Q  336 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
      |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  1186 cacttaatcttctcagtagtttgctgaac 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26062 - 25719
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26062 acatcatcccttggaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25963  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||| ||||||||||| | |||||||||  || |||| |  ||| |||||||||| ||||||   || |||||    
T  25962 ccactcgatacgccacggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagt 25863  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25862 cataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 25763  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25762 atcttttcttggattaacttaaccttctcagtagtttgctgaac 25719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Original strand, 16920 - 17142
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16920 acatcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17019  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  17020 caactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17119  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaaca 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  17120 cacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5933 - 5588
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  5933 acatcatcccttggaatcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 5834  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
     ||||| |||||| ||  | ||||||||||  || || ||||| |||||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |  || |||   ||||| ||    
T  5833 tcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggt 5734  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5733 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatcctt-ttgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttc 5635  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
    || ||||||  ||||| |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  5634 atcttctctctaatcaacttaaccttctctgttgtttgttgaacaat 5588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25414 - 25068
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  25414 acatcatcccttggaatcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25315  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||    ||||| ||    
T  25314 ccactctatatgccactgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgt 25215  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25214 cacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttc 25115  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 367  Q
    || ||||||   || | |||||| || || |||||||| ||||||||    
T  25114 atcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtctggtgaacaat 25068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16355 - 16213
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| ||||||||| | || || |||||||| || || ||  ||||||| || | ||| ||||| |    
T  16355 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatccccaacttgaaagtctatatccttcctcc 16256  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16255 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcat 16213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 369
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7708
Alignment:
Q  183 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgct 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  283 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 7708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11082 - 10774
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||      
T  11082 acatcatctcttggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaat 10983  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| ||| |||||  | |||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||    | ||| ||    
T  10982 ccactctatatgccactgttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgt 10883  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10882 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 10783  T
Q  321 attttctct 329  Q
    || ||||||    
T  10782 atcttctct 10774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 966 - 767
Alignment:
Q  178 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcct 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  966 tcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttccttaaactcaagatcttttct 867  T
Q  278 gcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  866 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 86847 - 86496
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||| |    
T  86847 acatcatctcttagaatcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaac 86748  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |||||| |||||| |||   |||||||||||||| || ||||| |  |||||||| |||| |||||  |||||||| || |  ||||||   ||||| ||    
T  86747 ccactctatacgcaaccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggt 86648  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  86647 cacaagagtgactctaaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttcc 86548  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    || || |||   |||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  86547 atcttttctcttatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaaaaatgtctg 86496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 141 - 372
Target Start/End: Original strand, 9053 - 9284
Alignment:
Q  141 ccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 240  Q
    |||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9053 ccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaa 9152  T
Q  241 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctt 340  Q
    | || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  9153 atacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattatctt 9252  T
Q  341 aactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 372  Q
    ||| ||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  9253 aaccttctcagcagtttgttgaacaatttctg 9284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7052
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaac 7039  T
Q  121 ccactcgatacgc 133  Q
    |||||||||||||    
T  7040 ccactcgatacgc 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 351
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    |||| ||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 346  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28805
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | |||  | ||||||| ||| |||||  | |||||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 328  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 28805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40796
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | |||  | ||||||| ||| |||||  | |||||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 328  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 40796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4181
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | ||||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| |||||||||| ||| |||||| || ||||| ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtc 4173  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  4174 tgatgaac 4181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47430
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | ||||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| || | |||||| || |||| |||||| || ||||| ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 47422  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  47423 tgatgaac 47430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10426 - 10090
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  10426 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10327  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  10326 caactctatatgccacagttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 10227  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10226 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttc 10127  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  10126 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 48 - 364
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26448
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | |||||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || |||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 347  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||   |||||||| || |||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttc 26431  T
Q  348 tcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||    
T  26432 tccgtagtctgatgaac 26448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 27482 - 27825
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  27482 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 27581  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | ||||| || || ||||||| ||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | ||||||   ||||| ||    
T  27582 caactctatatgccactgttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgt 27681  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27682 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 27781  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27782 atcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 27825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1473 - 1149
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||   || || |||   || |||||      
T  1473 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgccactg 1374  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| |||| ||| |||||     
T  1373 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcag 1275  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  1274 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 1175  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||  |||||||| |||||    
T  1174 ttgactttcttcgtagtctgatgaac 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18862 - 18537
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  18862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgccactg 18763  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | | ||| || || |||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| |   ||||| |||| |||||| |||||||     
T  18762 ttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 18663  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||    
T  18662 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatc 18563  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  18562 ttgactttctccgtagtctgatgaac 18537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14226 - 13901
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  14226 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgccactg 14127  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||  ||||| ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  14126 ttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaa 14027  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||    
T  14026 aaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 13927  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  13926 ttgactttctcagtagtctgatgaac 13901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4960
Alignment:
Q  93 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttct 192  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  193 ttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgata 292  Q
    | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  293 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 4960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19113
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||      
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcat 19113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 322
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23275
Alignment:
Q  141 ccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 240  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  241 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcat 23275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51863
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | ||||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||| ||   ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||     
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtt 51871  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  51870 tgatgaac 51863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37508
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | ||||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| ||| |||||||| | |||||| || ||||   |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtc 37500  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  37501 tgatgaac 37508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 153 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38385 - 38180
Alignment:
Q  153 gatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctc 252  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||    
T  38385 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 38286  T
Q  253 cttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagt 352  Q
    | ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||| |||||||| ||    
T  38285 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgt 38186  T
Q  353 agtctg 358  Q
    ||||||    
T  38185 agtctg 38180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 27548 - 27383
Alignment:
Q  153 gatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctc 252  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||    
T  27548 gatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctc 27449  T
Q  253 cttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    | ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27448 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgctt 27383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7078
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | |||||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || |||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| |||||| |||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 7078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5956
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||  | |||||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatg-aaaacatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||  |||| ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcat 5956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 9779 - 10099
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  9779 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 9878  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| | || |||||| |||||||     
T  9879 ttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcag 9978  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| |     |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  9979 aaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 10073  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  10074 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 10099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 14067 - 14391
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || |||||      
T  14067 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 14166  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| ||||| |||||||  || ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| ||||||||||||||     
T  14167 ttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcag 14265  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  14266 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 14365  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  14366 ttgacattctccgtagtctgatgaac 14391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13686 - 13362
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  13686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13587  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || |||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  13586 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 13487  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  13486 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 13387  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaa 363  Q
    || |||||||| |||||||| ||||    
T  13386 ttgactttctctgtagtctgatgaa 13362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17456 - 17132
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  17456 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 17357  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || |||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || || |     
T  17356 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaag 17257  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  17256 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 17157  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaa 363  Q
    || |||||||| |||||||| ||||    
T  17156 ttgactttctctgtagtctgatgaa 17132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20247
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | |||||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || ||||||||||| | |||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcat 20247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21671
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | |||||||||| ||| | |||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 347  Q
    ||  || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttc 21688  T
Q  348 tcagtagtctgctgaac 364  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21687 tcagtagtctgatgaac 21671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 343
Target Start/End: Original strand, 26004 - 26091
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26004 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 26091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58448
Alignment:
Q  102 gaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttca 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||| |||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  202 aagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttg 301  Q
      ||| ||   ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  302 tcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcat 58448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 357
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19419
Alignment:
Q  58 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| || ||||||||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  158 ctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 257  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| ||   ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    |||||||| |||||||| |||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtct 19419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 59115 - 59042
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatg 94  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  59115 acatcatctcttggaatcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 349
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74191
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||||   ||||| || |||||| | ||||||| |||||| || ||  |  | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 349  Q
    ||| || | |||||| || ||| || | ||||   ||||||||||||| |||||    
T  74138 cttatgcctactctgagatgctctcgtcttcttgagaatcatcttaaccttctc 74191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 61 - 404
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  61 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 160  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||  || |||||  | ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||    
T  161 ccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgt 260  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||  |  | || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  261 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttc 360  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||    |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  361 atcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33719
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| | ||| |||||  | || ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| || || || |||||    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 33719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 343
Target Start/End: Original strand, 40419 - 40543
Alignment:
Q  219 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |    
T  40419 gtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgcct 40518  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||    
T  40519 tcatcttctcctgaatcatcttaac 40543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 363
Target Start/End: Original strand, 10869 - 11193
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  10869 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 10968  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || |||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || || |     
T  10969 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaag 11068  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  11069 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 11168  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaa 363  Q
    || |||||||| |||||||| ||||    
T  11169 ttgactttctctgtagtctgatgaa 11193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 400
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | ||||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || || | ||| || ||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 347  Q
     || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttc 416  T
Q  348 tcagtagtctgctgaa 363  Q
    || |||||||| ||||    
T  415 tctgtagtctgatgaa 400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7831
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    || || ||||||||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 7831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6483
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||| || || | || ||| |||||      
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||| |||||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  239 -aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 337  Q
     ||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcat 6463  T
Q  338 cttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6464 cttgactttctcagtagtct 6483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 358
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4191
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||  | |||   || |||||      
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || |||||||||||   |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||   ||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatc 4171  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctg 358  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  4172 ttgactttctccgtagtctg 4191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5002
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||   | ||||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||     ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| || ||||| || |||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtc 5010  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  5009 tgatgaac 5002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 329
Target Start/End: Original strand, 172 - 462
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || |||| ||| |||||      
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||||||||| || |||||||| | |||||| ||  | |||||||| |||||  ||||||| ||||||   | ||| |||| |||||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 329  Q
    ||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1211
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |   || |||||  | ||||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  248 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 1211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27531
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||      
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| | || |||||| |||||||     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || | ||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||   ||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatc 27505  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  27506 ttgactttctccgtagtctgatgaac 27531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42658 - 42333
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  42658 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 42559  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||| |   ||||| |||| |||||| || ||||     
T  42558 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcag 42459  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || |||   ||||||    
T  42458 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatc 42359  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  42358 ttgactttctctgtagtctgatgaac 42333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47724 - 47399
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  47724 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 47625  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | |||||||| || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||  |   ||||| |||| |||||| || ||||     
T  47624 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcag 47525  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || |||   ||||||    
T  47524 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatc 47425  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  47424 ttgactttctctgtagtctgatgaac 47399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 118
Target Start/End: Original strand, 2212 - 2243
Alignment:
Q  87 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2212 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 2243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 364
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5056
Alignment:
Q  68 aagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaa 167  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | ||||| || || ||||||| ||| | |    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  168 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa 267  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||| |   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  268 gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    |  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 5056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14257
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||  ||| |||||      
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || | |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 14277  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctg 358  Q
    || ||| ||||  |||||||    
T  14276 ttgactatctctatagtctg 14257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||  ||| |||||      
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 202  Q
    | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3057
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | ||||| || || ||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||  |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || | ||| ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||    |||||||| |||||||| || |||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtc 3049  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  3050 tgatgaac 3057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13340 - 13189
Alignment:
Q  219 gtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 318  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||    
T  13340 gtcaccggattgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaatgatttccttcgtttatcatgatagctcttctgtctactttgtgatgctt 13241  T
Q  319 tcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 370  Q
    ||||| ||||| ||||||| || || || || || || ||||||||||||||    
T  13240 tcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtttgctgaacaatctc 13189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  72 tgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaa 171  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| | |||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  172 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtca 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36974
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37089 acatcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatc 36990  T
Q  121 ccactcgatacgccac 136  Q
    | ||| ||||||||||    
T  36989 caactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4441
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagttt 4461  T
Q  358 gctgaacaatctctgctcct 377  Q
    | |||||||| |||| ||||    
T  4460 gttgaacaatttctggtcct 4441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 328
Target Start/End: Original strand, 58969 - 59024
Alignment:
Q  273 ttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 328  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  58969 ttcctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctc 59024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 49358 - 49033
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||| |      
T  49358 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccgctg 49259  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || ||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| |   ||||| |||| ||| || |||||||     
T  49258 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcag 49159  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || | ||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||   ||||||    
T  49158 aaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatc 49059  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  49058 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 49033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 58141 - 57859
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||     
T  58141 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccg 58042  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||  || || || ||||||||   |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  58041 ttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaa 57942  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    ||| || || || || |  |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  57941 aaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcat 57859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Original strand, 509 - 792
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || || || ||||| | ||| |||||  |||||||||||||||| || || || ||||     ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcat 792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 266
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||  | ||||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 247  Q
    | |  |||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  248 gtctccttcttgaaactca 266  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26264 - 26203
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26264 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatg 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49214
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||| |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 49233  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
    || ||||| || |||||||    
T  49232 ttgactttttctgtagtct 49214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 61538 - 61220
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  61538 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 61439  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| ||||  |||||||||||   |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||  ||| |||||| || ||||     
T  61438 ttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcag 61339  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||    
T  61338 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatc 61239  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
    || |||||||| |||||||    
T  61238 ttgactttctctgtagtct 61220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67608
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||  | ||||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    |||||||   |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||  ||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtc 67609  T
Q  357 t 357  Q
    |    
T  67608 t 67608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 52504 - 52186
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||      
T  52504 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 52405  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| ||||  |||||||||||   |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||  ||| |||||| || ||||     
T  52404 ttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcag 52305  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   ||||||    
T  52304 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatc 52205  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
    || |||||||| |||||||    
T  52204 ttgactttctctgtagtct 52186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 39720 - 40045
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  || |||||      
T  39720 acatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 39819  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || |||||| |||| | |||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |  || |||   ||||| |||| |||||| |||||||     
T  39820 ttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 39919  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    ||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   || |||    
T  39920 aaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttataatc 40019  T
Q  339 ttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    || ||||||||  ||||||| |||||    
T  40020 ttgactttctcgttagtctgatgaac 40045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26208 - 25907
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || |    
T  26208 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 26109  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    ||||||  || |||||  | ||||| ||||  ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| |   ||||| ||    
T  26108 ccactctgtatgccactgttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgt 26009  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26008 cataggagtaactctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttc 25909  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  25908 at 25907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 16639 - 16940
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  16639 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16738  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | || | ||| |||||  | ||||| || || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  16739 caacactatatgccactattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgt 16838  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16839 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttc 16938  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  16939 at 16940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17056 - 16755
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  17056 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 16957  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | |||||||| || || |||| ||| | |||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||   |||||| ||    
T  16956 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgt 16857  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16856 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttc 16757  T
Q  321 at 322  Q
    ||    
T  16756 at 16755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 346
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20410
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatc 20402  T
Q  339 ttaacttt 346  Q
    || |||||    
T  20403 ttgacttt 20410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 43486 - 43804
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  43486 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacag 43585  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| ||||||   || || |||| |||||| || ||||     
T  43586 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcag 43685  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||| |||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||   ||||||    
T  43686 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatc 43785  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||| || |||||||    
T  43786 ttaactttttctgtagtct 43804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 357
Target Start/End: Original strand, 44498 - 44816
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  44498 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacag 44597  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| ||||||   || || |||| |||||| || ||||     
T  44598 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcag 44697  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 338  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||| |||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||   ||||||    
T  44698 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatc 44797  T
Q  339 ttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||| || |||||||    
T  44798 ttaactttttctgtagtct 44816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36206
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 209  Q
    | ||||| || || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgt 36206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 279 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3804 - 3706
Alignment:
Q  279 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  3804 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctggtcct 3706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38929
Alignment:
Q  22 catcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcc 121  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||| || ||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  122 cactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtc 221  Q
     |||| ||| |||||    |||||||| || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||   |||||| |||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  222 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 321  Q
    | |||||||||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttca 38930  T
Q  322 t 322  Q
    |    
T  38929 t 38929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 357
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248912
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||||| || |||||| | || || |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| ||||||||| |||| ||| || || || || ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
     |||||||| ||    || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||| |||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtc 248911  T
Q  357 t 357  Q
    |    
T  248912 t 248912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 118
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6333
Alignment:
Q  23 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6238 atcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Original strand, 26224 - 26560
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  26224 acatcatcccttggaatcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 26323  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    |  ||| ||| |||||  | || || || || || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| ||    
T  26324 cagctctataagccactgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 26423  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||| | || || | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26424 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 26523  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || || ||    |||| | ||||||||||||||||||    
T  26524 atcttttcccttatcaacctaactttctcagtagtct 26560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12781
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||  || |||||| | ||||  || || || |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||| ||| | |||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
     |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||| || ||    |||||||| || |||||||| |||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtc 12789  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  12788 tgatgaac 12781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 358
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2094
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||      
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca--ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 358  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctctt--atcatcttgaccctctccgtagtctg 2094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1241
Alignment:
Q  213 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 312  Q
    ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  313 acgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||| |||||||| |||||||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtct 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 309 - 377
Target Start/End: Original strand, 12738 - 12806
Alignment:
Q  309 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 12806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2023
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||  | ||||| || |||||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcac 207  Q
    ||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4464 - 4235
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacct 138  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||      
T  4464 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 4365  T
Q  139 taccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaa 238  Q
    | ||||| || |  || |||||||| | ||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  4364 ttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaa 4265  T
Q  239 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaag 268  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||    
T  4264 aaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7238
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || |||| ||| |||||  | |||||   ||| || |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaacc--ttctgaaa 7446  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 256  Q
    ||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||  ||| || ||| || |||| ||| || || || || ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
     ||||||| |||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||| |    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagac 7246  T
Q  357 tgctgaac 364  Q
    || |||||    
T  7245 tgatgaac 7238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 357
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14822
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtct 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  57 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactctttccgata 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  || | |||  | ||||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  157 tctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctca 237  Q
    |||||||   |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| ||   ||||| |||| |||||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 357
Target Start/End: Original strand, 42746 - 43082
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 120  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  42746 acatcatcccttggaataacatgtgaaggatccgctagatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaac 42845  T
Q  121 ccactcgatacgccaccttaccaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagt 220  Q
    | |||| ||| |||||  | |||||  | || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  42846 caactctataagccactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 42945  T
Q  221 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 320  Q
    || ||||||||| || | ||| || || || || || |||||||| ||    || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42946 cataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttc 43045  T
Q  321 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    || || ||    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  43046 atcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtct 43082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 364
Target Start/End: Original strand, 1 - 176
Alignment:
Q  189 ttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcat 288  Q
    ||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  289 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    | |||||||| || |||||||  ||||||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46439
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| || |||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 46439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 322
Target Start/End: Original strand, 5311 - 5477
Alignment:
Q  156 atctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 255  Q
    |||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||||||||   ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || |    
T  5311 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccct 5410  T
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 322  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5411 cctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7559 - 7498
Alignment:
Q  21 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 82  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7559 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5537 - 5467
Alignment:
Q  279 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 349  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||    
T  5537 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 209
Target Start/End: Original strand, 136109 - 136270
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccttaccaactc 147  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||  | |||||||    
T  136109 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactc 136208  T
Q  148 tttccgatatctgatatgaaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 209  Q
    | || || |||||||| | |||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  136209 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgt 136270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8997 - 8898
Alignment:
Q  258 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  8997 tgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 8898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3444
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    | ||| ||||||||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||| |  || || || |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 3444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3446 - 3355
Alignment:
Q  273 ttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 364  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3446 ttcctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaac 3355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3496
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccac 136  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||    
T  3593 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccac 3496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1061
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||| | ||||| ||||| || || || ||  |  ||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtct 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 393
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||||    ||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 357
Target Start/End: Original strand, 8293 - 8394
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    |||||||||||| ||| || || | ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  8293 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 8392  T
Q  356 ct 357  Q
    ||    
T  8393 ct 8394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 23570 - 23679
Alignment:
Q  234 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaa 333  Q
    |||||||||||||| || |   |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  23570 ctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaa 23669  T
Q  334 tcatcttaac 343  Q
    ||||||||||    
T  23670 tcatcttaac 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13207
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| ||||||||  | |||||||| ||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtct 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 357
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43837
Alignment:
Q  257 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 356  Q
    ||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtc 43836  T
Q  357 t 357  Q
    |    
T  43837 t 43837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 357
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14956
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||||||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||| ||||| | |||||||||||| || || |||||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtct 14956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3896
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||    ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| || || |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 3896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28450 - 28287
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| |||||| || | || ||||||||||| || || ||| |||| ||||||| ||| || || |    
T  28450 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcc 28351  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28350 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 28287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 940
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 334  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 136
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45923
Alignment:
Q  48 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccac 136  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| |||||    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccac 45923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 357
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71518
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 71518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 357
Target Start/End: Original strand, 13406 - 13550
Alignment:
Q  213 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 312  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| || ||||| || ||  | |||||||||| ||| || || |  ||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  13406 acaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatctactctgag 13505  T
Q  313 acgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  13506 acgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttctgtagtct 13550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14758
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||  |||||| || | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| || || |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 14758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 343
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24165
Alignment:
Q  180 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 279  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  280 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaac 24165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1532 - 1431
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 355  Q
    |||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  1532 cttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 1433  T
Q  356 ct 357  Q
    ||    
T  1432 ct 1431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 357
Target Start/End: Original strand, 9210 - 9286
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 357  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  9210 cttatcatgatagctcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtct 9286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 328
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||||||||    ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 328  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 328
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||||||||    ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  ||||| |||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 328  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4077 - 3965
Alignment:
Q  231 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 330  Q
    |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  4077 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactttgagacgccttcatcttctcct 3978  T
Q  331 gaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||||    
T  3977 gaatcatcttaac 3965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 126
Target Start/End: Original strand, 9200 - 9287
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 126  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  9200 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaatcccactc 9287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26178
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 26178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 886
Alignment:
Q  39 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgg 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 328
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  196 acttcaaagcacgtttgacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 295  Q
    |||||||||||||    ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  ||||| |||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  296 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 328  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 343
Target Start/End: Original strand, 10829 - 10941
Alignment:
Q  231 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 330  Q
    |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| | ||||||||| |||||||| || | ||| || |||||| |||| |||||||    
T  10829 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatcttctctt 10928  T
Q  331 gaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||||    
T  10929 gaatcatcttaac 10941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 346
Target Start/End: Original strand, 14370 - 14425
Alignment:
Q  291 taactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 346  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14370 taactcttctgtctactctgagatgctttcattttctcttgattcatcttaacttt 14425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 343
Target Start/End: Original strand, 18332 - 18394
Alignment:
Q  281 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 343  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18332 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 18394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 820
Alignment:
Q  256 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 346  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | |||||| || || ||||| || || | |||||||||||||||    
T  910 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatcttctgcctactctgagatgcattcatcttttcctaaatcatcttaacttt 820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 832 times since January 2019
Visitors: 2568