View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0300_high_1 (Length: 422)

Name: NF0300_high_1
Description: NF0300
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0300_high_1
NF0300_high_1
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (21-398)||(26071753-26072131)
chr7 (21-398)||(26095540-26095918)
chr7 (21-398)||(3893381-3893772)
chr7 (21-287)||(15824105-15824371)
chr7 (21-398)||(12753172-12753558)
chr7 (21-288)||(141869-142136)
chr7 (21-288)||(44863443-44863711)
chr7 (21-288)||(47287976-47288244)
chr7 (21-398)||(112784-113168)
chr7 (124-398)||(45453745-45454016)
chr7 (21-398)||(1938257-1938629)
chr7 (21-215)||(7290908-7291102)
chr7 (21-214)||(7286328-7286522)
chr7 (245-398)||(15913921-15914075)
chr7 (21-214)||(2192606-2192799)
chr7 (21-213)||(13867887-13868080)
chr7 (21-213)||(18305642-18305831)
chr7 (21-214)||(16480836-16481029)
chr7 (21-214)||(12545607-12545802)
chr7 (21-214)||(15952859-15953050)
chr7 (21-214)||(369143-369336)
chr7 (214-379)||(9058141-9058311)
chr7 (21-214)||(14253071-14253263)
chr7 (249-398)||(13388493-13388643)
chr7 (194-378)||(15761867-15762051)
chr7 (192-378)||(32496053-32496242)
chr7 (21-288)||(49049452-49049723)
chr7 (21-210)||(15762262-15762445)
chr7 (249-374)||(13376200-13376324)
chr7 (244-358)||(20587140-20587254)
chr7 (192-288)||(13867688-13867784)
chr7 (21-268)||(15629004-15629255)
chr7 (254-358)||(8565108-8565212)
chr7 (195-374)||(18255324-18255505)
chr7 (249-378)||(3058585-3058713)
chr7 (249-358)||(9322594-9322703)
chr7 (192-288)||(11285619-11285715)
chr7 (244-358)||(28718977-28719091)
chr7 (21-86)||(2024692-2024757)
chr7 (192-288)||(11582535-11582631)
chr7 (21-287)||(13272976-13273246)
chr7 (158-297)||(15952673-15952813)
chr7 (265-378)||(125378-125492)
chr7 (254-378)||(2027097-2027222)
chr7 (192-289)||(13038808-13038905)
chr7 (21-93)||(16416509-16416581)
chr7 (153-288)||(12249771-12249908)
chr7 (192-288)||(12545404-12545501)
chr7 (123-288)||(16571751-16571919)
chr7 (123-288)||(16593743-16593911)
chr7 (21-91)||(16571983-16572053)
chr7 (21-91)||(16593609-16593679)
chr7 (21-149)||(13038991-13039114)
chr7 (200-272)||(36051075-36051147)
chr7 (192-297)||(369364-369471)
chr7 (21-214)||(11582659-11582840)
chr7 (123-214)||(2024763-2024858)
chr7 (143-288)||(10862515-10862661)
chr7 (194-372)||(10988092-10988271)
chr7 (200-271)||(122987-123059)
chr7 (192-272)||(16210183-16210263)
chr7 (195-372)||(26010695-26010874)
chr7 (21-97)||(45455505-45455581)
chr7 (21-214)||(122770-122951)
chr7 (140-214)||(12545553-12545627)
chr7 (185-239)||(18305492-18305546)
chr7 (195-271)||(2192376-2192453)
chr7 (195-297)||(15518435-15518539)
chr7 (195-374)||(2436110-2436285)
chr7 (158-252)||(2024904-2024998)
chr7 (312-358)||(4483318-4483364)
chr7 (214-272)||(7291277-7291335)
chr7 (195-288)||(7821406-7821500)
chr7 (195-288)||(7828717-7828811)
chr7 (195-288)||(16416949-16417043)
chr7 (195-272)||(16480605-16480683)
chr7 (195-288)||(27103134-27103228)
chr7 (195-288)||(27110482-27110576)
chr7 (195-288)||(27175098-27175192)
chr7 (195-288)||(38785226-38785320)
chr7 (21-93)||(16209975-16210045)
chr7 (21-93)||(32496381-32496451)
chr7 (21-89)||(3054982-3055049)
chr7 (244-296)||(4483268-4483320)
chr7 (195-358)||(13757060-13757225)
chr7 (192-239)||(3055193-3055241)
chr7 (195-297)||(25293856-25293960)
chr7 (195-288)||(11514604-11514698)
chr7 (195-288)||(15443146-15443240)
chr7 (195-272)||(30263727-30263805)
chr7 (220-297)||(42057741-42057819)
chr7 (293-338)||(3193586-3193630)
chr7 (302-371)||(19066193-19066262)
chr7 (293-337)||(13460914-13460958)
chr7 (199-297)||(13912691-13912791)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (21-397)||(5845-6221)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (21-398)||(138296-138673)
scaffold0021 (21-288)||(76589-76853)
scaffold0021 (121-268)||(9998-10148)
[»] chr6 (89 HSPs)
chr6 (21-398)||(31626739-31627117)
chr6 (21-394)||(18775506-18775886)
chr6 (21-394)||(22428473-22428850)
chr6 (21-398)||(16104850-16105237)
chr6 (21-288)||(25646518-25646786)
chr6 (21-394)||(25745792-25746160)
chr6 (21-214)||(35017451-35017645)
chr6 (21-213)||(35011124-35011316)
chr6 (21-214)||(18128340-18128532)
chr6 (273-398)||(16083970-16084095)
chr6 (21-214)||(18578834-18579027)
chr6 (21-205)||(33316422-33316606)
chr6 (21-214)||(18843708-18843900)
chr6 (215-398)||(18128776-18128964)
chr6 (21-213)||(19627498-19627690)
chr6 (21-288)||(13016436-13016702)
chr6 (21-214)||(18004857-18005050)
chr6 (192-378)||(19984699-19984887)
chr6 (21-214)||(23975708-23975902)
chr6 (21-208)||(13622937-13623121)
chr6 (29-214)||(14628368-14628553)
chr6 (249-398)||(18383173-18383323)
chr6 (194-378)||(1554324-1554508)
chr6 (169-288)||(18422184-18422303)
chr6 (21-154)||(23151706-23151839)
chr6 (249-398)||(33323342-33323492)
chr6 (21-210)||(1553930-1554113)
chr6 (304-398)||(23151845-23151939)
chr6 (194-374)||(16238848-16239028)
chr6 (254-379)||(17790652-17790776)
chr6 (255-398)||(16889236-16889379)
chr6 (244-358)||(34965470-34965584)
chr6 (273-398)||(35137439-35137565)
chr6 (21-288)||(18397163-18397434)
chr6 (21-149)||(16827875-16828003)
chr6 (214-357)||(22846615-22846767)
chr6 (195-374)||(11214623-11214803)
chr6 (21-239)||(32896282-32896492)
chr6 (139-288)||(25369014-25369165)
chr6 (254-358)||(16134814-16134918)
chr6 (88-214)||(18825647-18825774)
chr6 (193-374)||(4989379-4989561)
chr6 (21-93)||(25173518-25173590)
chr6 (204-288)||(35017303-35017387)
chr6 (244-358)||(19852795-19852909)
chr6 (21-91)||(18422115-18422185)
chr6 (200-272)||(18740863-18740935)
chr6 (195-374)||(1659212-1659387)
chr6 (194-272)||(13622800-13622878)
chr6 (244-358)||(23220222-23220336)
chr6 (195-372)||(14628111-14628289)
chr6 (21-93)||(18740645-18740717)
chr6 (195-372)||(23976053-23976231)
chr6 (195-372)||(26088319-26088497)
chr6 (195-296)||(33316158-33316260)
chr6 (21-93)||(18835474-18835544)
chr6 (21-94)||(4988988-4989061)
chr6 (192-288)||(16827462-16827559)
chr6 (21-102)||(17787746-17787827)
chr6 (192-288)||(18004635-18004732)
chr6 (215-357)||(1651466-1651605)
chr6 (219-372)||(16650745-16650899)
chr6 (193-288)||(18825420-18825515)
chr6 (21-214)||(19984915-19985096)
chr6 (195-288)||(25174040-25174134)
chr6 (195-288)||(27655670-27655764)
chr6 (220-357)||(15861243-15861375)
chr6 (184-288)||(28196439-28196546)
chr6 (220-288)||(15738687-15738757)
chr6 (219-372)||(16557515-16557669)
chr6 (193-288)||(18843481-18843576)
chr6 (140-207)||(23975956-23976023)
chr6 (140-214)||(4989201-4989275)
chr6 (195-288)||(10487364-10487458)
chr6 (154-208)||(16238711-16238765)
chr6 (195-288)||(16377869-16377963)
chr6 (195-288)||(16385193-16385287)
chr6 (195-372)||(29870975-29871153)
chr6 (144-214)||(16827663-16827733)
chr6 (195-272)||(17343864-17343942)
chr6 (293-338)||(16374954-16374999)
chr6 (195-297)||(16230065-16230169)
chr6 (195-297)||(23993645-23993749)
chr6 (195-272)||(22227278-22227356)
chr6 (140-214)||(25173731-25173805)
chr6 (244-288)||(21930417-21930462)
chr6 (293-338)||(31162441-31162486)
chr6 (144-205)||(33316292-33316353)
chr6 (216-260)||(32896494-32896538)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (21-361)||(37760-38101)
[»] chr8 (101 HSPs)
chr8 (21-398)||(37605283-37605668)
chr8 (21-364)||(41243948-41244277)
chr8 (21-288)||(25120745-25121012)
chr8 (21-288)||(19994802-19995078)
chr8 (21-214)||(41508927-41509122)
chr8 (21-288)||(20479893-20480166)
chr8 (21-214)||(13664550-13664743)
chr8 (21-214)||(13723825-13724018)
chr8 (159-378)||(16203832-16204052)
chr8 (21-213)||(18610428-18610620)
chr8 (21-288)||(16416537-16416810)
chr8 (21-214)||(24108465-24108657)
chr8 (21-203)||(22008366-22008548)
chr8 (21-214)||(22909342-22909535)
chr8 (270-398)||(41245210-41245338)
chr8 (249-398)||(21192234-21192384)
chr8 (249-398)||(21696086-21696236)
chr8 (249-398)||(21199661-21199811)
chr8 (21-209)||(24719328-24719513)
chr8 (254-398)||(31195772-31195917)
chr8 (21-276)||(20655677-20655943)
chr8 (249-398)||(23835746-23835895)
chr8 (214-398)||(37655134-37655324)
chr8 (192-378)||(29758768-29758956)
chr8 (249-398)||(39448310-39448460)
chr8 (21-213)||(269950-270138)
chr8 (21-213)||(645782-645970)
chr8 (21-213)||(831517-831705)
chr8 (21-213)||(16043054-16043245)
chr8 (21-175)||(17343480-17343632)
chr8 (21-213)||(16041378-16041569)
chr8 (201-378)||(270226-270401)
chr8 (201-378)||(645519-645694)
chr8 (201-378)||(831254-831429)
chr8 (21-214)||(23509068-23509261)
chr8 (21-214)||(22323225-22323414)
chr8 (312-398)||(37609956-37610042)
chr8 (200-288)||(24719077-24719165)
chr8 (21-136)||(6776307-6776422)
chr8 (122-288)||(17731117-17731287)
chr8 (243-358)||(22498832-22498947)
chr8 (202-374)||(24930614-24930789)
chr8 (200-378)||(24387203-24387383)
chr8 (249-358)||(23116349-23116458)
chr8 (21-93)||(23631101-23631173)
chr8 (244-358)||(22312190-22312304)
chr8 (244-358)||(45560747-45560861)
chr8 (214-304)||(25294490-25294582)
chr8 (214-304)||(25756479-25756571)
chr8 (244-349)||(33170785-33170890)
chr8 (254-379)||(33612569-33612694)
chr8 (21-214)||(43375310-43375493)
chr8 (21-214)||(3433535-3433718)
chr8 (244-398)||(23153297-23153452)
chr8 (123-288)||(28543272-28543440)
chr8 (21-288)||(38531882-38532152)
chr8 (192-288)||(22008139-22008236)
chr8 (21-93)||(28835980-28836052)
chr8 (170-288)||(24108245-24108363)
chr8 (192-288)||(22323102-22323197)
chr8 (200-272)||(43375202-43375274)
chr8 (219-372)||(22089943-22090097)
chr8 (244-358)||(24238065-24238177)
chr8 (195-288)||(23509397-23509491)
chr8 (192-288)||(13664296-13664393)
chr8 (192-288)||(13723571-13723668)
chr8 (21-288)||(18768422-18768691)
chr8 (195-372)||(3433076-3433254)
chr8 (195-372)||(21853396-21853574)
chr8 (192-288)||(22909146-22909242)
chr8 (215-357)||(24547724-24547863)
chr8 (219-372)||(15320559-15320713)
chr8 (219-372)||(15500928-15501082)
chr8 (297-358)||(11543088-11543149)
chr8 (195-297)||(21846065-21846169)
chr8 (339-398)||(25294581-25294641)
chr8 (339-398)||(25756570-25756630)
chr8 (21-84)||(28543151-28543213)
chr8 (195-288)||(272786-272880)
chr8 (195-288)||(642969-643063)
chr8 (195-288)||(828775-828869)
chr8 (195-288)||(5236674-5236768)
chr8 (21-93)||(24387523-24387593)
chr8 (21-94)||(39448573-39448646)
chr8 (195-372)||(16874439-16874617)
chr8 (21-88)||(29758559-29758624)
chr8 (312-398)||(23148481-23148568)
chr8 (140-203)||(23509315-23509378)
chr8 (140-205)||(3433390-3433455)
chr8 (21-93)||(24930938-24931008)
chr8 (219-297)||(224737-224816)
chr8 (219-297)||(738360-738439)
chr8 (219-297)||(862255-862334)
chr8 (140-207)||(3433285-3433352)
chr8 (21-92)||(16204109-16204179)
chr8 (219-297)||(16675900-16675979)
chr8 (21-64)||(21695899-21695942)
chr8 (21-94)||(22737759-22737834)
chr8 (21-75)||(17731333-17731387)
chr8 (195-288)||(24662830-24662924)
chr8 (318-358)||(18043091-18043131)
[»] chr3 (136 HSPs)
chr3 (21-397)||(319099-319486)
chr3 (21-398)||(50113612-50113991)
chr3 (21-378)||(51159973-51160335)
chr3 (21-396)||(12351332-12351709)
chr3 (21-288)||(17098913-17099181)
chr3 (21-288)||(6148457-6148723)
chr3 (21-398)||(47786356-47786735)
chr3 (21-288)||(30204696-30204961)
chr3 (140-398)||(7852223-7852482)
chr3 (192-398)||(8630315-8630521)
chr3 (21-288)||(19572430-19572693)
chr3 (21-214)||(11812801-11812994)
chr3 (21-214)||(38166213-38166407)
chr3 (21-214)||(19944805-19944998)
chr3 (21-288)||(22145882-22146145)
chr3 (21-214)||(7851683-7851877)
chr3 (21-214)||(18737974-18738167)
chr3 (21-214)||(30140984-30141177)
chr3 (146-398)||(14060726-14060980)
chr3 (21-288)||(16183665-16183945)
chr3 (26-205)||(12796728-12796908)
chr3 (21-214)||(16819043-16819234)
chr3 (213-398)||(38812481-38812671)
chr3 (245-376)||(18008645-18008776)
chr3 (200-398)||(19230535-19230734)
chr3 (249-379)||(15874690-15874820)
chr3 (249-379)||(48420197-48420327)
chr3 (249-398)||(55442252-55442404)
chr3 (249-372)||(12490249-12490372)
chr3 (21-214)||(17936455-17936649)
chr3 (192-378)||(2048535-2048723)
chr3 (21-288)||(14296730-14297000)
chr3 (21-288)||(14302357-14302627)
chr3 (249-398)||(11330493-11330643)
chr3 (244-358)||(5229607-5229721)
chr3 (192-378)||(33340317-33340506)
chr3 (21-288)||(14287323-14287596)
chr3 (192-378)||(23490980-23491169)
chr3 (21-288)||(11199144-11199415)
chr3 (186-378)||(19945098-19945289)
chr3 (192-378)||(10737033-10737219)
chr3 (21-131)||(54045593-54045703)
chr3 (195-374)||(14846160-14846339)
chr3 (28-210)||(9304664-9304841)
chr3 (244-356)||(47983418-47983531)
chr3 (244-356)||(47992705-47992818)
chr3 (244-356)||(48001992-48002105)
chr3 (244-356)||(48011278-48011391)
chr3 (21-210)||(8630057-8630232)
chr3 (123-288)||(11062691-11062859)
chr3 (192-288)||(11813307-11813403)
chr3 (21-288)||(35121921-35122189)
chr3 (244-398)||(9592239-9592394)
chr3 (21-93)||(18908679-18908751)
chr3 (21-93)||(22273034-22273106)
chr3 (158-372)||(49230655-49230869)
chr3 (201-378)||(5227201-5227378)
chr3 (21-288)||(14523006-14523278)
chr3 (195-374)||(15939959-15940140)
chr3 (192-372)||(17913751-17913933)
chr3 (28-210)||(54686529-54686707)
chr3 (21-214)||(19230318-19230499)
chr3 (244-358)||(41660135-41660249)
chr3 (21-155)||(17958169-17958303)
chr3 (21-97)||(17536847-17536923)
chr3 (192-288)||(17957996-17958093)
chr3 (194-372)||(44227903-44228083)
chr3 (195-372)||(16819386-16819565)
chr3 (21-108)||(13815856-13815943)
chr3 (123-214)||(13815979-13816070)
chr3 (21-155)||(25057035-25057166)
chr3 (158-357)||(16259487-16259683)
chr3 (21-93)||(2451370-2451442)
chr3 (21-97)||(11062944-11063020)
chr3 (192-287)||(19262602-19262698)
chr3 (26-214)||(49230251-49230429)
chr3 (192-288)||(25057247-25057344)
chr3 (249-338)||(33370914-33371002)
chr3 (195-372)||(27839184-27839362)
chr3 (192-264)||(45581310-45581382)
chr3 (140-288)||(15516052-15516197)
chr3 (146-288)||(12563136-12563281)
chr3 (194-272)||(15860824-15860902)
chr3 (195-272)||(18905356-18905434)
chr3 (140-214)||(18908892-18908966)
chr3 (215-374)||(15613564-15613720)
chr3 (21-154)||(23490768-23490898)
chr3 (140-212)||(11813048-11813120)
chr3 (215-357)||(23081682-23081821)
chr3 (193-288)||(30141361-30141456)
chr3 (195-288)||(2450910-2451004)
chr3 (292-338)||(11517010-11517056)
chr3 (140-214)||(11813179-11813253)
chr3 (195-288)||(18909169-18909263)
chr3 (195-288)||(22273524-22273618)
chr3 (21-89)||(10736824-10736890)
chr3 (195-357)||(12266007-12266167)
chr3 (215-288)||(15574545-15574618)
chr3 (30-93)||(15861043-15861104)
chr3 (195-372)||(16745670-16745848)
chr3 (121-288)||(17536606-17536776)
chr3 (21-92)||(45581101-45581170)
chr3 (21-97)||(53900388-53900463)
chr3 (151-214)||(7851972-7852035)
chr3 (195-288)||(1469236-1469330)
chr3 (140-290)||(40938085-40938236)
chr3 (195-287)||(15470048-15470141)
chr3 (146-288)||(17137827-17137969)
chr3 (195-372)||(30151813-30151991)
chr3 (144-207)||(16819292-16819355)
chr3 (214-288)||(12951476-12951555)
chr3 (21-94)||(39654163-39654237)
chr3 (140-214)||(49230509-49230583)
chr3 (21-82)||(2048323-2048383)
chr3 (158-214)||(7851875-7851931)
chr3 (195-297)||(8269976-8270080)
chr3 (195-297)||(8277087-8277191)
chr3 (195-297)||(8305896-8306000)
chr3 (21-92)||(19262838-19262907)
chr3 (195-297)||(53769137-53769241)
chr3 (121-288)||(53900177-53900347)
chr3 (21-84)||(12563334-12563397)
chr3 (219-297)||(13956378-13956457)
chr3 (219-297)||(13977211-13977290)
chr3 (327-374)||(18905296-18905343)
chr3 (219-297)||(41268743-41268822)
chr3 (219-297)||(45859521-45859600)
chr3 (219-297)||(55314883-55314962)
chr3 (140-214)||(2451155-2451229)
chr3 (140-214)||(22273247-22273321)
chr3 (158-207)||(2451035-2451084)
chr3 (243-288)||(11883923-11883968)
chr3 (243-288)||(14291910-14291955)
chr3 (244-288)||(38377415-38377460)
chr3 (21-92)||(14061039-14061110)
chr3 (249-288)||(15989508-15989548)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (21-398)||(59865-60250)
[»] chr5 (100 HSPs)
chr5 (21-398)||(4863551-4863943)
chr5 (21-398)||(27185318-27185699)
chr5 (21-338)||(21661268-21661593)
chr5 (21-288)||(21392432-21392698)
chr5 (21-214)||(34937571-34937764)
chr5 (21-214)||(10307-10500)
chr5 (21-214)||(10780112-10780305)
chr5 (21-214)||(43445708-43445901)
chr5 (245-398)||(32967661-32967815)
chr5 (21-214)||(22885041-22885234)
chr5 (21-208)||(25211796-25211982)
chr5 (21-208)||(25275948-25276134)
chr5 (249-379)||(23492532-23492662)
chr5 (21-211)||(17473704-17473892)
chr5 (214-379)||(24226976-24227146)
chr5 (243-379)||(21615535-21615671)
chr5 (21-214)||(11579922-11580113)
chr5 (254-398)||(7727112-7727257)
chr5 (243-398)||(19860756-19860912)
chr5 (245-398)||(28888441-28888598)
chr5 (21-213)||(23986165-23986359)
chr5 (21-205)||(19497936-19498120)
chr5 (21-214)||(28257781-28257970)
chr5 (249-398)||(13793659-13793809)
chr5 (249-379)||(37189637-37189767)
chr5 (21-288)||(23453184-23453454)
chr5 (21-288)||(23460428-23460698)
chr5 (21-288)||(23464689-23464959)
chr5 (142-288)||(1170321-1170467)
chr5 (140-288)||(11582266-11582414)
chr5 (21-214)||(1221638-1221826)
chr5 (21-164)||(1171320-1171464)
chr5 (140-372)||(1221351-1221584)
chr5 (21-288)||(24470555-24470804)
chr5 (21-214)||(9732592-9732782)
chr5 (244-358)||(11964472-11964586)
chr5 (21-288)||(24184869-24185137)
chr5 (21-214)||(29192671-29192857)
chr5 (28-210)||(17907853-17908030)
chr5 (21-93)||(11340599-11340671)
chr5 (192-288)||(21653052-21653148)
chr5 (21-93)||(25944678-25944750)
chr5 (192-372)||(11213222-11213404)
chr5 (21-272)||(23510233-23510473)
chr5 (192-372)||(110604-110785)
chr5 (21-214)||(18780052-18780235)
chr5 (21-214)||(35793162-35793345)
chr5 (244-358)||(20455627-20455741)
chr5 (158-288)||(22884887-22885017)
chr5 (21-214)||(110990-111173)
chr5 (192-272)||(17473568-17473648)
chr5 (21-93)||(25424664-25424736)
chr5 (158-358)||(35792767-35792964)
chr5 (21-93)||(22368602-22368674)
chr5 (158-288)||(16534750-16534881)
chr5 (21-93)||(16534391-16534463)
chr5 (158-272)||(18779790-18779904)
chr5 (192-288)||(22368188-22368285)
chr5 (195-372)||(19498280-19498458)
chr5 (192-288)||(28257998-28258093)
chr5 (192-372)||(10779799-10779980)
chr5 (21-89)||(11338734-11338802)
chr5 (195-372)||(11341116-11341294)
chr5 (195-297)||(25425102-25425206)
chr5 (140-214)||(10554-10628)
chr5 (195-288)||(10831-10925)
chr5 (214-288)||(5452432-5452511)
chr5 (195-358)||(43445390-43445555)
chr5 (195-372)||(4201586-4201764)
chr5 (195-297)||(9732360-9732464)
chr5 (123-226)||(11338584-11338687)
chr5 (140-204)||(25944472-25944536)
chr5 (140-207)||(9732495-9732562)
chr5 (170-261)||(25211623-25211714)
chr5 (170-261)||(25275775-25275866)
chr5 (195-288)||(21075192-21075286)
chr5 (195-288)||(21933863-21933957)
chr5 (195-288)||(21940033-21940127)
chr5 (140-214)||(22368337-22368411)
chr5 (195-288)||(29192321-29192415)
chr5 (195-288)||(35580735-35580829)
chr5 (195-288)||(37010867-37010961)
chr5 (214-288)||(3672421-3672497)
chr5 (30-90)||(21647196-21647255)
chr5 (195-372)||(24594981-24595159)
chr5 (140-207)||(11341018-11341085)
chr5 (144-214)||(110888-110957)
chr5 (140-214)||(16534604-16534678)
chr5 (219-358)||(23327458-23327598)
chr5 (21-93)||(11213541-11213613)
chr5 (195-297)||(27008492-27008596)
chr5 (21-94)||(7726919-7726993)
chr5 (160-214)||(16534520-16534574)
chr5 (195-296)||(25902021-25902123)
chr5 (160-214)||(25944566-25944620)
chr5 (140-198)||(29192583-29192641)
chr5 (195-288)||(37051465-37051559)
chr5 (140-205)||(11340862-11340927)
chr5 (21-77)||(19403813-19403869)
chr5 (346-378)||(21649463-21649495)
[»] chr4 (95 HSPs)
chr4 (21-310)||(12837900-12838192)
chr4 (21-398)||(21961053-21961440)
chr4 (21-386)||(12901269-12901631)
chr4 (21-214)||(34393385-34393580)
chr4 (21-289)||(33738477-33738732)
chr4 (21-214)||(53909555-53909750)
chr4 (214-398)||(8873978-8874162)
chr4 (21-288)||(44345057-44345333)
chr4 (21-214)||(18166874-18167067)
chr4 (21-288)||(16366361-16366624)
chr4 (21-214)||(7134310-7134503)
chr4 (194-379)||(14899948-14900136)
chr4 (21-214)||(15274470-15274663)
chr4 (245-398)||(34197658-34197812)
chr4 (21-213)||(19699414-19699606)
chr4 (21-213)||(19709999-19710191)
chr4 (21-214)||(8372607-8372800)
chr4 (245-398)||(37958550-37958704)
chr4 (254-398)||(27959563-27959708)
chr4 (21-214)||(26678179-26678370)
chr4 (21-288)||(13244606-13244861)
chr4 (192-378)||(109957-110143)
chr4 (249-398)||(12245745-12245895)
chr4 (249-379)||(15852829-15852959)
chr4 (257-379)||(41167447-41167569)
chr4 (21-288)||(44054168-44054427)
chr4 (140-378)||(15211762-15212004)
chr4 (21-288)||(45460611-45460894)
chr4 (21-288)||(30236147-30236411)
chr4 (21-216)||(53706635-53706828)
chr4 (21-214)||(22356424-22356616)
chr4 (21-214)||(15211515-15211698)
chr4 (21-167)||(18294600-18294746)
chr4 (21-288)||(13811287-13811558)
chr4 (200-288)||(53909431-53909519)
chr4 (214-398)||(41257842-41258031)
chr4 (244-358)||(5372228-5372342)
chr4 (244-358)||(10238967-10239081)
chr4 (249-358)||(47469867-47469976)
chr4 (222-374)||(16521294-16521447)
chr4 (21-214)||(19998517-19998700)
chr4 (21-102)||(8874265-8874346)
chr4 (21-93)||(18246178-18246250)
chr4 (192-372)||(5684404-5684586)
chr4 (21-195)||(20813715-20813890)
chr4 (21-93)||(16520801-16520874)
chr4 (21-203)||(47355509-47355688)
chr4 (21-155)||(9293712-9293843)
chr4 (244-354)||(50223696-50223806)
chr4 (196-288)||(43283043-43283138)
chr4 (21-288)||(18496065-18496334)
chr4 (28-95)||(55378691-55378757)
chr4 (21-155)||(54120066-54120195)
chr4 (192-288)||(10642586-10642683)
chr4 (26-86)||(5684742-5684802)
chr4 (195-372)||(19999005-19999183)
chr4 (219-288)||(52267125-52267196)
chr4 (182-258)||(53706515-53706591)
chr4 (21-155)||(10642374-10642505)
chr4 (202-272)||(54119906-54119976)
chr4 (192-288)||(9293924-9294021)
chr4 (193-372)||(22356065-22356244)
chr4 (195-297)||(15138134-15138238)
chr4 (195-297)||(26678522-26678626)
chr4 (195-297)||(47355803-47355907)
chr4 (195-272)||(8372951-8373029)
chr4 (195-288)||(14994678-14994772)
chr4 (195-272)||(18167195-18167273)
chr4 (195-288)||(18246668-18246762)
chr4 (332-378)||(25120617-25120663)
chr4 (192-272)||(15274361-15274442)
chr4 (140-205)||(19998780-19998845)
chr4 (139-207)||(13751910-13751978)
chr4 (140-196)||(34393610-34393666)
chr4 (123-206)||(55378542-55378626)
chr4 (140-207)||(8372854-8372921)
chr4 (140-261)||(7134088-7134208)
chr4 (140-205)||(16521015-16521080)
chr4 (361-398)||(34393690-34393727)
chr4 (21-92)||(109748-109817)
chr4 (195-297)||(14950498-14950602)
chr4 (228-288)||(15043381-15043443)
chr4 (228-288)||(15110981-15111043)
chr4 (144-207)||(26678428-26678491)
chr4 (140-204)||(47355705-47355769)
chr4 (232-288)||(53706465-53706521)
chr4 (142-268)||(7848776-7848902)
chr4 (158-252)||(16521168-16521263)
chr4 (195-288)||(10487149-10487243)
chr4 (195-288)||(16329508-16329602)
chr4 (315-357)||(17213378-17213420)
chr4 (140-214)||(18246391-18246465)
chr4 (312-358)||(24237479-24237525)
chr4 (195-297)||(13049739-13049843)
chr4 (244-288)||(17377040-17377084)
[»] chr1 (72 HSPs)
chr1 (21-398)||(35053141-35053515)
chr1 (21-288)||(22407894-22408162)
chr1 (21-288)||(2422733-2422997)
chr1 (140-398)||(5676091-5676355)
chr1 (21-214)||(41217544-41217739)
chr1 (21-206)||(5676350-5676535)
chr1 (217-398)||(41217945-41218126)
chr1 (192-398)||(20444214-20444420)
chr1 (21-213)||(20252342-20252534)
chr1 (192-398)||(37845956-37846162)
chr1 (192-398)||(20529978-20530185)
chr1 (249-379)||(38035130-38035260)
chr1 (254-398)||(13378250-13378395)
chr1 (151-288)||(49966014-49966151)
chr1 (21-214)||(9786123-9786315)
chr1 (254-377)||(19601713-19601836)
chr1 (249-398)||(36357826-36357976)
chr1 (249-379)||(37235470-37235600)
chr1 (200-374)||(20929955-20930131)
chr1 (249-398)||(21193694-21193844)
chr1 (195-374)||(22226459-22226638)
chr1 (21-288)||(35524082-35524350)
chr1 (263-357)||(8539490-8539584)
chr1 (263-357)||(8604729-8604823)
chr1 (192-374)||(22352601-22352785)
chr1 (200-378)||(44036401-44036582)
chr1 (140-288)||(22836911-22837059)
chr1 (249-358)||(5769744-5769853)
chr1 (21-194)||(18505646-18505817)
chr1 (85-214)||(22250776-22250905)
chr1 (21-119)||(20895589-20895687)
chr1 (21-214)||(15863325-15863508)
chr1 (192-288)||(20895390-20895486)
chr1 (158-374)||(15862938-15863149)
chr1 (244-358)||(20821476-20821590)
chr1 (244-398)||(5471872-5472028)
chr1 (192-288)||(9785899-9785995)
chr1 (21-93)||(17146820-17146892)
chr1 (140-288)||(20956627-20956776)
chr1 (21-93)||(22352285-22352357)
chr1 (21-288)||(51657986-51658255)
chr1 (21-288)||(21716430-21716707)
chr1 (332-398)||(20526725-20526791)
chr1 (244-358)||(41213197-41213311)
chr1 (244-357)||(22144923-22145036)
chr1 (140-214)||(15863221-15863295)
chr1 (158-288)||(22250622-22250752)
chr1 (192-288)||(27673257-27673355)
chr1 (21-214)||(21857753-21857934)
chr1 (140-214)||(41217793-41217867)
chr1 (192-288)||(22365155-22365252)
chr1 (195-297)||(17147258-17147362)
chr1 (21-93)||(22364943-22365015)
chr1 (21-71)||(22080190-22080240)
chr1 (203-272)||(21857966-21858035)
chr1 (215-288)||(35935166-35935239)
chr1 (138-214)||(20895514-20895590)
chr1 (195-358)||(7642105-7642270)
chr1 (195-288)||(17003302-17003396)
chr1 (195-372)||(22034325-22034503)
chr1 (215-357)||(45050185-45050324)
chr1 (195-288)||(41392929-41393023)
chr1 (195-288)||(51451090-51451184)
chr1 (31-214)||(20444015-20444186)
chr1 (31-214)||(20529755-20529926)
chr1 (195-297)||(20826805-20826909)
chr1 (21-92)||(37846297-37846366)
chr1 (219-297)||(5073884-5073963)
chr1 (249-288)||(18505816-18505855)
chr1 (219-297)||(18602627-18602706)
chr1 (160-214)||(17146949-17147003)
chr1 (244-288)||(77632-77677)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (21-398)||(12488-12874)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (21-288)||(31038-31304)
[»] scaffold0011 (9 HSPs)
scaffold0011 (21-288)||(256560-256827)
scaffold0011 (192-272)||(125009-125089)
scaffold0011 (194-272)||(72028-72106)
scaffold0011 (194-272)||(76409-76487)
scaffold0011 (21-155)||(192768-192897)
scaffold0011 (21-93)||(72247-72317)
scaffold0011 (200-272)||(192985-193057)
scaffold0011 (21-93)||(76628-76698)
scaffold0011 (21-93)||(125228-125298)
[»] chr2 (99 HSPs)
chr2 (21-288)||(36892360-36892628)
chr2 (140-398)||(6877859-6878117)
chr2 (21-397)||(8886450-8886814)
chr2 (21-288)||(25877618-25877882)
chr2 (159-394)||(22861923-22862158)
chr2 (194-398)||(25600431-25600635)
chr2 (140-379)||(24088880-24089120)
chr2 (214-398)||(19434958-19435144)
chr2 (161-378)||(43644471-43644688)
chr2 (21-205)||(12638003-12638187)
chr2 (21-213)||(42180210-42180402)
chr2 (244-398)||(19658470-19658625)
chr2 (21-214)||(21276342-21276535)
chr2 (192-398)||(15631864-15632071)
chr2 (249-379)||(4795-4925)
chr2 (21-207)||(21140139-21140325)
chr2 (249-398)||(25304094-25304244)
chr2 (271-398)||(27260130-27260257)
chr2 (249-379)||(23823027-23823157)
chr2 (249-379)||(23824971-23825101)
chr2 (249-379)||(23832106-23832236)
chr2 (243-398)||(43641346-43641502)
chr2 (249-398)||(19670629-19670778)
chr2 (200-378)||(22282601-22282782)
chr2 (249-398)||(24296071-24296221)
chr2 (21-208)||(24966425-24966609)
chr2 (21-288)||(7319718-7319989)
chr2 (21-214)||(12643812-12644000)
chr2 (200-376)||(22273368-22273547)
chr2 (21-288)||(28972272-28972543)
chr2 (21-288)||(31832-32102)
chr2 (21-214)||(34822315-34822498)
chr2 (21-290)||(269422-269693)
chr2 (140-297)||(12643600-12643758)
chr2 (21-214)||(3801123-3801306)
chr2 (195-374)||(22692768-22692949)
chr2 (195-374)||(22697415-22697596)
chr2 (121-287)||(24573051-24573221)
chr2 (123-214)||(25600310-25600401)
chr2 (21-214)||(15631631-15631812)
chr2 (21-214)||(38706810-38706993)
chr2 (21-93)||(8941712-8941784)
chr2 (21-93)||(19888848-19888920)
chr2 (21-93)||(25210893-25210965)
chr2 (21-108)||(4450084-4450171)
chr2 (244-358)||(18534350-18534464)
chr2 (244-354)||(24272579-24272689)
chr2 (244-372)||(22137341-22137469)
chr2 (21-108)||(22691823-22691910)
chr2 (21-108)||(22696470-22696557)
chr2 (21-108)||(25600173-25600260)
chr2 (192-272)||(461139-461219)
chr2 (121-288)||(22581588-22581759)
chr2 (200-272)||(9654507-9654579)
chr2 (195-372)||(12637665-12637843)
chr2 (192-272)||(20629034-20629114)
chr2 (195-372)||(21140355-21140533)
chr2 (194-272)||(24966692-24966770)
chr2 (139-288)||(22691607-22691758)
chr2 (139-288)||(22696254-22696405)
chr2 (195-372)||(21276027-21276205)
chr2 (21-91)||(6877721-6877791)
chr2 (21-214)||(9654615-9654792)
chr2 (219-379)||(24687161-24687322)
chr2 (195-372)||(3800613-3800791)
chr2 (142-214)||(25211108-25211180)
chr2 (195-372)||(34822676-34822854)
chr2 (21-214)||(20629142-20629323)
chr2 (140-207)||(34822578-34822645)
chr2 (195-288)||(19888362-19888456)
chr2 (21-91)||(22282397-22282466)
chr2 (195-372)||(12726531-12726709)
chr2 (140-207)||(12637873-12637940)
chr2 (195-288)||(5889880-5889974)
chr2 (195-288)||(11232835-11232929)
chr2 (195-288)||(14908022-14908116)
chr2 (21-91)||(22273164-22273233)
chr2 (195-288)||(22514682-22514776)
chr2 (195-288)||(28777283-28777377)
chr2 (21-94)||(22654339-22654412)
chr2 (215-272)||(24828161-24828218)
chr2 (215-272)||(24832613-24832670)
chr2 (21-214)||(43644713-43644894)
chr2 (192-272)||(720835-720918)
chr2 (195-297)||(8942124-8942228)
chr2 (195-372)||(23773015-23773193)
chr2 (140-214)||(3800969-3801043)
chr2 (21-92)||(460832-460901)
chr2 (140-207)||(3800822-3800889)
chr2 (219-297)||(17398170-17398249)
chr2 (26-92)||(23806415-23806479)
chr2 (195-288)||(20013601-20013695)
chr2 (195-288)||(23818658-23818752)
chr2 (21-75)||(24573266-24573320)
chr2 (160-214)||(25211022-25211076)
chr2 (215-265)||(25211379-25211429)
chr2 (160-213)||(461007-461060)
chr2 (21-74)||(22581805-22581858)
chr2 (121-196)||(4449966-4450042)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (21-398)||(13964-14354)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (21-288)||(20860-21128)
scaffold0008 (21-289)||(28450-28719)
scaffold0008 (200-374)||(129700-129877)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (21-398)||(4425-4805)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (21-288)||(535-802)
[»] scaffold0447 (6 HSPs)
scaffold0447 (192-398)||(3095-3301)
scaffold0447 (21-108)||(2475-2561)
scaffold0447 (140-214)||(2737-2811)
scaffold0447 (140-214)||(2865-2939)
scaffold0447 (151-214)||(2620-2683)
scaffold0447 (140-214)||(2993-3067)
[»] scaffold0383 (7 HSPs)
scaffold0383 (192-398)||(5703-5909)
scaffold0383 (21-214)||(328-511)
scaffold0383 (158-288)||(813-943)
scaffold0383 (21-108)||(5339-5425)
scaffold0383 (151-214)||(5484-5547)
scaffold0383 (140-214)||(641-715)
scaffold0383 (140-214)||(5601-5675)
[»] scaffold0396 (4 HSPs)
scaffold0396 (194-398)||(13680-13884)
scaffold0396 (195-374)||(15922-16103)
scaffold0396 (127-214)||(13914-14001)
scaffold0396 (21-97)||(14078-14154)
[»] scaffold0622 (4 HSPs)
scaffold0622 (217-398)||(7927-8108)
scaffold0622 (38-214)||(7453-7631)
scaffold0622 (138-214)||(7683-7759)
scaffold0622 (140-206)||(7842-7908)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-398)||(249025-249394)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (192-398)||(3129-3335)
scaffold0434 (21-214)||(2907-3101)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (21-289)||(7012-7287)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (140-398)||(3784-4044)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (21-214)||(27950-28145)
scaffold0116 (158-288)||(28197-28327)
scaffold0116 (140-214)||(28125-28199)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (215-398)||(27067-27250)
scaffold0120 (21-102)||(26873-26954)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (21-214)||(13548-13740)
scaffold0359 (178-288)||(13434-13543)
[»] scaffold0195 (8 HSPs)
scaffold0195 (139-398)||(19799-20067)
scaffold0195 (193-398)||(17776-17983)
scaffold0195 (245-398)||(8140-8293)
scaffold0195 (245-398)||(13529-13682)
scaffold0195 (21-214)||(17526-17716)
scaffold0195 (21-214)||(19556-19746)
scaffold0195 (21-94)||(8466-8539)
scaffold0195 (21-94)||(13855-13928)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (21-214)||(4638-4831)
scaffold0483 (192-374)||(4250-4435)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (21-214)||(49478-49671)
scaffold0109 (192-374)||(49090-49275)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (21-288)||(1046-1307)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (214-398)||(56431-56615)
scaffold0051 (21-194)||(56206-56370)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (21-214)||(156183-156376)
scaffold0023 (21-214)||(85966-86149)
scaffold0023 (194-370)||(34811-34989)
scaffold0023 (195-288)||(155937-156031)
scaffold0023 (21-69)||(92252-92300)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (21-206)||(236412-236597)
scaffold0009 (193-398)||(236652-236857)
scaffold0009 (140-378)||(270545-270785)
scaffold0009 (21-214)||(270329-270515)
scaffold0009 (294-338)||(255963-256007)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (21-213)||(26451-26642)
scaffold0138 (21-288)||(15006-15271)
scaffold0138 (305-398)||(23915-24009)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (139-398)||(8493-8754)
scaffold0190 (21-75)||(8387-8441)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (23-214)||(77600-77793)
scaffold0034 (214-272)||(77919-77977)
[»] scaffold0269 (4 HSPs)
scaffold0269 (21-213)||(3055-3248)
scaffold0269 (21-214)||(281-477)
scaffold0269 (214-374)||(577-739)
scaffold0269 (200-288)||(3430-3518)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (21-213)||(30650-30843)
scaffold0049 (200-288)||(31002-31090)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (21-214)||(21633-21827)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (245-398)||(71768-71922)
scaffold0058 (21-94)||(72093-72166)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (21-205)||(2474-2658)
scaffold0342 (21-288)||(4078-4346)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (21-205)||(14849-15032)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (28-214)||(29644-29830)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (21-288)||(26416-26660)
scaffold0037 (278-398)||(70883-71003)
scaffold0037 (21-282)||(66322-66592)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (104-288)||(3707-3893)
scaffold0673 (21-108)||(3927-4014)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (248-398)||(2112-2262)
scaffold0610 (21-63)||(2469-2511)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (249-398)||(106409-106559)
scaffold0022 (195-374)||(6649-6830)
scaffold0022 (21-268)||(113902-114150)
scaffold0022 (244-357)||(130409-130522)
scaffold0022 (195-374)||(58936-59117)
scaffold0022 (192-288)||(108058-108156)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (21-208)||(499-683)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (21-214)||(33395-33580)
scaffold0184 (200-378)||(32688-32869)
scaffold0184 (170-288)||(33730-33848)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (21-214)||(39264-39449)
scaffold0078 (200-378)||(39975-40156)
scaffold0078 (170-288)||(38996-39114)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (182-359)||(68785-68964)
scaffold0031 (24-198)||(68597-68773)
scaffold0031 (351-398)||(69394-69441)
scaffold0031 (21-239)||(30314-30531)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (140-378)||(2627-2869)
scaffold0597 (21-214)||(2899-3083)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (21-213)||(17735-17928)
scaffold0292 (192-288)||(18055-18151)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (249-398)||(4842-4991)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (21-214)||(16770-16961)
scaffold0315 (214-272)||(17070-17128)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (21-272)||(19248-19489)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (200-378)||(145016-145195)
scaffold0025 (200-378)||(147275-147454)
scaffold0025 (160-214)||(144926-144980)
scaffold0025 (160-214)||(147185-147239)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (21-167)||(23040-23186)
scaffold0158 (21-90)||(16376-16445)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (249-398)||(7153-7303)
scaffold0095 (21-94)||(7416-7489)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (249-379)||(78342-78472)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (249-398)||(118094-118244)
scaffold0016 (204-288)||(163817-163901)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (194-376)||(54118-54300)
scaffold0032 (158-374)||(109582-109799)
scaffold0032 (21-214)||(53931-54112)
scaffold0032 (140-214)||(109897-109971)
scaffold0032 (160-213)||(110002-110055)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (200-378)||(197600-197778)
scaffold0004 (244-358)||(84942-85056)
scaffold0004 (244-358)||(26080-26194)
scaffold0004 (32-91)||(197920-197978)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (24-214)||(6984-7175)
scaffold0338 (204-288)||(7214-7298)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (21-214)||(9930-10122)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (270-379)||(78228-78337)
scaffold0028 (140-288)||(90600-90748)
scaffold0028 (21-97)||(90942-91018)
scaffold0028 (104-214)||(90802-90913)
scaffold0028 (195-356)||(128867-129026)
scaffold0028 (140-214)||(128730-128804)
[»] scaffold0407 (4 HSPs)
scaffold0407 (21-119)||(21-119)
scaffold0407 (21-119)||(6485-6583)
scaffold0407 (192-288)||(6310-6406)
scaffold0407 (138-214)||(6410-6486)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (228-398)||(25101-25274)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (257-379)||(34006-34128)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (200-378)||(217246-217426)
scaffold0003 (21-93)||(5221-5293)
scaffold0003 (195-288)||(5661-5755)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (214-358)||(3244-3393)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (21-214)||(21158-21344)
scaffold0039 (192-288)||(20906-21002)
scaffold0039 (140-214)||(21030-21104)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (192-378)||(11532-11716)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (195-374)||(4320-4501)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (200-371)||(5102-5274)
scaffold0266 (200-288)||(12788-12876)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (58-212)||(94340-94495)
scaffold0044 (192-239)||(94695-94742)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (21-291)||(1652-1925)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (250-398)||(14101-14250)
scaffold0346 (138-214)||(15935-16011)
scaffold0346 (192-266)||(15833-15907)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (121-288)||(6215-6386)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (195-374)||(51511-51690)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (195-374)||(14779-14958)
scaffold0225 (195-374)||(28300-28479)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (21-93)||(27169-27241)
scaffold0026 (195-374)||(106479-106660)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (244-379)||(211-346)
scaffold0786 (244-379)||(5266-5401)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (21-214)||(804-987)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (244-379)||(3799-3934)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (260-379)||(4568-4686)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (254-378)||(1-126)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (21-288)||(3125-3395)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (21-93)||(376-448)
scaffold0384 (195-287)||(1-94)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (21-93)||(15167-15239)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (121-288)||(31923-32093)
scaffold0103 (21-97)||(31776-31850)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (193-374)||(1292-1469)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (195-374)||(35-215)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (21-203)||(25538-25718)
scaffold0134 (140-204)||(25735-25799)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (21-93)||(31120-31192)
scaffold0130 (49-144)||(12989-13085)
scaffold0130 (140-198)||(31333-31391)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (200-288)||(40010-40098)
scaffold0106 (21-93)||(37627-37697)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (254-358)||(55922-56026)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (200-378)||(41190-41371)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (195-374)||(9426-9607)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (28-210)||(44266-44443)
scaffold0066 (28-195)||(52435-52597)
[»] scaffold0450 (2 HSPs)
scaffold0450 (21-108)||(4639-4725)
scaffold0450 (139-207)||(4528-4596)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (21-206)||(75550-75727)
scaffold0001 (217-288)||(72106-72177)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (200-374)||(7465-7641)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (86-268)||(145231-145413)
scaffold0014 (21-94)||(144987-145060)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (194-272)||(1509-1587)
scaffold1140 (21-155)||(1298-1427)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (312-378)||(52771-52837)
scaffold0018 (312-378)||(56723-56789)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (200-272)||(6826-6898)
scaffold0218 (21-214)||(6934-7115)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (219-372)||(29855-30009)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (195-379)||(17586-17771)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (195-288)||(37768-37862)
[»] scaffold1610 (1 HSPs)
scaffold1610 (21-92)||(45-114)
[»] scaffold1605 (1 HSPs)
scaffold1605 (21-92)||(1465-1534)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (312-358)||(4532-4578)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (294-338)||(12285-12329)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (21-64)||(7299-7342)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (195-288)||(25382-25476)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (195-288)||(3160-3254)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (196-269)||(7049-7125)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26072131 - 26071753
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
26072131 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 26072032  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
26072031 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 26071932  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
26071931 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtatcggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 26071832  T
320 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26071831 tttcacacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 26071753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26095918 - 26095540
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
26095918 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 26095819  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
26095818 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 26095719  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
26095718 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtatcggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 26095619  T
320 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26095618 tttcacacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 26095540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 3893381 - 3893772
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata------cttaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||      ||||||    
3893381 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatt-caacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcataaatatatatatacttaca 3893479  T
115 tcaat-cctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----a 207  Q
    ||||  || |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     |    
3893480 tcaaaaccccaatatctcacattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcaccaatca 3893579  T
208 tatatc--aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaa 305  Q
     || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
3893580 catttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaa 3893679  T
306 catcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3893680 catcgtatgtaagagttcacacctgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 3893772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15824371 - 15824105
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
15824371 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 15824272  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||    
15824271 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacataatcaccaaacacatacatcaataaga 15824172  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15824171 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 15824105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 12753172 - 12753558
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||    
12753172 acatcatcataatccaaataacatttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcacaaata-atacttatatcacat 12753270  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 213  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||   || ||||||||||||| ||| |||||||     | || ||    
12753271 tctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaatcatcaatttgcagttattcatacacagtcaccaatcaccaatcacatttc 12753370  T
214 aataa---gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 310  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
12753371 aaaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 12753470  T
311 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
12753471 tatttaagatttcacacccgtcttacataatttccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatg 12753558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 141869 - 142136
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
141869 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaatcatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 141968  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
141969 cccaatatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaattattcatacacaataaccaatcacatacatcaataaga 142068  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
142069 ctcatgtcatgatatgcacctatcaacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 142136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 44863443 - 44863711
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
44863443 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacttatacttacatcaaaa 44863542  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
44863543 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcaataag 44863642  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44863643 actcatgtcatgatattcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 44863711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 47287976 - 47288244
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
47287976 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcgtacatatacttacatcaaaa 47288075  T
121 -ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
47288076 acccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaattacatacatcaataag 47288175  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
47288176 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatcccaaggttgtcac 47288244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 113168 - 112784
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || |   | ||||   |||||||||||||      
113168 acatcatcataatccaaataacatttagcatgaatatttcaaaataaacattatgcacttgatcaatagtagt---cacatatcaatacttacatcaaaa 113072  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca------ 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||  ||  ||          
113071 ctcaatatctcacatcaataataaccaatcacatgtgtcatgaacaaacaacaattcacatttattcatacgcaattatcaatcaccaatcacattttca 112972  T
215 -ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtc---actttcgatgcaacaaaaacatcg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
112971 aataagactcatgtcatgatatgcacttattaacacataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 112872  T
311 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
112871 tatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaatccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 112784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 124 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 45454016 - 45453745
Alignment:
124 aatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagact 222  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||    
45454016 aatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcaca-attcaaataagact 45453918  T
223 catgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagattt 322  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||    
45453917 catgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcatcaccttcgatgcaacaaaa---tcgtatgtaagattt 45453821  T
323 cacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
45453820 cacatccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatg 45453745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 1938629 - 1938257
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || |||||||| || |||||||| || |  | |||    |||||||| ||   |    
1938629 acattatcataatccaaatagcagttaacatgaatatttcaatt--aagatcatgcatttaatcaataaaaaaa--cacatttcaatacttacgtcgcac 1938534  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
      |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| | | | |||||||    
1938533 tccaatatctcacatcaataaccaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaatacacaattatgcatacgtaatcaccaatcacgtttctaaataaga 1938434  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagat 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||| |  ||| |||||| |||||||      
1938433 ctcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctttgatg-ataaaacacatcgtatgtaaggg 1938335  T
321 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
1938334 ttcacacccaccttacataatctccgaagtaaaagagttcaactcttttacaactacaatctcaacaagactatgatg 1938257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 7290908 - 7291102
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||      
7290908 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaat 7291007  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa 215  Q
    | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
7291008 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcaa 7291102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7286522 - 7286328
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
7286522 acatcatcataatcaacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 7286423  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
7286422 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 7286328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 15914075 - 15913921
Alignment:
245 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 344  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15914075 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 15913976  T
345 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
15913975 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 15913921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2192799 - 2192606
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
2192799 acattatcataatccaaataacatataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 2192700  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
2192699 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 2192606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13868080 - 13867887
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |     
13868080 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatcataa 13867981  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
13867980 tctcaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatttatacacaatcaccaatcacatatatc 13867887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18305831 - 18305642
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||| ||| |    
18305831 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacaccaaac 18305735  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18305734 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcgtcaatcacatatatc 18305642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16481029 - 16480836
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
16481029 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacatgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 16480930  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
16480929 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 16480836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12545802 - 12545607
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 118  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
12545802 acatcatcatagtccacattacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcttatacatatacttacatcaaaa 12545703  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12545702 accccaatatctcacatcaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacggttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 12545607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15953050 - 15952859
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
15953050 acattatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 15952953  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
15952952 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 15952859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 369143 - 369336
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
369143 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatacatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 369242  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
369243 cccaatatctcacatcaatcatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaattatcaatcatatacatca 369336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 214 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9058311 - 9058141
Alignment:
214 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 308  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
9058311 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 9058212  T
309 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
9058211 cgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaacccttttaaagctacaa 9058141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14253263 - 14253071
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||| |    
14253263 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcaaatcaatacttacatcaaac 14253164  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
14253163 cccaatatctcacatcaataataaccaatcacatgtgtcatg-acaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 14253071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Original strand, 13388493 - 13388643
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
13388493 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacagaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtattacataatcaccgaa 13388592  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
13388593 gtaaaagagctcaacccttttacaactataagactcaacatgactatgatg 13388643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15762051 - 15761867
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc 292  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||    
15762051 aatcaccaaccacatttatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttc 15761952  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15761951 gatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 15761867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32496242 - 32496053
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
32496242 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 32496143  T
291 tcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
32496142 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgcgttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 32496053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49049723 - 49049452
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatc-aataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||||| | |||| |||| | |||   |||    
49049723 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacatatatattcataccataat 49049624  T
120 cctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
    || |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| |||| | |||| |||||| | |||||||    
49049623 cc-caatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacactaatcattcacatttcatcaata 49049525  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
49049524 agactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 49049452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15762445 - 15762262
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||     
15762445 acatcaacataatcaaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaa 15762346  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
15762345 cctcaatatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 15762262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 249 - 374
Target Start/End: Original strand, 13376200 - 13376324
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
13376200 cataaatgcatatggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcaca-ccgtcttacataatcaccgaa 13376298  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
13376299 gtaaaagagctcaacccttttacaac 13376324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20587254 - 20587140
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
20587254 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactcatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 20587155  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    ||||| |||||||||    
20587154 ccgaaataaaagagt 20587140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13867784 - 13867688
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
13867784 acaatcaccaaccacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 13867688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Original strand, 15629004 - 15629255
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| | ||||||| |  ||| |||| | |||   |||    
15629004 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaatcataatatccatatatatattcataccataat 15629103  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||| | |||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||    
15629104 cc-caatatcttacatcaattaatcaccaatcagatgtgttatgaacaatcatcaactcacatttattcatgcacaatcatcattcacatttcaccaata 15629202  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtacca 268  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||    
15629203 agactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtacca 15629255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 8565212 - 8565108
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
8565212 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaataaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaa 8565113  T
354 agagt 358  Q
    |||||    
8565112 agagt 8565108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18255505 - 18255324
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
18255505 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 18255406  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||    
18255405 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagcgcttagcccttttacaac 18255324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 249 - 378
Target Start/End: Original strand, 3058585 - 3058713
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
3058585 cataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttatataatctccgaa 3058683  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
3058684 gtaaaagagctcaacccttttacaactaca 3058713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 249 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9322703 - 9322594
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
9322703 catatatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcactgaa 9322604  T
349 gtaaaagagt 358  Q
    ||||||||||    
9322603 gtaaaagagt 9322594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 11285619 - 11285715
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
11285619 acaatcattaatcacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaattaactcaaggtcgtcac 11285715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 28718977 - 28719091
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||     
28718977 cgacacatatatgcatgtggtaccaagtcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaatatcacatgtaagatttcacacctgtcttacattatca 28719076  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||| ||||    
28719077 ccgaagtaaacgagt 28719091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Original strand, 2024692 - 2024757
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
2024692 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11582631 - 11582535
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
11582631 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcatttcagggtcgtcac 11582535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Original strand, 13272976 - 13273246
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||| | |||| | || | |||   |||    
13272976 acatcatcataattcacataacagttgacaagaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacatatacattcataccataat 13273075  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
    || | |||||| ||||| || |||||||||| |||||||||  ||||||  |||||  |||| |||| ||| ||||||||||| |||||| | | |||||    
13273076 cc-cgatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtctggaacaatcatcaaatcacatttatccatgcacaatcatcattcacatttcaccaata 13273174  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 287  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
13273175 agactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtca 13273246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15952813 - 15952673
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
15952813 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacattttcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 15952714  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||    
15952713 atgtggtaccaagtctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 15952673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Original strand, 125378 - 125492
Alignment:
265 accaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaac 363  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
125378 accaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggtttacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaac 125477  T
364 ccttttacaactaca 378  Q
    |||||||||||||||    
125478 ccttttacaactaca 125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 378
Target Start/End: Original strand, 2027097 - 2027222
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaa 352  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
2027097 atgcatgtggtaccaaatctcgaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcacatcgtatgtaagggttcacccccgacttacataatctccgaagtaa 2027196  T
353 aagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
2027197 aagagctcaacccttttacaactaca 2027222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13038905 - 13038808
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
13038905 acaatcaccaatcacatatatcaataaaactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatttcagggtcgtcact 13038808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 16416509 - 16416581
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
16416509 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataat 16416581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12249908 - 12249771
Alignment:
153 atgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgca 250  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||    
12249908 atgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacattcactaatcacatttcgaaataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacaca 12249809  T
251 tacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
12249808 tatatgcatgtggtaccatatcacttcaaagtcgtcac 12249771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12545501 - 12545404
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtacc-aaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
12545501 acaatcaccaaccacatttatcaataagacttatgtcatgatatgcaccaattgacacatatatgcatgtggtaccaaaatcacctcaaggtcgtcac 12545404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16571919 - 16571751
Alignment:
123 caatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagac 221  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||    
16571919 caatacctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcgtgaacaatcatcaactcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaataagac 16571820  T
222 tcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    | |||||||| | ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||    
16571819 ttatgtcatgttgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcatcac 16571751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 288
Target Start/End: Original strand, 16593743 - 16593911
Alignment:
123 caatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagac 221  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||    
16593743 caatacctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcgtgaacaatcatcaactcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaataagac 16593842  T
222 tcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    | |||||||| | ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||    
16593843 ttatgtcatgttgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcatcac 16593911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16572053 - 16571983
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataata 91  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16572053 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16571983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 16593609 - 16593679
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataata 91  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16593609 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16593679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13039114 - 13038991
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
13039114 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatccataataa-----tcacacattaatacttacatcac 13039022  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaat 149  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
13039021 acctcaatatctcacatcaataatcatcaat 13038991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 36051075 - 36051147
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
36051075 caatcacatatatcaataagactcatgttatgttatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 36051147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 297
Target Start/End: Original strand, 369364 - 369471
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 289  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
369364 acaatcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 369463  T
290 ttcgatgc 297  Q
    ||||||||    
369464 ttcgatgc 369471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11582840 - 11582659
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
11582840 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatagttcaatt--aacatcatgcatttgattaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 11582748  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| |       |||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||    
11582747 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatca-------catggacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaaccacatttatca 11582659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Original strand, 2024763 - 2024858
Alignment:
123 caatatctcacatccataatcaccaatta----catgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |    | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
2024763 caatatctcacatcaataatcaccaatcaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcatcaatcatatacatca 2024858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10862661 - 10862515
Alignment:
143 caccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacat 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| |||| |||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |    
10862661 caccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaac-cacatttat-catgaacaatcatcaatcacatttcaccaataagacttatgtcatgatatgcacct 10862564  T
242 a--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |  ||||| |||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
10862563 agttcgacacatatatgcatgcagtagcaaatcacttcaaggtcgtcac 10862515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 372
Target Start/End: Original strand, 10988092 - 10988271
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-cttt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
10988092 aatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 10988191  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
10988192 cgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 10988271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 271
Target Start/End: Original strand, 122987 - 123059
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaat 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
122987 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtgccaaat 123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Original strand, 16210183 - 16210263
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||    
16210183 acaatcacaaatcacatatatcaatgagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcacgtggtaccaaatc 16210263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26010874 - 26010695
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac-tttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||| ||||    
26010874 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtgccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 26010775  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttaca-taatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
26010774 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatctc-gaagtaaaagagttcaacccttttaca 26010695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 45455581 - 45455505
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
45455581 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataatttaattcaaaaatcatatacttgatcaataatgatattc 45455505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 122770 - 122951
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||      ||| ||||  ||| ||||||||     
122770 acattatcataatccaaatagcagttaacacgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataata-----gtcacacattaataattacatcac 122862  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| |       ||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||| |||| |||| |||||    
122863 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatca-------catgaacaattatcaattcacaactattaattcacaatcaccaattacatttatca 122951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12545627 - 12545553
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
12545627 aatcaccaatcacatatatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcccatatatca 12545553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18305546 - 18305492
Alignment:
185 ttcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18305546 ttcataaacaatcaccaaccacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 18305492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2192453 - 2192376
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaat 271  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
2192453 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaat 2192376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15518539 - 15518435
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
15518539 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 15518440  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
15518439 gatgc 15518435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 2436110 - 2436285
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||| || |    
2436110 atcaccaatcacataattcacataggactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaaaaaggtcgtcacctttg 2436209  T
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||| |  ||| ||||| ||||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
2436210 atg-ataaaacacatcacatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaac 2436285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 252
Target Start/End: Original strand, 2024904 - 2024998
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcata 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
2024904 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcataatatgcacttattgacacata 2024998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 358
Target Start/End: Original strand, 4483318 - 4483364
Alignment:
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
4483318 atgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaaagagt 4483364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Original strand, 7291277 - 7291335
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
7291277 aatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 7291335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 7821406 - 7821500
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
7821406 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 7821500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 7828717 - 7828811
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
7828717 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 7828811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 16416949 - 16417043
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
16416949 atcaccaatcgcatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16417043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16480683 - 16480605
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||    
16480683 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgatacataaatgcatgtggtaccaaatc 16480605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27103228 - 27103134
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
27103228 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 27103134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27110576 - 27110482
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
27110576 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 27110482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 27175098 - 27175192
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
27175098 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 27175192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38785320 - 38785226
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
38785320 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 38785226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 16209975 - 16210045
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||    
16209975 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattctatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 16210045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 32496451 - 32496381
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
32496451 acattatcataatccaaacagcagttaacatgaatatttcaatt--aacaacatgcatttgatcaataataat 32496381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Original strand, 3054982 - 3055049
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataa 89  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
3054982 acattatcataattcaaatagcagttaacatgaatatttcaa-ttaatcatcatgcatttgatcaataa 3055049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 296
Target Start/End: Original strand, 4483268 - 4483320
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatg 296  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
4483268 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacgtcaaggtcgtcaccttcgatg 4483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 358
Target Start/End: Original strand, 13757060 - 13757225
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
13757060 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 13757159  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
13757160 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt 13757225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 239
Target Start/End: Original strand, 3055193 - 3055241
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
3055193 acaatcaccaatcacatatatcaaacaagactcatgtcatgatatgcac 3055241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25293960 - 25293856
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
25293960 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 25293861  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
25293860 gatgc 25293856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 11514604 - 11514698
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
11514604 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctctacaaggtcgtcac 11514698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15443240 - 15443146
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
15443240 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 15443146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30263805 - 30263727
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
30263805 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatc 30263727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42057819 - 42057741
Alignment:
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
42057819 actcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 42057741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3193630 - 3193586
Alignment:
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 338  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
3193630 gatgcaacaaaaacatca-atgtaacatttcacacccgtcttacat 3193586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 371
Target Start/End: Original strand, 19066193 - 19066262
Alignment:
302 aaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttac 371  Q
    ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||  || |||||||||    
19066193 aaaacatcctatgtaagatttcacgtccgtcttacattttcgccgaagtaaaagagcacaccccttttac 19066262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 337
Target Start/End: Original strand, 13460914 - 13460958
Alignment:
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttaca 337  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
13460914 gatgcaacaaaaacatcaaatgtaagatttcactcccgtattaca 13460958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13912791 - 13912691
Alignment:
199 tcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatg 296  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||  ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||    
13912791 tcaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttacggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatg 13912692  T
297 c 297  Q
    |    
13912691 c 13912691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 21 - 397
Target Start/End: Original strand, 5845 - 6221
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |    
5845 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattcaaacatcatgtatttgatcaataataacattctcatacatatagttacattaaac 5944  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
5945 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaaa 6044  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagat 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
6045 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagat 6144  T
321 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6145 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 6221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 138673 - 138296
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
138673 acatcatcataatccaaataacagttaacattaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattttcatacttatacttacatcaaac 138574  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
138573 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtttcatgaacaaatatcaattcaaaattatttatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 138474  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagat 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
138473 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaatat 138374  T
321 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
138373 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 138296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 76589 - 76853
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||  |||   ||||||||||||| |    
76589 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgat---taataatattcatatatcaatacttacatcaaac 76685  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
76686 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatctcaattcacaattattcatgcacaatcaccaatcacatatatcaataaga 76785  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
76786 ctcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 76853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 268
Target Start/End: Original strand, 9998 - 10148
Alignment:
121 ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 218  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||    
9998 ctcattatctcacatcaattaatcatcaatcacatgtgccatgaacaatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacatttcagcaataa 10097  T
219 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtacca 268  Q
    |||||||| |||||| || || ||   |||| ||||||||||||||||||||    
10098 gactcatg-catgatgtgtacctagcccgacacatacatgcatgtggtacca 10148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 89)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 31626739 - 31627117
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
31626739 acatcatcttaatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 31626838  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
31626839 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatattaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 31626938  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
31626939 actcatgtcatgatatgcacctatagacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcatatgtaaga 31627038  T
320 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
31627039 tttcacacatgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacgactacattctcaacacgactatgatg 31627117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 18775506 - 18775886
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | ||||||||||||| |    
18775506 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataaaattcaaaaaaaaatacttacatcaaac 18775605  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-------atatatc 213  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||       || |       
18775606 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcataaacaaaaatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcaccattcacattttca 18775705  T
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcat 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
18775706 aataagacttatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaagtcgtcaccttcgatacaacaaagacatcgtat 18775805  T
314 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
18775806 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacaactat 18775886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Original strand, 22428473 - 22428850
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca- 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||     
22428473 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaacaataatactcaaatatatcaatacttacatcat 22428572  T
118 atcctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaat 216  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||||||||||  |||| || |||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||     
22428573 atccccaacatctcacatcaaataatcaccaaacacatatgacatgaacaatcatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaac 22428672  T
217 aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
22428673 aagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgta 22428772  T
317 agatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 394  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22428773 cgatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttgaacccttttacaactacaaactcaacacgactat 22428850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 16104850 - 16105237
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |     
16104850 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcgttataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacataacaatacttacatcatac 16104949  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 213  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||     | || ||    
16104950 ccccaatatctcacatcaattaatcacctatcacatttgtcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcactaatcacatttc 16105049  T
214 ---aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 310  Q
       || |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
16105050 caaaacaagactcatgtcatgatatgtacttattgacacataaatgcatgtggtaccggataacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 16105149  T
311 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
16105150 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaagactatgatg 16105237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25646786 - 25646518
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
25646786 acatcatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatacatatacttacatcaaaa 25646687  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
25646686 ccccaatatttcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaactattcacacacaatcaccaatcaaatatatcaataag 25646587  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25646586 actcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 25646518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25746160 - 25745792
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||           ||  || |    
25746160 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcat-----------ca--aaac 25746074  T
121 ctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc- 213  Q
    | |||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     | || ||     
25746073 cccaatatctcacattaataaatccccaatcacgtgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcaccaatcacatttcc 25745974  T
214 -aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgca 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
25745973 aaataagactcatgtcatgatatgcagttattgacacataaattcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccctcgatgcaacaaaaacatcgta 25745874  T
313 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 394  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25745873 tgtaagagttcacacctgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 25745792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35017645 - 35017451
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
35017645 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatatcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatagatatacttacatcaaaa 35017546  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
35017545 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 35017451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35011316 - 35011124
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
35011316 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 35011217  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
35011216 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 35011124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 18128340 - 18128532
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |    
18128340 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttca-tctaaacatcatgcacttgatcaataattacattcccatacatatacttacatcaaac 18128438  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
18128439 cccaatatctcacatcaataatctccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaatcacatatatca 18128532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 273 - 398
Target Start/End: Original strand, 16083970 - 16084095
Alignment:
273 acctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16083970 acctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 16084069  T
373 actacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
16084070 actacaatctcaacaagactatgatg 16084095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 18578834 - 18579027
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
18578834 acatgatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatatgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 18578933  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
18578934 cccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18579027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33316606 - 33316422
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
33316606 acattatcataaaccaaatagcagttaacatggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 33316507  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
33316506 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 33316422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18843900 - 18843708
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
18843900 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatattttaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 18843803  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
18843802 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18843708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 398
Target Start/End: Original strand, 18128776 - 18128964
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgat-----gcaacaaaaacatc 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||     || ||   ||||||    
18128776 ataagactcatgtcatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaaatcacctccagttcgtcaccttcgattcgatgccacttgaacatc 18128875  T
310 gcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18128876 gtatgtaagatttcacacctgtcttacataatcttcgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 18128964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 19627498 - 19627690
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
19627498 acatcaacataatccaaataacagttaacattattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19627597  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | ||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
19627598 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcatatatatc 19627690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13016702 - 13016436
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
13016702 acatcatcataatccaaata-cagttaacatgaatatttcaatttaa-catcaagcatttgatcaataataatattctaaaaaatatacttacatcaacc 13016605  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca-tatatcaataag 219  Q
    | |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| |  ||| |||||    
13016604 c-caatatctcacattaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcacctgtcacattcaatcgataag 13016506  T
220 actcatgtcatgatatgcacat--atcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| |||||| || | ||  | |||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
13016505 actcatg-catgatgtgtatatagaccgacacaaatatgcatgtggtaccatatcatctcaaggtcgtcac 13016436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18005050 - 18004857
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
18005050 acattatcataatccaaataatagttaacatgaacatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 18004951  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
18004950 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18004857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19984887 - 19984699
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |    
19984887 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatatccaaaaggtcgtcacct 19984788  T
291 tcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
19984787 tcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 19984699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 23975708 - 23975902
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||||||    
23975708 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatt-tcccacatcaatacttacatcaa 23975806  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
23975807 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 23975902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13623121 - 13622937
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||| |    
13623121 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 13623025  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 208  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
13623024 cccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcacat 13622937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14628553 - 14628368
Alignment:
29 ataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatcctcaatat 128  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || |   ||||||||||||| || ||||||    
14628553 ataatccaaataacatataacatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcattaataatattcccacatcaatacttacatcaaaccccaatat 14628454  T
129 ctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
14628453 ctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatgtatca 14628368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 18383323 - 18383173
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
18383323 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcactgaa 18383224  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
18383223 gtaaaagagctaaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 18383173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 1554324 - 1554508
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc 292  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||    
1554324 aatcaccaaccacatttatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttc 1554423  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1554424 gatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 1554508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 169 - 288
Target Start/End: Original strand, 18422184 - 18422303
Alignment:
169 tatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtacca 268  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
18422184 tatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtacca 18422283  T
269 aatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||    
18422284 aatcacctcaaggtcgtcac 18422303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 23151706 - 23151839
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
23151706 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 23151805  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacat 154  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
23151806 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacat 23151839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Original strand, 33323342 - 33323492
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
33323342 cataaatgcatttggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatttccgta 33323441  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | | || ||||||| ||||||||||    
33323442 gtaaaaaagctcaacccttttacaattgcaaaactcaacatgactatgatg 33323492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 1553930 - 1554113
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||     
1553930 acatcaacataatcaaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaa 1554029  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
1554030 cctcaatatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 1554113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 304 - 398
Target Start/End: Original strand, 23151845 - 23151939
Alignment:
304 aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23151845 aacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 23151939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 16238848 - 16239028
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacc-tcaaggtcgtcactttc 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |    
16238848 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacatatatgcatgtggtacaaaatctccaaaaaggtcgtcacctcc 16238947  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||| |  ||| |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16238948 gatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 16239028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17790776 - 17790652
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17790776 atgcatgtggtaccgaatcacctctaggtcgtcaccttcgatgcatcaaca-catcgtatataagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 17790678  T
354 agagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
17790677 agagctcaacccttttacaactacaa 17790652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 255 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 16889379 - 16889236
Alignment:
255 tgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaa 354  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16889379 tgcatgtggtaccgaatcacctccaggtcgtcaccttcgatgcatcaaca-catcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaa 16889281  T
355 gagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
      | |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
16889280 tcgctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 16889236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 34965470 - 34965584
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||     
34965470 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacattatca 34965569  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
34965570 ccgaagtaaaagagt 34965584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 273 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 35137565 - 35137439
Alignment:
273 acctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
35137565 acctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatcttcgtagtaaaagagctcaacccttttaca 35137466  T
373 actac-aatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||    
35137465 actgcaaaactcaacatgactatgatg 35137439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 18397163 - 18397434
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||  |    
18397163 acatcatcataatccacataacgtttaacatgaatatttcaatttaaacttcgtgtacttggtcaataataatattcacatatatatacatatatcacga 18397262  T
119 tcctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 216  Q
    | ||||| | |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| || |||||||||||||| || | ||||    
18397263 t-ctcaacaactcacatcaattaatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaagtatccaatcacatttattcatgcaaaatcatcaatcacaaatcaccaat 18397361  T
217 aagactcatgtcatgatatgca--catatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||| |||||| || |   | | || | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
18397362 aagactcatg-catgatgtgtatctagaccggcacttatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 18397434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16828003 - 16827875
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||| |    
16828003 acattatcataatccaaataacagttaatatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacgtcaatacttacatcaaac 16827904  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaat 149  Q
    | || ||||||||||| ||||||| ||||    
16827903 cccattatctcacatcaataatcatcaat 16827875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 214 - 357
Target Start/End: Original strand, 22846615 - 22846767
Alignment:
214 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 308  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
22846615 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtagtaccaaatcaccgcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 22846714  T
309 cgc----atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    ||     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
22846715 cgatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 22846767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 11214623 - 11214803
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacc-tcaaggtcgtcactttc 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | |    
11214623 atcatcaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaaggtcgtcacctcc 11214722  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||| |  ||| |||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
11214723 gatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcacccccgctttacataatctccgaagtaaaagagctcaaccattttacaac 11214803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 32896282 - 32896492
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||| ||| |||||||| |||  |||||          |||||||||||| |     
32896282 acatcatcataatccaaataacagttaccatgaataatttaattcaaacattatgtacttgatcgatataaatat----------atacttacatcataa 32896371  T
120 cctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 218  Q
    || ||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||    
32896372 ccccaataactcatatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttctaaataa 32896471  T
219 gactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    |||||||||||||||||||||    
32896472 gactcatgtcatgatatgcac 32896492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25369165 - 25369014
Alignment:
139 taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgc 237  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||    
25369165 taatcaccaatcacaagtgtcatgaacaatcatcaat-cacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatgtgc 25369067  T
238 acata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    || ||  |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
25369066 acctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 25369014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 358
Target Start/End: Original strand, 16134814 - 16134918
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
16134814 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcttcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaa 16134913  T
354 agagt 358  Q
    |||||    
16134914 agagt 16134918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18825774 - 18825647
Alignment:
88 aataatattctcatacatatacttacatcaat-cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattatt 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
18825774 aataatattctcatatatatacttacatcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatt 18825675  T
187 catacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||  ||||||| |||||| ||| ||||    
18825674 catgaacaatcaccaatcatatacatca 18825647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 374
Target Start/End: Original strand, 4989379 - 4989561
Alignment:
193 caatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctt 290  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||    
4989379 caatcatcaatcacatacatcatttaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctt 4989478  T
291 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
4989479 tcgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 4989561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 25173518 - 25173590
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25173518 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 25173590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35017387 - 35017303
Alignment:
204 cacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
35017387 cacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacatattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 35017303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 19852795 - 19852909
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||     
19852795 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacactcgtcttacattatca 19852894  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
     |||| |||||||||    
19852895 tcgaaataaaagagt 19852909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 18422115 - 18422185
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataata 91  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
18422115 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataata 18422185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 18740863 - 18740935
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
18740863 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatagacacatatatgcatgtggtaccaaatc 18740935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1659387 - 1659212
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
1659387 atcaccaatcacatatttcatataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 1659288  T
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||| |  ||| |||||| |||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
1659287 atg-ataaaacacatcgtatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaac 1659212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13622878 - 13622800
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
13622878 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 13622800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 23220222 - 23220336
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||     
23220222 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgttatccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacatccgtcttatattatca 23220321  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    | |||||||||||||    
23220322 ctgaagtaaaagagt 23220336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14628289 - 14628111
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
14628289 atcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 14628190  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
14628189 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 14628111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 18740645 - 18740717
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
18740645 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttgaatataaacatcatgcatttgatcaataataat 18740717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 23976053 - 23976231
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
23976053 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 23976152  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
23976153 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 23976231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 26088319 - 26088497
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
26088319 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgttatgatatgcacttatggacgcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 26088418  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
26088419 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 26088497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 33316260 - 33316158
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
33316260 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcg 33316161  T
294 atg 296  Q
    |||    
33316160 atg 33316158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18835544 - 18835474
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
18835544 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 18835474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 4988988 - 4989061
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||| |||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
4988988 acattatcataatacaaataacaaataacataaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataata 4989061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16827559 - 16827462
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
16827559 acaatcataaatcacatacatcatttaagactcatgtcaagatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16827462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 17787746 - 17787827
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcata 102  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
17787746 acatcatcataatcaaaataataattaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattatcata 17787827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18004732 - 18004635
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
18004732 acaatcaccaatcacatttctcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 18004635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1651605 - 1651466
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||    
1651605 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 1651507  T
313 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
1651506 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 1651466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16650899 - 16650745
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
16650899 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 16650800  T
318 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
16650799 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 16650745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18825515 - 18825420
Alignment:
193 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
18825515 caatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 18825420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19985096 - 19984915
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||| ||||     
19985096 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttatatcac 19985004  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     ||||||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||     ||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
19985003 acctcaatatctcacatcaatcgtcatcaat--catg-----tgaacaattatcgattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 19984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 25174040 - 25174134
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
25174040 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 25174134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27655764 - 27655670
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
27655764 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 27655670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Original strand, 15861243 - 15861375
Alignment:
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 319  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| |||||| |||||||     
15861243 actcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtatgtaagg 15861341  T
320 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
      |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
15861342 ggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 15861375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28196546 - 28196439
Alignment:
184 attcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaag 280  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| | || |||||||||||||||  |||| |||||    
28196546 attcatgcataatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacttatatgcatgtggtaccatttcacttcaag 28196447  T
281 gtcgtcac 288  Q
    ||||||||    
28196446 gtcgtcac 28196439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 288
Target Start/End: Original strand, 15738687 - 15738757
Alignment:
220 actcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
15738687 actcatgtcatcatatgcacctagttcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacttcaacgtcgtcac 15738757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16557669 - 16557515
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
16557669 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgtatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 16557570  T
318 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
16557569 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 16557515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18843576 - 18843481
Alignment:
193 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
18843576 caatcaccaatcacattttcaaatatgacgcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 18843481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Original strand, 23975956 - 23976023
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
23975956 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 23976023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 4989201 - 4989275
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
4989201 aatcaccaattacatgtatcatgaataaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 4989275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 10487364 - 10487458
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
10487364 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 10487458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Original strand, 16238711 - 16238765
Alignment:
154 tgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 208  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
16238711 tgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 16238765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16377963 - 16377869
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
16377963 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16377869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16385287 - 16385193
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
16385287 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16385193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29871153 - 29870975
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
29871153 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 29871054  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
29871053 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 29870975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16827733 - 16827663
Alignment:
144 accaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
16827733 accaattacatgtatcatgaacaaatatcaattaacagttattcatacataatcaccaatcatataaatca 16827663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17343942 - 17343864
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | || |||||||||||||| ||||    
17343942 atcaccaatcacttatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgactcgtaaatgcatgtggtaccgaatc 17343864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 338
Target Start/End: Original strand, 16374954 - 16374999
Alignment:
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 338  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
16374954 gatgtaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacat 16374999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 16230065 - 16230169
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
16230065 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 16230164  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
16230165 gatgc 16230169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 23993645 - 23993749
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
23993645 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 23993744  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
23993745 gatgc 23993749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22227356 - 22227278
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
22227356 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccgaatc 22227278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 25173731 - 25173805
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
25173731 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 25173805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Original strand, 21930417 - 21930462
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcac 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
21930417 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcac 21930462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31162486 - 31162441
Alignment:
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 338  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
31162486 gatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttgacatccgtcttacat 31162441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33316353 - 33316292
Alignment:
144 accaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    |||||| |||||| |||  ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
33316353 accaatcacatgtatcagaaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatca 33316292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 260
Target Start/End: Original strand, 32896494 - 32896538
Alignment:
216 taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
32896494 taagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatg 32896538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 37760 - 38101
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
37760 acatcatcataatccaaataacagttaccatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 37859  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
37860 ccccaatatctcacatcaataatcaccaataacaagtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcactaag 37959  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaaga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
37960 actcatgtcatgatatgcacatatcgacacgtacatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaga 38059  T
320 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
38060 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaaaagttca 38101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 101)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 37605283 - 37605668
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
37605283 acatcatcataatctaaataacagttaacatgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaac 37605382  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcataca-------caatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |       
37605383 cccaatatttcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcaccaatcatcaatcacatttcca 37605482  T
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtc-gtcactttcgatgcaacaaaaacatcgca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |    
37605483 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtctgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcata 37605582  T
313 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37605583 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaaataaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 37605668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 364
Target Start/End: Original strand, 41243948 - 41244277
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
41243948 acatcatcataatccaaataacagttaacatgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 41244047  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||||    
41244048 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaat--------------cctcaatcacatatatcaataaga 41244133  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagat 320  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
41244134 ttcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagat 41244233  T
321 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacc 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41244234 ttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacc 41244277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 25120745 - 25121012
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
25120745 acatcatcataatccaaataacagttaacatgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 25120844  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
25120845 cccaatatctcacataaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacacaattatcaaacacatatatcaataaga 25120944  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25120945 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 25121012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19995078 - 19994802
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatactta-------- 112  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||            
19995078 acatcatcataatcaaaataatagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatatatatatatata 19994979  T
113 catcaat-cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatata 211  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
19994978 catcaaaaccccaataactcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccaaacacatata 19994879  T
212 tcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19994878 tcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 19994802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41509122 - 41508927
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
41509122 acatcatcataatccaaataacagttaatatggatatttcaattcaaacatcaggcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 41509023  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
41509022 accccaatatctcacatcaataatcaccactcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 41508927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 20479893 - 20480166
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacata------tacttaca 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||      ||||||||    
20479893 acatcatcataatcaaaataacacttaacatggatagttcaatataaacatcatgcatttgatcaa-aatgatattctcatatatacatatatacttaca 20479991  T
115 tcaatcctcaa-tatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    ||||  | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||    
20479992 tcaaaacccaaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacataatcaccgagcacatatatc 20480091  T
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
20480092 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaatgtcgtcac 20480166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13664743 - 13664550
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
13664743 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 13664644  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
13664643 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 13664550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13724018 - 13723825
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
13724018 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 13723919  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
13723918 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 13723825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16204052 - 16203832
Alignment:
159 catgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgca 258  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||    
16204052 catgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgca 16203953  T
259 tgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa-aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| | |||   |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
16203952 tgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggatcaattcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtaaaagag 16203853  T
358 ttcaacccttttacaactaca 378  Q
     ||||||||||||||||||||    
16203852 ctcaacccttttacaactaca 16203832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 18610428 - 18610620
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
18610428 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 18610527  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | ||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
18610528 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 18610620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 16416537 - 16416810
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacata------tacttaca 114  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||  ||| |||      |||| |||    
16416537 acatcatcataatcaaaataataattaacatggatagttcaatataaacatcataca-ttgatcaataatgatattcaaatatatacatatatactcaca 16416635  T
115 tcaat-cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||| | | |||||||||     
16416636 tcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaataatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccgaacacatatatg 16416735  T
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
16416736 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcatcac 16416810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24108657 - 24108465
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
24108657 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 24108560  T
121 ctc-aatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
24108559 ctccaatatgtcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 24108465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22008548 - 22008366
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
22008548 acattatcataatccaaataacagttaacataaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 22008449  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 203  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || | ||||||||||||||||||||||    
22008448 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcatttcatagttattcatacacaatcatcaat 22008366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22909535 - 22909342
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||      
22909535 acattatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaat 22909436  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
22909435 cccaatatctcaaattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 22909342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 270 - 398
Target Start/End: Original strand, 41245210 - 41245338
Alignment:
270 atcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttt 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
41245210 atcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccatttt 41245309  T
370 acaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
41245310 acaactacaatttcaacacgactatgatg 41245338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21192384 - 21192234
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
21192384 cataaatgcatgtggtaccgaatcaccttaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaa 21192285  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
21192284 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 21192234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Original strand, 21696086 - 21696236
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
21696086 cataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacacccgttttacataatctccgaa 21696185  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
21696186 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaaaactcaacatgactatgatg 21696236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21199811 - 21199661
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
21199811 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaagctcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcactgaa 21199712  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
21199711 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 21199661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24719513 - 24719328
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||   |||||| |||||| |    
24719513 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttgcatcaaac 24719417  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacata 209  Q
    | |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
24719416 cccaatatctcacattaataatcaccattcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacaattattcatacacaatcaccaatcacata 24719328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 31195917 - 31195772
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
31195917 atgcatgtggtaccaaatcaccttaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacgcccgtcttacataatctccgaagtaaa 31195818  T
354 agagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
31195817 agagctcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 31195772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20655943 - 20655677
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||||  |    
20655943 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatatccacatatgtatacttatatcatga 20655844  T
119 tcctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca-----catatat 212  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||     || || |    
20655843 tcc-caatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaccaatcacattt 20655745  T
213 c--aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacct 276  Q
    |  || ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
20655744 caaaacaagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacct 20655677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Original strand, 23835746 - 23835895
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
23835746 cataaatgcatgtggtaccgaa-cacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagattttacacccgtcttacataatcaccgaa 23835844  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
23835845 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 23835895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37655324 - 37655134
Alignment:
214 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 308  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
37655324 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtgccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 37655225  T
309 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  | |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
37655224 cgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagcacccctcttttacagctacaagactcaacatgactatgatg 37655134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Original strand, 29758768 - 29758956
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
29758768 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 29758867  T
291 tcgatgcaacaaa-aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||||| ||||||  |||| | |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
29758868 tcgatggaacaaatcacattgtatgtaagggttcacacccgccttacaaaatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 29758956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 39448460 - 39448310
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
39448460 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtgtgtaagatttcacaccagtcttacataatctccgaa 39448361  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaacta-caatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||    
39448360 gtaaaagagctcaacctttttacgactaccagactcaacatgactatgatg 39448310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 269950 - 270138
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||| || |   ||||||||||||| |    
269950 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatcaaac 270045  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    |  ||||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
270046 ccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatc 270138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 645970 - 645782
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||| || |   ||||||||||||| |    
645970 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatcaaac 645875  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    |  ||||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
645874 ccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatc 645782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 831705 - 831517
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||| || |   ||||||||||||| |    
831705 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatcaaac 831610  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    |  ||||||||||||| |||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
831609 ccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatc 831517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16043245 - 16043054
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||      
16043245 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa 16043148  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    || |||||||||||||  ||||||| | || ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
16043147 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatatatc 16043054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Original strand, 17343480 - 17343632
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||  |||||| |    
17343480 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatact--catcaaac 17343577  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaat 175  Q
    | ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
17343578 cccaatatcccacatcaataatcgccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaat 17343632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16041569 - 16041378
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||      
16041569 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa 16041472  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    || |||||||||||||  ||||||| | || ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||    
16041471 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatatatc 16041378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 378
Target Start/End: Original strand, 270226 - 270401
Alignment:
201 aatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaac 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |      
270226 aatcacatatatcaataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatg-ata 270324  T
301 aaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||| |||||| || |||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
270325 aaacacatcgtat-taatggttcacatccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 270401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 645694 - 645519
Alignment:
201 aatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaac 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |      
645694 aatcacatatatcaataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatg-ata 645596  T
301 aaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||| |||||| || |||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
645595 aaacacatcgtat-taatggttcacatccgccttacataatctccgaagtaaaagagatcaacccttttacaactaca 645519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 831429 - 831254
Alignment:
201 aatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaac 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |      
831429 aatcacatatatcaataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatg-ata 831331  T
301 aaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||| |||||| || |||   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
831330 aaacacatcgtat-taatggttcacatccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 831254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 23509068 - 23509261
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| |  |   ||||||||||||| |    
23509068 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatataaacatcctacatttggtcaataataatattcccgcatcaatacttacatcaaac 23509167  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
23509168 cccaatatcgcacatcaatcatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 23509261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22323414 - 22323225
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||   || |||||||||  |    
22323414 acatcatcataaacaaaataacagttaacatgaaaatt-caatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacataacaatgcttacatcacac 22323319  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
22323318 cccaatatctcacatcaatattcatcaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 22323225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 312 - 398
Target Start/End: Original strand, 37609956 - 37610042
Alignment:
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37609956 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaaataaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 37610042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24719165 - 24719077
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24719165 caatcatatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 24719077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 6776422 - 6776307
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
6776422 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 6776323  T
121 ctcaatatctcacatc 136  Q
    | ||||||||||||||    
6776322 cccaatatctcacatc 6776307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17731287 - 17731117
Alignment:
122 tcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataag 219  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||    
17731287 tcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacaagtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttatttatacacaatcatcaatcacatttcaccaataag 17731188  T
220 actcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
17731187 actcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 17731117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22498947 - 22498832
Alignment:
243 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 342  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
22498947 tcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatc 22498848  T
343 tccgaagtaaaagagt 358  Q
     |||||||||||||||    
22498847 accgaagtaaaagagt 22498832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24930789 - 24930614
Alignment:
202 atcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaac 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |||    
24930789 atcacgtatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaac 24930690  T
301 aa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||   ||||||| |||||||  ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
24930689 aactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgctttacataatctctgaagtaaaagagctcaactcttttacaac 24930614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24387383 - 24387203
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |  |||| |    
24387383 caatcatatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc-tcaaaaggtcgtcacctctgatgga 24387285  T
299 acaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||   ||||||| |||||||   |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
24387284 acaactcaacatcgtatgtaagggctcacccctgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 24387203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23116458 - 23116349
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
23116458 catatatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaa 23116359  T
349 gtaaaagagt 358  Q
    ||||||||||    
23116358 gtaaaagagt 23116349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23631173 - 23631101
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23631173 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 23631101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 22312190 - 22312304
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
22312190 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcatcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 22312289  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
22312290 ccgaagtaaaagagt 22312304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45560861 - 45560747
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||     
45560861 cgacacatacatgcatgtggtaacaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagattttacacccgtcttacattatca 45560762  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    ||||| |||||||||    
45560761 ccgaattaaaagagt 45560747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 304
Target Start/End: Original strand, 25294490 - 25294582
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25294490 aataagactcatgtcatgatatgcatctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaa 25294582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 304
Target Start/End: Original strand, 25756479 - 25756571
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25756479 aataagactcatgtcatgatatgcatctagttcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaa 25756571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 349
Target Start/End: Original strand, 33170785 - 33170890
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
33170785 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 33170884  T
344 ccgaag 349  Q
    ||||||    
33170885 ccgaag 33170890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33612694 - 33612569
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
33612694 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaa 33612595  T
354 agagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||  || |||||||| | ||||||    
33612594 agagcacatcccttttaaagctacaa 33612569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43375493 - 43375310
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
43375493 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 43375399  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || ||||||| |||||| ||||||| ||||  |||     |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
43375398 accccaatatcccacatcaataatcatcaat--cat-----atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 43375310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3433718 - 3433535
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||  |    
3433718 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 3433622  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | | |||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
3433621 cccgatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 3433535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23153452 - 23153297
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    | || |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
23153452 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgtcacccatggtgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 23153353  T
344 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||    
23153352 ccgaagtaaaagagtatatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatg 23153297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 288
Target Start/End: Original strand, 28543272 - 28543440
Alignment:
123 caatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataaga 220  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | | ||||||||    
28543272 caataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaaatttcaccaataaga 28543371  T
221 ctcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||| |||||| || ||  | | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
28543372 ctcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 28543440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 38531882 - 38532152
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatcaa 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| |  ||| |||  | |||   ||    
38531882 acatcatcataattcatataacagttaaacatgaataattcaattcaaatatcatgcacttaatcaaataagaatatccatatatatactcataccataa 38531981  T
119 tcctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 216  Q
    ||| |||||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | | | ||    
38531982 tcc-caatatcttacattaagtaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacaattatt-atgcacaatcatcaatcacatttcacccat 38532078  T
217 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||| | | ||| ||  ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
38532079 aagactcatgtcatgctgtacacctagttcgacacatatatgcatggggtaccatatcacttcaaggtcgtcac 38532152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22008236 - 22008139
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
22008236 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22008139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 28835980 - 28836052
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
28835980 acattatcataatccaaataacagttaacctgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataat 28836052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24108363 - 24108245
Alignment:
170 atcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaa 269  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
24108363 atcaattcacaattattcacacataatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaa 24108264  T
270 atcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||| ||  |||||||||||    
24108263 atctccaaaaggtcgtcac 24108245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22323197 - 22323102
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
22323197 acaatcaccaaacacatttatcaataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc-aatctcctcaaggtcgtcac 22323102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43375274 - 43375202
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
43375274 caatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 43375202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22090097 - 22089943
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
22090097 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 22089998  T
318 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
22089997 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 22089943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 24238065 - 24238177
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||| ||||||    || |||||||| |||     
24238065 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcagctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcgtatgtacgatttcgt--ccatcttacattatcg 24238162  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
24238163 ccgaagtaaaagagt 24238177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 23509397 - 23509491
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
23509397 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 23509491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13664393 - 13664296
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
13664393 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcac 13664296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13723668 - 13723571
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
13723668 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcac 13723571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18768691 - 18768422
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||| |  ||| |||  | |||   |||    
18768691 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataaatcaattcaaatatcatgtacttactcaataataatatccaaatatatactcataccataat 18768592  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
     | |||||||| ||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || ||||||||||||||| | | |||||    
18768591 tc-caatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-catattta-tcatgcataatcatcaatcacatttcaccaata 18768495  T
218 agactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||  |  ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||    
18768494 agactcatgtcatgttatgcaccaagttcgacacatacatgcatatggtaccatttcacttcaaagtcgtcac 18768422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3433254 - 3433076
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
3433254 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 3433155  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
3433154 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 3433076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21853574 - 21853396
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
21853574 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 21853475  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
21853474 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 21853396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22909242 - 22909146
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||| |   |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
22909242 acaatcatcaatcacattttcaaatctgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22909146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 357
Target Start/End: Original strand, 24547724 - 24547863
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||    
24547724 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 24547822  T
313 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
24547823 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 24547863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15320713 - 15320559
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
15320713 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 15320614  T
318 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
15320613 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 15320559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15501082 - 15500928
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
15501082 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 15500983  T
318 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
15500982 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 15500928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 358
Target Start/End: Original strand, 11543088 - 11543149
Alignment:
297 caacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
11543088 caacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaaataaaagagt 11543149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21846169 - 21846065
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
21846169 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 21846070  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
21846069 gatgc 21846065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Original strand, 25294581 - 25294641
Alignment:
339 aatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
25294581 aatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 25294641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 398
Target Start/End: Original strand, 25756570 - 25756630
Alignment:
339 aatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
25756570 aatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 25756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Original strand, 28543151 - 28543213
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatc 84  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
28543151 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattcaa-ttaaacatcatgtacttgatc 28543213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 272880 - 272786
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
272880 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 272786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 642969 - 643063
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
642969 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 643063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 828775 - 828869
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
828775 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 828869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 5236674 - 5236768
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
5236674 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 5236768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24387593 - 24387523
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
24387593 acattatcataatccaaatagcagataacatgaatatttcaatt--aacaacatgcatttgatcaataataat 24387523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 39448646 - 39448573
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| | |||| ||||||    
39448646 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaaccaatgataata 39448573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16874617 - 16874439
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
16874617 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 16874518  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
16874517 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 16874439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Original strand, 29758559 - 29758624
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaata 88  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
29758559 acattatcataattcaaatagcagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaata 29758624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 398
Target Start/End: Original strand, 23148481 - 23148568
Alignment:
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  || |||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||    
23148481 atgtaagattttacacccgtcttacattatcaccgaagttaaagagcacatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatg 23148568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 203
Target Start/End: Original strand, 23509315 - 23509378
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 203  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
23509315 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaat 23509378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3433455 - 3433390
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
3433455 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 3433390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24931008 - 24930938
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| |||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
24931008 acattatcataatccaaatagtagataacatgaatatttcaatt--aacaacatgcatttgatcaataataat 24930938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 224816 - 224737
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
224816 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 224737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 738439 - 738360
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
738439 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 738360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 862334 - 862255
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
862334 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 862255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3433352 - 3433285
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
3433352 aatcaccattcacatgtatcaggaataaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 3433285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16204179 - 16204109
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||    
16204179 acattatcataatccaaatagcagttatcatgaatatttcaaatt-aacatcatgcatttggccaataataa 16204109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16675979 - 16675900
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
16675979 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 16675900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 21695899 - 21695942
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatt 64  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
21695899 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatt 21695942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22737834 - 22737759
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatc-aataataata 94  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
22737834 acatcatcataatctacataacagttaaacatgaatagttcaattcaaatatcatgcacttaatcaaataataata 22737759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 17731387 - 17731333
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatg 75  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||    
17731387 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatgattcaatttaaatatcatg 17731333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24662924 - 24662830
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
24662924 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 24662830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 18043131 - 18043091
Alignment:
318 gatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
18043131 gatttcacacccgtcttacattatcatcgaagtaaaagagt 18043091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 136)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 319486 - 319099
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata--cttacatcaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
319486 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatcaa 319387  T
119 t-cctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac--at---ata 211  Q
      || |||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||   ||     
319386 aaccccaatatctcatattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcaccaatcgcatt 319287  T
212 tc--aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatc 309  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
319286 tccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatc 319187  T
310 gcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 397  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
319186 gtatgtaagagttcacacccgtcttacataatttccgaagtaaaagagttcaacccttttacgactacaatctcaacacgactatgat 319099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 50113991 - 50113612
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | |     
50113991 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcacattca-atacttacattagaa 50113893  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-ta 217  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||| |||| | ||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
50113892 ccccaatatctcacatcaattaatcatcaatcacatatatcatgaataatcatcaatccacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcaaata 50113793  T
218 agactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 317  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
50113792 agactcatgtcattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaataaaaacatcgtatgtaa 50113693  T
318 gatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50113692 gatttcacacccgtcttgcataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 50113612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51160335 - 51159973
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |    
51160335 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatctcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatcaaac 51160236  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
51160235 ctcaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcaatgaga 51160136  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa-aaacatcgcatgt---- 315  Q
    |||||| |||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||        
51160135 ctcatgccatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaacaactcacatcgtatgtaagg 51160036  T
316 aagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
51160035 aagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 51159973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12351709 - 12351332
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||||||  ||| ||    
12351709 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcagttgatcaacaataatactcacatatcaatacttatgtcatat 12351610  T
120 cctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 218  Q
    || ||| |||||||||| | ||||||||||  |||| || |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| |   || ||    
12351609 ccccaacatctcacatcaaataatcaccaaacacatatgacatgaacaatcatcaattcataattattcatacacaatcaccagtcacatttcaaaacaa 12351510  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaag 318  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
12351509 gactcacgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtactggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaag 12351410  T
319 atttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatga 396  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12351409 atttcacactcgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaccactatga 12351332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 17098913 - 17099181
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
17098913 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcataaatatacttacatcaaaa 17099012  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
17099013 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcacacacaatcaccaatcacatatatcaataag 17099112  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
17099113 actcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggttgtcac 17099181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6148723 - 6148457
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
6148723 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacacatacttacatcaaaa 6148624  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||    
6148623 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaagtattcacacacaatcaccaatcac--atatcaataag 6148526  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6148525 actcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 6148457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 47786735 - 47786356
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| ||||  |    
47786735 acatcatcataatccaaataactgttatcatgaatatatcaatt--aacatcatgtacttgatcaataatagttttcacatatatatacttatatcacaa 47786638  T
119 tcctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 216  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||    
47786637 tcc-caatatctcacatcaattaatcactaatctcatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaccaat 47786539  T
217 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatg 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
47786538 aagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtgttactatatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatg 47786439  T
315 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
47786438 taagatttcacatccgtcttacataatctccaaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-ctcaacatgactatgatg 47786356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 30204696 - 30204961
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
30204696 acatcatcataatccaaataaaagttaatatggatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatgttctcatacatatacttacatcaaac 30204795  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
30204796 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatttccaaataaga 30204895  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30204896 ctcatgtcatgatatgcacctattga--cacaaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 30204961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 140 - 398
Target Start/End: Original strand, 7852223 - 7852482
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgca 238  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||  ||||||||||||||||||||||    
7852223 aatcaccaatcacatttatcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatttgcaaaacaagactcatgtcatgatatgca 7852322  T
239 catatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 338  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
7852323 cctatcgacacatacatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatccaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacactcgtcttacat 7852422  T
339 aatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7852423 aatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 7852482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 192 - 398
Target Start/End: Original strand, 8630315 - 8630521
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 291  Q
    |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
8630315 acaatcattaatcacatttctaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctccaggtcgtcacctt 8630414  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 391  Q
    |||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8630415 cgatgccacttgaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 8630514  T
392 tatgatg 398  Q
    |||||||    
8630515 tatgatg 8630521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19572693 - 19572430
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
19572693 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgtgtttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 19572600  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 218  Q
     || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
19572599 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaatacacaaatattcattcacaatcaccactcacatatatcaataa 19572500  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
19572499 gactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 19572430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 11812801 - 11812994
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
11812801 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatttatacttacatcaaac 11812900  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
11812901 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 11812994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 38166213 - 38166407
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
38166213 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 38166312  T
121 ct-caatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
38166313 ctccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 38166407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 19944805 - 19944998
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
19944805 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19944904  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
19944905 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 19944998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22146145 - 22145882
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||   |||| |||||| | |    
22146145 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcgatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacatacatccacc 22146049  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
22146048 c-caatatctaacatcaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatatgcaatcaccaatcacatatatcaataaga 22145950  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||| |||||| | |||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22145949 ctcgtgtcatcacatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaattacctcaaggtcgtcac 22145882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 7851683 - 7851877
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | |     
7851683 acatcatcataatccaaataacagttagtatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttatatgacaa 7851782  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
7851783 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaccacatatatca 7851877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 18737974 - 18738167
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
18737974 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatattccaatataaacatcatgcacttgatcaatagtactattctcatacatatacttacatcaaac 18738073  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
18738074 cccaatatctcacatcaataatcttcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaattacatatatca 18738167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 30140984 - 30141177
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||      
30140984 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaat 30141083  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
30141084 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 30141177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14060980 - 14060726
Alignment:
146 caattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata-- 242  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||      
14060980 caatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgcacaatcatcaattacattttaccaataagactcatgtcatgatgtgcacctagt 14060883  T
243 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 342  Q
    ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
14060882 tcgacacgtatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcacctttgatgcaacaaaaatatcgaatgtaagagttcacccccatcttacataatc 14060783  T
343 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
14060782 tccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 14060726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16183945 - 16183665
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||  ||     
16183945 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatatatatatatata 16183846  T
120 ------------cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
                || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| | ||||||| ||| ||||    
16183845 tatatatcaaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaatcattcacagacaatcaccaaacaca 16183746  T
208 tatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
16183745 tatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcgtcac 16183665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Original strand, 12796728 - 12796908
Alignment:
26 atcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaatcctc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||  ||||||||||||| || |    
12796728 atcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatt-tcccacatcaatacttacatcaaacccc 12796826  T
124 aatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
12796827 aatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 12796908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 16819043 - 16819234
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
16819043 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 16819140  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
16819141 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 16819234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 38812671 - 38812481
Alignment:
213 caataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaaca 307  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
38812671 caataagactcatgtcaccatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtcgtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaaca 38812572  T
308 tcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||    
38812571 tcgtatgtaatatttcac-cccgtcttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactactagactcaacatgactatgatg 38812481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18008776 - 18008645
Alignment:
245 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 344  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
18008776 gacgcataaatgcatgtggtactgaatcacctcaaggtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 18008677  T
345 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaacta 376  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18008676 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaacta 18008645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 398
Target Start/End: Original strand, 19230535 - 19230734
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac-tttcgatgca 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||  || |||||||| |||||||| |    
19230535 caatcacatttatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatatggtaccaaatctccaaaacgtcgtcacctttcgatgaa 19230634  T
299 acaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
     |||| |||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
19230635 tcaaacacatcgtatgtaagggttcacacccaccttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatttcaacataactatgatg 19230734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Original strand, 15874690 - 15874820
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
15874690 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcactgaa 15874789  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
15874790 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 15874820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Original strand, 48420197 - 48420327
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
48420197 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaa 48420296  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
48420297 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 48420327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 55442404 - 55442252
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtc---actttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctcc 345  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
55442404 cataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgccttacataatctcc 55442305  T
346 gaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
55442304 gaagtaaaagagttcaaccattttacaactacaaactcaacatgactatgatg 55442252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 249 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12490372 - 12490249
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12490372 cataaatgcatgtggtaccgaatcatctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 12490273  T
349 gtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
12490272 gtaaaagagctcaacccttttaca 12490249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 17936455 - 17936649
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatt-taaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||     
17936455 acatcatcataatccacataacagttaacatgaacattttcatcataaacatcatgcacttgatcaattataatattcccatacatatacttatatcaaa 17936554  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    || |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
17936555 ccccaatatctcacatcaataatctcaaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaatcatatatatca 17936649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Original strand, 2048535 - 2048723
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |    
2048535 acaatcaccaatcacatatatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacct 2048634  T
291 tcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||||| |||||   |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
2048635 tcgatggaacaactcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 2048723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 14296730 - 14297000
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||  |    
14296730 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaattt-aacatcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttataccatga 14296828  T
119 tcctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaat 216  Q
    ||| ||| | |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| | ||| || |||||||| ||||||| ||  | ||||    
14296829 tcc-caaaaactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacattcatttatgcacaatcaccaatcacaatccaccaat 14296927  T
217 aagactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||| |||||| || ||  | | |||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
14296928 aagactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacgtatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 14297000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 14302357 - 14302627
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||  |    
14302357 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaattt-aacatcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttataccatga 14302455  T
119 tcctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaat 216  Q
    ||| ||| | |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| | ||| || |||||||| ||||||| ||  | ||||    
14302456 tcc-caaaaactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacattcatttatgcacaatcaccaatcacaatccaccaat 14302554  T
217 aagactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||| |||||| || ||  | | |||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
14302555 aagactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacgtatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 14302627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 11330643 - 11330493
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
11330643 cataaatgcatgtggtaccgagtcacctcaaggttgtcacctttgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacatgtcttacataatctccgaa 11330544  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
11330543 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 11330493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5229721 - 5229607
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
5229721 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 5229622  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
5229621 ccgaagtaaaagagt 5229607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Original strand, 33340317 - 33340506
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
33340317 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcataatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 33340416  T
291 tcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
33340417 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 33340506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 14287323 - 14287596
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata--cttacatca- 117  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||  |||| | ||     
14287323 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatagttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataacgttcacatatatatatacttataccat 14287422  T
118 -atcctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa 215  Q
     || | ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |   ||    
14287423 gattc-caatacctcacatcaattaatcaacaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacaaaatcaccaatcacatttcaaaa 14287521  T
216 taagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
14287522 taagactcatgtcatgatgtgtacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 14287596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Original strand, 23490980 - 23491169
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
23490980 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 23491079  T
291 tcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
23491080 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagcacaacctttttacaactaca 23491169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11199415 - 11199144
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatactta---catca 117  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||   |||||    
11199415 acatcatcataatccacataacaattaacatgaacaattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatatatacatataccatca 11199316  T
118 atcctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaa 215  Q
     ||  |||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||  |||| | |||||| |||||||| ||||||||| | | |||    
11199315 ttc--caatatttcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacagtcatcaaatcacattcattcatgcacaatcaccaatcacatttcaccaa 11199218  T
216 taagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||   || | |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
11199217 taagactcatg-catgatgtgcacctagcccgccacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 11199144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 186 - 378
Target Start/End: Original strand, 19945098 - 19945289
Alignment:
186 tcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgt 285  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
19945098 tcataaacaatcaccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgt 19945197  T
286 cactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||| | ||||| |  ||| |||||| |||||||  |||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
19945198 cacctccgatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcaaaaccaccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 19945289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Original strand, 10737033 - 10737219
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |    
10737033 acaatcaccaatcacatatatcaaatcagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgccacct 10737132  T
291 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
10737133 tcgatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtagaagagctcaacccttttacaactaca 10737219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 54045703 - 54045593
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
54045703 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 54045604  T
121 ctcaatatctc 131  Q
    | |||||||||    
54045603 cccaatatctc 54045593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14846339 - 14846160
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
14846339 atcaccaatcacatatattacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 14846240  T
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
14846239 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcaccccccccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 14846160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9304841 - 9304664
Alignment:
28 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aatcctcaa 125  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
9304841 cataatccaaataatagttaatcatggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaacctcaa 9304742  T
126 tatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 210  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||  |||     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
9304741 tatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 9304664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 356
Target Start/End: Original strand, 47983418 - 47983531
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatc 342  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
47983418 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataata 47983517  T
343 tccgaagtaaaaga 356  Q
    ||||||||||||||    
47983518 tccgaagtaaaaga 47983531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 356
Target Start/End: Original strand, 47992705 - 47992818
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatc 342  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
47992705 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataata 47992804  T
343 tccgaagtaaaaga 356  Q
    ||||||||||||||    
47992805 tccgaagtaaaaga 47992818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 356
Target Start/End: Original strand, 48001992 - 48002105
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatc 342  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
48001992 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataata 48002091  T
343 tccgaagtaaaaga 356  Q
    ||||||||||||||    
48002092 tccgaagtaaaaga 48002105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 356
Target Start/End: Original strand, 48011278 - 48011391
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc-gtcttacataatc 342  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
48011278 cgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaacagatcgtatgtaagatttcacacccggtcttacataata 48011377  T
343 tccgaagtaaaaga 356  Q
    ||||||||||||||    
48011378 tccgaagtaaaaga 48011391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 8630057 - 8630232
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||               ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||     
8630057 acatcatcataatccaaataacagttaatcatggatatttcaattt---------------gatcaataacaatatccacatacatatacttacatcaaa 8630141  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 210  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||| | |||||||||||    
8630142 ccccaatatctcacattcataatctccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatgcacaattaccaatcacatat 8630232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11062859 - 11062691
Alignment:
123 caatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagac 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||    
11062859 caatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttcaaaataagac 11062760  T
222 tcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| |||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
11062759 tcatgtcctgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccgtttcacttcaaggtcgtcac 11062691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 11813307 - 11813403
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
11813307 acaatcagcaatcacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 11813403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 35121921 - 35122189
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||||||||   |||||||||  |||| | ||||||| |||  ||    
35121921 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcgtgtacttgatc---aataatatttacatataaatacttatatcaaaa 35122017  T
119 tcctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaata 217  Q
    ||| |||  ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||   |   || |    
35122018 tcc-caaattctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcaggaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacgattcaaaaca 35122116  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
35122117 agactcatgtcataatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 35122189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9592394 - 9592239
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||     
9592394 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatgtgtaagatttcacacccgtcttacattatca 9592295  T
344 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||    
9592294 ccgaagtaaaagagcacatcccttttacagccacaagactcaacatgactatgatg 9592239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 18908679 - 18908751
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18908679 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 18908751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 22273034 - 22273106
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22273034 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 22273106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 372
Target Start/End: Original strand, 49230655 - 49230869
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
49230655 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 49230754  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaag 355  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
49230755 atgtggtaccaaatctcaacaacgtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaag 49230853  T
356 agttcaacccttttaca 372  Q
    || ||| ||||||||||    
49230854 ag-tcatcccttttaca 49230869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 378
Target Start/End: Original strand, 5227201 - 5227378
Alignment:
201 aatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||  || ||||||||| |||||||      
5227201 aatcacatatatcaaacaagactcatgttatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccgaatctccaaaaaggtcgtcacattcgatgat 5227300  T
299 acaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    | ||| |||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
5227301 a-aaacacattgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagag-ccaacccttttacaactaca 5227378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14523278 - 14523006
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | || | |||| || | ||  |    
14523278 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatattccaatttaaccatcatgtacttgatcaataataatattcacgtataaatacatataccatca 14523179  T
119 tcctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 216  Q
    | |||||    |||  || | || |||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| |||| ||| ||||||||||||| |||| | | ||||    
14523178 ttctcaaagattcagctcaattattcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacacttatgcatgcacaatcatcaattacatttcaccaat 14523079  T
217 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||| ||| |||||| ||  | ||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14523078 aagacttatg-catgatgtgttcctagcccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 14523006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15940140 - 15939959
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
15940140 atcaccaatcacataaatcacataagactcatgttatgatatgaacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 15940041  T
294 atgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||  | |||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
15940040 ataga-caagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaaaagttcagcccttttacaac 15939959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17913933 - 17913751
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 289  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
17913933 acaatcatcaatcacatacatcatataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 17913834  T
290 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||||| ||    |||||| | |||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
17913833 ttcgatgccacttgcacatcgtacgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagcttaacccttttaca 17913751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 54686529 - 54686707
Alignment:
28 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aatcctca 124  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || || ||    
54686529 cataatccaaataacagttactcatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 54686628  T
125 atatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 210  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||  |||     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
54686629 atatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcacatat 54686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 19230318 - 19230499
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||      || ||||  ||||||||||||     
19230318 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa-----ccacacattaatacttacatcac 19230410  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| ||||||| ||||  |||     |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
19230411 accccaatatctcacatcaataatcatcaat--cat-----atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatca 19230499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 41660135 - 41660249
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||     
41660135 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacctgtcttacattatca 41660234  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    ||||| |||||||||    
41660235 ccgaaataaaagagt 41660249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17958303 - 17958169
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||| ||    
17958303 acatcaacataatc--aataacagttaacatggatatttcaaagtaaacatcatgtacttgatcaataataatactcccatattaatacttacatcatat 17958206  T
120 -cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatg 155  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
17958205 cccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatg 17958169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 17536923 - 17536847
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc 97  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
17536923 acatcatcataatccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttcatgcacttgatcaataataatattc 17536847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17958093 - 17957996
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
17958093 acaatcatcaatcacatatatcatataagactcatgtcatgagatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 17957996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 372
Target Start/End: Original strand, 44227903 - 44228083
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-cttt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
44227903 aatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 44228002  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
44228003 cgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaacccttttaca 44228083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 16819386 - 16819565
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
16819386 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 16819485  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
     |||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
16819486 aatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttgcaataatct-cgaagtaaaagagttcaacccttttaca 16819565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 13815856 - 13815943
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
13815856 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcgatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatata 13815943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Original strand, 13815979 - 13816070
Alignment:
123 caatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
13815979 caatatctcacgtcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 13816070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 25057035 - 25057166
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca- 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
25057035 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 25057129  T
118 atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatg 155  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
25057130 atcc-caatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 25057166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 357
Target Start/End: Original strand, 16259487 - 16259683
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||   |||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
16259487 tcatgaacaattatcaattgacaaatattcattcacaatctctaatcacatttccaaataagacccatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 16259586  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaag 355  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||    
16259587 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaag 16259681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2451442 - 2451370
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
2451442 acattatcttaatccagataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatacacttgatcattaataat 2451370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 11063020 - 11062944
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc 97  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
11063020 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattc 11062944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19262698 - 19262602
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
19262698 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 19262602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 214
Target Start/End: Original strand, 49230251 - 49230429
Alignment:
26 atcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacata-tacttacatcaatcctca 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | | |||   || |||||||||||  || ||    
49230251 atcacaatccaaataacagttaacatgaatatttcaattaaaacatcatggacttgatcaataataat-tacacat---tagtacttacatcacacccca 49230346  T
125 atatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
49230347 atatctcacatcaatcttcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 49230429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 25057247 - 25057344
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
25057247 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcac 25057344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33371002 - 33370914
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
33371002 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatggtgcaacaaaaa-atcatatgtaagatttcacacccgtcttacat 33370914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 27839184 - 27839362
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
27839184 atcatcaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 27839283  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
27839284 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 27839362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Original strand, 45581310 - 45581382
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggt 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
45581310 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcataatatgcacttattgacacataaatgcatgtggt 45581382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Original strand, 15516052 - 15516197
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgca 238  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
15516052 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgaacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatatgca 15516149  T
239 cata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    | ||  |||    ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
15516150 cctagttcg----atatatgcatgtggtacgaaatcacttcaaggtcgtcac 15516197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12563281 - 12563136
Alignment:
146 caattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata-- 242  Q
    |||| |||||||||||||  ||  |||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| ||||| ||      
12563281 caatcacatgtgtcatgagaaatcatcaaatcacatttaatcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgccatgatgtgcacctagt 12563182  T
243 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
12563181 tcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 12563136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15860902 - 15860824
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||    
15860902 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatgtgcatgttgtaccaaatc 15860824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18905434 - 18905356
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
18905434 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 18905356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 18908892 - 18908966
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
18908892 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18908966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Original strand, 15613564 - 15613720
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||    
15613564 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 15613662  T
313 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
15613663 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagagccgaactcttttacaac 15613720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 23490768 - 23490898
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca- 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||     ||| ||||  ||||||||||||     
23490768 acattatcataatccaaataacagataacatgagtatttcaatataaacatcatgcatttgatcaatagtaa-----tcacacattaatacttacatcac 23490862  T
118 atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacat 154  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
23490863 atcc-caatatctcacatcaataatcatcaatcacat 23490898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Original strand, 11813048 - 11813120
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
11813048 aatcaccaattacatgtttcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 11813120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23081821 - 23081682
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||    
23081821 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 23081723  T
313 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
23081722 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 23081682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Original strand, 30141361 - 30141456
Alignment:
193 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
30141361 caatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 30141456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2451004 - 2450910
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
2451004 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 2450910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11517056 - 11517010
Alignment:
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
11517056 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgttttacat 11517010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 11813179 - 11813253
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
11813179 aatcaccaatcacatgggtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 11813253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 18909169 - 18909263
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
18909169 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 18909263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 22273524 - 22273618
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
22273524 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 22273618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Original strand, 10736824 - 10736890
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataa 89  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
10736824 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgaccaataa 10736890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12266167 - 12266007
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
12266167 atcaccaatcaaatatttcacataagactcatgatatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 12266068  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    |||  ||||   |||||||||||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
12266067 atg-gacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 12266007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 288
Target Start/End: Original strand, 15574545 - 15574618
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
15574545 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 15574618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15861104 - 15861043
Alignment:
30 taatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||    
15861104 taatccaattaacagttaacatggatatttcaatt--aaaatcatgcatttgatcaataataat 15861043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16745848 - 16745670
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
16745848 atcaccaatcacatatttcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 16745749  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
     |||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
16745748 aatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 16745670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17536776 - 17536606
Alignment:
121 ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 218  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||| |  | ||||||||  | | ||||||    
17536776 ctcaataactcacatcaattaatcaccgatcacatctgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcacgcaccaataccaatcacaattcaccaataa 17536677  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||| |||||| || || ||   |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
17536676 gactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 17536606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 45581101 - 45581170
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
45581101 acattatcataatccaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa 45581170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 53900463 - 53900388
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc 97  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
53900463 acatcatcataatccaaacaacagtta-cataaataattcaatataaacatcatgaacttgatcaataacaatattc 53900388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 214
Target Start/End: Original strand, 7851972 - 7852035
Alignment:
151 acatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
7851972 acatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 7852035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1469330 - 1469236
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
1469330 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 1469236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 290
Target Start/End: Original strand, 40938085 - 40938236
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgca 238  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||    ||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||| || | | |||||||||||||| |||||| ||||    
40938085 aatcaccagtcacatgtgtcatgaacattcttcaat-cacatttattcacacacaattatcattcatatttcaccaataagactcatg-catgatgtgca 40938182  T
239 cata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    | ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
40938183 cctagctcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcactt 40938236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15470141 - 15470048
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 287  Q
    |||| |||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
15470141 atcaccaatcacaaatttcacataagacttatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 15470048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 288
Target Start/End: Original strand, 17137827 - 17137969
Alignment:
146 caattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat-atatcaataagactcatgtcatgatatgcacata-t 243  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||| || |    
17137827 caatcacatgtgtcatgaacaaacatcaat-cacatttatt-atgcacaatcatcaaccacattacaccaataacactcatgtcatgatgtgcacctaat 17137924  T
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
      || |||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||    
17137925 tcacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggttgtcac 17137969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 30151813 - 30151991
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
30151813 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 30151912  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
30151913 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 30151991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 207
Target Start/End: Original strand, 16819292 - 16819355
Alignment:
144 accaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
16819292 accaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 16819355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 288
Target Start/End: Original strand, 12951476 - 12951555
Alignment:
214 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
12951476 aataagactcatgtcaacatgatatgcacgtagttcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacttcaaggtcgtcac 12951555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 39654163 - 39654237
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||||    
39654163 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaatgataata 39654237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 49230509 - 49230583
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
49230509 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 49230583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 2048323 - 2048383
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttga 82  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||    
2048323 acattatcataatccaaatagcagttaacatgaatatttcaa-ttaatcatcatgcatttga 2048383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Original strand, 7851875 - 7851931
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
7851875 tcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaaccatcaaccacatatatca 7851931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8270080 - 8269976
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
8270080 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 8269981  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
8269980 gatgc 8269976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8277191 - 8277087
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
8277191 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 8277092  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
8277091 gatgc 8277087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8306000 - 8305896
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
8306000 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 8305901  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
8305900 gatgc 8305896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19262907 - 19262838
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
19262907 acattatcataatccaattagcagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa 19262838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 53769137 - 53769241
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
53769137 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 53769236  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
53769237 gatgc 53769241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 53900347 - 53900177
Alignment:
121 ctcaatatctcacatccata-atcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 218  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||   ||||||| |||||| | ||||||||  | | ||||||    
53900347 ctcaataactcacatcaattgatcatcaatcacatgtgtcataaacaagtatcaaatcacgtatattcatgcacaattaccaatcacaattcaccaataa 53900248  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||| |||||| |  || ||   ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
53900247 gactcatg-catgatgtatacctagaccgacgcatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 53900177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 12563397 - 12563334
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatc 84  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |||    
12563397 acatcatcataattcacataacacttaacatgaataattcaatttaaatatcatgtacttaatc 12563334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13956457 - 13956378
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
13956457 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 13956378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13977290 - 13977211
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
13977290 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 13977211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 327 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18905343 - 18905296
Alignment:
327 cccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
18905343 cccgccttacataatctccaaagtaaaagagcccaacccttttacaac 18905296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Original strand, 41268743 - 41268822
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
41268743 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 41268822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Original strand, 45859521 - 45859600
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
45859521 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 45859600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Original strand, 55314883 - 55314962
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
55314883 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 55314962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2451229 - 2451155
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
2451229 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 2451155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 22273247 - 22273321
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
22273247 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 22273321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2451084 - 2451035
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
2451084 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaaacatcaatcaca 2451035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11883968 - 11883923
Alignment:
243 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
11883968 tcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaagtcgtcac 11883923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 288
Target Start/End: Original strand, 14291910 - 14291955
Alignment:
243 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
14291910 tcgacgcatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 14291955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38377460 - 38377415
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacc-tcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
38377460 cgacgcatatatgcatgtggtaccaaatcaccttaaaggtcgtcac 38377415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14061110 - 14061039
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||| |||| |||||| ||||    
14061110 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataattcaa-ttcaacatcatgtacttaatcaatgataa 14061039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 249 - 288
Target Start/End: Original strand, 15989508 - 15989548
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcac 288  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
15989508 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcac 15989548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 59865 - 60250
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||| |||| ||    
59865 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatccacaaata-atacttatatcatat 59963  T
120 cctcaatatctcacatccata-atcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 213  Q
     | |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||     | || ||    
59964 tcccaatatctcacatcaatacatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaccaatcacatttc 60063  T
214 --aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgc 311  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
60064 caaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgt 60163  T
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
60164 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatatcaacacgaatatgatg 60250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 100)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 4863551 - 4863943
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacata------tacttac 113  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||      |||||||    
4863551 acatcatcataatcaaaacaacagttaatcatgaataatttaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatacatatatacttac 4863650  T
114 atcaat-cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac------ 206  Q
    |||||  || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||          
4863651 atcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaaagcacaattattcatacacaatcaccaatcaccaatca 4863750  T
207 -atatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaa 305  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
4863751 catttatcaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacgcataaatgaatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaa 4863850  T
306 catcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
4863851 catcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgattatgatg 4863943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27185699 - 27185318
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||| |    
27185699 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatataaacattatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 27185603  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc-- 213  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||     | || ||      
27185602 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgtacaaacaacaattcacatttattcagacacaattatcaatcaccaatcacatttcca 27185503  T
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
27185502 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 27185403  T
314 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27185402 gtaagatttcacacacgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatg 27185318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21661593 - 21661268
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-t 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
21661593 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcatacatatgcttacatcaaga 21661494  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca-----catatatc- 213  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     || || ||     
21661493 ccccaatatctcacaacaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcaccattcacatttcc 21661394  T
214 -aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgca 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
21661393 aaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgta 21661294  T
313 tgtaagatttcacacccgtcttacat 338  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
21661293 tgtaagatttcacaccagtcttacat 21661268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 21392432 - 21392698
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
21392432 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataaaaatattctcatacatatacttacatcaacc 21392531  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
21392532 c-caatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcagtttccaattattcatacacaatcaccaaacacatatatcaataaga 21392630  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
21392631 ctcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaactcaaggtcgtcac 21392698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 34937571 - 34937764
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
34937571 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 34937670  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
34937671 cccaatatctaacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 34937764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 10307 - 10500
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
10307 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 10406  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
10407 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 10500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10780305 - 10780112
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |    
10780305 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcacatcaatacttacatcaaac 10780206  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
10780205 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaatcatatacatca 10780112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43445901 - 43445708
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
43445901 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 43445802  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
43445801 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 43445708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 32967815 - 32967661
Alignment:
245 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 344  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
32967815 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 32967716  T
345 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
32967715 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 32967661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22885234 - 22885041
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
22885234 acattatcataatccaaataacagtcatcatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 22885135  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||    
22885134 cccaatatctcacatcaatgatcgccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaccaccaatcatatacatca 22885041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25211982 - 25211796
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
25211982 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 25211885  T
121 ctc-aatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 208  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
25211884 ctccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcacat 25211796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25276134 - 25275948
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
25276134 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 25276037  T
121 ctc-aatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 208  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
25276036 ctccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcacat 25275948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Original strand, 23492532 - 23492662
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23492532 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 23492631  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
23492632 gtaaaagagttcaacctttttacaactacaa 23492662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17473892 - 17473704
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||| |    
17473892 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacat-ca-atacttacatcaaac 17473795  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatata 211  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
17473794 cccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatatgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatata 17473704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 214 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24227146 - 24226976
Alignment:
214 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 308  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
24227146 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtcgtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 24227047  T
309 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
24227046 cgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagctcaacccttttacagctacaa 24226976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 379
Target Start/End: Original strand, 21615535 - 21615671
Alignment:
243 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 342  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
21615535 tcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaaatttcacacccgtcttacataatc 21615634  T
343 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
21615635 accgaagtaaaagagttcaactcttttacagctacaa 21615671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 11579922 - 11580113
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      
11579922 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattctcata--tatacttacatcaaaa 11580018  T
121 ctc-aatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||    
11580019 ctccaatatctcacatcagtaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacgcagtcaccaatcatatacatca 11580113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 398
Target Start/End: Original strand, 7727112 - 7727257
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
7727112 atgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaa 7727211  T
354 agagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    | || ||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
7727212 atagctcaacccctttacaactacaagactcaacatgactatgatg 7727257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 243 - 398
Target Start/End: Original strand, 19860756 - 19860912
Alignment:
243 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 342  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
19860756 tcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaccccaaggtcgtcaccttcgatacaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 19860855  T
343 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
19860856 accgaagtaaaagagctcaactcttttacagctacaagactcaacatgactatgatg 19860912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Original strand, 28888441 - 28888598
Alignment:
245 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact---ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataat 341  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
28888441 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcatcatcatcttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataat 28888540  T
342 ctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
28888541 ctccgaagtaaaagagttcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 28888598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23986359 - 23986165
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||| |     
23986359 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttctatataaacatcatgcacttgataaataataatactctcatatcaatacttacatcatac 23986260  T
120 cctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    || |||| | ||||||| | ||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
23986259 ccccaatgtttcacatcaagtaatcaccaatcatatgtgtcaggaacaaatattaattcacagttattcatacacaatcatcattcacatatatc 23986165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 19497936 - 19498120
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
19497936 acattatcataatgcaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacattacgtacatgatcattaataatattcacacatcaatacttacatcaaac 19498035  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
19498036 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 19498120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 28257781 - 28257970
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||  |    
28257781 acatcatcataatcaaaataacagttaaaatgaaaatt-caatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcacac 28257876  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
28257877 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 28257970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Original strand, 13793659 - 13793809
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
13793659 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacctttgatgcaacaaaaacatcgtatataagatctcacacccgtcttacataatcaccgaa 13793758  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
13793759 gtaaaagagctcaacccttttacaaccacaagactcaacatgactatgatg 13793809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37189767 - 37189637
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
37189767 cataaatgcaagtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaatatttcacacccgtcttacataatcaccgaa 37189668  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
37189667 gtaaaagagctcaacccttttacagctacaa 37189637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 23453184 - 23453454
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatc-aataataatattctcatacatatacttaca-tcaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||   || | ||||| ||||| || |    
23453184 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat---cacaaatatatttacaatcta 23453280  T
119 tcctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 216  Q
      |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
23453281 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 23453380  T
217 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23453381 aagactcatgtcatgatgtgaacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 23453454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 23460428 - 23460698
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatc-aataataatattctcatacatatacttaca-tcaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||   || | ||||| ||||| || |    
23460428 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat---cacaaatatatttacaatcta 23460524  T
119 tcctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 216  Q
      |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
23460525 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 23460624  T
217 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23460625 aagactcatgtcatgatgtgaacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 23460698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 23464689 - 23464959
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatc-aataataatattctcatacatatacttaca-tcaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||   || | ||||| ||||| || |    
23464689 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat---cacaaatatatttacaatcta 23464785  T
119 tcctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 216  Q
      |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||    
23464786 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 23464885  T
217 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
23464886 aagactcatgtcatgatgtgaacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 23464959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1170467 - 1170321
Alignment:
142 tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacat 241  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
1170467 tcacaaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatattcacct 1170368  T
242 atcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    || ||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
1170367 attgatacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 1170321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Original strand, 11582266 - 11582414
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
11582266 aatcaccaatcacatgtgtaatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatctccaatcacatacatcaataagactcatgccatgatatgcac 11582365  T
240 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
     ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
11582366 ctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctcagggtcgtcac 11582414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1221826 - 1221638
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||| |    
1221826 acattatcataatccaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacat-ca-atacttacatcaaac 1221732  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
1221731 cccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 1221638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1171464 - 1171320
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
1171464 acatcatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaag 1171365  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaa 164  Q
    || |||||||||||||  |||| || |||| |||| | |||||||    
1171364 ccccaatatctcacattaataaacatcaatcacatttatcatgaa 1171320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1221584 - 1221351
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||    
1221584 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttccaaatatgactcatgtcatgatatgcac 1221485  T
240 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-a 337  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| |    
1221484 ttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaagttcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaa 1221385  T
338 taatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
1221384 taatct-cgaagtaaaagagttcaacccttttaca 1221351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 24470555 - 24470804
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   | || |   ||| ||||||||  |    
24470555 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatagttcaatttaa-catcatgcatttgatcaataataat---cacacaataatatttacatcacac 24470650  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||| | ||||| | |||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||              || ||||||||||||||| |||||    
24470651 cccaatatctcacaacaataataatcaatcacatatgtcacgaacaattatcaattcacaat--------------cagcaatcacatatatcagtaaga 24470736  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
24470737 ctcatgtcatgatatgcacctattgacccatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 24470804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9732782 - 9732592
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca- 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
9732782 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcaagataaacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 9732688  T
118 atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
9732687 atcc-caatatctcgcatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaagatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 9732592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 11964472 - 11964586
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||     
11964472 cgacacatacatgcatgtggtaccaaaccacctcaaggtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcaaacccgtattacattatca 11964571  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
11964572 ccgaagtaaaagagt 11964586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24185137 - 24184869
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||   ||| |||| | ||||  | |||| |     
24185137 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtaattgatcaataata---ttcacatataaatacaaatatcataa 24185041  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 218  Q
     |||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||    
24185040 tctcaatttctcacatcaattaatcaccaattccatgtgtcaggaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacacttcaaaacaa 24184941  T
219 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
24184940 gactcatgtcatgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 24184869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29192857 - 29192671
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
29192857 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 29192758  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | | ||||||| |||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
29192757 cccgatatctcgcatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcaatcacaatcaccaatcacatttatca 29192671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 17907853 - 17908030
Alignment:
28 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aatcctcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || || |||    
17907853 cataatccaaataacagttaatcatggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacaccaaaaccccaa 17907952  T
126 tatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 210  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||  |||     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
17907953 tatctcacatcaataatcatcgat--cat-----atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 17908030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 11340599 - 11340671
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11340599 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 11340671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21653148 - 21653052
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
21653148 acaatcaccaatcacatttatcaataagactcgtgtcatgatatgcacttatcgacgcatatatgcatgtggtaccaaatgtcctcaaggtcgtcac 21653052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25944750 - 25944678
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25944750 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 25944678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11213404 - 11213222
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
11213404 acaatcatcaatcacttatatcatatgagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 11213305  T
290 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
11213304 ttcgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaacccttttaca 11213222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 23510233 - 23510473
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||      || ||||  |||||| |||||     
23510233 acattatcataatccaaatgacagttaacataaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataacaac-----cacacattaatacttgcatcat 23510325  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca-ata 217  Q
     || |||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||     ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||    
23510326 accccaatatctcacatcaatagtcatcaat--catgtg-----aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcacata 23510418  T
218 agactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
23510419 agactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgttgtaccaaatc 23510473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 110785 - 110604
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 289  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
110785 acaatcatcaatcacatacatcatttaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 110686  T
290 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
110685 ttcgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttaca 110604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18780235 - 18780052
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||    ||||||||||||  |    
18780235 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgattaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 18780139  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||| |||||||||||| ||  ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
18780138 ctcgatatctcacatcaatcttcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 18780052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35793345 - 35793162
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||  |    
35793345 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 35793249  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||| |||||||||||| ||  ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
35793248 ctcgatatctcacatcaatcttcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 35793162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20455741 - 20455627
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||     
20455741 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgttacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacatccgtcttacattatca 20455642  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
20455641 ccgaagtaaaagagt 20455627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22885017 - 22884887
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
22885017 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 22884918  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
22884917 atgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 22884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 111173 - 110990
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
111173 acattatcataattcaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 111079  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || | |||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
111078 accccgatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 110990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17473648 - 17473568
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
17473648 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 17473568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 25424664 - 25424736
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25424664 acattatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 25424736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35792964 - 35792767
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
35792964 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacgatctctaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 35792865  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaag 355  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   |||||||||||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||    
35792864 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaag 35792770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22368674 - 22368602
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22368674 acattatcataatccaaataacagttaacattaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat 22368602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 288
Target Start/End: Original strand, 16534750 - 16534881
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatg 256  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| |||    
16534750 tcatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatctccaatcacatagttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatg 16534849  T
257 catgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
16534850 catgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16534881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 16534391 - 16534463
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16534391 acattatcataatccagataataattaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaacaataat 16534463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18779904 - 18779790
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
18779904 tcatgaacaattatcaattcacaaatgttcattcacaatctctaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 18779805  T
258 atgtggtaccaaatc 272  Q
    |||||||||||||||    
18779804 atgtggtaccaaatc 18779790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22368285 - 22368188
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
22368285 acaatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 22368188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 19498280 - 19498458
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |    
19498280 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcc 19498379  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
19498380 gatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 19498458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 28257998 - 28258093
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
28257998 acaatcaccaaccacatttatcgataaaactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacc-aatctcctcaaggtcgtcac 28258093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10779980 - 10779799
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 289  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
10779980 acaatcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacct 10779881  T
290 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    | |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
10779880 tccgatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-caaagtaaaagagctcaacccttttaca 10779799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 11338802 - 11338734
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataa 89  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
11338802 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatatttcaattaaaagatcatgtacttgatcaataa 11338734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 11341116 - 11341294
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
11341116 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 11341215  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
11341216 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 11341294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 25425102 - 25425206
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
25425102 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 25425201  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
25425202 gatgc 25425206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 10554 - 10628
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
10554 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 10628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 10831 - 10925
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
10831 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 10925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5452511 - 5452432
Alignment:
214 aataagactcatgtca---tgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5452511 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 5452432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43445555 - 43445390
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
43445555 atcaccaatcatatatttcacataagattcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 43445456  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
43445455 gatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt 43445390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4201764 - 4201586
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
4201764 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 4201665  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||  ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
4201664 gatgtcacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 4201586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9732464 - 9732360
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
9732464 atcaccaatcagatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattaacacatagatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 9732365  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
9732364 gatgc 9732360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11338687 - 11338584
Alignment:
123 caatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagac 221  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| |   ||||||||    
11338687 caataactcacatcaattaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaat-cacatttattcatgcacaatcaccaatcacatttcaaaataagac 11338589  T
222 tcatg 226  Q
    |||||    
11338588 tcatg 11338584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25944536 - 25944472
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||    
25944536 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatc 25944472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9732562 - 9732495
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
9732562 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 9732495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25211714 - 25211623
Alignment:
170 atcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgt 261  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
25211714 atcaattcacaattattcacacataatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 25211623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25275866 - 25275775
Alignment:
170 atcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgt 261  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
25275866 atcaattcacaattattcacacataatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgt 25275775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21075286 - 21075192
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
21075286 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 21075192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21933957 - 21933863
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
21933957 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 21933863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21940127 - 21940033
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
21940127 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 21940033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22368411 - 22368337
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
22368411 aatcaccaattacatgtatcctgaacaaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 22368337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 29192415 - 29192321
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
29192415 atcaccaatcacatacttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 29192321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 35580735 - 35580829
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
35580735 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 35580829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37010961 - 37010867
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
37010961 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 37010867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 288
Target Start/End: Original strand, 3672421 - 3672497
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
3672421 aataagactcatgtcttgatatgcatctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaactcacttcaaggtcgtcac 3672497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Original strand, 21647196 - 21647255
Alignment:
30 taatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataat 90  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
21647196 taatccaaatagcagttaacatgaatatttcaa-ttaatcatcatgcatttgatcaataat 21647255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 24594981 - 24595159
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
24594981 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 24595080  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
24595081 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 24595159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Original strand, 11341018 - 11341085
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
11341018 aatcaccattcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 11341085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 110957 - 110888
Alignment:
144 accaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
110957 accaattacatgtatcatgaacaa-tatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 110888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 16534604 - 16534678
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||    
16534604 aatcaccaattaaatgtatcatgaacaattatctattcacagttattcatacgcaatcaccaatcatatacatca 16534678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 358
Target Start/End: Original strand, 23327458 - 23327598
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
23327458 gactcatgctatgatatgcacttatggacccataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 23327557  T
318 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
23327558 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt 23327598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11213613 - 11213541
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
11213613 acattatcataatccaaatatcaatcaacatgaatattacaaattaaacatcatacacttgattaacaataat 11213541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 27008492 - 27008596
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
27008492 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgaggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 27008591  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
27008592 gatgc 27008596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 7726919 - 7726993
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||||    
7726919 acatcatcataatccagataacagctaagcatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaatgataata 7726993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 16534520 - 16534574
Alignment:
160 atgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
16534520 atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 16534574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25902123 - 25902021
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| ||||    
25902123 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctctataaggtcgtcaccttcg 25902024  T
294 atg 296  Q
    |||    
25902023 atg 25902021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25944620 - 25944566
Alignment:
160 atgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
25944620 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacatttatca 25944566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29192641 - 29192583
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatca 198  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
29192641 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacaatca 29192583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 37051465 - 37051559
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
37051465 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 37051559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 205
Target Start/End: Original strand, 11340862 - 11340927
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
11340862 aatcaccaattacatgtatcatgactaataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 11340927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 19403813 - 19403869
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgca 77  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
19403813 acatcatcataatccatataataattaacatgaatagttcaattcaaatatcatgca 19403869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 378
Target Start/End: Original strand, 21649463 - 21649495
Alignment:
346 gaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
21649463 gaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 21649495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 95)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12838192 - 12837900
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
12838192 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttatatcaaaa 12838093  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
12838092 ccccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaaaaag 12837993  T
220 actcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 310  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
12837992 actcatgtcatgatatgcacctatatcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacatcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 12837900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21961440 - 21961053
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||   ||||||| ||||  |    
21961440 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcatatatcaatacttaaatcatac 21961341  T
121 -ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 213  Q
     | ||||| |||||||| || |||||||||| |||| | ||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||     | || ||    
21961340 tcccaatagctcacatcaattaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcactaaacacatttc 21961241  T
214 ---aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 310  Q
       || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
21961240 caaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 21961141  T
311 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21961140 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 21961053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12901631 - 12901269
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||          |||||||||||| |     
12901631 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataatt-aattcaaacatcatgtacttgatcaatataaatat----------atacttacatcataa 12901543  T
120 cctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 213  Q
    ||  ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||     | || ||    
12901542 ccctaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaataatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatcaccaatcacatttc 12901443  T
214 aat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgca 312  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
12901442 aaagaagactcatgtcatgatatacacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgta 12901343  T
313 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaac 386  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
12901342 tgtaatatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatttcaac 12901269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 34393385 - 34393580
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
34393385 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 34393484  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
34393485 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatctgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcgccaatcacatatatca 34393580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Original strand, 33738477 - 33738732
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||      
33738477 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaata--------------catatacttacatcaaaa 33738562  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
33738563 ccccaatatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgccatgagcaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcaataag 33738662  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact 289  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
33738663 actcatgtcatgatatgcatgtatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcaccttaaggtcgtcact 33738732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 53909750 - 53909555
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-- 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
53909750 acatcatcataatccaaataatagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 53909651  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
53909650 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttatca 53909555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 214 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8874162 - 8873978
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
8874162 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacaaataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcttat 8874063  T
314 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
8874062 gtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccatttacaactacaatctcaacacgactatgatg 8873978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 44345057 - 44345333
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatac--------tta 112  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||        |||    
44345057 acatcatcataatcaaaacaacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatacatatatactta 44345156  T
113 catcaat-cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatata 211  Q
    ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||| ||| || ||| |    
44345157 catcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccaaacatataca 44345256  T
212 tcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
44345257 tcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaacaaatcacctcaaggtcgtcac 44345333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 18166874 - 18167067
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
18166874 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 18166973  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
18166974 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 18167067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16366624 - 16366361
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
16366624 acatcatcataatccaaataatagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgcgtttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 16366531  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 218  Q
     ||  ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
16366530 accctaatatctcacatcaataatcatcaatcaaatgtgtcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcactaatcacatatatcaataa 16366431  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16366430 gactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 16366361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7134503 - 7134310
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||| ||||||||| |    
7134503 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaataattacatcaaac 7134404  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
7134403 cccaatatcccacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 7134310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 194 - 379
Target Start/End: Original strand, 14899948 - 14900136
Alignment:
194 aatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
14899948 aatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatatgcacgtagttcgacacatatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcgtcacct 14900047  T
291 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14900048 ccgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacaaaatcaccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 14900136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15274663 - 15274470
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |   ||||||||||||| |    
15274663 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataaaattcccacatcaatacttacatcaaac 15274564  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
15274563 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaattcacagttattcatacacaattatcaatcatatacatca 15274470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34197812 - 34197658
Alignment:
245 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 344  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
34197812 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 34197713  T
345 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
34197712 cgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 34197658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19699606 - 19699414
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
19699606 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19699507  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | ||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
19699506 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 19699414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19710191 - 19709999
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
19710191 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 19710092  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | ||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
19710091 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 19709999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 8372607 - 8372800
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
8372607 acattatcataatccaaataacagttaacaagaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 8372706  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
8372707 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 8372800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37958704 - 37958550
Alignment:
245 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 344  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
37958704 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcatcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 37958605  T
345 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
37958604 tgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 37958550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 254 - 398
Target Start/End: Original strand, 27959563 - 27959708
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
27959563 atgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagattttacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 27959662  T
354 agagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
27959663 agagttcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 27959708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 26678179 - 26678370
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |    
26678179 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccatatcaatacttacatcaaac 26678276  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
26678277 cccaatatgtcacatcaatattcacctatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 26678370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 13244606 - 13244861
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
13244606 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 13244698  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 218  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
13244699 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaataa 13244791  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
13244792 gactcatgccatgatatccacctattgacacatatatgcatgtgggaccaaatcatttcagggtcgtcac 13244861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Original strand, 109957 - 110143
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
109957 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 110056  T
291 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||||  | ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
110057 tcgatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 110143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12245895 - 12245745
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
12245895 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatcaccgaa 12245796  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
12245795 gtaaaagagctaaacccttttacaaatacaagactcaacatgactatgatg 12245745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15852959 - 15852829
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
15852959 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaaaaaaaacatcgtatgtaagatttcaccaaagtcttacataatctccgaa 15852860  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
15852859 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 15852829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41167569 - 41167447
Alignment:
257 catgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaaga 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
41167569 catgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgtaacaaaaacatcgtatgtgagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaaaga 41167470  T
357 gttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    | |||||||||||||||| ||||    
41167469 gctcaacccttttacaaccacaa 41167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 44054168 - 44054427
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || || |||| |||||||||| |||||||| |||  |||||          ||||||||||||  |    
44054168 acatcatcataatccaaataacagttaacataattaatttaattcaaacatcatgtacttgatcgatataaatat----------atacttacatcataa 44054257  T
119 tcctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaata 217  Q
    ||| |||||||||| ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||    
44054258 tcc-caatatctcatatcaataaatcaccagtcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttccaaata 44054356  T
218 agactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
44054357 agactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggccgtcac 44054427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 378
Target Start/End: Original strand, 15211762 - 15212004
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc-aataagactcatgtcatgatatgca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || || || |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
15211762 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcaaaaatactcattcacaatcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgttatgatatgca 15211861  T
239 catatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacc-tcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtctta 335  Q
    | ||| ||  |||| ||||||||||||||||||  ||   |||| |||||| |  |||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||    
15211862 cttattgagacataaatgcatgtggtaccaaatatccaaaaaggacgtcacctctgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgcctta 15211961  T
336 cataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
15211962 cataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 15212004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45460894 - 45460611
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcata--catatacttacatca- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||| ||||     
45460894 acatcataataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaatgataatattcacatatgtatatacttatatcat 45460795  T
118 atcctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacac--------aatcatcaatcacat 208  Q
    | || |||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||        ||||| ||||||||     
45460794 aaccccaatatttcacatcaataattcatcaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaatcaccaatcacag 45460695  T
209 atatca--ataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
     | |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
45460694 ttctcaacataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacgtatatgcatgcggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 45460611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30236411 - 30236147
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||||         || ||||||||| ||||       
30236411 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacctgatcaataata---------tatatatacttatatcataa 30236321  T
121 ct-caatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca--at 216  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  | |||  ||    
30236320 ctgcaatatctcacatcaataaatcaccaattacatgtgtcatgaacaatcaataattcacagttattcatacacagtcaccaatcacaattctcaacat 30236221  T
217 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
30236220 aagactcatgtcatgatgtgcacctaatttgacacatatatggatgtggtaccatatcacctcaaggtcgtcac 30236147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 53706828 - 53706635
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacata--tacttacatcaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||      |||| ||   |||||||||||     
53706828 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcagtataaacatcatgcatttgatcaatagtaaa-----cataaattagtacttacatcac 53706734  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatc-aatcacatatatcaat 216  Q
     || |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
53706733 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtatcatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaaatcacatatatcaat 53706635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22356616 - 22356424
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||   |||||| ||||||      
22356616 acattatcataatccaaataacagttaacaataatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacataacaatacttgcatcaaga 22356519  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
22356518 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 22356424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 15211515 - 15211698
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||  ||||||||||||     
15211515 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa-----tcatacattcatacttacatcac 15211609  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| ||||||| | ||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
15211610 acctcaatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaattcgcaaatattcattaacaatcaccaatcacatttatca 15211698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18294746 - 18294600
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||      
18294746 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaatatcatctacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacattaaat 18294647  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaa 167  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| || ||||   ||||||||||    
18294646 cccaatatctcacatcaataatcaccgatcacataaatcatgaacaa 18294600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13811558 - 13811287
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |  ||| | || | |||   |||    
13811558 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccaaatataaattcataccataat 13811459  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||| || || ||| | | |||||    
13811458 cc-caatatcttacatccattaatcaccaatcacacgtgtaatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcaacattcgcatttcaccaata 13811360  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
13811359 agactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 13811287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 53909519 - 53909431
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
53909519 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 53909431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41258031 - 41257842
Alignment:
214 aataagactcatgtca---tgatatgcacatat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 308  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||    
41258031 aataagactcatgtcaacatgatatgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaatat 41257932  T
309 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacc-cttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||  || || |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
41257931 catatgtaagatttcacacccgtcttacattatcactgaagtagaagag--caccctcttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 41257842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5372342 - 5372228
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||     
5372342 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaagatcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagacttcacacccgtcttacattatca 5372243  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
5372242 ccgaagtaaaagagt 5372228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10239081 - 10238967
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||     
10239081 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacacatgatgcaacaaaaacatcatatgtaaaatttcacacccgtcttacattatca 10238982  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    || ||||||||||||    
10238981 ccaaagtaaaagagt 10238967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 249 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47469976 - 47469867
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
47469976 catatatgcatgtggtaccaaataaccccaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaa 47469877  T
349 gtaaaagagt 358  Q
    ||||||||||    
47469876 gtaaaagagt 47469867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 374
Target Start/End: Original strand, 16521294 - 16521447
Alignment:
222 tcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaaga 319  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||| | ||||| | |||   ||||||| |||||||     
16521294 tcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcttcaaaaggtcgtcacctccgatgga-caagccaacatcgtatgtaagg 16521392  T
320 tttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16521393 gttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 16521447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 19998517 - 19998700
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||| ||||||  |    
19998517 acattatcataatccaaataacagtcaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatactcacatcacac 19998613  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
19998614 cccaatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 19998700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 8874346 - 8874265
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcata 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
8874346 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcata 8874265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 18246178 - 18246250
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18246178 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 18246250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5684586 - 5684404
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ct 289  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||    
5684586 acaatcatcaatcacatacatcatttaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtgataccaaatctcaacaaggtcgtcacct 5684487  T
290 ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
5684486 ttcgatgccacttgcacatcgtatgtaaggactcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaactcttttaca 5684404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20813890 - 20813715
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||   | |||  ||||||||| |||  ||    
20813890 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataat-attcacacatgtatatacttatatcataa 20813792  T
119 tcctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaa 195  Q
    ||| |||||| ||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||    
20813791 tcc-caatatttcacatcaataattcattaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaa 20813715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 16520801 - 16520874
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaattt-aaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
16520801 acatcatcataatctaaataatagttaacatggatatttcaatttaaaacatcatgcacttgatcaataataat 16520874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 47355509 - 47355688
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||| |     
47355509 acattatcataatccaa-taacagttatcacgaacatttcaatt---acatgatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaa 47355604  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 203  Q
    || |||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
47355605 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacatgtgtcataaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcatcaat 47355688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 9293712 - 9293843
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca- 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
9293712 acattatcataatccaaataacagataacatggatatttcaacataaacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 9293806  T
118 atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatg 155  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
9293807 atcc-caatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 9293843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50223806 - 50223696
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||     
50223806 cgacacatatatgcatgtgataccaaatcacctcaaggtcatcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgttagatttcatacccgtcttacattatca 50223707  T
344 ccgaagtaaaa 354  Q
    |||||||||||    
50223706 ccgaagtaaaa 50223696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43283138 - 43283043
Alignment:
196 tcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
43283138 tcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 43283043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18496334 - 18496065
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||  |||||||||| | || | |||| | |||   |||    
18496334 acatcatcataatccatataacaaataacatgaatagttcaatttaaatatcatgcatttaatccgataataatat-cacaaatatattcataccataat 18496236  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||  |||| ||||| || |||| |||||| ||| || | | || ||    
18496235 c-tcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtttcatgaataatcatcaaatcacatttatttatgcacagtcatcactcatatttcaccatta 18496137  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata-tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    | |||||||||||||| ||||| || | ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
18496136 aaactcatgtcatgatgtgcacctagttgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 18496065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 55378757 - 55378691
Alignment:
28 cataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatat 95  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
55378757 cataatccaa-taactgttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttaatcaataataatat 55378691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 54120195 - 54120066
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
54120195 acatcaacataatccaattaacaattaacatggatatttcaatt--aacatcatgcattcgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 54120103  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatg 155  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
54120102 acctcaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 54120066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 10642586 - 10642683
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
10642586 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 10642683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5684802 - 5684742
Alignment:
26 atcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
5684802 atcataatccaaataacagttaacatgaatattacaaattaaacatcatgcacttgatcaa 5684742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 19999005 - 19999183
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |    
19999005 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcc 19999104  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
19999105 gatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 19999183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 52267196 - 52267125
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
52267196 gactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 52267125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 53706591 - 53706515
Alignment:
182 ttattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgca 258  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
53706591 ttattcacacacaatcaccaaacacaaatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgca 53706515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 10642374 - 10642505
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca- 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
10642374 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaacataaacctcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 10642468  T
118 atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatg 155  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
10642469 atcc-caatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 10642505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 54119976 - 54119906
Alignment:
202 atcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||    
54119976 atcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatctggtaccaaatc 54119906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 9293924 - 9294021
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
9293924 acaatcaccaatcacatttatgaaacaagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 9294021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22356244 - 22356065
Alignment:
193 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-cttt 291  Q
    |||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
22356244 caatcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacaaataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 22356145  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
22356144 cgatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 22356065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15138238 - 15138134
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||    
15138238 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcatcacctttc 15138139  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
15138138 gatgc 15138134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 26678522 - 26678626
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
26678522 atcaccaatcacatatttcacataagactcgtgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcatctttc 26678621  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
26678622 gatgc 26678626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 47355803 - 47355907
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
47355803 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgaacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 47355902  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
47355903 gatgc 47355907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 8372951 - 8373029
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
8372951 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 8373029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 14994678 - 14994772
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
14994678 atcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 14994772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 18167195 - 18167273
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
18167195 atcaccaatcacatatgtcacataagactcatgttatgatttgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccaaatc 18167273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 18246668 - 18246762
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
18246668 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 18246762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25120663 - 25120617
Alignment:
332 cttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
25120663 cttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 25120617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15274442 - 15274361
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
15274442 acaatcaccaatcacaaatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 15274361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 205
Target Start/End: Original strand, 19998780 - 19998845
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
19998780 aatcaccaattacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcatacacaatcaccaatca 19998845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13751978 - 13751910
Alignment:
139 taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
13751978 taatcaccaatcacatatgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 13751910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 34393610 - 34393666
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaat 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
34393610 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaat 34393666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 55378626 - 55378542
Alignment:
123 caatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 206  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
55378626 caatatctcacatcaattaatcaccaatcttatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaaatattcatacacaatcatcaatcac 55378542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Original strand, 8372854 - 8372921
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
8372854 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 8372921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7134208 - 7134088
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||| | ||| || ||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||    
7134208 aatcaccaatcacatgtatcaggaataaatatcaattcacaaatattcattcgcaa-caccaatcacatttccaaatatgactcatgtcatgatatgcac 7134110  T
240 atatcgacgcatacatgcatgt 261  Q
     ||| ||| |||| ||||||||    
7134109 ttattgacacataaatgcatgt 7134088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 205
Target Start/End: Original strand, 16521015 - 16521080
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
16521015 aatcaccaattacatgtatcatgaataatcatcaattaacaattattcatacacaatcaccaatca 16521080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 398
Target Start/End: Original strand, 34393690 - 34393727
Alignment:
361 aacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34393690 aacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 34393727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 109748 - 109817
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
109748 acattatcataatacaaatagcagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatctgatcaataataa 109817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 14950498 - 14950602
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
14950498 atcaccaatcacgtatttcacataggactcatgatatgatatgcacttattgacccataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 14950597  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
14950598 gatgc 14950602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 288
Target Start/End: Original strand, 15043381 - 15043443
Alignment:
228 catgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15043381 catgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatgacctcaaggtcgtcac 15043443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15111043 - 15110981
Alignment:
228 catgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
15111043 catgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatgacctcaaggtcgtcac 15110981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 207
Target Start/End: Original strand, 26678428 - 26678491
Alignment:
144 accaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
26678428 accaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 26678491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Original strand, 47355705 - 47355769
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatc 204  Q
    |||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
47355705 aatcaccaatcatatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatc 47355769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 53706521 - 53706465
Alignment:
232 atatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
53706521 atatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtactagatcacctcagggtcgtcac 53706465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 268
Target Start/End: Original strand, 7848776 - 7848902
Alignment:
142 tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcaca 240  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||||| || |||  ||||| |||||  ||||||||| || ||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||     
7848776 tcaccaatcacatgggtcctaaacaaataccaaaccacaactattcgcacacaatcaccactcaca-atttcaaatgagattcatgtcatgatatgcacc 7848874  T
241 tatcgacgcatacatgcatgtggtacca 268  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||    
7848875 tattgacacatatatgcatgtggtacca 7848902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 252
Target Start/End: Original strand, 16521168 - 16521263
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagac-tcatgtcatgatatgcacatatcgacgcata 252  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
16521168 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttcaaaataagccatcatgtcatgatatgcacttattgacacata 16521263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 10487149 - 10487243
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
10487149 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 10487243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16329602 - 16329508
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
16329602 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 16329508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17213420 - 17213378
Alignment:
315 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
17213420 taagatttcacacccgtcttacattttcgccgaagtaaaagag 17213378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 18246391 - 18246465
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
18246391 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaatccacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatca 18246465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 358
Target Start/End: Original strand, 24237479 - 24237525
Alignment:
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||    
24237479 atgtaagatttcacgcacgtcttacattatcgccgaagtaaaagagt 24237525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13049843 - 13049739
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||  ||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
13049843 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacatataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 13049744  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
13049743 gatgc 13049739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17377084 - 17377040
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
17377084 cgacacatatatgaatgtggtaccaaatcacctcaaggtcatcac 17377040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 72)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 35053141 - 35053515
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||          ||| |    
35053141 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacaccatgtacttgatcaataataacattctcatacat----------caaac 35053230  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaa-------tcacatatatc 213  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||       |||||| |       
35053231 cacaatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaacatcaattcacaattattcatacacaatcaccaaacaccattcacatttcca 35053330  T
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
35053331 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtat 35053430  T
314 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35053431 gtaagatttcacacccgtcttacataatctcataagtaaaagagttcaacccttctacaactacaatctcaacacgactatgatg 35053515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22408162 - 22407894
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
22408162 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 22408063  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
22408062 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgagcaaatatcaattcacaattattcacacacaatcaccaatcacatatatcaataag 22407963  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22407962 acttatgtcatgatatgcacatatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 22407894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2422997 - 2422733
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |    
2422997 acatcaacataatccaaataacaattaacatggatatttcaatataaacatcatacacttgatcaataata---ttctcatacatatacttacatcaaac 2422901  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||    
2422900 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatttccaaataaga 2422801  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2422800 ctcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaagtcgtcac 2422733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 140 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5676355 - 5676091
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat-------cacatatatcaataagactcatgtcatga 232  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||       ||||| |   |||||||||||||||||||    
5676355 aatcaccaatcacatgtgtcatga-caaatatcaatacataattattcatacacaatcaccaattaccaatcacatttccaaataagactcatgtcatga 5676257  T
233 tatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtc 332  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
5676256 tatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccgtatcacctcaaggtcgtcaccttcaatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtc 5676157  T
333 ttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5676156 ttacataatctctgaagtaagagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 5676091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 41217544 - 41217739
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
41217544 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaatatacttacatcaaaa 41217643  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
41217644 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 41217739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5676535 - 5676350
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
5676535 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcattataaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatgcatatacttacatcaaac 5676436  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 206  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
5676435 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaatacacaattattcatacacaatcaccaatcac 5676350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 217 - 398
Target Start/End: Original strand, 41217945 - 41218126
Alignment:
217 aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
41217945 aagactcatgtcatgatatgcacctatcgatagatatatacatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgta 41218044  T
317 agatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41218045 agagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaatagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 41218126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 192 - 398
Target Start/End: Original strand, 20444214 - 20444420
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||    
20444214 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt 20444313  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 391  Q
    ||||| | |||| |||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
20444314 cgatgaatcaaacacatcttatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 20444413  T
392 tatgatg 398  Q
    |||||||    
20444414 tatgatg 20444420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 20252342 - 20252534
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |    
20252342 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattatcatatcaatacttacatcaaac 20252441  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
20252442 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtatcatgaacgaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 20252534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 37846162 - 37845956
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||    
37846162 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctt 37846063  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 391  Q
    ||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
37846062 cgatgaatcaaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcagcccttttacaactacaatttcaacatgac 37845963  T
392 tatgatg 398  Q
    |||||||    
37845962 tatgatg 37845956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 398
Target Start/End: Original strand, 20529978 - 20530185
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact-t 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||| |  |    
20529978 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaacgtcgtccccct 20530077  T
291 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 390  Q
    |||||| | |||| |||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
20530078 tcgatgaatcaaacacatcttatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaatctcaacacga 20530177  T
391 ctatgatg 398  Q
    ||||||||    
20530178 ctatgatg 20530185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38035260 - 38035130
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
38035260 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgttttacataatctccgaa 38035161  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
38035160 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 38035130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 254 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13378395 - 13378250
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
13378395 atgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaagtaaa 13378296  T
354 agagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
13378295 agagcttaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 13378250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 151 - 288
Target Start/End: Original strand, 49966014 - 49966151
Alignment:
151 acatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgca 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
49966014 acatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacaca 49966113  T
251 tacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49966114 tatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 49966151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9786315 - 9786123
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
9786315 acatcatcataatccacataacagttaacatgaacatttcatcataaacatcatacacttgatcaataataatatcctcatacatgtacttacatcaa-c 9786217  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||    
9786216 cccaatgtctcacatcaataatctccaatcacatttgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattacccatcacatatatca 9786123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 254 - 377
Target Start/End: Original strand, 19601713 - 19601836
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
19601713 atgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaacgaagtaaa 19601812  T
354 agagttcaacccttttacaactac 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
19601813 agagctcaacccttttacaactac 19601836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 36357976 - 36357826
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
36357976 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcatcttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcactccagtcttacataatctctgaa 36357877  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
36357876 gtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 36357826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37235600 - 37235470
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
37235600 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatttaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaa 37235501  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||||||    
37235500 gtaaaagagctcaaccattttatagctacaa 37235470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 20929955 - 20930131
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||    
20929955 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgtaa 20930054  T
300 caa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
20930055 caactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccaaagtaaaagagctcaaccattttacaac 20930131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Original strand, 21193694 - 21193844
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
21193694 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggttgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaa 21193793  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||  |  | |||||||| |||| || ||||||| ||||||||||    
21193794 gtaaaagagcacccctcttttacagctacaaaactcaacatgactatgatg 21193844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 22226459 - 22226638
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
22226459 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 22226558  T
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22226559 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 22226638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35524350 - 35524082
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||| | |||||||||||  ||    
35524350 acatcatcataatccaaagaacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaat---aatattcacatataaatacttacatcataa 35524254  T
119 tcctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaata 217  Q
    ||| |||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |   || |    
35524253 tcc-caatttctcacatcaattaatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacaattcaaaaca 35524155  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
35524154 agactcatgtcgtgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 35524082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 263 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8539584 - 8539490
Alignment:
263 gtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
8539584 gtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 8539490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 263 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8604823 - 8604729
Alignment:
263 gtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
8604823 gtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatcaccgaagtaaaagag 8604729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Original strand, 22352601 - 22352785
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
22352601 acaatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 22352700  T
291 tcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
     |||||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
22352701 ccgatg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctctgaagtaagagagctcaacccttttacaac 22352785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44036582 - 44036401
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |  |||| |    
44036582 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttactgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctctgatgga 44036483  T
299 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||   ||||||| |||||||  | ||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
44036482 acaactcaacatcgtatgtaagggtccacccctgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 44036401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22837059 - 22836911
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22837059 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcttcaat-cacatttat-catgaacaatcatcaatcacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcac 22836962  T
240 ata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
     ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22836961 ctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 22836911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 249 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5769853 - 5769744
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
5769853 catatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaa 5769754  T
349 gtaaaagagt 358  Q
    ||||||||||    
5769753 gtaaaagagt 5769744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 18505646 - 18505817
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   | ||||   ||||||||||||  |    
18505646 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaattt-aacatcatgcatttgatcaataataat-cacacatattaatacttacatcacac 18505743  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacaca 194  Q
    |  ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||    
18505744 ccaaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacaaatattcattcaca 18505817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22250905 - 22250776
Alignment:
85 aataataatattctcatacatatacttacatcaatcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaatta 184  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
22250905 aataataatattctcatatcaatacttacatcaaaccccaatatctcacatcaatgatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtta 22250806  T
185 ttcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| ||||    
22250805 ttcatacacaaccaccaatcatatacatca 22250776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20895687 - 20895589
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
20895687 acatcaacataattcaattaactgtttacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttacatcaat 20895589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15863508 - 15863325
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
15863508 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaccatcatgcacttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 15863414  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || | |||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
15863413 accccgatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 15863325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20895486 - 20895390
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
20895486 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctcagggtcgtcac 20895390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15863149 - 15862938
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
15863149 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 15863050  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |  ||| |||||| |||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
15863049 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ataaaacacatcgtatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 15862955  T
358 ttcaacccttttacaac 374  Q
       ||| ||||||||||    
15862954 ccgaactcttttacaac 15862938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 20821476 - 20821590
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||     
20821476 cgacacatatatgcatgtggtatcaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacgcccgtcttacattatcg 20821575  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
20821576 ccgaagtaaaagagt 20821590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5472028 - 5471872
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc-gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 342  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
5472028 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatc 5471929  T
343 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
     ||||| ||||||||| |  | | ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
5471928 accgaaataaaagagtacccctcatttacaacttcaagactcaacatgactatgatg 5471872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9785995 - 9785899
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
9785995 acaatcaccaaccacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 9785899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 17146820 - 17146892
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17146820 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 17146892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20956776 - 20956627
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgca 238  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
20956776 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcatcaat-cacaataat-catgaacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcatgtcatgatatgca 20956679  T
239 cata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
20956678 cctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcac 20956627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 22352285 - 22352357
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22352285 acattatcataatccaaataatagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 22352357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 51658255 - 51657986
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||  ||||||||   |||| | || | |||   |||     
51658255 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatatacttaatcac-aataatatctacatatacattcataccataatt 51658157  T
121 ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca-tatatcaataa 218  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||    
51658156 c-caatatcttacatcaattaatcaccaatcgcatgtggcatgaacaattatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacattccaccaataa 51658058  T
219 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
51658057 gactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcactccaaggtcgtcac 51657986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 21716430 - 21716707
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||   ||     
21716430 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcattataaacatcatgtacttgatcaataataatattcatatatatatacacacacacata 21716529  T
120 ------cctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atata 211  Q
           ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| | ||||||| ||  |    
21716530 ccataatctcaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaattaccaatcacaattca 21716629  T
212 tcaataagactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
     |||  ||||||||| |||||| || ||  | | |||| |||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
21716630 ccaaatagactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatattatctcaaggtcgtcac 21716707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 398
Target Start/End: Original strand, 20526725 - 20526791
Alignment:
332 cttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
20526725 cttacataatctccgaagtaaaagagctcaaccattttacaactacaatctcaacacgactatgatg 20526791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41213311 - 41213197
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
41213311 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatacaataaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 41213212  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
     ||||||||||||||    
41213211 tcgaagtaaaagagt 41213197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22145036 - 22144923
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||     
22145036 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaaaatttcacactcgtcttacattatca 22144937  T
344 ccgaagtaaaagag 357  Q
    ||||||||||||||    
22144936 ccgaagtaaaagag 22144923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15863295 - 15863221
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
15863295 aatcaccaattacatgtatcatgaacaagtatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 15863221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22250752 - 22250622
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||| |   |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
22250752 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacagtctccaatcacatttccaaatatgacacatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 22250653  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
22250652 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22250622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 27673257 - 27673355
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
27673257 acaatcatcaatcacatttatcaaatagactcatgtcatgatatgcacctagtttgacacatatatgcatgtggtaccaactcacttcaagggcgtcac 27673355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 21857753 - 21857934
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
21857753 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgtatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacatcac 21857845  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||     ||||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||    
21857846 accccaatatctcacatcaataatcatcaat--catg-----tgaacaattatcaatgcacaaatattcattcataatcaccaatcacatttatca 21857934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 41217793 - 41217867
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
41217793 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 41217867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 22365155 - 22365252
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaat-aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
22365155 acaatcaccaatcacatttatcaaacaagactcatgtcattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 22365252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 17147258 - 17147362
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
17147258 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 17147357  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
17147358 gatgc 17147362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 22364943 - 22365015
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||    
22364943 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaacataaacctcatgcatttgatcaataataat 22365015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 71
Target Start/End: Original strand, 22080190 - 22080240
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacat 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
22080190 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacat 22080240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 272
Target Start/End: Original strand, 21857966 - 21858035
Alignment:
203 tcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||    
21857966 tcacatatgtcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatatggtaccaaatc 21858035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 35935239 - 35935166
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
35935239 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 35935166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20895590 - 20895514
Alignment:
138 ataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
20895590 ataatcaccaatcacatgtgtcataaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 20895514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 7642270 - 7642105
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
7642270 atcaccaatcacataattcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 7642171  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
7642170 gatgccacttgcacatcgaatgtaaggactcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagt 7642105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 17003302 - 17003396
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
17003302 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 17003396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 22034325 - 22034503
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
22034325 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 22034424  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
22034425 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 22034503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 357
Target Start/End: Original strand, 45050185 - 45050324
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgca 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| | |||||  ||||   |||||||||    
45050185 ataagactcatgttatgatatgcacttgttgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctccgatg-gacaagtcaacatcgca 45050283  T
313 tgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagag 357  Q
    ||||||   |||| |    ||||||||||||||||||||||||||    
45050284 tgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaagag 45050324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 41392929 - 41393023
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
41392929 atcaccaatcacatatttcacataggactcatactatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 41393023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 51451090 - 51451184
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
51451090 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 51451184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Original strand, 20444015 - 20444186
Alignment:
31 aatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaatcctcaatat 128  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||      || ||||  ||||||||||||  || ||||||    
20444015 aatccaaatagtagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa-----ccacacattaatacttacatcacaccccaatat 20444107  T
129 ctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||| |||||||  |||||        |||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||    
20444108 ctcacatcaataatcattaatta-------tatgaacaattatcaattcacaattattcattcatagtcaccaatcacatttatca 20444186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Original strand, 20529755 - 20529926
Alignment:
31 aatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaatcctcaatat 128  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||      || ||||  ||||||||||||  || ||||||    
20529755 aatccaaatagtagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa-----ccacacattaatacttacatcacaccccaatat 20529847  T
129 ctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||| |||||||  |||||        |||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||    
20529848 ctcacatcaataatcattaatta-------tatgaacaattatcaattcacaattattcattcatagtcaccaatcacatttatca 20529926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20826909 - 20826805
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
20826909 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 20826810  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
20826809 gatgc 20826805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 37846366 - 37846297
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||    
37846366 acattatcataatccaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgattttgatcaataataa 37846297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5073963 - 5073884
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
5073963 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 5073884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 249 - 288
Target Start/End: Original strand, 18505816 - 18505855
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18505816 catatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 18505855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18602706 - 18602627
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
18602706 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 18602627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 17146949 - 17147003
Alignment:
160 atgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
17146949 atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtatatca 17147003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 77677 - 77632
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctc-aaggtcgtcac 288  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
77677 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaaggtcgtcac 77632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 12488 - 12874
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata------cttaca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||      ||||||    
12488 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatatagacatcatgcacttgatgaataataatattctcatatatatatatatacttaca 12587  T
115 tcaat---cctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 210  Q
    ||||    || |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
12588 tcaaaaccccccaatatctcacattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaac-attaattcaaaattattcatacacaatcaccaatcacattt 12686  T
211 atcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 310  Q
       |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
12687 ccaaataggactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcg 12786  T
311 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
12787 tatgtaagatttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagttcaagccttttatgactacaatctcaacacgactatgatg 12874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 31038 - 31304
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
31038 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaaaatacttacatcaacc 31137  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
31138 c-caatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 31236  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
31237 ctcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 31304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 9)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 256827 - 256560
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
256827 acatcatcataatccaaataacagttaatatgaatatttcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 256728  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
256727 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 256628  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
256627 ctcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 256560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 125089 - 125009
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
125089 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 125009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 72106 - 72028
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
72106 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 72028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 76487 - 76409
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
76487 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 76409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 192768 - 192897
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  |||||||||| |     
192768 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacattac 192860  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatg 155  Q
     || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
192861 accccaatatctcacatcaataatcatcaattacatg 192897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 72317 - 72247
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
72317 acatcatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 72247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Original strand, 192985 - 193057
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
192985 caatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 193057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 76698 - 76628
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
76698 acatcatcataatccaaataacagttatcaagaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 76628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 125298 - 125228
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
125298 acatcatcataatctaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 125228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 99)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 36892628 - 36892360
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
36892628 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 36892529  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataag 219  Q
    || ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
36892528 ccccaatagcttacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataag 36892429  T
220 actcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36892428 actcatgtcaagatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 36892360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 140 - 398
Target Start/End: Original strand, 6877859 - 6878117
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
6877859 aatcaccattcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcac 6877958  T
240 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacata 339  Q
     ||| ||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
6877959 ttattgacacataaatgcatttggtaccggatcacctcaaagtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacata 6878058  T
340 atctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6878059 atctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 6878117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 397
Target Start/End: Original strand, 8886450 - 8886814
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||     || ||||  |||| |||||||     
8886450 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacatcaatacctacatcac 8886542  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 218  Q
     |  ||||||||| |||| |||||||  ||| |||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||    
8886543 actccaatatctcgcatcaataatcattaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcactcacaatcaccaatcacacatatcaataa 8886635  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaag 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
8886636 gactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaag 8886735  T
319 atttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 397  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8886736 agttcacacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgat 8886814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25877882 - 25877618
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||   |||||||||||||||    
25877882 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacataacaatacttacatcaatc 25877786  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
25877785 cccaatatctcgcatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 25877686  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25877685 ctcatatcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 25877618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 159 - 394
Target Start/End: Original strand, 22861923 - 22862158
Alignment:
159 catgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgca 258  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |   ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||    
22861923 catgaacgattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacacttccaaataagaatcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgca 22862022  T
259 tgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22862023 tgtggtacgagatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 22862122  T
359 tcaacccttttacaactacaatctcaacacgactat 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
22862123 tcaacccttttacaactacaatctcaacacaactat 22862158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 194 - 398
Target Start/End: Original strand, 25600431 - 25600635
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
25600431 aatcaccaaccacatttatcaataagattcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccatattacctcaaggtcgtcaccttcg 25600530  T
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgacta 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
25600531 atgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaactcaacgagacta 25600630  T
394 tgatg 398  Q
    |||||    
25600631 tgatg 25600635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 140 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24089120 - 24088880
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgca 238  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||  |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||    
24089120 aatcatcaatcacatttatcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgcacaatcatcaatcacatttcaccaataagactcgtgtcatgatgtgca 24089023  T
239 cata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac 336  Q
    | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
24089022 cctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcatcttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac 24088923  T
337 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
24088922 ataatctccgacgtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 24088880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 214 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19435144 - 19434958
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
19435144 aataagactcatgtcatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtatcaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgt 19435045  T
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
19435044 acgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagt-aaagagctcaaccctttttcaactacaagactcaacatgactatgatg 19434958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 161 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43644688 - 43644471
Alignment:
161 tgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatg 260  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
43644688 tgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacgcatatatgcatg 43644589  T
261 tggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttc 360  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||| |||| || | |||  |||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||    
43644588 tggtaccaaatctccaaaagatcgtcaccttcgttgaatcaagcacatcgtatgtaagggttcacacccgcctcacataatcttcgaagtaaaagagctc 43644489  T
361 aacccttttacaactaca 378  Q
    ||||||||||||||||||    
43644488 aacccttttacaactaca 43644471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12638187 - 12638003
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
12638187 acattatcataaaccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 12638088  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
12638087 cccaatgtctcacatcaataatcactaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 12638003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42180402 - 42180210
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
42180402 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 42180303  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | ||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
42180302 cccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatc 42180210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 244 - 398
Target Start/End: Original strand, 19658470 - 19658625
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
19658470 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 19658569  T
344 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
19658570 tcgaagtaaaagagctcaacctttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 19658625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21276535 - 21276342
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||| || |   ||||||||||||| |    
21276535 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataagcatcatgcatttgatcaataatcatattcccacatcaatacttacatcaaac 21276436  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
21276435 cccaatatctcacatcgataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 21276342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 192 - 398
Target Start/End: Original strand, 15631864 - 15632071
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
15631864 acaatcaccaatcacatttatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgactcaaaaatgcatgtggtaccgaatcacctccaggtcgtcacct 15631963  T
291 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 390  Q
    | |||||  |   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||    
15631964 ttgatgcctcttgaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagcttaacccttttacaactacaaatacaacacga 15632063  T
391 ctatgatg 398  Q
    ||||||||    
15632064 ctatgatg 15632071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4925 - 4795
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
4925 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacattgtatgtaagatttcacccccgtcttacataatctccgaa 4826  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
4825 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 21140139 - 21140325
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |    
21140139 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatcaaac 21140238  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
21140239 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtataaggaacaaatatcaattcacaagtattcatttacaatcatcaatcaca 21140325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Original strand, 25304094 - 25304244
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
25304094 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccttcttacataatctccgaa 25304193  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
25304194 gtaaaatagcttaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 25304244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 271 - 398
Target Start/End: Original strand, 27260130 - 27260257
Alignment:
271 tcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttta 370  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27260130 tcacctcaaggtcgtcacctttgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttta 27260229  T
371 caactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||    
27260230 caactacaaacacaacatgactatgatg 27260257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23823157 - 23823027
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
23823157 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtcttacataatctccgaa 23823058  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
23823057 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 23823027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23825101 - 23824971
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
23825101 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtcttacataatctccgaa 23825002  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
23825001 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 23824971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23832236 - 23832106
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
23832236 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacctcagtcttacataatctccgaa 23832137  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
23832136 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaa 23832106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 398
Target Start/End: Original strand, 43641346 - 43641502
Alignment:
243 tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatc 342  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
43641346 tcgacacatatatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaataaaaacatcgtatgtaagatttcacatccgtcttacataatc 43641445  T
343 tccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||    
43641446 accgaagtaaaagagctcaacccttttacggctacaagactcaacatgactatgatg 43641502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19670778 - 19670629
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19670778 cataaatgcatgtggtgccgaatctcctcaaggtcgtcaccttcgatgcatcaaga-catcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 19670680  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
19670679 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 19670629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Original strand, 22282601 - 22282782
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
22282601 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 22282700  T
299 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
22282701 acaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 22282782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24296221 - 24296071
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
24296221 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaactaaaacatcgtatgtaagatttcacccaagtcttacataatctccgaa 24296122  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
24296121 gtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 24296071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 24966425 - 24966609
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||| |    
24966425 acatcatcataatccaaataaaagttaacatgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 24966521  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 208  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
24966522 cccaatatctcacattaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcacat 24966609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 7319718 - 7319989
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa-taataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||| | | || |||| | |||   |||    
7319718 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacgtatatattcataccataat 7319817  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | | |||||    
7319818 cc-caatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacattcattcatacacaatcatcattcacatttcaccaata 7319916  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||| || || ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
7319917 agactcatgtcatgatgtgtacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 7319989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12644000 - 12643812
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||||| |    
12644000 acattatcataatccaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacat-ca-atacttacatcaaac 12643906  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||    
12643905 cccaatgtctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatcatatacatca 12643812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 376
Target Start/End: Original strand, 22273368 - 22273547
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
22273368 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 22273467  T
299 acaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaacta 376  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
22273468 acaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctcttaagtaaaagagctcaactcttttacaacta 22273547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 28972272 - 28972543
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||  |    
28972272 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatagttcaatt-aaacatcatgtacttgatcaataataatattcacacatatatacatataccataa 28972370  T
119 tcctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaat 216  Q
    | | ||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||    
28972371 ttcccaaaatttcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcctgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaat 28972470  T
217 aagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||| |||||| || || ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
28972471 aagactcatg-catgatgtgtacctagcccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 28972543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32102 - 31832
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgat-caataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| || | |||||||||| | |||| |||| | |||   |||    
32102 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaattcgataataatat-cacatatatattcatactataat 32004  T
120 cctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
      ||||||||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||    
32003 t-tcaatatctcacatcaaataatcaccagtcacatatgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaata 31905  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
31904 agactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 31832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 34822315 - 34822498
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||  |    
34822315 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 34822411  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | | |||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
34822412 cccgatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 34822498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 269422 - 269693
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||| |  |||    ||     
269422 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattaaatataaacatcatgaatttgatcaataacaatattcacatatatacatataccatgat- 269520  T
121 ctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaataa 218  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| || |||||| | ||||||| ||  | ||||||    
269521 ctcaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatatatttatgcacaattaccaatcacaattcaccaataa 269620  T
219 gactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    |||||||| |||||| || ||  | | |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
269621 gactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcactt 269693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12643758 - 12643600
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||    
12643758 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcagaaatattcatacacaatcaccaatcacatttccaaatatgactcatgtcatgatatgcac 12643659  T
240 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
     ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
12643658 ttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 12643600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3801306 - 3801123
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||  |    
3801306 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 3801210  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | | |||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
3801209 cccgatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 3801123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 22692768 - 22692949
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
22692768 atcaccaatcacatatatcaaataagactaatgttattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacctccg 22692867  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22692868 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacaaaatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 22692949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 22697415 - 22697596
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
22697415 atcaccaatcacatatatcaaataagactaatgttattatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccataaggtcgtcacctccg 22697514  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
22697515 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacaaaatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 22697596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 121 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24573221 - 24573051
Alignment:
121 ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 218  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| || ||||||| |||||||||| | | ||||||    
24573221 ctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttatttatgcacaatcttcaatcacatttcaccaataa 24573122  T
219 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 287  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
24573121 gactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacccatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtca 24573051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 214
Target Start/End: Original strand, 25600310 - 25600401
Alignment:
123 caatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25600310 caatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 25600401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 15631631 - 15631812
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||            |||||||||||     
15631631 acatcatcataattcaaataacagttaatcatggatatttcaatataa-catcatgcatttgatcaataacaatat------------acttacatcaaa 15631717  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||   |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
15631718 ctccaatatctcacatcaataatctccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaacttacaattattcatacaccattatcaatcatatatatca 15631812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38706993 - 38706810
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacata-tacttacatcaat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||   || |||||||||||      
38706993 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat---tagtacttacatcaca 38706898  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |  |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
38706897 caccaatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatca 38706810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 8941712 - 8941784
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8941712 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 8941784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19888920 - 19888848
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19888920 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 19888848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 25210893 - 25210965
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25210893 acattatcataattcaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 25210965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4450171 - 4450084
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
4450171 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgaacttgatcaataacaatattctcatatatata 4450084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 18534350 - 18534464
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||| |||     
18534350 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaacgtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagattgcacactcgtcttacattatca 18534449  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
18534450 ccgaagtaaaagagt 18534464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 354
Target Start/End: Original strand, 24272579 - 24272689
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||     
24272579 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacactcgtcttacattatca 24272678  T
344 ccgaagtaaaa 354  Q
    |||||||||||    
24272679 ccgaagtaaaa 24272689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22137469 - 22137341
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||     
22137469 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccatcttacattatca 22137370  T
344 ccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||||||    
22137369 ccgaaataaaagagcacatcccttttaca 22137341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22691910 - 22691823
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata 108  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22691910 acatcatcatagtccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacatacatata 22691823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22696557 - 22696470
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata 108  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
22696557 acatcatcatagtccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacatacatata 22696470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 25600173 - 25600260
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
25600173 acatcatcataatccacataacagttaacatgaatatttcaaactaaacatcatgcacttgatcaataatagtattcacacacatata 25600260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Original strand, 461139 - 461219
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
461139 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 461219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22581759 - 22581588
Alignment:
121 ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 218  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||  || | | ||| || |||||||||||||||||| | | ||||||    
22581759 ctcaatatctcacgtcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcatattcatttatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataa 22581660  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
22581659 gactcatgtcatgatgtgcacctagtccgacacataaatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 22581588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9654579 - 9654507
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
9654579 caatcacatatatcaataagactcatggcatgatatgcacctatagacacatatatgcatgtggtaccaaatc 9654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12637843 - 12637665
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
12637843 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 12637744  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
12637743 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 12637665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20629114 - 20629034
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
20629114 acaatcaccaatcacatatatcaataagactcttgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 20629034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 21140355 - 21140533
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |    
21140355 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcc 21140454  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
21140455 gatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttaca 21140533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 272
Target Start/End: Original strand, 24966692 - 24966770
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
24966692 aatcaccaatcacatatatcaataagattcatgccatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 24966770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22691758 - 22691607
Alignment:
139 taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaataagactcatgtcatgatatgc 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    ||||||||| |||| |||||| ||     
22691758 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcacaattcgccaataagacacatg-catgatgtgt 22691660  T
238 ac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||  | | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
22691659 acctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcttcac 22691607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22696405 - 22696254
Alignment:
139 taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaataagactcatgtcatgatatgc 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    ||||||||| |||| |||||| ||     
22696405 taatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcacaattcgccaataagacacatg-catgatgtgt 22696307  T
238 ac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||  | | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
22696306 acctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaaggtcttcac 22696254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21276205 - 21276027
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |    
21276205 atcaccaatcaaatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttcc 21276106  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
21276105 gatgccacttgcacatcgtatgtaag-gctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagctcaacccttttaca 21276027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 6877721 - 6877791
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataata 91  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
6877721 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatataaacatcatacacttgaacaataata 6877791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9654792 - 9654615
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||||| ||||||||||||||   || ||||   |||||||||||| ||    
9654792 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaat------atcatgcatttgatcaataataa---tcacatattaatacttacatcacat 9654702  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||  |||     |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
9654701 cc-caatatctcacatcaataatcatcaat--cat-----atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaattaccaatcacatttatca 9654615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24687322 - 24687161
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtc-actttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||    |||||| ||||||    
24687322 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaactttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 24687223  T
318 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
24687222 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttacaacaacaa 24687161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3800791 - 3800613
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
3800791 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 3800692  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
3800691 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 3800613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 214
Target Start/End: Original strand, 25211108 - 25211180
Alignment:
142 tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
25211108 tcaccaattacttgtatcatgaacaattatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatca 25211180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 34822676 - 34822854
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
34822676 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 34822775  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
34822776 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 34822854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20629323 - 20629142
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||      || ||||  ||||||||||||     
20629323 acattatcataatccaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataacaa-----ccacacattaatacttacatcac 20629231  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || || ||||||||||| ||||| | |||| |       ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
20629230 accccattatctcacatcaataattatcaatca-------catgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 20629142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Original strand, 34822578 - 34822645
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
34822578 aatcaccaattacatgtatcatgaataaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 34822645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19888456 - 19888362
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
19888456 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 19888362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 22282397 - 22282466
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataata 91  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
22282397 acattatcataatccaaatagcagttaacatgaatatttcaa-ttaatcatcatgcatttgatcaataata 22282466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 12726531 - 12726709
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
12726531 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 12726630  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
12726631 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 12726709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12637940 - 12637873
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
12637940 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 12637873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5889974 - 5889880
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
5889974 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 5889880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11232929 - 11232835
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
11232929 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 11232835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14908116 - 14908022
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
14908116 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 14908022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 22273164 - 22273233
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataata 91  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
22273164 acattatcataatccaaatagcagttaacatgaatatttcaa-ttaatcatcatgtatttgatcaataata 22273233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22514776 - 22514682
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
22514776 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 22514682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28777377 - 28777283
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
28777377 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 28777283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 22654339 - 22654412
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||  |||| |||||||||||||    
22654339 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaataataata 22654412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24828218 - 24828161
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
24828218 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 24828161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24832670 - 24832613
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
24832670 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 24832613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43644894 - 43644713
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||    | || |   ||||||||||||  |    
43644894 acattatcacaatccaaaaagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaatattaac---cacacaataatacttacatcacac 43644800  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||  |||     |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
43644799 cccaatatctcacatcaataatcatcaat--cat-----atgaacaattatcaattcgcaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 43644713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Original strand, 720835 - 720918
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||    
720835 acaatcatcaatcacatttcaccaataagactcgtgacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 720918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 297
Target Start/End: Original strand, 8942124 - 8942228
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| |||||  |||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
8942124 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcacttggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 8942223  T
293 gatgc 297  Q
    |||||    
8942224 gatgc 8942228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 372
Target Start/End: Original strand, 23773015 - 23773193
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
23773015 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 23773114  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
23773115 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagag-tcatcccttttaca 23773193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3801043 - 3800969
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
3801043 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 3800969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 460832 - 460901
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||    
460832 acattatcataatccaaatagcaattatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcagtaataa 460901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3800889 - 3800822
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
3800889 aatcaccattcacatgtatcaggaataaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 3800822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17398249 - 17398170
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgc 297  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
17398249 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgc 17398170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23806479 - 23806415
Alignment:
26 atcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||  || ||||||||||||||    
23806479 atcataatacaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacgtcagacatttgatcaataataa 23806415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 20013601 - 20013695
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
20013601 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 20013695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 23818658 - 23818752
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
23818658 atcaccaatcacataattcacataggactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 23818752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24573320 - 24573266
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatg 75  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
24573320 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatg 24573266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 25211022 - 25211076
Alignment:
160 atgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
25211022 atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 25211076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 265
Target Start/End: Original strand, 25211379 - 25211429
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggta 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||    
25211379 ataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggta 25211429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Original strand, 461007 - 461060
Alignment:
160 atgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
461007 atgaacaattatcaagtcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatc 461060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22581858 - 22581805
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcat 74  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
22581858 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcat 22581805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4450042 - 4449966
Alignment:
121 ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaat 196  Q
    ||||||| |||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||    
4450042 ctcaataactcacatcaattaattatcaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatatattcatgcacaat 4449966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 13964 - 14354
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatac--atatacttacatca- 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||     
13964 acatcaacataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatatacttatatcat 14063  T
118 atcctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaat 216  Q
    | || |||||||||||||  |||| ||| ||||   |||||||||||||||  |||||  ||||   |||||||||||||| ||||||||  ||  ||||    
14064 aaccccaatatctcacattaataagtcatcaatcgtatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacagacattcatacacaatcgtcaatcaccaatcacaat 14163  T
217 ---------aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaaca 307  Q
             ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
14164 tttcaacataagactcatgtcatgatatgcacttatcgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcatcttcgatgcaacaaaaaca 14263  T
308 tcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
14264 tcgtatgtaagatttgacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagaattcaacccttttacaactacaatctcaacaagactatgatg 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 20860 - 21128
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
20860 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaagcatcatgcatttgattaacaataatattctcatacatatacttacatcataa 20959  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 218  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
20960 tcc-caatatctcacatcaataatcaccaatcataagtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaacaccaatcacatacatcaataa 21058  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
21059 gactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 21128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Original strand, 28450 - 28719
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
28450 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattgaaacatcatgcatttgatcaacaataatattctcatacatagacttacatcatga 28549  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataa 218  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||    
28550 tc-tgaatatctcacatcaataatcaccaatcacaagtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaaacaccaatcacatacatcaataa 28648  T
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
28649 gactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtgccaaatctcctcaaggtcgtcact 28719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 129877 - 129700
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  || ||| |||| | ||||| |    
129877 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaacgtcttcacctccgatgga 129778  T
299 acaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||||   ||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
129777 acaactcaacattgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccaaagtaaaagagctcaactcttttacaac 129700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4805
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||  |    
4425 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataagtcaatataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacatatcaatacttacatcatac 4524  T
121 -ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc 213  Q
     | |||||||||||||| || |||||||||| |||||       |||||  || ||| || | ||||||||||||| ||| |||||||     | |||||    
4525 tcccaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatg-------aacaatcattaattcatagttattcatacacattcaccaatcaccaatcacatatc 4617  T
214 ---aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcg 310  Q
       || || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
4618 caaaacaatactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatca 4717  T
311 catgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4718 tatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 4805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 535 - 802
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
535 acatcatcataatacaaataacagttagcatgaatatttcaatttaagcatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 634  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
635 cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacgtaattaccaatcacatatatcaataaga 734  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
735 ctcatgtcatggtatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctaaaggtcgtcac 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 6)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 192 - 398
Target Start/End: Original strand, 3095 - 3301
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 291  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
3095 acaatcaccaatcacatttatcaataagactcatagcatgatatgcacctatcgacacgtacatgcatgtggtaccaaatcacctcaagctcgtcacctt 3194  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3195 cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaaatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 3294  T
392 tatgatg 398  Q
    |||||||    
3295 tatgatg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 2475 - 2561
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||    
2475 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaata-ttcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcatatatata 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 2737 - 2811
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
2737 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 2865 - 2939
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
2865 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 2939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 214
Target Start/End: Original strand, 2620 - 2683
Alignment:
151 acatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
2620 acatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcatcaatcacatatatca 2683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 2993 - 3067
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
2993 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 3067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 7)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 192 - 398
Target Start/End: Original strand, 5703 - 5909
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 291  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
5703 acaatcaccaatcacatttatcaataagactcatagcatgatatgcacctatcgacacgtacatgcatgtggtaccaaatcacctcaagctcgtcacctt 5802  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5803 cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaaaatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 5902  T
392 tatgatg 398  Q
    |||||||    
5903 tatgatg 5909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 328 - 511
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||  |    
328 acattatcataatccaaataacagttaccatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 424  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | | |||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
425 cccgatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 288
Target Start/End: Original strand, 813 - 943
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
813 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcttcaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgc 912  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||    
913 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 5339 - 5425
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||    
5339 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaata-ttcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcatatatata 5425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 214
Target Start/End: Original strand, 5484 - 5547
Alignment:
151 acatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
5484 acatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcatcaatcacatatatca 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 641 - 715
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
641 aatcaccaattacatgtatcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 5601 - 5675
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
5601 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 5675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 194 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13884 - 13680
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
13884 aatcaccaaccacatttatcaataagattcatgtcatgatatacacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcg 13785  T
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgacta 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13784 atgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgacta 13685  T
394 tgatg 398  Q
    |||||    
13684 tgatg 13680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 15922 - 16103
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| | ||    
15922 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtatcaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 16021  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
16022 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14001 - 13914
Alignment:
127 atctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14001 atctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatgtcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 13914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14154 - 14078
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc 97  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
14154 acatcatcataatccacataatagttaacatgaatatttcaaactaaacatcatgcacttgatcaataatagtattc 14078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 217 - 398
Target Start/End: Original strand, 7927 - 8108
Alignment:
217 aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgta 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
7927 aagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgta 8026  T
317 agatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8027 agatttcacaaccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 8108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Original strand, 7453 - 7631
Alignment:
38 ataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aatcctcaatatctcacat 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||    
7453 ataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaagaataatattctcatacatatacttacatcaaaaaccccaatatctcccat 7552  T
136 ccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
7553 caataatcaccaatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 7631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Original strand, 7683 - 7759
Alignment:
138 ataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
7683 ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaccacatttatca 7759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 206
Target Start/End: Original strand, 7842 - 7908
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 206  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||    
7842 aatcaccaatcacatttgtcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcac 7908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 249394 - 249025
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatattt-caatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||| | | |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||    
249394 acattatcataatccaaataacaattatcatgaatattttcaatt--aacatcaggaatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatca 249302  T
118 atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaata 217  Q
      || |||||||||||||| |||||||  ||| |||||       ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |   ||||    
249301 caccccaatatctcacatcaataatcattaatcacatg-------aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttccaaata 249209  T
218 agactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtc---actttcgatgcaacaaaaacatcgcatg 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  |||    
249208 agactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccagatcacctcaaggtcgtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcttatg 249109  T
315 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
249108 taagagttcacacccgtcttacataatctcctaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 249025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 192 - 398
Target Start/End: Original strand, 3129 - 3335
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 291  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
3129 acaatcaccaaccacatttatcaataagactcgtggcatgatatgcacctattgacacatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacctt 3228  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgac 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
3229 cgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttttcaactacaaactcaacaagac 3328  T
392 tatgatg 398  Q
    |||||||    
3329 tatgatg 3335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 2907 - 3101
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacat--caa 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| || ||  |||    
2907 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgaacaataatagtattcacataaatatacctatatcccaa 3006  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | | |||||||||||| | ||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
3007 ttc-caatatctcacagcaatagtcactaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacggttattcatacacaattaccaatcacatatatca 3101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7287 - 7012
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacata------tacttaca 114  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||      ||||||||    
7287 acatcatcataatcaaaataaaagttaacatgaataattcaatataaacatcatacatttgatcaataatgatattctcatatatacatatatacttaca 7188  T
115 tcaat-cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    ||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
7187 tcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattttcaattattcacacacaatcaccaaacacatatatc 7088  T
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
7087 aataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaataacctcaaggtcgtcact 7012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 140 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4044 - 3784
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataagactcatgtcatgatatgca 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||    
4044 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgcacaatcatcaatcacatttcaccaataatactcatgtcatgatgtgca 3947  T
239 cata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac 336  Q
    | ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
3946 cctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttat 3847  T
337 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
3846 ataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 3784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 27950 - 28145
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaa-- 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
27950 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 28049  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
28050 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 28145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 288
Target Start/End: Original strand, 28197 - 28327
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
28197 tcattaacaaatatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaacacaaatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgc 28296  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
28297 atgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 28327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 28125 - 28199
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
28125 aatcaccaatcacatatatcatgaacaagtatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaccacatatatca 28199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 215 - 398
Target Start/End: Original strand, 27067 - 27250
Alignment:
215 ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
27067 ataagactcatgtcatgatatgcacttatcgacacataaatgcatgtagtaccggatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatg 27166  T
315 taagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27167 taagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacaagactatgatg 27250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Original strand, 26873 - 26954
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcata 102  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
26873 acatcaacatagtccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaaaaataatattcacata 26954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13740 - 13548
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
13740 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 13641  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
13640 cccaatatctcacatcaatattcactaatcacatgtgtcatgaacaa-tatcaattcacaattatttatacacaatcaccaatcacaaatatca 13548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 178 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13543 - 13434
Alignment:
178 acaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctc 277  Q
    ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
13543 acaattactcatacacaatcactaaacacatatatcaa-aagactcatgtcatgatatgaacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacttc 13445  T
278 aaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||    
13444 aaggtcgtcac 13434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 8)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 139 - 398
Target Start/End: Original strand, 19799 - 20067
Alignment:
139 taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-----atatatc--aataagactcatgtcatg 231  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||     | || ||  |||||||||||| |||||    
19799 taatcagcaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaccaatcacatttccaaataagactcatatcatg 19898  T
232 atatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact--ttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacaccc 329  Q
    |||||||| ||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
19899 atatgcacttattgacacattaatgcatttggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacgccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacaccc 19998  T
330 gtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19999 gtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacacttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 20067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 17776 - 17983
Alignment:
193 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcact--t 290  Q
    |||||| ||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |    
17776 caatcaccaatcacatttccaaataagactcatatcatgatatgcacttattgacacattaatgcatttggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacgcct 17875  T
291 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacga 390  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
17876 tcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagagttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacacttttacaactacaatctcaacatga 17975  T
391 ctatgatg 398  Q
    ||||||||    
17976 ctatgatg 17983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8293 - 8140
Alignment:
245 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 344  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
8293 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttagataatctc 8194  T
345 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
8193 cgaagtaaaagagttcaacctatttacaacaacaaactctacatgactatgatg 8140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13682 - 13529
Alignment:
245 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 344  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13682 gacgcataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttagataatctc 13583  T
345 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
13582 cgaagtaaaagagttcaacctatttacaacaacaaactctacatgactatgatg 13529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 17526 - 17716
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||| |    
17526 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 17622  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
17623 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 17716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 19556 - 19746
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||| |    
19556 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 19652  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
19653 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 19746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8539 - 8466
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  ||||  |||| |||||| ||||||    
8539 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaatgataata 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 13928 - 13855
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||  ||||  |||| |||||| ||||||    
13928 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaatgataata 13855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4831 - 4638
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
4831 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 4732  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
4731 cccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 4638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4435 - 4250
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
4435 acaatcaccaatcacatatatcaaataagagtaatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 4336  T
291 tcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
4335 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 4250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49671 - 49478
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
49671 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 49572  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
49571 cccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 49478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49275 - 49090
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
49275 acaatcaccaatcacatatatcaaataagagtaatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 49176  T
291 tcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
     ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
49175 ccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 49090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1307 - 1046
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||      ||| | ||   ||||||||||||  |    
1307 acatcatcataatcaaaataatagttatcatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaata------ttcacgtatcaatacttacatcacac 1214  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
1213 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacccaatcaccaatcacatatatcaataaga 1114  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
1113 ctcatgtcataatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctcctcaaggtcgtcac 1046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 214 - 398
Target Start/End: Original strand, 56431 - 56615
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
56431 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcaccaaaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaacatcgtat 56530  T
314 gtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
56531 gtaagaattcaaacccgtcttacataatctctgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacatgactatgatg 56615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Original strand, 56206 - 56370
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||          |||||||||||||| |     
56206 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaatataaat----------atatacttacatcataa 56295  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacaca 194  Q
    ||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
56296 ccctaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatg-gtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacaca 56370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 156376 - 156183
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
156376 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 156277  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
156276 tccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 156183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 86149 - 85966
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||     ||| ||||  ||||||||||||     
86149 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcactataaacatcatgcatttgatcaataacaa-----tcacacattaatacttacatcac 86055  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || ||||||| |||||| ||||||| ||||  |||     |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
86054 accccaatatcccacatcaataatcatcaat--cat-----atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaacaatcacatttatca 85966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 370
Target Start/End: Original strand, 34811 - 34989
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-cttt 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||    
34811 aatcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcaccttt 34910  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttta 370  Q
    |||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
34911 cgatgccacttgcacatcgtatgtaagggctcacacctgccttacaataatat-cgaagtaaaagagttcaatcctttta 34989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 156031 - 155937
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
156031 atcaccaatcacatatgtcacataagactcatgttatgatctgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 155937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Original strand, 92252 - 92300
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaac 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
92252 acatcatcataatccacataacagttaacataaatatttaaatttaaac 92300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 236412 - 236597
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
236412 acatcatcataattcaaataacaattaacatgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcgaac 236511  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 206  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
236512 cccaatatctgacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacaccattattcatacacaatcaccaatcac 236597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 236652 - 236857
Alignment:
193 caatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc 292  Q
    |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
236652 caatcaccaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccttatcacctctaggtcgtcaccttc 236751  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgact 392  Q
    ||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
236752 gatgctactttaacatcgtatgtaagatttcacacctttcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgact 236851  T
393 atgatg 398  Q
    ||||||    
236852 atgatg 236857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 140 - 378
Target Start/End: Original strand, 270545 - 270785
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgca 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
270545 aatcaccaattacatgtatcatgaataa-tatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgtcatgatatgca 270643  T
239 catatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac 336  Q
    | ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| | ||||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||    
270644 cttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaagatcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttac 270743  T
337 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
270744 ataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaactaca 270785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 270329 - 270515
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
270329 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 270428  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
270429 cccaatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaataaccaatcacatttatca 270515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 256007 - 255963
Alignment:
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 338  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
256007 atgcaacaaaaacatcaaatgtaagatttcatacccgtcttacat 255963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 26451 - 26642
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
26451 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaa-c 26549  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
26550 cccaatatctcacattcataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 26642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15271 - 15006
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||  ||||||||||||     
15271 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataat-----catacattaatacttacatcac 15177  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaa-tcatcaatcacatatatcaata 217  Q
     || |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||    
15176 accccaatatctcacatcaataataatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcactaatattcattcacaaatcaccagtcacatgtatcaata 15077  T
218 agactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
15076 agactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtacaaaatcatctcagggtcgtcac 15006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24009 - 23915
Alignment:
305 acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
24009 acatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcttcgaagtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 23915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 398
Target Start/End: Original strand, 8493 - 8754
Alignment:
139 taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgca 238  Q
    ||||||||| | ||| || ||||||||||  | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |   || ||||||||||||||||| ||||    
8493 taatcaccactcacacgtatcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatctcaattcaaaacaagactcatgtcatgatgtgca 8592  T
239 catat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac 336  Q
    | ||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
8593 cctagtccgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggccgtcacctccgattcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttac 8692  T
337 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
8693 ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaactcaacaagactatgatg 8754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Original strand, 8387 - 8441
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||| |||||    
8387 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattcactataaacgtcatg 8441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 214
Target Start/End: Original strand, 77600 - 77793
Alignment:
23 atcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat--c 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
77600 atcatcataatccaaataacatttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaac 77699  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
77700 cctaatatctcacatccataaccaccaatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatgcacaatcaccaatcacatatatca 77793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Original strand, 77919 - 77977
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
77919 aataagactcatatcatgatatacacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 77977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 3055 - 3248
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
3055 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaaaatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 3154  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
3155 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 3248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 281 - 477
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctc--atacatatacttacatc-a 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |    
281 acattatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatcaa 380  T
118 atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | || |||||||| || || | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
381 aaccccaatatcttacctcaacaatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Original strand, 577 - 739
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |||||   |||||||     
577 aataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatggaacaactcaacatcgt 676  T
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
677 atgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Original strand, 3430 - 3518
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
3430 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 3518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 30650 - 30843
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
30650 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 30749  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    || |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
30750 ccccaatatctcacattaataatcaccattcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 30843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Original strand, 31002 - 31090
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
31002 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 31090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21827 - 21633
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
21827 acatcatcataatccaaataacagttagcataaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 21728  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
21727 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaaatgtcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 21633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 71922 - 71768
Alignment:
245 gacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctc 344  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
71922 gacgcataaatgcctgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacattcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacaaccgtcttacataatctc 71823  T
345 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac-aatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
71822 cgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaaaactcaacatgactatgatg 71768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 72166 - 72093
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| || ||| |||||  |||| |||||| ||||||    
72166 acatcatcataatccacataatagttaacatgaataattcatttcaaatatcatatacttaatcaatgataata 72093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2658 - 2474
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |    
2658 acattatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatcaaac 2559  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||    
2558 cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattaccaatca 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Original strand, 4078 - 4346
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||   ||| |||| | ||||||| ||||  |    
4078 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtgcttgatcaatagta---ttcacatatacatacttatatcataa 4174  T
119 tcctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaata 217  Q
    ||| |||| ||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||   | |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |   || |    
4175 tcc-caatttctcacatcaattaataaccaatcacatgtgtcatgaacactcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcacaattcaaaaca 4273  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| || ||||||||||||  |||| |||||||||||||    
4274 agactcatgtcatgatgtgcacctagcccgacacatatatacatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 14849 - 15032
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat- 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
14849 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 14946  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatca 205  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
14947 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatca 15032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 29644 - 29830
Alignment:
28 cataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatcctcaata 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| || |||||    
29644 cataatcaaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacaaatcaatacttacatcaaaccccaata 29743  T
128 tctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
29744 tctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtaatgaacaaatatcaattcaccgttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 29830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26660 - 26416
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||      |||||                
26660 acatcatcataatccaaagaacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaata---atattc------atata------------ 26582  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataaga 220  Q
     |||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
26581 -tcaata-cttacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatctcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcaataaga 26484  T
221 ctcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26483 ctcatgtcaagatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 26416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 71003 - 70883
Alignment:
278 aaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac 377  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
71003 aaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatggaagatttcacacctatcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactac 70904  T
378 aatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||| ||||||||||    
70903 aatctcaacatgactatgatg 70883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 66592 - 66322
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |     
66592 acatcatcataatccaaatgacatttaacatgaataattcaatataatcatcatgtacttgctcaataataatattcacatatcaatacttacatcataa 66493  T
120 cctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcataca-------caatcatcaatcacatata 211  Q
     |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| || | ||| |||||||       |||||| ||||||||  |     
66492 tctcaatatctcatatcaattaatcaccaatcacatgaatcatgaacaatcatcaatccatagttactcatacacaattcccaatcaccaatcacacttc 66393  T
212 tcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggt 282  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
66392 aaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggt 66322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3893 - 3707
Alignment:
104 atatacttacatcaat-cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaag-tatcaatacacaattattcatacacaatcatca 201  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
3893 atatacttacatcaaaaccccaatatctcacattaataatcactaatcacatgtgtcatgaacaaaatatcaattcacaattattcacacaccatcatca 3794  T
202 atcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3793 atcacatatatcaacaaaactcatgtcatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4014 - 3927
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata 108  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
4014 acatcattataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatata 3927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 248 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2262 - 2112
Alignment:
248 gcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccga 347  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2262 gcataaatgcatgtggtaccggatcacctcaagatcgtcaccttcgattcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccga 2163  T
348 agtaaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
2162 agtaaaagagttcaacccttttacaactacaaactctacatgactatgatg 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 2511 - 2469
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaat 63  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
2511 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaat 2469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 106559 - 106409
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
106559 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 106460  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
106459 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 106409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6830 - 6649
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
6830 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 6731  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
6730 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 6649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 114150 - 113902
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||| |||| | ||||||| ||||  |    
114150 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataata---ttcacatataaatacttatatcataa 114054  T
119 tcctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaata 217  Q
    ||| |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  | |||  || | ||||| ||||||||||| ||||||||  |   || |    
114053 tcc-caatttctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcaccaaatcatagttatttatacacaatcaccaatcacaattcaaaaca 113955  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtacca 268  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||   |||| |||| |||||||||||||||    
113954 agactcatgtcttgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtacca 113902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 357
Target Start/End: Original strand, 130409 - 130522
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||     
130409 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacaccggtcttacgttatca 130508  T
344 ccgaagtaaaagag 357  Q
    ||||||||||||||    
130509 ccgaagtaaaagag 130522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 59117 - 58936
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||      ||||||||||| | ||    
59117 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaattttaaaaaggtcgtcacctccg 59018  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  ||||   ||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
59017 atg-gacaagtcaacatcttatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 58936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 108058 - 108156
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
108058 acaaccatcaatcacatttcccaataagactcatgtcatgatgtgcaccaagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 108156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 683 - 499
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||   ||||||||||||| |    
683 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcaaac 587  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacat 208  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||    
586 cccaatatctcatattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacaccatcaccaatcacat 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 33395 - 33580
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||      
33395 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc--------atacttacatcaaat 33486  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
33487 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 33580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32869 - 32688
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
32869 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 32770  T
299 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
32769 acaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 32688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Original strand, 33730 - 33848
Alignment:
170 atcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaa 269  Q
    |||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
33730 atcaattcacaattattcacacatactcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaa 33829  T
270 atcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||| ||  |||||||||||    
33830 atctccaaaaggtcgtcac 33848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39449 - 39264
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||      
39449 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc--------atacttacatcaaat 39358  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
39357 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 39264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Original strand, 39975 - 40156
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
39975 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 40074  T
299 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
40075 acaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 40156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 39114 - 38996
Alignment:
170 atcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaa 269  Q
    |||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
39114 atcaattcacaattattcacacatactcaccaatcacattttcaaatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaa 39015  T
270 atcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||| ||  |||||||||||    
39014 atctccaaaaggtcgtcac 38996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 359
Target Start/End: Original strand, 68785 - 68964
Alignment:
182 ttattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatat--cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaa 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
68785 ttattcatacacaatcaccaatcacaattcaaaacaagactcatgtcatgatgtgcacctagtccgacacatatatgcatgtggtaccatatcacctcaa 68884  T
280 ggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtt 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
68885 ggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatctcccaagtaaaagagtt 68964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 198
Target Start/End: Original strand, 68597 - 68773
Alignment:
24 tcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aatcc 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||  |||||    
68597 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcgcatataaatacttatatcataatcc 68696  T
122 tcaatatctcacatc-cataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatca 198  Q
     |||| |||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||  |||| |||||||||||||||||    
68697 -caatttctcacatcagttaatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatca 68773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 398
Target Start/End: Original strand, 69394 - 69441
Alignment:
351 aaaagagttcaacccttttacaactacaatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
69394 aaaagagttcaacccttttacaactacaaactcaacatgactatgatg 69441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 30314 - 30531
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatca-ataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||| | |||| | |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||||| | |||| |||| | |||   |||    
30314 acatcatcataatctatataataattaacatgaataattcaattcaaatatcatgcatttaatccgataataatat-cacatatatattcatactataat 30412  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
    || || ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| || | | |||||    
30413 cccca-tatctcacatcaatcaatcaccagtcacatgtgtcatgaacattcttcaat-cacatttattcacacacaattatcaatcatatttcaccaata 30510  T
218 agactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
30511 agactcatg-catgatgtgcac 30531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 140 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2627
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatg-- 236  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||      
2869 aatcaccaattacatgtatcatgaataatcattaat-cacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatatcaaataagactcatgtcatgatatgtg 2771  T
237 cacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtctt 334  Q
    ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |  |||| |||||   ||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
2770 cacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctctgatggaacaactcaacatcgtatgtaagggttcacccccgtctt 2671  T
335 acataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
2670 acataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 2627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2899
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     ||| ||||  ||||||||||||     
3083 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacataatgcacttgatcattaataa-----tcacacattaatacttacatcac 2989  T
119 tcctcaatatctcacatccataatc-accaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || | |||||||||||| |||||| | ||||  |||     |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
2988 accccgatatctcacatcaataatcaatcaat--cat-----atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacatttatca 2899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 17735 - 17928
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--a 118  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |    
17735 acatcatcaaaatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacaccatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatcatta 17834  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
17835 tcc-caatacctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattaacagttattaatacacaatcaccaatcacatatatc 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Original strand, 18055 - 18151
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18055 acaatcaccaaccacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4991 - 4842
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
4991 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcacctt-gatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcatacataatctccgaa 4893  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
4892 gtaaaagagctcaactcttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 4842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 16770 - 16961
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
16770 acattatcataatctaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacgtcatgcatttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 16867  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
16868 cccaatatctcacatcaatgatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcacacacaatcaccaatcatatacatca 16961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Original strand, 17070 - 17128
Alignment:
214 aataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
17070 aatatgactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatc 17128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19489 - 19248
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca- 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||  ||||||||||||     
19489 acattatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataat-----cacacattaatacttacatcac 19395  T
118 atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaata 217  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
19394 atcc-caatatctcacatcaataatcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatcaaaa 19303  T
218 agactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||    
19302 agactcatgtcatgatatgcacctatcgccacatatatgcatgtggtatcaaatc 19248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Original strand, 145016 - 145195
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||    
145016 caatcacatatatcaataagactcatgctatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatggaa 145115  T
300 caa-aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||   |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
145116 caactcacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 145195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Original strand, 147275 - 147454
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||| ||    
147275 caatcacatatatcaataagactcatgctatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcaccttcgatggaa 147374  T
300 caa-aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||   |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
147375 caactcacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 144926 - 144980
Alignment:
160 atgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
144926 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 144980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 147185 - 147239
Alignment:
160 atgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
147185 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 147239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 23040 - 23186
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |    
23040 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 23139  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaa 167  Q
    | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||  |||||||    
23140 cccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgttctgaacaa 23186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 16376 - 16445
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataat 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
16376 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataat 16445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7303 - 7153
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
7303 cataaatgcatgtggtaccgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtgtgtaagatttcacaccagtcttacataatctccgaa 7204  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaacta-caatctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||    
7203 gtaaaagagctcaacctttttacgactaccagactcaacatgactatgatg 7153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7489 - 7416
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| | |||| ||||||    
7489 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaaccaatgataata 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 78472 - 78342
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
78472 cataaatgcatgtggtactgaatcacctcaaggttgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccgtcttacataatcaccgaa 78373  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
78372 gtaaaagagctcaacccttttacacctacaa 78342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 249 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 118244 - 118094
Alignment:
249 catacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaa 348  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
118244 catatatgcatgtggtactgaatcacctcaaggtcgtcaccttcgattcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacagccatcttacataatcaccgaa 118145  T
349 gtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
118144 gtaaaagagctcaacccttttacaactacaagactcaacatgactatgatg 118094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 288
Target Start/End: Original strand, 163817 - 163901
Alignment:
204 cacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
163817 cacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 163901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 376
Target Start/End: Original strand, 54118 - 54300
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttc 292  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
54118 aatcaccaatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcactttc 54217  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaacta 376  Q
    |||| |  ||| |||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
54218 gatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcacacccagcttacataatctctgaagtaaaagagctcaacctttttacaacta 54300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 109799 - 109582
Alignment:
158 tcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgc 257  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||   |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
109799 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctcaaatcacatttccaaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacataaatgc 109700  T
258 atgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaag 355  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
109699 atgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgtcttacataatctccgaagtaaaag 109601  T
356 agttcaacccttttacaac 374  Q
    || |||||| |||||||||    
109600 agatcaaccattttacaac 109582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 53931 - 54112
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||    | |||    |||||||| |||  |    
53931 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaa---ccacatgtcaatacttacgtcacac 54025  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
      |||||||||||||| |||||||||||| |       ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||| |||||    
54026 tccaatatctcacatcaataatcaccaatca-------catgaacaattatcaattcacaattattaattcactatcaccaatcacatttatca 54112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 109971 - 109897
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
109971 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 109897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 110055 - 110002
Alignment:
160 atgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatc 213  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
110055 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcactaatcacatatatc 110002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 197778 - 197600
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||      
197778 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatacatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcaccttcgatgat 197679  T
299 acaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    | ||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
197678 a-aaagacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctctgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 197600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 84942 - 85056
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
84942 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 85041  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
85042 ccgaagtaaaagagt 85056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 358
Target Start/End: Original strand, 26080 - 26194
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||     
26080 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctaaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacacgtcttacattatca 26179  T
344 ccgaagtaaaagagt 358  Q
    |||||||||||||||    
26180 ccgaagtaaaagagt 26194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 197978 - 197920
Alignment:
32 atccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataata 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||    
197978 atccaaatagcagttaacatggatatttc-agttaatcatcatgcatttgatcaataata 197920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 214
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7175
Alignment:
24 tcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--atcc 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||  |||  ||||    
6984 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcatacatgtatacttatctcataatcc 7083  T
122 tcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     | |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
7084 -cgatatctcacatcaataatcaccaatcacacgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 288
Target Start/End: Original strand, 7214 - 7298
Alignment:
204 cacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
7214 cacatttatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtactaaatcacctcaaggtcgtcac 7298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10122 - 9930
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |   | ||||||||||| |    
10122 acattatcataatccaaatgacagttaacatgtatttttcaatttaa-catcatgcactttatcgataatattattctcaaatcaacacttacatcaaac 10024  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
10023 cccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaataaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 9930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 270 - 379
Target Start/End: Original strand, 78228 - 78337
Alignment:
270 atcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaaccctttt 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
78228 atcacctcaaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaagatttcacacccatcttacataatctccgaagtaaaagagctgaaccctttt 78327  T
370 acaactacaa 379  Q
    ||||||||||    
78328 acaactacaa 78337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 90748 - 90600
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
90748 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcttacacaatctccaatcacatacatcaataagactcatgccatgatatgcac 90649  T
240 atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
     ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
90648 ctattgacacatatatgcatttggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 90600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 91018 - 90942
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
91018 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattc 90942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 90913 - 90802
Alignment:
104 atatacttacatcaat-cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaa 202  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||    
90913 atatacttacatcaaaaccccaatatctcacattaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaa 90814  T
203 tcacatatatca 214  Q
    ||| ||| ||||    
90813 tcatatacatca 90802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 356
Target Start/End: Original strand, 128867 - 129026
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
128867 atcatcaatcacctataacacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 128966  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaaga 356  Q
    |||  ||||   |||||||||||||||   |||| |    |||||||||||||||||||||||||    
128967 atg-gacaagtcaacatcgcatgtaaggggtcactc----cttacataatctccgaagtaaaaga 129026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Original strand, 128730 - 128804
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
128730 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatca 128804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 119 - 21
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
119 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttacatcaat 21  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6583 - 6485
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
6583 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatacttacatcaat 6485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6406 - 6310
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
6406 acaatcattaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatcatctcagggtcgtcac 6310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6486 - 6410
Alignment:
138 ataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||    
6486 ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatttatacacaatcaccaaccacatttatca 6410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25274 - 25101
Alignment:
228 catgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcac 325  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
25274 catgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtacaaaatcacctcaaggtcgtcaccttaaatgcaacaaaaatatcgtatgtaagatttcac 25175  T
326 acccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
25174 acccgtcttacataatcaccgaagtaaaagagcacacctcttttacagctacaagactcaacatgactatgatg 25101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 257 - 379
Target Start/End: Original strand, 34006 - 34128
Alignment:
257 catgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaaga 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
34006 catgtggtaccgaatcacctcaaagtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacatcgtatgtaacatttcacacctgtcttacataatcaccgaagtaaaaga 34105  T
357 gttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
34106 gctcaacccttttacagctacaa 34128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 217426 - 217246
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
217426 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 217327  T
299 acaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
217326 acaactcaacatcgtatgtaagggttcac-cccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaattaca 217246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 5221 - 5293
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
5221 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataat 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 5661 - 5755
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
5661 atcaccaatcgcatatttcacataagactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 5755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 358
Target Start/End: Original strand, 3244 - 3393
Alignment:
214 aataagactcatgt---catgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacat 308  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
3244 aataagactcatgtgaacatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctctaggtcgtcaccttcgatgcaacaaaaacat 3343  T
309 cgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
3344 tgtatgtaagatttcacgcccgtcttacataatcaccgaagtataagagt 3393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21344 - 21158
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc--aa 118  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
21344 acattatcataatccaaatagtagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatacatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 21247  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
     || |||||||||||||| ||||||| ||||  |||     |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
21246 accccaatatctcacatcaataatcatcaat--cat-----atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatatatca 21158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 192 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21002 - 20906
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
21002 acaatcaccaatcacatatatcattaagactcatgccatgatatgcacctatcgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcagggtcgtcac 20906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21104 - 21030
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
21104 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11716 - 11532
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactt 290  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
11716 acaatcaccaatcacatacatcaaataagactcatgtcatgttatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacct 11617  T
291 tcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||||| |  ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
11616 tcgatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaaga--accacccttttacaactaca 11532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 4320 - 4501
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
4320 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 4419  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  ||||   ||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
4420 atg-gacaagtcaacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 4501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5274 - 5102
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||||  |    
5274 caatcacatatatcaataaaactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatg-ga 5176  T
300 caa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttac 371  Q
    |||  |||||||| |||||||  |||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
5175 caagtaaacatcgtatgtaagggttcactgccgccttacataatctccaaagtaaaagagctcaacccttttac 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12876 - 12788
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
12876 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcac 12788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 212
Target Start/End: Original strand, 94340 - 94495
Alignment:
58 ttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca--atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatg 155  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
94340 ttcaattcaaacatcatgtactggatcaataataatattctcatatatataattatatcataatcc-caatatctcatattaataatcaccaatcacatg 94438  T
156 tgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatat 212  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
94439 tgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaccaccaatcacatatat 94495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 239
Target Start/End: Original strand, 94695 - 94742
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcac 239  Q
    ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
94695 acaatcaccaatcacatttatatataagactcatgtcatgatatgcac 94742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Original strand, 1652 - 1925
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgat-caataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  || || ||||||||||||||| |||| || | |||||||||| | |||| |||| | |||   |||    
1652 acatcatcataatccacataacaattaacatgagtaatttaatttaaacatcatgtacttaattcgataataatat-cacatatatattcatactataat 1750  T
120 cctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
    || |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||   ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||    
1751 cc-caatatctcacatcaattaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcttcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaata 1849  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 291  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
1850 agactcatgtcatgatgtgcacctagtttgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtctcttt 1925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14250 - 14101
Alignment:
250 atacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaag 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
14250 atacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgttacccatgatgcaacaaaaacatcatatgtaaaatttcacacccgtcttacattatcaccgaag 14151  T
350 taaaagagttcaacccttttacaactacaa-tctcaacacgactatgatg 398  Q
    ||||||||| |  | ||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
14150 taaaagagtacccctcttttacaacttcaagactcaacatgactatgatg 14101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15935
Alignment:
138 ataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
16011 ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttgttcatacacaatcaccaatcacatatatca 15935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15907 - 15833
Alignment:
192 acaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtac 266  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||    
15907 acaatcaccaaccacatttatgaataagactcacgtcatgatatgcacctattgacacatatatgcatgtggtac 15833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 288
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6386
Alignment:
121 ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaataa 218  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||  |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||    
6215 ctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgttatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacatttcaccaataa 6314  T
219 gactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
6315 gactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccatttcacttcaaggtcgtcac 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 51511 - 51690
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||| | ||    
51511 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcacgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctccg 51610  T
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
51611 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccgcctgacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 51690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14958
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| | ||    
14779 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgatatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggaaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 14878  T
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
14879 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccaccttacataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaac 14958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 28300 - 28479
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||  ||| ||| |||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| | ||    
28300 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgatatgatattcatttattgacacataaatgcatgtggcaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 28399  T
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
28400 atgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaattaaaagagctcaacccttttacaac 28479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 27169 - 27241
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27169 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 27241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 106479 - 106660
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||    
106479 atcaccaatcacataagtcacataagactcatgttatgatatgcacttattgactcataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccg 106578  T
294 atgcaacaa--aaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    |||  ||||   ||||||  |||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
106579 atg-gacaagtcaacatcatatgtaagggatcacccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 106660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 379
Target Start/End: Original strand, 211 - 346
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
211 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 310  T
344 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||    
311 ccgaagtaaaagagcacgtcccttttacaaccacaa 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 379
Target Start/End: Original strand, 5266 - 5401
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
5266 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 5365  T
344 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||    
5366 ccgaagtaaaagagcacgtcccttttacaaccacaa 5401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 804 - 987
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaatc 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||  |    
804 acattatcataatccaaataacagttaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacat--taatacttacatcacac 900  T
121 ctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    | | |||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
901 cccgatatctcacatcaatattcatcaat--cat-----atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatca 987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 379
Target Start/End: Original strand, 3799 - 3934
Alignment:
244 cgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatct 343  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
3799 cgacacatatatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacccatgatgtaacaaacacatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatca 3898  T
344 ccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||| ||||    
3899 ccgaaataaaagagcacatcccttttacaaccacaa 3934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 260 - 379
Target Start/End: Original strand, 4568 - 4686
Alignment:
260 gtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagtt 359  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||      
4568 gtggtactgaatcacctccaggtcgtcaccttcgatgcatcaaca-catcgtatgtaagatttcacactcgtcttacataatctctgaagtaaaagagcc 4666  T
360 caacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||    
4667 caacccttttacaactacaa 4686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 378
Target Start/End: Original strand, 1 - 126
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaa-acatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaa 352  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
1 atgcatgtggtaccaaatctccaaaagctcgtcaccttcgatggaacaaatcacatcgtatgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaa 100  T
353 aagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    || || ||||||||||||||||||||    
101 aaaagctcaacccttttacaactaca 126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3395 - 3125
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatc-aataataatattctcatacatatacttacatcaat 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||||| | |||| |||| | |||   |||    
3395 acatcatcataatccacataatagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacatatatattcataccataat 3296  T
120 cctcaatatctcacatcca-taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat-atcaata 217  Q
     |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||| | ||||||| | |||||| | | |||||    
3295 -ctcaatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcgcaatcataattcacatttcaccaata 3197  T
218 agactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||| |||||| || || ||  ||||| |||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
3196 agactcatg-catgatgtgtacctagttcgacacatatatgcatgtgataccatttcacttcaaggtcgtcac 3125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 448 - 376
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
448 acattatcataatccaaataacagttaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 94 - 1
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca 287  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
94 atcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15239 - 15167
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15239 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 15167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 288
Target Start/End: Original strand, 31923 - 32093
Alignment:
121 ctcaatatctcacatccat-aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac-atatatcaataa 218  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||    
31923 ctcaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatacacaattatcaatcacaattcaccaataa 32022  T
219 gactcatgtcatgatatgcac--atatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||||||| |||||| || ||  | | |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
32023 gactcatg-catgatgtgtacctagaccgacacatatatgcatgtggtaccatttcacctcaaggtcgtcac 32093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 97
Target Start/End: Original strand, 31776 - 31850
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattc 97  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
31776 acatcatcataacccacataacattta-catgaatatttcaatttaa-cttcatgcacttgatcaataataatattc 31850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1469 - 1292
Alignment:
193 caatcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcacttt 291  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |     
1469 caatcaccaatcacatatttcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctc 1370  T
292 cgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||||| |  ||| |||||| |||||||  ||||| |    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
1369 cgatg-ataaaacacatcgtatgtaagggttcactc----cttacataatctccaaagtaaaagagctcaactcttttacaac 1292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 35 - 215
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaa-ggtcgtcactttc 292  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||| || ||  || ||||||||| | |    
35 atcaccaaccacatatatcacataagactcatgttatgatatgcacttattgacatataaatgcatgtggtaccaattctccaaaaaggtcgtcacctcc 134  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||||  | ||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
135 gatgata-aaacacatcgtatgtaagggttcacccccgccttacataatctccgaaataaaagagctcaacccttttacaac 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 25538 - 25718
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||   ||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||| |     
25538 acattatcataatccaaataacagttatcaagaacatttcaatt---acatcgtgcatctgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaa 25634  T
120 cctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaat 203  Q
    || |||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
25635 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacatgtgtcataaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcatcaat 25718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Original strand, 25735 - 25799
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatc 204  Q
    |||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
25735 aatcaccaatcatatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatc 25799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 31120 - 31192
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31120 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 31192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13085 - 12989
Alignment:
49 catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aatcctcaatatctcacatccataatca 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||    
13085 catggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaccccaatatctcacatcaataatca 12989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Original strand, 31333 - 31391
Alignment:
140 aatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatca 198  Q
    ||||||||||||| ||| |||| || || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
31333 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacaatca 31391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Original strand, 40010 - 40098
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
40010 caatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattgacacataaatgcatgtggtaccaaatcacctcagggttgtcac 40098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 37627 - 37697
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
37627 acattatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 37697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 358
Target Start/End: Original strand, 55922 - 56026
Alignment:
254 atgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaa 353  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
55922 atgcatgtggtacaaaatcccctcaaggtcgtcacccatgatgcaacaaaaatatcatatgtaagatttcacacccgtcttacattatcaccgaagtaaa 56021  T
354 agagt 358  Q
    |||||    
56022 agagt 56026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 378
Target Start/End: Original strand, 41190 - 41371
Alignment:
200 caatcacatatatcaataa-gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||||  ||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| |    
41190 caatcacatatataaaaaaagacttatgtctggatatgcacttattgacacataaattcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcgtcacctccgatgga 41289  T
299 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||    ||||||| |||||||  ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
41290 acagctcaacatcgtatgtaagggttcacccctgccttacataatctacgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 41371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9607 - 9426
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcg 293  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| | ||    
9607 atcaccaatcacatatatcacataagactcatgttatgatatgcactttttgacacataaatgcatgtggtaccaaatctccaaaaggtcatcacctccg 9508  T
294 atgca-acaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
    ||| | |    || |||  |||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
9507 atggacatgtcaatatcatatgtaagggttcaaccccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaac 9426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 44266 - 44443
Alignment:
28 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aatcctcaa 125  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || || |||    
44266 cataatccgaataacagtcaatcatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacaccaaaaccccaa 44365  T
126 tatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatat 210  Q
    ||||||||||| |||| || | ||  |||     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
44366 tatctcacatcaataaacatcgat--cat-----atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcacatat 44443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Original strand, 52435 - 52597
Alignment:
28 cataatccaaataacagttaa-catggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-aatcctcaa 125  Q
    |||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || || |||    
52435 cataattcgaataacagtcaatcatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttaaatcaaaaccccaa 52534  T
126 tatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaa 195  Q
    ||||||| ||| ||| ||| ||||  |||     |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
52535 tatctcagatcaatagtcatcaat--cat-----atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaa 52597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4725 - 4639
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatata 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
4725 acatcatcataatccacataacatttaacatgaatatttcaattt-aacttcatgcacttgatcaataataatattcacatatatata 4639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4596 - 4528
Alignment:
139 taatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcaca 207  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
4596 taatcaccaatcacatatatcatgaacaagtatcaattcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 75727 - 75550
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-at 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||  | ||||         | |||||||||||||| |     
75727 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataatttaattcaaacatcatgtacttgatcg-tcataa---------atatatacttacatcataa 75638  T
120 cctcaatatctcacatccataa-tcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcac 206  Q
    || |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
75637 ccccaatatctcatatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 75550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 72177 - 72106
Alignment:
217 aagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
72177 aagactcatgtcatgatatgcacttattgacgcataaatgcatgtggtaccggatcacctcaaggtcgtcac 72106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 7465 - 7641
Alignment:
200 caatcacatatatcaa-taagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcactttcgatgca 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||| |||| |||||||| |||||||||| ||  |||||| |||| |  |||| |    
7465 caatcacatatatcaaataagactcatgtcatgatatgtacttgttgacacataaatgcatgtcgtaccaaatctccaaaaggtcatcacctctgatgga 7564  T
299 acaaa--aacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaac 374  Q
     |||   ||||||| || ||||  ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
7565 -caagtcaacatcgtatataagggttcaccccagccttacataatctccaaagtaaaagagttcaacccttttacaac 7641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 268
Target Start/End: Original strand, 145231 - 145413
Alignment:
86 ataataatattctcatacatatacttacatca--atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaatt 183  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| | ||  ||| |||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||    
145231 ataataatattcacatatatatacttataccatgatc-tcaatacctcacatc---aatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaatcatcaattcacagtt 145326  T
184 attcatacacaatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtacca 268  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |   |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||    
145327 attcatacacaatcactactcacatttcaaaataagactcatgtcatgatgtgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtacca 145413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 144987 - 145060
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataata 94  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
144987 acattatcataatccacataacaattaacatgattaattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 145060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 272
Target Start/End: Original strand, 1509 - 1587
Alignment:
194 aatcatcaatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||    
1509 aatcaccaatcacatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctaatgacacatatatgcatgtggtaccaaatc 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 1298 - 1427
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||  |||||||||| |     
1298 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa-----tcacacattaatacttacattac 1390  T
119 tcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatg 155  Q
     || |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
1391 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatg 1427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 52837 - 52771
Alignment:
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
52837 atgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 52771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 56789 - 56723
Alignment:
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactaca 378  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
56789 atgtaagggttcacacccgccttacataatctccgaagtaaaagagctcaacccttttacaactaca 56723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6898 - 6826
Alignment:
200 caatcacatatatcaataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatc 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||||    
6898 caatcatatatatcaataagactcatgccatgatatgcacctattaacacatatatgcatgtggtaccaaatc 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7115 - 6934
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacat--atacttacatca- 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| |||     ||| ||||  |||||||| |||     
7115 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaatagtaa-----tcacacattaatacttacttcac 7023  T
118 atcctcaatatctcacatccataatcaccaattacatgtgtcatgaacaagtatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 214  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||     |||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
7022 atcc-caatatctcacatcaatagtcatcaat--cat-----atgaccaattatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcacatttatca 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 372
Target Start/End: Original strand, 29855 - 30009
Alignment:
219 gactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttcgatgcaacaaaaacatcgcatgtaa 317  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||    |||||| ||||||    
29855 gactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttcgatgccacttgcacatcgaatgtaa 29954  T
318 gatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttaca 372  Q
    |   ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
29955 gggctcacacctgccttacaataatct-cgaagtaaaagagttcaactcttttaca 30009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17771 - 17586
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtca-ctttc 292  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
17771 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcacctttc 17672  T
293 gatgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttac-ataatctccgaagtaaaagagttcaacccttttacaactacaa 379  Q
    ||||| ||    |||||| |||||||   ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
17671 gatgccacttgcacatcgaatgtaagggctcacacctgccttacaataatct-caaagtaaaagag-tcatcccttttacaacaacaa 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 37768 - 37862
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
37768 atcaccaatcacatatttcacataggactcatgctatgatatgcacttattgacacataaatgcatgtggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 37862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1610 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1610
Description:

Target: scaffold1610; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 114 - 45
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
114 acattatcataattcaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa 45  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1605 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1605
Description:

Target: scaffold1605; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 1465 - 1534
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa 92  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
1465 acattatcataattcaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa 1534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 358
Target Start/End: Original strand, 4532 - 4578
Alignment:
312 atgtaagatttcacacccgtcttacataatctccgaagtaaaagagt 358  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
4532 atgtaagatttcacgtccgtcttacattatctccgaagtaaaagagt 4578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 338
Target Start/End: Original strand, 12285 - 12329
Alignment:
294 atgcaacaaaaacatcgcatgtaagatttcacacccgtcttacat 338  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
12285 atgcaacaaaaacatcatatgtaagatttcacacccatcttacat 12329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 7299 - 7342
Alignment:
21 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatt 64  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
7299 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatt 7342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Original strand, 25382 - 25476
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
25382 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 25476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3254 - 3160
Alignment:
195 atcatcaatcacatatatca-ataagactcatgtcatgatatgcacatatcgacgcatacatgcatgtggtaccaaatcacctcaaggtcgtcac 288  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||    
3254 atcaccaatcacataattcacatatgactcatgctatgatatgcacttatggacacataaatgcatgcggtaccaaatctcaacaaggtcgtcac 3160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Original strand, 7049 - 7125
Alignment:
196 tcatcaatcacat-atatcaataagactcatgtcatgatatgcacata--tcgacgcatacatgcatgtggtaccaa 269  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
7049 tcatcaatcacattacatcaaatagactcatgttatgatatgcacctagttcgacacatatatgcatgtggtaccaa 7125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 256 times since January 2019
Visitors: 2563