View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0319_low_21 (Length: 225)

Name: NF0319_low_21
Description: NF0319
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0319_low_21
NF0319_low_21
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (4-225)||(23076445-23076666)
chr2 (1-225)||(23060516-23060739)
chr2 (1-225)||(22731128-22731352)
chr2 (1-225)||(22738074-22738297)
chr2 (1-225)||(23285868-23286088)
chr2 (1-225)||(22337118-22337342)
chr2 (5-225)||(23660026-23660245)
chr2 (1-225)||(23654280-23654504)
chr2 (1-225)||(298708-298933)
chr2 (7-225)||(38016-38232)
chr2 (62-225)||(22105412-22105575)
chr2 (62-222)||(21155060-21155219)
chr2 (62-225)||(18808943-18809105)
chr2 (62-225)||(23130862-23131024)
chr2 (62-225)||(23133329-23133491)
chr2 (62-225)||(23709532-23709694)
chr2 (62-225)||(23712013-23712175)
chr2 (62-225)||(26505379-26505541)
chr2 (62-225)||(26507857-26508019)
chr2 (62-225)||(34402522-34402684)
chr2 (62-225)||(39682313-39682475)
chr2 (62-225)||(571397-571559)
chr2 (62-225)||(6725995-6726157)
chr2 (62-225)||(23135590-23135752)
chr2 (62-225)||(24367774-24367936)
chr2 (62-221)||(32214921-32215079)
chr2 (7-225)||(20309111-20309326)
chr2 (62-225)||(24898195-24898358)
chr2 (62-225)||(24900678-24900841)
chr2 (62-225)||(24903155-24903318)
chr2 (62-225)||(24905632-24905795)
chr2 (62-225)||(24908107-24908270)
chr2 (62-225)||(32039498-32039660)
chr2 (74-221)||(25616192-25616339)
chr2 (62-225)||(28577099-28577261)
chr2 (62-223)||(43137301-43137461)
chr2 (62-225)||(45029854-45030016)
chr2 (7-225)||(23708518-23708735)
chr2 (62-225)||(24529528-24529691)
chr2 (59-225)||(23103348-23103513)
chr2 (62-225)||(38967374-38967537)
chr2 (56-221)||(19671837-19672001)
chr2 (52-224)||(22799071-22799243)
chr2 (102-223)||(28405981-28406103)
chr2 (52-224)||(23019651-23019823)
chr2 (151-225)||(8946660-8946734)
chr2 (61-209)||(7687-7835)
chr2 (105-224)||(7679589-7679707)
chr2 (102-224)||(25175854-25175976)
chr2 (56-209)||(32451878-32452031)
chr2 (165-225)||(23040247-23040307)
chr2 (1-73)||(27753730-27753802)
chr2 (146-222)||(24643034-24643109)
chr2 (152-225)||(22134251-22134324)
chr2 (130-225)||(23071972-23072067)
chr2 (79-224)||(25963688-25963832)
chr2 (109-209)||(23207296-23207398)
chr2 (7-209)||(20520092-20520295)
chr2 (152-213)||(18786947-18787009)
chr2 (158-207)||(23287384-23287433)
chr2 (62-139)||(24642856-24642933)
chr2 (139-207)||(23038048-23038116)
chr2 (159-207)||(26392403-26392451)
chr2 (165-202)||(25961592-25961629)
chr2 (52-119)||(22740905-22740973)
chr2 (109-209)||(23791292-23791394)
chr2 (165-201)||(24655396-24655432)
chr2 (165-201)||(24869903-24869939)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-225)||(51916-52140)
scaffold0011 (1-225)||(167873-168096)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (1-225)||(18818303-18818527)
chr8 (1-225)||(20536211-20536435)
chr8 (1-225)||(21923822-21924046)
chr8 (1-225)||(23406382-23406608)
chr8 (1-225)||(7372781-7372997)
chr8 (1-225)||(22626739-22626962)
chr8 (1-225)||(28648938-28649162)
chr8 (1-225)||(21918894-21919118)
chr8 (1-225)||(18879131-18879349)
chr8 (2-221)||(23648560-23648779)
chr8 (1-225)||(16092235-16092460)
chr8 (1-225)||(6759261-6759483)
chr8 (2-225)||(22875068-22875291)
chr8 (7-225)||(31971260-31971476)
chr8 (1-225)||(45130892-45131114)
chr8 (62-225)||(14409444-14409606)
chr8 (7-225)||(16199546-16199762)
chr8 (62-225)||(1484402-1484564)
chr8 (62-225)||(5853292-5853454)
chr8 (62-221)||(16413316-16413474)
chr8 (62-225)||(20403227-20403389)
chr8 (62-225)||(22001753-22001915)
chr8 (62-225)||(41598188-41598350)
chr8 (62-225)||(4483281-4483442)
chr8 (62-225)||(4542373-4542535)
chr8 (62-225)||(15203231-15203393)
chr8 (74-221)||(18678069-18678216)
chr8 (62-225)||(20046195-20046357)
chr8 (74-221)||(32121739-32121886)
chr8 (62-225)||(19896265-19896430)
chr8 (12-225)||(21395888-21396098)
chr8 (12-225)||(21790381-21790591)
chr8 (7-225)||(21389353-21389568)
chr8 (62-225)||(14823774-14823935)
chr8 (82-225)||(26219717-26219858)
chr8 (46-221)||(13508024-13508199)
chr8 (62-221)||(45290694-45290853)
chr8 (25-225)||(21778697-21778894)
chr8 (62-221)||(26223923-26224081)
chr8 (82-225)||(26225268-26225409)
chr8 (62-225)||(25484275-25484430)
chr8 (46-221)||(13597556-13597731)
chr8 (117-225)||(19937061-19937168)
chr8 (117-212)||(15070571-15070665)
chr8 (44-224)||(23776772-23776952)
chr8 (102-225)||(38855246-38855369)
chr8 (62-209)||(19801382-19801527)
chr8 (56-221)||(17612059-17612224)
chr8 (105-225)||(6520371-6520491)
chr8 (130-225)||(17140919-17141014)
chr8 (46-209)||(20498581-20498744)
chr8 (109-224)||(21285601-21285716)
chr8 (131-225)||(21490998-21491092)
chr8 (113-225)||(5866280-5866392)
chr8 (1-90)||(25363034-25363123)
chr8 (110-213)||(983407-983512)
chr8 (157-224)||(23760893-23760961)
chr8 (152-224)||(26355742-26355815)
chr8 (102-216)||(21673716-21673830)
chr8 (52-201)||(20465983-20466132)
chr8 (109-209)||(37116366-37116468)
chr8 (178-225)||(21249387-21249434)
chr8 (178-225)||(21255225-21255272)
chr8 (25-201)||(17439423-17439601)
chr8 (79-215)||(16410226-16410361)
chr8 (109-209)||(24353039-24353140)
chr8 (105-201)||(19154883-19154981)
chr8 (79-201)||(30643264-30643385)
chr8 (79-224)||(17926678-17926822)
chr8 (109-209)||(17266994-17267096)
chr8 (165-204)||(20533467-20533506)
chr8 (139-224)||(17353975-17354060)
chr8 (160-209)||(20502154-20502203)
chr8 (158-207)||(22525579-22525628)
chr8 (13-64)||(26222987-26223039)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (1-225)||(25421535-25421759)
chr5 (1-225)||(25431398-25431621)
chr5 (1-225)||(23390390-23390614)
chr5 (1-225)||(24493572-24493795)
chr5 (1-225)||(8286736-8286961)
chr5 (1-225)||(9077955-9078179)
chr5 (1-225)||(13025314-13025537)
chr5 (1-225)||(13095498-13095721)
chr5 (1-225)||(24529223-24529447)
chr5 (1-219)||(22075028-22075246)
chr5 (1-221)||(1096474-1096694)
chr5 (61-225)||(21808343-21808507)
chr5 (61-225)||(21729018-21729182)
chr5 (13-214)||(18418594-18418793)
chr5 (1-225)||(21292864-21293087)
chr5 (13-225)||(22412187-22412388)
chr5 (62-225)||(264768-264930)
chr5 (62-225)||(39363384-39363546)
chr5 (63-225)||(10732941-10733102)
chr5 (62-225)||(20909012-20909174)
chr5 (62-225)||(29329934-29330096)
chr5 (62-225)||(42245365-42245527)
chr5 (120-225)||(21997547-21997652)
chr5 (62-225)||(29345980-29346142)
chr5 (62-225)||(36154783-36154942)
chr5 (62-225)||(11581199-11581361)
chr5 (62-225)||(29348453-29348615)
chr5 (62-225)||(29350926-29351088)
chr5 (62-225)||(39245136-39245298)
chr5 (62-225)||(20902008-20902172)
chr5 (62-225)||(2154613-2154776)
chr5 (74-221)||(17517168-17517315)
chr5 (62-225)||(32027393-32027555)
chr5 (62-222)||(18319033-18319193)
chr5 (62-225)||(10775675-10775838)
chr5 (117-225)||(31061068-31061175)
chr5 (117-225)||(38619434-38619541)
chr5 (62-225)||(20917952-20918110)
chr5 (61-209)||(22144068-22144216)
chr5 (52-221)||(37723910-37724078)
chr5 (117-224)||(23064512-23064618)
chr5 (53-179)||(18356364-18356488)
chr5 (52-224)||(21873254-21873423)
chr5 (62-222)||(24067110-24067270)
chr5 (53-179)||(20910745-20910869)
chr5 (110-209)||(20026942-20027043)
chr5 (102-224)||(21565546-21565668)
chr5 (152-225)||(19660879-19660953)
chr5 (152-225)||(21329541-21329615)
chr5 (105-225)||(21502154-21502274)
chr5 (152-224)||(22959576-22959649)
chr5 (4-124)||(21986044-21986164)
chr5 (1-91)||(22107267-22107357)
chr5 (82-162)||(20766095-20766174)
chr5 (130-225)||(36314580-36314675)
chr5 (139-224)||(26704075-26704160)
chr5 (139-224)||(26973808-26973893)
chr5 (109-225)||(26012037-26012151)
chr5 (13-221)||(40725860-40726069)
chr5 (152-225)||(19668901-19668975)
chr5 (171-225)||(20806850-20806904)
chr5 (159-212)||(26732884-26732937)
chr5 (159-209)||(26740697-26740747)
chr5 (52-224)||(22032323-22032490)
chr5 (109-179)||(29448052-29448123)
chr5 (160-224)||(20805552-20805616)
chr5 (109-209)||(22178221-22178323)
chr5 (161-224)||(20766974-20767037)
chr5 (52-224)||(18769949-18770118)
chr5 (160-209)||(23469822-23469871)
chr5 (13-64)||(20766035-20766087)
chr5 (160-224)||(23512098-23512162)
chr5 (165-201)||(26680605-26680641)
chr5 (165-201)||(26952212-26952248)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-225)||(13214-13438)
[»] chr3 (94 HSPs)
chr3 (5-225)||(23083259-23083479)
chr3 (1-225)||(13442277-13442501)
chr3 (1-225)||(26686890-26687114)
chr3 (1-225)||(17487859-17488083)
chr3 (9-225)||(43840935-43841151)
chr3 (1-225)||(17499341-17499565)
chr3 (1-224)||(14576727-14576949)
chr3 (1-225)||(14972857-14973081)
chr3 (1-225)||(20698330-20698553)
chr3 (13-225)||(24153115-24153326)
chr3 (1-225)||(18438537-18438761)
chr3 (1-225)||(25476279-25476503)
chr3 (1-215)||(14572602-14572815)
chr3 (2-225)||(12399212-12399435)
chr3 (7-210)||(42386428-42386632)
chr3 (1-225)||(40213615-40213838)
chr3 (1-225)||(11424657-11424877)
chr3 (1-213)||(30029855-30030066)
chr3 (62-225)||(29172583-29172745)
chr3 (62-225)||(9707607-9707769)
chr3 (62-225)||(17463178-17463340)
chr3 (62-225)||(34159326-34159488)
chr3 (62-225)||(45606907-45607069)
chr3 (62-225)||(55476491-55476653)
chr3 (62-225)||(7781347-7781509)
chr3 (62-225)||(8899094-8899256)
chr3 (62-225)||(16454281-16454443)
chr3 (62-225)||(17672626-17672788)
chr3 (62-225)||(28848611-28848773)
chr3 (62-225)||(38961891-38962053)
chr3 (62-225)||(13151790-13151953)
chr3 (62-225)||(13154255-13154418)
chr3 (62-225)||(6469134-6469296)
chr3 (62-225)||(10247723-10247885)
chr3 (62-221)||(12567564-12567722)
chr3 (62-221)||(13544029-13544187)
chr3 (62-225)||(17446655-17446816)
chr3 (62-223)||(16282811-16282971)
chr3 (82-225)||(36166598-36166739)
chr3 (74-221)||(46822272-46822419)
chr3 (62-225)||(50242822-50242984)
chr3 (111-225)||(55500942-55501055)
chr3 (62-223)||(41123892-41124049)
chr3 (62-225)||(43550478-43550641)
chr3 (62-209)||(53070653-53070799)
chr3 (74-221)||(12511064-12511211)
chr3 (99-225)||(15977515-15977640)
chr3 (117-225)||(12119780-12119887)
chr3 (117-225)||(15412429-15412536)
chr3 (82-214)||(21618460-21618590)
chr3 (13-221)||(24340628-24340837)
chr3 (117-225)||(8499518-8499625)
chr3 (109-225)||(10556985-10557101)
chr3 (128-225)||(44494809-44494905)
chr3 (46-209)||(52523666-52523831)
chr3 (105-225)||(14234490-14234610)
chr3 (46-210)||(23274705-23274869)
chr3 (62-225)||(27165250-27165413)
chr3 (12-90)||(14179570-14179648)
chr3 (128-225)||(17737236-17737335)
chr3 (113-225)||(13210333-13210445)
chr3 (109-224)||(15470928-15471043)
chr3 (102-224)||(16103784-16103905)
chr3 (84-225)||(53301527-53301669)
chr3 (152-224)||(12174303-12174376)
chr3 (109-221)||(32307684-32307795)
chr3 (102-224)||(16097332-16097454)
chr3 (13-221)||(37642170-37642379)
chr3 (1-90)||(16796685-16796774)
chr3 (152-224)||(49668120-49668193)
chr3 (164-225)||(28194693-28194755)
chr3 (152-224)||(9512924-9512997)
chr3 (152-224)||(9520899-9520972)
chr3 (172-225)||(45577947-45578000)
chr3 (79-224)||(11298500-11298644)
chr3 (46-146)||(2051138-2051238)
chr3 (109-209)||(37251168-37251270)
chr3 (109-209)||(43925977-43926079)
chr3 (57-224)||(856140-856304)
chr3 (152-221)||(1644718-1644787)
chr3 (139-224)||(23408428-23408513)
chr3 (109-209)||(22110352-22110454)
chr3 (160-224)||(23077530-23077594)
chr3 (53-215)||(19725857-19726018)
chr3 (105-209)||(12377940-12378046)
chr3 (79-225)||(14665400-14665545)
chr3 (79-225)||(14668556-14668701)
chr3 (56-221)||(22147474-22147639)
chr3 (158-207)||(13919350-13919399)
chr3 (139-224)||(15878083-15878168)
chr3 (160-224)||(14878569-14878633)
chr3 (165-202)||(3389994-3390031)
chr3 (159-224)||(15060284-15060349)
chr3 (159-223)||(15051509-15051573)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (1-225)||(12698834-12699059)
chr7 (1-225)||(9509192-9509416)
chr7 (13-225)||(18456319-18456530)
chr7 (1-225)||(38227484-38227707)
chr7 (1-225)||(3564258-3564482)
chr7 (1-219)||(26212005-26212223)
chr7 (1-225)||(10589042-10589265)
chr7 (1-225)||(16386141-16386366)
chr7 (7-225)||(40443394-40443610)
chr7 (62-225)||(13647328-13647491)
chr7 (56-225)||(16213684-16213852)
chr7 (62-225)||(456321-456483)
chr7 (62-225)||(11972496-11972658)
chr7 (62-225)||(14949122-14949284)
chr7 (62-225)||(15376713-15376875)
chr7 (62-225)||(16232520-16232682)
chr7 (62-225)||(18640272-18640434)
chr7 (62-225)||(20385123-20385285)
chr7 (62-225)||(21189595-21189757)
chr7 (62-225)||(32125491-32125653)
chr7 (62-225)||(41522917-41523079)
chr7 (62-225)||(41525379-41525541)
chr7 (62-224)||(11393287-11393448)
chr7 (13-225)||(48273392-48273594)
chr7 (62-225)||(18430712-18430874)
chr7 (62-225)||(24702238-24702400)
chr7 (62-225)||(27216860-27217022)
chr7 (79-221)||(24275175-24275316)
chr7 (1-213)||(15143931-15144143)
chr7 (64-225)||(16410059-16410219)
chr7 (62-225)||(44116509-44116671)
chr7 (59-224)||(14932685-14932851)
chr7 (59-224)||(15356120-15356286)
chr7 (59-224)||(15360234-15360400)
chr7 (62-225)||(3386333-3386495)
chr7 (22-225)||(2280033-2280235)
chr7 (62-225)||(24704688-24704847)
chr7 (117-225)||(13869346-13869453)
chr7 (62-225)||(20110556-20110708)
chr7 (62-225)||(17061915-17062077)
chr7 (62-221)||(38898376-38898535)
chr7 (13-225)||(27847739-27847948)
chr7 (99-225)||(13831373-13831498)
chr7 (109-225)||(22072916-22073033)
chr7 (62-225)||(26355983-26356156)
chr7 (62-225)||(26358435-26358608)
chr7 (109-225)||(67748-67864)
chr7 (62-209)||(12756671-12756817)
chr7 (51-205)||(15211480-15211634)
chr7 (113-225)||(34200789-34200901)
chr7 (130-225)||(28505321-28505416)
chr7 (102-224)||(18005650-18005772)
chr7 (105-224)||(811129-811248)
chr7 (105-224)||(16219715-16219834)
chr7 (115-224)||(44014182-44014291)
chr7 (113-225)||(15754893-15755005)
chr7 (113-225)||(16495405-16495517)
chr7 (105-225)||(47831810-47831930)
chr7 (139-222)||(18154873-18154956)
chr7 (7-213)||(1867895-1868101)
chr7 (98-179)||(2530129-2530208)
chr7 (13-221)||(19486649-19486858)
chr7 (99-210)||(10063810-10063921)
chr7 (131-225)||(11996051-11996145)
chr7 (46-206)||(12255730-12255892)
chr7 (109-213)||(16056343-16056446)
chr7 (7-201)||(15008398-15008593)
chr7 (151-213)||(12901338-12901401)
chr7 (52-201)||(12321686-12321835)
chr7 (52-224)||(17138008-17138177)
chr7 (158-213)||(14044761-14044817)
chr7 (158-213)||(14354791-14354847)
chr7 (52-224)||(12187019-12187188)
chr7 (139-224)||(19649521-19649606)
chr7 (165-202)||(20569654-20569691)
chr7 (165-225)||(2832499-2832559)
chr7 (165-201)||(9446216-9446252)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-225)||(22886-23109)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-225)||(38764-38987)
scaffold0145 (11-225)||(32945-33158)
scaffold0145 (62-225)||(9749-9912)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-225)||(1854-2078)
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (1-225)||(22780121-22780345)
chr6 (1-225)||(17287690-17287914)
chr6 (1-225)||(20360854-20361078)
chr6 (1-225)||(29060543-29060767)
chr6 (1-225)||(20638177-20638401)
chr6 (1-225)||(18409721-18409945)
chr6 (1-225)||(19303435-19303658)
chr6 (1-225)||(25629249-25629473)
chr6 (1-225)||(20593776-20594000)
chr6 (61-225)||(16496247-16496411)
chr6 (61-225)||(20076703-20076863)
chr6 (62-225)||(12742317-12742479)
chr6 (62-225)||(18334592-18334754)
chr6 (62-225)||(19005046-19005208)
chr6 (62-225)||(19858919-19859081)
chr6 (62-225)||(22782227-22782389)
chr6 (62-225)||(24422547-24422709)
chr6 (62-225)||(33861794-33861956)
chr6 (62-225)||(33864278-33864440)
chr6 (62-225)||(1595549-1595711)
chr6 (62-225)||(2291180-2291342)
chr6 (62-225)||(8055029-8055191)
chr6 (62-225)||(25754809-25754971)
chr6 (62-225)||(26924640-26924802)
chr6 (62-221)||(30676710-30676868)
chr6 (62-225)||(25656629-25656791)
chr6 (62-221)||(34963377-34963535)
chr6 (62-225)||(1540911-1541073)
chr6 (82-225)||(25688502-25688644)
chr6 (62-225)||(3852017-3852179)
chr6 (62-209)||(18456735-18456881)
chr6 (62-222)||(16448526-16448686)
chr6 (62-225)||(20556894-20557054)
chr6 (46-213)||(25644335-25644503)
chr6 (53-225)||(35245589-35245758)
chr6 (79-209)||(18461895-18462024)
chr6 (2-201)||(15041446-15041644)
chr6 (74-221)||(23992434-23992578)
chr6 (62-221)||(19847949-19848109)
chr6 (1-205)||(25603279-25603482)
chr6 (56-209)||(18821795-18821946)
chr6 (7-225)||(16920533-16920748)
chr6 (46-225)||(20109143-20109322)
chr6 (21-205)||(25611637-25611820)
chr6 (7-225)||(22831506-22831723)
chr6 (152-225)||(27333262-27333336)
chr6 (152-225)||(27394002-27394076)
chr6 (53-179)||(27415887-27416011)
chr6 (13-221)||(8227416-8227625)
chr6 (167-225)||(25714420-25714478)
chr6 (113-225)||(1561306-1561418)
chr6 (113-225)||(28496477-28496589)
chr6 (113-225)||(29808888-29809000)
chr6 (109-224)||(19652199-19652313)
chr6 (109-225)||(23019411-23019525)
chr6 (79-224)||(21766695-21766839)
chr6 (151-213)||(9098557-9098620)
chr6 (55-201)||(18907134-18907280)
chr6 (110-213)||(19668386-19668491)
chr6 (151-207)||(33443068-33443124)
chr6 (139-224)||(19873120-19873205)
chr6 (157-216)||(4185870-4185930)
chr6 (20-209)||(11185524-11185710)
chr6 (139-224)||(19862978-19863063)
chr6 (175-224)||(31155465-31155514)
chr6 (181-225)||(22080799-22080843)
chr6 (165-202)||(19790837-19790874)
chr6 (157-216)||(4186379-4186439)
chr6 (158-209)||(23076749-23076801)
chr6 (52-119)||(25642128-25642196)
chr6 (158-209)||(35008167-35008219)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-225)||(8427-8647)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (1-225)||(44052832-44053056)
chr4 (1-225)||(7893706-7893927)
chr4 (11-225)||(16270140-16270353)
chr4 (1-223)||(14038653-14038875)
chr4 (1-225)||(12902760-12902984)
chr4 (1-225)||(16239864-16240087)
chr4 (44-225)||(7798777-7798958)
chr4 (9-225)||(22636438-22636653)
chr4 (1-225)||(7088880-7089104)
chr4 (1-225)||(16377417-16377639)
chr4 (56-225)||(6899894-6900062)
chr4 (1-221)||(23374253-23374473)
chr4 (103-225)||(52873363-52873485)
chr4 (62-225)||(18215274-18215436)
chr4 (62-225)||(44928879-44929042)
chr4 (13-225)||(54798669-54798872)
chr4 (62-225)||(12307-12469)
chr4 (62-225)||(15118352-15118514)
chr4 (62-225)||(52312510-52312672)
chr4 (56-225)||(1837503-1837671)
chr4 (62-225)||(3515007-3515169)
chr4 (62-225)||(19242699-19242861)
chr4 (62-221)||(19618172-19618330)
chr4 (62-225)||(23803265-23803427)
chr4 (62-225)||(44615288-44615450)
chr4 (62-225)||(44773087-44773249)
chr4 (62-225)||(50222339-50222501)
chr4 (13-225)||(14280316-14280518)
chr4 (62-225)||(18239419-18239581)
chr4 (62-225)||(51463868-51464030)
chr4 (62-225)||(44102214-44102376)
chr4 (7-225)||(14053202-14053419)
chr4 (62-221)||(15355324-15355483)
chr4 (62-214)||(14970707-14970858)
chr4 (62-225)||(12610950-12611105)
chr4 (62-221)||(15367697-15367856)
chr4 (62-221)||(15402710-15402869)
chr4 (12-225)||(17046490-17046700)
chr4 (142-225)||(3096296-3096379)
chr4 (117-221)||(15370025-15370128)
chr4 (117-221)||(15371209-15371312)
chr4 (117-221)||(15373490-15373593)
chr4 (62-225)||(7641192-7641344)
chr4 (64-209)||(21815587-21815731)
chr4 (13-213)||(52243099-52243302)
chr4 (46-209)||(13790-13953)
chr4 (117-221)||(16223539-16223642)
chr4 (82-225)||(8574844-8574985)
chr4 (62-222)||(20149832-20149992)
chr4 (62-225)||(22353836-22353999)
chr4 (46-213)||(43198492-43198661)
chr4 (1-113)||(3096759-3096870)
chr4 (52-224)||(15093775-15093947)
chr4 (53-179)||(43256106-43256230)
chr4 (57-209)||(6190481-6190633)
chr4 (152-224)||(12774011-12774084)
chr4 (157-225)||(15551820-15551889)
chr4 (105-225)||(39706286-39706406)
chr4 (110-213)||(12288211-12288316)
chr4 (14-90)||(17047979-17048055)
chr4 (152-224)||(8846360-8846433)
chr4 (79-224)||(16356924-16357068)
chr4 (79-224)||(16348636-16348780)
chr4 (53-201)||(16488023-16488171)
chr4 (158-207)||(17333298-17333347)
chr4 (64-153)||(15464888-15464977)
chr4 (109-209)||(46640456-46640558)
chr4 (52-224)||(15121748-15121917)
chr4 (165-202)||(11250619-11250656)
chr4 (165-201)||(15353365-15353401)
chr4 (158-209)||(53082202-53082254)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-225)||(3473-3697)
scaffold0292 (1-225)||(346-569)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (1-225)||(22532272-22532496)
chr1 (1-225)||(50210107-50210331)
chr1 (1-225)||(27250623-27250847)
chr1 (1-225)||(34509783-34510007)
chr1 (1-225)||(21026683-21026907)
chr1 (14-221)||(22468604-22468810)
chr1 (2-221)||(20135194-20135413)
chr1 (1-151)||(22354466-22354616)
chr1 (62-225)||(13988866-13989028)
chr1 (62-225)||(21923291-21923453)
chr1 (62-225)||(23593735-23593897)
chr1 (62-225)||(21475087-21475249)
chr1 (62-225)||(31612313-31612475)
chr1 (62-225)||(45574842-45575005)
chr1 (62-221)||(21840771-21840929)
chr1 (62-225)||(29298137-29298298)
chr1 (62-225)||(29776688-29776850)
chr1 (62-225)||(433012-433172)
chr1 (62-225)||(16275363-16275526)
chr1 (1-116)||(22356068-22356184)
chr1 (1-116)||(22357754-22357870)
chr1 (62-221)||(16361921-16362079)
chr1 (13-225)||(38801297-38801505)
chr1 (128-225)||(20847175-20847272)
chr1 (62-225)||(13212861-13213024)
chr1 (62-225)||(15860008-15860171)
chr1 (62-225)||(21346961-21347124)
chr1 (44-224)||(21787979-21788159)
chr1 (62-225)||(22123067-22123230)
chr1 (62-225)||(21707167-21707329)
chr1 (62-225)||(21711709-21711871)
chr1 (62-222)||(40389157-40389317)
chr1 (117-225)||(21342096-21342203)
chr1 (46-209)||(21896195-21896358)
chr1 (47-209)||(21861510-21861672)
chr1 (12-90)||(48603652-48603730)
chr1 (53-179)||(33797570-33797694)
chr1 (7-213)||(16758664-16758872)
chr1 (102-224)||(22921864-22921986)
chr1 (160-221)||(20454606-20454667)
chr1 (109-221)||(21754052-21754163)
chr1 (102-224)||(33681011-33681133)
chr1 (139-224)||(21714546-21714631)
chr1 (102-224)||(22237631-22237753)
chr1 (115-209)||(35261086-35261180)
chr1 (113-225)||(14295557-14295669)
chr1 (113-224)||(20248283-20248394)
chr1 (113-212)||(20918620-20918719)
chr1 (109-209)||(50614117-50614219)
chr1 (109-209)||(50621945-50622047)
chr1 (109-209)||(41050036-41050138)
chr1 (152-213)||(52928014-52928076)
chr1 (109-209)||(16368287-16368388)
chr1 (79-201)||(18182093-18182214)
chr1 (139-224)||(42865245-42865330)
chr1 (165-225)||(24783150-24783210)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-225)||(6015-6242)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-225)||(3045-3268)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-225)||(39480-39703)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-225)||(75109-75332)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-225)||(39916-40139)
scaffold0080 (109-209)||(19885-19987)
scaffold0080 (52-201)||(18600-18749)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-225)||(8482-8702)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-225)||(25899-26122)
scaffold0026 (1-225)||(39861-40084)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (9-210)||(24203-24406)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-223)||(4513-4734)
scaffold0228 (1-223)||(12095-12316)
scaffold0228 (1-223)||(22047-22268)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-221)||(25959-26179)
scaffold0122 (82-225)||(44682-44825)
scaffold0122 (1-91)||(33389-33479)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (1-176)||(13144-13319)
scaffold0175 (153-225)||(34126-34199)
scaffold0175 (172-225)||(276-329)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-225)||(17109-17335)
scaffold0056 (62-209)||(79284-79430)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-225)||(943-1166)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-225)||(16494-16718)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (18-225)||(4852-5059)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (24-225)||(3103-3304)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (11-225)||(32863-33074)
scaffold0120 (11-225)||(45931-46142)
scaffold0120 (17-225)||(16116-16323)
scaffold0120 (167-225)||(17389-17447)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-225)||(339844-340065)
scaffold0003 (62-225)||(158450-158612)
scaffold0003 (53-179)||(71350-71474)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-221)||(20917-21138)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (7-225)||(32070-32285)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (12-225)||(15370-15581)
scaffold0114 (52-224)||(7295-7464)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (7-225)||(4715-4932)
scaffold0358 (7-163)||(1-156)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-225)||(1955-2179)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (7-225)||(13500-13716)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (12-225)||(10331-10541)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (2-165)||(3424-3588)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (98-225)||(28417-28544)
scaffold0046 (113-225)||(11295-11407)
scaffold0046 (113-225)||(2000-2112)
scaffold0046 (175-225)||(4555-4605)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (62-225)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (62-225)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (62-225)||(94411-94573)
scaffold0023 (62-221)||(17440-17598)
scaffold0023 (65-225)||(44454-44614)
scaffold0023 (101-224)||(100378-100501)
scaffold0023 (52-224)||(38424-38596)
scaffold0023 (102-224)||(40169-40291)
scaffold0023 (157-225)||(119878-119947)
scaffold0023 (152-224)||(101503-101576)
scaffold0023 (52-136)||(23611-23695)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-147)||(27911-28057)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-138)||(124675-124812)
scaffold0021 (52-225)||(174769-174941)
scaffold0021 (159-225)||(121769-121835)
scaffold0021 (110-209)||(136370-136471)
scaffold0021 (110-209)||(145078-145179)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (61-225)||(128754-128917)
scaffold0031 (62-209)||(20379-20524)
scaffold0031 (139-200)||(65830-65891)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (62-225)||(4694-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (62-225)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (62-225)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (62-225)||(136680-136842)
scaffold0028 (62-225)||(139149-139311)
scaffold0028 (62-225)||(144087-144249)
scaffold0028 (62-225)||(134211-134373)
scaffold0028 (62-225)||(141618-141780)
scaffold0028 (102-225)||(62201-62321)
scaffold0028 (142-224)||(132662-132745)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (62-221)||(10777-10935)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (62-225)||(16784-16946)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (62-225)||(82072-82234)
scaffold0037 (102-213)||(22665-22776)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (62-221)||(501088-501246)
scaffold0001 (62-225)||(85579-85742)
scaffold0001 (102-224)||(160688-160809)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (1-169)||(857-1021)
scaffold0395 (162-225)||(4888-4951)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (9-207)||(4545-4742)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (7-225)||(952-1167)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (62-222)||(4300-4459)
scaffold0761 (79-201)||(6281-6402)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-225)||(16285-16506)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (62-225)||(40400-40562)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (62-221)||(11292-11450)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (62-225)||(106-268)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (62-221)||(12249-12407)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (62-221)||(9246-9404)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (18-225)||(46998-47202)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-169)||(6669-6837)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (82-225)||(116430-116571)
scaffold0022 (109-209)||(128971-129072)
scaffold0022 (109-221)||(78328-78442)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (63-224)||(29558-29720)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (62-211)||(29946-30094)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (7-225)||(1292-1507)
scaffold0106 (7-225)||(7269-7484)
scaffold0106 (160-225)||(15291-15356)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (62-225)||(4214-4377)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (62-225)||(12064-12220)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (106-222)||(11442-11558)
scaffold0235 (1-44)||(11407-11450)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (46-213)||(8481-8650)
scaffold0621 (102-225)||(6538-6661)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (22-225)||(161049-161252)
scaffold0007 (62-145)||(164590-164674)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (12-225)||(51585-51795)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (13-221)||(17932-18141)
scaffold0247 (117-225)||(2184-2291)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (62-222)||(1280-1440)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (46-209)||(53488-53651)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (22-209)||(13147-13336)
scaffold0357 (22-213)||(16014-16206)
scaffold0357 (158-209)||(2680-2732)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (22-213)||(27663-27855)
scaffold0165 (1-69)||(3640-3708)
scaffold0165 (1-69)||(7704-7772)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (12-225)||(5036-5246)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (46-221)||(11471-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (46-221)||(38195-38370)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (102-224)||(19268-19390)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (59-201)||(29117-29262)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (53-179)||(15362-15486)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (52-224)||(4749-4921)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (62-225)||(38657-38820)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (102-224)||(2801-2923)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (52-202)||(16294-16443)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (56-209)||(51833-51985)
scaffold0034 (109-225)||(32541-32654)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (7-201)||(60614-60810)
scaffold0010 (102-216)||(129917-130031)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (102-224)||(14692-14814)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (113-225)||(15664-15776)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (102-216)||(5655-5769)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (46-207)||(7998-8161)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-90)||(1052-1141)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (105-225)||(6121-6241)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (102-209)||(1051-1158)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (102-213)||(10536-10647)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (46-209)||(12587-12749)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (51-205)||(192919-193074)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (102-224)||(133-255)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (52-224)||(23843-24018)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-68)||(10323-10390)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (152-225)||(6614-6688)
scaffold0333 (152-225)||(13994-14068)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (152-225)||(15821-15895)
scaffold0020 (161-224)||(178898-178961)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (113-225)||(1075-1187)
scaffold0184 (165-202)||(4284-4321)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (157-224)||(2694-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (105-224)||(12943-13062)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (109-224)||(45794-45909)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (152-224)||(28813-28887)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (152-224)||(1086-1159)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (157-225)||(1083-1152)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (105-225)||(12769-12889)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (152-224)||(23927-24000)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (46-171)||(225465-225588)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (110-213)||(8075-8180)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (52-137)||(1172-1257)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (152-216)||(6824-6889)
scaffold0556 (109-153)||(8090-8134)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (79-224)||(897-1041)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (79-224)||(1830-1974)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (109-213)||(10542-10646)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-49)||(17881-17929)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (109-213)||(25121-25226)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (52-201)||(26851-26997)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (130-224)||(32102-32197)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (161-224)||(36454-36517)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (52-202)||(46671-46821)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (167-209)||(11982-12024)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (57-224)||(1881-2045)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (79-224)||(44081-44225)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (139-224)||(69794-69879)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (109-209)||(6284-6386)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (109-201)||(38343-38437)
scaffold0139 (139-224)||(19980-20065)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (110-209)||(569-669)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (158-201)||(206575-206618)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (52-224)||(21751-21920)
scaffold0210 (52-224)||(29643-29812)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (160-224)||(6095-6159)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (160-224)||(10575-10639)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (109-209)||(97024-97126)
scaffold0006 (109-209)||(106302-106404)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-36)||(20595-20630)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (163-202)||(4999-5038)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (52-201)||(17055-17205)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (110-213)||(103632-103737)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (102-171)||(2213-2281)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (165-202)||(7328-7365)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (79-140)||(13092-13153)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (79-215)||(6387-6522)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (160-224)||(14664-14728)
scaffold0081 (160-224)||(23679-23743)
scaffold0081 (160-224)||(39103-39167)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23076666 - 23076445
Alignment:
Q  4 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076666 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 23076567  T
Q  104 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23076566 atttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 23076467  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  23076466 tctaagtggatgaagatgatga 23076445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23060739 - 23060516
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23060739 ttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattt 23060641  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060640 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatga 23060516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22731128 - 22731352
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22731128 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 22731227  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731228 aatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||| ||||||||||||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatga 22731352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22738074 - 22738297
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22738074 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 22738173  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738174 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagt 22738272  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  22738273 cggtctaagttgatcaagatgatga 22738297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23286088 - 23285868
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | | |||    
T  23286088 ttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttg 23285989  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285988 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23285893  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  23285892 cggtctaagttgatgaagatgatga 23285868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22337342 - 22337118
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  22337342 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22337243  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337242 tatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatgaagatgatga 22337118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23660245 - 23660026
Alignment:
Q  5 tgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||    
T  23660245 tgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaata 23660146  T
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 204  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||    
T  23660145 tttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggt 23660047  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23660046 ctaagttgatgaagatgatga 23660026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 23654280 - 23654504
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||    
T  23654280 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttg 23654379  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654380 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||| ||||||||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatga 23654504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 298708 - 298933
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  298708 ttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 298807  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  298808 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 298907  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||||| ||||||||||    
T  298908 tcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 38016 - 38232
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  38016 atgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 38114  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38115 taagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 38213  T
Q  207 aagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  38214 aagttgttgaagatgatga 38232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  571459 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135590
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23135652 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215079
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 32215079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20309326 - 20309111
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  20309326 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 20309228  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20309227 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20309131  T
Q  206 taagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  20309130 taagatgttgaagatgatga 20309111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25616339 - 25616192
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  25616339 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 25616240  T
Q  174 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25616239 attgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 g-ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtata-t 43137363  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43137362 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45029954 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 23708518 - 23708735
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||| |    
T  23708518 atgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgt 23708617  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagt 204  Q
    || |||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23708618 ttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggt 23708716  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  23708717 ctaagttga--aagatgatga 23708735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| || || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24529628 tga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103513
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||| | |||||  || |||||||| ||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gta 23103445  T
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  23103446 tactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 23103513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671837
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-g 19671904  T
Q  156 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19671903 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 19671837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 22799071 - 22799243
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| ||||    
T  22799071 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgtt 22799170  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  22799171 gttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 22799243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 23019651 - 23019823
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| ||||    
T  23019651 ttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgtt 23019750  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23019751 gttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946660
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 8946660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 7785  T
Q  161 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7679707 - 7679589
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7679707 tttatgatgttgatgacttaca-ttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcag 7679610  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  7679609 tctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 32451878 - 32452031
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 154  Q
    |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  32451878 ttatgatgtgatattatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattgttatgtcatgctattttt 32451975  T
Q  155 gtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    | || ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32451976 gaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040307
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 23040307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27753802 - 27753730
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27753802 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134324
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatga 22134324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 225
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072067
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatga 23072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 25963688 - 25963832
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  25963688 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 25963786  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  25963787 tattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 25963832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23207398 - 23207296
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  23207398 agatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 23207300  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  23207299 taag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 20520092 - 20520295
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||  ||||| | | | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||| | |    
T  20520092 atgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga-tgt 20520190  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||     
T  20520191 ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 20520288  T
Q  203 gtctaag 209  Q
    |||||||    
T  20520289 gtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787009
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 139
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatta 139  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961629
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 25961629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Original strand, 22740905 - 22740973
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||    
T  22740905 ttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23791394 - 23791292
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | |||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  23791394 agatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtc 23791296  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  23791295 taag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52140 - 51916
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52140 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 52041  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52040 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatga 51916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 167873 - 168096
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  167873 ttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttg 167971  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  167972 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||| ||||||||||||    
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatga 168096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18818303 - 18818527
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818303 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 18818402  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818403 aatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatga 18818527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20536435 - 20536211
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20536435 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 20536336  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536335 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatga 20536211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 21923822 - 21924046
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923822 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattg 21923921  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923922 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatga 21924046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23406608 - 23406382
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406608 ttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 23406509  T
Q  101 aatatttaagatgtt--gttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 198  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406508 aatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 23406409  T
Q  199 gtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23406408 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 23406382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7372997 - 7372781
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||||||||    
T  7372997 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattg 7372906  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372905 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatga 7372781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22626962 - 22626739
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  22626962 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattg 22626863  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626862 aatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22626764  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  22626763 cggtctaagttgatgaagatgatga 22626739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 28648938 - 28649162
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | ||    
T  28648938 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatg 28649037  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28649038 tataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagt 28649137  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  28649138 cggtctaagttgatgaagatgatga 28649162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 21918894 - 21919118
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt- 99  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||     
T  21918894 ttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaattattt 21918992  T
Q  100 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918993 gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 21919092  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||| ||||||||||||    
T  21919093 tcggtctaagttgttgaagatgatga 21919118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18879131 - 18879349
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  18879131 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttg 18879229  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879230 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 18879324  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18879325 cggtctaagttgatgaagatgatga 18879349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23648779 - 23648560
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  23648779 taatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattga 23648680  T
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23648679 atatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 23648580  T
Q  202 agtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  23648579 agtctaagttgattaagatg 23648560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16092235 - 16092460
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| | |    
T  16092235 ttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaat 16092334  T
Q  100 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092335 gtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 16092434  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  16092435 tcggtctaagttgatgaagatgatga 16092460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6759483 - 6759261
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | |    
T  6759483 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagt 6759384  T
Q  100 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    | ||| || ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759383 gtataattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 6759287  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  6759286 tcggtctaagttgatgaagatgatga 6759261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22875291 - 22875068
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  22875291 taatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22875192  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22875191 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagt 22875093  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||| ||||||||||||||||    
T  22875092 cggtctaaattgatgaagatgatga 22875068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31971476 - 31971260
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  31971476 atgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 31971378  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31971377 taagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 31971279  T
Q  207 aagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  31971278 aagttgttgaagatgatga 31971260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 45130892 - 45131114
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  45130892 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattg 45130990  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgactt-gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
     |||  |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130991 tatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 45131088  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||| || ||||||||||||    
T  45131089 tcggtctaagatgttgaagatgatga 45131114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 16199546 - 16199762
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  16199546 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacc 16199644  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16199645 taagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16199742  T
Q  206 taagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  16199743 taagatgttgaagatgatga 16199762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41598250 -actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 18678069 - 18678216
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  18678069 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 18678168  T
Q  174 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18678169 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 18678216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32121886 - 32121739
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  32121886 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 32121787  T
Q  174 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32121786 attgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatg 32121739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat---gtcatgctgtttttgtat 158  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396098
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21395986  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21395987 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21396083  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||||    
T  21396084 tgttgaagatgatga 21396098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790591
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21790479  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21790480 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21790576  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||||    
T  21790577 tgttgaagatgatga 21790591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389568
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21389451  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21389452 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T
Q  206 taagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  21389549 taagatgttgaagatgatga 21389568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219717
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttat 26219761  T
Q  182 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 13508024 - 13508199
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  13508024 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13508123  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || || || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13508124 gatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290853
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778894
Alignment:
Q  25 tgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttg 124  Q
    ||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| |||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  125 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223923
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| || || ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatg 26223923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  182 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
           | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 13597556 - 13597731
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  13597556 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13597655  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13597656 gatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937168
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 19937159  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  19937160 agatgatga 19937168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070571
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776952
Alignment:
Q  44 tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtc 23776871  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23776872 atgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 23776952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855369
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatga 38855369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 19801382 - 19801527
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19801382 tgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 19801480  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19801481 g-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612224
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  156 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 17612224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520371
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatga 6520371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17141014 - 17140919
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17141014 gatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 17140919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||  ||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20498644 gct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  208 agttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490998
Alignment:
Q  131 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21490998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866392
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  5866379 gttgaagatgatga 5866392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 25363034 - 25363123
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  25363034 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760961
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagt 21673732  T
Q  201 cagtctaagttgatga 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  21673731 cggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 20465983 - 20466132
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| |||    
T  20465983 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttgt 20466081  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    | ||||   ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466082 tgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20466132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37116468 - 37116366
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  37116468 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 37116370  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  37116369 taag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249387
Alignment:
Q  178 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21249387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255225
Alignment:
Q  178 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21255225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 201
Target Start/End: Original strand, 17439423 - 17439601
Alignment:
Q  25 tgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 123  Q
    |||||||||||| |||||||  || || ||||| || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||  ||| | ||| |||||||||||| ||    
T  17439423 tgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgattt 17439521  T
Q  124 gcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    ||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17439522 gcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 17439601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 215
Target Start/End: Original strand, 16410226 - 16410361
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || ||||| |||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  16410226 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16410324  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 215  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||    
T  16410325 tatttcactaagttgcatgagtcattataagatgatg 16410361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24353140 - 24353039
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  24353140 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 24353043  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  24353042 taag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 201
Target Start/End: Original strand, 19154883 - 19154981
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||  | | | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19154883 tttaagttgttgttgattagcacttgatattattatatctggatatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 19154981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 30643264 - 30643385
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| |||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  30643264 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 30643362  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  30643363 tatttaactaagttgcatgagtc 30643385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 17926678 - 17926822
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| | |  | |||||||| || |   ||||||||| | || ||||    
T  17926678 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctatgctactattgt 17926776  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  17926777 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 17926822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 17266994 - 17267096
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  | |||||  | |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  17266994 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 17267092  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  17267093 taag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533506
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 204  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagt 20533506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 17353975 - 17354060
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  17353975 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaatatgtgttgatattgattatgatgt 64  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25421759 - 25421535
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421759 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 25421660  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421659 aatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatga 25421535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25431621 - 25431398
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431621 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 25431522  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25431521 aacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagt 25431422  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||| || |||||||||||||    
T  25431421 cggtctaa-tttatgaagatgatga 25431398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 23390390 - 23390614
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23390390 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 23390489  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390490 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatga 23390614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24493795 - 24493572
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24493795 ttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattg 24493696  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24493695 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagt 24493597  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  24493596 cggtctaagttgatgaagatgatga 24493572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 8286736 - 8286961
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  8286736 ttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttg 8286835  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg-tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286836 attatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 8286935  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  8286936 tcggtctaagttgatgaagatgatga 8286961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9078179 - 9077955
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | ||    
T  9078179 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatg 9078080  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9078079 tataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggt 9077980  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9077979 cagtctaagttgatgaagatgatga 9077955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13025537 - 13025314
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13025537 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattg 13025438  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13025437 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13025339  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  13025338 cggtctaagttgatgaagatgatga 13025314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13095721 - 13095498
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13095721 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattg 13095622  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13095621 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagt 13095523  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  13095522 cggtctaagttgatgaagatgatga 13095498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24529447 - 24529223
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | ||    
T  24529447 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatg 24529348  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529347 tataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 24529248  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  24529247 cggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22075246 - 22075028
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  22075246 ttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 22075147  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22075146 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  201 cagtctaagttgatgaaga 219  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  22075046 cggtctaagttgttgaaga 22075028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1096694 - 1096474
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  1096694 ttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 1096595  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096594 tatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1096495  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  1096494 cggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808507
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729182
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 21729182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaaga 18418695  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 21292864 - 21293087
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  21292864 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattg 21292962  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaat--tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 198  Q
     |||  |||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292963 tatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 21293060  T
Q  199 gtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
     || ||||||| || ||||||||||||    
T  21293061 atcggtctaagatgttgaagatgatga 21293087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | || |||||| ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  213 atgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  63 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 162  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  163 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10733041 -ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 120 - 225
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997652
Alignment:
Q  120 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  220 tgatga 225  Q
    ||||||    
T  21997647 tgatga 21997652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||   || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 11581199 - 11581361
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11581199 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 11581298  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11581299 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245136
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39245198 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902172
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20902107  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg-atgaagatgatga 225  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20902108 tg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 2154712  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2154713 tgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 17517168 - 17517315
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  17517168 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 17517267  T
Q  174 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17517268 attgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 17517315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31061068
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 31061077  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  31061076 agatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619434
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 38619443  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  38619442 agatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20917952 - 20918110
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||||| || |  |||||| || ||| |||||||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20917952 tgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatact 20918047  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20918048 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22144216 - 22144068
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||    
T  22144216 atgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatac 22144118  T
Q  161 tgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22144117 tacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37724078 - 37723910
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgtt-atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| | |||||  || |||||||| ||| ||  | ||||||| || ||||||||||||    
T  37724078 ttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgt 37723979  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37723978 t---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064512
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23064520  T
Q  217 agatgatg 224  Q
    ||||||||    
T  23064519 agatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 152  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  153 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21873423 - 21873254
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||   |  ||  ||||||||||| | ||||||||| |    
T  21873423 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatggttaagatgttg---aaatgagattgatattatgaagtcatgctgat 21873327  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  21873326 gttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21873254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  24067170 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| | |||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660953
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 19660953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329615
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21329615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502274
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    ||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatga 21502274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 21986044 - 21986164
Alignment:
Q  4 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 103  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  ||| | |  ||    
T  21986044 atgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttgagatatgaatttat 21986143  T
Q  104 atttaagatgttgttgacttg 124  Q
    | | |||||||||||||||||    
T  21986144 aatgaagatgttgttgacttg 21986164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22107267 - 22107357
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 91  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  22107267 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 162
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766174
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 162  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314580
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 36314580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Original strand, 26012037 - 26012151
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  26012037 agatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26012135  T
Q  208 agttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  26012136 agttga--aagatgatga 26012151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725860
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T
Q  211 tgatgaagatg 221  Q
     | ||||||||    
T  40725870 cgttgaagatg 40725860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668901
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatga 19668901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  171 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22032490 - 22032323
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | |     
T  22032490 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgat-tg 22032396  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  22032395 tttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29448123 - 29448052
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29448123 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805552
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20805552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 22178221 - 22178323
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||  |||| |||| |||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  22178221 agatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 22178319  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  22178320 taag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766974
Alignment:
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20766974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 18769949 - 18770118
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  18769949 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 18770044  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  18770045 tgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766087
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctg-tttaatatgtgttgatattgattatgatgt 64  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 20766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23512162 - 23512098
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23512162 ctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 23512098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13214
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  13438 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 13339  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13338 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13239  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13238 cagtctaagttgatgaagatgatga 13214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 94)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 23083259 - 23083479
Alignment:
Q  5 tgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaata 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23083259 tgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaata 23083358  T
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23083359 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggt 23083458  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23083459 ctaagttgatgaagatgatga 23083479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13442501 - 13442277
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13442501 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 13442402  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13442401 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatga 13442277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26687114 - 26686890
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26687114 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatgg 26687015  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687014 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatga 26686890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17488083 - 17487859
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  17488083 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 17487984  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487983 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  17487883 cggtctaagttgatgaagatgatga 17487859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43841151 - 43840935
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841151 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 43841052  T
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  43841051 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaa 43840952  T
Q  209 gttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||| ||||    
T  43840951 gttgatgaagataatga 43840935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17499565 - 17499341
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  17499565 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 17499466  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499465 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  17499365 cggtctaagttgatgaagatgatga 17499341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14576727 - 14576949
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14576727 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattg 14576826  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576827 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagt 14576925  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||  |||||||    
T  14576926 cggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14973081 - 14972857
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  14973081 ttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 14972982  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972981 tatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14972882  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  14972881 cggtctaagttgatgaagatgatga 14972857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 20698330 - 20698553
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  20698330 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttg 20698428  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698429 aatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20698528  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20698529 cggtctaagttgatgaagatgatga 20698553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  213 atgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18438761 - 18438537
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||    
T  18438761 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatg 18438662  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18438661 tataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagt 18438562  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18438561 cggtctaagttgatgaagatgatga 18438537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 25476279 - 25476503
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  25476279 ttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatg 25476378  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25476379 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagt 25476478  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  25476479 cggtctaagttgatgaagatgatga 25476503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14572815 - 14572602
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  14572815 ttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtataattg 14572716  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572715 aatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14572617  T
Q  201 cagtctaagttgatg 215  Q
    | |||||||||||||    
T  14572616 cggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12399435 - 12399212
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattga 101  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    || ||||    
T  12399435 taatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttga 12399336  T
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 12399236  T
Q  202 agtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  12399235 ggtctaagttgttgaagatgatga 12399212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42386632 - 42386428
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||    
T  42386632 atgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatat 42386533  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  42386532 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtc 42386433  T
Q  206 taagt 210  Q
    |||||    
T  42386432 taagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 40213615 - 40213838
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | ||    
T  40213615 ttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatg 40213714  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40213715 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagt 40213813  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  40213814 cggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 11424657 - 11424877
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  11424657 ttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 11424756  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424757 cataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 11424852  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11424853 cagtctaagttgatgaagatgatga 11424877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30030066 - 30029855
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  30030066 ttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattg 30029967  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  30029966 aatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 30029868  T
Q  201 cagtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||    
T  30029867 cagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29172683 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17672688 g-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848773
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28848711 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  ||| || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544029
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13544029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16282911 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  182 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46822419 - 46822272
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  46822419 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgct 46822320  T
Q  174 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46822319 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 46822272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  50242884 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  111 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |    |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550641
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatga 43550641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12511211 - 12511064
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  12511211 ttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgct 12511112  T
Q  174 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12511111 attgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatg 12511064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15977640 - 15977515
Alignment:
Q  99 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 198  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977640 tgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 15977542  T
Q  199 gtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15977541 gtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119887
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 12119878  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  12119879 agatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412429
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15412438  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  15412437 agatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 21618493  T
Q  182 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21618492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340837
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| || || || ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24340728 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T
Q  211 tgatgaagatg 221  Q
     | ||||||||    
T  24340827 cgttgaagatg 24340837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499518
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 8499527  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  8499526 agatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10557101 - 10556985
Alignment:
Q  109 agatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10557101 agatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 10557003  T
Q  208 agttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  10557002 agttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  128 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  146 g--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234490
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatga 14234490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23274869 - 23274705
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| ||||  ||| | | ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||    
T  23274869 ttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 23274770  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23274769 gatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27165413 - 27165250
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||  ||| ||||| || ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | |||||    
T  27165413 tgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatact 27165315  T
Q  162 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27165314 gtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737236
Alignment:
Q  128 ttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210445
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatga 13210445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470928
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  208 agttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| || |||||||    
T  15470944 agttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16103905 - 16103784
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16103905 atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagt 16103808  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  16103807 cggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  84 tacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt-tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttat 181  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  182 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32307795 - 32307684
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32307795 agatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 32307698  T
Q  208 agttgatgaagatg 221  Q
    ||||||||| ||||    
T  32307697 agttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16097454 - 16097332
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| | ||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16097454 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16097356  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  16097355 cggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642379
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  211 tgatgaagatg 221  Q
     | ||||||||    
T  37642369 cgttgaagatg 37642379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16796774 - 16796685
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16796774 ttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  164 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  172 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 11298500 - 11298644
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  11298500 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 11298598  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  11298599 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 11298644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  146 g 146  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43926079 - 43925977
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  43926079 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 43925981  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  43925980 taag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  57 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttg 155  Q
    ||||||||  ||||||||| | || |||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  856304 tatgatgtattataatgtt-tatgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 856209  T
Q  156 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  856208 taatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644787
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23408513 - 23408428
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  23408513 atgtcacgctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 22110352 - 22110454
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  22110352 agatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 22110450  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  22110451 taag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 215
Target Start/End: Original strand, 19725857 - 19726018
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  19725857 tgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatga-gtcatgctgtt 19725954  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 215  Q
      |||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||    
T  19725955 gatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgatg 19726018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12378046 - 12377940
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||     
T  12378046 tttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcg 12377947  T
Q  203 gtctaag 209  Q
    |||||||    
T  12377946 gtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14665545 - 14665400
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| | | || || |||||  |||   |||  ||||||||| ||||    
T  14665545 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattttaaagttatactgttgatgtgatctgattatgttgctattgt 14665447  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||    
T  14665446 tatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 14665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14668701 - 14668556
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || || |||||  |||   |||  |||| |||| ||||    
T  14668701 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattataaagttatactgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 14668603  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||    
T  14668602 tatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 14668556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147639
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || |||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 22147572  T
Q  156 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     |||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||    
T  22147573 cataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatg 22147639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878633
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 14878633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390031
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 3390031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15060349 - 15060284
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  15060349 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatg 15060284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15051573 - 15051509
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||  ||||||||    
T  15051573 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgat 15051509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12699059 - 12698834
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12699059 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 12698960  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698959 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatga 12698834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9509416 - 9509192
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9509416 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttg 9509317  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509316 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatga 9509192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  213 atgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38227707 - 38227484
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38227707 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattg 38227608  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38227607 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 38227509  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||| ||||||||||||||    
T  38227508 cggtctaagtagatgaagatgatga 38227484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 3564258 - 3564482
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  3564258 ttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatg 3564357  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564358 tataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3564457  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  3564458 cggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26212223 - 26212005
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  26212223 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 26212124  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26212123 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  201 cagtctaagttgatgaaga 219  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  26212023 cggtctaagttgttgaaga 26212005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10589265 - 10589042
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| |||    
T  10589265 ttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattgcttgaagaatatttg 10589167  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    || ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10589166 aacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 10589067  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  |||||||||  |||||||||||    
T  10589066 cgatctaagttgtcgaagatgatga 10589042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16386141 - 16386366
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    |  |||    
T  16386141 ttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttg 16386240  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  16386241 aatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 16386340  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||||||| ||||||||||||    
T  16386341 tcggtctaagttgttgaagatgatga 16386366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40443610 - 40443394
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  40443610 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacc 40443512  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  40443511 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtc 40443414  T
Q  206 taagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  40443413 taagatgttgaagatgatga 40443394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647328
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatga 13647328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 56 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  156 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16213752 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273392
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | || ||||| | ||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatattga-ga 48273506  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  48273505 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  48273405 gattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430712
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18430712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15143931 - 15144143
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| | |    
T  15143931 ttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaat 15144030  T
Q  100 gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    | ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144031 gtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 15144129  T
Q  200 tcagtctaagttga 213  Q
    || |||||||||||    
T  15144130 tcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  64 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 163  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 16410121  T
Q  164 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16410120 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280235
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttga 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  121 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 219  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 2280229  T
Q  220 tgatga 225  Q
    ||||||    
T  2280230 tgatga 2280235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13869453 - 13869346
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13869355  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  13869354 agatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110556
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20110610 ---------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 17061915 - 17062077
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17061915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatact 17062013  T
Q  162 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17062014 gctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    || || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  38898476 tg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 27847739 - 27847948
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||    
T  27847739 ttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 27847837  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||| ||| ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  27847838 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagat 27847934  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  27847935 gttgaagatgatga 27847948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13831498 - 13831373
Alignment:
Q  99 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 198  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831498 tgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  199 gtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072916
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  208 agttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatga 22072916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356156
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  162 g----------cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |            | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26356083 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358608
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  162 g----------cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |            | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26358535 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 67864 - 67748
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  67864 agatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 67766  T
Q  208 agttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  67765 agttgattaagatgatga 67748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||  |||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15211634 - 15211480
Alignment:
Q  51 attgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||| | |||||||| || ||||||||| || ||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  15211634 attgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 15211536  T
Q  151 ttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15211535 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtc 15211480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200789
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  34200802 gttgaagatgatga 34200789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 225
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505416
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatga 28505416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18005772 - 18005650
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18005772 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 18005674  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  18005673 cggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Original strand, 811129 - 811248
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  811129 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 811227  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  811228 tctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219834
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16219814 tctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014182
Alignment:
Q  115 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  214 tgaagatgatg 224  Q
    ||| |||||||    
T  44014192 tgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15755005
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15754991  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  15754992 gttgaagatgatga 15755005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495405
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16495419  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  16495418 gttgaagatgatga 16495405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47831930 - 47831810
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | | | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  47831930 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 47831832  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  47831831 tctaagttgattaagatgatga 47831810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 222
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Original strand, 1867895 - 1868101
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||  ||||| ||| | || |||||||||| |  ||| |||||||| |||| ||||  ||| | ||    
T  1867895 atgatattaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtt 1867993  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    | |||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |    
T  1867994 tgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcgg 1868091  T
Q  204 tctaagttga 213  Q
    ||||||||||    
T  1868092 tctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 179
Target Start/End: Original strand, 2530129 - 2530208
Alignment:
Q  98 ttgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2530129 ttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 19486649 - 19486858
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  19486649 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19486749 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T
Q  211 tgatgaagatg 221  Q
     | ||||||||    
T  19486848 cgttgaagatg 19486858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 210
Target Start/End: Original strand, 10063810 - 10063921
Alignment:
Q  99 tgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatg 197  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  10063810 tgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatg 10063908  T
Q  198 agtcagtctaagt 210  Q
    |||||||||||||    
T  10063909 agtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996145
Alignment:
Q  131 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 11996145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 206
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||| || || || |||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  146 gctgtt-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    |   |  |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056343
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtcta 16056349  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  16056348 agttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 15008398 - 15008593
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  || || |    
T  15008398 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgt 15008496  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    || || ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||  ||| |||| |||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  15008497 ttgaggtgttgttgatttgc-attgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 15008593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 12321686 - 12321835
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| || ||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || |||||||    
T  12321686 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattatggaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgt 12321784  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    | ||||   |||  |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  12321785 tgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactacgttgcatgagtc 12321835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 17138008 - 17138177
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  17138008 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 17138103  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  17138104 tgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12187188 - 12187019
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  12187188 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 12187093  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
      |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  12187092 aattgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 19649521 - 19649606
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||  |||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  19649521 atgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569691
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 20569691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832559
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 2832559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23109 - 22886
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23109 ttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 23010  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23009 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38987 - 38764
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38987 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 38888  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  38887 aatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgact 38789  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  38788 cggtctaagttgatgaagatgatga 38764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32945
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 33059  T
Q  111 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  33058 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||    
T  32959 tgatgaagatgatga 32945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9749
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatac 9813  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9812 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1854
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2078 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 1979  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1978 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatga 1854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22780121 - 22780345
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22780121 ttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattg 22780220  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780221 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagt 22780320  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22780321 cagtctaagttgatgaagatgatga 22780345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 17287690 - 17287914
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287690 ttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 17287789  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287790 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatga 17287914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 20360854 - 20361078
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  20360854 ttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 20360953  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360954 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  |||||||||||||| |||||||    
T  20361054 cgatctaagttgatgaaaatgatga 20361078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29060767 - 29060543
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  29060767 ttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 29060668  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060667 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 29060568  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  29060567 cggtctaagctgatgaagatgatga 29060543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 20638177 - 20638401
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||  |||    
T  20638177 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttg 20638276  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638277 aatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 20638376  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  20638377 tggtctaagttgatgaagatgatga 20638401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18409721 - 18409945
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||| | ||    
T  18409721 ttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatg 18409820  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409821 gatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagt 18409920  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  18409921 cggtctaagttgatgaagatgatga 18409945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 19303435 - 19303658
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  19303435 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatg 19303534  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303535 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 19303633  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  19303634 cggtctaagatgatgaagatgatga 19303658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 25629249 - 25629473
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  25629249 ttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 25629348  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25629349 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagt 25629448  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  25629449 cggtctaagttgatgaagatgatga 25629473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20594000 - 20593776
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| ||||    
T  20594000 ttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattg 20593901  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  20593900 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgatt 20593801  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20593800 cggtctaagttgatgaagatgatga 20593776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496247
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 16496247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076703
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 20076703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1595611 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676868
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 30676868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656629
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25656691 gc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963377
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34963377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541073
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1541011 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  182 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 -attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18456881 - 18456735
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456881 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18456782  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18456781 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||   || ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaa--ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  20556992 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25644503 - 25644335
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| |||||| || |||||||| |||| |||     
T  25644503 ttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcac 25644404  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25644403 gctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245589
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttt 152  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  153 ttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 35245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 15041446 - 15041644
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattga 101  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| || | |||||| |||||||||||||||  | | |||||    
T  15041446 taatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgt-atgtgcattacttgagattttattga 15041544  T
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041545 atacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23992578 - 23992434
Alignment:
Q  74 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 173  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||    
T  23992578 ttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg---aattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 23992482  T
Q  174 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23992481 attgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 23992434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 19847949 - 19848109
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaa-tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||  |    
T  19847949 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatc 19848048  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19848049 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 19848109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 25603279 - 25603482
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| | ||||    
T  25603279 ttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattg 25603378  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||| || |||||| | ||| ||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  25603379 aataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagt 25603477  T
Q  201 cagtc 205  Q
    |||||    
T  25603478 cagtc 25603482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 18821795 - 18821946
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18821795 ttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatggcatgctgttttt 18821892  T
Q  155 gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18821893 gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 16920533 - 16920748
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| ||  |||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  16920533 atgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 16920631  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||| ||| | | | |||||||  |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16920632 taagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T
Q  206 taagttgatgaagatgatga 225  Q
     ||| || ||||||||||||    
T  16920729 aaagatgttgaagatgatga 16920748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109143
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  || | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatga 20109143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 205
Target Start/End: Original strand, 25611637 - 25611820
Alignment:
Q  21 aatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttga 120  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| | |||||||| || |||||| || ||    
T  25611637 aatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtagt-ga 25611735  T
Q  121 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
     ||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25611736 attataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtc 25611820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22831723 - 22831506
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat--a 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||  |    
T  22831723 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 22831625  T
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    | |||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22831624 tctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22831528  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||   || ||||||||||||    
T  22831527 tctactatgttgaagatgatga 22831506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333336
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27333336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394076
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27394076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagta-taattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| | || ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 8227416 - 8227625
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||    
T  8227416 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8227516 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 8227614  T
Q  211 tgatgaagatg 221  Q
    || ||||||||    
T  8227615 tgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714420
Alignment:
Q  167 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25714420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561306
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1561320  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  1561319 gttgaagatgatga 1561306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496589
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
      ||||||||||||    
T  28496576 tttgaagatgatga 28496589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29809000
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
      ||||||||||||    
T  29808987 tttgaagatgatga 29809000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19652313 - 19652199
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19652313 agatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtcta 19652216  T
Q  208 agttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||||||    
T  19652215 agttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019411
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  208 agttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||  ||||||||||    
T  23019426 agatga--aagatgatga 23019411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766695
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   |||||||||||||| ||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18907280 - 18907134
Alignment:
Q  55 attatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 153  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| | || |||||||| |    
T  18907280 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgttgt 18907182  T
Q  154 tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||   |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907181 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  207 aagttga 213  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Original strand, 4185870 - 4185930
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4185870 atactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11185710 - 11185524
Alignment:
Q  20 taatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 119  Q
    |||||||||||| ||  ||| || ||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||  ||| |||   |||||| || ||    
T  11185710 taatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  120 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080843
Alignment:
Q  181 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 22080843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790874
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 19790874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4186439 - 4186379
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4186439 atactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Original strand, 25642128 - 25642196
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||    
T  25642128 ttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 8427 - 8647
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8427 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 8526  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  8527 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagt 8622  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8623 cggtctaagttgatgaagatgatga 8647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44053056 - 44052832
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  44053056 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttg 44052957  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44052956 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | | |||||||||||||||||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatga 44052832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7893927 - 7893706
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7893927 ttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgct---gattatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattg 7893831  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  7893830 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatga 7893706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270353
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 16270239  T
Q  111 atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  16270240 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||    
T  16270339 tgatgaagatgatga 16270353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14038875 - 14038653
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  14038875 ttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatg 14038776  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038775 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 14038676  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14038675 cagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12902984 - 12902760
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  12902984 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttg 12902885  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902884 aatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||| ||||||||||||    
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatga 12902760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16239864 - 16240087
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaagatgatga 16240087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798777
Alignment:
Q  44 tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 7798777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22636653 - 22636438
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22636653 gatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatattta 22636555  T
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 208  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22636554 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22636455  T
Q  209 gttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  22636454 gttgatgaagatgatga 22636438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7089104 - 7088880
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  7089104 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttg 7089005  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089004 aatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 7088905  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  7088904 cggtctaagttgatgaagatgatga 7088880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16377417 - 16377639
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  16377417 ttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 16377516  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377517 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16377614  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||| ||||    
T  16377615 cggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899894
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttg 6899964  T
Q  156 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 6899894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23374253 - 23374473
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  23374253 ttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 23374352  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374353 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |  ||||||||| ||||||||    
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873485
Alignment:
Q  103 tatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  203 gtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatga 52873485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 44928879 - 44929042
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928879 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 44928978  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44928979 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | || |||||| |||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 225
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  156 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1837603 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242699
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19242761 g-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19242699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618330
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19618330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803365 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280316
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||     ||||      |||||||| ||| | |  |||||| |||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatctatatttgaga 14280429  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14280428 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  14280329 gattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239581
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18239519 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  51463968 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44102376 - 44102214
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102376 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44102277  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44102276 -actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 14053202 - 14053419
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| ||       
T  14053202 atgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatgca 14053300  T
Q  107 taag-atgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 204  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  14053301 taagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgat 14053398  T
Q  205 ctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  14053399 ctaagatgttgaagatgatga 14053419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15355424 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 214
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970858
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 214  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15367856 - 15367697
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367856 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15367757  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15367756 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15367697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15402869 - 15402710
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402869 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15402770  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15402769 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15402710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17046700 - 17046490
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| | ||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  17046700 gttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataaga 17046602  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||| |   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  17046601 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttct---atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 17046505  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||||    
T  17046504 tgttgaagatgatga 17046490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096296
Alignment:
Q  142 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 3096296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15370025
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15370030  T
Q  217 agatg 221  Q
    |||||    
T  15370029 agatg 15370025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15371312 - 15371209
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15371214  T
Q  217 agatg 221  Q
    |||||    
T  15371213 agatg 15371209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15373593 - 15373490
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15373495  T
Q  217 agatg 221  Q
    |||||    
T  15373494 agatg 15373490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 209
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  64 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 163  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  164 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243302
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||  ||||| ||| |||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 208  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52243199 tgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T
Q  209 gttga 213  Q
    |||||    
T  52243298 gttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13890 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16223642 - 16223539
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 16223544  T
Q  217 agatg 221  Q
    |||||    
T  16223543 agatg 16223539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttat 8574941  T
Q  182 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  8574942 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353836
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatga 22353836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  146 gctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    |   | ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 3096870 - 3096759
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  3096870 ttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T
Q  101 aatatttaagatg 113  Q
    |||||||| ||||    
T  3096771 aatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15093947 - 15093775
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||| ||||||| ||  || |||||||||||| | |||||||||||    
T  15093947 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtcatgctgtt 15093848  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||   ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||    
T  15093847 gttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatg 15093775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6190633 - 6190481
Alignment:
Q  57 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||  ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6190633 tatgatgtgatctaatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttaca-ttgatattgttatgtcatgctatttttg 6190536  T
Q  156 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
     || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6190535 aatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551820
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 15551820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Original strand, 39706286 - 39706406
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706286 tttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 39706384  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  39706385 tctaagttgattaagatgatga 39706406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  207 aagttga 213  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 17047979 - 17048055
Alignment:
Q  14 taattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17047979 taattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 16356924 - 16357068
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  16356924 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16357022  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  16357023 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 16348636 - 16348780
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    |||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  16348636 tgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16348734  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  16348735 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16348780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 16488023 - 16488171
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||   | |||||||||||| | || |||||| |    
T  16488023 tgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaag-aattgatattatgaagttatgctgct 16488121  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16488122 tttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16488171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 153
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  64 tgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 153  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 46640456 - 46640558
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    ||||||| |||| || || |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  46640456 agatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 46640554  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  46640555 taag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 15121748 - 15121917
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg-ctgt 150  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||  |||||  | |    
T  15121748 ttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattat 15121843  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  ||||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  15121844 tgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250656
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 11250656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082254
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3697 - 3473
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  3697 ttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttg 3598  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  3597 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatga 3473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 569 - 346
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  569 ttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcg 470  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  469 aatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagt 371  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||| ||| ||||||||||    
T  370 cggtctaagtcgataaagatgatga 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22532496 - 22532272
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  22532496 ttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 22532397  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22532396 aatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagt 22532297  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  22532296 tggtctaagttgatgaagatgatga 22532272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 50210107 - 50210331
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||    
T  50210107 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 50210206  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210207 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 50210306  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  50210307 cggtctaagttgatgaagatgatga 50210331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 27250623 - 27250847
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  27250623 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttg 27250722  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27250723 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||| ||||||||||||    
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatga 27250847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34510007 - 34509783
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | ||    
T  34510007 ttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatg 34509908  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509907 tataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 34509808  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  34509807 cggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21026907 - 21026683
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || |||    
T  21026907 ttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg 21026808  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026807 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatga 21026683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468810
Alignment:
Q  14 taattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  114 ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 22468802  T
Q  214 tgaagatg 221  Q
    | ||||||    
T  22468803 ttaagatg 22468810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20135413 - 20135194
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattga 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||    
T  20135413 taatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattga 20135314  T
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20135313 atacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtc 20135214  T
Q  202 agtctaagttgatgaagatg 221  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  20135213 agtctaagttgattaagatg 20135194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22354466 - 22354616
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||    
T  22354466 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttg 22354565  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354566 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23593835 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575005
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatga 45575005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840771
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21840829 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21840771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 433172 - 433012
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  433172 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatact 433073  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  433072 gcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||  |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 22356068 - 22356184
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgat-attgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22356068 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgttt 22356167  T
Q  100 gaatatttaagatgttg 116  Q
    ||||||||| |||||||    
T  22356168 gaatatttatgatgttg 22356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 22357754 - 22357870
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgat-attgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  22357754 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgttt 22357853  T
Q  100 gaatatttaagatgttg 116  Q
    ||||||||| |||||||    
T  22357854 gaatatttatgatgttg 22357870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361921
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16361979 g-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16361921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 38801297 - 38801505
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 112  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| || ||||| | ||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||    
T  38801297 ttaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatatataatat 38801395  T
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||| ||| ||| | ||||||| |||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38801396 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagat 38801491  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  38801492 gttgaagatgatga 38801505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847272
Alignment:
Q  128 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213024
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13212961 tgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13213024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 15860008 - 15860171
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||||||||||  ||||| |||   ||| || |||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15860008 tgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatac 15860107  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  15860108 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatga 15860171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21347124 - 21346961
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21347124 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21347025  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21347024 tgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788159
Alignment:
Q  44 tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtc 21788078  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||| ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  21788079 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21788159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| || |  |||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  162 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707167
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||  ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21707229 at-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711709
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||  ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21711771 at-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21342203 - 21342096
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21342203 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21342105  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  21342104 agatgatga 21342096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||| |||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21896295 gctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  47 tgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg 146  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  147 ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16758872 - 16758664
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| | ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  16758872 atgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 16758773  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |   ||||||||||  ||| | |||||||| |||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  16758772 tgt-gatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcg 16758675  T
Q  203 gtctaagttga 213  Q
    |||||||||||    
T  16758674 gtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | ||||||| |||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 221
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454667
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20454667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21754163 - 21754052
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21754163 agatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21754066  T
Q  208 agttgatgaagatg 221  Q
    ||||||||| ||||    
T  21754065 agttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681011
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | ||||||||||| || |||||||    
T  33681034 cggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237631
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | ||||||||||| || |||||||    
T  22237654 cggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261180
Alignment:
Q  115 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 14295557 - 14295669
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  14295557 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaat 14295655  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  14295656 gttgaagatgatga 14295669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248283
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  212 gatgaagatgatg 224  Q
    ||||| |||||||    
T  20248295 gatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20918621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 50614117 - 50614219
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  50614117 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50614215  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  50614216 taag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 50621945 - 50622047
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  50621945 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50622043  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  50622044 taag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 41050036 - 41050138
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  41050036 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtct 41050135  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  41050136 aag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 16368287 - 16368388
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  16368287 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 16368385  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  16368386 aag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 18182093 - 18182214
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  |  |||||||||||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  18182093 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaata-aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 18182191  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  18182192 tatttaactaagttgcatgagtc 18182214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865330
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  42865245 atgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 225
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783210
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatga 24783210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 6015 - 6242
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6015 ttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttg 6114  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgccta---tgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 197  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6115 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 6214  T
Q  198 agtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6215 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 6242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 3045 - 3268
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  3045 ttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 3144  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3145 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 3243  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  3244 cggtctaagttgatgaagatgatga 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39703 - 39480
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  39703 ttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 39604  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39603 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 39505  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||||||| |||||    
T  39504 cggtctaagttgatgaagacgatga 39480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 75109 - 75332
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  75109 ttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 75208  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  75209 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 75307  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||||||| |||||    
T  75308 cggtctaagttgatgaagacgatga 75332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40139 - 39916
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40139 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatca 40040  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40039 aatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagt 39941  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  39940 tggtctaagttgatgaagatgatga 39916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 18600 - 18749
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  | ||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||   | |||||||||||| | || || ||||    
T  18600 ttgattataatgtgatttaatgattaattccattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaacg-aattgatattatgaagttattctgt 18698  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    | ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18699 tgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8702 - 8482
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8702 ttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttg 8607  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8606 aatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagt 8507  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8506 cggtctaagttgatgaagatgatga 8482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26122 - 25899
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26122 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattg 26023  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26022 aatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 25924  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||||||| ||||    
T  25923 cggtctaagttgatgaagataatga 25899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40084 - 39861
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40084 ttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattg 39985  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39984 aatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagt 39886  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      |||||||||||||||||||||||    
T  39885 tggtctaagttgatgaagatgatga 39861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 24203 - 24406
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattga-ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24203 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatattt 24302  T
Q  108 aagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24303 aagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 24402  T
Q  207 aagt 210  Q
    ||||    
T  24403 aagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4513
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  4734 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 4635  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4634 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    | ||||||||||||||| |||||    
T  4535 cggtctaagttgatgaaaatgat 4513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12316 - 12095
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  12316 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 12217  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12216 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    | ||||||||||||||| |||||    
T  12117 cggtctaagttgatgaaaatgat 12095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22268 - 22047
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  22268 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22169  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22168 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
    | ||||||||||||||| |||||    
T  22069 cggtctaagttgatgaaaatgat 22047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 25959 - 26179
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||    
T  25959 ttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 26058  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26059 tatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 26158  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  26159 cggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  182 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 33389 - 33479
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  33389 ttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaa 33479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13319 - 13144
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13319 ttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 13220  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13219 aatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34126
Alignment:
Q  153 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 34126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 276
Alignment:
Q  172 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatga 276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 17109 - 17335
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||    
T  17109 ttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatg 17208  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg--tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 198  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17209 tatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 17308  T
Q  199 gtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17309 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 17335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 79284 - 79430
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  79284 tgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatact 79383  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  79384 gtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 943 - 1166
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| |||    
T  943 ttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataatatttg 1041  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1042 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||| ||||||||||||    
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatga 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16494 - 16718
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  16494 ttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 16593  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16594 tatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16693  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||| ||||||||||||||||    
T  16694 cggtctaaattgatgaagatgatga 16718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4852
Alignment:
Q  18 tataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    || ||||||| ||||||||||||    
T  5059 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgt 4960  T
Q  118 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaa 217  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 4860  T
Q  218 gatgatga 225  Q
    ||||||||    
T  4859 gatgatga 4852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3304
Alignment:
Q  24 ctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactt 123  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| | || ||| || |||||||||||| ||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  124 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 223  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  224 ga 225  Q
    ||    
T  3303 ga 3304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 32863 - 33074
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaatatg-tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32863 tgttagttataatctgtgaagctattt--tatgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaa 32959  T
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32960 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 33058  T
Q  210 ttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  33059 ttgatgaagatgatga 33074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46142 - 45931
Alignment:
Q  11 tgttaattataatctgtgaagctgtttaatatg-tgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  |||| || |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  46142 tgttagttataatctgtgaagctattt--tatgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaa 46046  T
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46045 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 45947  T
Q  210 ttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  45946 ttgatgaagatgatga 45931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16116
Alignment:
Q  17 ttataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | || ||| || ||||| ||    
T  16323 ttataatctgtgaagctgtttta-agatgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg 16225  T
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    ||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16224 ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16125  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  16124 agatgatga 16116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17447
Alignment:
Q  167 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 17447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 339844 - 340065
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | ||    
T  339844 ttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatg 339943  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
     ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  339944 tatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcatgagt 340040  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  340041 cggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagta-taattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| | || ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21138 - 20917
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | | |||    
T  21138 ttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttg 21039  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||    
T  21038 aatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgag 20939  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    || |||||||| | ||||||||    
T  20938 tcggtctaagtcgttgaagatg 20917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32285 - 32070
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  32285 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacc 32187  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32186 taagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 32089  T
Q  207 aagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  32088 aagttgttgaagatgatga 32070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 15370 - 15581
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |  |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||  |||  |||||    
T  15370 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaatatttttatacataaga 15468  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15469 tgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15567  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  15568 gttgaagatgatga 15581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7464 - 7295
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||| ||| |||||  |||| | ||    
T  7464 ttgaatatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat--catgattgt 7369  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  7368 tgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4932 - 4715
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| |||      
T  4932 atgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtataca 4834  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4833 taagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 4734  T
Q  207 aagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  4733 aagttgttgaagatgatga 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 1
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||| |||      
T  156 atgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaatatttgtataca 58  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 163  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  57 taagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2179 - 1955
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||| | |||| | ||||| ||| ||||||| ||  || ||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||  ||  |||    
T  2179 ttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttg 2080  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2079 aatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgagt 1980  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||| || ||||||||||||    
T  1979 cggtctaagatgttgaagatgatga 1955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13716 - 13500
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  13716 atgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 13618  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13617 taagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 13519  T
Q  207 aagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  13518 aagttgttgaagttgatga 13500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 10331 - 10541
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  10331 gttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaaga 10429  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10430 tgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagt 10526  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||||    
T  10527 tgttgaagatgatga 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  2 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 165  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28544 - 28417
Alignment:
Q  98 ttgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 197  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28544 ttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 28445  T
Q  198 agtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28444 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 28417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11295
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  11308 gttgaagatgatga 11295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 2000
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2014  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  2013 gttgaagatgatga 2000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4555
Alignment:
Q  175 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 4555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  65 gatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 163  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg- 44516  T
Q  164 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 101 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 100501 - 100378
Alignment:
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 199  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  100501 aatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 100403  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    || |||||||||||||| |||||||    
T  100402 tcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 38424 - 38596
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||  | |||||| ||||    
T  38424 ttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgtt 38523  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  38524 gttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 40169 - 40291
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40169 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagt 40267  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  40268 cagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119878
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 119878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 136
Target Start/End: Original strand, 23611 - 23695
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatatta 136  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  23611 ttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28057 - 27911
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  28057 ttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatg 27958  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgc 147  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27957 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 124812 - 124675
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  124812 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttg 124713  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatt 138  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||    
T  124712 aatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 174941 - 174769
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgt-gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  174941 ttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgt 174842  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  174841 t---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatga 174769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121769
Alignment:
Q  159 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 136468  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  136469 aag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 145176  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  145177 aag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128754
Alignment:
Q  61 atgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatga 128754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 20477  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20478 g-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65891
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13392
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13454 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 62321 - 62201
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||   |||| | |||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  62321 atatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagt 62226  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||| || || ||||||||    
T  62225 cggtttaagtcgaagatgatgatga 62201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 132745 - 132662
Alignment:
Q  142 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  132745 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10777
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10835 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16846 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 213
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22776
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  201 cagtctaagttga 213  Q
    | |||||||||||    
T  22764 cggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 85579 - 85742
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85579 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 85678  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  85679 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 160809 - 160688
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  160809 atatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagt 160712  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  160711 cggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 857 - 1021
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||| ||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  857 ttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattg 956  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 169  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  957 aatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4951
Alignment:
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 4951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4742 - 4545
Alignment:
Q  9 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatattta 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4742 gatgttaattataatttgtgaggctgtttta-agatgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatattta 4644  T
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4643 agatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Original strand, 952 - 1167
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||      
T  952 atgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 1050  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1051 taagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtc 1147  T
Q  206 taagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  1148 taagatgttgaagatgatga 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4359 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 201
Target Start/End: Original strand, 6281 - 6402
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||  || |||||||||||| | || ||| |||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  6281 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagaagttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 6379  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  6380 tatttaactaagttgcatgagtc 6402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16506 - 16285
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |||    
T  16506 ttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 16408  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgag 199  Q
     |||  ||| |||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16407 tatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgag 16311  T
Q  200 tcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||| || ||||||||||||    
T  16310 tcggtctaagatgttgaagatgatga 16285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| | ||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11292
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatg 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  168 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12407
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| || |  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  12349 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 12407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9246
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9304 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46998
Alignment:
Q  18 tataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| |  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||| |||  ||||||||||     
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttga 47104  T
Q  118 tgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  47103 tgaattgaaattgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttga 47007  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    |||||||||    
T  47006 agatgatga 46998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6837 - 6669
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattg 100  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||  || ||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||  ||  |||    
T  6837 ttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttg 6738  T
Q  101 aatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6737 aatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  82 attacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 181  Q
    |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  182 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 128971 - 129072
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  128971 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtct 129069  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  129070 aag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 78442 - 78328
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  78442 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T
Q  206 taagttg-atgaagatg 221  Q
     ||| || |||||||||    
T  78344 caagatgaatgaagatg 78328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  63 gtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     |||||| | || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29994 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1507 - 1292
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  1507 atgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 1409  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1408 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1312  T
Q  206 taagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  1311 taagatgttgaagatgatga 1292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7484 - 7269
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 106  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||      
T  7484 atgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 7386  T
Q  107 taagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7385 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7289  T
Q  206 taagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  7288 taagatgttgaagatgatga 7269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  162 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | || ||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 222
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11558
Alignment:
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  206 taagttgatgaagatga 222  Q
    ||||||| |||||||||    
T  11542 taagttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 11407 - 11450
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgt 44  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11407 ttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgtt--atgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtc 143  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||  || | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  144 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6538
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatga 6538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 161049 - 161252
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttg 119  Q
    ||||||||||||| || || |||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || |||||||| |||    
T  161049 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatattg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 161147  T
Q  120 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  161148 acttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaaga 161246  T
Q  220 tgatga 225  Q
    ||||||    
T  161247 tgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 164590 - 164674
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  164590 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51795 - 51585
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| | |||| ||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||| |||  |||||    
T  51795 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttgaaggatatttgtatacataaga 51697  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||| ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  51696 tgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 51600  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    || |||| |||||||    
T  51599 tgttgaaaatgatga 51585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18141
Alignment:
Q  13 ttaattataatctgtgaagctgtttaat-atgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    ||||| || ||||||||||||| || || |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| || || || ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18032 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T
Q  211 tgatgaagatg 221  Q
     | ||||||||    
T  18131 cgttgaagatg 18141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 2184 - 2291
Alignment:
Q  117 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  2184 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgatta 2282  T
Q  217 agatgatga 225  Q
    | |||||||    
T  2283 aaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 222
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 160  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 222  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53651
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53588 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaata-tttaagatgttgttg 119  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||  ||| |||||||||||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  120 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16206
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttga 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   |||| ||| ||||||||||||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  121 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
     || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  22 atctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttga 120  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  121 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 213  Q
     || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3708 - 3640
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatat 69  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3708 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7772 - 7704
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatat 69  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7772 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5246
Alignment:
Q  12 gttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 111  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||| || ||||| | ||||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  ||| |||  |||||    
T  5036 gttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataaga 5134  T
Q  112 tgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 210  Q
    ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5135 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 5231  T
Q  211 tgatgaagatgatga 225  Q
    || ||||||||||||    
T  5232 tgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11471
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  11546 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatg 11471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38370
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |||| |    ||||||||||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 221  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  38295 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatg 38370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  59 tgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat--ttaagatgttgttgac-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  156 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    ||  || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  53 tgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatt-gaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 179  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 4749 - 4921
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||| | |||| ||||||    
T  4749 ttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgtt 4848  T
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
     ||||   ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  4849 gttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 225
Target Start/End: Original strand, 38657 - 38820
Alignment:
Q  62 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 161  Q
    |||||||||||  |||  ||| |||||||| ||||  | ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  38657 tgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 38755  T
Q  162 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  38756 gtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | ||||||| |||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 202
Target Start/End: Original strand, 16294 - 16443
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||  |||||||||||||||  |  |||||||||||| | |||||| ||||    
T  16294 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaat-taattgatattatgaagtcatgatgtt 16392  T
Q  152 tttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
     |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16393 gttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtca 16443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 51833 - 51985
Alignment:
Q  56 ttatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatg-ttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  51833 ttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattattatgtcttgctattttt 51930  T
Q  155 gtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    | || ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51931 gaatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32654 - 32541
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  32654 agatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 32557  T
Q  208 agttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  32556 agttga--aagatgatga 32541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Original strand, 60614 - 60810
Alignment:
Q  7 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatat 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| | || |||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  60614 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 60713  T
Q  106 ttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat--gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  60714 ttgagatgttgttgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 60810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  201 cagtctaagttgatga 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15664
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  15677 gattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  201 cagtctaagttgatga 216  Q
    | ||||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  146 --gctgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
      ||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  8098 gagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1141 - 1052
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 90  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1141 ttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Original strand, 6121 - 6241
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||| ||||||  ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6121 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6219  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  6220 tctaagttgattaagatgatga 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||| | | | |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  201 cagtctaag 209  Q
    | |||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 213
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10647
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  201 cagtctaagttga 213  Q
    | |||||||||||    
T  10635 cggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12749 - 12587
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| | ||||||| ||| ||||  | | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12749 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 12651  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12650 gctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Original strand, 192919 - 193074
Alignment:
Q  51 attgattatgatgtgatataatgttatg-tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg 149  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  | ||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||| || ||  || ||||||| |||||||||| ||    
T  192919 attgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatg 193017  T
Q  150 tttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    || |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  193018 ttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtc 193074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  201 cagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24018 - 23843
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg----acttgcaattgatattattatgtcatgc 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||  || |||||||| ||    | |||  |||| ||| || ||||||| |    
T  24018 ttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctgttttatttgatattgttat-atgatgtcatac 23920  T
Q  148 tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23919 tgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10390 - 10323
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttgatattgattatgatgtgata 68  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10390 ttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6614
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13994
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15895
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 225
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1187
Alignment:
Q  113 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 211  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1173  T
Q  212 gatgaagatgatga 225  Q
    | ||||||||||||    
T  1174 gttgaagatgatga 1187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4321
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 224
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12943
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  12963 tctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 224
Target Start/End: Original strand, 45794 - 45909
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45794 agatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45892  T
Q  208 agttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||||||    
T  45893 agttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 225
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1152
Alignment:
Q  157 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12889 - 12769
Alignment:
Q  105 tttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  12889 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  204 tctaagttgatgaagatgatga 225  Q
    |||||||||||||  |||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatga 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 23927 - 24000
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 225588 - 225465
Alignment:
Q  46 ttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 145  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||     
T  225588 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcac 225490  T
Q  146 gctgtttttgtatactgcctatgttg 171  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  225489 gctg-ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtct 8173  T
Q  207 aagttga 213  Q
    |||||||    
T  8174 aagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 137
Target Start/End: Original strand, 1172 - 1257
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattat 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  1172 ttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattatttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattat 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  152 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8134 - 8090
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttt 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  8134 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 897
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  1041 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 943  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  942 tattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1974 - 1830
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||  ||||    
T  1974 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgt 1876  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  1875 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 1830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 207  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  208 agttga 213  Q
    ||||||    
T  10547 agttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17881 - 17929
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaatatgtgttga 49  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17881 ttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25226 - 25121
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  25226 agatgttgttgatttgca-ttgatatcgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 25129  T
Q  206 taagttga 213  Q
    ||||||||    
T  25128 taagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26997 - 26851
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||| | ||    
T  26997 ttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataattat--catgattgt 26902  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    | |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26901 tgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtc 26851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32197 - 32102
Alignment:
Q  130 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  32197 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  161 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 202
Target Start/End: Original strand, 46671 - 46821
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgt 150  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| | || ||||| |    
T  46671 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaagttatgctat 46769  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    | ||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  46770 tgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtca 46821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  167 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  57 tatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttg 155  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 1950  T
Q  156 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 44225 - 44081
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    |||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  44225 tgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 44127  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  44126 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Original strand, 6284 - 6386
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  6284 agatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtc 6382  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  6383 taag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38343
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtc 38343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  139 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 569
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  669 gatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 572  T
Q  207 aag 209  Q
    |||    
T  571 aag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 201
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206618
Alignment:
Q  158 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 206618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 21751 - 21920
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  21751 ttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 21846  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  21847 tgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 29643 - 29812
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgct-gt 150  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||  |||| | ||    
T  29643 ttgattaagatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgattgt 29738  T
Q  151 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    | |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  29739 tgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 97126 - 97024
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||  |||    
T  97126 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 97028  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  97027 taag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 106404 - 106302
Alignment:
Q  109 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 205  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||  |||    
T  106404 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 106306  T
Q  206 taag 209  Q
    ||||    
T  106305 taag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 20630 - 20595
Alignment:
Q  1 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 36  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20630 ttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5038
Alignment:
Q  163 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtca 5038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 17055 - 17205
Alignment:
Q  52 ttgattatgatgtgatataatg-ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtt-gacttgcaattgatattattatgtcatgctg 149  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||  || |||||||||||| | || ||||||    
T  17055 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaagatgttgttggaaatg-aattgatattatgaagttatgctg 17153  T
Q  150 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 201  Q
    ||  |||   |||  |||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17154 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagtc 17205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 103632 - 103737
Alignment:
Q  110 gatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgc--tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcagtct 206  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  103632 gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttt-tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtct 103730  T
Q  207 aagttga 213  Q
    |||||||    
T  103731 aagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 171
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2281
Alignment:
Q  102 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 171  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  2213 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7365
Alignment:
Q  165 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 7365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 13153 - 13092
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattat 140  Q
    |||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13153 tgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 215
Target Start/End: Original strand, 6387 - 6522
Alignment:
Q  79 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 178  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||| |  | ||||| || ||||   || |||||| |||| ||||    
T  6387 tgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctatgctgctattgt 6485  T
Q  179 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 215  Q
    |||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||    
T  6486 tatttaactatgttgcatgagtcattataagatgatg 6522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14728 - 14664
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  14728 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23743 - 23679
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23743 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39167 - 39103
Alignment:
Q  160 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 224  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  39167 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 682 times since January 2019
Visitors: 2783