View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0321_low_18 (Length: 247)

Name: NF0321_low_18
Description: NF0321
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0321_low_18
NF0321_low_18
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (1-168)||(25426628-25426795)
chr5 (1-168)||(12374-12541)
chr5 (1-168)||(18778077-18778244)
chr5 (1-168)||(19499899-19500066)
chr5 (1-168)||(21073680-21073847)
chr5 (1-168)||(22366566-22366733)
chr5 (1-168)||(43443480-43443647)
chr5 (4-168)||(27009841-27010005)
chr5 (1-168)||(4200070-4200237)
chr5 (4-168)||(23506965-23507128)
chr5 (12-168)||(27182655-27182810)
chr5 (5-168)||(22053934-22054096)
chr5 (5-168)||(18531168-18531330)
chr5 (4-116)||(29188372-29188483)
chr5 (71-157)||(34939289-34939375)
chr5 (124-164)||(29190482-29190522)
chr5 (127-168)||(17471803-17471844)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (1-168)||(222776-222943)
chr8 (1-168)||(736399-736566)
chr8 (1-168)||(860294-860461)
chr8 (1-168)||(30120722-30120889)
chr8 (4-168)||(21852053-21852217)
chr8 (4-168)||(21844660-21844824)
chr8 (1-168)||(16674477-16674644)
chr8 (4-168)||(43373568-43373731)
chr8 (4-169)||(16193816-16193980)
chr8 (4-164)||(6774346-6774505)
chr8 (4-164)||(24548986-24549145)
chr8 (12-157)||(24928899-24929043)
chr8 (1-40)||(691931-691970)
chr8 (62-168)||(16405129-16405235)
chr8 (11-168)||(22907321-22907476)
chr8 (5-157)||(17345581-17345731)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (1-168)||(25175563-25175730)
chr6 (1-168)||(27654068-27654235)
chr6 (1-168)||(16825839-16826006)
chr6 (4-164)||(14626218-14626377)
chr6 (12-157)||(23153458-23153602)
chr6 (4-164)||(1650193-1650352)
chr6 (5-157)||(1657849-1657999)
chr6 (124-168)||(35009658-35009702)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-168)||(19886746-19886913)
chr2 (10-168)||(17396758-17396916)
chr2 (12-168)||(19794812-19794967)
chr2 (4-163)||(462743-462901)
chr2 (12-168)||(8891242-8891397)
chr2 (4-168)||(36982541-36982704)
chr2 (4-168)||(20627413-20627576)
chr2 (12-168)||(43643065-43643220)
chr2 (4-168)||(7507944-7508107)
chr2 (5-168)||(24341490-24341652)
chr2 (127-168)||(25265612-25265653)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (1-168)||(47357654-47357821)
chr4 (4-168)||(10644219-10644383)
chr4 (4-160)||(13048321-13048477)
chr4 (12-168)||(13246430-13246585)
chr4 (15-168)||(54118355-54118507)
chr4 (71-168)||(111395-111492)
chr4 (5-168)||(15675190-15675352)
chr4 (5-168)||(31115629-31115791)
chr4 (4-168)||(26680201-26680363)
chr4 (124-168)||(10104450-10104494)
chr4 (4-68)||(121989-122052)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (1-168)||(10989410-10989576)
chr7 (1-168)||(2437457-2437624)
chr7 (4-168)||(13572676-13572840)
chr7 (1-168)||(13911109-13911277)
chr7 (4-162)||(25292438-25292595)
chr7 (10-168)||(18253941-18254098)
chr7 (12-168)||(13037122-13037277)
chr7 (4-166)||(16211768-16211929)
chr7 (4-168)||(36052667-36052827)
chr7 (4-168)||(3059966-3060129)
chr7 (12-163)||(11580847-11580997)
chr7 (4-168)||(16479050-16479213)
chr7 (4-168)||(47481131-47481294)
chr7 (11-168)||(7293017-7293172)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-168)||(36093-36260)
scaffold0023 (10-168)||(48598-48755)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (4-168)||(42997-43161)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (1-168)||(41270075-41270242)
chr3 (1-168)||(55316219-55316386)
chr3 (4-168)||(16821139-16821303)
chr3 (10-168)||(13975827-13975985)
chr3 (10-168)||(45860805-45860963)
chr3 (10-168)||(13954995-13955153)
chr3 (10-168)||(14842667-14842824)
chr3 (10-168)||(15936733-15936890)
chr3 (10-165)||(15938575-15938729)
chr3 (4-169)||(51158118-51158282)
chr3 (12-168)||(15859132-15859287)
chr3 (4-168)||(2049810-2049973)
chr3 (4-168)||(12030247-12030410)
chr3 (4-164)||(15614838-15614997)
chr3 (12-157)||(13838905-13839049)
chr3 (4-168)||(17912582-17912744)
chr3 (55-168)||(47984650-47984763)
chr3 (55-168)||(47993937-47994050)
chr3 (55-168)||(48003224-48003337)
chr3 (55-168)||(48012510-48012623)
chr3 (127-168)||(15468555-15468596)
chr3 (124-168)||(16744333-16744377)
chr3 (127-168)||(22275209-22275250)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (1-168)||(5072473-5072640)
chr1 (1-168)||(18601203-18601370)
chr1 (4-168)||(22227809-22227972)
chr1 (4-168)||(22232506-22232669)
chr1 (1-168)||(20931345-20931511)
chr1 (1-168)||(20913037-20913196)
chr1 (12-168)||(20893734-20893889)
chr1 (4-168)||(41394222-41394385)
chr1 (4-164)||(2116258-2116418)
chr1 (55-168)||(37844601-37844714)
chr1 (12-168)||(20445679-20445834)
chr1 (12-168)||(20531444-20531599)
chr1 (4-102)||(45051489-45051586)
chr1 (124-164)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (4-168)||(64616-64780)
scaffold0026 (7-168)||(107747-107907)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (4-168)||(35-199)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-168)||(31760-31928)
scaffold0008 (59-168)||(128323-128431)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (4-168)||(21204-21367)
scaffold0139 (4-168)||(14149-14312)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (4-144)||(5552-5692)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (10-168)||(3722-3879)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (4-168)||(1124-1287)
scaffold0266 (4-166)||(3682-3843)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (4-168)||(5304-5466)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (5-168)||(8878-9040)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (10-168)||(12115-12270)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-168)||(48187-48344)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (4-168)||(6164-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (4-168)||(1056-1218)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (62-168)||(9-115)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (4-168)||(148721-148884)
scaffold0025 (5-168)||(8849-9011)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (62-168)||(48514-48620)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (4-168)||(5161-5324)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (12-157)||(247550-247694)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (4-164)||(9437-9596)
scaffold0215 (4-164)||(16335-16494)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (4-168)||(19206-19369)
scaffold0195 (4-168)||(21290-21453)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (4-168)||(26515-26678)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (4-168)||(37013-37176)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (12-168)||(123272-123427)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (12-157)||(171916-172060)
scaffold0001 (12-157)||(177619-177763)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (12-162)||(272031-272180)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (71-168)||(9382-9479)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (4-164)||(41733-41892)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (1-62)||(1389-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (12-168)||(642-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (55-168)||(34610-34724)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (5-164)||(2966-3125)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (124-168)||(41648-41692)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (124-168)||(37284-37328)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (112-166)||(3210-3264)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25426795 - 25426628
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426795 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 25426696  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426695 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12541 - 12374
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541 catatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 12442  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12441 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 18778077 - 18778244
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778077 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 18778176  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778177 atgaatattatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19500066 - 19499899
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500066 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 19499967  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499966 atgaatgttatttgatattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 21073680 - 21073847
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073680 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 21073779  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073780 atcaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 22366566 - 22366733
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22366566 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgtt 22366665  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366666 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 43443480 - 43443647
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43443480 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgtt 43443579  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443580 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27010005 - 27009841
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27010005 atatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 27009906  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009905 aatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 4200070 - 4200237
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  4200070 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 4200169  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200170 atgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23507128 - 23506965
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23507128 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 23507030  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507029 gttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 27182655 - 27182810
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  27182655 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaa 27182753  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182754 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Original strand, 22053934 - 22054096
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 104  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||      
T  22053934 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 22054032  T
Q  105 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054033 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Original strand, 18531168 - 18531330
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 104  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||      
T  18531168 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 18531266  T
Q  105 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531267 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 116
Target Start/End: Original strand, 29188372 - 29188483
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  29188372 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatg 29188470  T
Q  104 aatgttatttgat 116  Q
      ||||| |||||    
T  29188471 gttgttaattgat 29188483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34939375 - 34939289
Alignment:
Q  71 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 157  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939375 ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 164
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  124 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  127 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 222776 - 222943
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222776 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 222875  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222876 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 736399 - 736566
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736399 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 736498  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736499 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 860294 - 860461
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860294 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 860393  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860394 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30120889 - 30120722
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  30120889 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 30120790  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120789 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 21852053 - 21852217
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21852053 atatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatg 21852152  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852153 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 21844660 - 21844824
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21844660 atatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatg 21844759  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844760 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 16674477 - 16674644
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16674477 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgtt 16674576  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674577 atgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 43373568 - 43373731
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  43373568 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatg 43373666  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373667 gttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 16193816 - 16193980
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||  || || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  16193816 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaaa-ttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 16193914  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 169  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193915 gttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 6774346 - 6774505
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||     
T  6774346 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatt 6774444  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
      ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774445 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24549145 - 24548986
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  24549145 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatg 24549047  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549046 gttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Original strand, 24928899 - 24929043
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||| | |||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  |||||     
T  24928899 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttcgc-taagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaa 24928997  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 157  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24928998 ttgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 691931 - 691970
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691931 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 168
Target Start/End: Original strand, 16405129 - 16405235
Alignment:
Q  62 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 161  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||    
T  16405129 gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaatt 16405228  T
Q  162 gatgatg 168  Q
    |||||||    
T  16405229 gatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 22907321 - 22907476
Alignment:
Q  11 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| ||    
T  22907321 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgcta 22907418  T
Q  111 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907419 atagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17345731 - 17345581
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 104  Q
    |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||      
T  17345731 tatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaatt-gagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  105 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 157  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25175730 - 25175563
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175730 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 25175631  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175630 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 27654068 - 27654235
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27654068 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgtt 27654167  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654168 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 16825839 - 16826006
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825839 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 16825938  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825939 atgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 14626218 - 14626377
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  ||||||||  | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  14626218 atatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattggtgaatta-tgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatg 14626316  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626317 gttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23153602 - 23153458
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||     
T  23153602 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaa 23153504  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 157  Q
    ||||| || || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153503 ttgatgttgtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 1650193 - 1650352
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||     
T  1650193 atatgtaagaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatt 1650291  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
      ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650292 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Original strand, 1657849 - 1657999
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 104  Q
    |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||      
T  1657849 tatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaatt-gagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  105 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 157  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Original strand, 35009658 - 35009702
Alignment:
Q  124 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009658 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 19886746 - 19886913
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886746 catatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 19886845  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886846 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 17396758 - 17396916
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17396758 aaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 17396857  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396858 atttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 19794812 - 19794967
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    ||||     
T  19794812 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaa 19794910  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794911 ttgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 462901 - 462743
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  462901 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 462803  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 163  Q
      ||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462802 gctgttaattgatgtcgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8891397 - 8891242
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||     
T  8891397 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaa 8891299  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891298 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 36982541 - 36982704
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||  || ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  36982541 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcc-aagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 36982639  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982640 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 20627413 - 20627576
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  20627413 atatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatg 20627511  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||| | || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627512 gttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 43643065 - 43643220
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| || || |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||   |||||     
T  43643065 aaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttctta-gttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaa 43643163  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643164 ttgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 7507944 - 7508107
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaat-gatgttat 102  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||  | |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||  ||| ||||||||    
T  7507944 atatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttggc-taagttgttgttaatt-gagatatgattcatgttttaattgatgttat 7508041  T
Q  103 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508042 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Original strand, 24341490 - 24341652
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 104  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||      
T  24341490 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 24341588  T
Q  105 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     ||||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341589 ttgttaattgatgttcctgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Original strand, 25265612 - 25265653
Alignment:
Q  127 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265612 atgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47357821 - 47357654
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357821 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 47357722  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357721 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10644383 - 10644219
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10644383 atatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatg 10644284  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644283 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 160
Target Start/End: Original strand, 13048321 - 13048477
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 160  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13246585 - 13246430
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  13246585 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaa 13246487  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246486 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 54118355 - 54118507
Alignment:
Q  15 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 114  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| |||    
T  54118355 tgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattg 54118453  T
Q  115 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118454 atgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  71 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Original strand, 15675190 - 15675352
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 104  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||      
T  15675190 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 15675288  T
Q  105 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675289 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31115791 - 31115629
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 104  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| ||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||      
T  31115791 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattg 31115693  T
Q  105 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115692 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26680363 - 26680201
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  124 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 122052 - 121989
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgtta 68  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122052 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10989576 - 10989410
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989576 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgt-aatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 10989478  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989477 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2437624 - 2437457
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2437624 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgtt 2437525  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437524 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13572840 - 13572676
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13572840 atatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13572741  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572740 aatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 13911109 - 13911277
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaa-gttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  13911109 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 13911208  T
Q  100 tatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911209 tatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Original strand, 25292438 - 25292595
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 162  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 18253941 - 18254098
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18253941 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtt 18254039  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254040 aattgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 13037122 - 13037277
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||     
T  13037122 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaa 13037220  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037221 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16211929 - 16211768
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  16211929 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatg 16211831  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 166  Q
      ||||| ||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211830 gttgttaattgatgttgtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36052827 - 36052667
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  36052827 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtg 36052732  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052731 gttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3060129 - 3059966
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3060129 atatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 3060031  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060030 actgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 11580847 - 11580997
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  11580847 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaa 11580945  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 163  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580946 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 16479050 - 16479213
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||     
T  16479050 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatt 16479148  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479149 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 47481131 - 47481294
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7293172 - 7293017
Alignment:
Q  11 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  | |  ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| ||    
T  7293172 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat--gttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgcta 7293075  T
Q  111 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293074 atagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36260 - 36093
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  36260 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgtt 36161  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36160 atgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48755 - 48598
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||    
T  48755 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctatt 48657  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48656 aattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43161 - 42997
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43161 atatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatg 43062  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43061 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41270242 - 41270075
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41270242 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgtt 41270143  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270142 atgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 55316386 - 55316219
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  55316386 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgtt 55316287  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316286 atgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16821303 - 16821139
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16821303 atatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatg 16821204  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821203 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 13975827 - 13975985
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13975827 aaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 13975926  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975927 atttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45860963 - 45860805
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45860963 aaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 45860864  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860863 atttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 13954995 - 13955153
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13954995 aaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 13955094  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955095 atttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 14842667 - 14842824
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14842667 aaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtt 14842765  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842766 aattgatgttatgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 15936733 - 15936890
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15936733 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtt 15936831  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936832 aattgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 15938575 - 15938729
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15938575 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtt 15938673  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 165  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938674 aattgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 51158118 - 51158282
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51158118 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 51158216  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 169  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158217 gctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 15859132 - 15859287
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  15859132 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaa 15859230  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15859231 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2049973 - 2049810
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  2049973 atatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatg 2049875  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049874 gttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 12030247 - 12030410
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12030247 atatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatg 12030345  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030346 gttgttaattgatgttatggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15614997 - 15614838
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  15614997 atatgtaaaaatgataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatg 15614899  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614898 gttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13839049 - 13838905
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  13839049 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaa 13838951  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 157  Q
    ||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838950 ttgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 17912582 - 17912744
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||    || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttga--tatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  55 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 154  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  155 atggattgatgatg 168  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  55 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 154  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  155 atggattgatgatg 168  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  55 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 154  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  155 atggattgatgatg 168  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  55 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 154  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  155 atggattgatgatg 168  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  127 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Original strand, 16744333 - 16744377
Alignment:
Q  124 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744333 ttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  127 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 5072473 - 5072640
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5072473 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgtt 5072572  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072573 atgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 18601203 - 18601370
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18601203 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgtt 18601302  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601303 atgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22227972 - 22227809
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  22227972 atatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 22227874  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227873 aatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22232669 - 22232506
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  22232669 atatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 22232571  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232570 aatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20931511 - 20931345
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  20931511 catatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgtt 20931413  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||  ||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931412 atggttgttaattgatgttgtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20913196 - 20913037
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||    
T  20913196 catatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatttga-------ttcttgttcaattgatgtt 20913105  T
Q  101 atgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||  ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913104 atggttgttaattgatcttgtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 20893734 - 20893889
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  20893734 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaa 20893832  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893833 ttgatgttgtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41394385 - 41394222
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||     
T  41394385 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttatt 41394287  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||||||||| || |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394286 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2116418 - 2116258
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgag-ttgtgattcttgttcaaatgatgttat 102  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||    
T  2116418 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttat 2116320  T
Q  103 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
    |  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116319 ggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Original strand, 37844601 - 37844714
Alignment:
Q  55 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 154  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37844601 ctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcattgcttgggtatgcatattc 37844700  T
Q  155 atggattgatgatg 168  Q
    ||| ||||| ||||    
T  37844701 atgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20445834 - 20445679
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||     
T  20445834 aaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaa 20445736  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445735 ttgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20531599 - 20531444
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||     
T  20531599 aaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaa 20531501  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531500 ttgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 45051586 - 45051489
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 102  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051586 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  124 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 64616 - 64780
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  64616 atatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 64715  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64716 aatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 107907 - 107747
Alignment:
Q  7 tgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaat 106  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  107907 tgcaaaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggat 107809  T
Q  107 gttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107808 gttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 199 - 35
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  199 atatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 100  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  99 aatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 31760 - 31928
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaa-gttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  31760 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgt 31859  T
Q  100 tatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31860 tatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 168
Target Start/End: Original strand, 128323 - 128431
Alignment:
Q  59 gttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgg 158  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  128323 gttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataattgattgggtatgcatattcatga 128421  T
Q  159 attgatgatg 168  Q
    ||||||||||    
T  128422 attgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 21204 - 21367
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21204 atatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatg 21302  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21303 aatgttatttgatgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 14149 - 14312
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||    
T  14149 atatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatg 14247  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14248 aatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5692 - 5552
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5692 atatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 5593  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 144  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5592 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3879 - 3722
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||   ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3879 aaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgtt 3781  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3780 aattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatattcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1287 - 1124
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  1287 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 1189  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1188 gttgttaattgatattgtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 166
Target Start/End: Original strand, 3682 - 3843
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  3682 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 3780  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 166  Q
     |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3781 gatgttaattgatgttgtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 5304 - 5466
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  5304 atatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 5402  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5403 aatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattcatggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9040 - 8878
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 104  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||     
T  9040 tatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgg 8942  T
Q  105 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8941 atgttaattgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12270 - 12115
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12270 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgtaa--ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgtt 12174  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12173 aattgatgttatgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48344 - 48187
Alignment:
Q  10 aaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtt 109  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  48344 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtt 48246  T
Q  110 atttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48245 aattgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6326
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||| ||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  6164 atatgtaaaaataataagttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaagtgatgttatg 6261  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6262 gatgttaatttttgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 1056 - 1218
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  1056 atatgtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaatt-gagattttattcttgttcaagtgatgttatg 1153  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 gatgttaatttatgttatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 168
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  62 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 161  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  162 gatgatg 168  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 148884 - 148721
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  148884 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatg 148786  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148785 gttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9011 - 8849
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 104  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||      
T  9011 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattg 8913  T
Q  105 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
     | ||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8912 ctattaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  62 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 161  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  162 gatgatg 168  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 5161 - 5324
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5161 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 5259  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5260 gctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Original strand, 247550 - 247694
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  247550 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaa 247648  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 157  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247649 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 9437 - 9596
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9437 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatg 9535  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9536 gttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Original strand, 16335 - 16494
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  16335 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatg 16433  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16434 gttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19369 - 19206
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  19369 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 19271  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19270 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21453 - 21290
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 26515 - 26678
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26515 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatg 26613  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26614 gctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Original strand, 37013 - 37176
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  37013 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatg 37111  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
      ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37112 gctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 123272 - 123427
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  123272 aaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaa 123370  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123371 ttgatgttgtggttgatgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 172060 - 171916
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  172060 aaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaa 171962  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 157  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171961 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 177763 - 177619
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  177763 aaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaa 177665  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 157  Q
    ||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177664 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 272180 - 272031
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   |||||     
T  272180 aaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaa 272082  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 162  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272081 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  71 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41892 - 41733
Alignment:
Q  4 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 103  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41892 atatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatg 41794  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
      ||||| ||| | || |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41793 gctgttaattgttgttgtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 1389 - 1450
Alignment:
Q  1 catatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1389 catatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 642 - 797
Alignment:
Q  12 aaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttat 111  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||     
T  642 aaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaa 740  T
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  741 ttgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Original strand, 34610 - 34724
Alignment:
Q  55 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaat-gatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 153  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||  ||| ||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  34610 ctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatatt 34709  T
Q  154 catggattgatgatg 168  Q
    |||||||||||||||    
T  34710 catggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3125 - 2966
Alignment:
Q  5 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaat-gatgttatg 103  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||  ||| ||||||||     
T  3125 tatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 3027  T
Q  104 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 164  Q
      ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3026 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41692 - 41648
Alignment:
Q  124 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41692 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Original strand, 37284 - 37328
Alignment:
Q  124 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 168  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37284 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  112 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 166  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 732 times since January 2019
Visitors: 2786