View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0323_high_5 (Length: 389)

Name: NF0323_high_5
Description: NF0323
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0323_high_5
NF0323_high_5
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (15-371)||(28163959-28164315)
chr6 (15-371)||(29504884-29505240)
chr6 (15-371)||(13520564-13520920)
chr6 (15-370)||(30554389-30554744)
chr6 (15-371)||(14141766-14142122)
chr6 (15-371)||(27626083-27626439)
chr6 (15-371)||(29576482-29576838)
chr6 (15-371)||(34460878-34461234)
chr6 (15-371)||(26789284-26789640)
chr6 (15-371)||(27197653-27198009)
chr6 (15-371)||(27251226-27251582)
chr6 (15-371)||(16677608-16677964)
chr6 (15-371)||(27060974-27061330)
chr6 (15-371)||(27358482-27358838)
chr6 (15-371)||(27448825-27449181)
chr6 (15-371)||(13295323-13295679)
chr6 (15-371)||(24867184-24867540)
chr6 (15-371)||(27011199-27011555)
chr6 (15-371)||(27022604-27022960)
chr6 (15-371)||(3699551-3699907)
chr6 (15-371)||(4761231-4761587)
chr6 (15-371)||(16753289-16753645)
chr6 (15-371)||(26774999-26775355)
chr6 (15-371)||(29553025-29553381)
chr6 (15-371)||(33372803-33373159)
chr6 (15-371)||(4776348-4776704)
chr6 (15-371)||(22931256-22931612)
chr6 (15-371)||(23853701-23854057)
chr6 (15-371)||(26921845-26922201)
chr6 (25-371)||(8902075-8902421)
chr6 (15-371)||(4528753-4529109)
chr6 (15-371)||(27286736-27287092)
chr6 (15-371)||(27488601-27488957)
chr6 (15-360)||(27179924-27180269)
chr6 (15-360)||(27268970-27269315)
chr6 (15-371)||(15420692-15421048)
chr6 (15-371)||(26112784-26113140)
chr6 (15-371)||(28210922-28211278)
chr6 (15-370)||(16940400-16940755)
chr6 (15-371)||(4720507-4720863)
chr6 (15-371)||(4542146-4542502)
chr6 (15-371)||(17088815-17089171)
chr6 (70-371)||(24302129-24302430)
chr6 (37-371)||(20172037-20172371)
chr6 (37-371)||(22163620-22163954)
chr6 (17-247)||(22455610-22455840)
chr6 (225-371)||(15408905-15409051)
chr6 (15-148)||(26992263-26992396)
chr6 (21-303)||(23971210-23971492)
chr6 (39-298)||(18119961-18120220)
chr6 (39-298)||(18212114-18212373)
chr6 (21-298)||(9135798-9136075)
chr6 (39-301)||(27545394-27545656)
chr6 (41-301)||(25707505-25707765)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (15-371)||(18497051-18497407)
chr5 (15-371)||(3793019-3793375)
chr5 (15-371)||(9320954-9321310)
chr5 (15-371)||(8661801-8662157)
chr5 (15-371)||(12135653-12136009)
chr5 (15-371)||(24586852-24587208)
chr5 (15-371)||(26483872-26484228)
chr5 (15-371)||(30155509-30155865)
chr5 (15-371)||(33878608-33878964)
chr5 (15-370)||(33519858-33520213)
chr5 (15-371)||(40469876-40470232)
chr5 (15-371)||(43081733-43082089)
chr5 (15-371)||(28652720-28653076)
chr5 (15-367)||(37758461-37758813)
chr5 (15-371)||(11552833-11553189)
chr5 (15-371)||(29887523-29887879)
chr5 (15-371)||(30171947-30172303)
chr5 (15-371)||(33296006-33296362)
chr5 (16-371)||(34619997-34620352)
chr5 (15-371)||(23629448-23629804)
chr5 (15-367)||(24727447-24727799)
chr5 (15-367)||(30032906-30033258)
chr5 (15-371)||(30938113-30938469)
chr5 (15-367)||(18371864-18372216)
chr5 (15-371)||(22995443-22995799)
chr5 (15-371)||(31434942-31435298)
chr5 (15-371)||(37767317-37767673)
chr5 (15-371)||(9547035-9547391)
chr5 (15-371)||(24973384-24973740)
chr5 (15-371)||(25203756-25204112)
chr5 (15-371)||(25267911-25268267)
chr5 (15-371)||(28956111-28956467)
chr5 (25-371)||(11327125-11327471)
chr5 (15-371)||(6877783-6878139)
chr5 (15-371)||(13321156-13321512)
chr5 (15-371)||(13439009-13439365)
chr5 (15-371)||(18124742-18125098)
chr5 (15-371)||(37667812-37668168)
chr5 (15-367)||(41678183-41678535)
chr5 (15-371)||(33780967-33781319)
chr5 (15-364)||(15655091-15655440)
chr5 (15-371)||(31822733-31823089)
chr5 (15-371)||(2514540-2514896)
chr5 (15-371)||(13183119-13183475)
chr5 (15-371)||(32592600-32592956)
chr5 (15-371)||(37354969-37355325)
chr5 (15-370)||(5641266-5641621)
chr5 (15-367)||(15755182-15755534)
chr5 (18-370)||(22891944-22892296)
chr5 (15-145)||(24684697-24684827)
chr5 (21-298)||(11943821-11944098)
chr5 (39-298)||(3483602-3483861)
chr5 (21-300)||(34469106-34469385)
chr5 (21-298)||(5439624-5439901)
chr5 (21-298)||(15784124-15784401)
chr5 (21-298)||(17957581-17957858)
chr5 (21-298)||(31520791-31521068)
chr5 (21-298)||(36375361-36375638)
chr5 (21-298)||(37000015-37000292)
chr5 (15-303)||(351609-351897)
chr5 (39-241)||(20388445-20388647)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (15-371)||(5009359-5009715)
chr4 (15-371)||(40102066-40102422)
chr4 (15-370)||(21973185-21973540)
chr4 (15-370)||(31122942-31123297)
chr4 (15-371)||(27159746-27160102)
chr4 (15-371)||(6573342-6573698)
chr4 (15-371)||(18797043-18797399)
chr4 (15-367)||(14102027-14102379)
chr4 (15-371)||(34185389-34185745)
chr4 (15-371)||(54836875-54837231)
chr4 (15-371)||(17016530-17016886)
chr4 (15-371)||(39854121-39854477)
chr4 (15-371)||(18313607-18313963)
chr4 (15-371)||(24116146-24116502)
chr4 (15-367)||(36340950-36341302)
chr4 (15-370)||(30757244-30757599)
chr4 (15-371)||(1903738-1904094)
chr4 (15-371)||(20334850-20335206)
chr4 (15-371)||(24588790-24589146)
chr4 (16-371)||(15231357-15231712)
chr4 (15-371)||(14668500-14668856)
chr4 (15-344)||(14759762-14760091)
chr4 (15-371)||(33670229-33670585)
chr4 (15-371)||(15281366-15281722)
chr4 (215-371)||(5698219-5698375)
chr4 (14-230)||(15387948-15388164)
chr4 (39-335)||(14725264-14725560)
chr4 (39-298)||(19767847-19768106)
chr4 (225-370)||(15384778-15384923)
chr4 (39-301)||(1881598-1881860)
chr4 (67-300)||(55784668-55784901)
chr4 (15-303)||(22146066-22146354)
chr4 (24-241)||(12515725-12515942)
chr4 (171-241)||(18044699-18044769)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (15-371)||(28112426-28112782)
chr3 (15-371)||(5714505-5714861)
chr3 (15-371)||(5725415-5725771)
chr3 (15-371)||(5766597-5766953)
chr3 (15-371)||(5017146-5017502)
chr3 (15-371)||(32294060-32294416)
chr3 (15-371)||(5592829-5593185)
chr3 (15-367)||(8215167-8215519)
chr3 (15-370)||(18228628-18228983)
chr3 (15-371)||(22384050-22384406)
chr3 (15-371)||(47026885-47027241)
chr3 (15-370)||(51785455-51785810)
chr3 (15-371)||(4627217-4627573)
chr3 (15-371)||(5605786-5606142)
chr3 (15-371)||(6205335-6205691)
chr3 (15-371)||(7076638-7076994)
chr3 (15-371)||(8285942-8286298)
chr3 (15-371)||(20573315-20573671)
chr3 (15-371)||(24331595-24331951)
chr3 (15-371)||(31032708-31033064)
chr3 (15-371)||(4420347-4420703)
chr3 (15-371)||(4725063-4725419)
chr3 (15-371)||(4793107-4793463)
chr3 (15-371)||(8299403-8299759)
chr3 (15-371)||(15737566-15737922)
chr3 (15-371)||(17981421-17981777)
chr3 (15-371)||(18304126-18304482)
chr3 (15-371)||(21678135-21678491)
chr3 (15-371)||(35884198-35884554)
chr3 (15-371)||(4687087-4687443)
chr3 (15-371)||(18334062-18334418)
chr3 (15-371)||(19697922-19698278)
chr3 (15-371)||(29145228-29145584)
chr3 (15-371)||(29661442-29661798)
chr3 (15-367)||(32442583-32442935)
chr3 (15-371)||(11106831-11107187)
chr3 (15-371)||(18054694-18055050)
chr3 (15-371)||(18246173-18246529)
chr3 (15-371)||(18273524-18273880)
chr3 (15-371)||(18288825-18289181)
chr3 (15-371)||(20069472-20069828)
chr3 (15-371)||(28024714-28025070)
chr3 (15-371)||(48469359-48469715)
chr3 (15-371)||(10399576-10399932)
chr3 (15-371)||(15889177-15889533)
chr3 (15-371)||(4343148-4343504)
chr3 (15-371)||(5470420-5470776)
chr3 (15-371)||(28342609-28342965)
chr3 (15-371)||(31960927-31961283)
chr3 (15-371)||(6539214-6539570)
chr3 (18-371)||(7999995-8000348)
chr3 (15-371)||(22867320-22867676)
chr3 (15-371)||(22882379-22882735)
chr3 (18-371)||(10646508-10646861)
chr3 (15-367)||(16620966-16621318)
chr3 (75-371)||(5653577-5653873)
chr3 (15-248)||(17992526-17992759)
chr3 (244-371)||(17973333-17973460)
chr3 (39-335)||(11924866-11925162)
chr3 (21-300)||(20443555-20443834)
chr3 (39-298)||(22959909-22960168)
chr3 (21-298)||(5950347-5950624)
chr3 (39-335)||(7088535-7088831)
chr3 (42-241)||(15918976-15919175)
chr3 (39-298)||(16431861-16432120)
chr3 (21-298)||(6571792-6572069)
chr3 (42-367)||(15592387-15592712)
chr3 (21-298)||(46380772-46381049)
chr3 (21-303)||(15704911-15705193)
chr3 (15-303)||(6962973-6963261)
chr3 (63-298)||(37260254-37260489)
chr3 (171-241)||(4450363-4450433)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (15-371)||(13932965-13933321)
chr2 (15-371)||(27119994-27120350)
chr2 (15-370)||(3785963-3786318)
chr2 (15-371)||(11631602-11631958)
chr2 (15-371)||(19412919-19413275)
chr2 (15-371)||(22924566-22924922)
chr2 (15-371)||(31879756-31880112)
chr2 (15-371)||(37682313-37682669)
chr2 (15-371)||(37697578-37697934)
chr2 (15-371)||(257071-257427)
chr2 (15-371)||(27779704-27780060)
chr2 (15-371)||(27819461-27819817)
chr2 (15-371)||(32053273-32053629)
chr2 (15-371)||(37928839-37929195)
chr2 (15-370)||(16825757-16826112)
chr2 (15-370)||(16895368-16895723)
chr2 (15-367)||(21673597-21673949)
chr2 (15-371)||(31889909-31890265)
chr2 (15-371)||(34158314-34158670)
chr2 (15-371)||(34294624-34294980)
chr2 (15-371)||(27807173-27807529)
chr2 (15-371)||(12590278-12590634)
chr2 (15-371)||(34865154-34865510)
chr2 (15-371)||(39048237-39048593)
chr2 (15-371)||(40236978-40237334)
chr2 (15-371)||(20841383-20841739)
chr2 (15-371)||(12659006-12659362)
chr2 (15-371)||(9346404-9346760)
chr2 (15-371)||(12713019-12713375)
chr2 (15-371)||(21699589-21699945)
chr2 (15-371)||(27430859-27431215)
chr2 (15-367)||(39893539-39893891)
chr2 (15-371)||(23124987-23125342)
chr2 (15-371)||(37948280-37948636)
chr2 (15-371)||(16164950-16165306)
chr2 (15-367)||(37381147-37381499)
chr2 (15-371)||(19452841-19453197)
chr2 (81-371)||(34271338-34271628)
chr2 (14-370)||(27395031-27395387)
chr2 (87-371)||(28885821-28886105)
chr2 (15-214)||(27827930-27828129)
chr2 (15-146)||(28885677-28885808)
chr2 (39-335)||(34701570-34701866)
chr2 (21-300)||(21760104-21760383)
chr2 (39-298)||(42394029-42394288)
chr2 (21-298)||(12384136-12384413)
chr2 (21-298)||(22949869-22950146)
chr2 (39-301)||(34533931-34534193)
chr2 (39-241)||(26723824-26724026)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (15-371)||(11357-11713)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (15-371)||(7431-7787)
scaffold0143 (15-371)||(30764-31120)
scaffold0143 (15-371)||(19541-19897)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (15-371)||(26316162-26316518)
chr7 (15-371)||(4202857-4203213)
chr7 (15-371)||(45390688-45391044)
chr7 (15-371)||(16747831-16748187)
chr7 (15-371)||(26271400-26271756)
chr7 (15-371)||(26666228-26666584)
chr7 (15-371)||(2776722-2777078)
chr7 (15-371)||(31127375-31127731)
chr7 (15-371)||(26512010-26512366)
chr7 (15-371)||(26681420-26681776)
chr7 (15-371)||(39209453-39209809)
chr7 (15-371)||(10913183-10913539)
chr7 (15-371)||(2158042-2158398)
chr7 (15-371)||(11421093-11421449)
chr7 (15-371)||(16514744-16515100)
chr7 (15-371)||(4141560-4141916)
chr7 (15-371)||(5143654-5144010)
chr7 (15-371)||(2106477-2106833)
chr7 (15-371)||(5131464-5131820)
chr7 (15-371)||(3448774-3449130)
chr7 (15-371)||(22145663-22146019)
chr7 (15-371)||(26534187-26534543)
chr7 (15-371)||(31086936-31087292)
chr7 (15-370)||(11444355-11444710)
chr7 (15-370)||(24588849-24589204)
chr7 (15-371)||(26516260-26516616)
chr7 (15-371)||(31560704-31561060)
chr7 (15-371)||(16446320-16446676)
chr7 (15-367)||(26438725-26439077)
chr7 (15-364)||(16044786-16045132)
chr7 (15-371)||(45734781-45735131)
chr7 (15-371)||(10845088-10845444)
chr7 (39-371)||(10842308-10842640)
chr7 (75-371)||(5161911-5162207)
chr7 (39-335)||(29090008-29090304)
chr7 (21-300)||(797908-798187)
chr7 (39-298)||(2557027-2557286)
chr7 (39-278)||(16127225-16127464)
chr7 (21-367)||(30369264-30369610)
chr7 (21-298)||(16392821-16393098)
chr7 (39-298)||(15193575-15193834)
chr7 (21-298)||(9469794-9470071)
chr7 (21-300)||(16286764-16287043)
chr7 (14-303)||(25726964-25727252)
chr7 (39-241)||(1893019-1893221)
chr7 (41-159)||(16237975-16238093)
chr7 (194-303)||(16238112-16238221)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (15-371)||(10966138-10966494)
chr1 (15-370)||(10948550-10948905)
chr1 (15-371)||(28153209-28153565)
chr1 (15-367)||(51641691-51642043)
chr1 (15-371)||(28588458-28588814)
chr1 (15-371)||(3644608-3644965)
chr1 (15-371)||(16204463-16204819)
chr1 (15-371)||(41789739-41790095)
chr1 (15-371)||(21894177-21894534)
chr1 (15-371)||(20464449-20464805)
chr1 (75-371)||(20336845-20337141)
chr1 (21-303)||(22489500-22489782)
chr1 (21-298)||(5628500-5628777)
chr1 (15-73)||(20339028-20339086)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (15-371)||(9507-9863)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (15-371)||(9493-9849)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (15-371)||(18712954-18713310)
chr8 (15-371)||(31357998-31358354)
chr8 (15-371)||(19204752-19205108)
chr8 (15-371)||(44564454-44564810)
chr8 (15-371)||(15771044-15771400)
chr8 (15-371)||(28358342-28358698)
chr8 (15-371)||(9358095-9358451)
chr8 (15-371)||(19691568-19691924)
chr8 (15-371)||(14561094-14561450)
chr8 (15-371)||(29832796-29833152)
chr8 (15-371)||(2133650-2134006)
chr8 (15-371)||(18794174-18794530)
chr8 (15-371)||(27605295-27605651)
chr8 (15-371)||(33262204-33262560)
chr8 (15-371)||(12089113-12089469)
chr8 (15-370)||(19677917-19678272)
chr8 (15-371)||(21344561-21344917)
chr8 (15-367)||(31486265-31486617)
chr8 (75-371)||(19657731-19658027)
chr8 (70-371)||(33245894-33246195)
chr8 (14-370)||(22077316-22077658)
chr8 (39-335)||(22412432-22412728)
chr8 (21-335)||(19844643-19844957)
chr8 (39-298)||(14212533-14212792)
chr8 (39-241)||(16768817-16769019)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (15-371)||(16052-16408)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (15-370)||(22621-22976)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (15-371)||(3538-3894)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (15-371)||(5608-5964)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (15-371)||(13042-13398)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (15-371)||(9516-9872)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (15-371)||(11420-11776)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (15-346)||(5125-5456)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (15-365)||(43145-43513)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (185-370)||(22757-22942)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (187-371)||(118762-118946)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (42-367)||(34673-34998)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (39-298)||(10713-10972)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (21-298)||(29647-29924)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (244-371)||(1979-2109)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (24-241)||(4969-5186)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (15-303)||(4412-4700)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (15-73)||(1351-1409)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 28163959 - 28164315
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28163959 gatgagtccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 28164058  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164059 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 28164158  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164159 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 28164258  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164259 aaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28164315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 29504884 - 29505240
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29504884 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 29504983  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29504984 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 29505083  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505084 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 29505183  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505184 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29505240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13520920 - 13520564
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13520920 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 13520821  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520820 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 13520721  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13520720 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 13520621  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520620 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13520564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30554744 - 30554389
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30554744 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 30554645  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554644 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 30554545  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554544 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 30554445  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30554444 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 30554389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14142122 - 14141766
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14142122 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 14142023  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14142022 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 14141923  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141922 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 14141823  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14141822 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 14141766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27626439 - 27626083
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27626439 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgaccgtgaaactc 27626340  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27626339 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaat 27626240  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626239 ggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27626140  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27626139 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27626083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 29576482 - 29576838
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29576482 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 29576581  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29576582 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 29576681  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576682 ggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 29576781  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576782 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29576838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34461234 - 34460878
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461234 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 34461135  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34461134 ggtatacaatgcttgagaggacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 34461035  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461034 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 34460935  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34460934 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 34460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 26789284 - 26789640
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789284 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 26789383  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789384 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 26789483  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789484 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26789583  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26789584 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 26789640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 27197653 - 27198009
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197653 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 27197752  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197753 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgagctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27197852  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197853 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27197952  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27197953 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27198009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27251582 - 27251226
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251582 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 27251483  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251482 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgagctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27251383  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251382 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27251283  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27251282 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27251226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 16677608 - 16677964
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16677608 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactacctgagcaagaagttcactgattgtgaaactc 16677707  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677708 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16677807  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677808 ggatccgataaagtatgtctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16677907  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677908 agggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16677964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 27060974 - 27061330
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27060974 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27061073  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061074 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27061173  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27061174 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatattatattgtgttcaaaactcaa 27061273  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061274 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27061330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27358838 - 27358482
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358838 gatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 27358739  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358738 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27358639  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358638 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27358539  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27358538 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27358482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27449181 - 27448825
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449181 gatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 27449082  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449081 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27448982  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27448981 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27448882  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27448881 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27448825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13295679 - 13295323
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13295679 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 13295580  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295579 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 13295480  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295479 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 13295380  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295379 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13295323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 24867184 - 24867540
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24867184 gatgaatccatgggatgcgtactttgtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 24867283  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24867284 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaat 24867383  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867384 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 24867483  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867484 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24867540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 27011199 - 27011555
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27011199 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27011298  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27011299 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 27011398  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011399 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27011498  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27011499 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27011555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 27022604 - 27022960
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27022604 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27022703  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27022704 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaat 27022803  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022804 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27022903  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022904 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27022960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 3699551 - 3699907
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3699551 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 3699650  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3699651 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaat 3699750  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699751 ggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 3699850  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3699851 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 3699907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 4761231 - 4761587
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761231 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 4761330  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4761331 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatatagaat 4761430  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761431 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4761530  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4761531 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4761587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 16753289 - 16753645
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  16753289 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactc 16753388  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753389 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16753488  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753489 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16753588  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16753589 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 16753645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26775355 - 26774999
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26775355 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 26775256  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26775255 ggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaat 26775156  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26775155 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatatcgtgttcaaaactcaa 26775056  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26775055 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26774999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 29553025 - 29553381
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29553025 gatgaatccatgggctgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 29553124  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553125 ggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 29553224  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553225 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 29553324  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553325 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29553381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33373159 - 33372803
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  33373159 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactc 33373060  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33373059 ggtatacactgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 33372960  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33372959 ggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 33372860  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33372859 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 33372803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 4776348 - 4776704
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4776348 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 4776447  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4776448 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 4776547  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776548 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4776647  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4776648 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4776704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22931612 - 22931256
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22931612 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgatatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 22931513  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22931512 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaccgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 22931413  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931412 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 22931313  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931312 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22931256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23854057 - 23853701
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23854057 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgatatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 23853958  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23853957 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaccgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 23853858  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23853857 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 23853758  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23853757 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 23853701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 26921845 - 26922201
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  26921845 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactc 26921944  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26921945 ggtatacaatgcttgagaagacctgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaat 26922044  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26922045 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26922144  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26922145 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26922201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8902421 - 8902075
Alignment:
Q  25 tgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8902421 tgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtacacaat 8902322  T
Q  125 gcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatc 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8902321 gcttgagaaaacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgata 8902222  T
Q  225 aagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8902221 aagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaatattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatca 8902122  T
Q  325 aaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8902121 aaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 8902075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 4528753 - 4529109
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4528753 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 4528852  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528853 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 4528952  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528953 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4529052  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4529053 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4529109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27287092 - 27286736
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27287092 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27286993  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27286992 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcatgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27286893  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27286892 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctattactgggaagattgcacgttggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27286793  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27286792 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcctatcaacctcttgatgat 27286736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 27488601 - 27488957
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27488601 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27488700  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27488701 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacctggttgatatccagaat 27488800  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488801 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27488900  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27488901 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27488957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Original strand, 27179924 - 27180269
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27179924 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27180023  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27180024 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctaggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaat 27180123  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27180124 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27180223  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaac 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27180224 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaac 27180269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27269315 - 27268970
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27269315 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27269216  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27269215 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctaggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaat 27269116  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269115 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27269016  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaac 360  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27269015 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaac 27268970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15421048 - 15420692
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15421048 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 15420949  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15420948 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgcgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaat 15420849  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15420848 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaa 15420749  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15420748 aagggaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15420692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26113140 - 26112784
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26113140 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 26113041  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113040 gatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 26112941  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112940 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26112841  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26112840 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 26112784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 28210922 - 28211278
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28210922 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 28211021  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211022 gatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 28211121  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211122 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 28211221  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28211222 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 28211278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16940755 - 16940400
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16940755 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 16940656  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940655 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16940556  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940555 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16940456  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16940455 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 16940400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4720863 - 4720507
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  4720863 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagtaagaagttcaccgattgtgaaactc 4720764  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720763 gatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 4720664  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720663 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4720564  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4720563 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4720507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4542502 - 4542146
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  4542502 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagtaagaagttcaccgattgtgaaactc 4542403  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542402 gatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 4542303  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542302 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4542203  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4542202 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccaatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4542146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17089171 - 17088815
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17089171 gatgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgggactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 17089072  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089071 ggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 17088972  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17088971 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcgactgttacagggaagattgcacgatggcagatgctcttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 17088872  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17088871 atggcaatcaaaggtagcatccttgctgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 17088815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 70 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24302430 - 24302129
Alignment:
Q  70 atgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcct 169  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  24302430 atgctatctactatctgagcaagaagttcaccgaccgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcct 24302331  T
Q  170 gcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24302330 gcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgc 24302231  T
Q  270 tggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatg 369  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24302230 tgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatg 24302131  T
Q  370 at 371  Q
    ||    
T  24302130 at 24302129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Original strand, 20172037 - 20172371
Alignment:
Q  37 ttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagac 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20172037 ttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgagactcggtatactatgcttgagaagac 20172136  T
Q  137 ttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatcttt 236  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||     
T  20172137 ttgttgtgctctggcctgggttgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttc 20172236  T
Q  237 gagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatcc 336  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |    
T  20172237 gagaaacctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattc 20172336  T
Q  337 ttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  20172337 ttgccgatcatcttgcctaccaacccctggatgat 20172371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 37 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22163954 - 22163620
Alignment:
Q  37 ttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagac 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22163954 ttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgagactcggtatactatgcttgagaagac 22163855  T
Q  137 ttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatcttt 236  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||     
T  22163854 ttgttgtgctctggcctgggttgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttc 22163755  T
Q  237 gagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatcc 336  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |    
T  22163754 gagaaacctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattc 22163655  T
Q  337 ttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22163654 ttgccgatcatcttgcctaccaacccctggatgat 22163620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22455840 - 22455610
Alignment:
Q  17 tgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcgg 116  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22455840 tgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcatcgactgtgaaactcgg 22455741  T
Q  117 tatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatgg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455740 tatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatgg 22455641  T
Q  217 atccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 247  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22455640 atccgataaagtatatctttgagaaagctgc 22455610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 225 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15409051 - 15408905
Alignment:
Q  225 aagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15409051 aagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaagggaatca 15408952  T
Q  325 aaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15408951 aaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15408905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 26992263 - 26992396
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26992263 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 26992362  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctct 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26992363 ggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctct 26992396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23971492 - 23971210
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || |||     
T  23971492 tccatgggctgtgtgttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgatatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 23971393  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23971392 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcc 23971293  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 303  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| ||||||  | ||||||||| | ||||| || |||||||||||||    
T  23971292 aatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgcttgatggcagatgttattgtccgagtatgatattgtgt 23971210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 18119961 - 18120220
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  18119961 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 18120060  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  18120061 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 18120160  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  18120161 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 18120220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18212373 - 18212114
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||  |  | |||||||| ||||    
T  18212373 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgttatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatactctgtacttgagaaaactt 18212274  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  18212273 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 18212174  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  18212173 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 18212114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9136075 - 9135798
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  9136075 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 9135976  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  9135975 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 9135876  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  9135875 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgagtatgatat 9135798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 301
Target Start/End: Original strand, 27545394 - 27545656
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| ||||| |||||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  27545394 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttaccgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 27545493  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  27545494 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 27545593  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgt 301  Q
    |||  | ||| | || ||||  ||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  27545594 gaagccggctttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgatattgt 27545656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 301
Target Start/End: Original strand, 25707505 - 25707765
Alignment:
Q  41 tcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||| |||||||| || || |||||  |  | ||| | ||||| ||||| || |||    
T  25707505 tcaacaagacgagactggaaaaaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtccagatattctatgctagagaaaacctgt 25707604  T
Q  141 tgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgaga 240  Q
    || ||| |  | |||||||| || || || ||||| ||  |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||    
T  25707605 tgcgctttgacatgggctgctaagcgtcttcgtcaataaatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatttttgaga 25707704  T
Q  241 aagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgt 301  Q
    |  ||||| | || ||||  ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  25707705 agcctgctttaacaggaagaattgctcgttggcagatgctattgtccgagtatgatattgt 25707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18497407 - 18497051
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497407 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 18497308  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18497307 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 18497208  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497207 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18497108  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497107 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18497051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 3793019 - 3793375
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793019 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 3793118  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793119 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 3793218  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793219 ggacccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 3793318  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3793319 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 3793375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 9320954 - 9321310
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9320954 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 9321053  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9321054 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 9321153  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9321154 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 9321253  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9321254 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9321310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8662157 - 8661801
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8662157 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 8662058  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662057 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 8661958  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8661957 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 8661858  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8661857 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 8661801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 12135653 - 12136009
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12135653 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 12135752  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135753 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 12135852  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12135853 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattatgttcaaaactcaa 12135952  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135953 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12136009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 24586852 - 24587208
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24586852 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 24586951  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586952 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 24587051  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24587052 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 24587151  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24587152 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24587208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 26483872 - 26484228
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26483872 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaggatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 26483971  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26483972 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 26484071  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484072 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26484171  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484172 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26484228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 30155509 - 30155865
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30155509 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 30155608  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155609 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 30155708  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30155709 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 30155808  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30155809 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 30155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 33878608 - 33878964
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33878608 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 33878707  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878708 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 33878807  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33878808 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 33878907  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878908 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 33878964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 33519858 - 33520213
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33519858 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 33519957  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33519958 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 33520057  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33520058 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 33520157  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33520158 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 33520213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40470232 - 40469876
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470232 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 40470133  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470132 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 40470033  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470032 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 40469933  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40469932 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40469876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 43081733 - 43082089
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081733 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 43081832  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081833 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 43081932  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081933 ggattcgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 43082032  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082033 aaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 43082089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 28652720 - 28653076
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28652720 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 28652819  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28652820 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 28652919  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652920 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 28653019  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28653020 aaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28653076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 37758461 - 37758813
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37758461 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 37758560  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37758561 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 37758660  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37758661 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 37758760  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37758761 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 37758813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 11552833 - 11553189
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11552833 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatttaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 11552932  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552933 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 11553032  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553033 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 11553132  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553133 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11553189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29887879 - 29887523
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887879 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaataagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 29887780  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29887779 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggat 29887680  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887679 ggatcctatcaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcactctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 29887580  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  29887579 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgataatctcgcctaccaacctctcgatgat 29887523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 30171947 - 30172303
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30171947 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 30172046  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30172047 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaat 30172146  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30172147 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 30172246  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30172247 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 30172303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 33296006 - 33296362
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33296006 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 33296105  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296106 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 33296205  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296206 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 33296305  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33296306 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 33296362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 34619997 - 34620352
Alignment:
Q  16 atgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34619997 atgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcg 34620096  T
Q  116 gtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatg 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620097 gtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatg 34620196  T
Q  216 gatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaa 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620197 gatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaa 34620296  T
Q  316 aggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620297 aggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34620352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 23629448 - 23629804
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23629448 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 23629547  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629548 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 23629647  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629648 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 23629747  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629748 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 23629804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 24727447 - 24727799
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24727447 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 24727546  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24727547 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 24727646  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24727647 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 24727746  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24727747 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttga 24727799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 30032906 - 30033258
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30032906 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 30033005  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30033006 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 30033105  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30033106 ggatccgataaagtatatctttgagaaggctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 30033205  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30033206 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttga 30033258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 30938113 - 30938469
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30938113 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 30938212  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30938213 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaat 30938312  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30938313 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 30938412  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938413 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 30938469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18372216 - 18371864
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18372216 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 18372117  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18372116 ggtacacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaat 18372017  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372016 ggatcagatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18371917  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18371916 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 18371864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22995799 - 22995443
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22995799 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaaattcaccgattgtgaaactc 22995700  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995699 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 22995600  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22995599 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 22995500  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995499 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22995443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 31434942 - 31435298
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31434942 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 31435041  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31435042 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 31435141  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435142 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 31435241  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31435242 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31435298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37767673 - 37767317
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37767673 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 37767574  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767573 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 37767474  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767473 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 37767374  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37767373 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 37767317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9547391 - 9547035
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  9547391 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactc 9547292  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9547291 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 9547192  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9547191 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 9547092  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9547091 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 9547035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 24973384 - 24973740
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24973384 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 24973483  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24973484 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtcctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaat 24973583  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973584 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 24973683  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973684 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24973740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 25203756 - 25204112
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203756 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagacgggaaagaaagaacatgctatatactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 25203855  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203856 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 25203955  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203956 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 25204055  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25204056 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 25204112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 25267911 - 25268267
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25267911 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagacgggaaagaaagaacatgctatatactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 25268010  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25268011 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 25268110  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25268111 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 25268210  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25268211 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 25268267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28956467 - 28956111
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28956467 gatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 28956368  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28956367 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgcgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 28956268  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28956267 ggatccgataaagtacatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaa 28956168  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28956167 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28956111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 25 - 371
Target Start/End: Original strand, 11327125 - 11327471
Alignment:
Q  25 tgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11327125 tgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagttcaccgatggtgaaactcggtatacaat 11327224  T
Q  125 gcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatc 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11327225 gcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgata 11327324  T
Q  225 aagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatca 324  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327325 aagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatca 11327424  T
Q  325 aaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11327425 aaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 11327471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 6877783 - 6878139
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6877783 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaggatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactc 6877882  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6877883 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaat 6877982  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6877983 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 6878082  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6878083 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 6878139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13321512 - 13321156
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13321512 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgttatctattatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 13321413  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13321412 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 13321313  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321312 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 13321213  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13321212 aaggcgatcaaaggtagcatcctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 13321156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13439365 - 13439009
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13439365 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 13439266  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13439265 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacgacttggttgatatccagaat 13439166  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13439165 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatatcgtgttcaaaactcaa 13439066  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13439065 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13439009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18125098 - 18124742
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18125098 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 18124999  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18124998 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccttggcccgggccgcaaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaat 18124899  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18124898 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgctgttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 18124799  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18124798 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18124742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37668168 - 37667812
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37668168 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 37668069  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37668068 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 37667969  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37667968 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 37667869  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  37667868 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttaatgat 37667812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 41678183 - 41678535
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  41678183 gatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactc 41678282  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678283 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 41678382  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678383 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 41678482  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41678483 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 41678535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 33780967 - 33781319
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33780967 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 33781066  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33781067 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 33781166  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  33781167 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaa----caa 33781262  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33781263 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 33781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15655440 - 15655091
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15655440 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 15655341  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655340 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggctgctaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 15655241  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655240 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 15655141  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctct 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15655140 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 15655091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31823089 - 31822733
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31823089 gatgaatccatgggatgcgtacttgggcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactc 31822990  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31822989 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31822890  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31822889 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 31822790  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31822789 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31822733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 2514540 - 2514896
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2514540 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactc 2514639  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2514640 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaat 2514739  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2514740 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 2514839  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2514840 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2514896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13183475 - 13183119
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  13183475 gatgaatccgtgggatgtgtaattggtcaacaagatgaaactggaaagaaagatcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgcgaaactc 13183376  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183375 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 13183276  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13183275 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtcttaatatgatattgtgttcaaaactcaa 13183176  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13183175 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 13183119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32592956 - 32592600
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32592956 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagaccggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagttcaccaattgtgaaactc 32592857  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32592856 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 32592757  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32592756 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaa 32592657  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592656 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 32592600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37355325 - 37354969
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37355325 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 37355226  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355225 gatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 37355126  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355125 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 37355026  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37355025 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 37354969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 5641266 - 5641621
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5641266 gatgaatccatgggatgtgtactgggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 5641365  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641366 ggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 5641465  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641466 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5641565  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5641566 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 5641621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15755534 - 15755182
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15755534 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatttaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 15755435  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15755434 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 15755335  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755334 ggacccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 15755235  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15755234 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttga 15755182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 370
Target Start/End: Original strand, 22891944 - 22892296
Alignment:
Q  18 gaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggt 117  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22891944 gaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggt 22892043  T
Q  118 atacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatgga 217  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22892044 atatgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcactatttggtgaatcataaaacttggttgatatccagaatgga 22892143  T
Q  218 tccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaag 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892144 tccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaag 22892243  T
Q  318 gcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  22892244 gcaatcaaaggtagcattcttgttgatcaccttgcctatcaaccgctcgatga 22892296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24684827 - 24684697
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24684827 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 24684728  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24684727 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgc 24684697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11944098 - 11943821
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  11944098 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgatact 11943999  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  11943998 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 11943899  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  11943898 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 11943821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3483861 - 3483602
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  3483861 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 3483762  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  3483761 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 3483662  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  3483661 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 3483602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 34469106 - 34469385
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||     
T  34469106 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctatt 34469205  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| || ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  34469206 ccatgctcgagaagacctgttgcgcactagtctgggctgccaaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatcc 34469305  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||  ||||| || ||||||||| |  | || |||||||||||||    
T  34469306 gatcaagtacatctttgagaaacctgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttactatccgaatatgatattg 34469385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5439901 - 5439624
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  5439901 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 5439802  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  5439801 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 5439702  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5439701 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5439624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15784401 - 15784124
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  15784401 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 15784302  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || || ||| || |||| | |||||||||    
T  15784301 ccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatcc 15784202  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  15784201 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 15784124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 17957581 - 17957858
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  17957581 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 17957680  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| ||||||| | |||||||||    
T  17957681 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctgatatctaaaatggatcc 17957780  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | |  |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  17957781 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgataggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 17957858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 31520791 - 31521068
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  31520791 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 31520890  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  31520891 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 31520990  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||    
T  31520991 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatcggaatatgatat 31521068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36375638 - 36375361
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || ||||| |||||| | ||||| ||||| || || |||||| |||| ||      
T  36375638 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagaacacgccatttattatttaagcaaaaagtttactgaatgtgaatctcgatact 36375539  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  36375538 ccatactcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 36375439  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     ||||| || || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  36375438 aatcaaatacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 36375361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37000292 - 37000015
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||| || ||||| |||||| | ||||| ||||| || || |||||| |||| ||      
T  37000292 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagaacacgccatttattatttaagcaaaaagtttactgaatgtgaatctcgatact 37000193  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  37000192 ccatactcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 37000093  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     ||||| || || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37000092 aatcaaatacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 37000015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 351897 - 351609
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| || || |||||  | |    
T  351897 gatgattctatgggctgcgtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtccc 351798  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || || || || ||||| ||  ||||  | || || |||||||||||||||| |||    
T  351797 gatattctatgcttgagaaaacttgttgcgctttggcatgggccgctaagcgtctccgtcactacatggtttaccacactacttggttgatatccaaaat 351698  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 303  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||  | ||  | || ||||  ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  351697 ggatccgatcaagtacctttttgagaagccggcgttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgtctgaatatgatattgtgt 351609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20388647 - 20388445
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| || || |||||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  20388647 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 20388548  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    || | ||| | || |||||||| |  || || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  20388547 gtcgcgctttggcatgggctgctatgcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 20388448  T
Q  239 gaa 241  Q
    |||    
T  20388447 gaa 20388445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 5009359 - 5009715
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009359 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 5009458  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009459 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 5009558  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009559 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5009658  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009659 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5009715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40102422 - 40102066
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40102422 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 40102323  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102322 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 40102223  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40102222 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 40102123  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40102122 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40102066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 21973185 - 21973540
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21973185 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 21973284  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973285 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 21973384  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973385 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 21973484  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21973485 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 21973540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31123297 - 31122942
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31123297 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 31123198  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123197 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31123098  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123097 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 31122998  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31122997 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 31122942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27160102 - 27159746
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27160102 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27160003  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160002 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27159903  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27159902 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27159803  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27159802 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27159746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 6573342 - 6573698
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573342 gatgaatccatgggttgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 6573441  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6573442 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagtttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 6573541  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573542 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 6573641  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573642 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 6573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18797399 - 18797043
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18797399 gatgaatccatgggatgtgtacttggacaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 18797300  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18797299 ggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaat 18797200  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797199 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18797100  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797099 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18797043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 14102027 - 14102379
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14102027 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 14102126  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14102127 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaat 14102226  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102227 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 14102326  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102327 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 14102379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34185745 - 34185389
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34185745 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 34185646  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185645 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgataaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 34185546  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185545 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 34185446  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185445 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34185389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 54836875 - 54837231
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54836875 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 54836974  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836975 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 54837074  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54837075 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 54837174  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54837175 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 54837231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 17016530 - 17016886
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17016530 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 17016629  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016630 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 17016729  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016730 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 17016829  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016830 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 17016886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 39854121 - 39854477
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854121 gatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 39854220  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39854221 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 39854320  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854321 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 39854420  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854421 aaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 39854477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18313963 - 18313607
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18313963 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 18313864  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18313863 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 18313764  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18313763 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18313664  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18313663 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 18313607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 24116146 - 24116502
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24116146 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 24116245  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116246 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 24116345  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116346 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 24116445  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24116446 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 24116502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36341302 - 36340950
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341302 gatgaatccatgggatgtgtactgggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacacgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 36341203  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36341202 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 36341103  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341102 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 36341003  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36341002 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 36340950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 30757244 - 30757599
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30757244 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 30757343  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30757344 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 30757443  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30757444 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaa 30757543  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30757544 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 30757599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 1903738 - 1904094
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903738 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 1903837  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903838 ggtatatgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 1903937  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903938 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 1904037  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1904038 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttaatgat 1904094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20335206 - 20334850
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20335206 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 20335107  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335106 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggcctccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 20335007  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335006 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 20334907  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20334906 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccctgcttaccaacctcttgatgat 20334850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24589146 - 24588790
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24589146 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgataactactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 24589047  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589046 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 24588947  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588946 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 24588847  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24588846 aaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 24588790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 15231357 - 15231712
Alignment:
Q  16 atgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcg 115  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231357 atgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcg 15231456  T
Q  116 gtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatg 215  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231457 ttatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatg 15231556  T
Q  216 gatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaa 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231557 gatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaggttgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaa 15231656  T
Q  316 aggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15231657 aggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 15231712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 14668500 - 14668856
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14668500 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 14668599  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  14668600 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgtctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccaagat 14668699  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14668700 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctaaatatgatattgtgttcaaaactcaa 14668799  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668800 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 14668856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14760091 - 14759762
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14760091 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 14759992  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759991 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 14759892  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759891 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 14759792  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgat 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14759791 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgat 14759762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33670585 - 33670229
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  33670585 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgttatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactc 33670486  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33670485 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 33670386  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33670385 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 33670286  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33670285 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 33670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15281722 - 15281366
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281722 gatgaattcgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 15281623  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281622 ggtatacgatgcttgaaaagacttgttgctctctggcctgggccgccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 15281523  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||||||  |||||    
T  15281522 ggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccaaatatgacattatgttcaaggctcaa 15281423  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15281422 aaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaaccgcttgatgat 15281366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 215 - 371
Target Start/End: Original strand, 5698219 - 5698375
Alignment:
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5698219 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5698318  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5698319 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5698375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15388164 - 15387948
Alignment:
Q  14 agatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaact 113  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |     
T  15388164 agatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacaagactggaaagaaagagcatgctatctactatttgagcaagaagtttaccgactgcgaagcc 15388065  T
Q  114 cggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15388064 cgatatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagga 15387965  T
Q  214 tggatccgatcaagtat 230  Q
    ||||||| |||||||||    
T  15387964 tggatccaatcaagtat 15387948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14725560 - 14725264
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  14725560 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 14725461  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  14725460 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 14725361  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 335  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||     ||||| || ||||||||||||||||||    
T  14725360 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgaatatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcatc 14725264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 19767847 - 19768106
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  19767847 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 19767946  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  19767947 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtttccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 19768046  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  19768047 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 19768106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15384923 - 15384778
Alignment:
Q  225 aagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15384923 aagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagtcaatca 15384824  T
Q  325 aaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||| |||||  ||||  |||| || || |||||||||||    
T  15384823 aaggtagcattcttgcatatcacgttgcctatcagcctcttgatga 15384778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1881860 - 1881598
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| ||||| |||||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  1881860 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttaccgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 1881761  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  1881760 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcattatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 1881661  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgt 301  Q
    |||  | ||| | || ||||  ||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  1881660 gaagccggctttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgatattgt 1881598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 300
Target Start/End: Original strand, 55784668 - 55784901
Alignment:
Q  67 agcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacg 166  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  55784668 agcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgattgtgaatctcgctattccatgctcgagaagacctgttgcgcactagcctgggctgccaaacg 55784767  T
Q  167 cctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgca 266  Q
    ||| ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| | || ||||  |||||     
T  55784768 cctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggacccgatcaagtacatctttgagaaacccgctttgacaggaagaattgcc 55784867  T
Q  267 cgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 300  Q
    || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  55784868 cggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 55784901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22146354 - 22146066
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| || || |||||  | |    
T  22146354 gatgattctatgggctgcgtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtccc 22146255  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || || || || ||||| ||  ||||  | || || |||||||||||||||| |||    
T  22146254 gatattctatgcttgagaaaacttgttgcgctttggcatgggccgctaagcgtctccgtcactacatggtttaccacactacttggttgatatccaaaat 22146155  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 303  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||  | ||  | || ||||  ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22146154 ggatccgatcaagtacctttttgagaagccggcgttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgtctgaatatgatattgtgt 22146066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Original strand, 12515725 - 12515942
Alignment:
Q  24 atgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaa 123  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || ||||||| |||||| ||||  || || ||| ||||||||||||| || ||  ||||  ||||||||   |    
T  12515725 atgggttgtgtgctcgggcagcaagaagaaactggaaggaaagaacatgttatttactatttgagcaagaagtttacagatagtgagtctcggtatttca 12515824  T
Q  124 tgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgat 223  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  12515825 tacttgagaagacttgatgtgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaat 12515924  T
Q  224 caagtatatctttgagaa 241  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  12515925 caagtatgtctttgagaa 12515942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 18044699 - 18044769
Alignment:
Q  171 cgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaa 241  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18044699 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 18044769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28112782 - 28112426
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28112782 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 28112683  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112682 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 28112583  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112582 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 28112483  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112482 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28112426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 5714505 - 5714861
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714505 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 5714604  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714605 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 5714704  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5714705 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaa 5714804  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5714805 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5714861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 5725415 - 5725771
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725415 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 5725514  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725515 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 5725614  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5725615 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaa 5725714  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5725715 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5725771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5766953 - 5766597
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766953 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 5766854  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766853 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 5766754  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5766753 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaa 5766654  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5766653 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5766597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 5017146 - 5017502
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5017146 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 5017245  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5017246 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 5017345  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5017346 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5017445  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017446 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5017502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 32294060 - 32294416
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32294060 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 32294159  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294160 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 32294259  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32294260 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 32294359  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32294360 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 32294416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5593185 - 5592829
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593185 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 5593086  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5593085 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaat 5592986  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5592985 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacactggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaacgcaa 5592886  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5592885 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5592829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 8215167 - 8215519
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215167 gatgagtccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctacctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 8215266  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215267 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 8215366  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215367 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 8215466  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8215467 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 8215519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 18228628 - 18228983
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18228628 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 18228727  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228728 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 18228827  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228828 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18228927  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18228928 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 18228983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22384406 - 22384050
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22384406 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 22384307  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384306 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 22384207  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384206 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 22384107  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384106 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22384050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 47026885 - 47027241
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47026885 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 47026984  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47026985 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 47027084  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47027085 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 47027184  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47027185 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 47027241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 51785455 - 51785810
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51785455 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 51785554  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51785555 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 51785654  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51785655 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 51785754  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51785755 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 51785810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 4627217 - 4627573
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627217 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 4627316  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627317 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 4627416  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627417 ggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4627516  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4627517 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4627573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5606142 - 5605786
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5606142 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 5606043  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606042 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 5605943  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5605942 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5605843  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5605842 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 6205335 - 6205691
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6205335 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 6205434  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205435 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 6205534  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205535 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 6205634  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205635 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 6205691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 7076638 - 7076994
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7076638 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 7076737  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7076738 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgacatccagaat 7076837  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076838 ggatccgataaaatatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 7076937  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076938 aaggcaatcaaaggtagtattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 7076994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8286298 - 8285942
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286298 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 8286199  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8286198 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaat 8286099  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286098 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 8285999  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8285998 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 8285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20573671 - 20573315
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573671 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 20573572  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20573571 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 20573472  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573471 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 20573372  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20573371 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttatcaacctcttgatgat 20573315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 24331595 - 24331951
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24331595 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 24331694  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24331695 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 24331794  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24331795 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 24331894  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24331895 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 24331951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31033064 - 31032708
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31033064 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 31032965  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31032964 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31032865  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31032864 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 31032765  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31032764 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctctagatgat 31032708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 4420347 - 4420703
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4420347 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctattatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 4420446  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4420447 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 4420546  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420547 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4420646  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4420647 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4420703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 4725063 - 4725419
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4725063 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 4725162  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725163 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 4725262  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725263 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4725362  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725363 aaggaaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 4725419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4793463 - 4793107
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4793463 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 4793364  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4793363 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaat 4793264  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793263 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4793164  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793163 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 4793107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 8299403 - 8299759
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8299403 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagattggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 8299502  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8299503 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccataat 8299602  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299603 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 8299702  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299703 aaggcaatcaaaggtagaattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 8299759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15737922 - 15737566
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15737922 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 15737823  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737822 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 15737723  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737722 ggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 15737623  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737622 aaggcaatcaaatgtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15737566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17981777 - 17981421
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17981777 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 17981678  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981677 ggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 17981578  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981577 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 17981478  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17981477 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 17981421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18304482 - 18304126
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18304482 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 18304383  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304382 ggtatacaatgcttgagaaggcttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 18304283  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304282 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18304183  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18304182 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 18304126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 21678135 - 21678491
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678135 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaacgggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 21678234  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21678235 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggatgatatccagaat 21678334  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678335 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 21678434  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21678435 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctgccaacctcttgatgat 21678491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 35884198 - 35884554
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35884198 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 35884297  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884298 ggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 35884397  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35884398 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 35884497  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884498 aaggcaattaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 35884554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 4687087 - 4687443
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4687087 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 4687186  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4687187 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 4687286  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4687287 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4687386  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4687387 aagacagtcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 4687443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 18334062 - 18334418
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18334062 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgtgaaactc 18334161  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334162 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 18334261  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334262 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18334361  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334362 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18334418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 19697922 - 19698278
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19697922 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 19698021  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698022 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 19698121  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19698122 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcccgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaa 19698221  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19698222 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19698278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29145584 - 29145228
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29145584 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 29145485  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145484 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 29145385  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145384 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 29145285  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145284 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29145228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29661798 - 29661442
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29661798 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgactgtgaaactc 29661699  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29661698 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 29661599  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661598 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 29661499  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29661498 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctctcgatgat 29661442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 32442583 - 32442935
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32442583 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 32442682  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442683 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 32442782  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442783 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 32442882  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32442883 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 32442935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11107187 - 11106831
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11107187 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaaattcaccgattgtgaaactc 11107088  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107087 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggcctctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 11106988  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11106987 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 11106888  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11106887 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 11106831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 18054694 - 18055050
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  18054694 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatttaagtaagaagttcaccgattgtgaaactc 18054793  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18054794 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggtctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaat 18054893  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18054894 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 18054993  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054994 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18055050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 18246173 - 18246529
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18246173 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 18246272  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18246273 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 18246372  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246373 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18246472  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18246473 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 18246529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18273880 - 18273524
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18273880 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaggaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 18273781  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273780 ggtatacaatgcttgagaaggcttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 18273681  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273680 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18273581  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18273580 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaatctcttgatgat 18273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18289181 - 18288825
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18289181 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaggaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 18289082  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289081 ggtatacaatgcttgagaaggcttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 18288982  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18288981 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18288882  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18288881 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaatctcttgatgat 18288825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 20069472 - 20069828
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20069472 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 20069571  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20069572 ggtatgcaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgaaatccagaat 20069671  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069672 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctagcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 20069771  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20069772 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 20069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 28024714 - 28025070
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28024714 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagttcaccaattgtgaaactc 28024813  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28024814 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 28024913  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024914 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 28025013  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28025014 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28025070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 48469359 - 48469715
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48469359 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactc 48469458  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  48469459 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaaccatacaacttggctgatatccagaat 48469558  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469559 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 48469658  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469659 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccaatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 48469715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 10399576 - 10399932
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10399576 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 10399675  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399676 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 10399775  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399776 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 10399875  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10399876 aaggcaatcaaaggtagcattcttgtcgatcaccttgcttaccaacctcttaatgat 10399932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15889533 - 15889177
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||    
T  15889533 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatataagcaagaagttcaccgattgcgaaactc 15889434  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889433 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 15889334  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889333 ggatccggtaaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 15889234  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889233 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15889177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4343504 - 4343148
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4343504 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 4343405  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4343404 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 4343305  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4343304 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4343205  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4343204 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4343148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 5470420 - 5470776
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5470420 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 5470519  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5470520 ggtatacaatgctagagaagacttgttgtgctctagcgtgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 5470619  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470620 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5470719  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5470720 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5470776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 28342609 - 28342965
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28342609 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactc 28342708  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342709 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 28342808  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342809 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 28342908  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28342909 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 28342965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31961283 - 31960927
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31961283 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 31961184  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961183 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31961084  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961083 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 31960984  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31960983 aaggcaatcaaagacagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31960927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6539570 - 6539214
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6539570 gatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 6539471  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6539470 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 6539371  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539370 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttacggggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 6539271  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6539270 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 6539214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Original strand, 7999995 - 8000348
Alignment:
Q  18 gaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggt 117  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7999995 gaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggt 8000094  T
Q  118 atacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatgga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8000095 atacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatgga 8000194  T
Q  218 tccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaag 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8000195 tccaataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaag 8000294  T
Q  318 gcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  8000295 gcaatcaaaggcagcattcttgccgatcacctggcttaccagcctctcgatgat 8000348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22867676 - 22867320
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22867676 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagataaaaccggaaagaaagagcatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 22867577  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22867576 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgcactagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 22867477  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22867476 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 22867377  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22867376 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 22867320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22882735 - 22882379
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22882735 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagataaaaccggaaagaaagagcatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 22882636  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22882635 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgcactagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 22882536  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22882535 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 22882436  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22882435 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 22882379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Original strand, 10646508 - 10646861
Alignment:
Q  18 gaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggt 117  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10646508 gaatccatgagatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggt 10646607  T
Q  118 atacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatgga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646608 atacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatgga 10646707  T
Q  218 tccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaag 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646708 tccaataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaag 10646807  T
Q  318 gcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  10646808 gcaatcaaaggcagcattcttgccgatcacctggcttaccagcctctcgatgat 10646861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16621318 - 16620966
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16621318 gatgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcactgactgtgaaactc 16621219  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621218 ggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggtctgggccgccaaacgcttgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16621119  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  16621118 ggatcagataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaa 16621019  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16621018 aaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttga 16620966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 75 - 371
Target Start/End: Original strand, 5653577 - 5653873
Alignment:
Q  75 atctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtc 174  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  5653577 atctactatctaagcaagaagctcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttatgctctggcctgggccgctaaacgcttgcgtc 5653676  T
Q  175 attatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5653677 attatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctgaca 5653776  T
Q  275 gatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5653777 ggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcctgcctaccaacctcttgatgat 5653873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17992759 - 17992526
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992759 gatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 17992660  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992659 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 17992560  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992559 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgct 17992526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 244 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17973460 - 17973333
Alignment:
Q  244 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17973460 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 17973361  T
Q  344 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17973360 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 17973333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11925162 - 11924866
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  11925162 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 11925063  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  11925062 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtacatatttga 11924963  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 335  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| | ||     ||||| || ||||||||||||||||||    
T  11924962 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcatc 11924866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 20443555 - 20443834
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||     
T  20443555 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagacgaaactggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctatt 20443654  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  20443655 ccatgctcgagaagacttgttgcgcactagcctgggctgctaaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatcc 20443754  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||||  ||||| || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  20443755 gatcaagtacatctttgagaaacctgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 20443834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 22959909 - 22960168
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  22959909 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 22960008  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  22960009 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 22960108  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  22960109 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 22960168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5950624 - 5950347
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  5950624 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 5950525  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  5950524 ccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 5950425  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5950424 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5950347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7088831 - 7088535
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  7088831 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 7088732  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  7088731 gttgtgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 7088632  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 335  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||  || |||||||| | ||     ||||| || ||||||||||||||||||    
T  7088631 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgttcgagtatgatatcgagtatcgtactcagaaagcaatcaaaggtagcatc 7088535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 241
Target Start/End: Original strand, 15918976 - 15919175
Alignment:
Q  42 caacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgtt 141  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  15918976 caacaagatgaaattggaaggaaggagcacgccatttattatttaagcaaaaagtttactgactgtgaatctcgctattccatgcttgagaggacttgtt 15919075  T
Q  142 gtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaa 241  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15919076 gtgctctggcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaa 15919175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 16431861 - 16432120
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||  |  | |||||||| ||||    
T  16431861 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgttatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatactctgtacttgagaaaactt 16431960  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  16431961 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 16432060  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  16432061 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 16432120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 6571792 - 6572069
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  |||| |||     
T  6571792 tccatgggctgtgtgttaggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtctcgatatt 6571891  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6571892 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttggcctgggccgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcc 6571991  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| ||| || |||||||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  6571992 aatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggatcgctcgctggcaaatgttattgtccgagtatgatat 6572069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15592712 - 15592387
Alignment:
Q  42 caacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgtt 141  Q
    ||||||||||| ||| |||  || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || ||| ||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  15592712 caacaagatgaaactagaagaaaggagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgacggtgaatctcgctattccatgcttgagaggacttgtt 15592613  T
Q  142 gtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaa 241  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || | | |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15592612 gtgctctagcctgggttgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaa 15592513  T
Q  242 agctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgcc 341  Q
      | ||| | || || | |||| | || ||||||||||| || || || |||||||||| || |    |||| || ||||||||||| || ||||||||     
T  15592512 gcccgctttgacagggaggatttcccggtggcagatgctattatccgagtatgatattgagtaccgttctcagaaagcaatcaaaggcagtatccttgct 15592413  T
Q  342 gatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    ||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15592412 gatcacctggctcaccaaccacttga 15592387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 46380772 - 46381049
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  46380772 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 46380871  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | || || || |||||| || |||| | |||||||||    
T  46380872 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatcc 46380971  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     ||||| || || ||||||||| | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  46380972 aatcaaatacatatttgagaaacccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 46381049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 15704911 - 15705193
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || |||||  | || ||      
T  15704911 tccatgggctgtgtgttaggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagaacatgctatctactatttgagtaagaaattcactgattgtgagtcccgatact 15705010  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    |  | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  15705011 ctgtacttgagaaaacttgttgtgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggaccc 15705110  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 303  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| |||||| |||||||||||| | || || || |||||||| ||||    
T  15705111 aatcaagtacatatttgagaagccagctttaaccggaaggattgctcgctggcagatgttattatccgagtatgatatcgtgt 15705193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6963261 - 6962973
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| || || |||||  | |    
T  6963261 gatgattctatgggctgcgtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtccc 6963162  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || || || || ||||| ||  ||||  | || || |||||||||||||||| |||    
T  6963161 gatattctatgcttgagaaaacttgttgcgctttggcatgggccgctaagcgtctccgtcactacatggtttaccacactacttggttgatatccaaaat 6963062  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 303  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||  | ||  | || ||||  ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6963061 ggatccgatcaagtacctttttgagaagccggcgttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgtctgaatatgatattgtgt 6962973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37260489 - 37260254
Alignment:
Q  63 aaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgcca 162  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||  | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37260489 aaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgatactccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgcca 37260390  T
Q  163 aacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagat 262  Q
    ||||||| ||||||||| |  | |||||  | |||||| || |||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| |||    
T  37260389 aacgcctccgtcattatataattaatcacgctacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggat 37260290  T
Q  263 tgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  37260289 tgcacggtggcaaatgctactatctgaatatgatat 37260254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 4450363 - 4450433
Alignment:
Q  171 cgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaa 241  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4450363 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 4450433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13933321 - 13932965
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933321 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 13933222  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13933221 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcggcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 13933122  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933121 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 13933022  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933021 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13932965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 27119994 - 27120350
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119994 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 27120093  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120094 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27120193  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120194 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27120293  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120294 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27120350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 3785963 - 3786318
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3785963 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 3786062  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786063 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtggtctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 3786162  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786163 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 3786262  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786263 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 3786318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11631958 - 11631602
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11631958 gatgaatccatgggatgtttacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 11631859  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631858 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 11631759  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631758 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 11631659  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631658 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11631602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19413275 - 19412919
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19413275 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 19413176  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19413175 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 19413076  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19413075 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 19412976  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19412975 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 19412919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22924922 - 22924566
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924922 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 22924823  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924822 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtggtctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 22924723  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924722 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 22924623  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924622 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22924566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 31879756 - 31880112
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31879756 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 31879855  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879856 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31879955  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31879956 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 31880055  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31880056 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 31880112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37682669 - 37682313
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37682669 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 37682570  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682569 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 37682470  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37682469 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 37682370  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37682369 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 37682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37697934 - 37697578
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37697934 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 37697835  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697834 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 37697735  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37697734 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 37697635  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37697634 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 37697578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 257427 - 257071
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257427 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcagcaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 257328  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  257327 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 257228  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  257227 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaa 257128  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  257127 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 257071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 27779704 - 27780060
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779704 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 27779803  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779804 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27779903  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779904 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27780003  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27780004 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27780060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 27819461 - 27819817
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819461 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 27819560  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819561 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27819660  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819661 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27819760  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27819761 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27819817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 32053273 - 32053629
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32053273 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 32053372  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053373 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 32053472  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32053473 ggatccgattaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagatcgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcag 32053572  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32053573 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttatcaacctcttgatgat 32053629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 37928839 - 37929195
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37928839 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 37928938  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37928939 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 37929038  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37929039 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 37929138  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37929139 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 37929195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16826112 - 16825757
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16826112 gatgaatccataggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 16826013  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826012 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16825913  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825912 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16825813  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16825812 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 16825757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 16895368 - 16895723
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16895368 gatgaatccataggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 16895467  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895468 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16895567  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895568 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16895667  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16895668 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 16895723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21673949 - 21673597
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21673949 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 21673850  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673849 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 21673750  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673749 ggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 21673650  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673649 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 21673597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31890265 - 31889909
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31890265 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 31890166  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31890165 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgttctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31890066  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31890065 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 31889966  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31889965 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 31889909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 34158314 - 34158670
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158314 gatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 34158413  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158414 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 34158513  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158514 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 34158613  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158614 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34158670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 34294624 - 34294980
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34294624 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactacttaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 34294723  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294724 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 34294823  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294824 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 34294923  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294924 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34294980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 27807173 - 27807529
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807173 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 27807272  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27807273 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 27807372  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807373 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27807472  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27807473 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27807529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 12590278 - 12590634
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590278 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 12590377  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12590378 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgccctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 12590477  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590478 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 12590577  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590578 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12590634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 34865154 - 34865510
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34865154 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 34865253  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34865254 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 34865353  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34865354 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 34865453  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34865454 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 34865510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39048593 - 39048237
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  39048593 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactacctaagtaagaagttcaccgactgtgaaactc 39048494  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048493 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaat 39048394  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048393 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 39048294  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39048293 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 39048237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 40236978 - 40237334
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40236978 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaacgggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 40237077  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237078 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaat 40237177  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237178 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 40237277  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40237278 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40237334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 20841383 - 20841739
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20841383 gatgagtccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 20841482  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20841483 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaat 20841582  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841583 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 20841682  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841683 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 20841739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 12659006 - 12659362
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12659006 gatgagtccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 12659105  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12659106 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaat 12659205  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12659206 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 12659305  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659306 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9346760 - 9346404
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  9346760 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactc 9346661  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9346660 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 9346561  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346560 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 9346461  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346460 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9346404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12713375 - 12713019
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12713375 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 12713276  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12713275 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 12713176  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12713175 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 12713076  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12713075 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 12713019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21699945 - 21699589
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21699945 gatgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagtaagaagttcaccgactgtgaaactc 21699846  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699845 ggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 21699746  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699745 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcatgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 21699646  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21699645 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 21699589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27431215 - 27430859
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27431215 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaaggcgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27431116  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27431016  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27431015 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtcggaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27430916  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430915 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27430859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 39893539 - 39893891
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39893539 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 39893638  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  39893639 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 39893738  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893739 ggacccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 39893838  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893839 aaggccatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 39893891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23125342 - 23124987
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23125342 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 23125243  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125242 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 23125143  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23125142 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatacgatattgtgttc-aaactcaa 23125044  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23125043 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcgtaccaacctcttgatgat 23124987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37948636 - 37948280
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948636 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaacttgaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 37948537  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37948536 ggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 37948437  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948436 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 37948337  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  37948336 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttgtcaacctcttgatgat 37948280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 16164950 - 16165306
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16164950 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 16165049  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16165050 ggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaat 16165149  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16165150 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16165249  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16165250 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 16165306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 37381147 - 37381499
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37381147 gatgaatcaatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 37381246  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37381247 ggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 37381346  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37381347 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacggtggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 37381446  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37381447 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 37381499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19453197 - 19452841
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453197 gatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 19453098  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19453097 ggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctccggcctgggccgccaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatataacttggttgatatccagaat 19452998  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  19452997 ggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaa 19452898  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19452897 aaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 81 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34271628 - 34271338
Alignment:
Q  81 tatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatt 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  34271628 tatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatt 34271529  T
Q  181 tggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgct 280  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34271528 tggtgaaccatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgct 34271429  T
Q  281 tttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271428 tttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34271338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 370
Target Start/End: Original strand, 27395031 - 27395387
Alignment:
Q  14 agatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaact 113  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |     
T  27395031 agatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagtttaccgactgcgaagcc 27395130  T
Q  114 cggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaa 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  27395131 cggtatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttgggtgatatccagga 27395230  T
Q  214 tggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactca 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27395231 tggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattttgttcaaaactca 27395330  T
Q  314 aaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27395331 aaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 27395387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 87 - 371
Target Start/End: Original strand, 28885821 - 28886105
Alignment:
Q  87 agcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtga 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28885821 agcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaaaacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtga 28885920  T
Q  187 atcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28885921 atcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatatagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaaattgcacgctggcagatgcttttgtc 28886020  T
Q  287 tgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28886021 tgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcgtaccaacctcttgatgat 28886105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 27827930 - 27828129
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827930 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 27828029  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828030 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27828129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Original strand, 28885677 - 28885808
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28885677 gatgagtccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 28885776  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgct 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885777 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgct 28885808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Original strand, 34701570 - 34701866
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  34701570 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 34701669  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  34701670 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 34701769  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 335  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| | ||     ||||| || ||||||||||||||||||    
T  34701770 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcatc 34701866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21760383 - 21760104
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||| |||| |||     
T  21760383 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagacgaaactggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgattgtgaatctcgctatt 21760284  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  21760283 ccatgctcgagaagacctgttgcgcactagcctgggccgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatcc 21760184  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||| | || ||||  ||||| || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  21760183 gatcaagtacatctttgagaaacccgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 21760104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 42394029 - 42394288
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  42394029 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 42394128  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  42394129 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 42394228  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  42394229 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 42394288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 12384136 - 12384413
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  12384136 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 12384235  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || || ||| || |||| | |||||||||    
T  12384236 ccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatcc 12384335  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  12384336 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 12384413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 22949869 - 22950146
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| || || |||||| |||| ||      
T  22949869 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaaaaagtttactgaatgtgaatctcgctact 22949968  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  22949969 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 22950068  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  22950069 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 22950146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34534193 - 34533931
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| ||||| |||||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  34534193 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttaccgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 34534094  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  34534093 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcattatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 34533994  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgt 301  Q
    |||  | ||| | || ||||  ||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  34533993 gaagccggctttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgtccgagtatgatattgt 34533931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26724026 - 26723824
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| || || |||||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  26724026 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 26723927  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  26723926 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 26723827  T
Q  239 gaa 241  Q
    |||    
T  26723826 gaa 26723824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11713 - 11357
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11713 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 11614  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11613 ggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 11514  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11513 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 11414  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11413 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 7431 - 7787
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7431 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 7530  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7531 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 7630  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7631 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 7730  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7731 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 30764 - 31120
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30764 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 30863  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30864 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 30963  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||    
T  30964 ggatccgataaagtatatctttgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaa 31063  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31064 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 19541 - 19897
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19541 gatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 19640  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19641 ggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 19740  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||    
T  19741 ggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaa 19840  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19841 aaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26316518 - 26316162
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26316518 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 26316419  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316418 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 26316319  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316318 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26316219  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316218 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26316162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 4202857 - 4203213
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202857 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 4202956  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202957 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 4203056  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4203057 ggatccgatcaaatatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4203156  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4203157 aaggccatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4203213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 45390688 - 45391044
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45390688 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 45390787  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45390788 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 45390887  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45390888 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 45390987  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45390988 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 45391044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16748187 - 16747831
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16748187 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 16748088  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748087 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16747988  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747987 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16747888  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16747887 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 16747831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26271756 - 26271400
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26271756 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 26271657  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271656 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 26271557  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271556 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgttgttacgggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26271457  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271456 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26271400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26666584 - 26666228
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26666584 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 26666485  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666484 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 26666385  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26666384 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26666285  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26666284 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26666228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 2776722 - 2777078
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776722 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 2776821  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776822 ggtatacaatgcttgcgaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 2776921  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2776922 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaa 2777021  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2777022 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2777078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 31127375 - 31127731
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127375 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 31127474  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127475 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31127574  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127575 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 31127674  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31127675 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 31127731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26512366 - 26512010
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512366 gatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 26512267  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26512266 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaat 26512167  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512166 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26512067  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26512066 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26512010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26681776 - 26681420
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681776 gatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 26681677  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681676 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 26681577  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681576 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgcgggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26681477  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26681476 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 26681420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39209809 - 39209453
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209809 gatgaatctgtgggatgcgtgctcggtcaacgagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 39209710  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39209709 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaat 39209610  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209609 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 39209510  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39209509 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 39209453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10913539 - 10913183
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10913539 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 10913440  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913439 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 10913340  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913339 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 10913240  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913239 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 10913183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 2158042 - 2158398
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2158042 gatgagtccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactagaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 2158141  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158142 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 2158241  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158242 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 2158341  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158342 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 2158398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11421449 - 11421093
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11421449 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 11421350  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421349 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 11421250  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11421249 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 11421150  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11421149 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 11421093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16515100 - 16514744
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16515100 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 16515001  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16515000 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaat 16514901  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16514900 agatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16514801  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16514800 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16514744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4141916 - 4141560
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4141916 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactc 4141817  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4141816 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaat 4141717  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4141716 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 4141617  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4141616 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4141560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5144010 - 5143654
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144010 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 5143911  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5143910 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 5143811  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143810 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcagccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5143711  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5143710 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctaccaacctctcgatgat 5143654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2106833 - 2106477
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2106833 gatgaatccatgggatgcgtaattggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 2106734  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106733 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 2106634  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106633 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 2106534  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2106533 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2106477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 5131464 - 5131820
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5131464 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 5131563  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5131564 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctaggccgctaaacgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaat 5131663  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131664 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5131763  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131764 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5131820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 3448774 - 3449130
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3448774 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaggatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactc 3448873  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3448874 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaat 3448973  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3448974 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 3449073  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3449074 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 3449130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 22145663 - 22146019
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22145663 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 22145762  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22145763 ggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccataat 22145862  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22145863 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcga 22145962  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145963 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 22146019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26534543 - 26534187
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  26534543 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaaattcaccgatggtgaaactc 26534444  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534443 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 26534344  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534343 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26534244  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26534243 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctctcgatgat 26534187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31087292 - 31086936
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087292 gatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 31087193  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087192 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31087093  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087092 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 31086993  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31086992 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctctcgatgat 31086936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 11444355 - 11444710
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11444355 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgttatctactatctaagcaagaagttcaccgactgcgaaactc 11444454  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11444455 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaat 11444554  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11444555 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 11444654  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11444655 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 11444710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24589204 - 24588849
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24589204 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 24589105  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589104 ggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 24589005  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589004 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 24588905  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24588904 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 24588849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 26516260 - 26516616
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516260 gatgaatccatgggatgcgtgctcggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 26516359  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26516360 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 26516459  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516460 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26516559  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26516560 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26516616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31561060 - 31560704
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31561060 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 31560961  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31560960 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31560861  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31560860 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 31560761  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31560760 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31560704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16446676 - 16446320
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446676 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 16446577  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446576 ggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgttaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16446477  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16446476 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaa 16446377  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  16446376 aaggcaatcaaaggtagcatccttgctgatcaccttgcttatcaacctctcgatgat 16446320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 26438725 - 26439077
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438725 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 26438824  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26438825 ggtatacaatgctcgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 26438924  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438925 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 26439024  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26439025 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 26439077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 16044786 - 16045132
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044786 gatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 16044885  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044886 ggtatacgatgcttgaaaagacttgt---gctctggcttgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16044982  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16044983 ggattcgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggtagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16045082  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctct 364  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16045083 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 16045132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 45734781 - 45735131
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  45734781 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactc 45734880  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45734881 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 45734980  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45734981 ggatccgat------tatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 45735074  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45735075 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 45735131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 10845088 - 10845444
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845088 gatgaatctgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 10845187  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845188 ggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 10845287  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||    
T  10845288 ggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaa 10845387  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10845388 aaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 10845444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 39 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10842640 - 10842308
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10842640 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagactt 10842541  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10842540 gttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcga 10842441  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatcctt 338  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10842440 gaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattctt 10842341  T
Q  339 gccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10842340 gccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 10842308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 75 - 371
Target Start/End: Original strand, 5161911 - 5162207
Alignment:
Q  75 atctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtc 174  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  5161911 atctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtc 5162010  T
Q  175 attatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5162011 attatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggca 5162110  T
Q  275 gatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5162111 ggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5162207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Original strand, 29090008 - 29090304
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  29090008 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 29090107  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  29090108 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 29090207  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 335  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| | ||     ||||| || ||||||||||||||||||    
T  29090208 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcatc 29090304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 798187 - 797908
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||     
T  798187 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagacgaaactggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttaccgattgtgaatctcgctatt 798088  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  798087 ccatggtcgagaagacctgttgcgcactagcctgggccgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaggatggatcc 797988  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||| | || ||||  ||||| || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  797987 gatcaagtacatctttgagaaacccgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 797908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 2557027 - 2557286
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  2557027 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 2557126  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  2557127 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 2557226  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  2557227 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 2557286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16127464 - 16127225
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  16127464 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 16127365  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  16127364 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 16127265  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatg 278  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16127264 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatg 16127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30369610 - 30369264
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  30369610 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 30369511  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  30369510 ccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 30369411  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggca 320  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| | || |    | || ||||||    
T  30369410 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtgccgttcccagaaggca 30369311  T
Q  321 atcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||| || |||||||| |||||  | ||| ||||||| |||||    
T  30369310 atcaaaggcagtatccttgctgatcacttggctcaccaaccacttga 30369264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16393098 - 16392821
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  16393098 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 16392999  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  16392998 ccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 16392899  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  16392898 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 16392821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 15193575 - 15193834
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  |  ||||||| ||||    
T  15193575 ggtcaacaagatgaaaccgggaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtatttgagaaaactt 15193674  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  15193675 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 15193774  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  15193775 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 15193834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 9469794 - 9470071
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  9469794 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 9469893  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||| || || ||| || |||| | |||||||||    
T  9469894 ccatgctcgagaagacgtgttgtgctctagcctgggctgccagacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatcc 9469993  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  9469994 aatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 9470071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16287043 - 16286764
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||     
T  16287043 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaggagcatgccatttattatttgagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctatc 16286944  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||| || | | |||||| || ||||||||||| |  ||||||||    
T  16286943 ccatgctcgagaaaacctgttgtgcactagcctgggctgcaaaacgcctccgccactatatgattagtcatactacatggttgatatctaagatggatcc 16286844  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattg 300  Q
    |||||||||  ||||||||||| | ||| | || ||||  ||||| || ||||||||| | || || |||||||||||||    
T  16286843 gatcaagtacgtctttgagaaacccgctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 16286764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 25726964 - 25727252
Alignment:
Q  14 agatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaact 113  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||| || |||||  |     
T  25726964 agatgattctatgggctgtgtgcttggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagttcactgattgtgagtcc 25727063  T
Q  114 cggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaa 213  Q
    || ||| |  | |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |  || ||||| ||  |||| ||||| || ||||||||||| |||| ||    
T  25727064 cgatattctgtacttgagaaaacttgttgcgct-ttgcatgggctgctaagcatctccgtcactacatggttaatcacactacttggttgatgtccaaaa 25727162  T
Q  214 tggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 303  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||  | ||| | || ||||  ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  25727163 tggacccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgctggcagatgttattgtctgagtatgatattgtgt 25727252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1893221 - 1893019
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||  |||| |||||||| || || |||||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  1893221 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacaccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 1893122  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  1893121 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 1893022  T
Q  239 gaa 241  Q
    |||    
T  1893021 gaa 1893019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Original strand, 16237975 - 16238093
Alignment:
Q  41 tcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgt 140  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||  ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| | || |||||||| ||||||    
T  16237975 tcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctcctatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctatacttgagaaaacttgt 16238074  T
Q  141 tgtgctctagcttgggctg 159  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  16238075 tgtgctttagcctgggctg 16238093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 303
Target Start/End: Original strand, 16238112 - 16238221
Alignment:
Q  194 aacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatat 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||  |  || | ||||||| |||||| || ||||||||| | ||||| || |||    
T  16238112 aacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccaactttaactggaaggattgctcgatggcagatgttattgtccgagtat 16238211  T
Q  294 gatattgtgt 303  Q
    ||||||||||    
T  16238212 gatattgtgt 16238221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 10966138 - 10966494
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10966138 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 10966237  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966238 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 10966337  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966338 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 10966437  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966438 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 10966494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 10948550 - 10948905
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10948550 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 10948649  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948650 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 10948749  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948750 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 10948849  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10948850 aaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttatcaacctcttgatga 10948905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 28153209 - 28153565
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28153209 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 28153308  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153309 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 28153408  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28153409 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 28153508  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28153509 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 28153565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Original strand, 51641691 - 51642043
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51641691 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 51641790  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51641791 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaaccatacaacttggttgatatccagaat 51641890  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51641891 ggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatactgtgttcaaaactcaa 51641990  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51641991 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 51642043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 28588458 - 28588814
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28588458 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 28588557  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588558 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 28588657  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588658 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 28588757  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28588758 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 28588814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 3644608 - 3644965
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaa-ct 113  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3644608 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaaact 3644707  T
Q  114 cggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3644708 cggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaa 3644807  T
Q  214 tggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactca 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3644808 tggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactca 3644907  T
Q  314 aaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3644908 aaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttatcaacctcttgatgat 3644965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16204819 - 16204463
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204819 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 16204720  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204719 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctaggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16204620  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204619 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcccgctggaagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16204520  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16204519 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 16204463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41790095 - 41789739
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41790095 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 41789996  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41789995 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaagcgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaat 41789896  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41789895 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 41789796  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41789795 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 41789739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21894534 - 21894177
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagca-tgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21894534 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcactgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaact 21894435  T
Q  114 cggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaa 213  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894434 cggtatacaatgtttgagaggacttgttgtgctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaa 21894335  T
Q  214 tggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactca 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894334 tggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaaggttgcacgctggcagatgctattgtctgaatatgatattgtgttcaaaactca 21894235  T
Q  314 aaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21894234 aaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 21894177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 20464449 - 20464805
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464449 gatgaatccgtgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 20464548  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464549 ggtatacgatacttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgcaaaatgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 20464648  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  20464649 ggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaa 20464748  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20464749 aaagcaatcaaaggtagcattcttgccaatcatcttgcctgccaacctcttgatgat 20464805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 75 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20337141 - 20336845
Alignment:
Q  75 atctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtc 174  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  20337141 atctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaaaacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtc 20337042  T
Q  175 attatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20337041 attatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggca 20336942  T
Q  275 gatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20336941 gatgctcttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaaccccttgatgat 20336845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 22489500 - 22489782
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||| | || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||  | || |||     
T  22489500 tccatgggctgtgtgttgggccaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatatt 22489599  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    || | |||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22489600 cagtacttgagaaaacttgttgtgatttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcc 22489699  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 303  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  22489700 aatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgatggcagatgttattgtccgagtatgatatcgtgt 22489782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5628777 - 5628500
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  5628777 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgctact 5628678  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | || || || |||||| || |||| | |||||||||    
T  5628677 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatcc 5628578  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||||||| || ||||||||| | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5628577 aatcaagtacatatttgagaaacccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5628500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20339086 - 20339028
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgc 73  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20339086 gatgaatccgtgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaacttgaaagaaagaacatgc 20339028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 9507 - 9863
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9507 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 9606  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9607 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 9706  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 9806  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9807 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 9863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 9493 - 9849
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9493 gatgaatccatgggatgtgtgcttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 9592  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9593 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 9692  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9693 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 9792  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9793 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 18712954 - 18713310
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712954 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgccatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 18713053  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18713054 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 18713153  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18713154 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18713253  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18713254 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 18713310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 31357998 - 31358354
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31357998 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 31358097  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358098 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31358197  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31358198 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaa 31358297  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31358298 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 31358354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19205108 - 19204752
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19205108 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactgggaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 19205009  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19205008 ggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 19204909  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19204908 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 19204809  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19204808 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 19204752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 44564454 - 44564810
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564454 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 44564553  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564554 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtggtctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 44564653  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564654 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 44564753  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44564754 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatctggcttaccaacctcttgatgat 44564810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 15771044 - 15771400
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15771044 gatgaatctgtgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagtttaccgattgtgaaactc 15771143  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771144 ggtatacaatgtttgagaggacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 15771243  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771244 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 15771343  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771344 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15771400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28358698 - 28358342
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358698 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccgggaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 28358599  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358598 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 28358499  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358498 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 28358399  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358398 aaggcaatcaaaggtagtattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28358342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 9358095 - 9358451
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9358095 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 9358194  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9358195 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 9358294  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9358295 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaagactcaa 9358394  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358395 aaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9358451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 19691568 - 19691924
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19691568 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 19691667  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691668 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 19691767  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691768 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 19691867  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691868 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 19691924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 14561094 - 14561450
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14561094 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaaattcaccgattgtgaaactc 14561193  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561194 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 14561293  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14561294 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaa 14561393  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561394 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 14561450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 29832796 - 29833152
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29832796 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 29832895  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832896 ggtatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 29832995  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832996 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 29833095  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29833096 aaggcaatcaaaggcagcatcctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 29833152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2134006 - 2133650
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2134006 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaggaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcatcgattgtgaaactc 2133907  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2133906 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaat 2133807  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2133806 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaaattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 2133707  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2133706 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 2133650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 18794174 - 18794530
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18794174 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 18794273  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18794274 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttgatgagtcatacaacttggttgatatccagaat 18794373  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794374 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 18794473  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794474 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18794530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27605651 - 27605295
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27605651 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaggatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 27605552  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605551 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27605452  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605451 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 27605352  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27605351 aaggcaatcaaaggtagcattcttgtcgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27605295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 33262204 - 33262560
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33262204 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 33262303  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33262304 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaat 33262403  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262404 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 33262503  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33262504 aaggcaatcaaaggcagcatcctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 33262560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12089469 - 12089113
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12089469 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 12089370  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089369 gatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 12089270  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089269 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 12089170  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12089169 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 12089113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 19677917 - 19678272
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19677917 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagaacatgctatctactacctaagcaagaagtttaccgattgcgaaactc 19678016  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19678017 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 19678116  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19678117 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 19678216  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19678217 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 19678272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21344917 - 21344561
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344917 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 21344818  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21344817 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctaggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaac 21344718  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
     |  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344717 cgcccagctcaagtatatctctgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgctgacagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 21344618  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21344617 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 21344561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31486617 - 31486265
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31486617 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatttactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 31486518  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31486517 ggtacacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 31486418  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31486417 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaa 31486318  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31486317 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttga 31486265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 75 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19658027 - 19657731
Alignment:
Q  75 atctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtc 174  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  19658027 atctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggcctgggccgccaaacgcctgcgcc 19657928  T
Q  175 attatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggca 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19657927 attatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagttgctgttactgggaagattgcacgctggca 19657828  T
Q  275 gatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19657827 gatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19657731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 70 - 371
Target Start/End: Original strand, 33245894 - 33246195
Alignment:
Q  70 atgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcct 169  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||    
T  33245894 atgctatctactatctaagtaagaagttcaccgattgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcct 33245993  T
Q  170 gcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33245994 gcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattgcacgc 33246093  T
Q  270 tggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatg 369  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33246094 tgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagcttaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatg 33246193  T
Q  370 at 371  Q
    ||    
T  33246194 at 33246195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22077658 - 22077316
Alignment:
Q  14 agatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaact 113  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| |     
T  22077658 agatgaatccatgggatgtgtactcggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgctatctactatctgagcaagaactttaccgactgcgaagcc 22077559  T
Q  114 cggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaa 213  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||        || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22077558 caatatacgatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggc------ac--------cactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagga 22077473  T
Q  214 tggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactca 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077472 tggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgatgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactca 22077373  T
Q  314 aaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22077372 aaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22077316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 335
Target Start/End: Original strand, 22412432 - 22412728
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  22412432 ggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 22412531  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  22412532 gttgtgctttagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 22412631  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 335  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| | ||     ||||| || ||||||||||||||||||    
T  22412632 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcatc 22412728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 335
Target Start/End: Original strand, 19844643 - 19844957
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||  | || |||     
T  19844643 tccatgggctgtgtgttgggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcaagctatctactatttgagtaagaagttcaccgattgtgagtcccgatatt 19844742  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    |  | |||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19844743 cggtacttgagaaaacttgttgtgatttagcctgggctgccaaacgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcc 19844842  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggca 320  Q
     |||||||| || ||||||||  | ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| |||      ||||| || |||    
T  19844843 aatcaagtacatatttgagaagccagctttaactagaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatatcgtgcatcgcactcagaaagca 19844942  T
Q  321 atcaaaggtagcatc 335  Q
    |||||||||||||||    
T  19844943 atcaaaggtagcatc 19844957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 14212533 - 14212792
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  14212533 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 14212632  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  14212633 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 14212732  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  14212733 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 14212792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Original strand, 16768817 - 16769019
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| || || |||||  | || ||| | ||||||||||| || |    
T  16768817 ggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcacgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtcccgatattctatgcttgagaaaacct 16768916  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  16768917 gttgcgctttggcatgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttga 16769016  T
Q  239 gaa 241  Q
    |||    
T  16769017 gaa 16769019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 16052 - 16408
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16052 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctgagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 16151  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16152 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 16251  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 16351  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22976 - 22621
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22976 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcacgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 22877  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22876 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 22777  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22776 ggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 22677  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22676 aaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatga 22621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 3538 - 3894
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3538 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 3637  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3638 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 3737  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3738 ggattcgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 3837  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3838 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 3894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5964 - 5608
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5964 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaggatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 5865  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5864 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaat 5765  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764 ggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5665  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5664 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 13042 - 13398
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13042 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaactggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 13141  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13142 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctttagcctgggccactaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 13241  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13242 ggatccgataaagtatatctttgagaaggcggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 13341  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13342 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctcttgatgat 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 9516 - 9872
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9516 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagatgagactggaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 9615  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9616 ggtatacgatgcttgaaaagacttgttgtgctctggccttggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 9715  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9716 ggatccgataaaatatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattgcaagctggcagatgctcttgtctgaatatgatgttgtgttcaaaactcaa 9815  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9816 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaaccttttgatgat 9872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 11420 - 11776
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11420 gatgaatccatgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaaccggaaagaaagagcatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtgaaactc 11519  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11520 gatatacaatgcttgaaaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 11619  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11620 ggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 11719  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11720 aaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacctcttgatgat 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5456 - 5125
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    |||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  5456 gatgaatctatgggatgtgtattgggtcaacaagacgagactggaaagaaagagcatgccatctactatctaagcaagaagtttaccgactgcgaaattc 5357  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5356 ggtatacgatgcttgagaagacttgctgtgctctagcctgggctgccaaacgccttcgtcattacctggtaaatcatactacttggttgatatccaggat 5257  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 314  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5256 ggatccaatcaagtatatcttcgagaagcctgctgttactgggaagattgcacactggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5157  T
Q  315 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5156 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 5125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43513 - 43145
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaaga-tgagactggaaa-gaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgt-gaaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43513 gatgaatccatgggatgcgtacttggtcaacaagaatgagactggaaaagaaagaacatgctatctactatctaagcaagaagttcaccgattgtagaaa 43414  T
Q  112 ctcggtatacaatgcttgagaagacttgtt-gtgctctagct--tgggctgccaaacg-cctgcgtc-attatttggt-gaatcatacaacttggttgat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || | | |  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43413 ctcggtatacaatgcttgagaagacttgtttgtccttttggtcctgggccgctaaacgacctgcgtctattatttggttgaatcatacaacgtggttgat 43314  T
Q  206 atccagaatggatccgatcaagt-atatctttgag-aaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgc-ttttgtctgaatat-gatattgt 301  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43313 atccagaatggatccgataaagtaatatctttgagtaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgctttttgtctgaatatagatattgt 43214  T
Q  302 gttc-aaaactc-aaaaggcaatcaaaggtagc--atccttgccgatca-tcttgcttaccaacctctt 365  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43213 gttcaaaaactcaaaaaggcaatcaaaggtagctatttcttgccgatcattcttgcttaccaacctctt 43145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 370
Target Start/End: Original strand, 22757 - 22942
Alignment:
Q  185 gaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttg 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  22757 gaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttg 22856  T
Q  285 tctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22857 tctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 118946 - 118762
Alignment:
Q  187 atcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtc 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  118946 atcatacaacttgggtgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtc 118847  T
Q  287 tgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  118846 tgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 118762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 42 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34998 - 34673
Alignment:
Q  42 caacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagacttgtt 141  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  34998 caacaagatgaaactggaagaaaggagcacgccatttattatctaagcaagaagtttactgactgtgaatctcgctattccatgcttgagaggacttgtt 34899  T
Q  142 gtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaa 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34898 gtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaa 34799  T
Q  242 agctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgcc 341  Q
      | ||| | || |||| |||| |  | ||||||||||| || || || |||||||||| || | |  |||| || ||||||||||| || ||||||||     
T  34798 gcccgctttgacaggaaggatttcctggtggcagatgctattatccgagtatgatattgagtaccattctcagaaagcaatcaaaggcagtatccttgct 34699  T
Q  342 gatcatcttgcttaccaacctcttga 367  Q
    ||||| || ||| ||||||| |||||    
T  34698 gatcacctggctcaccaaccacttga 34673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 10713 - 10972
Alignment:
Q  39 ggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaatgcttgagaagactt 138  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||  | || ||| |  | |||||||| ||||    
T  10713 ggtcaacaagacgaaaccggaaagaaagagcacgctatctactatttgagtaagaagttcactgattgtgagtcccgatattctgtacttgagaaaactt 10812  T
Q  139 gttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttga 238  Q
    |||||||| || ||||||||||||| || || ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||    
T  10813 gttgtgctttaacttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttga 10912  T
Q  239 gaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
    |||  | ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  10913 gaagccagctttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatat 10972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 29647 - 29924
Alignment:
Q  21 tccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtata 120  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||| |||| ||      
T  29647 tccatgggttgtgtgctcggacaacaagatgaaaccggaagaaaagagcacgccatttattatttaagcaagaagtttactgaatgtgaatctcgatact 29746  T
Q  121 caatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcc 220  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| | |||||||||    
T  29747 ccatgctcgagaagacatgttgtgctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatcc 29846  T
Q  221 gatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatat 298  Q
     |||| ||| || ||||||||  | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  29847 aatcaggtacatatttgagaagcccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 29924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 371
Target Start/End: Original strand, 1979 - 2109
Alignment:
Q  244 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc---atccttgc 340  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||   || |||||    
T  1979 ctgctgttactaggaagattggacgctggcagatgctcttgtctgaatatggcattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattattcttgc 2078  T
Q  341 cgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2079 cgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5186 - 4969
Alignment:
Q  24 atgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactcggtatacaa 123  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || ||||||| |||||| ||||  || || ||| ||||||||||||| || ||  ||||  ||||||||   |    
T  5186 atgggttgtgtgctcgggcagcaagaagaaactggaaggaaagaacatgttatttactatttgagcaagaagtttacagatagtgagtctcggtatttca 5087  T
Q  124 tgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgat 223  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  5086 tacttgagaagacttgatgtgctttagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaat 4987  T
Q  224 caagtatatctttgagaa 241  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  4986 caagtatgtctttgagaa 4969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4700 - 4412
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgccatctattatctgagcaagaagttcaccgactgtgaaactc 114  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| || || |||||  | |    
T  4700 gatgattctatgggttgcgtgcttggtcaacaagacgaaactggaaagaaagagcatgccatttactacttgagtaagaagtttactgattgtgagtccc 4601  T
Q  115 ggtatacaatgcttgagaagacttgttgtgctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 214  Q
    | ||  | ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || || || || ||||| ||  ||||  | || || |||||||||||||||| |||    
T  4600 gatactctatgcttgagaaaacttgttgcgctttggcatgggccgctaagcgtctccgtcactacatggtttaccacactacttggttgatatccaaaat 4501  T
Q  215 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 303  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||  | ||  | || ||||  ||||| || | ||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4500 ggatccgatcaagtacctttttgagaagccggcgttaacaggaagaattgctcgtttgcagatgttattgtctgattatgatattgtgt 4412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 1409 - 1351
Alignment:
Q  15 gatgaatccatgggatgcgtgcttggtcaacaagatgagactggaaagaaagagcatgc 73  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  1409 gatgaatccgtgggatgtgtacttggtcaacaagatgaaacttgaaagaaagaacatgc 1351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University