View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0328_low_2 (Length: 534)

Name: NF0328_low_2
Description: NF0328
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0328_low_2
NF0328_low_2
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (25-513)||(129908-130396)
scaffold0010 (330-497)||(60649-60818)
scaffold0010 (44-136)||(60289-60381)
scaffold0010 (161-228)||(60481-60548)
[»] chr3 (172 HSPs)
chr3 (25-513)||(16097331-16097819)
chr3 (11-513)||(15470927-15471427)
chr3 (11-512)||(14234491-14234993)
chr3 (26-513)||(16103783-16104268)
chr3 (25-509)||(32307684-32308157)
chr3 (25-513)||(49667716-49668194)
chr3 (25-512)||(13209960-13210444)
chr3 (25-513)||(9512923-9513399)
chr3 (25-513)||(9520898-9521374)
chr3 (25-509)||(1644315-1644787)
chr3 (22-404)||(1465038-1465419)
chr3 (285-513)||(12174152-12174377)
chr3 (25-404)||(49389276-49389639)
chr3 (25-351)||(12933942-12934268)
chr3 (161-497)||(37250934-37251270)
chr3 (161-497)||(22110118-22110454)
chr3 (44-269)||(324481-324705)
chr3 (11-267)||(2050819-2051071)
chr3 (334-497)||(52523665-52523831)
chr3 (26-281)||(12171750-12171992)
chr3 (335-512)||(27165251-27165429)
chr3 (330-498)||(24340657-24340826)
chr3 (25-267)||(12340000-12340241)
chr3 (330-498)||(23274705-23274874)
chr3 (25-267)||(14669008-14669249)
chr3 (11-267)||(42386660-42386914)
chr3 (338-512)||(53301492-53301668)
chr3 (11-254)||(52523345-52523586)
chr3 (330-498)||(37642199-37642368)
chr3 (25-199)||(17247918-17248092)
chr3 (164-358)||(43927291-43927484)
chr3 (397-512)||(18438538-18438653)
chr3 (34-267)||(14665853-14666085)
chr3 (34-267)||(14735366-14735598)
chr3 (390-512)||(12399213-12399335)
chr3 (335-512)||(14972858-14973036)
chr3 (25-128)||(18438920-18439023)
chr3 (25-199)||(53070331-53070504)
chr3 (362-497)||(43925977-43926114)
chr3 (390-498)||(42386428-42386536)
chr3 (390-512)||(13442278-13442400)
chr3 (25-128)||(14179708-14179811)
chr3 (418-512)||(11424783-11424876)
chr3 (390-512)||(24153204-24153325)
chr3 (390-512)||(36166599-36166719)
chr3 (329-497)||(43550457-43550625)
chr3 (338-498)||(22147467-22147628)
chr3 (334-454)||(2051137-2051260)
chr3 (25-129)||(20698079-20698183)
chr3 (397-512)||(20698437-20698552)
chr3 (25-128)||(11424395-11424498)
chr3 (390-509)||(14572596-14572714)
chr3 (390-512)||(17487860-17487982)
chr3 (390-512)||(17499342-17499464)
chr3 (390-512)||(23083356-23083478)
chr3 (394-512)||(25476384-25476502)
chr3 (390-502)||(21618460-21618570)
chr3 (335-512)||(9707592-9707768)
chr3 (390-513)||(14576828-14576950)
chr3 (335-512)||(17463179-17463355)
chr3 (390-512)||(26686891-26687013)
chr3 (25-128)||(26687273-26687376)
chr3 (355-512)||(29172587-29172744)
chr3 (335-512)||(34159327-34159503)
chr3 (25-128)||(40213353-40213456)
chr3 (394-512)||(40213720-40213837)
chr3 (335-512)||(45606892-45607068)
chr3 (335-512)||(55476492-55476668)
chr3 (25-123)||(14973245-14973343)
chr3 (335-511)||(16282796-16282971)
chr3 (329-512)||(8899095-8899277)
chr3 (335-502)||(12567571-12567737)
chr3 (335-502)||(13544036-13544202)
chr3 (35-128)||(14572974-14573067)
chr3 (44-125)||(22109926-22110007)
chr3 (451-512)||(28194694-28194755)
chr3 (335-502)||(38961876-38962042)
chr3 (44-136)||(605942-606034)
chr3 (25-101)||(12399608-12399684)
chr3 (44-136)||(23275119-23275211)
chr3 (394-509)||(606324-606441)
chr3 (335-512)||(6469119-6469295)
chr3 (335-512)||(7781332-7781508)
chr3 (335-512)||(16454266-16454442)
chr3 (25-108)||(17247152-17247235)
chr3 (25-128)||(25476017-25476120)
chr3 (335-512)||(28848596-28848772)
chr3 (44-126)||(14501587-14501669)
chr3 (35-136)||(23412815-23412916)
chr3 (335-512)||(13151775-13151952)
chr3 (335-512)||(13154240-13154417)
chr3 (25-129)||(30030213-30030317)
chr3 (335-512)||(10247708-10247884)
chr3 (25-128)||(14576465-14576568)
chr3 (25-128)||(17488243-17488346)
chr3 (25-128)||(17499725-17499828)
chr3 (394-512)||(17672627-17672744)
chr3 (390-504)||(43840944-43841058)
chr3 (329-502)||(50242833-50243005)
chr3 (35-125)||(4588457-4588547)
chr3 (330-440)||(19775998-19776107)
chr3 (330-440)||(37439403-37439512)
chr3 (44-126)||(45797631-45797713)
chr3 (399-512)||(55500943-55501055)
chr3 (330-415)||(23413186-23413271)
chr3 (335-511)||(41123892-41124064)
chr3 (330-497)||(53070633-53070799)
chr3 (400-497)||(12377940-12378039)
chr3 (44-136)||(43927558-43927650)
chr3 (208-267)||(4588602-4588661)
chr3 (394-512)||(15977516-15977633)
chr3 (335-512)||(17446640-17446815)
chr3 (25-108)||(43842584-43842667)
chr3 (44-118)||(316592-316666)
chr3 (330-440)||(4107164-4107273)
chr3 (330-440)||(4111016-4111125)
chr3 (330-440)||(8489232-8489341)
chr3 (330-440)||(15965202-15965311)
chr3 (330-440)||(15969126-15969235)
chr3 (330-440)||(15973050-15973159)
chr3 (330-440)||(16749761-16749870)
chr3 (454-512)||(17737237-17737294)
chr3 (463-512)||(8499519-8499568)
chr3 (463-512)||(10556986-10557035)
chr3 (51-136)||(12378374-12378459)
chr3 (463-512)||(15412430-15412479)
chr3 (25-78)||(15877461-15877514)
chr3 (463-512)||(45577950-45577999)
chr3 (394-512)||(12119768-12119886)
chr3 (44-136)||(37250763-37250855)
chr3 (25-128)||(12851996-12852099)
chr3 (365-440)||(16750390-16750464)
chr3 (25-129)||(16809774-16809874)
chr3 (22-85)||(22791727-22791790)
chr3 (161-199)||(14572903-14572941)
chr3 (330-440)||(12852300-12852413)
chr3 (26-75)||(17674209-17674258)
chr3 (463-512)||(44494810-44494859)
chr3 (64-128)||(13442660-13442724)
chr3 (56-136)||(21837878-21837958)
chr3 (345-440)||(45797242-45797337)
chr3 (163-202)||(2034752-2034791)
chr3 (163-202)||(2038259-2038298)
chr3 (163-202)||(2042000-2042039)
chr3 (161-200)||(11424531-11424570)
chr3 (163-202)||(14038489-14038528)
chr3 (163-202)||(14041957-14041996)
chr3 (365-440)||(16749994-16750068)
chr3 (163-202)||(18959206-18959245)
chr3 (34-77)||(23052719-23052762)
chr3 (163-198)||(23083132-23083167)
chr3 (163-202)||(39231036-39231075)
chr3 (56-122)||(9578070-9578136)
chr3 (31-73)||(16369845-16369887)
chr3 (161-202)||(606135-606176)
chr3 (26-75)||(3402600-3402649)
chr3 (26-75)||(11852006-11852055)
chr3 (25-78)||(12037586-12037639)
chr3 (222-267)||(45797415-45797460)
chr3 (35-75)||(321657-321697)
chr3 (164-200)||(11855032-11855068)
chr3 (35-75)||(12173221-12173261)
chr3 (31-75)||(12496690-12496734)
chr3 (345-440)||(14501198-14501293)
chr3 (31-75)||(15060727-15060771)
chr3 (35-75)||(17524817-17524857)
chr3 (31-75)||(18383556-18383600)
chr3 (164-200)||(20723297-20723333)
chr3 (163-199)||(30030153-30030189)
chr3 (163-199)||(54973700-54973736)
chr3 (163-199)||(54976310-54976346)
chr3 (163-199)||(54978920-54978956)
[»] chr5 (119 HSPs)
chr5 (25-513)||(21565545-21566033)
chr5 (21-512)||(21329123-21329614)
chr5 (26-513)||(22959166-22959650)
chr5 (25-512)||(19668902-19669389)
chr5 (11-513)||(26011652-26012154)
chr5 (25-512)||(19660469-19660952)
chr5 (161-512)||(21501922-21502273)
chr5 (22-319)||(21741172-21741469)
chr5 (161-497)||(20026707-20027043)
chr5 (22-251)||(5888804-5889033)
chr5 (240-497)||(22178064-22178323)
chr5 (11-267)||(22144299-22144553)
chr5 (21-139)||(21498645-21498763)
chr5 (330-497)||(22144068-22144236)
chr5 (34-267)||(22119834-22120066)
chr5 (415-512)||(36314581-36314678)
chr5 (330-498)||(40725871-40726040)
chr5 (390-512)||(22412188-22412309)
chr5 (390-512)||(24493573-24493694)
chr5 (383-512)||(8286829-8286960)
chr5 (25-129)||(21292613-21292717)
chr5 (390-512)||(21729059-21729181)
chr5 (390-512)||(21808384-21808506)
chr5 (25-128)||(21985779-21985882)
chr5 (390-512)||(23390491-23390613)
chr5 (390-512)||(13025315-13025436)
chr5 (390-512)||(13095499-13095620)
chr5 (34-267)||(36154469-36154700)
chr5 (408-512)||(21997547-21997651)
chr5 (335-509)||(1096474-1096649)
chr5 (397-512)||(24529224-24529339)
chr5 (25-128)||(1096853-1096956)
chr5 (394-512)||(9077956-9078074)
chr5 (25-267)||(21871203-21871444)
chr5 (25-267)||(21875483-21875724)
chr5 (25-128)||(23390128-23390231)
chr5 (25-128)||(24529607-24529710)
chr5 (390-512)||(25421536-25421658)
chr5 (161-267)||(24767104-24767210)
chr5 (328-463)||(29448055-29448192)
chr5 (26-127)||(11580878-11580979)
chr5 (335-512)||(264753-264929)
chr5 (335-512)||(20909013-20909189)
chr5 (335-512)||(29329935-29330111)
chr5 (335-512)||(39363385-39363561)
chr5 (22-136)||(20026492-20026606)
chr5 (334-512)||(11581183-11581360)
chr5 (25-129)||(22075393-22075497)
chr5 (25-128)||(9078338-9078441)
chr5 (355-512)||(10732944-10733101)
chr5 (390-500)||(22075035-22075145)
chr5 (335-512)||(42245350-42245526)
chr5 (330-440)||(21871507-21871616)
chr5 (330-440)||(21875787-21875896)
chr5 (392-496)||(25431414-25431518)
chr5 (25-129)||(8286485-8286589)
chr5 (345-512)||(36154777-36154941)
chr5 (25-128)||(13095880-13095983)
chr5 (330-501)||(20901988-20902159)
chr5 (25-128)||(24493954-24494057)
chr5 (25-128)||(25431780-25431883)
chr5 (161-296)||(25743940-25744074)
chr5 (335-512)||(29345981-29346157)
chr5 (330-440)||(10753594-10753703)
chr5 (25-103)||(25421943-25422021)
chr5 (44-125)||(22177794-22177875)
chr5 (444-497)||(37723922-37723975)
chr5 (445-512)||(21293020-21293086)
chr5 (26-125)||(22107017-22107116)
chr5 (335-512)||(29348454-29348630)
chr5 (335-512)||(29350927-29351103)
chr5 (406-512)||(39245137-39245242)
chr5 (330-512)||(2154593-2154775)
chr5 (454-512)||(20918052-20918109)
chr5 (330-440)||(22120131-22120240)
chr5 (463-512)||(23064512-23064561)
chr5 (240-312)||(27988774-27988846)
chr5 (463-512)||(38619435-38619484)
chr5 (241-497)||(15796438-15796696)
chr5 (345-502)||(18319027-18319185)
chr5 (348-404)||(21741486-21741541)
chr5 (465-512)||(10775790-10775837)
chr5 (25-128)||(13025696-13025799)
chr5 (25-128)||(24766969-24767072)
chr5 (335-512)||(32027394-32027570)
chr5 (31-78)||(37724337-37724384)
chr5 (161-199)||(25431709-25431747)
chr5 (463-512)||(31061069-31061118)
chr5 (344-416)||(24767287-24767359)
chr5 (163-202)||(4398019-4398058)
chr5 (163-202)||(16255704-16255743)
chr5 (163-202)||(16259337-16259376)
chr5 (390-449)||(20766115-20766174)
chr5 (163-202)||(22589501-22589540)
chr5 (163-202)||(22593056-22593095)
chr5 (163-202)||(22596611-22596650)
chr5 (163-202)||(22880519-22880558)
chr5 (35-78)||(23201802-23201845)
chr5 (163-202)||(23693769-23693808)
chr5 (163-202)||(26360854-26360893)
chr5 (335-394)||(36314670-36314728)
chr5 (163-202)||(43121474-43121513)
chr5 (163-202)||(43125007-43125046)
chr5 (161-199)||(1096782-1096820)
chr5 (161-199)||(11581013-11581051)
chr5 (161-199)||(25421847-25421885)
chr5 (463-513)||(26704074-26704124)
chr5 (56-122)||(26732421-26732487)
chr5 (446-500)||(26732884-26732937)
chr5 (56-122)||(26740234-26740300)
chr5 (463-513)||(26973807-26973857)
chr5 (26-75)||(17918796-17918845)
chr5 (463-512)||(20806854-20806903)
chr5 (35-75)||(18769647-18769687)
chr5 (31-75)||(21366305-21366349)
chr5 (35-75)||(21887260-21887300)
chr5 (164-200)||(23501118-23501154)
chr5 (163-199)||(26496199-26496235)
chr5 (163-199)||(29324991-29325027)
[»] chr1 (115 HSPs)
chr1 (21-513)||(22921495-22921987)
chr1 (25-513)||(33681010-33681498)
chr1 (26-513)||(22237630-22238117)
chr1 (25-513)||(52927613-52928088)
chr1 (26-513)||(20248282-20248765)
chr1 (25-509)||(21754052-21754524)
chr1 (32-500)||(20918620-20919083)
chr1 (11-409)||(20636956-20637354)
chr1 (22-404)||(35981316-35981696)
chr1 (214-497)||(21861389-21861672)
chr1 (214-497)||(21896078-21896358)
chr1 (22-277)||(28194077-28194332)
chr1 (224-509)||(16368115-16368401)
chr1 (165-404)||(49261452-49261690)
chr1 (160-497)||(50686630-50686968)
chr1 (240-497)||(41049880-41050138)
chr1 (335-513)||(14295495-14295672)
chr1 (224-497)||(50613945-50614219)
chr1 (224-497)||(50621773-50622047)
chr1 (161-431)||(12271639-12271901)
chr1 (330-497)||(35261015-35261180)
chr1 (328-501)||(16758664-16758839)
chr1 (21-139)||(43697735-43697853)
chr1 (401-513)||(21161719-21161830)
chr1 (329-463)||(22130844-22130975)
chr1 (394-512)||(50210212-50210330)
chr1 (330-512)||(433013-433193)
chr1 (25-129)||(22355817-22355921)
chr1 (25-129)||(22357503-22357607)
chr1 (397-512)||(34509784-34509899)
chr1 (345-497)||(45574836-45574989)
chr1 (25-129)||(20846862-20846966)
chr1 (25-129)||(27250372-27250476)
chr1 (338-497)||(16093826-16093987)
chr1 (22-125)||(16759115-16759218)
chr1 (335-512)||(23593719-23593896)
chr1 (390-512)||(27250724-27250846)
chr1 (25-199)||(433322-433496)
chr1 (22-136)||(21895861-21895975)
chr1 (22-126)||(21342536-21342640)
chr1 (22-126)||(21347401-21347505)
chr1 (335-512)||(13988867-13989043)
chr1 (335-512)||(21923276-21923452)
chr1 (25-128)||(22532655-22532758)
chr1 (25-128)||(34510166-34510269)
chr1 (335-448)||(51130632-51130741)
chr1 (31-129)||(21027054-21027152)
chr1 (22-136)||(21861123-21861237)
chr1 (394-502)||(21840778-21840885)
chr1 (25-129)||(38801034-38801138)
chr1 (445-512)||(20847205-20847271)
chr1 (390-512)||(21026684-21026806)
chr1 (335-512)||(21475072-21475248)
chr1 (390-512)||(22532273-22532395)
chr1 (335-512)||(29776689-29776865)
chr1 (335-512)||(31612314-31612490)
chr1 (44-126)||(41049619-41049701)
chr1 (335-502)||(16361928-16362095)
chr1 (345-512)||(29298138-29298304)
chr1 (44-136)||(26065372-26065464)
chr1 (440-512)||(38801433-38801504)
chr1 (447-502)||(20454606-20454660)
chr1 (25-100)||(21301170-21301245)
chr1 (347-495)||(26064959-26065108)
chr1 (330-440)||(1924896-1925005)
chr1 (22-136)||(16367839-16367953)
chr1 (26-128)||(20135573-20135675)
chr1 (330-440)||(20923910-20924019)
chr1 (24-78)||(21714983-21715037)
chr1 (44-125)||(35260706-35260787)
chr1 (335-512)||(22123052-22123229)
chr1 (69-128)||(50209889-50209948)
chr1 (330-440)||(41387815-41387924)
chr1 (463-512)||(13212974-13213023)
chr1 (463-512)||(21342097-21342146)
chr1 (463-512)||(21346962-21347011)
chr1 (463-512)||(21707168-21707217)
chr1 (463-512)||(21711710-21711759)
chr1 (25-78)||(22468329-22468382)
chr1 (161-253)||(26065202-26065293)
chr1 (161-267)||(16758900-16759004)
chr1 (463-513)||(21714545-21714595)
chr1 (25-127)||(22354204-22354306)
chr1 (56-122)||(27652808-27652874)
chr1 (56-122)||(48521036-48521102)
chr1 (463-512)||(15860121-15860170)
chr1 (56-133)||(16093479-16093556)
chr1 (52-136)||(50613699-50613783)
chr1 (52-136)||(50621527-50621611)
chr1 (64-136)||(50687046-50687118)
chr1 (26-73)||(3472560-3472607)
chr1 (163-202)||(14432123-14432162)
chr1 (163-202)||(20631628-20631667)
chr1 (447-502)||(22468749-22468803)
chr1 (163-202)||(22900022-22900061)
chr1 (163-202)||(24087727-24087766)
chr1 (163-202)||(36181887-36181926)
chr1 (163-202)||(37358780-37358819)
chr1 (365-440)||(41388048-41388122)
chr1 (163-202)||(45307602-45307641)
chr1 (25-75)||(8761266-8761316)
chr1 (249-311)||(16381389-16381451)
chr1 (161-199)||(38801160-38801198)
chr1 (56-98)||(52940464-52940506)
chr1 (463-512)||(16275476-16275525)
chr1 (162-199)||(20135502-20135539)
chr1 (365-430)||(39243943-39244008)
chr1 (365-430)||(39247498-39247563)
chr1 (11-91)||(12272047-12272127)
chr1 (25-125)||(20091106-20091206)
chr1 (163-199)||(20579779-20579815)
chr1 (164-200)||(21162079-21162115)
chr1 (31-75)||(22432422-22432466)
chr1 (35-75)||(22831021-22831061)
chr1 (35-75)||(42864854-42864894)
[»] chr7 (127 HSPs)
chr7 (21-513)||(16219344-16219835)
chr7 (25-512)||(67749-68235)
chr7 (11-512)||(47831811-47832311)
chr7 (25-513)||(18005649-18006130)
chr7 (25-513)||(44014181-44014663)
chr7 (22-501)||(16056343-16056820)
chr7 (11-513)||(810747-811249)
chr7 (22-512)||(22072917-22073408)
chr7 (25-512)||(15754519-15755004)
chr7 (25-512)||(28504933-28505415)
chr7 (25-512)||(34200790-34201272)
chr7 (161-512)||(11995797-11996144)
chr7 (25-290)||(9389327-9389592)
chr7 (11-324)||(16324197-16324509)
chr7 (160-501)||(12901338-12901683)
chr7 (161-431)||(15116565-15116834)
chr7 (240-497)||(20220034-20220290)
chr7 (162-431)||(15113028-15113296)
chr7 (11-267)||(12255409-12255663)
chr7 (335-512)||(16495406-16495579)
chr7 (11-267)||(2279736-2279990)
chr7 (330-513)||(2280053-2280238)
chr7 (330-501)||(1867929-1868101)
chr7 (334-494)||(12255729-12255892)
chr7 (329-501)||(14044761-14044935)
chr7 (329-501)||(14354791-14354965)
chr7 (330-498)||(19486678-19486847)
chr7 (26-199)||(12756350-12756522)
chr7 (329-497)||(13647344-13647512)
chr7 (390-512)||(38227485-38227606)
chr7 (394-512)||(3564363-3564481)
chr7 (25-267)||(9751182-9751423)
chr7 (330-493)||(15008433-15008597)
chr7 (390-512)||(18456408-18456529)
chr7 (25-267)||(39267278-39267519)
chr7 (390-512)||(12698835-12698958)
chr7 (25-129)||(16385890-16385994)
chr7 (390-512)||(9509193-9509315)
chr7 (330-512)||(17061895-17062076)
chr7 (25-128)||(38227866-38227969)
chr7 (26-267)||(17061593-17061832)
chr7 (330-498)||(10063757-10063921)
chr7 (25-245)||(18302448-18302667)
chr7 (25-129)||(40443762-40443866)
chr7 (335-512)||(18430713-18430889)
chr7 (394-512)||(48273393-48273511)
chr7 (25-267)||(2831938-2832178)
chr7 (25-103)||(11995690-11995768)
chr7 (25-129)||(26212370-26212474)
chr7 (25-129)||(27847476-27847580)
chr7 (335-512)||(456322-456498)
chr7 (25-128)||(3563996-3564099)
chr7 (25-128)||(9509575-9509678)
chr7 (335-512)||(11393272-11393448)
chr7 (335-512)||(11972497-11972673)
chr7 (25-128)||(12699218-12699321)
chr7 (335-512)||(14949107-14949283)
chr7 (335-512)||(15376698-15376874)
chr7 (335-512)||(16232521-16232697)
chr7 (390-512)||(16386242-16386365)
chr7 (335-512)||(20385108-20385284)
chr7 (335-512)||(21189580-21189756)
chr7 (335-512)||(24702239-24702415)
chr7 (335-512)||(32125492-32125668)
chr7 (335-512)||(41522918-41523094)
chr7 (335-512)||(41525380-41525556)
chr7 (25-195)||(21064794-21064964)
chr7 (345-512)||(18640273-18640440)
chr7 (26-199)||(44116820-44116992)
chr7 (25-128)||(15143668-15143772)
chr7 (330-512)||(44116510-44116691)
chr7 (335-512)||(24704689-24704862)
chr7 (390-500)||(26212012-26212122)
chr7 (335-512)||(27216861-27217037)
chr7 (397-512)||(40443395-40443509)
chr7 (35-125)||(2529619-2529709)
chr7 (394-502)||(24275182-24275289)
chr7 (394-513)||(15144037-15144154)
chr7 (57-136)||(1867650-1867729)
chr7 (57-136)||(14045202-14045281)
chr7 (57-136)||(14355232-14355311)
chr7 (394-512)||(16410060-16410177)
chr7 (24-78)||(18154468-18154522)
chr7 (446-512)||(27847881-27847947)
chr7 (401-512)||(16213685-16213795)
chr7 (69-136)||(12901783-12901850)
chr7 (454-512)||(3386334-3386391)
chr7 (56-122)||(9177252-9177318)
chr7 (44-122)||(17017042-17017120)
chr7 (330-440)||(18426070-18426179)
chr7 (330-440)||(39267582-39267691)
chr7 (330-440)||(45169773-45169882)
chr7 (439-500)||(10589055-10589115)
chr7 (463-512)||(13869347-13869396)
chr7 (25-78)||(19649117-19649170)
chr7 (463-512)||(20110557-20110606)
chr7 (25-86)||(24054894-24054955)
chr7 (207-267)||(2529866-2529926)
chr7 (26-90)||(2760549-2760613)
chr7 (26-90)||(3272209-3272273)
chr7 (388-488)||(14036282-14036384)
chr7 (388-488)||(14346312-14346414)
chr7 (395-431)||(16324135-16324171)
chr7 (57-124)||(14036664-14036731)
chr7 (57-124)||(14346694-14346761)
chr7 (44-126)||(15008095-15008177)
chr7 (463-512)||(13831374-13831423)
chr7 (344-416)||(9751500-9751572)
chr7 (364-440)||(18425668-18425743)
chr7 (364-440)||(18425870-18425945)
chr7 (345-502)||(38898370-38898528)
chr7 (163-202)||(123961-124000)
chr7 (163-202)||(4993798-4993837)
chr7 (35-78)||(10508725-10508768)
chr7 (163-202)||(13395233-13395272)
chr7 (447-498)||(18154894-18154944)
chr7 (163-202)||(48785625-48785664)
chr7 (56-122)||(11768526-11768592)
chr7 (24-62)||(14194729-14194767)
chr7 (161-199)||(26212310-26212348)
chr7 (444-490)||(48991206-48991252)
chr7 (347-404)||(9389649-9389705)
chr7 (35-96)||(11880668-11880729)
chr7 (161-201)||(9177432-9177472)
chr7 (35-75)||(9703703-9703743)
chr7 (163-199)||(16006732-16006768)
chr7 (163-199)||(21743056-21743092)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (25-506)||(6822-7300)
scaffold0556 (11-434)||(8097-8519)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (11-512)||(39705906-39706405)
chr4 (25-513)||(8846359-8846864)
chr4 (25-513)||(12774010-12774487)
chr4 (22-404)||(15099461-15099842)
chr4 (240-497)||(13695-13953)
chr4 (25-512)||(15551821-15552302)
chr4 (36-404)||(15190428-15190795)
chr4 (31-478)||(16596686-16597128)
chr4 (161-501)||(12287976-12288316)
chr4 (224-501)||(43198384-43198661)
chr4 (224-497)||(53081979-53082254)
chr4 (224-497)||(46640285-46640558)
chr4 (21-201)||(13844852-13845032)
chr4 (11-186)||(43198206-43198381)
chr4 (330-501)||(52243128-52243302)
chr4 (11-228)||(15464547-15464764)
chr4 (11-254)||(52242811-52243052)
chr4 (25-267)||(24028989-24029230)
chr4 (390-512)||(7798778-7798900)
chr4 (394-504)||(16377522-16377630)
chr4 (25-267)||(20156922-20157163)
chr4 (25-267)||(22633845-22634086)
chr4 (397-512)||(7088881-7088996)
chr4 (338-512)||(44928866-44929041)
chr4 (22-136)||(13402-13516)
chr4 (390-512)||(6899895-6900016)
chr4 (25-267)||(13812441-13812682)
chr4 (390-512)||(16270231-16270352)
chr4 (25-267)||(44928555-44928795)
chr4 (391-512)||(52873363-52873484)
chr4 (35-136)||(15868277-15868378)
chr4 (329-512)||(18215253-18215435)
chr4 (25-129)||(3097017-3097121)
chr4 (25-129)||(7089251-7089355)
chr4 (25-129)||(12903131-12903234)
chr4 (161-256)||(3332144-3332239)
chr4 (390-512)||(12902761-12902883)
chr4 (390-512)||(14280317-14280438)
chr4 (335-512)||(44615289-44615465)
chr4 (390-512)||(54798749-54798871)
chr4 (390-512)||(16239965-16240086)
chr4 (25-128)||(16239624-16239728)
chr4 (390-512)||(7893707-7893829)
chr4 (335-512)||(15118337-15118513)
chr4 (390-512)||(22636439-22636561)
chr4 (390-512)||(44052833-44052955)
chr4 (335-512)||(44773072-44773248)
chr4 (335-512)||(52312511-52312687)
chr4 (394-511)||(14038653-14038770)
chr4 (345-512)||(12301-12468)
chr4 (439-512)||(3096297-3096369)
chr4 (51-136)||(12287791-12287876)
chr4 (28-129)||(14052948-14053049)
chr4 (394-502)||(19618216-19618323)
chr4 (444-512)||(17046491-17046559)
chr4 (390-509)||(23374354-23374473)
chr4 (335-512)||(1837494-1837670)
chr4 (25-124)||(14039039-14039138)
chr4 (330-440)||(630710-630819)
chr4 (34-128)||(6190819-6190913)
chr4 (340-512)||(19242700-19242872)
chr4 (26-199)||(21814936-21815108)
chr4 (26-199)||(21818358-21818530)
chr4 (345-512)||(50222333-50222500)
chr4 (335-512)||(3515008-3515184)
chr4 (25-128)||(15091283-15091386)
chr4 (335-512)||(18239404-18239580)
chr4 (330-440)||(3331961-3332070)
chr4 (390-512)||(8574864-8574984)
chr4 (330-440)||(14953897-14954006)
chr4 (335-502)||(15355309-15355476)
chr4 (26-199)||(21815265-21815437)
chr4 (330-440)||(25690137-25690246)
chr4 (44-126)||(32851839-32851921)
chr4 (329-512)||(51463847-51464029)
chr4 (344-440)||(13812759-13812854)
chr4 (25-129)||(16377154-16377258)
chr4 (25-125)||(44053218-44053318)
chr4 (44-136)||(53081748-53081840)
chr4 (25-128)||(7799083-7799186)
chr4 (35-122)||(17047726-17047813)
chr4 (25-128)||(22636820-22636923)
chr4 (447-497)||(6190481-6190531)
chr4 (454-512)||(7641286-7641343)
chr4 (330-440)||(10713083-10713192)
chr4 (330-440)||(10926853-10926962)
chr4 (454-512)||(12610951-12611008)
chr4 (330-440)||(15225308-15225417)
chr4 (454-512)||(23803369-23803426)
chr4 (335-440)||(12487941-12488045)
chr4 (399-512)||(14053306-14053418)
chr4 (463-512)||(44102215-44102264)
chr4 (26-127)||(44102597-44102697)
chr4 (258-333)||(14164732-14164807)
chr4 (330-440)||(15868645-15868754)
chr4 (394-502)||(14970751-14970858)
chr4 (330-434)||(15464865-15464970)
chr4 (345-440)||(32851450-32851545)
chr4 (44-124)||(46640031-46640111)
chr4 (163-202)||(287402-287441)
chr4 (258-333)||(14158027-14158102)
chr4 (365-440)||(15225114-15225188)
chr4 (163-202)||(16359815-16359854)
chr4 (51-122)||(17333749-17333820)
chr4 (163-202)||(31116822-31116861)
chr4 (163-202)||(55502517-55502556)
chr4 (161-199)||(7089191-7089229)
chr4 (161-199)||(17047841-17047879)
chr4 (447-497)||(22353852-22353901)
chr4 (56-122)||(32306582-32306648)
chr4 (161-199)||(44102525-44102563)
chr4 (214-267)||(32851623-32851676)
chr4 (35-96)||(44676047-44676108)
chr4 (163-199)||(4171338-4171374)
chr4 (35-75)||(13569948-13569988)
chr4 (163-199)||(14699030-14699066)
chr4 (35-75)||(15094209-15094249)
chr4 (35-75)||(15121446-15121486)
chr4 (330-374)||(15791916-15791960)
chr4 (31-75)||(16348331-16348375)
chr4 (344-416)||(20157240-20157312)
chr4 (344-416)||(22634163-22634235)
chr4 (35-75)||(23843915-23843955)
chr4 (56-136)||(26789792-26789872)
[»] chr6 (136 HSPs)
chr6 (25-513)||(19652198-19652684)
chr6 (11-513)||(23019408-23019910)
chr6 (25-512)||(29808515-29808999)
chr6 (25-512)||(28496105-28496588)
chr6 (25-512)||(1561307-1561792)
chr6 (161-501)||(19668386-19668726)
chr6 (25-457)||(22080369-22080800)
chr6 (240-513)||(20109140-20109417)
chr6 (11-324)||(27332902-27333214)
chr6 (11-324)||(27393642-27393954)
chr6 (35-513)||(4185465-4185939)
chr6 (161-501)||(9098292-9098620)
chr6 (20-267)||(25644571-25644816)
chr6 (35-461)||(4667855-4668277)
chr6 (35-461)||(4674702-4675124)
chr6 (161-497)||(35008167-35008503)
chr6 (415-512)||(27333238-27333335)
chr6 (415-512)||(27393978-27394075)
chr6 (240-497)||(23076749-23077008)
chr6 (21-201)||(25956249-25956429)
chr6 (330-501)||(25644335-25644508)
chr6 (164-513)||(31155169-31155515)
chr6 (330-509)||(8227445-8227625)
chr6 (401-507)||(4186376-4186482)
chr6 (25-129)||(20637926-20638030)
chr6 (54-268)||(4189203-4189416)
chr6 (394-512)||(29060544-29060662)
chr6 (329-512)||(22782228-22782410)
chr6 (390-512)||(16496248-16496370)
chr6 (394-512)||(18409826-18409944)
chr6 (394-512)||(19303540-19303657)
chr6 (410-512)||(20076704-20076805)
chr6 (25-125)||(19303173-19303273)
chr6 (25-129)||(20360603-20360707)
chr6 (25-128)||(18409459-18409562)
chr6 (26-129)||(18821463-18821566)
chr6 (25-128)||(22779859-22779962)
chr6 (394-512)||(25629354-25629472)
chr6 (26-199)||(18457030-18457202)
chr6 (25-267)||(21939631-21939872)
chr6 (335-502)||(30676695-30676861)
chr6 (335-512)||(2291165-2291341)
chr6 (335-512)||(12742318-12742494)
chr6 (390-512)||(17287791-17287913)
chr6 (335-512)||(18334577-18334753)
chr6 (335-512)||(19005047-19005223)
chr6 (335-512)||(19858904-19859080)
chr6 (390-504)||(20360955-20361069)
chr6 (394-512)||(20593777-20593895)
chr6 (335-512)||(24422548-24422724)
chr6 (335-512)||(33861795-33861971)
chr6 (335-512)||(33864279-33864455)
chr6 (22-124)||(20109605-20109707)
chr6 (216-497)||(18199237-18199519)
chr6 (397-512)||(16920634-16920747)
chr6 (241-497)||(18204096-18204354)
chr6 (397-512)||(20638285-20638400)
chr6 (397-512)||(35245590-35245703)
chr6 (335-512)||(1595550-1595726)
chr6 (335-512)||(8055030-8055206)
chr6 (25-108)||(17287428-17287511)
chr6 (25-128)||(25628987-25629090)
chr6 (335-512)||(26924625-26924801)
chr6 (408-512)||(25656630-25656733)
chr6 (329-512)||(25754810-25754992)
chr6 (25-129)||(16920276-16920380)
chr6 (241-497)||(18177517-18177775)
chr6 (329-512)||(20556873-20557053)
chr6 (25-128)||(15894062-15894165)
chr6 (328-464)||(18706356-18706493)
chr6 (25-128)||(22334514-22334617)
chr6 (448-495)||(22831524-22831571)
chr6 (330-440)||(22949375-22949484)
chr6 (330-440)||(22953331-22953440)
chr6 (330-440)||(23871819-23871928)
chr6 (330-440)||(23875775-23875884)
chr6 (25-99)||(25611355-25611429)
chr6 (330-440)||(27325370-27325479)
chr6 (161-368)||(17105880-17106086)
chr6 (330-497)||(18456735-18456901)
chr6 (25-86)||(22439227-22439288)
chr6 (335-502)||(34963384-34963550)
chr6 (335-512)||(1540896-1541072)
chr6 (25-128)||(20594159-20594262)
chr6 (390-512)||(22780222-22780344)
chr6 (208-267)||(27325248-27325307)
chr6 (29-128)||(29060926-29061025)
chr6 (22-136)||(9098078-9098192)
chr6 (330-440)||(16760525-16760634)
chr6 (44-126)||(19668836-19668918)
chr6 (454-512)||(25714421-25714478)
chr6 (56-122)||(35008618-35008684)
chr6 (453-506)||(11185515-11185568)
chr6 (25-78)||(19863413-19863466)
chr6 (394-502)||(25688513-25688620)
chr6 (293-374)||(28103796-28103877)
chr6 (345-502)||(16448520-16448678)
chr6 (327-435)||(18696569-18696676)
chr6 (44-122)||(18696955-18697034)
chr6 (454-512)||(3852121-3852178)
chr6 (330-416)||(16624583-16624669)
chr6 (361-497)||(18461895-18462031)
chr6 (35-125)||(19023838-19023928)
chr6 (241-319)||(23539165-23539243)
chr6 (330-440)||(31477577-31477686)
chr6 (26-75)||(18180925-18180974)
chr6 (25-86)||(22432677-22432738)
chr6 (25-86)||(25641816-25641877)
chr6 (35-128)||(31155040-31155133)
chr6 (26-90)||(15041184-15041248)
chr6 (25-89)||(22831916-22831980)
chr6 (237-309)||(23527948-23528020)
chr6 (418-495)||(33443068-33443146)
chr6 (163-202)||(12596269-12596308)
chr6 (161-200)||(15894199-15894238)
chr6 (163-202)||(16102655-16102694)
chr6 (163-202)||(16813088-16813127)
chr6 (163-202)||(16830108-16830147)
chr6 (44-122)||(18706706-18706785)
chr6 (161-200)||(18821588-18821627)
chr6 (454-497)||(18821904-18821946)
chr6 (163-202)||(29493065-29493104)
chr6 (56-122)||(20224412-20224478)
chr6 (56-122)||(22118396-22118462)
chr6 (464-513)||(4738626-4738675)
chr6 (365-430)||(16624371-16624436)
chr6 (344-409)||(21939488-21939553)
chr6 (25-78)||(22059376-22059429)
chr6 (161-202)||(25611492-25611533)
chr6 (163-199)||(2287677-2287713)
chr6 (163-199)||(8523246-8523282)
chr6 (25-129)||(11185876-11185980)
chr6 (163-199)||(15539593-15539629)
chr6 (163-199)||(15685871-15685907)
chr6 (161-201)||(20109454-20109494)
chr6 (35-75)||(21739665-21739705)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (25-513)||(45421-45910)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (26-515)||(160685-161173)
scaffold0001 (335-502)||(501095-501261)
scaffold0001 (463-512)||(85692-85741)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (11-512)||(6615-7116)
scaffold0333 (11-512)||(13995-14496)
[»] chr8 (127 HSPs)
chr8 (21-512)||(38854879-38855368)
chr8 (25-513)||(26355330-26355816)
chr8 (12-512)||(6520372-6520870)
chr8 (30-513)||(23760477-23760962)
chr8 (25-513)||(21673707-21674194)
chr8 (25-512)||(5865909-5866391)
chr8 (25-512)||(21490999-21491481)
chr8 (25-512)||(17140920-17141402)
chr8 (123-502)||(21285611-21285989)
chr8 (163-497)||(20498581-20498915)
chr8 (25-512)||(21255226-21255708)
chr8 (25-512)||(21249388-21249870)
chr8 (21-251)||(39834095-39834325)
chr8 (241-501)||(983248-983512)
chr8 (240-497)||(37116366-37116625)
chr8 (224-497)||(17266821-17267096)
chr8 (240-497)||(24353039-24353300)
chr8 (330-498)||(13508019-13508188)
chr8 (330-498)||(13597551-13597720)
chr8 (224-435)||(22364744-22364954)
chr8 (25-199)||(19801059-19801233)
chr8 (342-498)||(17612056-17612213)
chr8 (328-497)||(17439438-17439609)
chr8 (390-512)||(16092337-16092459)
chr8 (335-512)||(28648983-28649161)
chr8 (390-512)||(22626740-22626861)
chr8 (25-228)||(41598471-41598673)
chr8 (390-512)||(22875069-22875190)
chr8 (390-512)||(7372782-7372904)
chr8 (390-512)||(20536212-20536334)
chr8 (397-512)||(31971261-31971375)
chr8 (11-83)||(21286652-21286724)
chr8 (25-129)||(45130663-45130767)
chr8 (406-512)||(6759262-6759368)
chr8 (335-512)||(14409429-14409605)
chr8 (390-512)||(18818404-18818526)
chr8 (25-128)||(18878869-18878972)
chr8 (22-125)||(20499049-20499152)
chr8 (390-512)||(21918995-21919117)
chr8 (390-512)||(21923923-21924045)
chr8 (406-512)||(23406383-23406489)
chr8 (26-128)||(7373135-7373237)
chr8 (390-512)||(26219718-26219838)
chr8 (439-512)||(18879276-18879348)
chr8 (397-512)||(21395984-21396097)
chr8 (397-512)||(21790477-21790590)
chr8 (335-512)||(1484403-1484579)
chr8 (335-512)||(5853277-5853453)
chr8 (25-128)||(6759643-6759746)
chr8 (397-512)||(16199647-16199761)
chr8 (335-512)||(20403228-20403404)
chr8 (25-128)||(21918642-21918745)
chr8 (335-512)||(22001754-22001930)
chr8 (25-124)||(22627125-22627224)
chr8 (25-128)||(23406767-23406870)
chr8 (330-440)||(21383887-21383996)
chr8 (335-502)||(16413301-16413467)
chr8 (25-125)||(16091973-16092073)
chr8 (397-512)||(21389454-21389567)
chr8 (397-512)||(21778780-21778893)
chr8 (25-129)||(31971629-31971733)
chr8 (330-512)||(41598189-41598370)
chr8 (37-136)||(13507653-13507752)
chr8 (37-136)||(13597185-13597284)
chr8 (25-128)||(18818042-18818145)
chr8 (335-512)||(20046180-20046356)
chr8 (25-128)||(20536594-20536697)
chr8 (25-128)||(28648676-28648779)
chr8 (25-199)||(22875380-22875554)
chr8 (25-122)||(21414859-21414956)
chr8 (25-129)||(16199290-16199394)
chr8 (44-124)||(17266567-17266647)
chr8 (22-125)||(982956-983058)
chr8 (335-512)||(4483282-4483457)
chr8 (335-512)||(15203216-15203392)
chr8 (445-512)||(45131047-45131113)
chr8 (330-440)||(18862412-18862521)
chr8 (330-440)||(21387307-21387416)
chr8 (330-440)||(21411180-21411289)
chr8 (330-440)||(21805672-21805781)
chr8 (330-440)||(21827781-21827890)
chr8 (35-129)||(25362793-25362887)
chr8 (390-512)||(26225288-26225408)
chr8 (25-125)||(21923560-21923660)
chr8 (335-512)||(4542358-4542534)
chr8 (44-135)||(24353479-24353570)
chr8 (454-512)||(19896266-19896323)
chr8 (35-125)||(23648942-23649032)
chr8 (444-497)||(19154936-19154989)
chr8 (56-125)||(37116813-37116882)
chr8 (330-497)||(19801362-19801527)
chr8 (22-85)||(5610267-5610330)
chr8 (463-502)||(45290807-45290846)
chr8 (463-500)||(15070571-15070608)
chr8 (26-75)||(16409889-16409938)
chr8 (26-75)||(16860971-16861020)
chr8 (463-512)||(19937118-19937167)
chr8 (25-78)||(21389085-21389138)
chr8 (378-435)||(40492834-40492891)
chr8 (56-136)||(17439092-17439172)
chr8 (161-201)||(22419183-22419223)
chr8 (56-124)||(40492438-40492506)
chr8 (51-126)||(2418457-2418532)
chr8 (240-374)||(2418719-2418852)
chr8 (163-202)||(17615229-17615268)
chr8 (163-202)||(22059159-22059198)
chr8 (163-202)||(22145156-22145195)
chr8 (163-202)||(24707577-24707616)
chr8 (161-200)||(37116663-37116702)
chr8 (56-122)||(16799958-16800024)
chr8 (161-199)||(20536522-20536560)
chr8 (161-199)||(21918769-21918807)
chr8 (56-122)||(22996313-22996379)
chr8 (161-199)||(23406695-23406733)
chr8 (11-48)||(7465320-7465357)
chr8 (26-75)||(16411903-16411952)
chr8 (35-96)||(19899510-19899571)
chr8 (44-125)||(22365128-22365209)
chr8 (463-512)||(25484380-25484429)
chr8 (163-199)||(6608025-6608061)
chr8 (163-199)||(7300833-7300869)
chr8 (31-75)||(15602656-15602700)
chr8 (31-75)||(15611108-15611152)
chr8 (164-200)||(16861100-16861136)
chr8 (163-199)||(21414997-21415033)
chr8 (35-75)||(30642934-30642974)
chr8 (163-199)||(45134676-45134712)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (21-513)||(12942-13433)
scaffold0138 (161-435)||(18004-18277)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (22-501)||(10542-11020)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (25-512)||(6539-7025)
scaffold0621 (161-501)||(8481-8823)
scaffold0621 (22-91)||(8968-9037)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (25-513)||(132-619)
[»] scaffold0555 (3 HSPs)
scaffold0555 (151-513)||(10298-10659)
scaffold0555 (11-105)||(10186-10280)
scaffold0555 (25-128)||(965-1068)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (26-513)||(2277-2763)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (11-513)||(32538-33039)
scaffold0034 (26-128)||(51517-51619)
scaffold0034 (447-497)||(51936-51985)
[»] chr2 (106 HSPs)
chr2 (21-513)||(25175853-25176335)
chr2 (25-512)||(22133849-22134323)
chr2 (57-511)||(28405981-28406436)
chr2 (161-497)||(7499-7835)
chr2 (161-497)||(23207296-23207632)
chr2 (47-512)||(23071617-23072066)
chr2 (241-501)||(18786748-18787009)
chr2 (161-497)||(23791292-23791629)
chr2 (350-512)||(7679589-7679750)
chr2 (161-431)||(22459328-22459598)
chr2 (330-513)||(23708553-23708738)
chr2 (224-497)||(25108906-25109181)
chr2 (334-498)||(19671848-19672011)
chr2 (26-256)||(23708252-23708479)
chr2 (335-512)||(22105413-22105590)
chr2 (330-497)||(20520127-20520295)
chr2 (390-512)||(298809-298932)
chr2 (390-512)||(23060517-23060639)
chr2 (25-128)||(23660408-23660511)
chr2 (330-497)||(22413070-22413240)
chr2 (25-129)||(23286235-23286339)
chr2 (25-129)||(23654042-23654146)
chr2 (25-199)||(298447-298621)
chr2 (390-512)||(22337119-22337241)
chr2 (390-512)||(23076446-23076568)
chr2 (390-512)||(23285869-23285987)
chr2 (390-512)||(23654381-23654503)
chr2 (418-512)||(38138-38231)
chr2 (25-199)||(23076756-23076929)
chr2 (390-512)||(23660027-23660148)
chr2 (397-512)||(20309112-20309225)
chr2 (335-512)||(18808944-18809120)
chr2 (390-512)||(22731229-22731351)
chr2 (335-512)||(23130863-23131039)
chr2 (335-512)||(23133330-23133506)
chr2 (335-512)||(23709517-23709693)
chr2 (335-512)||(23711998-23712174)
chr2 (335-512)||(26505380-26505556)
chr2 (335-512)||(26507858-26508034)
chr2 (25-128)||(27753961-27754064)
chr2 (335-512)||(34402507-34402683)
chr2 (335-512)||(39682314-39682490)
chr2 (26-128)||(22730866-22730968)
chr2 (394-512)||(23103396-23103512)
chr2 (335-502)||(24367785-24367951)
chr2 (25-118)||(28291934-28292027)
chr2 (25-129)||(20309479-20309583)
chr2 (328-497)||(24697538-24697709)
chr2 (26-129)||(37760-37863)
chr2 (335-512)||(571398-571574)
chr2 (335-512)||(6725996-6726172)
chr2 (22-125)||(18786437-18786540)
chr2 (25-124)||(22737812-22737911)
chr2 (335-512)||(23135591-23135767)
chr2 (335-512)||(28577100-28577276)
chr2 (26-128)||(32451562-32451664)
chr2 (439-512)||(8946661-8946733)
chr2 (335-502)||(21155045-21155211)
chr2 (329-512)||(32039477-32039659)
chr2 (335-502)||(32214906-32215072)
chr2 (452-512)||(23040247-23040306)
chr2 (335-512)||(24898180-24898357)
chr2 (335-512)||(24900663-24900840)
chr2 (335-512)||(24903140-24903317)
chr2 (335-512)||(24905617-24905794)
chr2 (335-512)||(24908092-24908269)
chr2 (25-128)||(22337501-22337604)
chr2 (330-440)||(1283657-1283766)
chr2 (36-126)||(19672290-19672380)
chr2 (330-440)||(30344758-30344867)
chr2 (11-64)||(7679746-7679799)
chr2 (25-78)||(23100863-23100916)
chr2 (44-136)||(22412710-22412802)
chr2 (340-497)||(23004767-23004926)
chr2 (44-124)||(23207744-23207824)
chr2 (345-511)||(43137301-43137467)
chr2 (390-512)||(22738175-22738296)
chr2 (22-124)||(7305-7407)
chr2 (463-512)||(38967375-38967424)
chr2 (463-512)||(45029966-45030015)
chr2 (56-136)||(23005183-23005263)
chr2 (454-502)||(24643054-24643101)
chr2 (163-202)||(31756229-31756268)
chr2 (44-122)||(20519767-20519845)
chr2 (447-497)||(32451981-32452031)
chr2 (463-512)||(24529641-24529690)
chr2 (161-228)||(20519959-20520026)
chr2 (47-86)||(22740615-22740654)
chr2 (47-86)||(22758370-22758409)
chr2 (163-202)||(41684531-41684570)
chr2 (163-202)||(44621239-44621278)
chr2 (28-78)||(23038468-23038518)
chr2 (445-495)||(23287384-23287433)
chr2 (44-125)||(25109354-25109436)
chr2 (56-102)||(39827602-39827648)
chr2 (446-495)||(26392403-26392451)
chr2 (25-78)||(44369932-44369985)
chr2 (161-201)||(18786669-18786709)
chr2 (163-199)||(21238877-21238913)
chr2 (163-199)||(21241427-21241463)
chr2 (35-75)||(22798769-22798809)
chr2 (163-199)||(24505016-24505052)
chr2 (31-75)||(25963356-25963400)
chr2 (163-199)||(31503913-31503949)
chr2 (163-199)||(31506479-31506515)
chr2 (35-75)||(45677798-45677838)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (11-512)||(5740-6240)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (85-513)||(39864-40292)
scaffold0023 (207-513)||(100377-100683)
scaffold0023 (25-332)||(101578-101883)
scaffold0023 (439-513)||(101502-101576)
scaffold0023 (443-512)||(119879-119948)
scaffold0023 (335-512)||(94412-94588)
scaffold0023 (335-502)||(17425-17591)
scaffold0023 (394-512)||(44455-44573)
scaffold0023 (25-80)||(39641-39696)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (11-512)||(646-1151)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (25-513)||(132661-133142)
scaffold0028 (214-512)||(62202-62496)
scaffold0028 (335-512)||(136681-136857)
scaffold0028 (335-512)||(139150-139326)
scaffold0028 (335-512)||(141619-141795)
scaffold0028 (335-512)||(144088-144264)
scaffold0028 (335-512)||(134212-134388)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (25-513)||(19267-19755)
scaffold0102 (25-86)||(48093-48154)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (22-495)||(7686-8161)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (230-513)||(22509-22788)
scaffold0037 (25-267)||(79964-80205)
scaffold0037 (329-512)||(82073-82255)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (206-502)||(1096-1391)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (25-513)||(32101-32572)
[»] scaffold0476 (3 HSPs)
scaffold0476 (207-512)||(12770-13075)
scaffold0476 (11-125)||(8191-8304)
scaffold0476 (11-124)||(13233-13345)
[»] scaffold0020 (4 HSPs)
scaffold0020 (11-324)||(15448-15761)
scaffold0020 (378-512)||(15760-15894)
scaffold0020 (24-78)||(179085-179139)
scaffold0020 (463-513)||(178897-178947)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (25-512)||(15665-16147)
scaffold0261 (25-83)||(1768-1826)
scaffold0261 (44-126)||(17917-17999)
scaffold0261 (214-267)||(18163-18216)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (25-512)||(34127-34609)
scaffold0175 (25-121)||(13485-13581)
scaffold0175 (463-504)||(285-326)
scaffold0175 (390-466)||(13141-13218)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (25-513)||(2435-2924)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (206-513)||(14508-14815)
scaffold0008 (26-75)||(30379-30428)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (207-512)||(11296-11598)
scaffold0046 (277-512)||(2001-2233)
scaffold0046 (397-512)||(28418-28533)
scaffold0046 (460-512)||(4556-4608)
[»] scaffold0075 (4 HSPs)
scaffold0075 (240-497)||(53393-53651)
scaffold0075 (25-267)||(7926-8167)
scaffold0075 (22-136)||(53100-53214)
scaffold0075 (330-430)||(8230-8330)
[»] scaffold0413 (3 HSPs)
scaffold0413 (161-497)||(12587-12922)
scaffold0413 (22-125)||(13033-13136)
scaffold0413 (29-199)||(15251-15421)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (161-501)||(7843-8180)
scaffold0218 (25-469)||(28912-29354)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (25-359)||(28441-28775)
scaffold0211 (432-513)||(28806-28888)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (206-505)||(5654-5952)
scaffold0278 (25-139)||(5968-6082)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (207-458)||(2030-2281)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (26-251)||(3195-3420)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (25-447)||(2077-2494)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (26-359)||(1934-2267)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (161-497)||(128737-129072)
scaffold0022 (224-493)||(78345-78614)
scaffold0022 (390-512)||(116431-116551)
scaffold0022 (44-136)||(80716-80808)
scaffold0022 (56-135)||(128557-128636)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (166-497)||(6054-6386)
scaffold0420 (450-497)||(13793-13840)
[»] scaffold0021 (10 HSPs)
scaffold0021 (161-497)||(136134-136471)
scaffold0021 (161-497)||(144842-145179)
scaffold0021 (25-128)||(62947-63050)
scaffold0021 (444-497)||(174785-174838)
scaffold0021 (446-512)||(121770-121835)
scaffold0021 (25-108)||(124988-125071)
scaffold0021 (25-76)||(175202-175253)
scaffold0021 (44-136)||(135942-136034)
scaffold0021 (44-136)||(144650-144742)
scaffold0021 (163-202)||(133740-133779)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (161-497)||(19651-19987)
scaffold0080 (390-512)||(39917-40038)
scaffold0080 (25-125)||(40300-40400)
scaffold0080 (330-440)||(48921-49030)
scaffold0080 (161-199)||(40227-40265)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (240-497)||(97024-97282)
scaffold0006 (240-497)||(106302-106560)
scaffold0006 (161-200)||(97320-97359)
scaffold0006 (161-200)||(106598-106637)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (160-493)||(38339-38673)
scaffold0139 (44-136)||(38751-38843)
scaffold0139 (25-76)||(20418-20469)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (161-501)||(103405-103737)
scaffold0040 (44-136)||(103234-103326)
[»] scaffold1403 (2 HSPs)
scaffold1403 (164-497)||(569-900)
scaffold1403 (45-136)||(1004-1095)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (161-497)||(1564-1900)
scaffold0737 (44-124)||(1372-1452)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (35-461)||(9133-9555)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (161-466)||(54-360)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (335-512)||(1013-1186)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (410-513)||(23898-24001)
scaffold0100 (25-128)||(20498-20601)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (47-201)||(43438-43592)
scaffold0116 (47-201)||(47358-47512)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (335-512)||(38641-38819)
scaffold0074 (236-269)||(8427-8460)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (335-512)||(3090-3267)
scaffold0540 (25-121)||(645-741)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (330-498)||(11482-11651)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (330-498)||(17961-18130)
scaffold0247 (25-122)||(6460-6557)
scaffold0247 (463-502)||(2241-2280)
[»] scaffold0124 (5 HSPs)
scaffold0124 (330-498)||(38190-38359)
scaffold0124 (161-267)||(24418-24524)
scaffold0124 (330-440)||(21828-21937)
scaffold0124 (330-440)||(24587-24699)
scaffold0124 (35-124)||(24293-24382)
[»] scaffold0165 (4 HSPs)
scaffold0165 (330-501)||(27683-27855)
scaffold0165 (22-139)||(27271-27388)
scaffold0165 (35-129)||(3855-3949)
scaffold0165 (35-129)||(7919-8013)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (390-497)||(1051-1158)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (347-501)||(25121-25276)
scaffold0123 (328-435)||(619-725)
scaffold0123 (56-136)||(25560-25640)
[»] scaffold0357 (6 HSPs)
scaffold0357 (330-501)||(16034-16206)
scaffold0357 (330-497)||(13147-13316)
scaffold0357 (44-139)||(13582-13677)
scaffold0357 (51-136)||(3148-3233)
scaffold0357 (160-267)||(15865-15971)
scaffold0357 (445-497)||(2680-2732)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (261-497)||(267679-267916)
scaffold0005 (46-136)||(268106-268196)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (390-504)||(39489-39602)
scaffold0141 (330-440)||(13854-13963)
scaffold0141 (163-202)||(33458-33497)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (390-504)||(75210-75323)
scaffold0049 (163-202)||(81315-81354)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (11-157)||(227849-227995)
scaffold0012 (330-458)||(225465-225593)
scaffold0012 (330-440)||(189144-189253)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (22-181)||(12329-12487)
[»] scaffold0026 (6 HSPs)
scaffold0026 (390-504)||(25908-26021)
scaffold0026 (390-512)||(39862-39983)
scaffold0026 (25-128)||(39563-39666)
scaffold0026 (25-128)||(40242-40345)
scaffold0026 (69-125)||(59179-59235)
scaffold0026 (162-200)||(59271-59309)
[»] scaffold0016 (5 HSPs)
scaffold0016 (35-267)||(207161-207392)
scaffold0016 (390-512)||(1855-1977)
scaffold0016 (25-128)||(2237-2340)
scaffold0016 (44-122)||(119202-119280)
scaffold0016 (342-416)||(207467-207541)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (163-374)||(165-374)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (394-512)||(3185-3303)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (25-128)||(39145-39248)
scaffold0145 (390-512)||(32946-33067)
scaffold0145 (390-512)||(38765-38886)
scaffold0145 (454-512)||(9750-9807)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (394-512)||(17214-17334)
scaffold0056 (25-127)||(78994-79096)
scaffold0056 (47-128)||(16869-16950)
scaffold0056 (330-497)||(79264-79430)
[»] scaffold0358 (3 HSPs)
scaffold0358 (25-129)||(310-414)
scaffold0358 (25-129)||(5086-5190)
scaffold0358 (439-512)||(4716-4788)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (25-128)||(2717-2820)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (390-512)||(3474-3596)
scaffold0292 (25-124)||(732-831)
scaffold0292 (25-129)||(3855-3959)
scaffold0292 (390-512)||(347-468)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (390-512)||(13215-13337)
scaffold0193 (25-129)||(13585-13689)
[»] scaffold0122 (4 HSPs)
scaffold0122 (390-512)||(44702-44824)
scaffold0122 (394-509)||(26064-26179)
scaffold0122 (35-125)||(25707-25797)
scaffold0122 (25-128)||(33126-33229)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (335-512)||(339889-340064)
scaffold0003 (335-512)||(158435-158611)
scaffold0003 (25-199)||(339583-339757)
[»] scaffold0347 (3 HSPs)
scaffold0347 (161-255)||(288-382)
scaffold0347 (25-128)||(414-516)
scaffold0347 (344-430)||(6-92)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (25-267)||(10158-10399)
[»] scaffold0120 (7 HSPs)
scaffold0120 (390-512)||(32952-33073)
scaffold0120 (390-512)||(45932-46053)
scaffold0120 (394-512)||(16117-16235)
scaffold0120 (25-125)||(32591-32691)
scaffold0120 (25-125)||(46314-46414)
scaffold0120 (454-512)||(17389-17446)
scaffold0120 (34-128)||(16473-16566)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (25-126)||(594-695)
scaffold0395 (449-512)||(4888-4950)
scaffold0395 (25-202)||(8124-8301)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (26-127)||(17167-17268)
scaffold0142 (345-512)||(16785-16952)
scaffold0142 (161-199)||(17095-17133)
[»] scaffold0718 (2 HSPs)
scaffold0718 (25-129)||(4774-4878)
scaffold0718 (397-512)||(5132-5245)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (25-129)||(695-799)
scaffold0598 (397-512)||(1053-1166)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (25-129)||(10069-10173)
scaffold0456 (444-512)||(10472-10540)
[»] scaffold0427 (2 HSPs)
scaffold0427 (25-129)||(13869-13973)
scaffold0427 (397-500)||(13513-13615)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (397-512)||(4853-4968)
scaffold0403 (25-129)||(5222-5326)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (25-125)||(13240-13340)
[»] scaffold0351 (2 HSPs)
scaffold0351 (25-125)||(16657-16757)
scaffold0351 (399-512)||(16286-16397)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (397-512)||(1293-1406)
scaffold0106 (397-512)||(7270-7383)
scaffold0106 (447-512)||(15291-15355)
scaffold0106 (25-89)||(1700-1764)
scaffold0106 (25-89)||(7677-7741)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (25-129)||(21275-21379)
scaffold0088 (397-498)||(20928-21030)
[»] scaffold1842 (2 HSPs)
scaffold1842 (25-124)||(692-791)
scaffold1842 (390-512)||(1043-1165)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (25-128)||(290-393)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (25-128)||(20789-20892)
[»] scaffold0228 (7 HSPs)
scaffold0228 (25-128)||(4894-4997)
scaffold0228 (25-128)||(12476-12579)
scaffold0228 (25-128)||(22428-22531)
scaffold0228 (390-504)||(4520-4633)
scaffold0228 (390-504)||(12102-12215)
scaffold0228 (390-504)||(22054-22167)
scaffold0228 (35-75)||(18286-18326)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (25-128)||(16231-16334)
scaffold0217 (394-512)||(16599-16717)
scaffold0217 (161-199)||(16368-16406)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (390-512)||(51917-52039)
scaffold0011 (25-124)||(167622-167721)
scaffold0011 (390-512)||(167973-168095)
scaffold0011 (34-128)||(52298-52392)
[»] scaffold0166 (3 HSPs)
scaffold0166 (161-267)||(9601-9707)
scaffold0166 (25-128)||(9466-9569)
scaffold0166 (344-416)||(9784-9856)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (26-199)||(12244-12416)
scaffold0503 (454-497)||(11982-12024)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (390-512)||(8528-8646)
scaffold0121 (25-128)||(8165-8267)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (25-130)||(15108-15213)
scaffold0114 (397-512)||(15466-15580)
scaffold0114 (25-83)||(32908-32966)
scaffold0114 (35-75)||(7726-7766)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (397-497)||(51601-51699)
scaffold0032 (25-129)||(51953-52057)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (34-254)||(1719-1936)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (25-129)||(32438-32542)
scaffold0113 (397-512)||(32071-32184)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (44-136)||(24171-24263)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (335-512)||(4695-4871)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (335-512)||(20748-20924)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (335-512)||(37822-37998)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (390-498)||(24297-24406)
scaffold0042 (25-128)||(23934-24037)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (390-512)||(6116-6241)
scaffold0647 (25-126)||(5753-5854)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (25-127)||(17640-17742)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (15-77)||(9060-9122)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (25-267)||(12441-12681)
scaffold0221 (344-416)||(12758-12830)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (344-497)||(20372-20524)
scaffold0031 (25-196)||(20058-20228)
scaffold0031 (330-440)||(35853-35962)
scaffold0031 (25-78)||(65426-65479)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (394-502)||(10784-10891)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (25-126)||(28924-29025)
scaffold0130 (22-125)||(1332-1435)
scaffold0130 (335-434)||(27912-28012)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (25-129)||(2326-2430)
scaffold0490 (378-512)||(1956-2091)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (25-129)||(6984-7088)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (335-512)||(13393-13569)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (25-128)||(18590-18693)
[»] scaffold0235 (6 HSPs)
scaffold0235 (35-126)||(14027-14118)
scaffold0235 (47-129)||(11178-11260)
scaffold0235 (399-510)||(11447-11558)
scaffold0235 (345-440)||(13638-13733)
scaffold0235 (161-199)||(11282-11320)
scaffold0235 (222-267)||(13811-13856)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (390-512)||(22887-23008)
scaffold0231 (26-108)||(23288-23370)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (335-512)||(13948-14124)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (25-108)||(10550-10633)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (446-512)||(46999-47065)
scaffold0064 (25-129)||(47360-47464)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (397-512)||(8483-8598)
scaffold0639 (25-124)||(8865-8964)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (25-93)||(10904-10972)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (35-129)||(1288-1382)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (24-78)||(26834-26888)
scaffold0198 (463-513)||(23842-23892)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (24-78)||(36023-36077)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (24-78)||(36891-36945)
scaffold0131 (463-513)||(36453-36503)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (44-126)||(29149-29231)
scaffold0098 (214-256)||(26847-26889)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (410-497)||(2694-2783)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (35-136)||(7108-7209)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (25-122)||(2245-2342)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (394-502)||(9253-9360)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (25-125)||(4912-5012)
scaffold0070 (440-495)||(4545-4599)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (329-512)||(12065-12241)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (335-512)||(40401-40577)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (330-440)||(627-736)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (330-440)||(11268-11377)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (35-117)||(35512-35594)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (345-500)||(161083-161239)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (44-122)||(332784-332862)
scaffold0004 (35-86)||(70221-70272)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (329-512)||(107-289)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (335-440)||(32432-32536)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (394-502)||(11299-11406)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (454-502)||(4308-4355)
scaffold0761 (34-78)||(5951-5995)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (330-512)||(4215-4396)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (26-75)||(1718-1767)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (394-502)||(12293-12400)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (454-499)||(29946-29990)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (35-78)||(891-934)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (163-202)||(10643-10682)
scaffold0525 (163-199)||(9485-9521)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (35-78)||(21449-21492)
scaffold0210 (35-78)||(29341-29384)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (463-502)||(1393-1432)
scaffold0101 (35-78)||(8600-8643)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (35-125)||(577-667)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (25-103)||(10569-10647)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (37-90)||(2247-2300)
scaffold0104 (37-90)||(9929-9982)
scaffold0104 (164-200)||(2136-2172)
scaffold0104 (164-200)||(9818-9854)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (26-75)||(44486-44535)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (30-75)||(18676-18721)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (35-75)||(2312-2352)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (31-75)||(1926-1970)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (35-75)||(15837-15877)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (35-75)||(6721-6761)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (26-90)||(35155-35219)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (26-78)||(32867-32919)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (22-122)||(86013-86113)


Alignment Details
Target: scaffold0010 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 130396 - 129908
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  130396 gatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacct 130297  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  130296 ggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttgtt 130197  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  130196 taggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga 130097  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130096 tgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 129997  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  129996 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgatgaagatgt 129908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 60649 - 60818
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||    
T  60649 atgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtat 60747  T
Q  429 atcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  60748 atcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 60289 - 60381
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  60289 ttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacatgggaaagtttaa 60381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Original strand, 60481 - 60548
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||| ||| | |||||||||    
T  60481 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatacattgtttagg 60548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 172)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16097819 - 16097331
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  16097819 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacct 16097720  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    | ||   ||| |||| |||| | || || ||  |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16097719 gaaaagattttagaatgaatttttgtgaattggacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgtcttgtt 16097620  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16097619 tatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga 16097520  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097519 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 16097420  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097419 ttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16097331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15471427 - 15470927
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| | |    
T  15471427 cagagaagcatcatgatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaacatgtataatgatgattaggaaagattggaga 15471328  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||  | |||||    
T  15471327 ttaagattgaacctggaatagtttaagaacgaattt-tgagagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaactgcccagtta 15471229  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15471228 cagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgttagatgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgt 15471129  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    | ||||||| ||||   ||||| ||  | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15471128 ttcagtaagcctgaattatatg-atctaagttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgact 15471030  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatga 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15471029 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatga 15470930  T
Q  511 tgt 513  Q
    |||    
T  15470929 tgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14234993 - 14234491
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |    
T  14234993 cagagacgcatcatgatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatttttttgagtgcctgaacatgtataatgatgattaggaaagattataga 14234894  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  14234893 ttgagattgaacccgaaatagtt-aagaatgaatttttgggagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagtta 14234795  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  14234794 cagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgaacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgt 14234695  T
Q  311 --tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatga 408  Q
      | ||||||| ||||    | | |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  14234694 tgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatga 14234595  T
Q  409 cttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||    
T  14234594 cttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagat 14234495  T
Q  509 gatg 512  Q
    ||||    
T  14234494 gatg 14234491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16104268 - 16103783
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  16104268 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctg 16104169  T
Q  126 g-aatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    | || | |||| ||  |||| | || || ||  |   ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||       |||||| | |||||||||    
T  16104168 ggaagacttta-gattgaattt-tgtgaattgaatccgaactcgtcgtggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtactggtgttacagactgccttgtt 16104071  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16104070 taggttaaatgcgctctttgtcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaa 16103971  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16103970 tccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattg 16103872  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103871 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 16103783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 25 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 32308157 - 32307684
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  32308157 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 32308058  T
Q  125 -ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttg 222  Q
     |||| | |||| ||| |||| | |||||  |  |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  32308057 aggaagacttta-gaatgaattt-tgggaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacataatgccttg 32307961  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  32307960 tttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagact 32307861  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32307860 gatgcttatgaattaatgttgtttataat--------gttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgcattcgatat 32307771  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307770 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Original strand, 49667716 - 49668194
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  49667716 gatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgttttga-gcgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacct 49667814  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttg 222  Q
    ||||   ||| |||| ||| ||| || ||  |  |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| | |||||||    
T  49667815 ggaaagattttagaatgaaatat-tgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagactgccttg 49667912  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  49667913 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagact 49668012  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatg-ttgatgacttgcattcgata 421  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||        | ||||||||| ||| | | |||||| ||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  49668013 gatgcatatgagttgatgttgtatataat--------gctgtatatactttaaatggattatg-ttgataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgata 49668102  T
Q  422 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49668103 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 49668194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Original strand, 13209960 - 13210444
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  13209960 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaata-tgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacct 13210058  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagt-tacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    |||| ||  | |||| ||| |     |||  |   |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||||| ||||||||||    
T  13210059 ggaa-agacttagaatgaaaactcttgagaatgtgaccgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgt 13210157  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    |||||||||| |||    
T  13210158 ttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctg 13210257  T
Q  324 atgcatatgaattga-tgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||    
T  13210258 atgcatatgaattcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcattcgatat 13210354  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13210355 tattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 13210444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9513399 - 9512923
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  9513399 gatttcgtactattgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacct 9513300  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgcctt 221  Q
    | ||   ||| |||| ||| | | || ||  || |  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||  | ||| ||  |||| ||||||||    
T  9513299 gaaaagattttagaatgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgaga--ttacttgtgttacagaatgcctt 9513202  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  9513201 gcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagac 9513102  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||| | | |||||| ||||||  |||||||||||    ||||||||||||    
T  9513101 tgatgcatatgaattgatgttgtttataat--------gttttatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttga----ttgcattcgata 9513015  T
Q  422 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9513014 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9512923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9521374 - 9520898
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  9521374 gatttcgtactattgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacct 9521275  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgcctt 221  Q
    | ||   ||| |||| ||| | | || ||  || |  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||  | ||| ||  |||| ||||||||    
T  9521274 gaaaagattttagaatgaaatttttgtgaactaaacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgaga--ttacttgtgttacagaatgcctt 9521177  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  9521176 gcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagac 9521077  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||  ||||||||||| | | |||||| ||||||  |||||||||||    ||||||||||||    
T  9521076 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt------gt--tatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttga----ttgcattcgata 9520990  T
Q  422 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9520989 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 9520898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 509
Target Start/End: Original strand, 1644315 - 1644787
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  1644315 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacct 1644414  T
Q  125 g-gaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttg 222  Q
    | ||| | |||| ||| |||| | || ||  |  |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| | |||||||    
T  1644415 gagaagacttta-gaatgaattt-tgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacaaactgccttg 1644511  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1644512 tttaagttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagact 1644611  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  1644612 gatgcatatgaattgatgttgtttataat--------gttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatat 1644701  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644702 tgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 404
Target Start/End: Original strand, 1465038 - 1465419
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1465038 catgattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattatgaaagattgtagattgagattgaa 1465137  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1465138 cctggaataatttaagaacgaatttgtgtgagttgcacctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgcctt 1465237  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  || |||  |||||||||| |    
T  1465238 gtttaggttaaaagtaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcc 1465337  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    ||     | |    | |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1465338 tggattgtttattctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 1465419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 285 - 513
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174377
Alignment:
Q  285 taagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattat 384  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||    
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttat 12174251  T
Q  385 gtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccat 484  Q
    |||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12174252 gtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 12174348  T
Q  485 gagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174349 gagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12174377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 404
Target Start/End: Original strand, 49389276 - 49389639
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  49389276 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 49389375  T
Q  125 gga-atagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    ||| | | |||| ||| |||| | || ||  |  |  |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||   ||||           ||||||    
T  49389376 ggagagacttta-gaatgaattt-tgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggttctcgcctcgc-ag---acta-----------ccttgt 49389458  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49389459 ttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactg 49389558  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  49389559 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 351
Target Start/End: Original strand, 12933942 - 12934268
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||    
T  12933942 gatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacct 12934041  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgt 223  Q
    ||||   ||| |||| |||  | || ||  |  |  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||  |  |||||| | | ||||||    
T  12934042 ggaaagattttagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagacttccttgt 12934140  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  12934141 ttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactg 12934240  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934241 atgcatatgaattgatgttgtttataat 12934268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Original strand, 37250934 - 37251270
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||| ||  ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  37250934 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaacaccttgtt-aggttaaaagtgacctttgtcgcacgagttgatgt 37251032  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||     
T  37251033 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataa 37251132  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  37251133 atgtatatgcattacatgaattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttg 37251231  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37251232 ctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Original strand, 22110118 - 22110454
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||  ||| ||  ||||||| ||||| |||  || ||||||||||||| |||||||    
T  22110118 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcaagagggacagaacaccttgtt-aggtttaatgtgacctttgtcgcacgaattgatgt 22110216  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||| |   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||     
T  22110217 gagttgatcatgagggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatataa 22110316  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
     ||||||  ||||||| ||||| | | ||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||||||||||||    
T  22110317 atgtatacgcattacatgaattctatatgat-gttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttg 22110415  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22110416 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 324705 - 324481
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaa 143  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  324705 ttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaactgagaatagtttaagaatgaa 324606  T
Q  144 tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatcttt 243  Q
    | | |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| ||  ||||| |||||||||||  || ||||    
T  324605 tttttgggagttgcacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccaagttacagaacaccttg-ttaggttaaatgtgaccttt 324507  T
Q  244 gtcgcacgagttgatgtgagttgatc 269  Q
    |||| || ||||||||||||||||||    
T  324506 gtcgtacaagttgatgtgagttgatc 324481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 2050819 - 2051071
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |    
T  2050819 cagagagtcaacatgattttgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctcaacatgtgtaataatgattaggaaagattctaga 2050918  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | || | |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |  | |||||    
T  2050919 ttgagattgaacc--gaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactctccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagtta 2051016  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    || |||| |||||||||| |   | |||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  2051017 caaaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcatgagttgttgagagttga 2051071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 334 - 497
Target Start/End: Original strand, 52523665 - 52523831
Alignment:
Q  334 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  52523665 attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatca 52523764  T
Q  433 tga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52523765 tgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 281
Target Start/End: Original strand, 12171750 - 12171992
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||             |||||||||    
T  12171750 atttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga-------------ttgaacctg 12171836  T
Q  126 ga-atagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    || | | |||| ||| |||| | || ||  |  |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12171837 gagagacttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgatctaactagttacagaatgccttgtt 12171935  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttaga 281  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171936 taggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaga 12171992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165251
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  || |||   |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  434 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27165329 gttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 24340657 - 24340826
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  24340657 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 24340756  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24340757 atcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12340241 - 12340000
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  12340241 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 12340142  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttg 222  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |  || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  12340141 ggaa-agacttagaatgaaactttggagaatctaactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacataatgccttg 12340045  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12340044 tttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttgagagttga 12340000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23274874 - 23274705
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  23274874 atgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 23274775  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  23274774 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14669249 - 14669008
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  14669249 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatgtctaatattgaataggaaagaatgtaggatgagattgaacct 14669150  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttg 222  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||    
T  14669149 ggaa-agacttagaatgaaactttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagc--actagtattacagaatgccttg 14669053  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14669052 tttaggttaaattcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 14669008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42386914 - 42386660
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| | || |    
T  42386914 cagagagctatcatgaatccgtagttttgacctttaagttgaaccttagttgtttatgagtgcatgaacatgcataataatgattaggcaagactttaga 42386815  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgt-gggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtt 209  Q
     || ||||||||||| ||||||| ||||| |||  | | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | | ||    
T  42386814 ctgtgattgaacctgaaatagtt-aagaatgaaacttttgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaatt 42386716  T
Q  210 acataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||| || |||||||||||| |   | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42386715 acagaa-gccttgtttaggat-tttgcgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttga 42386660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 338 - 512
Target Start/End: Original strand, 53301492 - 53301668
Alignment:
Q  338 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcatga 435  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||   | |||  ||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  53301492 atgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgt 53301591  T
Q  436 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  53301592 tgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 53301668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Original strand, 52523345 - 52523586
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||  | ||||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  52523345 cagagagtcaacatgatttcgtagttttggtccttaagttggtatttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaataattattaggaaagattctagt 52523444  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| |||  |||| |  | |||||    
T  52523445 ttgatattgaacctggaacagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctgacgagttgcccagtta 52523544  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagt 254  Q
    || |||| |||||||||| |   | |||||||||||||||||||    
T  52523545 cagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagt 52523586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 37642199 - 37642368
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  37642199 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 37642298  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37642299 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 17247918 - 17248092
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  17247918 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 17248017  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||   ||| |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17248018 ggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17248092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43927484 - 43927291
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgag 263  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |  ||| ||| ||||||| ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  43927484 actcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgtgagacagaataccttgtt-aggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgag 43927386  T
Q  264 ttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatat 358  Q
    |||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  43927385 ttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438538
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  496 agttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| |||||||    
T  18438554 agttgatgaagatgatg 18438538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14666085 - 14665853
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtt 133  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||      
T  14666085 attttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agac 14665987  T
Q  134 taagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggtta 231  Q
    | |||| |||  | |||    |   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  14665986 ttagaatgaaactttggagaatctgactgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggtta 14665889  T
Q  232 aatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14665888 aatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 14665853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14735598 - 14735366
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtt 133  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||      
T  14735598 attttgacttttgagttgaaccttagatgtcgttgagtgcctgaacatggctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agac 14735500  T
Q  134 taagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggtta 231  Q
    | |||| |||  | |||    |   | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  14735499 ttagaatgaaactttggagaatctgactgaactcgcaatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggtta 14735402  T
Q  232 aatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14735401 aatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 14735366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399213
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  12399236 cggtctaagttgttgaagatgatg 12399213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14973036 - 14972858
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  14973036 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 14972937  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14972936 gctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 14972858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18439023 - 18438920
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18439023 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaaaatgagattgaacct 18438924  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  18438923 ggaa 18438920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 53070331 - 53070504
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  53070331 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 53070430  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||| ||  ||||||| ||| | | ||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53070431 ggatta-attaagaatgaactttttggaagct-gacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 53070504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 362 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 43926114 - 43925977
Alignment:
Q  362 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgc 459  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||    
T  43926114 tgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgc 43926015  T
Q  460 tgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43926014 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 390 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42386536 - 42386428
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  42386536 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagt 42386438  T
Q  489 cggtctaagt 498  Q
    ||||||||||    
T  42386437 cggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13442400 - 13442278
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13442400 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatg 13442278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14179811 - 14179708
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  14179811 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaactt 14179712  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  14179711 ggaa 14179708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 418 - 512
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424876
Alignment:
Q  418 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 11424876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 24153204 - 24153325
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24153204 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtc 24153302  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  24153303 ggtctaagttgattaagatgatg 24153325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166599
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatg 36166599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 329 - 497
Target Start/End: Original strand, 43550457 - 43550625
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  43550457 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 43550555  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    | ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43550556 tgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 498
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147628
Alignment:
Q  338 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 436  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  437 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagt 22147628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 454
Target Start/End: Original strand, 2051137 - 2051260
Alignment:
Q  334 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2051137 attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatca 2051236  T
Q  433 tga--tgatttgcatactgcctat 454  Q
    |||  || ||||||||||||||||    
T  2051237 tgaactgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 20698079 - 20698183
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  20698079 gattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 20698178  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  20698179 ggaat 20698183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698552
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  496 agttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20698536 agttgatgaagatgatg 20698552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 11424395 - 11424498
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||    
T  11424395 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagaatgagattgaacct 11424494  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  11424495 ggaa 11424498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 14572714 - 14572596
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| |||||  || | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14572714 atatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 14572616  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  14572615 ggtctaagttgatgttgatg 14572596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17487982 - 17487860
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17487982 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 17487884  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  17487883 cggtctaagttgatgaagatgatg 17487860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17499464 - 17499342
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17499464 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 17499366  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  17499365 cggtctaagttgatgaagatgatg 17499342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 23083356 - 23083478
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  23083356 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  23083455 cggtctaagttgatgaagatgatg 23083478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476502
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25476483 ctaagttgatgaagatgatg 25476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  490 ggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 9707592 - 9707768
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  9707592 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcat 9707690  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9707691 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9707768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 513
Target Start/End: Original strand, 14576828 - 14576950
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  14576828 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtc 14576926  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  14576927 ggtctaagttgatgttgatgatgt 14576950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17463355 - 17463179
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  17463355 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 17463257  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17463256 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17463179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26687013 - 26686891
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26687013 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatg 26686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26687376 - 26687273
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  26687376 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 26687277  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  26687276 ggaa 26687273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 355 - 512
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172744
Alignment:
Q  355 atatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 452  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 29172685  T
Q  453 atgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29172686 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29172744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34159503 - 34159327
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34159503 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 34159405  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34159404 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34159327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 40213353 - 40213456
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  40213353 gatttcgtgattttgacttttgagttgatcattagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 40213452  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  40213453 ggaa 40213456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213837
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatgatg 40213837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 45606892 - 45607068
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  45606892 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 45606990  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45606991 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45607068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 55476668 - 55476492
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  55476668 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 55476570  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  55476569 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 55476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14973343 - 14973245
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacc 123  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  14973343 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaacc 14973245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 511
Target Start/End: Original strand, 16282796 - 16282971
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  16282796 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcat 16282894  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 511  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16282895 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8899277 - 8899095
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  8899277 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 8899179  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  8899178 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 8899095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12567737 - 12567571
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12567737 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 12567639  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||| ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12567638 gatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 13544202 - 13544036
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13544202 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13544104  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||| ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13544103 gatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14573067 - 14572974
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  14573067 ttttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 14572974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 22109926 - 22110007
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||  |||||||||||||||    
T  22109926 ttaagttgaactttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctg 22110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 451 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194694
Alignment:
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28194694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Original strand, 38961876 - 38962042
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  38961876 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 38961974  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38961975 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 605942 - 606034
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||  || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  605942 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatgtgtataataatgattaggcaattttctagattgagattgaacctggaaaagtttaa 606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12399684 - 12399608
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaa 101  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12399684 gattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaa 12399608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23275211 - 23275119
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  23275211 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttgggaaagtttaa 23275119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 394 - 509
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606441
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 606422  T
Q  492 tctaagttg-atgatgatg 509  Q
    | |||| || |||||||||    
T  606423 tataagatgaatgatgatg 606441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 6469119 - 6469295
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||   |||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  6469119 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 6469217  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6469218 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6469295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 7781332 - 7781508
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  7781332 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcat 7781430  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7781431 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7781508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 16454266 - 16454442
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16454266 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16454364  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16454365 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16454442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Original strand, 17247152 - 17247235
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17247152 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgccggaacatgtctaataatgattaggaaagaatgta 17247235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 25476017 - 25476120
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| | |||||| ||||||    
T  25476017 gattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagatcgaacct 25476116  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  25476117 ggaa 25476120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 28848596 - 28848772
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  28848596 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 28848694  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28848695 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28848772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14501669 - 14501587
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||| ||||||    
T  14501669 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaaggttttagattgagattggacctgg 14501587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 23412815 - 23412916
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagttt 134  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || |||||||||| |||||| | |||||    
T  23412815 ttttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataaaaatgattaggcaagtttttagattgagattggacctgggaaagttt 23412914  T
Q  135 aa 136  Q
    ||    
T  23412915 aa 23412916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 13151775 - 13151952
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13151775 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13151873  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13151874 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13151952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 13154240 - 13154417
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13154240 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13154338  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13154339 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30030317 - 30030213
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| |||    |||||||||||||    
T  30030317 gatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaataatgattacgaaagaatgtgggatgagattgaacct 30030218  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  30030217 ggaat 30030213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 10247708 - 10247884
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10247708 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 10247806  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10247807 gctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10247884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 14576465 - 14576568
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||| | ||| |||||||||    
T  14576465 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagaatgtagaatgacattgaacct 14576564  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  14576565 ggaa 14576568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17488346 - 17488243
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| | |||||| ||| || ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  17488346 gatttcgtgaatttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 17488247  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  17488246 ggaa 17488243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17499828 - 17499725
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||||||| ||| || ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  17499828 gatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 17499729  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  17499728 ggaa 17499725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17672744 - 17672627
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17672744 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17672647  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  17672646 ctaagttgattaagatgatg 17672627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 43841058 - 43840944
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43841058 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T
Q  489 cggtctaagttgatga 504  Q
    |||| |||||||||||    
T  43840959 cggtttaagttgatga 43840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 50243005 - 50242833
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  50243005 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 50242907  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | ||||| || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50242906 tgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Original strand, 4588457 - 4588547
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  4588457 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 4588547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19776107 - 19775998
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  19776107 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 19776008  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  19776007 t-atgatgatt 19775998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 37439403 - 37439512
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  37439403 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 37439502  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  37439503 t-atgatgatt 37439512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45797713 - 45797631
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||| ||||||    
T  45797713 ttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattggacctgg 45797631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500943
Alignment:
Q  399 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  498 ttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||| | |||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatg 55500943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 415
Target Start/End: Original strand, 23413186 - 23413271
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 415  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23413186 atgatttgatgatatttataatgttatatagatggatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcat 23413271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 41124064 - 41123892
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41124064 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41123966  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 511  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41123965 gctgtttttgtatactgt-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 53070633 - 53070799
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||| | | ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  53070633 atgatttgatgttgtt-agattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 53070731  T
Q  429 atcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     || || || ||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53070732 gtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 400 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12378039 - 12377940
Alignment:
Q  400 tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||    
T  12378039 tgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43927650 - 43927558
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || || |||||| |||||||||| | |||||||    
T  43927650 ttaagtcgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattagacaagtttttagattgagtttgaacctgggaaagtttaa 43927558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 4588602 - 4588661
Alignment:
Q  208 ttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4588602 ttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgagctttgtcgcacgagttgttatgagttga 4588661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977516
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatgatg 15977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 17446640 - 17446815
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  |||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  17446640 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 17446738  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  17446739 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatg 17446815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 43842667 - 43842584
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgta 108  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  43842667 gatttcatgattttgactttttagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtctaataatgattaggaaagaatgta 43842584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 316666 - 316592
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagatt 118  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||    
T  316666 ttaagtcgaactttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagatt 316592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 4107164 - 4107273
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  4107164 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 4107263  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  4107264 t-atgatgatt 4107273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 4111016 - 4111125
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  4111016 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 4111115  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  4111116 t-atgatgatt 4111125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 8489232 - 8489341
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |  |||||||||    
T  8489232 atgatttgatgatatttataatgttatatatttagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgtatttgtaattgttata 8489331  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  8489332 t-atgatgatt 8489341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15965311 - 15965202
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15965311 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15965212  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  15965211 t-atgatgatt 15965202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15969235 - 15969126
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15969235 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15969136  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  15969135 t-atgatgatt 15969126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15973159 - 15973050
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15973159 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15973060  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  15973059 t-atgatgatt 15973050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 16749761 - 16749870
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  16749761 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 16749860  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  16749861 t-atgatgatt 16749870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737237
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499519
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8499519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556986
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10556986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12378459 - 12378374
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| | | || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  12378459 gaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcatgtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 12378374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412430
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 15877461 - 15877514
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15877461 gatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 15877514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577999
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45577999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 12119768 - 12119886
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcgg 491  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12119768 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcgg 12119865  T
Q  492 tctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  12119866 tctaagttgattaagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 37250763 - 37250855
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||| ||||||| || | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  37250763 ttaagtcgaactttagatgattctgagtatctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 37250855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 12851996 - 12852099
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||   || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||| ||    
T  12851996 gatttcgtgattttgacttttgagtttaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatct 12852095  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  12852096 ggaa 12852099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 440
Target Start/End: Original strand, 16750390 - 16750464
Alignment:
Q  365 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16750390 atatacattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16750464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16809874 - 16809774
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||| |||||    |||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  16809874 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcttgaac----ataataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgatcct 16809779  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  16809778 ggaat 16809774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22791790 - 22791727
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtat 85  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  22791790 catgattttgtagttatgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacttgtat 22791727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14572941 - 14572903
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14572941 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 14572903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 12852300 - 12852413
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttg----tatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgt 425  Q
    |||| |||||| | ||| |||||||||||| |||    |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||    
T  12852300 atgatttgatgatttttttaatgttatataattggatatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgt 12852399  T
Q  426 tatatcatgatgatt 440  Q
    ||||| |||||||||    
T  12852400 tatat-atgatgatt 12852413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 17674209 - 17674258
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17674209 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494810
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13442724 - 13442660
Alignment:
Q  64 ttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||   |||||||||||||||||    
T  13442724 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaa 13442660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21837958 - 21837878
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  21837958 ttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttgggaaagtttaa 21837878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 45797337 - 45797242
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || || ||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  45797337 ttataatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 45797242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 2034752 - 2034791
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2034752 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 2034791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 2038259 - 2038298
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2038259 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 2038298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 2042000 - 2042039
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2042000 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 2042039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 200
Target Start/End: Original strand, 11424531 - 11424570
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11424531 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 11424570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14038528 - 14038489
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14038528 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 14038489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14041996 - 14041957
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14041996 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 14041957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 440
Target Start/End: Original strand, 16749994 - 16750068
Alignment:
Q  365 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16749994 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16750068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18959245 - 18959206
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18959245 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 18959206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 77
Target Start/End: Original strand, 23052719 - 23052762
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctga 77  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23052719 attttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 23052762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 198
Target Start/End: Original strand, 23083132 - 23083167
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23083132 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcga 23083167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39231075 - 39231036
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39231075 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 39231036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9578136 - 9578070
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  9578136 ttagatgactttgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagattttagattgaaattgaac 9578070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 16369887 - 16369845
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgc 73  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  16369887 gtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 16369845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Original strand, 606135 - 606176
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  606135 tgaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgagcta 606176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 3402600 - 3402649
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3402600 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 3402649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 11852055 - 11852006
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11852055 atttcgtaattttaacttttcagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 11852006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 12037586 - 12037639
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12037586 gatttcgtgattttgacatgtgagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 12037639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 45797460 - 45797415
Alignment:
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  45797460 gtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcgagttgttatgagttga 45797415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 321657 - 321697
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  321657 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 321697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11855068 - 11855032
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11855068 actcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagc 11855032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12173261 - 12173221
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12173261 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 12173221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12496734 - 12496690
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12496734 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 12496690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14501293 - 14501198
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  || || ||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  14501293 ttataatgttatataattggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 14501198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15060771 - 15060727
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15060771 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 15060727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 17524817 - 17524857
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17524817 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 17524857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 18383556 - 18383600
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18383556 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 18383600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20723333 - 20723297
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20723333 actcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 20723297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30030189 - 30030153
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30030189 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 30030153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54973736 - 54973700
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  54973736 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 54973700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54976346 - 54976310
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  54976346 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 54976310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54978956 - 54978920
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  54978956 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 54978920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 119)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21566033 - 21565545
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  21566033 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 21565934  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   ||| |||| |||| |  | || ||  |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21565933 ggaaagattttagaatgaattttcgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctaactagttacagaatgacttgtt 21565834  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  21565833 tatgtaaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactga 21565734  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21565733 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattg 21565634  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565633 ttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 21565545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 512
Target Start/End: Original strand, 21329123 - 21329614
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  21329123 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattga 21329222  T
Q  121 acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcct 220  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| | |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  21329223 acctggaataatttaggaatgaatttttgggagttgcacttgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgaattacctagttacagaatgcct 21329322  T
Q  221 tgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaaga 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||     
T  21329323 tgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagc 21329422  T
Q  321 ctgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgat 420  Q
    ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  21329423 ctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgat 21329522  T
Q  421 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21329523 attgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21329614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Original strand, 22959166 - 22959650
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  22959166 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 22959265  T
Q  126 ga-atagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    || | | |||| ||| |||| | || ||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22959266 gagagacttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtt 22959364  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22959365 taggttaaatgcgattcttgttgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactga 22959464  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||    
T  22959465 tgcatatgaatcaatgttggttaaaatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcaatattg 22959561  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959562 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 22959650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19669389 - 19668902
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||| |    
T  19669389 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacgt 19669290  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgg-gagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    ||||    || |||| |||| | | | || ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19669289 ggaaagactttagaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgtgtagaggctctcgcctcaccagctaactagttacagaatgccttgt 19669190  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||||| |||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19669189 ttaggataaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactg 19669090  T
Q  324 atgcatatga--attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 421  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  19669089 atgcatatgaatattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgata 19668993  T
Q  422 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668992 ttgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19668902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 513
Target Start/End: Original strand, 26011652 - 26012154
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| || | |||| || ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||    
T  26011652 cagagagtcaacatgatttcgtagttttgatccttaagttgaactttagatgattatgagtgtctaaacatgtgtaataatgattaagaaagattctaaa 26011751  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |  |||||||    
T  26011752 ttgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccttcgcctcgcgagttgtctagtta 26011851  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || ||||| ||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  26011852 cagaatgctttgtt-aggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgt 26011950  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    | ||||||| ||||   |||| |  ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  26011951 ttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatt 26012050  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg-atgatgatg 509  Q
      |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26012051 cacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatg 26012150  T
Q  510 atgt 513  Q
    ||||    
T  26012151 atgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Original strand, 19660469 - 19660952
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  19660469 gattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtggaatgagattaaacct 19660568  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaat-gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    |||| ||  | |||| ||| |  | ||||   | ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| || ||||| |    
T  19660569 ggaa-agacttagaatgaaaactttggagaatctaaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctt-t 19660666  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  19660667 ttaggttgaatgcaatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactg 19660766  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   ||  |||||||||     
T  19660767 atgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttatattcgatatc 19660863  T
Q  424 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19660864 attatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 19660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Original strand, 21501922 - 21502273
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | |||| || |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21501922 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagtt-cagaatgccttgttg-ggttaaatgcgatatttgtcgcacgagttgatgt 21502019  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaa-ctaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatat 358  Q
     |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  |||||||||||    
T  21502020 tagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatat 21502119  T
Q  359 agttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21502120 aattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttg 21502219  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21502220 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21502273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 319
Target Start/End: Original strand, 21741172 - 21741469
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  21741172 catgattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgaataggaaagattatagattgagattgaa 21741271  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  21741272 cctggaatagtttaagaacgaatttatgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgtgagctaaccagttacataatgtctt 21741371  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaag 319  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||  ||||||||||    
T  21741372 gtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgttgtcattccagtaag 21741469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Original strand, 20026707 - 20027043
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||       |  ||| ||||||||||| || ||||||  || | ||||||||||||| |||||    
T  20026707 tgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-agcttaaatgtgaccgttgtcgcacgagtcgatgt 20026805  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||   |||||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  20026806 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatag 20026905  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  20026906 ttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttg 20027004  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20027005 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 251
Target Start/End: Original strand, 5888804 - 5889033
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5888804 catgattttgtagttttgacctttaagtcgaagcttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaa 5888903  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    | |||||||||||||||| |||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  5888904 catggaatagtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgcctt 5889003  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacg 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5889004 gtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacg 5889033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 22178064 - 22178323
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || |   |||||| | |||    
T  22178064 ctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggat 22178163  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||    
T  22178164 gttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctg 22178263  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22178264 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22144553 - 22144299
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || |    
T  22144553 cagagagtcaacatgatttcgtagttttgatccttaagttggtatttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaacaatgattaggaaagattctaga 22144454  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||    
T  22144453 ttgagattgaacctggaataatttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagtta 22144354  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    || |||| |||||||||| |   | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22144353 cagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttga 22144299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Original strand, 21498645 - 21498763
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21498645 tcatgattgcgtaattttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtataataattattaggagagattgtagattgagattga 21498744  T
Q  121 acctggaatagtttaagaa 139  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  21498745 acctggaatagttgaagaa 21498763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22144236 - 22144068
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  22144236 atgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttat 22144137  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22144136 atcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 22119834 - 22120066
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtt 133  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||      
T  22119834 attttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agac 22119932  T
Q  134 taagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggtta 231  Q
    | |||| |||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22119933 ttagaatgaaactttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggtta 22120030  T
Q  232 aatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22120031 aatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 22120066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 415 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314581
Alignment:
Q  415 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 36314581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 40726040 - 40725871
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  40726040 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 40725941  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40725940 atcatgatgctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412188
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatg 22412188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24493694 - 24493573
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24493694 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagtc 24493596  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  24493595 ggtctaagttgatgaagatgatg 24493573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 383 - 512
Target Start/End: Original strand, 8286829 - 8286960
Alignment:
Q  383 atgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 479  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286829 atgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagc 8286927  T
Q  480 tccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8286928 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8286960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 21292613 - 21292717
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  21292613 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 21292712  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  21292713 ggaat 21292717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729181
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  21729158 cggtctaagttgttgaagatgatg 21729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 21808384 - 21808506
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21808384 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  21808483 cggtctaagttgttgaagatgatg 21808506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 21985779 - 21985882
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  21985779 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 21985878  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  21985879 ggaa 21985882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 23390491 - 23390613
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23390491 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatg 23390613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13025436 - 13025315
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13025436 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtc 13025338  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13025337 ggtctaagttgatgaagatgatg 13025315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13095620 - 13095499
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13095620 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtc 13095522  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  13095521 ggtctaagttgatgaagatgatg 13095499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 36154469 - 36154700
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatag-t 132  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  36154469 attttgacttttaagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctgg-atagat 36154567  T
Q  133 ttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaa 232  Q
    || ||||  ||  | || || |   |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||| |||| |||||||||| |      
T  36154568 tttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtttaggat-t 36154665  T
Q  233 atacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
     | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  36154666 ttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttga 36154700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 408 - 512
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997651
Alignment:
Q  408 acttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatg 506  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21997645  T
Q  507 atgatg 512  Q
    ||||||    
T  21997646 atgatg 21997651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1096649 - 1096474
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| | ||    
T  1096649 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttat 1096550  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    | || ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1096549 gttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529224
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  496 agttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24529240 agttgatgaagatgatg 24529224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1096956 - 1096853
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||| ||    
T  1096956 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatct 1096857  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  1096856 ggaa 1096853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077956
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  9077975 ctaagttgatgaagatgatg 9077956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 21871203 - 21871444
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  21871203 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacct 21871302  T
Q  125 ggaatagtttaag-aacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    |||| || ||| | || | |  | || || |   |  || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  |||| |||||||||     
T  21871303 ggaa-agattatggaatggacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttg- 21871400  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  21871401 ctaggttaaacgcgatccttgtcgcatgagttgttatgagttga 21871444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 21875483 - 21875724
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  21875483 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacct 21875582  T
Q  125 ggaatagtttaag-aacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    |||| || ||| | || | |  | || || |   |  || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  |||| |||||||||     
T  21875583 ggaa-agattatggaatggacttttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttg- 21875680  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  21875681 ctaggttaaacgcgatccttgtcgcatgagttgttatgagttga 21875724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 23390128 - 23390231
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  23390128 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 23390227  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  23390228 ggaa 23390231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24529710 - 24529607
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  24529710 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 24529611  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  24529610 ggaa 24529607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25421658 - 25421536
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25421658 atatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatg 25421536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 24767104 - 24767210
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgat 258  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  24767104 tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgtt 24767201  T
Q  259 gtgagttga 267  Q
     ||||||||    
T  24767202 atgagttga 24767210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 328 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 29448192 - 29448055
Alignment:
Q  328 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||||| ||||||||| | |||| || || || |||||||| ||||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  29448192 atatgatttgatgttgataataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 29448093  T
Q  428 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtt 463  Q
    ||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||    
T  29448092 tatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtt 29448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Original strand, 11580878 - 11580979
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  11580878 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 11580977  T
Q  126 ga 127  Q
    ||    
T  11580978 ga 11580979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 264753 - 264929
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  264753 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 264851  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  264852 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 264929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20909189 - 20909013
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20909189 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20909091  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20909090 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20909013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29330111 - 29329935
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29330111 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29330013  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29330012 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29329935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39363561 - 39363385
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  39363561 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 39363463  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39363462 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39363385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 20026492 - 20026606
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  20026492 catgattttgtagttttgacccttaagtcgatctttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaa 20026591  T
Q  122 cctggaatagtttaa 136  Q
    | ||| | |||||||    
T  20026592 catgggaaagtttaa 20026606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 512
Target Start/End: Original strand, 11581183 - 11581360
Alignment:
Q  334 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 432  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||   ||| || |||||| |||  ||||||||||| |||||| |||| |||    
T  11581183 attgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 11581281  T
Q  433 tgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    || || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11581282 tgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 22075497 - 22075393
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||   ||| | |||||||    
T  22075497 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgaaaatgaacct 22075398  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  22075397 ggaat 22075393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9078441 - 9078338
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| | ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||    
T  9078441 gatttcgtgattttgacttttgagttgatctttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagaatgagattgaacct 9078342  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  9078341 ggaa 9078338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 512
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733101
Alignment:
Q  355 atatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 452  Q
    ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  453 atgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10733043 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10733101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22075145 - 22075035
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  22075145 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  489 cggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||    
T  22075046 cggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 42245350 - 42245526
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  42245350 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 42245448  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42245449 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 42245526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 21871507 - 21871616
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21871507 atgaattgatgatatttataatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21871606  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  21871607 t-atgatgatt 21871616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 21875787 - 21875896
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21875787 atgaattgatgatatttataatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21875886  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  21875887 t-atgatgatt 21875896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25431518 - 25431414
Alignment:
Q  392 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcg 490  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  25431518 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcg 25431420  T
Q  491 gtctaa 496  Q
    ||||||    
T  25431419 gtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 8286485 - 8286589
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||   |||||||||||||    
T  8286485 gatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtgccggaacatgtctaataatgattaagaaagaatgtaggatgagattgaacct 8286584  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  8286585 ggaat 8286589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 512
Target Start/End: Original strand, 36154777 - 36154941
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 442  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  36154777 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 36154876  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||||||| | |||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  36154877 tatactgc-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 36154941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13095983 - 13095880
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  13095983 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacct 13095884  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  13095883 ggaa 13095880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 501
Target Start/End: Original strand, 20901988 - 20902159
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatat--ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||    
T  20901988 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattatta 20902086  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20902087 tgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24494057 - 24493954
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  24494057 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgaacgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 24493958  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  24493957 ggaa 24493954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25431883 - 25431780
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||   |||||||| ||||    
T  25431883 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagaatttaggatgagattggacct 25431784  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  25431783 ggaa 25431780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25743940
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||| ||| | ||||||| ||||| |  ||  || |||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgagtgacagactgccttg-ttagggtttatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 25743976  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttat 296  Q
    ||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||||    
T  25743975 gagttgatcatgggggtaataaactaagttgcttat 25743940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29346157 - 29345981
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29346157 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29346059  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29346058 gctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29345981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10753703 - 10753594
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10753703 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 10753604  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  10753603 t-atgatgatt 10753594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25422021 - 25421943
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaaga 103  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  25422021 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctattaatgattaggaaaga 25421943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 22177794 - 22177875
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||| |||||||||    
T  22177794 ttaagttgaaccctagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagtttgaacctg 22177875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723922
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 512
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293086
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 21293086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Original strand, 22107017 - 22107116
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  22107017 atttcgtatttttgacttttgagttgaactttagatgcgtttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctg 22107116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29348630 - 29348454
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29348630 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29348532  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | || |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29348531 gctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29348454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29351103 - 29350927
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29351103 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29351005  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | || |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29351004 gctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29350927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39245242 - 39245137
Alignment:
Q  406 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatga 504  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  39245242 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39245145  T
Q  505 tgatgatg 512  Q
     |||||||    
T  39245144 agatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 512
Target Start/End: Original strand, 2154593 - 2154775
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatat--ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||    
T  2154593 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattatta 2154691  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2154692 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2154775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918109
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20918109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 22120131 - 22120240
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||    
T  22120131 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgttcatttgtaattgttata 22120230  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  22120231 t-atgatgatt 22120240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 27988774 - 27988846
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtt-agaaactaagttgtttatcttactgttgttgttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27988774 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcat-gaggttaaggaactaagttgtttatatatctgttgttgttc 27988846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619435
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38619435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15796696 - 15796438
Alignment:
Q  241 tttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  ||||| || |||| ||||||| |||||  | |||| ||||||    
T  15796696 tttgtcgcacgagttgttgtgagatgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactactgctgctgtttcagtaagcctgatataaatgatttgatg 15796597  T
Q  341 ttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgaga-tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    ||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||    ||| ||| ||| || || ||| |  |||| ||||||| ||||||||||  ||    
T  15796596 ttgctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctg 15796497  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||   | |||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||    
T  15796496 ttttatgtgctgcctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 15796438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 502
Target Start/End: Original strand, 18319027 - 18319185
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt- 441  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||     
T  18319027 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 18319126  T
Q  442 gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18319127 gtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 404
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741541
Alignment:
Q  348 taatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 512
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775837
Alignment:
Q  465 gttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13025799 - 13025696
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||  |||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  13025799 gatttcgtgattttgaattttgagttgatccttagatacttttgaaagcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacct 13025700  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  13025699 ggaa 13025696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 24766969 - 24767072
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||   |||||||||| ||    
T  24766969 gatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggatgagattgaatct 24767068  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  24767069 ggaa 24767072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32027570 - 32027394
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  32027570 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 32027472  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32027471 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32027394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 37724384 - 37724337
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37724384 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 37724337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25431747 - 25431709
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25431747 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcacctcgcgag 25431709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061069
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Original strand, 24767287 - 24767359
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 416  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24767287 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 24767359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4398058 - 4398019
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4398058 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 4398019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 16255704 - 16255743
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16255704 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16255743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 16259337 - 16259376
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16259337 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16259376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 449
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766174
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 22589501 - 22589540
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22589501 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22589540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 22593056 - 22593095
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22593056 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22593095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 22596611 - 22596650
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22596611 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22596650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22880558 - 22880519
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22880558 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22880519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23201845 - 23201802
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23201845 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 23201802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23693808 - 23693769
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23693808 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 23693769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 26360854 - 26360893
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26360854 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 26360893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36314728 - 36314670
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatt 394  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  36314728 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagttcgatatt 36314670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43121513 - 43121474
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43121513 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 43121474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43125046 - 43125007
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43125046 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 43125007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1096820 - 1096782
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1096820 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 1096782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Original strand, 11581013 - 11581051
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11581013 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 11581051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25421885 - 25421847
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25421885 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 25421847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704074
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 26704074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 26732421 - 26732487
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || || ||||| |||||||    
T  26732421 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgaaattgaac 26732487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 500
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 26740234 - 26740300
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || || ||||| |||||||    
T  26740234 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgaaattgaac 26740300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973807
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 26973807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 17918796 - 17918845
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17918796 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 17918845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806903
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatg 20806903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 18769647 - 18769687
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18769647 ttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 18769687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 21366305 - 21366349
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21366305 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 21366349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 21887300 - 21887260
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21887300 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 21887260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 200
Target Start/End: Original strand, 23501118 - 23501154
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23501118 actcgccatggcgagcagatgctctcacctcgcgagc 23501154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26496235 - 26496199
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26496235 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 26496199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 29324991 - 29325027
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29324991 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 29325027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 115)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 513
Target Start/End: Original strand, 22921495 - 22921987
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  22921495 tcatgatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattga 22921594  T
Q  121 acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcct 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  22921595 accaggaatagtttaagaacgaatttttgagagttagacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcctagttacagaatgcct 22921694  T
Q  221 tgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaaga 320  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  22921695 tgtttgggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagc 22921794  T
Q  321 ctg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcga 419  Q
    ||| ||  ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22921795 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattttg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcga 22921893  T
Q  420 tattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22921894 tattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 22921987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33681498 - 33681010
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  33681498 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagttcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 33681399  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   ||| |||| |||| | || ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || | ||||||| | ||||||| |    
T  33681398 ggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttgct 33681299  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  33681298 tatgttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactga 33681199  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33681198 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattg 33681099  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33681098 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 22238117 - 22237630
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  22238117 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctg 22238018  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgttt 225  Q
    |||   |||  ||| |||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  22238017 gaaagattttggaatgaattt-tgtgagttgcacttgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgttt 22237919  T
Q  226 aggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactg-ttgttgttccagtaagactga 324  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  22237918 aggttaaatgcgatctttttcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactga 22237819  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237818 tacatatgaattgatgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 22237719  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22237718 ttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Original strand, 52927613 - 52928088
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||||||    
T  52927613 gatttcgtaattttgacttttgagttgacccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacct 52927712  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   |||  ||| |||| | |   ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | || ||||||| |||||||||||    
T  52927713 ggaaagattttggaatgaattttttaaagttagacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgaccagttacagaatgccttgtt 52927812  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  52927813 -aggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactga 52927911  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||||||    
T  52927912 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg------------attcgatattg 52927999  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  52928000 ttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20248765 - 20248282
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  20248765 atttcgaaattttgacttttgagttgatccatagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctg 20248666  T
Q  126 ga-atagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    || | | |||| ||| |||| | || ||  |  |  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20248665 gagagacttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttatt 20248567  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  20248566 taggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtaaattgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttg-tccagtaagactga 20248468  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||    
T  20248467 tgcatatgaatccatgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcattcgatattg 20248371  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248370 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 20248282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 21754524 - 21754052
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  21754524 gatttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacct 21754425  T
Q  125 gg-aatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtt--acataatgcctt 221  Q
    || || | |||| ||| |||| | || ||  |  |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| |||  ||| | ||||||    
T  21754424 gggaagacttta-gaatgaattt-tgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt--acttgttttacagactgcctt 21754329  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  21754328 gtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagac 21754230  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  21754229 tgatgcatatgaattgatgttgtttataat--------gttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgcatttgata 21754140  T
Q  422 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754139 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20919083 - 20918620
Alignment:
Q  32 taattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatag 131  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||    
T  20919083 taattttgacctttgagttgatccttacatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-ag 20918985  T
Q  132 tttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggtta 231  Q
      | ||||   | || |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     |||| | |||||||| ||||||||     
T  20918984 acttagaatttaaatttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttgtgtgttaaagaatgcctt-tttaggttg 20918886  T
Q  232 aatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatat 331  Q
    ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  20918885 aatgcgatctttgtcgttcgacttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttat 20918786  T
Q  332 gaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||    
T  20918785 gaattgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatc 20918689  T
Q  432 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20918688 atgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20637354 - 20636956
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgttttta-agtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaa 109  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  || |||||||| || |||||||||||||| |     
T  20637354 cagagaggtatcataatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttggatgttttttgagtgcctagacttgtataatgatgattaggaaagattggag 20637255  T
Q  110 attgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtt 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  20637254 attaagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaatcagtt 20637155  T
Q  210 acataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttg 309  Q
    ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||      
T  20637154 acagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtca 20637055  T
Q  310 ttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 409  Q
    |||||||||| ||||    |||   || |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  20637054 ttccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttg-tatttgggatgttgttgac 20636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 404
Target Start/End: Original strand, 35981316 - 35981696
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35981316 catgattttgtagttttgacctttaagtcgaacctt-gatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaa 35981414  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35981415 cctgggatagtttaagaacgaatttatgtgagttgcacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgcctt 35981514  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||| |    
T  35981515 gtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgaattgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcc 35981614  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    ||     |||    | |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35981615 tggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 35981696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 214 - 497
Target Start/End: Original strand, 21861389 - 21861672
Alignment:
Q  214 aatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttcc 313  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  21861389 aatgccttgtt-aggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttc 21861487  T
Q  314 agtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttg 412  Q
    |||||| ||||    |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  21861488 agtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttg 21861587  T
Q  413 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21861588 catttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 214 - 497
Target Start/End: Original strand, 21896078 - 21896358
Alignment:
Q  214 aatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttcc 313  Q
    ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||| |    
T  21896078 aatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatctt---gttgttgtttc 21896173  T
Q  314 agtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttg 412  Q
    |||||| ||||    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  21896174 agtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttg 21896273  T
Q  413 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21896274 catttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 277
Target Start/End: Original strand, 28194077 - 28194332
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28194077 catgattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaa 28194176  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||| |||    
T  28194177 cctgaaatagtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacaaaatgtctt 28194276  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggt 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| | || | |||||||| ||| |||||    
T  28194277 gtttaggttacatgcgatctttgtcgcacgtgatgttatgagttgacctttgaggt 28194332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 224 - 509
Target Start/End: Original strand, 16368115 - 16368401
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16368115 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 16368214  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||    |||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16368215 aattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatatt 16368312  T
Q  424 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg-atgatgatg 509  Q
    ||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  16368313 gttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgaatgatgatg 16368401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49261690 - 49261452
Alignment:
Q  165 ctcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagt 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49261690 ctcgccatggcgaatagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagt 49261591  T
Q  265 tgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgt 364  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||  |||||||||| | ||    |||    | |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  49261590 tgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgt 49261491  T
Q  365 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49261490 atatacattatataaattatg-ttgatatttgagatgttg 49261452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 50686968 - 50686630
Alignment:
Q  160 atgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatg 259  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |  ||| ||| ||||||| ||| |||||  || |||||||||||||||||| |    
T  50686968 atgagctcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccctgtgagacagaataccttgtt-aggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgacg 50686870  T
Q  260 tgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 359  Q
    |||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||   ||||||||| ||||||| |||||    
T  50686869 tgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatata 50686770  T
Q  360 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgtt 457  Q
      ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  |  |||    ||||||||||||    
T  50686769 aatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatgaactgcctatgtt 50686670  T
Q  458 gctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    || |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  50686669 gccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 41049880 - 41050138
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||     
T  41049880 ctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcataggggtaaggaactaggtttcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgac 41049979  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |     
T  41049980 gttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaacta 41050078  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||  |||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  41050079 ttttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 335 - 513
Target Start/End: Original strand, 14295495 - 14295672
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  14295495 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 14295590  T
Q  435 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa---gttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  14295591 atggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 497
Target Start/End: Original strand, 50613945 - 50614219
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| |||    
T  50613945 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctg 50614043  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |   |||||| ||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||    ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  50614044 aattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 50614143  T
Q  424 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50614144 gttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 497
Target Start/End: Original strand, 50621773 - 50622047
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||| |||    
T  50621773 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctg 50621871  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |   |||||| ||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||    ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  50621872 aattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 50621971  T
Q  424 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50621972 gttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12271901 - 12271639
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||       |  ||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  12271901 tgaactctccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 12271803  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||       ||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  12271802 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactg-------tgagttgatgttatttataatgtgatataa 12271710  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 431  Q
    ||||||||| |||||   | ||||   | |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12271709 ttgtatatatattactttagttatacgtaaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 35261015 - 35261180
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  35261015 atgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttat 35261111  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35261112 atcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 328 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 16758839 - 16758664
Alignment:
Q  328 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||   ||| ||||||| ||  ||| ||| ||||||||||    
T  16758839 atatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgtta 16758740  T
Q  428 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16758739 tatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43697853 - 43697735
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||| ||||||| || ||||||||| |    
T  43697853 tcatgatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatttatgattagaaaagattctagattgagattta 43697754  T
Q  121 acctggaatagtttaagaa 139  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43697753 acctggaatagtttaagaa 43697735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21161830 - 21161719
Alignment:
Q  401 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||    
T  21161830 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactg-ttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttg 21161732  T
Q  501 atgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||    
T  21161731 atgatgatgatgt 21161719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 463
Target Start/End: Original strand, 22130844 - 22130975
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||    
T  22130844 tatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattat 22130940  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt 463  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22130941 atcatgatggtttggatactgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210330
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  50210311 ctaagttgatgaagatgatg 50210330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 330 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 433193 - 433013
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  433193 atgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 433094  T
Q  429 atcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     || |||||  |||| ||||||||| ||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  433093 gtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 433013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 22355817 - 22355921
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  22355817 gatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22355916  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  22355917 ggaat 22355921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 22357503 - 22357607
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  22357503 gatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22357602  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  22357603 ggaat 22357607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509784
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  496 agttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| |||||||    
T  34509800 agttgatgaagatgatg 34509784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 345 - 497
Target Start/End: Original strand, 45574836 - 45574989
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgt-ttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 442  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |    
T  45574836 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 45574935  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45574936 catactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 20846862 - 20846966
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  20846862 gattttgtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacct 20846961  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  20846962 ggaat 20846966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 27250372 - 27250476
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  27250372 gatttcgtaatattgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgggattgaacct 27250471  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  27250472 ggaat 27250476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 497
Target Start/End: Original strand, 16093826 - 16093987
Alignment:
Q  338 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg-atgacttgcattcgatattgttatatcatga- 435  Q
    |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  16093826 atgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgag 16093924  T
Q  436 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     || |||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  16093925 ctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16759218 - 16759115
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  16759218 catgattttgtagttttgacccttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacacgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaa 16759119  T
Q  122 cctg 125  Q
    ||||    
T  16759118 cctg 16759115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593896
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23593896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 27250724 - 27250846
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  27250724 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagt 27250822  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  27250823 cggtctaagttgttgaagatgatg 27250846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 433496 - 433322
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  433496 gattccgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 433397  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||   ||| |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  433396 ggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 433322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 21895861 - 21895975
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  21895861 catgattttgtagttttgacccttaagttgatctttagatgattatgagtgcctgaacaagtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaa 21895960  T
Q  122 cctggaatagtttaa 136  Q
    ||||| | |||||||    
T  21895961 cctgggaaagtttaa 21895975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21342640 - 21342536
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||| ||||    
T  21342640 catgattttgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaa 21342541  T
Q  122 cctgg 126  Q
    |||||    
T  21342540 cctgg 21342536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21347505 - 21347401
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||| ||||    
T  21347505 catgattttgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaa 21347406  T
Q  122 cctgg 126  Q
    |||||    
T  21347405 cctgg 21347401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13989043 - 13988867
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13989043 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13988945  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13988944 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 21923276 - 21923452
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21923276 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 21923374  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21923375 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21923452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22532758 - 22532655
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  22532758 gatttcgtgattttgacttttgatttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22532659  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  22532658 ggaa 22532655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34510269 - 34510166
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  34510269 gatttcgtgattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 34510170  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  34510169 ggaa 34510166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 51130741 - 51130632
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  51130741 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 51130646  T
Q  435 atgatttgcatact 448  Q
    ||| ||||||||||    
T  51130645 atggtttgcatact 51130632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21027152 - 21027054
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  21027152 gtaattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 21027054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 21861123 - 21861237
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  21861123 catgattttgtagttttgacccttaagttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaa 21861222  T
Q  122 cctggaatagtttaa 136  Q
    ||||| | |||||||    
T  21861223 cctgggaaagtttaa 21861237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840778
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  493 ctaagttgat 502  Q
    ||||||||||    
T  21840787 ctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 38801034 - 38801138
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  38801034 gatttcatatttttgacttttgagttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgtgattgaacct 38801133  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  38801134 ggaat 38801138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 512
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847271
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21026806 - 21026684
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||  ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21026806 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatg 21026684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 21475072 - 21475248
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21475072 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 21475170  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  21475171 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 21475248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22532395 - 22532273
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  22532395 atatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagt 22532297  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  22532296 tggtctaagttgatgaagatgatg 22532273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29776865 - 29776689
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  29776865 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29776767  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | |  ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29776766 gttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29776689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31612490 - 31612314
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  31612490 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 31612392  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | |||||   | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31612391 gctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31612314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 41049619 - 41049701
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || || |||||||||||||||||    
T  41049619 ttaagtcgaaccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtataataatggttaggcaagtttttagattgagattgaacctgg 41049701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361928
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  434 gatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || |||   ||||||  | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16361995 gttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29298304 - 29298138
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 442  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  29298304 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttg 29298206  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29298205 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 29298138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26065464 - 26065372
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  26065464 ttaagttgaactttagatgatcctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 26065372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 440 - 512
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801504
Alignment:
Q  440 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatg 38801504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 447 - 502
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454660
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 21301170 - 21301245
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaa 100  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21301170 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaa 21301245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26065108 - 26064959
Alignment:
Q  347 ataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 444  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||       
T  26065108 ataatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcatt-ggtattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 1924896 - 1925005
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  1924896 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 1924995  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  1924996 t-atgatgatt 1925005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 16367839 - 16367953
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| |||| ||||| | || ||| || | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||| ||||    
T  16367839 catgattttgtaaatttgatcctttagtcgagctttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaa 16367938  T
Q  122 cctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||| |||||||    
T  16367939 cctggaaaagtttaa 16367953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20135675 - 20135573
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||    
T  20135675 attttgtaattttgacttttgagtttatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctg 20135576  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  20135575 gaa 20135573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 20923910 - 20924019
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  20923910 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 20924009  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  20924010 t-atgatgatt 20924019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21715037 - 21714983
Alignment:
Q  24 tgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21715037 tgatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21714983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 35260706 - 35260787
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  35260706 ttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 35260787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 22123052 - 22123229
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||  | ||| || ||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22123052 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22123150  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | |  ||| | ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  22123151 gctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatg 22123229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 128
Target Start/End: Original strand, 50209889 - 50209948
Alignment:
Q  69 agtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  50209889 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 50209948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 41387815 - 41387924
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  41387815 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 41387914  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  41387915 t-atgatgatt 41387924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213023
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13213023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342097
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21342097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346962
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21346962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707168
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21707168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711710
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21711710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 22468329 - 22468382
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22468329 gatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 22468382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26065293 - 26065202
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgag 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||| ||| ||||||||||| |   | ||||||||||||||||||    
T  26065293 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaataccttgtttagggt-tttgcgatctttgtcgcacgag 26065202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16759004 - 16758900
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||| || ||||||| |   | ||||||||||||||||||||| ||     
T  16759004 tgaactcgccatagcaagtagaggccctcacctcgcgagttgcctagttacagaatg-ctcgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttga 16758907  T
Q  261 gagttga 267  Q
    |||||||    
T  16758906 gagttga 16758900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714545
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 21714545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Original strand, 22354204 - 22354306
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |  |||   |||||||||||||    
T  22354204 gattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcttgaacatgtcttataatgattaggaaataacgtaggatgagattgaacct 22354303  T
Q  125 gga 127  Q
    |||    
T  22354304 gga 22354306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 27652808 - 27652874
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  27652808 ttagatgtttttgagtgcctgaatatgcataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 27652874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48521102 - 48521036
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  48521102 ttagatgtttttgagtacctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 48521036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860170
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 15860170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 133
Target Start/End: Original strand, 16093479 - 16093556
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtt 133  Q
    ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||| || ||| || || ||||||||||||||||||| ||||    
T  16093479 ttagatggttttgagtgcctggatatgtataataatgatttggcaagtttttagattgagattgaacctggaaaagtt 16093556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 136
Target Start/End: Original strand, 50613699 - 50613783
Alignment:
Q  52 aaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  50613699 aaccttcgatgattttgagtgcatgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacatgggaaagtttaa 50613783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 136
Target Start/End: Original strand, 50621527 - 50621611
Alignment:
Q  52 aaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  50621527 aaccttcgatgattttgagtgcatgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacatgggaaagtttaa 50621611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 50687118 - 50687046
Alignment:
Q  64 ttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  50687118 ttttgagtgcctgtatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 50687046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Original strand, 3472560 - 3472607
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgc 73  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  3472560 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgc 3472607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 14432123 - 14432162
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14432123 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 14432162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20631667 - 20631628
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20631667 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 20631628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 502
Target Start/End: Original strand, 22468749 - 22468803
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  22468749 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 22468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 22900022 - 22900061
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22900022 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22900061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24087766 - 24087727
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24087766 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 24087727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 36181926 - 36181887
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36181926 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 36181887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37358819 - 37358780
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37358819 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 37358780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 440
Target Start/End: Original strand, 41388048 - 41388122
Alignment:
Q  365 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  41388048 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 41388122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45307641 - 45307602
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45307641 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 45307602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Original strand, 8761266 - 8761316
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8761266 gatttcgtaatttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 8761316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16381451 - 16381389
Alignment:
Q  249 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16381451 acgagttgatgtgagttgatcatgagggtaagaaactaagttgtttatatttctattgttgtt 16381389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Original strand, 38801160 - 38801198
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38801160 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 38801198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 98
Target Start/End: Original strand, 52940464 - 52940506
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattagg 98  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52940464 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataataattagg 52940506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 16275476 - 16275525
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16275476 ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16275525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20135539 - 20135502
Alignment:
Q  162 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20135539 gaactcgccatggcgagcagaagctctcacctcgcgag 20135502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 430
Target Start/End: Original strand, 39243943 - 39244008
Alignment:
Q  365 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 430  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  39243943 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 39244008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 430
Target Start/End: Original strand, 39247498 - 39247563
Alignment:
Q  365 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 430  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  39247498 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 39247563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12272127 - 12272047
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataat 91  Q
    ||||||| || |||||||| ||| |||||||| |||||||||   || |||| || | |||||||||||||||||| ||||    
T  12272127 cagagagtcaacatgattttgtagttttgacccttaagttgataattggatgattctgagtgcctgaacatgtatattaat 12272047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Original strand, 20091106 - 20091206
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||  || |||||  |||||||| ||||    
T  20091106 gatttcttatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgattgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacct 20091205  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  20091206 g 20091206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20579815 - 20579779
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20579815 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 20579779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21162115 - 21162079
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21162115 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 21162079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 22432422 - 22432466
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22432422 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 22432466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 22831021 - 22831061
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22831021 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 22831061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 42864854 - 42864894
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42864854 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 42864894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 127)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 21 - 513
Target Start/End: Original strand, 16219344 - 16219835
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  16219344 tcatgatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaacttgtataataatgattaggaaagattttagattgagattga 16219443  T
Q  121 acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcct 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  16219444 acctggaatagtttaagaatgaatttttgggagttacacgtgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgcct 16219543  T
Q  221 tgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaaga 320  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  16219544 tgtt-aggttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagc 16219642  T
Q  321 ctgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgat 420  Q
    ||||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16219643 ctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgat 16219742  T
Q  421 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16219743 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 68235 - 67749
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  68235 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgttttcgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacct 68136  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  68135 ggaataatttaagaacaaacttgtgggagttacagatgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtt 68036  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg- 323  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||     
T  68035 taggttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctga 67936  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    ||  ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  67935 attaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgata-ttgagatgttgttgatttgcattcgatatt 67838  T
Q  424 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  67837 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 67749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 47832311 - 47831811
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |    
T  47832311 cagagaggtatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggaga 47832212  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  | |||||    
T  47832211 ttaagattgaatctggaatagtttaagaacgaattt-tgagagttacacatgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagtta 47832113  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  47832112 cagaatgctttgtttaggttaaatgtgatctttgtcggacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgt 47832013  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    | ||||||| ||||    ||| |  | |||||||   |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  47832012 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgact 47831913  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatga 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  47831912 tgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 47831813  T
Q  511 tg 512  Q
    ||    
T  47831812 tg 47831811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18006130 - 18005649
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||      |||||||||||||    
T  18006130 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagatt------tgagattgaacct 18006037  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
      |||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  | |||||||||| |||||||||||    
T  18006036 aaaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgactagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtt 18005937  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  18005936 taggataa-tgcgatctttgtcgcacaagttgatatgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 18005838  T
Q  325 tgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |  | |||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18005837 tttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatatt 18005739  T
Q  424 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005738 gttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 18005649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 44014663 - 44014181
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  44014663 gatttcgtaattttgacttttgagttgatacttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 44014564  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   ||| |||| |||| | ||  |||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  44014563 ggaaagattttagaatgaatttttgttagttgcacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccggttacagaatgccttgtt 44014464  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  44014463 taggttaaatgcgatcattgtcgcacgaattgatgtgagttgatc--agaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 44014367  T
Q  325 -tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
     |  ||||||  | ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  44014366 attaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgat---ttgcattcgatatt 44014271  T
Q  424 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014270 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 44014181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 16056820 - 16056343
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||| || ||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  16056820 catgatttcgtagttttgatccttaagttgagctttaggtgattttgtgtacctgaacatgtataataatgaataggaaagattttagattgagattgaa 16056721  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    |||||||||||||||||| | || | ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||    
T  16056720 cctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgcctt 16056621  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |    
T  16056620 g-ttaggttaaatgcgatctttgtagcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcc 16056522  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 421  Q
    |||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  16056521 tgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgata 16056422  T
Q  422 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16056421 ttgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 513
Target Start/End: Original strand, 810747 - 811249
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | |    
T  810747 cagagagccatccagatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggaga 810846  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gtt 209  Q
     | |||||||||||||||    || |||| |||| | || ||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || |||    
T  810847 ataagattgaacctggaaagaatttagaatgaatttttgtgaactgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag-tacttatgtt 810945  T
Q  210 acataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttg 309  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  810946 acaaaatgccttgtttaagttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgtgagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttgtag 811045  T
Q  310 ttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 409  Q
    || ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  811046 tttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgac 811145  T
Q  410 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  811146 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 811245  T
Q  510 atgt 513  Q
    ||||    
T  811246 atgt 811249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 22 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22073408 - 22072917
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  22073408 catggtttcgtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaa 22073309  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    ||| |||||||||||||| | || | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||| ||||| ||    
T  22073308 cctagaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgcttt 22073209  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |    
T  22073208 g-ttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcc 22073110  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacga-attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgat 420  Q
    |||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||    
T  22073109 tgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgat 22073010  T
Q  421 attgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||    
T  22073009 attgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatg 22072917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Original strand, 15754519 - 15755004
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  15754519 gatttcgaatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacct 15754618  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaat-gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtt--acataatgcctt 221  Q
    |||| |  ||| ||| ||| |  |  |||   |  |  ||||| |||| |||||| | |||||||| ||||| ||||  ||| |||  ||||||||||||    
T  15754619 ggaaaaactta-gaatgaaaacttttgagaatctgaccgaacttgccacggcgagcataggctctcgcctcgggagc--acttgttttacataatgcctt 15754715  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  15754716 gtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagac 15754815  T
Q  322 tgatgcatatgaa-ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgat 420  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  15754816 tgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgat 15754912  T
Q  421 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  15754913 attattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 15755004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Original strand, 28504933 - 28505415
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  28504933 gattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 28505032  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    | || ||  | |||| ||| || | |    |   |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| ||    
T  28505033 gaaa-agacttagaatgaaaatttagagaatctgaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tt 28505130  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||   |||||||||||||||||    
T  28505131 taggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactga 28505230  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| || ||||   ||  || |||||||     
T  28505231 tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgat---ttatatccgatatta 28505327  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28505328 ttatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatg 28505415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34201272 - 34200790
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| || | |||||| | || | |||||||||||||    
T  34201272 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgatcaagaaagaatttagaatgagattgaacct 34201173  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    | || ||  | |||| ||| || |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||      ||||||||||||||| ||    
T  34201172 gtaa-agacttagaatgaaaatttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacataatgcctt-tt 34201075  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||||||| |||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  34201074 taggttaaatgcgatccctgtcattcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactga 34200975  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||     
T  34200974 tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatatta 34200878  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  34200877 ttatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34200790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 161 - 512
Target Start/End: Original strand, 11995797 - 11996144
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  11995797 tgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctt-tttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgt 11995895  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  11995896 gagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 11995995  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 460  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||   || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11995996 ttgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgagttgttgat---ttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgtt 11996092  T
Q  461 gtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11996093 gtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 11996144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 290
Target Start/End: Original strand, 9389327 - 9389592
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9389327 gattttgtacttttgacttttaagttgaaccttggatgtttttgagtgtctggacttgtataatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacct 9389426  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  9389427 ggaatagtttaagaacgaatttatgtgagttacagctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaagcagttacagaatgccttgtt 9389526  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtt 290  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9389527 taggttaaaagcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagtt 9389592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16324509 - 16324197
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |      
T  16324509 cagagaggtgtcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttgaatgtttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagt 16324410  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |   |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||  | |||||    
T  16324409 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttttgagagttagattggaactcgccatggcgagtagaggccctcgccttgcgaactgcccagtta 16324310  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16324309 cagaatgccttg-ttaggttaaatgtgatccttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgt 16324211  T
Q  311 tccagtaagactga 324  Q
    | ||||||| ||||    
T  16324210 ttcagtaagcctga 16324197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 12901683 - 12901338
Alignment:
Q  160 atgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatg 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |  | | ||||| ||  ||||| |||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||    
T  12901683 atgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacaaaacaccttg-ttaggttaaatgtgacatttgtcgtacgagttgatg 12901585  T
Q  260 tgagttgatcttagaggt---ta-gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtta 355  Q
    |||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||   |||||| || ||||||||  ||||||||    
T  12901584 tgagttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtta 12901485  T
Q  356 tatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgccta 453  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||    
T  12901484 tatagttgtatatacattacatgaattatgtatgat-gttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgccta 12901386  T
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12901385 tgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 161 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15116834 - 15116565
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||       |  ||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  15116834 tgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 15116736  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||     
T  15116735 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttataatgtgatataa 15116636  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 431  Q
    ||||||||| |||||  || |||| | |||   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15116635 ttgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 20220034 - 20220290
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| |||||    
T  20220034 ctttgtcgcacgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgat 20220133  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  20220134 gttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgaactg 20220230  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  20220231 ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 162 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15113296 - 15113028
Alignment:
Q  162 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtg 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||       |  |||  |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  15113296 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacaggatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 15113198  T
Q  262 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagt 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |    
T  15113197 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgatataat 15113098  T
Q  362 tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 431  Q
    |||||||| |||||  || |||| | |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15113097 tgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 12255409 - 12255663
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| | ||||||||    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  12255409 cagagagtcaacatgatttcgtagttttgatccttaagttggtatttagatgattttgagtgcttgaacatgtataataatgattaggaaagattctaga 12255508  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||    
T  12255509 ttgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagtta 12255608  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    || |||| |||||||||| |   | ||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  12255609 cagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttga 12255663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16495579 - 16495406
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  16495579 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 16495484  T
Q  435 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16495483 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16495406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 2279736 - 2279990
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || | |||||| ||| |||||| | |||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |    
T  2279736 cagagagtcaacttgattttgtagttttgatccttaagttgatatttagatgattttgagtgcctgaacatgcataataatgattaggaaagattttaga 2279835  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||    
T  2279836 ttgagattgaacctgtaatagtttaagaatggatttttgggtgttacacctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcctagtta 2279935  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
     | |||| |||||||||| |   | ||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  2279936 tagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttga 2279990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 513
Target Start/End: Original strand, 2280053 - 2280238
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||   ||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  2280053 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 2280152  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg-atgatgatgatgt 513  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2280153 atcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 501
Target Start/End: Original strand, 1867929 - 1868101
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  1867929 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttata 1868027  T
Q  430 tcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||  || |||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1868028 tcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 494
Target Start/End: Original strand, 12255729 - 12255892
Alignment:
Q  334 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatca 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||| | ||| | ||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||    
T  12255729 attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatca 12255828  T
Q  433 tga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtct 494  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12255829 tgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 329 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044761
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14044837  T
Q  428 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||| ||  || |||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14044836 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 329 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354791
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14354867  T
Q  428 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||| ||  || |||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14354866 tatcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 19486678 - 19486847
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  19486678 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 19486777  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19486778 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 12756350 - 12756522
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  12756350 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 12756449  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    || || |||||||| ||| | | ||| || |  |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12756450 gatta-tttaagaatgaactttttggaagct-gacctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 12756522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 329 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13647512 - 13647344
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  13647512 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 13647414  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13647413 tgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38227606 - 38227485
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38227606 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtc 38227508  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  38227507 ggtctaagtagatgaagatgatg 38227485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564481
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3564462 ctaagttgatgaagatgatg 3564481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 9751182 - 9751423
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||| ||||||||    
T  9751182 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgaggttgaacct 9751281  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgg-gagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    |||| ||  | |||| |||  | ||| || ||   | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||      |||||| ||||||||||    
T  9751282 ggaa-agacttagaatgaaactttggagaatt-tgactgaactcgccatggtgagcagaggctctcgcctcgcgagcgcttgtgttacagaatgccttgt 9751379  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9751380 ttagtttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 9751423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 330 - 493
Target Start/End: Original strand, 15008433 - 15008597
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15008433 atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttata 15008531  T
Q  430 tcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtc 493  Q
    ||||||  || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  15008532 tcatgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 18456408 - 18456529
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  18456408 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtc 18456506  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  18456507 ggtctaagttgattaagatgatg 18456529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 39267278 - 39267519
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  39267278 gattttgtgattttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 39267377  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttg 222  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||  |||| |||||||||    
T  39267378 ggaa-agacttagaatgaaactttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgggagc--actagtattacagaatgccttg 39267474  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39267475 tttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 39267519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12698958 - 12698835
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgag 487  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12698958 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  488 tcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatg 12698835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 16385890 - 16385994
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  16385890 gattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 16385989  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  16385990 ggaat 16385994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9509315 - 9509193
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9509315 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatg 9509193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 330 - 512
Target Start/End: Original strand, 17061895 - 17062076
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgt-ttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  17061895 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattat 17061993  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||||| |  |||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17061994 gtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17062076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38227969 - 38227866
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  38227969 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 38227870  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  38227869 ggaa 38227866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Original strand, 17061593 - 17061832
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  17061593 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17061692  T
Q  126 gaatag-tttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    | |||| ||| ||||  ||  | || || |   |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||    
T  17061693 g-atagattttagaataaaactttgagaatctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatg-cttgtt 17061790  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||| |   | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  17061791 taggat-tttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttga 17061832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 10063757 - 10063921
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |     ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||    
T  10063757 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgttt-----gaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattat 10063851  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  10063852 atcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18302667 - 18302448
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  18302667 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 18302568  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||| ||||    
T  18302567 ggaa-agacttagaatgaaactttggataatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccatgtt 18302469  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgt 245  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  18302468 taggttaaatgcgatccttgt 18302448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 40443866 - 40443762
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||    
T  40443866 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacct 40443767  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  40443766 ggaat 40443762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18430889 - 18430713
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18430889 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18430791  T
Q  434 gatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| |||   ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18430790 gatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18430713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273393
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatg 48273393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 2831938 - 2832178
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  2831938 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 2832037  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactag--ttacataatgccttg 222  Q
     ||| ||  | |||| |||  | |||    |   | ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||  ||||| |||| ||||    
T  2832038 agaa-agacttagaatgaa-ctttggagaatctgactgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgtcttg 2832133  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  2832134 tttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgttatgagttga 2832178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Original strand, 11995690 - 11995768
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaaga 103  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11995690 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 11995768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26212474 - 26212370
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  26212474 gattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggtaagaatgtaggatgagattgaacct 26212375  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  26212374 ggaat 26212370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 27847476 - 27847580
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||   |||||||||||||    
T  27847476 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacct 27847575  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  27847576 ggaat 27847580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 456498 - 456322
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  456498 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 456400  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  456399 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 456322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 3563996 - 3564099
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  3563996 gatttcgttattttgacttttgagttgattcttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 3564095  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  3564096 ggaa 3564099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9509678 - 9509575
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  9509678 gatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 9509579  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  9509578 ggaa 9509575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 11393272 - 11393448
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  11393272 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 11393370  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11393371 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11972673 - 11972497
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  11972673 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 11972575  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11972574 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11972497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12699321 - 12699218
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||||    
T  12699321 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacct 12699222  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  12699221 ggaa 12699218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 14949107 - 14949283
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14949107 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 14949205  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14949206 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14949283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 15376698 - 15376874
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15376698 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 15376796  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15376797 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15376874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16232697 - 16232521
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16232697 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16232599  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16232598 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16232521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 16386242 - 16386365
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||||||||||  | || | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16386242 atatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16386341  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  16386342 cggtctaagttgttgaagatgatg 16386365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 20385108 - 20385284
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20385108 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20385206  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20385207 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 21189580 - 21189756
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21189580 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 21189678  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21189679 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 21189756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24702415 - 24702239
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24702415 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24702317  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24702316 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24702239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32125668 - 32125492
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32125668 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 32125570  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32125569 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 32125492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 41523094 - 41522918
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41523094 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41522996  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41522995 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 41525556 - 41525380
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  41525556 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 41525458  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41525457 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41525380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Original strand, 21064794 - 21064964
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || ||||||| || | |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||| |    
T  21064794 gattttgtgattttgagctgtgagtttaaccttagatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggaaatattttagaatgagattgaactt 21064893  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcg 195  Q
    |||||||| | |||| | || | || | |||  |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21064894 ggaatagtgtcagaatggatttttgagtgttttaccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcg 21064964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18640440 - 18640273
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 442  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  18640440 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18640341  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18640340 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18640273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44116992 - 44116820
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||  ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |    
T  44116992 atttcgtaattttgactcttgagttgatccttatatgcctttgagtccctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccg 44116893  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||| || || |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44116892 gaa-agatttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44116820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 15143668 - 15143772
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgaccttta-agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacc 123  Q
    |||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  15143668 gatttcgtgattttgactttttgagttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaacc 15143767  T
Q  124 tggaa 128  Q
    |||||    
T  15143768 tggaa 15143772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 330 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 44116691 - 44116510
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||| |  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  44116691 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 44116593  T
Q  429 atcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44116592 gtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44116510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24704862 - 24704689
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || |    
T  24704862 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtctt 24704764  T
Q  434 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | |  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24704763 gtt--tttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24704689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26212122 - 26212012
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  26212122 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  489 cggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||    
T  26212023 cggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27217037 - 27216861
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  27217037 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 27216939  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  27216938 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 27216861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 40443509 - 40443395
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaa 40443411  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  40443410 gatgttgaagatgatg 40443395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Original strand, 2529619 - 2529709
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||| |||||    
T  2529619 ttttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattggacctg 2529709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275182
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  493 ctaagttgat 502  Q
    ||||||||||    
T  24275191 ctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 513
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144154
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| || || | ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  15144135 ctaagttga-gatgatgatgt 15144154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 136
Target Start/End: Original strand, 1867650 - 1867729
Alignment:
Q  57 tagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  1867650 tagatgttttttagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 1867729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14045281 - 14045202
Alignment:
Q  57 tagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  14045281 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 14045202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14355311 - 14355232
Alignment:
Q  57 tagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  14355311 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 14355232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16410177 - 16410060
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16410177 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16410080  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  16410079 ctaagttgattaagatgatg 16410060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 18154468 - 18154522
Alignment:
Q  24 tgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18154468 tgatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 18154522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 446 - 512
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847947
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatg 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213685
Alignment:
Q  401 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagtt 499  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T
Q  500 gatgatgatgatg 512  Q
    ||| | |||||||    
T  16213697 gattaagatgatg 16213685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12901850 - 12901783
Alignment:
Q  69 agtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  12901850 agtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 12901783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386334
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3386334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 9177252 - 9177318
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  9177252 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattaggtaagtttttagattgagattgaac 9177318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Original strand, 17017042 - 17017120
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  17017042 ttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 17017120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18426179 - 18426070
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  18426179 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 18426080  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  18426079 t-atgatgatt 18426070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 39267582 - 39267691
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||| ||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  39267582 atgatttgatgatatttataattttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 39267681  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  39267682 t-atgatgatt 39267691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 45169773 - 45169882
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  45169773 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 45169872  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  45169873 t-atgatgatt 45169882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 10589115 - 10589055
Alignment:
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10589115 tttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869347
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 19649117 - 19649170
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19649117 gatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 19649170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110557
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20110557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 24054955 - 24054894
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtata 86  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24054955 gattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtata 24054894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 2529866 - 2529926
Alignment:
Q  207 gttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2529866 gttacagaatgccttaattaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 2529926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 2760613 - 2760549
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataa 90  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| ||||||    
T  2760613 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataa 2760549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 3272273 - 3272209
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataa 90  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| ||||||    
T  3272273 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataa 3272209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 14036384 - 14036282
Alignment:
Q  388 tgatatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccat 484  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  14036384 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 14036286  T
Q  485 gagt 488  Q
    ||||    
T  14036285 gagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 14346414 - 14346312
Alignment:
Q  388 tgatatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccat 484  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  14346414 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 14346316  T
Q  485 gagt 488  Q
    ||||    
T  14346315 gagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  395 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14036731 - 14036664
Alignment:
Q  57 tagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  14036731 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtaaaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 14036664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14346761 - 14346694
Alignment:
Q  57 tagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  14346761 tagatgtttttgagtgcctgaatatgtaaaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 14346694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 15008095 - 15008177
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    |||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||  || || |||||||||||||||||    
T  15008095 ttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattagacaattttttagattgagattgaacctgg 15008177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831374
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatg 13831374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Original strand, 9751500 - 9751572
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 416  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  9751500 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9751572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18425743 - 18425668
Alignment:
Q  364 tatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18425743 tatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18425668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18425945 - 18425870
Alignment:
Q  364 tatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18425945 tatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18425870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 502
Target Start/End: Original strand, 38898370 - 38898528
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 442  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||     
T  38898370 ttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 38898469  T
Q  443 c-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
      ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38898470 atatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 123961 - 124000
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  123961 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 124000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4993837 - 4993798
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4993837 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 4993798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 10508725 - 10508768
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10508725 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 10508768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 13395233 - 13395272
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13395233 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 13395272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 498
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154944
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48785664 - 48785625
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48785664 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 48785625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 11768526 - 11768592
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || || ||||| |||||||    
T  11768526 ttagatgattttgagtgcctgaacatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgaaattgaac 11768592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 14194767 - 14194729
Alignment:
Q  24 tgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatg 62  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14194767 tgatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatg 14194729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26212348 - 26212310
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26212348 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 26212310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991206
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcg 490  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 404
Target Start/End: Original strand, 9389649 - 9389705
Alignment:
Q  347 ataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9389649 ataatgttatataattgtatatacattgtatgaattatg-ttgatatatgagatgttg 9389705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11880729 - 11880668
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattatta 96  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| || |||| ||||    
T  11880729 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 11880668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 201
Target Start/End: Original strand, 9177432 - 9177472
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9177432 tgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagct 9177472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 9703743 - 9703703
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9703743 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 9703703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16006768 - 16006732
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16006768 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 16006732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 21743056 - 21743092
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21743056 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 21743092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 25 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7300 - 6822
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  7300 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 7201  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   ||| |||| |||| | || ||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7200 ggaaagattttagaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgagctaactagttacagaatgccttgtt 7101  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7100 taggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga 7001  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||    
T  7000 tgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcaatattg 6904  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6903 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatgatg 6822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8519 - 8097
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| || |    
T  8519 cagagagtcaacatgatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttaaatgtttttgggtgtctgaatatgtgtaataatgattagaaaagattctaga 8420  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |  | |||||    
T  8419 ttgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtggaggccctcgcctcgcgagttgtccagtta 8320  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    |||||||| ||| ||||||  |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8319 cataatgctttg-ttaggtataatgtgatctttgtctcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgt 8221  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    | ||||||| ||||   |||| |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8220 ttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgact 8121  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatg 434  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  8120 tgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Original strand, 39705906 - 39706405
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |    
T  39705906 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaaga 39706005  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  | |||||    
T  39706006 ttaagattgaacctggaatagtttaagaacgaattt-tgagagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagtta 39706104  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39706105 cagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgt 39706204  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    |  |||||| ||||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||    
T  39706205 tttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatg-ttgatgtttatgatgttcatgact 39706303  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatga 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  39706304 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 39706403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8846864 - 8846359
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  8846864 gatttcgtaattttgacttttgagttgattcttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 8846765  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgg-gagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    ||||   ||| |||| |||| | | | ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8846764 ggaaagattttagaatgaattttttgtgagttgcaccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgt 8846665  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  8846664 ttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactg 8846565  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846564 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 8846465  T
Q  424 ----------------gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatga 507  Q
                    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  8846464 gttagcattcgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatga 8846365  T
Q  508 tgatgt 513  Q
    ||||||    
T  8846364 tgatgt 8846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12774487 - 12774010
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||||    
T  12774487 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacct 12774388  T
Q  125 gga-atagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttg 222  Q
    ||| | |  ||| ||| |||| | || ||  |  |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| | |||||||    
T  12774387 ggagagacgtta-gaatgaattt-tgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagactgccttg 12774291  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12774290 tttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagact 12774191  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  12774190 gatgcatatgaattgatgttgtttataat--------gttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatat 12774101  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774100 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 12774010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 22 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15099842 - 15099461
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15099842 catgattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacttgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaa 15099743  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  15099742 cctggaatagtttaagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgtctt 15099643  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||  |||||||||| |    
T  15099642 gtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcc 15099543  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    ||     |||    | |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15099542 tggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15099461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 13695 - 13953
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  13695 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgat 13794  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga 438  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  13795 gttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgt 13894  T
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13895 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 15552302 - 15551821
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  15552302 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacct 15552203  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    |||| ||  | ||||  || || |||    |   |  |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||      |||||| |||| ||| ||    
T  15552202 ggaa-agacttagaatcaaaatttggagaatctgaccgaactcgccacggcgagcagaggctcgcgcctcgcgagcattggtgttacaaaatgtctt-tt 15552105  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||  ||| |||||||||||||    
T  15552104 taggtaaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt-accctgctgttaatgtcccagtaagactga 15552006  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || | |||||||||     
T  15552005 tgcttatgaatcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttaccttcgatatta 15551909  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15551908 ttatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 15551821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15190795 - 15190428
Alignment:
Q  36 tttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagttta 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15190795 tttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaaggttctagattgagatttaacctggaatagttta 15190696  T
Q  136 agaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaata 235  Q
    |||| | || | |||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||      
T  15190695 agaatggatttttgggcgttacatctgtactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaag 15190596  T
Q  236 cgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaat 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||  ||||||  |||||||||| |||     |||        
T  15190595 cgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattc 15190496  T
Q  336 tgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    | |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15190495 taatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15190428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16597128 - 16596686
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaata 130  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  16597128 gtaattttgatttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-a 16597030  T
Q  131 gtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggtt 230  Q
    |  | |||| ||| || | |    |   |  ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||      |||||| |||||||| ||||||||    
T  16597029 gacttagaatgaaaatttagagaatctgaccgaactcgccatggcgagtagaggttctcgccccgcgggcgtttgtgttacagaatgcctt-tttaggtt 16596931  T
Q  231 aaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcata 330  Q
     |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  16596930 gaatgtgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgctta 16596831  T
Q  331 tgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 430  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||   |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16596830 taaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatat 16596734  T
Q  431 catgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 478  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596733 catgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 161 - 501
Target Start/End: Original strand, 12287976 - 12288316
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||  ||||||  | ||||| ||||| |||  ||  |||||||||  |||||||||    
T  12287976 tgaactcgccatagcgagtagaagctctcgcctcgcgagctcaagagagacataacactttgtt-aggtttaatgtgacttttgtcgcataagttgatgt 12288074  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  12288075 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatag 12288174  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  12288175 ttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttg 12288273  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12288274 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 224 - 501
Target Start/End: Original strand, 43198384 - 43198661
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||     
T  43198384 ttaggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgct---agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagacta 43198480  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43198481 atgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatat 43198580  T
Q  423 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
     ||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43198581 ggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 224 - 497
Target Start/End: Original strand, 53081979 - 53082254
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtta-gaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  53081979 ttaggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcct 53082078  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    ||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || |||||    
T  53082079 gaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatat 53082177  T
Q  423 tgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||  || |||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53082178 tgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 224 - 497
Target Start/End: Original strand, 46640285 - 46640558
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||    
T  46640285 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctg 46640383  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |   |||||| ||||||||||| || |||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||  ||| || |||| ||||||    
T  46640384 aattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgat-gttgagatgttattgattttcatttgatatt 46640482  T
Q  424 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46640483 gttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13845032 - 13844852
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||| || ||  ||||| |    
T  13845032 tcatgatttcgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagatcaagattta 13844933  T
Q  121 acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 201  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13844932 acctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgtacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagct 13844852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Original strand, 43198206 - 43198381
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |    
T  43198206 cagagagtcagcatgatttcgtagttttgacccttaagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattttaga 43198305  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggct 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   || | |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  43198306 ttgagattgaacatggaatagtttaagaattgatttttgggagttacacctgaactcaccatagcgagtagaggct 43198381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 330 - 501
Target Start/End: Original strand, 52243128 - 52243302
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  | ||||| | ||| | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  52243128 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttat 52243227  T
Q  429 atcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52243228 atcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 15464547 - 15464764
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||   ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  15464547 cagagagtcaacataatttcgtagttttgacccttaagttgatatttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagattttaga 15464646  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||    
T  15464647 ttgagattgaacctgaaatagtttaagaatggatttttgggtgttacacctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagtta 15464746  T
Q  211 cataatgccttgtttagg 228  Q
    || |||| ||||||||||    
T  15464747 cagaatgacttgtttagg 15464764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Original strand, 52242811 - 52243052
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |    
T  52242811 cagagagtcaacatgatttcgtagttttgatctttaagttggtatttagatgatttcgagtgcctgaacatgtataataatgatcaggaaagattctaga 52242910  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||    
T  52242911 atgagattgaacctggaatagtttaagaatgcattgttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagtta 52243010  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagt 254  Q
    || |||| |||||||||| |   | |||||||||||||||||||    
T  52243011 cagaatg-cttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagt 52243052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24029230 - 24028989
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||   |||||||||||||    
T  24029230 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtaggatgagattgaacct 24029131  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttg 222  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||    
T  24029130 ggaa-agacttagaatgaaactttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttg 24029034  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24029033 tttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 24028989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7798900 - 7798778
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7798900 atatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 7798802  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7798801 cggtctaagttgatgaagatgatg 7798778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 394 - 504
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377630
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtc 493  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16377619  T
Q  494 taagttgatga 504  Q
    |||||||||||    
T  16377620 taagttgatga 16377630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 20156922 - 20157163
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  20156922 gatttcgtgattttgacttttgagttaatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 20157021  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttg 222  Q
    ||||  | ||| ||| |||  | ||     ||  | |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| | |||||||    
T  20157022 ggaaaggctta-gaatgaaactttgaagaatatgactgaactcgccatggcgtgcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagagtgccttg 20157118  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20157119 tttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 20157163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 22633845 - 22634086
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||   || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  22633845 gatttcgtgattttgacttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22633944  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||||||    
T  22633945 ggaa-agacttagaatgaaactttggataatcagattgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtt 22634043  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  22634044 taggttaaatgcgatctttgtcgcacgatttgttatgagttga 22634086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088881
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  496 agttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| |||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatg 7088881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 512
Target Start/End: Original strand, 44928866 - 44929041
Alignment:
Q  338 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 436  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||| |    
T  44928866 atgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgct 44928965  T
Q  437 gattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44928966 gtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44929041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 13402 - 13516
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  13402 catgattttgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaa 13501  T
Q  122 cctggaatagtttaa 136  Q
    ||||| | |||||||    
T  13502 cctgggaaagtttaa 13516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 6900016 - 6899895
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||   ||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  6900016 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtc 6899918  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  6899917 ggtctaagttgatgaagatgatg 6899895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 13812441 - 13812682
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||   |||||||||||||    
T  13812441 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgtctgaacatgtctaatattgattaggaaataatgtaggatgagattgaacct 13812540  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttg 222  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |   | | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||| |||    
T  13812541 ggaa-agacttagaatgaaactttggagaatctgactaaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgctttg 13812637  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13812638 tttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 13812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 16270231 - 16270352
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16270231 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtc 16270329  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  16270330 ggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 44928555 - 44928795
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  44928555 gattccgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 44928654  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   ||| |||| |||  | ||||| |   |   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||| |||| ||||||    
T  44928655 ggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgaccagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtt 44928753  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||| |   | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  44928754 taggat-tttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttga 44928795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 391 - 512
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873484
Alignment:
Q  391 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 52873461  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  52873462 ggtctaagttgatgaagatgatg 52873484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 15868277 - 15868378
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagttt 134  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||    
T  15868277 ttttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgggaaagttt 15868376  T
Q  135 aa 136  Q
    ||    
T  15868377 aa 15868378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 18215253 - 18215435
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  18215253 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 18215351  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18215352 tgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18215435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3097121 - 3097017
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  3097121 gatttcataattttgacttttgagttaaaccttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 3097022  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  3097021 ggaat 3097017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7089355 - 7089251
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  7089355 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 7089256  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  7089255 ggaat 7089251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12903234 - 12903131
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  12903234 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgctttga-gtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 12903136  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  12903135 ggaat 12903131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3332239 - 3332144
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttg 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3332239 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcatgagttg 3332144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12902883 - 12902761
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12902883 atatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 12902785  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  12902784 cggtctaagttgttgaagatgatg 12902761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280317
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  14280340 cggtctaagttgattaagatgatg 14280317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 44615465 - 44615289
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  44615465 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 44615367  T
Q  434 gatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44615366 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44615289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798871
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  54798848 cggtctaagttgattaagatgatg 54798871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 16239965 - 16240086
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| | |||||||     
T  16239965 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagtt 16240063  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  16240064 ggtctaagttgatgaagatgatg 16240086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 16239624 - 16239728
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaag-attgtaaattgagattgaacc 123  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  16239624 gatttcgtaattttgacttttgagttgctccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaatgtagaatgagattgaacc 16239723  T
Q  124 tggaa 128  Q
    |||||    
T  16239724 tggaa 16239728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7893829 - 7893707
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |    
T  7893829 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatg 7893707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 15118337 - 15118513
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15118337 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 15118435  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15118436 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15118513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22636561 - 22636439
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22636561 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22636463  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  22636462 cggtctaagttgatgaagatgatg 22636439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 44052955 - 44052833
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  44052955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatg 44052833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 44773072 - 44773248
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  44773072 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 44773170  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44773171 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44773248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 52312687 - 52312511
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  52312687 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 52312589  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  52312588 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 52312511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038653
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgat 511  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  14038671 ctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 512
Target Start/End: Original strand, 12301 - 12468
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 442  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  12301 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12400  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12401 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 439 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096297
Alignment:
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 3096297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 136
Target Start/End: Original strand, 12287791 - 12287876
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  12287791 gaaccttagatgtttctaagtgtctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 12287876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Original strand, 14052948 - 14053049
Alignment:
Q  28 ttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgga 127  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||    
T  14052948 ttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacttgga 14053047  T
Q  128 at 129  Q
    ||    
T  14053048 at 14053049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Original strand, 19618216 - 19618323
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19618216 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19618313  T
Q  493 ctaagttgat 502  Q
    ||||||||||    
T  19618314 ctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046491
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 17046491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 390 - 509
Target Start/End: Original strand, 23374354 - 23374473
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23374354 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    || ||||||||| ||| ||||    
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837670
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  1837494 ttgatgttgtt-ataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1837670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14039138 - 14039039
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  14039138 gatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatttggaaagaatgtagaatgagattgaacct 14039039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 630710 - 630819
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  630710 atgatttgatgttatttataatgttatataattggatatatattgcatgcattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 630809  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  630810 t-atgatgatt 630819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6190913 - 6190819
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||    
T  6190913 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaa 6190819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19242872 - 19242700
Alignment:
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga 438  Q
    |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||     
T  19242872 gttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt 19242773  T
Q  439 ttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||| | ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19242772 ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19242700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 21814936 - 21815108
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | || | ||| | ||||||||    
T  21814936 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctg 21815035  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    || ||  ||||||| ||| | | ||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21815036 gatta-attaagaatgaactttttggaagct-gacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21815108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 21818358 - 21818530
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | || | ||| | ||||||||    
T  21818358 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctg 21818457  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    || ||  ||||||| ||| | | ||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21818458 gatta-attaagaatgaactttttggaagct-gacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 512
Target Start/End: Original strand, 50222333 - 50222500
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 442  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  50222333 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 50222432  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  50222433 tataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 50222500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3515184 - 3515008
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || |    
T  3515184 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtctt 3515086  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3515085 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3515008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15091386 - 15091283
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  15091386 gatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtttctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 15091287  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  15091286 ggaa 15091283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 18239404 - 18239580
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18239404 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18239502  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18239503 gctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18239580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3332070 - 3331961
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  3332070 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacatgcatttgtaattgttata 3331971  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  3331970 t-atgatgatt 3331961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574984
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| || | |||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatg 8574984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 14953897 - 14954006
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  14953897 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 14953996  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  14953997 t-atgatgatt 14954006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Original strand, 15355309 - 15355476
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatca 432  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  15355309 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 15355407  T
Q  433 tgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    || || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15355408 tgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 21815265 - 21815437
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | | || | ||| | ||||||||    
T  21815265 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctg 21815364  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    || || || ||||| ||| | | ||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21815365 gattaatt-aagaatgaactttttggaagctg-acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 21815437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25690246 - 25690137
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  25690246 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 25690147  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  25690146 t-atgatgatt 25690137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 32851921 - 32851839
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||| || || |||||||||| ||||||    
T  32851921 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagacaagtttttagattgagattggacctgg 32851839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 51463847 - 51464029
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  51463847 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 51463945  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  51463946 tgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 51464029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 440
Target Start/End: Original strand, 13812759 - 13812854
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13812759 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13812854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 16377154 - 16377258
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||   |||||||||||||    
T  16377154 gatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagcgtctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtaggatgagattgaacct 16377253  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  16377254 ggaat 16377258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 44053318 - 44053218
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||   |||||||||||||    
T  44053318 gatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattgggaaagaatgtaggatgagattgaacct 44053219  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  44053218 g 44053218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 53081748 - 53081840
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||| ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| || || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  53081748 ttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctaaacatgtataataatgattaagcaagtttttagattgagattgaacctggaaaagtttaa 53081840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7799186 - 7799083
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| | | ||||   |||||||||||||    
T  7799186 gatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggacataatgtaggatgagattgaacct 7799087  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  7799086 ggaa 7799083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Original strand, 17047726 - 17047813
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||   |||||||||||    
T  17047726 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgactaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaac 17047813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22636923 - 22636820
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| | | |||||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  22636923 gattttgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22636824  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  22636823 ggaa 22636820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190481
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641343
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 7641343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10713192 - 10713083
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10713192 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 10713093  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  10713092 t-atgatgatt 10713083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10926962 - 10926853
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  10926962 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 10926863  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  10926862 t-atgatgatt 10926853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610951
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12610951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15225417 - 15225308
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15225417 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15225318  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  15225317 t-atgatgatt 15225308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Original strand, 23803369 - 23803426
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23803369 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23803426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12488045 - 12487941
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 434  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||    
T  12488045 ttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atg 12487947  T
Q  435 atgatt 440  Q
    ||||||    
T  12487946 atgatt 12487941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 512
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053418
Alignment:
Q  399 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||     
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaaga 14053404  T
Q  499 tgatgatgatgatg 512  Q
    || ||| |||||||    
T  14053405 tgttgaagatgatg 14053418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102215
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 44102215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 44102697 - 44102597
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| || ||||   ||||||||||||||    
T  44102697 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgagcatgtttaataatgattatgaa-gaatgtaggatgagattgaacctg 44102599  T
Q  126 ga 127  Q
    ||    
T  44102598 ga 44102597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14164807 - 14164732
Alignment:
Q  258 tgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatga 333  Q
    |||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  14164807 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaatcatatga 14164732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 15868645 - 15868754
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||  ||| || |||||||| | | |  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  15868645 atgaattgatgatatttataatgttatataattggatatttattgcatgaattatggtcgctgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 15868744  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  15868745 t-atgatgatt 15868754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970858
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 14970848  T
Q  493 ctaagttgat 502  Q
    ||||||||||    
T  14970849 ctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 434
Target Start/End: Original strand, 15464865 - 15464970
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| || |||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  15464865 atgatttgatgtcgtttaaaatttgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 15464964  T
Q  429 atcatg 434  Q
    ||||||    
T  15464965 atcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 32851545 - 32851450
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || || ||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  32851545 ttataatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 32851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Original strand, 46640031 - 46640111
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| |||| ||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||| |||||    
T  46640031 ttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtaaaataatgattaggcaagtttttagattgagattaaacct 46640111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 287441 - 287402
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  287441 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 287402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14158102 - 14158027
Alignment:
Q  258 tgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatga 333  Q
    |||||| ||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  14158102 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttttttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaatcatatga 14158027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15225188 - 15225114
Alignment:
Q  365 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15225188 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15225114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16359854 - 16359815
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16359854 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16359815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17333820 - 17333749
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  17333820 gaactttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 17333749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 31116822 - 31116861
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31116822 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 31116861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 55502517 - 55502556
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55502517 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 55502556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7089229 - 7089191
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7089229 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 7089191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Original strand, 17047841 - 17047879
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17047841 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17047879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22353901 - 22353852
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22353901 ctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Original strand, 32306582 - 32306648
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||| |||||||    
T  32306582 ttagatggttttgagtgcctaaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgaaattgaac 32306648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44102563 - 44102525
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44102563 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 44102525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32851676 - 32851623
Alignment:
Q  214 aatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||    
T  32851676 aatgcctggtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgtgagttgttatgagttga 32851623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44676108 - 44676047
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattatta 96  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| || |||| ||||    
T  44676108 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 44676047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4171374 - 4171338
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4171374 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 4171338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 13569988 - 13569948
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13569988 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 13569948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14699066 - 14699030
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14699066 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 14699030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15094249 - 15094209
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15094249 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15094209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 15121446 - 15121486
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15121446 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15121486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15791960 - 15791916
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacatta 374  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15791960 atgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcatta 15791916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 16348331 - 16348375
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16348331 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16348375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Original strand, 20157240 - 20157312
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 416  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| | | || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  20157240 tttataatgttatataattagatatatactgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 20157312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Original strand, 22634163 - 22634235
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 416  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||  |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  22634163 tttataatgttatataattagatatatattgcataaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 22634235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23843955 - 23843915
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23843955 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 23843915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26789872 - 26789792
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||| || || ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  26789872 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataacgattaggcaagtttttagattgaaattgaacatgggaaagtttaa 26789792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 136)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19652684 - 19652198
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  19652684 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacct 19652585  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||    || |||| |||| | || || ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  19652584 ggaaagactttagaatgaatttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgggctaactagttacaaaataccttgtt 19652485  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19652484 taggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactga 19652385  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19652384 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatggattatg-ttgatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattg 19652287  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652286 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19652198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 23019910 - 23019408
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| || |    
T  23019910 cagagagtcaacatgatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtgtgataatgattaggaaagattttaga 23019811  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |  | | |||    
T  23019810 ttgagattgaacctggaatattttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggcccttgcctcgcgagttgtccaatta 23019711  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23019710 caaaatg-cttggttaggttaaatgcgatctttgtcgaacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgt 23019612  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    | ||||||| ||||   |||| |  | |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23019611 ttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgact 23019512  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg-atgatgatg 509  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||    
T  23019511 tgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatgaaagatgatg 23019412  T
Q  510 atgt 513  Q
    ||||    
T  23019411 atgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Original strand, 29808515 - 29808999
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  29808515 gatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacct 29808614  T
Q  125 ggaat-agtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttg 222  Q
    ||||  | ||| |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| |||||||||    
T  29808615 ggaaagatttttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttg 29808713  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  29808714 tttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagact 29808812  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||    
T  29808813 gatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacattcgatat 29808909  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  29808910 tattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 29808999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Original strand, 28496105 - 28496588
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  28496105 gatttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacct 28496204  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgg-gagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttg 222  Q
    |||| ||  | |||| |||  | | | || |   |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| |||||||||    
T  28496205 ggaa-agacttagaatgaaacttttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttg 28496302  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  28496303 tttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagact 28496401  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||    
T  28496402 gatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacattcgatat 28496498  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  28496499 tattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatg 28496588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1561792 - 1561307
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  1561792 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacct 1561693  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaat-gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtt--acataatgcctt 221  Q
    |||| |  ||| ||| ||| |  |  |||   |  |  ||||| |||| |||||| | |||||||| ||||| ||||  ||| |||  ||||||||||||    
T  1561692 ggaaaaactta-gaatgaaaacttttgagaatctgaccgaacttgccacggcgagcataggctctcgcctcgggagc--acttgttttacataatgcctt 1561596  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  1561595 gtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagac 1561496  T
Q  322 tgatgcatatgaa-ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgat 420  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  1561495 tgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgat 1561399  T
Q  421 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  1561398 attattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatg 1561307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 161 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 19668726 - 19668386
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||| ||  ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  19668726 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctgtccaattacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 19668628  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |  ||||||| ||||||||||||||    
T  19668627 gagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatag 19668528  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||  ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||    
T  19668527 ttgtatatacattacatgaattacgtatgat-gttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttg 19668429  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668428 ctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 457
Target Start/End: Original strand, 22080369 - 22080800
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||  | ||| |||||||||||    
T  22080369 gatttcgtaactttaaacttttagttgaaccttagatgtttttgagtgactgaacatgtctaataatgattagaaaagattagagattaagattgaacct 22080468  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      | ||| ||  |||||||    
T  22080469 ggaatagtttaagaacgaacttatgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcttgtgtctgacagaacaccttgtt 22080568  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact-g 323  Q
    ||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||      
T  22080569 taggaataatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaa 22080668  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact-tgcattcgatat 422  Q
    ||  ||||||  | ||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||   ||| |||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  22080669 attgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatattaattatg-acgatgtttgagatgttgtt--ctgtgcattcgatat 22080765  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 457  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22080766 tgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 240 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20109417 - 20109140
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  20109417 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgat 20109318  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagt--tgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 436  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  20109317 gttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgtt 20109218  T
Q  437 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg-atgatgatgatgt 513  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20109217 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Original strand, 27332902 - 27333214
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| || |    
T  27332902 cagagaggcatcatgatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttaga 27333001  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
     |||| ||||||||||||   ||| |||| |||  | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | | |||    
T  27333002 atgaggttgaacctggaaagattttagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaatta 27333101  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || ||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||    
T  27333102 cagaatgctttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgt 27333200  T
Q  311 tccagtaagactga 324  Q
    | ||||||| ||||    
T  27333201 ttcagtaagcctga 27333214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Original strand, 27393642 - 27393954
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| || |    
T  27393642 cagagaggcatcatgatttcataattttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttaga 27393741  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
     |||| ||||||||||||   ||| |||| |||  | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | | |||    
T  27393742 atgaggttgaacctggaaagattttagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaatta 27393841  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || ||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||    
T  27393842 cagaatgctttgtt-aggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgt 27393940  T
Q  311 tccagtaagactga 324  Q
    | ||||||| ||||    
T  27393941 ttcagtaagcctga 27393954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 513
Target Start/End: Original strand, 4185465 - 4185939
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat-agtt 133  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||| |||| ||||| |||||| || ||||||  |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||    
T  4185465 ttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcatgaacaagtctaataacgattatgaaagaatgtagagtgagattgaacctggaaagagtt 4185564  T
Q  134 taagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaa 233  Q
    || ||| |||| | || ||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| | ||||||||| | ||||||||    
T  4185565 ta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttatagaatgccttgct-aggttaaa 4185662  T
Q  234 tacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcat--at 331  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | |  ||||| ||||||||| || || ||   |  ||    
T  4185663 tgcgatccttgccgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgttgttgatgttccagtgagtctaattgtttaat 4185762  T
Q  332 gaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
      | ||||||||   || |||||| | |  |||||| ||||| || || |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4185763 ccaatgatgttg---atgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgatattgttata 4185855  T
Q  430 tcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4185856 tcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgatgt 4185939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 161 - 501
Target Start/End: Original strand, 9098292 - 9098620
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |  ||  ||| ||  ||||||| ||||| | |   | |||||||||||||||||||||    
T  9098292 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagctcatgagagacagaacaccttgtt-aggtttattgtcacctttgtcgcacgagttgatgt 9098390  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||            |||||||||||     
T  9098391 gagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaattatatgattt------------aatgttatataa 9098478  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| || | || |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  9098479 ttatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcatactgcctttgttg 9098577  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9098578 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25644816 - 25644571
Alignment:
Q  20 atcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||   | ||||||||||||| || ||||||||||    
T  25644816 atcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgttcatgtataacgttgattaggaaagattttagattgagattg 25644717  T
Q  120 aacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcc 219  Q
    |||||| ||||||||||||| | || | |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  |  ||| || |||| |    
T  25644716 aacctgaaatagtttaagaatggatttttgggagttacacccgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcccggtttcagaatg-c 25644618  T
Q  220 ttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25644617 ttgtttaggtt-tttgcgatctttgtcgcacgagttgctgagagttga 25644571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 461
Target Start/End: Original strand, 4667855 - 4668277
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat-agtt 133  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||    
T  4667855 ttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagtt 4667954  T
Q  134 taagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaa 233  Q
    || ||| |||| | || ||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  4667955 ta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaa 4668052  T
Q  234 tacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcat--at 331  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | | |||||| ||||||||| || || ||   |  ||    
T  4668053 tgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtctaattgtttaat 4668152  T
Q  332 gaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
      | ||||||||   || |||||| | |  |||||| ||||| || || |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4668153 ccaatgatgttg---atgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgatattgttata 4668245  T
Q  430 tcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 461  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4668246 tcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 461
Target Start/End: Original strand, 4674702 - 4675124
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat-agtt 133  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||    
T  4674702 ttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagtt 4674801  T
Q  134 taagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaa 233  Q
    || ||| |||| | || ||  |  |  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  4674802 ta-gaatgaatttttgtgaactgaaccttaactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaa 4674899  T
Q  234 tacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcat--at 331  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | | |||||| ||||||||| || || ||   |  ||    
T  4674900 tgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtctaattgtttaat 4674999  T
Q  332 gaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
      | ||||||||   || |||||| | |  |||||| ||||| || || |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4675000 ccaatgatgttg---atgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgatattgttata 4675092  T
Q  430 tcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 461  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4675093 tcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 35008503 - 35008167
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     |  ||| | ||| ||||| ||| |||||  || |||||| ||||||||||||||    
T  35008503 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctgttgtgagacagactgc-ttgtt-aggataaatgtgacctttgttgcacgagttgatgt 35008406  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||     
T  35008405 gagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatat 35008306  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg--atgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||  ||| |  || | |||||| |||||||  |  ||| |||   ||||||||||||||    
T  35008305 ttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttg 35008206  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35008205 ttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 415 - 512
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333335
Alignment:
Q  415 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27333335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 415 - 512
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394075
Alignment:
Q  415 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27394075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23077008 - 23076749
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| |||||    
T  23077008 ctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgat 23076909  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg--atg 437  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||| ||| |  || | |||||| |||||||  |  |||    
T  23076908 gttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatg 23076809  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23076808 ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 25956249 - 25956429
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |  ||| | ||||||| || ||||||||| |    
T  25956249 tcatgatttcgtaattttgacttttaagttgaatcttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaattacgattggaaaagattctagattgagattta 25956348  T
Q  121 acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 201  Q
    ||||||||||||||||||| | || | | |||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25956349 acctggaatagtttaagaatggattttttggagttacacctgtattcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaagct 25956429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25644508 - 25644335
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||  ||||||  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25644508 atgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttat 25644409  T
Q  429 atcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25644408 atcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 513
Target Start/End: Original strand, 31155169 - 31155515
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgag 263  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |   |||||  |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||    
T  31155169 actctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctacccctttacaacatgccttgtt-aggttaaatgcggtccttgtcgcacgagttgttgtgag 31155267  T
Q  264 ttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttg 363  Q
     |||| ||||| ||||  ||||||||||  || ||| |||||| ||||||||| || || |    | | |   |||| ||||  | ||||||||||  ||    
T  31155268 atgattttagatgttaagaactaagttgcctagcttgctgttgatgttccagtgagtctaaattttttaatccgatgatgttgttgatgttatataaatg 31155367  T
Q  364 tatatacattacacgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 461  Q
    |||| ||||| || || |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||    
T  31155368 tataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctg 31155462  T
Q  462 -tttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31155463 ttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatgt 31155515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 330 - 509
Target Start/End: Original strand, 8227445 - 8227625
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  8227445 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 8227544  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  |||  |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  8227545 atcatgatgttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186376
Alignment:
Q  401 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  501 atgatga 507  Q
    |||||||    
T  4186382 atgatga 4186376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 20637926 - 20638030
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  20637926 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 20638025  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  20638026 ggaat 20638030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4189416 - 4189203
Alignment:
Q  54 ccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat-agtttaagaacgaatatgtggga 152  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||  |||||| ||| |||| | || ||    
T  4189416 ccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtga 4189318  T
Q  153 gttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacga 252  Q
      |  |  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4189317 actgaacctaaactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttg-ctaggttaaatgcgatcgttgtcgcacga 4189219  T
Q  253 gttgatgtgagttgat 268  Q
    |||| |||||||||||    
T  4189218 gttgttgtgagttgat 4189203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060544
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  29060563 ctaagctgatgaagatgatg 29060544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22782410 - 22782228
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  22782410 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 22782312  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22782311 tgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22782228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496248
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  16496271 cggtctaagttgttgaagatgatg 16496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 18409826 - 18409944
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  18409826 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatg 18409944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303657
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtc 493  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19303638  T
Q  494 taagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  19303639 taagatgatgaagatgatg 19303657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 410 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20076805 - 20076704
Alignment:
Q  410 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20076805 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20076707  T
Q  510 atg 512  Q
    |||    
T  20076706 atg 20076704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Original strand, 19303173 - 19303273
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  19303173 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 19303272  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  19303273 g 19303273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 20360603 - 20360707
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  20360603 gatttcgtgtttttgacttttcagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 20360702  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  20360703 ggaat 20360707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 18409459 - 18409562
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  18409459 gatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 18409558  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  18409559 ggaa 18409562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Original strand, 18821463 - 18821566
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  18821463 atttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 18821562  T
Q  126 gaat 129  Q
    ||||    
T  18821563 gaat 18821566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 22779859 - 22779962
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  22779859 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22779958  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  22779959 ggaa 22779962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629472
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggt 25629452  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25629453 ctaagttgatgaagatgatg 25629472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18457202 - 18457030
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  18457202 atttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 18457103  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    || ||  ||||||| ||| | | ||| || |  |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18457102 gatta-attaagaatgaactttttggaagct-gacctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 18457030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21939872 - 21939631
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  21939872 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgagcct 21939773  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttg 222  Q
    |||| ||  | ||||  ||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||    
T  21939772 ggaa-agacttagaataaaactttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgtcttg 21939676  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  21939675 tttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgttatgagttga 21939631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Original strand, 30676695 - 30676861
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30676695 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcat 30676793  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30676794 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 2291165 - 2291341
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  2291165 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 2291263  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2291264 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 2291341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12742494 - 12742318
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  12742494 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 12742396  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12742395 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12742318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 17287791 - 17287913
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17287791 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatg 17287913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 18334577 - 18334753
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18334577 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18334675  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18334676 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18334753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19005223 - 19005047
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19005223 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 19005125  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19005124 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19005047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 19858904 - 19859080
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19858904 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 19859002  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19859003 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19859080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 504
Target Start/End: Original strand, 20360955 - 20361069
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20360955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20361053  T
Q  489 cggtctaagttgatga 504  Q
    || |||||||||||||    
T  20361054 cgatctaagttgatga 20361069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593777
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  20593796 ctaagttgatgaagatgatg 20593777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 24422724 - 24422548
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24422724 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24422626  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24422625 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24422548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 33861971 - 33861795
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33861971 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 33861873  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33861872 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33861795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 33864455 - 33864279
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33864455 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 33864357  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33864356 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 33864279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20109707 - 20109605
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  20109707 catgattttgtagttttgatccttaagttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaa 20109608  T
Q  122 cct 124  Q
    |||    
T  20109607 cct 20109605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 216 - 497
Target Start/End: Original strand, 18199237 - 18199519
Alignment:
Q  216 tgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccag 315  Q
    ||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  | ||||||||||| |||    
T  18199237 tgccttgtttagggtctatgcgat-tttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcag 18199335  T
Q  316 taagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgaga-tgttgatgacttgca 414  Q
    |||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||   ||||||| | |||| ||| ||| || || ||| |  ||    
T  18199336 taagtctgatataaatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatca 18199435  T
Q  415 ttcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||||||||||||||||  || |||   | || ||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||    
T  18199436 tttgatattgttatatcatgagttgttttatgtgcttcctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 18199519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 16920634 - 16920747
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaa 16920731  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  16920732 gatgttgaagatgatg 16920747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18204354 - 18204096
Alignment:
Q  241 tttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||    
T  18204354 tttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaaatgatttgatg 18204255  T
Q  341 ttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgaga-tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||   ||||||| | |||| ||| ||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  18204254 ttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttg 18204155  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||   | || ||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||    
T  18204154 ttttatgtgcttcctatgttgttgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 18204096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 20638285 - 20638400
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20638285 agatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtcta 20638383  T
Q  496 agttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20638384 agttgatgaagatgatg 20638400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 35245703 - 35245590
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35245703 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 35245606  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  35245605 gatgttgaagatgatg 35245590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1595726 - 1595550
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  1595726 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcat 1595628  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  1595627 gttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 1595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8055206 - 8055030
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  8055206 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 8055108  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | |||||   | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8055107 gctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 8055030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Original strand, 17287428 - 17287511
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgta 108  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17287428 gatttcgtgattttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgta 17287511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 25628987 - 25629090
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | || |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  25628987 gatttcatgattttgactttttagttgaaccttagatgttgttaagcgcctaaacatctctattaatgattaggaaatattgtagaatgagattgaacct 25629086  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  25629087 ggaa 25629090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 26924625 - 26924801
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26924625 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26924723  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | |||||   | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26924724 gctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26924801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 408 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25656733 - 25656630
Alignment:
Q  408 acttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatg 506  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  25656733 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 25656636  T
Q  507 atgatg 512  Q
    ||||||    
T  25656635 atgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25754992 - 25754810
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  25754992 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 25754894  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25754893 tgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25754810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 16920276 - 16920380
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||   | |||||| ||||    
T  16920276 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattagaaaagaatgtaggataagattgtacct 16920375  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  16920376 ggaat 16920380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 241 - 497
Target Start/End: Original strand, 18177517 - 18177775
Alignment:
Q  241 tttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatg 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||  ||||  |||||| ||||  | ||||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||    
T  18177517 tttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatg 18177616  T
Q  341 ttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgaga-tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    ||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||   ||||||| | |||| ||| ||| || || ||| |  |||| ||||||||||||||||||  ||    
T  18177617 ttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttg 18177716  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||   | || ||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||||||||||||||    
T  18177717 ttttatgtgcttcctatgttgttgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 18177775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 20556873 - 20557053
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  20556873 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaatt-gagacgttgttgacttgcatttgatattattat 20556970  T
Q  429 atcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
      |||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  20556971 gccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatg 20557053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 15894062 - 15894165
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||  || |||||  |||||||| ||||    
T  15894062 gatttcgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacct 15894161  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  15894162 ggaa 15894165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18706493 - 18706356
Alignment:
Q  328 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||  ||| |||| || ||||||||||    
T  18706493 atatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 18706395  T
Q  428 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgttt 464  Q
    ||||||||  || |||  ||| |||||||||||||||||    
T  18706394 tatcatgaactgttttatatattgcctatgttgctgttt 18706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 22334514 - 22334617
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||  || |||||  |||||||| ||||    
T  22334514 gatttcgtaaatttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagattggacct 22334613  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  22334614 ggaa 22334617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 448 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831524
Alignment:
Q  448 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22949484 - 22949375
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  22949484 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 22949385  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  22949384 t-atgatgatt 22949375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22953440 - 22953331
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  22953440 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 22953341  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  22953340 t-atgatgatt 22953331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23871928 - 23871819
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  23871928 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 23871829  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  23871828 t-atgatgatt 23871819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23875884 - 23875775
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  23875884 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 23875785  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  23875784 t-atgatgatt 23875775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 25611355 - 25611429
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattagga 99  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25611355 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagga 25611429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 27325370 - 27325479
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  27325370 atgatttgatgatatttataatgttatataattatatatatattgcattaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 27325469  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  27325470 t-atgatgatt 27325479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17106086 - 17105880
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||       ||| | ||||||||||||| |  ||  ||| |||||||||||||||| |||    
T  17106086 tgaactcgccatggcgagtagaggccctcgactcgcgagctagtgttagacagactgccttgtttagggttcatgtgat-tttgtcgcacgagttgttgt 17105988  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcat---atgaattgatgttgtttataatgttata 357  Q
    ||||||||| | | |||  | ||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||  |||   |||||||||||||||| |||| || |||    
T  17105987 gagttgatccttggggtagggaatgaagttgtttatattactgttgttgtt-cagtaaccctga--cataaaatgaattgatgttgttaataacgtgata 17105891  T
Q  358 tagttgtatat 368  Q
    |||||||||||    
T  17105890 tagttgtatat 17105880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18456901 - 18456735
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  18456901 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 18456803  T
Q  429 atcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     ||||| || ||| | |||||   | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18456802 gtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22439288 - 22439227
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtata 86  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22439288 gattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtata 22439227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 34963550 - 34963384
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34963550 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 34963452  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34963451 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 1540896 - 1541072
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  1540896 ttgatgttgtt-atattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 1540994  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
      || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  1540995 actgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 1541072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20594262 - 20594159
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || |||||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  20594262 gatttcgtgatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtctaaatatgattagggaagaatgtaggatgagattgaacct 20594163  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  20594162 ggaa 20594159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 22780222 - 22780344
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||| | || ||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22780222 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22780320  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  22780321 cagtctaagttgatgaagatgatg 22780344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 27325248 - 27325307
Alignment:
Q  208 ttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27325248 ttacagaatgccttgtttatgttaaatacaatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 27325307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29061025 - 29060926
Alignment:
Q  29 tcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||   |||||||||||||||||    
T  29061025 tcgtgatttcgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtccaataatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaa 29060926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 9098078 - 9098192
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||  ||||||||| |||||  ||| || || ||||| ||||||    
T  9098078 catgattttgtagttttgacccttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctgaacagatataataatgattagacaagtttctagattgatattgaa 9098177  T
Q  122 cctggaatagtttaa 136  Q
    ||||| | |||||||    
T  9098178 cctgggaaagtttaa 9098192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16760634 - 16760525
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  16760634 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 16760535  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  16760534 t-atgatgatt 16760525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19668918 - 19668836
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||| || || |||||||||||||||||    
T  19668918 ttaagtcgaaccttagatgtttctgagtgtctgaacatgtatcataatgattagacaagtttttatattgagattgaacctgg 19668836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714421
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25714421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35008684 - 35008618
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || || | |||||||||||    
T  35008684 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataagaatgattaggcaagtttttagactgagattgaac 35008618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185515
Alignment:
Q  453 atgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatg 506  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgatg 11185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19863466 - 19863413
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19863466 gatttcgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 19863413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688513
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  493 ctaagttgat 502  Q
    ||||||||||    
T  25688522 ctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 374
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103877
Alignment:
Q  293 ttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacatta 374  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 28103877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 502
Target Start/End: Original strand, 16448520 - 16448678
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt- 441  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||     
T  16448520 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 16448619  T
Q  442 gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16448620 gtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18696676 - 18696569
Alignment:
Q  327 catatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtt 426  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| || ||||||||  ||| |||| || |||||||||    
T  18696676 catatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgtt 18696578  T
Q  427 atatcatga 435  Q
    |||||||||    
T  18696577 atatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18697034 - 18696955
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatg-tttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||| ||||    
T  18697034 ttaagttgaactttagatgatttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagatggaac 18696955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852178
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 3852178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16624669 - 16624583
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 416  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  16624669 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatt 16624583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   | |||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttg 18461933  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18461932 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19023928 - 19023838
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  19023928 ttttgaaccttaagttgaattttagatgatttcgggtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 19023838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23539243 - 23539165
Alignment:
Q  241 tttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaag 319  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||  ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  23539243 tttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaataaagttgtttatattacagttgttgtttcagtaag 23539165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 31477577 - 31477686
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  31477577 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcataaattttgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 31477676  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  31477677 t-atgatgatt 31477686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 18180974 - 18180925
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18180974 atttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18180925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22432738 - 22432677
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtata 86  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  22432738 gattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcatgaagatgtata 22432677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 25641816 - 25641877
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtata 86  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25641816 gattttgtagtttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtata 25641877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Original strand, 31155040 - 31155133
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||  ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  31155040 ttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaataagtctaataacgattgggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 31155133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Original strand, 15041184 - 15041248
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataa 90  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  15041184 attttgtaattttgacttttgagttataccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttaataa 15041248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22831980 - 22831916
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataata 89  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||    
T  22831980 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtttgaacatgtctaata 22831916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 309
Target Start/End: Original strand, 23527948 - 23528020
Alignment:
Q  237 gatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttg 309  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  23527948 gatctttgtcgcacgagttgtggtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatgttactgttgttg 23528020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443068
Alignment:
Q  418 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12596308 - 12596269
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12596308 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 12596269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 200
Target Start/End: Original strand, 15894199 - 15894238
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15894199 tgaactcgccatggcgagcagagtctctcacctcgcgagc 15894238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16102694 - 16102655
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16102694 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16102655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16813127 - 16813088
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16813127 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16813088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16830147 - 16830108
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16830147 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 16830108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18706785 - 18706706
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatg-tttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||| ||||    
T  18706785 ttaagttgaactttagatgatttttgagtgtctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagatggaac 18706706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 200
Target Start/End: Original strand, 18821588 - 18821627
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18821588 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 18821627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 497
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821946
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29493104 - 29493065
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29493104 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 29493065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20224478 - 20224412
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  20224478 ttagatgattttgagtgcctgaacatgcataagaatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 20224412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22118462 - 22118396
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  22118462 ttagatgattttgagtgcctgaacatgcataagaatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 22118396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 464 - 513
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738675
Alignment:
Q  464 tgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatgatgacgatgt 4738675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16624436 - 16624371
Alignment:
Q  365 atatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 430  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  16624436 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 16624371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21939553 - 21939488
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 409  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  21939553 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgac 21939488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 22059376 - 22059429
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||| ||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22059376 gatttcgtgattttaagctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 22059429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 202
Target Start/End: Original strand, 25611492 - 25611533
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25611492 tgaactcgccatggagagcagaggctctcgcctcgcgagcta 25611533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 2287677 - 2287713
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2287677 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 2287713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8523282 - 8523246
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8523282 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 8523246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11185980 - 11185876
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||| | |||||  |||| ||||    ||||||||||||    
T  11185980 gatttcgtatatttgatttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtcgaatattgattagtgaagagtgtaggacgagattgaacct 11185881  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  11185880 ggaat 11185876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15539629 - 15539593
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15539629 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 15539593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 15685871 - 15685907
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15685871 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 15685907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20109494 - 20109454
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20109494 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagct 20109454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 21739665 - 21739705
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21739665 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 21739705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Original strand, 45421 - 45910
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  45421 gattttgtaatttttacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacct 45520  T
Q  125 gg-aatagtttaagaacgaatatgtgg-gagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttg 222  Q
    || || | |||| ||| |||| | | | || ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  45521 ggtaagacttta-gaatgaattttttgtgaattgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttg 45619  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  45620 tttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagact 45719  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45720 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatat 45819  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45820 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 45910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 161173 - 160685
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  161173 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctg 161074  T
Q  126 ga-atagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    || | | |||| ||| |||| | || ||  |  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |    
T  161073 gagagacttta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaagtcgccatggcgagtagaggctctcacctcacgaggtaactagttacagaatgtcttggt 160975  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  160974 taggataaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactga 160875  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  160874 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattg 160776  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtcc 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160775 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtcc 160685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 501261 - 501095
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  501261 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 501163  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || ||| | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  501162 gttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85741
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7116 - 6615
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |    
T  7116 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattataga 7017  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  7016 ttaagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagtta 6917  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6916 tagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgt 6817  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    |  ||||||  |||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||| |||| |||    
T  6816 tttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataact 6717  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatga 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6716 tgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 6617  T
Q  511 tg 512  Q
    ||    
T  6616 tg 6615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14496 - 13995
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |    
T  14496 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattataga 14397  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  14396 ttaagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagtta 14297  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
     | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14296 tagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgt 14197  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    |  ||||||  |||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||| |||| |||    
T  14196 tttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataact 14097  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatga 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  14096 tgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 13997  T
Q  511 tg 512  Q
    ||    
T  13996 tg 13995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 127)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 21 - 512
Target Start/End: Original strand, 38854879 - 38855368
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  38854879 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagattta 38854978  T
Q  121 acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |  | ||||||| |||||||    
T  38854979 acctggaatagtttaagaacgaat-tttgagagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgcccagttacagaatgcct 38855077  T
Q  221 tgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaaga 320  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  38855078 tgcttaggttaaacacgatctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagc 38855177  T
Q  321 ctgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgat 420  Q
    ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38855178 ctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgat 38855276  T
Q  421 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38855277 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38855368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Original strand, 26355330 - 26355816
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  26355330 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacct 26355429  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||    || |||| |||| | || || ||  |  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26355430 ggaaagactttagaatgaatttttgtgaattgtacctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcacgagctaactagttacagaatgccttgtt 26355529  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  26355530 tatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactga 26355629  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||| |||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26355630 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatggaatatg-ttgatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattg 26355727  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355728 ttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 26355816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 6520870 - 6520372
Alignment:
Q  12 agagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaat 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||    
T  6520870 agagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagat 6520771  T
Q  112 tgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttac 211  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||| | || | || |||||| |  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||  | | ||||    
T  6520770 taagactgaacctgaaatagtttaagaatggatttttgagagttagacctgaattcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaaactgcccaattac 6520671  T
Q  212 ataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgtt 311  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6520670 agaatgctttg-ttaggttaaatgcgatctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtt 6520572  T
Q  312 ccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgactt 411  Q
     ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  6520571 tcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatg-ttgatgtttatgatgttgatgactt 6520473  T
Q  412 gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6520472 gcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 6520373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 30 - 513
Target Start/End: Original strand, 23760477 - 23760962
Alignment:
Q  30 cgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || |  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  23760477 cgtaattttgacttttgagttgatccctgaatgtttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaatattggatattgagattgaacctggaat 23760576  T
Q  130 agtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggt 229  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||     
T  23760577 agtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaacttgccaaggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttg-ttagga 23760675  T
Q  230 taaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttta---tcttactgttgttgttccagtaagactg-at 325  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||  |||||||||| ||||||| ||| ||    
T  23760676 taaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaat 23760775  T
Q  326 gcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgt 425  Q
      ||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||    
T  23760776 aaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgt 23760874  T
Q  426 tatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23760875 tatatcatgatgatttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21674194 - 21673707
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  21674194 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttggacgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 21674095  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   ||| |||| |||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||    
T  21674094 ggaaagattttagaatgaatatttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgacttgttacagaatgccttgtt 21673995  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg- 323  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||  ||     
T  21673994 taggataaatgcgatctttgtcgcacaagttaatgtgagttgatattagaggttaaaaactaagttg-ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttga 21673896  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    ||  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21673895 attaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaattat-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatatt 21673797  T
Q  424 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21673796 gttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgatgatgatcatgt 21673707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Original strand, 5865909 - 5866391
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  5865909 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 5866008  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    | || ||  | |||| ||| || | |    |   |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| ||    
T  5866009 gaaa-agacttagaatgaaaatttagagaatctgaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tt 5866106  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  5866107 taggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 5866206  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||     
T  5866207 tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatatta 5866303  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  5866304 ttatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 5866391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21491481 - 21490999
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  21491481 gattttgtaattttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 21491382  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
     ||| ||  | |||| ||| || | |    |   |   |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||      |||||| |||||||| ||    
T  21491381 agaa-agacttagaatgaaaatttagagaatctgaccaaacttgccatggcgagtagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tt 21491284  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  21491283 taggttgaatgcgatctttgtagttcgagttaatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 21491184  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||| |||||     
T  21491183 tgcctatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcaatatta 21491087  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21491086 ttatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21490999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 17141402 - 17140920
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||| |||| || ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  17141402 gattttgtattttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 17141303  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaat-gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    | || ||  | |||| ||| || | | ||   || |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| || ||||| |    
T  17141302 gaaa-agacttagaatgaaaatttag-agaatcagaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctt-t 17141206  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  17141205 ttaggttgaatgcgatctttgtcattcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactg 17141106  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||   |||||||| || |||||||||||    
T  17141105 atgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatatt 17141009  T
Q  424 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17141008 attatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 17140920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 123 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21285989 - 21285611
Alignment:
Q  123 ctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttg 222  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |  | ||||||| ||||| |||    
T  21285989 ctggaatagtttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgctatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagttgcccagttacagaatgctttg 21285890  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  21285889 tt-aggttaaatgcgatctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcct 21285791  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    ||   |||| |  | || |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  21285790 gaattatataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 21285691  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285690 tgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 163 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20498915 - 20498581
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtga 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||  ||| ||  ||||||| ||||| | |  || ||||||| |||||||||||||||    
T  20498915 aactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgtt-aggtttattgtgacctttgtcacacgagttgatgtga 20498817  T
Q  263 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagtt 362  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20498816 gttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataatt 20498717  T
Q  363 gtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 461  Q
    |||||||||||||  ||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||    
T  20498716 gtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctg 20498617  T
Q  462 tttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20498616 tttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21255708 - 21255226
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  21255708 gatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 21255609  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc-taactagttacataatgccttgt 223  Q
    |||| ||  |  ||| ||| || |||    |   |  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |   || ||||| |||||||| |    
T  21255608 ggaa-agacttggaatgaaaatttggagaatctgaccgaactcgccatggcgagcagcggctctcgcctcgcgagcatttgta-ttacagaatgcctt-t 21255512  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||  |||  || ||||||||    
T  21255511 ttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactg 21255413  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||    
T  21255412 atgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatatt 21255316  T
Q  424 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21255315 attatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21255226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 21249870 - 21249388
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||| |||||||    
T  21249870 gatttcgcatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagactgaacct 21249771  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    |||| ||  |  ||| ||| || |||    |   |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| ||    
T  21249770 ggaa-agacttggaatgaaaatttggagaatctgaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctt-tt 21249673  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||  |||  || |||||||||    
T  21249672 taggttaaatgcgatctttgtcgttcaagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactga 21249574  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||     
T  21249573 tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatatta 21249477  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21249476 ttatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 21249388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39834325 - 39834095
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39834325 tcatgattttgtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacttgtatgataatgattaggaaagattgtagattgagattga 39834226  T
Q  121 acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcct 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||| |||    
T  39834225 acctggaatagtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatacct 39834126  T
Q  221 tgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacg 251  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  39834125 tgtttaagttaaatgcgatctttgtcccacg 39834095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 241 - 501
Target Start/End: Original strand, 983248 - 983512
Alignment:
Q  241 tttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatc---ttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattg 337  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||  |||||||||| ||||||| ||||   |||||| |      
T  983248 tttgtcgcacgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattga 983347  T
Q  338 atgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 435  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||      
T  983348 atgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaac 983446  T
Q  436 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  983447 ttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 37116625 - 37116366
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| |||||    
T  37116625 ctttgtcgtacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgat 37116526  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  37116525 gttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg 37116426  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37116425 ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 224 - 497
Target Start/End: Original strand, 17266821 - 17267096
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  17266821 ttaggttaaatgtgacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctg 17266920  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  17266921 aattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 17267020  T
Q  424 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||   | |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17267021 gttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24353300 - 24353039
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgt---tgttccagtaagactgatgcatatgaatt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||| ||||   |||||| ||    
T  24353300 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattt 24353201  T
Q  337 gatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 435  Q
    ||||||||| ||||| | |||||  ||||||| ||||||| ||||| | |  ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  24353200 gatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaa 24353102  T
Q  436 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24353101 ctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 13508019 - 13508188
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  13508019 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 13508118  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13508119 atcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 13597551 - 13597720
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  13597551 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattat 13597650  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13597651 atcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22364954 - 22364744
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||   | | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22364954 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcagggggataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 22364855  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |   |||||| ||||||||||| |||| || |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| || | || ||||||    
T  22364854 aattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatatt 22364756  T
Q  424 gttatatcatga 435  Q
    ||||||||||||    
T  22364755 gttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 19801059 - 19801233
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||  | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | | | |||||||||||    
T  19801059 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcatatgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagactagagaataagattgaacct 19801158  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  19801159 ggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgag 19801233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 342 - 498
Target Start/End: Original strand, 17612056 - 17612213
Alignment:
Q  342 tgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||| ||    
T  17612056 tgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt 17612155  T
Q  441 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17612156 tgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 328 - 497
Target Start/End: Original strand, 17439438 - 17439609
Alignment:
Q  328 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||||| || |||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  17439438 atatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 17439537  T
Q  428 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17439538 tatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092459
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16092436 cggtctaagttgatgaagatgatg 16092459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 28648983 - 28649161
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  |||| |||||||  ||||||||  || ||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  28648983 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 28649082  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28649083 gctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 28649161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22626861 - 22626740
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22626861 atatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 22626763  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  22626762 ggtctaagttgatgaagatgatg 22626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41598673 - 41598471
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  41598673 gattccgtgattttgacttttgagttgacccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagattgaacct 41598574  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   ||| |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||| ||||||    
T  41598573 ggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaatg-cttgtt 41598475  T
Q  225 tagg 228  Q
    ||||    
T  41598474 tagg 41598471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22875190 - 22875069
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  22875190 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctg-ctgctatttaactaagctgcatgagtc 22875092  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  22875091 ggtctaaattgatgaagatgatg 22875069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7372904 - 7372782
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7372904 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatg 7372782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20536334 - 20536212
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20536334 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatg 20536212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 31971375 - 31971261
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| ||| |||||||    
T  31971276 gttgttgaagatgatg 31971261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21286724 - 21286652
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgt 83  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21286724 cagagagtcaacatgatttcgtagttttgacccttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgt 21286652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 45130663 - 45130767
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  45130663 gatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 45130762  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  45130763 ggaat 45130767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 406 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 6759368 - 6759262
Alignment:
Q  406 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatga 504  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6759368 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 6759270  T
Q  505 tgatgatg 512  Q
     |||||||    
T  6759269 agatgatg 6759262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 14409429 - 14409605
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14409429 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 14409527  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14409528 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 14409605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 18818404 - 18818526
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||| || |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18818404 atatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatg 18818526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 18878869 - 18878972
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  18878869 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 18878968  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  18878969 ggaa 18878972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20499152 - 20499049
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  20499152 catgattttgtagttttgacccttgagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattgaa 20499053  T
Q  122 cctg 125  Q
    ||||    
T  20499052 cctg 20499049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 21918995 - 21919117
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21918995 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  21919094 cggtctaagttgttgaagatgatg 21919117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 21923923 - 21924045
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21923923 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatg 21924045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 406 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23406489 - 23406383
Alignment:
Q  406 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatga 504  Q
    ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23406489 tgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23406391  T
Q  505 tgatgatg 512  Q
     |||||||    
T  23406390 agatgatg 23406383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7373237 - 7373135
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||||||||    
T  7373237 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctg 7373138  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  7373137 gaa 7373135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219718
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatg 26219718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 439 - 512
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879348
Alignment:
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 18879348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396097
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21396081  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  21396082 gatgttgaagatgatg 21396097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790590
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21790574  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  21790575 gatgttgaagatgatg 21790590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1484579 - 1484403
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  1484579 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 1484481  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1484480 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 1484403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 5853277 - 5853453
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  5853277 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 5853375  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  5853376 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 5853453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6759746 - 6759643
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  6759746 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaactt 6759647  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  6759646 ggaa 6759643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 16199647 - 16199761
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||| ||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16199745  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  16199746 gatgttgaagatgatg 16199761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20403404 - 20403228
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20403404 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20403306  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20403305 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20403228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 21918642 - 21918745
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    ||||||||||||    
T  21918642 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaggaagagattgaacct 21918741  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  21918742 ggaa 21918745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22001930 - 22001754
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22001930 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22001832  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22001831 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22001754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22627224 - 22627125
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  22627224 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22627125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23406870 - 23406767
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  23406870 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacct 23406771  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  23406770 ggaa 23406767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21383996 - 21383887
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21383996 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21383897  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  21383896 t-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Original strand, 16413301 - 16413467
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16413301 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16413399  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16413400 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Original strand, 16091973 - 16092073
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  16091973 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaacct 16092072  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  16092073 g 16092073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389567
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21389551  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  21389552 gatgttgaagatgatg 21389567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778893
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21778877  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  21778878 gatgttgaagatgatg 21778893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31971733 - 31971629
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||   |||||||||||||    
T  31971733 gatttcgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtaggatgagattgaacct 31971634  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  31971633 ggaat 31971629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 330 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 41598370 - 41598189
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  41598370 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 41598272  T
Q  429 atcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||||| || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41598271 gtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 41598189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 13507653 - 13507752
Alignment:
Q  37 ttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||| || || ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13507653 ttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagacaagtttttagattgagactgaacctgggaaagtttaa 13507752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 13597185 - 13597284
Alignment:
Q  37 ttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||| || || ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13597185 ttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagacaagtttttagattgagactgaacctgggaaagtttaa 13597284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 18818042 - 18818145
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||   |||||||||||||    
T  18818042 gatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacct 18818141  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  18818142 ggaa 18818145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 20046180 - 20046356
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | | | || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20046180 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20046278  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20046279 gttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20046356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20536697 - 20536594
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  20536697 gattttgtgattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 20536598  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  20536597 ggaa 20536594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 28648676 - 28648779
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||   ||||||||||| |    
T  28648676 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaggatgagattgaacat 28648775  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  28648776 ggaa 28648779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22875554 - 22875380
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |||| || | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  22875554 gatttcgtgattttgacctttgagttaatccttagatgcttttgagcgtctaaacatgtttaataatgattaggaaagattgtagaacgaggttgaacct 22875455  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||   ||| |||| |||  | ||||| |   |  ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  22875454 ggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagaggctctcgcctcgcgag 22875380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Original strand, 21414859 - 21414956
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21414859 gatttcggaatttttactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 21414956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 16199290 - 16199394
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  16199290 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaacatgtcttataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 16199389  T
Q  125 ggaat 129  Q
     ||||    
T  16199390 agaat 16199394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Original strand, 17266567 - 17266647
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  17266567 ttaagtcgaactttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 17266647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 982956 - 983058
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||| || || ||||||||||||    
T  982956 catgattatgtagttttgacctt-aagttgaactttagatgattttgagtgtctgaacatgtatattagtgattaggaaagtttttagattgagattgaa 983054  T
Q  122 cctg 125  Q
    ||||    
T  983055 cctg 983058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4483457 - 4483282
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4483457 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4483359  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4483358 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4483282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 15203216 - 15203392
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  15203216 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcat 15203314  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  15203315 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 445 - 512
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131113
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 45131113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 18862412 - 18862521
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  18862412 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 18862511  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  18862512 t-atgatgatt 18862521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21387416 - 21387307
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21387416 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21387317  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  21387316 t-atgatgatt 21387307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21411289 - 21411180
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21411289 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21411190  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  21411189 t-atgatgatt 21411180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21805781 - 21805672
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21805781 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21805682  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  21805681 t-atgatgatt 21805672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 21827781 - 21827890
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  21827781 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 21827880  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  21827881 t-atgatgatt 21827890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 25362793 - 25362887
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  25362793 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgactgaacatgactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 25362887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225408
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||  || |||| ||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatg 26225408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Original strand, 21923560 - 21923660
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||   |||||||||||||    
T  21923560 gattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtaggatgagattgaacct 21923659  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  21923660 g 21923660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 4542358 - 4542534
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||| ||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4542358 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4542456  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||  ||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4542457 gctgtttttgtatcttgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4542534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24353570 - 24353479
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagttta 135  Q
    |||||| |||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  24353570 ttaagtcgaactttagataattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagttta 24353479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896266
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 19896266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23649032 - 23648942
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||    
T  23649032 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgactgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctg 23648942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154989
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 37116882 - 37116813
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  37116882 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctg 37116813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 19801362 - 19801527
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||  |||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||| || |||||| ||||    
T  19801362 atgacttgatgttgtt-atattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattat 19801460  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     ||||| || |||| ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19801461 gtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 5610267 - 5610330
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtat 85  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  5610267 catgattttgtagttatgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacttgtat 5610330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 502
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290846
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 16409889 - 16409938
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16409889 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16409938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 16860971 - 16861020
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16860971 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 16861020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937167
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatg 19937167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 21389085 - 21389138
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21389085 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa 21389138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 378 - 435
Target Start/End: Original strand, 40492834 - 40492891
Alignment:
Q  378 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 435  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492834 gaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Original strand, 17439092 - 17439172
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || || |||| |||||||||||| | |||||||    
T  17439092 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgggattgaacctgggaaagtttaa 17439172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 201
Target Start/End: Original strand, 22419183 - 22419223
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22419183 tgaactcgccatagcgagtagaggccctcacctcgcgagct 22419223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Original strand, 40492438 - 40492506
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  40492438 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 40492506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 126
Target Start/End: Original strand, 2418457 - 2418532
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || ||||| |||||||||||    
T  2418457 gaactttagatggttttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgaaattgaacctgg 2418532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 374
Target Start/End: Original strand, 2418719 - 2418852
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaact-aagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattga 338  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||   | |||| ||||    
T  2418719 ctttgtcgcacgagtcgctgtgagttgatccttg-ggttaggaaatgaagttgtttatattactgttgttgtt-cagtatgcctgactaagatgatttga 2418816  T
Q  339 tgttgtttataatgttatatagttgtatatacatta 374  Q
    ||||||| | ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  2418817 tgttgttaacaatgtgatatgattgtatatgcatta 2418852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17615268 - 17615229
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17615268 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 17615229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 22059159 - 22059198
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22059159 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22059198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 22145156 - 22145195
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22145156 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 22145195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 24707577 - 24707616
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24707577 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 24707616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37116702 - 37116663
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37116702 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 37116663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16800024 - 16799958
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| | | || || |||||||||||||    
T  16800024 ttagatgtttttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggcaggtttttagattgagattgaac 16799958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20536560 - 20536522
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20536560 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 20536522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Original strand, 21918769 - 21918807
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21918769 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 21918807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22996379 - 22996313
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  22996379 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 22996313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23406733 - 23406695
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23406733 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 23406695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 7465320 - 7465357
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaag 48  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7465320 cagagaggtatcatgatttcgtaattttaacctttaag 7465357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 16411903 - 16411952
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16411903 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgcct 16411952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19899571 - 19899510
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattatta 96  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| || |||| ||||    
T  19899571 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19899510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22365209 - 22365128
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| |||||||  | |||||||||||| |||||| ||| || || |||||| |||||||||    
T  22365209 ttaagtcgaactttagatgattttgagtgcctagatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagtttgaacctg 22365128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484429
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatg 25484429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 6608025 - 6608061
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6608025 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 6608061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 7300833 - 7300869
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7300833 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 7300869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 15602656 - 15602700
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15602656 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 15602700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 15611108 - 15611152
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15611108 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 15611152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 200
Target Start/End: Original strand, 16861100 - 16861136
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16861100 actcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 16861136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 21414997 - 21415033
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21414997 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 21415033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 30642934 - 30642974
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30642934 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 30642974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 45134676 - 45134712
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45134676 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 45134712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13433 - 12942
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||| |||||||    
T  13433 tcatgatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattga 13334  T
Q  121 acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcct 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13333 acctggaatagtttaagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgcct 13234  T
Q  221 tgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaaga 320  Q
    || |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||     
T  13233 tg-ttaggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagc 13135  T
Q  321 ctgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgat 420  Q
    ||||     || |  | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  13134 ctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgat 13035  T
Q  421 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13034 attgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 435
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18277
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta--cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgat 258  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||   ||||| |  || ||| ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  18004 tgaactcgccatagcgagtggaggctctcgcctcgcgagcc--ctagtgagacagaataccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgat 18100  T
Q  259 gtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatat 358  Q
    ||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||  |||||||||||  |||||| ||||    
T  18101 gtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgatat 18200  T
Q  359 agttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 435  Q
    |  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18201 aaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 22 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 11020 - 10542
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||    
T  11020 catgatttcgtagttttgatccttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaa 10921  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  10920 cctggaatagtttaagaatgaatttttgtgagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacctagttccaaaatgcctt 10821  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  10820 gtt-aggttaaatgcgatctctgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcc 10722  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 421  Q
    |||   |||| |  | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10721 tgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgata 10622  T
Q  422 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10621 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7025 - 6539
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7025 gatttcgtaattttgacttttgagttgatcctttgatgttttga-gtgcctggacatgtctaataataattaggaaagattggagattgagattgaacct 6927  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatat-gtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgt 223  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  6926 ggaatagtttaagaacgaaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtggaggccctcccctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgt 6827  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  6826 ttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 6728  T
Q  324 a-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    | |  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6727 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatat 6629  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 6539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 161 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 8823 - 8481
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||       |  ||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  8823 tgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 8725  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata- 359  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8724 gaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataa 8625  T
Q  360 -gttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 457  Q
      |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8624 tattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgtt 8525  T
Q  458 gctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8524 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 9037 - 8968
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataat 91  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9037 catgattttgtagttttgacccttaagttgatctttagaagattttgagtgcctgaacatgtataataat 8968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 132
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  619 gatttcgtaattttgacttttgaattgatccttagacttttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaactt 520  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   ||| |||| |||| | || ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||| |||| |||| |    
T  519 ggaaagattttagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatgtcttgct 420  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  419 tatgttaaatgcgatctttgtcgtacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttgtt-atcttgctgttgttgttctagtgagactga 321  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  320 tacatatgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattg 221  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  220 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 3)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 151 - 513
Target Start/End: Original strand, 10298 - 10659
Alignment:
Q  151 gagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcac 250  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |  |  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  10298 gagttacacctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtcctgttacatactgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgttgcac 10396  T
Q  251 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10397 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 10496  T
Q  351 tgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 450  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10497 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgc 10596  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10597 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 10186 - 10280
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagatt 105  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  10186 cagagagctatcatgatttcgtaattttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagtaaagatt 10280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1068 - 965
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||  || |||||  |||||| | ||||    
T  1068 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtgctagaacatgtctaatattgattaggagtgaatgtaagatgagataggacct 969  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  968 ggaa 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Original strand, 2277 - 2763
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2277 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttaaatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 2376  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgttt 225  Q
    || ||||| ||||||| |  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  2377 gattagtt-aagaacgtacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggccattgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgttt 2475  T
Q  226 aggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg-a 324  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |    
T  2476 aggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaa 2575  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    |  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  2576 ttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattg 2674  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2675 ttataacatgatgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33039 - 32538
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |    
T  33039 cagagagtcaacatgatttcgtagttttggtccttaagttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattctaga 32940  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| | || | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||    
T  32939 ttgagattgaacttggaatagtctaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagtta 32840  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  32839 cagaatgccttg-ttgggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgt 32741  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    | ||||||| ||||   |||| |  | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  32740 ttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttga-t 32642  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg-atgatgatg 509  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32641 tgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaagatgatg 32542  T
Q  510 atgt 513  Q
    ||||    
T  32541 atgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 51517 - 51619
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  51517 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctg 51616  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  51617 gaa 51619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51985
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 106)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 21 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 25176335 - 25175853
Alignment:
Q  21 tcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  25176335 tcatgatttcgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattga 25176236  T
Q  121 acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcct 220  Q
    ||||||||||||||||||||  || | || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    ||||||| |||||||    
T  25176235 acctggaatagtttaagaacagatttttgagagttagacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcgcagttacagaatgcct 25176136  T
Q  221 tgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaaga 320  Q
    |||||||          ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  25176135 tgtttag----------atctttgtcgcacgaattgatgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagc 25176046  T
Q  321 ctga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcga 419  Q
    |||| |  ||||||  | ||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25176045 ctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcga 25175947  T
Q  420 tattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25175946 tattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatgt 25175853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Original strand, 22133849 - 22134323
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  22133849 gatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 22133948  T
Q  125 -ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttg 222  Q
     |||| | |||| ||| |||| | || ||  |  || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||  |  |||||| | |||||||    
T  22133949 aggaagacttta-gaatgaattt-tgtgaactg-aactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaa-tacttgtgttacagactgccttg 22134044  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  22134045 tttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagact 22134144  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||| | | |||||| ||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22134145 gatgcatatgaattggtgttgtttataat--------gttgtatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatat 22134234  T
Q  423 tgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22134235 tgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg-ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatg 22134323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 57 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28406436 - 28405981
Alignment:
Q  57 tagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagtta 156  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||   ||| ||||  ||  | || ||  |     
T  28406436 tagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaataaaattttgtgaactg 28406337  T
Q  157 caaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagtt 255  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28406336 aacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaag-tacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagtt 28406238  T
Q  256 gatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgtt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || ||  | |||||  |  |||||||  ||||| |    
T  28406237 gatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggt 28406138  T
Q  355 atatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgccta 453  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28406137 atataattgtatatacattttatgaattaagtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgccta 28406039  T
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406038 tgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Original strand, 7499 - 7835
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |  ||  ||| ||| | ||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||||||    
T  7499 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagctcatgagagacagaatac-ttggttaggtttaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 7597  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  |||||| |||||     
T  7598 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataa 7697  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 459  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7698 ttgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgc 7797  T
Q  460 tgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  7798 tgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23207632 - 23207296
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |  | ||||||| ||  ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  23207632 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttgcccagttacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 23207534  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||     
T  23207533 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataa 23207434  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | | ||  ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  23207433 atgtatatgcattacatgaattatttataat-gttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttg 23207335  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23207334 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 512
Target Start/End: Original strand, 23071617 - 23072066
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatat 146  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||  | |||| ||| ||    
T  23071617 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-agacttagaatgaaaat 23071715  T
Q  147 gtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtc 246  Q
     | |    |   |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||| ||    
T  23071716 ttagagaatctgaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacaaaatgcctt-tttaggttgaatgagatctttttc 23071814  T
Q  247 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgttt 346  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||         ||| ||  ||| |||  || |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  23071815 gttcgagttgatgtgagttgatcttagag---------taattt--ttaccttgttgctaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 23071903  T
Q  347 ataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcata 446  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| || ||||   ||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23071904 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgat---ttatattcgatattattatatcatgatggtttgcata 23072000  T
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  23072001 ctgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatg 23072066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 241 - 501
Target Start/End: Original strand, 18786748 - 18787009
Alignment:
Q  241 tttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |   |||||| |  |||    
T  18786748 tttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatg 18786847  T
Q  341 ttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tga 438  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  ||     
T  18786848 ttattgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactgg 18786946  T
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23791629 - 23791292
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |  ||| ||  ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  23791629 tgaactcgccatcgcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgtgagacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 23791531  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||     
T  23791530 gagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataa 23791431  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | | || |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||   ||||||||||||||    
T  23791430 atgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttg 23791331  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791330 ttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 350 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679589
Alignment:
Q  350 atgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 449  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  450 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 161 - 431
Target Start/End: Original strand, 22459328 - 22459598
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||       |  ||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||  ||||||||||||    
T  22459328 tgaactcgccatagcgagtagaggctcttgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcctacgagttgatgt 22459426  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||     
T  22459427 gagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgtgatataa 22459526  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 431  Q
    |||||||||||||||  || |||| | || |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22459527 ttgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 330 - 513
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708738
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttat 23708652  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg-atgatgatgatgt 513  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23708653 atcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttgaaagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 224 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25109181 - 25108906
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||| | | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25109181 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 25109082  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||| ||| ||   || ||||||    
T  25109081 aattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatatt 25108982  T
Q  424 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||  |  |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108981 gttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 334 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19672011 - 19671848
Alignment:
Q  334 attgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||   ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||    
T  19672011 attgatgttgtt-ataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 19671913  T
Q  434 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19671912 gatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Original strand, 23708252 - 23708479
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||| |||| |||||||| | || |||| |||||||||| | ||| |||||||||||| | |    
T  23708252 atttcgtagttttgacccttgagttgatctttagatgtttttgagtgtctgaacatatgtattaatgattaggaaagttcgtagattgagattgaatc-g 23708350  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgttt 225  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||| |||| |||||||    
T  23708351 gaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatg-cttgttt 23708449  T
Q  226 aggttaaatacgatctttgtcgcacgagttg 256  Q
    ||| |   | |||||||||||||||||||||    
T  23708450 aggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttg 23708479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22105590 - 22105413
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22105590 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 22105492  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22105491 gctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 22105413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 20520127 - 20520295
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20520127 atgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttata 20520225  T
Q  430 tcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||  || |||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20520226 tcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 298809 - 298932
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  298809 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 298908  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  298909 cggtctaagttgattaagatgatg 298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23060639 - 23060517
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23060639 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatg 23060517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23660511 - 23660408
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  23660511 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 23660412  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  23660411 ggaa 23660408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 22413070 - 22413240
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat--tgtta 427  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||    
T  22413070 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgtta 22413168  T
Q  428 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||  || |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22413169 tatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23286339 - 23286235
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |    
T  23286339 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacat 23286240  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  23286239 ggaat 23286235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 23654042 - 23654146
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  23654042 gatttcataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 23654141  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  23654142 ggaat 23654146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 298447 - 298621
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||    
T  298447 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatataggatgagattgaacct 298546  T
Q  125 ggaatagtttaagaacg-aatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||| || || |||| | ||  ||||||| |   |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  298547 ggaa-agatttagaatgaaacttgtgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 22337241 - 22337119
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22337241 atatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22337143  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  22337142 cggtctaagttgatgaagatgatg 22337119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23076568 - 23076446
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23076568 atatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  23076469 cggtctaagtggatgaagatgatg 23076446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23285987 - 23285869
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| || || |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23285987 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 23285892  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23285891 ggtctaagttgatgaagatgatg 23285869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 23654381 - 23654503
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23654381 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatg 23654503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 418 - 512
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38231
Alignment:
Q  418 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 38231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23076929 - 23076756
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  23076929 gatttcgtgattttgactattaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattggacct 23076830  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||| || || |||| |||  | ||| | |   |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23076829 ggaa-agatttagaatgaaactttggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 23076756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23660148 - 23660027
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||    
T  23660148 atatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtc 23660050  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  23660049 ggtctaagttgatgaagatgatg 23660027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309112
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20309128  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  20309127 gatgttgaagatgatg 20309112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 18809120 - 18808944
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18809120 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 18809022  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18809021 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 18808944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 22731229 - 22731351
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22731229 atatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatg 22731351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23131039 - 23130863
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23131039 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23130941  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23130940 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23133506 - 23133330
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23133506 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23133408  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23133407 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23133330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 23709517 - 23709693
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23709517 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23709615  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23709616 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23709693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 23711998 - 23712174
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23711998 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23712096  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23712097 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23712174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26505556 - 26505380
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26505556 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26505458  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | |  ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26505457 gctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26505380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 26508034 - 26507858
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  26508034 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 26507936  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | |  ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26507935 gctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 26507858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27754064 - 27753961
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  27754064 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 27753965  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  27753964 ggaa 27753961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 34402507 - 34402683
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  34402507 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 34402605  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34402606 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 34402683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39682490 - 39682314
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  39682490 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 39682392  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  39682391 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39682314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 22730866 - 22730968
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  22730866 atttcgtgattttaacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 22730965  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  22730966 gaa 22730968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103512
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtc 493  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||  | || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T
Q  494 taagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| || ||| |||||||    
T  23103494 taagatgttgaagatgatg 23103512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 24367951 - 24367785
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24367951 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24367853  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24367852 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 28291934 - 28292027
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagatt 118  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||    
T  28291934 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaagaatgattaggaaagaatgtagaatgagatt 28292027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20309583 - 20309479
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  20309583 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgcctggatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 20309484  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  20309483 ggaat 20309479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 328 - 497
Target Start/End: Original strand, 24697538 - 24697709
Alignment:
Q  328 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||| | | |||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  24697538 atatgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtta 24697637  T
Q  428 tatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||  || ||    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  24697638 tatcatgaactgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Original strand, 37760 - 37863
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||   ||||||||||||||    
T  37760 atttcgtatttttgacttttgagtggaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaagatgtaggatgagattgaacctg 37859  T
Q  126 gaat 129  Q
    ||||    
T  37860 gaat 37863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 571574 - 571398
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  571574 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 571476  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  571475 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 571398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 6726172 - 6725996
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  6726172 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcat 6726074  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6726073 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 18786437 - 18786540
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| || | |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  18786437 catgattttgtagttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacacgtatattattgattaggcaagtttttagattgagattgaa 18786536  T
Q  122 cctg 125  Q
    ||||    
T  18786537 cctg 18786540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Original strand, 22737812 - 22737911
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  22737812 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22737911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23135767 - 23135591
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23135767 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23135669  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23135668 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23135591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28577276 - 28577100
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  28577276 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcat 28577178  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28577177 gctgtttttgtatactgt-tgcgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 28577100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 128
Target Start/End: Original strand, 32451562 - 32451664
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||   ||||||||||| ||    
T  32451562 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacatg 32451661  T
Q  126 gaa 128  Q
    |||    
T  32451662 gaa 32451664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 439 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946661
Alignment:
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 8946661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Original strand, 21155045 - 21155211
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  21155045 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcat 21155143  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21155144 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Original strand, 32039477 - 32039659
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  32039477 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 32039575  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  32039576 tgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatg 32039659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Original strand, 32214906 - 32215072
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32214906 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 32215004  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32215005 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 452 - 512
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040306
Alignment:
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 23040306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 24898180 - 24898357
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24898180 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24898278  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24898279 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24898357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 24900663 - 24900840
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24900663 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24900761  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24900762 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24900840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 24903140 - 24903317
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24903140 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24903238  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24903239 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24903317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 24905617 - 24905794
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24905617 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24905715  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24905716 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24905794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 24908092 - 24908269
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  24908092 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 24908190  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24908191 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24908269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22337604 - 22337501
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  22337604 gatttcgtgattctgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgtatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22337505  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  22337504 ggaa 22337501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1283766 - 1283657
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  1283766 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 1283667  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  1283666 t-atgatgatt 1283657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19672380 - 19672290
Alignment:
Q  36 tttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||| ||||||||||    
T  19672380 tttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtttgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagcttgaacctgg 19672290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 30344758 - 30344867
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  30344758 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 30344857  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  30344858 t-atgatgatt 30344867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 7679799 - 7679746
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7679799 cagagaggcatcatgatttcgtagatttgacttttaagttgaaccttagatgtt 7679746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 23100863 - 23100916
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23100863 gatttcgtaattttgacttttgagttgaacctcagatgtttttaagtgcctgaa 23100916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 22412710 - 22412802
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  22412710 ttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 22412802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23004926 - 23004767
Alignment:
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    |||||| || |||||| ||| |||||||| |||||   | ||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |     
T  23004926 gttgttaatgatgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaacta 23004827  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||   |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23004826 ttttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23207824 - 23207744
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  23207824 ttaagtcgaactttagatgattatgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacct 23207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 43137467 - 43137301
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 442  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  43137467 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 43137368  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 511  Q
     ||| | | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43137367 tatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 22738175 - 22738296
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22738175 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22738272  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  22738273 cggtctaagttgatcaagatgatg 22738296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Original strand, 7305 - 7407
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||| || ||| || || |||| |||||||    
T  7305 catgattttgtagttttgacccttaagttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgattcggcaagtttttagattgtgattgaa 7404  T
Q  122 cct 124  Q
    |||    
T  7405 cct 7407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967375
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 38967375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030015
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 45030015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23005263 - 23005183
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || |  ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  23005263 ttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataagaatgattaggcaagttttttgattgagattgaacttgggaaagtttaa 23005183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 502
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643101
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756229
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 31756229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Original strand, 20519767 - 20519845
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    |||||| |||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  20519767 ttaagtcgaactttagatgatcctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaac 20519845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452031
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 512
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529690
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 24529690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Original strand, 20519959 - 20520026
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttagg 228  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  20519959 tgaagtcgccatagcgtgtagaggctctcgcctcgcgagttgcctagttacagaataccttgtttagg 20520026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 86
Target Start/End: Original strand, 22740615 - 22740654
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtata 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22740615 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtata 22740654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 86
Target Start/End: Original strand, 22758370 - 22758409
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtata 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22758370 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtata 22758409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 41684531 - 41684570
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41684531 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 41684570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44621278 - 44621239
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44621278 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 44621239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23038518 - 23038468
Alignment:
Q  28 ttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23038518 ttcgtaattttgacttttgagatgaaccttagatgttgttgagtgcctgaa 23038468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25109436 - 25109354
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttt-taagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||| ||||||    
T  25109436 ttaagtcgaactttagatgatttctgagtgactgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattcaacctg 25109354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 102
Target Start/End: Original strand, 39827602 - 39827648
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaag 102  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39827602 ttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggaaag 39827648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 44369932 - 44369985
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||| ||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44369932 gatttcgtgattttaagctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 44369985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 201
Target Start/End: Original strand, 18786669 - 18786709
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 201  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18786669 tgaacttgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagct 18786709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 21238877 - 21238913
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21238877 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 21238913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Original strand, 21241427 - 21241463
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21241427 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 21241463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 22798769 - 22798809
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22798769 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 22798809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24505052 - 24505016
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24505052 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 24505016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 25963356 - 25963400
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25963356 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 25963400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31503949 - 31503913
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31503949 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 31503913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31506515 - 31506479
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31506515 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 31506479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 45677798 - 45677838
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45677798 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 45677838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Original strand, 5740 - 6240
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  5740 cagataggcatcatgatttcgtagatttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtacctgaacatgtataataatgattaggaaaaattgtaga 5839  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| | | || | || || || ||  |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||  || | |||||    
T  5840 ttgagattgaaccagtaatagtttaaggatggattt-tgtgatttgcacctgaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacccagtta 5938  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5939 cataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgt 6038  T
Q  311 tccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 410  Q
    | ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  6039 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgact 6138  T
Q  411 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatga 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6139 tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 6238  T
Q  511 tg 512  Q
    ||    
T  6239 tg 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 85 - 513
Target Start/End: Original strand, 39864 - 40292
Alignment:
Q  85 taataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagagg 184  Q
    |||||||  ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||    
T  39864 taataatggttaggaaagattggagattgacattcaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaacttgccatggcaagtagagg 39963  T
Q  185 ctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaac 284  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39964 ctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttatttaggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaac 40063  T
Q  285 taagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaatta 383  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| ||| ||  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  40064 taagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatta 40163  T
Q  384 tgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctcca 483  Q
    || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  40164 tg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgca 40262  T
Q  484 tgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40263 tgagtcagtctaagttgatgatgatgatgt 40292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 207 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 100683 - 100377
Alignment:
Q  207 gttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttg 306  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  100683 gttacaaaatgccttgtctaagttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttg 100584  T
Q  307 ttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga 405  Q
    ||||| ||||||| || | |  ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||     
T  100583 ttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtta-atatttgagatgttgt 100485  T
Q  406 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgat 505  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  100484 tgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgat 100385  T
Q  506 gatgatgt 513  Q
    ||||||||    
T  100384 gatgatgt 100377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 101883 - 101578
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  101883 gatttcgtaatttttacttttgagttgatccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 101784  T
Q  125 gga-atagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttg 222  Q
    ||| | | |||| ||| |||| | || ||  |  |  |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||  |  |||| | | || ||||    
T  101783 ggagagacttta-gaatgaattt-tgtgaacttgacctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggag-tacttgtgttatagactgtcttg 101687  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| | |||||||    
T  101686 tttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttg-ttctcttgttgttgttgttcaattaagact 101588  T
Q  323 gatgcatatg 332  Q
     |||| ||||    
T  101587 aatgcctatg 101578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 439 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101502
Alignment:
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatgt 101502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119879
Alignment:
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 119879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 94588 - 94412
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  94588 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 94490  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  94489 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 94412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 335 - 502
Target Start/End: Original strand, 17425 - 17591
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  17425 ttgatgttgtt-atactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 17523  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | || ||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17524 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 44573 - 44455
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||  | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44573 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 44476  T
Q  492 tctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  44475 tctaagttgattaagatgatg 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Original strand, 39641 - 39696
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaaca 80  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  39641 gatttcataattttgacttttgagttgatccttagatgttttcgagtgcctgaaca 39696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 512
Target Start/End: Original strand, 646 - 1151
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  646 cagagaggcatcatgatttcgtagatttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggaaagattgtaga 745  T
Q  111 ttgagattga------acctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaac 204  Q
    ||||||||||      ||||| ||||||||||| | | || | || ||||| ||  |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||  || |    
T  746 ttgagattgagattgaacctgtaatagtttaaggatggattt-tgtgagttgcacctgaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacc 844  T
Q  205 tagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgt 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  845 cagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgt 944  T
Q  305 tgttgttccagtaagactgatgcatatgaat-tgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgtt 403  Q
    ||||||| ||||||| ||||    ||  ||| | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||    
T  945 tgttgtttcagtaagcctgaattgta--aatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgtt 1042  T
Q  404 gatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatg 503  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  1043 gatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 1142  T
Q  504 atgatgatg 512  Q
    | |||||||    
T  1143 aagatgatg 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 133142 - 132661
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  133142 gatttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 133043  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttg 222  Q
    ||||    || |||| |||  | || ||  |  |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| ||  ||||||||||||||    
T  133042 ggaaagactttagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt--acttgtcttacataatgccttg 132945  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132944 tttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 132845  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| | | |||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  132844 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatggattatg-ttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatat 132753  T
Q  423 tgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  132752 tgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 132661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 214 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 62496 - 62202
Alignment:
Q  214 aatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttcc 313  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  62496 aatgccttgtttatgttaa-tgcgatccttgtcgcccgattcgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttc 62398  T
Q  314 agtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttg 412  Q
    |||||| |||| |   |||||| | ||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||   ||    
T  62397 agtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttg---tg 62302  T
Q  413 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  62301 cattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatg 62202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 136857 - 136681
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  136857 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 136759  T
Q  434 gatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  136758 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 136681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 139326 - 139150
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  139326 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 139228  T
Q  434 gatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  139227 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 139150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 141795 - 141619
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  141795 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 141697  T
Q  434 gatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  141696 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 141619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 144264 - 144088
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  144264 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 144166  T
Q  434 gatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  144165 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 144088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 134388 - 134212
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  134388 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 134290  T
Q  434 gatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  134289 gctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatg 134212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19755 - 19267
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | | |||||||||||||    
T  19755 gattttgtaattttgacttctgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacct 19656  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    ||||   ||| |||| |||| | |  | ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   | | ||||||| |||| |||| |    
T  19655 ggaaagattttagaatgaatttttatgtgttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccagttacagaatgtcttgct 19556  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||    
T  19555 tatgttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctga 19456  T
Q  325 tgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |  | |||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19455 tttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatatt 19357  T
Q  424 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19356 gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 19267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Original strand, 48093 - 48154
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtata 86  Q
    ||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  48093 gattttgtgattttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgtata 48154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Original strand, 7686 - 8161
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  || | ||||||||||    
T  7686 catgatttcgtagttttgatccttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaa 7785  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgcctt 221  Q
    ||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||| || ||||||||    
T  7786 cctagaatagtttaagaatgaatttttgggggttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccttgttccagaatgcctt 7885  T
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagac 321  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  7886 g-ctaggttaaatgcgatctttgtcgcaagaattgatgtgagttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagac 7984  T
Q  322 tgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgat 420  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||| | || || ||| |||||||| ||| || |||| |||    
T  7985 tgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgat 8084  T
Q  421 attgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  8085 attattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 230 - 513
Target Start/End: Original strand, 22509 - 22788
Alignment:
Q  230 taaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcat 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22509 taaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcat 22608  T
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22609 at----tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 22704  T
Q  430 tcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22705 tcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 79964 - 80205
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |||   || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  79964 gatttcgtgattttgacttttgagttgaacattaaatgccattgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 80063  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta-actagttacataatgccttgt 223  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |   | |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||||||    
T  80064 ggaa-agacttagaatgaaactttggagaatctgactgaactcgacatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcaatagta-ttacagaatgccttgt 80161  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  80162 ttaggttaaatgcgatcttcgtcgcacgagttgttatgagttga 80205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 82255 - 82073
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  82255 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 82157  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  82156 tgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 82073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 206 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1096
Alignment:
Q  206 agttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgtt 305  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||    
T  1391 agttacagaatgccttgtt-aggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgtt 1293  T
Q  306 gttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga 405  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1292 gttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttga 1193  T
Q  406 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1192 tgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32572 - 32101
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  32572 gattttgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 32473  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgt 223  Q
    ||||    || |||| |||  | || ||  |  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||    
T  32472 ggaaagactttagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgag-tacttgtgttacataatgccttgt 32374  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373 ttaggttaaatgcgatctttgtcgcactagttgat----------cttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 32284  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||| | | |||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  32283 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttgta------tatatacattaaatggattatg-ttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatatt 32192  T
Q  424 gttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32191 gttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 32101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 207 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13075 - 12770
Alignment:
Q  207 gttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttg 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13075 gttacaaaatgccttgtttaggttaaatgcaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttg 12976  T
Q  307 ttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgat 406  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||  | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  12975 ttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgat 12876  T
Q  407 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  12875 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatt 12776  T
Q  507 atgatg 512  Q
    ||||||    
T  12775 atgatg 12770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 8304 - 8191
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || || |    
T  8304 cagagaggcattgtgatttcgtaattttgacctt-aagttgaactttagttgtttctaagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttaga 8206  T
Q  111 ttgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||    
T  8205 ttgagattgaacctg 8191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13345 - 13233
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || || |    
T  13345 cagagaggcatcgtgattttgtaattttgacctt-aagttgaactttagttgtttatgagtgcctgaacatgtatgataatgattaggcaagtttttaga 13247  T
Q  111 ttgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||    
T  13246 ttgagattgaacct 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Original strand, 15448 - 15761
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |    
T  15448 cagagaggcatcatgatttcgtaattttaacttttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattataga 15547  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagtta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  15548 ttgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttcggaattacacatgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagtta 15647  T
Q  211 cataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgt 310  Q
    || ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15648 cagaatgccttgtttatgttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgt 15747  T
Q  311 tccagtaagactga 324  Q
    | ||||||| ||||    
T  15748 ttcagtaagcctga 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 378 - 512
Target Start/End: Original strand, 15760 - 15894
Alignment:
Q  378 gaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa 477  Q
    |||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15760 gaattatgtttgatgtatatgatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa 15859  T
Q  478 gctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15860 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 179139 - 179085
Alignment:
Q  24 tgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  179139 tgatttcataattttgacttttgagttggaccttagatgtttttcagtgcctgaa 179085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178897
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgt 178897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16147 - 15665
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  16147 gattttgtaattttgactttagagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 16048  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    | || ||  | | || ||| || | |    |   |  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     |||||| |||||||| ||    
T  16047 gaaa-agactcaaaatgaaaatttagagaatctgaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttttgtgttacagaatgcctt-tt 15950  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||||||||    
T  15949 taggtggaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactga 15850  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    | | |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||     
T  15849 ttcttatgaaataatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatatta 15753  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15752 ttatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1826 - 1768
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgt 83  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1826 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgt 1768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Original strand, 17917 - 17999
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||| ||||||    
T  17917 ttaagttgaaccttagataattttgagtgcatgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattggacctgg 17999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 267
Target Start/End: Original strand, 18163 - 18216
Alignment:
Q  214 aatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  18163 aatgccttgtttaggttaaatgcaatctttgtcgtgcgagttgttatgagttga 18216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 34609 - 34127
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  34609 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 34510  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    | || ||  | |||| ||| || |||    |   |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |     |||||||||| |||| ||    
T  34509 gaaa-agacttagaatgaaaatttggagaatctgaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgattttttgtgttacataattcctt-tt 34412  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||| ||| |||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||    
T  34411 taggttgaatgcgatctttgttgttctagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactga 34312  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||     
T  34311 tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatatta 34215  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  34214 ttatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 34127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 13581 - 13485
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  13581 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaa 13485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 285
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatga 504  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13218 - 13141
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgt 466  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13218 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 513
Target Start/End: Original strand, 2435 - 2924
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  2435 gatttcataattttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacct 2534  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgt 223  Q
    | ||   ||| |||| ||| || || ||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| ||||||||||    
T  2535 gtaaagattttagaatgaa-atttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttgt 2632  T
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  2633 ttaggaaaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 2732  T
Q  324 atgca-tatgaattgatgttgtttataatgttata-tagt-tgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgat 420  Q
    ||  | |||||  |  |||||||  ||||| |||| | || | ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  2733 atttaatatgatctattgttgttgttaatggtataattgtatatatatacattttatgaattaagct-gatatttgagatgttgttgatttgcatttgat 2831  T
Q  421 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2832 attgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatgt 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 206 - 513
Target Start/End: Original strand, 14508 - 14815
Alignment:
Q  206 agttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgtt 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14508 agttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatcttggtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctgtt 14607  T
Q  306 gttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||  | ||||| ||  ||||| |||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14608 gttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttg 14706  T
Q  405 atgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatga 504  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14707 ttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 14806  T
Q  505 tgatgatgt 513  Q
    |||||||||    
T  14807 tgatgatgt 14815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 30379 - 30428
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30379 atttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 30428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 207 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 11598 - 11296
Alignment:
Q  207 gttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttg 306  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||     
T  11598 gttacagaatgccctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgtta 11499  T
Q  307 ttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgat 406  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  11498 atgttcaagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 11399  T
Q  407 gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatg 506  Q
       || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  11398 ---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 11302  T
Q  507 atgatg 512  Q
    ||||||    
T  11301 atgatg 11296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 277 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2233 - 2001
Alignment:
Q  277 ttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattaca 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2233 ttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaca 2134  T
Q  377 cgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 476  Q
     || ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2133 tgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaacta 2037  T
Q  477 agctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2036 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28418
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  496 agttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| |||||||    
T  28434 agttgatgaagatgatg 28418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 460 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4556
Alignment:
Q  460 tgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 53393 - 53651
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  53393 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgat 53492  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga 438  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  53493 gttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgt 53592  T
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  53593 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 7926 - 8167
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  7926 gattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 8025  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttg 222  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |  ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||    
T  8026 ggaa-agacttagaatgaaactttggagaatctaacagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtgttacagaatgccttg 8122  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8123 tttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatatgggttga 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 136
Target Start/End: Original strand, 53100 - 53214
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  53100 catgattttgtatttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaa 53199  T
Q  122 cctggaatagtttaa 136  Q
    ||||| | |||||||    
T  53200 cctgggaaagtttaa 53214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 430
Target Start/End: Original strand, 8230 - 8330
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| |||  | |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  8230 atgatttgatgatatttataatgttatataattaaatatatattgtatgaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 8329  T
Q  430 t 430  Q
    |    
T  8330 t 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12922 - 12587
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |  ||  ||| ||  ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  12922 tgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagtggatgt 12824  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||  ||| | ||||||||||||||||||| |||||     
T  12823 gagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataa 12724  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 459  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12723 ttgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgc 12625  T
Q  460 tgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12624 tgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13136 - 13033
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| || || ||||||||||||    
T  13136 catgattttgtggttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaccatgtatattaatgattaggcaagtttttagattgagattgaa 13037  T
Q  122 cctg 125  Q
    ||||    
T  13036 cctg 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 199
Target Start/End: Original strand, 15251 - 15421
Alignment:
Q  29 tcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||| |    
T  15251 tcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaatctgg-a 15349  T
Q  129 tag-tttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||| ||| |||| |||  | ||||| |   |  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  15350 tagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgag 15421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 161 - 501
Target Start/End: Original strand, 7843 - 8180
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |  | ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7843 tgaactcgccatagcgagtaaaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacaaaatgccttgtt-agggtaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgt 7941  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| ||||   |||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  7942 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatct---tgctgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatag 8038  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  8039 ttgtatatacattacatgaattatatatgat-gttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttg 8137  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8138 ctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 469
Target Start/End: Original strand, 28912 - 29354
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  28912 gattttgtaattttgacttttgggttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 29011  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
     ||| ||  | |||| ||| || | |    |   |  ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||      |||||| |||||||| ||    
T  29012 agaa-agacttagaatgaaaatttagagaatctgaccgaactagccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagcgtttgtgttacagaatgcctt-tt 29109  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  29110 taggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga 29209  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttata---atgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 421  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||| ||||   |||| ||| || |||||||||    
T  29210 tgcttatgaattaatgttgcttataattatgttatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgata 29306  T
Q  422 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttat 469  Q
    || ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29307 ttattatatcatgatagtttgaatactacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 359
Target Start/End: Original strand, 28441 - 28775
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  28441 gatttcgtacttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 28540  T
Q  125 g-gaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttg 222  Q
      ||| | |||| ||| |||  | || ||  |  |  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| |||||||||    
T  28541 acgaagacttta-gaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttg 28638  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagact 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  28639 tttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagact 28738  T
Q  323 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28739 gatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 28775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 432 - 513
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28888
Alignment:
Q  432 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 28888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 206 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 5952 - 5654
Alignment:
Q  206 agttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgtt 305  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||    
T  5952 agttacagaatgccttatttaggctaaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgtt 5854  T
Q  306 gttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttg 404  Q
    |||||| ||||||| |||| |  ||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5853 gttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttg 5755  T
Q  405 atgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatga 504  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5754 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 6082 - 5968
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  6082 gatttcgtaattttgactttttagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacaggtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaactt 5983  T
Q  125 ggaatagtttaagaa 139  Q
    |||||||||||||||    
T  5982 ggaatagtttaagaa 5968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 207 - 458
Target Start/End: Original strand, 2030 - 2281
Alignment:
Q  207 gttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttg 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2030 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttg 2129  T
Q  307 ttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttga 405  Q
    ||||| ||||||| |||| |  ||||||    ||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||     
T  2130 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ctgatatttgagatgttgt 2228  T
Q  406 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2229 tgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3420 - 3195
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3420 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctg 3321  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgttt 225  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  3320 gaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaattgactagttacagaatgccttgttt 3221  T
Q  226 aggttaaatacgatctttgtcgcacg 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3220 aggttaaatgcgatctttgtcgcacg 3195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 447
Target Start/End: Original strand, 2077 - 2494
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  2077 gattttgtaattttgactgttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 2176  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    | || ||  | |||| ||| || | |    |   |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||| ||    
T  2177 gaaa-agacttagaatgaaaatttagagaatctgaccgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtgtgtgttacagaatgcctt-tt 2274  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  2275 taggttgaatgcgatctttgccgttcgagtttatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactga 2374  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattg 424  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||   |||| ||| || |||||||||||     
T  2375 tgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatatta 2471  T
Q  425 ttatatcatgatgatttgcatac 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  2472 ttatatcatgatggtttgcatac 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 1934 - 2267
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |     
T  1934 atttcgtatttttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtcactgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacata 2033  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaacta-gttacataatgccttgtt 224  Q
     ||    || |||| |||  | || ||  |  |  ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||  |  |||||| |||||||||||    
T  2034 aaaagactttagaatgaaattttgtgaactgaacctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgag-tacttgtgttacagaatgccttgtt 2132  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactga 324  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||    
T  2133 taggttaaatgcgatccttgtcgcacgagtggatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactga 2232  T
Q  325 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2233 tgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Original strand, 128737 - 129072
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||        ||| ||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||| || | |    
T  128737 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcctgtaagacagaataccttgtttaggttgt-tgcgatctttgtcgcacgagatgttat 128835  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| |||||     
T  128836 gagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatat 128934  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||||||||||||    
T  128935 ttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttg 129034  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  129035 ctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 224 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 78614 - 78345
Alignment:
Q  224 ttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg 323  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  78614 ttaggttaaatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctg 78515  T
Q  324 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 423  Q
    |   |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||    |||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  78514 aattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatatt 78417  T
Q  424 gttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtc 493  Q
    ||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  78416 gttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116431
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatg 116431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 80808 - 80716
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  80808 ttaagtcgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 80716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 135
Target Start/End: Original strand, 128557 - 128636
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagttta 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |   | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  128557 ttagatgattttaagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagttatgagattgagattgaacctggaaaagttta 128636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 166 - 497
Target Start/End: Original strand, 6054 - 6386
Alignment:
Q  166 tcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacata--atgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgag 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||  || ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  6054 tcgccaaggcgagtagaggctctcacctcgcgagcc--ctagtgagatagaataccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgag 6150  T
Q  264 ttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttg 363  Q
     ||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||| |||||||||||  |||||| |||||  ||    
T  6151 atgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatg 6250  T
Q  364 tatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctg 461  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||||||||||||||||    
T  6251 tatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctg 6350  T
Q  462 tttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6351 tttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 497
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  450 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 10)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Original strand, 136134 - 136471
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | | ||| | ||  ||||||| |||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  136134 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgt 136232  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatga-attgatgttgtttataatgttatata 359  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||  || ||||||||  ||||||||||||    
T  136233 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatata 136332  T
Q  360 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgtt 457  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||   || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||     
T  136333 gttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtc 136431  T
Q  458 gctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  136432 gctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Original strand, 144842 - 145179
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | | ||| | ||  ||||||| |||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  144842 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgt 144940  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatga-attgatgttgtttataatgttatata 359  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||  || ||||||||  ||||||||||||    
T  144941 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatata 145040  T
Q  360 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgtt 457  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||   || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||     
T  145041 gttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtc 145139  T
Q  458 gctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  145140 gctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 63050 - 62947
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  63050 gatttcgtaaatttgacttttgagttgatccttagatgtttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacct 62951  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  62950 ggaa 62947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 174838 - 174785
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  174838 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 446 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121770
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 121770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 125071 - 124988
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgta 108  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  125071 gatttggtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgta 124988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 175253 - 175202
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctg 76  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  175253 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 175202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 135942 - 136034
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||||||||| |  | | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  135942 ttaagtcgaaccttagaggactctgagtgcttgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 136034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 144650 - 144742
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||||||||| |  | | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  144650 ttaagtcgaaccttagaggactctgagtgcttgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 144742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 133740 - 133779
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  133740 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 133779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Original strand, 19651 - 19987
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||| ||  ||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||| |    
T  19651 tgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacagaacaccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacgggttgatat 19749  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||| |||||||| || ||||||| |||||     
T  19750 gagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatataa 19849  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
     ||||||| ||||||| || |||| | ||||   |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  19850 atgtatatgcattacatgagttatttatgat-gctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttg 19948  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19949 ctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 40038 - 39917
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||     
T  40038 atatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtt 39940  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39939 ggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 40400 - 40300
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  40400 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacct 40301  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  40300 g 40300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 48921 - 49030
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  48921 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 49020  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  49021 t-atgatgatt 49030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40265 - 40227
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40265 tgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 40227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 97282 - 97024
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| |||||    
T  97282 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgat 97184  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  97183 gttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg 97084  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  97083 ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 106560 - 106302
Alignment:
Q  240 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||| |||||    
T  106560 ctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgat 106462  T
Q  340 gttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tg 437  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  106461 gttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg 106362  T
Q  438 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  106361 ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 97359 - 97320
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  97359 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 97320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 106637 - 106598
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  106637 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagc 106598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 38673 - 38339
Alignment:
Q  160 atgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatg 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      |  ||| ||| |||||||  ||||||||  || |||| |||||||||||||||    
T  38673 atgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgtgagacagaataccttgttg-ggttaaatgagacctttatcgcacgagttgatg 38575  T
Q  260 tgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 359  Q
    ||||||||||   | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||| |||||||||    |||||| |||||    
T  38574 tgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatata 38475  T
Q  360 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgtt 457  Q
      ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||||||||||||    
T  38474 tatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgtt 38375  T
Q  458 gctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtc 493  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  38374 gctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38843 - 38751
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  38843 ttaagtcgaaccttagatgattctgagtgcgtgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 38751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 20469 - 20418
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctg 76  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20469 gattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctg 20418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 161 - 501
Target Start/End: Original strand, 103405 - 103737
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |  | | ||||| ||  ||||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  103405 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacagaacaccttg-ttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgt 103503  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   |||||| || ||||||||  ||||||||| |||    
T  103504 gagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgtag 103603  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |         ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||| |||||||||    
T  103604 ttgtatatacattacatgaattatgtat---------gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttg 103694  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  103695 ctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 103234 - 103326
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||| |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  103234 ttaagtcgaaccttagaggattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 103326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 900 - 569
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgag 263  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||| ||  ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  900 actcgccatggcgagtagaggccctcacctcgcgagctagtgttagacagaacaccttgtt-aggttaaatgagacctttgtcgcacgagttgatgtgag 802  T
Q  264 ttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagttg 363  Q
    |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||| || |  ||||| | ||||   ||    
T  801 ttgatcatat-ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatg 703  T
Q  364 tatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctg 461  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | |||| || | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||    
T  702 tatatgcattacatgaattatatatgatgttgg-gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctg 605  T
Q  462 tttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  604 tttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1095 - 1004
Alignment:
Q  45 taagttgaaccttagatg-tttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||  || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  1095 taagttgaactttagatgatttttgagtgcctgaatgtgtataataatgattaggcaa-tttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 497
Target Start/End: Original strand, 1564 - 1900
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |  | | ||||| ||  ||||||| |||||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  1564 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagatgcccaattacagaacaccttgtt-aggttacatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 1662  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||| ||||||| |||||     
T  1663 gagttgatcttgagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatataa 1762  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
     ||||||| |||||||  |||||| | ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  ||||| ||||||||     
T  1763 atgtatatgcattacataaattatatatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgtta 1861  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     |||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1862 atgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Original strand, 1372 - 1452
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| |||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || || || ||||||||||||    
T  1372 ttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgagtaggcaagtttttagatggagattgaacct 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 9555 - 9133
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat-agtt 133  Q
    ||||||| ||| || ||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||  ||||    
T  9555 ttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagtt 9456  T
Q  134 taagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaa 233  Q
    || ||| |||| | || ||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  9455 ta-gaatgaatttttgtgaactgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgct-aggttaaa 9358  T
Q  234 tacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcat--at 331  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || | | |||||| ||||||||| || || ||   |  ||    
T  9357 tgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtctaattgtttaat 9258  T
Q  332 gaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
      | ||||||||   || |||||| | |  |||||| ||||| || || |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9257 ccaatgatgttg---atgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgatattgttata 9165  T
Q  430 tcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 461  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9164 tcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 360 - 54
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||      |  ||| ||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  360 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagcccttgtgagacagaataccttgtt-aggttaaatgtgacctttgtcgcacaagttgatgt 262  T
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatag 360  Q
    ||||||||| | | ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |   | |||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  261 gagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataa 162  T
Q  361 ttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
     ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||  || |||   ||||||||||||||    
T  161 atgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttg 62  T
Q  459 ctgtttgt 466  Q
    ||||||||    
T  61 ctgtttgt 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 1013 - 1186
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||    
T  1013 ttgatgttgtt-ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatg 1108  T
Q  435 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  1109 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 410 - 513
Target Start/End: Original strand, 23898 - 24001
Alignment:
Q  410 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatg 23997  T
Q  510 atgt 513  Q
    ||||    
T  23998 atgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20601 - 20498
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| | | |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  20601 gatttcgtgattttgacttctgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaataagattgaacct 20502  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  20501 ggaa 20498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 43438 - 43592
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatat 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  43438 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 43537  T
Q  147 gtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 201  Q
     |||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43538 ttgggagttacacctgtactcgccatgacgagtagaggctctcgcctcgcgagct 43592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 201
Target Start/End: Original strand, 47358 - 47512
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatat 146  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  47358 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 47457  T
Q  147 gtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagct 201  Q
     |||||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  47458 ttgggagttacacctgtactagccatgacgagtagaggctctcgcctcgcgagct 47512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38819
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  || |||  ||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  434 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38741 gttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatg 38819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8460 - 8427
Alignment:
Q  236 cgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatc 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8460 cgatctttgtcgcacgagatgatgtgagttgatc 8427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 3090 - 3267
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  3090 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 3189  T
Q  434 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3190 gttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 645 - 741
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    ||||| || |||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  645 gattttgtgattttgaccttcgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaa 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11651 - 11482
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  11651 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 11552  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  11551 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 17961 - 18130
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  17961 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattat 18060  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18061 atcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Original strand, 6460 - 6557
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    |||||| | |||||||| ||| || ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  6460 gatttcatgattttgacttttgagatgatccttagatgccttttagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaac 6557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 502
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2280
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 498
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38359
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||    
T  38190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattat 38289  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  38290 atcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 24418 - 24524
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgt 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| | |    
T  24418 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgtcatgtttaggttaaatgcgatccttgtagtacgagttgttat 24517  T
Q  261 gagttga 267  Q
    |||||||    
T  24518 gagttga 24524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 21828 - 21937
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||    
T  21828 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgtagatgacgtgcatttgtaattgttata 21927  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  21928 t-atgatgatt 21937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 24587 - 24699
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttg--tatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtt 426  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| |||  |||||| ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  24587 atgatttgatgatatttataatgttatataattggatatatatattgcatgaaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgtt 24686  T
Q  427 atatcatgatgatt 440  Q
    |||| |||||||||    
T  24687 atat-atgatgatt 24699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Original strand, 24293 - 24382
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||   |||||||||||||    
T  24293 ttttgacttttgagtttaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatttaggatgagattgaacct 24382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 501
Target Start/End: Original strand, 27683 - 27855
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  27683 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttat 27782  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27783 atcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 139
Target Start/End: Original strand, 27271 - 27388
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||  |||||||||||    
T  27271 catgattttttagttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaa 27370  T
Q  122 cctggaatagtttaagaa 139  Q
    ||||| | | ||||||||    
T  27371 cctgggaaattttaagaa 27388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3949 - 3855
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  3949 ttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 3855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8013 - 7919
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  8013 ttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagtgcctgaacatgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 7919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 390 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  490 ggtctaag 497  Q
    ||||||||    
T  1058 ggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 347 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25276 - 25121
Alignment:
Q  347 ataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 444  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  |    
T  25276 ataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttata 25178  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25177 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 725 - 619
Alignment:
Q  328 atatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||    
T  725 atatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgtta 627  T
Q  428 tatcatga 435  Q
    ||||||||    
T  626 tatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25560
Alignment:
Q  56 ttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25640 ttagatgattttgagtgcctgaaaatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttggaaaagtttaa 25560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 6)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 330 - 501
Target Start/End: Original strand, 16034 - 16206
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |  || | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  16034 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttat 16133  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16134 atcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13316 - 13147
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgata--tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | |||    ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  13316 atgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgtta 13217  T
Q  428 tatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13216 tatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13677 - 13582
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaagaa 139  Q
    |||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13677 ttaagtcgaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaagaa 13582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3233 - 3148
Alignment:
Q  51 gaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  3233 gaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttgggaaagtttaa 3148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 15865 - 15971
Alignment:
Q  160 atgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatg 259  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| |  | ||||||| ||||||||||||||| |   | ||||||||||||||| ||||| |     
T  15865 atgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacaagttgtta 15963  T
Q  260 tgagttga 267  Q
    ||||||||    
T  15964 tgagttga 15971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 445 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 267916 - 267679
Alignment:
Q  261 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactg-atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 359  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||    
T  267916 gagttgatcataagggtaagaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatg-atatgatttgatggtgttaataatgtgatata 267818  T
Q  360 gttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgtt 457  Q
      ||||||| ||||||| ||||||| | |||| || ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||| ||||||    
T  267817 aatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgtt 267719  T
Q  458 gctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    | ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  267718 gatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 268196 - 268106
Alignment:
Q  46 aagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  268196 aagttgaactttagatgattctaagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaa 268106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 39602 - 39489
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39602 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 39504  T
Q  490 ggtctaagttgatga 504  Q
    |||||||||||||||    
T  39503 ggtctaagttgatga 39489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 13854 - 13963
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| |  |||||||||    
T  13854 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgaagtgcatttgtaattgttata 13953  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  13954 t-atgatgatt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33497 - 33458
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33497 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 33458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 504
Target Start/End: Original strand, 75210 - 75323
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  75210 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 75308  T
Q  490 ggtctaagttgatga 504  Q
    |||||||||||||||    
T  75309 ggtctaagttgatga 75323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 81315 - 81354
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  81315 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 81354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 227995 - 227849
Alignment:
Q  11 cagagaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaa 110  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||   ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  227995 cagagagtcaacatgatttcgtagttttgacccttaagctgatatttaaatgattttgagtgcctaaacatgtataataatgattaggaaagattctaga 227896  T
Q  111 ttgagattgaacctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttac 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  227895 ttgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttac 227849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 330 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 225593 - 225465
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  225593 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattat 225495  T
Q  429 atcatgatgatttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  225494 atcacgctgttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 189144 - 189253
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  189144 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 189243  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  189244 t-atgatgatt 189253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12487 - 12329
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||   ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12487 catgatttcgtagttttgatccttaagttgatatttagatgattttgagtgtctgaacatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaa 12388  T
Q  122 cctggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtag 181  Q
    |||||||||| ||||||| | || | | |||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  12387 cctggaatag-ttaagaatggattttttggagttacaactgaatttgccatagcgagtag 12329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 6)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 26021 - 25908
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26021 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtc 25923  T
Q  490 ggtctaagttgatga 504  Q
    |||||||||||||||    
T  25922 ggtctaagttgatga 25908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 39983 - 39862
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||     
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagcttcatgagtt 39885  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  39884 ggtctaagttgatgaagatgatg 39862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 39563 - 39666
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  39563 gatttcatgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 39662  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  39663 ggaa 39666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40345 - 40242
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |   |||||||||||||    
T  40345 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccgtagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatggaggatgagattgaacct 40246  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  40245 ggaa 40242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 125
Target Start/End: Original strand, 59179 - 59235
Alignment:
Q  69 agtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  59179 agtgcctgaacatgtctaataatgattaggacagaatgtagaatgagattgaacctg 59235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 200
Target Start/End: Original strand, 59271 - 59309
Alignment:
Q  162 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  59271 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc 59309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 267
Target Start/End: Original strand, 207161 - 207392
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagttt 134  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||| ||  |    
T  207161 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agact 207259  T
Q  135 aagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaa 232  Q
     |||| |||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  207260 tagaatgaaactttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacacaatgctttgtttaggttaa 207357  T
Q  233 atacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  207358 atgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttga 207392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1977 - 1855
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1977 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatg 1855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2340 - 2237
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  2340 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 2241  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  2240 ggaa 2237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Original strand, 119202 - 119280
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||| || || |||||||||||||    
T  119202 ttaagttgaacattagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattagacaagtttttagattgagattgaac 119280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 416
Target Start/End: Original strand, 207467 - 207541
Alignment:
Q  342 tgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 416  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  207467 tgtttataatgttatataattatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 207541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 165
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||  ||||| | ||||||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  374 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctactgagagacatactaccttgtttaggattcatatgat-tttgtcgcacgagttgttgtga 276  T
Q  263 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatatagtt 362  Q
    || |||| | | |||  ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  275 gtcgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatattactattgttgtt-cagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatataatt 177  T
Q  363 gtatatacatta 374  Q
    |||||| |||||    
T  176 gtatatgcatta 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3303
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  3284 ctaagttgatgaagatgatg 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39248 - 39145
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  39248 gatttcgtaattttgactttgaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 39149  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  39148 ggaa 39145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 33067 - 32946
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33067 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtc 32969  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  32968 ggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 38886 - 38765
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| | | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  38886 atatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactc 38788  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  38787 ggtctaagttgatgaagatgatg 38765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 9807 - 9750
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9807 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 9750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17334
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcg 490  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  491 gtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  17313 gtctaagttgatgaagatgatg 17334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Original strand, 78994 - 79096
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  78994 gattttgtaattctgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgattaggaaggaatgtagaatgagattgaacct 79093  T
Q  125 gga 127  Q
    |||    
T  79094 gga 79096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 16869 - 16950
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  16869 agttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 16950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 497
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79430
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 428  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||    
T  79264 atgatttgatgttgtt-atattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattat 79362  T
Q  429 atcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     ||||| || |||   |||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  79363 gtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 414 - 310
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||| ||    
T  414 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatct 315  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  314 ggaat 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 5190 - 5086
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||| ||    
T  5190 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatct 5091  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  5090 ggaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 439 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4716
Alignment:
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 4716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 2717 - 2820
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  2717 gatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 2816  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  2817 ggaa 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3474
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  3596 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatg 3474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 732
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  831 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacct 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3959 - 3855
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  3959 gatttcgtgattttgacttttgagttgatctttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 3860  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  3859 ggaat 3855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 347
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||  ||||| |  |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  468 atatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 370  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| ||| | |||||||    
T  369 ggtctaagtcgataaagatgatg 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13337 - 13215
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13337 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 13239  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  13238 cagtctaagttgatgaagatgatg 13215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 13689 - 13585
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||| |||||||    
T  13689 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgcttttgagtgcctgaaaatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagactgaacct 13590  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  13589 ggaat 13585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44824
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 44800  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | |||||||||||| | |||||||    
T  44801 cagtctaagttgattaagatgatg 44824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 394 - 509
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  493 ctaagttgatgatgatg 509  Q
    |||||||||||| ||||    
T  26163 ctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Original strand, 25707 - 25797
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  25707 ttttgacttttgagttgatccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctg 25797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 33126 - 33229
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  33126 gatttcgtgattttcacttttgagttgatccttagatgcttctgagtgcctggacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 33225  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  33226 ggaa 33229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 339889 - 340064
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  |||| |||||||  ||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  339889 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcat 339987  T
Q  434 gatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  339988 gttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatg 340064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Original strand, 158435 - 158611
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  158435 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 158533  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  158534 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 158611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 199
Target Start/End: Original strand, 339583 - 339757
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  339583 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttaaatgcttttgagtgcctgaatttgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatgagattgaacct 339682  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||   ||  |||| |||  | ||||| |   | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  339683 ggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctgacatgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 339757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 382 - 288
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagtt 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  382 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagtt 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 516 - 414
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  516 gatttcgtgattttgacttttgaattgaaccttagatgccttga-gtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 418  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  417 ggaa 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 92 - 6
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 430  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  92 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10399 - 10158
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| || || | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  10399 gattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaacatgtctattattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 10300  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtt 224  Q
    |||| ||  | |||| |||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      |||||| |||||||||||    
T  10299 ggaa-agacttagaaggaaactttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtt 10201  T
Q  225 taggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  10200 taggttaaatgcgatctttgtcgtacgagttgttatgagttga 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 7)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 32952 - 33073
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  32952 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtc 33050  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  33051 ggtctaagttgatgaagatgatg 33073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 46053 - 45932
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  46053 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtc 45955  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  45954 ggtctaagttgatgaagatgatg 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16117
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| || || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatgatg 16117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Original strand, 32591 - 32691
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || || | | |||||||||||||    
T  32591 gatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacct 32690  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  32691 g 32691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 46414 - 46314
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| || || | | |||||||||||||    
T  46414 gatttcgtgattttgacttttgagtcgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacct 46315  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  46314 g 46314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 454 - 512
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17446
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16566 - 16473
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  16566 attttgacttttgagttgatccttagg-gcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctggaa 16473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Original strand, 594 - 695
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  594 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtagaacgagattgaacct 693  T
Q  125 gg 126  Q
    ||    
T  694 gg 695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 512
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4950
Alignment:
Q  449 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 4950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 202
Target Start/End: Original strand, 8124 - 8301
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||  | | |||| |||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||| |||||| ||| || || | ||||||||||| |    
T  8124 gatttcgtgattttgagttgtgagtttaaccttggatgtttatgagggcctgaacatgtacaataatgattaggcaaggttttagaatgagattgaactt 8223  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| | |||| | ||   || | |||  |    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8224 ggaatagtgtcagaatggattcttgagtgttttaccctaaatcgccgtggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 8301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17268 - 17167
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  17268 atttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 17169  T
Q  126 ga 127  Q
    ||    
T  17168 ga 17167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16952 - 16785
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-g 442  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | | | || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |    
T  16952 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16853  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
     ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16852 tatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 16785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17133 - 17095
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17133 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 17095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 4774 - 4878
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  4774 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 4873  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  4874 ggaat 4878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5245
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 5229  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  5230 gatgttgaagatgatg 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 695 - 799
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  695 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 794  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  795 ggaat 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1166
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1053 agatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1150  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  1151 gatgttgaagatgatg 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Original strand, 10069 - 10173
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  10069 gatttcgtatttttgacttttgaattgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 10168  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  10169 ggaat 10173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 512
Target Start/End: Original strand, 10472 - 10540
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10472 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 10540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 13973 - 13869
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||   |||||||||||||    
T  13973 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagcatgagattgaacct 13874  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  13873 ggaat 13869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13513
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| | | | | |||||| | || ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T
Q  497 gttg 500  Q
    ||||    
T  13516 gttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4853
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  496 agttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  4869 agttgttgaagatgatg 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 5326 - 5222
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  5326 gattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 5227  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  5226 ggaat 5222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Original strand, 13240 - 13340
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||    
T  13240 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgagcct 13339  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  13340 g 13340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16757 - 16657
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    ||||||||||||    
T  16757 gatttcgtacttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacct 16658  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  16657 g 16657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16286
Alignment:
Q  399 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagt 498  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16300  T
Q  499 tgatgatgatgatg 512  Q
    || ||| |||||||    
T  16299 tgttgaagatgatg 16286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1293
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1309  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  1308 gatgttgaagatgatg 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7270
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7286  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| |||||||    
T  7285 gatgttgaagatgatg 7270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 447 - 512
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15355
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatg 15355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1764 - 1700
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataata 89  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  1764 gatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaata 1700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 7741 - 7677
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataata 89  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  7741 gatttcgtatttttgacttttaaattgaacgttagatgcttttgcgtgcctgaacatgtctaata 7677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21379 - 21275
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||   |||||||| ||||    
T  21379 gattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaggatgagattgtacct 21280  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  21279 ggaat 21275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20928
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  496 agt 498  Q
    |||    
T  20930 agt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Original strand, 692 - 791
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||    
T  692 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacct 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 1043 - 1165
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1043 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 1141  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  1142 cggtctaagttgttgaagatgatg 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 290
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  393 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttatatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 294  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  293 ggaa 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20892 - 20789
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  20892 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 20793  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  20792 ggaa 20789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 7)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4997 - 4894
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  4997 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacct 4898  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  4897 ggaa 4894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12579 - 12476
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  12579 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacct 12480  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  12479 ggaa 12476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22531 - 22428
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  22531 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacct 22432  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  22431 ggaa 22428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 4633 - 4520
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  4633 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagt 4536  T
Q  489 cggtctaagttgatga 504  Q
    ||||||||||||||||    
T  4535 cggtctaagttgatga 4520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 12215 - 12102
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  12215 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagt 12118  T
Q  489 cggtctaagttgatga 504  Q
    ||||||||||||||||    
T  12117 cggtctaagttgatga 12102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22167 - 22054
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  22167 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagt 22070  T
Q  489 cggtctaagttgatga 504  Q
    ||||||||||||||||    
T  22069 cggtctaagttgatga 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 18286 - 18326
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18286 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 16231 - 16334
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||    
T  16231 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattgaacct 16330  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  16331 ggaa 16334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 394 - 512
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16717
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  493 ctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  16698 ctaaattgatgaagatgatg 16717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Original strand, 16368 - 16406
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16368 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 16406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 52039 - 51917
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52039 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatg 51917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Original strand, 167622 - 167721
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||   |||||||||||||    
T  167622 gatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacct 167721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 167973 - 168095
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  167973 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 168071  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  168072 cggtctaagttgttgaagatgatg 168095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52392 - 52298
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaa 128  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  52392 attttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 52298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 9601 - 9707
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagt--tacataatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgat 258  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  9601 tgaactcgtcatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagc--actagtattacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgtt 9698  T
Q  259 gtgagttga 267  Q
     ||||||||    
T  9699 atgagttga 9707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 9466 - 9569
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||   |||||||||| ||    
T  9466 gatttcatgatttcgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattacgaaagaatgtaggatgagattgaatct 9565  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  9566 ggaa 9569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Original strand, 9784 - 9856
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 416  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  9784 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12416 - 12244
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  12416 atttcgtgattttgacttttgaattgatccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 12317  T
Q  126 gaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    || ||  ||||||| |||  | | |||     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12316 gatta-attaagaatgaactttttggaaactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 12244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8646
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtc 489  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||    
T  8528 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtc 8623  T
Q  490 ggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  8624 ggtctaagttgatgaagatgatg 8646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 8165 - 8267
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  8165 gatttcgtgattttgacttttgagttgatcctt-gatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 8263  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  8264 ggaa 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Original strand, 15108 - 15213
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  15108 gatttcgtatttttgacttttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaatatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 15207  T
Q  125 ggaata 130  Q
    ||||||    
T  15208 ggaata 15213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Original strand, 15466 - 15580
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15466 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| ||| |||||||    
T  15565 gttgttgaagatgatg 15580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 83
Target Start/End: Original strand, 32908 - 32966
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgt 83  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  32908 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatgcctgaacatgt 32966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 7766 - 7726
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7766 ttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 7726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 397 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51601
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 52057 - 51953
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||| |||||| ||||  ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||    ||||||||||||    
T  52057 gatttcgtattttttacttttgagttaaacctttgatgcctttgagtgcctgaacaagtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacct 51958  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  51957 ggaat 51953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Original strand, 1719 - 1936
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtt 133  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||    
T  1719 attttgacttttgagttgatccttagatgttttga-gtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatt 1817  T
Q  134 taagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactagttacataatgccttgtttaggttaaa 233  Q
    | |||| |||  | ||| | |   |  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||||||| |||| |||||||||| |       
T  1818 ttagaatgaaactttggaaatctgacctgaattcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatg-cttgtttaggat-tt 1915  T
Q  234 tacgatctttgtcgcacgagt 254  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  1916 tgcgatctttgtcgcacgagt 1936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 32542 - 32438
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||    |||||||||||||    
T  32542 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgactaggaaagaatgtgggatgagattgaacct 32443  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  32442 ggaat 32438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 32071
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaa 496  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T
Q  497 gttgatgatgatgatg 512  Q
    |||| ||| |||||||    
T  32086 gttgttgaagatgatg 32071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 136
Target Start/End: Original strand, 24171 - 24263
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagtttaa 136  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24171 ttaagttgaagcttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagcttttagattgagattgaacctggaatagtttaa 24263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4871 - 4695
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  4871 ttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 4773  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4772 gttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatg 4695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20924 - 20748
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20924 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 20826  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20825 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 20748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 37998 - 37822
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  37998 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 37900  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  37899 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 37822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 498
Target Start/End: Original strand, 24297 - 24406
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgag 487  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24297 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 24395  T
Q  488 tcggtctaagt 498  Q
    |||||||||||    
T  24396 tcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 23934 - 24037
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||   |||||||||||||    
T  23934 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacct 24033  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  24034 ggaa 24037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6241
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctccatga 486  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  6116 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 6215  T
Q  487 gtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  6216 gtcggtctaagttgatgaagatgatg 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Original strand, 5753 - 5854
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||  |||| || ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  5753 gatttcgtgttttttacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtaggatgagattgaacct 5852  T
Q  125 gg 126  Q
    ||    
T  5853 gg 5854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 127
Target Start/End: Original strand, 17640 - 17742
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  17640 gatttcatgattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 17739  T
Q  125 gga 127  Q
    |||    
T  17740 gga 17742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 9060 - 9122
Alignment:
Q  15 gaggcatcatgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctga 77  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9060 gaggcatcatgatttcgtagatttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctga 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 12441 - 12681
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  12441 gatttcgtgattttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 12540  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaatatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagctaactag--ttacataatgccttg 222  Q
    |||| ||    |||| |||  | |||    |   | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||  ||||| |||| ||||    
T  12541 ggaa-agacatagaatgaaactttggagaatctgactgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagc--actagtattacagaatg-cttg 12636  T
Q  223 tttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  12637 tttaggttaaatgcgattcttgtcgcacgagttgttatgagttga 12681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Original strand, 12758 - 12830
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 416  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  12758 tttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 12830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 497
Target Start/End: Original strand, 20372 - 20524
Alignment:
Q  344 tttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttg 442  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||    
T  20372 tttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttg 20471  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20472 tatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 196
Target Start/End: Original strand, 20058 - 20228
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  20058 gatttcgtgaatttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtttaataatgagtaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 20157  T
Q  125 ggaatagtttaagaacgaa-tatgtgggagttacaaatgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgc 196  Q
    ||| ||  ||||||| ||| | | ||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20158 ggatta-attaagaatgaactttttggaagct-gacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 20228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 35853 - 35962
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  35853 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 35952  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  35953 t-atgatgatt 35962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Original strand, 65426 - 65479
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  65426 gattttgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 65479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10784
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  493 ctaagttgat 502  Q
    ||||||||||    
T  10793 ctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29025 - 28924
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| || ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  29025 gatttcgtgattttgacttttgagtagatccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 28926  T
Q  125 gg 126  Q
    ||    
T  28925 gg 28924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1435
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||  |||||||| | ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| || || ||||||||||||    
T  1332 catgattttgtggttttgaccctaaagttgaacttcagatgattttgagtgcctgaacatgtatattaatgattagacaagtttttagattgagattgaa 1431  T
Q  122 cctg 125  Q
    ||||    
T  1432 cctg 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28012 - 27912
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  28012 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 27913  T
Q  434 g 434  Q
    |    
T  27912 g 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2430 - 2326
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  2430 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataataattaggaaggaatgtaggatgagattgaacct 2331  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  2330 ggaat 2326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 378 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 2091 - 1956
Alignment:
Q  378 gaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact 475  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  2091 gaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaact 1993  T
Q  476 aagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  1992 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 1956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7088 - 6984
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  7088 gatttcatatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacgtgtctaataattattaggaaggaatgtaggatgagattgaacct 6989  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  6988 ggaat 6984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13569 - 13393
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  13569 ttgatgttgtt-atactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 13471  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13470 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 128
Target Start/End: Original strand, 18590 - 18693
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| ||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  18590 gattttgtgattttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 18689  T
Q  125 ggaa 128  Q
    ||||    
T  18690 ggaa 18693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 6)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14118 - 14027
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||| ||||||    
T  14118 ttttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattggacctgg 14027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Original strand, 11178 - 11260
Alignment:
Q  47 agttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat 129  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  11178 agttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 11260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 510
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11558
Alignment:
Q  399 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  498 ttgatgatgatga 510  Q
    ||| ||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13733 - 13638
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 440  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || || ||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13733 ttataatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 199
Target Start/End: Original strand, 11282 - 11320
Alignment:
Q  161 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11282 tgaactcgccaaggcgagaagaggctctcacctcgcgag 11320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13856 - 13811
Alignment:
Q  222 gtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttga 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  13856 gtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcgagttgttatgagttga 13811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 23008 - 22887
Alignment:
Q  390 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagt 488  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23008 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  489 cggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatg 22887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23370 - 23288
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgta 108  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  23370 atttcgtaattttgacttttgagttgatccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgta 23288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 14124 - 13948
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14124 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 14026  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14025 gctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10633 - 10550
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgta 108  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  10633 gatttcgtgattttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgta 10550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 446 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46999
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 46999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 47464 - 47360
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||   |||||||||||||    
T  47464 gatttcgtattgttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaatatgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatgagattgaacct 47365  T
Q  125 ggaat 129  Q
    |||||    
T  47364 ggaat 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 397 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8483
Alignment:
Q  397 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 8500  T
Q  496 agttgatgatgatgatg 512  Q
    ||||||||| |||||||    
T  8499 agttgatgaagatgatg 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8964 - 8865
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||    
T  8964 gattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaatatgtctaatagtgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 8865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 93
Target Start/End: Original strand, 10904 - 10972
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataatta 93  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10904 gatttcgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatta 10972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1382 - 1288
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaat 129  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  1382 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacattactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26888 - 26834
Alignment:
Q  24 tgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26888 tgatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23842
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 23842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Original strand, 36023 - 36077
Alignment:
Q  24 tgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36023 tgatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 36945 - 36891
Alignment:
Q  24 tgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36945 tgatttcgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 36891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 463 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36453
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgt 513  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgt 36453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29231 - 29149
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctgg 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||| |||||| ||| || || |||||||||| ||||||    
T  29231 ttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagtttttagattgagattggacctgg 29149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26889 - 26847
Alignment:
Q  214 aatgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  26889 aatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcgcgagttg 26847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2694
Alignment:
Q  410 ttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||    
T  2783 ttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7209 - 7108
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctggaatagttt 134  Q
    |||||| | ||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| | |||||    
T  7209 ttttgaaccttaagttgaattttagatgattttgagtgactgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagttt 7110  T
Q  135 aa 136  Q
    ||    
T  7109 aa 7108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2342 - 2245
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||| |||| | || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2342 gatttcggaattataactttttagtggaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaac 2245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9253
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9263  T
Q  493 ctaagttgat 502  Q
    ||||||||||    
T  9262 ctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5012 - 4912
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacct 124  Q
    |||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| || |||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  5012 gatttcgtgactttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctattaatgactagggaagattgtagaatgagattgaacct 4913  T
Q  125 g 125  Q
    |    
T  4912 g 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 440 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4599 - 4545
Alignment:
Q  440 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4599 ttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 12241 - 12065
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  12241 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 12143  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12142 tgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgttt-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 40577 - 40401
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 433  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||||  ||||| | | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  40577 ttgatgttgtt-atactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 40479  T
Q  434 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
      || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  40478 cctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatg 40401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 736 - 627
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  736 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 637  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  636 t-atgatgatt 627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Original strand, 11268 - 11377
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata 429  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  11268 atgatttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttata 11367  T
Q  430 tcatgatgatt 440  Q
    | |||||||||    
T  11368 t-atgatgatt 11377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 117
Target Start/End: Original strand, 35512 - 35594
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagat 117  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||    
T  35512 ttttgtcccttaagttgaaccttaaatgattttgagtgcctgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagat 35594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 500
Target Start/End: Original strand, 161083 - 161239
Alignment:
Q  345 ttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt- 441  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||| |||     
T  161083 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgttttt 161182  T
Q  442 gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttg 500  Q
    | ||||||| | ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  161183 gtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 332862 - 332784
Alignment:
Q  44 ttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaac 122  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  332862 ttaagttgagctttagatgattttgagtgcctgaatatgtataagaatgattaggaaagtttttagattgagattgaac 332784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 70272 - 70221
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtata 86  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  70272 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtata 70221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 289 - 107
Alignment:
Q  329 tatgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 427  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  289 tatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattatta 191  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | |||||   | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  190 tgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 440
Target Start/End: Original strand, 32432 - 32536
Alignment:
Q  335 ttgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 434  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||    
T  32432 ttgatgatatttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atg 32530  T
Q  435 atgatt 440  Q
    ||||||    
T  32531 atgatt 32536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 11406 - 11299
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  11406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 11309  T
Q  493 ctaagttgat 502  Q
    |||| |||||    
T  11308 ctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 454 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4355 - 4308
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4355 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 78
Target Start/End: Original strand, 5951 - 5995
Alignment:
Q  34 attttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5951 attttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4396 - 4215
Alignment:
Q  330 atgaattgatgttgtttataatgttatatagttgtatatacattacacgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 427  Q
    |||| |||||||||| |||  ||| ||||| |||||||| |||||   ||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  4396 atgatttgatgttgtatat--tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 4299  T
Q  428 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 512  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4298 tgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Original strand, 1718 - 1767
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1718 attttgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 1767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 502
Target Start/End: Original strand, 12293 - 12400
Alignment:
Q  394 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| || | ||||| || ||| | || |||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12293 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 12390  T
Q  493 ctaagttgat 502  Q
    ||||||||||    
T  12391 ctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 29990 - 29946
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagtt 499  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29990 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 891 - 934
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  891 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 202
Target Start/End: Original strand, 10643 - 10682
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagcta 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10643 aactcgccgtggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcta 10682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9521 - 9485
Alignment:
Q  163 aactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgag 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9521 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgag 9485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 21449 - 21492
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21449 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 21492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 29341 - 29384
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29341 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 29384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 502
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1432
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctccatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 8600 - 8643
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8600 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaa 8643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Original strand, 577 - 667
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaacctg 125  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| || || || ||||||| |||||    
T  577 ttttgtcccttaagttgatccttaaatgattttgagtgcatgaatatgtataataatgattaggcaagtttttagatggagattggacctg 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10569
Alignment:
Q  25 gatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaaga 103  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||  || || | |||||||||||    
T  10647 gatttcgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgcctagtagtgattaggaaaga 10569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 2300 - 2247
Alignment:
Q  37 ttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataa 90  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||    
T  2300 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataa 2247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 9982 - 9929
Alignment:
Q  37 ttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataa 90  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||    
T  9982 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataa 9929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2172 - 2136
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2172 actcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 2136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9854 - 9818
Alignment:
Q  164 actcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagc 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9854 actcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagc 9818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 44535 - 44486
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44535 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 44486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 18721 - 18676
Alignment:
Q  30 cgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18721 cgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 18676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 2352 - 2312
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2352 ttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 2312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 1970 - 1926
Alignment:
Q  31 gtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1970 gtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcct 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15877 - 15837
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15877 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 15837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 6721 - 6761
Alignment:
Q  35 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcct 75  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6721 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcct 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Original strand, 35155 - 35219
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataa 90  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||  | |||||||||||    
T  35155 attttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtataataa 35219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 32919 - 32867
Alignment:
Q  26 atttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaa 78  Q
    |||| ||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32919 attttgtacttttgatcgttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaa 32867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 86113 - 86013
Alignment:
Q  22 catgatttcgtaattttgacctttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaacatgtataataattattaggaaagattgtaaattgagattgaa 121  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||  |||||| |||| |||||||| | ||||||| |||| |||||| ||  || || ||||||||||||    
T  86113 catgattttgtagtttcgacccttaagtcgaactctagatgattttgagtgcctggatatgtatattaatgattaggcaaatttttagattgagattgaa 86014  T
Q  122 c 122  Q
    |    
T  86013 c 86013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University