View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0328_low_7 (Length: 385)

Name: NF0328_low_7
Description: NF0328
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0328_low_7
NF0328_low_7
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (27-365)||(9077952-9078290)
chr5 (27-362)||(24529223-24529558)
chr5 (31-365)||(1096467-1096801)
chr5 (31-365)||(25421532-25421866)
chr5 (27-365)||(24493569-24493906)
chr5 (31-365)||(25431395-25431728)
chr5 (22-365)||(8286621-8286964)
chr5 (22-365)||(23390275-23390617)
chr5 (27-365)||(13095495-13095832)
chr5 (27-365)||(13025311-13025648)
chr5 (27-365)||(22075018-22075356)
chr5 (28-261)||(21985931-21986164)
chr5 (22-362)||(11581023-11581361)
chr5 (27-365)||(21292754-21293090)
chr5 (150-362)||(22412187-22412388)
chr5 (199-362)||(264768-264930)
chr5 (199-362)||(29329934-29330096)
chr5 (22-362)||(36154606-36154942)
chr5 (199-362)||(39363384-39363546)
chr5 (200-362)||(10732941-10733102)
chr5 (199-362)||(20909012-20909174)
chr5 (199-362)||(42245365-42245527)
chr5 (22-229)||(22107152-22107358)
chr5 (199-362)||(29345980-29346142)
chr5 (199-362)||(32027393-32027555)
chr5 (199-362)||(29348453-29348615)
chr5 (199-362)||(29350926-29351088)
chr5 (199-362)||(39245136-39245298)
chr5 (31-346)||(22144068-22144384)
chr5 (199-362)||(2154613-2154776)
chr5 (257-365)||(21997547-21997655)
chr5 (198-365)||(21808343-21808510)
chr5 (199-362)||(20902008-20902172)
chr5 (199-359)||(18319033-18319193)
chr5 (239-362)||(38619434-38619557)
chr5 (246-365)||(21729066-21729185)
chr5 (199-362)||(10775675-10775838)
chr5 (199-362)||(31061068-31061231)
chr5 (239-361)||(23064512-23064634)
chr5 (199-362)||(20917952-20918110)
chr5 (199-359)||(24067110-24067270)
chr5 (181-358)||(37723910-37724086)
chr5 (219-300)||(20766095-20766175)
chr5 (187-361)||(21565546-21565719)
chr5 (150-351)||(18418594-18418793)
chr5 (250-365)||(19668898-19669013)
chr5 (247-365)||(21329500-21329618)
chr5 (250-361)||(22959538-22959649)
chr5 (247-346)||(20026942-20027043)
chr5 (312-365)||(19660903-19660956)
chr5 (267-365)||(36314577-36314675)
chr5 (246-365)||(21502158-21502277)
chr5 (243-365)||(26012034-26012154)
chr5 (150-365)||(40725853-40726069)
chr5 (310-362)||(20806852-20806904)
chr5 (198-346)||(22178174-22178323)
chr5 (312-361)||(26704075-26704124)
chr5 (312-361)||(26973808-26973857)
chr5 (217-363)||(17517174-17517320)
chr5 (296-346)||(26740697-26740747)
chr5 (190-316)||(20910745-20910869)
chr5 (304-349)||(26732892-26732937)
chr5 (243-284)||(29448085-29448126)
chr5 (83-135)||(22120033-22120085)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (27-365)||(14972854-14973192)
chr3 (27-362)||(40213504-40213838)
chr3 (31-365)||(25476172-25476506)
chr3 (27-365)||(18438534-18438872)
chr3 (31-365)||(11424550-11424880)
chr3 (31-361)||(14576620-14576949)
chr3 (27-365)||(26686887-26687224)
chr3 (27-365)||(17487856-17488194)
chr3 (27-365)||(13442274-13442611)
chr3 (27-365)||(43840932-43841269)
chr3 (22-365)||(23083140-23083482)
chr3 (24-365)||(17499338-17499679)
chr3 (27-365)||(20698220-20698556)
chr3 (22-352)||(14572602-14572931)
chr3 (22-347)||(42386428-42386754)
chr3 (33-365)||(12399209-12399537)
chr3 (150-362)||(24153115-24153326)
chr3 (199-362)||(17463178-17463340)
chr3 (199-362)||(29172583-29172745)
chr3 (199-362)||(34159326-34159488)
chr3 (219-362)||(36166598-36166739)
chr3 (199-362)||(45606907-45607069)
chr3 (199-362)||(55476491-55476653)
chr3 (199-363)||(13544024-13544187)
chr3 (199-362)||(7781347-7781509)
chr3 (199-362)||(8899094-8899256)
chr3 (199-362)||(9707607-9707769)
chr3 (199-358)||(12567564-12567722)
chr3 (199-362)||(16454281-16454443)
chr3 (199-362)||(28848611-28848773)
chr3 (199-362)||(38961891-38962053)
chr3 (199-362)||(13151790-13151953)
chr3 (199-362)||(13154255-13154418)
chr3 (219-351)||(21618460-21618590)
chr3 (199-362)||(6469134-6469296)
chr3 (199-362)||(10247723-10247885)
chr3 (199-362)||(17672626-17672788)
chr3 (22-346)||(53070476-53070799)
chr3 (199-360)||(16282811-16282971)
chr3 (22-350)||(30029855-30030181)
chr3 (199-362)||(17446655-17446816)
chr3 (199-360)||(41123892-41124049)
chr3 (199-362)||(50242822-50242984)
chr3 (239-362)||(15977515-15977637)
chr3 (36-227)||(16796685-16796875)
chr3 (248-362)||(55500942-55501055)
chr3 (199-365)||(43550478-43550644)
chr3 (239-362)||(12119764-12119887)
chr3 (239-362)||(15412429-15412552)
chr3 (31-346)||(52523514-52523831)
chr3 (254-362)||(8499518-8499625)
chr3 (199-362)||(27165250-27165413)
chr3 (101-365)||(24340579-24340844)
chr3 (243-362)||(10556985-10557104)
chr3 (199-362)||(53301505-53301669)
chr3 (262-362)||(44494809-44494908)
chr3 (187-361)||(16097332-16097505)
chr3 (74-347)||(23274705-23274979)
chr3 (149-227)||(14179570-14179648)
chr3 (250-365)||(13210333-13210448)
chr3 (239-358)||(32307684-32307802)
chr3 (243-361)||(15470928-15471046)
chr3 (187-361)||(16103784-16103956)
chr3 (31-284)||(2050986-2051239)
chr3 (263-362)||(17737236-17737337)
chr3 (247-365)||(14234487-14234605)
chr3 (250-361)||(12174265-12174376)
chr3 (150-365)||(37642170-37642386)
chr3 (310-362)||(45577948-45578000)
chr3 (239-361)||(49668071-49668193)
chr3 (312-362)||(28194693-28194743)
chr3 (22-126)||(17248064-17248168)
chr3 (239-358)||(1644670-1644787)
chr3 (259-361)||(9512924-9513026)
chr3 (259-361)||(9520899-9521001)
chr3 (217-363)||(46822267-46822413)
chr3 (243-346)||(37251165-37251270)
chr3 (243-346)||(43925977-43926082)
chr3 (246-363)||(12511059-12511176)
chr3 (187-290)||(22147468-22147571)
chr3 (312-361)||(15878119-15878168)
chr3 (304-344)||(13919350-13919390)
chr3 (312-364)||(14665398-14665450)
chr3 (312-364)||(14668554-14668606)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (27-365)||(25629138-25629476)
chr6 (27-365)||(20593773-20594111)
chr6 (27-365)||(19303324-19303661)
chr6 (31-365)||(29060540-29060874)
chr6 (27-364)||(18409610-18409947)
chr6 (27-365)||(20638067-20638404)
chr6 (22-365)||(20360739-20361081)
chr6 (28-365)||(22780012-22780348)
chr6 (31-365)||(17287584-17287917)
chr6 (199-362)||(22782227-22782389)
chr6 (22-346)||(18456735-18457058)
chr6 (199-362)||(2291180-2291342)
chr6 (199-362)||(12742317-12742479)
chr6 (199-362)||(18334592-18334754)
chr6 (199-362)||(19005046-19005208)
chr6 (199-362)||(19858919-19859081)
chr6 (199-362)||(24422547-24422709)
chr6 (199-362)||(33861794-33861956)
chr6 (199-362)||(33864278-33864440)
chr6 (199-362)||(8055029-8055191)
chr6 (199-362)||(26924640-26924802)
chr6 (199-364)||(30676710-30676874)
chr6 (199-364)||(34963371-34963535)
chr6 (199-362)||(25754809-25754971)
chr6 (22-365)||(16920412-16920751)
chr6 (199-362)||(20556894-20557054)
chr6 (199-362)||(1540911-1541073)
chr6 (27-365)||(22831503-22831839)
chr6 (198-365)||(20076700-20076863)
chr6 (199-362)||(1595549-1595711)
chr6 (199-362)||(3852017-3852179)
chr6 (31-350)||(25644335-25644656)
chr6 (199-362)||(25656629-25656791)
chr6 (212-346)||(18461895-18462028)
chr6 (199-359)||(16448526-16448686)
chr6 (246-365)||(16496244-16496363)
chr6 (219-362)||(25688502-25688644)
chr6 (193-346)||(18821795-18821946)
chr6 (22-338)||(25603164-25603478)
chr6 (187-365)||(20109140-20109318)
chr6 (190-365)||(35245586-35245758)
chr6 (22-338)||(25611502-25611816)
chr6 (243-361)||(19652199-19652316)
chr6 (101-365)||(8227367-8227632)
chr6 (22-156)||(18821598-18821731)
chr6 (304-365)||(25714417-25714478)
chr6 (250-365)||(1561303-1561418)
chr6 (250-365)||(28496477-28496592)
chr6 (250-365)||(29808888-29809003)
chr6 (267-365)||(27333241-27333339)
chr6 (267-365)||(27393981-27394079)
chr6 (27-346)||(11185524-11185839)
chr6 (243-365)||(23019408-23019528)
chr6 (123-338)||(15041430-15041644)
chr6 (247-350)||(19668386-19668491)
chr6 (114-183)||(5834367-5834436)
chr6 (114-183)||(20177096-20177165)
chr6 (114-183)||(22158826-22158895)
chr6 (250-350)||(9098518-9098620)
chr6 (318-365)||(22080799-22080846)
chr6 (312-363)||(19848063-19848114)
chr6 (187-256)||(25642126-25642196)
chr6 (250-353)||(4185827-4185930)
chr6 (250-353)||(4186379-4186482)
chr6 (312-363)||(23992429-23992480)
chr6 (293-344)||(33443068-33443119)
chr6 (312-361)||(19862978-19863027)
chr6 (181-253)||(19863089-19863162)
chr6 (312-361)||(19873120-19873169)
chr6 (181-253)||(19873231-19873304)
chr6 (312-361)||(31155465-31155514)
chr6 (313-353)||(4738626-4738666)
chr6 (80-128)||(18453419-18453467)
chr6 (324-368)||(19008799-19008843)
chr6 (295-346)||(23076749-23076801)
chr6 (295-346)||(35008167-35008219)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (22-365)||(16378-16721)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (27-364)||(50209996-50210333)
chr1 (27-362)||(34509783-34510118)
chr1 (24-365)||(22532269-22532610)
chr1 (27-365)||(27250513-27250850)
chr1 (27-365)||(21026680-21027017)
chr1 (22-364)||(20135188-20135530)
chr1 (31-288)||(22354360-22354616)
chr1 (22-362)||(433012-433350)
chr1 (199-362)||(13988866-13989028)
chr1 (199-362)||(21923291-21923453)
chr1 (199-362)||(23593735-23593897)
chr1 (199-363)||(21840766-21840929)
chr1 (199-362)||(21475087-21475249)
chr1 (199-362)||(29776688-29776850)
chr1 (199-362)||(31612313-31612475)
chr1 (199-362)||(29298137-29298298)
chr1 (82-364)||(22468535-22468816)
chr1 (199-364)||(16361915-16362079)
chr1 (199-362)||(21346961-21347124)
chr1 (199-365)||(13212861-13213027)
chr1 (199-362)||(21707167-21707329)
chr1 (199-362)||(21711709-21711871)
chr1 (27-228)||(22355958-22356159)
chr1 (27-228)||(22357644-22357845)
chr1 (199-368)||(21342090-21342259)
chr1 (199-365)||(45574842-45575008)
chr1 (31-365)||(38801179-38801508)
chr1 (199-362)||(16275363-16275526)
chr1 (199-362)||(22123067-22123230)
chr1 (254-368)||(15860064-15860177)
chr1 (74-350)||(16758664-16758942)
chr1 (31-346)||(35260866-35261180)
chr1 (239-358)||(21754052-21754170)
chr1 (199-359)||(40389157-40389317)
chr1 (243-361)||(22921868-22921986)
chr1 (263-365)||(20847173-20847275)
chr1 (149-227)||(48603652-48603730)
chr1 (27-176)||(20847003-20847151)
chr1 (187-346)||(21861513-21861672)
chr1 (187-346)||(21896199-21896358)
chr1 (187-361)||(33681011-33681184)
chr1 (250-361)||(20248283-20248394)
chr1 (181-361)||(21714546-21714732)
chr1 (250-365)||(14295557-14295672)
chr1 (304-364)||(20454613-20454673)
chr1 (218-361)||(22237631-22237773)
chr1 (267-350)||(52927993-52928076)
chr1 (250-349)||(20918620-20918719)
chr1 (198-346)||(50614070-50614219)
chr1 (198-346)||(50621898-50622047)
chr1 (31-128)||(26065176-26065274)
chr1 (198-346)||(41049990-41050138)
chr1 (22-73)||(33681301-33681352)
chr1 (304-346)||(21533932-21533974)
chr1 (312-361)||(21161720-21161769)
chr1 (181-338)||(21787979-21788136)
chr1 (22-74)||(21162056-21162108)
chr1 (74-126)||(21342332-21342384)
chr1 (74-126)||(21347197-21347249)
chr1 (312-364)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (27-363)||(39479-39814)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (27-363)||(74998-75333)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (27-368)||(6759255-6759594)
chr8 (27-365)||(16092124-16092463)
chr8 (27-364)||(28648827-28649164)
chr8 (27-365)||(22875065-22875403)
chr8 (27-365)||(22626736-22627073)
chr8 (27-365)||(18818193-18818530)
chr8 (24-365)||(21923709-21924049)
chr8 (31-365)||(20536208-20536541)
chr8 (31-365)||(23406379-23406714)
chr8 (46-365)||(7372778-7373088)
chr8 (27-365)||(18879021-18879352)
chr8 (22-365)||(21918779-21919121)
chr8 (30-364)||(23648554-23648888)
chr8 (27-365)||(31971257-31971592)
chr8 (38-365)||(45130793-45131117)
chr8 (27-365)||(16199430-16199765)
chr8 (22-362)||(41598188-41598527)
chr8 (199-362)||(1484402-1484564)
chr8 (199-362)||(5853292-5853454)
chr8 (199-362)||(14409444-14409606)
chr8 (199-362)||(20403227-20403389)
chr8 (199-362)||(22001753-22001915)
chr8 (22-227)||(25362919-25363123)
chr8 (199-358)||(16413316-16413474)
chr8 (199-362)||(20046195-20046357)
chr8 (199-362)||(4483281-4483442)
chr8 (199-362)||(15203231-15203393)
chr8 (199-362)||(4542373-4542535)
chr8 (219-362)||(26219717-26219858)
chr8 (219-362)||(26225268-26225409)
chr8 (199-362)||(19896265-19896430)
chr8 (199-362)||(14823774-14823935)
chr8 (144-365)||(21389353-21389571)
chr8 (149-365)||(21395888-21396101)
chr8 (149-365)||(21790381-21790594)
chr8 (240-368)||(19937046-19937174)
chr8 (199-358)||(45290694-45290853)
chr8 (199-346)||(19801382-19801527)
chr8 (162-365)||(21778697-21778897)
chr8 (199-364)||(26223917-26224081)
chr8 (239-349)||(15070571-15070681)
chr8 (199-362)||(25484275-25484430)
chr8 (243-365)||(38855250-38855372)
chr8 (74-358)||(13507914-13508199)
chr8 (247-365)||(6520368-6520486)
chr8 (243-361)||(21285601-21285719)
chr8 (74-358)||(13597446-13597731)
chr8 (193-365)||(17612059-17612231)
chr8 (250-365)||(5866280-5866395)
chr8 (262-365)||(17140916-17141019)
chr8 (250-365)||(21490995-21491110)
chr8 (244-361)||(26355699-26355815)
chr8 (243-353)||(21673716-21673826)
chr8 (187-346)||(20498581-20498740)
chr8 (243-361)||(23760843-23760961)
chr8 (315-365)||(21249384-21249434)
chr8 (315-365)||(21255222-21255272)
chr8 (247-350)||(983407-983512)
chr8 (187-346)||(17439449-17439609)
chr8 (217-363)||(18678075-18678221)
chr8 (198-346)||(37116366-37116515)
chr8 (243-346)||(17266991-17267096)
chr8 (217-363)||(32121734-32121880)
chr8 (305-344)||(22525579-22525618)
chr8 (74-128)||(22963249-22963303)
chr8 (243-284)||(40492850-40492891)
chr8 (150-201)||(26222987-26223039)
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (27-360)||(14038653-14038986)
chr4 (27-362)||(16377305-16377639)
chr4 (27-363)||(22636437-22636771)
chr4 (27-365)||(44052829-44053166)
chr4 (38-365)||(16239764-16240090)
chr4 (31-365)||(12902757-12903090)
chr4 (27-365)||(7893703-7894038)
chr4 (22-365)||(7088877-7089219)
chr4 (27-358)||(23374143-23374473)
chr4 (148-365)||(16270140-16270356)
chr4 (22-362)||(44928701-44929042)
chr4 (22-365)||(14053081-14053422)
chr4 (27-168)||(15091093-15091234)
chr4 (150-362)||(54798669-54798872)
chr4 (181-365)||(7798774-7798958)
chr4 (150-362)||(14280316-14280518)
chr4 (199-364)||(19618172-19618336)
chr4 (22-362)||(44102214-44102553)
chr4 (199-362)||(12307-12469)
chr4 (199-362)||(15118352-15118514)
chr4 (199-362)||(18215274-18215436)
chr4 (199-362)||(44773087-44773249)
chr4 (199-362)||(52312510-52312672)
chr4 (193-362)||(1837503-1837671)
chr4 (22-227)||(17047851-17048055)
chr4 (199-368)||(19242693-19242861)
chr4 (199-362)||(44615288-44615450)
chr4 (199-362)||(50222339-50222501)
chr4 (199-362)||(3515007-3515169)
chr4 (199-362)||(18239419-18239581)
chr4 (27-228)||(3096781-3096980)
chr4 (193-365)||(6899891-6900062)
chr4 (219-362)||(8574844-8574985)
chr4 (199-362)||(23803265-23803427)
chr4 (199-362)||(51463868-51464030)
chr4 (31-350)||(52242980-52243302)
chr4 (246-365)||(52873369-52873488)
chr4 (199-358)||(15355324-15355483)
chr4 (199-364)||(14970707-14970871)
chr4 (199-362)||(12610950-12611105)
chr4 (199-365)||(15367690-15367856)
chr4 (199-365)||(15402703-15402869)
chr4 (125-365)||(17046487-17046724)
chr4 (101-365)||(15371202-15371466)
chr4 (101-365)||(15373483-15373747)
chr4 (199-362)||(7641192-7641344)
chr4 (201-346)||(21815587-21815731)
chr4 (239-365)||(15370018-15370144)
chr4 (101-365)||(16223532-16223796)
chr4 (31-283)||(15464716-15464970)
chr4 (187-346)||(13794-13953)
chr4 (255-365)||(39706299-39706409)
chr4 (187-350)||(43198496-43198661)
chr4 (279-365)||(3096293-3096379)
chr4 (44-346)||(6190481-6190782)
chr4 (199-359)||(20149832-20149992)
chr4 (239-361)||(12774011-12774132)
chr4 (250-365)||(15551817-15551932)
chr4 (199-363)||(22353835-22353999)
chr4 (247-350)||(12288211-12288316)
chr4 (261-361)||(8846360-8846460)
chr4 (27-87)||(7798975-7799034)
chr4 (243-346)||(46640453-46640558)
chr4 (22-124)||(21815409-21815511)
chr4 (295-344)||(17333298-17333347)
chr4 (83-135)||(20157130-20157182)
chr4 (83-135)||(24028970-24029022)
chr4 (38-128)||(32306787-32306879)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (22-365)||(4508-4850)
scaffold0228 (22-365)||(12090-12432)
scaffold0228 (22-365)||(22042-22384)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (35-362)||(3564155-3564482)
chr7 (27-365)||(38227481-38227818)
chr7 (31-365)||(9509189-9509522)
chr7 (27-365)||(12698831-12699169)
chr7 (22-350)||(15143815-15144143)
chr7 (27-365)||(10589039-10589375)
chr7 (31-365)||(26211995-26212329)
chr7 (27-365)||(16386031-16386369)
chr7 (150-362)||(18456319-18456530)
chr7 (27-363)||(40443393-40443726)
chr7 (199-365)||(18430709-18430874)
chr7 (150-362)||(48273392-48273594)
chr7 (28-365)||(27847618-27847951)
chr7 (31-365)||(2279905-2280238)
chr7 (199-362)||(456321-456483)
chr7 (199-362)||(11972496-11972658)
chr7 (199-362)||(14949122-14949284)
chr7 (199-362)||(15376713-15376875)
chr7 (199-362)||(16232520-16232682)
chr7 (199-362)||(18640272-18640434)
chr7 (199-362)||(20385123-20385285)
chr7 (199-362)||(21189595-21189757)
chr7 (199-362)||(24702238-24702400)
chr7 (199-362)||(32125491-32125653)
chr7 (199-362)||(41522917-41523079)
chr7 (199-362)||(41525379-41525541)
chr7 (199-361)||(11393287-11393448)
chr7 (199-362)||(27216860-27217022)
chr7 (193-362)||(16213684-16213852)
chr7 (201-362)||(16410059-16410219)
chr7 (199-362)||(44116509-44116671)
chr7 (199-365)||(13647325-13647491)
chr7 (22-362)||(17061738-17062077)
chr7 (212-358)||(24275175-24275320)
chr7 (199-362)||(3386333-3386495)
chr7 (199-362)||(24704688-24704847)
chr7 (199-358)||(38898376-38898535)
chr7 (239-362)||(13831373-13831495)
chr7 (22-346)||(12756494-12756817)
chr7 (239-362)||(13869346-13869469)
chr7 (199-362)||(20110556-20110708)
chr7 (199-362)||(26355983-26356156)
chr7 (199-362)||(26358435-26358608)
chr7 (242-365)||(67745-67868)
chr7 (247-365)||(47831807-47831925)
chr7 (31-343)||(12255578-12255892)
chr7 (243-365)||(22072913-22073036)
chr7 (250-365)||(16495402-16495517)
chr7 (250-365)||(34200786-34200901)
chr7 (243-361)||(18005650-18005768)
chr7 (252-361)||(44014182-44014291)
chr7 (246-361)||(16219719-16219834)
chr7 (267-365)||(28505321-28505419)
chr7 (250-365)||(11996033-11996148)
chr7 (250-365)||(15754893-15755008)
chr7 (255-361)||(811142-811248)
chr7 (76-361)||(19649317-19649606)
chr7 (144-350)||(1867895-1868101)
chr7 (31-342)||(15008284-15008597)
chr7 (101-365)||(19486600-19486865)
chr7 (243-350)||(16056343-16056449)
chr7 (259-350)||(12901338-12901431)
chr7 (187-359)||(18154779-18154956)
chr7 (31-78)||(16056615-16056662)
chr7 (295-346)||(18203831-18203882)
chr7 (196-361)||(14932685-14932851)
chr7 (196-361)||(15356120-15356286)
chr7 (196-361)||(15360234-15360400)
chr7 (319-350)||(14044761-14044792)
chr7 (319-350)||(14354791-14354822)
chr7 (74-128)||(17017297-17017351)
chr7 (252-346)||(20220194-20220290)
chr7 (181-250)||(24054581-24054651)
chr7 (312-364)||(2832509-2832561)
chr7 (22-50)||(9751327-9751355)
chr7 (83-135)||(9751390-9751442)
chr7 (22-78)||(22073203-22073259)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (27-358)||(25848-26179)
scaffold0122 (27-240)||(33278-33491)
scaffold0122 (219-362)||(44682-44825)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (27-364)||(16998-17337)
scaffold0056 (20-346)||(79105-79430)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (27-362)||(339734-340065)
scaffold0003 (199-362)||(158450-158612)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (31-365)||(22337115-22337449)
chr2 (31-365)||(23076442-23076775)
chr2 (27-365)||(23660023-23660360)
chr2 (27-365)||(22737964-22738300)
chr2 (27-365)||(23285865-23286198)
chr2 (27-365)||(22731017-22731355)
chr2 (60-365)||(23060513-23060815)
chr2 (45-365)||(23654188-23654507)
chr2 (27-365)||(37900-38235)
chr2 (31-362)||(298602-298933)
chr2 (24-365)||(20309108-20309445)
chr2 (199-364)||(32214921-32215085)
chr2 (199-362)||(18808943-18809105)
chr2 (199-362)||(23130862-23131024)
chr2 (199-362)||(23133329-23133491)
chr2 (199-362)||(23709532-23709694)
chr2 (199-362)||(23712013-23712175)
chr2 (199-362)||(34402522-34402684)
chr2 (199-362)||(39682313-39682475)
chr2 (199-362)||(571397-571559)
chr2 (199-362)||(6725995-6726157)
chr2 (199-362)||(22105412-22105575)
chr2 (199-362)||(23135590-23135752)
chr2 (199-362)||(24367774-24367936)
chr2 (199-362)||(26505379-26505541)
chr2 (199-362)||(26507857-26508019)
chr2 (27-210)||(27753730-27753912)
chr2 (199-362)||(45029854-45030016)
chr2 (199-359)||(21155060-21155219)
chr2 (199-362)||(24898195-24898358)
chr2 (199-362)||(24900678-24900841)
chr2 (199-362)||(24903155-24903318)
chr2 (199-362)||(24905632-24905795)
chr2 (199-362)||(24908107-24908270)
chr2 (199-362)||(32039498-32039660)
chr2 (27-346)||(32451713-32452031)
chr2 (31-365)||(23708405-23708738)
chr2 (199-362)||(28577099-28577261)
chr2 (199-360)||(43137301-43137461)
chr2 (199-362)||(24529528-24529691)
chr2 (199-362)||(38967374-38967537)
chr2 (196-365)||(23103348-23103516)
chr2 (74-365)||(19671830-19672118)
chr2 (243-360)||(28405981-28406099)
chr2 (304-365)||(23040249-23040310)
chr2 (267-365)||(23071972-23072070)
chr2 (243-361)||(25175854-25175972)
chr2 (292-365)||(8946657-8946730)
chr2 (285-359)||(24643036-24643109)
chr2 (198-346)||(7687-7835)
chr2 (239-364)||(22134203-22134326)
chr2 (247-361)||(7679589-7679702)
chr2 (199-276)||(24642856-24642933)
chr2 (31-346)||(20519978-20520295)
chr2 (243-346)||(23207296-23207401)
chr2 (312-350)||(18786971-18787009)
chr2 (144-346)||(22413035-22413240)
chr2 (217-358)||(25616192-25616333)
chr2 (187-253)||(22758658-22758725)
chr2 (187-338)||(22799069-22799220)
chr2 (243-346)||(23791292-23791397)
chr2 (187-256)||(22740903-22740973)
chr2 (243-277)||(23004838-23004872)
chr2 (181-253)||(23038144-23038217)
chr2 (295-344)||(23287384-23287433)
chr2 (243-284)||(24697604-24697645)
chr2 (304-344)||(26392403-26392443)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (80-365)||(2987-3271)
scaffold0540 (24-68)||(793-837)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (27-362)||(22886-23220)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (27-365)||(38761-39098)
scaffold0145 (148-365)||(32942-33158)
scaffold0145 (199-367)||(9744-9912)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (27-283)||(27912-28168)
scaffold0130 (329-364)||(27878-27913)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (27-365)||(51913-52249)
scaffold0011 (27-365)||(167763-168099)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (31-365)||(39913-40246)
scaffold0080 (244-346)||(19883-19987)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (27-365)||(39858-40194)
scaffold0026 (47-365)||(25896-26213)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (27-365)||(13211-13548)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (31-365)||(343-676)
scaffold0292 (27-365)||(3470-3807)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (22-365)||(1851-2193)
scaffold0016 (83-135)||(207359-207411)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (24-365)||(8313-8650)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (31-365)||(32746-33077)
scaffold0120 (31-365)||(45928-46259)
scaffold0120 (154-365)||(16113-16323)
scaffold0120 (303-365)||(17388-17450)
scaffold0120 (30-129)||(16323-16422)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (27-365)||(833-1169)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (27-365)||(5905-6245)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (31-365)||(8479-8808)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (161-364)||(3103-3306)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (27-313)||(13144-13429)
scaffold0175 (250-365)||(34123-34238)
scaffold0175 (310-365)||(273-328)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (27-347)||(24085-24406)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (27-365)||(13497-13832)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (27-365)||(1952-2289)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (31-365)||(4849-5181)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (22-344)||(4545-4866)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (27-365)||(32067-32401)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (27-365)||(15249-15584)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (27-205)||(10323-10501)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (27-365)||(10210-10544)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (139-305)||(3424-3591)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (27-365)||(20910-21248)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (22-365)||(4712-5054)
scaffold0358 (22-299)||(2-278)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (27-228)||(124722-124922)
scaffold0021 (181-364)||(174767-174949)
scaffold0021 (304-365)||(121766-121827)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (22-288)||(741-1006)
scaffold0395 (304-365)||(4893-4954)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (27-365)||(1289-1623)
scaffold0106 (27-365)||(7266-7600)
scaffold0106 (312-362)||(15306-15356)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (27-365)||(836-1170)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (27-365)||(16282-16616)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (27-365)||(51582-51916)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (199-362)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (199-362)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (199-362)||(94411-94573)
scaffold0023 (202-362)||(44454-44614)
scaffold0023 (199-358)||(17440-17598)
scaffold0023 (243-361)||(100378-100496)
scaffold0023 (243-361)||(40173-40291)
scaffold0023 (312-365)||(119875-119928)
scaffold0023 (294-361)||(101503-101571)
scaffold0023 (187-361)||(38422-38596)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (199-363)||(10772-10935)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (27-299)||(6676-6947)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (199-362)||(4694-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (199-362)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (199-362)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (199-362)||(136680-136842)
scaffold0028 (199-362)||(139149-139311)
scaffold0028 (199-362)||(144087-144249)
scaffold0028 (199-362)||(134211-134373)
scaffold0028 (199-362)||(141618-141780)
scaffold0028 (243-363)||(62200-62317)
scaffold0028 (312-361)||(132662-132711)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (219-362)||(116430-116571)
scaffold0022 (243-346)||(128968-129072)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (22-227)||(1052-1256)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (199-363)||(9241-9404)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (33-350)||(15887-16206)
scaffold0357 (61-346)||(13147-13435)
scaffold0357 (295-346)||(2680-2732)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (199-362)||(16784-16946)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (199-358)||(501088-501246)
scaffold0001 (199-362)||(85579-85742)
scaffold0001 (243-361)||(160688-160805)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (22-206)||(3640-3823)
scaffold0165 (22-206)||(7704-7887)
scaffold0165 (159-350)||(27663-27855)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (199-362)||(106-268)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (246-365)||(28414-28533)
scaffold0046 (250-365)||(11292-11407)
scaffold0046 (250-365)||(1997-2112)
scaffold0046 (312-365)||(4552-4605)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (199-362)||(40400-40562)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (199-362)||(82072-82234)
scaffold0037 (187-350)||(22614-22776)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (27-362)||(4915-5246)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (27-346)||(51668-51985)
scaffold0034 (243-365)||(32538-32657)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (199-364)||(11286-11450)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (22-346)||(20203-20524)
scaffold0031 (198-365)||(128751-128917)
scaffold0031 (181-250)||(65730-65800)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (199-364)||(12249-12413)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (199-359)||(4300-4459)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (199-362)||(161089-161252)
scaffold0007 (199-282)||(164590-164674)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (199-362)||(12064-12220)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (199-348)||(29946-30094)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (199-362)||(4214-4377)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (199-362)||(2128-2291)
scaffold0247 (101-365)||(17883-18148)
scaffold0247 (27-74)||(6578-6625)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (29-365)||(46995-47321)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (27-173)||(20595-20740)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (199-359)||(1280-1440)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (187-350)||(8481-8646)
scaffold0621 (243-365)||(6535-6657)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (46-185)||(17790-17928)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (199-362)||(38657-38820)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (31-176)||(11301-11445)
scaffold0235 (248-365)||(11447-11564)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (31-346)||(60500-60818)
scaffold0010 (218-353)||(129917-130051)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (31-290)||(225482-225741)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (31-106)||(163-238)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (243-361)||(19268-19386)
[»] scaffold1984 (2 HSPs)
scaffold1984 (218-361)||(133-275)
scaffold1984 (22-58)||(437-473)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (250-365)||(1075-1190)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (243-361)||(2805-2923)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (255-365)||(15788-15898)
scaffold0020 (312-361)||(178898-178947)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (257-365)||(6611-6719)
scaffold0333 (257-365)||(13991-14099)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (250-362)||(15664-15776)
scaffold0261 (181-250)||(1452-1522)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (187-350)||(10485-10647)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (187-346)||(53492-53651)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (247-365)||(1037-1155)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (247-365)||(12766-12884)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (187-365)||(11464-11642)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (255-365)||(6134-6244)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (239-361)||(45787-45909)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (187-365)||(38199-38377)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (243-361)||(14696-14814)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (243-353)||(5655-5765)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (158-361)||(23843-24048)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (243-350)||(10542-10649)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (243-361)||(1086-1204)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (243-361)||(2644-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (247-361)||(12943-13057)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (285-346)||(11982-12042)
scaffold0503 (22-129)||(12165-12272)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (243-346)||(1051-1154)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (243-346)||(12587-12690)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (239-361)||(32102-32224)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (259-361)||(23898-24000)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (187-284)||(8002-8099)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (312-361)||(36454-36503)
scaffold0131 (181-253)||(36567-36640)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (22-114)||(1855-1947)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (250-353)||(6824-6927)
scaffold0556 (243-290)||(8090-8137)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (313-361)||(28839-28887)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (247-350)||(8075-8180)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (76-253)||(69905-70082)
scaffold0004 (312-361)||(69794-69843)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (212-277)||(13092-13157)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (198-346)||(6237-6386)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (243-342)||(38339-38440)
scaffold0139 (181-250)||(20095-20165)
scaffold0139 (312-361)||(19980-20029)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (243-350)||(25121-25229)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (198-346)||(97024-97173)
scaffold0006 (198-346)||(106302-106451)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (243-286)||(2217-2260)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (243-284)||(1795-1836)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (312-361)||(29558-29607)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (187-250)||(15612-15676)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9078290 - 9077952
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9078290 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggt 9078191  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078190 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 9078091  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  9078090 agttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 9077991  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9077990 gctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 27 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24529558 - 24529223
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24529558 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcactagtagttgagagttgaaccttggggt 24529459  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529458 agtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttg 24529359  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24529358 agatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 24529259  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529258 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1096801 - 1096467
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1096801 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagaatgcctttttagaattttgcgatctctgtcgcacaagttgttaaaagttggaccttggggtagta 1096702  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1096701 ttgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaatt 1096602  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1096601 atgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctg 1096502  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096501 catgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25421866 - 25421532
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25421866 agaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaccgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagca 25421767  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  25421766 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagt 25421667  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    || | || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25421666 ataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctg 25421567  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421566 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24493906 - 24493569
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24493906 gagcagaggctttcgcctcgtgagtaacccataaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 24493807  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  24493806 agtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttg 24493707  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |||||| ||||| ||    
T  24493706 aagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaa 24493608  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493607 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25431728 - 25431395
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  25431728 agaggctctcacctcgcgagtgacccagaaatcgagtgccttgttaggattttgcgacctttgttacacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagca 25431629  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  25431628 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagt 25431529  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    || | || | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  25431528 ataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatg 25431429  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25431428 catgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Original strand, 8286621 - 8286964
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| ||   ||||||| |||||||||||||    
T  8286621 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcttgagttgttgagagttgaacctt 8286719  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  8286720 tgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 8286819  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-ttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    |||||||  |||  ||  || || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  8286820 acttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttattt 8286919  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286920 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Original strand, 23390275 - 23390617
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  23390275 atggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttag-attttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctt 23390373  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23390374 gggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 23390473  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    |||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23390474 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttattta 23390573  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390574 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13095832 - 13095495
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13095832 gagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagtcgttgagagttgaaccttggggt 13095733  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  13095732 agtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttg 13095633  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||     
T  13095632 aagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactat 13095534  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095533 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13025648 - 13025311
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  13025648 gagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggt 13025549  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||    
T  13025548 agtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttg 13025449  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||     
T  13025448 aagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactat 13025350  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025349 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22075356 - 22075018
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaa-cagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttgggg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||  || |||||| |||    
T  22075356 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgacttgttag--ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggg 22075259  T
Q  126 tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22075258 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattactt 22075159  T
Q  226 --gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaac 323  Q
      |||||||   || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  22075158 gagaattat--ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaac 22075061  T
Q  324 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075060 taagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 261
Target Start/End: Original strand, 21985931 - 21986164
Alignment:
Q  28 agcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggta 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21985931 agcagaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggta 21986030  T
Q  128 gtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21986031 gtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttga 21986130  T
Q  228 attatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 261  Q
      ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  21986131 gatatgaatttataatgaagatgttgttgacttg 21986164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 362
Target Start/End: Original strand, 11581023 - 11581361
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||| |  ||||||||||||||| | ||||| || ||| ||| |||||||||||||    
T  11581023 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccatttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgtacgagtcgttgagagttgaacctt 11581122  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    ||||||||  |||   |||   || || ||||| ||||||||||||| || |||| | ||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  ||||  |||    
T  11581123 ggggtagttatgaatattatatataatattaatgataatctgtgaagttgatttatgatga-ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatacat 11581220  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    ||||||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11581221 tacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt 11581319  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11581320 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 21292754 - 21293090
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||  | ||| |||| ||||||   |||||| ||| | ||||    
T  21292754 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgactttttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgggagttggacccttgggt 21292852  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21292853 aggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttg 21292951  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttg-acttgcat-ttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaact 324  Q
    ||  || | ||||||  | |||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||  |||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  21292952 aagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaact 21293049  T
Q  325 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21293050 aagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||          |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  350 atgaagatgatga 362  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  264868 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 362
Target Start/End: Original strand, 36154606 - 36154942
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |   ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  36154606 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaacctt 36154705  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    ||||||||  |||   |||   ||  | ||||| || || |||||||||| |||| | ||  ||| || || ||||  |||||||||||  |||| ||||    
T  36154706 ggggtagttatgaatattatatatattattaatgatgatatgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcat 36154804  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    ||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||   ||||||||||||||    
T  36154805 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctg---tgttgttgttattt 36154900  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36154901 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 362
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  200 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 299  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  300 tctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10733041 t-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 gt-tgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 229
Target Start/End: Original strand, 22107152 - 22107358
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |  | |||||||  | ||| |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  22107152 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaatagagtgccttgtgat-actttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagatgaacctt 22107250  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||    
T  22107251 tgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcatt 22107350  T
Q  222 acttgaat 229  Q
    ||||||||    
T  22107351 acttgaat 22107358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 gt-tgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 gt-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 gt-tgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 gt-tgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245136
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39245198 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22144384 - 22144068
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  22144384 agaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtcgta 22144285  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaat 229  Q
     |||   ||  | ||||| ||||| || | |||||||| |||| |||| ||  ||| ||||| |||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22144284 atgaagattgtttatgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaat 22144185  T
Q  230 tatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgt-tgttatttaactaagc 328  Q
    |||  ||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22144184 tatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagc 22144086  T
Q  329 tgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22144085 tgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 2154613 - 2154776
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt---ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtat 295  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2154613 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattat--atgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 2154710  T
Q  296 actgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154711 actgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 257 - 365
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  257 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  357 tgatgatgt 365  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 365
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttga--attatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtat 295  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||   || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatt--tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtat 21808440  T
Q  296 actgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808441 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 20902008 - 20902172
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt---ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtat 295  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20902008 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattat--atgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtat 20902105  T
Q  296 actgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-atgaagatgatga 362  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20902106 actg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 239 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38619557 - 38619434
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619557 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 38619459  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  38619458 cggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 246 - 365
Target Start/End: Original strand, 21729066 - 21729185
Alignment:
Q  246 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729066 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21729165  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  21729166 gttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tg-ctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31061231 - 31061068
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||   || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31061231 tgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 31061132  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |  |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31061131 ta-ctgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 239 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23064634 - 23064512
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064634 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 23064536  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  23064535 cggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 20917952 - 20918110
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||||    || |||||||||| |||||||||||    || |||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20917952 tgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatact 20918047  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918048 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  24067170 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37724086 - 37723910
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 279  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||  ||||||||| || ||||    
T  37724086 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgt 37723987  T
Q  280 catgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    |||| ||||   |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  37723986 catgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 300
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766175
Alignment:
Q  219 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt 20766175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21565719 - 21565546
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  21565719 tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 21565621  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
     ||| | |||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21565620 atttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| | | | || || ||| |||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaat-attaaga 18418695  T
Q  249 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19669013 - 19668898
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19669013 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagtt 19668915  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||    
T  19668914 gatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| | |||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21329598  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21329599 gttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 361
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959649
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  349 gatgaagatgatg 361  Q
    ||||| |||||||    
T  22959637 gatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 346
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 343  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  344 aag 346  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 365
Target Start/End: Original strand, 19660903 - 19660956
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19660903 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  267 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 365
Target Start/End: Original strand, 21502158 - 21502277
Alignment:
Q  246 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||| || ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21502158 agatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 21502256  T
Q  345 agttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  21502257 agttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 365
Target Start/End: Original strand, 26012034 - 26012154
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  26012034 ttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  26012133 ctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725853
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 248  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  249 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||  |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgcttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T
Q  348 tgatgaagatgatgatgt 365  Q
     | |||||||| ||||||    
T  40725870 cgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 362
Target Start/End: Original strand, 20806852 - 20806904
Alignment:
Q  310 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20806852 tgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 346
Target Start/End: Original strand, 22178174 - 22178323
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtat 295  Q
    |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  ||||||  |||    
T  22178174 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt-atat 22178271  T
Q  296 actgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178272 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704075
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973808
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 363
Target Start/End: Original strand, 17517174 - 17517320
Alignment:
Q  217 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgtt 316  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||| || || || | |||||    
T  17517174 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 17517273  T
Q  317 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  17517274 attaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 346
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  296 actgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 316
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  190 tgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt--gaattat--gaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||  ||||||  ||    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatgttcaa----gatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgct 20910840  T
Q  286 gttttcgtatactgtctgtgttgttgttgtt 316  Q
    ||||  |||| |||||| ||||| |||||||    
T  20910841 gttt--gtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 349
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  304 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 349  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29448126 - 29448085
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  29448126 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 29448085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Original strand, 22120033 - 22120085
Alignment:
Q  83 tgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgag 135  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22120033 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 22120085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14973192 - 14972854
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14973192 gagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggt 14973093  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14973092 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttg 14972993  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14972992 aattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaa 14972893  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972892 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 362
Target Start/End: Original strand, 40213504 - 40213838
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  40213504 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagtttaaccttggggt 40213603  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213604 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 40213703  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40213704 gattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaa 40213802  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40213803 gctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Original strand, 25476172 - 25476506
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25476172 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagta 25476271  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25476272 ttgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaatt 25476371  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  25476372 atgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagcta 25476471  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476472 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18438872 - 18438534
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  18438872 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagtgttgaaccttggggt 18438773  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18438772 agtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttg 18438673  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    |  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  18438672 agatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 18438573  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438572 gctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Original strand, 11424550 - 11424880
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11424550 agaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagta 11424649  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424650 ttgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 11424749  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11424750 atgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 11424845  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11424846 catgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 361
Target Start/End: Original strand, 14576620 - 14576949
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14576620 agaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagta 14576719  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14576720 ttaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagt 14576819  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    || | || ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  14576820 ataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgt-ttatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttg 14576918  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14576919 aatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26687224 - 26686887
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  | ||| |||| | | ||| |||||||||| |||||||    
T  26687224 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagg-ttttacgacctttgttgcacgaatcgttgagagttgaactttggggt 26687126  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26687125 agtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttg 26687026  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| |  | ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26687025 aagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 26686926  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26686925 gctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17488194 - 17487856
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaa-cagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttgggg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||     
T  17488194 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaaacagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggga 17488096  T
Q  126 tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17488095 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 17487996  T
Q  226 gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaacta 325  Q
    |||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  17487995 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaacta 17487896  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487895 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13442611 - 13442274
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  13442611 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggat 13442513  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13442512 gacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttg 13442413  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  13442412 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaa 13442313  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442312 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43841269 - 43840932
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||  ||| ||||||| ||||||  || |||||||    
T  43841269 gagcaaaggccctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagg-ttttgcgacctttgttacacgagttgttgagagtttgactttggggt 43841171  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43841170 agtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttg 43841071  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43841070 aagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaa 43840971  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43840970 gctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Original strand, 23083140 - 23083482
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  23083140 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacatagtgtcttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttcagagttgaacctt 23083238  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23083239 gaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 23083338  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    ||| ||| ||  | || ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||    
T  23083339 actagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttattta 23083438  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083439 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 24 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17499679 - 17499338
Alignment:
Q  24 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaa-cagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttg 122  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  17499679 ggtgagcagaggctctcgcctctctagtgacctagaaaacagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttg 17499581  T
Q  123 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatta 222  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17499580 ggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcatta 17499481  T
Q  223 cttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaa 322  Q
    ||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  17499480 cttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaa 17499381  T
Q  323 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499380 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 20698220 - 20698556
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||| || |    
T  20698220 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgtggcacgagttgtcgagagttgaacctttggat 20698318  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20698319 agaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttg 20698417  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  20698418 aagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 20698517  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698518 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14572931 - 14572602
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  14572931 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctt 14572832  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |   ||||    
T  14572831 ggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcatt 14572732  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    | ||||| ||| | || ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14572731 atttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttattta 14572633  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572632 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42386754 - 42386428
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacct 120  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||   |||||  |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  42386754 atggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttgcgaactttgtcgcacgagttgttgtgagttgaacct 42386656  T
Q  121 tggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgca 219  Q
    ||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42386655 tggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgca 42386556  T
Q  220 ttacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatt 319  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  42386555 ttgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatt 42386456  T
Q  320 taactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386455 taactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12399537 - 12399209
Alignment:
Q  33 aggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtatt 132  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||  |||| |||  | ||| |||| |||||||  |  || | |||| |||||| |||    
T  12399537 aggctctcgcctcacgagtgacccagaaacag--tgacttgttag--ttttccgacctttgttgcacgagttgttggggattaagcctttgggtagcatt 12399442  T
Q  133 gagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga--att 230  Q
     |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||    
T  12399441 aagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaatt 12399342  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    ||   || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12399341 att--tgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 12399244  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12399243 catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||| | || ||| || ||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  350 atgaagatgatga 362  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29172683 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  219 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848773
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28848711 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38961991 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  219 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttat 21618493  T
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 gt-tgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17672688 g-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Original strand, 53070476 - 53070799
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacct 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  53070476 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaacct 53070574  T
Q  121 tggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgca 219  Q
    |||||||||  |||   ||    || || ||||| || || |||||||||| |||| | ||  ||| ||||| |||   |||||||||||  |||| |||    
T  53070575 tggggtagttatgaatattgtatataatattaatgatgatttgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttagattgtgatataattgtatatgca 53070673  T
Q  220 ttacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatt 319  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  53070674 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttatt 53070772  T
Q  320 taactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  53070773 taactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 360
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 360  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30030181 - 30029855
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtta-cccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacct 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||    
T  30030181 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaatcccagaa-cagaatgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacct 30030084  T
Q  121 tggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    | ||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||| |   |||    
T  30030083 ttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacat 30029984  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    |||||||| | | | || ||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||| |||||||||| |||| | |||  |||||| || || | ||||||||     
T  30029983 tacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatta 30029885  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30029884 aactaagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 360  Q
    || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41123949 gt-tg---tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50242884 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 239 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15977637 - 15977515
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977637 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 15977539  T
Q  339 ggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  15977538 ggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16796875 - 16796685
Alignment:
Q  36 ctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgag 135  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||||||  | ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  16796875 ctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgag-actttgcgacctttgttgcacgaattgttaagagttgaacctttgggtagcattaag 16796777  T
Q  136 acttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
    ||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16796776 acttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 248 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  248 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  348 tgatgaagatgatga 362  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 365
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550644
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |  | ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 362
Target Start/End: Original strand, 12119764 - 12119887
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12119764 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagt 12119862  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  12119863 cggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15412552 - 15412429
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412552 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15412454  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  15412453 cggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 52523514 - 52523831
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| |||  || |||||||||| |||||||||||    
T  52523514 agaggccctcgcctgacgagttgcccagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaactttggggtagta 52523613  T
Q  131 ttga-gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 228  Q
     ||| || |  || | ||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  52523614 atgaagattgtataa-gatattaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaa 52523711  T
Q  229 ttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||||  ||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  |||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  52523712 ttatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacta 52523810  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  52523811 agctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499518
Alignment:
Q  254 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatacta-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 8499527  T
Q  354 agatgatga 362  Q
    |||||||||    
T  8499526 agatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27165413 - 27165250
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| | |||||    
T  27165413 tgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatact 27165315  T
Q  299 gtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27165314 gtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 365
Target Start/End: Original strand, 24340579 - 24340844
Alignment:
Q  101 agttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgat 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| |||| ||    
T  24340579 agttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataat 24340678  T
Q  200 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 299  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| | | ||||||    
T  24340679 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcatactg 24340777  T
Q  300 tctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
      | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  24340778 catatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 243 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10556985
Alignment:
Q  243 ttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 10557006  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  10557005 ctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 53301505 - 53301669
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgt-tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||||| | ||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||    
T  53301505 tgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatac 53301603  T
Q  298 tgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53301604 tgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  262 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16097505 - 16097332
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  16097505 tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatg 16097407  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
     ||| | ||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16097406 attt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23274979 - 23274705
Alignment:
Q  74 ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt- 172  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||   ||||| || || ||||| || |||||||||||||      
T  23274979 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgagccttgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgaa 23274880  T
Q  173 ttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 272  Q
    ||| | ||  ||| ||||| |||| ||||||| ||||  ||||  | |||||||||||||   || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  23274879 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatatt 23274780  T
Q  273 attatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274779 attatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179570
Alignment:
Q  149 gttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210448
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307684
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470928
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  15470947 ctaagttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16103956 - 16103784
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| |||||  |||||  |||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  16103956 tgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatg 16103859  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
     ||| | |||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16103858 attt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 284
Target Start/End: Original strand, 2050986 - 2051239
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||| | ||| |  ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||| |||    
T  2050986 agaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacaaaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcatgagttgttgagagttgaacattgaggtcgta 2051085  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaat 229  Q
     |||   ||  | ||||| ||||| || || |||||||||| | |||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  2051086 atgaagattgtttatgatattaatgatgatttgtgaagctgctataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaat 2051184  T
Q  230 tatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 284  Q
    |||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  2051185 tatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 2051239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  263 atttgatattattatgtcatgatgttttcgta---tactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||   || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 17737239  T
Q  360 tga 362  Q
    |||    
T  17737238 tga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaa 14234507  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  14234506 gttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 361
Target Start/End: Original strand, 12174265 - 12174376
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174265 gttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12174363  T
Q  349 gatgaagatgatg 361  Q
    ||||| |||||||    
T  12174364 gatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 365
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642386
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 248  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  249 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | |||||| || ||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  348 tgatgaagatgatgatgt 365  Q
     | |||||||| ||||||    
T  37642369 cgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 362
Target Start/End: Original strand, 45577948 - 45578000
Alignment:
Q  310 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45577948 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 361
Target Start/End: Original strand, 49668071 - 49668193
Alignment:
Q  239 ataattgagatgtt-gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgag 336  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49668071 ataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 49668168  T
Q  337 tcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||| |||||| |||||||    
T  49668169 tcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194693
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 17248064 - 17248168
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |  |||| |||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  17248064 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatgcttgtttagaattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttaaacctt 17248163  T
Q  122 ggggt 126  Q
    |||||    
T  17248164 ggggt 17248168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 358
Target Start/End: Original strand, 1644670 - 1644787
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 338  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||| | |||||| ||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  1644670 ataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagtt 1644767  T
Q  339 ggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  1644768 ggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512924
Alignment:
Q  259 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 357  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9512928  T
Q  358 gatg 361  Q
    ||||    
T  9512927 gatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520899
Alignment:
Q  259 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 357  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9520903  T
Q  358 gatg 361  Q
    ||||    
T  9520902 gatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 46822413 - 46822267
Alignment:
Q  217 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgtt 316  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||| || || || | |||||    
T  46822413 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 46822314  T
Q  317 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  46822313 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Original strand, 37251165 - 37251270
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||    
T  37251165 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcg 37251263  T
Q  340 gtctaag 346  Q
    |||||||    
T  37251264 gtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43926082 - 43925977
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  43926082 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 43925984  T
Q  340 gtctaag 346  Q
    |||||||    
T  43925983 gtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12511176 - 12511059
Alignment:
Q  246 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||| || || || | |||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  12511176 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaa 12511077  T
Q  346 gttgatgaagatgatgat 363  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  12511076 gttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 290
Target Start/End: Original strand, 22147468 - 22147571
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  22147468 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 22147567  T
Q  287 tttt 290  Q
    ||||    
T  22147568 tttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Original strand, 15878119 - 15878168
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878119 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  304 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 25629138 - 25629476
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25629138 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacttttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggt 25629237  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629238 agtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 25629337  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||    
T  25629338 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaa 25629437  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629438 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20594111 - 20593773
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20594111 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggt 20594012  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20594011 agtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttg 20593912  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| |    
T  20593911 atttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactga 20593812  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593811 gctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 19303324 - 19303661
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19303324 gagcagaggctctcgcctcgagagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctatgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggt 19303423  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  19303424 agcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttg 19303523  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19303524 aaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaa 19303622  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303623 gctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29060874 - 29060540
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29060874 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggtagta 29060775  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29060774 ttgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaatt 29060675  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29060674 atgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 29060575  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060574 catgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 18409610 - 18409947
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  18409610 gagcagaggctctcgcctctctagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttacgacctttgttgcacgagttattgagagttgaaccttagggt 18409709  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  18409710 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttg 18409809  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  18409810 aattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactga 18409909  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409910 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 20638067 - 20638404
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  20638067 gagcaaaggctctcacctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggat 20638165  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  20638166 aacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttg 20638265  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  |||  || ||| |  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20638266 aagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 20638365  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20638366 gctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Original strand, 20360739 - 20361081
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||  |||||||||    
T  20360739 atggcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattgaacctt 20360837  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20360838 tgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcatt 20360937  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    |||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||    
T  20360938 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttattta 20361037  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361038 actaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 365
Target Start/End: Original strand, 22780012 - 22780348
Alignment:
Q  28 agcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggta 127  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||  | ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22780012 agcaaaggctctcgcctcgcgagtaacctagaaacagagtgtcctgttagg-ttttgtgacctttgttgcacaagttgccgagagttgaaccttggggta 22780110  T
Q  128 gtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||    
T  22780111 gtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttga 22780210  T
Q  228 attatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaag 327  Q
    | ||| | || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||    
T  22780211 agtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaag 22780310  T
Q  328 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22780311 ctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Original strand, 17287584 - 17287917
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| || || | ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17287584 agaggctcttgtctcgtgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagggttt-gctatctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagca 17287682  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| |    
T  17287683 ttgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagt 17287782  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    || | || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17287783 ataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctg 17287882  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287883 catgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18457058 - 18456735
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacct 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  18457058 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgttcaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaacct 18456960  T
Q  121 tggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgca 219  Q
    ||||| |||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  |||| |||    
T  18456959 tggggcagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgca 18456861  T
Q  220 ttacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatt 319  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  18456860 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatt 18456762  T
Q  320 taactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18456761 taactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34963435 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Original strand, 16920412 - 16920751
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  | ||| |||| | || |  ||||||||||| |    
T  16920412 atggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgtt-ggattttgcgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaaccct 16920510  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| |  |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  16920511 tgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcatt 16920609  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttattt 320  Q
    |||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| | | |||||||||  |||||||||||||||   |||||||| || || || |||| |||||||    
T  16920610 acttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtttgttattt 16920706  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  16920707 aactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattat--atgtgaaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20556992 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541073
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1541011 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22831839 - 22831503
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||| | | ||  ||||||||||| | ||||    
T  22831839 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccgagaaacagagtgacttgtt-ggattttgcgacctttgtcgcacgattcgtcgagagttgaacccttgggt 22831741  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  22831740 agaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttg 22831642  T
Q  227 aattatgaatgtata-at-tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaac 323  Q
    ||  |||  |||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||   | | | || || ||||| || ||||||||||||    
T  22831641 aagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaac 22831545  T
Q  324 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  22831544 taagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 198 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||  || |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1595611 gt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 at-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25644656 - 25644335
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagt- 129  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |   |||| ||| |  ||||| ||||||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||     
T  25644656 agaggccctcgcctcgcgagttgcccggtttcagaatgcttgtttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgctgagagttgaaccttggggtagtt 25644557  T
Q  130 attgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 228  Q
    ||  ||| |  || ||||| ||||| || ||||||||||||| | || | ||  ||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25644556 ataaagattatat-atgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaa 25644458  T
Q  229 ttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgt-tgttatttaactaag 327  Q
    ||||  ||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||| | |||||| || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  25644457 ttatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaag 25644358  T
Q  328 ctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25644357 ctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656629
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25656691 g-ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  212 tatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg 311  Q
    |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctg 18461930  T
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 246 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16496363 - 16496244
Alignment:
Q  246 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496363 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16496264  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  16496263 gttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  219 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttat 318  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 346
Target Start/End: Original strand, 18821795 - 18821946
Alignment:
Q  193 ttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttc 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||| ||||| |||| ||||||     
T  18821795 ttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgttttt 18821892  T
Q  292 gtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821893 gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 25603164 - 25603478
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||  |   |||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  25603164 atggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctagtctagaacagagtgcattgtgaggactt-gcgatctgtgtcgcatgagttgcttagagttgaacctt 25603262  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     ||||||  || ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  25603263 tgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacatt 25603362  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    ||||||| | | | || ||||||||||||| | ||| ||  |  ||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| || || || |||||||| |||    
T  25603363 acttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaatta 25603461  T
Q  322 actaagctgcatgagtc 338  Q
    ||||||  |||||||||    
T  25603462 actaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20109318 - 20109140
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgtt--atacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 284  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||     
T  20109318 tgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgt 20109219  T
Q  285 tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||| | |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109218 tgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  190 tgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 289  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 35245661  T
Q  290 tcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
      |||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35245660 --gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 25611502 - 25611816
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |   |||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  25611502 atggagagcagaggctctcgcctcgcgagctagtctagaacagagtgcattgtgaggactt-gcgatctgtgtcgcatgagttacttagagttgaacctt 25611600  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     ||||||  ||  |||||||||| |||||| |  | ||||| |||||||||||||| ||| | |   |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  25611601 tgggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacatt 25611700  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    ||||||| | | | || ||||||||||||| | ||| ||  |  ||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| || || || |||||||| |||    
T  25611701 acttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaatta 25611799  T
Q  322 actaagctgcatgagtc 338  Q
    ||||||  |||||||||    
T  25611800 actaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652199
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  19652218 ctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 365
Target Start/End: Original strand, 8227367 - 8227632
Alignment:
Q  101 agttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgat 199  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| |||| ||    
T  8227367 agttgttgagagttgaaccttagggtagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataat 8227466  T
Q  200 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 299  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  8227467 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactg 8227565  T
Q  300 tctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
     ||  |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  8227566 cctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 156
Target Start/End: Original strand, 18821598 - 18821731
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  18821598 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctt 18821696  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaatta 156  Q
    ||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||||    
T  18821697 ggggtagcattaagacttgaatatgatattaatta 18821731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 304 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  304 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561303
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||  || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1561320  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  1561319 gttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496592
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
      |||||||||||||||    
T  28496576 tttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29809003
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
      |||||||||||||||    
T  29808987 tttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Original strand, 27333241 - 27333339
Alignment:
Q  267 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27333241 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Original strand, 27393981 - 27394079
Alignment:
Q  267 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27393981 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 11185839 - 11185524
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  | ||| |||   |||||  ||  | | ||| | ||||    
T  11185839 gagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccagaaacatagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcatgggttgtcgaggatcggacccttgggt 11185741  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| |||||||||  ||| |||||   |||||||||||| ||  |||| | ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  11185740 aggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttg 11185642  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaacta 325  Q
    ||  |||  ||||||    ||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||    |||||||||| ||||||||||||    
T  11185641 aagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttgttatttaacta 11185545  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11185544 agctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019408
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||  | ||||| || |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||| |||  |||||||||||||    
T  23019429 ctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 338
Target Start/End: Original strand, 15041430 - 15041644
Alignment:
Q  123 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatta 222  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||| ||| || | ||||| |||  ||||||    
T  15041430 gggtagtaatgagacctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatg-tatgtgcatta 15041528  T
Q  223 cttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaa 322  Q
    |||||  | | | || ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||   ||| || || |  | |||||||||||    
T  15041529 cttgagattttattgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaa 15041628  T
Q  323 ctaagctgcatgagtc 338  Q
    ||||| ||||||||||    
T  15041629 ctaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||| | ||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  344 aagttga 350  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 183
Target Start/End: Original strand, 5834367 - 5834436
Alignment:
Q  114 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgt 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  5834367 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 5834436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20177165 - 20177096
Alignment:
Q  114 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgt 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  20177165 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 20177096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 183
Target Start/End: Original strand, 22158826 - 22158895
Alignment:
Q  114 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgt 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22158826 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 22158895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 350
Target Start/End: Original strand, 9098518 - 9098620
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  |||||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098518 gttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt-gcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T
Q  347 ttga 350  Q
    ||||    
T  9098617 ttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 365
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  318 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 363
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848114
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 256
Target Start/End: Original strand, 25642126 - 25642196
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  25642126 tgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 353
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185930
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||  || | |||||| || ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4185925  T
Q  349 gatga 353  Q
    |||||    
T  4185926 gatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186379
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||  || | ||||||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4186384  T
Q  349 gatga 353  Q
    |||||    
T  4186383 gatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23992480 - 23992429
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  23992480 ttgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443068
Alignment:
Q  293 tatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    ||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19863162 - 19863089
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 253  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  19863162 tgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaatgattgagatgttg 19863089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19873169 - 19873120
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873169 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19873304 - 19873231
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 253  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  19873304 tgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaatatgaatgaatgattgagatgttg 19873231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 353
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738666
Alignment:
Q  313 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 353  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga 4738666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18453467 - 18453419
Alignment:
Q  80 ttttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtag 128  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18453467 ttttgcgatctttgtcgcacaagatgttatgagttgatccttggggtag 18453419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  324 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 368  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  295 tactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  295 tactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Original strand, 16378 - 16721
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16378 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgccttgttgggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaggagttgaacctt 16477  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16478 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcatt 16577  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16578 acttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttattta 16677  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16678 actaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 50209996 - 50210333
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50209996 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctttgggt 50210095  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50210096 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttg 50210195  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  50210196 aattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 50210295  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210296 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34510118 - 34509783
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  34510118 gagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcatgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagggttgaaccttggggt 34510019  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34510018 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttg 34509919  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34509918 agatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 34509819  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509818 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22532610 - 22532269
Alignment:
Q  24 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttgg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||| || |||| ||||||||||||||     
T  22532610 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaaccttga 22532511  T
Q  124 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattac 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22532510 ggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattac 22532411  T
Q  224 ttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaac 323  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  22532410 ttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 22532311  T
Q  324 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22532310 taaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 27250513 - 27250850
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27250513 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtcccttgttat-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggt 27250611  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27250612 agcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttg 27250711  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  27250712 aataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaa 27250811  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250812 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21027017 - 21026680
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||| ||  || |||||| ||||    
T  21027017 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggt 21026919  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt- 225  Q
    || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  21026918 agcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttg 21026819  T
Q  226 -gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaact 324  Q
     |||||||   || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| || ||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||    
T  21026818 agaattat--ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaact 21026721  T
Q  325 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026720 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20135530 - 20135188
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | ||| | || ||||||| |||||||||||||    
T  20135530 atggcgagcagaagctctcacctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgtacgagttgttgagagttgaacctt 20135431  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  20135430 agggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcatt 20135331  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    ||||||| | | | || ||| || |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||  ||| || || || | ||||| ||||    
T  20135330 acttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgttta 20135231  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20135230 actaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 22354360 - 22354616
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||    
T  22354360 agaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgacttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttaggtagta 22354458  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||      
T  22354459 ttaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaaga 22354558  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt 288  Q
    ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  22354559 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 433350 - 433012
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   || | ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  433350 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttgcaaaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaacctt 433251  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    |||||||   |||   |||   || || ||||| || |||||| |||||| |||| | ||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||    
T  433250 ggggtagctatgaatattataaataatattaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcat 433151  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||   |||||  |||||||    
T  433150 tacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctg---tgttgccgttattt 433054  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  433053 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21840829 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 364
Target Start/End: Original strand, 22468535 - 22468816
Alignment:
Q  82 ttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgt 181  Q
    ||||||| ||||||||| || | | | |||| || ||| | ||||||||||||||| |  ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22468535 ttgcgatatgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtattgagaccttttgaagttggtaattataatctgtgaagctgtttaagatgt 22468634  T
Q  182 gttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 281  Q
    | || |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22468635 gctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtca 22468733  T
Q  282 tgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    || |||| | |||  ||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  22468734 tgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21347124 - 21346961
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21347124 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21347025  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21347024 tg-ctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 365
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213027
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212961 tgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707167
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21707229 at-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711709
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21711771 at-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 22355958 - 22356159
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgcc-ttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttgggg 125  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||     
T  22355958 gagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttag-attttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggga 22356055  T
Q  126 tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 224  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22356056 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22356155  T
Q  225 tgaa 228  Q
    ||||    
T  22356156 tgaa 22356159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Original strand, 22357644 - 22357845
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgcc-ttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttgggg 125  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||||| ||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||     
T  22357644 gagcagaggct-tcgcatcgcgagtgacctagaaacagagtgacattgttag-attttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggga 22357741  T
Q  126 tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtg-ttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 224  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22357742 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22357841  T
Q  225 tgaa 228  Q
    ||||    
T  22357842 tgaa 22357845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21342259 - 21342090
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21342259 tgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21342160  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 368  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21342159 tg-ctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 365
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Original strand, 38801179 - 38801508
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| | || ||||||    ||||||||| | |||||| |    
T  38801179 agaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgtacgagttgtcggaagttgaacccttgggtagga 38801277  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    || ||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||  |||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||      
T  38801278 ttaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaaga 38801376  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagct 329  Q
    || | ||||||  | | |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   | | |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38801377 ataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgtt---gcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagct 38801473  T
Q  330 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  38801474 gcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |   || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  299 gtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 gt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 368
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860177
Alignment:
Q  254 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 15860162  T
Q  354 agatgatgatgtcca 368  Q
    ||||||||| |||||    
T  15860163 agatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16758942 - 16758664
Alignment:
Q  74 ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 173  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||   ||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16758942 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgtt 16758843  T
Q  174 -taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 272  Q
     |||  ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16758842 ataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatatt 16758744  T
Q  273 attatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
     |||| ||||||  || ||| | |||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758743 gttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 35260866 - 35261180
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttg-ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagt 129  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  ||| | | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35260866 agaggccctcgcctcgcgagtttcccagttacaaaataccttgcttaggattttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgaacattggggtagt 35260965  T
Q  130 attg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
    | || ||| |  || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||| |||| ||  ||| ||||| | || ||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  35260966 aatggagattgtat-atgatattaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttga 35261064  T
Q  228 attatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaa 326  Q
    |||||| ||| ||  ||||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || ||||| |||| |||  ||||||||    
T  35261065 attatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaa 35261160  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35261161 gctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 239 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754052
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    ||  ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921986
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  22921967 ctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 263 - 365
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  263 atttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  363 tgt 365  Q
    |||    
T  20847273 tgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603652
Alignment:
Q  149 gttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Original strand, 20847003 - 20847151
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| |||| ||||||| ||  || |||||| ||||    
T  20847003 gagcagaggctcttgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggt 20847101  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaa 176  Q
    || ||| ||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20847102 agcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgtttaa 20847151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 346
Target Start/End: Original strand, 21861513 - 21861672
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  21861513 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21861612  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| | |||||| || ||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861613 tttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 346
Target Start/End: Original strand, 21896199 - 21896358
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  21896199 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21896298  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| |||||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896299 tttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33681184 - 33681011
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  33681184 tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 33681086  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
     ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33681085 attt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248283
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  349 gatgaagatgatg 361  Q
    ||||| |||||||    
T  20248295 gatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21714732 - 21714546
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatat-----tat 274  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |   ||  |||||||||     |||    
T  21714732 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttatat 21714633  T
Q  275 tatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
     |||||||  |||| | |||  ||| || || || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714632 gatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Original strand, 14295557 - 14295672
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14295557 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaat 14295655  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  14295656 gttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 304 - 364
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454673
Alignment:
Q  304 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22237773 - 22237631
Alignment:
Q  218 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gtt 316  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || || ||| | |||| |||    
T  22237773 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgtt 22237676  T
Q  317 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22237675 atttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Original strand, 52927993 - 52928076
Alignment:
Q  267 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927993 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20918719 - 20918620
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918719 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20918621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 346
Target Start/End: Original strand, 50614070 - 50614219
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtat 295  Q
    |||||||||||   |||| ||||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |    
T  50614070 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgt 50614167  T
Q  296 actgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614168 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 346
Target Start/End: Original strand, 50621898 - 50622047
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtat 295  Q
    |||||||||||   |||| ||||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |    
T  50621898 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgt 50621995  T
Q  296 actgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621996 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26065274 - 26065176
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttg-ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtag 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||    
T  26065274 agaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaataccttgtttagggttttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagtttatccttggggtag 26065176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 346
Target Start/End: Original strand, 41049990 - 41050138
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtata 296  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||  ||||    
T  41049990 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatata 41050087  T
Q  297 ctgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||| || ||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050088 ctgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 33681352 - 33681301
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttg 73  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  33681352 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttg 33681301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 346
Target Start/End: Original strand, 21533932 - 21533974
Alignment:
Q  304 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533932 tgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21161769 - 21161720
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  21161769 ttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 338
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788136
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |  ||| | || || ||| ||||||||||||  || | |||||||||  | |||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtc 21788078  T
Q  281 atgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 338  Q
    ||| |||| | ||   ||| || || || | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21788079 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21162108 - 21162056
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgt 74  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||    
T  21162108 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcaaccctgaaccagaatgccttgt 21162056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21342384 - 21342332
Alignment:
Q  74 ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||| |||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21342384 ttaggtttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 21342332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21347249 - 21347197
Alignment:
Q  74 ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||| |||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21347249 ttaggtttttgcgatcgttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 21347197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39814 - 39479
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39814 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggt 39715  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39714 agtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttg 39615  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39614 aattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 39516  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39515 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 363
Target Start/End: Original strand, 74998 - 75333
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  74998 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagggttgaaccttggggt 75097  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  75098 agtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttg 75197  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  75198 aattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 75296  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  75297 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 27 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6759594 - 6759255
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6759594 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggt 6759495  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6759494 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaatt 6759395  T
Q  226 gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaacta 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6759394 gaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaacta 6759298  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759297 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 16092124 - 16092463
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092124 gagcagaggctctcgcctcccgagtgacccagaaacagagtgccctgttaggattttgcgatctgtgtcacacaagttgttaagagttgaaccttggggt 16092223  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092224 aatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 16092323  T
Q  226 gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaacta 325  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16092324 aaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaacta 16092423  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092424 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 28648827 - 28649164
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28648827 gagcagaggctctcgccttgcgcatgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 28648926  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28648927 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttg 28649026  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  28649027 aattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaa 28649126  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649127 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22875403 - 22875065
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875403 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttagggctttgcgatctatgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 22875304  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875303 agtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 22875204  T
Q  226 gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaacta 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  22875203 gaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgctatttaacta 22875105  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875104 agctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22627073 - 22626736
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22627073 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgatctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 22626974  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22626973 agtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttg 22626874  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  22626873 aagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 22626775  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626774 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 18818193 - 18818530
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||  || ||||    
T  18818193 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaatttagggt 18818291  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18818292 agtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttg 18818391  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  18818392 aagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 18818491  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818492 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 365
Target Start/End: Original strand, 21923709 - 21924049
Alignment:
Q  24 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttgg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| || | ||| ||| ||||||||||||||     
T  21923709 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcccgagtagttgagagttgaaccttga 21923807  T
Q  124 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattac 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||  |||||||    
T  21923808 ggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattac 21923907  T
Q  224 ttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaac 323  Q
    ||||| ||| | || ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  21923908 ttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaac 21924007  T
Q  324 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924008 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20536541 - 20536208
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  20536541 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagtgttgaaccttggggtagta 20536443  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      
T  20536442 ttaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaga 20536343  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  20536342 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctg 20536243  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536242 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23406714 - 23406379
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||| |||| || |||||||||| ||||| || ||    
T  23406714 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttagg-ttttgtgacctttgttgcacgagttattgagagttgaactttgggataata 23406616  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  23406615 ttgggacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagt 23406516  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagc 328  Q
    || | || ||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  23406515 ataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 23406416  T
Q  329 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406415 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 46 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7373088 - 7372778
Alignment:
Q  46 gcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgat 145  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||     
T  7373088 gcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgag 7372990  T
Q  146 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| ||| | || ||| ||     
T  7372989 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtataattgaatattta 7372898  T
Q  246 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372897 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7372798  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7372797 gttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 18879021 - 18879352
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  18879021 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttag-attttgcggcctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggat 18879119  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18879120 agcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttg 18879218  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||     |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  18879219 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 18879313  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879314 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Original strand, 21918779 - 21919121
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||  ||||||  ||||||||||| |    
T  21918779 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtcgagagttgaaccct 21918877  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21918878 tgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcatt 21918976  T
Q  222 acttgaattatga-atgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    |||||||  || |  || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  21918977 acttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttattt 21919076  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21919077 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23648888 - 23648554
Alignment:
Q  30 cagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagt 129  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23648888 cagaggctctcgcctcgtgagtaacccagaaacagagtgacttgttaggtttatgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagt 23648789  T
Q  130 attgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaat 229  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||     
T  23648788 attaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaag 23648689  T
Q  230 tatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagct 329  Q
    | | | || ||| || |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| | |||  ||| || ||||| | |||||| ||||||||| |    
T  23648688 ttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagtt 23648589  T
Q  330 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23648588 gcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31971592 - 31971257
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  |||| |||||||| ||||    
T  31971592 gagcagaggctgtcacctcgcgagcgacccagaaatagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagctgaacctttgggt 31971494  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31971493 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttg 31971395  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  31971394 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 31971296  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31971295 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 365
Target Start/End: Original strand, 45130793 - 45131117
Alignment:
Q  38 ctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagac 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||| ||| | |||||| ||| ||||    
T  45130793 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttattag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggtaggattaagac 45130891  T
Q  138 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 237  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || | ||    
T  45130892 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaataattg 45130990  T
Q  238 tataattgagatgttgttg-acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgag 336  Q
    ||||  | |||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45130991 tatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag 45131088  T
Q  337 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||    
T  45131089 tcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 16199430 - 16199765
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||| | ||||    
T  16199430 gagcagacgctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttatt-ggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggt 16199528  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  16199529 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttg 16199627  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||  ||   ||||||  | |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16199628 aagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaacta 16199725  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16199726 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41598527 - 41598188
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||| |  ||||||||||||||| | || ||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  41598527 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgccgcacgagtcgttgagagttgaacctt 41598428  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    ||||||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||| ||| |||| | ||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||    
T  41598427 ggggtagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcat 41598329  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    ||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||     
T  41598328 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttattc 41598230  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41598229 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 227
Target Start/End: Original strand, 25362919 - 25363123
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || | |||||||  | | | |||| ||||||| |||||||||||||    
T  25362919 atggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccggaaacagagtgccttgtgag-actttgcgacctttcttgcacgagttgttgagagttgaacctt 25363017  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  25363018 tgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcatt 25363117  T
Q  222 acttga 227  Q
    ||||||    
T  25363118 acttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 gt-tgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| |||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219717
Alignment:
Q  219 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||| | |||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 26219761  T
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  219 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat---gtcatgatgttttcgtat 295  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  296 actgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 gt-tgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 365
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389571
Alignment:
Q  144 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 243  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||      
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21389451  T
Q  244 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 342  Q
    | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389452 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T
Q  343 taagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21389549 taagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  149 gttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21395986  T
Q  249 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21395987 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21396083  T
Q  348 tgatgaagatgatgatgt 365  Q
    || |||||||||||||||    
T  21396084 tgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 365
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  149 gttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21790479  T
Q  249 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21790480 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21790576  T
Q  348 tgatgaagatgatgatgt 365  Q
    || |||||||||||||||    
T  21790577 tgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 240 - 368
Target Start/End: Original strand, 19937046 - 19937174
Alignment:
Q  240 taattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 338  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937046 taattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19937144  T
Q  339 ggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 368  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19937145 ggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 45290694 - 45290853
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||  |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45290694 tgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 45290793  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290794 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 346
Target Start/End: Original strand, 19801382 - 19801527
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19801382 tgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 19801480  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801481 gt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 365
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  162 tgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttg 261  Q
    ||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| |||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  262 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 360  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  361 gatgt 365  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    | || | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15070681 - 15070571
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070681 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15070583  T
Q  338 cggtctaagttg 349  Q
    ||||||||||||    
T  15070582 cggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
           | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 365
Target Start/End: Original strand, 38855250 - 38855372
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855250 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38855348  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  38855349 ctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 358
Target Start/End: Original strand, 13507914 - 13508199
Alignment:
Q  74 ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt- 172  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||| |||      
T  13507914 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaatcgtgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaaactgaa 13508013  T
Q  173 ttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 272  Q
    ||| | ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  13508014 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatatt 13508113  T
Q  273 attatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    ||||| |||||||||| | | ||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13508114 attatatcatgatgttgt-gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6520388  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  6520387 gttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285601
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  21285620 ctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 358
Target Start/End: Original strand, 13597446 - 13597731
Alignment:
Q  74 ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgt- 172  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||| |||      
T  13597446 ttaggtttttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaatcgtgggatagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaaactgaa 13597545  T
Q  173 ttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 272  Q
    ||| | ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||    
T  13597546 ttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatatt 13597645  T
Q  273 attatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||  | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13597646 attatatcatgatgtttt-gcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 365
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  193 ttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcg 292  Q
    |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  293 tatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
     |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866395
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140916
Alignment:
Q  262 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 17140921  T
Q  361 gatgt 365  Q
    |||||    
T  17140920 gatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21490995
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  21491011 gttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 244 - 361
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355815
Alignment:
Q  244 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 342  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26355699 tgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 26355796  T
Q  343 taagttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  26355797 taagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673716
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  342 ctaagttgatga 353  Q
    ||||||||||||    
T  21673727 ctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20498740 - 20498581
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |     
T  20498740 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgcta 20498641  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||   |||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498640 tttt-acatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 23760843 - 23760961
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||| |||||||| |||   |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760843 ttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttac-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 23760941  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  23760942 ctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  315 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  315 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 350
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt-ttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  || || | |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  345 agttga 350  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 346
Target Start/End: Original strand, 17439449 - 17439609
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga-- 284  Q
    ||||||| || |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||      
T  17439449 tgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaac 17439547  T
Q  285 tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||  | ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439548 tgtttt-atgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 363
Target Start/End: Original strand, 18678075 - 18678221
Alignment:
Q  217 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgtt 316  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||| || || || | |||||    
T  18678075 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 18678174  T
Q  317 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  18678175 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37116515 - 37116366
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtat 295  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |    
T  37116515 atgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgt 37116418  T
Q  296 actgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116417 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Original strand, 17266991 - 17267096
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||   |||||  | ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  17266991 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgtttt-atgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 17267089  T
Q  340 gtctaag 346  Q
    |||||||    
T  17267090 gtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32121880 - 32121734
Alignment:
Q  217 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgtt 316  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||| || || || | |||||    
T  32121880 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 32121781  T
Q  317 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121780 atttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22525618 - 22525579
Alignment:
Q  305 gttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525618 gttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 128
Target Start/End: Original strand, 22963249 - 22963303
Alignment:
Q  74 ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtag 128  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22963249 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgacccttggggtag 22963303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 284
Target Start/End: Original strand, 40492850 - 40492891
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  40492850 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 201
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgt 201  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 27 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14038986 - 14038653
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14038986 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgctaagagttgaaccttggggt 14038887  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14038886 agtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttg 14038787  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  14038786 aaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaa 14038687  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 360  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14038686 gctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 27 - 362
Target Start/End: Original strand, 16377305 - 16377639
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgt-taagagttgaaccttgggg 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||| |||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  16377305 gagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacatagtgccttgttaggattttgctacctttgttgcacgagttttatgagagttgaaccttgggg 16377404  T
Q  126 tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377405 tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 16377504  T
Q  226 gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaacta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16377505 gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 16377602  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377603 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22636771 - 22636437
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22636771 gagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggt 22636673  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22636672 agtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttg 22636574  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22636573 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaa 22636474  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636473 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44053166 - 44052829
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  44053166 gagcagagactctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggat 44053068  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44053067 agcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttg 44052968  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |    
T  44052967 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactga 44052868  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44052867 gctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 38 - 365
Target Start/End: Original strand, 16239764 - 16240090
Alignment:
Q  38 ctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagac 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16239764 ctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagtattaagac 16239863  T
Q  138 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||| | ||    
T  16239864 ttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattg 16239963  T
Q  238 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16239964 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagt 16240062  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16240063 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12903090 - 12902757
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| || |||| ||||||||||||| |||||| |    
T  12903090 agaggctcccgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctttgggtagga 12902992  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  12902991 ttaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaata 12902892  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    ||   || ||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12902891 atatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 12902792  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902791 catgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7894038 - 7893703
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  | ||| |||  |||||   ||||||||||||||||||    
T  7894038 gagcagaggctctcgcctcacgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcatgagttgccgagagttgaaccttggggt 7893939  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  7893938 aatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttg 7893842  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7893841 aagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaa 7893742  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893741 gctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7089219 - 7088877
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||  ||||||  |||||||||||||    
T  7089219 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgtcttgttag-attttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaacctt 7089121  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     | |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7089120 tgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcatt 7089021  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    |||||||| ||   || |||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  7089020 acttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttattta 7088921  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088920 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 358
Target Start/End: Original strand, 23374143 - 23374473
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  | ||| |||| ||||||| ||  || |||||| ||||    
T  23374143 gagcagaggctctcgcctcgcgggtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcaacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggt 23374241  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt- 225  Q
    || ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  23374242 agcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttg 23374341  T
Q  226 -gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaact 324  Q
     |||||||   || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  23374342 agaattat--ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 23374439  T
Q  325 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23374440 aagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 365
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270356
Alignment:
Q  148 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgag 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | || ||| || ||    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 16270239  T
Q  248 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  16270240 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  348 tgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16270339 tgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 362
Target Start/End: Original strand, 44928701 - 44929042
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  44928701 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaacctt 44928800  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    | ||||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||  ||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||    
T  44928801 gtggtagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcat 44928900  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  44928901 tacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattt 44929000  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44929001 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Original strand, 14053081 - 14053422
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||| |    
T  14053081 atggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccct 14053179  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14053180 tgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcatt 14053278  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgag-atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatt 319  Q
    |||||||  ||   |||||   | || |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14053279 acttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatt 14053376  T
Q  320 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  14053377 taactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15091234 - 15091093
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15091234 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagtttctaagagttgaaccttggggt 15091135  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaag 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15091134 agtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||          |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  249 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  349 gatgaagatgatga 362  Q
    ||| ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 280  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| | || ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  281 atgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280316
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||          |  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatctatatttgaga 14280429  T
Q  249 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280428 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  349 gatgaagatgatga 362  Q
    ||| ||||||||||    
T  14280329 gattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44102553 - 44102214
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||| | | |  ||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||| |||||||||||||    
T  44102553 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatacttgtttaggattttgcgatctttgtagcacgagtcgttgagagttgaacctt 44102454  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    ||| ||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| || || ||||  |||||||||||  |||| ||||    
T  44102453 gggatagttatgaatattatatataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcat 44102355  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    ||||||||||||   || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  44102354 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttattt 44102256  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44102255 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12407 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  193 ttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcg 292  Q
    |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  293 tatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 227
Target Start/End: Original strand, 17047851 - 17048055
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  17047851 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgag-actttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctt 17047949  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17047950 tgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcatt 17048049  T
Q  222 acttga 227  Q
    ||||||    
T  17048050 acttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 368  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239581
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18239519 gt-tgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3096980 - 3096781
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  3096980 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggt 3096882  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  3096881 aggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttg 3096783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  193 ttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  293 tatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  219 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttat 8574941  T
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8574942 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23803365 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463968 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Original strand, 52242980 - 52243302
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  52242980 agaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgtaaagagttgaactttggggtagta 52243079  T
Q  131 ttg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 228  Q
     || ||| |  || | ||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |    
T  52243080 atgaagattgtat-aagatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgga 52243178  T
Q  229 ttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||||  ||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  52243179 ttatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 52243277  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  52243278 agctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 246 - 365
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873488
Alignment:
Q  246 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52873468  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52873469 gttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15355424 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15367856 - 15367690
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| || ||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15367856 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15367757  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15367756 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15402869 - 15402703
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| || ||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15402869 tgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15402770  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15402769 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  125 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 224  Q
    |||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattact 17046626  T
Q  225 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaac 323  Q
    ||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    ||||||  || ||||| || ||||||||||||    
T  17046625 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---ctatactacctatgttgctgtttgttatttaac 17046529  T
Q  324 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17046528 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 101 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15371466 - 15371202
Alignment:
Q  101 agttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgat 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| ||||  |    
T  15371466 agttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatatt 15371368  T
Q  200 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    ||||||||||  |||| || ||| |||||||||   || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15371367 gtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15371268  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15371267 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 101 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15373747 - 15373483
Alignment:
Q  101 agttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgat 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| ||||  |    
T  15373747 agttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatatt 15373649  T
Q  200 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    ||||||||||  |||| || ||| |||||||||   || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15373648 gtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15373549  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15373548 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||            
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-------- 7641283  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7641284 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 201 - 346
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  201 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgt 300  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagt 21815686  T
Q  301 ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815687 -tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 239 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15370144 - 15370018
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370144 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15370046  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15370045 cagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16223796 - 16223532
Alignment:
Q  101 agttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgat 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||   ||| | | ||| ||||| || ||||||||||||| |||| | ||   || ||||| ||||  |    
T  16223796 agttgttgagagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacgatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatgtgatgttg-ttatatt 16223698  T
Q  200 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    ||||||||||  |||| |  ||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16223697 gtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16223598  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  16223597 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 283
Target Start/End: Original strand, 15464716 - 15464970
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagt 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15464716 agaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgacttgtttaggattttgcaatctttgtcgcacaagttgttatgagttgaaccttggagtagt 15464815  T
Q  130 attgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 228  Q
    | ||||| ||    ||||| ||||| || || |||||||||| | || | ||  ||| ||| | |||  || |||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  15464816 aatgagaattgtatatgatattaatgatgatttgtgaagctgatatatgatgatttgatgtcgtttaaaatttgatataattgtatatgcaatacttgaa 15464915  T
Q  229 ttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 283  Q
    ||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15464916 ttatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 346
Target Start/End: Original strand, 13794 - 13953
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  13794 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 13893  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| | |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894 tttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 255 - 365
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706409
Alignment:
Q  255 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 353  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39706397  T
Q  354 agatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||    
T  39706398 agatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Original strand, 43198496 - 43198661
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga-- 284  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||      
T  43198496 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaat 43198595  T
Q  285 tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198596 tgtttt-gcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 279 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  279 tcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6190782 - 6190481
Alignment:
Q  44 tcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatg 143  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| || |||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||| |      
T  6190782 tcgcgagtgacccaaaaatagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagctgtcgagagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaat 6190684  T
Q  144 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgat-tatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 242  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||||| | |   ||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||    
T  6190683 atgatattaattacaattcgtgaagctgtt-atgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataa 6190586  T
Q  243 ttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 340  Q
    |||||||| |||||  ||| |||| |||||| |||||||||| | |||| | || ||| || ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  6190585 ttgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcgg 6190487  T
Q  341 tctaag 346  Q
    ||||||    
T  6190486 tctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    ||  ||||| | ||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 239 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774011
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15551932 - 15551817
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| ||||||||  || | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551932 gttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15551834  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  15551833 gttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||     |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    | || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 350
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  344 aagttga 350  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8846460 - 8846360
Alignment:
Q  261 gcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  8846460 gcattcgatattgttatctcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatga 8846362  T
Q  360 tg 361  Q
    ||    
T  8846361 tg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7799034 - 7798975
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  7799034 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgtcttgttagg-ttttgcga 7798975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Original strand, 46640453 - 46640558
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 339  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  46640453 ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 46640551  T
Q  340 gtctaag 346  Q
    |||||||    
T  46640552 gtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Original strand, 21815409 - 21815511
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttg-ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacct 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||||  |||||| ||||||||||||||| |   |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  21815409 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaga-agccttgtttaggattttgcgatcttcatcgcacgagtcgttgagagttgaacct 21815507  T
Q  121 tggg 124  Q
    ||||    
T  21815508 tggg 21815511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  295 tactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Original strand, 20157130 - 20157182
Alignment:
Q  83 tgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgag 135  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20157130 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 20157182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24029022 - 24028970
Alignment:
Q  83 tgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgag 135  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24029022 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 24028970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 128
Target Start/End: Original strand, 32306787 - 32306879
Alignment:
Q  38 ctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggatt-ttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtag 128  Q
    ||||||||||||| | | |||| ||||| | ||||||| ||| || ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  32306787 ctcgcctcgcgagctgcacagagacagactaccttgtttagggttcttgcgatttttgtcgcacgagatgttatgagttgacccttggggtag 32306879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4850 - 4508
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4850 atggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 4751  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4750 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 4651  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  4650 acttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttattta 4551  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4550 actaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12432 - 12090
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12432 atggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 12333  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12332 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 12233  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  12232 acttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttattta 12133  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12132 actaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22384 - 22042
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384 atggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccagaaacagggtacctagttaggattttgcgatcagtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 22285  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 22185  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  22184 acttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttattta 22085  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22084 actaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 35 - 362
Target Start/End: Original strand, 3564155 - 3564482
Alignment:
Q  35 gctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattga 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3564155 gctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagtttaaccttggggtagtattga 3564254  T
Q  135 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564255 gacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatga 3564354  T
Q  235 atgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3564355 atgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 3564454  T
Q  335 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564455 agtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38227818 - 38227481
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38227818 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgccttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaaccttggggt 38227719  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||    
T  38227718 agtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattg 38227619  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38227618 aagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaa 38227520  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227519 gctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9509522 - 9509189
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||  ||||||  |||||||||||||||| ||| |    
T  9509522 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcaagagttgtcgagagttgaaccttgggatagca 9509424  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||      
T  9509423 ttaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaaga 9509324  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  9509323 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctg 9509224  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509223 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12699169 - 12698831
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  12699169 gagcagaggctctcacctcgtgagtgacccagaaacaaagtgacttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgtcgatagttgaaccttggggt 12699071  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12699070 agtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttg 12698971  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaacta 325  Q
    ||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  12698970 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 12698871  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698870 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 350
Target Start/End: Original strand, 15143815 - 15144143
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| ||||||||||||||     
T  15143815 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagttgaacctc 15143914  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15143915 ggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcat 15144014  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||| | | ||||||    ||||| |||||||||||    
T  15144015 tacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttattt 15144113  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144114 aactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10589375 - 10589039
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | | | |||| ||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  10589375 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgaccttttttgcacgagttgtctagagttggacctttgggt 10589277  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  10589276 aggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattgcttg 10589178  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   || | | |  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  10589177 aagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaa 10589078  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  10589077 gctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26212329 - 26211995
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaa-cagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagt 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||  || |||||| ||||||     
T  26212329 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaacagagtgatttgttag--ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagc 26212232  T
Q  130 attgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt--ga 227  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||  ||    
T  26212231 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgaga 26212132  T
Q  228 attatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaag 327  Q
    |||||   || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  26212131 attat--ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 26212034  T
Q  328 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 365  Q
     || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212033 ttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 16386031 - 16386369
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  16386031 gagcagtggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgtccagagttgaacctttgggt 16386129  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |  ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  16386130 aacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttg 16386229  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    |    ||  || ||| || |||||||| |||  | || |||||||  |||||||||| || ||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  16386230 agaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaacta 16386329  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16386330 agctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | || ||| || ||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  350 atgaagatgatga 362  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40443726 - 40443393
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||  | ||| |||| ||||||  |||| |||||| | ||||    
T  40443726 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttatt-ggattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaacccttgggt 40443628  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40443627 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttg 40443529  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||  | ||||| || ||||||||||||||    
T  40443528 aagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaacta 40443431  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40443430 agctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 199 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273392
Alignment:
Q  150 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgaga 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||          |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata----------cttattacttgaattatgaatgtata-ttgaga 48273506  T
Q  249 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48273505 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  349 gatgaagatgatga 362  Q
    ||| ||||||||||    
T  48273405 gattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 365
Target Start/End: Original strand, 27847618 - 27847951
Alignment:
Q  28 agcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggta 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||| | |||||    
T  27847618 agcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggta 27847716  T
Q  128 gtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
    | ||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  27847717 ggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttga 27847815  T
Q  228 attatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaa 326  Q
    |  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||   ||| |||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  27847816 agaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaa 27847912  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  27847913 gctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Original strand, 2279905 - 2280238
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | ||| ||| |  ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  2279905 agaggccctcgcctcgcgagttgcctagttatagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttgaaccttggggtcgta 2280004  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaat 229  Q
     |||   ||| | ||||| | ||| || ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||    
T  2280005 atgaagattatttatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaat 2280104  T
Q  230 tatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagc 328  Q
    |||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||    
T  2280105 tatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 2280203  T
Q  329 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280204 tgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  456383 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 361
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11393387 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  193 ttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcg 292  Q
    ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  293 tatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16213752 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  201 tgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgt 300  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt 16410120  T
Q  301 ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16410119 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 362
Target Start/End: Original strand, 17061738 - 17062077
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |   ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||| |    
T  17061738 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaaccat 17061837  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    ||||||||  |||   |||   || || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||    
T  17061838 ggggtagttatgaatattacatataatattaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcat 17061936  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatt 319  Q
    ||||||||||||   |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  17061937 tacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactg-ctgagttgctgattgttatt 17062034  T
Q  320 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17062035 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 212 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275175
Alignment:
Q  212 tatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg 311  Q
    |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 24275222  T
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3386395 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898476 tg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 239 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13831495 - 13831373
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831495 ataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactacc-gtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 13831397  T
Q  339 ggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||    
T  13831396 ggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Original strand, 12756494 - 12756817
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacct 120  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  12756494 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacaaaa-gccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaacct 12756592  T
Q  121 tggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgca 219  Q
    |||||||||  |||   ||    || || ||||| || |||||||| |||| |||| | ||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  |||| |||    
T  12756593 tggggtagttatgaatattgtatataatattaatgatgatctgtgatgctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgca 12756691  T
Q  220 ttacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatt 319  Q
    ||||||||||| |   || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  12756692 ttacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgctgttgttatt 12756790  T
Q  320 taactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756791 taactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 239 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13869469 - 13869346
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869469 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13869371  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  13869370 cggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110556
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
             | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110610 ---------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356156
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  299 gt----------ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||           |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26356083 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358608
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  299 gt----------ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||           |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  26358535 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67745
Alignment:
Q  242 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 340  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  341 tctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47831925 - 47831807
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| | | | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831925 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 47831827  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  47831826 gttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 343
Target Start/End: Original strand, 12255578 - 12255892
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12255578 agaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcacacgagttgttgagagttgaattttggggtagta 12255677  T
Q  131 ttg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 228  Q
     || ||| |  || || || ||||| || |||| ||||| |||| |||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  12255678 atgaagattgtataat-atattaatgatgatctatgaagttgttataagatg-attgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaa 12255775  T
Q  229 ttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||||  ||| ||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  12255776 ttatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaattgattt-gcatactgactatgttgttgtttgttatttaacta 12255874  T
Q  326 agctgcatgagtcggtct 343  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  12255875 agctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072913
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495402
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16495419  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  16495418 gttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200786
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18005768 - 18005650
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005768 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18005670  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18005669 ctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014182
Alignment:
Q  252 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  351 tgaagatgatg 361  Q
    ||| |||||||    
T  44014192 tgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 361
Target Start/End: Original strand, 16219719 - 16219834
Alignment:
Q  246 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16219719 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 16219817  T
Q  345 agttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||| || |||||||    
T  16219818 agttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  267 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Original strand, 11996033 - 11996148
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11996033 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagtt 11996131  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  11996132 gttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15755008
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||  || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15754991  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  15754992 gttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 361
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811248
Alignment:
Q  255 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 353  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 811240  T
Q  354 agatgatg 361  Q
     |||||||    
T  811241 tgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 361
Target Start/End: Original strand, 19649317 - 19649606
Alignment:
Q  76 aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 175  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || ||| | |||| || ||| | ||||||||||||||| |||    || ||||| |  |||||||||||| ||| |    
T  19649317 aggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctaaattagaagttaactgcaatctgtgaagcagtt-a 19649415  T
Q  176 agttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattat 274  Q
    |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||  |||||||||| |    
T  19649416 agtgatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgctg-tttttatttgatattgt 19649514  T
Q  275 t-----atgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |     |||||||  |||| | |||  |||||| || || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649515 tatgtgatgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 350
Target Start/End: Original strand, 1867895 - 1868101
Alignment:
Q  144 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataat 243  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||  ||| ||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  |    
T  1867895 atgatattaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtt 1867993  T
Q  244 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 340  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  1867994 tgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcgg 1868091  T
Q  341 tctaagttga 350  Q
    ||||||||||    
T  1868092 tctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 342
Target Start/End: Original strand, 15008284 - 15008597
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggta-g 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    ||| | ||||||| ||| ||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||| | ||| |    
T  15008284 agaggctctcgcctcgcgagttgcccagttgtagaataccttgtttagggttttgcgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgaaccttcgagtatg 15008383  T
Q  129 tattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
     || |||  |  || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||| | || |||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  15008384 aatggaggttgtat-atgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttga 15008482  T
Q  228 attatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaact 324  Q
    |||||  ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||  || |||||||||| |||  ||||||    
T  15008483 attatatatg-atgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgtttta-tatactacctatgttgttgtttgtttattaact 15008579  T
Q  325 aagctgcatgagtcggtc 342  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15008580 aagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 365
Target Start/End: Original strand, 19486600 - 19486865
Alignment:
Q  101 agttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgat 199  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||   ||||| |  || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| |||| ||    
T  19486600 agttgttgagagttgaaccttagggtagttatgaatattaattaaaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataat 19486699  T
Q  200 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 299  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||||||||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  19486700 gtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactg 19486798  T
Q  300 tctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
     || ||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  19486799 cctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgc--ataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  342 ctaagttga 350  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12901431 - 12901338
Alignment:
Q  259 ttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901431 ttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 359
Target Start/End: Original strand, 18154779 - 18154956
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatga 284  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||  |||||||||  |||||| |||     
T  18154779 tgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttt--atttgatatcgttatgtgatgt 18154876  T
Q  285 -----tgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
         |||| | |||  ||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154877 catactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16056662 - 16056615
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttagg 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  16056662 agaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttagg 16056615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  295 tactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 361
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  196 tgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 294  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | | || ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  295 tactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
      ||  || || |  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 361
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  196 tgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 294  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | | || ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  295 tactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
      ||  || || |  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 361
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  196 tgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 294  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | | || ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  295 tactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
      ||  || || |  | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 128
Target Start/End: Original strand, 17017297 - 17017351
Alignment:
Q  74 ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtag 128  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  17017297 ttagggttttgcgatctttgtcgcacaagatgttatgagttgatccttggggtag 17017351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 346
Target Start/End: Original strand, 20220194 - 20220290
Alignment:
Q  252 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||| || |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220194 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24054651 - 24054581
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatg 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24054651 tgttagtgttgattatgatgtgatatgatgtttaaatacattacttgaattatgaatgaaagattgagatg 24054581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 50
Target Start/End: Original strand, 9751327 - 9751355
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9751327 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgag 9751355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Original strand, 9751390 - 9751442
Alignment:
Q  83 tgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgag 135  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9751390 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 9751442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22073259 - 22073203
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttagg 78  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  22073259 atggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgctttgttagg 22073203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 358
Target Start/End: Original strand, 25848 - 26179
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  25848 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgctaagagctgaaccttggggt 25947  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25948 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttg 26047  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  26048 aattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 26147  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26148 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 33278 - 33491
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278 gagcaaaggctctcgcctcgcgtgtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcgatctgtgtcatacaagttgttaagagttgaaccttggggt 33377  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33378 agtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttg 33477  T
Q  227 aattatgaatgtat 240  Q
    ||||||||||||||    
T  33478 aattatgaatgtat 33491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  219 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Original strand, 16998 - 17337
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  16998 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttattaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttaaaccttggggt 17097  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17098 agtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttg 17197  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg--ttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaact 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  17198 aattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 17297  T
Q  325 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17298 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 346
Target Start/End: Original strand, 79105 - 79430
Alignment:
Q  20 gaatggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaac 118  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||   |||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||  || ||||||||||    
T  79105 gaatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa-gccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcattgagagttgaac 79203  T
Q  119 cttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacg 217  Q
    |||||||||||  |||   ||    || || ||||| || ||| ||||||||| |||| | ||  ||| ||||| ||||  ||||||||| |  |||| |    
T  79204 cttggggtagttatgaatattgtatataatattaatgatgatcagtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatatacttgtatatg 79302  T
Q  218 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgtta 317  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  79303 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgtta 79401  T
Q  318 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  79402 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 362
Target Start/End: Original strand, 339734 - 340065
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  339734 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaatagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagtcgttaagggttgaaccttggggt 339832  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  339833 agtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttg 339932  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  339933 aattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaa 340029  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340030 gctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  158550 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22337449 - 22337115
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22337449 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagta 22337350  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337349 ttaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 22337250  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22337249 atgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctg 22337150  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337149 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23076775 - 23076442
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23076775 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggtagta 23076677  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  23076676 ttgggattttatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagt 23076577  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    || | || ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23076576 ataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 23076477  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23076476 catgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23660360 - 23660023
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | | | |||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  23660360 gagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtttttgtgacctttattgcacgagttattgagagttgaaccttggggt 23660261  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660260 agtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 23660161  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    | |||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  23660160 agttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaa 23660062  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660061 gatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 22737964 - 22738300
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22737964 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaaccttggggt 22738062  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22738063 agtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttg 22738162  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || | ||  |||||||||||||||||    
T  22738163 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaa 22738261  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738262 gctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23286198 - 23285865
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23286198 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcatgagttgttgagagttgaacctttgggt 23286100  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23286099 agtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttg 23286000  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  |    || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  23285999 aagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 23285904  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285903 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 22731017 - 22731355
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttgggg- 125  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| || |||| | | |||||||||||||     
T  22731017 gagcaaaggctctcgcctcacgagtcacccagaaacagagtgccttgttagg-ttttgcgatctttgttgcacgagctgttgataattgaaccttggggg 22731115  T
Q  126 tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22731116 tagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 22731215  T
Q  226 gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaacta 325  Q
    |||  ||   || ||| || | |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  22731216 gaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaacta 22731315  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22731316 agctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 60 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23060815 - 23060513
Alignment:
Q  60 aacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  ||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23060815 aacagagtgccttgttagg-ttttgcgacctttgtt-cacgagttgttgagaattgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataa 23060718  T
Q  160 tctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgact 259  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |  ||| || ||||||||||||||    
T  23060717 t-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgact 23060619  T
Q  260 tgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060618 tgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 23060519  T
Q  360 tgatgt 365  Q
    ||||||    
T  23060518 tgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 365
Target Start/End: Original strand, 23654188 - 23654507
Alignment:
Q  45 cgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatga 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  23654188 cgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatga 23654286  T
Q  145 tgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataatt 244  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||   || ||| ||    
T  23654287 agaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatattt 23654386  T
Q  245 gagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
     |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654387 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23654486  T
Q  345 agttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  23654487 agttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 37900 - 38235
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  37900 gagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacatagtgacttgttag-actttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggt 37998  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37999 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttg 38097  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  |||  ||||||  | ||||| || ||| | | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  38098 aagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 38196  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38197 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 362
Target Start/End: Original strand, 298602 - 298933
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||| ||  || |||||| |||||| |    
T  298602 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttgggtagca 298700  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattactt--gaa 228  Q
    || ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  298701 ttaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaa 298800  T
Q  229 ttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaag 327  Q
    ||||   || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  298801 ttat--ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 298898  T
Q  328 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  298899 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 20309445 - 20309108
Alignment:
Q  24 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttgg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    ||| |||| | ||||  ||||||||||| | |    
T  20309445 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacaaagtgacttgttag-attttgcgacccttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttg 20309347  T
Q  124 ggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattac 223  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  20309346 ggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattac 20309248  T
Q  224 ttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttg-ttgttgttatttaa 322  Q
    |||||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| || ||||| |  |||||||||||    
T  20309247 ttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaa 20309151  T
Q  323 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20309150 ctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135590
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23135652 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24367836 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27753912 - 27753730
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  || |||| ||||||  ||||||||| |||||| |    
T  27753912 gagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaacagagtgccttgttag-attttgcgaccttcgttgcacgagttgtcgagagttgaagcttgggat 27753814  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatg 210  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27753813 agcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45029954 gt-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21155160 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 gt-tgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 346
Target Start/End: Original strand, 32451713 - 32452031
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  32451713 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagatgaaccttggggt 32451811  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttga-ttatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    || ||| |||||| |  ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |   ||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32451812 agcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctg-ttatgggatgttaatgttgatttatgatgtgatattatg-tatacgcattactt 32451909  T
Q  226 gaattatgaatgtataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaac 323  Q
    ||| | | |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||| | |||| | || ||| || ||||| || ||| | ||||||    
T  32451910 gaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaac 32452008  T
Q  324 taagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  32452009 caagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Original strand, 23708405 - 23708738
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  23708405 agaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgatagttgaaccttggggtcgta 23708504  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaat 229  Q
     |||   ||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  23708505 atgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaat 23708604  T
Q  230 tatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgt-tgttatttaactaagc 328  Q
    |||   || ||  ||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || ||||| | | ||||||||||||||||    
T  23708605 tatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagc 23708703  T
Q  329 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23708704 tgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 360  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43137361 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 24529528 - 24529691
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgta-taattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24529528 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 24529627  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24529628 tga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 365
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103516
Alignment:
Q  196 tgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 294  Q
    |||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||  |||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gta 23103445  T
Q  295 tactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23103446 tactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19672118 - 19671830
Alignment:
Q  74 ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 173  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||   ||| | || || ||||| |||||||||||||||| |    
T  19672118 ttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggg-tagttatgaatattatttataatattaatgataatctgtgaagctgat 19672020  T
Q  174 -taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatt 272  Q
     || | ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  19672019 ctatgatga-ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata-ttgagatgttgtttacttgcgttcgatatt 19671923  T
Q  273 attatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  19671922 attatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405981
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgat 360  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 304 - 365
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040310
Alignment:
Q  304 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 365
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  267 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25175972 - 25175854
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  25175972 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgt 25175874  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25175873 ctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8946730 - 8946657
Alignment:
Q  292 gtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946730 gtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 359
Target Start/End: Original strand, 24643036 - 24643109
Alignment:
Q  285 tgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24643036 tgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 346
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7835
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatac 7785  T
Q  298 tgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    || || ||||| || |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 364
Target Start/End: Original strand, 22134203 - 22134326
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 338  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22134203 ataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtc 22134300  T
Q  339 ggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||    
T  22134301 ggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679589
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7679702 gatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 7679605  T
Q  346 gttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||| |||||||||    
T  7679604 gttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 276
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 276  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 20519978 - 20520295
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttg-ttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggta-g 128  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||| | ||||| ||||| ||||||||| | ||| |||| || ||||| ||||| | |||||||||| |    
T  20519978 agaggctctcgcctcgcgagttgcctagttacagaataccttgtttagggttttgcgatctttgttgcacgagatgttatgagtttatccttggggtagg 20520077  T
Q  129 tattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
     || |||  |  || ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||  ||| ||| | | || |||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  20520078 aatggaggttgtat-atgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttga 20520176  T
Q  228 attatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaact 324  Q
    |||||  ||| ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||  | |||||  | ||||| || |||||  ||||||    
T  20520177 attatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcatatgttgctgtttgtttattaact 20520273  T
Q  325 aagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20520274 aagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23207401 - 23207296
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 339  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||| || ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23207401 ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23207303  T
Q  340 gtctaag 346  Q
    |||||||    
T  23207302 gtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 350
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 22413035 - 22413240
Alignment:
Q  144 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataa 242  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||| | || |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||  ||| ||      
T  22413035 atgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatg-atg- 22413132  T
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatat--tattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||  ||||||  ||||||| || |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  22413133 ttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagt 22413231  T
Q  338 cggtctaag 346  Q
    |||||||||    
T  22413232 cggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25616333 - 25616192
Alignment:
Q  217 gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgtt 316  Q
    |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||| || || || | ||||     
T  25616333 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgta 25616234  T
Q  317 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25616233 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 253
Target Start/End: Original strand, 22758658 - 22758725
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22758658 tgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 22758725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 338
Target Start/End: Original strand, 22799069 - 22799220
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| |  ||| | || || ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||||||||    
T  22799069 tgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatg 22799168  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 338  Q
    || | ||   ||| || || || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22799169 ttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23791397 - 23791292
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||| || |||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  23791397 ttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcg 23791299  T
Q  340 gtctaag 346  Q
    |||||||    
T  23791298 gtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 256
Target Start/End: Original strand, 22740903 - 22740973
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  22740903 tgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23004872 - 23004838
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 277  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23004872 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattattat 23004838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23038217 - 23038144
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 253  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23038217 tgttagtgttaaatatgatgtgatataatgtttaattgaattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 23038144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  295 tactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    ||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 284
Target Start/End: Original strand, 24697604 - 24697645
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24697604 ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatga 24697645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 304 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  304 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 80 - 365
Target Start/End: Original strand, 2987 - 3271
Alignment:
Q  80 ttttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagtt 179  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  2987 ttttgcgacctgtgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagat 3086  T
Q  180 gtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 279  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3087 gcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 3186  T
Q  280 catgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3187 catgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Original strand, 793 - 837
Alignment:
Q  24 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtg 68  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  793 ggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtg 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23220 - 22886
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23220 gagcagaggccctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 23121  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23120 agtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttg 23021  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  23020 aagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaa 22922  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22921 gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39098 - 38761
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39098 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacatagtgacttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 38999  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38998 agtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttg 38899  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||| |||    
T  38898 aagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaa 38800  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38799 gctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32942
Alignment:
Q  148 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgag 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | || ||| || ||    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 33059  T
Q  248 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  33058 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  348 tgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32959 tgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 199 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9912 - 9744
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgt---ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtat 295  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  9912 tgtgatataattgtatatgcattatttgaattat--atgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtat 9815  T
Q  296 actgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc 367  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9814 actgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28168 - 27912
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28168 gagcaaaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgtcaggattttgcaatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 28069  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28068 agtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttg 27969  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27968 aattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27913 - 27878
Alignment:
Q  329 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27913 tgcatgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatg 27878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 52249 - 51913
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  52249 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttagg-ttttgcgacct-tgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggt 52152  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  52151 agtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttg 52052  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  52051 aagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaa 51952  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51951 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 167763 - 168099
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| | ||||  ||||||||||||| ||||    
T  167763 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggt 167861  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  167862 agcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttg 167960  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  167961 aataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 168060  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  168061 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40246 - 39913
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40246 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggtgtttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagta 40147  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  40146 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagt 40047  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    || |    ||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  40046 ataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctg 39948  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39947 catgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 346
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  244 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||| || ||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  341 tctaag 346  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 40194 - 39858
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  40194 gagcagaggctctcgcctcgcgggtgacctagaaaccgagtgccttgttatgattttgcgacctttgttgcacaatttgttgagagttgaaccttggg-t 40096  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40095 agcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttg 39996  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    || ||| | || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  39995 aagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaa 39897  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39896 gcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26213 - 25896
Alignment:
Q  47 cgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatg 146  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26213 cgagtgacccagaaaccaagtgccttgttaggattttgcgacctttgttgcacgatttgttgagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgagg 26114  T
Q  147 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattga 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | || ||| ||||    
T  26113 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttga 26014  T
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26013 gatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaag 25915  T
Q  347 ttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  25914 ttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13548 - 13211
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  | |||||||||||||| |    
T  13548 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaatcagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaaccttgggat 13450  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13449 agcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttg 13350  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  13349 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 13250  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13249 gctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 676 - 343
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  676 agaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttaggtttttgcaacctttgttgcatgagttgttgagagttgaaccttggggtagta 577  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  576 ttgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagt 477  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    || |  | ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  476 ataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctg 378  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  377 catgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3807 - 3470
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  3807 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaacagagtgagttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaactttggggt 3709  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3708 agtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttg 3609  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | | |||||||||||||    
T  3608 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaa 3509  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3508 gctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2193 - 1851
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  2193 atggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccctaaaacagagtgccttgttag-attttgtgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctt 2095  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2094 gggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatt 1995  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    |||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1994 acttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttattta 1895  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1894 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 135
Target Start/End: Original strand, 207359 - 207411
Alignment:
Q  83 tgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgag 135  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  207359 tgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttgaaccttgggatagtaatgag 207411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 365
Target Start/End: Original strand, 8313 - 8650
Alignment:
Q  24 ggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttgg 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |  || |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  8313 ggtgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgtcttgttagg-ttttgcgaccttcgttgcacgagttgttgagagttgaacgttgg 8411  T
Q  124 gg-tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatta 222  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  8412 gggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcatta 8511  T
Q  223 cttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaa 322  Q
    |||||| ||| | || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||    ||||| ||||||||||    
T  8512 cttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcct---atgttgctgttatttaa 8607  T
Q  323 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8608 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Original strand, 32746 - 33077
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746 agaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagta 32845  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| | |  || || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |    
T  32846 ttgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta-tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagt 32944  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    || |||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32945 at-aatgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctg 33042  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33043 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 46259 - 45928
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46259 agaggctcccgcctcgcgagtgacccataaacagaatgtcttgttaggattttgcgatctgtgtcgcaccaattgttaagagttgaaccttggggtagta 46160  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    |||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| | |  || || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |    
T  46159 ttgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta-tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagt 46061  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    || |||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  46060 at-aatgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctg 45963  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45962 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  154 ttataatctgtgaagctgttt-aagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgtt 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  253 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 352  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  353 aagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 303 - 365
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17450
Alignment:
Q  303 gtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 16422 - 16323
Alignment:
Q  30 cagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagt 129  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16422 cagaggccctcacctcgcaagtgacccagaaacagagagtcttgttaggtttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttgaggtagt 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 833 - 1169
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| | ||||  ||||||||||||| ||||    
T  833 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgaattgtcgagagttgaacctttgggt 931  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  932 agcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttg 1030  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1031 aataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 1130  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1131 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 5905 - 6245
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| |||| |  ||||| |||||||||| |    
T  5905 gagcagaggctctcgcctcgttagtgacccagaaacagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttatcgagagtggaaccttgggat 6003  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6004 agcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttg 6103  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtct---gtgttgttgttgttatttaac 323  Q
    ||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||  ||    ||||||||||||||||||||    
T  6104 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaac 6203  T
Q  324 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 8808 - 8479
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8808 agaggctctcgcctcgcgaatgacccagaaacagagtgtcttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaaccttggagtagta 8710  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    |||||||||  |||||||||||| |    
T  8709 ttaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagt 8614  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctg 330  Q
    |    || ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8613 acacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctg 8514  T
Q  331 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 161 - 364
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  161 ctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgactt 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  261 gcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 360  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  361 gatg 364  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13429 - 13144
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  13429 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaactgagtgtcttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaactttggggt 13331  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13330 agtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttg 13231  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt 313  Q
    || ||| | || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  13230 aagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34123
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  34139 gttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 273
Alignment:
Q  310 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  328 tgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 347
Target Start/End: Original strand, 24085 - 24406
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| |    
T  24085 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaactttgggat 24183  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttg-attatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24184 agtattaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 24283  T
Q  226 gaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaact 324  Q
    |||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  24284 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 24383  T
Q  325 aagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  24384 aagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13832 - 13497
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||||  |||||||||||||  |||    
T  13832 gagcagaggctctcgcctcgcgagcgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttcggt 13734  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13733 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttg 13635  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  |||  ||||||  | |||||||| ||| | | | |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  13634 aagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 13536  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13535 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2289 - 1952
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  2289 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacatgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggt 2191  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| |||||||||||| | |||| | ||||| ||| ||||||| || | | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  2190 aggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttg 2091  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||| |||  || ||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || ||| | |||||||| ||||||||    
T  2090 aataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaa 1991  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1990 gctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5181 - 4849
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |||||| |  | ||| |||| ||||||| ||  || |||||| || ||| |    
T  5181 agaggctcttgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgttag--ttttgccacctttgttgcacgagttgttgaggattaaacctttggctagca 5084  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga--a 228  Q
     | ||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |    
T  5083 ataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaa 4984  T
Q  229 ttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagc 328  Q
    ||||   || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  4983 ttatt--tgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatc 4886  T
Q  329 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4885 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4866 - 4545
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4866 atggcgagcaaaggctctcgcctcgcaagctacccagaaacagaatgccatgttaggattttgcgacctttgttgcacgagttgttaagagttgaacctt 4767  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcat 220  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||    
T  4766 gaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaag--atgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcat 4669  T
Q  221 tacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattt 320  Q
    |||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| || || || || | | | |||||| || || ||||||||||||||    
T  4668 tacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttattt 4569  T
Q  321 aactaagctgcatgagtcggtcta 344  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  4568 aactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32401 - 32067
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || | |||||||||  | ||| || | ||||||  ||||||||||| | ||||    
T  32401 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagttacttttttg-attttgcgacctttgttgctctagttgtcgagagttgaacccttgggt 32303  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32302 aggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttg 32204  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  32203 aagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 32106  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32105 gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 15249 - 15584
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||  | | ||||    
T  15249 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgactcgttgggt 15347  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  15348 aggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttg 15446  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaa 326  Q
    ||  ||   | ||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15447 aagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaa 15545  T
Q  327 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15546 gctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10501 - 10323
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||  || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10501 gagcagagcttcccgcctcgcgagtgacctagaaacaaagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 10402  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgata 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  10401 agtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10544
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    ||| |||| ||||||  ||||||||||| | ||||    
T  10210 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgaccattgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggt 10308  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  10309 agaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttg 10407  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||  ||   |||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  10408 aagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaacta 10504  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10505 tgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 305
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3591
Alignment:
Q  139 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  238 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtg 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 21248 - 20910
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||  | ||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  21248 gagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccaaaaacagagtgacttgttgag-ttttgcgacctttgttgcacgagttgatcagagttgaacctttgggt 21150  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21149 agtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttg 21050  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
     |  |    || |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| || || ||||| || |||||| |||||||    
T  21049 tagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaacta 20950  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20949 agctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 5054 - 4712
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||| ||||||||  |||||| |  | ||| |||| ||||||  | |||||||||||    
T  5054 atggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctt 4955  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  4954 tgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcctt 4856  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttattta 321  Q
    |||||||  ||   ||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4855 acttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttattta 4756  T
Q  322 actaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4755 actaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 2
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||| ||||||||  |||||| |  | ||| |||| ||||||  | |||||||||||    
T  278 atggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccataataagagtgacttgttagatttttgcaacctttgttgcacgagttgtcgacagttgaacctt 179  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  178 tgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcctt 80  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 299  Q
    |||||||  ||   ||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  79 acttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactg 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 124922 - 124722
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |    
T  124922 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaaaagagtgtcttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttgggat 124824  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  124823 agcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttg 124724  T
Q  227 aa 228  Q
    ||    
T  124723 aa 124722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 174949 - 174767
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatgtt-atacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgt 279  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||    
T  174949 tgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgt 174850  T
Q  280 catgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    |||| ||||   |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  174849 catgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 304 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121766
Alignment:
Q  304 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 288
Target Start/End: Original strand, 741 - 1006
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||  | ||| |||| || |||| |||||||||||||    
T  741 atggcgagcagaggttcccgcctcgtgagtgacctagaaacagagagtcttgttaggatttttcgacctttgttgcacgagctgttgagagttgaacctt 840  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  841 gaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcatt 940  T
Q  222 acttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt 288  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  941 acttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 304 - 365
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4954
Alignment:
Q  304 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1623 - 1289
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||| ||| | ||||    
T  1623 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgtt-ggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggt 1525  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  1524 aggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttg 1426  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaacta 325  Q
    ||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  1425 aagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 1329  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1328 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7600 - 7266
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||| ||| | ||||    
T  7600 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgtt-ggagtttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttggacccttgggt 7502  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  7501 aggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttg 7403  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaacta 325  Q
    ||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  7402 aagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaacta 7306  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7305 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 362
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15356
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Original strand, 836 - 1170
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  | ||| |||| | ||||  ||||||||||| | ||||    
T  836 gagcagaggctctcgcctcgcgagtaacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcaacctttgttgcacgatttgtcgagagttgaacccttgggt 934  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| || |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  935 aggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttg 1033  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| || ||||| || || ||| |||||||    
T  1034 aagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtttattaattaacta 1130  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1131 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16616 - 16282
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||  | ||| |||| | || |  ||||||||||  | ||||    
T  16616 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtgacttgtt-ggattttgtgacctttgttgcacgatttctcgagagttgaacgcttgggt 16518  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  16517 aggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttg 16419  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||  |||  ||||||  | | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  16418 aagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaacta 16322  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16321 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 51916 - 51582
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||  ||| ||| ||| | ||||    
T  51916 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgacttgtta-gattttgcgacttttgttgcacgagttgtcgagaattggacccttgggt 51818  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  51817 aggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttg 51719  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||  ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  51718 aaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 51622  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  51621 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20809 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37883 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  94473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 202 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  202 gatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-ttttcgtatactgt 300  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  301 ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44514 -tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 100496 - 100378
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  100496 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 100398  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  100397 ctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 40173 - 40291
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |  ||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40173 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagt 40271  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  40272 ctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 119928 - 119875
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119928 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  294 atactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 361
Target Start/End: Original strand, 38422 - 38596
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |  ||| | || || ||| ||||||||||||  || | |||||||||  | |||||| ||    
T  38422 tgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttg 38521  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    || | ||   |||||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  38522 ttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10835 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6947 - 6676
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  6947 gagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccataaacagagtgacatgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacctttgggt 6849  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| || | | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  6848 aggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttg 6749  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 299  Q
    ||| |||  || ||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||    
T  6748 aataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactg 6676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13392
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13454 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14009 gt-tgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136742 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139211 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144149 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  134273 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141680 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 62317 - 62200
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  62317 ttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 62222  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
     ||||| || || |||||||||    
T  62221 ttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 132711 - 132662
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  132711 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 219 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  219 attacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  319 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Original strand, 128968 - 129072
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  128968 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcg 129065  T
Q  340 gtctaag 346  Q
    |||||||    
T  129066 gtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1256 - 1052
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| || | |||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||| ||    
T  1256 atggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccggaaacaaagtgccttgtgag-actttgcgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacttt 1158  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcatt 221  Q
     |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1157 tgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcatt 1058  T
Q  222 acttga 227  Q
    ||||||    
T  1057 acttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 363  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 350
Target Start/End: Original strand, 15887 - 16206
Alignment:
Q  33 aggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtat 131  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  15887 aggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacaagttgttatgagttgaacctttgggtagtaa 15986  T
Q  132 tgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaatt 230  Q
    ||  | ||    ||||| | ||| || ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  15987 tggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt 16086  T
Q  231 atgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagct 329  Q
    ||  | | ||  ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||  || |||||||||| |||  |||||||||||    
T  16087 atataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagct 16185  T
Q  330 gcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16186 gcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13435 - 13147
Alignment:
Q  61 acagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataa 159  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  | ||    ||||| | ||| || |    
T  13435 acagaatgccttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatga 13336  T
Q  160 tctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattg-agatgttgttga 257  Q
    |||||||||||||| |||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||  ||  ||||||||||||    
T  13335 tctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttga 13236  T
Q  258 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
     |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13235 tttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  295 tactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16846 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 358  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 85579 - 85742
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  85579 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 85678  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  85679 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 160805 - 160688
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160805 ttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggt 160708  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  160707 ctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3823 - 3640
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||| ||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  3823 atggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgag-actttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctt 3725  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatat 206  Q
     |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3724 tgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7887 - 7704
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||| ||  | ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  7887 atggcgagcagaggctctcgtctcgcgagtgacccggaaacagagtgccttgtgag-actttgtgacctttgttgcacgagttgttgagagttgaacctt 7789  T
Q  122 ggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatat 206  Q
     |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7788 tgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 350
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  159 atctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||   || ||  |||||||||||||||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  258 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
     || ||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||  || |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28414
Alignment:
Q  246 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28433 gttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11292
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  11308 gttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1997
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2014  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  2013 gttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Original strand, 22614 - 22776
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22614 tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 22712  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
     ||| | ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22713 attt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 362
Target Start/End: Original strand, 4915 - 5246
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||| ||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||| | ||||    
T  4915 gagcagaggatctcgcctcgcgagtgacacagaaacagagtgacttatt-ggattttgagacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggt 5013  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttg 226  Q
    || ||| ||| ||||| || | |||||||||||| |||||| |||  |||  | ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  5014 aggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttg 5112  T
Q  227 aattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaacta 325  Q
    ||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |  || ||||| || ||||||||||||||    
T  5113 aagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttgatgtttgttatttaacta 5209  T
Q  326 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5210 agctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 346
Target Start/End: Original strand, 51668 - 51985
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  51668 gagcagaggctctcacctcgctagtgacccagaaacagagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggggt 51766  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttga-ttatgatgtgatataatgttatacgcattactt 225  Q
    || ||| |||||| |  ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |   | ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51767 agcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctg-ttatgagatattaatgttgatttatgatgtgatataatg-tatacgcattactt 51864  T
Q  226 gaattatgaatgtataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaact 324  Q
    ||| | | |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || | |||| | || ||| || |||  |  ||| | |||||||    
T  51865 gaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgtgctgtttgatgtttaact 51963  T
Q  325 aagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  51964 aagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32538
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  32559 ctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Original strand, 20203 - 20524
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacct 120  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |   |||||  |||||||| ||||||||||| | | |||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  20203 atggcgagtagaggctctcgcctcgcaagttgcctaattacagaa-gccttgtttaggattttgcggtctttgtcgcacgagtcgttgagagttgaacct 20301  T
Q  121 tggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgca 219  Q
    |||| ||||  |||   ||    || |||||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||  ||||  |||||||||||  |||| |||    
T  20302 tgggatagttatgaatattgtatataatgttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt--ttatattgtgatataattgtatatgca 20399  T
Q  220 ttacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatt 319  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  20400 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg-atgtgttgctgttgttatt 20497  T
Q  320 taactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20498 taactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-tttttt 128819  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    | | | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Original strand, 65730 - 65800
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatg 250  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  65730 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattaattgaattatgaatgaatgattgagatg 65800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 364
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 364  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12349 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4359 a-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161252
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  161189 tg-ctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 282
Target Start/End: Original strand, 164590 - 164674
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcat 282  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  164590 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    | |||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  299 gtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29994 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    || |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tg-ctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 2128 - 2291
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2128 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 2227  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  2228 tgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 365
Target Start/End: Original strand, 17883 - 18148
Alignment:
Q  101 agttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagttgtgttggtgttgattatgat 199  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  |||   ||| | |  || ||||| || ||||||||||||| |||| | ||  ||| ||||| |||| ||    
T  17883 agttgttgaaagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacaatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataat 17982  T
Q  200 gtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 299  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| | | ||| ||    
T  17983 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataatg 18081  T
Q  300 tctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
      | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18082 catatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Original strand, 6578 - 6625
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgt 74  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6578 gagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccagaaatagagtgccttgt 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 47321 - 46995
Alignment:
Q  29 gcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtag 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| | |  ||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  47321 gcagaggctctcgcctcgcgagtgacccaaaaccagagtgacttgttagaaatg-gcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaacccttgggtag 47223  T
Q  129 tattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaa 228  Q
     ||| ||||||||  ||||       |||||||||||||||||| |||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  47222 gattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgga 47130  T
Q  229 ttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaag 327  Q
      ||   ||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || |   ||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  47129 gaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 47033  T
Q  328 ctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47032 ctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20740 - 20595
Alignment:
Q  27 gagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  |||||||||||||||  |    
T  20740 gagcagaggctctcgcctcgcgagcgacctagaaacagagtgccttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtcgagagttgaaccttggaat 20642  T
Q  127 agtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 173  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20641 agcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 359
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 297  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  298 tgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 359  Q
    |   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1380 tca-tgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8646 - 8481
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgtt--atacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 284  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||     
T  8646 tgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgc 8547  T
Q  285 tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
    |||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 tgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6657 - 6535
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6657 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6559  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  6558 ctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 46 - 185
Target Start/End: Original strand, 17790 - 17928
Alignment:
Q  46 gcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgat 145  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | ||| |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  17790 gcgagtcacccagaaatagagtgacttgttagg-ttttgcgacctttgttgcacgagttgttgagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgag 17888  T
Q  146 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagttgtgttg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17889 gatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 199 - 362
Target Start/End: Original strand, 38657 - 38820
Alignment:
Q  199 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 298  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||  ||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  38657 tgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 38755  T
Q  299 gtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 362  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38756 gtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Original strand, 11301 - 11445
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |    
T  11301 agaggctctcacctcgcgagtgacacagaaacaaagtgacttgttag-attttgcgacctttgttgcacgagttgtagagagttgaacctttgggtagaa 11399  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaa 176  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11400 ttaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaa 11445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 365
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  248 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 347  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 11546  T
Q  348 tgatgaagatgatgatgt 365  Q
    || ||||||||| |||||    
T  11547 tgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 346
Target Start/End: Original strand, 60500 - 60818
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgtt-aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagt 129  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | | ||||| ||| ||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||     
T  60500 agaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaatacattgtttagggttttgtgatctttgtcgcacgagatgttatgagttgaaccttggggtagg 60599  T
Q  130 attg-agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttga 227  Q
    | || ||| |  || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||  ||| ||||| | || |||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  60600 aatggagattgtat-atgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttga 60698  T
Q  228 attatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaact 324  Q
    |||||  ||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||  ||||||    
T  60699 attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctgtttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaact 60796  T
Q  325 aagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  60797 aagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 130051 - 129917
Alignment:
Q  218 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgt-tgtt 316  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| ||| ||||    
T  130051 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgtt 129954  T
Q  317 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 353  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  129953 atttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 225741 - 225482
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagta 130  Q
    |||||| || ||||||||||||||  ||  ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  225741 agaggcccttgcctcgcgagttacatagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttgaaccttggggtagtt 225642  T
Q  131 ttgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaat 229  Q
     |||   |||   ||||| ||||| || | ||||||||||| | || | ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  225641 atgaagattatatatgatattaataatgaactgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaat 225542  T
Q  230 tatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 290  Q
    |||  ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  225541 tatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 238 - 163
Alignment:
Q  31 agaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  238 agaggctctcgccacgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatctgtgtcgcacaagttgt 163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19386 - 19268
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19386 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 19288  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  19287 ctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 275 - 133
Alignment:
Q  218 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gtt 316  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| |||    
T  275 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgtt 178  T
Q  317 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  177 gtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 437
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccag 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  473 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1190
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1173  T
Q  349 gatgaagatgatgatgt 365  Q
    | |||||||||||||||    
T  1174 gttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2923
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  2904 ctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 365
Target Start/End: Original strand, 15788 - 15898
Alignment:
Q  255 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 353  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15788 tgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15886  T
Q  354 agatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||    
T  15887 agatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6719 - 6611
Alignment:
Q  257 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 355  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6719 acttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 6621  T
Q  356 atgatgatgt 365  Q
    ||||||||||    
T  6620 atgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14099 - 13991
Alignment:
Q  257 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 355  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14099 acttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 14001  T
Q  356 atgatgatgt 365  Q
    ||||||||||    
T  14000 atgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15664
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  349 gatgaagatgatga 362  Q
    ||| ||||||||||    
T  15677 gattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1522 - 1452
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatg 250  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1522 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatg 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Original strand, 10485 - 10647
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10485 tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 10583  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 350  Q
     ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10584 attt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 346
Target Start/End: Original strand, 53492 - 53651
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  53492 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 53591  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| | |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53592 tttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Original strand, 1037 - 1155
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | | | |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1037 gatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatct-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1135  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  1136 gttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaa 12786  T
Q  346 gttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  12785 gttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11642 - 11464
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  11642 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 11543  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||| | |||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  11542 tttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 365
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6244
Alignment:
Q  255 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 353  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6232  T
Q  354 agatgatgatgt 365  Q
    ||||||||||||    
T  6233 agatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 239 - 361
Target Start/End: Original strand, 45787 - 45909
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45787 ataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 45885  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  45886 cggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 365
Target Start/End: Original strand, 38199 - 38377
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  38199 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 38298  T
Q  287 ttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 365  Q
    |||| | |||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  38299 tttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14814
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  | ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  14795 ctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5765 - 5655
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-ttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||  |||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5765 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc--atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcgg 5668  T
Q  341 tctaagttgatga 353  Q
    |||||||||||||    
T  5667 tctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24048 - 23843
Alignment:
Q  158 aatctgtgaagctgtttaagttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttga 257  Q
    |||||||||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||     
T  24048 aatctgtgaagctgtt-aagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctgt 23950  T
Q  258 cttgcatttgatattattat-----gtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 352  Q
     ||  |||||||||| ||||     |||||  |||| | |||  ||| || || || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23949 ttt--atttgatattgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatc 23852  T
Q  353 aagatgatg 361  Q
    |||||||||    
T  23851 aagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  342 ctaagttga 350  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1086
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    |||| |||||| |||| || ||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1204 ttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1106  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  1105 ctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 2644 - 2762
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||| |||   |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2644 ttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttac-atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2742  T
Q  342 ctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  2743 ctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12943
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 345  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 12959  T
Q  346 gttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||| || |||||||    
T  12958 gttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  285 tgttttcgtatactgtctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12272 - 12165
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaacctt 121  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||   |||||   |||  ||||||||||||||| | |||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  12272 atggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaagccctgtttaggattttgcgatctttgtcacacgagtcgttgagagttgaacctt 12173  T
Q  122 ggggtagt 129  Q
    ||||||||    
T  12172 ggggtagt 12165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1051
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 ttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1056  T
Q  342 ctaag 346  Q
    |||||    
T  1055 ctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12690 - 12587
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12690 ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggt 12592  T
Q  342 ctaag 346  Q
    |||||    
T  12591 ctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32102
Alignment:
Q  239 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 337  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||   | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  338 cggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||||||| |||||| |||||||    
T  32125 cggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 361
Target Start/End: Original strand, 23898 - 24000
Alignment:
Q  259 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 357  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgat 23996  T
Q  358 gatg 361  Q
    ||||    
T  23997 gatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 284
Target Start/End: Original strand, 8002 - 8099
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 284  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||| ||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  8002 tgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatga 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36640 - 36567
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 253  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  36640 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttg 36567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 114
Target Start/End: Original strand, 1855 - 1947
Alignment:
Q  22 atggtgagcagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagtt 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||    
T  1855 atggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatgcttgtttaggattttgcgatctttgtcgcacgagtcgttgagagtt 1947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6824
Alignment:
Q  250 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 348  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| | |||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  349 gatga 353  Q
    |||||    
T  6828 gatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 361
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28887
Alignment:
Q  313 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 350
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  247 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 343  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||  || ||| |||||||| || ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtct 8173  T
Q  344 aagttga 350  Q
    |||||||    
T  8174 aagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 70082 - 69905
Alignment:
Q  76 aggattttgcgatttgtgtcgcacaagttgttaagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttta 175  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| || ||| | |||| || ||| | |||||||| |||||| ||   | || ||||| |  |||||||||||||||| |    
T  70082 aggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgtt-a 69984  T
Q  176 agttgtgttggtgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg 253  Q
     |   |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  69983 tgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 69905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69794
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69843 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13157 - 13092
Alignment:
Q  212 tatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 277  Q
    |||| ||||||||| ||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13157 tatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 346
Target Start/End: Original strand, 6237 - 6386
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtat 295  Q
    |||||||||||   |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  ||||||  |||    
T  6237 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt-atat 6334  T
Q  296 actgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6335 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38440 - 38339
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  ||||||  ||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  38440 ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcg 38342  T
Q  340 gtc 342  Q
    |||    
T  38341 gtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20165 - 20095
Alignment:
Q  181 tgttggtgttgattatgatgtgatataatgttatac-gcattacttgaattatgaatgtataattgagatg 250  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20165 tgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatg 20095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25229 - 25121
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgtctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||  ||||||  ||||||| || ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  25229 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 25132  T
Q  340 gtctaagttga 350  Q
    |||||||||||    
T  25131 gtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 97173 - 97024
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtat 295  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |    
T  97173 atgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgt 97076  T
Q  296 actgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| || ||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97075 actgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 106451 - 106302
Alignment:
Q  198 atgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtat 295  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |    
T  106451 atgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgt 106354  T
Q  296 actgtctgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 346  Q
    |||| || ||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106353 actgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 286
Target Start/End: Original strand, 2217 - 2260
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2217 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatg 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 284
Target Start/End: Original strand, 1795 - 1836
Alignment:
Q  243 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  1795 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29558
Alignment:
Q  312 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 361  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 250
Target Start/End: Original strand, 15612 - 15676
Alignment:
Q  187 tgttgattatgatgtgatataatg-ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatg 250  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15612 tgttgaatatgatgtgagataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatg 15676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University