View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0329_high_9 (Length: 254)

Name: NF0329_high_9
Description: NF0329
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0329_high_9
NF0329_high_9
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (5-254)||(18059590-18059841)
chr1 (5-254)||(17004811-17005062)
chr1 (5-254)||(38054923-38055174)
chr1 (5-221)||(19962366-19962582)
chr1 (5-254)||(17148740-17148992)
chr1 (5-209)||(22227981-22228185)
chr1 (5-209)||(22232678-22232882)
chr1 (5-212)||(46523562-46523768)
chr1 (5-237)||(5072237-5072467)
chr1 (5-212)||(22035621-22035827)
chr1 (5-212)||(7640810-7641016)
chr1 (5-170)||(2116427-2116589)
chr1 (5-170)||(45051595-45051757)
chr1 (139-213)||(15861284-15861358)
chr1 (5-152)||(18601052-18601197)
chr1 (148-218)||(18598845-18598914)
chr1 (96-212)||(51452765-51452882)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (6-254)||(22251398-22251648)
chr6 (5-254)||(16376205-16376456)
chr6 (5-254)||(16383529-16383780)
chr6 (5-254)||(22225570-22225821)
chr6 (5-254)||(10488872-10489123)
chr6 (5-252)||(16555973-16556222)
chr6 (5-252)||(16632529-16632778)
chr6 (5-237)||(16232065-16232297)
chr6 (5-221)||(19299410-19299626)
chr6 (5-237)||(18086674-18086906)
chr6 (5-212)||(1556178-1556385)
chr6 (5-212)||(19610191-19610398)
chr6 (5-212)||(23977942-23978149)
chr6 (61-254)||(27653814-27654006)
chr6 (7-170)||(13620712-13620875)
chr6 (5-237)||(29869627-29869858)
chr6 (61-237)||(25175792-25175968)
chr6 (5-254)||(14625961-14626209)
chr6 (5-166)||(29666046-29666208)
chr6 (154-254)||(16814829-16814930)
chr6 (5-170)||(1650022-1650184)
chr6 (61-159)||(16825678-16825775)
chr6 (139-212)||(4991396-4991470)
chr6 (96-212)||(1657620-1657738)
chr6 (96-212)||(15862744-15862862)
chr6 (58-90)||(19629556-19629588)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (5-254)||(7822901-7823152)
chr7 (5-254)||(7830212-7830463)
chr7 (5-254)||(27176606-27176857)
chr7 (5-254)||(27101469-27101720)
chr7 (5-254)||(27108817-27109068)
chr7 (5-254)||(38783561-38783812)
chr7 (5-237)||(18979872-18980104)
chr7 (5-237)||(15950641-15950874)
chr7 (5-237)||(15927741-15927973)
chr7 (5-212)||(13758543-13758750)
chr7 (5-212)||(15759990-15760197)
chr7 (5-254)||(13910855-13911103)
chr7 (61-247)||(2437686-2437873)
chr7 (5-212)||(14250775-14250981)
chr7 (5-237)||(13572849-13573079)
chr7 (5-241)||(16478808-16479041)
chr7 (61-244)||(10989638-10989821)
chr7 (5-170)||(48622584-48622749)
chr7 (69-170)||(18253761-18253862)
chr7 (87-170)||(15862174-15862257)
chr7 (5-170)||(16418671-16418835)
chr7 (5-170)||(10000288-10000452)
chr7 (139-213)||(15516719-15516793)
chr7 (96-212)||(7293289-7293406)
chr7 (96-212)||(30262002-30262119)
chr7 (115-212)||(11516520-11516617)
chr7 (115-212)||(15441437-15441534)
chr7 (96-212)||(13321289-13321407)
chr7 (115-170)||(14113904-14113959)
chr7 (96-170)||(14423555-14423629)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (5-254)||(21932213-21932464)
chr5 (5-254)||(21938383-21938634)
chr5 (5-254)||(35582209-35582460)
chr5 (5-254)||(10777802-10778053)
chr5 (5-254)||(36989602-36989853)
chr5 (5-221)||(22882951-22883167)
chr5 (5-237)||(7425497-7425729)
chr5 (5-213)||(11211940-11212148)
chr5 (5-237)||(17471438-17471671)
chr5 (5-212)||(23514734-23514941)
chr5 (5-212)||(35790974-35791181)
chr5 (5-212)||(1219396-1219603)
chr5 (61-254)||(18777823-18778015)
chr5 (61-254)||(21073426-21073618)
chr5 (61-254)||(12603-12795)
chr5 (5-254)||(29188116-29188363)
chr5 (61-254)||(22366311-22366504)
chr5 (5-254)||(4199816-4200064)
chr5 (61-254)||(19500128-19500319)
chr5 (5-251)||(43443232-43443474)
chr5 (61-254)||(25426857-25427049)
chr5 (5-237)||(27010014-27010244)
chr5 (5-212)||(23328731-23328937)
chr5 (5-212)||(24616335-24616541)
chr5 (5-212)||(24712711-24712917)
chr5 (5-212)||(24745729-24745935)
chr5 (139-254)||(11343008-11343125)
chr5 (139-254)||(16105967-16106084)
chr5 (115-212)||(20623262-20623359)
chr5 (115-212)||(21233401-21233498)
chr5 (5-90)||(32950867-32950952)
chr5 (115-212)||(37053037-37053134)
chr5 (115-170)||(25900321-25900376)
chr5 (115-212)||(16536490-16536587)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (5-254)||(31482-31733)
scaffold0107 (5-121)||(39819-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (5-254)||(39276-39527)
scaffold0076 (5-241)||(43170-43404)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (5-254)||(271192-271443)
chr8 (5-254)||(644477-644728)
chr8 (5-254)||(830212-830463)
chr8 (5-221)||(15319026-15319242)
chr8 (5-221)||(15499395-15499611)
chr8 (5-254)||(22088626-22088877)
chr8 (5-212)||(22006134-22006341)
chr8 (5-212)||(13720804-13721011)
chr8 (5-212)||(13662141-13662348)
chr8 (5-212)||(16195404-16195611)
chr8 (5-212)||(16872927-16873134)
chr8 (61-254)||(30120951-30121144)
chr8 (5-241)||(6774105-6774337)
chr8 (5-241)||(24549154-24549387)
chr8 (6-241)||(21851810-21852043)
chr8 (5-241)||(21844417-21844651)
chr8 (5-234)||(16674245-16674471)
chr8 (96-212)||(17345842-17345960)
chr8 (96-212)||(22907087-22907204)
chr8 (115-212)||(5238380-5238477)
chr8 (115-212)||(24661121-24661218)
chr8 (115-212)||(43685839-43685936)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (5-254)||(1467571-1467822)
chr3 (5-254)||(12264623-12264875)
chr3 (5-254)||(49232609-49232860)
chr3 (5-254)||(12812014-12812265)
chr3 (5-237)||(22275382-22275615)
chr3 (5-212)||(18911166-18911373)
chr3 (5-212)||(25058912-25059119)
chr3 (5-212)||(15468216-15468423)
chr3 (5-212)||(18896920-18897127)
chr3 (5-212)||(5228486-5228692)
chr3 (5-170)||(12902008-12902173)
chr3 (61-237)||(41270304-41270478)
chr3 (61-237)||(55316448-55316622)
chr3 (7-212)||(54651632-54651837)
chr3 (5-213)||(16821312-16821517)
chr3 (5-170)||(44229158-44229323)
chr3 (69-170)||(15936553-15936654)
chr3 (69-170)||(15938395-15938496)
chr3 (5-170)||(15615006-15615168)
chr3 (138-212)||(8268609-8268683)
chr3 (138-212)||(8275709-8275783)
chr3 (139-212)||(14842446-14842519)
chr3 (139-212)||(23492696-23492769)
chr3 (115-212)||(2449111-2449208)
chr3 (5-90)||(11986172-11986257)
chr3 (96-212)||(13954763-13954880)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (5-254)||(11231170-11231421)
chr2 (5-254)||(22513017-22513268)
chr2 (5-254)||(28775639-28775890)
chr2 (5-221)||(24685648-24685864)
chr2 (5-212)||(12728565-12728772)
chr2 (5-212)||(16935766-16935973)
chr2 (5-212)||(17006426-17006633)
chr2 (5-212)||(34824648-34824855)
chr2 (5-212)||(8944019-8944226)
chr2 (5-212)||(12635744-12635951)
chr2 (5-212)||(42177845-42178052)
chr2 (61-254)||(19886492-19886684)
chr2 (5-209)||(3798482-3798686)
chr2 (5-212)||(12641518-12641725)
chr2 (5-170)||(23777963-23778128)
chr2 (5-212)||(23774310-23774516)
chr2 (139-254)||(24826531-24826646)
chr2 (5-123)||(21142068-21142187)
chr2 (5-170)||(5888548-5888712)
chr2 (139-212)||(25213372-25213446)
chr2 (5-170)||(7507758-7507935)
chr2 (115-212)||(14906313-14906410)
chr2 (96-170)||(19689316-19689391)
chr2 (115-212)||(23820364-23820461)
chr2 (96-170)||(17396568-17396643)
chr2 (115-212)||(20015304-20015401)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (5-228)||(29335-29558)
scaffold0213 (202-241)||(29565-29604)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (5-237)||(15287096-15287328)
chr4 (5-237)||(18169143-18169375)
chr4 (5-237)||(15294205-15294437)
chr4 (5-212)||(7131941-7132148)
chr4 (5-212)||(20000896-20001103)
chr4 (5-212)||(17145533-17145740)
chr4 (5-182)||(18248391-18248568)
chr4 (5-170)||(19020659-19020824)
chr4 (5-237)||(22351915-22352146)
chr4 (5-241)||(10644392-10644625)
chr4 (5-170)||(22738442-22738607)
chr4 (46-161)||(8378365-8378480)
chr4 (5-212)||(26339193-26339399)
chr4 (61-212)||(47357883-47358030)
chr4 (139-237)||(14952085-14952183)
chr4 (95-170)||(9795490-9795564)
chr4 (138-212)||(14996444-14996518)
chr4 (5-48)||(8374681-8374724)
chr4 (132-170)||(8378486-8378524)
chr4 (115-212)||(16608972-16609069)
chr4 (115-212)||(26680493-26680590)
chr4 (115-170)||(16327841-16327896)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (5-212)||(1390-1597)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (5-212)||(1451-1658)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (5-212)||(153883-154090)
scaffold0023 (66-254)||(36327-36514)
scaffold0023 (61-254)||(169741-169935)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (5-212)||(5088-5295)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (5-237)||(2565-2799)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (5-212)||(3895-4102)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (5-237)||(7306-7539)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (66-254)||(31506-31693)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (61-246)||(20953-21139)
scaffold0139 (61-246)||(13899-14084)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (61-212)||(10624-10775)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (5-182)||(10245-10422)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (5-237)||(6771-7002)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (5-212)||(34034-34241)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (5-237)||(1153-1383)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (5-241)||(13171-13404)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (61-237)||(64372-64546)
scaffold0026 (69-170)||(107983-108084)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (5-212)||(3135-3341)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (5-170)||(54047-54212)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (5-237)||(23600-23831)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (7-170)||(54591-54755)
scaffold0066 (5-170)||(45203-45369)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (5-212)||(208-411)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (5-130)||(3586-3711)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (139-254)||(130880-130997)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (5-170)||(9266-9428)
scaffold0215 (5-170)||(16164-16326)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (139-243)||(17136-17241)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (5-170)||(7383-7547)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (146-237)||(154282-154373)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (66-170)||(12045-12149)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (5-81)||(3-79)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (95-170)||(13268-13342)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (5-212)||(5949-6155)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (139-212)||(841-914)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (5-90)||(56105-56190)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (96-170)||(34374-34450)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (115-212)||(22833-22930)
scaffold0141 (115-212)||(27088-27185)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (115-212)||(1455-1552)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (5-90)||(41820-41905)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (139-171)||(42677-42709)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18059841 - 18059590
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059841 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 18059742  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059741 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattatacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 18059642  T
Q  205 agctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18059641 agctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 18059590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 17004811 - 17005062
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17004811 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 17004910  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  17004911 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 17005010  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  17005011 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 17005062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38055174 - 38054923
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38055174 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 38055075  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  38055074 tttcatacaacatgagaagatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 38054975  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  38054974 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 38054923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19962582 - 19962366
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19962582 gtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccat 19962483  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  19962482 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 19962383  T
Q  205 agctcctaggtcaccca 221  Q
    |||||||||||| ||||    
T  19962382 agctcctaggtcgccca 19962366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 17148740 - 17148992
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17148740 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccat 17148839  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa-cccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17148840 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttgcttcaatt 17148939  T
Q  204 cagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17148940 cagctcctatgtcaccccacttgattcctcaagctttcccttcaaccctcttg 17148992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 22227981 - 22228185
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22227981 gtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 22228080  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  22228081 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 22228180  T
Q  205 agctc 209  Q
    |||||    
T  22228181 agctc 22228185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 22232678 - 22232882
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22232678 gtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 22232777  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  22232778 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 22232877  T
Q  205 agctc 209  Q
    |||||    
T  22232878 agctc 22232882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 46523562 - 46523768
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46523562 gtaatttcacccacaaacataacataaacatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 46523661  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||| ||||     
T  46523662 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-atggaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctttaattt 46523760  T
Q  205 agctccta 212  Q
    | ||||||    
T  46523761 atctccta 46523768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5072467 - 5072237
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  5072467 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 5072368  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||    
T  5072367 tttcatacaacttgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttcaattc 5072270  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5072269 agctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 5072237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 22035621 - 22035827
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22035621 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 22035719  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  22035720 tttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 22035819  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  22035820 agctccta 22035827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7641016 - 7640810
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  7641016 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 7640918  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  7640917 tttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 7640818  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  7640817 agctccta 7640810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 2116427 - 2116589
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  2116427 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 2116526  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2116527 ttttatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccctttacctt 2116589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 45051595 - 45051757
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  ||  || || ||||| |||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  45051595 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 45051694  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45051695 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--cacatgattatgataaagactaacccccttacctt 45051757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861284
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctag 213  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15861284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18601197 - 18601052
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  18601197 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 18601098  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  18601097 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataat 18601052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18598914 - 18598845
Alignment:
Q  148 ataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18598914 ataataactaacccccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttcaattcagctcctaagtcac 18598845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 51452765 - 51452882
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 193  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  51452765 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 51452863  T
Q  194 tgcttcaattcagctccta 212  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  51452864 ggcttcaatttagctccta 51452882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251398
Alignment:
Q  6 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
Q  106 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251548 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 22251449  T
Q  206 gctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  22251448 gctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttg 22251398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16376456 - 16376205
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16376456 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 16376357  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16376356 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 16376257  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  16376256 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 16376205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16383780 - 16383529
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16383780 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 16383681  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16383680 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 16383581  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  16383580 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 16383529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22225821 - 22225570
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225821 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 22225722  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225721 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 22225622  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  22225621 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttg 22225570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 10488872 - 10489123
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488872 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 10488971  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  10488972 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 10489071  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  10489072 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 10489123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16556222 - 16555973
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16556222 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 16556123  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16556122 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 16556023  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctct 252  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  16556022 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16555973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16632778 - 16632529
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16632778 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 16632679  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16632678 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 16632579  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctct 252  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||    
T  16632578 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16632529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 16232065 - 16232297
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16232065 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 16232164  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  16232165 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 16232264  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16232265 agctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 16232297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 19299410 - 19299626
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19299410 gtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccat 19299509  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  19299510 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 19299609  T
Q  205 agctcctaggtcaccca 221  Q
    |||||||||||| ||||    
T  19299610 agctcctaggtcgccca 19299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18086906 - 18086674
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18086906 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 18086807  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  18086806 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 18086707  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18086706 agctcctaagtcacccacttgatttctaaagct 18086674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 1556178 - 1556385
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1556178 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 1556277  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||    
T  1556278 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattc 1556377  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  1556378 agctccta 1556385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 19610191 - 19610398
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19610191 gtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccat 19610290  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  19610291 tttcatacaacatcagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 19610390  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  19610391 agctccta 19610398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 23977942 - 23978149
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23977942 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccat 23978041  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  23978042 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 23978141  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  23978142 agctccta 23978149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27654006 - 27653814
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  27654006 cacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 27653908  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653907 ccctcacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 27653814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13620875 - 13620712
Alignment:
Q  7 aatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattt 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13620875 aatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattt 13620776  T
Q  107 tcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  13620775 tcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29869858 - 29869627
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  29869858 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 29869760  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacat-gattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaatt 203  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  || ||| ||||||||||||    
T  29869759 tttcatacaacatgagaagatgtaaa-attttaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaatt 29869661  T
Q  204 cagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29869660 cagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 29869627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 25175792 - 25175968
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaac 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  25175792 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-attatacatgattatggtaatcactaac 25175890  T
Q  160 ccccttacctttgaagatgattattcctaa-cccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25175891 ccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctccta-gtcacccacttgattccgaaagct 25175968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14626209 - 14625961
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| | | ||     
T  14626209 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaa 14626110  T
Q  105 tttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaat 202  Q
    || || |||||||  |||||  || ||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  14626109 tt-caaacaacatttgagaatttgtaaag--tgaagatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaat 14626013  T
Q  203 tcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14626012 tcagctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttcccttcaaccctcttg 14625961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 29666046 - 29666208
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||  || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  29666046 gtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatcaccccat 29666145  T
Q  105 tttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 166  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  29666146 tttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccactta 29666208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16814930 - 16814829
Alignment:
Q  154 actaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctct 252  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16814930 actaaccctcttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattgctaaagcttcccttcaaacctct 16814831  T
Q  253 tg 254  Q
    ||    
T  16814830 tg 16814829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1650184 - 1650022
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  ||  || || ||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  1650184 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 1650085  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1650084 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16825775 - 16825678
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaac 159  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  16825775 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991470
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcct-aacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 4991470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1657738 - 1657620
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 193  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||    
T  1657738 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactct 1657639  T
Q  194 tgcttcaattcagctccta 212  Q
    || ||||||||||||||||    
T  1657638 tgtttcaattcagctccta 1657620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 15862744 - 15862862
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 193  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||    
T  15862744 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactct 15862843  T
Q  194 tgcttcaattcagctccta 212  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  15862844 tgcttcaattcacctccta 15862862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 90
Target Start/End: Original strand, 19629556 - 19629588
Alignment:
Q  58 caccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 90  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19629556 caccacaacaagagcacgaatttaacaacaatt 19629588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 7822901 - 7823152
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7822901 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 7823000  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  7823001 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 7823100  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  7823101 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 7823152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 7830212 - 7830463
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7830212 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 7830311  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  7830312 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 7830411  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  7830412 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 7830463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 27176606 - 27176857
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27176606 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 27176705  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  27176706 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 27176805  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27176806 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 27176857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27101720 - 27101469
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27101720 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 27101621  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  27101620 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 27101521  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  27101520 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 27101469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27109068 - 27108817
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27109068 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 27108969  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  27108968 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 27108869  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  27108868 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 27108817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38783812 - 38783561
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38783812 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 38783713  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  38783712 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 38783613  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  38783612 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 38783561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18980104 - 18979872
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18980104 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 18980005  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  18980004 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 18979905  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18979904 agctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 18979872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15950874 - 15950641
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15950874 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 15950775  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  15950774 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 15950675  T
Q  205 agctcctaggtca-cccacttgattcctaaagct 237  Q
    ||||||||| | | |||| ||||||||| |||||    
T  15950674 agctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 15950641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 15927741 - 15927973
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  15927741 gtaatttcacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccat 15927840  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  15927841 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 15927940  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15927941 agctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 15927973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 13758543 - 13758750
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13758543 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccat 13758642  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  13758643 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 13758742  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  13758743 agctccta 13758750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15760197 - 15759990
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15760197 gtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccat 15760098  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||    
T  15760097 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattc 15759998  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  15759997 agctccta 15759990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13911103 - 13910855
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || | |||||||||| ||| |  || ||| || |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||    
T  13911103 gtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcat 13911004  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  13911003 tttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcaataacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 13910905  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910904 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 13910855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 61 - 247
Target Start/End: Original strand, 2437686 - 2437873
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437686 cacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattatcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacc 2437784  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaac 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  2437785 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaac 2437873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14250981 - 14250775
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250981 gtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 14250882  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | | ||| |||||||||||||    
T  14250881 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttaccttagaagaagataact-caaactcttgcttcaattc 14250783  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  14250782 agctccta 14250775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 13572849 - 13573079
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || || || || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  13572849 gtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 13572948  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  13572949 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 13573046  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13573047 agctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 13573079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16479041 - 16478808
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || | ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  16479041 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccat 16478942  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||    
T  16478941 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--aaatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttc 16478845  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16478844 agctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttccc 16478808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 244
Target Start/End: Original strand, 10989638 - 10989821
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10989638 cacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacc 10989736  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacc-cacttgattcctaaagcttcccttc 244  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  10989737 cccatacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattaagctcctatgtcacctcacttgattcctcaagctccccttc 10989821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48622749 - 48622584
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  48622749 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccat 48622650  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  48622649 tttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 48622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18253862 - 18253761
Alignment:
Q  69 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 168  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18253862 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 18253763  T
Q  169 tt 170  Q
    ||    
T  18253762 tt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 170
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
Q  87 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 16418671 - 16418835
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  16418671 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagcaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 16418769  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  16418770 tttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 16418835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10000452 - 10000288
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||  | || || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  10000452 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaacaa-caacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccat 10000354  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  ||| |  |||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  10000353 ttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatgaagacaaacccccttacctt 10000288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516719
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctag 213  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 7293289 - 7293406
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 193  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  7293289 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 7293387  T
Q  194 tgcttcaattcagctccta 212  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  7293388 ggcttcaatttagctccta 7293406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30262119 - 30262002
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 193  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  30262119 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 30262021  T
Q  194 tgcttcaattcagctccta 212  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  30262020 ggcttcaatttagctccta 30262002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 11516520 - 11516617
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  11516520 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 11516617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15441534 - 15441437
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  15441534 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 15441437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 13321289 - 13321407
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 193  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||      
T  13321289 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaaccta 13321388  T
Q  194 tgcttcaattcagctccta 212  Q
     |||||| || ||||||||    
T  13321389 ggcttcactttagctccta 13321407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14113959 - 14113904
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14113959 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 14113904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14423629 - 14423555
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14423629 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataa-gactaacccccttacctt 14423555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21932464 - 21932213
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21932464 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 21932365  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  21932364 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 21932265  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  21932264 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 21932213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21938634 - 21938383
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21938634 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 21938535  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  21938534 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 21938435  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  21938434 agctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 21938383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 35582209 - 35582460
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35582209 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 35582308  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  35582309 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 35582408  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  35582409 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 35582460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10778053 - 10777802
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10778053 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 10777954  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10777953 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgcttcaattc 10777854  T
Q  205 agctcctaggtca-cccacttgattcctaaagctt-cccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  10777853 agctcctaggtcaccccacttgattcctcaagcttccccttcaactctcttg 10777802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36989853 - 36989602
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36989853 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 36989754  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  36989753 tttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 36989654  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  36989653 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 36989602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22883167 - 22882951
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22883167 gtaatttcatccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccat 22883068  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22883067 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattc 22882968  T
Q  205 agctcctaggtcaccca 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  22882967 agctcctaggtcaccca 22882951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 7425497 - 7425729
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7425497 gtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccat 7425596  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  7425597 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 7425696  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7425697 agctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 7425729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11212148 - 11211940
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11212148 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 11212049  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  11212048 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 11211949  T
Q  205 agctcctag 213  Q
    |||||||||    
T  11211948 agctcctag 11211940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17471671 - 17471438
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17471671 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccat 17471572  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||||||||    
T  17471571 tttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaactcttgcttcaattc 17471472  T
Q  205 agctcctaggtca-cccacttgattcctaaagct 237  Q
    ||||||||| | | |||| ||||||||| |||||    
T  17471471 agctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 17471438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 23514734 - 23514941
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23514734 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 23514833  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  23514834 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 23514933  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  23514934 agctccta 23514941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35791181 - 35790974
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35791181 gtaatttcactcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 35791082  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  35791081 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 35790982  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  35790981 agctccta 35790974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1219603 - 1219396
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1219603 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 1219504  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  1219503 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 1219404  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  1219403 agctccta 1219396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18778015 - 18777823
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  18778015 cacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 18777917  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18777916 cccttacctttgaagttaattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttcccttcaaccctcttg 18777823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21073618 - 21073426
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21073618 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacc 21073520  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073519 cccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 21073426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 12603 - 12795
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12603 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaa-attacacatgattatgataataactaacc 12701  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12702 cccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 12795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29188363 - 29188116
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  29188363 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcgacccat 29188264  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29188263 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattataataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 29188167  T
Q  205 agctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29188166 agctcctaggtcaccccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 29188116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22366504 - 22366311
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  22366504 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 22366406  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22366405 cccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcaactcctaggtcaccccacttgattgctaaagcttcccttcaaccctcttg 22366311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4200064 - 4199816
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || |||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||    
T  4200064 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcat 4199965  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  4199964 tttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatccctaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 4199866  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199865 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 4199816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 19500128 - 19500319
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19500128 cacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 19500226  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19500227 cccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcacccacttgattcctcaagcttcccttcaactctcttg 19500319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43443474 - 43443232
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  43443474 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaatccat 43443375  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  43443374 tttcatataacatgagaatatgca---attacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 43443278  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443277 agctcctaggtcacccacttgattcct-aagcttcccttcaaccctc 43443232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 25426857 - 25427049
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  25426857 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacc 25426955  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaa-cccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25426956 cccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgcttcaattcagctccta-gttacccacttgattctttaagcttcccttcaaccctcttg 25427049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 27010014 - 27010244
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | |  ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  27010014 gtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 27010113  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  27010114 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 27010211  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27010212 agctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 27010244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 23328731 - 23328937
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23328731 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 23328829  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  23328830 tttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 23328929  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  23328930 agctccta 23328937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 24616335 - 24616541
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  24616335 gtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 24616433  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  24616434 tttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 24616533  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  24616534 agctccta 24616541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 24712711 - 24712917
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  24712711 gtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 24712809  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  24712810 tttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 24712909  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  24712910 agctccta 24712917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 24745729 - 24745935
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  24745729 gtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 24745827  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  24745828 tttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 24745927  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  24745928 agctccta 24745935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 254
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343125
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagct 11343107  T
Q  237 ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  11343108 ttcccttcaacactcttg 11343125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 254
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106084
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 236  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||     
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 16106066  T
Q  237 ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  16106067 ttcccttcaacactcttg 16106084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 20623262 - 20623359
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20623262 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 20623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21233498 - 21233401
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  21233498 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 21233401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Original strand, 32950867 - 32950952
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 90  Q
    ||||||||| ||| || ||||| || |||||||| |||  |||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32950867 gtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 32950952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 37053037 - 37053134
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  37053037 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 37053134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25900376 - 25900321
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25900376 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 25900321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 16536490 - 16536587
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16536490 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16536587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 31482 - 31733
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31482 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 31581  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  31582 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 31681  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  31682 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 31733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Original strand, 39819 - 39935
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39819 gtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 39918  T
Q  105 tttcatacaacatgaga 121  Q
    |||||||||||||||||    
T  39919 tttcatacaacatgaga 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 39276 - 39527
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39276 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 39375  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  39376 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 39475  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  39476 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 39527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 43170 - 43404
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || | |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  43170 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccat 43269  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaa-tgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||| ||    
T  43270 tttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-att--acatgtttgtgatagtaactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcactt 43366  T
Q  204 cagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  43367 cagctcctagatcacccacttgattcctcaagcttccc 43404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 271443 - 271192
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  271443 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 271344  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  271343 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 271244  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  271243 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 271192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 644477 - 644728
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  644477 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 644576  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  644577 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 644676  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  644677 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 644728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 830212 - 830463
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  830212 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 830311  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  830312 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 830411  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  830412 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 830463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15319242 - 15319026
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15319242 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 15319143  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  15319142 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 15319043  T
Q  205 agctcctaggtcaccca 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  15319042 agctcctaggtcaccca 15319026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15499611 - 15499395
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15499611 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 15499512  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  15499511 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 15499412  T
Q  205 agctcctaggtcaccca 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  15499411 agctcctaggtcaccca 15499395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22088877 - 22088626
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22088877 gtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacat 22088778  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22088777 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 22088678  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  22088677 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 22088626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22006341 - 22006134
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22006341 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 22006242  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||| |||||||||||||    
T  22006241 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaaactcttgcttcaattc 22006142  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  22006141 agctccta 22006134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13721011 - 13720804
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13721011 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 13720912  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  13720911 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 13720812  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  13720811 agctccta 13720804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13662348 - 13662141
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13662348 gtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccat 13662249  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  13662248 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 13662149  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  13662148 agctccta 13662141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 16195404 - 16195611
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16195404 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 16195503  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  16195504 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgcttcaattc 16195603  T
Q  205 agctccta 212  Q
    | ||||||    
T  16195604 aactccta 16195611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16873134 - 16872927
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16873134 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccat 16873035  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||||||||||||     
T  16873034 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaattt 16872935  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  16872934 agctccta 16872927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Original strand, 30120951 - 30121144
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||  |||||||||||||||| |||||||    
T  30120951 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagattatacaaaaattacacatgattatgataatcactaacc 30121050  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30121051 cccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 30121144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6774337 - 6774105
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  6774337 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 6774238  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  6774237 tttcatataacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 6774141  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6774140 agctccta-gtcacccacttgattcctcaagcttccc 6774105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 24549154 - 24549387
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  24549154 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 24549253  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||| |||    
T  24549254 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagttgattatccttaaccctagcttcacttc 24549350  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24549351 agctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttccc 24549387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21852043 - 21851810
Alignment:
Q  6 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 105  Q
    |||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |    
T  21852043 taatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaat 21851944  T
Q  106 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||| || ||||    
T  21851943 ttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagctccacttca 21851846  T
Q  206 gctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 241  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21851845 gcttctaggtcacccacttgattcctcaagcttccc 21851810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21844651 - 21844417
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||     
T  21844651 gtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaa 21844552  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||| ||| || |||    
T  21844551 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacccccttaccgttgaagttgattatccttaatcctagctccacttc 21844454  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21844453 agcttctaggtcacccacttgattcctcaagcttccc 21844417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16674471 - 16674245
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | ||| |||||| ||| || || ||| || ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  16674471 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccat 16674372  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||    
T  16674371 tttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagatta-actcaactcttgcttcaattc 16674275  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaa 234  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16674274 agctcataagtcacccacttgattcctaaa 16674245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 17345842 - 17345960
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 193  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||  || ||| ||    
T  17345842 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactct 17345941  T
Q  194 tgcttcaattcagctccta 212  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17345942 tgcttcaattcagctccta 17345960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22907204 - 22907087
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 193  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  22907204 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 22907106  T
Q  194 tgcttcaattcagctccta 212  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  22907105 ggcttcaatttagctccta 22907087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 5238380 - 5238477
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  5238380 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 5238477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24661218 - 24661121
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  24661218 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 24661121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 43685839 - 43685936
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  43685839 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 43685936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1467822 - 1467571
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1467822 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 1467723  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  1467722 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 1467623  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  1467622 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 1467571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12264875 - 12264623
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12264875 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 12264776  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  12264775 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgcttcaattc 12264676  T
Q  205 agctcctaggtcaccc--acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  12264675 agctcctaggtcaccccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 12264623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 49232609 - 49232860
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49232609 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 49232708  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  49232709 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 49232808  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  49232809 agctcataggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 49232860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 12812014 - 12812265
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12812014 gtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccat 12812113  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  12812114 tttcatacaatatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 12812213  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  12812214 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 12812265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 22275382 - 22275615
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22275382 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 22275481  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||    
T  22275482 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaacttttgcttcaattc 22275581  T
Q  205 agctcctaggtca-cccacttgattcctaaagct 237  Q
    ||||||||| | | |||| ||||||||| |||||    
T  22275582 agctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 22275615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 18911166 - 18911373
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18911166 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 18911265  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  18911266 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 18911365  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  18911366 agctccta 18911373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 25058912 - 25059119
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25058912 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 25059011  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||   ||||||||||||    
T  25059012 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgcttcaattc 25059111  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  25059112 agctccta 25059119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15468423 - 15468216
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15468423 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcctcaacccat 15468324  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||    
T  15468323 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattc 15468224  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  15468223 agctccta 15468216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18897127 - 18896920
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18897127 gtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacccat 18897028  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  18897027 tttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 18896928  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  18896927 agctccta 18896920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 5228486 - 5228692
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5228486 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat-gttcatcaacccat 5228584  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||| ||||||||    
T  5228585 tttcataacacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattc 5228684  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  5228685 agctccta 5228692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12902173 - 12902008
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  12902173 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccat 12902074  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902073 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 41270304 - 41270478
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  41270304 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 41270401  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41270402 cccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 41270478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 55316448 - 55316622
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  55316448 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 55316545  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    || ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55316546 cctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 55316622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 54651632 - 54651837
Alignment:
Q  7 aatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattt 106  Q
    |||||||| || || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  54651632 aatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattt 54651731  T
Q  107 tcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcag 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||  || |||  ||||||||||| ||    
T  54651732 tcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaattaag 54651831  T
Q  207 ctccta 212  Q
    ||||||    
T  54651832 ctccta 54651837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 16821312 - 16821517
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||| | ||| |  || ||| || ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  16821312 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacataaattgttcatcaacccat 16821411  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||| |||||||||||||    
T  16821412 tttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacacaaactcttgcttcaattc 16821508  T
Q  205 agctcctag 213  Q
    |||||||||    
T  16821509 agctcctag 16821517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 44229158 - 44229323
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44229158 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccat 44229257  T
Q  105 tttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44229258 tttcatacaaccatgagaaa-tgaaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 44229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15936654 - 15936553
Alignment:
Q  69 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 168  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15936654 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccatacc 15936555  T
Q  169 tt 170  Q
    ||    
T  15936554 tt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15938496 - 15938395
Alignment:
Q  69 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 168  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15938496 gagcacgtatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 15938397  T
Q  169 tt 170  Q
    ||    
T  15938396 tt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 15615006 - 15615168
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || | ||| || |||||||||||| ||| |  || ||| |||||||| |||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  15615006 gtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccat 15615105  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15615106 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 15615168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268609
Alignment:
Q  138 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8268683 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8268609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275709
Alignment:
Q  138 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8275783 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8275709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842446
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctccta 14842446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492769
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 23492769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2449208 - 2449111
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  2449208 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 2449111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 11986257 - 11986172
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 90  Q
    ||||||||| ||| || ||||| || ||||| || ||| ||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11986257 gtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 11986172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13954880 - 13954763
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaccct 193  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  13954880 tcaacccattt-catacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 13954782  T
Q  194 tgcttcaattcagctccta 212  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  13954781 ggcttcaatttagctccta 13954763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11231421 - 11231170
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11231421 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 11231322  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  11231321 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 11231222  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  11231221 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 11231170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22513268 - 22513017
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22513268 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 22513169  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22513168 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 22513069  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  22513068 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 22513017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28775890 - 28775639
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28775890 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 28775791  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  28775790 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 28775691  T
Q  205 agctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  28775690 agctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttg 28775639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24685864 - 24685648
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24685864 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccat 24685765  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  24685764 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattc 24685665  T
Q  205 agctcctaggtcaccca 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  24685664 agctcctaggtcaccca 24685648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 12728565 - 12728772
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12728565 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 12728664  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  12728665 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 12728764  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  12728765 agctccta 12728772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 16935766 - 16935973
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935766 gtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 16935865  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| |||||||||    
T  16935866 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattc 16935965  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  16935966 agctccta 16935973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 17006426 - 17006633
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006426 gtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 17006525  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| |||||||||    
T  17006526 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattc 17006625  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  17006626 agctccta 17006633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 34824648 - 34824855
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34824648 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 34824747  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  34824748 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 34824847  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  34824848 agctccta 34824855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 8944019 - 8944226
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8944019 gtaatttcacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 8944118  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  8944119 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 8944218  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  8944219 agctccta 8944226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12635951 - 12635744
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12635951 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctat 12635852  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  12635851 tttcatacaacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 12635752  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  12635751 agctccta 12635744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42178052 - 42177845
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42178052 gtaatttcacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 42177953  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||    
T  42177952 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattc 42177853  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||| ||||    
T  42177852 agccccta 42177845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19886684 - 19886492
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19886684 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacc 19886586  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886585 cccttacctttgaagttgattatccttaatcctagtttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 19886492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3798686 - 3798482
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3798686 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccat 3798587  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  3798586 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 3798487  T
Q  205 agctc 209  Q
    |||||    
T  3798486 agctc 3798482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12641725 - 12641518
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12641725 gtaatttcagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccat 12641626  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||     
T  12641625 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattt 12641526  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  12641525 agctccta 12641518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23778128 - 23777963
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23778128 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 23778029  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23778028 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 23774310 - 23774516
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23774310 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 23774408  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  23774409 tttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 23774508  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  23774509 agctccta 23774516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 139 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24826646 - 24826531
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt 238  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826646 atgattatgatgatgactaacccctttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagctt 24826547  T
Q  239 cccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||||||||    
T  24826546 cccttcaaccctcttg 24826531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 21142068 - 21142187
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21142068 gtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccat 21142167  T
Q  105 tttcatacaa-catgagaaa 123  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  21142168 tttcatacaaccatgagaaa 21142187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5888712 - 5888548
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5888712 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagcaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 5888614  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  5888613 tttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 5888548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213446
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcct-aacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 25213446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7507935 - 7507758
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttca--------- 95  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||             
T  7507935 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaataattattcattcattcaa 7507836  T
Q  96 -tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
     ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  7507835 ttcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 7507758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14906410 - 14906313
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  14906410 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 14906313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19689391 - 19689316
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19689391 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 19689316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 23820364 - 23820461
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  23820364 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 23820461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17396643 - 17396568
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  17396643 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagactaacccccttacctt 17396568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 20015304 - 20015401
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20015304 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 20015401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 29335 - 29558
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29335 gtaatttcacccataaacataacataatcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 29434  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||| |||    
T  29435 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttc 29534  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgatt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29535 agctcctaggtcacccacttgatt 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 241
Target Start/End: Original strand, 29565 - 29604
Alignment:
Q  202 ttcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29565 ttcagctcctaggtcacccacttgattcctcaagcttccc 29604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15287328 - 15287096
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||    
T  15287328 gtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccat 15287229  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  15287228 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 15287129  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15287128 agctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 15287096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 18169143 - 18169375
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18169143 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 18169242  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  |||||||||||||    
T  18169243 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc-ttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattc 18169341  T
Q  205 agctcctaggtca-cccacttgattcctaaagct 237  Q
    ||||||||| | | |||| ||||||||| |||||    
T  18169342 agctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 18169375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15294437 - 15294205
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||    
T  15294437 gtaatttcacccacaaacataccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccat 15294338  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  15294337 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 15294238  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15294237 agctcctaagtcacccacttcattcctaaagct 15294205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7132148 - 7131941
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7132148 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 7132049  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  7132048 tttcatataacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgcttcaattc 7131949  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  7131948 agctccta 7131941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 20000896 - 20001103
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20000896 gtaatttcacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccat 20000995  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  20000996 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 20001095  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  20001096 agctccta 20001103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17145740 - 17145533
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17145740 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcat 17145641  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||| |||||||||    
T  17145640 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttacttcaattc 17145541  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  17145540 agctccta 17145533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 18248391 - 18248568
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18248391 gtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccat 18248490  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 182  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18248491 tttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacaagattatgataataactaacccccttaccttagatgatgatta 18248568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 19020659 - 19020824
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19020659 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 19020758  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19020759 tttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22352146 - 22351915
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||| || | |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  22352146 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataacaagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 22352048  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  22352047 tttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 22351948  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22351947 agctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 22351915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 10644392 - 10644625
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||  | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  10644392 gtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 10644491  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||  ||||| |||    
T  10644492 tttcatacaacatgagcaaatgcaaa-att--acatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttcacttc 10644588  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10644589 agctcctagatcacccacttgattcctcaagcttccc 10644625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 22738442 - 22738607
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  22738442 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccat 22738541  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  22738542 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaattgattatgatgaagacaaacccccttacctt 22738607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 161
Target Start/End: Original strand, 8378365 - 8378480
Alignment:
Q  46 acaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgatta 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8378365 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgatta 8378464  T
Q  146 tgataataactaaccc 161  Q
    ||||||||||||||||    
T  8378465 tgataataactaaccc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 26339193 - 26339399
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  26339193 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 26339291  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||     
T  26339292 tttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattt 26339391  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  26339392 agctccta 26339399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 212
Target Start/End: Original strand, 47357883 - 47358030
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  47357883 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaggaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacc 47357979  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  47357980 cccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttcaattcagctccta 47358030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952183
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 14952183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
Q  95 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 212
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996518
Alignment:
Q  138 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  14996444 catgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 14996518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Original strand, 8374681 - 8374724
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcaca 48  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8374681 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcaca 8374724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 170
Target Start/End: Original strand, 8378486 - 8378524
Alignment:
Q  132 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378486 attgtacatgattatgataataactaatccccttacctt 8378524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16609069 - 16608972
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16609069 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16608972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 26680493 - 26680590
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  26680493 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 26680590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16327896 - 16327841
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16327896 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 16327841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1597 - 1390
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1597 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 1498  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||    
T  1497 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattc 1398  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  1397 agctccta 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1658 - 1451
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1658 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccat 1559  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||||||||||||||    
T  1558 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgcttcaattc 1459  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  1458 agctccta 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 154090 - 153883
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  154090 gtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 153991  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||||    
T  153990 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaattc 153891  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  153890 agctccta 153883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 254
Target Start/End: Original strand, 36327 - 36514
Alignment:
Q  66 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 165  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36327 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcattaaccccctt 36425  T
Q  166 acctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36426 acctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagctttccttcaaccctcttg 36514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 169935 - 169741
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  169935 cacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacc 169837  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagcttc-ccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  169836 cccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagctcttatgtcaccccacttgattcctcaagcttcgccttcaactctcttg 169741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5295 - 5088
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5295 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccat 5196  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  5195 tttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaactcccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 5096  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  5095 agctccta 5088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 2565 - 2799
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2565 gtaatttcacccacaaacataccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccat 2664  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaga-ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||    
T  2665 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatt 2764  T
Q  204 cagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||||| | | |||| ||||||||| |||||    
T  2765 cagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 2799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 3895 - 4102
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3895 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 3994  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  3995 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttcaattc 4094  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  4095 agctccta 4102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7539 - 7306
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  7539 gtaatttcatccacaaacataccataatcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccat 7440  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||    
T  7439 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattc 7340  T
Q  205 agctcctaggtca-cccacttgattcctaaagct 237  Q
    ||||||||| | | |||| ||||||||| |||||    
T  7339 agctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 7306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31693 - 31506
Alignment:
Q  66 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctt 165  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31693 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaaccccctt 31595  T
Q  166 acctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 254  Q
    || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31594 acatttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttcccttcaaccctcttg 31506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 61 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21139 - 20953
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139 cacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacc 21041  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  21040 cccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaa 20953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14084 - 13899
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14084 cacagcaagagcacga-tttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacc 13987  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc-ttcccttcaa 246  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  13986 cccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaa 13899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 61 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10775 - 10624
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775 cacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacc 10676  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10675 cccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctccta 10624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10422 - 10245
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10422 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccat 10323  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |  || |||||||||||||| || ||||||||    
T  10322 tttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgatta 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 6771 - 7002
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  6771 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 6869  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  6870 tttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 6969  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6970 agctcctaagtcacccacttgattcgtaaagct 7002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34241 - 34034
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  34241 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca- 34143  T
Q  105 tttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaatt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||    
T  34142 tttcatacaacaatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatt 34043  T
Q  204 cagctccta 212  Q
     ||||||||    
T  34042 tagctccta 34034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1153
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| |  | |||||||||| ||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  1383 gtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccat 1284  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  1283 tttcatacaacatgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattc 1186  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1185 agctcctaagtcaccaacttgattcctaaagct 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13404 - 13171
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || ||||  |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  13404 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccat 13305  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| |||    
T  13304 tttcatacaacatgagaaaatgaaaa-att--acatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttc 13208  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagcttccc 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13207 agttcctaggtcacccacttgattcctcaagcttccc 13171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 64546 - 64372
Alignment:
Q  61 cacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacc 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  64546 cacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaacc 64449  T
Q  161 cccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  64448 cccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattccttaagct 64372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Original strand, 107983 - 108084
Alignment:
Q  69 gagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 168  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  107983 gagcacgaatttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacc 108082  T
Q  169 tt 170  Q
    ||    
T  108083 tt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 3135 - 3341
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| | | |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3135 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 3234  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||    
T  3235 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacataattatgataataattaacccccttaccttagaagaagattaaccgaaactcttgcttcaattc 3333  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  3334 agctccta 3341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 54047 - 54212
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  54047 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccat 54146  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  54147 tttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 54212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23831 - 23600
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||  | || || | | ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  23831 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataagaaacaa-caacataaccagagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccat 23733  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||    
T  23732 tttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataataactaacccccttaacttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattc 23633  T
Q  205 agctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23632 agttcctaagtcacccacttgattcctaaagct 23600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 54591 - 54755
Alignment:
Q  7 aatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattt 106  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54591 aatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattt 54690  T
Q  107 tcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  54691 tcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt 54755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 45203 - 45369
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45203 gtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatcaacccat 45302  T
Q  105 tttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45303 tttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 208 - 411
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  208 gtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 307  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattc 204  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  308 tttcatataacatgag-caatgcaaa-at--tacatgattttgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactctcgcttcaattc 403  T
Q  205 agctccta 212  Q
    ||||||||    
T  404 agctccta 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 130
Target Start/End: Original strand, 3586 - 3711
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  3586 gtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccat 3685  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaa 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3686 tttcataaaacatgagaaaatgcaaa 3711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 254
Target Start/End: Original strand, 130880 - 130997
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagc- 236  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 130979  T
Q  237 ttcccttcaaccctcttg 254  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  130980 ttcccttcaacactcttg 130997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9428 - 9266
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  9428 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 9329  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9328 tttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 9266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16164
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  16326 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 16227  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16226 tttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 16164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17136
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtca-cccacttgattcctaaagct 237  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 17142  T
Q  238 tccctt 243  Q
    | ||||    
T  17141 ttcctt 17136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Original strand, 7383 - 7547
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||| || | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  7383 gtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagcaac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccat 7481  T
Q  105 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  7482 tttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 7547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 154373 - 154282
Alignment:
Q  146 tgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccacttgattcctaaagct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  154373 tgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcacccacttgattcctaaagct 154282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
Q  66 caagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccct 164  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa-tgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct 12051  T
Q  165 tacctt 170  Q
    ||||||    
T  12050 tacctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 79 - 3
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaattta 81  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  79 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaattta 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  95 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6155 - 5949
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccat 104  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||   ||||||||||||| |||||||| | ||| | | ||     
T  6155 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaa 6056  T
Q  105 tttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttga-agatgattattcctaacccttgcttcaa 201  Q
    || ||||||||||  |||||  |||||||  || | |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  6055 tt-catacaacatttgagaatttgcaaag--tgaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataga-gattaatcctaactcttgcttcaa 5960  T
Q  202 ttcagctccta 212  Q
    |||||||||||    
T  5959 ttcagctccta 5949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 841
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||| ||||||||||||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaactcttgattcaattcagctccta 841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 56190 - 56105
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 90  Q
    ||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  56190 gtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 56105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34450 - 34374
Alignment:
Q  96 tcaacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 170  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34450 tcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccctcttacctt 34374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 22833 - 22930
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  22833 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 22930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 27088 - 27185
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  27088 catgaaaaattgcaaagaaggaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 27185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1552 - 1455
Alignment:
Q  115 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctccta 212  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  1552 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Original strand, 41820 - 41905
Alignment:
Q  5 gtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcaccacagcaagagcacgaatttaacaacaatt 90  Q
    ||||||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||| |  || ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41820 gtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 41905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42709
Alignment:
Q  139 atgattatgataataactaacccccttaccttt 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttaccttt 42709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University