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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0367_low_38 (Length: 255)

Name: NF0367_low_38
Description: NF0367
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0367_low_38
NF0367_low_38
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (22-219)||(3926400-3926597)
chr5 (80-186)||(42878736-42878842)
chr5 (86-221)||(42837713-42837848)
chr5 (117-220)||(39206939-39207042)
chr5 (123-221)||(23429445-23429543)
chr5 (117-219)||(33742521-33742623)
chr5 (117-173)||(35188430-35188486)
chr5 (84-182)||(2209796-2209893)
chr5 (92-186)||(26621603-26621697)
chr5 (84-156)||(39800234-39800306)
chr5 (22-150)||(39886941-39887069)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (20-211)||(8226966-8227157)
chr8 (60-221)||(9762692-9762853)
chr8 (60-221)||(11481621-11481782)
chr8 (11-221)||(7986919-7987129)
chr8 (84-184)||(36582721-36582820)
chr8 (20-167)||(7968187-7968334)
chr8 (12-165)||(28211632-28211785)
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (68-221)||(13807749-13807902)
chr2 (20-221)||(5110412-5110613)
chr2 (22-221)||(31575668-31575868)
chr2 (85-221)||(45151029-45151164)
chr2 (84-222)||(5704800-5704938)
chr2 (20-221)||(13626038-13626239)
chr2 (86-190)||(5938912-5939016)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (22-221)||(21288294-21288494)
chr3 (80-210)||(13826266-13826396)
chr3 (84-221)||(25874493-25874630)
chr3 (85-188)||(5295450-5295553)
chr3 (85-202)||(3778768-3778884)
chr3 (84-220)||(27926423-27926557)
chr3 (80-158)||(27519922-27520000)
chr3 (89-170)||(48251282-48251363)
chr3 (84-149)||(36585000-36585065)
chr3 (84-156)||(12149253-12149325)
chr3 (110-182)||(26188109-26188181)
chr3 (83-153)||(52632798-52632868)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (84-221)||(23809464-23809601)
chr7 (85-221)||(5973192-5973328)
chr7 (11-221)||(11038902-11039112)
chr7 (15-221)||(38440131-38440337)
chr7 (91-186)||(7767233-7767328)
chr7 (20-220)||(2943777-2943976)
chr7 (11-220)||(30541203-30541411)
chr7 (84-173)||(22518965-22519054)
chr7 (80-186)||(25502330-25502437)
chr7 (92-160)||(2891187-2891255)
chr7 (114-165)||(15953894-15953945)
chr7 (11-182)||(1052776-1052950)
chr7 (11-186)||(33189557-33189732)
chr7 (91-165)||(36299063-36299136)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (85-221)||(8576942-8577078)
chr6 (84-201)||(7622527-7622643)
chr6 (11-221)||(10788680-10788889)
chr6 (90-160)||(641825-641895)
chr6 (11-173)||(10408658-10408820)
chr6 (84-160)||(35167076-35167151)
chr6 (89-157)||(28582432-28582500)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (11-220)||(11894464-11894673)
chr1 (86-221)||(48378875-48379012)
chr1 (84-201)||(31585027-31585144)
chr1 (84-165)||(15378995-15379076)
chr1 (92-221)||(47140991-47141119)
chr1 (117-221)||(25987567-25987671)
chr1 (85-186)||(2191580-2191681)
chr1 (114-201)||(17562610-17562697)
chr1 (91-154)||(33089058-33089121)
chr1 (84-186)||(29677399-29677496)
chr1 (80-165)||(38264112-38264197)
chr1 (84-156)||(25293839-25293911)
chr1 (179-221)||(31292664-31292706)
chr1 (139-203)||(36728621-36728684)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (85-221)||(19841934-19842070)
chr4 (85-221)||(38951826-38951962)
chr4 (97-202)||(43624569-43624674)
chr4 (85-182)||(51357441-51357538)
chr4 (80-158)||(8819076-8819154)
chr4 (85-220)||(40714611-40714746)
chr4 (22-157)||(29117274-29117409)
chr4 (11-156)||(41041707-41041852)
chr4 (72-182)||(36464578-36464688)
chr4 (86-205)||(17120074-17120193)
chr4 (72-190)||(42555571-42555690)
chr4 (85-151)||(22279277-22279343)
chr4 (13-51)||(51357566-51357604)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (85-170)||(6736-6821)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (84-156)||(22243-22315)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (84-156)||(9060-9132)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3926597 - 3926400
Alignment:
Q  22 cttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatcc 121  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3926597 cttaatggatatctatggataaaataaacggattttttaactacatgcttattaatggatgtggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatcc 3926498  T
Q  122 atacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttatta 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  3926497 atacccgctataaaatcgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaacttcctaagaaaacaccatagatattgtgagtgttatcagttatta 3926400  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 186
Target Start/End: Original strand, 42878736 - 42878842
Alignment:
Q  80 atatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttct 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  42878736 atatgaatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataaccttaataccattcaactttct 42878835  T
Q  180 aagaaaa 186  Q
    |||||||    
T  42878836 aagaaaa 42878842  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 86 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42837848 - 42837713
Alignment:
Q  86 atgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaa 185  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42837848 atgcagatttaatagtatccacacccgcagatatctatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataatctccatatcattcaactttctaagaaa 42837749  T
Q  186 acaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  42837748 acaccctagatattatgagtgttatcagttattacg 42837713  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Original strand, 39206939 - 39207042
Alignment:
Q  117 tatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggtta 216  Q
    |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  39206939 tatccacacccgctattaaaccgagtaaattacataaataatctcaatatcattcaacttcctaagaaaacaccctaggtattgtgagtgttatcagtta 39207038  T
Q  217 ttac 220  Q
    ||||    
T  39207039 ttac 39207042  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23429543 - 23429445
Alignment:
Q  123 tacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  23429543 tacccgctattaaactgagtaaattacataaataacctcagtatcattcaacttcctaagaaaactccctaagtattgtgagggttatcagttattacg 23429445  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 219
Target Start/End: Original strand, 33742521 - 33742623
Alignment:
Q  117 tatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggtta 216  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||    
T  33742521 tatccacacccgctattaaacagagtaaattacataaataaccttaatatcattcaacttcctaagaaaacaccctaggtattgtaagtgttattagtta 33742620  T
Q  217 tta 219  Q
    |||    
T  33742621 tta 33742623  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 173
Target Start/End: Original strand, 35188430 - 35188486
Alignment:
Q  117 tatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaa 173  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35188430 tatccacacccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaa 35188486  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2209893 - 2209796
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaag 182  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  2209893 ggatgcagatttaatggtacccgcatccggggatatctat-cccgctattaaatcgagtaaattttataaataactttaatatcattcaaattcctaag 2209796  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26621697 - 26621603
Alignment:
Q  92 atttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaa 186  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| || |||||||||    
T  26621697 atttaatggtatctccatccgcatatatccatacctactattaaatcgagtaaattacacaaataaccttaatacctttcaacttcctaagaaaa 26621603  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 39800234 - 39800306
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaata 156  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  39800234 ggatgcggatttaatggtatctgcacccgcggatatccgcacccgctattaaactgagtgaattacgtaaata 39800306  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39887069 - 39886941
Alignment:
Q  22 cttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatcc 121  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||       |||||| |||| ||||||  |||  ||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  39887069 cttaatggatatacatggataaaataaacgaatatttcaactacctgctaattaatggatacagatgcagatttcatggtatctacacccgcgggtatcc 39886970  T
Q  122 atacccgctataaaattgagtaaattaca 150  Q
     |||||||||| | || ||||||||||||    
T  39886969 gtacccgctattatatagagtaaattaca 39886941  T

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Target: chr8 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 8226966 - 8227157
Alignment:
Q  20 accttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatat 119  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||        ||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8226966 accttaatggatatacatggataaaataaacggatcttttaactacccgctaattaatagatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatat 8227065  T
Q  120 ccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatc 211  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8227066 tcatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaacttcctaagaaaacaccctaagtattgtgagtgttatc 8227157  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 221
Target Start/End: Original strand, 9762692 - 9762853
Alignment:
Q  60 aactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacc 159  Q
    |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  9762692 aactacctgctaattaatggatatggatgcggatttgatggtatccacatcctcggatatccatactcgctattaaatcgaataaattacataaataacc 9762791  T
Q  160 tcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    | |||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||    
T  9762792 ttaatatcattcaacttcctaagaaaacaccctagatattgtgagtgttattagttattacg 9762853  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11481782 - 11481621
Alignment:
Q  60 aactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacc 159  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||    
T  11481782 aactacttgctaattaatggatatggatgtggatttaacggtatccacatccgcgaatatccatacccgctattaaaccgagtaaattatgtaaataacc 11481683  T
Q  160 tcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  11481682 tcaatatcattcaacttcctaagaaaacaccctagatattgtgagtgttatcagttattacg 11481621  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 7986919 - 7987129
Alignment:
Q  11 ggagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatc 110  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||        |||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  7986919 ggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggatttgtcaactacctgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtattcacacc 7987018  T
Q  111 cgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttat 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  7987019 cgcggatatccatacccgctattaaaccgaataaattacataaataaccttaataccattcaacttattaagaaaaaaacataggtattgtgaatgttat 7987118  T
Q  211 cggttattacg 221  Q
      |||||||||    
T  7987119 tagttattacg 7987129  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 36582721 - 36582820
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaaga 183  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  36582721 ggatgcggatttaatagtatacacacccgcgaatatccatacccgttattaaaccgagtaagatacataaataacctcaatat-attcaacttcctaaga 36582819  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 7968187 - 7968334
Alignment:
Q  20 accttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatat 119  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||        ||||||  ||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  7968187 accttaatggatatccatggataaaataaacggatttttcaactacccgctaattaatggatacgcatgcggatttaatggtattcacacccgcgtatat 7968286  T
Q  120 ccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatc 167  Q
    |||||  |||||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7968287 ccatattcgctattaaaccgaataaattacataaataaccttaatatc 7968334  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 28211632 - 28211785
Alignment:
Q  12 gagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatcc 111  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||        ||||||   || ||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28211632 gagcagatactttaatggatatctatggataaaataaacggatattttaactacccactaattaatggatacgaatgcggatttaatagtatccacaccc 28211731  T
Q  112 gcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaata 165  Q
    || ||||||||||  |||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28211732 gcagatatccatattcgctattaaaccaagtaaattacataaataaccttaata 28211785  T

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Target: chr2 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13807902 - 13807749
Alignment:
Q  68 gcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatc 167  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13807902 gcttattaatggatacggatgtggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccaagtaaattatataaataacctcaatatc 13807803  T
Q  168 attcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    |||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13807802 attcaacttcctaagaaaacaccctaggtattgtgagtgttatcagttattacg 13807749  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5110613 - 5110412
Alignment:
Q  20 accttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatat 119  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||       ||||||  ||| ||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5110613 accttaatggatatccatggataaaataaatgaattttttaactacccgctaattaatggatacgaatgcggatttaatggtatccacacccgcagatat 5110514  T
Q  120 ccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttatta 219  Q
    ||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  5110513 ccatacccgctattaaaccaaataaattacataaataacctcaatatcattcaactttctaagaaaacacgataggtattgtgagtgttatcaattatta 5110414  T
Q  220 cg 221  Q
    ||    
T  5110413 cg 5110412  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Original strand, 31575668 - 31575868
Alignment:
Q  22 cttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatcc 121  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||       ||||||  ||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31575668 cttaatggatatgcatggataaaataaacgaattttgtaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaattgtatccacaccagcggatatcc 31575767  T
Q  122 atacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaa-ttttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattac 220  Q
    ||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31575768 atatccgctattaaaccaagtaaattacataaataacctcaatatcattcaacttttctaagaaaacactctaggtattgtgagtgttatcagttattac 31575867  T
Q  221 g 221  Q
    |    
T  31575868 g 31575868  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 45151029 - 45151164
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  45151029 gatgcggatttaatggtatccacacccacagatatccatatccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaacttccttagaa 45151128  T
Q  185 aacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45151129 aaca-cttcggtattgtgagtgttatcggttattacg 45151164  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5704938 - 5704800
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaaga 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5704938 ggatgtggatttaatggtatccacacccgcaaatattcatatctgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaacttcctaaga 5704839  T
Q  184 aaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacgt 222  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5704838 aaacaccctaggtattgtgagtgttattagttattacgt 5704800  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 221
Target Start/End: Original strand, 13626038 - 13626239
Alignment:
Q  20 accttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatat 119  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||         ||||||  ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  13626038 accttaatggatatctatggataaaataaacagattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatctacacccgcgaatat 13626137  T
Q  120 ccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttatta 219  Q
    |||||||| |||| |||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||    
T  13626138 ccataccctctattaaaccggataagttacataaataacctcaatatcattcaacttcctaagaaaacaccttaggtattatgagtgttatcaattatta 13626237  T
Q  220 cg 221  Q
    ||    
T  13626238 cg 13626239  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5939016 - 5938912
Alignment:
Q  86 atgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaa 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||    
T  5939016 atgcggatttaatggtatctacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtatattacataaattacctcaatatcattcaacttccgaagaaa 5938917  T
Q  186 acacc 190  Q
    |||||    
T  5938916 acacc 5938912  T

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Target: chr3 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21288494 - 21288294
Alignment:
Q  22 cttaatgaatatttatggataaaataaacg-annnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatc 120  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |       ||||||  ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21288494 cttaatggatatctatggataaaataaacggatttttttaactacccgctaattaatggatagggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatc 21288395  T
Q  121 catacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattac 220  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21288394 catacccgctattaaaccaagtaaattacataaataacttcaatatcattcaacttcctgagaaaacaccctaggtattgtgagtgttatcagttattac 21288295  T
Q  221 g 221  Q
    |    
T  21288294 g 21288294  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13826396 - 13826266
Alignment:
Q  80 atatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttct 179  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  13826396 atatggatacagatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattacattaataacctcaatatcattcaacttcct 13826297  T
Q  180 aagaaaacaccatatgtattgtgagtgttat 210  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13826296 aagaaaacaccctaggtattgtgagtgttat 13826266  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 221
Target Start/End: Original strand, 25874493 - 25874630
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  25874493 ggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgttattaaaccgaatatattacataaataacctcaatatcattcaacttccgaaga 25874592  T
Q  184 aaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  25874593 aaacaccctagatattgtgagtgttatcagttattacg 25874630  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5295553 - 5295450
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaa 184  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||    
T  5295553 gatgcagatttaatggtatctacacctgcggatatccatatccgctattaaactgagtaaattacataaataatctcaatatcattaaacttcctaagaa 5295454  T
Q  185 aaca 188  Q
    ||||    
T  5295453 aaca 5295450  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Original strand, 3778768 - 3778884
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaa 184  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  3778768 gatgcggatttaacggtatccatacccgcggatattcatacca-ctattaaacagagtaaattacataaataaccttaatatcattcaacttcctaagaa 3778866  T
Q  185 aacaccatatgtattgtg 202  Q
    || ||| || ||||||||    
T  3778867 aaaaccctaagtattgtg 3778884  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 220
Target Start/End: Original strand, 27926423 - 27926557
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaaga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||  |||||| |||  || |||||||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  27926423 ggatgcggatttaatggtatccacacatgcggatatctatatgcgctattaaaccgaataaattatgtaaataacctcaataccattcaacttcctaaga 27926522  T
Q  184 aaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattac 220  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  27926523 aaa-acc-taggtattgtgagtgttattagttattac 27926557  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 158
Target Start/End: Original strand, 27519922 - 27520000
Alignment:
Q  80 atatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataac 158  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27519922 atatggatgtggatttcatgggatccgcatccgcggatatccgtgcccgttattaaattaagtaaaatacataaataac 27520000  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 170
Target Start/End: Original strand, 48251282 - 48251363
Alignment:
Q  89 cggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcatt 170  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  48251282 cggatttaatggtatccctacccgcgtatatccatatccgctattaaaccgagtaaattagataaataaccttaataccatt 48251363  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 36585065 - 36585000
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattac 149  Q
    |||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  36585065 ggatgcagattaaatggtatccgcacccgcggatatccatacccgctattaaaccgaataaattac 36585000  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12149325 - 12149253
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaata 156  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  12149325 ggatgctgatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacccgttattaaactgagtgaattacgtaaata 12149253  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26188181 - 26188109
Alignment:
Q  110 ccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaag 182  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||    
T  26188181 ccgcagatatccatacccactattatactgagtaaattacataaataacattaatacccttcaactttctaag 26188109  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Original strand, 52632798 - 52632868
Alignment:
Q  83 tggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataa 153  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  52632798 tggatgcaggtttgatggtatctacatccgcggatatacgaacctgctattaaattaagtaaattacataa 52632868  T

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Target: chr7 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 221
Target Start/End: Original strand, 23809464 - 23809601
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23809464 ggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacttgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaacttcctaaga 23809563  T
Q  184 aaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  23809564 aaacacgatacgtattgtgagtgttataagttattacg 23809601  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5973328 - 5973192
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttct-aaga 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |    
T  5973328 gatgcggatttaatggtattcacacccgcggatatccatacccgctattaaatcgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaacttcctaaaaa 5973229  T
Q  184 aaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5973228 aaacacc-taggtattgtgagtgttatcagttattacg 5973192  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 11038902 - 11039112
Alignment:
Q  11 ggagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatc 110  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||        ||||||  ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11038902 ggagcagataccttaatggatattcatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatgaatatggatacggatttaatggtatccacacc 11039001  T
Q  111 cgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttat 210  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||| || |||| ||||| | || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11039002 cgcagatatccataccggctattaaaccgagtaaatttcataaataagcttaataccattccacttcctaagaaaaaaccatacgtattgtgagtgttat 11039101  T
Q  211 cggttattacg 221  Q
      |||||||||    
T  11039102 tcgttattacg 11039112  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 38440131 - 38440337
Alignment:
Q  15 cagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcg 114  Q
    |||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||       ||||||  ||| ||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  38440131 cagataccttaatggatatccatagataaaataaacgaattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttgatggtatccacacctgca 38440230  T
Q  115 gatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggt 214  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||    
T  38440231 gatatccatacccactattaaaccgagtaaattacataaataatctcaatatcattcaactttttaagaaaacaccctaggtattatgagtgttataagt 38440330  T
Q  215 tattacg 221  Q
    |||||||    
T  38440331 tattacg 38440337  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7767328 - 7767233
Alignment:
Q  91 gatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaa 186  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  7767328 gatttaatggtatccacacctgcggatatccatacccactattaaactgagtaaattacataaataaccttaatatcattgaacttcctaagaaaa 7767233  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Original strand, 2943777 - 2943976
Alignment:
Q  20 accttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatat 119  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||        ||||||  ||| |||||| | || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2943777 accttaatggatatttatgggtaaaataaacggatattttaactacccgctaattaatga-tacgaatgcagatttaatggtatccacatccgcggatat 2943875  T
Q  120 ccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttatta 219  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| | ||||   ||||| || ||||| ||| | |||  ||||||||| ||||||  |||||||    
T  2943876 ccatatccgctattaaaccgagtaaattacataaataacattaatacatttcaacttcctaagcaaaaatcatcggtattgtgaatgttattagttatta 2943975  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 30541203 - 30541411
Alignment:
Q  11 ggagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatc 110  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||       ||||||  ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||   || |    
T  30541203 ggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacgaatattttaactacccgctaattaatggatatggatgccgatttaatggtatttgcacc 30541302  T
Q  111 cgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttat 210  Q
    ||| |||||||||| ||| ||| |||  ||||||  |||||||||||||| |||| | ||||| || ||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  30541303 cgcagatatccatatccgttattaaaccgagtaagatacataaataacct-aataactttcaacttcctaagcaaaaacccttggtattgtgagtgttat 30541401  T
Q  211 cggttattac 220  Q
      ||||||||    
T  30541402 tagttattac 30541411  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 173
Target Start/End: Original strand, 22518965 - 22519054
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaa 173  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  22518965 ggatgtgggtttaatggtatccgcatcagcagatatccatacacgttattaaattgaataaattacataaataaacttaatatctttcaa 22519054  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25502437 - 25502330
Alignment:
Q  80 atatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaata--acctcaatatcattcaatttt 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||| ||     
T  25502437 atatagatgcggatttaatggtattcaca-ccgcggatatttatatccgctattaaatcgagtaaattatgtaaatataacctcaataccattcaacttc 25502339  T
Q  178 ctaagaaaa 186  Q
    |||||||||    
T  25502338 ctaagaaaa 25502330  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2891255 - 2891187
Alignment:
Q  92 atttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacct 160  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  2891255 atttgatgatatccacatctgcggatatccatacccgctattaaaataagtaaactacataaataacct 2891187  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Original strand, 15953894 - 15953945
Alignment:
Q  114 ggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaata 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15953894 ggatatccatacccgctattaaatcgagtaaattacataaataaccttaata 15953945  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Original strand, 1052776 - 1052950
Alignment:
Q  11 ggagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccaca-- 108  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||        ||||||  ||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||      
T  1052776 ggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggatattttaactacccgctaattaatggataaggatgtggatttaatggtatccgcacc 1052875  T
Q  109 tcc-gcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaag 182  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||    
T  1052876 tcctgcggatatccatacccgctattataccgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaattcctaag 1052950  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33189732 - 33189557
Alignment:
Q  11 ggagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatc 110  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||        ||||||  ||| ||||||  |||  |||||| ||| ||||||||||||| |    
T  33189732 ggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacagatgcgaattcaatggtatccacacc 33189633  T
Q  111 cgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaa 186  Q
    ||||||||  |||| ||| ||| | |  |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  | |||||||||    
T  33189632 cgcggataaacatatccgttattacacagagtaaattacataaatatccttaataccattcaacatcctaagaaaa 33189557  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 36299136 - 36299063
Alignment:
Q  91 gatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaata 165  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||| ||||    
T  36299136 gatttaatggtatccgcacccacggatattcatacccgctattaaa-ccaataaattacataaataaccttaata 36299063  T

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Target: chr6 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8577078 - 8576942
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaa 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8577078 gatgcagatttaatggtatccacacccgtggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattatataaataacctcaatatcattcaacttcctaagaa 8576979  T
Q  185 aacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8576978 aacaccttaggtattgtgagtgttatcagttattacg 8576942  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7622643 - 7622527
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  7622643 ggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattaagtaaataacattaatatcattcaactttctaaga 7622544  T
Q  184 aaacaccatatgtattgt 201  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  7622543 aaa-accctatgtattgt 7622527  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10788889 - 10788680
Alignment:
Q  11 ggagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatc 110  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||       |||||| |||| ||||||  |||   ||| ||||||||| ||||||||| |    
T  10788889 ggagcggataccttaatggatatccatggataaaataaacgaattttt-aactacctgctaattaatggatacaaatgtggatttaatagtatccacacc 10788791  T
Q  111 cgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttat 210  Q
    || ||| |||||||  |||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  10788790 cgaggagatccatattcgctattaaaccaactaaattacataaataacctcaatatcattcaacttcctaagaaaacaccttaggtattgtgattgttat 10788691  T
Q  211 cggttattacg 221  Q
    |  ||||||||    
T  10788690 caattattacg 10788680  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 641825 - 641895
Alignment:
Q  90 ggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacct 160  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  641825 ggatttaatggtaaccgcatccgcggatatccatatccgctattaaactgagtaaattacataaataacct 641895  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 10408658 - 10408820
Alignment:
Q  11 ggagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatc 110  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||        ||||||  ||| | || || |||  ||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  10408658 ggagcggataccttaatggatattcatggataaaataaacggatatttcaactacccgctaaatagtagatacagatgcagatttattggcatccgcatc 10408757  T
Q  111 cgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaa 173  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  10408758 cgcagatatccatacccactattaaaccgagtaaattacataaataacgttaataccattcaa 10408820  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Original strand, 35167076 - 35167151
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacct 160  Q
    ||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  35167076 ggatgtggatttaatggtatctgca-ccgcggatatccatacccgctactaaactgagtaaattacataagtaacct 35167151  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28582500 - 28582432
Alignment:
Q  89 cggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataa 157  Q
    |||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||| |||   | ||||||||||||||||    
T  28582500 cggatttaatagtatccacaccctcagatatccatactcgctattaaacaaaataaattacataaataa 28582432  T

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Target: chr1 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11894673 - 11894464
Alignment:
Q  11 ggagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatc 110  Q
    ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||       |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  11894673 ggagcggataccttaatggatatcaatggataaaataaatgaattttttaactacctgctaattaatggatatggatgcggatttaacggtatccacacc 11894574  T
Q  111 cgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttat 210  Q
    || |||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11894573 cgtggatatccataccgactattaaaccgagtaaattacataaataaccttaatatcattcaacttcctaaaaaaaaaccttatgtattgtgagtgttat 11894474  T
Q  211 cggttattac 220  Q
      ||||||||    
T  11894473 ttgttattac 11894464  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 221
Target Start/End: Original strand, 48378875 - 48379012
Alignment:
Q  86 atgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaa 185  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48378875 atgcggatttaatgatattcacgcccgcggacatccataccctctattaaactgagtaagttacatcaataacctcaatatcattcaacttcctaagaaa 48378974  T
Q  186 acacc--atatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    |||||  | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  48378975 acaccctagatatattgtgagtgttatcagttattacg 48379012  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 31585027 - 31585144
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaaga 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||    
T  31585027 ggatgcggatttaatgatatccacacccgcggatatccatacccgctattaaaccgattaaattacataaataacatcaatatcattcaacttcctagga 31585126  T
Q  184 aaacaccatatgtattgt 201  Q
    ||| ||  ||||||||||    
T  31585127 aaaaactctatgtattgt 31585144  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15379076 - 15378995
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaata 165  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15379076 ggatgcagatttaatagtatccacacccgcagatatccatacccgctattaaattgagtaaattacataaataaccttaata 15378995  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47141119 - 47140991
Alignment:
Q  92 atttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacacca 191  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||| || ||||||||| |||     
T  47141119 atttaatggtatcagcacccgcggatatccatacccgctattaaatcgagtaaattaaataaataatcttaataccattcaacttcctaagaaaaaaccc 47141020  T
Q  192 tatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    |  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  47141019 t-cgtattgtgagtgttattagttattacg 47140991  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25987671 - 25987567
Alignment:
Q  117 tatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggtta 216  Q
    |||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  25987671 tatccacacccgctattaaaccgattaaattacataaatatcctcaatatcattcaacattctaagaaaacaccctagatattgtgagtgttatcagtta 25987572  T
Q  217 ttacg 221  Q
    |||||    
T  25987571 ttacg 25987567  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 186
Target Start/End: Original strand, 2191580 - 2191681
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||    
T  2191580 gatgcagatttaatggtatccgcacccgcagatatccatacctgctattaaaccgaataaattacataaataaccttaatacttttcaaatttctaagaa 2191679  T
Q  185 aa 186  Q
    ||    
T  2191680 aa 2191681  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 201
Target Start/End: Original strand, 17562610 - 17562697
Alignment:
Q  114 ggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||| ||  ||||||||||    
T  17562610 ggatatccatacccgctattaaaccgattaaattacataaataacatcaatatcattcaacttcctaggaaaaaactctatgtattgt 17562697  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33089121 - 33089058
Alignment:
Q  91 gatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaa 154  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33089121 gatttaatggtatccacatcagcggatattcatatctgctattaaatcgagtaaattacataaa 33089058  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 186
Target Start/End: Original strand, 29677399 - 29677496
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||| |||    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||    
T  29677399 ggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatat-----cccgctattaaaccaggtaaattacataaataactttaatatcattcaacttcttaaga 29677493  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 165
Target Start/End: Original strand, 38264112 - 38264197
Alignment:
Q  80 atatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaata 165  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38264112 atatggatgtgaatttaatggtatccgcacccgcagatatctatacccgctattaaaccaattaaattacataaataaccttaata 38264197  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 25293839 - 25293911
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaata 156  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  25293839 ggatgcggatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacctgctattaaactgagtgaattacgtaaata 25293911  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 221
Target Start/End: Original strand, 31292664 - 31292706
Alignment:
Q  179 taagaaaacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  31292664 taagaaaacaccataagtattgtgagtgttattagttattacg 31292706  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 203
Target Start/End: Original strand, 36728621 - 36728684
Alignment:
Q  139 gagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgtattgtga 203  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||||||||| ||| || |||||||||    
T  36728621 gagtaaattacataaataatcttaatatcatttaacttcctaagaaaaaacc-taggtattgtga 36728684  T

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Target: chr4 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19842070 - 19841934
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaa 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19842070 gatgcggatttaatggtttccacacccgcgaatatcaatacctgctattaaaccgagtaaattacataaataaccttaatatcattcaattttctaagaa 19841971  T
Q  185 aacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    || ||| || ||||||||||||||||  |||||||||    
T  19841970 aaaaccctaggtattgtgagtgttattagttattacg 19841934  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38951962 - 38951826
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  38951962 gatgcggatttaatggtattcacacccgcatttatccatatccgctattaaaccgaggaaattacataaataacctcaatatcattcaacttcctgagaa 38951863  T
Q  185 aacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattacg 221  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38951862 aacaccttaggtattgtgagtgttatcagttattacg 38951826  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43624674 - 43624569
Alignment:
Q  97 atggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaaacaccatatgt 196  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||| || ||    
T  43624674 atggtatccacactcgcggatatccatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataaccttaatatcattcaacttcctaacaaaaaaccctaggt 43624575  T
Q  197 attgtg 202  Q
    ||||||    
T  43624574 attgtg 43624569  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 51357538 - 51357441
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaag 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  51357538 gatgcggatttaatggtatccacacccacggatatccatacccgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttcaaatttttaag 51357441  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 158
Target Start/End: Original strand, 8819076 - 8819154
Alignment:
Q  80 atatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataac 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  8819076 atatggatgcggatttaatggtatccgcacccgcggatatccatacccgctattaaactaaataaattacataaataac 8819154  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Original strand, 40714611 - 40714746
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaa 184  Q
    ||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||| |||| |    
T  40714611 gatgcagatttaatggcatccgcacccgcggatatccatactcgctattaaaccgagtaaattacataaataactttaatacctttcaactttttaagca 40714710  T
Q  185 aacaccatatgtattgtgagtgttatcggttattac 220  Q
    || | | || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  40714711 aaaaacctaagtattgtgagtgttattagttattac 40714746  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29117409 - 29117274
Alignment:
Q  22 cttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatcc 121  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||  ||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29117409 cttaataaatattcatggataaaataaacggatattttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaacggtatccgcatccgcggatatcc 29117310  T
Q  122 atacccgctataaaattgagtaaattacataaataa 157  Q
    ||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  29117309 atttccgctattaaactgaataaattacataaataa 29117274  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41041852 - 41041707
Alignment:
Q  11 ggagcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacgannnnnnnaactacatgcttattaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatc 110  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |        ||||||  ||| ||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||| |    
T  41041852 ggagcggataccttaatggatatttatggataaaataaatggattttttaactacccgctaattaatagatacagatgcgaatttaatgatatccacacc 41041753  T
Q  111 cgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaata 156  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||| ||||    
T  41041752 cgcggacatccatacccgctattaaaccgagtaagttacatcaata 41041707  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 182
Target Start/End: Original strand, 36464578 - 36464688
Alignment:
Q  72 attaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattc 171  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  36464578 attaatagatacggatgcggatttaatgatatccgcacccgcaaatatccttactcgctattaaactgaataaattacataaataaccttaatacctttc 36464677  T
Q  172 aattttctaag 182  Q
    || ||| ||||    
T  36464678 aaatttttaag 36464688  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 205
Target Start/End: Original strand, 17120074 - 17120193
Alignment:
Q  86 atgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattcaattttctaagaaa 185  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||| || |||||| || || || ||||| ||    
T  17120074 atgcggacttaatggcatccgcacgcgcggatatccatacccgatattaaaccgagtaaattacataagtaatcttaatatctttgaacttcctaagcaa 17120173  T
Q  186 acaccatatgtattgtgagt 205  Q
    | | |||  |||||||||||    
T  17120174 aaaacatcggtattgtgagt 17120193  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42555690 - 42555571
Alignment:
Q  72 attaataaatatggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcattc 171  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || || || |||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||| ||| |||| | |||    
T  42555690 attaatgaatatgaatgtggatttaatgatatccgcacccacgaatatccatactcgctattaaaccaagtaaattacataaatatccttaatacctttc 42555591  T
Q  172 aattttctaag-aaaacacc 190  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  42555590 aacttcctaagtaaaacacc 42555571  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22279343 - 22279277
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacat 151  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||||    
T  22279343 gatgcagatttaatagtatccacacccgcggatatccaaatccgctattaaaccgagtaaattacat 22279277  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 51357604 - 51357566
Alignment:
Q  13 agcagagaccttaatgaatatttatggataaaataaacg 51  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51357604 agcagataccttaatggatatttatggataaaataaacg 51357566  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 170
Target Start/End: Original strand, 6736 - 6821
Alignment:
Q  85 gatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaataacctcaatatcatt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6736 gatgcggatttaatggtatccacacccgtggatattcatacccgctattaaaccgagtaaattacataaataacctcaatatcatt 6821  T

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Target: scaffold0115 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22315 - 22243
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaata 156  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  22315 ggatgcggatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacctgctattaaactgagtgaattacgtaaata 22243  T

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Target: scaffold0634 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 9060 - 9132
Alignment:
Q  84 ggatgcggatttaatggtatccacatccgcggatatccatacccgctataaaattgagtaaattacataaata 156  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  9060 ggatgctgatttaatggtatccgcacccgcggatatccgcacccgttattaaactgagtgaattacgtaaata 9132  T

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