View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0397_low_1 (Length: 727)

Name: NF0397_low_1
Description: NF0397
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0397_low_1
NF0397_low_1
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (11-544)||(27284177-27284709)
chr6 (11-544)||(27623522-27624056)
chr6 (11-544)||(13518009-13518541)
chr6 (11-544)||(22928696-22929230)
chr6 (11-544)||(8899514-8900047)
chr6 (11-544)||(16755670-16756204)
chr6 (11-544)||(27355926-27356459)
chr6 (11-544)||(4763614-4764146)
chr6 (11-544)||(29555408-29555941)
chr6 (11-544)||(33370246-33370779)
chr6 (11-544)||(27490983-27491516)
chr6 (11-544)||(34458323-34458854)
chr6 (11-540)||(26110226-26110754)
chr6 (11-544)||(28166344-28166878)
chr6 (11-544)||(27063331-27063864)
chr6 (11-544)||(26772444-26772976)
chr6 (11-544)||(27200036-27200569)
chr6 (11-544)||(27248664-27249198)
chr6 (11-544)||(4539573-4540107)
chr6 (11-544)||(16679989-16680523)
chr6 (11-544)||(26791666-26792199)
chr6 (11-544)||(29507266-29507801)
chr6 (11-544)||(28213304-28213838)
chr6 (11-544)||(13292766-13293293)
chr6 (11-544)||(4778730-4779264)
chr6 (14-544)||(14139218-14139742)
chr6 (14-544)||(27013583-27014106)
chr6 (11-544)||(29578865-29579397)
chr6 (11-544)||(4531138-4531671)
chr6 (11-544)||(16937840-16938373)
chr6 (11-544)||(30551815-30552364)
chr6 (11-544)||(26926620-26927135)
chr6 (11-544)||(27030871-27031403)
chr6 (11-544)||(24869560-24870087)
chr6 (11-544)||(27024995-27025524)
chr6 (11-544)||(24299575-24300103)
chr6 (11-544)||(15406348-15406877)
chr6 (11-544)||(15418135-15418664)
chr6 (11-451)||(27208848-27209283)
chr6 (11-451)||(27239945-27240380)
chr6 (11-314)||(26666473-26666774)
chr6 (23-544)||(20174399-20174930)
chr6 (23-544)||(22161061-22161592)
chr6 (319-544)||(23851450-23851675)
chr6 (543-650)||(1822116-1822223)
chr6 (411-544)||(4718349-4718483)
chr6 (462-544)||(27184778-27184860)
chr6 (462-544)||(27264380-27264462)
chr6 (549-650)||(1841731-1841835)
chr6 (545-630)||(13035580-13035668)
chr6 (543-626)||(6472879-6472965)
chr6 (544-646)||(6505719-6505824)
chr6 (554-650)||(6515948-6516047)
chr6 (611-650)||(1832542-1832581)
chr6 (557-649)||(1838867-1838962)
chr6 (554-648)||(6465567-6465664)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (11-544)||(3047-3582)
scaffold0159 (11-255)||(17949-18194)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (11-544)||(3647001-3647534)
chr1 (11-544)||(20334283-20334817)
chr1 (11-544)||(10968520-10969054)
chr1 (33-544)||(51644075-51644588)
chr1 (11-544)||(10950946-10951480)
chr1 (11-544)||(41787177-41787712)
chr1 (11-544)||(28590938-28591470)
chr1 (11-544)||(16201895-16202434)
chr1 (11-544)||(20466634-20467173)
chr1 (11-544)||(28155589-28156116)
chr1 (11-544)||(21891630-21892149)
chr1 (499-544)||(31544609-31544654)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (11-544)||(32296445-32296979)
chr3 (11-544)||(16618400-16618936)
chr3 (11-544)||(5727794-5728328)
chr3 (11-544)||(5716884-5717418)
chr3 (11-544)||(5764040-5764574)
chr3 (11-544)||(24333989-24334524)
chr3 (11-544)||(47029269-47029803)
chr3 (11-544)||(31958366-31958901)
chr3 (11-544)||(29658879-29659412)
chr3 (11-544)||(5603224-5603759)
chr3 (11-544)||(16422000-16422532)
chr3 (11-544)||(4340587-4341121)
chr3 (11-544)||(4422735-4423267)
chr3 (11-544)||(28109862-28110400)
chr3 (11-544)||(5472804-5473336)
chr3 (11-544)||(8217448-8217983)
chr3 (11-544)||(28027107-28027638)
chr3 (11-544)||(4790544-4791078)
chr3 (11-544)||(4629601-4630133)
chr3 (11-544)||(10401965-10402497)
chr3 (11-544)||(10648887-10649420)
chr3 (11-544)||(22381492-22382023)
chr3 (11-544)||(17970777-17971308)
chr3 (11-544)||(29142665-29143201)
chr3 (11-544)||(18248554-18249087)
chr3 (11-544)||(48471743-48472280)
chr3 (11-544)||(21680517-21681049)
chr3 (11-544)||(22864759-22865290)
chr3 (11-544)||(22879818-22880349)
chr3 (14-544)||(5590275-5590805)
chr3 (11-544)||(51787838-51788371)
chr3 (11-544)||(20071851-20072384)
chr3 (11-540)||(18286266-18286794)
chr3 (11-540)||(18301567-18302095)
chr3 (11-544)||(17978861-17979397)
chr3 (11-540)||(28344991-28345519)
chr3 (11-544)||(6536654-6537187)
chr3 (11-544)||(20570757-20571290)
chr3 (11-543)||(7079041-7079576)
chr3 (11-544)||(11104272-11104806)
chr3 (11-544)||(18057076-18057612)
chr3 (11-544)||(5019529-5020061)
chr3 (11-544)||(18231009-18231542)
chr3 (11-544)||(6207716-6208245)
chr3 (11-544)||(31030156-31030682)
chr3 (14-544)||(18336444-18336968)
chr3 (11-543)||(19700304-19700847)
chr3 (11-544)||(32444970-32445494)
chr3 (11-544)||(4727449-4727976)
chr3 (11-544)||(15735011-15735539)
chr3 (11-544)||(8283369-8283913)
chr3 (11-544)||(35886580-35887109)
chr3 (11-544)||(4689466-4689994)
chr3 (11-544)||(5657951-5658480)
chr3 (290-544)||(15886894-15887151)
chr3 (314-544)||(8002376-8002607)
chr3 (11-261)||(15886652-15886895)
chr3 (499-544)||(10718148-10718193)
chr3 (499-544)||(41002937-41002982)
chr3 (499-544)||(41011718-41011763)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (11-544)||(3795398-3795932)
chr5 (11-544)||(18369300-18369833)
chr5 (11-544)||(33880987-33881519)
chr5 (15-544)||(11555214-11555742)
chr5 (11-544)||(22894277-22894808)
chr5 (11-544)||(30174325-30174859)
chr5 (11-544)||(28655102-28655636)
chr5 (11-544)||(37746090-37746628)
chr5 (11-544)||(18494536-18495068)
chr5 (11-544)||(37352412-37352945)
chr5 (11-544)||(32590044-32590576)
chr5 (14-544)||(9544478-9545009)
chr5 (11-544)||(6880163-6880697)
chr5 (11-544)||(13180561-13181090)
chr5 (11-544)||(33298393-33298930)
chr5 (11-544)||(8659240-8659773)
chr5 (11-544)||(37760842-37761376)
chr5 (11-544)||(9323337-9323869)
chr5 (11-544)||(40467321-40467854)
chr5 (11-544)||(24729830-24730363)
chr5 (11-544)||(23631829-23632364)
chr5 (11-544)||(28953548-28954081)
chr5 (11-544)||(13318596-13319128)
chr5 (11-544)||(13436442-13436982)
chr5 (11-544)||(15752626-15753152)
chr5 (11-544)||(30157893-30158427)
chr5 (11-544)||(12138036-12138568)
chr5 (11-544)||(11329497-11330032)
chr5 (11-544)||(31820178-31820709)
chr5 (11-544)||(37665254-37665787)
chr5 (34-544)||(30035287-30035795)
chr5 (11-544)||(33522239-33522776)
chr5 (11-544)||(34622378-34622912)
chr5 (11-544)||(41680564-41681098)
chr5 (11-544)||(2516925-2517459)
chr5 (11-544)||(43084118-43084651)
chr5 (11-544)||(26486256-26486778)
chr5 (14-544)||(31437324-31437847)
chr5 (11-544)||(5643662-5644191)
chr5 (11-544)||(18122184-18122717)
chr5 (18-544)||(25206139-25206670)
chr5 (18-544)||(25270295-25270826)
chr5 (11-544)||(15652528-15653059)
chr5 (11-544)||(22992892-22993417)
chr5 (11-544)||(23897735-23898261)
chr5 (11-544)||(33783347-33783875)
chr5 (11-544)||(24608106-24608634)
chr5 (11-544)||(30940496-30941023)
chr5 (11-544)||(24975709-24976236)
chr5 (499-544)||(12176455-12176500)
chr5 (499-544)||(21863308-21863353)
chr5 (499-544)||(24960667-24960712)
chr5 (499-544)||(26085218-26085263)
chr5 (499-544)||(28848466-28848511)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (11-544)||(11891-12421)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (11-542)||(27809554-27810087)
chr2 (11-544)||(37945723-37946257)
chr2 (11-544)||(12661390-12661922)
chr2 (11-544)||(12592661-12593198)
chr2 (11-544)||(37383528-37384061)
chr2 (11-544)||(19410342-19410878)
chr2 (11-544)||(22922001-22922536)
chr2 (11-544)||(39895919-39896452)
chr2 (11-544)||(3788345-3788877)
chr2 (11-544)||(27122376-27122907)
chr2 (11-544)||(34867534-34868066)
chr2 (11-544)||(21671028-21671564)
chr2 (11-544)||(21697031-21697565)
chr2 (11-544)||(254510-255043)
chr2 (11-544)||(37679749-37680284)
chr2 (11-544)||(37695014-37695549)
chr2 (11-544)||(13930402-13930937)
chr2 (11-544)||(16167329-16167862)
chr2 (11-544)||(34160695-34161230)
chr2 (11-544)||(40239360-40239892)
chr2 (11-544)||(32055654-32056185)
chr2 (11-544)||(12710459-12710992)
chr2 (11-544)||(9343845-9344378)
chr2 (11-544)||(37931223-37931763)
chr2 (11-544)||(11629043-11629575)
chr2 (11-544)||(39045680-39046213)
chr2 (11-544)||(16823195-16823731)
chr2 (11-544)||(16897749-16898285)
chr2 (11-544)||(27782083-27782616)
chr2 (11-544)||(31882138-31882670)
chr2 (11-544)||(34297008-34297533)
chr2 (11-544)||(27396174-27396717)
chr2 (11-544)||(19450276-19450818)
chr2 (11-544)||(34268784-34269311)
chr2 (11-544)||(28888130-28888658)
chr2 (11-544)||(23122436-23122964)
chr2 (15-544)||(27428315-27428837)
chr2 (11-544)||(20843764-20844296)
chr2 (11-348)||(31868644-31868979)
chr2 (343-544)||(31887682-31887884)
chr2 (11-148)||(23117044-23117180)
chr2 (411-544)||(27821840-27821974)
chr2 (499-546)||(24289784-24289831)
chr2 (499-544)||(15948523-15948568)
chr2 (499-540)||(21117696-21117737)
chr2 (499-544)||(35143271-35143316)
chr2 (499-544)||(42569999-42570044)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (11-544)||(9510-10041)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (11-544)||(39856501-39857032)
chr4 (11-544)||(20332290-20332824)
chr4 (11-544)||(40099504-40100038)
chr4 (11-544)||(54839256-54839787)
chr4 (11-544)||(14104408-14104939)
chr4 (11-540)||(24586229-24586759)
chr4 (11-544)||(30759628-30760159)
chr4 (11-544)||(33667671-33668202)
chr4 (11-544)||(1906117-1906654)
chr4 (11-544)||(27157180-27157718)
chr4 (11-544)||(5700403-5700937)
chr4 (11-540)||(14753362-14753890)
chr4 (11-544)||(18794485-18795018)
chr4 (11-544)||(15233681-15234217)
chr4 (11-544)||(5011741-5012275)
chr4 (11-544)||(34182832-34183363)
chr4 (14-544)||(21975565-21976098)
chr4 (11-544)||(31120378-31120915)
chr4 (11-544)||(6575726-6576251)
chr4 (11-544)||(36338394-36338919)
chr4 (11-544)||(15380106-15380639)
chr4 (11-544)||(15276497-15277033)
chr4 (15-544)||(24118526-24119055)
chr4 (11-544)||(17018916-17019445)
chr4 (11-544)||(14670880-14671410)
chr4 (11-392)||(1673877-1674258)
chr4 (11-319)||(36324185-36324484)
chr4 (380-544)||(18311414-18311580)
chr4 (499-544)||(8098581-8098626)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (11-544)||(28355780-28356316)
chr8 (11-544)||(9360475-9361007)
chr8 (11-544)||(31360381-31360914)
chr8 (11-544)||(29835176-29835708)
chr8 (11-544)||(33248219-33248751)
chr8 (11-544)||(31483700-31484235)
chr8 (11-544)||(18796559-18797093)
chr8 (11-544)||(19680301-19680833)
chr8 (11-544)||(44566834-44567369)
chr8 (11-544)||(12086553-12087087)
chr8 (11-544)||(15773427-15773960)
chr8 (11-544)||(21342000-21342534)
chr8 (11-544)||(18715335-18715868)
chr8 (11-544)||(19910992-19911527)
chr8 (48-544)||(33264584-33265079)
chr8 (11-544)||(19202205-19202727)
chr8 (11-544)||(27602744-27603269)
chr8 (11-544)||(22074759-22075292)
chr8 (14-544)||(19655180-19655707)
chr8 (140-544)||(16260076-16260480)
chr8 (11-544)||(22138760-22139286)
chr8 (11-544)||(2131098-2131625)
chr8 (11-544)||(19693948-19694477)
chr8 (11-544)||(14569010-14569540)
chr8 (499-544)||(17678418-17678463)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (11-544)||(5141088-5141622)
chr7 (11-544)||(24586289-24586822)
chr7 (11-544)||(26441103-26441637)
chr7 (11-544)||(5164234-5164767)
chr7 (11-544)||(31558148-31558680)
chr7 (11-544)||(4138999-4139534)
chr7 (11-544)||(16745274-16745808)
chr7 (11-544)||(5153934-5154466)
chr7 (11-544)||(26518643-26519174)
chr7 (11-544)||(16443757-16444290)
chr7 (11-544)||(16047167-16047695)
chr7 (11-544)||(26663666-26664200)
chr7 (11-544)||(26678858-26679392)
chr7 (33-544)||(26509471-26509984)
chr7 (11-544)||(11446738-11447271)
chr7 (11-544)||(4205239-4205772)
chr7 (11-544)||(2160421-2160955)
chr7 (11-544)||(45393068-45393602)
chr7 (11-544)||(26313603-26314135)
chr7 (11-544)||(39206893-39207426)
chr7 (11-544)||(26268839-26269376)
chr7 (11-544)||(45737153-45737686)
chr7 (11-544)||(31084376-31084910)
chr7 (11-544)||(11418533-11419066)
chr7 (14-544)||(2779102-2779626)
chr7 (11-544)||(31129755-31130282)
chr7 (11-544)||(3451168-3451702)
chr7 (11-525)||(10847452-10847968)
chr7 (11-544)||(16512194-16512721)
chr7 (11-544)||(10910680-10911207)
chr7 (11-313)||(26595750-26596053)
chr7 (314-544)||(26531926-26532157)
chr7 (412-544)||(16732684-16732817)
chr7 (453-543)||(2104357-2104447)
chr7 (499-544)||(565046-565091)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (11-544)||(1510-2043)
scaffold0322 (11-544)||(11900-12443)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-544)||(8797-9329)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (11-544)||(4471-5009)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (11-544)||(9767-10299)
scaffold0143 (11-544)||(33150-33680)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-544)||(18438-18973)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-544)||(15422-15962)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-544)||(13802-14336)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-544)||(24969-25509)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (11-544)||(5919-6449)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (11-540)||(24774-25299)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (238-544)||(230-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (254-469)||(26243-26458)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (11-184)||(1-173)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (260-522)||(40759-41036)
scaffold0099 (11-118)||(40497-40606)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (462-544)||(20512-20594)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (495-544)||(11883-11934)
[»] scaffold1691 (1 HSPs)
scaffold1691 (499-544)||(407-452)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (499-544)||(4141-4186)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (499-528)||(259-288)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (497-546)||(69968-70017)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 451; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 27284177 - 27284709
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284177 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27284276  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27284375  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284376 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27284474  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27284475 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagctt 27284574  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284575 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 27284674  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27284675 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27284709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 27623522 - 27624056
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623522 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27623621  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaa-tgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27623622 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatat 27623720  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27623721 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27623820  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27623821 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 27623920  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623921 tctgatggagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 27624020  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27624021 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 27624056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 13518009 - 13518541
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518009 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13518108  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-agttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13518207  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13518208 gctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 13518307  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||     
T  13518308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttt 13518407  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13518408 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaac 13518507  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  13518508 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 13518541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 22928696 - 22929230
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22928696 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgct 22928795  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  22928796 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 22928895  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22928896 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 22928994  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22928995 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagct 22929094  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929095 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 22929194  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22929195 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 22929230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 8899514 - 8900047
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899514 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8899613  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8899614 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 8899712  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8899713 aactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 8899811  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8899812 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 8899911  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899912 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 8900011  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8900012 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 8900047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16756204 - 16755670
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756204 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16756105  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaat--gtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756104 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattgtcaaaatatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 16756006  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756005 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16755907  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  16755906 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagct 16755807  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755806 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 16755707  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16755706 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 16755670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 27355926 - 27356459
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355926 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27356025  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356026 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 27356124  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27356125 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27356223  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27356224 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 27356323  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356324 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 27356423  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27356424 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27356459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4764146 - 4763614
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764146 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4764047  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4764046 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 4763948  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763947 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4763849  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | |||    
T  4763848 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 4763749  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4763748 tcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgtatgaa 4763649  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4763648 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 4763614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 29555941 - 29555408
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29555941 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgtt 29555842  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555841 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagctttt-aattttctaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 29555743  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29555742 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatt 29555644  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29555643 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaactt 29555544  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29555543 ctgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatga 29555444  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29555443 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 29555408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 33370246 - 33370779
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370246 cacagactatcctggaggagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33370345  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33370346 caggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaattt-caattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatat 33370444  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33370445 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 33370543  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  33370544 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 33370643  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33370644 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcctga 33370743  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370744 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 33370779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27491516 - 27490983
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491516 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27491417  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27491416 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 27491318  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27491317 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 27491219  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  27491218 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtataggagctt 27491119  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27491118 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttctgtttcaatctcatttttgcatga 27491019  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27491018 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27490983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 34458323 - 34458854
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458323 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34458422  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34458520  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34458521 gcttagaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 34458619  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  34458620 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 34458719  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  | | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  34458720 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggcggttggccagatatagttacttgcctttcatttcaatctcgtttttgcatgaa 34458819  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458820 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 34458854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 540
Target Start/End: Original strand, 26110226 - 26110754
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110226 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatatggaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26110325  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110326 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 26110424  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110425 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 26110523  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||  ||||| |||     
T  26110524 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttt 26110623  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110624 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 26110723  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagac 540  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26110724 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagac 26110754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28166878 - 28166344
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166878 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28166779  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  28166778 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtata 28166680  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166679 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 28166581  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||  || | ||    
T  28166580 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaagcgtaggagct 28166481  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166480 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 28166381  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  28166380 aaccgcccttccgggtttttgattcatcgagacgctc 28166344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27063864 - 27063331
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063864 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27063765  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27063764 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 27063666  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063665 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 27063568  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||| |  | ||     
T  27063567 tacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaagcataagagctc 27063468  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27063467 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacgatggttagccagatatagttacttgcctttttgtttcaatctcatttttgcatg 27063368  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27063367 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27063331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 26772444 - 26772976
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26772444 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26772543  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772544 caggtttgtttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 26772642  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26772643 agctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 26772740  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  26772741 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctt 26772840  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26772841 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatga 26772940  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26772941 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 26772976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27200569 - 27200036
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200569 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27200471  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27200470 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtaca 27200372  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200371 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27200274  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |    
T  27200273 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagc 27200174  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200173 ttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 27200074  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27200073 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27200036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 27248664 - 27249198
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248664 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27248762  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27248763 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtaca 27248861  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248862 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27248959  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |    
T  27248960 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagc 27249059  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc--aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27249060 ttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 27249159  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27249160 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27249198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 4539573 - 4540107
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4539573 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 4539672  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539673 caggtttgcttttcaaaacagac-aaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 4539771  T
Q  211 gctttgaaagt-agaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4539772 gctttgaaagtaaaaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 4539870  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4539871 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 4539970  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539971 tttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 4540070  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4540071 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 4540107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16680523 - 16679989
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680523 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgct 16680424  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16680423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 16680325  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16680324 aactttgaaagtagaagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggat 16680226  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | ||    
T  16680225 tttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagct 16680126  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccaga-tatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680125 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagattatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 16680026  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  16680025 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 16679989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 26792199 - 26791666
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26792199 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26792100  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26792099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 26792001  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26792000 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggatt 26791902  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||    
T  26791901 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt 26791802  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791801 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26791702  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||    
T  26791701 accgcccttccgggttttcgatccatcgagacgctc 26791666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 29507801 - 29507266
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507801 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgct 29507702  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507701 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatat 29507603  T
Q  210 agctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||| || |  |||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507602 agctttgaaagtaaaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 29507504  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | |    
T  29507503 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 29507404  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507403 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcatatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttatttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 29507304  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29507303 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 29507266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28213838 - 28213304
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28213838 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 28213739  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28213738 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 28213640  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28213639 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 28213541  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28213540 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 28213441  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213440 tttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 28213341  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28213340 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 28213304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 13292766 - 13293293
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292766 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13292865  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292866 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13292959  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292960 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 13293058  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |||     
T  13293059 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttt 13293158  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13293159 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaggcggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcctttttgcatgaa 13293258  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13293259 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 13293293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4779264 - 4778730
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4779264 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4779166  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4779165 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatac 4779067  T
Q  210 agcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4779066 agcttttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggat 4778968  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |    
T  4778967 tcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 4778868  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778867 tttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 4778768  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  4778767 gaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 4778730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Original strand, 14139218 - 14139742
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14139218 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcag 14139317  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139318 gtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 14139411  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14139412 ttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 14139510  T
Q  314 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| |||    
T  14139511 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttga 14139610  T
Q  414 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 512  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139611 tgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 14139710  T
Q  513 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14139711 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 14139742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27014106 - 27013583
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27014106 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattaaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 27014007  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014006 gtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 27013914  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27013913 ttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 27013815  T
Q  314 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| |||    
T  27013814 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttga 27013715  T
Q  414 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 512  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013714 tgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 27013615  T
Q  513 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27013614 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27013583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 29579397 - 29578865
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579397 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 29579298  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  29579297 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatat 29579199  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579198 agctttgaaaatagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 29579101  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||   || | |||    
T  29579100 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatttgcaagtgtaggagctt 29579001  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579000 tagatgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 29578901  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29578900 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 29578865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4531671 - 4531138
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaa-atagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 109  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4531671 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaagatagacacccacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgc 4531573  T
Q  110 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4531572 tcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtata 4531474  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4531473 cagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggat 4531375  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  4531374 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagct 4531275  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531274 tttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 4531175  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4531174 aaccgaccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 4531138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 16937840 - 16938373
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937840 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16937939  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16937940 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatat 16938038  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16938039 agctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggatt 16938136  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  16938137 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcgcaagtacaaaagct 16938236  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16938237 tcagatggagatggccattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttatttcaatctcatttttgcatg 16938336  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16938337 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 16938373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 30551815 - 30552364
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30551815 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 30551914  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30551915 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 30552013  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30552014 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 30552112  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-t 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |    
T  30552113 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 30552212  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatg--ccccaagggg--------------attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaa 492  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||              |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552213 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaa 30552312  T
Q  493 tctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30552313 tctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 30552364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 26927135 - 26926620
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||    
T  26927135 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactct---------------catttgaatgtaccctgttgct 26927051  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  26927050 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 26926952  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926951 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 26926854  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||    |||    
T  26926853 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgctt 26926756  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926755 ttgatgaagatggtcattaacagctgcggatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26926656  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  26926655 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 26926620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27031403 - 27030871
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27031403 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27031305  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||     |||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||     
T  27031304 caggtttgcttttcaaaa-----aaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtac 27031210  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031209 ataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 27031111  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  || | |    
T  27031110 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggagc 27031011  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatt--gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031010 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaacgggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 27030911  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcgg-ctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27030910 tgaaccgcccttccgggttttcggtctcatcgagacgctc 27030871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24870087 - 24869560
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24870087 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24869989  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24869988 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24869897  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869896 ataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24869798  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | |    
T  24869797 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagc 24869698  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24869697 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttccat 24869598  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24869597 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 24869560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27025524 - 27024995
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27025524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactagctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgct 27025425  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||    
T  27025424 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgta 27025333  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025332 cataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27025234  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||  || |     
T  27025233 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagagactttgaattcgcaagcgtaggag 27025134  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025133 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 27025034  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27025033 tgaaccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctc 27024995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 24299575 - 24300103
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24299575 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttact 24299673  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| |    
T  24299674 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcatttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtaca 24299767  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    || |||||| |||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24299768 taactttgagagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24299866  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||    
T  24299867 ttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 24299966  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24299967 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 24300066  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  24300067 aaccgcccttccgggttttcggtccatcgagacgctc 24300103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 15406348 - 15406877
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15406348 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15406446  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  15406447 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 15406539  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406540 atatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 15406638  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||| |||||  ||       
T  15406639 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtagggg 15406738  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406739 cttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 15406838  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15406839 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 15406877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 15418135 - 15418664
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15418135 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15418233  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  15418234 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 15418326  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418327 atatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 15418425  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||| |||||  ||       
T  15418426 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtagggg 15418525  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418526 cttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 15418625  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15418626 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 15418664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27209283 - 27208848
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27209283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27209185  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gt 205  Q
    || |||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  27209184 caagtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgt 27209093  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    | ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209092 acataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 27208994  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  27208993 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcatagga 27208894  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg 451  Q
     ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27208893 gcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27208848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 451
Target Start/End: Original strand, 27239945 - 27240380
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27239945 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27240043  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gt 205  Q
    || |||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  27240044 caagtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgt 27240135  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    | ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240136 acataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 27240234  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || |    
T  27240235 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcatagga 27240334  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg 451  Q
     ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240335 gcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 26666473 - 26666774
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26666473 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26666572  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666573 caggtttgtttttcaaaatagac-aaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 26666671  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26666672 agctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 26666769  T
Q  310 cacaa 314  Q
    |||||    
T  26666770 cacaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20174930 - 20174399
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  | |  | || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  20174930 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 20174831  T
Q  123 tcaaaatagacaaaaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 214  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  20174830 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 20174731  T
Q  215 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 312  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||    
T  20174730 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 20174632  T
Q  313 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctgga-aactttgaattcacaagcacagaaacttct 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||||||  |  | ||||||||||||||   || | |||||    
T  20174631 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcctttagcattttgaattcacaagtgtagtagcttct 20174532  T
Q  412 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 511  Q
    ||  |  ||    ||| |||| | ||||||||  |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20174531 gacaagaacaactattgacagttacagatgcctaaaggggatggtgacttgctagaaatagttacttgccttttgtttcaatctcattttttcatgaacc 20174432  T
Q  512 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20174431 gccctttcgggttttcggttcattgagacgctc 20174399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 544
Target Start/End: Original strand, 22161061 - 22161592
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  | |  | || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22161061 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 22161160  T
Q  123 tcaaaatagacaaaaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 214  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  22161161 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 22161260  T
Q  215 tgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 312  Q
    || |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||    
T  22161261 tggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttac 22161359  T
Q  313 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctgga-aactttgaattcacaagcacagaaacttct 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||||||  |  | ||||||||||||||   || | |||||    
T  22161360 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcctttagcattttgaattcacaagtgtagtagcttct 22161459  T
Q  412 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 511  Q
    ||  |  ||    ||| |||| | ||||||||  |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22161460 gacaagaacaactattgacagttacagatgcctaaaggggatggtgacttgctagaaatagttacttgccttttgtttcaatctcattttttcatgaacc 22161559  T
Q  512 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22161560 gccctttcgggttttcggttcattgagacgctc 22161592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 319 - 544
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851675
Alignment:
Q  319 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaag 23851549  T
Q  419 acggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttt 518  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23851550 atggtcattaacagctgcagatgccccaagggaatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttc 23851649  T
Q  519 cgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23851650 cgggttttcggctcatcgagacgctc 23851675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 543 - 650
Target Start/End: Original strand, 1822116 - 1822223
Alignment:
Q  543 tcctgtttccctaacttggcattcaagcaaaggtgtaaaacaagaatctcatgaaattgtttcagctattttgaaagatgttgaaggtttgaactcatat 642  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1822116 tcctgtttccgtaacttggcattcaagcaaaggtgttaaacaagaatctcatgaaattgtttcagctattttgaaagatgttgaaggtatgaactcatct 1822215  T
Q  643 gcaataac 650  Q
    ||||||||    
T  1822216 gcaataac 1822223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 411 - 544
Target Start/End: Original strand, 4718349 - 4718483
Alignment:
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4718349 tgatgaagataggcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatcttatttttgcatgaa 4718448  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4718449 ccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctc 4718483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 462 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27184860 - 27184778
Alignment:
Q  462 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27184860 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27184778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 462 - 544
Target Start/End: Original strand, 27264380 - 27264462
Alignment:
Q  462 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27264380 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27264462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 549 - 650
Target Start/End: Original strand, 1841731 - 1841835
Alignment:
Q  549 ttccctaacttggcattcaagcaaaggtgtaaaacaagaatctcatga---aattgtttcagctattttgaaagatgttgaaggtttgaactcatatgca 645  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  1841731 ttccataacttggcattcaagcaaaggtgtaaaagaagaatttcatgatgaaattgtttcagctcttttgaaatatgttgaaggtttgaactcatctgaa 1841830  T
Q  646 ataac 650  Q
    |||||    
T  1841831 ataac 1841835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 545 - 630
Target Start/End: Original strand, 13035580 - 13035668
Alignment:
Q  545 ctgtttccctaacttggcattcaagcaaaggtgtaaaacaagaatctcatg---aaattgtttcagctattttgaaagatgttgaaggt 630  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13035580 ctgtttctgtaacttggcatacaagcaaaggtgtaaaagaagaatcacatgacaaaattgtttcagctctttcgaaagatgttgaaggt 13035668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 543 - 626
Target Start/End: Original strand, 6472879 - 6472965
Alignment:
Q  543 tcctgtttccctaacttggcattcaagcaaaggtgtaaaacaagaatctcat---gaaattgtttcagctattttgaaagatgttga 626  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  6472879 tcctgtttctattacttggcattcaagcaaaggtgtaaaagaagaatcacatgacgaaattgtttcagctctttcaaaagatgttga 6472965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 544 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 6505824 - 6505719
Alignment:
Q  544 cctgtttccctaacttggcattcaagcaaaggtgtaaaacaagaatctc---atgaaattgtttcagctattttgaaagatgttgaaggtttgaactcat 640  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |   |||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  6505824 cctgtttccatgacttggcactcaagcaaaggtgtaaaagacgaatcacgcaatgaaattgtttcatcactttctaaagatgttgaaggtttaaactcat 6505725  T
Q  641 atgcaa 646  Q
     |||||    
T  6505724 ctgcaa 6505719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 554 - 650
Target Start/End: Original strand, 6515948 - 6516047
Alignment:
Q  554 taacttggcattcaagcaaaggtgtaaaacaagaatc---tcatgaaattgtttcagctattttgaaagatgttgaaggtttgaactcatatgcaataac 650  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   | |||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  6515948 taacttggcattcaagcaaaggtataaaagaagaatcacatgatgaaattgtttcgtcgcttttaaaagatgttgaaggtttaaattcatcagcaataac 6516047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 611 - 650
Target Start/End: Original strand, 1832542 - 1832581
Alignment:
Q  611 ttttgaaagatgttgaaggtttgaactcatatgcaataac 650  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1832542 ttttgaaagatgttgaaggtttgaactcatctgcaataac 1832581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 557 - 649
Target Start/End: Original strand, 1838867 - 1838962
Alignment:
Q  557 cttggcattcaagcaaaggtgtaaaacaagaatctcatga---aattgtttcagctattttgaaagatgttgaaggtttgaactcatatgcaataa 649  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||  |||||||| ||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  1838867 cttggcattcaagaaattgtgtaaatgaagaatctaatgatgaaattgtttcagctctcttgaaagatgttgaataattgaactcatttgcaataa 1838962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 6465664 - 6465567
Alignment:
Q  554 taacttggcattcaagcaaaggtgtaaaacaagaatctcatgaa---attgtttcagctattttgaaagatgttgaaggtttgaactcatatgcaata 648  Q
    ||||||||||||| |  || ||||| ||| |||||||||||||    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  6465664 taacttggcattctactaagggtgttaaagaagaatctcatgatgagattgtttccgttcttttgaaagatgttgaaggtttgaattcgtctgcaata 6465567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3582
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3047 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 3146  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3147 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatata 3245  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3246 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 3345  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3346 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaact 3445  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3446 tctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 3545  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3546 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 3582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18194 - 17949
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 18095  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18094 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatata 17996  T
Q  211 gctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 255  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17995 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaag 17949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 3647534 - 3647001
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647534 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3647435  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647434 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 3647336  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3647335 gctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 3647236  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |||     
T  3647235 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 3647136  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647135 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 3647036  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3647035 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 3647001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 20334283 - 20334817
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20334382  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  20334383 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 20334481  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20334482 atagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaatttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 20334580  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20334581 tttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagc 20334680  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334681 ttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 20334780  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20334781 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 20334817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 10969054 - 10968520
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969054 cacagaccatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10968955  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10968954 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatata 10968856  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10968855 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 10968756  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | |||    
T  10968755 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 10968656  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968655 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 10968556  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10968555 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 10968520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 51644588 - 51644075
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644588 cctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 51644489  T
Q  133 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51644488 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaa 51644389  T
Q  232 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644388 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaa 51644289  T
Q  332 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaaca 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||| |||    
T  51644288 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattgaca 51644189  T
Q  432 gctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggc 530  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51644188 gctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggc 51644089  T
Q  531 tcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||    
T  51644088 tcatcgagacgctc 51644075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 10951480 - 10950946
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10951480 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 10951381  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10951380 caggtttacttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatata 10951282  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  10951281 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagatt 10951182  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||   || | |||    
T  10951181 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatccgcaagtgtaggagctt 10951082  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951081 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 10950982  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10950981 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 10950946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 41787177 - 41787712
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787177 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 41787276  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787277 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 41787375  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41787376 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacgga 41787473  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || |     
T  41787474 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggag 41787573  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787574 cttttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 41787673  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41787674 tgaaccgcccttcagggttttcggctcatcgagacgctc 41787712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28591470 - 28590938
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591470 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28591371  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28591370 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatata 28591272  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28591271 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 28591173  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || |  ||     
T  28591172 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagtttt 28591073  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28591072 tgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggtcggccagatatagctacttgccttttatttcaatctcatttttgcatgaa 28590973  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28590972 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 28590938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 16201895 - 16202434
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16201895 cacagactatcctggagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16201994  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--- 203  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  16201995 caggtttgcttt-caaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgttttttt 16202093  T
Q  204 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 301  Q
      ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202094 ttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 16202192  T
Q  302 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcac 401  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16202193 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcac 16202292  T
Q  402 agaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttt 501  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16202293 aggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagaggatggtggttggccagatatagttacttgcc-tctgtttcaatctcatttt 16202391  T
Q  502 tgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16202392 tgcatgaaccgcccttgcgggttttcggctcatcgagacgctc 16202434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20467173 - 20466634
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20467173 cacagactatcatggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgct 20467074  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttc-------aattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--tt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||  ||||        |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20467073 caggtttgcttt-caaaatagacaggaactttttttttttctaattttgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggttt 20466975  T
Q  202 ttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 301  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466974 ttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 20466876  T
Q  302 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcac 401  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||  ||||||     
T  20466875 cacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcat 20466776  T
Q  402 agaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttt 501  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466775 agaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtgatttgccaaatat-gttacttgccttttgtttcaatctcatttt 20466677  T
Q  502 tgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20466676 tgcatgaaccgccctttcgggttttcagctcatcgagacgctc 20466634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28156116 - 28155589
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156116 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28156017  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28156016 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 28155918  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155917 tatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 28155820  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||        
T  28155819 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcg 28155722  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||    
T  28155721 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgtcttttgtt------tcatttttgca 28155628  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28155627 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 28155589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 21891630 - 21892149
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21891630 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 21891728  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||         
T  21891729 caggtttgcttttcaaaa-----aaaacttttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttt----- 21891818  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
          ||||  || || | ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21891819 ------tgaacataaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 21891911  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21891912 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagc 21892011  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892012 ttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 21892111  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21892112 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 21892149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 31544654 - 31544609
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  31544654 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 31544609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 32296979 - 32296445
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296979 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 32296880  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296879 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 32296781  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  32296780 gctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggatt 32296681  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32296680 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaactt 32296581  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296580 ctgatgaaaatggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 32296481  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  32296480 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 32296445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 16618400 - 16618936
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16618400 cacagactatcctggggaagagcctccttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16618499  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt--caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 205  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  16618500 caggtttgcttt-caaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 16618598  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618599 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 16618697  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16618698 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaa 16618797  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618798 gcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 16618897  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618898 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 16618936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5728328 - 5727794
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728328 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5728229  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728228 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5728130  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5728129 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5728030  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  5728029 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 5727930  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727929 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5727830  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727829 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 5727794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5717418 - 5716884
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717418 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5717319  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717318 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5717220  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5717219 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5717120  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |||    
T  5717119 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 5717020  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717019 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5716920  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5716919 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 5716884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 5764040 - 5764574
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764040 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5764139  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764140 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5764238  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5764239 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5764338  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |||    
T  5764339 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 5764438  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764439 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5764538  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764539 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 5764574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24334524 - 24333989
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24334524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 24334425  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24334424 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtata 24334326  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334325 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24334226  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  24334225 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 24334126  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24334125 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcattctcatttttgcatg 24334026  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334025 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 24333989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 47029803 - 47029269
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029803 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 47029704  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 47029605  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47029604 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 47029505  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  47029504 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 47029405  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029404 tagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagccggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 47029305  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47029304 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 47029269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 31958366 - 31958901
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31958366 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 31958465  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958466 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31958564  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958565 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 31958664  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  31958665 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 31958764  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958765 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 31958864  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31958865 aaccgcccctccgggttttcggctcatcgagacgctc 31958901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 29658879 - 29659412
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658879 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29658978  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658979 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 29659077  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29659078 aactttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 29659176  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  29659177 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 29659276  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659277 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 29659376  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29659377 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 29659412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 5603224 - 5603759
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5603224 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgct 5603323  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603324 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5603422  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603423 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 5603522  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  5603523 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 5603622  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5603623 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatg 5603722  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5603723 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 5603759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16422532 - 16422000
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422532 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16422433  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  16422432 caggtttgcttt-caaaatacacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 16422334  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422333 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16422235  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16422234 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc-ggaaactttgaattcgcaagcacagaagct 16422136  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttg-ccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16422135 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccctaagggaacggtggttggcccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcatg 16422037  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422036 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 16422000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 4340587 - 4341121
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340587 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 4340686  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4340687 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 4340785  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340786 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 4340884  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-t 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| | |    
T  4340885 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 4340984  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4340985 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacagtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatg 4341084  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  4341085 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 4341121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4423267 - 4422735
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423267 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4423168  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4423167 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 4423069  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423068 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4422970  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  4422969 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 4422870  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422869 tcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 4422770  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  4422769 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 4422735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 28109862 - 28110400
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109862 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28109961  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109962 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaacgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 28110060  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28110061 tatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacgg 28110160  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  28110161 attcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 28110260  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 504  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110261 gcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 28110360  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28110361 atgaaccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctc 28110400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5473336 - 5472804
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473336 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5473237  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5473236 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 5473139  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5473138 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5473040  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | |||    
T  5473039 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 5472940  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472939 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccaggtatagctacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5472840  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5472839 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 5472804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 8217983 - 8217448
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217983 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8217884  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8217883 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtat 8217785  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8217784 ataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 8217686  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |    
T  8217685 tccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagc 8217586  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217585 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 8217486  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  8217485 gaaccgcccttccgggttttcggttcattgagacgctc 8217448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28027638 - 28027107
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027638 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28027539  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  28027538 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 28027440  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28027439 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattc 28027342  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||     
T  28027341 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttt 28027242  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027241 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 28027142  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28027141 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 28027107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 4790544 - 4791078
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790544 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4790643  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4790644 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4790742  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4790743 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggatt 4790841  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | ||    
T  4790842 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 4790941  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  | | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790942 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggcggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 4791041  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4791042 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgaggcgctc 4791078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4630133 - 4629601
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4630133 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4630035  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4630034 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 4629936  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4629935 aactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 4629837  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4629836 aacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 4629737  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629736 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 4629637  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4629636 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 4629601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 10402497 - 10401965
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402497 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10402398  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402397 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 10402299  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10402298 agctttgaaagtagaa-aaaaatagaatttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatt 10402201  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||    
T  10402200 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagctt 10402101  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10402100 ttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatga 10402001  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10402000 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 10401965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 10649420 - 10648887
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649420 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10649321  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10649320 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 10649222  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10649221 aactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 10649123  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  10649122 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 10649023  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649022 tagatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 10648923  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10648922 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 10648887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 22381492 - 22382023
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  22381492 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgct 22381590  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381591 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 22381689  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381690 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 22381788  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||    
T  22381789 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt 22381888  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381889 -tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 22381987  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22381988 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 22382023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 17970777 - 17971308
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970777 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacgcatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 17970876  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  17970877 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 17970975  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970976 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 17971073  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  17971074 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 17971173  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971174 tgatgaagacggtcattgacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 17971273  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17971274 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 17971308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 29142665 - 29143201
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29142665 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 29142764  T
Q  111 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29142765 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 29142863  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29142864 atagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 29142963  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  29142964 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 29143063  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143064 ttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 29143163  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29143164 gaaccgccctttcgggttttcgattcatcgagacgctc 29143201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18249087 - 18248554
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18248988  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18248987 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgt 18248889  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18248888 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttc-caaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggatt 18248790  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18248789 cacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 18248690  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248689 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 18248590  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18248589 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 18248554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 48472280 - 48471743
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472280 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 48472181  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-----caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472180 caggtttgcttttcaaaatagac-agaaagttttcaatttttaaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 48472082  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  48472081 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatg 48471983  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  48471982 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtagga 48471883  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 504  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48471882 acttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattcttgc 48471783  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48471782 atgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 48471743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21681049 - 21680517
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21681049 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 21680951  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  21680950 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatat 21680852  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21680851 aactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 21680753  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21680752 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 21680653  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680652 cagatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 21680553  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21680552 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 21680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 22864759 - 22865290
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864759 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22864858  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22864859 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 22864957  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22864958 gctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatt 22865054  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | |||    
T  22865055 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 22865154  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865155 ttgatgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 22865254  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22865255 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 22865290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 22879818 - 22880349
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879818 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22879917  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22879918 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 22880016  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22880017 gctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatt 22880113  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | |||    
T  22880114 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 22880213  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880214 ttgatgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 22880313  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22880314 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 22880349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Original strand, 5590275 - 5590805
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590275 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacctattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 5590374  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5590375 gtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagc 5590473  T
Q  213 tttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 312  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5590474 tttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttac 5590572  T
Q  313 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || | ||||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  5590573 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttag 5590672  T
Q  413 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 511  Q
    |||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590673 atgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 5590772  T
Q  512 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590773 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 5590805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 51788371 - 51787838
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788371 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 51788272  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51788271 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatat 51788173  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51788172 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 51788074  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  51788073 cacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 51787974  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787973 tagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 51787874  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  51787873 accgcccttccgggttttcggctcattgagacgctc 51787838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20072384 - 20071851
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072384 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20072285  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20072284 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 20072186  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20072185 tatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacgg 20072088  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||        
T  20072087 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcg 20071990  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20071989 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 20071890  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20071889 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 20071851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 540
Target Start/End: Original strand, 18286266 - 18286794
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18286266 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18286364  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286365 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18286463  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286464 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18286561  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||  |||||| |  | ||    
T  18286562 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagct 18286661  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286662 tttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 18286761  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagac 540  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18286762 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagac 18286794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 540
Target Start/End: Original strand, 18301567 - 18302095
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18301567 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18301665  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301666 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18301764  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301765 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18301862  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||  |||||| |  | ||    
T  18301863 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagct 18301962  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301963 tttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 18302062  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagac 540  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18302063 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagac 18302095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 17978861 - 17979397
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17978861 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgct 17978960  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17978961 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 17979059  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17979060 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 17979158  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac- 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |     
T  17979159 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagct 17979258  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc--aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979259 ttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 17979358  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17979359 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 17979397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 28345519 - 28344991
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345519 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28345420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28345419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 28345321  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345320 agctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 28345223  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| |||    
T  28345222 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagctt 28345123  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345122 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 28345023  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagac 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28345022 accgcccttccgggttttcggctcatcgagac 28344991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 6536654 - 6537187
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6536654 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgct 6536753  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536754 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 6536852  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536853 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 6536951  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | |||    
T  6536952 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 6537051  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6537052 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcgatctcatttttgcatga 6537151  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6537152 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 6537187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 20570757 - 20571290
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570757 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 20570856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20570857 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 20570955  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20570956 agctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 20571054  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  20571055 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 20571154  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20571155 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggtcggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcgtga 20571254  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20571255 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 20571290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7079576 - 7079041
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079576 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 7079477  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttg----t 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    |    
T  7079476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatat 7079377  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079376 atatagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 7079278  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||       
T  7079277 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattc 7079180  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 504  Q
     ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079179 gcttttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 7079080  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgct 543  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7079079 atgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 7079041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 11104272 - 11104806
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104272 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11104371  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat- 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||     
T  11104372 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatt 11104470  T
Q  210 -agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
     ||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11104471 tagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggat 11104569  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| || |||||  || | ||    
T  11104570 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaactcgcaagcgtaggagct 11104669  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    |  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104670 ttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 11104769  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11104770 aaccgcccttccaggttttcggctcatcgagacgctc 11104806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18057612 - 18057076
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057612 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18057513  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatc-aaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18057512 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 18057413  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    || ||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057412 taactttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18057314  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |    
T  18057313 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 18057214  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18057213 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgttttaatctcatttttgcat 18057114  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057113 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 18057076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5020061 - 5019529
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5020061 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5019962  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5019961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 5019863  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5019862 agctttgaaagtagaagaaag-tagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 5019765  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  5019764 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 5019665  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019664 tagatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5019565  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5019564 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 5019529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18231542 - 18231009
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18231542 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgct 18231443  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231442 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18231344  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18231343 agctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 18231245  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |||    
T  18231244 cgcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 18231145  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231144 tagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 18231045  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  18231044 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 18231009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 6208245 - 6207716
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6208245 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6208147  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6208146 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcctttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtata 6208054  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208053 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 6207954  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |    
T  6207953 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagc 6207854  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207853 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 6207754  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6207753 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 6207716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 31030156 - 31030682
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31030156 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatcttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 31030254  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030255 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31030348  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31030349 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31030447  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | |||     
T  31030448 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 31030547  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030548 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 31030647  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  31030648 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 31030682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18336968 - 18336444
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18336968 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcag 18336870  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336869 gtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagct 18336776  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18336775 ttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 18336677  T
Q  314 aagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | || | ||| ||    
T  18336676 aagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagtataggagcttttg 18336577  T
Q  413 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 511  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18336576 atgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaacc 18336477  T
Q  512 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18336476 gcccttccgggttttcggttcatcgagacgctc 18336444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19700847 - 19700304
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19700847 cacagactatcctggggaagaatctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19700748  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----- 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19700747 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttttt 19700649  T
Q  204 ------gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 297  Q
          ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700648 ttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtg 19700550  T
Q  298 actccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaa 397  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  19700549 actccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattcgcaa 19700450  T
Q  398 gcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctca 497  Q
     || || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700449 acataggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagacgccccaagggaacggtggttggcctgatatagttacttgccttttgtttcaatctca 19700350  T
Q  498 tttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgct 543  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  19700349 tttttgcatgaaccgcccttccaggtttacggctcatcgagacgct 19700304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 32445494 - 32444970
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32445494 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 32445396  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32445395 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatata 32445304  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
     ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32445303 actttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 32445205  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| | |||| |  | |||     
T  32445204 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcgagcataagagcttt 32445105  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445104 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 32445005  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  32445004 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 32444970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4727976 - 4727449
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727976 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4727878  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727877 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtata 4727785  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727784 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4727686  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||  || | ||    
T  4727685 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagct 4727586  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4727585 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatcccatttttgcatg 4727486  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  4727485 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 4727449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 15735011 - 15735539
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15735011 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15735109  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||     
T  15735110 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtac 15735203  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735204 ataactttgaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 15735301  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||   |   |    
T  15735302 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgttggggc 15735401  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735402 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 15735501  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15735502 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 15735539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 8283369 - 8283913
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8283369 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 8283468  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaag--------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ctgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg- 199  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||         |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||||||     
T  8283469 caggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgt 8283568  T
Q  200 ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 299  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||   ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283569 ttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaaacacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 8283667  T
Q  300 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagc 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8283668 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 8283767  T
Q  400 acagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcat 498  Q
      || | |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283768 gtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcat 8283867  T
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8283868 ttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 8283913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 35887109 - 35886580
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |     
T  35887109 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttaca 35887011  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  35887010 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 35886918  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886917 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 35886819  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || |     
T  35886818 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggag 35886719  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886718 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 35886619  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  35886618 tgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 35886580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4689994 - 4689466
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4689994 cacagactatcctggaggagaatctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 4689896  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  4689895 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 4689804  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689803 ataacttagaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 4689706  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || |     
T  4689705 tttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacgcagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggag 4689606  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctca-tttttgc 504  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4689605 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggatggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcattttttgc 4689506  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4689505 atgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 4689466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5658480 - 5657951
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5658480 cacagactatccttgaggagaacctgcttgtaacatgcgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 5658382  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
     |||||||||||||||||       |||  ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  5658381 taggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 5658289  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat--gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    ||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5658288 ataacgttgaaagtaaaaggaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaatgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacg 5658190  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |    
T  5658189 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataaga 5658090  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5658089 gcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccccagggaacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 5657990  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5657989 tgaaccgcccttccgggttttcagctcatcgagacgctc 5657951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 290 - 544
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887151
Alignment:
Q  290 aaggcgtgactccacggattc-acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaacttt 387  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  388 gaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttg 486  Q
    |||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| | |    
T  15886994 gaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctctcg 15887093  T
Q  487 tttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15887094 tttcaatctcatttttccatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 15887151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 314 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002376
Alignment:
Q  314 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||  ||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 8002508  T
Q  414 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 512  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002507 tgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 8002408  T
Q  513 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8002407 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 8002376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Original strand, 15886652 - 15886895
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15886652 cacagactatccgggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatg-ttcgtttgaatgtaccctgttgct 15886750  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ctgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||        |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||| |  |||||||     
T  15886751 caggtttgcttttca--------aaaaactttttcaattttcaagatgtttgcttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtac 15886842  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 261  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15886843 ataactttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 10718148 - 10718193
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  10718148 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 10718193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 41002982 - 41002937
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41002982 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 41002937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 41011763 - 41011718
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41011763 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 41011718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 3795932 - 3795398
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795932 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3795833  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795832 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 3795734  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3795733 gctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 3795634  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  3795633 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaggctt 3795534  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795533 tagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 3795434  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3795433 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 3795398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 18369300 - 18369833
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369300 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18369399  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369400 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-agttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 18369498  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18369499 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 18369598  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || |  ||     
T  18369599 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagtttt 18369698  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369699 tgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacagtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 18369798  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369799 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 18369833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 33881519 - 33880987
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881519 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33881420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 33881321  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33881320 gctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 33881221  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||     
T  33881220 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttt 33881121  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33881120 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaac 33881021  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  33881020 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 33880987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 11555742 - 11555214
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555742 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 11555643  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555642 tttgcttttcaaaatagacaagaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 11555544  T
Q  215 tgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555543 tgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 11555445  T
Q  315 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgat 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | ||| ||||    
T  11555444 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgat 11555345  T
Q  415 gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 513  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555344 gaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 11555245  T
Q  514 cctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11555244 ccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 11555214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 22894808 - 22894277
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22894808 cacagactatcctggggaagagtctgcttgtaacacatatcgaaatagacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 22894709  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22894708 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacata 22894610  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22894609 gctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 22894511  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22894510 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttc 22894411  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894410 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtagttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 22894311  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22894310 tgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 22894277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30174859 - 30174325
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174859 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 30174760  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174759 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 30174661  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30174660 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 30174561  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  30174560 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 30174461  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174460 tagatgaagataggcattaacagccgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 30174361  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30174360 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 30174325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28655636 - 28655102
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655636 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28655537  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28655536 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtata 28655437  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28655436 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggat 28655339  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||    
T  28655338 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagct 28655239  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655238 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtagttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 28655139  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  28655138 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 28655102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 37746090 - 37746628
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgt------actcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccct 104  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37746090 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacattaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccct 37746189  T
Q  105 gttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746190 gttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaa-agttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttg 37746288  T
Q  205 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 304  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746289 tatatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 37746388  T
Q  305 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacaga 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |      
T  37746389 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataag 37746488  T
Q  405 aacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 504  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746489 agcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 37746588  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37746589 atgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 37746628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 18494536 - 18495068
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494536 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18494635  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||    
T  18494636 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatata 18494734  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18494735 gctttgaaagtagaagaaaa-tggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattc 18494833  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| | |||| || | |||     
T  18494834 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaacttcgaattcgccagcataggagcttt 18494933  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494934 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 18495033  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18495034 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 18495068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 37352412 - 37352945
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37352412 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 37352511  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  37352512 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 37352610  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37352611 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 37352709  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  37352710 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagctt 37352809  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352810 ttgatgaagacagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 37352909  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37352910 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 37352945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 32590044 - 32590576
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590044 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32590143  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32590144 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatat 32590242  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| |||    
T  32590243 agctttgaaagtagaagaaag-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaatt 32590340  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  32590341 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 32590440  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590441 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 32590540  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32590541 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 32590576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Original strand, 9544478 - 9545009
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544478 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 9544577  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9544578 gtttacttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 9544676  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544677 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 9544774  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | |||    
T  9544775 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcct-gaaactttgaattcgcaagcataagagctt 9544873  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544874 ttgatgaaaatggtcattaacagctgtagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 9544973  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9544974 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 9545009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 6880697 - 6880163
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880697 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacacattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6880598  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6880597 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatat 6880499  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880498 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 6880400  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||  |    
T  6880399 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagat 6880300  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880299 tcagatgaagatggtcattaacagttgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 6880200  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6880199 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 6880163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 13180561 - 13181090
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180561 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13180660  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180661 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13180754  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13180755 gctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 13180854  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  |  | |||    
T  13180855 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtatgagctt 13180954  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13180955 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatga 13181054  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13181055 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 13181090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 33298930 - 33298393
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33298930 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 33298831  T
Q  111 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33298830 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 33298732  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33298731 atagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 33298632  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||     
T  33298631 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 33298532  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298531 cttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 33298432  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33298431 tgaaccgccctttcgggttttcgattcatcgagacgctc 33298393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 8659240 - 8659773
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659240 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 8659339  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8659340 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 8659438  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8659439 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 8659537  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  8659538 cacaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcc-cgaaactttgaattcacaagtacaagagctt 8659636  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttg-ccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8659637 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccctcttgtttcaatctcatttttgcatg 8659736  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8659737 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 8659773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 37761376 - 37760842
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37761376 cacagtctatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgct 37761277  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761276 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 37761178  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  37761177 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggat 37761079  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| || | ||    
T  37761078 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagct 37760979  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37760978 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 37760879  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37760878 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 37760842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 9323869 - 9323337
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9323869 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 9323770  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9323769 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 9323671  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323670 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 9323573  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9323572 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaactt 9323473  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323472 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 9323373  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9323372 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 9323337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 40467321 - 40467854
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467321 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40467420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40467421 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatat 40467519  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467520 agctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 40467618  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  40467619 tataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 40467718  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467719 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 40467818  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40467819 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 40467854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24730363 - 24729830
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24730363 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 24730264  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24730263 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtata 24730165  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730164 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24730067  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | ||    
T  24730066 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagct 24729967  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729966 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 24729867  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24729866 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 24729830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23632364 - 23631829
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632364 cacagactatcctggaggagaaccggcttataacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 23632265  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632264 caagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaagatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 23632165  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632164 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 23632066  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | ||    
T  23632065 tcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagct 23631966  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23631965 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 23631866  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23631865 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 23631829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 28953548 - 28954081
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28953548 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28953646  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28953647 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 28953745  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28953746 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 28953844  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28953845 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 28953944  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953945 tcagatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 28954044  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28954045 aaccgcccttccgggtcttcggctcatcgagacgctc 28954081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 13318596 - 13319128
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318596 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13318695  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318696 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13318794  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13318795 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 13318893  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||  |  | |||     
T  13318894 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcataacatttcccagaaactttgaattcgcaagcgtatgagcttt 13318993  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318994 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 13319093  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13319094 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 13319128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 13436442 - 13436982
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436442 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaatatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13436541  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13436542 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgt 13436640  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436641 atatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 13436739  T
Q  305 ggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  13436740 ggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcatag 13436839  T
Q  404 aaacttctga-tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttt 501  Q
     | ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436840 gagcttttgattgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttt 13436939  T
Q  502 tgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13436940 tgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 13436982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 15752626 - 15753152
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752626 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15752725  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  15752726 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaa----gaaagaaaatgttttgtatata 15752820  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15752821 gctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 15752918  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||     
T  15752919 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 15753018  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15753019 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaac 15753118  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15753119 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 15753152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30158427 - 30157893
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30158427 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 30158328  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30158327 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 30158229  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30158228 agctttgaaagtagaagaaaggtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 30158130  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-t 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| || ||| || | |    
T  30158129 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacgagtacataagctt 30158030  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158029 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcctcaaggggaacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 30157930  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30157929 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 30157893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 12138568 - 12138036
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12138568 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12138469  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12138468 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 12138370  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138369 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 12138272  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12138271 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaactt 12138172  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138171 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgtcttttgtttcaatctcatttttgcatga 12138072  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12138071 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 12138036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 11330032 - 11329497
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11329933  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  11329932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 11329834  T
Q  210 --agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329833 ttagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 11329735  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |    
T  11329734 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagc 11329635  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329634 ttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 11329535  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11329534 gaactgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 11329497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 31820178 - 31820709
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31820178 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgct 31820277  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31820278 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 31820376  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820377 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 31820474  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  31820475 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 31820574  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820575 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 31820674  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31820675 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 31820709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 37665254 - 37665787
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37665254 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 37665352  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665353 caggtttgctttttaaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 37665451  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665452 cagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 37665550  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||    
T  37665551 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaattttgaattcgcaagcataagagct 37665650  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665651 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 37665750  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37665751 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 37665787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30035795 - 30035287
Alignment:
Q  34 ctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagac 133  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30035795 ctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaac 30035696  T
Q  134 aaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 232  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30035695 aaaaa-gttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-t 30035598  T
Q  233 agagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaat 332  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30035597 agaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaat 30035499  T
Q  333 tttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacag 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30035498 tttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacag 30035399  T
Q  433 ctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctc 532  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  30035398 ctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattc 30035299  T
Q  533 atcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||    
T  30035298 atcgagacgctc 30035287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 33522776 - 33522239
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33522776 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 33522677  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33522676 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 33522578  T
Q  210 agctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33522577 agctttgaaagtaaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 33522479  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac- 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |     
T  33522478 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagct 33522379  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 504  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522378 ttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 33522279  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33522278 atgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 33522239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 34622912 - 34622378
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622912 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34622813  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622812 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 34622714  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34622713 agctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggatt 34622615  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | ||    
T  34622614 cacaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 34622515  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622514 ttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 34622415  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34622414 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 34622378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 41681098 - 41680564
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41681098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 41681000  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  41680999 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 41680901  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  41680900 tagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggat 41680801  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||    
T  41680800 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 41680701  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41680700 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcata 41680601  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  41680600 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 41680564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2517459 - 2516925
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2517459 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacacgttgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 2517360  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517359 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 2517261  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2517260 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatct-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacgga 2517163  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  2517162 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 2517063  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2517062 ttttgatgaagataggcattgacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcat 2516963  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2516962 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 2516925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 43084651 - 43084118
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084651 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 43084552  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43084551 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaactttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 43084453  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43084452 aactttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 43084354  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| | |||| || | |||    
T  43084353 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattcgccagcataggagctt 43084254  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||   | || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084253 ttgatgaagataatcattaacagcagcagatgcccccaggggggcggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 43084154  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43084153 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 43084118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 26486778 - 26486256
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26486778 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26486679  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26486678 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26486580  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||           |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486579 gctttgaaa-----------atagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 26486492  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486491 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaactt 26486392  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486391 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26486292  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26486291 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 26486256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 31437847 - 31437324
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31437847 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 31437748  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437747 gtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 31437655  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31437654 ttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 31437556  T
Q  314 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| |||    
T  31437555 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttga 31437456  T
Q  414 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 512  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437455 tgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 31437356  T
Q  513 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31437355 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 31437324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5644191 - 5643662
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5644191 cacagattatcttggaggagaacctgcttttaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 5644093  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5644092 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcgattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 5643994  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643993 agctttgaaagtaaaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 5643896  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| | |||||||||||| ||||  ||    |||    
T  5643895 cacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaag--cattcgctt 5643798  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643797 ttgatgaaaatgggcattaacagctgcagatgccccaaggggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5643698  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5643697 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 5643662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 18122184 - 18122717
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18122184 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18122282  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  18122283 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 18122381  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122382 agctttgaaagtagaaaaaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18122480  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  18122481 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagct 18122580  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122581 tttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 18122680  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  18122681 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 18122717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 18 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 25206670 - 25206139
Alignment:
Q  18 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 117  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25206670 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25206571  T
Q  118 gcttttcaaaatagacaaaaaag----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25206570 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25206472  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25206471 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25206373  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| || || | |||    
T  25206372 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagctt 25206273  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  25206272 ctgatgaagatggtcattaacagctgtagatgccccaacgggatggtggttggccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcataaa 25206174  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25206173 cctcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 25206139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 18 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 25270826 - 25270295
Alignment:
Q  18 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 117  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25270826 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25270727  T
Q  118 gcttttcaaaatagacaaaaaag----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25270726 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25270628  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25270627 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 25270529  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| || || | |||    
T  25270528 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagctt 25270429  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  25270428 ctgatgaagatggtcattaacagctgtagatgccccaacgggatggtggttggccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcataaa 25270330  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25270329 cctcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 25270295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 15652528 - 15653059
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15652528 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15652626  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||    | | | |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652627 caggtttgcttttttttaaaaa-aaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 15652725  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15652726 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 15652824  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||     
T  15652825 acaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 15652924  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652925 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccgagggagacggtggtcggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 15653024  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15653025 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 15653059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 22992892 - 22993417
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22992892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 22992990  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992991 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcatcatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 22993083  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22993084 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 22993182  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||     
T  22993183 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcgatacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 22993282  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993283 tgatgaggatagtcattaacagctgcagatgccccaagggtgacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 22993382  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  22993383 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 22993417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 23898261 - 23897735
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23898261 cacagactatcctggagaagaatctgcttgcaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 23898162  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----gt 205  Q
    ||||||||||||  ||| |           |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    ||    
T  23898161 caggtttgctttcaaaact-----------ttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgt 23898073  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23898072 acatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatg 23897974  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||| || |    
T  23897973 aatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcggaagcatagga 23897874  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897873 gcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 23897774  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23897773 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 23897735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 33783875 - 33783347
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33783875 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 33783777  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gta 206  Q
    | ||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  33783776 ccggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 33783685  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33783684 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 33783586  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || |     
T  33783585 atttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggag 33783486  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33783485 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgca 33783386  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33783385 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 33783347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24608634 - 24608106
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24608634 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacacttgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 24608535  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ctgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||     
T  24608534 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24608443  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||   ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608442 ataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaagcacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24608344  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || |     
T  24608343 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggag 24608244  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608243 cttttgatgaagatggtcattagtagctgcagacgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 24608144  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24608143 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 24608106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30941023 - 30940496
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30941023 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgct 30940925  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ctgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||     
T  30940924 caggtttgcttttcaaaa---------actttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 30940834  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940833 ataactttgaaagtaaaaagaaagcaga-atttcaaacaaaagcacaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 30940735  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || |     
T  30940734 tttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggag 30940635  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940634 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 30940535  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940534 tgaaccgccttttcgggttttcggctcatcgagacgctc 30940496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24976236 - 24975709
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24976236 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgct 24976137  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         |  ||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24976136 caggtttgcttttcaaaa---------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24976046  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24976045 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 24975947  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||| || | |    
T  24975946 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcgagcataggagc 24975847  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24975846 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctctcgtttcaatctcatttttgcat 24975747  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24975746 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 24975709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 12176455 - 12176500
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12176455 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 12176500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 21863308 - 21863353
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21863308 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 21863353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 24960667 - 24960712
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24960667 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 24960712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 26085218 - 26085263
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  26085218 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 26085263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28848511 - 28848466
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  28848511 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 28848466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 12421 - 11891
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12421 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12322  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12321 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatata 12223  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12222 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 12124  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||    |||     
T  12123 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaag--cattcgcttt 12026  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12025 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 11926  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11925 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 11891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27810087 - 27809554
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27810087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgct 27809988  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809987 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27809889  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa--tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27809888 gctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27809789  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  27809788 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagct 27809689  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809688 tttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 27809589  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgc 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809588 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgc 27809554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 37945723 - 37946257
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945723 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37945822  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945823 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 37945921  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37945922 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 37946021  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  37946022 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 37946121  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946122 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 37946221  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946222 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 37946257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 12661922 - 12661390
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661922 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12661823  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661822 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 12661724  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661723 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 12661625  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |||     
T  12661624 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttt 12661525  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661524 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 12661425  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12661424 tcgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctc 12661390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 12593198 - 12592661
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593198 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12593099  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12593098 caggtttgctttccaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 12593000  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12592999 tatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 12592900  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |     
T  12592899 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagag 12592800  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592799 cttttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 12592700  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592699 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 12592661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 37384061 - 37383528
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37384061 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 37383962  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383961 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 37383863  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37383862 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattc 37383764  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||    
T  37383763 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagctt 37383664  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37383663 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatga 37383564  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37383563 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 37383528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 19410342 - 19410878
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19410342 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgct 19410441  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19410442 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtata 19410540  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410541 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19410640  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  19410641 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 19410740  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa--ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19410741 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcattctcatttttgcat 19410840  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410841 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 19410878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 22922001 - 22922536
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22922001 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 22922100  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922101 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 22922199  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922200 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22922299  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  22922300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 22922399  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22922400 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttctgtttcaatctcattcttgcatg 22922499  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22922500 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 22922536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 39896452 - 39895919
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896452 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39896353  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896352 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 39896254  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39896253 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattc 39896155  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  39896154 acaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttccccaaaaactttgaattctcaagtacagaagctt 39896055  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39896054 cagatgacgatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatga 39895955  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39895954 accgcccctccgggttttcggctcatcgagacgctc 39895919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 3788877 - 3788345
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788877 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3788778  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788777 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 3788679  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||     
T  3788678 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggattt 3788580  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| || | |||     
T  3788579 ataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 3788480  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788479 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 3788380  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3788379 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 3788345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27122907 - 27122376
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122907 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27122808  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27122807 caggtttgcttctcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 27122709  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27122708 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 27122611  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | |||     
T  27122610 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 27122511  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122510 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 27122411  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27122410 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27122376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 34868066 - 34867534
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34868066 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34867967  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34867966 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 34867868  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34867867 agctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggatt 34867770  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||    
T  34867769 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctt 34867670  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867669 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 34867570  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  34867569 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 34867534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 21671028 - 21671564
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671028 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21671127  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21671128 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 21671227  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21671228 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 21671325  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||     
T  21671326 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaag 21671425  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671426 cttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 21671525  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21671526 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 21671564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 21697031 - 21697565
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21697031 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 21697130  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21697131 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 21697229  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
     |||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697230 catagctttgaaagtaggaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 21697328  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21697329 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaag 21697428  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21697429 ctttagatgaaggtggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcat 21697527  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697528 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 21697565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 254510 - 255043
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254510 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 254609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 254707  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  254708 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 254807  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  254808 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 254907  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  |||||  || || ||||||||||||||||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254908 tagatgaagatagtcatcgacggcagcagatgccccaagggggacggtggctggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 255007  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  255008 accgcccttctgggttttcgattcatcgagacgctc 255043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 37679749 - 37680284
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679749 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37679848  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37679849 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaa-atttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 37679947  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37679948 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 37680045  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||     
T  37680046 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaag 37680145  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680146 cttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 37680245  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37680246 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 37680284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 37695014 - 37695549
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695014 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37695113  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37695114 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaa-atttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 37695212  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37695213 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacgga 37695310  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||     
T  37695311 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaag 37695410  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695411 cttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 37695510  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37695511 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 37695549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 13930402 - 13930937
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930402 cacagactatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13930501  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13930502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 13930600  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13930601 tagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggat 13930700  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||    
T  13930701 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 13930800  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    |  ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930801 ttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 13930900  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13930901 aaccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctc 13930937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16167862 - 16167329
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167862 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16167763  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16167762 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 16167664  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16167663 aactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 16167565  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  16167564 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 16167465  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
       |||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167464 tatatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 16167365  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16167364 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 16167329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 34161230 - 34160695
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161230 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtgacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34161131  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161130 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 34161032  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161031 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 34160933  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | |    
T  34160932 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagc 34160833  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160832 ttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 34160733  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34160732 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 34160695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 40239892 - 40239360
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40239892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 40239794  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  40239793 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatat 40239695  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40239694 aactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 40239596  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  40239595 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 40239496  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239495 cagatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 40239396  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40239395 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 40239360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 32056185 - 32055654
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056185 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32056086  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056085 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 32055987  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055986 agctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggatt 32055889  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||    
T  32055888 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcataggagctt 32055789  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055788 ttgatgaagatggttattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 32055689  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32055688 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 32055654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 12710459 - 12710992
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12710459 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 12710558  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710559 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 12710657  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12710658 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 12710755  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12710756 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 12710855  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710856 tcagatgaagacggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 12710955  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12710956 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 12710992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 9343845 - 9344378
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343845 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9343944  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9343945 caggtttgcttttcaaaatggacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatat 9344043  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344044 agctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 9344142  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  9344143 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 9344242  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344243 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 9344342  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9344343 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 9344378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 37931763 - 37931223
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37931763 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 37931664  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931663 caggtttgcttttcaaaataaac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 37931565  T
Q  210 agctttgaaagtagaag------aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 303  Q
    |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37931564 agctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 37931465  T
Q  304 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  37931464 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtag 37931365  T
Q  404 aaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 502  Q
     | |||  ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931364 gagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgctccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 37931265  T
Q  503 gcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931264 gcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 37931223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 11629043 - 11629575
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11629043 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 11629141  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11629142 caggtttgtttttcaaaatagacaaaga-gttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 11629240  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629241 tagctttgaaaataaaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 11629338  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11629339 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagct 11629438  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11629439 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattcttgcatg 11629538  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11629539 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 11629575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 39045680 - 39046213
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39045779  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39045780 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatat 39045878  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045879 agctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 39045977  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  39045978 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattgaacacagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 39046077  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046078 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatacagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 39046177  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39046178 accgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctc 39046213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 16823195 - 16823731
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16823195 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16823294  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16823295 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 16823393  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16823394 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 16823492  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-t 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |    
T  16823493 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 16823592  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823593 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 16823692  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16823693 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 16823731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16898285 - 16897749
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16898285 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16898186  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16898185 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 16898087  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16898086 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 16897988  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-t 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |    
T  16897987 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 16897888  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897887 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 16897788  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16897787 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 16897749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27782616 - 27782083
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782616 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 27782517  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27782516 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 27782418  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27782417 agctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 27782319  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27782318 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 27782219  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782218 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 27782119  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  27782118 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 27782083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 31882670 - 31882138
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31882670 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 31882571  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882570 caagtttgcttttcaaaataga-aaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31882472  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882471 agctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31882374  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  31882373 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 31882274  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882273 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 31882174  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882173 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 31882138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 34297533 - 34297008
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297533 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34297434  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297433 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcgaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34297341  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34297340 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattc 34297242  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||||    | |||     
T  34297241 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcatgagagcttt 34297142  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297141 tgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagatataattacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 34297042  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34297041 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 34297008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27396717 - 27396174
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27396717 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 27396618  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt---------caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtt 201  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||         |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27396617 taggtttgcttt-caaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgtt 27396519  T
Q  202 tt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 299  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396518 ttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 27396420  T
Q  300 tccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagc 399  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27396419 tccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 27396320  T
Q  400 acagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcat 498  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||||    
T  27396319 acaaaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacaatcatttgtcttttcatttcaatctcat 27396220  T
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27396219 ttttgcatgaaccgccctttcggattttcggctcatcgagacgctc 27396174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 19450276 - 19450818
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||    
T  19450276 cacagactatcctggggaagagcctgcttataacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgct 19450375  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-----caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-- 203  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19450376 caggtttacttt-caaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttt 19450474  T
Q  204 ---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgact 300  Q
       ||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19450475 tttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacatgctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgatt 19450573  T
Q  301 ccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagca 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19450574 ccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 19450673  T
Q  401 cagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatt 499  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  |||||||||||||    
T  19450674 cagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcatt 19450773  T
Q  500 tttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19450774 tttgcatgaaccgccctttcgggttttcggcccatcgagacgctc 19450818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 34268784 - 34269311
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34268784 cacagactatcctagagaagaatctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 34268883  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  34268884 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 34268975  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34268976 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacatgctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 34269074  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||  | | |    
T  34269075 tttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcatgacatttcctagaaactttgaattcacaagcatgggagc 34269174  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269175 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 34269274  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34269275 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 34269311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 28888658 - 28888130
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28888658 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28888560  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  28888559 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 28888467  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888466 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacgga 28888368  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | |    
T  28888367 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagc 28888268  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888267 ttttgatgaagattgtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 28888168  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28888167 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 28888130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 23122436 - 23122964
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23122436 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 23122534  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  23122535 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 23122627  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23122628 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggat 23122726  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |    
T  23122727 ttgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 23122826  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122827 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 23122926  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23122927 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 23122964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 544
Target Start/End: Original strand, 27428315 - 27428837
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27428315 gactatcctgggggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcagg 27428413  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatag 211  Q
    ||||||||||||||         |  ||| |||||||||| ||||||||||| | || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | | |||     
T  27428414 tttgcttttcaaaa---------acttttgcaattttcaagatgtttgtttcgaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataa 27428504  T
Q  212 ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 311  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27428505 ctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 27428603  T
Q  312 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |  || |    
T  27428604 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaactcacaagcataagagttttt 27428703  T
Q  412 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27428704 gatgaagatggtcattaccagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaac 27428803  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27428804 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 27428837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 20844296 - 20843764
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20844296 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 20844197  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--a 206  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |    
T  20844196 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaa 20844103  T
Q  207 tatagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
     ||| |||| ||| ||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20844102 cataacttttgaaggtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacg 20844004  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacaga 404  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||  ||     
T  20844003 gatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtag- 20843905  T
Q  405 aacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttg 503  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843904 agcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttg 20843805  T
Q  504 catgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20843804 catgaaccgccctttcgggtttttggttcatcgagacgctc 20843764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 348
Target Start/End: Original strand, 31868644 - 31868979
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868644 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31868743  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31868744 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 31868842  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868843 agctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31868940  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 348  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31868941 tacaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 544
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887884
Alignment:
Q  343 ggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgc 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgc 31887781  T
Q  443 cccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacg 541  Q
    ||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  31887782 cccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttctgggttttcgattcatcgagacg 31887881  T
Q  542 ctc 544  Q
    |||    
T  31887882 ctc 31887884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23117180 - 23117044
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23117180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcc 23117081  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23117080 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaat 23117044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 411 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 27821974 - 27821840
Alignment:
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821974 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 27821875  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  27821874 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 27821840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 24289831 - 24289784
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcct 546  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  24289831 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcct 24289784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 15948523 - 15948568
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  15948523 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 15948568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 21117737 - 21117696
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagac 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21117737 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcagtccatcgagac 21117696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 35143316 - 35143271
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  35143316 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 35143271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 42569999 - 42570044
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  42569999 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 42570044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 9510 - 10041
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 9708  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9709 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattt 9807  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||     
T  9808 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 9907  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9908 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaac 10007  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10008 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 10041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 39857032 - 39856501
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39856933  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 39856834  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39856833 gctttgaaagtagaagaaaaa-agagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 39856736  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39856735 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 39856636  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856635 agatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaagggggacggtggttggccagatacagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 39856536  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39856535 ccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctc 39856501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 20332290 - 20332824
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332290 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20332389  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20332390 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatata 20332488  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20332489 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 20332588  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  20332589 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 20332688  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332689 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 20332788  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332789 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 20332824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 40099504 - 40100038
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099504 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40099603  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099604 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 40099702  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40099703 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 40099802  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  40099803 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 40099902  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099903 tagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 40100002  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40100003 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 40100038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 54839787 - 54839256
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839787 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 54839688  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  54839687 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 54839589  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839588 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caagcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 54839491  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||    
T  54839490 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt 54839391  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839390 ttgatgaagatggtcattaacaactgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 54839291  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54839290 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 54839256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14104939 - 14104408
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104939 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 14104840  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104839 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 14104741  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14104740 gctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 14104642  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||     
T  14104641 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttt 14104542  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14104541 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaac 14104442  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  14104441 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 14104408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 540
Target Start/End: Original strand, 24586229 - 24586759
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586229 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgct 24586328  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586329 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa-agttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 24586427  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24586428 gctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 24586527  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |||    
T  24586528 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 24586627  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586628 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 24586727  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagac 540  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24586728 accgcccttccgggtttttggctcatcgagac 24586759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30760159 - 30759628
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30760159 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 30760060  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30760059 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 30759961  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759960 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 30759863  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||     
T  30759862 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttt 30759763  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30759762 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgtatgaa 30759663  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30759662 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 30759628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 33667671 - 33668202
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33667671 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 33667770  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33667771 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 33667869  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667870 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 33667967  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||     
T  33667968 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttt 33668067  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668068 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttccttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 33668167  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33668168 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 33668202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 1906654 - 1906117
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1906654 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1906555  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttt----tg 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  1906554 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttg 1906456  T
Q  205 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 304  Q
    || || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906455 tacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 1906357  T
Q  305 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacaga 404  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  1906356 agatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatg 1906257  T
Q  405 aacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 504  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906256 agcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 1906157  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1906156 atgaaccgcccttccgggtttttggctcatcgagacgctc 1906117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 27157180 - 27157718
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27157279  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27157280 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 27157378  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27157379 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27157478  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||    
T  27157479 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 27157578  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg--attgtgatttgccagatatagttacttgcc-ttttgtttcaatctca-tttttgc 504  Q
    | |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||     ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27157579 tttgatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacgggtggttggccagatatagttacttgcctttttgtttcaatctcattttttgc 27157678  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157679 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 27157718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5700937 - 5700403
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700937 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5700838  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700837 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 5700739  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5700738 agctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 5700641  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  5700640 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagct 5700541  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagg-ggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700540 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 5700441  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcgg-ctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5700440 aaccgccctttcgggttttcggtctcatcgagacgctc 5700403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 540
Target Start/End: Original strand, 14753362 - 14753890
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14753362 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 14753460  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753461 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 14753559  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753560 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 14753657  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  14753658 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagct 14753757  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753758 tttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 14753857  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagac 540  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14753858 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagac 14753890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 18794485 - 18795018
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794485 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 18794584  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18794585 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 18794683  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18794684 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 18794782  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18794783 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 18794882  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18794883 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcctga 18794982  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  18794983 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 18795018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15234217 - 15233681
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15234217 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcc 15234118  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  15234117 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttcaagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgt 15234019  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15234018 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacg 15233920  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||    
T  15233919 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaa 15233820  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233819 gcttatgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 15233720  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15233719 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 15233681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5012275 - 5011741
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5012275 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgct 5012176  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  5012175 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatat 5012077  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5012076 agctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 5011978  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5011977 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagct 5011878  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5011877 tcagatgaaaatggtcattaacagctgcagatgcctcaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 5011778  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5011777 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 5011741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 34182832 - 34183363
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34182832 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 34182930  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182931 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 34183028  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183029 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 34183127  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | |||    
T  34183128 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 34183227  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183228 ttgatggagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 34183327  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  34183328 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 34183363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21976098 - 21975565
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21976098 agactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgg 21975999  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21975998 gtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagc 21975900  T
Q  213 tttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 312  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21975899 tttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcgcagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcac 21975801  T
Q  313 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-ttct 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | || |    
T  21975800 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagcttttt 21975701  T
Q  412 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975700 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 21975601  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21975600 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 21975565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 31120378 - 31120915
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31120378 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 31120477  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31120478 cgggtttgcttttcaaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 31120576  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31120577 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggat 31120675  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac- 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| |     
T  31120676 tcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaagct 31120775  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 504  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120776 ttttgatgaagacggtcattaacagctgcagataccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 31120875  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31120876 atgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 31120915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 6576251 - 6575726
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6576251 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6576153  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576152 caggtttgcttttcaaag-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 6576060  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6576059 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 6575961  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||| || | |||     
T  6575960 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagcttt 6575861  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575860 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 6575761  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6575760 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 6575726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 36338394 - 36338919
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36338394 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36338492  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338493 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 36338585  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338586 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 36338684  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  36338685 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 36338784  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338785 tgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 36338884  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  36338885 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 36338919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 15380106 - 15380639
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15380106 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaaaagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 15380205  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  15380206 caggcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttaattt-caagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 15380303  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380304 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15380402  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15380403 ttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataaccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagct 15380502  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  15380503 tcggatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatatagtcatttctcttttcatttcaatctcatttttgcatg 15380602  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380603 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 15380639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 15276497 - 15277033
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15276497 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 15276596  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt--caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    || |||| |||| ||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  15276597 caagtttacttt-caaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgta 15276695  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276696 catagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 15276794  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  15276795 atttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaag 15276894  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | | |||||  |||||||||||||||||||    
T  15276895 cttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcattagtcttttcatttcaatctcatttttgca 15276994  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15276995 tgaaccgccctttcgggttttcggcccatcgagacgctc 15277033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 24119055 - 24118526
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| || |  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24119055 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccagcacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccgg 24118957  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118956 tttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 24118858  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24118857 ttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 24118759  T
Q  314 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | ||| |||    
T  24118758 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttga 24118659  T
Q  414 tgaagacggtca-ttaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccaga-tatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 511  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24118658 tgaggacggtcatttaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccatattatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaacc 24118559  T
Q  512 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24118558 gcccttccgggttttcggttcatcgagacgctc 24118526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 17019445 - 17018916
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17019445 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 17019347  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  17019346 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 17019254  T
Q  209 tagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17019253 tagcttttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcataggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 17019155  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || |     
T  17019154 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggag 17019055  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17019054 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 17018955  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17018954 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 17018916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14671410 - 14670880
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14671410 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 14671311  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||     
T  14671310 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtac 14671218  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14671217 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacgga 14671119  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  || |     
T  14671118 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggag 14671019  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671018 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 14670919  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14670918 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 14670880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1674258 - 1673877
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1674258 cacagactatcctagggaagaacctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1674161  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  1674160 caagtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgta 1674062  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
     || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1674061 catggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacgg 1673963  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaatt 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  1673962 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaatt 1673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 319
Target Start/End: Original strand, 36324185 - 36324484
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36324185 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36324283  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324284 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 36324376  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324377 gctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 36324475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 380 - 544
Target Start/End: Original strand, 18311414 - 18311580
Alignment:
Q  380 gaaactttgaattcacaagcacagaaacttct-gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttact 477  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||    
T  18311414 gaaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacagtggttggccagatatagttact 18311513  T
Q  478 tgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  18311514 tgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 18311580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 8098581 - 8098626
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  8098581 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 8098626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 28355780 - 28356316
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355780 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28355879  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355880 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 28355978  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa--tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28355979 gctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 28356078  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||      
T  28356079 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaga 28356178  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356179 ttcagatgaagatggtcattaacagttgtagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 28356278  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28356279 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 28356316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 9361007 - 9360475
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361007 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9360908  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360907 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 9360809  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9360808 gctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 9360710  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  9360709 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 9360610  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360609 tgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 9360510  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  9360509 ccgcccttccgtgttttcggctcatcgagacgctc 9360475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 31360914 - 31360381
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360914 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31360815  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31360814 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 31360716  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31360715 aactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 31360617  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  31360616 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 31360517  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360516 tagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 31360417  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31360416 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 31360381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 29835708 - 29835176
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835708 cacagattatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29835609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29835608 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 29835510  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29835509 gctttgaaagtagaagaaaa-tggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 29835411  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  29835410 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaggcttc 29835311  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835310 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 29835211  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29835210 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 29835176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 33248751 - 33248219
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248751 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33248652  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248651 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 33248553  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248552 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 33248454  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |||     
T  33248453 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 33248354  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248353 tgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggagacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 33248254  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33248253 ccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctc 33248219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 31483700 - 31484235
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31483700 cacagactatcctggaggagaacctgctcgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgct 31483799  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483800 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31483898  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483899 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 31483998  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||     ||| ||    
T  31483999 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgtggaagct 31484098  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484099 tcagatgaagatggtcatcaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 31484198  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31484199 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 31484235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18797093 - 18796559
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797093 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18796994  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 18796895  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796894 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18796796  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||    
T  18796795 tataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagct 18796696  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796695 tttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccctaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 18796596  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18796595 aaccacccttccgggttttcggttcatcgagacgctc 18796559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19680833 - 19680301
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680833 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19680734  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19680733 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 19680635  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680634 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 19680537  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19680536 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 19680437  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680436 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 19680337  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  19680336 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 19680301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 44567369 - 44566834
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567369 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 44567270  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44567269 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 44567171  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567170 tatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 44567073  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcct-ggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  || |    
T  44567072 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaattcgcaagcgtagga 44566973  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
     ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44566972 gcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 44566873  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  44566872 tgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 44566834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 12086553 - 12087087
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12086553 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 12086652  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12086653 caggcttgcttttcaaaacagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 12086751  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12086752 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 12086850  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12086851 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 12086950  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086951 tttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 12087050  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12087051 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 12087087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15773960 - 15773427
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773960 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15773861  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15773860 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatat 15773762  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||| |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773761 agctctgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 15773663  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | |||    
T  15773662 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 15773563  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773562 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggaacgatggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 15773463  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  15773462 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 15773427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 21342000 - 21342534
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342000 cacagactattctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21342099  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21342100 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 21342198  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342199 agctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacagaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 21342297  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| || | ||    
T  21342298 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagct 21342397  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342398 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagtcacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 21342497  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  21342498 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 21342534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18715868 - 18715335
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715868 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagtcatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18715769  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18715768 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 18715670  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715669 tatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 18715572  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||        
T  18715571 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcg 18715474  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18715473 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaacctcatttttgca 18715374  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18715373 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 18715335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 19910992 - 19911527
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19910992 cacagactatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19911091  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  19911092 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 19911191  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911192 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19911290  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||  |||||  || | ||    
T  19911291 ttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagct 19911390  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911391 tttgatgaagatcgtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 19911490  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19911491 aaccgcccttccggattttcggttcatcgagacgctc 19911527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 33265079 - 33264584
Alignment:
Q  48 tattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaa 147  Q
    |||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33265079 tattgaaatagacattgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaa 33264981  T
Q  148 ttttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaaca 246  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  33264980 ttttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaaca 33264883  T
Q  247 aaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtg 346  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264882 aaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtg 33264783  T
Q  347 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccca 446  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33264782 gtacattgaacacagtaatcatggcatttcctaggaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtccca 33264683  T
Q  447 a-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    | |||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264682 agggggacggtggttggccagatatagttacttgctttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 33264584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 19202205 - 19202727
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19202205 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19202304  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19202305 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 19202403  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||           |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202404 gctttgaaa-----------atagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 19202491  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaa-actttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19202492 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaactt 19202591  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19202592 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttgtgtttcaatctcatttttgcatga 19202691  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19202692 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 19202727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 27602744 - 27603269
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  27602744 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgca 27602842  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         || |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  27602843 caggtttgcttttcaaaa---------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 27602933  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27602934 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 27603032  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27603033 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 27603132  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27603133 ttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaagggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcgtttttgcatg 27603232  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603233 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 27603269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 22074759 - 22075292
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22074759 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 22074858  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 207  Q
    || | ||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  22074859 catgcttgcttt-caaaacagacaaaaactttttta-ttttcaagaagtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 22074956  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074957 atagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcctaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 22075055  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |    
T  22075056 tttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggcaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagc 22075155  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22075156 ttctgatg-agatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcatttttgcat 22075254  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075255 gaaccgccatttcgggttttcggctcatcgagacgctc 22075292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Original strand, 19655180 - 19655707
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19655180 agactatcctggggaagagtctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcag 19655279  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatata 210  Q
    ||||||||| |||||       |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  19655280 gtttgcttt-caaaa-------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacata 19655371  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
     ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19655372 actttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggattt 19655470  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaa--ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||    
T  19655471 acaaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagct 19655570  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655571 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 19655670  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19655671 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 19655707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 140 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260076
Alignment:
Q  140 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt 16260382  T
Q  240 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260381 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattg 16260282  T
Q  340 gttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcaga 439  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260281 gttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcaga 16260182  T
Q  440 tgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgag 538  Q
    ||||| ||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16260181 tgccctaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgag 16260082  T
Q  539 acgctc 544  Q
    | ||||    
T  16260081 atgctc 16260076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 22139286 - 22138760
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22139286 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgct 22139187  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    || |||||||||          ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  22139186 caagtttgcttt----------caaaaactttttcaattttcaagacgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 22139097  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22139096 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 22138998  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || |     
T  22138997 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggag 22138898  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22138897 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcat 22138798  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22138797 gaaccgcccttccgggttttcggctgatcgagacgctc 22138760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 2131098 - 2131625
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2131098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 2131196  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||||||||||||         ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  2131197 caggtttgcttttcaaag--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 2131288  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2131289 ataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacgga 2131387  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |    
T  2131388 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 2131487  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2131488 ttttgatgaagaaggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 2131587  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2131588 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 2131625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19694477 - 19693948
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19694477 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 19694379  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  19694378 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 19694286  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694285 ataactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 19694187  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || |     
T  19694186 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggag 19694087  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694086 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 19693987  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19693986 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 19693948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14569540 - 14569010
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14569540 cacagaatatcctggaggagaacctgcttgtaacatgtattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 14569442  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat- 207  Q
    ||||||||  ||||||||        ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |     
T  14569441 caggtttgtctttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttttt 14569350  T
Q  208 ----atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 303  Q
        ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569349 gaacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 14569251  T
Q  304 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||   ||||||||||||| | | || ||    
T  14569250 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattaca-ttcccaaaaactttgaattcgccatcatag 14569152  T
Q  404 aaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 502  Q
     | ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569151 gagcttttgatgaagatagtcgttaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 14569052  T
Q  503 gcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  14569051 gcatgaaccgcccttccgggttttcggtacatcgagacgctc 14569010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 17678418 - 17678463
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  17678418 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 17678463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 5141088 - 5141622
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141088 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5141187  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5141188 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 5141286  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5141287 taactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 5141385  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5141386 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 5141485  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141486 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 5141585  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5141586 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 5141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 24586289 - 24586822
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586289 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 24586388  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24586389 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatata 24586487  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586488 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacgaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 24586586  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  24586587 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagatt 24586686  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586687 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcctcaaggggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 24586786  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24586787 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 24586822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 26441637 - 26441103
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441637 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26441538  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26441537 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 26441439  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26441438 gctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26441339  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26441338 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 26441239  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 cagacgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26441139  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26441138 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 26441103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5164767 - 5164234
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5164767 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5164668  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164667 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5164569  T
Q  211 g-ctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5164568 ggctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggatt 5164470  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |||    
T  5164469 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagctt 5164370  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164369 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5164270  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5164269 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 5164234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 31558148 - 31558680
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558148 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31558247  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31558248 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 31558346  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558347 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 31558445  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  31558446 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 31558545  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558546 tcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 31558645  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31558646 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 31558680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 4138999 - 4139534
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138999 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4139098  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 4139197  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139198 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4139297  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  4139298 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 4139397  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139398 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 4139497  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4139498 aaccgccctttcgggttttcgattcatcgagacgctc 4139534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 16745274 - 16745808
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16745274 cacagactatcctgaaggagaacttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgct 16745373  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745374 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 16745472  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16745473 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 16745571  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16745572 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagct 16745671  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745672 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 16745771  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16745772 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 16745808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 5154466 - 5153934
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5154466 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5154367  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154366 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5154268  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5154267 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 5154169  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  5154168 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 5154069  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154068 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 5153969  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5153968 ccgcccttccgggttttcggctcatcaagacgctc 5153934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 26519174 - 26518643
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26519174 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26519075  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26519074 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26518976  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518975 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 26518878  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  26518877 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 26518778  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518777 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 26518678  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  26518677 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 26518643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 16443757 - 16444290
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16443757 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16443856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  16443857 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 16443955  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16443956 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggat 16444054  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  16444055 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcacataagct 16444154  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16444155 tcagacgaagatggtcgttaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttcgcatga 16444254  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16444255 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 16444290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16047695 - 16047167
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16047695 cacagactatcccggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgct 16047596  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  16047595 caggcttgcttt-caaaatagacaaaaac-ttttcaattttcaggatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacata 16047499  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16047498 gctttgacagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 16047400  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16047399 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttc 16047300  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047299 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttgcccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcatgaac 16047201  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047200 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 16047167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 26663666 - 26664200
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663666 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26663765  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26663766 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatata 26663864  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26663865 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26663964  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  26663965 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 26664064  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664065 tagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26664164  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26664165 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 26664200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 26678858 - 26679392
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26678858 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26678957  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26678958 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatata 26679056  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26679057 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26679156  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  26679157 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 26679256  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679257 taggtgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26679356  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26679357 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 26679392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 544
Target Start/End: Original strand, 26509471 - 26509984
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509471 cctgcttgtgacatgtattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 26509570  T
Q  133 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509571 caaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 26509670  T
Q  233 agagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaat 332  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26509671 ggagttttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaat 26509770  T
Q  333 ttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaaca 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26509771 ttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaaca 26509870  T
Q  432 gctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggc 530  Q
    |||||||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26509871 gctgcagatgccccaagggggacggcggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcgtttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggt 26509970  T
Q  531 tcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||    
T  26509971 tcatcgagacgctc 26509984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 11447271 - 11446738
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11447271 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgct 11447172  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447171 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 11447073  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11447072 tagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggat 11446975  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  11446974 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 11446875  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446874 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 11446775  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  11446774 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 11446738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 4205772 - 4205239
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205772 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4205673  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4205672 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 4205574  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205573 agctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4205476  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaa-ctttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  4205475 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagct 4205376  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205375 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacgatggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 4205276  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4205275 aaccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctc 4205239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2160955 - 2160421
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160955 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 2160856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  2160855 cagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 2160756  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160755 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 2160657  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||    
T  2160656 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 2160557  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2160556 tttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggaatggtggttggctagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatga 2160457  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  2160456 accgcccttccgggttttcggtccatcgagacgctc 2160421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 45393602 - 45393068
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393602 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatactgaaatggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45393503  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  45393502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtat 45393404  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45393403 agctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 45393305  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-t 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||| || | |    
T  45393304 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacataagctt 45393205  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45393204 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccctttgtttcaatctcatttttgcatg 45393105  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45393104 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 45393068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 26313603 - 26314135
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313603 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26313702  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26313703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26313801  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313802 gctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 26313899  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26313900 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaactt 26313999  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314000 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26314099  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26314100 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 26314135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 39206893 - 39207426
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206893 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39206992  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39206993 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatat 39207091  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39207092 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 39207190  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  39207191 cacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 39207290  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207291 tagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 39207390  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39207391 accgcccttccgggttttcggctcattgagacgctc 39207426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 26268839 - 26269376
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268839 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26268938  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26268939 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgt 26269037  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269038 acatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 26269136  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26269137 gatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 26269236  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 504  Q
     ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269237 gcttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 26269336  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26269337 atgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 26269376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 45737686 - 45737153
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737686 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagatatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45737587  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45737586 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 45737488  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737487 tatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 45737390  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||        
T  45737389 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcg 45737292  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737291 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 45737192  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45737191 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 45737153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 31084376 - 31084910
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31084376 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 31084475  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaa-atttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31084574  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31084575 agctttgaaagtagaagaaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggatt 31084673  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31084674 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagct 31084773  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084774 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 31084873  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  31084874 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 31084910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 11418533 - 11419066
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418533 cacagactatcctggaggaggacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11418632  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11418633 caggtttgcttttcaaaacagacagaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 11418731  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418732 agctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 11418830  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| || | |||    
T  11418831 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagctt 11418930  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11418931 ttgatgaagatagtcatgaacagctgcagatgccctaagggagacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcttttttgcatga 11419030  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  11419031 accgcccttccgggctttcgattcatcgagacgctc 11419066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2779626 - 2779102
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779626 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 2779527  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779526 gtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 2779433  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 313  Q
    ||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2779432 ttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 2779334  T
Q  314 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| |||    
T  2779333 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttga 2779234  T
Q  414 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 512  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779233 tgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 2779134  T
Q  513 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779133 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 2779102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 31130282 - 31129755
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31130282 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgct 31130183  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130182 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31130089  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 310  Q
    |||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31130088 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31129990  T
Q  311 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  31129989 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 31129890  T
Q  411 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 509  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129889 tgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 31129790  T
Q  510 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31129789 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 31129755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 3451702 - 3451168
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3451702 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattggaatagacattcacataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgct 3451603  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451602 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 3451504  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3451503 atagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcaccagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 3451406  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3451405 ttcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 3451306  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3451305 ttcagatgaggacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttcaacctcctttttgcat 3451206  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  3451205 gaaccacccttccgggttttcgattcatcgagacgctc 3451168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10847968 - 10847452
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  10847968 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 10847871  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt--caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 205  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  10847870 caggtttacttt-caaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 10847772  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 305  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847771 acatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-cagacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 10847673  T
Q  306 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10847672 gatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaa 10847573  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgc 504  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  10847572 gcttctgatgaagatgatcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcatttttgc 10847473  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttt 525  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10847472 atgaaccgccctttcgggttt 10847452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 16512194 - 16512721
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16512194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgct 16512293  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         |  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  16512294 caggtttgcttttcaaaa---------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 16512384  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16512385 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggcttaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 16512483  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |    
T  16512484 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagc 16512583  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16512584 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctctcgtttcaatctcatttttgcat 16512683  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16512684 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 16512721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 10910680 - 10911207
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10910680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgct 10910778  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  10910779 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 10910870  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10910871 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 10910969  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||  || | |    
T  10910970 tttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgtattcgcaagcgtaggagc 10911069  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10911070 ttttgatgaagatagtcgttaacagcggcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 10911169  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  10911170 gaaccgcccttccgggttttcggtccatcgagacgctc 10911207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26596053 - 26595750
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596053 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26595954  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26595953 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatat 26595855  T
Q  210 agctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26595854 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 26595755  T
Q  309 tcaca 313  Q
    |||||    
T  26595754 tcaca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 314 - 544
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532157
Alignment:
Q  314 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  ||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 26532025  T
Q  414 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 512  Q
    ||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532026 tgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 26532125  T
Q  513 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26532126 ccctttcggattttcggctcatcgagacgctc 26532157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 412 - 544
Target Start/End: Original strand, 16732684 - 16732817
Alignment:
Q  412 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732684 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 16732783  T
Q  511 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16732784 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 16732817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 453 - 543
Target Start/End: Original strand, 2104357 - 2104447
Alignment:
Q  453 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgct 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2104357 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgct 2104447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 565046 - 565091
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  565046 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 565091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2043 - 1510
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2043 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgct 1944  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1943 caggtttgcttttcaaagtaaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 1845  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1844 agctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 1747  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1746 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaact 1647  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1646 tctgatgaagatggtcattaacaactgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 1547  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1546 aaccgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctc 1510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 12443 - 11900
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12443 cacagactatcctggagaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12344  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat--- 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |       
T  12343 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgttttttttttt 12245  T
Q  208 --------atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 298  Q
            ||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12244 ttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 12146  T
Q  299 ctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaag 398  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12145 ctccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaag 12046  T
Q  399 cacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcat 498  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12045 tacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgtcttttgtttcaatctcat 11946  T
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11945 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggcccatcgagacgctc 11900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 8797 - 9329
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8896  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8897 caagtttgcttttcaaaatagac-aaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 8995  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8996 agctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 9093  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||| |||||| |  | |||    
T  9094 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagctt 9193  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagg-ggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9194 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 9293  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9294 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 9329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Original strand, 4471 - 5009
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4471 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4570  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4571 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4670  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4671 agctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4769  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |    
T  4770 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagc 4869  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgcc-ttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4870 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagacatagttacttgcctttttgtttcaatctcatttttgca 4969  T
Q  506 tgaaccgccctt-tcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4970 tgaaccgcccttcccgggttttcggttcatcgagacgctc 5009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 10299 - 9767
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10299 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10200  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10199 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 10101  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10100 agctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggatt 10003  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||    
T  10002 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt 9903  T
Q  410 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 508  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9902 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatga 9803  T
Q  509 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9802 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 9767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 33680 - 33150
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 33582  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||  |||     |||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  33581 caggtttgcttttacaaa-----aaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 33487  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 308  Q
    || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33486 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 33388  T
Q  309 tcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 407  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |    
T  33387 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggggc 33288  T
Q  408 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 506  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33287 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 33188  T
Q  507 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33187 ggaccgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctc 33150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 18973 - 18438
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18973 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18874  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18873 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 18775  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18774 atagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacgga 18677  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || |     
T  18676 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggag 18577  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18576 cttttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 18477  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18476 tgaaccgcccttcagggttttcggctcatcgagacgctc 18438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15962 - 15422
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15863  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa------tgtttgtttcaagcactgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgttt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||| |||| ||||||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  15862 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgttt 15764  T
Q  203 tgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15763 tgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcc 15665  T
Q  303 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcaca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  15664 acggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtaca 15565  T
Q  403 gaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttt 501  Q
    ||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15564 gaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttt 15465  T
Q  502 tgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15464 tgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 15422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 14336 - 13802
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14336 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 14237  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14236 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 14138  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14137 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 14039  T
Q  310 cacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14038 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 13939  T
Q  409 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 507  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13938 tttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 13839  T
Q  508 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13838 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 13802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 25509 - 24969
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25509 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 25410  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt------caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt- 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||      |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  25409 caggtttgcttt-caaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttt 25311  T
Q  204 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 301  Q
      ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25310 tcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcgcaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactc 25212  T
Q  302 cacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcac 401  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  25211 cacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcac 25112  T
Q  402 agaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcattt 500  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||    
T  25111 agaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcattt 25012  T
Q  501 ttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25011 tagc-tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 24969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 6449 - 5919
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6449 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6350  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--a 206  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |    
T  6349 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaa 6258  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 306  Q
     ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257 cataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaatatgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 6159  T
Q  307 attcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 405  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || |    
T  6158 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtagga 6059  T
Q  406 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 504  Q
     ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6058 gcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 5959  T
Q  505 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  5958 atgaaccgcccttccgggttttcggttcattgagacgctc 5919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 540
Target Start/End: Original strand, 24774 - 25299
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24774 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24872  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||| ||||||||||       |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24873 caggttttcttttcaaaa-------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24965  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 307  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24966 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 25064  T
Q  308 ttcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 406  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || |     
T  25065 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagcaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggag 25164  T
Q  407 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 505  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25165 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttctatctcatttttgca 25264  T
Q  506 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagac 540  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25265 tgaaccgcccttccgagttttcggctcatcgagac 25299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 238 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 230
Alignment:
Q  238 tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 337  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  537 tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 438  T
Q  338 tggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgca 437  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  437 tggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgca 338  T
Q  438 gatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcg 536  Q
    |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  337 gatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggttcatcg 238  T
Q  537 agacgctc 544  Q
    ||||||||    
T  237 agacgctc 230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 254 - 469
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26458
Alignment:
Q  254 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 353  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  354 gaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 453  Q
    || ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 26442  T
Q  454 tgtgatttgccagata 469  Q
     ||| ||||| |||||    
T  26443 ggtggtttgctagata 26458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 1
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtagcacatattgaaatagacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 74  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaa 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 260 - 522
Target Start/End: Original strand, 40759 - 41036
Alignment:
Q  260 aaattgatgtataagagtggtggtc-agccgaaggcgtgactcc-acggattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-att 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40759 aaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaatt 40858  T
Q  354 g-aacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaa-ttcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatg-ccccaagg 449  Q
    | ||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||| ||| | |||| || | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40859 gaaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatttcgcgagcataggagctttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccccaagg 40958  T
Q  450 gg---attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctc-atttttg-catgaaccgccctttcggg 522  Q
    ||      ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40959 ggggacgggtggttggccagatatagttacttgcctctcgtttcaatctctatttttgtcatgaaccgcccttccggg 41036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 40497 - 40606
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacac-atattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  40497 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacattatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttg 40596  T
Q  109 ctcaggtttg 118  Q
    ||||||||||    
T  40597 ctcaggtttg 40606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 462 - 544
Target Start/End: Original strand, 20512 - 20594
Alignment:
Q  462 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    |||| |||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20512 gccaaatatagttacttgcctgtggtgtcaatctcaatttggcatgacccccccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 20594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 495 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 11934 - 11883
Alignment:
Q  495 tcatttttg-catgaaccgccctttcgggttttcgg-ctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11934 tcatttttgtcatgaaccgccctttcgggttttcggtctcatcgagacgctc 11883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1691 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1691
Description:

Target: scaffold1691; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 452 - 407
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  452 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Original strand, 4141 - 4186
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  4141 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 4186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 259
Alignment:
Q  499 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  288 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcg 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 497 - 546
Target Start/End: Original strand, 69968 - 70017
Alignment:
Q  497 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcct 546  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  69968 atttttgcatggaccgccctttcaggttttcagtccatcgagacgctcct 70017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 470 times since January 2019
Visitors: 3060