View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0400_high_1 (Length: 636)

Name: NF0400_high_1
Description: NF0400
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0400_high_1
NF0400_high_1
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (11-575)||(27284177-27284743)
chr6 (11-575)||(27623522-27624090)
chr6 (11-575)||(16755636-16756204)
chr6 (11-575)||(22928696-22929264)
chr6 (11-575)||(29555374-29555941)
chr6 (11-575)||(27490949-27491516)
chr6 (11-575)||(26110226-26110792)
chr6 (11-575)||(13518009-13518575)
chr6 (11-575)||(27355926-27356493)
chr6 (11-575)||(27200002-27200569)
chr6 (11-575)||(8899514-8900081)
chr6 (11-575)||(26772444-26773010)
chr6 (11-575)||(4763580-4764146)
chr6 (11-575)||(27248664-27249232)
chr6 (11-575)||(27063297-27063864)
chr6 (11-575)||(4539573-4540141)
chr6 (11-575)||(29507232-29507801)
chr6 (11-575)||(28166310-28166878)
chr6 (11-575)||(16679955-16680523)
chr6 (11-575)||(28213270-28213838)
chr6 (11-575)||(33370246-33370813)
chr6 (11-575)||(34458323-34458888)
chr6 (11-575)||(13292766-13293327)
chr6 (11-575)||(4778696-4779264)
chr6 (14-575)||(27013549-27014106)
chr6 (14-575)||(14139218-14139776)
chr6 (11-575)||(26791632-26792199)
chr6 (11-575)||(29578831-29579397)
chr6 (11-575)||(4531104-4531671)
chr6 (11-575)||(16937840-16938407)
chr6 (11-575)||(30551815-30552398)
chr6 (11-575)||(26926586-26927135)
chr6 (11-575)||(27030837-27031403)
chr6 (11-574)||(27024962-27025524)
chr6 (11-575)||(24869526-24870087)
chr6 (11-575)||(24299575-24300137)
chr6 (11-575)||(15406348-15406911)
chr6 (11-575)||(15418135-15418698)
chr6 (11-448)||(27208848-27209283)
chr6 (11-448)||(27239945-27240380)
chr6 (23-575)||(20174365-20174930)
chr6 (23-575)||(22161061-22161626)
chr6 (316-575)||(23851450-23851709)
chr6 (11-311)||(26666473-26666774)
chr6 (408-575)||(4718349-4718517)
chr6 (459-575)||(27184744-27184860)
chr6 (459-575)||(27264380-27264496)
chr6 (494-551)||(27070573-27070630)
chr6 (493-525)||(27283969-27284001)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (11-575)||(3047-3616)
scaffold0159 (11-249)||(17952-18194)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (15-575)||(11555180-11555742)
chr5 (11-575)||(3795364-3795932)
chr5 (11-575)||(22894243-22894808)
chr5 (11-575)||(18369300-18369867)
chr5 (11-575)||(28655068-28655636)
chr5 (11-575)||(33880953-33881519)
chr5 (14-575)||(9544478-9545043)
chr5 (11-575)||(13318596-13319162)
chr5 (11-575)||(30174291-30174859)
chr5 (11-575)||(15752626-15753186)
chr5 (11-575)||(32590044-32590610)
chr5 (11-575)||(6880129-6880697)
chr5 (11-575)||(23631795-23632364)
chr5 (11-575)||(40467321-40467888)
chr5 (11-575)||(13436442-13437016)
chr5 (11-575)||(37746090-37746662)
chr5 (11-575)||(9323303-9323869)
chr5 (11-575)||(18494536-18495102)
chr5 (11-575)||(24729796-24730363)
chr5 (11-575)||(37352412-37352979)
chr5 (11-575)||(30157859-30158427)
chr5 (11-575)||(34622344-34622912)
chr5 (11-575)||(37665254-37665821)
chr5 (11-575)||(2516891-2517459)
chr5 (11-575)||(12138002-12138568)
chr5 (11-575)||(31820178-31820743)
chr5 (11-575)||(13180561-13181124)
chr5 (14-575)||(31437290-31437847)
chr5 (11-575)||(37760808-37761376)
chr5 (11-575)||(33298359-33298930)
chr5 (34-575)||(30035253-30035795)
chr5 (11-575)||(33522205-33522776)
chr5 (11-575)||(26486222-26486778)
chr5 (11-575)||(28953548-28954115)
chr5 (11-575)||(8659240-8659807)
chr5 (11-575)||(5643628-5644191)
chr5 (11-575)||(11329463-11330032)
chr5 (11-575)||(43084084-43084651)
chr5 (11-575)||(41680530-41681098)
chr5 (11-575)||(18122184-18122751)
chr5 (11-575)||(15652528-15653093)
chr5 (18-575)||(25206105-25206670)
chr5 (18-575)||(25270261-25270826)
chr5 (11-575)||(22992892-22993451)
chr5 (11-575)||(23897701-23898261)
chr5 (11-575)||(33783311-33783875)
chr5 (11-575)||(24608072-24608634)
chr5 (11-575)||(24975675-24976236)
chr5 (11-575)||(30940462-30941023)
chr5 (495-551)||(34471338-34471394)
chr5 (496-551)||(24960667-24960722)
chr5 (496-551)||(28848456-28848511)
chr5 (494-544)||(24064552-24064602)
chr5 (494-551)||(5437611-5437668)
chr5 (494-551)||(11941808-11941865)
chr5 (496-541)||(12176455-12176500)
chr5 (496-541)||(21863308-21863353)
chr5 (496-541)||(26085218-26085263)
chr5 (494-551)||(31523025-31523082)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (11-575)||(20334283-20334851)
chr1 (11-575)||(3646967-3647534)
chr1 (33-575)||(51644041-51644588)
chr1 (11-575)||(28590904-28591470)
chr1 (11-575)||(41787177-41787746)
chr1 (11-575)||(10968486-10969054)
chr1 (11-575)||(10950912-10951480)
chr1 (11-575)||(16201895-16202468)
chr1 (11-575)||(20466600-20467173)
chr1 (11-575)||(28155555-28156116)
chr1 (11-575)||(21891630-21892183)
chr1 (494-551)||(6200107-6200164)
chr1 (496-551)||(31544599-31544654)
chr1 (493-525)||(10969230-10969262)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (11-575)||(9510-10075)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (11-575)||(12661356-12661922)
chr2 (11-575)||(37383494-37384061)
chr2 (11-575)||(39895885-39896452)
chr2 (11-575)||(34867500-34868066)
chr2 (11-575)||(27809518-27810087)
chr2 (11-575)||(34160661-34161230)
chr2 (11-575)||(21697031-21697599)
chr2 (11-575)||(37945723-37946291)
chr2 (11-575)||(27122342-27122907)
chr2 (11-575)||(12592627-12593198)
chr2 (11-575)||(12710459-12711026)
chr2 (11-575)||(21671028-21671598)
chr2 (11-575)||(32055620-32056185)
chr2 (11-575)||(22922001-22922570)
chr2 (11-575)||(3788311-3788877)
chr2 (11-575)||(19410342-19410912)
chr2 (11-575)||(37679749-37680318)
chr2 (11-575)||(37695014-37695583)
chr2 (11-575)||(9343845-9344412)
chr2 (11-575)||(39045680-39046247)
chr2 (11-575)||(31882104-31882670)
chr2 (11-575)||(254510-255077)
chr2 (11-575)||(11629043-11629609)
chr2 (11-575)||(16823195-16823765)
chr2 (11-575)||(16897715-16898285)
chr2 (11-575)||(13930402-13930971)
chr2 (11-575)||(16167295-16167862)
chr2 (11-575)||(40239326-40239892)
chr2 (11-575)||(37931189-37931763)
chr2 (11-575)||(34296974-34297533)
chr2 (11-575)||(27782049-27782616)
chr2 (11-575)||(27396140-27396717)
chr2 (11-575)||(19450276-19450852)
chr2 (11-575)||(34268784-34269345)
chr2 (11-575)||(28888096-28888658)
chr2 (11-575)||(23122436-23122998)
chr2 (15-575)||(27428315-27428871)
chr2 (11-575)||(20843730-20844296)
chr2 (11-345)||(31868644-31868979)
chr2 (340-575)||(31887682-31887918)
chr2 (408-575)||(27821806-27821974)
chr2 (11-148)||(23117044-23117180)
chr2 (496-551)||(15948523-15948578)
chr2 (496-551)||(21117682-21117737)
chr2 (496-551)||(35143261-35143316)
chr2 (496-551)||(42569999-42570054)
chr2 (494-544)||(21758096-21758146)
chr2 (494-551)||(21753135-21753192)
chr2 (496-541)||(24289786-24289831)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (11-575)||(16618400-16618970)
chr3 (11-575)||(32296411-32296979)
chr3 (11-575)||(4790544-4791112)
chr3 (11-575)||(22864759-22865324)
chr3 (11-575)||(22879818-22880383)
chr3 (11-575)||(28027073-28027638)
chr3 (11-575)||(22381492-22382057)
chr3 (11-575)||(5727760-5728328)
chr3 (11-575)||(5716850-5717418)
chr3 (11-575)||(5764040-5764608)
chr3 (11-575)||(16421966-16422532)
chr3 (11-575)||(17970777-17971342)
chr3 (11-575)||(29658879-29659446)
chr3 (11-575)||(48471709-48472280)
chr3 (11-575)||(10401931-10402497)
chr3 (11-575)||(24333955-24334524)
chr3 (11-575)||(31958366-31958935)
chr3 (11-575)||(47029235-47029803)
chr3 (11-575)||(5603224-5603793)
chr3 (11-575)||(4422701-4423267)
chr3 (11-575)||(4340587-4341155)
chr3 (11-575)||(8217414-8217983)
chr3 (11-575)||(5472770-5473336)
chr3 (14-575)||(5590275-5590839)
chr3 (11-575)||(6536654-6537221)
chr3 (11-575)||(18248520-18249087)
chr3 (11-575)||(20071817-20072384)
chr3 (11-575)||(28109862-28110434)
chr3 (11-575)||(4629567-4630133)
chr3 (11-575)||(10648853-10649420)
chr3 (11-575)||(29142665-29143235)
chr3 (11-575)||(18286266-18286832)
chr3 (11-575)||(18301567-18302133)
chr3 (11-575)||(7079006-7079576)
chr3 (11-575)||(17978861-17979431)
chr3 (11-575)||(5019495-5020061)
chr3 (11-575)||(28344953-28345519)
chr3 (11-575)||(18057042-18057612)
chr3 (11-575)||(21680483-21681049)
chr3 (11-575)||(11104272-11104840)
chr3 (11-575)||(51787804-51788371)
chr3 (11-575)||(31030156-31030716)
chr3 (11-575)||(18230975-18231542)
chr3 (11-575)||(20570757-20571324)
chr3 (14-575)||(18336410-18336968)
chr3 (11-575)||(19700269-19700847)
chr3 (11-575)||(32444936-32445494)
chr3 (11-575)||(6207682-6208245)
chr3 (11-575)||(4727415-4727976)
chr3 (11-575)||(15735011-15735573)
chr3 (11-575)||(8283369-8283947)
chr3 (11-575)||(4689432-4689994)
chr3 (11-575)||(35886546-35887109)
chr3 (11-575)||(5657917-5658480)
chr3 (287-575)||(15886894-15887185)
chr3 (311-575)||(8002342-8002607)
chr3 (11-258)||(15886652-15886895)
chr3 (494-551)||(20445787-20445844)
chr3 (496-551)||(15624563-15624618)
chr3 (496-551)||(41002927-41002982)
chr3 (496-551)||(41011708-41011763)
chr3 (494-544)||(15707153-15707203)
chr3 (494-551)||(71829-71886)
chr3 (494-551)||(3408705-3408762)
chr3 (494-551)||(3681413-3681470)
chr3 (494-551)||(8609891-8609948)
chr3 (496-541)||(10718148-10718193)
chr3 (494-551)||(30017969-30018026)
chr3 (494-551)||(37258241-37258298)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-575)||(8797-9363)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (11-572)||(5164203-5164767)
chr7 (11-575)||(24586289-24586856)
chr7 (11-575)||(5153900-5154466)
chr7 (11-575)||(5141088-5141656)
chr7 (11-575)||(26518609-26519174)
chr7 (11-575)||(11446704-11447271)
chr7 (11-575)||(26441069-26441637)
chr7 (11-575)||(16047133-16047695)
chr7 (11-575)||(31558148-31558714)
chr7 (11-575)||(16745274-16745842)
chr7 (11-575)||(31084376-31084944)
chr7 (11-575)||(45393034-45393602)
chr7 (11-575)||(4138999-4139568)
chr7 (11-575)||(16443757-16444324)
chr7 (11-575)||(4205205-4205772)
chr7 (11-575)||(26268839-26269410)
chr7 (11-575)||(26313603-26314169)
chr7 (11-575)||(2160387-2160955)
chr7 (11-575)||(45737119-45737686)
chr7 (33-575)||(26509471-26510018)
chr7 (11-575)||(26663666-26664234)
chr7 (11-575)||(26678858-26679426)
chr7 (14-575)||(2779068-2779626)
chr7 (11-575)||(31129721-31130282)
chr7 (11-575)||(11418533-11419100)
chr7 (11-575)||(39206893-39207460)
chr7 (11-575)||(3451134-3451702)
chr7 (11-522)||(10847452-10847968)
chr7 (11-575)||(16512194-16512755)
chr7 (11-575)||(10910680-10911241)
chr7 (11-310)||(26595750-26596053)
chr7 (311-575)||(26531926-26532191)
chr7 (409-575)||(16732684-16732851)
chr7 (450-575)||(2104357-2104482)
chr7 (494-551)||(795898-795955)
chr7 (494-551)||(16284754-16284811)
chr7 (494-544)||(16240130-16240180)
chr7 (494-544)||(29092230-29092280)
chr7 (496-541)||(565046-565091)
chr7 (494-551)||(9472023-9472080)
chr7 (494-551)||(16390806-16390863)
chr7 (493-525)||(26509241-26509273)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (11-575)||(39856467-39857032)
chr4 (11-575)||(54839222-54839787)
chr4 (11-575)||(14104374-14104939)
chr4 (11-575)||(5700369-5700937)
chr4 (11-575)||(1906083-1906654)
chr4 (11-575)||(20332290-20332858)
chr4 (11-575)||(30759594-30760159)
chr4 (11-575)||(40099504-40100072)
chr4 (11-575)||(33667671-33668236)
chr4 (11-575)||(24586229-24586797)
chr4 (11-575)||(14753362-14753928)
chr4 (11-575)||(27157180-27157752)
chr4 (11-575)||(5011707-5012275)
chr4 (14-575)||(21975531-21976098)
chr4 (11-575)||(34182832-34183397)
chr4 (11-575)||(15233647-15234217)
chr4 (11-575)||(6575692-6576251)
chr4 (11-575)||(18794485-18795052)
chr4 (11-575)||(36338394-36338953)
chr4 (11-575)||(15380106-15380673)
chr4 (11-575)||(31120378-31120949)
chr4 (11-575)||(15276497-15277067)
chr4 (15-575)||(24118492-24119055)
chr4 (11-575)||(14670846-14671410)
chr4 (11-575)||(17018882-17019445)
chr4 (11-389)||(1673877-1674258)
chr4 (11-316)||(36324185-36324484)
chr4 (377-575)||(18311414-18311614)
chr4 (494-551)||(3361412-3361469)
chr4 (494-551)||(3362109-3362166)
chr4 (494-551)||(3362806-3362863)
chr4 (496-551)||(8098581-8098636)
chr4 (494-548)||(14723288-14723342)
chr4 (494-544)||(55786861-55786911)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (11-575)||(11857-12421)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (11-575)||(1476-2043)
scaffold0322 (11-575)||(11866-12443)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (11-575)||(33248185-33248751)
chr8 (11-575)||(18796525-18797093)
chr8 (11-575)||(28355780-28356350)
chr8 (11-575)||(29835142-29835708)
chr8 (11-575)||(9360441-9361007)
chr8 (11-575)||(19680267-19680833)
chr8 (11-575)||(44566800-44567369)
chr8 (11-575)||(12086553-12087121)
chr8 (11-575)||(15773393-15773960)
chr8 (11-575)||(31360347-31360914)
chr8 (11-573)||(31483700-31484267)
chr8 (11-575)||(21342000-21342568)
chr8 (48-575)||(33264550-33265079)
chr8 (11-575)||(18715301-18715868)
chr8 (11-575)||(19910992-19911561)
chr8 (11-575)||(19202205-19202761)
chr8 (11-575)||(27602744-27603303)
chr8 (14-575)||(19655180-19655741)
chr8 (11-575)||(22074759-22075326)
chr8 (11-575)||(22138726-22139286)
chr8 (140-575)||(16260042-16260480)
chr8 (11-575)||(19693914-19694477)
chr8 (11-575)||(2131098-2131659)
chr8 (11-575)||(14568976-14569540)
chr8 (494-544)||(19846883-19846933)
chr8 (496-541)||(17678418-17678463)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (11-575)||(9733-10299)
scaffold0143 (11-575)||(33116-33680)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (11-575)||(4471-5043)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-575)||(18404-18973)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-575)||(13768-14336)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-575)||(15388-15962)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (11-575)||(24935-25509)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (11-575)||(5885-6449)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (11-575)||(24774-25337)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (233-575)||(196-539)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (253-466)||(26245-26458)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (11-184)||(1-173)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (257-572)||(40759-41096)
scaffold0099 (11-118)||(40497-40606)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (459-575)||(20512-20628)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (492-575)||(11849-11934)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (527-575)||(303-351)
[»] scaffold1691 (1 HSPs)
scaffold1691 (496-551)||(397-452)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (496-551)||(4141-4196)
[»] scaffold0799 (1 HSPs)
scaffold0799 (494-544)||(276-326)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (494-551)||(3601-3658)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (494-551)||(19326-19383)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (496-525)||(259-288)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (494-551)||(31882-31939)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (494-551)||(15932-15989)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (494-551)||(1632-1689)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 27284177 - 27284743
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284177 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27284276  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284277 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27284375  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaat---agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27284376 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 27284475  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27284476 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagcttc 27284575  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284576 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 27284675  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284676 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatttttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 27284743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 27623522 - 27624090
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623522 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27623621  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaa-tgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27623622 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatat 27623720  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27623721 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27623820  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27623821 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 27623920  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623921 tctgatggagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 27624020  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27624021 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 27624090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16756204 - 16755636
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756204 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16756105  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaat--gtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756104 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattgtcaaaatatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 16756006  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16756005 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 16755906  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | |||    
T  16755905 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 16755806  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755805 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 16755706  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755705 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 16755636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 22928696 - 22929264
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22928696 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgct 22928795  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  22928796 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 22928895  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928896 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 22928995  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  22928996 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagctt 22929095  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929096 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 22929195  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22929196 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatacaatctcagcgagc 22929264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29555941 - 29555374
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29555941 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgtt 29555842  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555841 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagctttt-aattttctaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 29555743  T
Q  210 agctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  29555742 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggattt 29555643  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29555642 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttc 29555543  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29555542 tgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatgaa 29555443  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555442 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 29555374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27491516 - 27490949
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491516 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27491417  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27491416 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 27491318  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27491317 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 27491218  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| | || | |||     
T  27491217 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtataggagcttt 27491118  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27491117 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttctgtttcaatctcatttttgcatgaa 27491018  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491017 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 27490949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 26110226 - 26110792
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110226 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatatggaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26110325  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110326 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 26110424  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26110425 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 26110524  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||  ||||| ||| |    
T  26110525 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctttt 26110624  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110625 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 26110724  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26110725 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 26110792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 13518009 - 13518575
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518009 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13518108  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518109 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13518207  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  13518208 gctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 13518307  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||     
T  13518308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttt 13518407  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13518408 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaac 13518507  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13518508 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcatttttgcctgagttgcgaacaatctcagcgagc 13518575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 27355926 - 27356493
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355926 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27356025  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356026 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 27356124  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27356125 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 27356224  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  27356225 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 27356324  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356325 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 27356424  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27356425 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 27356493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27200569 - 27200002
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200569 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27200471  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27200470 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtaca 27200372  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27200371 tagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 27200272  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  27200271 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 27200172  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200171 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 27200072  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200071 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 27200002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 8899514 - 8900081
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899514 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8899613  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8899614 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 8899712  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  8899713 aactttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 8899812  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8899813 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 8899912  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899913 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 8900012  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8900013 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatacaatctcagcgagc 8900081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 26772444 - 26773010
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26772444 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26772543  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772544 caggtttgtttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 26772642  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26772643 agctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattca 26772742  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||  ||||| ||| |    
T  26772743 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctttt 26772842  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26772843 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaac 26772942  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26772943 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtatacaatctcagcgagc 26773010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4764146 - 4763580
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764146 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4764047  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4764046 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 4763948  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4763947 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 4763848  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | |||     
T  4763847 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 4763748  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4763747 cgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgtatgaac 4763648  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763647 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 4763580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 27248664 - 27249232
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248664 cacagacta-cctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatacacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27248762  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27248763 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtaca 27248861  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27248862 tagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaatcaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 27248961  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  27248962 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 27249061  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa--ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27249062 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 27249161  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27249162 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 27249232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27063864 - 27063297
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063864 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27063765  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27063764 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 27063666  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27063665 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 27063566  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||| |  | ||  |    
T  27063565 caaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaagcataagagctctt 27063466  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27063465 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacgatggttagccagatatagttacttgcctttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 27063366  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27063365 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 27063297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 4539573 - 4540141
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4539573 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 4539672  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539673 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 4539771  T
Q  211 gctttgaaagtagaa-gaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4539772 gctttgaaagtaaaaagaaaaatagagtttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 4539871  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4539872 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 4539971  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539972 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 4540071  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4540072 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 4540141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29507801 - 29507232
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507801 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgct 29507702  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507701 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatat 29507603  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaat----agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||| || || ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29507602 agctttgaaagtaaaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 29507503  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | ||    
T  29507502 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 29507403  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507402 tttgatgaagatagtcattaacagctgcatatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttatttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 29507303  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507302 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 29507232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28166878 - 28166310
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166878 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28166779  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  28166778 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtata 28166680  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28166679 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 28166580  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||  || | |||    
T  28166579 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaagcgtaggagctt 28166480  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166479 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 28166380  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28166379 accgcccttccgggtttttgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatcccagcgagc 28166310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16680523 - 16679955
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16680523 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgct 16680424  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16680423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 16680325  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaat---agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    | ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16680324 aactttgaaagtagaagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggatt 16680225  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||    
T  16680224 ttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctt 16680125  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccaga-tatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680124 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagattatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 16680025  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16680024 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgcacaatctcagcgagc 16679955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28213838 - 28213270
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28213838 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 28213739  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28213738 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 28213640  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28213639 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 28213540  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28213539 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 28213440  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213439 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 28213340  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213339 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 28213270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 33370246 - 33370813
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370246 cacagactatcctggaggagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33370345  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33370346 caggttcgcttttcaaaatagacaaaaaa-atttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatat 33370444  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  33370445 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 33370544  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  33370545 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 33370644  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33370645 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcctgaa 33370744  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33370745 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtataatctcagcgagc 33370813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 34458323 - 34458888
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458323 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34458422  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458423 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34458520  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34458521 gcttagaaaatagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 34458620  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  34458621 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttt 34458720  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  | | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  34458721 gatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggcggttggccagatatagttacttgcctttcatttcaatctcgtttttgcatgaac 34458820  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34458821 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 34458888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 13292766 - 13293327
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292766 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13292865  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292866 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13292959  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13292960 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 13293059  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | ||| |    
T  13293060 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagctttt 13293159  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13293160 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaggcggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcctttttgcatgaac 13293259  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293260 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 13293327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4779264 - 4778696
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4779264 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4779166  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4779165 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatac 4779067  T
Q  210 agcttt-gaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4779066 agcttttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggatt 4778967  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | ||    
T  4778966 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 4778867  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778866 ttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 4778767  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778766 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 4778696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27014106 - 27013549
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27014106 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattaaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 27014007  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27014006 gtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 27013914  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaa 311  Q
    ||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27013913 ttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 27013814  T
Q  312 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  27013813 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 27013714  T
Q  412 gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 510  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013713 gaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 27013614  T
Q  511 cctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013613 ccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 27013549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Original strand, 14139218 - 14139776
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14139218 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcag 14139317  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139318 gtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 14139411  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaa 311  Q
    ||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14139412 ttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 14139511  T
Q  312 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  14139512 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 14139611  T
Q  412 gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 510  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139612 gaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 14139711  T
Q  511 cctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14139712 ccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 14139776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26792199 - 26791632
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26792199 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26792100  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26792099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 26792001  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||     
T  26792000 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggattt 26791901  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||     
T  26791900 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 26791801  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791800 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 26791701  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26791700 ccgcccttccgggttttcgatccatcgagacgctcattcttgcctgagttgcctgcaatctcagcgagc 26791632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29579397 - 29578831
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579397 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 29579298  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  29579297 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatat 29579199  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29579198 agctttgaaaatagaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 29579099  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||   || | |||      
T  29579098 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatttgcaagtgtaggagcttta 29578999  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29578998 gatgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 29578899  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29578898 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 29578831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4531671 - 4531104
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaa-atagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgc 109  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4531671 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaagatagacacccacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgc 4531573  T
Q  110 tcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4531572 tcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtata 4531474  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  4531473 cagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggatt 4531374  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  4531373 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagctt 4531274  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531273 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 4531174  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4531173 accgaccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 4531104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 16937840 - 16938407
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937840 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16937939  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16937940 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatat 16938038  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16938039 agctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattca 16938138  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||||||| |||| ||| || ||||    
T  16938139 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcgcaagtacaaaagcttc 16938238  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16938239 agatggagatggccattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttatttcaatctcatttttgcatgaa 16938338  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938339 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 16938407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 30551815 - 30552398
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30551815 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 30551914  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30551915 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 30552013  T
Q  210 agctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30552014 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 30552113  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-tt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||    
T  30552114 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagcttt 30552213  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatg--ccccaagggg--------------attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaat 490  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||              |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552214 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaat 30552313  T
Q  491 ctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30552314 ctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 30552398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26927135 - 26926586
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||               ||||||||||||||||||||||    
T  26927135 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactct---------------catttgaatgtaccctgttgct 26927051  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  26927050 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 26926952  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26926951 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 26926852  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||    ||| |    
T  26926851 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgctttt 26926754  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926753 gatgaagatggtcattaacagctgcggatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 26926654  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26926653 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 26926586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27031403 - 27030837
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27031403 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27031305  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||     |||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||     
T  27031304 caggtttgcttttcaaaa-----aaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtac 27031210  T
Q  208 atagctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27031209 ataactttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 27031110  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  || | ||    
T  27031109 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggagct 27031010  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatt--gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031009 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaacgggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 27030910  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcgg-ctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27030909 gaaccgcccttccgggttttcggtctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 27030837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 27025524 - 27024962
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27025524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactagctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgct 27025425  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||    
T  27025424 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgta 27025333  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 304  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27025332 cataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 27025233  T
Q  305 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||  || | |    
T  27025232 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagagactttgaattcgcaagcgtaggagc 27025133  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025132 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 27025033  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgag 574  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27025032 gaaccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgag 27024962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24870087 - 24869526
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24870087 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24869989  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24869988 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24869897  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24869896 ataactttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24869797  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  24869796 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagct 24869697  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24869696 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttccatg 24869597  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24869596 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 24869526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 24299575 - 24300137
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24299575 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttact 24299673  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| |    
T  24299674 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcatttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtaca 24299767  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    || |||||| |||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24299768 taactttgagagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 24299867  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |||    
T  24299868 tacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 24299967  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24299968 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 24300067  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24300068 accgcccttccgggttttcggtccatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 24300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 15406348 - 15406911
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15406348 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15406446  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  15406447 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 15406539  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15406540 atatctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15406639  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||| |||||  ||   |    
T  15406640 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtaggggc 15406739  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406740 ttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 15406839  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  15406840 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatgcaatcgcagcgagc 15406911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 15418135 - 15418698
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15418135 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 15418233  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       ||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  15418234 caggtttgcttttcaaaa-------aactttttccaattttccagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 15418326  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15418327 atatctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 15418426  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||| | |||||||||||| |||||  ||   |    
T  15418427 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtaggggc 15418526  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418527 ttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 15418626  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  15418627 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatgcaatcgcagcgagc 15418698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27209283 - 27208848
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27209283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27209185  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gt 205  Q
    || |||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  27209184 caagtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgt 27209093  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    | ||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27209092 acataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27208993  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || |     
T  27208992 atttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggag 27208893  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg 448  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27208892 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27208848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 448
Target Start/End: Original strand, 27239945 - 27240380
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27239945 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgct 27240043  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gt 205  Q
    || |||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  27240044 caagtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgt 27240135  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    | ||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27240136 acataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacacgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 27240235  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || |     
T  27240236 atttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggag 27240335  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg 448  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240336 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20174930 - 20174365
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  | |  | || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  20174930 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 20174831  T
Q  123 tcaaaatagacaaaaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 214  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  20174830 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 20174731  T
Q  215 tgaaagta----gaagaaaaatagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcaca 310  Q
    || |||||    ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  20174730 tggaagtaaagagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttaca 20174631  T
Q  311 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctgga-aactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||||||  |  | ||||||||||||||   || | ||||||    
T  20174630 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcctttagcattttgaattcacaagtgtagtagcttctg 20174531  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 509  Q
    |  |  ||    ||| |||| | ||||||||  |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20174530 acaagaacaactattgacagttacagatgcctaaaggggatggtgacttgctagaaatagttacttgccttttgtttcaatctcattttttcatgaaccg 20174431  T
Q  510 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20174430 ccctttcgggttttcggttcattgagacgctcatttttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 20174365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 575
Target Start/End: Original strand, 22161061 - 22161626
Alignment:
Q  23 tggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  | |  | || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22161061 tggggaaaagcttgcttgtaacacatattgagatatacattgatgcgcactcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttt 22161160  T
Q  123 tcaaaatagacaaaaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt-caagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctt 214  Q
    |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  22161161 tcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttttcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactt 22161260  T
Q  215 tgaaagta----gaagaaaaatagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcaca 310  Q
    || |||||    ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  22161261 tggaagtaaagagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttaca 22161360  T
Q  311 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctgga-aactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||||||  |  | ||||||||||||||   || | ||||||    
T  22161361 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatggtaaacactatatttcctttagcattttgaattcacaagtgtagtagcttctg 22161460  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 509  Q
    |  |  ||    ||| |||| | ||||||||  |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22161461 acaagaacaactattgacagttacagatgcctaaaggggatggtgacttgctagaaatagttacttgccttttgtttcaatctcattttttcatgaaccg 22161560  T
Q  510 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22161561 ccctttcgggttttcggttcattgagacgctcatttttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 22161626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 316 - 575
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851709
Alignment:
Q  316 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaag 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaag 23851549  T
Q  416 acggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttt 515  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23851550 atggtcattaacagctgcagatgccccaagggaatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttc 23851649  T
Q  516 cgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23851650 cgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatacaatctcagcgagc 23851709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 311
Target Start/End: Original strand, 26666473 - 26666774
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26666473 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 26666572  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666573 caggtttgtttttcaaaatagac-aaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 26666671  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26666672 agctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattca 26666771  T
Q  309 caa 311  Q
    |||    
T  26666772 caa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 4718349 - 4718517
Alignment:
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4718349 tgatgaagataggcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatcttatttttgcatgaa 4718448  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4718449 ccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 4718517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 459 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27184860 - 27184744
Alignment:
Q  459 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184860 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 27184761  T
Q  559 gtacaatctcagcgagc 575  Q
     | ||||||||||||||    
T  27184760 atgcaatctcagcgagc 27184744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 459 - 575
Target Start/End: Original strand, 27264380 - 27264496
Alignment:
Q  459 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27264380 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 27264479  T
Q  559 gtacaatctcagcgagc 575  Q
     | ||||||||||||||    
T  27264480 atgcaatctcagcgagc 27264496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 27070573 - 27070630
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  27070573 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 27070630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 525
Target Start/End: Original strand, 27283969 - 27284001
Alignment:
Q  493 catttttgcatgaaccgccctttcgggttttcg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27283969 catttttgcctgaaccgccctttcgggttttcg 27284001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 3047 - 3616
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3047 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 3146  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3147 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatata 3245  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3246 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 3345  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3346 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaact 3445  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3446 tctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 3545  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3546 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 3616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18194 - 17952
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 18095  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18094 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatata 17996  T
Q  211 gctttgaaagtagaaga--aaaatag---tttcaaacaaaagca 249  Q
    |||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||    
T  17995 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagca 17952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11555742 - 11555180
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555742 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 11555643  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 214  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555642 tttgcttttcaaaatagacaagaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctt 11555544  T
Q  215 tgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11555543 tgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaa 11555444  T
Q  313 gcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatg 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | ||| |||||    
T  11555443 gcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatg 11555344  T
Q  413 aagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcc 511  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555343 aagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcc 11555244  T
Q  512 ctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11555243 cttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 11555180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3795932 - 3795364
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795932 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3795833  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795832 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 3795734  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  3795733 gctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 3795634  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  3795633 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaggctt 3795534  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795533 tagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 3795434  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3795433 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 3795364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22894808 - 22894243
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22894808 cacagactatcctggggaagagtctgcttgtaacacatatcgaaatagacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 22894709  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22894708 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacata 22894610  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22894609 gctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 22894510  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22894509 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttct 22894410  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22894409 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtagttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaact 22894310  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894309 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 22894243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 18369300 - 18369867
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369300 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18369399  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369400 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 18369498  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18369499 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 18369598  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || |  ||     
T  18369599 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagtttt 18369698  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369699 tgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacagtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 18369798  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18369799 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtatacaatctcagcgagc 18369867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28655636 - 28655068
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655636 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28655537  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28655536 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtata 28655437  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28655436 tagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattc 28655337  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||     
T  28655336 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 28655237  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655236 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtagttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 28655137  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28655136 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 28655068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33881519 - 33880953
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881519 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33881420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 33881321  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  33881320 gctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 33881221  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||     
T  33881220 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttt 33881121  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33881120 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaac 33881021  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33881020 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcatttttgcctgagttgcgaacaatctcagcgagc 33880953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Original strand, 9544478 - 9545043
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544478 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 9544577  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9544578 gtttacttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 9544676  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9544677 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 9544776  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| |    
T  9544777 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcct-gaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 9544875  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544876 gatgaaaatggtcattaacagctgtagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 9544975  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544976 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 9545043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 13318596 - 13319162
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318596 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13318695  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318696 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13318794  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13318795 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 13318894  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||  |  | ||| |    
T  13318895 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcataacatttcccagaaactttgaattcgcaagcgtatgagctttt 13318994  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318995 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 13319094  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13319095 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 13319162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30174859 - 30174291
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174859 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 30174760  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174759 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 30174661  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30174660 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 30174561  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  30174560 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 30174461  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174460 tagatgaagataggcattaacagccgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 30174361  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30174360 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 30174291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 15752626 - 15753186
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752626 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15752725  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  15752726 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaa----gaaagaaaatgttttgtatata 15752820  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15752821 gctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcac 15752920  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| ||    
T  15752921 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttg 15753020  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15753021 atgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaaccg 15753120  T
Q  510 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15753121 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgatttgcgtacaatctcagcgagc 15753186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 32590044 - 32590610
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590044 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32590143  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32590144 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatat 32590242  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||| | |||||    
T  32590243 agctttgaaagtagaagaaagtagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattca 32590342  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| |    
T  32590343 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctttt 32590442  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590443 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 32590542  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  32590543 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 32590610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6880697 - 6880129
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880697 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacacattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6880598  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6880597 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatat 6880499  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatagtttc--aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6880498 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtcttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 6880399  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  6880398 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagatt 6880299  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880298 cagatgaagatggtcattaacagttgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 6880199  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880198 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 6880129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23632364 - 23631795
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632364 cacagactatcctggaggagaaccggcttataacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 23632265  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632264 caagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaagatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 23632165  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23632164 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 23632065  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |||    
T  23632064 cacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagctt 23631965  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23631964 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 23631865  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23631864 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 23631795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 40467321 - 40467888
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467321 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40467420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40467421 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatat 40467519  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  40467520 agctttgaaagtagaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 40467619  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  40467620 ataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 40467719  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467720 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 40467819  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40467820 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 40467888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 13436442 - 13437016
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436442 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaatatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13436541  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaa-tgttttgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13436542 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgt 13436640  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaat---agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13436641 atatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacg 13436740  T
Q  303 gattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacaga 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||     
T  13436741 gattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcatagg 13436840  T
Q  402 aacttctgat-gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 499  Q
    | ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436841 agcttttgattgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 13436940  T
Q  500 gcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13436941 gcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 13437016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 37746090 - 37746662
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgt------actcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccct 104  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |      ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37746090 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacattaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccct 37746189  T
Q  105 gttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746190 gttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttg 37746288  T
Q  205 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccat 301  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37746289 tatatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 37746388  T
Q  302 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacaga 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |      
T  37746389 ggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataag 37746488  T
Q  402 aacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 501  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746489 agcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 37746588  T
Q  502 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37746589 atgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 37746662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9323869 - 9323303
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9323869 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 9323770  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9323769 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 9323671  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9323670 gctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 9323571  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9323570 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttca 9323471  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323470 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 9323371  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9323370 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 9323303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 18494536 - 18495102
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494536 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18494635  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||    
T  18494636 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatata 18494734  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaat-agttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18494735 gctttgaaagtagaagaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattca 18494834  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| | |||| || | ||| |    
T  18494835 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaacttcgaattcgccagcataggagctttt 18494934  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494935 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 18495034  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18495035 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 18495102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24730363 - 24729796
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24730363 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 24730264  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24730263 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtata 24730165  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24730164 tagctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 24730065  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | |||     
T  24730064 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttt 24729965  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729964 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 24729865  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24729864 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 24729796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 37352412 - 37352979
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37352412 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 37352511  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  37352512 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 37352610  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37352611 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 37352710  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||  ||||| |||     
T  37352711 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttt 37352810  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352811 tgatgaagacagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 37352910  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37352911 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 37352979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30158427 - 30157859
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30158427 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 30158328  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30158327 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 30158229  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30158228 agctttgaaagtagaagaaaggtagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 30158129  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-tt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| || ||| || | ||    
T  30158128 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacgagtacataagcttt 30158029  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158028 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcctcaaggggaacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 30157929  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30157928 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 30157859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34622912 - 34622344
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622912 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34622813  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622812 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 34622714  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34622713 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattc 34622614  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |||    
T  34622613 acaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 34622514  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622513 tagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 34622414  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34622413 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 34622344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 37665254 - 37665821
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37665254 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 37665352  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665353 caggtttgctttttaaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 37665451  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37665452 cagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 37665551  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | |||    
T  37665552 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaattttgaattcgcaagcataagagctt 37665651  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665652 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 37665751  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37665752 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 37665821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2517459 - 2516891
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2517459 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacacgttgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 2517360  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517359 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 2517261  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  2517260 atagctttgaaagtagaagaaaatagaatctcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacggatt 2517161  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2517160 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 2517061  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2517060 ttgatgaagataggcattgacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatga 2516961  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2516960 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtataatctcagcgagc 2516891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12138568 - 12138002
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12138568 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12138469  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12138468 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 12138370  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12138369 gctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 12138270  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  12138269 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttca 12138170  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138169 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgtcttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 12138070  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12138069 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 12138002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 31820178 - 31820743
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31820178 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgct 31820277  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31820278 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 31820376  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31820377 gctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 31820476  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  31820477 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttg 31820576  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820577 atgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 31820676  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31820677 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 31820743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 13180561 - 13181124
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180561 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13180660  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180661 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 13180754  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13180755 gctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 13180854  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  |  | |||    
T  13180855 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtatgagctt 13180954  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13180955 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatga 13181054  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13181055 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 13181124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31437847 - 31437290
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31437847 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 31437748  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437747 gtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 31437655  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaa 311  Q
    ||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31437654 ttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 31437555  T
Q  312 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  31437554 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 31437455  T
Q  412 gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 510  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437454 gaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 31437355  T
Q  511 cctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437354 ccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 31437290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37761376 - 37760808
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37761376 cacagtctatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgct 37761277  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761276 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 37761178  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  37761177 tagctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatt 37761078  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| || | |||    
T  37761077 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt 37760978  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37760977 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 37760878  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37760877 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 37760808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33298930 - 33298359
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33298930 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 33298831  T
Q  111 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33298830 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 33298732  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag----tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  33298731 atagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 33298632  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||     
T  33298631 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 33298532  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 502  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298531 cttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 33298432  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33298431 tgaaccgccctttcgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 33298359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30035795 - 30035253
Alignment:
Q  34 ctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagac 133  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30035795 ctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaac 30035696  T
Q  134 aaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-a 231  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30035695 aaaaa-gttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaata 30035597  T
Q  232 tagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaaagcttggaaaatggtaattt 331  Q
     | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30035596 gaattttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattt 30035497  T
Q  332 tattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagct 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30035496 tattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagct 30035397  T
Q  432 gcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcat 531  Q
    ||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  30035396 gcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcat 30035297  T
Q  532 cgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30035296 cgagacgctcatttttgcctgagttgcgaacaatctcagcgagc 30035253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33522776 - 33522205
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33522776 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 33522677  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33522676 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 33522578  T
Q  210 agctttgaaagtagaa--gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33522577 agctttgaaagtaaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 33522478  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-t 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |    
T  33522477 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 33522378  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 502  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522377 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 33522278  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33522277 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 33522205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26486778 - 26486222
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26486778 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26486679  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26486678 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26486580  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcaca 310  Q
    ||||||||| ||||         |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26486579 gctttgaaaataga---------gttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 26486489  T
Q  311 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26486488 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcag 26486389  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486388 atgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 26486289  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486288 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 26486222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 28953548 - 28954115
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28953548 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28953646  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28953647 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtata 28953745  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  28953746 tagctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 28953845  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28953846 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 28953945  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953946 cagatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 28954045  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28954046 accgcccttccgggtcttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 28954115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 8659240 - 8659807
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659240 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 8659339  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8659340 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 8659438  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8659439 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 8659538  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||  | |||     
T  8659539 acaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcc-cgaaactttgaattcacaagtacaagagcttt 8659637  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttg-ccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8659638 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccctcttgtttcaatctcatttttgcatga 8659737  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8659738 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgaacaacctcagcgagc 8659807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5644191 - 5643628
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5644191 cacagattatcttggaggagaacctgcttttaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 5644093  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5644092 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcgattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 5643994  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5643993 agctttgaaagtaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 5643894  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| | |||||||||||| ||||  ||    ||| |    
T  5643893 caaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaag--cattcgctttt 5643796  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643795 gatgaaaatgggcattaacagctgcagatgccccaaggggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 5643696  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643695 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 5643628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11330032 - 11329463
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11329933  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata- 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||   |||||||     
T  11329932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 11329834  T
Q  209 -tagctttgaaagtagaagaaaa-atag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
     |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11329833 ttagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 11329734  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | ||    
T  11329733 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagct 11329634  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329633 tttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 11329534  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11329533 aactgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 11329463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 43084651 - 43084084
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084651 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 43084552  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43084551 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaactttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 43084453  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  43084452 aactttgaaaatagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 43084353  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| | |||| || | |||     
T  43084352 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattcgccagcataggagcttt 43084253  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||   | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084252 tgatgaagataatcattaacagcagcagatgcccccaggggggcggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 43084153  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084152 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 43084084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41681098 - 41680530
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41681098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacataaattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 41681000  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  41680999 caggtttgcttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 41680901  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||    
T  41680900 tagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggat 41680801  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||    
T  41680800 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 41680701  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41680700 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcata 41680601  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41680600 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 41680530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 18122184 - 18122751
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18122184 cacagactatcctggaggagaaactgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18122282  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  18122283 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatat 18122381  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaat---agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||||| |||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18122382 agctttgaaagtagaaaaaaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18122481  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | |||    
T  18122482 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctt 18122581  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122582 ttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 18122681  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18122682 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatgcaatctcagcgagc 18122751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 15652528 - 15653093
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15652528 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15652626  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||    | | | |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652627 caggtttgcttttttttaaaaa-aaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 15652725  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15652726 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 15652825  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| |    
T  15652826 caaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 15652925  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652926 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccgagggagacggtggtcggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 15653025  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15653026 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 15653093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25206670 - 25206105
Alignment:
Q  18 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 117  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25206670 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25206571  T
Q  118 gcttttcaaaatagacaaaaaag----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25206570 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25206472  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25206471 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 25206372  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| || || | ||||    
T  25206371 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttc 25206272  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25206271 tgatgaagatggtcattaacagctgtagatgccccaacgggatggtggttggccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcataaac 25206173  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206172 ctcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 25206105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25270826 - 25270261
Alignment:
Q  18 tatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttt 117  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25270826 tatcctagggaagaatttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggttt 25270727  T
Q  118 gcttttcaaaatagacaaaaaag----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatata 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  25270726 gcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacata 25270628  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25270627 gctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 25270528  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| || || | ||||    
T  25270527 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttc 25270428  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25270427 tgatgaagatggtcattaacagctgtagatgccccaacgggatggtggttggccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcataaac 25270329  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270328 ctcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 25270261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 22992892 - 22993451
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22992892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 22992990  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992991 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcatcatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 22993083  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22993084 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 22993183  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||| |    
T  22993184 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcgatacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 22993283  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993284 gatgaggatagtcattaacagctgcagatgccccaagggtgacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 22993383  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22993384 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 22993451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23898261 - 23897701
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23898261 cacagactatcctggagaagaatctgcttgcaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 23898162  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----gt 205  Q
    ||||||||||||  ||| |           |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    ||    
T  23898161 caggtttgctttcaaaact-----------ttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgt 23898073  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    | ||||||||||||||| ||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23898072 acatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatga 23897973  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||| || |     
T  23897972 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcggaagcataggag 23897873  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897872 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 23897773  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897772 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 23897701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33783875 - 33783311
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33783875 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 33783777  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gta 206  Q
    | ||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  33783776 ccggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgta 33783685  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 304  Q
     ||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33783684 cataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 33783585  T
Q  305 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |    
T  33783584 tttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagc 33783485  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33783484 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcat 33783385  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc--gtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33783384 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgtacaatctcagcgagc 33783311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24608634 - 24608072
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24608634 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacacttgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 24608535  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24608534 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24608443  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaat--agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24608442 ataactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttcaaacaaaagcacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24608343  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |    
T  24608342 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagc 24608243  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608242 ttttgatgaagatggtcattagtagctgcagacgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 24608143  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24608142 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 24608072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24976236 - 24975675
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24976236 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgct 24976137  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         |  ||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24976136 caggtttgcttttcaaaa---------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24976046  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24976045 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24975946  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||| || | ||    
T  24975945 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcgagcataggagct 24975846  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24975845 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctctcgtttcaatctcatttttgcatg 24975746  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24975745 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 24975675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30941023 - 30940462
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  30941023 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgct 30940925  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  30940924 caggtttgcttttcaaaa---------actttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 30940834  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  ||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30940833 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagaatttcaaacaaaagcacaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 30940734  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |    
T  30940733 ttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 30940634  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940633 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 30940534  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30940533 gaaccgccttttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcctgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 30940462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 495 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 34471394 - 34471338
Alignment:
Q  495 tttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  34471394 tttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatttttgcct 34471338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Original strand, 24960667 - 24960722
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  24960667 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 24960722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 28848511 - 28848456
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  28848511 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 28848456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Original strand, 24064552 - 24064602
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 544  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  24064552 atttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatt 24064602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 5437611 - 5437668
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  5437611 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 5437668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 11941808 - 11941865
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  11941808 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 11941865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 541
Target Start/End: Original strand, 12176455 - 12176500
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12176455 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 12176500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 541
Target Start/End: Original strand, 21863308 - 21863353
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21863308 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 21863353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 541
Target Start/End: Original strand, 26085218 - 26085263
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  26085218 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 26085263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31523082 - 31523025
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  31523082 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 31523025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 20334283 - 20334851
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334283 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20334382  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  20334383 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 20334481  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334482 atagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaatttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 20334581  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20334582 ttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagct 20334681  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334682 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 20334781  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20334782 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatttttgcctgagttgcatacaatctcagcgagc 20334851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3647534 - 3646967
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647534 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3647435  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647434 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 3647336  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3647335 gctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 3647236  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |||     
T  3647235 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 3647136  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647135 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 3647036  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647035 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 3646967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 51644588 - 51644041
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644588 cctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 51644489  T
Q  133 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51644488 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaa 51644389  T
Q  232 tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaaagcttggaaaatggtaa 328  Q
    |||   ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644388 tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaa 51644289  T
Q  329 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaaca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||| |||    
T  51644288 ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattgaca 51644189  T
Q  429 gctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggc 527  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51644188 gctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggc 51644089  T
Q  528 tcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51644088 tcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 51644041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28591470 - 28590904
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591470 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28591371  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28591370 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatata 28591272  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28591271 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 28591172  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || |  || |    
T  28591171 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagttttt 28591072  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28591071 gatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggtcggccagatatagctacttgccttttatttcaatctcatttttgcatgaac 28590972  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28590971 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgatttgcgtacaatctcagcgagc 28590904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 41787177 - 41787746
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787177 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 41787276  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787277 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 41787375  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  41787376 atagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggatt 41787475  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||    
T  41787476 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 41787575  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787576 tttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 41787675  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41787676 aaccgcccttcagggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 41787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10969054 - 10968486
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969054 cacagaccatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10968955  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10968954 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatata 10968856  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10968855 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 10968756  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | |||    
T  10968755 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 10968656  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968655 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 10968556  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10968555 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 10968486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10951480 - 10950912
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10951480 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 10951381  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10951380 caggtttacttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatata 10951282  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||    
T  10951281 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagatt 10951182  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||   || | |||    
T  10951181 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatccgcaagtgtaggagctt 10951082  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951081 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 10950982  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10950981 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 10950912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 16201895 - 16202468
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16201895 cacagactatcctggagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16201994  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--- 203  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  16201995 caggtttgcttt-caaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgttttttt 16202093  T
Q  204 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 299  Q
      ||| || |||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202094 ttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 16202193  T
Q  300 atggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcaca 399  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16202194 acggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcaca 16202293  T
Q  400 gaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 499  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16202294 ggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagaggatggtggttggccagatatagttacttgcc-tctgtttcaatctcattttt 16202392  T
Q  500 gcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16202393 gcatgaaccgcccttgcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 16202468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20467173 - 20466600
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  20467173 cacagactatcatggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgct 20467074  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttc-------aattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--tt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||  ||||        |||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20467073 caggtttgcttt-caaaatagacaggaactttttttttttctaattttgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggttt 20466975  T
Q  202 ttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 299  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466974 ttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 20466875  T
Q  300 atggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcaca 399  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||  |||||| |    
T  20466874 acggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcata 20466775  T
Q  400 gaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 499  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466774 gaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtgatttgccaaatat-gttacttgccttttgtttcaatctcattttt 20466676  T
Q  500 gcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466675 gcatgaaccgccctttcgggttttcagctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 20466600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28156116 - 28155555
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156116 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28156017  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28156016 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 28155918  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28155917 tatagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 28155818  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||    ||    
T  28155817 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgct 28155720  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||    
T  28155719 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgtcttttgtt------tcatttttgcatg 28155626  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28155625 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 28155555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 21891630 - 21892183
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21891630 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 21891728  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |     
T  21891729 caggtttgcttttcaaaa-----aaaacttttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgaac 21891823  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||     |||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21891824 ataaaaaagaaagtaga---------gtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 21891914  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21891915 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagcttc 21892014  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892015 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 21892114  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892115 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 21892183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 6200107 - 6200164
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  6200107 atttttgcatgaaccgcccttttgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 6200164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31544654 - 31544599
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  31544654 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 31544599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 10969262 - 10969230
Alignment:
Q  493 catttttgcatgaaccgccctttcgggttttcg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10969262 catttttgcctgaaccgccctttcgggttttcg 10969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 9510 - 10075
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 9708  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  9709 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattta 9808  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| |    
T  9809 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 9908  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9909 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaacc 10008  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10009 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 10075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12661922 - 12661356
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661922 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12661823  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661822 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 12661724  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12661723 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 12661624  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | ||| |    
T  12661623 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagctttt 12661524  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12661523 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaat 12661424  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12661423 cgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 12661356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37384061 - 37383494
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37384061 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 37383962  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 37383863  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37383862 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattca 37383763  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||     
T  37383762 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 37383663  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37383662 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatgaa 37383563  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37383562 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgttcaatctcagcgagc 37383494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 39896452 - 39895885
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896452 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39896353  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896352 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 39896254  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39896253 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattca 39896154  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  39896153 caaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttccccaaaaactttgaattctcaagtacagaagcttc 39896054  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39896053 agatgacgatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaa 39895954  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39895953 ccgcccctccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 39895885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34868066 - 34867500
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34868066 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34867967  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34867966 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 34867868  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34867867 agctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattca 34867768  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   || | ||| |    
T  34867767 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctttt 34867668  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867667 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 34867568  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867567 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 34867500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27810087 - 27809518
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27810087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgct 27809988  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809987 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 27809889  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa--tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27809888 gctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27809789  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  27809788 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagct 27809689  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809688 tttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 27809589  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27809588 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgcacattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 27809518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34161230 - 34160661
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161230 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtgacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34161131  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161130 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 34161032  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34161031 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 34160932  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  34160931 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagct 34160832  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160831 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 34160732  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34160731 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 34160661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 21697031 - 21697599
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21697031 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 21697130  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21697131 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgta 21697229  T
Q  207 tatagctttgaaagtag-aagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 304  Q
     |||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21697230 catagctttgaaagtaggaagatagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 21697329  T
Q  305 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21697330 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagc 21697429  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21697430 tttagatgaaggtggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcatg 21697528  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21697529 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcaacgagc 21697599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 37945723 - 37946291
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945723 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37945822  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945823 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 37945921  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  37945922 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 37946021  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  37946022 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 37946121  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946122 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 37946221  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37946222 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcgttcttgcctgatttgcgtacaatctcagcgagc 37946291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27122907 - 27122342
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122907 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27122808  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27122807 caggtttgcttctcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 27122709  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27122708 gctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttac 27122609  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | ||| ||    
T  27122608 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttg 27122509  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122508 atgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 27122409  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27122408 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 27122342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12593198 - 12592627
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593198 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12593099  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12593098 caggtttgctttccaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 12593000  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  12592999 tatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgg 12592900  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |     
T  12592899 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagag 12592800  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 502  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592799 cttttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 12592700  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12592699 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgatttgcgtacaatctcagcgagc 12592627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 12710459 - 12711026
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12710459 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 12710558  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710559 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 12710657  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  12710658 tagctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 12710757  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12710758 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 12710857  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710858 agatgaagacggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 12710957  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12710958 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtatacaatctcagcgagc 12711026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 21671028 - 21671598
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671028 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21671127  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21671128 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 21671227  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21671228 atagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 21671327  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21671328 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagct 21671427  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671428 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 21671527  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21671528 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 21671598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32056185 - 32055620
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056185 cacagattatcttggaggagaacctgctggtaacatatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 32056086  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32056085 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcagttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 32055987  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32055986 agctttgaaagtagaagaaaatagaattttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattta 32055887  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| |    
T  32055886 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 32055787  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055786 gatgaagatggttattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 32055687  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055686 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 32055620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 22922001 - 22922570
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22922001 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 22922100  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922101 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 22922199  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22922200 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22922299  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  22922300 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 22922399  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22922400 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttctgtttcaatctcattcttgcatg 22922499  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22922500 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 22922570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3788877 - 3788311
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788877 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 3788778  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788777 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 3788679  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| |    
T  3788678 gctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggattta 3788579  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| || | ||| |    
T  3788578 taaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 3788479  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788478 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 3788379  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788378 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 3788311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 19410342 - 19410912
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19410342 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgct 19410441  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19410442 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtata 19410540  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19410541 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19410640  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  19410641 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 19410740  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa--ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19410741 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcattctcatttttgcat 19410840  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19410841 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtatacaatctcagcgagc 19410912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 37679749 - 37680318
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37679749 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37679848  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37679849 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaattt-caattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 37679947  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37679948 atagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 37680047  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37680048 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagct 37680147  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680148 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 37680247  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37680248 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 37680318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 37695014 - 37695583
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695014 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 37695113  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37695114 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaattt-caattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 37695212  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  37695213 atagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatt 37695312  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  37695313 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagct 37695412  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695413 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 37695512  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  37695513 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 37695583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 9343845 - 9344412
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343845 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9343944  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9343945 caggtttgcttttcaaaatggacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatat 9344043  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9344044 agctttgaaagtagaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 9344143  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  9344144 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 9344243  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344244 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 9344343  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9344344 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 9344412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 39045680 - 39046247
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39045779  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  39045780 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatat 39045878  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  39045879 agctttgaaagtagaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 39045978  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  39045979 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattgaacacagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 39046078  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046079 agatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatacagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 39046178  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39046179 ccgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 39046247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31882670 - 31882104
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31882670 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 31882571  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882570 caagtttgcttttcaaaataga-aaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31882472  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31882471 agctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31882372  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||      
T  31882371 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttta 31882272  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882271 gatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 31882172  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31882171 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 31882104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 254510 - 255077
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254510 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 254609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254610 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 254707  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  254708 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 254807  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  254808 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 254907  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  |||||  || || ||||||||||||||||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254908 tagatgaagatagtcatcgacggcagcagatgccccaagggggacggtggctggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 255007  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  255008 accgcccttctgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 255077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 11629043 - 11629609
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11629043 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 11629141  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11629142 caggtttgtttttcaaaatagacaaaga-gttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 11629240  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||| || ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11629241 tagctttgaaaataaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 11629340  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11629341 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 11629440  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11629441 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattcttgcatgaa 11629540  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11629541 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatgcaatctcagcgagc 11629609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 16823195 - 16823765
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16823195 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16823294  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16823295 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 16823393  T
Q  210 agctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16823394 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 16823493  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-tt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||    
T  16823494 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagcttt 16823593  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823594 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 16823693  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16823694 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 16823765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16898285 - 16897715
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16898285 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 16898186  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16898185 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 16898087  T
Q  210 agctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16898086 agctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 16897987  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-tt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||    
T  16897986 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagcttt 16897887  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897886 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 16897787  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16897786 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 16897715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 13930402 - 13930971
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930402 cacagactatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 13930501  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13930502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 13930600  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||    
T  13930601 tagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggat 13930700  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||    
T  13930701 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 13930800  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    |  ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930801 ttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 13930900  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13930901 aaccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 13930971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16167862 - 16167295
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167862 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16167763  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16167762 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 16167664  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16167663 aactttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 16167564  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  16167563 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 16167464  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
      |||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167463 atatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 16167364  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16167363 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 16167295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 40239892 - 40239326
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40239892 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 40239794  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  40239793 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatat 40239695  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  40239694 aactttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 40239595  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40239594 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 40239495  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239494 agatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 40239395  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  40239394 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgtctgagttgtttacaatctcagcgagc 40239326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37931763 - 37931189
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37931763 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 37931664  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931663 caggtttgcttttcaaaataaac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 37931565  T
Q  210 agctttgaaagtagaag------aaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 300  Q
    |||||||||||||||||      ||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37931564 agctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 37931465  T
Q  301 tggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacag 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  37931464 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtag 37931365  T
Q  401 aaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 499  Q
     | |||  ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931364 gagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgctccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 37931265  T
Q  500 gcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37931264 gcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 37931189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34297533 - 34296974
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297533 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 34297434  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297433 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcgaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 34297341  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34297340 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattca 34297241  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||||    | ||| |    
T  34297240 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcatgagagctttt 34297141  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297140 gatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccagatataattacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 34297041  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34297040 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcaacgagc 34296974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27782616 - 27782049
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782616 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 27782517  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27782516 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 27782418  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27782417 agctttgaaaatagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 27782318  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  27782317 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 27782218  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782217 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 27782118  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27782117 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 27782049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27396717 - 27396140
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27396717 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 27396618  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt---------caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtt 201  Q
     ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||         |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27396617 taggtttgcttt-caaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgtt 27396519  T
Q  202 tt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgact 297  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396518 ttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgact 27396419  T
Q  298 ccatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagca 397  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27396418 ccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27396319  T
Q  398 cagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatt 496  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | | ||| |||||  |||||||||||||    
T  27396318 caaaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacaatcatttgtcttttcatttcaatctcatt 27396219  T
Q  497 tttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396218 tttgcatgaaccgccctttcggattttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 27396140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 19450276 - 19450852
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||    
T  19450276 cacagactatcctggggaagagcctgcttataacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgct 19450375  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-----caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-- 203  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  19450376 caggtttacttt-caaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttt 19450474  T
Q  204 ---gtatatagctttgaaagtaga-agaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactc 298  Q
       ||| ||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19450475 tttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagtttcaaacaaaagcacatgctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgattc 19450574  T
Q  299 catggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcac 398  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19450575 cacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcac 19450674  T
Q  399 agaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcattt 497  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||    
T  19450675 agaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcattt 19450774  T
Q  498 ttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19450775 ttgcatgaaccgccctttcgggttttcggcccatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaacctcagcgagc 19450852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 34268784 - 34269345
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34268784 cacagactatcctagagaagaatctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 34268883  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  34268884 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 34268975  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34268976 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacatgctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 34269075  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||  | | ||    
T  34269076 ttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcatgacatttcctagaaactttgaattcacaagcatgggagct 34269175  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269176 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 34269275  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269276 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 34269345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28888658 - 28888096
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28888658 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 28888560  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  28888559 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 28888467  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28888466 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggat 28888367  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  28888366 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagct 28888267  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888266 tttgatgaagattgtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 28888167  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28888166 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 28888096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 23122436 - 23122998
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23122436 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 23122534  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  23122535 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 23122627  T
Q  209 tagctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23122628 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatt 23122727  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||    
T  23122728 tgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 23122827  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122828 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 23122927  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23122928 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatgcaatctcagcgagc 23122998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 15 - 575
Target Start/End: Original strand, 27428315 - 27428871
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27428315 gactatcctgggggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcagg 27428413  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatag 211  Q
    ||||||||||||||         |  ||| |||||||||| ||||||||||| | || | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | | |||     
T  27428414 tttgcttttcaaaa---------acttttgcaattttcaagatgtttgtttcgaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataa 27428504  T
Q  212 ctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||||| ||  |||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27428505 ctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttac 27428604  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |  || ||    
T  27428605 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaactcacaagcataagagtttttg 27428704  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428705 atgaagatggtcattaccagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 27428804  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27428805 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 27428871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20844296 - 20843730
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20844296 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 20844197  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--a 206  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |    
T  20844196 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaa 20844103  T
Q  207 tatagcttt-gaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
     ||| |||| ||| ||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  20844102 cataacttttgaaggtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacgg 20844003  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 402  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||  |||     
T  20844002 atttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtagag 20843903  T
Q  403 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 501  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20843902 -cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 20843804  T
Q  502 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20843803 atgaaccgccctttcgggtttttggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 20843730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 31868644 - 31868979
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868644 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31868743  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31868744 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 31868842  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31868843 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31868942  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 345  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31868943 caatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 340 - 575
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887918
Alignment:
Q  340 ggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgc 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgc 31887781  T
Q  440 cccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacg 538  Q
    ||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  31887782 cccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttctgggttttcgattcatcgagacg 31887881  T
Q  539 ctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31887882 ctcattcttgcctgagttgcatacaatctcagcgagc 31887918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27821974 - 27821806
Alignment:
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821974 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 27821875  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27821874 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 27821806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23117180 - 23117044
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23117180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcc 23117081  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23117080 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaat 23117044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Original strand, 15948523 - 15948578
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  15948523 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 15948578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21117737 - 21117682
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| || ||||||    
T  21117737 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacactcttttttgcct 21117682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 35143316 - 35143261
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  35143316 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 35143261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Original strand, 42569999 - 42570054
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  42569999 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 42570054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Original strand, 21758096 - 21758146
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 544  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  21758096 atttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatt 21758146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 21753135 - 21753192
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| ||||||    
T  21753135 atttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccactgagacgctcatttttgcct 21753192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 24289831 - 24289786
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24289831 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 24289786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 16618400 - 16618970
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16618400 cacagactatcctggggaagagcctccttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16618499  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt--caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 205  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  16618500 caggtttgcttt-caaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 16618598  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16618599 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 16618698  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  16618699 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaag 16618798  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618799 cttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 16618898  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16618899 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttacctaagttgcgtacaatctcagcgagc 16618970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32296979 - 32296411
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32296979 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 32296880  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296879 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 32296781  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  32296780 gctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggatt 32296681  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32296680 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaactt 32296581  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296580 ctgatgaaaatggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 32296481  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32296480 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtataatctcagcgagc 32296411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 4790544 - 4791112
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790544 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4790643  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4790644 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4790742  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  4790743 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggattt 4790842  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |||    
T  4790843 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 4790942  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  | | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790943 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggcggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 4791042  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4791043 accgcccttccgggttttcggctcatcgaggcgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 4791112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 22864759 - 22865324
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864759 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22864858  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22864859 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 22864957  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22864958 gctttgaaagtagaagaaagcatagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttac 22865057  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||    
T  22865058 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttg 22865157  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865158 atgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 22865257  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865258 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 22865324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 22879818 - 22880383
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879818 cacagactaccctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 22879917  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22879918 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtataca 22880016  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22880017 gctttgaaagtagaagaaagcatagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttac 22880116  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||    
T  22880117 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttg 22880216  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880217 atgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 22880316  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880317 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 22880383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28027638 - 28027073
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027638 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatacattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28027539  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  28027538 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 28027440  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  28027439 gctttgaaagtagaagaaaatagaattttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattcac 28027340  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||    
T  28027339 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttg 28027240  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027239 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 28027140  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28027139 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 28027073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 22381492 - 22382057
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  22381492 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgct 22381590  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381591 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 22381689  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22381690 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 22381789  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||     
T  22381790 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt- 22381888  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381889 tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 22381988  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381989 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 22382057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5728328 - 5727760
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728328 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5728229  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728228 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5728130  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5728129 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5728030  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  5728029 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 5727930  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727929 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5727830  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727829 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 5727760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5717418 - 5716850
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717418 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5717319  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717318 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5717220  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5717219 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5717120  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |||    
T  5717119 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 5717020  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717019 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5716920  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5716919 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 5716850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 5764040 - 5764608
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764040 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5764139  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764140 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5764238  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5764239 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5764338  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |||    
T  5764339 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 5764438  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764439 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5764538  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764539 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 5764608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16422532 - 16421966
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422532 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 16422433  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  16422432 caggtttgcttt-caaaatacacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 16422334  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16422333 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 16422234  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16422233 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcc-ggaaactttgaattcgcaagcacagaagctt 16422135  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttg-ccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16422134 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccctaagggaacggtggttggcccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcatga 16422036  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422035 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 16421966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 17970777 - 17971342
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970777 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacgcatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 17970876  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  17970877 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatata 17970975  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17970976 gctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 17971075  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||    
T  17971076 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttg 17971175  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971176 atgaagacggtcattgacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 17971275  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971276 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 17971342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 29658879 - 29659446
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658879 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29658978  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658979 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 29659077  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  29659078 aactttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 29659177  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  29659178 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 29659277  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659278 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 29659377  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29659378 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 29659446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 48472280 - 48471709
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472280 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 48472181  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-----caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472180 caggtttgcttttcaaaatagac-agaaagttttcaatttttaaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 48472082  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaat--agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48472081 atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatgg 48471982  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||    
T  48471981 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggaa 48471882  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 502  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48471881 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattcttgca 48471782  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  48471781 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 48471709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10402497 - 10401931
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402497 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10402398  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402397 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 10402299  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  10402298 agctttgaaagtagaa-aaaaatagaattttaatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggattt 10402200  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||     
T  10402199 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttt 10402100  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10402099 tgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatgaa 10402000  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10401999 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 10401931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24334524 - 24333955
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24334524 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 24334425  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24334424 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtata 24334326  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24334325 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 24334226  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  24334225 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 24334126  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24334125 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcattctcatttttgcatg 24334026  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24334025 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtatacaatctcagcgagc 24333955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 31958366 - 31958935
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31958366 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgct 31958465  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958466 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31958564  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31958565 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 31958664  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  31958665 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 31958764  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958765 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 31958864  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31958865 aaccgcccctccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 31958935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 47029803 - 47029235
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029803 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 47029704  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 47029605  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  47029604 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 47029505  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  47029504 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 47029405  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029404 tagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagccggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 47029305  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47029304 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 47029235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 5603224 - 5603793
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5603224 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgct 5603323  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603324 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5603422  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5603423 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 5603522  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  5603523 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 5603622  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5603623 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatg 5603722  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5603723 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 5603793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4423267 - 4422701
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423267 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4423168  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4423167 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 4423069  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4423068 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 4422969  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  4422968 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 4422869  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422868 cgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 4422769  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4422768 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 4422701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 4340587 - 4341155
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340587 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 4340686  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4340687 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 4340785  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4340786 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 4340885  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-tt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| | ||    
T  4340886 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttt 4340985  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4340986 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacagtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatga 4341085  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4341086 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 4341155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8217983 - 8217414
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217983 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8217884  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8217883 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtat 8217785  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  8217784 ataactttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 8217685  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||    
T  8217684 ccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagct 8217585  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217584 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 8217485  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217484 aaccgcccttccgggttttcggttcattgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 8217414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5473336 - 5472770
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473336 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5473237  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5473236 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 5473139  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  5473138 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 5473039  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  5473038 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 5472939  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472938 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccaggtatagctacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 5472839  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5472838 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 5472770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Original strand, 5590275 - 5590839
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590275 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacctattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 5590374  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5590375 gtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagc 5590473  T
Q  213 tttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcaca 310  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5590474 tttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttaca 5590573  T
Q  311 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || | ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  5590574 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttaga 5590673  T
Q  411 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 509  Q
    ||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590674 tgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 5590773  T
Q  510 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5590774 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 5590839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 6536654 - 6537221
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6536654 cacagactatccttgagaagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgct 6536753  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536754 caggtttgcttttcaaaacagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 6536852  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  6536853 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 6536952  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  6536953 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 6537052  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6537053 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcgatctcatttttgcatgaa 6537152  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6537153 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 6537221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18249087 - 18248520
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18249087 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18248988  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18248987 caggtttgcttttcaaaatagaccaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgt 18248889  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18248888 agctttgaaagtagaagaaaaatagagttccaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18248789  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  18248788 acaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 18248689  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248688 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 18248589  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18248588 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 18248520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20072384 - 20071817
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072384 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20072285  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20072284 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 20072186  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20072185 tatagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacggat 20072086  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||    ||    
T  20072085 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgct 20071988  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20071987 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 20071888  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20071887 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 20071817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 28109862 - 28110434
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109862 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28109961  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109962 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaacgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 28110060  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  28110061 tatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacgg 28110160  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaa 402  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  28110161 attcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 28110260  T
Q  403 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 501  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110261 gcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgc 28110360  T
Q  502 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  28110361 atgaaccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 28110434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4630133 - 4629567
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4630133 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4630035  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4630034 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 4629936  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  4629935 aactttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatta 4629836  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4629835 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 4629736  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629735 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 4629636  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4629635 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatacaatctcagcgagc 4629567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10649420 - 10648853
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649420 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10649321  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10649320 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 10649222  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  10649221 aactttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 10649122  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  10649121 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 10649022  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649021 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 10648922  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10648921 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 10648853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 29142665 - 29143235
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29142665 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgct 29142764  T
Q  111 caggtttgcttttc--aaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29142765 caggtttgttttttcaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtat 29142863  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  29142864 atagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacgga 29142963  T
Q  305 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  29142964 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagc 29143063  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143064 ttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 29143163  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29143164 gaaccgccctttcgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 29143235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 18286266 - 18286832
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18286266 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18286364  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286365 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18286463  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18286464 tagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 18286563  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||  |||||| |  | |||     
T  18286564 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagcttt 18286663  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286664 tgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 18286763  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18286764 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 18286832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 18301567 - 18302133
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18301567 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 18301665  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301666 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 18301764  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18301765 tagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 18301864  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||  |||||| |  | |||     
T  18301865 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagcttt 18301964  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301965 tgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 18302064  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18302065 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 18302133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7079576 - 7079006
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079576 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 7079477  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttg----t 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    |    
T  7079476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatat 7079377  T
Q  206 atatagctttgaaagt-agaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7079376 atatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 7079277  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||        
T  7079276 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcg 7079179  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 502  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079178 cttttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 7079079  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7079078 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgcttattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 7079006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 17978861 - 17979431
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17978861 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgct 17978960  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17978961 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 17979059  T
Q  209 tagctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17979060 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 17979159  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-t 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |    
T  17979160 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 17979259  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc--aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979260 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 17979359  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17979360 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 17979431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5020061 - 5019495
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5020061 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5019962  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5019961 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 5019863  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  5019862 agctttgaaagtagaagaaagtagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattta 5019763  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||      
T  5019762 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttta 5019663  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019662 gatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 5019563  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5019562 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 5019495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28345519 - 28344953
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345519 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28345420  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28345419 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 28345321  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28345320 agctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 28345221  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||||     
T  28345220 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttca 28345121  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345120 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 28345021  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28345020 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 28344953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18057612 - 18057042
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057612 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18057513  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatc-aaaatagaaagaaaatg-ttttgtata 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18057512 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 18057413  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    || ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18057412 taactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 18057313  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||    
T  18057312 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 18057213  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18057212 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgttttaatctcatttttgcatg 18057113  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18057112 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 18057042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21681049 - 21680483
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21681049 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 21680951  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  21680950 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatat 21680852  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  21680851 aactttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 21680752  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21680751 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 21680652  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680651 agatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 21680552  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21680551 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 21680483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 11104272 - 11104840
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104272 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11104371  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat- 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||     
T  11104372 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatt 11104470  T
Q  210 -agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
     ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11104471 tagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggatt 11104570  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| || |||||  || | |||    
T  11104571 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaactcgcaagcgtaggagctt 11104670  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104671 tagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 11104770  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11104771 accgcccttccaggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 11104840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 51788371 - 51787804
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788371 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 51788272  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  51788271 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatat 51788173  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  51788172 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 51788073  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  51788072 acaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 51787973  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51787972 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 51787873  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51787872 ccgcccttccgggttttcggctcattgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 51787804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 31030156 - 31030716
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31030156 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatcttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 31030254  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030255 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31030348  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31030349 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31030448  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | ||| |    
T  31030449 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttt 31030548  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030549 gatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 31030648  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030649 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 31030716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18231542 - 18230975
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18231542 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgct 18231443  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231442 cgggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 18231344  T
Q  210 agctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18231343 agctttgaaagtagaaagaaaacagagttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18231244  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |||     
T  18231243 gcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 18231144  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231143 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 18231044  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18231043 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcatttttgcctgagttgcgaacaatctcagcgagc 18230975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 20570757 - 20571324
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570757 cacagactatcctggaggagaacctgtttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 20570856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20570857 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 20570955  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20570956 agctttgaaaatagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 20571055  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  20571056 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 20571155  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20571156 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggtcggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcgtgaa 20571255  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20571256 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 20571324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18336968 - 18336410
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18336968 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcag 18336870  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336869 gtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagct 18336776  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaa 311  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18336775 ttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 18336676  T
Q  312 agcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | || | ||| |||    
T  18336675 agcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagtataggagcttttga 18336576  T
Q  411 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 509  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18336575 tgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 18336476  T
Q  510 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18336475 cccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcactctcagcgagc 18336410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19700847 - 19700269
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19700847 cacagactatcctggggaagaatctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19700748  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----- 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||         
T  19700747 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttttt 19700649  T
Q  204 ------gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 295  Q
          ||| ||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700648 ttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtga 19700549  T
Q  296 ctccatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaag 395  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||     
T  19700548 ctccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattcgcaaa 19700449  T
Q  396 cacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcat 495  Q
    || || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700448 cataggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagacgccccaagggaacggtggttggcctgatatagttacttgccttttgtttcaatctcat 19700349  T
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700348 ttttgcatgaaccgcccttccaggtttacggctcatcgagacgcttattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 19700269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32445494 - 32444936
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32445494 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 32445396  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32445395 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatata 32445304  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
     ||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  32445303 actttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 32445204  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| | |||| |  | ||| |    
T  32445203 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcgagcataagagctttt 32445104  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445103 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 32445004  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32445003 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 32444936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6208245 - 6207682
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6208245 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6208147  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6208146 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcctttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtata 6208054  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6208053 tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 6207954  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |    
T  6207953 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagc 6207854  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207853 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 6207754  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6207753 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 6207682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4727976 - 4727415
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727976 cacagaccatcctggggaagagcctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 4727878  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4727877 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtata 4727785  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4727784 tagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4727685  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |||    
T  4727684 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagctt 4727585  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4727584 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatcccatttttgcatga 4727485  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4727484 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 4727415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 15735011 - 15735573
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15735011 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 15735109  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||     
T  15735110 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtac 15735203  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15735204 ataactttgaaagtaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 15735303  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||   |   |||    
T  15735304 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgttggggctt 15735403  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735404 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 15735503  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  15735504 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgtctaagttgtgtacaatctcagcgagc 15735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 8283369 - 8283947
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8283369 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgct 8283468  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaag--------ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgt 200  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||         |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  8283469 caggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgt 8283568  T
Q  201 ttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaat--agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgact 297  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283569 ttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttcaaacaaaaacacatgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgact 8283668  T
Q  298 ccatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagca 397  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||     
T  8283669 ccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcg 8283768  T
Q  398 cagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatt 496  Q
     || | |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283769 taggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatt 8283868  T
Q  497 tttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8283869 tttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgtctgagttgtgtacaatctcagcgagc 8283947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4689994 - 4689432
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4689994 cacagactatcctggaggagaatctgcttgtaacatatattgaaataggcaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 4689896  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  4689895 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 4689804  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4689803 ataacttagaaagtaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 4689704  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||    
T  4689703 tacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacgcagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 4689604  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctca-tttttgcat 503  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4689603 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggatggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcattttttgcat 4689504  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4689503 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 4689432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 35887109 - 35886546
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |     
T  35887109 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttaca 35887011  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  35887010 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 35886918  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35886917 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 35886818  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |    
T  35886817 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagc 35886718  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886717 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 35886618  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35886617 gaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 35886546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5658480 - 5657917
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5658480 cacagactatccttgaggagaacctgcttgtaacatgcgttgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 5658382  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
     |||||||||||||||||       |||  ||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  5658381 taggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 5658289  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat--gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    ||| | ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5658288 ataacgttgaaagtaaaaggaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaaatgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacgg 5658189  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  |     
T  5658188 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagag 5658089  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5658088 cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccccagggaacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 5657989  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5657988 gaaccgcccttccgggttttcagctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 5657917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887185
Alignment:
Q  287 aaggcgtgactccatggattc-acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaacttt 384  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  385 gaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttg 483  Q
    |||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||| | |    
T  15886994 gaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctctcg 15887093  T
Q  484 tttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15887094 tttcaatctcatttttccatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 15887185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 311 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002342
Alignment:
Q  311 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||  ||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 8002508  T
Q  411 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 509  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002507 tgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 8002408  T
Q  510 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8002407 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 8002342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 15886652 - 15886895
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15886652 cacagactatccgggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatg-ttcgtttgaatgtaccctgttgct 15886750  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ctgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||        |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||| |  |||||||     
T  15886751 caggtttgcttttca--------aaaaactttttcaattttcaagatgtttgcttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtac 15886842  T
Q  208 atagctttgaaagt-agaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaa 258  Q
    ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||    
T  15886843 ataactttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20445844 - 20445787
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  20445844 atttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatttttgcct 20445787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 15624618 - 15624563
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  15624618 ttttgcctggaccgccctttcgggttttcagttcaccgagacgctcatttttgcct 15624563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41002982 - 41002927
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  41002982 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 41002927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 41011763 - 41011708
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  41011763 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 41011708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 15707203 - 15707153
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 544  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  15707203 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatt 15707153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 71886 - 71829
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  71886 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 71829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3408762 - 3408705
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  3408762 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 3408705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3681470 - 3681413
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  3681470 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagaccaccgagacgctcatttttgcct 3681413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 8609948 - 8609891
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  8609948 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 8609891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 541
Target Start/End: Original strand, 10718148 - 10718193
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  10718148 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 10718193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 30018026 - 30017969
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  30018026 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagaccaccgagacgctcatttttgcct 30017969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 37258241 - 37258298
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  37258241 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 37258298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 8797 - 9363
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 8896  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8897 caagtttgcttttcaaaatagac-aaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 8995  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8996 agctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattca 9095  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||| |||||| |  | ||| |    
T  9096 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 9195  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagg-ggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9196 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 9295  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9296 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 9363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 5164767 - 5164203
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5164767 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5164668  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164667 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5164569  T
Q  211 g-ctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5164568 ggctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattc 5164469  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |||     
T  5164468 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttt 5164369  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164368 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 5164269  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcg 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5164268 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcg 5164203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 24586289 - 24586856
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586289 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 24586388  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24586389 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatata 24586487  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagtttc--aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24586488 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtcttaaacgaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 24586587  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaa-ctttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||  |||    
T  24586588 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattc 24586687  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586688 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgcctcaaggggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 24586787  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586788 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 24586856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5154466 - 5153900
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5154466 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgct 5154367  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154366 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 5154268  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  5154267 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 5154168  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| |    
T  5154167 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 5154068  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154067 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 5153968  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5153967 cgcccttccgggttttcggctcatcaagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaacctcagcgagc 5153900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 5141088 - 5141656
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141088 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5141187  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5141188 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtata 5141286  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  5141287 taactttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 5141386  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5141387 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 5141486  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141487 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5141586  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141587 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 5141656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26519174 - 26518609
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26519174 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26519075  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26519074 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26518976  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26518975 gctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 26518876  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||| ||    
T  26518875 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttg 26518776  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518775 atgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 26518676  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26518675 gcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtataatctcagcgagc 26518609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11447271 - 11446704
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11447271 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgct 11447172  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447171 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 11447073  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11447072 tagctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 11446973  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  11446972 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 11446873  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446872 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 11446773  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11446772 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtataatctcagcgagc 11446704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26441637 - 26441069
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441637 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26441538  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26441537 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatata 26441439  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag----tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||| ||||||||  |    ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26441438 gctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26441339  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26441338 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 26441239  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 cagacgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26441139  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26441138 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 26441069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16047695 - 16047133
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16047695 cacagactatcccggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgct 16047596  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  16047595 caggcttgcttt-caaaatagacaaaaac-ttttcaattttcaggatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacata 16047499  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||| |||||||  ||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16047498 gctttgacagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 16047399  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16047398 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttct 16047299  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047298 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttgcccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 16047200  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047199 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 16047133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 31558148 - 31558714
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558148 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31558247  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31558248 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 31558346  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  31558347 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 31558446  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  31558447 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 31558546  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558547 cgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 31558646  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31558647 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 31558714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 16745274 - 16745842
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16745274 cacagactatcctgaaggagaacttgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgct 16745373  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745374 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 16745472  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16745473 tagctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 16745572  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16745573 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagctt 16745672  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745673 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 16745772  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16745773 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 16745842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 31084376 - 31084944
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31084376 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 31084475  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084476 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaa-atttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 31084574  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31084575 agctttgaaagtagaagaaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattc 31084674  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31084675 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 31084774  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084775 cagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 31084874  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31084875 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 31084944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 45393602 - 45393034
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393602 cacagactatcctgaaggagaacctgcttgtaacatatactgaaatggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45393503  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  45393502 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtat 45393404  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45393403 agctttgaaagtagaagaaaagtagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattc 45393304  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-tt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| ||| || | ||    
T  45393303 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacataagcttt 45393204  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45393203 ttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccctttgtttcaatctcatttttgcatga 45393104  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393103 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 45393034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 4138999 - 4139568
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138999 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4139098  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139099 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 4139197  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4139198 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 4139297  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||   | ||| ||    
T  4139298 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagct 4139397  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139398 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 4139497  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4139498 aaccgccctttcgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtataatctcagcgagc 4139568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 16443757 - 16444324
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16443757 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 16443856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  16443857 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 16443955  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16443956 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggatt 16444055  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||    
T  16444056 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcacataagctt 16444155  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    | || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16444156 cagacgaagatggtcgttaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttcgcatgaa 16444255  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16444256 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatacaatctcagcgagc 16444324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4205772 - 4205205
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205772 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4205673  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4205672 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaatttttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 4205574  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4205573 agctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 4205474  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaa-ctttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4205473 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 4205374  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205373 agatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacgatggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 4205274  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4205273 ccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 4205205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 26268839 - 26269410
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268839 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26268938  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26268939 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgt 26269037  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    | ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26269038 acatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 26269137  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||     
T  26269138 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaag 26269237  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 502  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269238 cttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 26269337  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26269338 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 26269410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 26313603 - 26314169
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313603 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 26313702  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26313703 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 26313801  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26313802 gctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 26313901  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  26313902 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttca 26314001  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314002 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 26314101  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26314102 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 26314169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2160955 - 2160387
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160955 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 2160856  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  2160855 cagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 2160756  T
Q  209 tagctttgaaagtagaa--gaaaaatagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||| ||  |||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2160755 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 2160656  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  2160655 tacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 2160556  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2160555 ttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggaatggtggttggctagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaa 2160456  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2160455 ccgcccttccgggttttcggtccatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 2160387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 45737686 - 45737119
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737686 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagatatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 45737587  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45737586 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 45737488  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45737487 tatagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 45737388  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||    ||    
T  45737387 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgct 45737290  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737289 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 45737190  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45737189 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 45737119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 575
Target Start/End: Original strand, 26509471 - 26510018
Alignment:
Q  33 cctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509471 cctgcttgtgacatgtattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataga 26509570  T
Q  133 caaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 232  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509571 caaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat 26509670  T
Q  233 ag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaaagcttggaaaatggtaat 329  Q
     |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26509671 ggagttttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaat 26509770  T
Q  330 ttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaaca 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26509771 ttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaaca 26509870  T
Q  429 gctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggc 527  Q
    |||||||||||||||||||| |  | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26509871 gctgcagatgccccaagggggacggcggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcgtttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggt 26509970  T
Q  528 tcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26509971 tcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 26510018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 26663666 - 26664234
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663666 cacagactatcctggaggggaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26663765  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26663766 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatata 26663864  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26663865 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26663964  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  26663965 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 26664064  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664065 tagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26664164  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26664165 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 26664234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 26678858 - 26679426
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26678858 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgct 26678957  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26678958 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatata 26679056  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26679057 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26679156  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  26679157 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 26679256  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679257 taggtgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 26679356  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26679357 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 26679426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2779626 - 2779068
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2779626 agactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcag 2779527  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779526 gtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 2779433  T
Q  214 ttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaa 311  Q
    ||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2779432 ttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 2779333  T
Q  312 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  2779332 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 2779233  T
Q  412 gaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 510  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779232 gaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgc 2779133  T
Q  511 cctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2779132 ccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 2779068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31130282 - 31129721
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31130282 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgct 31130183  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||      ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130182 caggtttgcttttcaaaa------aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31130089  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  31130088 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 31129989  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| |    
T  31129988 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 31129889  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129888 gatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 31129789  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31129788 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 31129721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 11418533 - 11419100
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418533 cacagactatcctggaggaggacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 11418632  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11418633 caggtttgcttttcaaaacagacagaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 11418731  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  11418732 agctttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 11418831  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| || | |||     
T  11418832 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagcttt 11418931  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11418932 tgatgaagatagtcatgaacagctgcagatgccctaagggagacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcttttttgcatgaa 11419031  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11419032 ccgcccttccgggctttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 11419100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 39206893 - 39207460
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206893 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39206992  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39206993 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatat 39207091  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  39207092 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 39207191  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  39207192 acaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 39207291  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207292 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 39207391  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39207392 ccgcccttccgggttttcggctcattgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 39207460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3451702 - 3451134
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  || ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3451702 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattggaatagacattcacataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgct 3451603  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451602 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 3451504  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  3451503 atagctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcaccagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 3451404  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3451403 cacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 3451304  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3451303 cagatgaggacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttcaacctcctttttgcatga 3451204  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3451203 accacccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtataatctcagcgagc 3451134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 10847968 - 10847452
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  10847968 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 10847871  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt--caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gt 205  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  10847870 caggtttacttt-caaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgt 10847772  T
Q  206 atatagctttgaaagtaga-agaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10847771 acatagctttgaaagtagagagaaaatagagtttcagacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgg 10847672  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  10847671 atttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaag 10847572  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgca 502  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  10847571 cttctgatgaagatgatcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcatttttgca 10847472  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttt 522  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10847471 tgaaccgccctttcgggttt 10847452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 16512194 - 16512755
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16512194 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgct 16512293  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         |  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  16512294 caggtttgcttttcaaaa---------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 16512384  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16512385 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggcttaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 16512484  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||    
T  16512485 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagct 16512584  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16512585 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctctcgtttcaatctcatttttgcatg 16512684  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16512685 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 16512755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 10910680 - 10911241
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10910680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgct 10910778  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  10910779 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 10910870  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10910871 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 10910970  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||  || | ||    
T  10910971 ttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgtattcgcaagcgtaggagct 10911070  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10911071 tttgatgaagatagtcgttaacagcggcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 10911170  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10911171 aaccgcccttccgggttttcggtccatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 10911241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26596053 - 26595750
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596053 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 26595954  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26595953 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatat 26595855  T
Q  210 agctttgaaagtagaag-aaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26595854 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 26595755  T
Q  306 tcaca 310  Q
    |||||    
T  26595754 tcaca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 311 - 575
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532191
Alignment:
Q  311 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctga 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||  ||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 26532025  T
Q  411 tgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 509  Q
    ||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532026 tgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 26532125  T
Q  510 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532126 ccctttcggattttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 26532191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 409 - 575
Target Start/End: Original strand, 16732684 - 16732851
Alignment:
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732684 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 16732783  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16732784 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 16732851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 450 - 575
Target Start/End: Original strand, 2104357 - 2104482
Alignment:
Q  450 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2104357 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgcttattcttgc 2104456  T
Q  550 ctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2104457 ctgagttgcgtacaatctcagcgagc 2104482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 795898 - 795955
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  795898 atttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatttttgcct 795955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 16284754 - 16284811
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  16284754 atttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatttttgcct 16284811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 16240180 - 16240130
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 544  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  16240180 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcgatccatcgagacgctcatt 16240130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 29092280 - 29092230
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 544  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  29092280 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcgatccatcgagacgctcatt 29092230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 541
Target Start/End: Original strand, 565046 - 565091
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  565046 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 565091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9472080 - 9472023
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  9472080 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 9472023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 16390806 - 16390863
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  16390806 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 16390863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 525
Target Start/End: Original strand, 26509241 - 26509273
Alignment:
Q  493 catttttgcatgaaccgccctttcgggttttcg 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26509241 catttttgcctgaaccgccctttcgggttttcg 26509273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 39857032 - 39856467
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857032 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 39856933  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856932 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 39856834  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaat-agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  39856833 gctttgaaagtagaagaaaaaagagttttaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcac 39856734  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  39856733 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcag 39856634  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856633 atgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaagggggacggtggttggccagatacagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 39856534  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39856533 gcccttctgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 39856467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 54839787 - 54839222
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839787 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 54839688  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  54839687 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatat 54839589  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  54839588 agctttgaaagtagaagaaaatagagtttcaagcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 54839489  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| |    
T  54839488 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 54839389  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839388 gatgaagatggtcattaacaactgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 54839289  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54839288 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 54839222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14104939 - 14104374
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104939 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 14104840  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104839 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 14104741  T
Q  211 gctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14104740 gctttgaaagtagaaagaaaacagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattca 14104641  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | ||| |    
T  14104640 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagctttt 14104541  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14104540 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaacc 14104441  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14104440 gcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcatttttgcctgagttgcgaacaatctcagcgagc 14104374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5700937 - 5700369
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700937 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 5700838  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700837 caagtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 5700739  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5700738 agctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattca 5700639  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  5700638 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 5700539  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagg-ggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700538 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 5700439  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcgg-ctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5700438 ccgccctttcgggttttcggtctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 5700369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1906654 - 1906083
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1906654 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1906555  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttt----tg 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  1906554 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttg 1906456  T
Q  205 tatatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatg 302  Q
    || || |||||||||||||||  | | |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1906455 tacatggctttgaaagtagaaagatagtagagtttcaaacaaaagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccaca 1906356  T
Q  303 gattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaa 402  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  1906355 gatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatga 1906256  T
Q  403 acttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 502  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906255 gcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 1906156  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906155 tgaaccgcccttccgggtttttggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 1906083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 20332290 - 20332858
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332290 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 20332389  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20332390 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatata 20332488  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  20332489 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 20332588  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  20332589 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 20332688  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332689 tagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 20332788  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20332789 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgatttgcgtacaatctcagcgagc 20332858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30760159 - 30759594
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30760159 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 30760060  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30760059 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 30759961  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30759960 gctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 30759861  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | ||| ||    
T  30759860 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttg 30759761  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30759760 atgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgtatgaacc 30759661  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30759660 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 30759594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 40099504 - 40100072
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099504 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 40099603  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099604 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 40099702  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  40099703 gctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 40099802  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||    
T  40099803 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 40099902  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
      ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099903 tagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 40100002  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40100003 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 40100072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 33667671 - 33668236
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33667671 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgct 33667770  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33667771 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 33667869  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33667870 gctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 33667969  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   || | ||| ||    
T  33667970 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttg 33668069  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668070 atgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttccttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 33668169  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33668170 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatttttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 33668236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 24586229 - 24586797
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586229 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgct 24586328  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586329 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 24586427  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  24586428 gctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 24586527  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |||    
T  24586528 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctt 24586627  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586628 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 24586727  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586728 accgcccttccgggtttttggctcatcgagacactcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 24586797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 14753362 - 14753928
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14753362 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 14753460  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753461 cagatttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata 14753559  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14753560 tagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaatcaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 14753659  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  14753660 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 14753759  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753760 tgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 14753859  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14753860 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 14753928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 27157180 - 27157752
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157180 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 27157279  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27157280 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 27157378  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaa-tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27157379 agctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27157478  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||    
T  27157479 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 27157578  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg--attgtgatttgccagatatagttacttgcc-ttttgtttcaatctca-tttttgc 501  Q
    | |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||     ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27157579 tttgatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacgggtggttggccagatatagttacttgcctttttgtttcaatctcattttttgc 27157678  T
Q  502 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27157679 atgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 27157752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5012275 - 5011707
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5012275 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgct 5012176  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  5012175 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatat 5012077  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5012076 agctttgaaagtagaagaaaagtagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 5011977  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5011976 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 5011877  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5011876 cagatgaaaatggtcattaacagctgcagatgcctcaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 5011777  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5011776 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 5011707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21976098 - 21975531
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21976098 agactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgg 21975999  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21975998 gtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagc 21975900  T
Q  213 tttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcaca 310  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21975899 tttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcgcagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcaca 21975800  T
Q  311 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-ttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | || ||    
T  21975799 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttg 21975700  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975699 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 21975600  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975599 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 21975531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 34182832 - 34183397
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34182832 cacagattatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 34182930  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182931 caggtttgcttttcaaaatagacaaaa--gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 34183028  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  34183029 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 34183128  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | |||     
T  34183129 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttt 34183228  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183229 tgatggagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 34183328  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34183329 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatacaatctcaacgagc 34183397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15234217 - 15233647
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15234217 cacagactatcctggggaagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcc 15234118  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaag-----ttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgt 205  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||      ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  15234117 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttcaagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgt 15234019  T
Q  206 atatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgg 303  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  15234018 acatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacgg 15233919  T
Q  304 attcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||     
T  15233918 atttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaag 15233819  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233818 cttatgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 15233719  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15233718 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttacgtacaatctcagcgagc 15233647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6576251 - 6575692
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6576251 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 6576153  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576152 caggtttgcttttcaaag-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 6576060  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||| ||  |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  6576059 gctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 6575960  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||| || | ||| |    
T  6575959 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagctttt 6575860  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575859 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 6575760  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6575759 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 6575692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 18794485 - 18795052
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794485 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 18794584  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18794585 caggtttgcttttcaaaataaacaaaaa-gttttcaattttcaagaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 18794683  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18794684 agctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 18794783  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  18794784 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttt 18794883  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18794884 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcctgaa 18794983  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18794984 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 18795052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 36338394 - 36338953
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36338394 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36338492  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338493 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 36338585  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36338586 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 36338685  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| |    
T  36338686 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 36338785  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338786 gatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 36338885  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36338886 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcactctcagcgagc 36338953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 15380106 - 15380673
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15380106 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaaaagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 15380205  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtata 208  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  15380206 caggcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttaattt-caagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtaca 15380303  T
Q  209 tagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15380304 tagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 15380403  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||    
T  15380404 tacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataaccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagctt 15380503  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15380504 cggatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatatagtcatttctcttttcatttcaatctcatttttgcatga 15380603  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380604 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 15380673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 31120378 - 31120949
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31120378 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtagcatatattgaaatagacattcacataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgct 31120477  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31120478 cgggtttgcttttcaaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtata 31120576  T
Q  209 tagctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31120577 tagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggatt 31120676  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac-t 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| | |    
T  31120677 cacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaagctt 31120776  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccc---aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 502  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120777 tttgatgaagacggtcattaacagctgcagataccccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 31120876  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31120877 tgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctcagcgagc 31120949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 15276497 - 15277067
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  15276497 cacagactatcctggggaagagcctgtttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgct 15276596  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt--caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    || |||| |||| ||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  15276597 caagtttacttt-caaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgta 15276695  T
Q  207 tatagctttgaaagtaga-agaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 304  Q
     ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15276696 catagctttgaaagtagagagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 15276795  T
Q  305 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15276796 tttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagc 15276895  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  15276896 ttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcattagtcttttcatttcaatctcatttttgcat 15276995  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276996 gaaccgccctttcgggttttcggcccatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 15277067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24119055 - 24118492
Alignment:
Q  15 gactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagg 114  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||| || |  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24119055 gactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatgttgaaatagacaccagcacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccgg 24118957  T
Q  115 tttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118956 tttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagct 24118858  T
Q  214 ttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaa 311  Q
    ||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24118857 ttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaa 24118758  T
Q  312 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgat 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||    
T  24118757 agcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgat 24118658  T
Q  412 gaagacggtca-ttaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccaga-tatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 509  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24118657 gaggacggtcatttaacagctgcagatgccccaagggaacggtggttggccatattatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 24118558  T
Q  510 ccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24118557 cccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 24118492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14671410 - 14670846
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14671410 cacagactatcctagaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 14671311  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||     
T  14671310 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtac 14671218  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14671217 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggat 14671118  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  || | |    
T  14671117 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggagc 14671018  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671017 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 14670918  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14670917 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 14670846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17019445 - 17018882
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17019445 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 17019347  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    ||||||||||||||||||       |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  17019346 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 17019254  T
Q  209 tagcttt-gaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17019253 tagcttttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcataggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 17019154  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |    
T  17019153 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 17019054  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17019053 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 17018954  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17018953 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatgcaatctcagcgagc 17018882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1674258 - 1673877
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1674258 cacagactatcctagggaagaacctgcttgtaacacat--tgaaatagacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 1674161  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gta 206  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  1674160 caagtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgta 1674062  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 304  Q
     || |||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  1674061 catggctttgaaagtagaaagatagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacgga 1673962  T
Q  305 ttcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaatt 389  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  1673961 tttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaatt 1673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 316
Target Start/End: Original strand, 36324185 - 36324484
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36324185 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 36324283  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324284 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 36324376  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaat--agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36324377 gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 36324476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 377 - 575
Target Start/End: Original strand, 18311414 - 18311614
Alignment:
Q  377 gaaactttgaattcacaagcacagaaacttct-gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttact 474  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||    
T  18311414 gaaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacagtggttggccagatatagttact 18311513  T
Q  475 tgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgag 574  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18311514 tgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgag 18311613  T
Q  575 c 575  Q
    |    
T  18311614 c 18311614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3361469 - 3361412
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  3361469 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcatttttgcct 3361412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3362166 - 3362109
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  3362166 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcatttttgcct 3362109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3362863 - 3362806
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  3362863 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcatttttgcct 3362806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Original strand, 8098581 - 8098636
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  8098581 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 8098636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 548
Target Start/End: Original strand, 14723288 - 14723342
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttg 548  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  14723288 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcgatccaccgagacgctcattcttg 14723342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 55786911 - 55786861
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 544  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  55786911 atttttgcctgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatt 55786861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12421 - 11857
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12421 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 12322  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12321 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatata 12223  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12222 gctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 12123  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||    ||| |    
T  12122 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaag--cattcgctttt 12025  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 11925  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11924 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatacaatctcagcgagc 11857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2043 - 1476
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2043 cacagactatcccggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgct 1944  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1943 caggtttgcttttcaaagtaaacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatat 1845  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1844 agctttgaaagtagaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 1745  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1744 caaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaacttc 1645  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644 tgatgaagatggtcattaacaactgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 1545  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1544 ccgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 1476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12443 - 11866
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12443 cacagactatcctggagaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 12344  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat--- 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |       
T  12343 caggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgttttttttttt 12245  T
Q  208 --------atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 296  Q
            ||||||||||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12244 ttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgac 12145  T
Q  297 tccatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagc 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  12144 tccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaagt 12045  T
Q  397 acagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatt 496  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12044 acagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggttggccagatatagttacttgtcttttgtttcaatctcatt 11945  T
Q  497 tttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11944 tttgcatgaaccgccctttcgggttttcggcccatcgagacgctcattcttgtctgagttgtgtacaatctcagcgagc 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33248751 - 33248185
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248751 cacagactatcctggaggagaacctgcttataacatatattgaaatagacaccaacacacgctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 33248652  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248651 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 33248553  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33248552 gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattca 33248453  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||| |    
T  33248452 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttt 33248353  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248352 gatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggagacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 33248253  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248252 cgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 33248185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18797093 - 18796525
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797093 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18796994  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796993 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 18796895  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaat--agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18796894 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 18796795  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||    
T  18796794 ataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagctt 18796695  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796694 ttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccctaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 18796595  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18796594 accacccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 18796525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 28355780 - 28356350
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355780 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 28355879  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355880 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 28355978  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaa--tag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  28355979 gctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 28356078  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaa-ctttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||      
T  28356079 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaga 28356178  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356179 ttcagatgaagatggtcattaacagttgtagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 28356278  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356279 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 28356350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29835708 - 29835142
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835708 cacagattatcttggaggagaacctgctcgtaacacatattgaaatagacaccaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 29835609  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29835608 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 29835510  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaat-agttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  29835509 gctttgaaagtagaagaaaatggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattta 29835410  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||     
T  29835409 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaggcttca 29835310  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835309 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 29835210  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835209 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 29835142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9361007 - 9360441
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361007 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 9360908  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360907 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 9360809  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  9360808 gctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattca 9360709  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||| |  | ||| |    
T  9360708 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagctttt 9360609  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360608 gatgaaaatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 9360509  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9360508 cgcccttccgtgttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 9360441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19680833 - 19680267
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680833 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19680734  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19680733 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 19680635  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcac 309  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19680634 gctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcac 19680535  T
Q  310 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcattt-cctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  19680534 aaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttca 19680435  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680434 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 19680335  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19680334 cgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtataatctcagcgagc 19680267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44567369 - 44566800
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567369 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 44567270  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa----tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44567269 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 44567171  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44567170 tatagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 44567071  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctgg-aaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||  || | |    
T  44567070 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 44566971  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44566970 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 44566871  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44566870 aaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 44566800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 12086553 - 12087121
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12086553 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 12086652  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12086653 caggcttgcttttcaaaacagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 12086751  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12086752 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 12086851  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12086852 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 12086951  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086952 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 12087051  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12087052 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 12087121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15773960 - 15773393
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773960 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15773861  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15773860 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatat 15773762  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||| |||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15773761 agctctgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 15773662  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| |||||  || | |||     
T  15773661 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 15773562  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773561 tgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggaacgatggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 15773462  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773461 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 15773393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31360914 - 31360347
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360914 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 31360815  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31360814 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatat 31360716  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  31360715 aactttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattc 31360616  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||  || | |||     
T  31360615 acaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttt 31360516  T
Q  408 tgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 506  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360515 agatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 31360416  T
Q  507 ccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31360415 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgttcaatctcagcgagc 31360347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 573
Target Start/End: Original strand, 31483700 - 31484267
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31483700 cacagactatcctggaggagaacctgctcgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgct 31483799  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483800 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 31483898  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaa--aaatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31483899 gctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 31483998  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||| |||||||     ||| ||    
T  31483999 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgtggaagct 31484098  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484099 tcagatgaagatggtcatcaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 31484198  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcga 573  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31484199 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcga 31484267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 21342000 - 21342568
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342000 cacagactattctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 21342099  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc-aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21342100 caggtttgcttttcaaaatagac-aaaaagttttcaattttcaaaaatgcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 21342198  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    ||||||||||||| ||  |||  | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21342199 agctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacagaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattt 21342298  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| || | |||    
T  21342299 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagctt 21342398  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342399 ttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttagccagatatagtcacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 21342498  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21342499 accgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 21342568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33265079 - 33264550
Alignment:
Q  48 tattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaa 147  Q
    |||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33265079 tattgaaatagacattgacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gtttttaa 33264981  T
Q  148 ttttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaa 245  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  33264980 ttttcaaaaatgttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaagaaaatagaatttcaaacaaa 33264881  T
Q  246 agcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264880 agcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 33264781  T
Q  346 acattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa- 444  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  33264780 acattgaacacagtaatcatggcatttcctaggaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaag 33264681  T
Q  445 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 544  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264680 ggggacggtggttggccagatatagttacttgctttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 33264581  T
Q  545 cttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33264580 cttgcctgagttgcatacaatctcagcgagc 33264550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18715868 - 18715301
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715868 cacagactatcctggaggagaacccgcttgtaacatatattgaaatagtcatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18715769  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc----aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18715768 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaatttttcaaaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgta 18715670  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18715669 tatagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 18715570  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||| ||||  ||    ||    
T  18715569 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgct 18715472  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18715471 tttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaacctcatttttgcatg 18715372  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18715371 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 18715301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 19910992 - 19911561
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19910992 cacagactatcttggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 19911091  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtata 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  19911092 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtaca 19911191  T
Q  209 tagctttgaaagtagaa--gaaaaatagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    |||||||||||||| ||  |||| | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19911192 tagctttgaaagtaaaaaggaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 19911291  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||  |||||  || | |||    
T  19911292 tacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagctt 19911391  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911392 ttgatgaagatcgtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 19911491  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19911492 accgcccttccggattttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 19911561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 19202205 - 19202761
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19202205 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacatcgacatactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 19202304  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19202305 caggtttgcttttcaaaatagacaaaag-gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatata 19202403  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcaca 310  Q
    ||||||||| ||||         |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19202404 gctttgaaaataga---------gttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 19202494  T
Q  311 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaa-actttgaattcacaagcacagaaacttctg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19202495 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaacttcag 19202594  T
Q  410 atgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaacc 508  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19202595 atgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttgactagatatagttacttgccttgtgtttcaatctcatttttgcatgaacc 19202694  T
Q  509 gccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202695 gcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 19202761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 27602744 - 27603303
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  27602744 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacacatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgca 27602842  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||         || |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  27602843 caggtttgcttttcaaaa---------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 27602933  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27602934 atagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggat 27603033  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27603034 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagct 27603133  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27603134 tcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaagggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcgtttttgcatga 27603233  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603234 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 27603303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Original strand, 19655180 - 19655741
Alignment:
Q  14 agactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcag 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19655180 agactatcctggggaagagtctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcag 19655279  T
Q  114 gtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatata 210  Q
    ||||||||| |||||       |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||    
T  19655280 gtttgcttt-caaaa-------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacata 19655371  T
Q  211 gctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
     ||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  19655372 actttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggattta 19655471  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaatttt--attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||    
T  19655472 caaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt 19655571  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655572 ttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 19655671  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655672 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 19655741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 22074759 - 22075326
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22074759 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 22074858  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtat 207  Q
    || | ||||||| ||||| |||||||||  |||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||     
T  22074859 catgcttgcttt-caaaacagacaaaaactttttta-ttttcaagaagtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtac 22074956  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22074957 atagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcctaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22075056  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||    
T  22075057 ttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggcaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagct 22075156  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  22075157 tctgatg-agatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcatttttgcatg 22075255  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22075256 aaccgccatttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctaagttgcgtacaatctcagcgagc 22075326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22139286 - 22138726
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22139286 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacatacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgct 22139187  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    || |||||||||          ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  22139186 caagtttgcttt----------caaaaactttttcaattttcaagacgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 22139097  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22139096 ataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 22138997  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | |    
T  22138996 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagc 22138897  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22138896 ttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatg 22138797  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22138796 aaccgcccttccgggttttcggctgatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 22138726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 140 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260042
Alignment:
Q  140 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-atagttt- 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaatagagtttt 16260381  T
Q  238 caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattgg 337  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260380 caaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattgg 16260281  T
Q  338 ttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagat 437  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260280 ttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagat 16260181  T
Q  438 gccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgaga 536  Q
    |||| ||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16260180 gccctaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgaga 16260081  T
Q  537 cgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260080 tgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 16260042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19694477 - 19693914
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19694477 cacagactatcctggaggagaacttgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 19694379  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||||||||||||||       |||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  19694378 caggtttgcttttcaaaa-------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 19694286  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaat--agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19694285 ataactttgaaagtaaaaagaaagcggagttttaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 19694186  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | |    
T  19694185 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagc 19694086  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694085 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 19693986  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19693985 gaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 19693914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 2131098 - 2131659
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2131098 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 2131196  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    |||||||||||||||||         ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  2131197 caggtttgcttttcaaag--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 2131288  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2131289 ataactttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggat 2131388  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || | ||    
T  2131389 ttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 2131488  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2131489 tttgatgaagaaggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 2131588  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2131589 aaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtatacaatctcagcgagc 2131659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14569540 - 14568976
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14569540 cacagaatatcctggaggagaacctgcttgtaacatgtattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 14569442  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat- 207  Q
    ||||||||  ||||||||        ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |     
T  14569441 caggtttgtctttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttttt 14569350  T
Q  208 ----atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccat 301  Q
        ||| ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14569349 gaacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccac 14569250  T
Q  302 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacaga 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||   ||||||||||||| | | || ||     
T  14569249 ggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattacattcccaa-aaactttgaattcgccatcatagg 14569151  T
Q  402 aacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttg 500  Q
    | ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569150 agcttttgatgaagatagtcgttaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttg 14569051  T
Q  501 catgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14569050 catgaaccgcccttccgggttttcggtacatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 14568976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19846933 - 19846883
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 544  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19846933 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatt 19846883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 541
Target Start/End: Original strand, 17678418 - 17678463
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctc 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  17678418 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctc 17678463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10299 - 9733
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10299 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 10200  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10199 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatat 10101  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattca 308  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10100 agctttgaaaatagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattca 10001  T
Q  309 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| |    
T  10000 caaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctttt 9901  T
Q  409 gatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 507  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9900 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaac 9801  T
Q  508 cgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9800 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 9733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33680 - 33116
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33680 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgct 33582  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtata 208  Q
    |||||||||||||  |||     |||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  33581 caggtttgcttttacaaa-----aaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtaca 33487  T
Q  209 tagctttgaaagtagaa-gaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33486 taactttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatt 33387  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||    
T  33386 tacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggggct 33287  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33286 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 33187  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33186 gaccgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 33116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 4471 - 5043
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4471 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 4570  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatat 209  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4571 caggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatat 4670  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaat--agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4671 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattc 4770  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||    
T  4771 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagct 4870  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgcc-ttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4871 tttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagacatagttacttgcctttttgtttcaatctcatttttgcat 4970  T
Q  504 gaaccgccctt-tcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4971 gaaccgcccttcccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 5043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18973 - 18404
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18973 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 18874  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttc---aaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18873 caggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat 18775  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  18774 atagctttgaaagtagaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggatt 18675  T
Q  307 cacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaact 405  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||    
T  18674 cacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagct 18575  T
Q  406 tctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 504  Q
    | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18574 tttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatg 18475  T
Q  505 aaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18474 aaccgcccttcagggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 18404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14336 - 13768
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14336 cacagattatcttggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacattaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgct 14237  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat 209  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14236 caggcttgcttttcaaaacacacaaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatac 14138  T
Q  210 agctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14137 agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaacagcacaagctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattc 14038  T
Q  308 acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaactt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14037 acaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 13938  T
Q  407 ctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 505  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13937 ttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatga 13838  T
Q  506 accgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837 accgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 13768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15962 - 15388
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 15863  T
Q  111 caggtttgctttt-caaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaa------tgtttgtttcaagcactgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgttt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||||||| |||| ||||||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  15862 caggtttgctttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaaaaaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgttt 15764  T
Q  203 tgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-atagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15763 tgtatatagctttgaaagtagaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactcca 15664  T
Q  301 tggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacag 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  15663 cggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacag 15564  T
Q  401 aaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 499  Q
    || ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15563 aagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt 15464  T
Q  500 gcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15463 gcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctcagcgagc 15388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25509 - 24935
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25509 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcgacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgct 25410  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagtttt------caattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt- 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||      |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  25409 caggtttgcttt-caaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttt 25311  T
Q  204 --gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactcc 299  Q
      ||| ||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25310 tcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcgcaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactcc 25211  T
Q  300 atggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcaca 399  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  25210 acggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcaca 25111  T
Q  400 gaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttt 498  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  |||||||||||||||    
T  25110 gaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcatttt 25011  T
Q  499 tgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25010 agc-tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 24935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6449 - 5885
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6449 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 6350  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--a 206  Q
    ||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |    
T  6349 caggtttgcttttcaaaa--------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaa 6258  T
Q  207 tatagctttgaaagtagaagaaaaatag--tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgga 304  Q
     ||| ||||||||||| ||  ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6257 cataactttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaatatgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacgga 6158  T
Q  305 ttcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaa 403  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||  || |     
T  6157 tttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggag 6058  T
Q  404 cttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 502  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6057 cttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgca 5958  T
Q  503 tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5957 tgaaccgcccttccgggttttcggttcattgagacgctcattcttgcctgagttgcgtgcaatctcagcgagc 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 575
Target Start/End: Original strand, 24774 - 25337
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24774 cacagactatcctggaggagaacctgcttgtaacatatattgaaacagacaccaacacacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgct 24872  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcact-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtat 207  Q
    ||||||| ||||||||||       |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  24873 caggttttcttttcaaaa-------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtac 24965  T
Q  208 atagctttgaaagtagaagaaaa--atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggat 305  Q
    ||| ||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24966 ataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggat 25065  T
Q  306 tcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaac 404  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||  || | |    
T  25066 ttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagcaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagc 25165  T
Q  405 ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcat 503  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25166 ttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttctatctcatttttgcat 25265  T
Q  504 gaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25266 gaaccgcccttccgagttttcggctcatcgagacactcattcttgcctgagttgcatgcaatctcagcgagc 25337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 539 - 196
Alignment:
Q  233 agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  539 agtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt 440  T
Q  333 attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  439 attggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctg 340  T
Q  433 cagatgccccaa-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcat 531  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  339 cagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggttcat 240  T
Q  532 cgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  239 cgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 253 - 466
Target Start/End: Original strand, 26245 - 26458
Alignment:
Q  253 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 352  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26245 gctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacattga 26344  T
Q  353 acacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggggattg 452  Q
     ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26345 gcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatgg 26444  T
Q  453 tgatttgccagata 466  Q
    || ||||| |||||    
T  26445 tggtttgctagata 26458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 1
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacacatattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  173 cacagactatcctagggaagagcctgcttgtagcacatattgaaatagacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgct 74  T
Q  111 caggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcactgtcattatcaa 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73 caggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 257 - 572
Target Start/End: Original strand, 40759 - 41096
Alignment:
Q  257 aaattgatgtataagagtggtggtc-agccgaaggcgtgactcc-atggattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-att 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40759 aaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaatt 40858  T
Q  351 g-aacacagtaatcacttcatttcctggaaactttgaa-ttcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctgcagatg-ccccaagg 446  Q
    | ||||||  ||||| | |||||||| ||||||||||| ||| | |||| || | | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40859 gaaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatttcgcgagcataggagctttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccccaagg 40958  T
Q  447 gg---attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctc-atttttg-catgaaccgccctttcggg--ttttcggct--catcgagac 537  Q
    ||      ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||   ||||||||    
T  40959 ggggacgggtggttggccagatatagttacttgcctctcgtttcaatctctatttttgtcatgaaccgcccttccggggtttttcggcttcgatcgagac 41058  T
Q  538 gctcattctt--gcctgagttg-cgtacaatctcagcg 572  Q
    ||||||||||   |||||||||  ||||||||||||||    
T  41059 gctcattctttgtcctgagttgttgtacaatctcagcg 41096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 118
Target Start/End: Original strand, 40497 - 40606
Alignment:
Q  11 cacagactatcctggggaagagcctgcttgtaacac-atattgaaatagacatcaacgtactcttgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttg 108  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||  || || ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  40497 cacatactatcctggaggagaacctgcttgtaacattatgttgaaatagacaccaacacacactcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttg 40596  T
Q  109 ctcaggtttg 118  Q
    ||||||||||    
T  40597 ctcaggtttg 40606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 459 - 575
Target Start/End: Original strand, 20512 - 20628
Alignment:
Q  459 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 558  Q
    |||| |||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20512 gccaaatatagttacttgcctgtggtgtcaatctcaatttggcatgacccccccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattctttcctgagtcgc 20611  T
Q  559 gtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||||||||||||||    
T  20612 gtacaatctcagcgagc 20628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11934 - 11849
Alignment:
Q  492 tcatttttg-catgaaccgccctttcgggttttcgg-ctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11934 tcatttttgtcatgaaccgccctttcgggttttcggtctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 11849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 527 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 351 - 303
Alignment:
Q  527 ctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351 ctcatcaagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctcagcgagc 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1691 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1691
Description:

Target: scaffold1691; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 452 - 397
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  452 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 551
Target Start/End: Original strand, 4141 - 4196
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||    
T  4141 ttttgcatggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcttttttgcct 4196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0799 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0799
Description:

Target: scaffold0799; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 276
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 544  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  326 atttttgcctgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatt 276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 3601 - 3658
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  3601 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 3658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19383 - 19326
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  19383 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 19326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 259
Alignment:
Q  496 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcg 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  288 ttttgcatgaaccgccctttcgggttttcg 259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31939 - 31882
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  31939 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 31882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Original strand, 15932 - 15989
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  15932 atttttgcctggaccgcccttttgggttttcagtccatcgagacgctcatttttgcct 15989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1689 - 1632
Alignment:
Q  494 atttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 551  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  1689 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 1632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 351 times since January 2019
Visitors: 3059